Proteínas e Redes

As redes foram feitas no Cytoscape, com as proteínas encontradas na curadoria manual (https://bioinfo.com.br/construindo-redes-de-interacao-proteina-proteina-por-curadoria-manual/) utilizando as proteínas nos artigos na imagem "Artigos da curadoria manual" e utilizou-se a Uniprot (https://www.uniprot.org/) para a encontra os códigos das proteínas. Assim, com os códigos, colocar no Cytoscape para a formação das redes, as quais cores mais escura respresentam interações mais fortes, e as cores mais fracas teriam as interações mais fracas.

Clusters: 

A) Apresenta uma centralização com TP53, que age como um supressor tumoral. B) Mostra grande parte da rede que está envolvida com sinalização celular. C) Apresenta dois núcleos o grande com muitas de histonas, e o núcleo menor com receptores virais com um negativo, unidos a partir POU5F1 o qual tem relação com a ligação do DNA. D) Proteínas não conectadas. E) Apresenta grande relação com Regulação de processos de organismos multicelulares, além de apresentar envolvimento com a histona HDAC1. F) Apresenta maior envolvimento a programa de morte celular, antígenos e a receptor de fatores necrótico de tumores.

Rede Top 10:

A rede mostra uma grande interação entre o nucleossomo, partindo com H3-3B, em conjunto de vários mecanismos de sinalização do sistema imune e a AKT1, o qual é responsável regulam muitos processos, incluindo metabolismo, proliferação, sobrevivência celular, crescimento e angiogênese.