Published April 10, 2022 | Version v1
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Coverage and SNP datasets for Bathycoccus prasinos, Pelagomonas calceolata and Phaeocystis cordata in the Mediteranean Sea, studied with Tara Oceans metagenomic samples

Creators

  • 1. Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, LOV, F-06230 Villefranche-sur-Mer, France; Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB), Muséum national d'Histoire naturelle, CNRS, Sorbonne Université, EPHE, Université des Antilles CP 50, 57 rue Cuvier, 75005 Paris, France
  • 2. Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, LOV, F-06230 Villefranche-sur-Mer, France; Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB), Muséum national d'Histoire naturelle, CNRS, Sorbonne Université, EPHE, Université des Antilles CP 50, 57 rue Cuvier, 75005 Paris, France; Sorbonne Université, UMR 7159 CNRS-IRD-MNHN, LOCEAN-IPSL, 75005 Paris, France
  • 3. Sorbonne Université, UMR 7159 CNRS-IRD-MNHN, LOCEAN-IPSL, 75005 Paris, France; Department of Earth, Atmospheric and Planetary Sciences, Massachusetts Institute of Technology, 54-1514 MIT, Cambridge, MA 02139, USA
  • 4. Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, Université Paris-Saclay, Evry, France
  • 5. Génomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, Université Paris-Saclay, Evry, France; Research Federation for the study of Global Ocean Systems Ecology and Evolution, FR2022/Tara Oceans GOSEE, 3 rue Michel-Ange, 75016 Paris, France
  • 6. Service d'Etude des Prions et des Infections Atypiques (SEPIA), Institut François Jacob, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Université Paris Saclay, Fontenay-aux-Roses, France
  • 7. Sorbonne Université, CNRS, Laboratoire d'Océanographie de Villefranche, LOV, F-06230 Villefranche-sur-Mer, France; Research Federation for the study of Global Ocean Systems Ecology and Evolution, FR2022/Tara Oceans GOSEE, 3 rue Michel-Ange, 75016 Paris, France
  • 8. Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB), Muséum national d'Histoire naturelle, CNRS, Sorbonne Université, EPHE, Université des Antilles CP 50, 57 rue Cuvier, 75005 Paris, France; Institut Universitaire de France (IUF), Paris, France

Description

Files for Bathycoccus prasinos, Pelagomonas calceolata and Phaeocystis cordata

SNP dataset:
VCF files

Coverage dataset:
STATION: Tara Oceans station
SAMPLE: Tara Oceans metagenomic sample
TOT: Total length of the reference
H_SUM: Total number of position covered
V_SUM: Total length of aligned aligned
H_COV: Horizontal coverage
V_COV: Vertical coverage

Files

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