Published September 15, 2020 | Version v1
Poster Open

USO DE COMPUTAÇÃO PREDITIVA POR ANCORAGEM MOLECULAR DE COMPOSTOS DO ÓLEO ESSENCIAL DE COPAIFERA LANGSDORFFII DESF COMO INIBIDORES DO SARS-COV-2

  • 1. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Universidade Potiguar (UnP), Natal, RN, Brasil
  • 2. Programa Multi-institucional de Pós-Graduação em Biotecnologia –PPGBIOTEC, Universidade Federal do Amazonas (UFAM), Manaus, AM, Brasi
  • 3. Departamento de Nutrição, Universidade Federal do Pernambuco (UFPE), Recife, PE, Brasil.
  • 4. Departamento de Medicina Tropical, Universidade Federal do Pernambuco (UFPE), Recife, PE, Brasil

Description

O atual cenário causado pelo novo coronavirus (SARS-CoV-2019) trouxe a imperativa necessidade 
de desenvolvimento de pesquisas que visem amortizar a taxa de transmissão, a busca da cura e de 
tratamentos que promovam a redução de mortes de indivíduos acometidos por Covid-19. Neste contexto, a pesquisa de novas substâncias de combate ao vírus que explora compostos naturais oriundos da flora brasileira tem um papel muito importante. O presente trabalho estudou a interação dos principais compostos do óleo essencial de Copaíba (Copaifera langsdorffii Desf) contra os 15 
principais alvos conhecidos que favorecem a entrada do novo Coronavirus (SARS-CoV-2) no corpo humano: SARS-CoV-2 Mpro (protease principal), endoribonuclease NSP-15, RNA polimerase RNAdependente, ECA-2 e domínio Spike-S, através de uma análise computacional in-silico. A 
caracterização do óleo de copaíba foi realizada por cromatografia gasosa acoplada a 
espectrofotometria de massas (CG-MS). AutoDockTools 4.2, AutoDock Vina, APBS e PyMol foram usados para a pesquisa de acoplamento e interação molecular. As moléculas estudadas foram previamente tratadas, desidratadas, adicionado hidrogênios em cadeias polares e plotado em um grid proporcional suficiente para encobrir as macromoléculas e os ligantes. O óleo essencial de copaíba apresentou 10 principais moléculas analisadas por cromatografia, com destaque para o β-bisaboleno (23,6%), β-cariofileno (21,7%) e α-bergamoteno (20,5%), corroborando com resultados encontrados por outros autores. O β-selineno (6.1%) apresentou um resultado de energia de ligação significativo 
de -7.2 , ligando-se a nove aminoácidos através de ligações hidrofóbicas na protease principal do vírus (SARS-CoV-2 Mpro). Ademais, as superfícies eletrostáticas obtidas através do uso do APBS 
(Advanced Poisson-Boltzmann Solver) demonstrou que a molécula liga-se no isocontorno da 
superfície de potencial eletrostático, demonstrando uma afinidade com regiões apolares, ligando-se por interações hidrofóbicas com os resíduos: Phe 3, Arg 4, Lis 5, Phe 291, Glu 288, Trp 207 e Leu 282, todos encontrados na cadeia A da protease principal do vírus. Os demais compostos estudados 
presentes no óleo essencial também apresentaram excelentes resultados de energia de ligação contra os principais alvos de inibição considerados neste estudo, indicando um importante caminho 
na descoberta de novas drogas para fins terapêuticos. Em conclusão, sesquiterpenos presentes no óleo essencial de Copaifera langsdorffii Desf representam uma promissora fonte de obtenção de 
compostos terapêuticos para utilização contra o novo coronavírus e seus potenciais danos à saúde 
humana.

Files

CONCAF_FINAL_COPAIBA.pdf

Files (1.5 MB)

Name Size Download all
md5:99a393f4269ab7096fadf25b9a59bdac
1.5 MB Preview Download