Метагеном крови в норме и при псориазе.

Проведена обзорно-аналитическая оценка результатов основных работ по изучению метагенома крови в норме и при псориазе, а также по определению концентрации бактериальной ДНК в цельной крови здоровых людей. В дополнении дано детальное сравнение характеристик 16S-теста и WMS-теста.

Одной из главных целей данного обзора является выявление недостатков и ошибок, допущенных в изучаемых работах. Подчеркнута принципиальная важность определения суммарной концентрации бактериальной ДНК для сравнения метагеномов пациентов и здоровых людей, а также при сравнении метагеномов пациентов между собой.

Не менее важным является контроль уровня и состава контаминации. Отсутствие качественного контроля контаминации на всех шагах проводимых исследований  существенно снижают достоверность полученных результатов. 

Данный обзор представляет собой первую попытку проанализировать и систематизировать результаты исследований метагенома крови, количество которых существенно выросло в течение последних нескольких лет. 

Обзор выполнен в рамках подготовки к выполнению проекта по комплексному  изучению метагеномов цельной крови и биоптатов кожи у больных псориазом.

Дополнения к статье:

S1. Сравнительные характеристики 16S и WMS-тестов;

S2. Ресурсы по метагеномным исследованиям и секвенированию.

S3. YN-модель патогенеза псориаза. Частичное описание.

Версия данного препринта на английском языке (препринт и дополнения в одном файле):
https://doi.org/10.5281/zenodo.3370203