mappingAS v1.0.0
Authors/Creators
Description
Métricas de distribuição geográfica (EOO/AOO) e conversão de habitat (MapBiomas) para avaliação de espécies.
mappingAS é um pacote R, acompanhado de interface gráfica em Shiny, voltado à triagem do Critério B da Lista Vermelha da IUCN. O pacote executa as seguintes etapas:
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Importação dos dados de ocorrência. Lê registros a partir de planilhas (
.xlsx,.csv) e de arquivos vetoriais (.shp,.gpkg,.geojsonou.zip), com detecção automática das colunas de espécie, longitude e latitude. -
Cálculo das métricas de distribuição. Estima a Extensão de Ocorrência (EOO; minimum convex polygon) e a Área de Ocupação (AOO; grade de 2 km), ambas computadas em projeção equivalente (de áreas iguais) centrada nos dados, em conformidade com as diretrizes da IUCN.
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Quantificação da conversão de habitat. Calcula, para cada espécie e tanto na EOO quanto na AOO, o percentual de área convertida (antrópica) e o percentual de área natural remanescente, com base na coleção mais recente do MapBiomas (Coleção 10). O índice de conversão adota denominador terrestre —
convertido = antrópico / (antrópico + natural) × 100, com água e áreas não observadas excluídas por padrão — e o detalhamento por classe do MapBiomas é disponibilizado integralmente. -
Série temporal da cobertura. Gera a evolução da composição da cobertura (percentual de área por ano) no interior da EOO/AOO, em formato análogo aos gráficos de cobertura e uso da terra do MapBiomas.
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Aplicação interativa (Shiny). Disponibiliza uma interface para visualização cartográfica, consulta a tabelas e gráficos e exportação dos resultados (CSV, shapefile/GeoPackage).
Nota. As categorias de risco geradas são provisórias e destinam-se exclusivamente à triagem, uma vez que se baseiam apenas nos limiares de tamanho de EOO e AOO. Elas não substituem uma avaliação formal da IUCN, que requer também a análise das condições de fragmentação, declínio e flutuação (subcritérios a, b e c).
Documentação
Inclui documentação das funções (man/), vinheta com tutorial passo a passo (vignette("mappingAS")) e workflow de checagem automática (R CMD check) no GitHub Actions.
Instalação
# install.packages("remotes")
remotes::install_github("lucasbarreirageo/mappingAS")
Observações
- As categorias de risco são provisórias e servem apenas para triagem — não substituem uma avaliação formal da IUCN.
- Os resultados de conversão dependem da acurácia do MapBiomas, que varia por classe, bioma e ano.
Files
lucasbarreirageo/geoConvBR-v1.0.0.zip
Files
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md5:c76ab523994cfe550b42bf5020ad8eba
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Additional details
Related works
- Is supplement to
- Software: https://github.com/lucasbarreirageo/mappingAS/tree/v1.0.0 (URL)
Software
- Repository URL
- https://github.com/lucasbarreirageo/mappingAS