TABLE 2 in Revalidation of the two upogebiid mud shrimp species, Upogebia foresti Ngoc-Ho, 1989 and Upogebia rupicola Komai, 2005, removed from the synonymy of Upogebia carinicauda (Stimpson, 1860) (Decapoda: Gebiidea)

Komai, Tomoyuki; Fujita, Yoshihisa

doi:10.5281/zenodo.19696780

Published March 4, 2026 | Version v1

Dataset Open

TABLE 2 in Revalidation of the two upogebiid mud shrimp species, Upogebia foresti Ngoc-Ho, 1989 and Upogebia rupicola Komai, 2005, removed from the synonymy of Upogebia carinicauda (Stimpson, 1860) (Decapoda: Gebiidea)

1. Natural History Museum and Institute, Chiba, 955 - 2 Aoba-cho, Chuo-ku, Chiba 260 - 8682, Japan
2. Okinawa Prefectural University of Arts, 1 - 4 Shuri-Tounokura, Naha, Okinawa 903 - 8602, Japan

TABLE 2. Pairwise genetic divergences of the mitochondrial COI gene among 23 species of Upogebia (26 sequences) based on the Kimura 2-parameter model. The rate variation among sites was modeled with a gamma distribution (shape parameter = 1). All ambiguous positions were removed for each sequence pair (pairwise deletion option). There were a total of 657 positions in the final dataset.

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25
1. Upogebia carinicauda (CBM-ZC 10292)
2. Upogebia carinicauda (CBM-ZC 11653)	0.0062
3. Upogebia carinicauda (AB771735)	0.0047	0.0047
4. Upogebia foresti (CBM-ZC 18136)	0.1156	0.1178	0.1187
5. Upogebia foresti (CBM-ZC 18137)	0.1114	0.1136	0.1187	0.0077
6. Upogebia rupicola (CBM-ZC 9841)	0.1028	0.1028	0.1061	0.0883	0.0864
7. Upogebia affinis	0.1982	0.2008	0.2098	0.2035	0.2011	0.1886
8. Upogebia africana	0.1829	0.1797	0.1963	0.1892	0.1892	0.1890	0.1770
9. Upogebia bowerbankii	0.1940	0.1940	0.2049	0.2168	0.2170	0.2043	0.2101	0.1556
10. Upogebia brasiliensis	0.1922	0.1896	0.1985	0.1715	0.1717	0.1668	0.1114	0.1768	0.1984
11. Upogebia corallifora	0.2080	0.2051	0.2297	0.2021	0.1993	0.1886	0.1330	0.2124	0.2074	0.1088
12. Upogebia deltaura	0.1988	0.1963	0.2203	0.1889	0.1866	0.1771	0.1840	0.1480	0.1935	0.1527	0.2108
13. Upogebia iriomotensis	0.1800	0.1764	0.1877	0.2181	0.2264	0.2065	0.2160	0.2068	0.2696	0.2329	0.2393	0.2409
14. Upogebia issaeffi	0.2237	0.2158	0.2217	0.2194	0.2117	0.1976	0.2227	0.2485	0.1825	0.1982	0.1773	0.2090	0.2443
15. Upogebia major	0.2053	0.2001	0.2058	0.1821	0.1847	0.1875	0.1622	0.2003	0.1944	0.1496	0.1640	0.1756	0.2524	0.1352
16. Upogebia miyakei	0.1854	0.1889	0.1976	0.2064	0.2064	0.2100	0.2394	0.1980	0.2291	0.2353	0.2430	0.1890	0.2191	0.2322	0.2297
17. Upogebia noronhensis	0.2085	0.2059	0.2205	0.2032	0.2088	0.1986	0.1741	0.2363	0.2164	0.1380	0.1283	0.2120	0.2271	0.2177	0.1824	0.2473
18. Upogebia paraffinis	0.1965	0.1965	0.2176	0.1970	0.1972	0.1796	0.0540	0.1870	0.2257	0.1156	0.1433	0.1700	0.2237	0.2081	0.1488	0.2245	0.1738
19. Upogebia omissa	0.1836	0.1863	0.1980	0.1725	0.1727	0.1572	0.1298	0.1984	0.1967	0.1147	0.1200	0.1702	0.2192	0.2126	0.1820	0.2205	0.1494	0.1391
20. Upogebia pugettensis	0.1954	0.1954	0.2141	0.1749	0.1774	0.1684	0.1606	0.1742	0.1866	0.1338	0.1448	0.1592	0.2237	0.1288	0.0856	0.2102	0.1809	0.1383	0.1657
21. Upogebia pusilla	0.2095	0.2069	0.2487	0.1891	0.1868	0.2038	0.2123	0.1707	0.2251	0.1696	0.2046	0.1527	0.2547	0.2420	0.1905	0.1996	0.2219	0.1859	0.2077	0.1756
22. Upogebia sakaii	0.2271	0.2357	0.2314	0.1874	0.1874	0.2187	0.2677	0.1913	0.2408	0.2276	0.2487	0.2031	0.2085	0.2421	0.2208	0.1986	0.2355	0.2442	0.2265	0.1989	0.2189
23. Upogebia snelliusi	0.1706	0.1636	0.1666	0.1571	0.1571	0.1600	0.1935	0.1833	0.1926	0.1803	0.2078	0.1588	0.1705	0.2052	0.1767	0.1858	0.2110	0.1825	0.1819	0.1657	0.2207	0.1834
24. Upogebia spinidactylus	0.2308	0.2390	0.2391	0.1987	0.1987	0.2085	0.2213	0.1865	0.1935	0.1689	0.2154	0.2243	0.1786	0.2014	0.1803	0.1958	0.2324	0.2029	0.2037	0.1627	0.2131	0.1799	0.1646
25. Upogebia stellata	0.2732	0.2766	0.3127	0.2605	0.2633	0.2753	0.2781	0.2615	0.2655	0.2618	0.3006	0.2357	0.2632	0.3116	0.2958	0.3094	0.3108	0.2773	0.2876	0.2637	0.2785	0.2859	0.3078	0.3098
26. Upogebia yokoyai	0.2075	0.1997	0.2130	0.1773	0.1750	0.1801	0.1694	0.1442	0.1874	0.1627	0.1814	0.1703	0.2195	0.1719	0.1429	0.2026	0.2017	0.1705	0.1601	0.1279	0.1703	0.2147	0.1790	0.1760	0.3079

......continued on the next page

Notes

Published as part of Komai, Tomoyuki & Fujita, Yoshihisa, 2026, Revalidation of the two upogebiid mud shrimp species, Upogebia foresti Ngoc-Ho, 1989 and Upogebia rupicola Komai, 2005, removed from the synonymy of Upogebia carinicauda (Stimpson, 1860) (Decapoda: Gebiidea), pp. 358-359 in Zootaxa 5763 (3) on page 358, DOI: 10.11646/zootaxa.5763.3.3, http://zenodo.org/record/19191562

Files

Files (9.5 kB)

Name	Size	Download all
table.html md5:2c0fb8ac887cf30d2125a53b099b33da	9.5 kB	Download

System files (26.9 kB)

Name	Size	Download all
application/vnd.plazi.v1+xml md5:9afa0ee0c4d17cea5028f38de0515f47	26.9 kB	Download

Additional details

URL: http://table.plazi.org/id/DF23A0EEFFC2FFC9FF33B7E8DB759C0C

Is part of: Journal article: 10.11646/zootaxa.5763.3.3 (DOI); Journal article: urn:lsid:plazi.org:pub:FFCC3908FFCBFFC0FFA4B60AD9289E48 (LSID); Journal article: http://publication.plazi.org/id/FFCC3908FFCBFFC0FFA4B60AD9289E48 (URL); Journal article: http://zenodo.org/record/19191562 (URL); Journal article: http://zoobank.org/0596B759-7B71-4A66-9458-5335373B4DAC (URL)

	All versions	This version
Views	10	10
Downloads	0	0
Data volume	0 Bytes	0 Bytes

Biodiversity Literature Repository

Biodiversity Literature Repository

Files (9.5 kB)

System files (26.9 kB)

Identifiers

Related works

About

Funded by

Biodiversity Literature Repository

Biodiversity Literature Repository

Liberated Data

TABLE 2 in Revalidation of the two upogebiid mud shrimp species, Upogebia foresti Ngoc-Ho, 1989 and Upogebia rupicola Komai, 2005, removed from the synonymy of Upogebia carinicauda (Stimpson, 1860) (Decapoda: Gebiidea)

Authors/Creators

Description

Notes

Files

Files (9.5 kB)

System files (26.9 kB)

Additional details

Identifiers

Related works