Published January 1, 2022
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IN SILICO STUDIES OF DITERPENES EXTRACTED FROM Paubrasilia echinata Lam. AND DERIVATIVES AGAINST HIV-1 INTEGRASE AND REVERSE TRANSCRIPTASE
Description
Introduction: HIV whose viral multiplication is associated with three enzymes. Reverse transcriptase is responsible for synthesizing vital DNA based on its RNA; integrase is responsible for integrating viral DNA into human DNA; and protease is responsible for cleaving the genetic code into smaller functional units. Many research groups around the world are motivated by the proposal of a new bioactive against HIV. Objectives: To propose natural diterpenes or synthetic products from the Pau-Brasil plant species against HIV through in silico techniques. Methods: Diterpenes found in the ethanolic extract of Pau-Brasil (Paubrasilia echinata Lam.) were used as well as some of their products that were known by computational means. The work was developed through a hybrid screening (ligand-based and structure-based) for a possible biological activity of these phytoconstituents against the main enzymes of HIV-1 multiplication. Results: Computational assays showed that the compounds ALX04 and ALX07 showed possible activity against HIV-integrase and reverse transcriptase proteins respectively. No compound was simultaneously active against the two enzymes (HIV-integrase and reverse transcriptase) and all other compounds proved inactive. Discussion: Diterpenes found in the ethanolic extract of Pau-Brasil (Paubrasilia echinata Lam.) were used and some results were obtained through computational methods. The work was developed to achieve a viable observable activity to the tested prediction models. Conclusions: Computational assays showed that the diterpenes ALX04 and ALX07 had promising assays of retroviral activity.
--- Resumo ---
Introdução: O HIV é um retrovírus cuja multiplicação viral está associada a três enzimas. A transcriptase reversa, responsável por sintetizar o DNA vital com base em seu RNA; a integrase, responsável por integrar o DNA viral ao DNA humano; e uma protease responsável pela clivagem do código genético em unidade menores e funcional. Muitos grupos de pesquisas pelo mundo estão motivados na proposta de novos bioativos contra o HIV. Objetivos: Propor diterpenos naturais ou produtos sintéticos da espécie de planta Pau-Brasil frente ao vírus HIV por meio de técnicas in silico. Métodos: Foram utilizados diterpenos encontrados no extrato etanólico do Pau-Brasil (Paubrasilia echinata Lam.), assim como alguns produtos dos mesmos que foram avaliados por meios computacionais. O trabalho foi desenvolvido através de uma triagem hibrida (ligand based e structure based) para uma possível atividade biológica desses fitoconstituintes frente às enzimas principais da multiplicação do HIV-1. Resultados: Os ensaios computacionais apontaram que os compostos ALX04 e ALX07 apresentaram possível atividade frente as proteínas HIV-integrase e transcriptase reversa, respectivamente. Nenhum composto foi ativo simultaneamente frente as duas enzimas (HIV-integrase e transcriptase reversa), e todos os demais compostos demonstraram-se inativos. Discussão: Foram utilizados os diterpenos encontrados no extrato etanólico do Pau-Brasil (Paubrasilia echinata Lam.), assim como alguns derivados, onde foram avaliados através dos métodos computacionais. O trabalho foi desenvolvido por meio de uma seleção híbrida (e baseada e estruturada) realizada para apontar uma atividade viável observável. aos modelos de predição testadas. Conclusões: Os ensaios computacionais apontaram os diterpenos ALX04 e ALX07 apresentaram promissora atividade retroviral.
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