Position paper on cooperation between NFDI and de.NBI & ELIXIR-DE
Authors/Creators
- Barysch, Sina (Editor)1
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Buchhalter, Ivo
(Editor)2
- Dammann-Kalinowski, Tanja (Editor)3
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Goesmann, Alexander
(Editor)4
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Grüning, Björn
(Editor)5
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Jünemann, Sebastian
(Editor)3
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Krüger, Jens
(Editor)6
- Kummer, Ursula (Editor)7
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Lawerenz, Chris
(Editor)8
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Sczyrba, Alexander
(Editor)9, 3
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Wagener, Harald
(Editor)10
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Hoffmann, Nils
(Editor)3
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Kohlbacher, Oliver
(Editor)6
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German Network for Bioinformatics Infrastructure – de.NBI
(Contact person)
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1.
European Molecular Biology Laboratory
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2.
German Cancer Research Center
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3.
Forschungszentrum Jülich
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4.
University of Giessen
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5.
University of Freiburg
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6.
University of Tübingen
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7.
Heidelberg University
- 8. Steinbeis-Transferzentrum Health Data
- 9. Universität Bielefeld
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10.
Berlin Institute of Health at Charité - Universitätsmedizin Berlin
Description
Summary
de.NBI & ELIXIR-DE are central pillars of the German research data infrastructure and, with the de.NBI cloud, offer cloud-based services, storage solutions, and resources for scientific research and education. They support scientific work with computing power, data management, and security, especially for sensitive data such as human genome data. However, they face challenges: Long-term financing of hardware and personnel is crucial to meet the associated, ever-growing demands. In addition, there is a lack of needs-based services, including for long-term data archiving, which will have to be coordinated in the future with other infrastructures such as the National High Performance Computing Network (NHR) and other actors, e.g., within the European Open Science Cloud (EOSC). The increasing demand for powerful GPUs for AI and HPC requires continuous investment, often at the expense of renewing existing systems. At the same time, the development of secure working environments (SPE/TRE) is necessary to comply with EU and national guidelines and to protect sensitive data.
Cooperation with the National Research Data Infrastructure (NFDI) and the National High Performance Computing Network is crucial: The de.NBI Cloud is closely linked to the NFDI consortia and has been supporting them in the development and operation of sustainable research data infrastructures from the very beginning. The NHR provides the NFDI consortia with HPC infrastructures for use in AI, HPC, and data applications. Closer cooperation between NFDI, NHR, and de.NBI Cloud would not only improve the integration of technologies in the transition area between cloud, HPC, and AI, but also offer a sustainable and needs-based option for integrated research data management, even across disciplines.
Strategically, de.NBI & ELIXIR-DE with the de.NBI Cloud are key players within the EOSC Federation and for the national EOSC node in Germany. Their further development requires sustainable funding, technological adaptation, and close cooperation with NFDI, NHR, and European initiatives to ensure Germany's research competitiveness and independence. Only in this way can research continue to work with state-of-the-art technology and under secure conditions in the long term.
Abstract (German)
Zusammenfassung
de.NBI & ELIXIR-DE sind zentrale Säulen der deutschen Forschungsdateninfrastruktur und bieten mit der de.NBI-Cloud cloudbasierte Dienste, Speicherlösungen sowie Ressourcen für die wissenschaftliche Forschung und Ausbildung an. Sie unterstützen die wissenschaftliche Arbeit durch Rechenleistung, Datenverwaltung und Sicherheit, insbesondere bei sensiblen Daten wie humanen Genomdaten. Doch sie stehen vor Herausforderungen: Die langfristige Finanzierung von Hardware und Personal ist entscheidend, um die damit einhergehenden, stetig wachsenden Anforderungen zu bewältigen. Zudem fehlen bedarfsgerechte Dienste, unter anderem für die langfristige Datenarchivierung, die künftig mit anderen Infrastrukturen wie dem Nationalen Hochleistungsrechenverbund (NHR) und anderen Akteuren, z.B. innerhalb der European Open Science Cloud (EOSC) koordiniert werden müssen. Die steigende Nachfrage nach leistungsstarken GPUs für KI und HPC erfordert kontinuierliche Investitionen, die oft auf Kosten der Erneuerung von Bestandssystemen gehen. Gleichzeitig ist die Entwicklung sicherer Arbeitsumgebungen (SPE/TRE) notwendig, um EU- und nationale Richtlinien zu erfüllen und sensible Daten zu schützen.
Die Zusammenarbeit mit der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) und dem Verbund Nationales Hochleistungsrechnen ist entscheidend: Die de.NBI-Cloud ist eng mit den NFDI-Konsortien verknüpft und unterstützt diese bereits bei Entwicklung und Betrieb nachhaltiger Forschungsdateninfrastrukturen von Beginn an. Der NHR stellt den NFDI Konsortien HPC-Infrastrukturen zur Nutzung für KI, HPC und Datenanwendungen bereit. Eine engere Kooperation zwischen NFDI, NHR und de.NBI-Cloud würde neben einer besseren Integration von Technologien im Übergangsbereich zwischen Cloud, HPC und KI eine nachhaltige und bedarfsgerechte Möglichkeit für ein integriertes Forschungsdatenmanagement, auch über Fachdisziplinen hinaus bieten.
Strategisch sind de.NBI & ELIXIR-DE mit der de.NBI-Cloud Schlüsselakteure innerhalb der EOSC-Föderation und für den nationalen EOSC-Knoten in Deutschland. Ihre Weiterentwicklung erfordert nachhaltige Finanzierung, technologische Anpassung und enge Kooperationen mit NFDI, NHR und europäischen Initiativen, um die Forschungswettbewerbsfähigkeit und Unabhängigkeit Deutschlands zu sichern. Nur so kann die Forschung langfristig auf modernster Technologie und unter sicheren Bedingungen arbeiten.
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- Translated title (German)
- Positionspapier zur Kooperation von NFDI und de.NBI & ELIXIR-DE