Taller: Análisis de datos de metilación del TCGA-LUAD

Este repositorio contiene el material práctico, código y flujos de trabajo para el taller de análisis de datos epigenéticos utilizando R y Bioconductor. Nos centraremos en datos de Adenocarcinoma de Pulmón (LUAD) provenientes del programa The Cancer Genome Atlas (TCGA).

Al finalizar este taller, los participantes serán capaces de realizar un flujo de trabajo completo de análisis bioinformático, incluyendo:

• Adquisición de Datos: Descarga y manipulación de datos de microarreglos de metilación (Illumina 450K) específicos del proyecto TCGA-LUAD, enfocándonos exclusivamente en muestras pareadas (mismo paciente).
• Anotación y Filtrado: Identificación y selección de sondas CpG situadas estratégicamente en regiones promotoras de genes candidatos de interés.
• Análisis Comparativo: Evaluación de diferencias de metilación entre tejido tumoral y tejido normal adyacente.
• Estadística y Visualización: Ejecución de pruebas de hipótesis pertinentes y generación de visualizaciones de alto impacto (Boxplots, Heatmaps, etc.) para interpretar los resultados.