Published December 31, 2020
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Conception d'un outil de traitement des données "Codes pathologie"
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Manon, Laine, Pierre, Elie, Sophie, De Lavergne, Résumé (2020): Conception d'un outil de traitement des données "Codes pathologie". Cybium 44 (3), DOI: 10.26028/cybium/2020-443-018, URL: http://dx.doi.org/10.26028/cybium/2020-443-018
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- urn:lsid:plazi.org:pub:FC54FFEBFFE0531BFF98FFD0FFB79F66
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- Le suivi de l'etat de sante des poissons est reconnu comme un outil pertinent de l'etude des milieux dans lesquels ces derniers evoluent. Neanmoins, cet indicateur n'est a ce jour peu ou pas integre dans les diverses etudes menees en France. Malgre la formation de nombreux gestionnaires a l'outil "Codes pathologie" (Elie et Girard, 2014), sa mise en application concrete se heurte au traitement des donnees qui reste un obstacle pour leur valorisation.
- Depuis 2010, la FDAAPPMA 33 a integre l'outil "Codes pathologie" a son reseau departemental d'inventaire piscicole et a rencontre des difficultes operationnelles. Pour y pallier, elle a travaille, avec l'ASPS (Association Sante Poissons Sauvages), sur la mise en oeuvre de methodologies associees. Ce travail s'est concretise par la realisation de l' Atlas de l'etat de sante des poissons de Gironde (Laine et al., 2018) ainsi que par le suivi approfondi de l'etat de sante des poissons sur deux bassins versants (Laine et al., 2016 ; Laine et Elie, 2020).
- Pour permettre a tous de beneficier de cette experience et faci- liter la prise en compte de l'etat de sante des poissons, la FDAAPPMA 33 et l'ASPS ont cree un guide methodologique. Il a vocation a fournir l'ensemble des elements methodologiques et techniques necessaires a l'application des "Codes pathologie". Il accompagne les agents dans la recolte des donnees, en reprenant les bases de l'outil "Codes pathologie" et en fournissant les methodes disponibles. Il permet le traitement automatique et l'analyse des donnees, via un tableur, et presente le cheminement des differentes analyses et d'interpretation (Elie et Laine, 2019).