Observation de la Terre pour la modélisation du paludisme : une boîte à outils pratique pour la prédiction par satellite de la distribution des moustiques à l'aide de Google Earth Engine et de R

Ce guide de l'utilisateur fournit une introduction qui se veut aussi conviviale que possible à la mise en œuvre de l'analyse par satellite et de la modélisation Random forest (Forêt aléatoire) pour identifier les principales variables biogéographiques qui influencent la distribution et l'abondance des moustiques dans le contexte des études sur le paludisme. Il se veut une ressource pour les utilisateurs ayant des connaissances préalables limitées sur les analyses de cette nature et présente des instructions étape par étape pour que les utilisateurs puissent effectuer une modélisation prédictive des distributions géographiques de moustiques ; des exemples de jeux de données et de scripts d'analyse sont fournis.

Ce guide utilise trois logiciels, Google Earth Engine, R (avec RStudio) et QGIS pour le prétraitement, la modélisation et la visualisation des données, qui sont tous gratuits pour un usage non commercial. Des exemples de scripts sont fournis pour effectuer le traitement et l'analyse des données à la fois dans Google Earth Engine (GEE) et dans R. Bien que ces scripts soient conçus pour automatiser l'analyse dans une large mesure, ils sont actuellement optimisés pour la zone d'étude et la période de temps de l'exemple fourni de Lodja, en République démocratique du Congo. Les utilisateurs sont libres de les adapter et de les développer en fonction de leurs propres besoins. En suivant les instructions, l'utilisateur apprendra à mettre en œuvre ces méthodes. Il disposera ainsi d'une base lui permettant de les appliquer à différents ensembles de données, zones et scénarios de son choix.