Chemotion ELN Erklärvideos

Chemotion ELN Erklärvideos

Chemotion^[1] ist ein Open-Source-System für die Speicherung und Verwaltung von Experimenten und Moleküldaten in der Chemie und deren angrenzenden Wissenschaften. Dabei besteht das System hauptsächlich aus zwei Komponenten: dem elektronischen Laborjournal (electronic laboratory notebook, ELN) Chemotion ELN^[2] zur Eintragung und Auswertung von Experimenten und deren Analytik-Daten und dem Chemotion-Repositorium^[3,4] zur Veröffentlichung dieser. Durch die Verknüpfung des ELNs mit dem Repositorium können Einträge einfach aus dem Laborbuch transferiert werden. Daten werden inklusive ihrer maschinenlesbaren Metadaten in dem Repositorium unter Open-Access-Bedingungen veröffentlicht und erfüllen somit die FAIR-Data-Prinzipien (findable, accessible, interoperable, reusable).^[5] Diese dienen als Grundlage für nachhaltiges Datenmanagement im Rahmen der guten wissenschaftlichen Praxis.^[6]

Zur Nutzung von Chemotion und zur Erläuterung der grundlegenden Funktionen haben wir Erklärvideos erstellt, die Neulingen den Einstieg in das ELN erleichtern sollen. Diese Videos umfassen wichtige Themen von der Erstellung von Molekülen, über die Auswertung von Analytik-Daten, bis hin zum Teilen von Einträgen. Die Videos sind dabei in verschiedene Themenblöcke aufgeteilt und befassen sich jeweils mit konkreten Funktionen. Die Struktur der Themenblöcke und Videos können dem PDF-Dokument in diesem Zenodo-Eintrag entnommen werden. Wir bitten zu beachten, dass grau hinterlegte Videos in diesem Dokument erst in späteren Versionen des Eintrags zur Verfügung stehen werden.

Chemotion ELN Erklärvideos auf YouTube

Die Erklärvideos gibt es zusätzlich auch auf Chemotions YouTube Channel: https://www.youtube.com/playlist?list=PL1AonKd9WAd8n8YPXxMaGLQ5ad8PdR3OC

Danksagung

Die Autoren danken Nicole Jung für weiterführende Erklärungen zu den Funktionen von Chemotion und die Hilfe bei der Erstellung und Überarbeitung der Videos. Weiterhin danken die Autoren Anna Manukânc für die Hilfe bei der konzeptionellen Entwicklung der Videos.

Literatur

[1]            Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023).

[2]            Tremouilhac, P., Nguyen, A., Huang, Y.-C., Kotov, S., Lütjohann, D. S., Hübsch, F., Jung, N., Bräse, S., J. Cheminform. 2017, 9, 54.

[3]            Tremouilhac, P., Lin, C.-L., Huang, P.-C., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Ulrich, R., Neumair, B., Streit, A., Bräse, S., Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 22771-22778; Angew. Chem. 2020, 132, 22960-22968.

[4]            Tremouilhac, P., Huang, P.-C., Lin, C.-L., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Bräse, S., Chemistry–Methods 2021, 1, 8-11.

[5]            Wilkinson, M. D., Dumontier, M., Aalbersberg, I. J., Appleton, G., Axton, M., Baak, A., Blomberg, N., Boiten, J.-W., da Silva Santos, L. B., Bourne, P. E., Bouwman, J., Brookes, A. J., Clark, T., Crosas, M., Dillo, I., Dumon, O., Edmunds, S., Evelo, C. T., Finkers, R., Gonzalez-Beltran, A., Gray, A. J. G., Groth, P., Goble, C., Grethe, J. S., Heringa, J., ’t Hoen, P. A. C., Hooft, R., Kuhn, T., Kok, R., Kok, J., Lusher, S. J., Martone, M. E., Mons, A., Packer, A. L., Persson, B., Rocca-Serra, P., Roos, M., van Schaik, R., Sansone, S.-A., Schultes, E., Sengstag, T., Slater, T., Strawn, G., Swertz, M. A., Thompson, M., van der Lei, J., van Mulligen, E., Velterop, J., Waagmeester, A., Wittenburg, P., Wolstencroft, K., Zhao, J., Mons, B., Sci. Data 2016, 3, 160018.

[6]            Deutsche Forschungsgemeinschaft. Guidelines for Safeguarding Good Research Practice. Code of Conduct. 2019, https://doi.org/10.5281/zenodo.3923602.

Nützliche Links

Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023).

Chemotion ELN Documentation. https://chemotion.net/docs/eln/ (accessed 02/19/2023).

Chemotion Repository. https://www.chemotion-repository.net/welcome (accessed 03/14/2022).

Molecule Archive of the Compound Platform. https://compound-platform.eu/home (accessed 03/14/2022).