Digitization of the historical Herbarium of Giovanni Giannini at Pisa (PI-GIANN)
Authors/Creators
- 1. Botanic Garden and Museum, University of Pisa, Pisa, Italy
- 2. Department of Biology, University of Pisa, Pisa, Italy
- 3. Botanic Garden and Museum, University of Pisa, Pisa, Italy|Department of Biology, University of Pisa, Pisa, Italy
Description
The herbarium digitization aligns with global efforts to modernise natural collection data and facilitate broad reuse. In this framework, the Herbarium of Giovanni Giannini (1793–1871) conserved in the Herbarium of the University of Pisa (international code PI) was digitized. The Herbarium is composed by 25 packages of plants, algae, fungi, and lichens. Metadata were entered into the online database Virtual Herbaria JACQ and mirrored into a personalized virtual Herbarium of the Botanic Museum. After the completion of the digitization process, the number of specimens preserved in the Herbarium amounts to 1,314. Besides Giannini, who collected 98.5% of the specimens, four other collectors are represented: Benedetto Puccinelli, Lorenzo Chiostri, Pietro Savi, and Attilio Tassi. Most specimens were collected in Tuscany in the province of Lucca (72%). Based on specimens conserved in PI-GIANN, Centaurea phrygia subsp. pseudophrygia should be considered as at least historically occurring in Tuscany, while Euphrasia officinalis subsp. kerneri is newly recorded as historically occurring in the province of Lucca. The digitization and revision of PI-GIANN herbarium provide a re-evaluation of a historically important collection, preserving valuable historical occurrences, including several Italian endemic, alien, threatened, or locally extinct species.
Files
IB_article_182950.pdf
Files
(4.6 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:ce0c0e3ae5d63114ec2ed10456cd6b98
|
4.5 MB | Preview Download |
|
md5:2c2ce36d0ebdddd67db9f999d756e939
|
84.7 kB | Preview Download |
Linked records
Additional details
References
- Alessandrini A, Delfini L, Ferrari P, Fiandri F, Gualmini M, Lodesani U, Santini C (2010) Flora del Modenese. Censimento, Analisi, Tutela. Provincia di Modena, Istituto per i Beni Culturali della Regione Emilia-Romagna, 415 pp.
- Angiolini C (2001) Il pattern di distribuzione di Santolina etrusca (Lacaita) Marchi et D'Amato. Informatore Botanico Italiano 33(2): 351–357.
- APG IV (2016) An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV. Botanical Journal of the Linnean Society 181(1): 1–20. https://doi.org/10.1111/boj.12385
- Arrigoni PV, Ferretti G, Nepi C (2016) Flora del Prato Fiorito (Bagni di Lucca, Toscana). Annali del Museo Civico di Rovereto, Sezione Archeologia, Storia, Scienze Naturali 31(2015): 169–245.
- Astuti G, Amadei L, Maccioni S, Peruzzi L (2019) Il nucleo originario dell'Herbarium Horti Botanici Pisani: le tracce di Gaetano Savi. Notiziario della Società Botanica Italiana 3(2): 235.
- Baldini R, Maccioni S, Del Guerra R, Bedini G (2010) Globularia incanescens Viv. nel promontorio del Caprione (Liguria orientale). Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Memorie, serie B 117: 1–6. https://doi.org/10.2424/ASTSN.M.2010.10
- Bartolucci F, Peruzzi L, Galasso G, Alessandrini A, Ardenghi NMG, Bacchetta G, Banfi E, Barberis G, Bernardo L, Bouvet, Bovio M, Calvia G, Castello M, Cecchi L, Del Guacchio E, Domina G, Fascetti S, Gallo L, Gottschlich G, Guarino R, Gubellini L, Hofmann N, Iberite M, Jiménez-Mejías P, Longo D, Marchetti D, Martini F, Masina RR, Medagli P, Peccenini S, Prosser F, Roma-Marzio F, Rosati L, Santangelo A, Scoppola A, Selvaggi A, Selvi F, Soldano A, Stinca A, Wagensommer RP, Wilhalm T, Conti F (2024) A second update to the checklist of the vascular flora native to Italy. Plant Biosystems 158(2): 219–296. https://doi.org/10.1080/11263504.2024.2320126
- Bertoloni A (1833–1854) Flora Italica: sistens plantas in Italia et in insulis circumstantibus sponte nascentes. Tipografia Masi Bologna. https://doi.org/10.5962/bhl.title.6611
- Brancaleoni L, Nepi C, Gerdol R (2021) L'Erbario di Antonio Campana: una piacevole ed importante scoperta. Notiziario della Società Botanica Italiana 5(1): 51–54.
- Bräuchler C, Schuster TM, Vitek E, Rainer H (2021) The Department of Botany at the Natural History Museum Vienna (Herbarium W) – history, status, and a best practice guideline for usage and requests. Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien Series B 123: 297–322.
- Caruel T (1860–1864) Prodromo della Flora Toscana. Tipografia Le Monnier, Firenze.
- Caruel T (1872) Notizie. Nuovo Giornale Botanico Italiano 4: 238–240.
- Caruel T (1884–1894) Flora Italiana. Voll. 6–10, Tipografia Le Monnier, Firenze.
- Cecchi L, Nepi C, Roma‐Marzio F, Gerace S, Amadei L, Peruzzi L, Lastrucci L, Armeli Minicante S, Donatelli A, Stinca A, Esposito A, Santangelo A, Rosati L, Salerno G, Fascetti S, Chianese G, Licandro G, Marcucci R (2018) Erbari 5. Notiziario della Società Botanica Italiana 2(2): 217–223.
- Christenhusz MJM, Reveal JL, Farjon A, Gardner MF, Mill RR, Chase MW (2011) A new classification and linear sequence of extant gymnosperms. Phytotaxa 19(1): 55–70. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.19.1.3
- Conti F, Bartolucci F, Bacchetta G, Pennesi R, Lakušić D, Niketić M (2021) A taxonomic revision of the Siler montanum group (Apiaceae) in Italy and the Balkan Peninsula. Willdenowia 51: 321–347. https://doi.org/10.3372/wi.51.51301
- Daru BH, Park DS, Primack RB, Willis CG, Barrington DS, Whitfeld TJS, Seidler TG, Sweeney PV, Foster DR, Ellison AM, Davis CC (2017) Widespread sampling biases in herbaria revealed from large-scale digitization. New Phytologist 217(2): 939–955. https://doi.org/10.1111/nph.14855
- Davis CC (2023) The Herbarium of the future. Trends in Ecology & Evolution 38(5): 412–423. https://doi.org/10.1016/j.tree.2022.11.015
- Domina G, Abeli T, Alessandrini A, Angiolini C, Argenti C, Astuti G, Bacchetta G, Bagella S, Ballelli S, Banfi E, Barberis G, Barone G, Bernardo L, Bertolli A, Bianchi E, Bonari G, Bouvet D, Bovio M, Briozzo I, Brullo C, Brullo S, Calvia G, Caria M, Caputo P, Caruso G, Casazza G, Cecchi L, Cibei C, Cogoni D, Conti F, Crisafulli A, Croce A, Dagnino D, Del Guacchio E, Di Gristina E, Di Marzio P, Fanfarillo E, Farris E, Fascetti S, Fenu G, Ferrando U, Ferretti G, Fiaschi T, Fortini P, Fois M, Franzoni J, Galasso G, Galesi R, Ganz C, Gargano D, Giacò A, Gianguzzi L, Giardini M, Giusso del Galdo G, Guarino R, Gubellini L, Hofmann N, Iamonico D, Iberite M, Laface V, Lallai A, Lastrucci L, Lavezzo P, Lazzaro L, Longo D, Lucchese F, Maiorca G, Manca M, Marchetti D, Marsili S, Martini F, Mascia F, Medagli P, Mondello F, Montagnani C, Mugnai M, Musarella C, Nicolella G, Orsenigo S, Passalacqua N, Peccenini S, Pennesi R, Peruzzi L, Picone R, Pinzani L, Podda L, Prosser F, Rivieccio G, Roma-Marzio F, Rosati L, Salerno G, Santangelo A, Sciandrello S, Selvaggi A, Selvi F, Spampinato G, Stinca A, Tardella F, Tavilla G, Tilia A, Tondi G, Tognon G, Urbani M, Villani M, Wilhalm T, Zappa E, Bartolucci F (2025) Refining the inventory of the vascular flora of Italy: Unconfirmed, doubtful, excluded or extinct taxa. Phytotaxa 723(1): 1–137. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.723.1.1
- Ellwood ER, Dunckel BA, Flemons P, Guralnick R, Nelson G, Newman G, Newman S, Paul D, Riccardi G, Rios N, Seltmann KC, Mast AR (2015) Accelerating the digitization of biodiversity research specimens through online public participation. BioScience 65(4): 383–396. https://doi.org/10.1093/biosci/biv005
- Fascetti S, Adurno M, Potenza G, Rosati L (2020) L'erbario dimenticato di Orazio Gavioli, botanico potentino. Notiziario della Società Botanica Italiana 4(1): 1–4.
- Ferretti G, Canini M, Viciani D (2023) Il manoscritto "Catalogo di piante alpine colle precise loro località" di Giovanni Giannini, botanico toscano del XIX secolo: trascrizione, aggiornamento nomenclaturale e indagine d'erbario su alcune piante critiche o di interesse fitogeografico. Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Memorie, serie B, 130: 53–58.
- Fiaschi T, Fanfarillo E, Cannucci S, Bonini I, Grifoni L, Loppi S, Maccherini S, Ravera S, Manganelli G, Barbato D, Angiolini C (2025) Biagio Bartalini's Herbarium: an insight into the flora of Siena and its surroundings (Italy) during the eighteenth century. Rendiconti Lincei, Scienze Fisiche e Naturali 36: 1029–1041. https://doi.org/10.1007/s12210-025-01343-3
- Galasso G, Conti F, Peruzzi L, Alessandrini A, Ardenghi NMG, Bacchetta G, Banfi E, Barberis G, Bernardo L, Bouvet D, Bovio M, Castello M, Cecchi L, Del Guacchio E, Domina G, Fascetti S, Gallo L, Guarino R, Gubellini L, Guiggi A, Hofmann N, Iberite M, Jiménez Mejías P, Longo D, Marchetti D, Martini F, Masin RR, Medagli P, Musarella CM, Peccenini S, Podda L, Prosser F, Roma-Marzio F, Rosati L, Santangelo A, Scoppola A, Selvaggi A, Selvi F, Soldano A, Stinca A, Wagensommer RP, Wilhalm T, Bartolucci F (2024) A second update to the checklist of the vascular flora alien to Italy. Plant Biosystems 158(2): 297–340. https://doi.org/10.1080/11263504.2024.2320129
- Gargano ML, Domina G, Venturella G (2018) The neglected herbarium of Emanuele Taranto Rosso (Sicily, 1801–1887). Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Memorie, serie B 125: 49–54.
- Gennai M, Angiolini C, Bedini G, Bertacchi A, Carta A, Fanfarillo E, Ferretti G, Fiaschi T, Gabellini A, Gestri G, Lazzaro L, Lazzeri V, Mugnai M, Olivieri F, Peruzzi L, Pinzani L, Sarmati S, Selvi F, Viciani D, Foggi, B (2025) A novel method for plant species conservation prioritisation at a local scale: the IDEA protocol and beyond. Environmental and Sustainability Indicators 28: 101026. https://doi.org/10.1016/j.indic.2025.101026
- Giannessi F, Olivero D (2019) Contributi di Gaetano Savi all'Erbario Giannini. In: Peruzzi L (ed) Giornata celebrativa per il 250° anniversario della nascita di Gaetano Savi, Pisa. Mini lavori della Riunione scientifica del Gruppo di Lavoro per la Floristica, Sistematica ed Evoluzione Sezione Toscana. Notiziario della Società Botanica Italiana 3: 10– 11.
- Heberling JM, Prather LA, Tonsor SJ (2019) The changing uses of herbarium data in an era of global change: an overview using automated content analysis. BioScience 69(10): 812–822. https://doi.org/10.1093/biosci/biz094
- Hedrick BP, Heberling JM, Meineke EK, Turner KG, Grassa CJ, Park DS, Kennedy J, Clarke JA, Cook JA, Blackburn DC, Edwards SV, Davis CC (2020) Digitization and the Future of Natural History Collections. BioScience 70(3): 243–251. https://doi.org/10.1093/biosci/biz163
- James SA, Soltis PS, Belbin L, Chapman AD, Nelson G, Paul DL, Collins M (2018) Herbarium data: Global biodiversity and societal botanical needs for novel research. Applications in Plant Sciences 6(2): e1024. https://doi.org/10.1002/aps3.1024
- Marín-Rodulfo M, Rondinel-Mendoza KV, Martín-Girela I, Cañadas EM, Lorite J (2024) Old meets new: innovative and evolving uses of herbaria over time as revealed by a literature review. Plants People Planet 6: 1261–1271. https://doi.org/10.1002/ppp3.10541
- Martelli U (1931) Notizie sugli erbari del Dott. Giovanni Giannini (1793–1871). Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Processi Verbali 40(3): 44–46.
- Martellos S, Bartolucci F, Conti F, Galasso G, Moro A, Pennesi R, Peruzzi L, Pittao E, Nimis PL (2020) FlorItaly – the portal to the Flora of Italy. Phytokeys 156: 55–71. https://doi.org/10.3897/phytokeys.156.54023
- Maccioni S, Baldini R, Roma-Marzio F (2022) "Scelta di piante spontanee toscane": due erbari rilegati conservati nel Museo Botanico pisano. Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Memorie, serie B 129: 5–10.
- Marconi G (2021) L'erbario De Rozan della Biblioteca Classense di Ravenna. Notiziario della Società Botanica Italiana 5(1): 59–66.
- Meineke EK, Davies TJ, Daru BH, Davis CC (2019) Biological collections for understanding biodiversity in the Anthropocene. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 374(1763): 20170386. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0386
- Moraldo B, Ricceri C, Fiorini G, Demaria G (2011) Viola ferrarinii (Violaceae), a new species from the northern Apennines (Italy). Webbia 66(1): 45–55. https://doi.org/10.1080/00837792.2011.10670884
- Nardi E (2016) Il genere Aquilegia L. (Ranunculaceae) in Italia. The genus Aquilegia L. (Ranunculaceae) in Italy. Aquilegiarum Italicarum in Europaearum Conspectu Descriptio. Polistampa: Firenze, Italy, 688 pp.
- Nic Lughadha E, Walker BE, Canteiro C, Chadburn H, Davis AP, Hargreaves S, Lucas EJ, Schuiteman A, Williams E, Bachman SP, Baines D, Barker A, Budden AP, Carretero J, Clarkson JJ, Roberts A, Rivers MC (2019) The use and misuse of herbarium specimens in evaluating plant extinction risks. Philosophical Transactions of the Royal Society, B: Biological Sciences 374: 20170402. https://doi.org/10.1098/rstb.2017.0402
- Orsenigo S, Fenu G, Gargano D, Montagnani C, Abeli T, Alessandrini A, Bacchetta G, Bartolucci F, Carta A, Castello M, Cogoni D, Conti F, Domina G, Foggi B, Gennai M, Gigante D, Iberite M, Peruzzi L, Pinna MS, Prosser F, Santangelo A, Selvaggi A, Stinca A, Villani M, Wagensommer RP, Tartaglini N, Duprè E, Blasi C, Rossi G (2020) Red list of threatened vascular plant species in Italy. Plant Biosystems 155(2): 310–335. https://doi.org/10.1080/11263504.2020.1739165
- Parlatore F (1848–1875) Flora Italiana. Voll. 1–5, Tipografia Le Monnier, Firenze.
- Peruzzi L (2023) Botanici italiani – Cinque secoli di Botanica in 280 biografie. ETS, Pisa, 168 pp.
- Peruzzi L, Bedini G (2015 onwards) Wikiplantbase #Toscana v.2.1. http://bot.biologia.unipi.it/wpb/toscana/index.html [Accessed 11 December 2025]
- Peruzzi L, Gestri G (2013) A new butterwort species (Pinguicula, Lentibulariaceae) from Northern Apennine (Italy). Plant Biosystems 147: 692–703. https://doi.org/10.1080/11263504.2012.756073
- Peruzzi L, Conti F, Bartolucci F (2014) An inventory of vascular plants endemic to Italy. Phytotaxa 168(1): 1–75. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.168.1.1
- Peruzzi L, Roma-Marzio F, Pinzani L, Bedini G (2019) [onwards] Wikiplantbase #Italia. http://bot.biologia.unipi.it/wpb/italia/index.html [Accessed 3 December 2025]
- Peruzzi L, Dolci D, De Giorgi P, Giacò A, Chiarucci A (2026) Climate change associated with local extinction in peripheral populations of the threatened Italian endemic plant Santolina etrusca (Asteraceae). Environmental Conservation 53. [in press]
- Pierini B, Peruzzi L (2014) Prodromo della flora vascolare della Provincia di Lucca (Toscana nord-occidentale). Informatore Botanico Italiano 46(1): 3–16. [+ electronic appendix] [500 pp]
- Pierini B, Peruzzi L (2025) The vascular flora of the Apuan Alps (Tuscany, central Italy). Italian Botanist 19: 45–63. https://doi.org/10.3897/italianbotanist.19.145947
- Pignatti S, Guarino R, La Rosa M (2017a) Flora d'Italia 1, Ed. 2. New Business Media, Milano, 1064 pp.
- Pignatti S, Guarino R, La Rosa M (2017b) Flora d'Italia 2, Ed. 2. New Business Media, Milano, 1178 pp.
- Pignatti S, Guarino R, La Rosa M (2018) Flora d'Italia 3, Ed. 2. New Business Media: Milano, 1286 pp.
- Pignatti S, Guarino R, La Rosa M (2019) Flora d'Italia 4, Ed. 2. New Business Media, Milano, 1200 pp.
- Portal to the Flora of Italy (2025) Portal to the Flora of Italy. http:/dryades.units.it/floritaly [Accessed: 19/11/2025]
- POWO (2025) Plants of the World Online. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. https://powo.science.kew.org/ [Accessed: 24/11/2025]
- PPG I (2016) A community-derived classification for extant lycophytes and ferns. Journal of Systematics and Evolution 54(6): 563–603. https://doi.org/10.1111/jse.12229
- Puccinelli B (1841) Synopsis plantarum in agro lucensi sponte nascentium. Typis Bertinianis, Lucca.
- Reiner-Drehwald ME, Hörandl E, Appelhans MS (2022) Digitization of the historical Herrenhausen Herbarium at Göttingen (GOET), with special focus on plants collected in Switzerland in 1820. Taxon 71(3): 650– 673. https://doi.org/10.1002/tax.12660
- Romagnoli P, Foggi B (2005) Vascular Flora of the upper Sestaione Valley (NW-Tuscany, Italy). Flora Mediterranea 15: 225–305.
- Roma‐Marzio F, D'Antraccoli M, Astuti G, Maccioni S, Amadei L, Peruzzi L (2018) Typification of the names in Trifolium described by Gaetano Savi. Taxon 67(2): 411–421. https://doi.org/10.12705/672.10
- Roma-Marzio F, Amadei L, Dolci D, Maccioni S, Vangelisti R, Peruzzi L (2020) La digitalizzazione dell'Herbarium Horti Botanici Pisani: Stato dell'arte e prospettive future. Notiziario della Società Botanica Italiana 4(2): 181– 182.
- Roma-Marzio F, Maccioni S, Dolci D, Astuti G, Magrini N, Pierotti F, Vangelisti R, Amadei L, Peruzzi L (2023) Digitization of the historical Herbarium of Michele Guadagno at Pisa (PI-GUAD). PhytoKeys 234: 107–125. https://doi.org/10.3897/phytokeys.234.109464
- Rossi G, Montagnani C, Gargano D, Peruzzi L, Abeli T, Ravera S, Cogoni A, Fenu G, Magrini S, Gennai M, Foggi B, Wagensommer RP, Venturella G, Blasi C, Raimondo FM, Orsenigo S (2013) Lista Rossa della Flora Italiana. 1. Policy species e altre specie minacciate. Comitato Italiano IUCN e Ministero dell'Ambiente e della Tutela del Territorio e del Mare, 1–54.
- Rossi G, Orsenigo S, Gargano D, Montagnani C, Peruzzi L, Fenu G, Abeli T, Alessandrini A, Astuti G, Bacchetta G, Bartolucci F, Bernardo L, Bovio M, Brullo S, Carta A, Castello M, Cogoni D, Conti F, Domina G, Foggi B, Gennai M, Gigante D, Iberite M, Lasen C, Magrini S, Nicolella G, Pinna MS, Poggio L, Prosser F, Santangelo A, Selvaggi A, Stinca A, Tartaglini N, Troìa A, Villani MC, Wagensommer RP, Wilhalm T, Blasi C (2020) Lista Rossa della Flora Italiana. 2 Endemiti e altre specie minacciate. Ministero dell'Ambiente e della Tutela del Territorio e del Mare, 1– 94.
- Sweeney PW, Starly B, Morris PJ, Xu Y, Jones A, Radhakrishnan S, Grassa CJ, Davis CC (2018) Large-scale digitization of herbarium specimens: development and usage of an automated, high-throughput conveyor system. Taxon 67: 165–178. https://doi.org/10.12705/671.10
- Thiers BM (2020 onwards) Index Herbariorum: A Global Directory of Public Herbaria and Associated Staff. New York Botanical Garden's Virtual Herbarium. http://sweetgum.nybg.org/science/ih/ [Accessed 19 November 2025]
- Thiers BM (2024) Strengthening partnerships to safeguard the future of Herbaria. Diversity 16(1): 36. https://doi.org/10.3390/d16010036
- Tomei PE (2015) Un erbario della seconda metà del XVII secolo conservato presso l'Orto Botanico di Lucca. Paralleli e Meridiani 11–12: 41–86.
- Tomei PE, Riva S (1998) L'Erbario di Giovanni Giannini conservato presso il Dipartimento di Scienze Botaniche dell'università di Pisa. S. Marco litotipo Editore, Lucca.
- Tomei PE, Trimarchi S (2022) Un erbario sulla flora pisana del 1883. Inter Nos 5: 75–141. https://doi.org/10.12871/97888333963612
- Vangelisti R, Roma-Marzio F, Maccioni S (2025) Il registro manoscritto dell'erbario di Teodoro Caruel (1830–1898) conservato nel Museo Botanico Pisano. Atti della Società Toscana di Scienze Naturali, Memorie, serie B 132: 69–75.
- Vannini L (1937) La pineta di Viareggio. Contributo storico e botanico. Tipografia A. Pietrini, Viareggio.