SPITZ TUMOR DATASET Project: Artificial-Intelligence-based combined analysis of epigenetic data and whole slide digitized images of ambiguous melanocytic tumors for accurate diagnostic and prognostic classification

Published March 31, 2025 | Version 1

Dataset Open

El dataset recoge datos datos clínico-patológicos y epigenéticos de un set de tumores de Spitz.

Se integra por ficheros de datos epigenéticos y un fichero de datos tabulares con las siguientes características:

Hay dos tipos de ficheros de datos epigenéticos, ambos son ficheros FASTQ, que recogen datos de secuenciación. Unos recogen los datos de metilación del DNA de cada una de las posiciones CpG de todo el genoma para cada una de las muestras incluidas en el estudio tras su análisis por WGBS, y otros recogen los datos de abundancia de los diferentes miRNAs de cada una de las muestras, analizados por medio de la técnica ShortRNA-seq.
Los ficheros con los datos clínico-patológicos son ficheros de datos tabulares, tipo excel o csv, obtenidos a partir del sistema de información Orion Clinic. Se trata de datos alfanuméricos.

Files

Name	Size
15956_S1_L001_R1_001.fastq md5:2566199ba9222ade8382d5033ce899c4	1.0 GB	Download
Readme_PI20_00094.txt md5:3c89240424289efe237a9a0051fdedd5	5.1 kB	Preview Download
SPITZ DATABASE.xlsx md5:4325a8543f046d353b34e4ebc698acb5	269.4 kB	Download

Instituto de Salud Carlos III
Artificial-Intelligence-based combined analysis of epigenetic data and whole slide digitized images of ambiguous melanocytic tumors for accurate diagnostic and prognostic classification PI20/00094