Published May 7, 2024
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Dataset
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Dataset from "A user-friendly method to get automated pollen analysis from environmental samples". New Phytologist.
Authors/Creators
- 1. Institut des Sciences de l'Évolution de Montpellier (ISEM), Univ Montpellier, CNRS, IRD
Contributors
-
1.
Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
-
2.
Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
- 3. AMIS, Application des Mathématiques, Informatique et Statistique, Univ Paul-Valérie Montpellier 3
- 4. Centre Européen de Recherche et d'Enseignement en Géosciences de l'Environnement (CEREGE), Aix Marseille Université, CNRS, IRD, Coll. France, INRAE
- 5. HNHP, Histoire Naturelle de l'Homme Prehistorique, UMR 7194 CNRS, Museum national d'histoire Naturelle Institut de Paleontologie Humaine
- 6. Institut des Sciences de l'Évolution de Montpellier (ISEM), Univ Montpellier, CNRS, IRD
- 7. Institut de Recherche en Biologie Végétale, Département de Sciences Biologiques, Université de Montréal
Description
Dataset used in publication "A user-friendly method to get automated pollen analysis from environmental samples". New Phytologist.
This repository contains images from annual pollen trap samples mounted on slides and scanned under light microscopy; image annotation metadata; and the weights of the trained models from the YOLOv5 algorithm, saved after the last training epoch.
More details can be found in the README file.
Files
ANNOTATIONS.zip
Additional details
Related works
- Is metadata for
- Journal article: 10.1111/nph.19857 (DOI)
Funding
- Observatoire de Recherche Montpelliérain de l'Environnement OREME
- SO POLLIMED and SO POLLUMINE Service d'Observation
- Centre National de la Recherche Scientifique
- PEPS-CNRS DETECT to Céline Devaux PEPS-CNRS DETECT
- Université de Montpellier
- MUSE-UM to Odile Peyron and Céline Devaux MUSE-UM
- Then Try This
- HPC resources from GENCI-IDRIS Grant no.: 2023-(AD011013554R1)
Dates
- Other
-
2024-05-07