Supplementary Material JA6 . KEGG-based functional metabolic pathways annotated by Joint Pathway Analysis. Only KEGG OG annoted in CTRL group are used;;;;;
Pathway;Total;Expected;Hits;P value;FDR
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism;56;12,141;29;5,26E-07;4,42E-05
Pyruvate metabolism;45;9,7561;24;2,63E-06;0,00011058
Valine, leucine and isoleucine degradation;88;19,079;37;9,62E-06;0,0002159
Citrate cycle (TCA cycle);42;9,1057;22;1,03E-05;0,0002159
Glycolysis or Gluconeogenesis;61;13,225;28;1,72E-05;0,00028818
Glycine, serine and threonine metabolism;68;14,743;30;2,25E-05;0,00031487
Propanoate metabolism;48;10,407;23;4,24E-05;0,00050893
Butanoate metabolism;29;6,2873;16;7,61E-05;0,00079895
Aminoacyl-tRNA biosynthesis;74;16,043;29;0,00039659;0,0037015
beta-Alanine metabolism;44;9,5393;19;0,001024;0,0085365
Alanine, aspartate and glutamate metabolism;61;13,225;24;0,0011723;0,0085365
Glycerolipid metabolism;35;7,5881;16;0,0012195;0,0085365
Cysteine and methionine metabolism;71;15,393;26;0,0025209;0,016289
Ascorbate and aldarate metabolism;13;2,8184;7;0,010887;0,06532
Fructose and mannose metabolism;40;8,6721;15;0,015814;0,088557
Arginine biosynthesis;27;5,8537;11;0,019291;0,10128
Glutathione metabolism;56;12,141;19;0,022244;0,10555
Phenylalanine metabolism;21;4,5529;9;0,023511;0,10555
Lysine degradation;49;10,623;17;0,023875;0,10555
Riboflavin metabolism;9;1,9512;5;0,027188;0,11419
Histidine metabolism;32;6,9377;12;0,029588;0,11835
Pentose phosphate pathway;47;10,19;16;0,033395;0,12751
Arginine and proline metabolism;78;16,911;24;0,03655;0,13349
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism;79;17,127;24;0,042173;0,14497
Nitrogen metabolism;10;2,168;5;0,044872;0,14497
Synthesis and degradation of ketone bodies;10;2,168;5;0,044872;0,14497
Tryptophan metabolism;84;18,211;25;0,048675;0,15143
One carbon pool by folate;31;6,7209;11;0,054195;0,16259
Thiamine metabolism;14;3,0352;6;0,061672;0,17863
Starch and sucrose metabolism;43;9,3225;14;0,063999;0,1792
Pentose and glucuronate interconversions;32;6,9377;11;0,067085;0,18178
Sulfur metabolism;18;3,9025;7;0,073994;0,19424
Porphyrin and chlorophyll metabolism;53;11,491;16;0,091516;0,23295
Nicotinate and nicotinamide metabolism;42;9,1057;13;0,10287;0,25414
Ether lipid metabolism;39;8,4553;12;0,11861;0,28079
Galactose metabolism;51;11,057;15;0,12034;0,28079
Terpenoid backbone biosynthesis;36;7,8049;11;0,13702;0,31108
Glycerophospholipid metabolism;86;18,645;23;0,15227;0,33661
Drug metabolism - other enzymes;70;15,176;19;0,16348;0,35211
Neomycin, kanamycin and gentamicin biosynthesis;4;0,86721;2;0,20701;0,43137
Selenocompound metabolism;35;7,5881;10;0,21055;0,43137
Folate biosynthesis;61;13,225;16;0,23283;0,46566
Valine, leucine and isoleucine biosynthesis;12;2,6016;4;0,25147;0,49123
Linoleic acid metabolism;17;3,6857;5;0,30068;0,57403
Pantothenate and CoA biosynthesis;34;7,3713;9;0,30771;0,5744
alpha-Linolenic acid metabolism;22;4,7697;6;0,33716;0,61568
Phosphonate and phosphinate metabolism;10;2,168;3;0,37331;0,65329
D-Glutamine and D-glutamate metabolism;10;2,168;3;0,37331;0,65329
N-Glycan biosynthesis;77;16,694;18;0,4013;0,68794
Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis;11;2,3848;3;0,43837;0,72984
Retinol metabolism;47;10,19;11;0,44312;0,72984
Fatty acid degradation;102;22,114;23;0,45389;0,73321
Taurine and hypotaurine metabolism;16;3,4689;4;0,46903;0,74337
Sphingolipid metabolism;58;12,575;13;0,49788;0,77448
Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis;17;3,6857;4;0,52083;0,79546
Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate;18;3,9025;4;0,57011;0,85516
Arachidonic acid metabolism;81;17,561;17;0,60573;0,89266
D-Arginine and D-ornithine metabolism;6;1,3008;1;0,7696;1
Purine metabolism;166;35,989;32;0,80846;1
Vitamin B6 metabolism;21;4,5529;3;0,86583;1
Glycosaminoglycan degradation;44;9,5393;7;0,87164;1
Pyrimidine metabolism;99;21,464;17;0,89429;1
Fatty acid elongation;75;16,26;12;0,91635;1
Various types of N-glycan biosynthesis;36;7,8049;5;0,91746;1
Caffeine metabolism;19;4,1193;2;0,94042;1
Inositol phosphate metabolism;69;14,959;10;0,95277;1
Steroid biosynthesis;82;17,778;12;0,9616;1
Glycosphingolipid biosynthesis - globo and isoglobo series;31;6,7209;3;0,97743;1
Tyrosine metabolism;88;19,079;12;0,98148;1
Biotin metabolism;21;4,5529;1;0,99423;1
Phosphatidylinositol signaling system;74;16,043;7;0,99854;1
Primary bile acid biosynthesis;92;19,946;9;0,99932;1
Glycosphingolipid biosynthesis - ganglio series;47;10,19;2;0,99987;1
Biosynthesis of unsaturated fatty acids;47;10,19;1;0,99999;1
Glycosphingolipid biosynthesis - lacto and neolacto series;121;26,233;1;1;1
Drug metabolism - cytochrome P450;98;21,247;6;1;1
Metabolism of xenobiotics by cytochrome P450;145;31,436;8;1;1
Steroid hormone biosynthesis;199;43,144;11;1;1
Fatty acid biosynthesis;129;27,968;4;1;1