################################ ## Counts of transcripts, etc. ################################ Total trinity 'genes': 273517 Total trinity transcripts: 591627 Percent GC: 42.09 ######################################## Stats based on ALL transcript contigs: ######################################## Contig N10: 6545 Contig N20: 4357 Contig N30: 3228 Contig N40: 2397 Contig N50: 1777 Median contig length: 460 Average contig: 947.77 Total assembled bases: 560724842 ##################################################### ## Stats based on ONLY LONGEST ISOFORM per 'GENE': ##################################################### Contig N10: 4105 Contig N20: 2481 Contig N30: 1637 Contig N40: 1098 Contig N50: 760 Median contig length: 334 Average contig: 578.04 Total assembled bases: 158104067