Artifacts for Accelerating Computation of Steiner Trees on GPUs

This repository contains the version 1 code for the below journal paper.
Accelerating Computation of Steiner Trees on GPUs
Rajesh Pandian M · Rupesh Nasre · N.S. Narayanaswamy

Note: The latest Code is available at https://github.com/mrprajesh/gpuSteiner

Prerequisites
- CUDA 10.2
- GCC 7.3 with O3
- OGDF Installation https://ogdf.uos.de/

shipIJPP
├── 2approxCpu2.cpp                     CPU Code for KMB
├── cScript.sh                          Script to generate KMBCPU Time
├── CUDAMST.cu                        //MST Codes
├── CUDAMST.h                          //MST Codes
├── CUDAMST_kernel.cu            //MST Codes
├── gpuSteiner3_sk2_new0_2Dpull1.cu     1pull
├── gpuSteiner3_sk2_new0_2Dpull2.cu     2pull
├── gpuSteiner3_sk2_new0_2Dpull3.cu     3pull
├── gpuSteiner3_sk2_new0_2Dpull3_sh.cu  3pullShMem
├── gpuSteiner5-1.cu                    KMBGPU-OPT
├── gpuSteiner6-oddAgain.cu             double-barrel
├── kmb.cpp                             OGDF's KMB. Need to build OGFD a priori.
├── Makefile                            Compiles OGDF's KMB
├── ogdf.v2020.02.zip                   OGDF. Instruction to build https://github.com/ogdf/ogdf/blob/master/doc/build.md
├── optimize
│   ├── BellmanFord5.cu                 Edge-based
│   ├── BellmanFord6.cu                 Topology-driven TD
│   ├── BellmanFord7_DD2.cu             Data-driven DD
│   ├── BellmanFord7_warp.cu            Memoization
│   └── cScript.sh                      Script to run above 4 SSSP optimizations
├── pace2018Winner                      PACE 2018 winner of heuristic track https://github.com/HeathcliffAC/SteinerTreeProblem
│   ├── ***
│   ├── run.sh                          Script to run pacewinner code with 30m timeout
├── rCompare.sh                         Script file to compare 1pull,2pull,3pull,3pullShMem
├── Readme.txt                          This file
├── rScale.sh                           Script to run on Scalability instances GPU & CPU
├── tcRun.sh                            Script to run KMBGPU-OPT
├── tcJEA.sh                            Script to run OGDF KMB (i.e JEA's KMB)
├── tcScale                             Scalability instances
│   ├── Conv.cpp                        Converter from .gr to CSR format
│   ├── HR-edges-t1000.gr               instances in .gr and csr format
│   ├── HR-edges-t1000.gr.txt
│   ├── HR-edges-t1500.gr
│   ├── HR-edges-t1500.gr.txt
│   ├── HR-edges-t2000.gr
│   ├── HR-edges-t2000.gr.txt
│   ├── HR-edges-t2500.gr
│   ├── HR-edges-t2500.gr.txt
│   ├── HR-edges-t3000.gr
│   ├── HR-edges-t3000.gr.txt
│   ├── HR-edges-t3500.gr
│   ├── HR-edges-t3500.gr.txt
│   ├── HR-edges-t4000.gr
│   ├── HR-edges-t4000.gr.txt
│   ├── HR-edges-t4500.gr
│   ├── HR-edges-t4500.gr.txt
│   ├── HR-edges-t5000.gr
│   ├── HR-edges-t5000.gr.txt
│   ├── HR-edges-t500.gr
│   └── HR-edges-t500.gr.txt
└── tcSelected                        // Our Graph Suite instances
    ├── instance137.gr                // instances in .gr and csr format
    ├── instance137.gr.txt
    ├── instance163.gr
    ├── instance163.gr.txt
    ├── instance181.gr
    ├── instance181.gr.txt
    ├── instance183.gr
    ├── instance183.gr.txt
    ├── instance185.gr
    ├── instance185.gr.txt
    ├── instance187.gr
    ├── instance187.gr.txt
    ├── instance189.gr
    ├── instance189.gr.txt
    ├── instance191.gr
    ├── instance191.gr.txt
    ├── instance193.gr
    ├── instance193.gr.txt
    ├── instance195.gr
    ├── instance195.gr.txt
    ├── instance197.gr
    ├── instance197.gr.txt
    ├── zalin37.gr
    ├── zalin37.stp.txt
    ├── zalue7080.gr
    ├── zalue7080.stp.txt
    ├── zHR-edges-t3000.gr
    └── zHR-edges-t3000.gr.txt