Topologies contained within the 95% Highest Posterior Density (HPD) for each SNAPP subsample. Subsample 3 has 25 trees contained within the 95% HPD, and the first 20 are shown.

Subsample	Tree	Percentage	Tree topology
1	1	28.27%	((Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
1	2	25.62%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
1	3	18.52%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))))
1	4	5.00%	((Mobula mobular,((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
1	5	4.92%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
1	6	3.92%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species))
1	7	3.50%	((Mobula mobular,((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
1	8	3.47%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)))
1	9	2.87%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)))
2	1	19.55%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))))
2	2	19.35%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
2	3	13.17%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),Mobula mobular)
2	4	9.27%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
2	5	8.75%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)))
2	6	8.20%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species))
2	7	8.05%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)))
2	8	5.97%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)),Mobula mobular)
2	9	5.05%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)),Mobula mobular)
3	1	18.77%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))))
3	2	14.40%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
3	3	9.70%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),Mobula mobular)
3	4	9.25%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)))
3	5	7.72%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula mobular,((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)))
3	6	7.00%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
3	7	6.37%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species))
3	8	6.20%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)),Mobula mobular)
3	9	4.90%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)),Mobula mobular)
3	10	1.12%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
3	11	0.92%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),Mobula mobular),((Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
3	12	0.90%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),Mobula mobular),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
3	13	0.90%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
3	14	0.72%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
3	15	0.72%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),Mobula mobular)
3	16	0.70%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)),(Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
3	17	0.62%	(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),((Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),Mobula mobular)
3	18	0.57%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),Mobula mobular),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
3	19	0.55%	((((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),Mobula mobular),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))
3	20	0.52%	((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),((Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	1	23.95%	((Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	2	21.84%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
4	3	15.97%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))))
4	4	5.40%	((Mobula mobular,((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	5	5.30%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris))
4	6	4.82%	((Mobula mobular,((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	7	4.70%	((Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species))
4	8	3.57%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Undescribed species),Mobula birostris)))
4	9	2.85%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula alfredi,Mobula birostris),Undescribed species)))
4	10	1.37%	(((Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
4	11	1.12%	(((Mobula mobular,(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)))
4	12	0.75%	((Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))))
4	13	0.72%	((Mobula mobular,(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma))),((Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	14	0.70%	(Mobula mobular,((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),((Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species)),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))))
4	15	0.57%	(Mobula mobular,(((Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))))
4	16	0.52%	(((Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo)))
4	17	0.50%	(((Mobula mobular,(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)))
4	18	0.40%	(((Mobula mobular,(Mobula thurstoni,(Mobula kuhlii,Mobula eregoodoo))),(Mobula alfredi,(Mobula birostris,Undescribed species))),(Mobula tarapacana,(Mobula munkiana,Mobula hypostoma)))