# FLUX: JTT matrix
0.5733	
0.4764	0.5400	
0.6430	0.1727	5.0881	
0.7591	2.0833	0.5595	0.1481	
0.6333	4.6845	1.1600	0.5946	0.1865	
0.8811	0.3310	0.5908	7.0294	0.0783	4.1435	
1.0598	1.1031	0.5822	0.8406	0.6515	0.2353	0.8134	
0.2688	4.4410	4.7255	1.2178	1.2812	9.0860	0.2988	0.1865	
0.2160	0.1795	0.3423	0.0721	0.1902	0.0826	0.0831	0.0293	0.1315	
0.2805	0.4831	0.1362	0.0715	0.4010	1.0290	0.0971	0.0457	0.7171	1.7673	
0.2976	7.4716	2.7152	0.2415	0.1110	3.7962	1.7771	0.1870	0.5242	0.1474	0.1531	
0.5090	0.5641	0.3433	0.1544	0.5450	0.6196	0.1959	0.1075	0.4261	3.7273	4.7042	0.7169	
0.1209	0.0548	0.0978	0.0352	1.1726	0.0493	0.0465	0.0328	0.4416	0.5922	2.5711	0.0377	0.4495	
2.7351	1.4189	0.2567	0.2310	0.3681	3.5347	0.2930	0.2756	2.2208	0.1164	1.8497	0.3464	0.2925	0.2658	
4.2964	1.5613	6.9405	0.7324	4.7274	0.9209	0.3937	1.8611	1.1365	0.3753	0.8626	0.6251	0.4275	1.1597	6.2837	
3.3376	0.6116	1.9790	0.2916	0.5504	0.5478	0.2596	0.1889	0.4427	1.4212	0.2260	0.8468	2.0595	0.0935	1.6084	5.2416	
0.1831	3.4867	0.1976	0.0889	4.3642	0.5599	0.2349	0.9116	0.2230	0.1512	1.3609	0.2381	0.6333	1.1959	0.2368	1.1137	0.2361	
0.1018	0.2517	0.7864	0.4650	3.6076	0.3396	0.0748	0.0603	7.2638	0.2445	0.2857	0.0866	0.2160	5.5011	0.1795	0.9118	0.1879	1.8395	
1.9993	0.1551	0.1303	0.2272	0.7758	0.2051	0.3486	0.2569	0.1011	5.3226	1.5533	0.1099	2.8104	0.4613	0.2993	0.3987	0.7265	0.4696	0.1367	

0.0884	0.0438	0.0405	0.0543	0.0122	0.0307	0.0617	0.1034	0.0193	0.0750	0.0823	0.0578	0.0212	0.0417	0.0302	0.0506	0.0698	0.0059	0.0290	0.0823	
// end of data. The rest are notes
A	R	N	D	C	Q	E	G	H	I	L	K	M	F	P	S	T	W	Y	V	
0	10	4	3	17	2	1	6	19	13	5	7	14	15	12	8	11	18	16	9	
L= 316
P_mut:
0.0925	0.0454	0.0398	0.0535	0.0130	0.0312	0.0649	0.1047	0.0195	0.0692	0.0757	0.0594	0.0218	0.0409	0.0313	0.0496	0.0714	0.0062	0.0306	0.0793	
