TABLE 2. Pairwise genetic divergences of the mitochondrial COI gene among 23 species of Upogebia (26 sequences) based on the Kimura 2-parameter model. The rate variation among sites was modeled with a gamma distribution (shape parameter = 1). All ambiguous positions were removed for each sequence pair (pairwise deletion option). There were a total of 657 positions in the final dataset.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25
1. Upogebia carinicauda (CBM-ZC 10292)
......continued on the next page
2. Upogebia carinicauda (CBM-ZC 11653) 0.0062
3. Upogebia carinicauda (AB771735) 0.0047 0.0047
4. Upogebia foresti (CBM-ZC 18136) 0.1156 0.1178 0.1187
5. Upogebia foresti (CBM-ZC 18137) 0.1114 0.1136 0.1187 0.0077
6. Upogebia rupicola (CBM-ZC 9841) 0.1028 0.1028 0.1061 0.0883 0.0864
7. Upogebia affinis 0.1982 0.2008 0.2098 0.2035 0.2011 0.1886
8. Upogebia africana 0.1829 0.1797 0.1963 0.1892 0.1892 0.1890 0.1770
9. Upogebia bowerbankii 0.1940 0.1940 0.2049 0.2168 0.2170 0.2043 0.2101 0.1556
10. Upogebia brasiliensis 0.1922 0.1896 0.1985 0.1715 0.1717 0.1668 0.1114 0.1768 0.1984
11. Upogebia corallifora 0.2080 0.2051 0.2297 0.2021 0.1993 0.1886 0.1330 0.2124 0.2074 0.1088
12. Upogebia deltaura 0.1988 0.1963 0.2203 0.1889 0.1866 0.1771 0.1840 0.1480 0.1935 0.1527 0.2108
13. Upogebia iriomotensis 0.1800 0.1764 0.1877 0.2181 0.2264 0.2065 0.2160 0.2068 0.2696 0.2329 0.2393 0.2409
14. Upogebia issaeffi 0.2237 0.2158 0.2217 0.2194 0.2117 0.1976 0.2227 0.2485 0.1825 0.1982 0.1773 0.2090 0.2443
15. Upogebia major 0.2053 0.2001 0.2058 0.1821 0.1847 0.1875 0.1622 0.2003 0.1944 0.1496 0.1640 0.1756 0.2524 0.1352
16. Upogebia miyakei 0.1854 0.1889 0.1976 0.2064 0.2064 0.2100 0.2394 0.1980 0.2291 0.2353 0.2430 0.1890 0.2191 0.2322 0.2297
17. Upogebia noronhensis 0.2085 0.2059 0.2205 0.2032 0.2088 0.1986 0.1741 0.2363 0.2164 0.1380 0.1283 0.2120 0.2271 0.2177 0.1824 0.2473
18. Upogebia paraffinis 0.1965 0.1965 0.2176 0.1970 0.1972 0.1796 0.0540 0.1870 0.2257 0.1156 0.1433 0.1700 0.2237 0.2081 0.1488 0.2245 0.1738
19. Upogebia omissa 0.1836 0.1863 0.1980 0.1725 0.1727 0.1572 0.1298 0.1984 0.1967 0.1147 0.1200 0.1702 0.2192 0.2126 0.1820 0.2205 0.1494 0.1391
20. Upogebia pugettensis 0.1954 0.1954 0.2141 0.1749 0.1774 0.1684 0.1606 0.1742 0.1866 0.1338 0.1448 0.1592 0.2237 0.1288 0.0856 0.2102 0.1809 0.1383 0.1657
21. Upogebia pusilla 0.2095 0.2069 0.2487 0.1891 0.1868 0.2038 0.2123 0.1707 0.2251 0.1696 0.2046 0.1527 0.2547 0.2420 0.1905 0.1996 0.2219 0.1859 0.2077 0.1756
22. Upogebia sakaii 0.2271 0.2357 0.2314 0.1874 0.1874 0.2187 0.2677 0.1913 0.2408 0.2276 0.2487 0.2031 0.2085 0.2421 0.2208 0.1986 0.2355 0.2442 0.2265 0.1989 0.2189
23. Upogebia snelliusi 0.1706 0.1636 0.1666 0.1571 0.1571 0.1600 0.1935 0.1833 0.1926 0.1803 0.2078 0.1588 0.1705 0.2052 0.1767 0.1858 0.2110 0.1825 0.1819 0.1657 0.2207 0.1834
24. Upogebia spinidactylus 0.2308 0.2390 0.2391 0.1987 0.1987 0.2085 0.2213 0.1865 0.1935 0.1689 0.2154 0.2243 0.1786 0.2014 0.1803 0.1958 0.2324 0.2029 0.2037 0.1627 0.2131 0.1799 0.1646
25. Upogebia stellata 0.2732 0.2766 0.3127 0.2605 0.2633 0.2753 0.2781 0.2615 0.2655 0.2618 0.3006 0.2357 0.2632 0.3116 0.2958 0.3094 0.3108 0.2773 0.2876 0.2637 0.2785 0.2859 0.3078 0.3098
26. Upogebia yokoyai 0.2075 0.1997 0.2130 0.1773 0.1750 0.1801 0.1694 0.1442 0.1874 0.1627 0.1814 0.1703 0.2195 0.1719 0.1429 0.2026 0.2017 0.1705 0.1601 0.1279 0.1703 0.2147 0.1790 0.1760 0.3079