>KP317952.1 Human respiratory syncytial virus isolate Kilifi_9465_6_RSVB_2010, complete genome atcgacattgtgtttcaaaattgcataagttttggtcttagcttgatgtcag-ttgtgga acaattcac-----------atcaagctaagaccaaaacttatgaattt-t-----gaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactaaaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >JX576762.1 Human respiratory syncytial virus strain 02-000467 from Netherlands, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcgttgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacagacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctattcaagtccaaccccc-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--gaaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggtgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >JX576757.1 Human respiratory syncytial virus strain 05-004042 from Netherlands, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >JX576753.1 Human respiratory syncytial virus strain 06-036027 from Netherlands, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacagaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattactatttt--agttaatat ----aaaaccacatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccatgataacaatattgtagtggaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaatggattgaattgacacattgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacaccgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggtgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >JX576729.1 Human respiratory syncytial virus strain BE/5133/08 from Belgium, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaatggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >JX576748.1 Human respiratory syncytial virus strain 07-038682 from Netherlands, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattctccaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cctctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcaccctt-gaaaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaatggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatgtaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgagg cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KF826859.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/ITA/131/2009, complete genome ----------------------------------------------------------aa aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgttatttaagtctaacctat-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaatggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--gaaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgcga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KF826860.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/ITA/135/2009, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------aacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaatggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgcga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >MG839545.1 Human orthopneumovirus isolate HRSV/B/BuenosAires/ARG/014/2016, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acwa----------caaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctacttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcgttagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattgtgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU950509.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10221/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------g----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >LC530050.1 Human respiratory syncytial virus A sugckmmaht NGO3 viral cRNA, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------caatcagaaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagcatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KU950544.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10438/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KU950505.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10651/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KP317945.1 Human respiratory syncytial virus isolate Kilifi_9465_8_RSVB_2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaaa--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactaaaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctaaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgcatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aattcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >KU950548.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10530/2014, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaggtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU950582.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10391/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttaattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------aacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KU950698.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10454/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgattaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttgtacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacaccgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacacactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KX765962.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV50/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctgaccctt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KC731482.1 Human respiratory syncytial virus strain RSV-A/NIV1114046/11, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KU950569.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10307/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagtagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgttcattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cctctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KX765975.2 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV82/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacgatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaagtatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaattaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactgagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >KU950549.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10630/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >LC384998.1 Human respiratory syncytial virus B TB5_CA-15-0741_1 viral cRNA, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaccgataacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU950496.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10648/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-gaaaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aattcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >LC474531.1 Human orthopneumovirus RSV/B/Sendai/631/13 viral cRNA, nearly complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaactaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatggacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cctctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KJ643465.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9376/2013, complete genome ----------tttttttggtttac----------------gcaagtttgttgtacgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------ >KU950504.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10388/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU950586.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10181/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgcttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcataaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >LC474556.1 Human orthopneumovirus RSV/A/NIID/2347/14 viral cRNA, nearly complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------g--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ ---------------------------------------ttgcacacgc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aaatcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >KX765894.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV84/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactccc-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaattaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaattaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KX765925.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV13/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgttc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcaaccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-------------------------------------------------------cgaaa aaaaatggt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaattcgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcagctagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KX765887.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV05/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaatc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagcagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaatc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagcagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtataaa 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------------------------------ >KX765951.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV15/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaatc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagcagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccccaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KX765914.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV03/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaatc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagcagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >LC474537.1 Human orthopneumovirus RSV/B/Sendai/906/15 viral cRNA, nearly complete genome ------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtttgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >GU591763.1 Human respiratory syncytial virus isolate RSV-6, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcataaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactccc-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacccacaatgataatacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccgttgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt 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------------------------------ >MH447960.1 Human respiratory syncytial virus A isolate TH/B23964/2017, complete genome ----------------------------------------------------------aa aaaattggt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaactcgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatgaacacaacacacaatgatacaaaaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >GU591760.1 Human respiratory syncytial virus isolate RSV-3, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcataaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactccc-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacccacaatgataatacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccgttgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt 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------------------------------ >KY982516.1 Human respiratory syncytial virus A strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_76/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------c--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >MH447954.1 Human respiratory syncytial virus A isolate TH/CB135/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -------gt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgacccg accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >MK749879.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/NIC/IIIn_15_0220_01NT/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------aaaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga 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------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------gaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--agaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaccaacaacaccaccatgcaaagactgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaacaataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagcaccaaatacaag 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------------------------------ >JQ901455.1 Human respiratory syncytial virus isolate 02-017863, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaattcaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgctacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccagaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccta accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagatatcataacacacagattt 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-----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgttcgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaacggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaatcataataaatatcaactaacaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacgacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatctctaaccagagacatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaattatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >KU950671.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10344/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >MK109783.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/JOR/B1748/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------aat -------g-gggcaa-ataagaacttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattggccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcgtcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccatcatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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B/WI/629-DC1/08-09, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------acactc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgtcctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt 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VN-369-6/10, complete genome -----------------------------------------------------acgggaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaannnnn -------n-nggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattttccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagaccataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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VN-824-9/10, complete genome -----------------------------------------------------acgggaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcagctatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccgcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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VN-356-6/10, complete genome -----------------------------------------------------acgggaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattttccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagaccataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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VN-816-8/10, complete genome -----------------------------------------------------acgggaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattttccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagaccataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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VN-794-7/10, complete genome -----------------------------------------------------acgggaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcataaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgttc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaccaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagacatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaacggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaactcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa actatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacggacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcactttccccatgcctatatttatcaatcat 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RSV572, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaggtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------ >JX015493.1 Human respiratory syncytial virus isolate 08-000507, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaggtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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isolate TOp-12-061, complete genome -----------------------------------------------------acgcgaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtacatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaactatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacaccgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggtgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KU950506.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10532/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------aacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagcatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcctaataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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RSVB/Homo sapiens/NIC/IIIn_15_0353_01NT/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt cataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt 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5S4, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tttatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacagaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aattcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccacgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >KJ643497.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9418/2013, complete genome ---------------------------------------------------------gaa aaaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------ >KF973325.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V7342/2002, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------caa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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RSVA/Homo sapiens/ARG/190/2007, complete genome -----------------------------------------------------------a aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagcatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggcaacattt 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ttatatgtatattaactaaactac--gag-atattagtttttgacac------------- ------------------------------ >KF826850.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/629-11-1/2008, complete genome -----------------------------------------------------------a aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagcatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga 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RSVB/Homo sapiens/NIC/IIIn_15_0261_01NT/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcgtcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt 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-----------------------------------------------------------a aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttgagtttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaagcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaaggtaaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtattacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaactagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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RSVB/Homo sapiens/NIC/IIIn_15_0268_01NT/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt 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-----------------------------------------------------------a aaaatgcgt-----------acta----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaactatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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------------------------------ >MN630088.1 Human respiratory syncytial virus A isolate RSVA/USA/UAMS-DID-002/2016, complete genome ------------------------------------------------------------ ------cgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aaccaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacattc-a-gaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgttatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggagatggggcaaata----aactcacctaatcagtcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggaatcaataataacatctctcaccaaagaaatcataacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaaa 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------------------------------ >KU316097.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/78G-099-01/1978, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacattc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgttatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgtattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaacggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtttaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttgcttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggagatggggcaaata----aactcacctaatcagtcaa accatgagcgctacaaatgacaacactactatgcaaagactgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggaatcaataataacatctctcaccaaagaaatcataacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacattc-g-gaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgttatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggagatggggcaaata----aactcacctaatcagtcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggaatcaataataacatctctcaccaaagaaatcataacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctactttt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaaa 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------------------------------ >MK749903.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/NIC/IIIn_15_0349_01NT/2015, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------aat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga 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RSVB/Homo sapiens/USA/MCRSV_208/1980, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcacattc-g-gaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgttatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattgaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggagatggggcaaata----aactcacctaatcagtcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggaatcaataataacatctctcaccaaagaaatcataacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt 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------------------------------ >KU316175.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/85I-049A-01-01/1985, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcacattc-g-aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagtcatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--agaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgaagaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatgggggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagtaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcaaccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggctacattt acatttctggttaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KJ627277.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/PER/FPP00548/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagattaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >MF001042.1 Human respiratory syncytial virus B strain 6A6, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------------------------------gtgctatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KX765927.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV73/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaacctct-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaaatgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacgaacgataacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KJ627705.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8484/2001, complete genome ------------------------------------------------------------ --------------------acta----------caatattat-------------tatt -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtacatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatac ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KJ672465.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_13/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgtgtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggtaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcatcacacataaattt 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------------------------------ >KM042386.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_49/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagctgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaaatgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttaattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KX765890.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV72/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcataaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcaccacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------cacttaaatttaattcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KY418148.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/SN1/XXXX, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------ataaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactccc-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacccacaatgataatacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccgttgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgataaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattc atattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KJ627317.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/PER/FLU5625/2007, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagactgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggactcaacaataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtaggaagtaccaaatacaag aaatactctgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KJ672432.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_72/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattacaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KJ672473.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/LA2_24/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagactgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggactcaacaataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagactgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggactcaacaataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtaggaagtaccaaatacaag aaatactctgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KU839623.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH-23/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttaattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttaattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KU839631.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH-31/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag 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-----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtaagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KU839641.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH-36/2014, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KU950625.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/TH_10243/2014, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctatcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattggccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtaggaagcaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KX655655.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/JOR/B1011/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattactatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacataaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KX765907.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV25/2014, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctatcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgactatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatcttcattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccagagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggaacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KX765963.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/NZL/LJRSV90/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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tc-att-ttg-atctaggaagaataagttt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaatt-------------------------------------- ------------------------------ >KX894806.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_00074P/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattacaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca 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------------------------------ >MH279547.1 Human respiratory syncytial virus A strain LZ170020448/17, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------a----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattaagcatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttgactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactgacaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccgttatcgcttgagactataataacatccctaaccagagatatcataacacataaattt 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattggccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtaggaagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >MK109784.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/JOR/A0689/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattggccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KJ643525.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9456/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ----cgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-----------------------------------tatttaagtctaatcttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactga tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctatcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatactctgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >MG027862.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8392/2003, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------atatttttat--------------g -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaataaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KJ643534.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9471/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----gcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttgatt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcggtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccact--agttaatat ----aaaacttaacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca actatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagatatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacatta acattcctggtcaactatgaaatgaaactattacacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttctttgaatgcattggcattaagcctacaaagcacactccaataatatacaag 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------------------------------ >KF973323.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V7339/2002, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ---------gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtggttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccgccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaactcgatgagagacaagctacattc acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacatactcctataatatacaaa 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------------------------------ >MN108242.1 UNVERIFIED: Human orthopneumovirus strain 318587_R1.fastq.gz/USA, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------anttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattaacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacggcaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcactgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaattaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacgcattgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactgagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactaagctgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcactgacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacatagattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtaagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactacgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcaccaaatacaaa aaatatactgaatataacacaaaatatggtactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctactaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >MH383066.1 Human respiratory syncytial virus A isolate JF204, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------t -------g-gggcaa-gtaagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagcatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaaccaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agtcaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KU950595.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10313/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KU950498.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_11187/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttgatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KJ643563.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9513/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ --------------------acta----------caatattat-------------tatt -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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---------------------------------------ttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccatttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat 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SC1053, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------a----------caaacttgcgtaaacc--aagaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagcagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaactatctgaactacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacataagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtataaa 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacataatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccgttatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtggggagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >MK534510.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Novosibirsk/50Hl/2018, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ----atggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatatacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KJ643520.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9448/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------ata--ttattatt -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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--------------------------gataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataacaaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >JF920058.1 Human respiratory syncytial virus strain A/WI/629-17/06-07, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaactttacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgactaactatatgaatcaattgtctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattacaataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccctt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >MF001040.1 Human respiratory syncytial virus B strain 6A10, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------c agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacagaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttggacttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aattcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccacgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU950528.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10217/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------acttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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--------------a-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggtatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaacggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaactcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa actatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacggacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcactttccccatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacacactcctataatatacaaa 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------------------------------ >MK167035.1 Human respiratory syncytial virus A strain 8L8, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------a----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt cgagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattacaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacagaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca atcatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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tc-att-ttg-atctaggaagaataagttt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaact-------------------------------------- ------------------------------ >KX655660.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/JOR/B1725/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggagttgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa 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------------------------------ >KJ643503.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9426/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ----------------------cattgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------ >KJ627722.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8523/2004, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------t -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataacaaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacatcacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >MF973156.1 Human respiratory syncytial virus A strain 7I2, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatgctgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcttaatagatgataattgtgaaatcaaattctcaaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgagttacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatagactcaaccgatcca accatggacacaacacacaatgatactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattc 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >MN108245.1 UNVERIFIED: Human orthopneumovirus strain 440204_S10_L001/rsvB/2014, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------taagtaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattanatggtctaagagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcatccaatcaatcaa 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KF973340.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V7359/2002, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------t -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KJ627702.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8481/2001, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ---------------------ggtctcat-------gtctgtgatcatcagtc-tttgtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtacatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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-------------aa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >MK167041.1 Human orthopneumovirus strain SC3198, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtggaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacattgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaatttaatagatatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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tc-att-ttg-atctaggaggaacaaattt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaactac------------------------------------ ------------------------------ >LC488177.1 Human respiratory syncytial virus B Fukushima/BA9-I/2016 viral cRNA, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ --------cgggtgc-ata--gatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttgtttgataa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtggaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatctt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa 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-------------------agaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KJ643540.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9480/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------ctttgtgtttgagtcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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tc-att-ttg-atctaggaagaataagttt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaac-------------------------------------------- ------------------------------ >KF530268.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/MEX/59/2007, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------t -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagcatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca 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--------------------------------------------------cct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KJ627710.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8493/2001, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------caa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattgtctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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----------------------gtttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataacaaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacgaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KU950460.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10473/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------aaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgagg ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaacccatcaaag--ggagatggggcaaata----aactcacctaatcagtcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgataacagacatgaga cccctgtcgatggaatcaataataacatctctcaccaaagaaatcataacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaaa aaatacactgaatataatacaaaatatggcactttccccatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacacactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KJ643585.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9553/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ --------------------------gataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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tc-att-tta-tttttaaggggttgaataa-aagt-ctaaaactaacaa---------tt atacatgtgtatttacaacaca-------------------------------------- ------------------------------ >KP258712.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/79E-159-01/1979, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattgcaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa 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--------------a-ataagaatttcataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattgtctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatataag 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------------------------------ >KJ643552.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9496/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ --------------------------gataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------ >MF001054.1 Human respiratory syncytial virus A strain 8Q3, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ---------gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt cgagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattacaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacagaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacaaaagataaaaatggggcaaata----aatcaacccagccgaccca atcatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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-----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaggtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagcaaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcgattc atgaattatgcttagtctaactcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa actatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacagacatgaaa cccctgtcgatggattcaataataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtaggaagtaccaaatacaag aaatacactgagtataatacaaaatatggcactttccccatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacacactcctataatatacaaa 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------------------------------ >KU316113.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/89I-102A-01-01/1989, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagcaaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgcttagtctaactcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aacacacctaatcaatcaa actatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacagacatgaaa cccctgtcgatggattcaataataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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-----------------------------------tatttaagtttaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcactagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaatggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaatta atgaattatgtttagtctaacttaatagacatatgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcaccaaaa--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa actatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctactgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatacactgaatataatacaaaatatggcactttccccatgcctatatttatcaatcat ggcgggtttctagaatgtattggcattaagcctacaaaacacactcctataatatacaaa 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------------------------------ >MG642042.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/USA/MCRSV_242/1985, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagtcatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--agaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattaatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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tc-att-tta-tttttaaggggttgaataa-aagt-ctaaaactaacaa---------tt atacatgtgtatttacaacaca-------------------------------------- ------------------------------ >MG642082.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/USA/MCRSV_257/1989, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagcaaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaacattgtagtaaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgcttagtctaactcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aacacacctaatcaatcaa 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----------------------ctttgtggtgta----------gtagcattg-tgtgtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaagtacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------ >KP258742.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/94I-104A-01/1994, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >MG642064.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/USA/MCRSV_280/1995, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaacctct-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctaactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattgaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtttgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaggattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaacctct-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctaactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattgaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaggattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtactaaatacaag 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------------------------------ >MG642052.1 Human respiratory syncytial virus A strain RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_263/1994, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaattcaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcagtgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------ >KP258728.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/92E-024-01/1992, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaattcaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcagtgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaacctct-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctaactaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattgaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagtactacaaatgacaacactactatgcaaggattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataatatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcttagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtactaaatacaag 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------------------------------ >MF001049.1 Human respiratory syncytial virus A strain 8O5, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------caa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtacatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatatcacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KP258721.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/81E-119-01/1981, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagtatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactgagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgatttgcttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctgattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KP258724.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVB/Homo sapiens/USA/97E-017-01/1997, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaatggtctaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttaataccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcattaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaaaagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatatttaataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtaggaagcactaaatataga 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-----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaattaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcactgacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagatatcataacacatagattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctactaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >MG642068.1 Human respiratory syncytial virus B strain RSVB/Homo sapiens/USA/MCRSV_252/1987, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------tatttaagtctaaccttt-tcaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattattaaaaataacatgttatactgataaattaattcttctgaccaa tgcattagccaaagcagcaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatactacaaaatggaggatacatatgggaattgattgagttgacacactgctc tcaattaaacggtttaatggatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactaattatatgaatcaaatatctgacttacttgggcttgatctcaattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaaactcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacctaatcaatcaa accatgagcactacaaatgacaacactactatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcaatggattcaataataacatctcttaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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------------------------------ >KU316121.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/92E-015-01/1992, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaattcaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataacattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcagtgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt acattcctagtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtaggaagcactaaatataaa 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RSVA/Homo sapiens/USA/90P-147-01/1990, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgataatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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------taa---------ttttt-----aaataacttttagtgaactaatcctaaagtta tc-att-ttg-atccagaaggaataaattt-aaat-cctaatctaattg---------gt ttatatgtgtattaactaaa---------------------------------------- ------------------------------ >KP258733.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/84E-004-01/1984, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/USA/85P-405-01/1985, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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------taa---------ttttt-----aaataacttttagtgaactaatcctaaagtta tc-att-ttg-atccagaaggaataaattt-aaat-cctaatctaattg---------gt ttatatgtgtattaactaaa---------------------------------------- ------------------------------ >KU316171.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/78I-016A-01-01/1977, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaaccacaatcaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_245/1985, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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------taa----------tttt-----taataacttctagtgaactaatcctaaaatta tc-att-ttg-atctaggaggaataaattt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaact-------------------------------------- ------------------------------ >MG642077.1 Human respiratory syncytial virus A strain RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_250/1987, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggtctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSV-A/US/BID-V8419/2001, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------ggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgataaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattc atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/90I-283A-01/1990, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatggcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacccacaatgatactacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagaaatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/83G-012-01/1983, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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------taa---------ttttt-----aaataacttttagtgaactaatcctaaagtta tc-att-ttg-atctaggaggaataaattt-aaat-cctaatctaattg---------gt ttatatgtgtattaactaaa---------------------------------------- ------------------------------ >KU316119.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/89E-503-01/1989, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcaatgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatggcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/USA/95I-103A-01-01/1995, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactacaataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_214/1980, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactcct-ttggtt agaaatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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------taa----------tttt-----taataacttttagtgaactaatcctaaaatta tc-att-ttg-atctaggaggaataaattt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaact-------------------------------------- ------------------------------ >MG642079.1 Human respiratory syncytial virus A strain RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_237/1982, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/PER/FLA7464/2009, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaagtccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaacggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacggaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagtcaactca accatggacacgacacacaatgataccacatcacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatctctaaccagagacatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_226/1982, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacacttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tatcacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KJ627305.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLU5848/2007, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattaagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaggtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaagttaatacagttaactaa tgctttagctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt cattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaatcataataaatatcaactggcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10346/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttgatt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcggtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccact--agttaatat ----aaaacttaacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca actatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagatatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacatta 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RSVA/Homo sapiens/USA/MCRSV_235/1982, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/88P-171-01/1988, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcacctagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaactcagccaaccca accatggacacaacacacaatgacaccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcactcgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacatagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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------taa----------tttt-----taataacttttagtgaactaatcctaaaatta tc-att-ttg-atctaggaggaataaattt-aaat-ccaaatctaattg---------gt ttatatgtatattaactaaac--------------------------------------- ------------------------------ >KU316167.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/85I-040A-01-01/1985, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaacatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat 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RSVA/Homo sapiens/USA/98E-027-01/1998, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggta agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaaattagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcactattaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggagttaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattttccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgagttacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatgtcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaggataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/94E-091-01/1994, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaactcacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV44/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttgatt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcgatgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccact--agttaatat ----aaaacttaacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca actatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagatatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacatta 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RSVA/Homo sapiens/USA/96I-029A-01-01/1996, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------taaatttaacttct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaattaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaactcagccgaccca accatggatacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacatagattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt 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RSVA/Homo sapiens/USA/97I-058A-01-01/1997, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaatttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca actatggacacaactcacaaggataccacaccacaaagactgatgatcacagatatgaga ccattgtcacttgagaccataataacatcactaaccagagacatcataacacacaaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaagccacattt 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------------------------------ >KJ627245.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLI1323/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627270.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLE8614/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627295.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLE8150/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627320.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLE9490/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627350.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLA6714/2009, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaataaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca atcatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ672436.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_30/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggtattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgactca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >MN630098.1 Human respiratory syncytial virus A isolate RSVA/USA/UAMS-DID-027/2016, complete genome ------------------------------------------------------------ --------------------------------------cttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacagaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627294.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLE9761/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaataaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca atcatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627356.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLI1294/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat -a-aaaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KX765913.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/NZL/LJRSV55/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627315.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/PER/FLA7756/2009, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaagcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatctaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaaccaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ672435.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_37/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ672463.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/LA2_31/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KU950563.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10175/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgccactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgatacctcaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaactagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >JF920053.1 Human respiratory syncytial virus strain A/WI/629-Q0284/10, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KX655678.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/A0108/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KX655616.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/A0444/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataatagatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgatagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccaa accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------ >KJ627721.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8522/2004, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------gtgtt tgagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataacaaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacatcacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagctaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcaattaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtgtttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcaccacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc atatacttgataaacaatgaatgtattgtaagaaaacttgatgaaagacaagctacattt acattcctagtcaattatgagatgaagctattgcacaaagtagggagtaccaaatacaag aaatactctgaatataatacaaaatatggcacattccctatgcctatatttatcaatcac 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------------------------------ >MK109763.1 Human respiratory syncytial virus A strain RSVA/Homo sapiens/JOR/A0101/2011, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ --------------------------------------ttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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--------------------------------------------------cct-cgggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgaaagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca atcatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcacttttcctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctacaaagcacactcccataatatacaag 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KX655657.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/D3040/2010, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattaaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >MG813990.1 Human orthopneumovirus isolate A-TX-018a-2012-WGS, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >MG813977.1 Human orthopneumovirus isolate A-TX-1043-2013-WGS, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >MG813982.1 Human orthopneumovirus isolate A-TX-032a-2012-WGS, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----agtcaattcagccgaccca 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-------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----agtcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa aaatatactgaatacaacacaaaatatggcactttccctatgccaatatttatcaatcat gatgggttcttagaatgcattggcattaagcctaccaagcacacacccataatatacaag 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------------------------------ >KF530267.1 UNVERIFIED: Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/ZAF/323/2007 cRNA sequence ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------ttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattaagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcaataacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagctgaccca accatggacacaacacacaatggtactacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >MG813992.1 Human orthopneumovirus isolate A-TX-1043a-2013-WGS, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------------aa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca 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------------------------------ >MN630103.1 Human respiratory syncytial virus A isolate RSVA/USA/ACRI-046/2016, complete genome ------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------aaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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sequence ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------actcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaactcagccaaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KJ627703.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V8482/2001, complete genome --------------------------------------------------actttgtgtt tgaatgcgt-----------acaa----------caaacttgcgtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtacatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca 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------------------------------ >KU950608.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/TH_10508/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagcaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ -------------------------------------------gtaaacc--aaaaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagcatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcctaataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KJ643574.1 Respiratory syncytial virus type A isolate RSV-A/US/BID-V9531/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------caaaaat -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactcct-ttggtt tgagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttatttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacctgctatactgacaaattgatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaacttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacccaatggcctaatagatgacaattgtgaaatcaaattctccaaaaaactaagcga ttcaacaatgaccaactatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatctcaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aataaactcagccgaccca 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------------------------------ >KX655619.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/C2358/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaagttaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtgttacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaactcagccaaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattgtcacttgagactataataacatcactaaccagagacatcataacacacagattt atatacttgataaatcatgaatgtatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acattcctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatacaaa 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >MG813989.1 Human orthopneumovirus isolate A-TX-Tracy-1989-WGS, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtaccacttaaatttaactccc-ttagtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattacaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgataaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaataaaattgaatggcattgtgtttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtaaaatccaatttcacaac aatgccagtactacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacattgctc tcaacctaatggtctactagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgatcttaatcc ataaattataattaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttaacagaagacaaaaatggggcaaata----aatcaattcagccaaccca 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------------------------------ >KX655667.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/C2408/2012, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggatacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcacttgagactataataacatctctaaccagagatattataacacataaattt 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KU316098.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/USA/84E-035-01/1984, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaattcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatttgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacatttaactaa tgctttggctaaggcagtgatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggctatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgaccttaatcc 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ -----------------------------------cacttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactgagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca accatggacacaacacacaatgataccacaccacaaagactgatgatcacagacatgaga ccattatcgcttgagactataataacatctctaaccagagatatcataacacataaattt atatacttgataaatcatgaatgcatagtgagaaaacttgatgaaagacaggccacattt acatttctggtcaactatgaaatgaaactattgcacaaagtgggaagcactaaatataaa 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------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------ >KX655665.1 Human respiratory syncytial virus strain RSVA/Homo sapiens/JOR/C2769/2013, complete genome ------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------ ------------------------------------acttaaatttaactcct-ttggtt agagatgggcagcaactcattgagtatgataaaagttagattgcaaaatctgtttgacaa tgatgaagtagcattgttaaaaataacatgctatactgacaaattaatacagttaactaa tgctttggctaaggcagttatacatacaatcaaattgaatggcattgtatttgtgcatgt tattacaagtagtgatatttgccctaataataatattgtagtgaaatccaatttcacaac aatgccagtattacaaaatggaggttatatatgggaaatgatggaattaacacactgctc tcaacctaatggcctaatagatgacaattgtgaaattaaattctccaaaaaactaagtga ttcaacaatgaccaattatatgaatcaattatctgaattacttggatttgacctcaatcc ataaatcataataaatatcaactagcaaatcaatgtcactaacaccatt--agttaatat ----aaaacttgacagaagataaaaatggggcaaata----aatcaattcagccgaccca 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------------------------------ >KP317941.1 Human respiratory syncytial virus isolate Kilifi_9465_11_RSVB_2010, complete genome ------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------t -------g-gggcaa-ataagaatttgataagtgctatttaagtctaaccttt-ttaatc agaaatggggtgcaattcactgagcatgataaaggttagattacaaaatttatttgacaa tgacgaagtagcattgttaaaaataacatgttatactgacaaattaattcttctgactaa tgcattagccaaagcaacaatacatacaattaaattaaacggcatagtttttatacatgt tataacaagcagtgaagtgtgccctgataacaatattgtagtgaaatctaactttacaac aatgccaatattacaaaatggaggatacatatgggaattgattgaattgacacactgctc tcagttaaatggtctaatagatgataattgtgaaatcaaattttctaaaagactaagtga ctcagtaatgactgattatatgaatcaaatatctgatttacttgggcttgatctccattc atgaattatgtttagtctaattcaatagacatgtatttattaccatttt--agttaatat ----aaaacctcatcaaag--ggaaatggggcaaata----aactcacccaatcaatcaa accatgagcactacaaacgacaacaccaccatgcaaagattgatgatcacagacatgaga cccctgtcgatggattcaataataacatctctcaccaaagaaatcatcacacacaaattc 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