product sequences frame codon ref_codon_maj alt_codon1_maj alt_codon2_maj num_defined_seqs nonamers nonamer_counts multiple_variants NN_sites SN_sites NS_sites SS_sites NN_diffs SN_diffs NS_diffs SS_diffs pair which_gene ratio_name sw_num_replicates sw_N_diffs sw_S_diffs sw_N_sites sw_S_sites sw_dN sw_dS sw_dNdS sw_dN_m_dS sw_boot_dN_SE sw_boot_dS_SE sw_boot_dN_over_dS_SE sw_boot_dN_over_dS_P sw_boot_dN_m_dS_SE sw_boot_dN_m_dS_P sw_boot_dN_gt_dS_count sw_boot_dN_eq_dS_count sw_boot_dN_lt_dS_count sw_ASL_dN_gt_dS_P sw_ASL_dN_lt_dS_P sw_ASL_dNdS_P N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAT 2 CCCCAATCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 8 TCA AAT CAA 2 CAATCAAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.8333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.0833333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666674 1 34.49999999999999 0 0.0295604764056575 0 -0.0295604764056575 0 0.0300224537165548 NA NA 0.0296956859361913 0.31951899231074 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000007 1 35.49999999999999 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0292074363764853 NA NA 0.0287464090238506 0.317896194312459 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.25000000000006 1 35.83333333333332 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0293088304668298 NA NA 0.0279742045922255 0.309329297993351 0 347 653 0.653 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.0833333333334 1 35.49999999999999 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0284686114686548 NA NA 0.0295716780240095 0.331589695832731 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.75000000000006 1 35.83333333333332 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0281412022416057 NA NA 0.0295697944235059 0.33616370718447 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0278784776877292 NA NA 0.0281350064270474 0.316669008172397 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0283519676875019 NA NA 0.0282578611423661 0.311911647902382 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000006 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0281946892682341 NA NA 0.0282216183128187 0.308980613940266 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.58333333333339 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0283929749180924 NA NA 0.0299002300399414 0.339236755463311 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.91666666666673 1 34.999999999999986 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.02934620734121 NA NA 0.0284934987629017 0.306622806144342 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.25000000000006 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0300094645280368 NA NA 0.0302849223506769 0.331402364335714 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666673 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0316926374013753 NA NA 0.0313130503788559 0.34515403321606 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.0833333333334 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0291875100391389 NA NA 0.0300029910600798 0.338587821702369 0 399 601 0.601 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000006 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0290419859123874 NA NA 0.030435690071387 0.345499696349712 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000006 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0305440428817267 NA NA 0.0286776959731067 0.325913856858605 0 390 610 0.61 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666673 1 36.499999999999986 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.0296207642912621 NA NA 0.0288698968320295 0.33366513698531 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.5833333333334 1 35.833333333333314 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0299210147537712 NA NA 0.028645024132334 0.320796434489629 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666673 1 35.833333333333314 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0306187912918359 NA NA 0.0291418286211588 0.329115457566885 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666673 1 35.833333333333314 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0291709754518489 NA NA 0.0288573522388611 0.324369931033333 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666673 1 35.833333333333314 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0288171955559609 NA NA 0.0288186189626726 0.323720057580984 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000007 1 36.499999999999986 0 0.0279101972553257 0 -0.0279101972553257 0 0.0273719367801194 NA NA 0.0282559189282671 0.323267934566757 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000007 1 37.499999999999986 0 0.0271522864979704 0 -0.0271522864979704 0 0.0273759590086517 NA NA 0.0276746917422301 0.326531912981311 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.0833333333334 1 37.66666666666665 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0277368746666974 NA NA 0.0273600895744345 0.323185158308414 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.0833333333334 1 38.33333333333332 0 0.026551445288187 0 -0.026551445288187 0 0.0286928460343913 NA NA 0.0281966210254551 0.346370098141651 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.0833333333334 1 37.66666666666665 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0275366099033907 NA NA 0.0285795430999258 0.344260949793544 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.0833333333334 1 37.66666666666665 0 0.0270299523623977 0 -0.0270299523623977 0 0.0282605033071742 NA NA 0.0265644551368622 0.308904548345071 0 334 666 0.666 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666673 1 38.16666666666665 0 0.0266694765273651 0 -0.0266694765273651 0 0.0279187876040858 NA NA 0.0252123411019952 0.290149126765615 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.75000000000006 1 38.83333333333332 0 0.0262035385209603 0 -0.0262035385209603 0 0.0268098511932408 NA NA 0.0274523514976022 0.339825651367954 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.25000000000006 1 37.83333333333332 0 0.0269087157486764 0 -0.0269087157486764 0 0.0282989474113439 NA NA 0.0263717046289464 0.307556261142668 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.25000000000006 1 36.83333333333332 0 0.0276529018562458 0 -0.0276529018562458 0 0.027447589922906 NA NA 0.0274390779429336 0.313554001454407 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666673 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0290858409276468 NA NA 0.0277618056071239 0.310207255918464 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000007 1 35.833333333333314 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.02749175017376 NA NA 0.0292795059696878 0.331394794223584 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666674 1 36.16666666666665 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0279875655446839 NA NA 0.0273439453733058 0.302871614429615 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666674 1 36.66666666666665 0 0.0277809537602618 0 -0.0277809537602618 0 0.0279341898828241 NA NA 0.0295490597214335 0.347133590781159 0 379 621 0.621 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 1 36.333333333333314 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0288137229436511 NA NA 0.0286714123870976 0.328074190582861 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666674 1 35.66666666666665 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0290522924723664 NA NA 0.0303986445987742 0.34721488193508 0 338 662 0.662 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75000000000007 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0304288187276308 NA NA 0.0290554877700135 0.3113508018809 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.0833333333334 1 34.66666666666665 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0305003734681043 NA NA 0.0312660318453383 0.346799949414957 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0286489380229917 NA NA 0.0304843764861649 0.336939552262322 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 1 34.16666666666665 0 0.0298546878003148 0 -0.0298546878003148 0 0.0307879285571304 NA NA 0.0293451084600857 0.30897980075564 0 338 662 0.662 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 1 34.833333333333314 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0294711566565296 NA NA 0.0289432443856791 0.311844682779969 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.027462314272607 NA NA 0.030263099281454 0.342755770808429 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 1 35.499999999999986 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0284818599652607 NA NA 0.0296476663867747 0.33283049852195 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666674 1 35.333333333333314 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0281083380267402 NA NA 0.0303786987870497 0.34228043064375 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000007 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0291176917090852 NA NA 0.0307912945864327 0.337041589740285 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666673 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.029607621235505 NA NA 0.031275699553861 0.334965124089639 0 379 621 0.621 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666673 1 33.33333333333332 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0297075523409674 NA NA 0.032800277392241 0.350602198710412 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666673 1 33.16666666666665 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0315168163267891 NA NA 0.0319336767402783 0.335211065948795 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0323608227932286 NA NA 0.0291436655663764 0.30081120648772 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666673 1 33.83333333333332 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0302527586455738 NA NA 0.0320447371286694 0.346693381495366 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666673 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000007 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000007 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000007 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000007 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.3333333333334 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000007 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.3333333333334 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.3333333333334 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 0 36.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 37.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 38.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 38.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 39.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 39.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333339 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.8333333333334 0 32.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 32.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 32.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 33.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000009 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333341 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333341 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666674 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000009 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333341 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333341 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333341 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000007 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.8333333333334 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666673 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666673 0 36.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666673 0 35.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.3333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666673 0 34.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666673 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333339 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333339 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666673 0 32.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 32.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666673 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000004 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 31.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000004 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000004 0 31.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333337 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 31.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 31.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 31.166666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 31.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.1666666666667 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAT GAA ATT 2 GGAAATTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 31.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ATT TCG 2 AATTTCGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666671 0 30.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333337 0 31.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 0 30.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 29.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333337 0 30.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333339 0 28.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666673 0 27.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666673 0 28.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 28.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 29.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 29.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 29.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 29.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.8333333333334 0 29.166666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 28.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666673 0 27.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 28.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.3333333333334 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000007 0 26.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666673 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.8333333333334 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.00000000000007 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666674 0 29.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000007 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333341 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000009 0 31.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333343 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666676 0 30.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.33333333333341 0 30.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666674 0 30.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666674 0 30.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000009 0 30.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000009 0 31.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000007 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 32.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000009 0 32.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 32.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTG CTT TGC 2 CCTTTGCCG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TGC CGC 2 TTGCCGCAG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_AY502924.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.41666666666669 1 34.416666666666664 0.0432292511544661 0.0296334842053817 1.45879744868527 0.0135957669490843 0.0329598356775401 0.0291422727473137 NA NA 0.0446402285823872 0.760698918144582 603 35 362 0.362 0.603 0.724 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25000000000001 1 34.583333333333336 0.0433333505001085 0.0294878275056261 1.46953350469243 0.0138455229944824 0.0333751572735649 0.0297686755155862 NA NA 0.0464850188311023 0.765818305525256 604 53 343 0.343 0.604 0.686 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.58333333333334 1 34.583333333333336 0.0431256509016318 0.0294878275056261 1.46248993397034 0.0136378233960057 0.0325056646871251 0.0306189662167245 NA NA 0.0443384734724492 0.758398581174889 613 52 335 0.335 0.613 0.67 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.58333333333334 1 34.916666666666664 0.0437548116643347 0.0292007684815911 1.49841301922992 0.0145540431827437 0.0346225033272091 0.0299083108921947 NA NA 0.0446313705654866 0.744352879960147 602 52 346 0.346 0.602 0.692 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.58333333333334 1 35.916666666666664 0.0444026073250892 0.0283721774047871 1.5650052758234 0.016030429920302 0.0335178559405333 0.0291722359514692 NA NA 0.0442848513921675 0.717363611116995 606 55 339 0.339 0.606 0.678 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.25 1 36.25 0.0446228241484839 0.0281063333749098 1.5876430252662601 0.0165164907735741 0.0326718541495478 0.02819061757147 NA NA 0.0452232871931776 0.714946499781513 642 40 318 0.318 0.642 0.636 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAT:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666667 1 35.41666666666667 0.0445124432883257 0.0287805096612113 1.54661761769692 0.0157319336271144 0.0334377501128137 0.0300089676400085 NA NA 0.0467410919392 0.736436488491604 632 44 324 0.324 0.632 0.648 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AAT---:TCAAACCAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.166666666666667 1.5 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.41666666666667 1 36.41666666666667 0.0438614614252191 0.0279752710599065 1.56786546701527 0.0158861903653126 0.0339128386917795 0.0285716553478313 NA NA 0.0435546325520449 0.715304233840494 613 44 343 0.343 0.613 0.686 N all ss13 10 --- ACC AAC 1 AACCAACGT:AAT---CGT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.91666666666667 1 35.91666666666667 0.0435430609699594 0.0283721774047871 1.53470987963767 0.0151708835651722 0.0327034360181377 0.0283050165073729 NA NA 0.0435260177401702 0.727429066632826 621 47 332 0.332 0.621 0.664 N all ss13 11 CGT --C GT- 1 ---CGT---:CAACGTAGT 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.5 1.16666666666667 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25 1 36.25000000000001 0.0421163271222966 0.0281063333749098 1.49846394264623 0.0140099937473869 0.0321125265013275 0.0291653503429232 NA NA 0.0435849607737311 0.747876210316849 615 42 343 0.343 0.615 0.686 N all ss13 12 --- GTA GTG 1 CGT---GCA:CGTAGTGCC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666667 1 35.083333333333336 0.0414374651394939 0.0290593249318817 1.42596103786402 0.0123781402076122 0.0315064314804842 0.0285889321761213 NA NA 0.0436153427850264 0.776561793251331 608 39 353 0.353 0.608 0.706 N all ss13 13 GCA --G CAC 1 ---GCACCC:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.75 1 36.416666666666664 0.040687942312311 0.0279752710599065 1.45442531102492 0.0127126712524045 0.03052199452586 0.0265585383873169 NA NA 0.042666373314741 0.765737294779798 597 49 354 0.354 0.597 0.708 N all ss13 14 CCC CAC CCC 2 GCACCCCGC:GCCCCCCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75 1 36.08333333333333 0.0401433603117785 0.0282386296527663 1.42157607523444 0.0119047306590122 0.031660696556117 0.0285572861223392 NA NA 0.0415578871571212 0.774524751298878 587 47 366 0.366 0.587 0.732 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666667 1 35.83333333333333 0.0533558250189308 0.0284394261467203 1.87612171721278 0.0249163988722105 0.0338390993312917 0.0293059291142346 NA NA 0.0436462812437869 0.568087049040199 685 17 298 0.298 0.685 0.596 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666667 1 35.83333333333333 0.0533558250189308 0.0284394261467203 1.87612171721278 0.0249163988722105 0.0317450685244602 0.0296003010257158 NA NA 0.0469389937801413 0.595539943432839 700 12 288 0.288 0.7 0.576 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666667 1 35 0.0526531940049364 0.0291298749871979 1.80753243974018 0.0235233190177385 0.0318539915043767 0.0291013108580742 NA NA 0.0454488647291864 0.604752941802611 679 15 306 0.306 0.679 0.612 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.33333333333333 1 35 0.0521949688493964 0.0291298749871979 1.79180202017122 0.0230650938621985 0.033516458999161 0.0297926424686575 NA NA 0.0462330556111904 0.617858635507205 678 9 313 0.313 0.678 0.626 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.5 1 35.333333333333336 0.0527690107059348 0.028849710620847 1.82910017363583 0.0239193000850877 0.0321285339199692 0.0278481615111837 NA NA 0.0456911803033063 0.600626850512657 677 18 305 0.305 0.677 0.61 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.83333333333333 1 35.5 0.0532374199351599 0.0287116399282627 1.85421035051206 0.0245257800068972 0.0335274926805417 0.0290358457438223 NA NA 0.0442573599356587 0.579467473107139 688 21 291 0.291 0.688 0.582 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.41666666666666 1 34.91666666666667 0.0528271104098974 0.0292007684815911 1.80910000513175 0.0236263419283063 0.0341282212615808 0.0306799026462552 NA NA 0.0472164726021232 0.616805097420621 688 14 298 0.298 0.688 0.596 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.74999999999999 1 35.25 0.0525954761681725 0.0289192452027623 1.81870155321857 0.0236762309654102 0.032380112224594 0.0292303805259567 NA NA 0.0459651632243173 0.60648959761107 686 21 293 0.293 0.686 0.586 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.41666666666666 0 34.583333333333336 0.0521382511052232 0 -Inf 0.0521382511052232 0.031257067946286 0 NA NA 0.0328845815467922 0.112854523128949 948 52 0 0 0.948 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCGACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.08333333333333 0 35.25 0.053060794799115 0 -Inf 0.053060794799115 0.033456914533336 0 NA NA 0.0323304525397729 0.100755545713792 948 52 0 0 0.948 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC:TCGACTGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.16666666666667 0 35.16666666666667 0.0530021800130169 0 -Inf 0.0530021800130169 0.0333984806078886 0 NA NA 0.0321398990200574 0.0991254127201428 957 43 0 0 0.957 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333334 0 35 0.0528853382457436 0 -Inf 0.0528853382457436 0.0333328924316369 0 NA NA 0.0329496220126974 0.108485824037538 943 57 0 0 0.943 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.66666666666667 0 34.66666666666667 0.0526531940049364 0 -Inf 0.0526531940049364 0.0314482941228729 0 NA NA 0.0324034232090548 0.104178135778886 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78 0 34.66666666666667 0.0531195394264593 0 -Inf 0.0531195394264593 0.0322711348367701 0 NA NA 0.0338550019480053 0.116640771854269 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666667 0 35 0.0533558250189308 0 -Inf 0.0533558250189308 0.0308527122921856 0 NA NA 0.0346064561331896 0.123125075308646 944 56 0 0 0.944 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.5 0 34.16666666666667 0.0527690107059348 0 -Inf 0.0527690107059348 0.0328006645757511 0 NA NA 0.0331867427212641 0.111820611714237 949 51 0 0 0.949 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGAC:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.16666666666667 1 34.833333333333336 0.067766156279967 0.0292720079293014 2.31504980606857 0.0384941483506656 0.0358972546335418 0.0287783969346915 NA NA 0.0395945867172097 0.330947403209263 840 18 142 0.142 0.84 0.284 N all ss13 32 GAC GAG ACC 2 GGAGACCGC:GGAGGACGC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.5 2 35.833333333333336 0.0828427466732329 0.0579999025523778 1.42832561827876 0.0248428441208551 0.0383713206543945 0.041879802202422003 NA NA 0.0388230867743167 0.522238436292709 750 3 247 0.247 0.75 0.494 N all ss13 33 CGC ACC GCA 2 GACCGCAGT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.91666666666666 2 35.75 0.0538952343889476 0.0581404786806199 0.926982983490856 -0.00424524429167234 0.0275559834664073 0.0399579439418931 NA NA 0.0313468947491579 0.892273562176605 438 18 544 0.544 0.438 0.876 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.25 2 35.083333333333336 0.0529436946379864 0.0592901175479514 0.892959852797859 -0.00634642290996498 0.0270077501109239 0.0426099154850708 NA NA 0.0318047846838464 0.841837991780687 405 11 584 0.584 0.405 0.81 N all ss13 35 GGA ATG GAG 2 AATGGGGCA:AGTGGAGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25 2 35.083333333333336 0.0393532888030902 0.0592901175479514 0.663741116236832 -0.0199368287448612 0.0237804001010128 0.0413121004245099 NA NA 0.0280931719263676 0.47790996076252 185 33 782 0.782 0.185 0.37 N all ss13 36 GCA GAG CAA 2 GGAGCAAGG:GGGGCAAGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.58333333333333 2 35.25 0.0391819232689516 0.0589984642956841 0.664117680632882 -0.0198165410267325 0.0224325813303007 0.0443810451563538 NA NA 0.0275978065416312 0.47272788689363 182 48 770 0.77 0.182 0.364 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.91666666666667 2 34.916666666666664 0.0390120440358434 0.059584670169267 0.654732902355905 -0.0205726261334235 0.0223237912375554 0.0449272846340297 NA NA 0.028241361443464 0.466333693277437 201 42 757 0.757 0.201 0.402 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666667 2 35.583333333333336 0.0395261602343306 0.058423686245627 0.676543415424923 -0.0188975260112964 0.0234023100730208 0.0422688982265307 NA NA 0.0270433375931219 0.484685309673555 200 47 753 0.753 0.2 0.4 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666667 2 35.583333333333336 0.0395261602343306 0.058423686245627 0.676543415424923 -0.0188975260112964 0.0223876772116898 0.0426577312459928 NA NA 0.0269629978400627 0.483384849099389 187 62 751 0.751 0.187 0.374 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGA:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75 2 35.583333333333336 0.0401433603117785 0.058423686245627 0.687107625201983 -0.0182803259338485 0.022949995245499 0.0431795562061432 NA NA 0.0270642745032126 0.499395499833238 198 48 754 0.754 0.198 0.396 N all ss13 41 CGA AAC GAA 2 CAACGAAGG:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.75 2 36.083333333333336 0.040687942312311 0.0575822255219405 0.706605935138921 -0.0168942832096295 0.0235977386171227 0.0435811438657187 NA NA 0.0252978655713438 0.504251965165579 236 52 712 0.712 0.236 0.472 N all ss13 42 AGG GAA GAC 2 CGAAGGCCC:CGCCGACCC 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.416666666666667 0.25 0 2 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.5 2 36.583333333333336 0.0408264049162628 0.0567646707244322 0.719222086470954 -0.0159382658081694 0.0236283863042065 0.0412694480307202 NA NA 0.0254105463280214 0.530508252986238 246 47 707 0.707 0.246 0.492 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 AGGCCCCAG:CGACCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75 2 37.166666666666664 0.0411061773712463 0.0558397336460622 0.736145656277589 -0.014733556274816 0.0243836109436812 0.0403393110356716 NA NA 0.0239351316820484 0.538183672234746 256 44 700 0.7 0.256 0.512 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT:CCCCAGGGA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75 2 37 0.0411061773712463 0.0561009098120238 0.732718551427774 -0.0149947324407775 0.0253208367853643 0.0415274460191661 NA NA 0.0255310659802469 0.556993367455436 239 43 718 0.718 0.239 0.478 N all ss13 45 GGA AAG GAT 2 CAAGGTTTA:CAGGGATTA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75 2 35.83333333333333 0.0411061773712463 0.0579999025523778 0.708728386812799 -0.0168937251811315 0.02486397922228 0.0424613149492913 NA NA 0.026653576610484 0.526194497521077 203 39 758 0.758 0.203 0.406 N all ss13 46 TTA GAT TAC 2 GGATTACCC:GGTTTACCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333334 2 35.75 0.0410592825874941 0.0581404786806199 0.706208196410678 -0.0170811960931259 0.024768635177014 0.0405906005657577 NA NA 0.0279915130638193 0.541710995733028 216 40 744 0.744 0.216 0.432 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000001 2 35.75 0.0412475068105866 0.0581404786806199 0.709445600494096 -0.0168929718700334 0.0244982337938625 0.0420688227647725 NA NA 0.0263652503984819 0.521698982448374 221 49 730 0.73 0.221 0.442 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000001 2 35.75 0.0412475068105866 0.0581404786806199 0.709445600494096 -0.0168929718700334 0.0241586122467033 0.0411257431062549 NA NA 0.0260137472997761 0.5160886980117 213 45 742 0.742 0.213 0.426 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333334 2 35.75 0.0416291816557173 0.0581404786806199 0.716010301263544 -0.0165112970249026 0.0246584556126821 0.0426888592654559 NA NA 0.0266618676468306 0.535728567020341 227 45 728 0.728 0.227 0.454 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000001 2 36.08333333333333 0.0418226808888407 0.0575822255219405 0.726312338742534 -0.0157595446330999 0.0250644133911756 0.0412066255111207 NA NA 0.0257358473028266 0.540301112324723 233 48 719 0.719 0.233 0.466 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000001 2 36.08333333333333 0.0418226808888407 0.0575822255219405 0.726312338742534 -0.0157595446330999 0.024432473223077 0.0401660756632492 NA NA 0.0261790126073558 0.547179755628175 247 47 706 0.706 0.247 0.494 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666669 2 36.08333333333333 0.0414374651394939 0.0575822255219405 0.719622500934858 -0.0161447603824467 0.0241446104313186 0.0433308870025569 NA NA 0.0260813074053313 0.53590547001914 232 48 720 0.72 0.232 0.464 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333334 2 35.416666666666664 0.0416291816557173 0.0587096677913667 0.70906859503366 -0.0170804861356494 0.0240347749359459 0.0424939300516854 NA NA 0.0270866036811168 0.528309973834628 216 38 746 0.746 0.216 0.432 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000001 2 34.416666666666664 0.0418226808888407 0.0604861633757489 0.691442117580381 -0.0186634824869082 0.0243750839361488 0.0435362577777271 NA NA 0.0270678844334753 0.490504578908933 225 47 728 0.728 0.225 0.45 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000001 2 33.83333333333333 0.0553246126797069 0.0615730216404005 0.898520345530779 -0.00624840896069369 0.0279754499229202 0.0422178410139224 NA NA 0.0320012227052553 0.845193073739554 407 14 579 0.579 0.407 0.814 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.50000000000001 2 33.33333333333333 0.0549444688504895 0.0625362067042884 0.878602520781321 -0.00759173785379889 0.0278678867549973 0.0447496775581544 NA NA 0.0335469804390258 0.820966795969552 391 9 600 0.6 0.391 0.782 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.83333333333336 2 33.666666666666664 0.054693929928504303 0.0618907677660026 0.88371710196409 -0.00719683783749829 0.0269472002270184 0.0456701116953935 NA NA 0.0321661600181247 0.822960074274619 416 15 569 0.569 0.416 0.832 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.83333333333336 2 33.666666666666664 0.054693929928504303 0.0618907677660026 0.88371710196409 -0.00719683783749829 0.0272586579001649 0.044240934015051 NA NA 0.0329410946030441 0.827058273562247 410 20 570 0.57 0.41 0.82 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 2 32.916666666666664 0.0542609435735893 0.0633621979772033 0.856361447453441 -0.00910125440361401 0.0270359688823258 0.0426381863327087 NA NA 0.0319658317797653 0.775860038313792 416 22 562 0.562 0.416 0.832 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGT:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.41666666666669 2 32.24999999999999 0.0535344239114693 0.0647301776657746 0.827039656648048 -0.0111957537543052 0.0270021122272609 0.0477073494784642 NA NA 0.034209701843395 0.743464904741658 383 10 607 0.607 0.383 0.766 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG:CATGGTAAG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333336 2 32.916666666666664 0.0545075207127158 0.0633621979772033 0.860252997099734 -0.00885467726448749 0.0268541176154547 0.0447216299129087 NA NA 0.0336136654759012 0.792223082424586 379 16 605 0.605 0.379 0.758 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG:GGTAAGGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75000000000003 2 33.916666666666664 0.0547563501152287 0.0614153696041381 0.891574054966515 -0.00665901948890944 0.0270048233906782 0.0425969760880771 NA NA 0.032000601579728 0.835158346043173 381 11 608 0.608 0.381 0.762 N all ss13 63 GAA AGG AAG 2 AAGGAAGAC:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.4166666666667 2 33.583333333333336 0.0550074627952335 0.0620508745044359 0.886489726930458 -0.00704341170920238 0.0268996043066346 0.0445601736674589 NA NA 0.031406730878092 0.822551574084071 397 12 591 0.591 0.397 0.794 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGACCTT:GAGGAACTT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000003 2 33.583333333333336 0.0555166649189651 0.0620508745044359 0.894695930755921 -0.00653420958547077 0.0282022740415964 0.0437125326081055 NA NA 0.0327151062032662 0.841691237699137 394 15 591 0.591 0.394 0.788 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA:GACCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.1666666666667 2 34.333333333333336 0.0421656696333547 0.0606390724718212 0.695354792125968 -0.0184734028384664 0.0237751382110196 0.0441437293067687 NA NA 0.0277601477212722 0.50575321157426 200 49 751 0.751 0.2 0.4 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.6666666666667 2 33.833333333333336 0.0418713371647064 0.0615730216404005 0.680027324454594 -0.0197016844756942 0.0250197429630256 0.046260949991948797 NA NA 0.0291013702413727 0.498404715512443 198 49 753 0.753 0.198 0.396 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.33333333333336 2 34 0.0420670999882827 0.0612585232607003 0.686714235817538 -0.0191914232724177 0.0251673163647908 0.0435769096949199 NA NA 0.02848267721192 0.500443043107694 188 45 767 0.767 0.188 0.376 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000003 2 34.66666666666667 0.0428688103799615 0.0600320307551523 0.714098954186757 -0.0171632203751908 0.0256586796251576 0.0433579215095985 NA NA 0.0273424062297478 0.530191092172988 234 46 720 0.72 0.234 0.468 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000003 2 34.66666666666667 0.0428688103799615 0.0600320307551523 0.714098954186757 -0.0171632203751908 0.0253353010144869 0.0424965843213466 NA NA 0.0270503431505041 0.525759929611825 232 52 716 0.716 0.232 0.464 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 CGAGGACAA:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.1666666666667 2 34.66666666666667 0.0421656696333547 0.0600320307551523 0.702386194552245 -0.0178663611217975 0.0244447067296439 0.0428258461457421 NA NA 0.0260561582912453 0.492910697196791 212 62 726 0.726 0.212 0.424 N all ss13 71 CAA GAC AAG 2 GGACAAGGT:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.08333333333337 2 34.75 0.042215127927666 0.0598821656332629 0.704969960275062 -0.0176670377055969 0.0245803704406588 0.0423441824251733 NA NA 0.026418483071182 0.503662763436108 231 49 720 0.72 0.231 0.462 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGTGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333337 2 35.083333333333336 0.05765141989764 0.0592901175479514 0.972361369515147 -0.00163869765031132 0.0285963039321325 0.043766097385725 NA NA 0.0302994906394333 0.956868765672574 472 14 514 0.514 0.472 0.944 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA:GGTGTTCCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333337 2 35.083333333333336 0.05765141989764 0.0592901175479514 0.972361369515147 -0.00163869765031132 0.0305119429621416 0.0446247061985506 NA NA 0.0309221483406499 0.957736448127967 454 17 529 0.529 0.454 0.908 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC:GTTCCGATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000003 2 34.41666666666667 0.0571024790858329 0.0604861633757488 0.944058539985484 -0.00338368428991593 0.0292418975846216 0.0474732002617773 NA NA 0.0320524222481209 0.915925754354745 444 22 534 0.534 0.444 0.888 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCGATTAAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.33333333333337 2 34.833333333333336 0.0574443341110378 0.0597330472949441 0.961684305630595 -0.00228871318390628 0.0289972258147718 0.0461076028150927 NA NA 0.0321219239915694 0.943198141605148 465 15 520 0.52 0.465 0.93 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:ATTAACACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.6666666666667 2 34.5 0.0571705240409132 0.0603340239140544 0.947566900599111 -0.00316349987314122 0.0295160804483383 0.0461469071863873 NA NA 0.0312813201285522 0.919446756830004 445 12 543 0.543 0.445 0.89 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.33333333333336 2 35.166666666666664 0.0582817382454872 0.0591439311842398 0.985422123259498 -8.62192938752594e-4 0.0301910700656389 0.0412941041354435 NA NA 0.0312666623354338 0.978000745575124 518 13 469 0.469 0.518 0.938 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.00000000000003 2 35.166666666666664 0.0577207808520962 0.0591439311842398 0.975937508656463 -0.00142315033214354 0.0295849104848132 0.0434278288550534 NA NA 0.0317807156127345 0.96428241881310806 468 18 514 0.514 0.468 0.936 N all ss13 79 AGT ATA GTA 2 AATAGTACC:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.00000000000003 2 35.166666666666664 0.0577207808520962 0.0591439311842398 0.975937508656463 -0.00142315033214354 0.0296914897656029 0.0421307528906689 NA NA 0.0312050831198703 0.963623997921069 450 14 536 0.536 0.45 0.9 N all ss13 80 ACC GTA CCA 2 AGTACCAAA:AGTGGTCCA 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.1666666666667 2 35 0.0575822255219405 0.0594370287406054 0.968793809886432 -0.00185480321866491 0.0300844401158336 0.0443429837173143 NA NA 0.0325077455413772 0.954499574436088 485 16 499 0.499 0.485 0.97 N all ss13 81 AAA CCA AAG 2 ACCAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333337 1 34.33333333333333 0.042364201600918 0.0297068535712844 1.4260750132713 0.0126573480296336 0.0248482070976501 0.0294637397076832 NA NA 0.0264369228979062 0.632098427280467 656 44 300 0.3 0.656 0.6 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.75000000000004 0 34.33333333333333 0.0280079218999906 0 -Inf 0.0280079218999906 0.020700368715885 0 NA NA 0.0198078197231976 0.157366871087764 842 158 0 0 0.842 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.58333333333339 1 35 0.0284731702204231 0.0291298749871979 0.97745597030322 -6.56704766774867e-4 0.0210724788944659 0.0286717798478618 NA NA 0.0357209085555578 0.98533225773603506 492 44 464 0.464 0.492 0.928 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.91666666666671 1 36 0.0287460335402285 0.0283052459871352 1.0155726452013 4.40787553093291e-4 0.0206128342077167 0.0292766054146066 NA NA 0.0355991730498865 0.990120877350465 496 45 459 0.459 0.496 0.918 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.91666666666671 1 36.33333333333333 0.029165278647943 0.0280406490537152 1.04010711706685 0.00112462959422776 0.021868657917274 0.029979794187562 NA NA 0.0352180921326986 0.974525249572346 529 57 414 0.414 0.529 0.828 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.75000000000004 1 35.99999999999999 0.029236344803184 0.0283052459871353 1.03289492048477 9.3109881604864e-4 0.0201467959335493 0.0302737488790998 NA NA 0.035288203264588 0.978949815852103 483 39 478 0.478 0.483 0.956 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.41666666666671 1 36.33333333333333 0.0293795213238626 0.0280406490537152 1.04774754919483 0.00133887227014735 0.0209475842579896 0.0287165464752687 NA NA 0.0364376238798888 0.970688945549718 539 47 414 0.414 0.539 0.828 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.75000000000004 1 36.66666666666666 0.029236344803184 0.0277809537602618 1.05238808773383 0.00145539104292213 0.0216422856462567 0.0301299481538608 NA NA 0.0364086143744065 0.968114005982071 510 39 451 0.451 0.51 0.902 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.25000000000004 1 36.16666666666666 0.0290241779148319 0.0281723261817365 1.0302371812537 8.51851733095432e-4 0.0206361089185164 0.0273040697299519 NA NA 0.0365726571951608 0.981417322487521 522 46 432 0.432 0.522 0.864 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.91666666666671 1 35.99999999999999 0.0287460335402285 0.0283052459871353 1.0155726452013 4.40787553093205e-4 0.020588823985589 0.0290984869320412 NA NA 0.0349577537883557 0.989939620659832 518 54 428 0.428 0.518 0.856 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.25000000000004 1 36.16666666666666 0.0294516368168802 0.0281723261817365 1.04541018824257 0.0012793106351437 0.020320213049837402 0.0282407030492611 NA NA 0.0367379660839589 0.972221218087453 522 52 426 0.426 0.522 0.852 N all ss13 92 ACC CTA CCA 2 GCTACCAGA:GCTACCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.58333333333339 1 35.49999999999999 0.0293077581780704 0.0287116399282627 1.02076225012911 5.96118249807674e-4 0.0210097278898569 0.0286277502912887 NA NA 0.035900088468123 0.986751796112273 510 49 441 0.441 0.51 0.882 N all ss13 93 AGA CCA GAC 2 ACCAGACGA:ACCCGACGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.91666666666671 1 35.16666666666666 0.029165278647943 0.0289891158257094 1.00607686082227 1.76162822233591e-4 0.0204730532007373 0.0284807561016414 NA NA 0.0363305568289203 0.996131161822825 496 52 452 0.452 0.496 0.904 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 AGACGAGTT:CGACGAGTT 1:1 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.25000000000004 1 34.99999999999999 0.0290241779148319 0.0291298749871979 0.996371523310262 -1.05697072366028e-4 0.0202874990519421 0.0310752493128421 NA NA 0.036742971050162 0.997704759755691 524 34 442 0.442 0.524 0.884 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.66666666666671 1 35.74999999999999 0.028849710620847 0.0285069944752381 1.01202217743111 3.42716145608914e-4 0.0203407838139557 0.030124582903535 NA NA 0.0349028428319829 0.992165580076405 514 49 437 0.437 0.514 0.874 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.33333333333339 1 35.74999999999999 0.0285748846742028 0.0285069944752381 1.00238152776939 6.78901989646756e-5 0.0210724202759228 0.0304156157975299 NA NA 0.0372619072683402 0.99854627646341 481 48 471 0.471 0.481 0.942 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000004 1 36.24999999999999 0.0285069944752381 0.0281063333749098 1.01425518921248 4.0066110032836e-4 0.0204793683002959 0.0275253831983465 NA NA 0.0382208356038053 0.99163609465346 484 46 470 0.47 0.484 0.94 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.66666666666671 1 36.58333333333332 0.0284394261467203 0.02784542552167 1.02133207210599 5.94000625050287e-4 0.0196150605905666 0.0298781095183587 NA NA 0.0355404249860663 0.986665273025652 509 50 441 0.441 0.509 0.882 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333339 1 35.91666666666666 0.0281723261817364 0.0283721774047871 0.992956084399182 -1.99851223050742e-4 0.0199560133996914 0.0282310414911363 NA NA 0.0354277114828403 0.995499078180707 540 41 419 0.419 0.54 0.838 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.66666666666671 1 35.91666666666666 0.0284394261467203 0.0283721774047871 1.00237023549422 6.7248741933177e-5 0.0205085546212912 0.0285596772524781 NA NA 0.0346688948161942 0.998452310073389 495 53 452 0.452 0.495 0.904 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.66666666666671 1 35.91666666666666 0.0284394261467203 0.0283721774047871 1.00237023549422 6.7248741933177e-5 0.020721560757876 0.0294911054466832 NA NA 0.034591615875188 0.998448852481571 494 50 456 0.456 0.494 0.912 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.66666666666671 1 35.91666666666666 0.0284394261467203 0.0283721774047871 1.00237023549422 6.7248741933177e-5 0.0198827811237225 0.0296327001386657 NA NA 0.0362247547411445 0.998518783564292 532 45 423 0.423 0.532 0.846 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG:ATGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.16666666666671 1 36.41666666666666 0.0282386296527662 0.0279752710599065 1.00941397823441 2.6335859285969e-4 0.0194428205980811 0.0279520546610098 NA NA 0.0346793397481278 0.99394083806012 523 54 423 0.423 0.523 0.846 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGATCTC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000004 1 37.08333333333332 0.0281063333749098 0.0274630224286674 1.02342462297853 6.43310946242374e-4 0.0194879378482795 0.0277508259579968 NA NA 0.0346124739088801 0.985171290479829 505 44 451 0.451 0.505 0.902 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GATCTCAGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333337 1 37.499999999999986 0.014002740465399 0.0271522864979704 0.515711281495415 -0.0131495460325714 0.0143346830883322 0.02707427101247 NA NA 0.0323238673033737 0.684150414388113 316 135 549 0.549 0.316 0.632 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTCAGTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.25000000000004 1 37.999999999999986 0.0139701361553758 0.0267885619515594 0.521496308037638 -0.0128184257961836 0.0141265052779461 0.0282259480019777 NA NA 0.0303798179905614 0.673069644122272 319 131 550 0.55 0.319 0.638 N all ss13 107 CCA GCC CAC 2 AGCCCCAGA:AGTCCACGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.25000000000004 1 37.33333333333332 0.0139701361553758 0.0272757331281561 0.512181875725816 -0.0133055969727803 0.0147415499387044 0.0278886141310829 NA NA 0.0331566580804764 0.688203036111189 323 112 565 0.565 0.323 0.646 N all ss13 108 AGA CAC GAT 2 CCACGATGG:CCCAGATGG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.916666666666667 0.25 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.25000000000004 1 37.33333333333332 0.0139701361553758 0.0272757331281561 0.512181875725816 -0.0133055969727803 0.0136384215177145 0.0283261353471073 NA NA 0.0310142874174307 0.667912250991294 321 120 559 0.559 0.321 0.642 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:CGATGGTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.25000000000004 1 37.749999999999986 0.0282054389472648 0.0269691977905829 1.04583900367676 0.00123624115668189 0.019811485691978 0.0268147434290296 NA NA 0.0337793186077128 0.970805876858754 529 50 421 0.421 0.529 0.842 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.58333333333337 1 38.41666666666666 0.0288844360583938 0.0264928206228063 1.09027409612734 0.00239161543558752 0.0205843123818398 0.0266812665615761 NA NA 0.0350707259941357 0.945631149885738 535 44 421 0.421 0.535 0.842 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.08333333333337 1 37.41666666666666 0.0286773285294381 0.0272138698048234 1.05377620805533 0.00146345872461478 0.0204243200217755 0.026305084509768 NA NA 0.034471540116677 0.966136689757374 520 50 430 0.43 0.52 0.86 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.08333333333337 1 36.41666666666666 0.0286773285294381 0.0279752710599065 1.02509564493685 7.0205746953159e-4 0.0205749238020191 0.0289691003015022 NA NA 0.0363878434030566 0.984606780393055 521 45 434 0.434 0.521 0.868 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA:TATTACCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000004 1 35.749999999999986 0.0284057619693268 0.0285069944752382 0.996448853771682 -1.01232505911417e-4 0.0212249659470182 0.0306965582358142 NA NA 0.0368146485788772 0.997805988788549 509 49 442 0.442 0.509 0.884 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA:TACCTTGGA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.16666666666667 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.08333333333339 1 35.41666666666665 0.0282718985737775 0.0287805096612114 0.98232793326383006 -5.08611087433906e-4 0.021280403347162 0.0281526424033198 NA NA 0.0364957738759759 0.988880909884545 508 48 444 0.444 0.508 0.888 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT:CTTGGAACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.08333333333339 1 35.249999999999986 0.0278777737612569 0.0289192452027623 0.96398690788078 -0.00104147144150539 0.0199999644831039 0.0288261378903214 NA NA 0.0361565222104737 0.977020492092272 480 50 470 0.47 0.48 0.94 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC:GGAACTGGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.08333333333339 1 35.249999999999986 0.0278777737612569 0.0289192452027623 0.96398690788078 -0.00104147144150539 0.0196244685759497 0.0305116375412322 NA NA 0.0366417382111622 0.977324708077874 504 32 464 0.464 0.504 0.928 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA:ACTGGGCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.41666666666673 1 34.91666666666665 0.0277488297186241 0.0292007684815911 0.950277378354537 -0.00145193876296693 0.0208584882827386 0.0299991842615049 NA NA 0.0354516596987649 0.967331409838525 517 40 443 0.443 0.517 0.886 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA:GGGCCAGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.0833333333334 2 34.249999999999986 0.0274944876870935 0.0607927570603562 0.452265845745349 -0.0332982693732627 0.0204638687415519 0.0441021042481936 NA NA 0.0515374607770743 0.51821565130101 226 11 763 0.763 0.226 0.452 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.0833333333334 2 33.583333333333314 0.0271215992572094 0.062050874504436 0.43708649513506 -0.0349292752472266 0.0194345894699714 0.04703821871372 NA NA 0.0527274126488803 0.507682859773272 233 21 746 0.746 0.233 0.466 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTGGA:GAAGCTTCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000006 2 33.749999999999986 0.0274316291149154 0.0617314855970427 0.444370143527366 -0.0342998564821273 0.0196198329543442 0.0448106025073016 NA NA 0.0525476646434063 0.513925212814054 208 11 781 0.781 0.208 0.416 N all ss13 121 GGA CTG CAC 2 GCTGGACTT:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666673 2 33.999999999999986 0.0272757331281561 0.0612585232607004 0.445256132147973 -0.0339827901325443 0.0206660035745674 0.0467937538427977 NA NA 0.0509466256942228 0.504754696202619 222 11 767 0.767 0.222 0.444 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 GGACTTCCC:TCACTTCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.3333333333334 2 33.333333333333314 0.0133932130500048 0.0625362067042884 0.214167340103256 -0.0491429936542835 0.0138862906311016 0.048020758965735 NA NA 0.0483341967309422 0.309280257757788 108 40 852 0.852 0.108 0.216 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.3333333333334 2 33.999999999999986 0.0133932130500048 0.0612585232607004 0.218634278743658 -0.0478653102106956 0.0129907961485362 0.0453776711812865 NA NA 0.0468708785275983 0.307151920212536 115 56 829 0.829 0.115 0.23 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666673 2 34.66666666666665 0.0135138791270087 0.0600320307551524 0.225111144117823 -0.0465181516281437 0.0139524470282201 0.043773262073965 NA NA 0.0469424638791442 0.321704617137563 109 47 844 0.844 0.109 0.218 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666673 2 34.66666666666665 0.0135138791270087 0.0600320307551524 0.225111144117823 -0.0465181516281437 0.0134807624763879 0.044683704444226 NA NA 0.0474616083543543 0.327026055430548 112 37 851 0.851 0.112 0.224 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666673 2 34.833333333333314 0.013423177093157 0.0597330472949441 0.22471944260398 -0.0463098702017871 0.0130309411078334 0.0440755525669518 NA NA 0.0461430662055825 0.315564254961364 119 33 848 0.848 0.119 0.238 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333339 2 33.91666666666665 0.0132600139021293 0.0614153696041381 0.215907092761936 -0.0481553557020089 0.01318730341154 0.0473826256502139 NA NA 0.0491157579358833 0.326865939400902 124 44 832 0.832 0.124 0.248 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666671 2 33.58333333333332 0.0132016609860952 0.062050874504436 0.212755438042238 -0.0488492135183408 0.0131141118687559 0.0450003502611534 NA NA 0.0495061535895311 0.323774953720152 94 31 875 0.875 0.094 0.188 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666671 2 33.08333333333332 0.0132016609860952 0.0630291953285242 0.209453110059311 -0.0498275343424291 0.0133512294654088 0.0468095336694438 NA NA 0.0500351289903908 0.319322535550768 117 46 837 0.837 0.117 0.234 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666671 2 32.91666666666665 0.0132893842388272 0.0633621979772033 0.209736793594321 -0.0500728137383761 0.0126942994362933 0.0476436518877749 NA NA 0.0494109285736637 0.310871277624692 97 46 857 0.857 0.097 0.194 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 2 33.58333333333332 0.0134081783305544 0.062050874504436 0.216083631981623 -0.0486426961738815 0.0131802476793251 0.0472122125409764 NA NA 0.0489638473922072 0.320495063019069 113 57 830 0.83 0.113 0.226 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 2 33.58333333333332 0.013333684515963 0.062050874504436 0.214883103944164 -0.048717189988473 0.0133615884603669 0.0467950079035223 NA NA 0.0468133411351961 0.298029224326269 100 51 849 0.849 0.1 0.2 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666671 1 33.58333333333332 0.0132453773639628 0.0303839016876759 0.435934051528848 -0.0171385243237131 0.0134686667038327 0.0318554013202395 NA NA 0.0337323162166536 0.611401209229866 261 136 603 0.603 0.261 0.522 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333339 1 32.91666666666665 0.0133041182530361 0.0310121698640216 0.428996691020667 -0.0177080516109855 0.0133263644481331 0.0338620945775196 NA NA 0.0354982243384558 0.61788977604575 259 147 594 0.594 0.259 0.518 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666671 1 32.58333333333332 0.0132453773639628 0.0313361505112163 0.422686805746028 -0.0180907731472535 0.0135673639616725 0.0324859137383039 NA NA 0.0366445425121811 0.621530353179707 271 128 601 0.601 0.271 0.542 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000006 1 33.24999999999999 0.0133633824875953 0.0306948207819131 0.4353627793608 -0.0173314382943178 0.0123532156631024 0.0328082083152007 NA NA 0.0375931563490972 0.644779650067505 277 136 587 0.587 0.277 0.554 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000006 1 33.24999999999999 0.0133633824875953 0.0306948207819131 0.4353627793608 -0.0173314382943178 0.0132527924951998 0.0330642562599359 NA NA 0.0358978064575543 0.629238199125168 267 126 607 0.607 0.267 0.534 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666671 1 32.91666666666666 0.013423177093157 0.0310121698640216 0.432835791626749 -0.0175889927708646 0.0136701975756045 0.032129756171375 NA NA 0.0368679867446148 0.633304892078936 259 149 592 0.592 0.259 0.518 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666671 1 33.41666666666666 0.0135138791270087 0.0305385697640887 0.442518403167004 -0.01702469063708 0.0136705837666377 0.0321091367404622 NA NA 0.0373915430116748 0.648887248975274 295 121 584 0.584 0.295 0.59 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666671 1 33.41666666666666 0.0135138791270087 0.0305385697640887 0.442518403167004 -0.01702469063708 0.0133543918793747 0.0311350414655321 NA NA 0.0376840169602657 0.651431198649106 283 133 584 0.584 0.283 0.566 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333339 1 33.08333333333333 0.0132162010123647 0.0308526791703671 0.428364776341964 -0.0176364781580024 0.0135414368999001 0.0317919627314841 NA NA 0.0337330424786816 0.601096035899598 272 126 602 0.602 0.272 0.544 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCA:AATACACCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333339 1 34.08333333333333 0.0132162010123647 0.0299291581301553 0.441582785419166 -0.0167129571177907 0.0133303393090533 0.0319067859591093 NA NA 0.0357259799977733 0.639920740712109 263 128 609 0.609 0.263 0.526 N all ss13 143 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000006 1 34.41666666666666 0.0132746828245506 0.0296334842053817 0.447962269051705 -0.0163588013808311 0.01406312324781 0.0317797830350692 NA NA 0.0362992822311734 0.652231302329959 308 110 582 0.582 0.308 0.616 N all ss13 144 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGAT:CCCAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666671 2 35.08333333333333 0.0269087157486763 0.0592901175479514 0.453848244219008 -0.032381401799275 0.0191629080131091 0.0479094863117084 NA NA 0.0407142670369615 0.426419798732065 165 45 790 0.79 0.165 0.33 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333339 2 35.16666666666666 0.0407801460981609 0.0591439311842398 0.68950685694406 -0.0183637850860789 0.0235089933276668 0.0458520434435633 NA NA 0.045504414681482 0.686535925165177 321 22 657 0.657 0.321 0.642 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666671 2 35.66666666666666 0.0414374651394939 0.0582817382454872 0.710985402750963 -0.0168442731059933 0.0227177337249071 0.0454209894073599 NA NA 0.0420245179266694 0.688552550699457 330 21 649 0.649 0.33 0.66 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.25000000000006 2 35.33333333333333 0.0415331021017154 0.0588537115811214 0.70570064293172 -0.017320609479406 0.0239153908784484 0.0440379560590878 NA NA 0.0415706902206009 0.676931239268201 326 14 660 0.66 0.326 0.652 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666671 2 34.33333333333333 0.0408727688266097 0.0606390724718212 0.674033542409528 -0.0197663036452115 0.0245101270291207 0.0459529217252456 NA NA 0.042764038207805 0.643925072939138 275 21 704 0.704 0.275 0.55 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.91666666666671 2 34.83333333333333 0.0417257068817799 0.0597330472949441 0.698536384319233 -0.0180073404131641 0.0239341141885402 0.0447529717192649 NA NA 0.0429170933928155 0.674789128534083 321 16 663 0.663 0.321 0.642 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.58333333333339 2 34.166666666666664 0.0413422677171007 0.0609472230590743 0.678328981076445 -0.0196049553419736 0.0236739680365928 0.0449423142601725 NA NA 0.0436691907913296 0.653473142115848 314 16 670 0.67 0.314 0.628 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCA:CGCAATCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666673 2 34.333333333333336 0.0414374651394939 0.0606390724718212 0.683345959137976 -0.0192016073323273 0.0232227952674006 0.0466374936035565 NA NA 0.0433686266838617 0.657944106048315 312 11 677 0.677 0.312 0.624 N all ss13 152 CCA ATC CAA 2 AATCCAAAC:AATCCTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333339 2 34 0.0416291816557173 0.0612585232607003 0.679565543533499 -0.019629341604983 0.0237408704434777 0.0475606292019061 NA NA 0.0423627516661486 0.643104027548443 310 11 679 0.679 0.31 0.62 N all ss13 153 AAC CAA ACA 2 CCAAACAAC:CCTAATAAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.58333333333339 2 34.166666666666664 0.0413422677171007 0.0609472230590743 0.678328981076445 -0.0196049553419736 0.0244795116143178 0.0476094660824475 NA NA 0.0424600924739863 0.644277372779665 327 15 658 0.658 0.327 0.654 N all ss13 154 AAC ACA ACA 2 AACAACAAT:AATAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.25000000000006 2 34.5 0.0415331021017154 0.0603340239140544 0.688386078158472 -0.018800921812339 0.0244645502363074 0.0463253548752947 NA NA 0.0420925313855572 0.65512276731386 329 16 655 0.655 0.329 0.658 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333339 2 34.333333333333336 0.0416291816557173 0.0606390724718212 0.686507559545247 -0.0190098908161038 0.0244213188160207 0.0460016038921597 NA NA 0.0422990987601456 0.653131607618306 324 15 661 0.661 0.324 0.648 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCA:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666673 2 34.333333333333336 0.0420179878270026 0.0606390724718212 0.692919368885932 -0.0186210846448186 0.0243179222683495 0.0461711303248189 NA NA 0.0426524635300365 0.662418144521832 298 16 686 0.686 0.298 0.596 N all ss13 157 GCA CTG CAA 2 GCTGCAATC:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000006 2 34.333333333333336 0.0562984016666259 0.0606390724718212 0.928417922170357 -0.00434067080519526 0.0279997540790387 0.0469686567433905 NA NA 0.0442301677872405 0.921822523233312 467 6 527 0.527 0.467 0.934 N all ss13 158 ACC CAA CCG 2 GCAATCGTG:GCCACCGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.91666666666673 2 34.166666666666664 0.0561665862243823 0.0609472230590743 0.921561039293647 -0.00478063683469206 0.0289027438520488 0.0454111066960045 NA NA 0.0469233845607465 0.918850530896403 468 10 522 0.522 0.468 0.936 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000006 2 34.83333333333333 0.0422647024133488 0.0597330472949441 0.707559790222291 -0.0174683448815952 0.0245281123756611 0.0445340081255038 NA NA 0.0399276090862139 0.661748487230249 325 18 657 0.657 0.325 0.65 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000006 2 34.83333333333333 0.0422647024133488 0.0597330472949441 0.707559790222291 -0.0174683448815952 0.0257681096966858 0.0455069961801717 NA NA 0.0423823651167964 0.680221647152958 362 13 625 0.625 0.362 0.724 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.50000000000006 2 35.33333333333333 0.0425646124443371 0.0588537115811214 0.723227325869973 -0.0162890991367843 0.0240631427020111 0.0440626589222179 NA NA 0.0406322446546168 0.688500413645891 328 19 653 0.653 0.328 0.656 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333339 2 35.83333333333333 0.0568319121182793 0.0579999025523778 0.979862200060704 -0.00116799043409847 0.0283744806989548 0.0425598035645897 NA NA 0.0438333319898863 0.978741947651787 501 6 493 0.493 0.501 0.986 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.91666666666671 2 36 0.0569668741816511 0.0577207808520962 0.98693873056955 -7.5390667044517e-4 0.0279991636947875 0.0429223717335526 NA NA 0.0434634854399015 0.98616078936923 506 5 489 0.489 0.506 0.978 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.58333333333337 3 36.666666666666664 0.0572387314369154 0.0866346653413833 0.660690858692264 -0.0293959339044678 0.0288351289242847 0.0516022400210549 NA NA 0.0549615445924905 0.592756708444242 312 4 684 0.684 0.312 0.624 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.25000000000004 4 36.666666666666664 0.0726080462723539 0.117889187641809 0.615900810962952 -0.0452811413694554 0.0312982328246098 0.0642553093377042 NaN NaN 0.0569557533113858 0.426600046575716 216 0 784 0.784 0.216 0.432 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA:GGAACAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.58333333333337 4 36.33333333333333 0.0722580068136367 0.119061291806916 0.606897554335451 -0.0468032849932792 0.0323277789704723 0.0635772336216036 NA NA 0.0579033838089213 0.418918102708307 196 1 803 0.803 0.196 0.392 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG:ACAGCTTTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.9166666666667 4 37 0.0729614963194685 0.116739982283845 0.624991497275268 -0.0437784859643764 0.0317655872783468 0.0629934769395577 NA NA 0.0575451724584896 0.446796063994628 198 1 801 0.801 0.198 0.396 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA:GCTTTGCCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.9166666666667 3 37.666666666666664 0.0884459172871288 0.0842004764033108 1.05042062782974 0.00424544088381801 0.0364546344869159 0.0516372828133241 NaN NaN 0.0488638811616659 0.930764507621557 501 3 496 0.496 0.501 0.992 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA:TTGCCTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.4166666666667 4 37.83333333333333 0.0891034205520704 0.113962844188242 0.78186378364593 -0.0248594236361715 0.0347239454054744 0.0591487061531213 NaN NaN 0.0585455130617273 0.671115854438034 367 0 633 0.633 0.367 0.734 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC:CCTAAAGGT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.08333333333337 4 38.166666666666664 0.0895472205406727 0.112888706112188 0.793234537135017 -0.0233414855715156 0.0347597039626348 0.0589098405599456 NaN NaN 0.0562494865608042 0.67816860037962 332 0 668 0.668 0.332 0.664 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC:AAAGGTTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.00000000000003 4 38.583333333333336 0.0910206427532005 0.111574227897278 0.81578554894415 -0.0205535851440774 0.0368692907394356 0.0583311770305064 NaN NaN 0.0570045533243456 0.718428089037674 399 0 601 0.601 0.399 0.798 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC:GGTTTCTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.66666666666669 4 38.91666666666667 0.0914838201648646 0.110544521791661 0.827574435007108 -0.0190607016267961 0.0359244935640333 0.0579600148135492 NaN NaN 0.0555006430632189 0.731273424502863 374 1 625 0.625 0.374 0.748 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.33333333333336 4 38.583333333333336 0.0919517415692492 0.111574227897278 0.824130655458406 -0.0196224863280287 0.0376583017750833 0.0578782226618826 NaN NaN 0.0578011286078769 0.734246086794752 371 1 628 0.628 0.371 0.742 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.91666666666669 4 37.583333333333336 0.0911359963120852 0.114781984854672 0.793992161988436 -0.0236459885425872 0.0372378378698008 0.0600426974249262 NaN NaN 0.0587690712346584 0.687423297525328 346 1 653 0.653 0.346 0.692 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.16666666666669 4 36.583333333333336 0.0907908105289243 0.11818004032857 0.768241492188554 -0.027389229799646 0.0368179371415919 0.0635319508431518 NA NA 0.0593976633519132 0.644715179410894 317 1 682 0.682 0.317 0.634 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.33333333333336 4 36.5 0.0919517415692492 0.118472334721436 0.776145264508002 -0.0265205931521864 0.038480194568489 0.0628216610010935 NaN NaN 0.0613821438071785 0.665699888425813 355 2 643 0.643 0.355 0.71 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.08333333333336 4 36.41666666666667 0.0909055811950413 0.118766081588831 0.76541702798411 -0.0278605003937896 0.0361700225620879 0.0647044724057093 NaN NaN 0.0600914840463643 0.642909450603496 325 0 675 0.675 0.325 0.65 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.58333333333336 4 36.16666666666667 0.0916003529269902 0.119656146346601 0.765529859716999 -0.0280557934196108 0.0371872509602335 0.0605011152562046 NaN NaN 0.0617760153732856 0.649718350875064 306 2 692 0.692 0.306 0.612 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.25000000000001 4 36 0.0935061462707286 0.120256987556385 0.777552707503891 -0.026750841285656 0.0371236160661351 0.0652352891680205 NaN NaN 0.0629618636088461 0.670928732396652 355 0 645 0.645 0.355 0.71 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.25000000000001 4 35.66666666666667 0.0935061462707286 0.121476995958792 0.769743650085388 -0.0279708496880635 0.0373560887968399 0.0653487192824425 NaN NaN 0.062028351814773 0.652035294793896 344 0 656 0.656 0.344 0.688 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 69.08333333333334 5 35.16666666666667 0.108858235901756 0.157645932730055 0.690523593070805 -0.048787696828299 0.0403095727016863 0.0747825288702754 NA NA 0.0703190724091673 0.487804749225637 224 0 776 0.776 0.224 0.448 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 68.75 5 34.833333333333336 0.109426474440289 0.159326652781303 0.686805832734659 -0.0499001783410144 0.0411384921316135 0.0784272509987334 NaN NaN 0.0711228761283374 0.482925420027589 241 0 759 0.759 0.241 0.482 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAAGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 68.75 5 34.833333333333336 0.109426474440289 0.159326652781303 0.686805832734659 -0.0499001783410144 0.0413428076286083 0.0800743087985349 NaN NaN 0.0699944264750398 0.475897456636655 232 1 767 0.767 0.232 0.464 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT:GCTTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 69.41666666666666 5 34.833333333333336 0.10829587866142 0.159326652781303 0.679709745801731 -0.051030774119883 0.0399829288760249 0.077893965963592507 NaN NaN 0.0697898339157371 0.464653083655832 203 0 797 0.797 0.203 0.406 N all ss13 185 TCA CTT CAC 2 TCTTCACGC:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 70.08333333333333 5 34.833333333333336 0.107188445973217 0.159326652781303 0.672759040010385 -0.0521382068080857 0.0410793817444518 0.0792487784012717 NaN NaN 0.0698568541411276 0.455451314275337 221 2 777 0.777 0.221 0.442 N all ss13 186 CGC CAC GCT 2 TCACGCTCT:TCTCGCTCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.25 6 34.16666666666667 0.121631243552431 0.200073130342575 0.607933925680913 -0.0784418867901445 0.0411036229279563 0.093384709047378 0.421805578351714 0.149509624479301 0.0822206589642672 0.340062845469413 159 0 841 0.841 0.159 0.318 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.16666666666667 6 34.25 0.12178588422283 0.199515431752951 0.61040834361941 -0.0777295475301208 0.0406264826985016 0.089689951532585993 NaN NaN 0.0805629583262603 0.334630038910318 137 0 863 0.863 0.137 0.274 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.16666666666667 6 34.25 0.12178588422283 0.199515431752951 0.61040834361941 -0.0777295475301208 0.0418448982940969 0.093169160464317 NaN NaN 0.0815497878246804 0.340511794180375 136 0 864 0.864 0.136 0.272 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.83333333333334 6 34.25 0.120559681536883 0.199515431752951 0.604262439640085 -0.078955750216068 0.0407991445823558 0.0917824830902817 0.388630586512819 0.119981692251603 0.0789627950229759 0.317353685490358 114 0 886 0.886 0.114 0.228 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.83333333333334 6 34.25 0.120559681536883 0.199515431752951 0.604262439640085 -0.078955750216068 0.0408909563373885 0.0915944562812396 0.410465337495168 0.140983077314864 0.0785110543799825 0.314577169556659 124 0 876 0.876 0.124 0.248 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.5 6 34.91666666666667 0.137790852861283 0.195163947524611 0.706026162152246 -0.0573730946633275 0.0426717706743206 0.0908598286605133 0.447890245738227 0.114948058198959 0.0781379518053869 0.462794017921519 217 0 783 0.783 0.217 0.434 N all ss13 192 CGC GTC GCA 2 AGTCGCAAT:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 72.5 6 33.91666666666667 0.135707397617875 0.201765204947521 0.672600598567888 -0.0660578073296456 0.0433963809712182 0.0928937267414404 NaN NaN 0.0864908939742512 0.44501357089936 210 1 789 0.789 0.21 0.42 N all ss13 193 AAT GCA ATA 2 CGCAATAGT:CGCGGTAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.91666666666667 6 33.16666666666667 0.149188878582045 0.207018740932176 0.720653975143838 -0.0578298623501309 0.0448858973092977 0.0965045858397839 NaN NaN 0.0959249609036912 0.546598079651687 238 1 761 0.761 0.238 0.476 N all ss13 194 AAT ATA ATT 2 AATAGTTCC:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 9 75.00000000000001 5 32.41666666666667 0.130765040358583 0.172678550040526 0.757274370950499 -0.0419135096819423 0.0425155246211328 0.0875621399139797 NaN NaN 0.0830686494642962 0.613864595950153 304 0 696 0.696 0.304 0.608 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AGTTCCAGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.16666666666669 6 31.916666666666668 0.114781984854672 0.216414580065769 0.530380091857905 -0.101632595211096 0.0401529960545789 0.108768558441419 NaN NaN 0.0973941876279051 0.296708413818925 121 0 879 0.879 0.121 0.242 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT:TCCAGAAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.66666666666669 6 32.083333333333336 0.113962844188242 0.215112484631514 0.529782566471952 -0.101149640443272 0.0383412170934791 0.105487409116284 NaN NaN 0.104535078660054 0.333237016187547 118 0 882 0.882 0.118 0.236 N all ss13 197 AAC GAA ACT 2 AGAAACTCA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.50000000000001 6 32.083333333333336 0.114234586398441 0.215112484631514 0.531045822812766 -0.100877898233073 0.0399779175955315 0.101020591123123 NaN NaN 0.104900337939595 0.336223107518577 114 0 886 0.886 0.114 0.228 N all ss13 198 TCA ACT CAA 2 AACTCAACT:AATTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.50000000000001 6 32.41666666666667 0.115892704074692 0.212555050951034 0.545236180256144 -0.0966623468763422 0.0397103381673025 0.105413196251009 NaN NaN 0.0965598749932297 0.316797208955966 112 0 888 0.888 0.112 0.224 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCA:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.00000000000001 6 32.916666666666664 0.115057659974651 0.208831643632827 0.550958935021114 -0.0937739836581756 0.039065769788926 0.0994069769739138 NaN NaN 0.095877819964595 0.328046078265379 119 0 881 0.881 0.119 0.238 N all ss13 200 CCA CTC CAG 2 ACTCCAGGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.50000000000001 6 34.083333333333336 0.115892704074692 0.200633974126986 0.577632500073694 -0.0847412700522943 0.0383455219852214 0.0949114178434743 0.378652663665521 0.127135841039982 0.0949515361281725 0.372141784612981 164 0 836 0.836 0.164 0.328 N all ss13 201 GGC CAG GCA 2 CCAGGCAGT:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.83333333333336 6 33.416666666666664 0.113692394224188 0.205237238024368 0.553955974649637 -0.0915448438001797 0.0384546895572402 0.0990932416433009 NaN NaN 0.0977588602510061 0.349049130274413 143 0 857 0.857 0.143 0.286 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT:GGCAGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.83333333333336 6 33.416666666666664 0.113692394224188 0.205237238024368 0.553955974649637 -0.0915448438001797 0.038369043114256 0.103399709108338 NaN NaN 0.0997169676101442 0.358594360901055 141 0 859 0.859 0.141 0.282 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG:AGTAGTAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.83333333333334 6 33.74999999999999 0.115334665090852 0.202909342656595 0.568404902311696 -0.0875746775657428 0.0370607407402179 0.0977327866004208 NaN NaN 0.0956212193203444 0.359745663153656 128 0 872 0.872 0.128 0.256 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.83333333333334 6 34.08333333333332 0.117025173722032 0.200633974126986 0.583276956114938 -0.0836088004049546 0.0399861561037252 0.0977499498643079 0.422738120098422 0.167660692476704 0.0917123394929313 0.361957321235611 149 0 851 0.851 0.149 0.298 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.5 6 34.749999999999986 0.117599765999126 0.196233824001589 0.599283872683304 -0.0786340580024629 0.038227748959031 0.0949693286895154 NaN NaN 0.0895720753003742 0.380005665595582 170 0 830 0.83 0.17 0.34 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAACTTCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.16666666666667 6 34.08333333333332 0.116456180279654 0.200633974126986 0.580440978584945 -0.084177793847332 0.0399017364934824 0.101107110979806 0.42783962619932703 0.174883270714129 0.0962613702461561 0.381861709539928 141 0 859 0.859 0.141 0.282 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:ACTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.33333333333334 6 34.58333333333332 0.102099130743435 0.19731556308439 0.517440840182322 -0.0952164323409554 0.035962078658402 0.100372441576051 NaN NaN 0.0904746874169503 0.292611652179452 118 1 881 0.881 0.118 0.236 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.58333333333334 6 34.999999999999986 0.101727620280473 0.194633396613814 0.522662718990196 -0.0929057763333406 0.0371180865963153 0.0944338099082381 0.405266815719856 0.197163318862748 0.0899128106992531 0.301469411905662 118 0 882 0.882 0.118 0.236 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.08333333333334 6 34.16666666666666 0.0995542025718477 0.200073130342575 0.49758906856401 -0.100518927770727 0.0361439260062646 0.0988317005595423 0.427749680792818 0.244719312176922 0.0898788185704159 0.263403522890552 93 0 907 0.907 0.093 0.186 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG:GCTCGAATT 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.75000000000001 6 33.499999999999986 0.0986178115404479 0.20465023999998 0.481884661070798 -0.106032428459532 0.0351821234548828 0.102671696437481 NaN NaN 0.0975559092560433 0.277085941632019 87 0 913 0.913 0.087 0.174 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT:CGAATTGCT 1:1 FALSE 2.25 0.25 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.75000000000001 6 33.999999999999986 0.0986178115404479 0.20119798994601 0.490153065479985 -0.102580178405562 0.0366498553099793 0.106944647773606 NaN NaN 0.095260218059625 0.28155097703098 84 0 916 0.916 0.084 0.168 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATTGCTGGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.16666666666669 6 34.499999999999986 0.0843980831669965 0.197860943283853 0.426552515955199 -0.113462860116857 0.0342006965303743 0.0915384480577807 0.295881511601508 0.149405967448073 0.086715078393108 0.190718706754067 44 0 956 0.956 0.044 0.088 N all ss13 213 AGC CTA GCA 2 GCTAGCGGA:GCTGGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.83333333333336 6 34.499999999999986 0.0836131751312665 0.197860943283853 0.422585547928548 -0.114247768152587 0.034448567003461 0.0904735185420713 NaN NaN 0.0879776916062039 0.194081480611879 51 0 949 0.949 0.051 0.102 N all ss13 214 AAT GCA ATG 2 AGCGGAGGT:GGCAATGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.1666666666667 5 33.83333333333332 0.0832261761385522 0.164591833676269 0.505651916499378 -0.0813656575377165 0.0326494507251954 0.0941480785985261 NaN NaN 0.078571582356108 0.300407047071847 107 0 893 0.893 0.107 0.214 N all ss13 215 GGT ATG GTG 2 AATGGTGGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.50000000000003 4 34.16666666666665 0.069333399391501 0.127288788480472 0.544693686059693 -0.0579553890889711 0.0303124552584938 0.075129829768701 NA NA 0.0653450654059058 0.375125733024046 172 0 828 0.828 0.172 0.344 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA:GGTGGTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.6666666666667 4 34.999999999999986 0.0701445435081175 0.123992985319038 0.565713804919153 -0.0538484418109203 0.0307234929290578 0.0723929794888729 NaN NaN 0.0672103100559912 0.423019820828824 181 0 819 0.819 0.181 0.362 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT:GGTGATGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.50000000000004 4 35.16666666666666 0.0703090568782303 0.123354245726484 0.56997678891514 -0.0530451888482533 0.0301742421125418 0.0725213233849109 NA NA 0.064111083629001 0.408013224161632 193 0 807 0.807 0.193 0.386 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC:GATGCTGCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000004 4 34.91666666666666 0.055516664918965 0.124314847835042 0.446581127562754 -0.0687981829160765 0.0280124409798875 0.0723518375756978 NA NA 0.0683362589785152 0.314050326265488 96 4 900 0.9 0.096 0.192 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC:GCTGCCCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666671 3 34.41666666666666 0.0546316519559279 0.0926626795339059 0.589575568402787 -0.038031027577978 0.0277956585144679 0.0644736088397223 NA NA 0.0503651037261835 0.450184959734156 179 12 809 0.809 0.179 0.358 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG:GCCCTTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.58333333333337 3 33.749999999999986 0.0541384900641951 0.0946134639951751 0.572207038809571 -0.04047497393098 0.0257501406611708 0.0613464997552857 NA NA 0.053536105902897 0.449630405195046 209 6 785 0.785 0.209 0.418 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA:CTTGCTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.41666666666671 3 33.583333333333314 0.0535344239114693 0.0951140793534504 0.562844368314093 -0.041579655441981 0.0257318171284443 0.0643582029271155 NA NA 0.0542743040947838 0.443615585373308 172 7 821 0.821 0.172 0.344 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG:GCTTTGCTA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333339 3 33.41666666666665 0.0534152253723938 0.0956200277799544 0.558619638715392 -0.0422048024075606 0.0254621773450739 0.0633330573990284 NA NA 0.0540953780816552 0.435277639955683 208 5 787 0.787 0.208 0.416 N all ss13 223 CTA TAT TAC 2 CTATTGCTG:TTGCTACTG 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.666666666666667 0 0.75 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000006 3 33.749999999999986 0.0536541558618204 0.0946134639951751 0.567087955521389 -0.0409593081333547 0.0277412792396937 0.0623446402909701 NA NA 0.0511367155533056 0.423145242796711 184 9 807 0.807 0.184 0.368 N all ss13 224 CTG TAC TGC 2 CTACTGCTT:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.25 1 0 0.75 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.16666666666673 3 34.91666666666665 0.0537142229868647 0.091251642986027 0.588638420407288 -0.0375374199991623 0.0264851950390592 0.0595194724484705 NA NA 0.0500061412714923 0.452859589063874 221 4 775 0.775 0.221 0.442 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTTGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.5833333333334 3 35.249999999999986 0.0534152253723938 0.0903346148069004 0.591304069725369 -0.0369193894345066 0.0265856318540404 0.0607341582724223 NA NA 0.0498503770335385 0.458933572231927 208 2 790 0.79 0.208 0.416 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTTGATCGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.25000000000006 3 35.33333333333332 0.0529436946379863 0.0901082338815474 0.587556678866705 -0.0371645392435611 0.0258959046838395 0.0610915243679846 NA NA 0.0509640195911783 0.465860416199511 193 5 802 0.802 0.193 0.386 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GATCGGTTG 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.5833333333334 3 35.33333333333332 0.0534152253723938 0.0901082338815474 0.592789616125551 -0.0366930085091536 0.0263789391114634 0.0580221638137966 NA NA 0.0479076902597599 0.443729489396446 211 3 786 0.786 0.211 0.422 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:CGGTTGAAT 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000007 3 35.41666666666665 0.0532965566864638 0.0898829861073046 0.592954896078297 -0.0365864294208408 0.0262370257044947 0.0578360602160093 NA NA 0.0515003108787546 0.477448797405094 219 2 779 0.779 0.219 0.438 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG:TTGAATGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.0833333333334 3 35.41666666666665 0.0523658652014987 0.0898829861073046 0.582600417157737 -0.0375171209058059 0.0255171992559885 0.0541344007789101 NA NA 0.0506816842254198 0.459148263949108 195 4 801 0.801 0.195 0.39 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT:AATGCACTT 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.41666666666673 3 36.41666666666665 0.0528271104098974 0.087265388607858 0.605361544280575 -0.0344382781979606 0.0262508287204187 0.0538757687095415 NA NA 0.0490862396193017 0.482936626438698 223 4 773 0.773 0.223 0.446 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG:GCACTTGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666674 2 37.08333333333332 0.0397883346582442 0.0559700169039056 0.71088659355877 -0.0161816822456614 0.0232980077736948 0.0442996227777929 NA NA 0.0397229264494313 0.683740810761247 341 20 639 0.639 0.341 0.682 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.00000000000007 2 37.16666666666666 0.0394828001140664 0.0558397336460622 0.707073575320514 -0.0163569335319958 0.0216105666795495 0.0428250822612803 NA NA 0.0407563467186152 0.688173767020228 341 17 642 0.642 0.341 0.682 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.00000000000007 2 36.16666666666666 0.0389698041980332 0.0574443341110379 0.678392478581195 -0.0184745299130046 0.0226916474938367 0.047598849046593 NA NA 0.04260892057835 0.664590833539279 327 17 656 0.656 0.327 0.654 N all ss13 234 AAA GCA AAA 2 AGCAAAATG:AGCAAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333341 2 36.16666666666666 0.0393103070130301 0.0574443341110379 0.684320005120865 -0.0181340270980077 0.0227884246671021 0.0448376573145615 NA NA 0.0435230393097605 0.6769318636753 334 17 649 0.649 0.334 0.668 N all ss13 235 ATG AAA TGT 2 AAAATGTCT:AAAGTTTCT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333341 2 36.16666666666666 0.0393103070130301 0.0574443341110379 0.684320005120865 -0.0181340270980077 0.0226276253535337 0.0446541400941613 NA NA 0.0431830159392484 0.674533491699299 339 15 646 0.646 0.339 0.678 N all ss13 236 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666674 1 36.33333333333332 0.0262035385209603 0.0280406490537152 0.9344840224905 -0.00183711053275499 0.0177823017880021 0.0292515299961915 NA NA 0.0374992329686909 0.960926774093963 455 45 500 0.5 0.455 0.91 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000007 1 35.91666666666666 0.0258367851740807 0.0283721774047871 0.91063808059093 -0.00253539223070643 0.0186633463511908 0.0307951085647438 NA NA 0.0375834438201526 0.946215227126774 486 34 480 0.48 0.486 0.96 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666674 1 35.74999999999999 0.0256161505491714 0.0285069944752381 0.898591767414213 -0.00289084392606671 0.018815040609497 0.0298551199554726 NA NA 0.0374844458254817 0.9385271602654 462 45 493 0.493 0.462 0.924 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA:AAAGGCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.0833333333334 1 35.41666666666666 0.0257259947650972 0.0287805096612113 0.893868630817515 -0.00305451489611408 0.0171885895876021 0.0289673917387957 NA NA 0.036350789738234 0.933033497443152 431 47 522 0.522 0.431 0.862 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA:GGCTCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.0833333333334 1 36.08333333333332 0.0257259947650972 0.0282386296527663 0.911021359089817 -0.00251263488766913 0.01710295311485 0.0313084080688196 NA NA 0.0354508518408494 0.943495988529214 487 60 453 0.453 0.487 0.906 N all ss13 241 CAA AAC AAA 2 CAACAACAA:TCACAAAAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.41666666666674 1 36.08333333333332 0.012698716061835 0.0282386296527663 0.449693070024415 -0.0155399135909314 0.0121877236962597 0.0294684144915014 NA NA 0.0322665745667285 0.630082831349188 261 134 605 0.605 0.261 0.522 N all ss13 242 AAA AAA AAC 2 CAAAAACAG:CAACAACAA 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000007 1 36.49999999999999 0.0257536031856686 0.0279101972553257 0.922730962811607 -0.00215659406965715 0.0180546501295129 0.0289485822553563 NA NA 0.035304819671087 0.951291534054616 499 53 448 0.448 0.499 0.896 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 AAACAGAGC:CAACAAGGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666674 1 36.58333333333332 0.0131150882907867 0.02784542552167 0.470996152692304 -0.0147303372308833 0.0128806935898457 0.0294410477288316 NA NA 0.033689389575095 0.661937550426714 288 133 579 0.579 0.288 0.576 N all ss13 244 AGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA:CAGAGCCAA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000007 1 36.33333333333332 0.0133633824875953 0.0280406490537152 0.476571796251797 -0.0146772665661199 0.013048314598708 0.0300577542949518 NA NA 0.0336508745940173 0.662718467540248 263 121 616 0.616 0.263 0.526 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 AGCCAAACA:GGCCAAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666674 0 36.49999999999999 0.013423177093157 0 -Inf 0.013423177093157 0.0133608055011181 0 NA NA 0.0133721301701133 0.315466630367569 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 246 ACA AAA CAG 2 CAAACAGTC:CAAACTGTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666674 0 35.49999999999999 0.0132453773639628 0 -Inf 0.0132453773639628 0.0128145057544844 0 NA NA 0.0128172683072753 0.301416297748708 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 247 GTC CAG TCA 2 ACAGTCACT:ACTGTCACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666674 0 35.49999999999999 0.0132453773639628 0 -Inf 0.0132453773639628 0.0135587599261872 0 NA NA 0.0135641859333321 0.328818581003581 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666674 0 35.49999999999999 0.0132453773639628 0 -Inf 0.0132453773639628 0.0130123659982678 0 NA NA 0.0134040836314099 0.32307436467636 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.16666666666674 0 35.16666666666666 0.0263763446044989 0 -Inf 0.0263763446044989 0.017948724773409402 0 NA NA 0.0184906020684051 0.153731855136249 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000007 0 34.16666666666666 0.0262608883838265 0 -Inf 0.0262608883838265 0.0182782468451146 0 NA NA 0.0187325370972387 0.160949182021838 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000007 0 34.66666666666666 0.026434454296256 0 -Inf 0.026434454296256 0.0189944564839999 0 NA NA 0.0187985110106191 0.159664931895811 858 142 0 0 0.858 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.00000000000007 0 34.33333333333333 0.0260895870640617 0 -Inf 0.0260895870640617 0.0182133688093588 0 NA NA 0.0179345871154816 0.145750121369383 883 117 0 0 0.883 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.66666666666673 0 33.666666666666664 0.0255343810572878 0 -Inf 0.0255343810572878 0.0177539375289893 0 NA NA 0.0177925069115924 0.151252928658599 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA:GCTGAGGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.00000000000007 0 33.333333333333336 0.025426163756761 0 -Inf 0.025426163756761 0.0183561712878321 0 NA NA 0.0175034260402528 0.146323941016227 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT:GAGGCTTCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.33333333333341 0 33.00000000000001 0.0253188599437158 0 -Inf 0.0253188599437158 0.0179202206116313 0 NA NA 0.0184530402036049 0.170041696934364 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCTAAA:GCTTCCAAG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.50000000000007 0 33.333333333333336 0.0252655469877565 0 -Inf 0.0252655469877565 0.0179926129563196 0 NA NA 0.017399414254589098 0.146476078094679 879 121 0 0 0.879 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAGAAA:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000007 0 32.833333333333336 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.0166189590541849 0 NA NA 0.0172136360471991 0.144689035223612 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 258 AAA AAA AAC 2 AAAAAGCCT:AAGAAACCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000007 0 31.58333333333334 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0178941026374834 0 NA NA 0.0178133548567876 0.165238135319203 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 259 CCT AAC CTC 2 AAACCTCGC:AAGCCTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.91666666666673 0 31.750000000000004 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.0172333812862203 0 NA NA 0.0183606379237257 0.176415205087017 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.91666666666673 0 31.750000000000004 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.0169739831243507 0 NA NA 0.0173346497683091 0.152175609311275 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.0833333333334 0 31.58333333333334 0.0247700531384151 0 -Inf 0.0247700531384151 0.0180097602844642 0 NA NA 0.0176283121479215 0.159982913263523 858 142 0 0 0.858 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666673 0 31.250000000000004 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0168173988576049 0 NA NA 0.0174007327808956 0.156292029514285 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.25000000000006 0 31.750000000000004 0.0250283912732922 0 -Inf 0.0250283912732922 0.0176372133960284 0 NA NA 0.0177677477943473 0.15894112828679 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000006 0 32.75 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.0170978818700419 0 NA NA 0.018026655851373 0.159722102550994 853 147 0 0 0.853 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCCACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333339 0 32.41666666666667 0.0252389746234554 0 -Inf 0.0252389746234554 0.0172467017181362 0 NA NA 0.0176343668801695 0.152362038345732 881 119 0 0 0.881 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCCACTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.91666666666671 0 31.750000000000004 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.0178046566455132 0 NA NA 0.0180737521898915 0.169648626576985 855 145 0 0 0.855 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACTAAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666671 0 31.750000000000004 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0179586874882369 0 NA NA 0.018108602296473 0.173123153712655 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 268 CAA AAC AAT 2 AAACAATAC:AAACAGTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.75000000000004 0 31.750000000000004 0.0248727457165764 0 -Inf 0.0248727457165764 0.0173999004126367 0 NA NA 0.0166971650505903 0.136319221567973 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 269 TAC AAT ACA 2 CAATACAAT:CAGTACAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.75000000000004 0 32.083333333333336 0.0248727457165764 0 -Inf 0.0248727457165764 0.0175495863030235 0 NA NA 0.0178618161227927 0.163768216392416 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 32.25000000000001 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.017245626871129 0 NA NA 0.017133418459763 0.145745411216944 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT:AATGTCACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.25000000000003 0 31.91666666666667 0.0250283912732922 0 -Inf 0.0250283912732922 0.0173159164102161 0 NA NA 0.0176922181125927 0.157169567272235 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA:GTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.9166666666667 0 32.75 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.0180512023062954 0 NA NA 0.0178988422186187 0.160264498342528 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA:ACTCAGGCA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 32.083333333333336 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.0172682790358533 0 NA NA 0.017181562703415 0.146877700439518 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAGGCATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.08333333333337 0 31.916666666666664 0.0247700531384151 0 -Inf 0.0247700531384151 0.0167328107088732 0 NA NA 0.0166895270813289 0.13776449816735 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGC:GCATTTGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.08333333333337 0 31.583333333333332 0.0244670014671393 0 -Inf 0.0244670014671393 0.0175810542027224 0 NA NA 0.0179840292451198 0.173676506313967 857 143 0 0 0.857 0.001 N all ss13 276 GGC TTG GCA 2 TTTGGCAGA:TTTGGGAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.91666666666671 0 31.249999999999996 0.0245169940203504 0 -Inf 0.0245169940203504 0.0170198292139834 0 NA NA 0.0180932260155165 0.175405710488807 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 277 AGA GCA GAC 2 GGCAGACGT:GGGAGACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000004 0 31.916666666666664 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0180513749599739 0 NA NA 0.0185053003115779 0.181620941665468 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000004 0 31.749999999999996 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0183999065219417 0 NA NA 0.017413211088943 0.155737050774886 854 146 0 0 0.854 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA:CGTGGTCCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 32.416666666666664 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.0166221015353135 0 NA NA 0.0178375955888085 0.162324392116013 877 123 0 0 0.877 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA:GGTCCTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 32.416666666666664 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.0173416105917272 0 NA NA 0.0175440218000276 0.155410288218584 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCTGAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666671 0 31.58333333333333 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0174441376448311 0 NA NA 0.0178840355042141 0.167789266827032 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.16666666666671 0 31.16666666666666 0.0244420815742095 0 -Inf 0.0244420815742095 0.0166752710018411 0 NA NA 0.0171866129398759 0.154980346340939 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.50000000000004 0 31.83333333333333 0.0252655469877565 0 -Inf 0.0252655469877565 0.0174725546656679 0 NA NA 0.0177452353737032 0.154506319761775 888 112 0 0 0.888 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.83333333333337 0 31.499999999999993 0.0254801574935108 0 -Inf 0.0254801574935108 0.018636567186883 0 NA NA 0.0180662888756707 0.158430366582376 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.1666666666667 0 31.499999999999993 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0180360750369684 0 NA NA 0.0177594579261394 0.147888882965332 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 286 AAT GAA ATT 2 GGAAATTTC:GGAAATTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.1666666666667 1 31.83333333333333 0.0388855983989721 0.0320904564039067 1.21174962143069 0.00679514199506537 0.0230459877796138 0.0339273720339922 NA NA 0.0272666225864094 0.803197579162469 603 45 352 0.352 0.603 0.704 N all ss13 287 TTC ATT TCG 2 AATTTCGGG:AATTTTGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.6666666666667 1 31.66666666666666 0.0391393148779276 0.0322630388127681 1.21313169243184 0.00687627606515953 0.0227708414876256 0.0342139136125933 NA NA 0.0277384361842511 0.80421407461917 570 51 379 0.379 0.57 0.758 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.33333333333336 1 31.499999999999996 0.0393103070130301 0.0324374878453625 1.21187889766409 0.00687281916766765 0.0233204560693719 0.0336756841410602 NA NA 0.028582990574527 0.809980360570628 576 33 391 0.391 0.576 0.782 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.83333333333336 1 32 0.0395696157178212 0.0319197108140969 1.23966084618617 0.00764990490372429 0.0236419084035927 0.0330640067350899 NA NA 0.0282229717219257 0.786350712179041 577 59 364 0.364 0.577 0.728 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAA:GACCAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 1 31.75 0.0394395350433882 0.0321765161581571 1.22572421605656 0.00726301888523109 0.0220796285384044 0.0350716622757105 NA NA 0.0283278652530461 0.797648686277119 594 57 349 0.349 0.594 0.698 N all ss13 291 GAA AAG AAT 2 CAAGAATTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.4166666666667 1 31.083333333333332 0.0528271104098974 0.0328819783981324 1.60656727433705 0.0199451320117651 0.02595566784349 0.0340487112998836 NA NA 0.0321081537846642 0.53447732364090506 742 17 241 0.241 0.742 0.482 N all ss13 292 CTA AAT TAA 2 GAATTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.6666666666667 1 30.833333333333332 0.0391393148779276 0.0331545693783718 1.18051042772584 0.00598474549955588 0.0228356333383168 0.035719874811208203 NA NA 0.0282975557958853 0.832502303490312 578 48 374 0.374 0.578 0.748 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:TTAATCAGA 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.00000000000003 1 30.5 0.0379827996140662 0.0335251341884302 1.13296487944184 0.00445766542563598 0.0218155027556709 0.0359175369557161 NA NA 0.0286264637047997 0.876255039809411 585 39 376 0.376 0.585 0.752 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.6666666666667 1 31.5 0.0376648177342698 0.0324374878453625 1.16115088547631 0.00522732988890728 0.0208280894769137 0.0347089211591397 NA NA 0.028643874253018 0.855195207772941 561 57 382 0.382 0.561 0.764 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.33333333333336 1 31.333333333333332 0.0373521168628637 0.0326138339548042 1.1452844493728 0.00473828290805952 0.0219481011097704 0.0357578362038799 NA NA 0.029026200006867 0.870328224885609 571 44 385 0.385 0.571 0.77 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.00000000000001 1 32 0.0379827996140662 0.0319197108140969 1.18994811185105 0.00606308879996927 0.0216096597061157 0.0332037418548379 NA NA 0.0292245853833123 0.835646451588445 568 44 388 0.388 0.568 0.776 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAG:GGAACTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000001 1 31.666666666666664 0.0769906155450625 0.0322630388127681 2.38634110047295 0.0447275767322944 0.0458862740302347 0.0357478666004888 NA NA 0.0479915785290824 0.351342711511727 826 27 147 0.147 0.826 0.294 N all ss13 298 GAG CTG AGT 2 ACTGAGTAC:ACTGATTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000001 1 31.666666666666664 0.0769906155450625 0.0322630388127681 2.38634110047295 0.0447275767322944 0.0464997400014554 0.0342270648381678 NA NA 0.0483836336717802 0.355259316057601 804 15 181 0.181 0.804 0.362 N all ss13 299 TAC AGT ACA 2 GAGTACAAA:GATTACAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.00000000000001 1 31.666666666666664 0.0635974024950577 0.0322630388127681 1.97121550961557 0.0313343636822896 0.0456667939366195 0.0336477909667497 NA NA 0.0469359740916612 0.504390217698937 754 35 211 0.211 0.754 0.422 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.83333333333336 1 31.5 0.062929976401818 0.0324374878453625 1.94003853509929 0.0304924885564555 0.0428820661430446 0.0338964339236181 NA NA 0.0470573492878657 0.516994211177957 724 47 229 0.229 0.724 0.458 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.83333333333336 1 31.5 0.062929976401818 0.0324374878453625 1.94003853509929 0.0304924885564555 0.0435889132616884 0.0331969865072626 NA NA 0.0466821697485078 0.513631557951644 729 35 236 0.236 0.729 0.472 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000001 1 32.166666666666664 0.0640047012994633 0.0317507728699206 2.01584703344651 0.0322539284295428 0.0428473480457722 0.0345896638988845 NA NA 0.0475267830382688 0.497361292562309 727 51 222 0.222 0.727 0.444 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.50000000000001 1 32.5 0.0648351627055778 0.0314182062818701 2.06361757650662 0.0334169564237077 0.0450936518201889 0.0323221175014594 NA NA 0.0442571506844337 0.450210918528876 718 61 221 0.221 0.718 0.442 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.50000000000001 1 31.5 0.0648351627055778 0.0324374878453625 1.99877262427544 0.0323976748602153 0.0463667686738226 0.0346322510075869 NA NA 0.0474830131339366 0.495049073371118 722 44 234 0.234 0.722 0.468 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.33333333333336 1 30.5 0.0658317081617892 0.0335251341884302 1.96365233892213 0.032306573973359 0.0444884905030265 0.0340284828862746 NA NA 0.0487935142561937 0.507902037563961 681 57 262 0.262 0.681 0.524 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.16666666666669 1 29.833333333333332 0.0659765797094679 0.0342916870035713 1.92398174235629 0.0316848927058965 0.0457654241439716 0.0355685399796166 NA NA 0.0497552861814702 0.524245614416379 700 41 259 0.259 0.7 0.518 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.16666666666669 1 30.5 0.0659765797094679 0.0335251341884302 1.96797362058694 0.0324514455210377 0.0447322461030993 0.0331215047922444 NA NA 0.0451241619767217 0.472042981083966 707 56 237 0.237 0.707 0.474 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCA:CAATTTGCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.83333333333336 1 30.833333333333332 0.0662682453670823 0.0331545693783718 1.99876658359834 0.0331136759887106 0.0458395750782856 0.034060574713212 NA NA 0.0468498390174743 0.479687991680822 728 50 222 0.222 0.728 0.444 N all ss13 309 GCA TTG CAC 2 TTTGCACCT:TTTGCTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.16666666666669 1 31.499999999999993 0.0668593871386967 0.0324374878453625 2.0611764837472 0.0344218992933343 0.0447879292278911 0.0341762069864043 NA NA 0.0477036622319923 0.4705541482155 743 46 211 0.211 0.743 0.422 N all ss13 310 CCA CAC CAA 2 GCACCTAGC:GCTCCAAGT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.83333333333336 1 31.499999999999993 0.0662682453670823 0.0324374878453625 2.04295245313075 0.0338307575217198 0.0461316242653325 0.0333195176532284 NA NA 0.0480293788389278 0.481198443623537 727 43 230 0.23 0.727 0.46 N all ss13 311 AGC CAA GCG 2 CCAAGTGCC:CCTAGCGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.66666666666669 1 31.66666666666666 0.0664150480060838 0.0322630388127681 2.05854905334584 0.0341520091933157 0.04481303768388 0.0335382747494476 NA NA 0.0472995764361628 0.470272185602187 726 52 222 0.222 0.726 0.444 N all ss13 312 GCC GCG CCT 2 AGCGCTTCT:AGTGCCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.33333333333336 1 31.33333333333333 0.0667106145123721 0.0326138339548042 2.04546986425511 0.034096780557568 0.0462722647619899 0.0343539079484279 NA NA 0.0500276467775224 0.495518003853214 737 46 217 0.217 0.737 0.434 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA:GCTTCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.00000000000001 1 31.33333333333333 0.0661220906960037 0.0326138339548042 2.02742464402176 0.0335082567411995 0.0433731179209836 0.0351953653945335 NA NA 0.0452827430687145 0.459313034151587 712 54 234 0.234 0.712 0.468 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.00000000000003 1 30.333333333333332 0.0652585327422223 0.0337135408966997 1.93567720881584 0.0315449918455226 0.0446201078444848 0.0353378768359233 NA NA 0.0490590443346369 0.520223751521954 698 46 256 0.256 0.698 0.512 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.33333333333336 1 29.666666666666664 0.0641416300786215 0.0344888349313675 1.85977955492735 0.029652795147254 0.0430724757373793 0.0369136203008184 NA NA 0.0499277164743728 0.552569295199557 695 59 246 0.246 0.695 0.492 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.00000000000003 1 30.333333333333332 0.0652585327422223 0.0337135408966997 1.93567720881584 0.0315449918455226 0.0441541207680167 0.0343499765852767 NA NA 0.0499740528959981 0.527891843982406 719 38 243 0.243 0.719 0.486 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.33333333333336 1 29.499999999999993 0.0649756739796766 0.0346882632380668 1.87313136820216 0.0302874107416098 0.0432537003575291 0.0342688679132783 NA NA 0.0445300420503879 0.496405184985522 699 49 252 0.252 0.699 0.504 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGAATGTCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.75000000000003 1 29.083333333333325 0.0646255322826462 0.0351970741664875 1.83610523922976 0.0294284581161587 0.0437159991804924 0.0354690795482816 NA NA 0.05033942300162 0.558816287786104 688 47 265 0.265 0.688 0.53 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCGCGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.25000000000003 1 29.249999999999993 0.0650461583956241 0.0349917687305995 1.85889884265103 0.0300543896650246 0.047020105182706 0.0365760506431222 NA NA 0.0505092016314094 0.551824748951858 693 40 267 0.267 0.693 0.534 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCGCGCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.08333333333336 1 29.41666666666666 0.0651875872755847 0.0347888449357013 1.87380717572165 0.0303987423398834 0.0461108863032186 0.0373588579321064 NA NA 0.0490893372588372 0.535749393367647 726 47 227 0.227 0.726 0.454 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.4166666666667 1 29.749999999999993 0.0649053422482923 0.0343899783720918 1.88733303481704 0.0305153638762005 0.0449207358358991 0.0355457817819907 NA NA 0.0497901000701722 0.539955590917807 684 40 276 0.276 0.684 0.552 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.08333333333336 1 29.249999999999996 0.0643481259821295 0.0349917687305995 1.83895036794349 0.02935635725153 0.0439364327907454 0.0367890749681649 NA NA 0.0456761486571938 0.520414568013824 720 50 230 0.23 0.72 0.46 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.75000000000003 1 29.249999999999996 0.0638004014677688 0.0349917687305995 1.82329741485679 0.0288086327371693 0.0429623157367998 0.0354973841098788 NA NA 0.0483573585410476 0.551345892782587 702 33 265 0.265 0.702 0.53 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.4166666666667 1 29.249999999999996 0.06407309248799 0.0349917687305995 1.83109041961515 0.0290813237573904 0.0431969671828719 0.0360992955141699 NA NA 0.0469343001499164 0.535509501736245 714 46 240 0.24 0.714 0.48 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.4166666666667 1 30.249999999999996 0.0649053422482923 0.0338085407384937 1.91979129623872 0.0310968015097986 0.0449292545108053 0.0351218440376412 NA NA 0.0475331685984545 0.512974794902547 704 48 248 0.248 0.704 0.496 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.9166666666667 1 30.416666666666664 0.0644865306153867 0.0336190735350483 1.91815311472396 0.0308674570803384 0.0437472497162651 0.036468261603552 NA NA 0.0484818974471956 0.524333268448641 707 55 238 0.238 0.707 0.476 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.58333333333336 1 30.416666666666664 0.0639364560441675 0.0336190735350483 1.90179113584177 0.0303173825091193 0.0447623150609339 0.034911927059712 NA NA 0.0456075455955289 0.50621368185197 706 50 244 0.244 0.706 0.488 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.25000000000003 1 30.749999999999996 0.0642103145422438 0.0332464403304228 1.93134404477844 0.030963874211821 0.0449697343756407 0.034674017999146003 NA NA 0.0463823847611228 0.504402804376411 723 43 234 0.234 0.723 0.468 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.9166666666667 1 30.749999999999996 0.0636649250476358 0.0332464403304228 1.91493959698831 0.030418484717213 0.0441162757686878 0.0340311681725525 NA NA 0.0472518937863166 0.519736489465845 699 46 255 0.255 0.699 0.51 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.08333333333336 1 30.249999999999996 0.0627324732790301 0.0338085407384937 1.8555214720523 0.0289239325405364 0.0443666854984646 0.0347812392131813 NA NA 0.0451813203123666 0.522059110069568 688 47 265 0.265 0.688 0.53 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.4166666666667 2 30.249999999999996 0.0756148767114708 0.0692133441658409 1.09248986048545 0.00640153254562992 0.0434497291304946 0.0532122548446815 NA NA 0.0542474931095097 0.906062861816633 525 17 458 0.458 0.525 0.916 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.4166666666667 2 30.916666666666664 0.0765808130596598 0.0676514664202386 1.13199043733884 0.0089293466394212 0.0458072692297287 0.0541868536971549 NA NA 0.0542578518234068 0.869280531243317 519 27 454 0.454 0.519 0.908 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAC:CTGACTTAT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.08333333333336 2 30.583333333333332 0.0749843548189804 0.0684234871721278 1.0958861922712 0.00656086764685253 0.0445161144058792 0.0542100130106792 NA NA 0.0553113876511733 0.905578842544734 545 15 440 0.44 0.545 0.88 N all ss13 334 TAC CTT ACA 2 ACTTACACA:ACTTATCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.75000000000003 2 31.249999999999996 0.0743642698449398 0.0668966841033532 1.11162863812576 0.00746758574158662 0.0437958591175621 0.051373415758364 NA NA 0.0531585568461791 0.888282660647001 538 19 443 0.443 0.538 0.886 N all ss13 335 ACA ACA ATG 2 TACACAGGT:TATCATGGA 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.00000000000003 2 30.999999999999996 0.0741343759774745 0.0674611774972046 1.09891909284486 0.0066731984802698 0.0433793039958199 0.0501948810269603 NA NA 0.0539531977197841 0.901564729516876 512 19 469 0.469 0.512 0.938 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 ACAGGTGCC:CATGGAGCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.6666666666667 1 31.666666666666664 0.0615098637456264 0.0322630388127681 1.90651178590418 0.0292468249328582 0.0436221782629299 0.035791448302829 NA NA 0.0438992161792927 0.505266281975967 682 51 267 0.267 0.682 0.534 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT:GGTGCCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.50000000000004 1 31.999999999999996 0.0616363094417144 0.0319197108140969 1.93097956935416 0.0297165986276174 0.0415822178759857 0.0344074719632992 NA NA 0.0460860452414658 0.51905234871496 714 45 241 0.241 0.714 0.482 N all ss13 338 ATC CCA TCA 2 GCCATCAAG:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.58333333333339 1 31.583333333333332 0.0608235875568599 0.0323500281131817 1.88017108807631 0.0284735594436782 0.0417940448128671 0.0330205540851329 NA NA 0.0445068257819023 0.522330502783182 697 45 258 0.258 0.697 0.516 N all ss13 339 AAA TCA AAT 2 ATCAAGCTT:ATTAAATTG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.41666666666671 1 31.41666666666666 0.0602128625824297 0.0325254218363474 1.85125539294748 0.0276874407460823 0.0415043623837312 0.0327147181086316 NA NA 0.045872646863675 0.546128297928497 707 42 251 0.251 0.707 0.502 N all ss13 340 CTT AAT TGG 2 AAATTGGAT:AAGCTTGAT 1:1 TRUE 2 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.66666666666671 1 31.16666666666666 0.0600320307551523 0.0327921082603737 1.83068530630876 0.0272399224947786 0.0422447873714988 0.0355137617534232 NA NA 0.0458542274223905 0.552475481604537 696 56 248 0.248 0.696 0.496 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 CTTGATGAC:TTGGATGAC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.33333333333339 1 30.83333333333333 0.0472597258715505 0.0331545693783718 1.42543627492807 0.0141051564931788 0.0377462432773731 0.0333726741490165 NA NA 0.0442877349562179 0.750114036051859 544 124 332 0.332 0.544 0.664 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.00000000000006 1 30.83333333333333 0.0723451996406716 0.0331545693783718 2.18205818977898 0.0391906302622998 0.0451260312431711 0.0360050752143989 NA NA 0.0506721488786683 0.439276462461647 737 51 212 0.212 0.737 0.424 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.33333333333339 1 31.83333333333333 0.0738300546099394 0.0320904564039067 2.3006857141786 0.0417395982060327 0.0462081785979914 0.0350815827093135 NA NA 0.0511340894141783 0.414341534710806 793 40 167 0.167 0.793 0.334 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.66666666666671 1 31.83333333333333 0.0753771912377858 0.0320904564039067 2.34889745066416 0.0432867348338791 0.0480471686692875 0.0335011499993925 NA NA 0.0517668458630909 0.403050022582525 771 48 181 0.181 0.771 0.362 N all ss13 345 CCA ATC CAA 2 GATCCAAGC:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.33333333333339 1 31.499999999999993 0.0766624238758938 0.0324374878453625 2.36338967559271 0.0442249360305313 0.0489560751495985 0.03219906556209 NA NA 0.0539290599742541 0.412183266074015 779 53 168 0.168 0.779 0.336 N all ss13 346 AGC CAA AAT 2 CCAAGCTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 3 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000006 1 31.83333333333333 0.0769906155450625 0.0320904564039067 2.39917483802722 0.0449001591411558 0.0479708751935874 0.0351336400207863 NA NA 0.0496850960345481 0.36615729758244 796 55 149 0.149 0.796 0.298 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AGCTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.16666666666673 1 31.999999999999993 0.0379028017472667 0.0319197108140969 1.18744189031084 0.00598309093316983 0.0282572639198915 0.0347345048373168 NA NA 0.035324640281384 0.865502132132347 506 121 373 0.373 0.506 0.746 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.16666666666673 1 31.999999999999993 0.0379028017472667 0.0319197108140969 1.18744189031084 0.00598309093316983 0.0278022501815196 0.035360637377125 NA NA 0.0345814359996114 0.862640005729654 519 121 360 0.36 0.519 0.72 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.16666666666673 1 32.33333333333332 0.0383879094086674 0.0315836140125951 1.21543751748482 0.00680429539607223 0.0291487967109958 0.032696645263339597 NA NA 0.0350853870874629 0.846226535723636 505 139 356 0.356 0.505 0.712 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.66666666666673 1 33.16666666666666 0.0391393148779276 0.0307735475083969 1.27184930067774 0.00836576736953079 0.0294721975891536 0.0327720453170939 NA NA 0.0337941702544237 0.804482130942552 525 151 324 0.324 0.525 0.648 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.00000000000006 1 32.83333333333333 0.0389698041980332 0.0310925352587596 1.25334920017673 0.00787726893927364 0.0302390122473764 0.0343997508913708 NA NA 0.0336306062020028 0.814807071300686 512 152 336 0.336 0.512 0.672 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.16666666666673 2 32.49999999999999 0.0383879094086674 0.0642103145422439 0.597846462555669 -0.0258224051335765 0.0287058411240531 0.0508201580679018 NA NA 0.049453184703111 0.601559916290624 246 49 705 0.705 0.246 0.492 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.50000000000007 2 31.499999999999993 0.0377438129156367 0.0663415654213976 0.568931599305659 -0.0285977525057608 0.0269125395021893 0.0500587388136615 NA NA 0.0496350851402272 0.564507014037764 226 57 717 0.717 0.226 0.452 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.16666666666674 2 31.499999999999993 0.036968468787658 0.0663415654213976 0.557244444758525 -0.0293730966337395 0.0281098479152048 0.0521907690562906 NA NA 0.0503360248559925 0.559529668180672 229 31 740 0.74 0.229 0.458 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.66666666666674 2 32.166666666666664 0.0362974056463876 0.0649053422482923 0.559236025711621 -0.0286079366019047 0.0277599806590226 0.0499545687202872 NA NA 0.0506914336540498 0.572512925842613 248 38 714 0.714 0.248 0.496 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.00000000000007 2 33.166666666666664 0.036592623127074 0.0628640039123036 0.582091830773638 -0.0262713807852296 0.0259871082550906 0.0458139586931547 NA NA 0.0484490369407296 0.587647851694405 248 54 698 0.698 0.248 0.496 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.00000000000007 2 32.916666666666664 0.0491979618643599 0.0633621979772033 0.776456048479577 -0.0141642361128434 0.0303159201040838 0.0489589885740318 NA NA 0.050013804481976 0.777018521540749 372 17 611 0.611 0.372 0.744 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.33333333333341 2 32.58333333333333 0.0489970106942918 0.0640388786228151 0.765113502109882 -0.0150418679285234 0.0290005581328622 0.0502587002552583 NA NA 0.0520428665863059 0.772559622945949 371 14 615 0.615 0.371 0.742 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.16666666666674 3 31.416666666666664 0.0485017445945919 0.102140577511979 0.474852852568839 -0.0536388329173872 0.0305557057230423 0.0669686089331527 NA NA 0.0686954674315724 0.434908043586964 199 4 797 0.797 0.199 0.398 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.50000000000009 3 31.083333333333332 0.0483064312987563 0.103314927985559 0.467564874124566 -0.0550084966868022 0.0301811580136611 0.0691256152427744 NA NA 0.0707918413542521 0.43713180203703 181 7 812 0.812 0.181 0.362 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.00000000000009 3 30.25 0.0723451996406716 0.106372646579413 0.680110930460508 -0.0340274469387417 0.0392812037317187 0.0671371831314031 NA NA 0.0724237327492297 0.638470514448483 330 1 669 0.669 0.33 0.66 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 86.83333333333341 3 30.416666666666668 0.0724909899460754 0.105746684778908 0.685515485403984 -0.0332556948328328 0.0381685194193818 0.0687401056785116 NA NA 0.0755491927933638 0.659802419230525 329 2 669 0.669 0.329 0.658 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.16666666666674 3 30.416666666666668 0.0739819020881027 0.105746684778908 0.69961438737093 -0.0317647826908055 0.0386753862538359 0.0686599825529256 NA NA 0.0761669191321763 0.676647894778358 340 3 657 0.657 0.34 0.68 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.3333333333334 3 30.916666666666668 0.0747506138799603 0.103912304538584 0.719362487550303 -0.0291616906586236 0.0392109707802097 0.0675057669813068 NA NA 0.0728776784181419 0.689049195744319 321 2 677 0.677 0.321 0.642 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000007 3 30.583333333333332 0.0769906155450624 0.105128058952294 0.732350775923674 -0.0281374434072318 0.0419364921077358 0.0679276590690354 NA NA 0.0766650578795509 0.713605716066967 334 0 666 0.666 0.334 0.668 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.00000000000007 3 29.583333333333332 0.0779922851430356 0.108952531416164 0.715837292895288 -0.0309602462731284 0.0412198488231177 0.0699593996589033 NA NA 0.0780657556276302 0.691668427347241 356 1 643 0.643 0.356 0.712 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.50000000000007 4 30.41666666666667 0.092424480317961 0.144590316625212 0.639216252340962 -0.0521658363072508 0.0442278654053609 0.0844394787383033 NaN NaN 0.0855748098074102 0.542131207641703 264 0 736 0.736 0.264 0.528 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.50000000000007 4 31.416666666666668 0.0936627429044698 0.139531497680893 0.671265946837863 -0.0458687547764233 0.0450285459866684 0.0774605570645427 NaN NaN 0.0839814389792645 0.58494407503394 247 0 753 0.753 0.247 0.494 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.00000000000007 4 31.916666666666668 0.09429441687774 0.137132914796851 0.687613305802097 -0.042838497919111 0.0456514601329954 0.079925169823178 NaN NaN 0.083706884558857 0.608813446962225 292 1 707 0.707 0.292 0.584 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.00000000000007 4 31.916666666666668 0.0955837099260902 0.137132914796851 0.69701508254009 -0.0415492048707608 0.0477175933834473 0.0787171124157211 NaN NaN 0.0830279408965771 0.616776298462753 291 1 708 0.708 0.291 0.582 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.00000000000007 4 31.25 0.0955837099260902 0.140349835343382 0.681038988697303 -0.0447661254172923 0.0445154715856901 0.0819380411431691 NaN NaN 0.0834367438165265 0.591593887497055 252 1 747 0.747 0.252 0.504 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.50000000000007 4 31.749999999999996 0.0962416871584159 0.137923200937065 0.697791861735657 -0.0416815137786494 0.0481105811094582 0.0765293217591896 NaN NaN 0.0831168197886112 0.61603257968523 293 1 706 0.706 0.293 0.586 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.83333333333341 4 31.749999999999996 0.0971332319175819 0.137923200937065 0.70425592835468 -0.0407899690194833 0.0445495206549923 0.0796450009826772 NA NA 0.0817137817856875 0.617651863709715 293 1 706 0.706 0.293 0.586 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAC:AAGACTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAC CTG ACG 2 ACTGACGAA:ACTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ACG AAA 2 GACGAAAGC:GATGAAGCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 AGC AAA CTC 2 GAAAGCCAG:GAAGCTCAG 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 AGCCAGCCT:GCTCAGCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAA:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAA AAC AAC 2 AAACAACAA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CAA AAC AAA 2 CAACAAACT:CAGCCCACT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTG:CCCACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG:CTTCCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT:CCTGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CGG CAG 2 GCGGCTGAC:GCTGCAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAAA:TTCTCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAATTG:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TGC 2 CAACTTCAA:CAATTGCAA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TGC AAA 2 CTTCAAAAT:TTGCAACAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA AAT 2 CAAAATTCC:CAACAATCC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC AAT CCA 2 AATTCCATG:CAATCCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGC:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGC TGA GC- 1 ATGAGC---:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 --- GTG GAG 1 AGC------:AGTGGAGCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 --- GAG CTT 1 ------AGT:GGAGCTTCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 AGT --A CTG 1 ---AGTGCT:GCTTCTGCT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 AGTGCTGAT:TCTGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA:ACTCAGGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCTTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410540 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.50000000000003 2 33.74999999999999 0.069333399391501 0.0617314855970427 1.123144838018 0.00760191379445824 0.0309051756597074 0.0444636514424864 NaN NaN 0.0556276490833939 0.891301832153094 564 0 436 0.436 0.564 0.872 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333336 2 33.91666666666666 0.0694941228620285 0.0614153696041381 1.13154285824482 0.00807875325789041 0.0308503011526793 0.044909868100266 NA NA 0.0572133782758181 0.887708849822784 571 0 429 0.429 0.571 0.858 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.66666666666669 2 33.91666666666666 0.0691734181620252 0.0614153696041381 1.12632096180309 0.0077580485578871 0.030889269240075 0.0467196727685994 NaN NaN 0.0556476368997307 0.889123167507614 571 1 428 0.428 0.571 0.856 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCA:AATGGACCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666669 2 34.24999999999999 0.0701445435081176 0.0607927570603562 1.15383060252518 0.0093517864477614 0.0313338151002758 0.0427128660008855 NA NA 0.0566730253131521 0.868933742560372 568 0 432 0.432 0.568 0.864 N all ss13 6 CCA GAC CAC 2 GGACCACAA:GGACCCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666669 2 35.24999999999999 0.0711433450940078 0.0589984642956841 1.20585079532675 0.0121448807983237 0.0318265582926394 0.043132768746063 NA NA 0.056486494904997 0.829763393216577 602 1 397 0.397 0.602 0.794 N all ss13 7 CAA CAC AA- 1 CCACAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.166666666666667 1.33333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.33333333333336 2 35.58333333333333 0.0714826348532436 0.058423686245627 1.22352147642163 0.0130589486076166 0.0320406197017889 0.0434195327687834 NaN NaN 0.0552677120776498 0.813211283398669 602 2 396 0.396 0.602 0.792 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAT:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.00000000000001 2 35.25 0.0718251788190063 0.0589984642956841 1.21740759995105 0.0128267145233222 0.0313748719344618 0.0435536595993577 NaN NaN 0.0558582152634393 0.818379396710986 598 0 402 0.402 0.598 0.804 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AATCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.00000000000001 2 36.25 0.070807263353306 0.0573071018565008 1.23557571504157 0.0135001614968051 0.0303605234315478 0.0406056983493845 NA NA 0.0558026850889684 0.808836932589837 579 0 421 0.421 0.579 0.842 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AATCAGCGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666669 2 36.58333333333333 0.0711433450940078 0.0567646707244323 1.25330322868211 0.0143786743695755 0.0313849293298383 0.043864303499971 NaN NaN 0.0562916673257767 0.798389715781282 609 2 389 0.389 0.609 0.778 N all ss13 11 CGA AAC GAA 2 CAACGTAGT:CAGCGAAAT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.08333333333336 2 36.166666666666664 0.0707237388415596 0.0574443341110379 1.23116996542867 0.0132794047305218 0.0304169295094013 0.0416024476857603 NA NA 0.0561124628496033 0.812922929436244 619 1 380 0.38 0.619 0.76 N all ss13 12 AAT GAA ATG 2 CGAAATGCA:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.50000000000001 2 35.99999999999999 0.0703090568782304 0.0577207808520962 1.21808914987464 0.0125882760261342 0.0310702814662423 0.042635519443381 NaN NaN 0.0549814149557866 0.81890380475395 582 1 417 0.417 0.582 0.834 N all ss13 13 GCA ATG CAC 2 AATGCACCC:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.83333333333336 2 36.66666666666666 0.0562324166616758 0.0566306643811089 0.992967631162633 -3.9824771943308e-4 0.0282250345203254 0.0429199445871237 NA NA 0.0532268064067657 0.994030212153656 489 2 509 0.509 0.489 0.978 N all ss13 14 CCC CAC CCC 2 GCACCCCGC:GCCCCCCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.33333333333336 2 36.83333333333333 0.0558397336460622 0.0563645417845084 0.990689037436823 -5.24808138446201e-4 0.0276376546362267 0.0433332577290131 NA NA 0.0522878042873227 0.991991836599238 525 2 473 0.473 0.525 0.946 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.25000000000001 2 36.58333333333333 0.0695747645549367 0.0567646707244323 1.22567018652661 0.0128100938305044 0.0295338601038092 0.0413199245127225 NaN NaN 0.0541803043907727 0.813095518471914 590 2 408 0.408 0.59 0.816 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA:CGCATTACG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.25000000000001 2 36.58333333333333 0.0695747645549367 0.0567646707244323 1.22567018652661 0.0128100938305044 0.0317647867199318 0.0430608127108572 NaN NaN 0.0547874003300299 0.81512891827501 638 0 362 0.362 0.638 0.724 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT:ATTACGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.25000000000003 2 35.74999999999999 0.0686192553184994 0.0581404786806199 1.18023203240967 0.0104787766378794 0.0305717944683715 0.0447008937441359 NA NA 0.0545651169114682 0.847709558278314 589 0 411 0.411 0.589 0.822 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT:ACGTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.91666666666669 2 35.74999999999999 0.0679967073757475 0.0581404786806199 1.16952438161492 0.0098562286951276 0.0303362401936157 0.0418785593710395 NaN NaN 0.0538193697071122 0.854691825522808 620 2 378 0.378 0.62 0.756 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.41666666666669 2 35.74999999999999 0.0684625513252421 0.0581404786806199 1.17753676747871 0.0103220726446222 0.0292884935002374 0.041744732184756 NaN NaN 0.0530341699789137 0.845682141064214 587 0 413 0.413 0.587 0.826 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.75000000000001 2 35.916666666666664 0.0690937042816379 0.0578600049104132 1.19415310089617 0.0112336993712246 0.0308567874219762 0.0424568552991427 NA NA 0.0534184111599168 0.833436347620431 603 1 396 0.396 0.603 0.792 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.33333333333334 2 35.33333333333333 0.0685408136920715 0.0588537115811214 1.16459628204753 0.00968710211095006 0.030700927868532 0.0420738179451322 NA NA 0.0546404469783292 0.859282081992475 608 2 390 0.39 0.608 0.78 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.66666666666667 2 35.666666666666664 0.068228833654295 0.0582817382454872 1.17067259330718 0.00994709540880778 0.0310832215054581 0.0424845902709227 NA NA 0.0530747693921133 0.851333970118213 593 0 407 0.407 0.593 0.814 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.33333333333334 1 35 0.0676133227457231 0.0291298749871979 2.32109896714071 0.0384834477585252 0.029925024089422 0.0313772381259944 NA NA 0.0423075329726449 0.363027067119409 837 2 161 0.161 0.837 0.322 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCAGCT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.00000000000001 1 35.666666666666664 0.068855661939842 0.0285748846742028 2.40965668715382 0.0402807772656393 0.030708074878204 0.0306921140265041 NA NA 0.0437482602826588 0.35718613828488 821 6 173 0.173 0.821 0.346 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC:TCAGCTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.08333333333336 1 35.58333333333333 0.0678428326164385 0.0286430990492925 2.36855769341461 0.039199733567146 0.0294103860832335 0.0296168120346556 NA NA 0.0426103337143849 0.357594509214959 832 0 168 0.168 0.832 0.336 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT:GCTGGCAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.91666666666669 0 35.74999999999999 0.0679967073757475 0 -Inf 0.0679967073757475 0.0292586852016752 0 NA NA 0.0299106857402111 0.0230066066666475 995 5 0 0 0.995 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC:GGCAGTAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333336 0 35.416666666666664 0.0534152253723939 0 -Inf 0.0534152253723939 0.0272941602456222 0 NA NA 0.0265390257181937 0.0441456904663065 977 23 0 0 0.977 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG:AGTAACCAG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666669 0 35.416666666666664 0.0400540111089283 0 -Inf 0.0400540111089283 0.0230587697587038 0 NA NA 0.0229473516073493 0.0809023526447124 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000003 0 35.58333333333333 0.0401433603117785 0 -Inf 0.0401433603117785 0.0232825006106788 0 NA NA 0.0233924538204332 0.0861471027063535 957 43 0 0 0.957 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333336 0 34.75 0.0397005575048303 0 -Inf 0.0397005575048303 0.0227622100162726 0 NA NA 0.0226302480942408 0.079376745052988 947 53 0 0 0.947 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGAA:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333336 1 35.416666666666664 0.0402331091273882 0.0287805096612113 1.39792900129257 0.0114525994661769 0.0229507000627831 0.0289454193657117 NA NA 0.0380764632533439 0.763583044416968 631 10 359 0.359 0.631 0.718 N all ss13 32 GAA GAG AAC 2 GGAGAACGC:GGAGGACGC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333336 1 36.416666666666664 0.0407801460981609 0.0279752710599065 1.45772121424074 0.0128048750382544 0.0227326834109019 0.0286835508797936 NA NA 0.0358349136765529 0.72084508008223 638 17 345 0.345 0.638 0.69 N all ss13 33 CGC AAC GCA 2 GAACGCAGT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333336 1 36.25 0.0267586909940917 0.0281063333749098 0.952052003267666 -0.00134764238081807 0.018322563500323 0.0282840666751925 NA NA 0.0337034070918828 0.968104809458677 491 38 471 0.471 0.491 0.942 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.08333333333336 1 35.916666666666664 0.0264053674769446 0.0283721774047871 0.93067821691011 -0.00196680992784252 0.0176956995749963 0.0283584138334046 NA NA 0.0338279367010452 0.953635848693242 478 53 469 0.469 0.478 0.938 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333336 1 35.916666666666664 0.0130864825012098 0.0283721774047871 0.461243503256884 -0.0152856949035773 0.0123109771878664 0.0306188115506429 NA NA 0.0324219663296614 0.637311514596401 272 131 597 0.597 0.272 0.544 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666669 1 36.08333333333333 0.0130296436641525 0.0282386296527663 0.461412038203352 -0.0152089859886138 0.012977125333209 0.0278830327587207 NA NA 0.0316947757514031 0.631328495910231 290 129 581 0.581 0.29 0.58 N all ss13 37 AGG CAA GAC 2 GCAAGGCCA:GCACGACCT 1:1 TRUE 1.75 1.08333333333333 0.166666666666667 0 0 2 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333336 1 35.416666666666664 0.0129174344873365 0.0287805096612113 0.448825772698039 -0.0158630751738747 0.0123182854106693 0.0295379016937611 NA NA 0.0335921478585992 0.636765705202675 250 126 624 0.624 0.25 0.5 N all ss13 38 CCA GAC CAA 2 AGGCCAAAA:CGACCTAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333336 1 36.25 0.0130438070339019 0.0281063333749098 0.46408782176995 -0.0150625263410079 0.0124514149835899 0.0275817961559532 NA NA 0.0319186154250754 0.636995222310397 292 139 569 0.569 0.292 0.584 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:CCTAAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666669 1 36.416666666666664 0.0130722263514627 0.0279752710599065 0.467277915680235 -0.0149030447084438 0.0133564257867556 0.0281995162180601 NA NA 0.0316918554767546 0.638177549876032 291 120 589 0.589 0.291 0.582 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGT:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000001 1 36.166666666666664 0.0132307731029258 0.0281723261817364 0.469637225466426 -0.0149415530788106 0.0127621559763689 0.0293595230652378 NA NA 0.0313980806640163 0.634163627966341 293 129 578 0.578 0.293 0.586 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGTCGT:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000001 1 36.666666666666664 0.0134081783305544 0.0277809537602618 0.482639237164479 -0.0143727754297074 0.0134846126962096 0.0266564071181981 NA NA 0.0316929666052319 0.65018840093146 274 130 596 0.596 0.274 0.548 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGTCGTCCC 1:1 FALSE 1 1 0.75 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666669 1 37 0.0134683754007452 0.0275260251378209 0.489296051039333 -0.0140576497370757 0.0133707801650474 0.0282434071082925 NA NA 0.0312151524243907 0.652460266222975 287 122 591 0.591 0.287 0.574 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGTCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666669 1 37.25 0.0134683754007452 0.0273378783823658 0.492663520276429 -0.0138695029816206 0.0135075098846906 0.0260354144096861 NA NA 0.0310941896304811 0.655562529834296 299 128 573 0.573 0.299 0.598 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666669 1 37.08333333333333 0.0134683754007452 0.0274630224286674 0.490418541357858 -0.0139946470279222 0.0133502293161947 0.0272432806815433 NA NA 0.0312792209597675 0.654578808125083 277 110 613 0.613 0.277 0.554 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000001 1 36.08333333333333 0.0134986770919624 0.0282386296527663 0.47802167661631 -0.0147399525608039 0.0130798525801297 0.0285603403575171 NA NA 0.030631956250181 0.630377719893071 263 114 623 0.623 0.263 0.526 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 2 36.08333333333333 0.0134683754007452 0.0575822255219405 0.233898139202927 -0.0441138501211953 0.0132741497119104 0.0439524615617001 NA NA 0.0461311581455398 0.338935760075887 144 42 814 0.814 0.144 0.288 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 2 35.75 0.0134683754007452 0.0581404786806199 0.231652296410051 -0.0446721032798747 0.0132390345777073 0.0423330268244882 NA NA 0.0465582465987417 0.337312698529207 107 46 847 0.847 0.107 0.214 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666667 2 35.75 0.0134683754007452 0.0581404786806199 0.231652296410051 -0.0446721032798747 0.0123567942944795 0.0437083934726038 NA NA 0.0452462471455361 0.323490353934811 101 46 853 0.853 0.101 0.202 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 2 35.75 0.0135904058348962 0.0581404786806199 0.233751185805532 -0.0445500728457238 0.0138497592873426 0.0441714954286548 NA NA 0.0444346553095216 0.316055118612601 99 45 856 0.856 0.099 0.198 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 2 36.08333333333333 0.0136522540928075 0.0575822255219405 0.237091463017621 -0.0439299714291331 0.0133953410986175 0.0428062423937848 NA NA 0.0433823551587264 0.311240260751654 114 47 839 0.839 0.114 0.228 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 2 36.08333333333333 0.0136522540928075 0.0575822255219405 0.237091463017621 -0.0439299714291331 0.0136700590816411 0.0434803110581766 NA NA 0.0470633929849221 0.350602509373668 152 37 811 0.811 0.152 0.304 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333334 2 36.08333333333333 0.0135291154422588 0.0575822255219405 0.234952979320047 -0.0440531100796818 0.0131563824270093 0.0425950854364291 NA NA 0.046278814175588 0.341144336412926 117 47 836 0.836 0.117 0.234 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25 2 35.416666666666664 0.0135904058348962 0.0587096677913667 0.231484972512392 -0.0451192619564705 0.0134525567083423 0.0421379191212911 NA NA 0.0477571985943977 0.344779588810354 126 42 832 0.832 0.126 0.252 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666667 2 34.416666666666664 0.0136522540928075 0.0604861633757489 0.225708713048928 -0.0468339092829414 0.0132089422981562 0.0441978959692321 NA NA 0.0482263698018736 0.331485252161756 112 42 846 0.846 0.112 0.224 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.16666666666667 2 33.83333333333333 0.0270909813104957 0.0615730216404005 0.439981352039417 -0.0344820403299048 0.0187345006238809 0.0470233078253497 NA NA 0.0503028915823764 0.493035882630897 225 19 756 0.756 0.225 0.45 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666667 2 33.33333333333333 0.0269087157486764 0.0625362067042884 0.430290181748923 -0.0356274909556119 0.0179247365632494 0.0441062340100054 NA NA 0.0522353998065262 0.495203261710369 203 18 779 0.779 0.203 0.406 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000001 2 33.666666666666664 0.0267885619515594 0.0618907677660026 0.43283615502787 -0.0351022058144432 0.0190803874457367 0.0464129934856452 NA NA 0.0497887133780925 0.48079570119932 224 17 759 0.759 0.224 0.448 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000001 2 33.666666666666664 0.0267885619515594 0.0618907677660026 0.43283615502787 -0.0351022058144432 0.0197968840048923 0.0458357850082691 NA NA 0.0502554467680947 0.484879781130979 236 14 750 0.75 0.236 0.472 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.66666666666669 2 33.166666666666664 0.026551445288187 0.0628640039123036 0.422363254577718 -0.0363125586241166 0.0179418666438494 0.0473833996608818 NA NA 0.0516442112740622 0.481975167971431 207 19 774 0.774 0.207 0.414 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGC:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666669 2 32.49999999999999 0.0262035385209603 0.0642103145422439 0.408089240922828 -0.0380067760212835 0.0182825746083047 0.0489598240131163 NA NA 0.0523921418571216 0.468188923196691 215 9 776 0.776 0.215 0.43 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.33333333333336 2 33.166666666666664 0.0266694765273651 0.0628640039123036 0.424240819349806 -0.0361945273849385 0.0180899323607083 0.0479484141627987 NA NA 0.0500645675590636 0.469706329378161 211 19 770 0.77 0.211 0.422 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAA:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000003 2 34.166666666666664 0.0267885619515594 0.0609472230590743 0.439537038883528 -0.0341586611075149 0.0183049789711664 0.045739671978188 NA NA 0.0501420411568359 0.495720941323246 227 10 763 0.763 0.227 0.454 N all ss13 63 GAA AGG AAG 2 AAGGAAGAC:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000003 2 33.5 0.0267885619515594 0.0622118122355632 0.430602501179765 -0.0354232502840038 0.0190170675993733 0.046857303539305 NA NA 0.0519342756612571 0.495189345895091 237 18 745 0.745 0.237 0.474 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGACCTT:GAGGAACTT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.1666666666667 2 33.666666666666664 0.0270909813104956 0.0618907677660026 0.437722495428099 -0.034799786455507 0.0191135939742146 0.0463531901354643 NA NA 0.0520966738919781 0.504143293099494 232 11 757 0.757 0.232 0.464 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA:GACCTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.9166666666667 2 33.916666666666664 0.0138412232800193 0.0614153696041381 0.225370674624852 -0.0475741463241189 0.0133411542466473 0.0439579921876522 NA NA 0.0475379560040946 0.316942226793565 123 40 837 0.837 0.123 0.246 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.9166666666667 2 32.916666666666664 0.0138412232800193 0.0633621979772033 0.218446072293753 -0.049520974697184 0.0137040843762475 0.047036018934731 NA NA 0.0487438440305017 0.309656456806984 107 39 854 0.854 0.107 0.214 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333336 2 33.083333333333336 0.0139053809368069 0.0630291953285242 0.22061809395358 -0.0491238143917172 0.0133860245593249 0.0496874858173883 NA NA 0.049461341149934 0.320624217348241 105 51 844 0.844 0.105 0.21 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.25000000000003 2 33.75 0.0141680718521655 0.0617314855970427 0.229511273139428 -0.0475634137448772 0.0141352295609728 0.0464302655753814 NA NA 0.0490121162648262 0.331826246381577 133 34 833 0.833 0.133 0.266 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.25000000000003 2 33.75 0.0141680718521655 0.0617314855970427 0.229511273139428 -0.0475634137448772 0.0139711759676498 0.0491489809751632 NA NA 0.049634768285477 0.337927598929376 120 47 833 0.833 0.12 0.24 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 CGAGGACAA:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.4166666666667 2 33.75 0.0139376833302847 0.0617314855970427 0.225779165939146 -0.047793802266758 0.0130388664143527 0.0482621477827245 NA NA 0.0490474132203743 0.329837702614485 119 45 836 0.836 0.119 0.238 N all ss13 71 CAA GAC AAG 2 GGACAAGGC:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333337 2 33.833333333333336 0.0139538908732759 0.0615730216404005 0.226623454583235 -0.0476191307671247 0.0136500814629809 0.0451970321339457 NA NA 0.0496657613703224 0.337663579831279 124 48 828 0.828 0.124 0.248 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGCGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.33333333333337 2 34.166666666666664 0.0285748846742028 0.0609472230590743 0.468846376257472 -0.0323723383848715 0.0206606542224099 0.0479980280678233 NA NA 0.050756308406943 0.523604330016739 270 21 709 0.709 0.27 0.54 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA:GGCGTTCCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.33333333333337 2 34.166666666666664 0.0285748846742028 0.0609472230590743 0.468846376257472 -0.0323723383848715 0.020428823522923 0.0445200744957797 NA NA 0.0490514372985523 0.509274895833093 249 13 738 0.738 0.249 0.498 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC:GTTCCGATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.00000000000004 2 33.5 0.0283052459871352 0.0622118122355632 0.454981859071365 -0.033906566248428 0.0199219244695828 0.0468019441260004 NA NA 0.0527443486743956 0.52032313729176 233 14 753 0.753 0.233 0.466 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCGATTAAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.58333333333337 2 33.916666666666664 0.0284731702204231 0.0614153696041381 0.463616361896885 -0.0329421993837151 0.0196451126727821 0.0491054197549901 NA NA 0.0494897112314424 0.505642937991908 228 23 749 0.749 0.228 0.456 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:ATTAACACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.9166666666667 2 33.583333333333336 0.0283386721709848 0.0620508745044359 0.456700608932738 -0.0337122023334511 0.0199360279904557 0.0478818105992355 NA NA 0.0554273258227272 0.543039247864369 262 17 721 0.721 0.262 0.524 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.58333333333337 2 34.24999999999999 0.0288844360583938 0.0607927570603562 0.475129562387124 -0.0319083210019624 0.0200759915229329 0.0469891389650701 NA NA 0.0530772949538543 0.547728726214383 259 15 726 0.726 0.259 0.518 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGC:ACCAATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.25000000000003 2 34.24999999999999 0.0286089511947678 0.0607927570603562 0.47059802151043 -0.0321838058655884 0.02020320440375 0.045558077507603 NA NA 0.0494044060000477 0.514765114150032 259 24 717 0.717 0.259 0.518 N all ss13 79 AGC ATA GCA 2 AATAGCAGT:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.25000000000003 2 34.24999999999999 0.0286089511947678 0.0607927570603562 0.47059802151043 -0.0321838058655884 0.0202516363801223 0.0459520769387555 NA NA 0.050567678877604 0.524483074802061 249 15 736 0.736 0.249 0.498 N all ss13 80 AGT GCA GTC 2 AGCAGTCCA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.4166666666667 2 34.08333333333333 0.0285408991973241 0.0611024764460933 0.467098894469586 -0.0325615772487692 0.0198824427530972 0.0445888053699997 NA NA 0.0532286776771485 0.540716431533798 257 23 720 0.72 0.257 0.514 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 AGTCCAGAT:GGTCCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000004 1 33.416666666666664 0.0284057619693268 0.0305385697640887 0.930160193773386 -0.00213280779476189 0.0205600530912964 0.0331215580565933 NA NA 0.0396468892049152 0.957098425051119 495 43 462 0.462 0.495 0.924 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.00000000000004 1 33.416666666666664 0.0283052459871352 0.0305385697640887 0.926868750101726 -0.00223332377695346 0.0210227800599663 0.0327905624216936 NA NA 0.0387198293213367 0.954004265015141 438 43 519 0.519 0.438 0.876 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.83333333333339 2 34.08333333333333 0.0287805096612113 0.0611024764460933 0.471020347049312 -0.032321966784882 0.0209266863530065 0.0468030314158648 NA NA 0.0495202579195981 0.513948472770708 245 16 739 0.739 0.245 0.49 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.16666666666671 2 35.08333333333333 0.0290593249318817 0.0592901175479514 0.49012088580158 -0.0302307926160696 0.0204753444759585 0.0450272602906445 NA NA 0.0501832178989502 0.54690231177248 283 19 698 0.698 0.283 0.566 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.16666666666671 2 35.41666666666666 0.0294878275056261 0.0587096677913667 0.50226527614524 -0.0292218402857406 0.0205400557306696 0.0440884247452586 NA NA 0.0460182919408962 0.525425227532875 246 12 742 0.742 0.246 0.492 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.00000000000006 2 35.08333333333332 0.0295604764056575 0.0592901175479514 0.498573415405193 -0.0297296411422939 0.0216457252308055 0.0435449278152137 NA NA 0.0487894825273458 0.542295596499896 282 19 699 0.699 0.282 0.564 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.16666666666671 2 35.24999999999999 0.0446782201839994 0.0589984642956841 0.757277680315277 -0.0143202441116847 0.0266610903011292 0.0472224112621502 NA NA 0.0513036542370363 0.780147228402916 421 4 575 0.575 0.421 0.842 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.00000000000004 2 35.08333333333332 0.0441303750172001 0.0592901175479514 0.744312489876737 -0.0151597425307513 0.0250380052694205 0.0444284480784768 NA NA 0.052964635661239 0.774706669228538 404 6 590 0.59 0.404 0.808 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 2 34.58333333333332 0.0438080716173109 0.0601826482875393 0.727918642064498 -0.0163745766702284 0.0257163110073441 0.0476667633640221 NA NA 0.0511875115812262 0.749048703560308 391 6 603 0.603 0.391 0.782 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.16666666666671 2 34.41666666666666 0.0433855884614561 0.0604861633757489 0.717281210116412 -0.0171005749142927 0.0251779744689359 0.0454611495678373 NA NA 0.0547623605193276 0.754836272771894 381 7 612 0.612 0.381 0.762 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.50000000000004 2 34.58333333333332 0.0444574574471551 0.0601826482875393 0.738708892216695 -0.0157251908403841 0.0259370806342877 0.0438753586863337 NA NA 0.0518331034267585 0.761599345863024 418 4 578 0.578 0.418 0.836 N all ss13 92 ACC CTA CCA 2 GCTACCAGA:GCTACCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.83333333333339 2 33.91666666666666 0.0442388662657619 0.0614153696041381 0.720322397323505 -0.0171765033383762 0.0251100730469445 0.0438278668891139 NA NA 0.0546037666042225 0.753090990464776 378 7 615 0.615 0.378 0.756 N all ss13 93 AGA CCA GAC 2 ACCAGACGA:ACCCGACGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.16666666666671 2 33.58333333333332 0.0440224147463932 0.062050874504436 0.709456798118874 -0.0180284597580427 0.0260266547258679 0.0467443794384774 NA NA 0.0535391464957119 0.736317306440668 368 5 627 0.627 0.368 0.736 N all ss13 94 CGA GAC GAA 2 AGACGAATT:CGACGAGTT 1:1 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333339 2 33.58333333333332 0.0439149815636805 0.062050874504436 0.707725425538379 -0.0181358929407554 0.0249593893829415 0.0456961737006225 NA NA 0.0541963079854419 0.737901672515248 379 6 615 0.615 0.379 0.758 N all ss13 95 ATT GAA TTC 2 CGAATTCGT:CGAGTTCGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000006 2 34.58333333333332 0.0438080716173109 0.0601826482875393 0.727918642064498 -0.0163745766702284 0.0248327550844443 0.0483541220591663 NA NA 0.0541482724753854 0.762345197058469 374 4 622 0.622 0.374 0.748 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 ATTCGTGGT:GTTCGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.00000000000006 1 34.58333333333332 0.043490443237762 0.0294878275056261 1.4748608804587 0.0140026157321359 0.0247596532922095 0.0302117637843781 NA NA 0.0376749341249097 0.710139098262701 655 16 329 0.329 0.655 0.658 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.16666666666671 1 35.08333333333332 0.0433855884614561 0.0290593249318817 1.49300056223456 0.0143262635295744 0.0254276754993265 0.029344313562897 NA NA 0.0392633618301374 0.715203872934909 648 16 336 0.336 0.648 0.672 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333339 1 35.41666666666666 0.043281238215485 0.0287805096612113 1.50383849087346 0.0145007285542738 0.0248865149539676 0.0292509792955795 NA NA 0.0388272236226235 0.708800100019676 636 16 348 0.348 0.636 0.696 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000006 1 34.749999999999986 0.0428688103799614 0.0293435958691742 1.46092559927175 0.0135252145107872 0.0254888002087638 0.0292790017412706 NA NA 0.0379009454861915 0.721198925038091 656 19 325 0.325 0.656 0.65 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333339 1 34.749999999999986 0.043281238215485 0.0293435958691742 1.47498072180556 0.0139376423463109 0.0248999338545788 0.0289550768903086 NA NA 0.0392923128046556 0.722801785049491 623 22 355 0.355 0.623 0.71 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333339 1 34.499999999999986 0.043281238215485 0.0295604764056576 1.46415902171325 0.0137207618098275 0.0245170469881567 0.0305926477510287 NA NA 0.0398944833910593 0.730901717272201 633 14 353 0.353 0.633 0.706 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.66666666666671 1 34.16666666666666 0.0430740368144066 0.0298546878003148 1.44278972543643 0.0132193490140918 0.0246717496664937 0.0295428329479611 NA NA 0.0415984550155395 0.750648321642267 634 14 352 0.352 0.634 0.704 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG:ATGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000004 1 34.83333333333332 0.0428688103799615 0.0292720079293014 1.46449845475238 0.0135968024506601 0.0243018688177392 0.0298701534461554 NA NA 0.0392316650879776 0.728908942489174 626 27 347 0.347 0.626 0.694 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGATCTC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.50000000000004 2 35.99999999999999 0.0581404786806199 0.0577207808520962 1.007271173784 4.19697828523614e-4 0.0296600120972659 0.0417356663374473 NA NA 0.0410112125452611 0.991834804392108 531 5 464 0.464 0.531 0.928 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GATCTCAGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.08333333333337 2 36.41666666666666 0.0434379525548368 0.0570345959917882 0.761607087759347 -0.0135966434369515 0.0251422662790121 0.0420442991845807 NA NA 0.0385807996059033 0.724523343166305 367 24 609 0.609 0.367 0.734 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTCAGTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25000000000004 2 36.91666666666666 0.0433333505001085 0.0562324166616758 0.770611563092247 -0.0128990661615673 0.0261232943289326 0.0377213475829645 NA NA 0.0370029218242801 0.727392719896431 373 13 614 0.614 0.373 0.746 N all ss13 107 CCA GCC CAA 2 AGCCCCAGA:AGTCCAAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25000000000004 2 36.24999999999999 0.0433333505001085 0.0573071018565008 0.756160215685255 -0.0139737513563923 0.0251730184742698 0.0431851346217658 NA NA 0.04058938099425 0.730642406741923 362 12 626 0.626 0.362 0.724 N all ss13 108 AGA CAA GAT 2 CCAAGATGG:CCCAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25000000000004 2 36.24999999999999 0.0433333505001085 0.0573071018565008 0.756160215685255 -0.0139737513563923 0.0249018260503764 0.0413601772682111 NA NA 0.038884854983067 0.719324065503468 368 17 615 0.615 0.368 0.736 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.1666666666667 2 36.41666666666666 0.058423686245627 0.0570345959917882 1.02435522211885 0.00138909025383874 0.0308892667777202 0.0401912180236931 NA NA 0.041470260364833 0.973279009187949 522 5 473 0.473 0.522 0.946 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.50000000000003 2 37.08333333333332 0.0598821656332629 0.0559700169039056 1.06989722258033 0.00391214872935729 0.030109636994712 0.0402107330626656 NA NA 0.0421682311953258 0.926082480493737 572 5 423 0.423 0.572 0.846 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TACTTTTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.00000000000003 2 36.08333333333332 0.0594370287406054 0.0575822255219405 1.0322113847086 0.00185480321866482 0.0303906988168028 0.0412403347945745 NA NA 0.0426719360248832 0.965329602807383 546 10 444 0.444 0.546 0.888 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTATTAC:TTTTACTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.00000000000003 2 35.08333333333332 0.0594370287406054 0.0592901175479514 1.00247783608348 1.46911192654003e-4 0.0319610231680045 0.0429426499239914 NA NA 0.0425174551850364 0.997243063145019 516 5 479 0.479 0.516 0.958 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTACCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.33333333333337 2 34.74999999999999 0.0591439311842397 0.0598821656332629 0.987671881248511 -7.38234449023198e-4 0.0313783387778801 0.0439637278801776 NA NA 0.0444109303658176 0.986737527473265 492 5 503 0.503 0.492 0.984 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.83333333333337 2 34.24999999999999 0.0587096677913666 0.0607927570603562 0.965734581392296 -0.00208308926898959 0.0286373386612482 0.0423267880950915 NA NA 0.0439232882701228 0.962174008543599 490 5 505 0.505 0.49 0.98 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000004 2 34.58333333333332 0.0573071018565008 0.0601826482875393 0.952219676055136 -0.00287554643103843 0.0293914276988213 0.0429720092549221 NA NA 0.0420028137858063 0.945418820166644 491 6 503 0.503 0.491 0.982 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC:GGAACTGGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000004 2 35.08333333333332 0.0568993130810351 0.0592901175479514 0.959676172593474 -0.00239080446691625 0.0289452435337955 0.0440853288448194 NA NA 0.0430325160738702 0.955693851019684 523 6 471 0.471 0.523 0.942 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA:ACTGGGCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333339 2 34.74999999999999 0.0566306643811088 0.0598821656332629 0.945701675653027 -0.00325150125215409 0.0286887460117822 0.0423036083353686 NA NA 0.0432660836225964 0.94009435335394 460 7 533 0.533 0.46 0.92 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA:GGGCCAGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 2 34.08333333333332 0.0561009098120237 0.0611024764460933 0.918144616634612 -0.00500156663406955 0.0292697483128 0.0430090569519672 NA NA 0.0450987269327203 0.911693573964997 481 4 515 0.515 0.481 0.962 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333339 2 33.08333333333332 0.0550706014161128 0.0630291953285242 0.873731627527066 -0.00795859391241144 0.0288370320649992 0.0456194436244777 NA NA 0.0456619077787951 0.861634459852257 471 5 524 0.524 0.471 0.942 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTGGA:GAAGCTTCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.66666666666671 2 33.08333333333332 0.0555809791152914 0.0630291953285242 0.881829108329706 -0.00744821621323286 0.0281870578510699 0.0441123844520663 NA NA 0.0479807411942541 0.876637274940995 462 8 530 0.53 0.462 0.924 N all ss13 121 GGA CTG CAC 2 GCTGGACTT:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333339 2 33.08333333333332 0.0550706014161128 0.0630291953285242 0.873731627527066 -0.00795859391241144 0.0281350018653402 0.0458455518890728 NA NA 0.0444800653144873 0.857996623697497 436 8 556 0.556 0.436 0.872 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 GGACTTCCC:TCACTTCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000006 2 32.41666666666666 0.0405504159527068 0.0643826713791054 0.629834318522342 -0.0238322554263987 0.0232279905004105 0.0467373264695274 NA NA 0.0427506420271788 0.577205471582755 293 9 698 0.698 0.293 0.586 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000006 2 33.08333333333332 0.0405504159527068 0.0630291953285242 0.643359251872845 -0.0224787793758175 0.0226869357853553 0.0454892485568511 NA NA 0.0449687484712135 0.617162685734199 298 17 685 0.685 0.298 0.596 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.33333333333339 2 33.74999999999999 0.0409192381878258 0.0617314855970427 0.66285847152504 -0.020812247409217 0.0242691383771868 0.0445066316027257 NA NA 0.0406321824724871 0.60850340405029 312 26 662 0.662 0.312 0.624 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.33333333333339 2 33.74999999999999 0.0409192381878258 0.0617314855970427 0.66285847152504 -0.020812247409217 0.0244080621090576 0.043254011163664 NA NA 0.0425794781686037 0.624993300529325 304 17 679 0.679 0.304 0.608 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.83333333333339 2 33.91666666666666 0.0406419966354019 0.0614153696041381 0.661756118987249 -0.0207733729687362 0.0240721175509734 0.0442527267619278 NA NA 0.04336696634752 0.631928850256332 312 6 682 0.682 0.312 0.624 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000004 2 32.99999999999999 0.0401433603117785 0.063195257713305 0.635227416808632 -0.0230518974015265 0.0233859223609167 0.0463389147116114 NA NA 0.0412441460562488 0.576220964474407 276 16 708 0.708 0.276 0.552 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333337 2 32.66666666666666 0.0399650588551816 0.0638683562552301 0.62574115255876706 -0.0239032974000485 0.0243562418844983 0.0454714584117431 NA NA 0.0440610495261316 0.587471324698277 290 10 700 0.7 0.29 0.58 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333337 2 32.16666666666666 0.0399650588551816 0.0649053422482924 0.615743750372614 -0.0249402833931107 0.0229776904919472 0.0488537024591025 NA NA 0.0451551896886171 0.58072656618528 274 20 706 0.706 0.274 0.548 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333337 2 31.999999999999993 0.0402331091273882 0.0652585327422224 0.616518751445316 -0.0250254236148342 0.0238106314360019 0.0472619871526631 NA NA 0.043361721435087 0.563850497541589 278 26 696 0.696 0.278 0.556 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 2 32.66666666666666 0.0405961546323978 0.0638683562552301 0.635622349041955 -0.0232722016228323 0.0238109701646809 0.0441324854875656 NA NA 0.0442856459578598 0.599234167597418 277 15 708 0.708 0.277 0.554 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.33333333333337 2 32.66666666666666 0.0403684875103351 0.0638683562552301 0.632057718050781 -0.023499868744895 0.023555573240053 0.0474880430375154 NA NA 0.0420923142452057 0.576643929207606 267 16 717 0.717 0.267 0.534 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333337 1 32.66666666666666 0.0400986359257937 0.0312545223004261 1.2829706863012 0.0088441136253677 0.0238083719377257 0.0322464543390595 NA NA 0.0270626893363201 0.743818411768865 585 44 371 0.371 0.585 0.742 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.50000000000004 1 31.999999999999993 0.0402781342288957 0.0319197108140969 1.26185774249269 0.00835842341479882 0.0236955825360546 0.0334282210962524 NA NA 0.0267375547164705 0.754577081077552 615 43 342 0.342 0.615 0.684 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAAAT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333339 1 31.666666666666664 0.0400986359257937 0.0322630388127681 1.24286605978122 0.00783559711302564 0.0233950708606588 0.0351949628816288 NA NA 0.0277540067282513 0.777695777349481 565 57 378 0.378 0.565 0.756 N all ss13 136 AAT CAA ATG 2 GCAAATGAG:GCAACTGAG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.16666666666671 1 32.33333333333333 0.0404592471687861 0.0315836140125951 1.28102018827394 0.00887563315619099 0.0245252993269883 0.0330553190061426 NA NA 0.0253463180734863 0.726207775395599 614 51 335 0.335 0.614 0.67 N all ss13 137 GAG ATG AGG 2 AATGAGGGA:ACTGAGGGA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333339 1 32.83333333333333 0.0270299523623976 0.0310925352587596 0.869338963112779 -0.00406258289636199 0.0200518331491779 0.0309998359055716 NA NA 0.0225546601456626 0.857057056040701 363 122 515 0.515 0.363 0.726 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.50000000000006 1 33 0.0273378783823658 0.0309322189005369 0.883799460694082 -0.00359434051817108 0.0192857497926048 0.0298167903492837 NA NA 0.0221117908759081 0.870870303506581 358 126 516 0.516 0.358 0.716 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000006 1 33.5 0.0275260251378209 0.0304610393656427 0.903646944131126 -0.00293501422782174 0.0209258659925153 0.0315104956302541 NA NA 0.02237924399911 0.895657483435011 380 147 473 0.473 0.38 0.76 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000006 1 33.5 0.0275260251378209 0.0304610393656427 0.903646944131126 -0.00293501422782174 0.0199775903703136 0.030446178146054 NA NA 0.0220102687043652 0.893918566238771 357 130 513 0.513 0.357 0.714 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666671 1 33.166666666666664 0.0269087157486763 0.0307735475083969 0.874410587253031 -0.00386483175972051 0.0202409657542897 0.0313380684124516 NA NA 0.0228470214022428 0.86566977198797 351 124 525 0.525 0.351 0.702 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666671 1 34.166666666666664 0.0269087157486763 0.0298546878003148 0.90132296571504 -0.00294597205163843 0.0190249248009212 0.0311439888550296 NA NA 0.0213203080634262 0.89010068609897 368 141 491 0.491 0.368 0.736 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333339 1 34.5 0.0270299523623976 0.0295604764056575 0.914395018248909 -0.00253052404325986 0.0189829326298109 0.0303206341060517 NA NA 0.0224928010451607 0.91042401143797 384 123 493 0.493 0.384 0.768 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666671 2 35 0.0410124947055404 0.0594370287406054 0.690015897068589 -0.018424534035065 0.0247776334723195 0.0450968373779877 NA NA 0.0284036521226601 0.516553132962857 197 44 759 0.759 0.197 0.394 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.16666666666671 2 35 0.0551973146854054 0.0594370287406054 0.928668808905256 -0.00423971405519993 0.0284381611920673 0.0412087039970849 NA NA 0.031634679349091 0.893385901296964 425 15 560 0.56 0.425 0.85 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000006 2 35.5 0.0568993130810351 0.0585663277285774 0.971536295475653 -0.00166701464754232 0.0297569426706505 0.0406484112210856 NA NA 0.0313728965201457 0.957623943829876 458 22 520 0.52 0.458 0.916 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 2 35.166666666666664 0.0570345959917882 0.0591439311842398 0.964335559875438 -0.00210933519245153 0.0288234853563954 0.0420713949591794 NA NA 0.0318403226754208 0.947180944900446 484 15 501 0.501 0.484 0.968 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 2 34.166666666666664 0.0561009098120237 0.0609472230590743 0.920483444465497 -0.00484631324705059 0.0290460187459638 0.0455849697441852 NA NA 0.0317851897717936 0.878815620999728 428 17 555 0.555 0.428 0.856 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGA:GGCACCCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000006 3 34.666666666666664 0.0564972895530331 0.0919517415692493 0.614423267997428 -0.0354544520162162 0.0281765855067455 0.0562219619932293 NA NA 0.044887176350476 0.42961126575425 202 1 797 0.797 0.202 0.404 N all ss13 150 CGA CCC GAA 2 ACCCGAAAT:ACCCGCAAT 1:1 FALSE 1 1 0.75 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666673 3 34 0.0559700169039055 0.0938723572155045 0.596235340883303 -0.037902340311599 0.0284796528983225 0.0538516275451155 NA NA 0.0463552300607973 0.413557235352402 207 4 789 0.789 0.207 0.414 N all ss13 151 AAT GAA ATC 2 CGAAATCCT:CGCAATCCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 3 34.41666666666667 0.0561009098120237 0.0926626795339059 0.605431551237367 -0.0365617697218822 0.0284003036617145 0.0564007247111317 NA NA 0.0485693316443455 0.451585242366526 199 2 799 0.799 0.199 0.398 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT:AATCCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333339 3 34.41666666666667 0.0566306643811088 0.0926626795339059 0.611148573146832 -0.0360320151527971 0.0279347061050873 0.0532565919505566 NA NA 0.0477504951746429 0.45049541531505 228 1 771 0.771 0.228 0.456 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC:CCTGCTAAC 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 3 34.41666666666667 0.0561009098120237 0.0926626795339059 0.605431551237367 -0.0365617697218822 0.0290170248280493 0.0560149832162552 NA NA 0.046235641097199 0.429078070194465 202 7 791 0.791 0.202 0.404 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT:GCTAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.50000000000006 2 34.25 0.0413898116754681 0.0607927570603562 0.680834587488366 -0.0194029453848881 0.0237006049873942 0.0431704744217089 NA NA 0.0428136363014524 0.650408004904188 340 19 641 0.641 0.34 0.68 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.3333333333334 2 34.083333333333336 0.0414852284880391 0.0611024764460933 0.6789451246651 -0.0196172479580541 0.0246385454291264 0.0438733614811552 NA NA 0.0434485631881462 0.651625548651936 331 16 653 0.653 0.331 0.662 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCA:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.66666666666673 2 34.083333333333336 0.0418713371647063 0.0611024764460933 0.685264159491909 -0.019231139281387 0.0248859111124778 0.0435100756336581 NA NA 0.0427377471568895 0.65272472985423 302 18 680 0.68 0.302 0.604 N all ss13 157 GCA CTG CAA 2 GCTGCAATC:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 2 34.083333333333336 0.0561009098120237 0.0611024764460933 0.918144616634612 -0.00500156663406955 0.0272791739912596 0.0459800650652533 NA NA 0.0436942457749635 0.908867288892398 463 7 530 0.53 0.463 0.926 N all ss13 158 ACC CAA CCG 2 GCAATCGTG:GCCACCGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666673 2 33.916666666666664 0.0559700169039055 0.0614153696041381 0.911335668329745 -0.00544535270023259 0.0276451071089417 0.0447896043976535 NA NA 0.0442081989078428 0.901968382197034 444 3 553 0.553 0.444 0.888 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000007 2 34.58333333333333 0.0421163271222965 0.0601826482875393 0.699808471722184 -0.0180663211652427 0.0240864692235512 0.042795384138865 NA NA 0.0415919259313165 0.664019145603754 329 11 660 0.66 0.329 0.658 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 2 34.75 0.042215127927666 0.0598821656332629 0.704969960275062 -0.0176670377055969 0.0240687671550663 0.0423188638209634 NA NA 0.0413884465914413 0.669481910596589 332 14 654 0.654 0.332 0.664 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666673 2 35.333333333333336 0.0423143935004423 0.0588537115811214 0.718975785275972 -0.0165393180806791 0.0235079081125277 0.0430756680194658 NA NA 0.0409155015788982 0.68604278846605 339 14 647 0.647 0.339 0.678 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.58333333333339 2 36 0.0419201068148284 0.0577207808520962 0.726256751831623 -0.0158006740372679 0.0243050980047989 0.0428421675880652 NA NA 0.0403724768724327 0.695521974315241 340 20 640 0.64 0.34 0.68 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.58333333333339 2 36 0.0419201068148284 0.0577207808520962 0.726256751831623 -0.0158006740372679 0.0229228439625161 0.0435975370340837 NA NA 0.0385386621371334 0.681809325005792 316 13 671 0.671 0.316 0.632 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000006 3 36.666666666666664 0.0421163271222965 0.0866346653413833 0.486137124860325 -0.0445183382190867 0.0244188130092944 0.0519803409382885 NA NA 0.0506676776669939 0.379599819728187 181 7 812 0.812 0.181 0.362 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.91666666666671 4 36.666666666666664 0.0569668741816511 0.117889187641809 0.483223909852848 -0.0609223134601582 0.030040584061954 0.0579298476653834 NA NA 0.0534008892598537 0.253933059111188 105 1 894 0.894 0.105 0.21 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000004 4 36.333333333333336 0.0566975883332356 0.119061291806916 0.476205049288255 -0.0623637034736802 0.0295536317898344 0.0639723204873173 NA NA 0.0545054073851419 0.252551228733187 104 4 892 0.892 0.104 0.208 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.58333333333337 4 37 0.0572387314369154 0.116739982283845 0.490309577893746 -0.0595012508469295 0.0298602739042519 0.0587777700326588 NA NA 0.0550161396402347 0.279464289244643 104 1 895 0.895 0.104 0.208 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.58333333333337 4 37.66666666666667 0.0722580068136367 0.114507630156718 0.631032244006294 -0.0422496233430816 0.031997558397577 0.0576621927538957 NaN NaN 0.0560624606520468 0.451079234113829 218 1 781 0.781 0.218 0.436 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.75000000000004 5 38.16666666666667 0.0731395159410335 0.143981241370948 0.50797947874751 -0.0708417254299144 0.0327009246698318 0.0659945095161687 NaN NaN 0.0650640942970778 0.276242501369197 124 0 876 0.876 0.124 0.248 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.25000000000004 5 38.66666666666667 0.0736788296875599 0.141931499728896 0.519115417143439 -0.0682526700413363 0.0316521050232393 0.0654213069852658 NaN NaN 0.0640219083568845 0.286386110157137 126 1 873 0.873 0.126 0.252 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.9166666666667 5 39.333333333333336 0.0751566968036821 0.13928785934632 0.539578231415098 -0.0641311625426375 0.0356974432341655 0.0675105579087821 NaN NaN 0.0638929219669624 0.315509376621066 145 0 855 0.855 0.145 0.29 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.58333333333336 5 39.66666666666667 0.0755354817013731 0.138002732232705 0.54734772623199 -0.0624672505313315 0.0346513234657603 0.065464338220462 NaN NaN 0.0631857048180332 0.322844456938248 137 0 863 0.863 0.137 0.274 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.25000000000003 5 39.333333333333336 0.0759181073184851 0.13928785934632 0.5450446842587 -0.0633697520278346 0.0330673088388016 0.067338755208254 NaN NaN 0.0612735469733427 0.301037717879741 142 0 858 0.858 0.142 0.284 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.83333333333336 5 38.333333333333336 0.0752510361297835 0.143291427572032 0.525160767848134 -0.0680403914422484 0.0326471617181352 0.0679218784993923 NaN NaN 0.065165055957869 0.29642807615491 126 0 874 0.874 0.126 0.252 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.33333333333336 5 37.333333333333336 0.0746885290720775 0.147532720684541 0.506250604784676 -0.0728441916124632 0.032731402520027 0.0727974623665329 NaN NaN 0.0686537536022825 0.288672961806283 122 0 878 0.878 0.122 0.244 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.50000000000003 5 37.25000000000001 0.075630775763093 0.147897559919249 0.511372708274477 -0.0722667841561559 0.0327597975763246 0.0708256201460794 NaN NaN 0.066112831519093307 0.274357545626257 128 0 872 0.872 0.128 0.256 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.25000000000003 5 37.16666666666667 0.0747816950380488 0.148264213964023 0.504381286884202 -0.0734825189259746 0.0329069619603117 0.0729472516268377 NaN NaN 0.0676823195500221 0.277612887683182 105 1 894 0.894 0.105 0.21 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.9166666666667 5 37.083333333333336 0.0751566968036821 0.148632696437812 0.505653860859128 -0.0734759996341294 0.0331873465939404 0.0682081279094873 NaN NaN 0.0745290088136256 0.324196345610837 117 0 883 0.883 0.117 0.234 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.58333333333336 5 36.91666666666667 0.0766951169694829 0.149375201835214 0.513439419844873 -0.0726800848657307 0.0338494806996645 0.0712345856366323 NaN NaN 0.0698723251221008 0.298254355529132 120 0 880 0.88 0.12 0.24 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.58333333333336 5 36.583333333333336 0.0766951169694829 0.150882768440169 0.508309316977408 -0.0741876514706865 0.0346440570215447 0.075141630266744 NaN NaN 0.066779266366739 0.266594864292644 112 0 888 0.888 0.112 0.224 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.25000000000003 5 36.583333333333336 0.0759181073184851 0.150882768440169 0.503159559592714 -0.0749646611216843 0.0343762389083173 0.0736101361280128 NA NA 0.066373242744662 0.258711848735953 114 0 886 0.886 0.114 0.228 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.91666666666669 5 36.25000000000001 0.0763046324181554 0.152421181209951 0.50061698651351 -0.0761165487917958 0.0338835716855108 0.0772719651310792 NaN NaN 0.0737323658731276 0.301914912666015 131 0 869 0.869 0.131 0.262 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAAGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.91666666666669 5 36.25000000000001 0.0763046324181554 0.152421181209951 0.50061698651351 -0.0761165487917958 0.0326968432431286 0.0741173158114257 NaN NaN 0.0672587481598306 0.257761685185814 103 0 897 0.897 0.103 0.206 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT:GCTTCTTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.58333333333334 5 36.25000000000001 0.0755354817013731 0.152421181209951 0.495570767145069 -0.0768856995085782 0.0341665299785991 0.072385612173185 NA NA 0.0705710250360746 0.27594239998364 132 0 868 0.868 0.132 0.264 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC:TCTTCTCGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.25000000000001 5 36.25000000000001 0.0747816950380488 0.152421181209951 0.490625347766078 -0.0776394861719025 0.0335219661095057 0.0718310948529616 NaN NaN 0.0667609488307152 0.244850757334566 100 0 900 0.9 0.1 0.2 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGTTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.41666666666669 6 35.583333333333336 0.0891034205520704 0.190999228388671 0.46651193988465 -0.101895807836601 0.0351165200435998 0.0938406778377162 NaN NaN 0.0797696116042789 0.201469443252819 70 1 929 0.929 0.07 0.14 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGTTCCTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.66666666666669 6 35.333333333333336 0.0887734500607747 0.19253988513586 0.461065248886661 -0.103766435075086 0.0369357528593288 0.0885772839914686 0.368031026872301 0.210282479444421 0.0752481697387845 0.167897994941216 50 1 949 0.949 0.05 0.1 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.66666666666669 6 35.333333333333336 0.0887734500607747 0.19253988513586 0.461065248886661 -0.103766435075086 0.0338859210554352 0.0885572792107783 NaN NaN 0.0772260474767667 0.179054653926904 65 0 935 0.935 0.065 0.13 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.33333333333336 6 35.333333333333336 0.0879053734766805 0.19253988513586 0.456556694290393 -0.10463451165918 0.0356321412882061 0.0890913665555127 NaN NaN 0.0832942334110872 0.209042180193433 74 0 926 0.926 0.074 0.148 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.33333333333336 6 35.333333333333336 0.0879053734766805 0.19253988513586 0.456556694290393 -0.10463451165918 0.0349033860335885 0.0898701717336992 NaN NaN 0.0825634154560071 0.20503983581287 75 0 925 0.925 0.075 0.15 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.33333333333336 6 36.00000000000001 0.0879053734766805 0.188485821210679 0.466376584254709 -0.100580447733999 0.034750959285016 0.0841271419638112 NaN NaN 0.079364163464305 0.205037937294062 81 0 919 0.919 0.081 0.162 N all ss13 192 CGC GTC GCA 2 AGTCGCAAC:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.33333333333336 6 35.00000000000001 0.0866346653413832 0.194633396613813 0.445117163080093 -0.10799873127243 0.0335387103396471 0.0892408741525271 NaN NaN 0.0827124861793526 0.191650328391687 61 0 939 0.939 0.061 0.122 N all ss13 193 AAC GCA ACA 2 CGCAACAGT:CGCGGTAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.00000000000003 6 34.00000000000001 0.0845966206090083 0.201197989946009 0.420464541577724 -0.116601369337001 0.0340743291794188 0.0910807712176353 NaN NaN 0.0857346649845818 0.17382171164313 46 0 954 0.954 0.046 0.092 N all ss13 194 AAT ACA ATT 2 AACAGTTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.33333333333337 5 33.00000000000001 0.0685408136920715 0.169253998250676 0.4049583135434 -0.100713184558605 0.0311255246745162 0.0834252265561646 NaN NaN 0.0805199601235075 0.21101281003727 69 0 931 0.931 0.069 0.138 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AGTTCAAGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333337 5 32.333333333333336 0.0543223783836108 0.173179167487274 0.313677327197006 -0.118856789103663 0.0260591574533859 0.0884990509313554 NA NA 0.0790223826362945 0.132558150462966 28 0 972 0.972 0.028 0.056 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAC:TCAAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.83333333333337 5 32.50000000000001 0.0532374199351599 0.172180831233375 0.309194813114832 -0.118943411298215 0.0263276454826456 0.0819927776629459 NA NA 0.0822444186376413 0.148115887049648 27 0 973 0.973 0.027 0.054 N all ss13 197 AAC GAA ACA 2 AGAAACACA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000003 5 32.66666666666667 0.0534747581886499 0.171193988985735 0.312363526929124 -0.117719230797085 0.0264209003232066 0.0839050940490774 NaN NaN 0.0802083086495544 0.142194214066089 29 0 971 0.971 0.029 0.058 N all ss13 198 ACA ACA CAA 2 AACACAACT:AATTCAACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.1666666666667 5 33.333333333333336 0.0544456664773409 0.167357663485657 0.325325206765969 -0.112911997008316 0.0271223786137623 0.0875587768553785 NaN NaN 0.0752122157801551 0.1332920874293 40 1 959 0.959 0.04 0.08 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 ACAACTCCA:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.6666666666667 4 33.833333333333336 0.0548189130040021 0.128656816904346 0.426086346009626 -0.0738379039003435 0.0262842432177439 0.0704644485738461 NA NA 0.0672769864643131 0.272413716031689 87 3 910 0.91 0.087 0.174 N all ss13 200 CCA CTC CAG 2 ACTCCAGGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.1666666666667 4 35 0.0551973146854054 0.123992985319038 0.445164817536904 -0.0687956706336322 0.027973840069808 0.0678551257330759 NA NA 0.0619461752188929 0.266752739273744 102 3 895 0.895 0.102 0.204 N all ss13 201 GGC CAG GCA 2 CCAGGCAGC:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.50000000000003 4 34.33333333333333 0.0541996476239404 0.126615652181289 0.428064356106124 -0.0724160045573487 0.0271265495672411 0.0682153312262439 NA NA 0.062706866557058 0.248158521854997 105 1 894 0.894 0.105 0.21 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGC:GGCAGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.6666666666667 4 34.166666666666664 0.0540774704260079 0.127288788480472 0.424840797619063 -0.0732113180544641 0.0253107591286446 0.0719090579872117 NA NA 0.0640353886064504 0.252916270026697 93 0 907 0.907 0.093 0.186 N all ss13 203 AGC GCA GCA 2 AGCAGCAGG:AGCAGTAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.6666666666667 4 34.49999999999999 0.0548189130040021 0.125949614506391 0.435244785931602 -0.0711307015023892 0.0267794947673079 0.0717891554569171 NA NA 0.0642405905149848 0.268183785358962 77 4 919 0.919 0.077 0.154 N all ss13 204 AGG GCA GGG 2 AGCAGGGGA:AGTAGGGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333336 4 34.666666666666664 0.0554524994575896 0.125290563497375 0.44259118891066 -0.0698380640397851 0.0278502098030106 0.0666073910457315 NA NA 0.0644450653510599 0.278505084655877 92 2 906 0.906 0.092 0.184 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000003 4 35.08333333333333 0.0555166649189651 0.123672788927057 0.448899595461612 -0.0681561240080917 0.0282673189878115 0.0718684604373392 NaN NaN 0.0638350656549923 0.285659927128769 102 2 896 0.896 0.102 0.204 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAACTTCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.4166666666667 4 34.41666666666666 0.0550074627952335 0.126281753068954 0.435593119816744 -0.0712742902737207 0.0268844913678209 0.0680877852298242 NA NA 0.0622876607006096 0.252509093134954 95 1 904 0.904 0.095 0.19 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:ACTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.4166666666667 4 35.08333333333333 0.0414374651394939 0.123672788927057 0.335057254704057 -0.0822353237875629 0.0233324174602321 0.0726146916052611 NA NA 0.0570136309570301 0.149195189115305 37 8 955 0.955 0.037 0.074 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.6666666666667 4 35.49999999999999 0.0412948328872706 0.122096350832699 0.338215127689231 -0.0808015179454289 0.0242182124369449 0.0678843994420919 NA NA 0.0615448215699634 0.189220361150167 37 6 957 0.957 0.037 0.074 N all ss13 209 GCT CTG CTA 2 CCTGCTAGG:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.1666666666667 4 34.666666666666664 0.0404592471687861 0.125290563497375 0.322923339471084 -0.0848313163285885 0.023786544887218 0.0707284789105203 NA NA 0.0627753789219001 0.176584321558451 31 8 961 0.961 0.031 0.062 N all ss13 210 AGG CTA GAA 2 GCTAGGATG:GCTCGAATG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.00000000000003 4 33.83333333333333 0.0400094855289696 0.128656816904346 0.31097835693165 -0.0886473313753761 0.0236411672734458 0.0727879599514886 NA NA 0.0603663311714995 0.141971270808908 32 2 966 0.966 0.032 0.064 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 AGGATGGCT:CGAATGGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.6666666666667 4 34.24999999999999 0.0401881846005797 0.126951325912032 0.316563724812353 -0.0867631413114519 0.0230208404626348 0.0727236039872394 NA NA 0.0620447005181874 0.161993795320722 34 4 962 0.962 0.034 0.068 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATGGCTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000004 4 34.58333333333333 0.0405504159527068 0.125619222573624 0.322804226311308 -0.0850688066209176 0.0227604479352736 0.072128965978722 NA NA 0.0643600681645153 0.186246824690786 43 7 950 0.95 0.043 0.086 N all ss13 213 AGC CTA GCA 2 GCTAGCGGA:GCTGGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.50000000000004 4 34.74999999999999 0.0402781342288957 0.124963623649129 0.32231887210624 -0.0846854894202328 0.0234444636666482 0.0699188235976388 NA NA 0.0598104089312928 0.156805120746813 43 3 954 0.954 0.043 0.086 N all ss13 214 AAT GCA ATG 2 AGCGGAGGT:GGCAATGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333339 3 34.08333333333333 0.0400986359257937 0.0936278982824406 0.428276578470565 -0.0535292623566469 0.0237638765411137 0.0589109958121709 NA NA 0.0488928469165667 0.273591956295065 75 26 899 0.899 0.075 0.15 N all ss13 215 GGT ATG GTG 2 AATGGTGGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.16666666666671 2 34.41666666666666 0.0267288865855191 0.0604861633757489 0.441900842999006 -0.0337572767902298 0.0185361848790864 0.0453802526016741 NA NA 0.0404178081680708 0.403600605228074 170 46 784 0.784 0.17 0.34 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA:GGTGGTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333339 2 35.24999999999999 0.0270299523623976 0.0589984642956841 0.458146710852182 -0.0319685119332865 0.0194684583648963 0.0446992121067524 NA NA 0.0400559498112223 0.424814512883632 164 45 791 0.791 0.164 0.328 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT:GGTGATGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333339 2 35.24999999999999 0.0270299523623976 0.0589984642956841 0.458146710852182 -0.0319685119332865 0.0190631780211641 0.0460821203427748 NA NA 0.0411676662975136 0.437427741724865 174 49 777 0.777 0.174 0.348 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC:GATGCTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333339 2 34.99999999999999 0.0133485169832455 0.0594370287406054 0.224582508010301 -0.0460885117573599 0.0131597521797785 0.0456012071421157 NA NA 0.0410215283889323 0.261216668041897 0 150 850 0.85 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC:GCTGCTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000006 1 34.49999999999999 0.0131438194165355 0.0295604764056575 0.444641663962493 -0.0164166569891219 0.0131980885767132 0.0313061707721733 NA NA 0.0208121066283871 0.430227019772256 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG:GCTCTTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666673 1 33.83333333333332 0.0130296436641525 0.0301548153585304 0.432091641392413 -0.0171251716943778 0.013229931569109 0.0325296482691411 NA NA 0.0201912012185203 0.396354318035 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA:CTTGCTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000007 1 33.66666666666665 0.0128896835290581 0.0303071537534075 0.425301684016068 -0.0174174702243494 0.0124832592433466 0.0333825976167914 NA NA 0.0205504637593968 0.396690672469168 0 342 658 0.658 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG:GCTTTGCTG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666674 1 33.499999999999986 0.0128620515547158 0.0304610393656427 0.422245984463127 -0.0175989878109268 0.0124088318097101 0.0316291115646215 NA NA 0.0199651933441405 0.378056199659029 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 223 CTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0 0.75 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.08333333333341 1 33.83333333333332 0.0129174344873365 0.0301548153585304 0.428370538295549 -0.0172373808711938 0.0131490804581042 0.0307707933988982 NA NA 0.0218716306426632 0.430628888794275 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTT:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666674 1 34.33333333333332 0.0128208250194751 0.0297068535712844 0.431578019150035 -0.0168860285518093 0.0132836200030607 0.033678461452174 NA NA 0.0181426768425298 0.351990539783975 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTTGAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 1 34.66666666666665 0.0127934871784325 0.029415534864961 0.434922813308139 -0.0166220476865285 0.0127068234615461 0.0322417002584864 NA NA 0.0188494145040943 0.377866780446552 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTTGACAGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666674 1 35.08333333333332 0.0127391597743079 0.0290593249318817 0.438384573770035 -0.0163201651575738 0.0126912361380385 0.0308948095632667 NA NA 0.0188413580670748 0.386386872257469 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GACAGGTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000009 1 35.08333333333332 0.0128482799476378 0.0290593249318817 0.44213965664225 -0.016211044984244 0.0128693794603264 0.0310676593921343 NA NA 0.0189578371078709 0.392489994338866 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:AGGTTGAAC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000009 1 34.999999999999986 0.0128482799476378 0.0291298749871979 0.441068832368294 -0.0162815950395602 0.0127213233955319 0.031636628395513 NA NA 0.0191908157912088 0.39621214086124 0 343 657 0.657 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAA:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333343 1 34.999999999999986 0.0126318775458731 0.0291298749871979 0.433639950443474 -0.0164979974413248 0.0124065421964153 0.0323807591001781 NA NA 0.0182140107397166 0.36504908867749303 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 230 CAA ACC AAC 2 AACCAACTT:AACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666676 1 35.999999999999986 0.0127391597743079 0.0283052459871353 0.450063559952732 -0.0155660862128274 0.0123988716325187 0.0309951566798076 NA NA 0.0171536259425643 0.364168005200145 0 352 648 0.648 0 0.001 N all ss13 231 CTT AAC TTG 2 CAACTTGAG:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000009 1 35.999999999999986 0.0128482799476378 0.0283052459871353 0.453918681840012 -0.0154569660394976 0.0124994594998431 0.0340496371711898 NA NA 0.0179693797800318 0.389687835788961 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.33333333333343 1 35.83333333333332 0.0127121687353299 0.0284394261467203 0.446991042285707 -0.0157272574113904 0.0129107962064189 0.031432450446069 NA NA 0.0190682652825232 0.409492525677295 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333343 1 34.83333333333332 0.0125525942666428 0.0292720079293014 0.428825869990203 -0.0167194136626586 0.0124623902979042 0.0307671744035312 NA NA 0.0196406490391953 0.394621694434637 0 386 614 0.614 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAA 2 AGCAAAATG:AGCAAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666677 1 34.83333333333332 0.0126585283405137 0.0292720079293014 0.432444824799411 -0.0166134795887877 0.012548783051757 0.0308308730831924 NA NA 0.0181453627549013 0.359888718493918 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 235 ATG AAA TGT 2 AAAATGTCT:AAAGTTTCT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666677 1 34.83333333333332 0.0126585283405137 0.0292720079293014 0.432444824799411 -0.0166134795887877 0.012725210811878 0.0292402174379323 NA NA 0.0184548640022289 0.368001976291266 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 236 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0000000000001 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333343 0 34.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333343 0 34.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000009 0 34.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000009 0 34.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000009 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333341 0 35.08333333333332 0.0125921111074123 0 -Inf 0.0125921111074123 0.0130866305172408 0 NA NA 0.0121212354122315 0.298875819562878 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000009 0 35.41666666666665 0.0129732964431592 0 -Inf 0.0129732964431592 0.0121883372252998 0 NA NA 0.0130124932180026 0.318770452023961 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333341 0 35.41666666666665 0.0132600139021293 0 -Inf 0.0132600139021293 0.0136351377329624 0 NA NA 0.0127058020832208 0.296661792098137 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333341 0 35.58333333333332 0.0132600139021293 0 -Inf 0.0132600139021293 0.0135320594119233 0 NA NA 0.0143070166844128 0.354020554420545 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333341 0 34.58333333333332 0.0130864825012097 0 -Inf 0.0130864825012097 0.012879607174005 0 NA NA 0.0133162685361968 0.325733468103972 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 34.41666666666665 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0129104085958434 0 NA NA 0.0131493292613437 0.320683372251121 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333341 0 34.08333333333332 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.0122594142296017 0 NA NA 0.0132432079998057 0.326227136090884 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.58333333333341 0 33.74999999999999 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.0130056481722841 0 NA NA 0.0121193518013775 0.289594359382704 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCC:AAGAAATCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000007 0 32.91666666666666 0.0128071415099282 0 -Inf 0.0128071415099282 0.0126195096095559 0 NA NA 0.0128660431432673 0.31953109658921 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 251 TCC AAT CCG 2 AAATCCGCT:AAATCTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000007 0 33.41666666666666 0.0128896835290581 0 -Inf 0.0128896835290581 0.0126827889988585 0 NA NA 0.0119227936687319 0.279654450409134 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 252 GCT CCG CTG 2 TCCGCTGCA:TCTGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.25000000000007 0 33.08333333333332 0.0256709551422775 0 -Inf 0.0256709551422775 0.0174987839878445 0 NA NA 0.0179211911199105 0.152019148647116 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 253 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGAG:GCTGCTGAG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.0833333333334 0 32.24999999999999 0.025080706950469 0 -Inf 0.025080706950469 0.0177369775493741 0 NA NA 0.0174352029231835 0.15028951285875 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 254 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGCT:GCTGAGGCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.25000000000007 0 32.08333333333332 0.0250283912732922 0 -Inf 0.0250283912732922 0.0175916041654893 0 NA NA 0.0175414717751961 0.15363394593126 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT:GAGGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.33333333333341 0 31.999999999999993 0.0250023152006938 0 -Inf 0.0250023152006938 0.0169601032455922 0 NA NA 0.0176538976005721 0.156702607777075 858 142 0 0 0.858 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA:GCTTCTAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000007 0 32.33333333333333 0.0249503257372043 0 -Inf 0.0249503257372043 0.0173915590620935 0 NA NA 0.0169931040119641 0.142033119006444 888 112 0 0 0.888 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG:TCTAAGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.16666666666674 0 31.66666666666666 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0177892965155859 0 NA NA 0.0172862501449007 0.152299471306352 858 142 0 0 0.858 0.001 N all ss13 258 AAA AAA AAC 2 AAAAAGCCT:AAGAAACCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.41666666666674 0 30.41666666666666 0.0243676255683408 0 -Inf 0.0243676255683408 0.0168225568919645 0 NA NA 0.0173551405186069 0.160301550154504 832 168 0 0 0.832 0.001 N all ss13 259 CCT AAC CTC 2 AAACCTCGC:AAGCCTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.0833333333334 0 30.58333333333333 0.0244670014671393 0 -Inf 0.0244670014671393 0.0175662121286884 0 NA NA 0.0166681314738411 0.142133812249999 877 123 0 0 0.877 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.0833333333334 0 30.58333333333333 0.0244670014671393 0 -Inf 0.0244670014671393 0.0167330460516084 0 NA NA 0.0168174772396322 0.145709233181757 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.91666666666673 0 30.75 0.0245169940203504 0 -Inf 0.0245169940203504 0.0170428038945734 0 NA NA 0.0172373274937651 0.15493340270178 850 150 0 0 0.85 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.25000000000007 0 30.416666666666664 0.0244172123964444 0 -Inf 0.0244172123964444 0.0167843553605944 0 NA NA 0.0170839649931582 0.152933140929031 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.0833333333334 0 30.916666666666664 0.0247700531384151 0 -Inf 0.0247700531384151 0.0170824890409655 0 NA NA 0.0171992095364217 0.149814908765008 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.08333333333339 0 31.916666666666664 0.025080706950469 0 -Inf 0.025080706950469 0.0174731842171055 0 NA NA 0.0175449485136187 0.152857250987024 879 121 0 0 0.879 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.41666666666673 0 31.583333333333332 0.02497629341178 0 -Inf 0.02497629341178 0.0171648513928968 0 NA NA 0.0177360695873178 0.159065844067252 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCCACCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.75000000000006 0 30.916666666666664 0.0245671913061601 0 -Inf 0.0245671913061601 0.0168117260362214 0 NA NA 0.0173301925411221 0.156309091154618 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.08333333333339 0 31.083333333333336 0.0244670014671393 0 -Inf 0.0244670014671393 0.016980993994915 0 NA NA 0.0162901334381488 0.133109458614752 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 268 CAA AAC AAT 2 AAACAATAC:AAACAGTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666671 0 31.083333333333336 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0170251065864716 0 NA NA 0.0176266335815734 0.161667664264069 853 147 0 0 0.853 0.001 N all ss13 269 TAC AAT ACA 2 CAATACAAT:CAGTACAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666671 0 31.416666666666668 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0169772544973716 0 NA NA 0.0170105774027508 0.147011510454426 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000004 0 31.583333333333336 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0182166362069074 0 NA NA 0.0170281803796699 0.146597867562239 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 271 GTA ACG TAA 2 AACGTCACT:AATGTAACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.9166666666667 0 31.250000000000004 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.0175281714021712 0 NA NA 0.0176204504398828 0.158934561408636 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 272 ACA TAA CAC 2 GTAACACAA:GTCACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 32.083333333333336 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.017206325539351 0 NA NA 0.0177640528765511 0.160592569848085 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 273 CAA CAC AAG 2 ACACAAGCT:ACTCAAGCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000004 0 31.416666666666664 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0167331613387077 0 NA NA 0.0167004226439559 0.138834919798706 856 144 0 0 0.856 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.08333333333337 0 31.916666666666664 0.0247700531384151 0 -Inf 0.0247700531384151 0.0169639841665642 0 NA NA 0.017283078609803 0.151801600922708 852 148 0 0 0.852 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGC 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.08333333333337 0 31.583333333333332 0.0244670014671393 0 -Inf 0.0244670014671393 0.0175432159089392 0 NA NA 0.0172019515440534 0.15492794812572 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 276 GGC TTG GCA 2 TTTGGCAGA:TTTGGGAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.25000000000004 0 30.916666666666664 0.0244172123964444 0 -Inf 0.0244172123964444 0.0167907029621387 0 NA NA 0.0162516462337881 0.132982098691054 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 277 AGA GCA GAC 2 GGCAGACGT:GGGAGACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.58333333333337 0 31.583333333333332 0.0246175945849123 0 -Inf 0.0246175945849123 0.0166801505926486 0 NA NA 0.0174744663817804 0.158901655416741 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.58333333333337 0 31.416666666666664 0.0246175945849123 0 -Inf 0.0246175945849123 0.0165752049267957 0 NA NA 0.0170679619315557 0.149209944308774 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.9166666666667 0 32.083333333333336 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.0165842971669211 0 NA NA 0.0168635007012649 0.141049380777425 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.9166666666667 0 32.083333333333336 0.0248212932013322 0 -Inf 0.0248212932013322 0.018135073175314 0 NA NA 0.0171727664646383 0.148349216152067 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.58333333333337 0 31.416666666666664 0.0246175945849123 0 -Inf 0.0246175945849123 0.0165051211244047 0 NA NA 0.0167842269400266 0.142454943718585 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.75000000000003 0 31.583333333333332 0.0245671913061601 0 -Inf 0.0245671913061601 0.0170268866314156 0 NA NA 0.016884255737069 0.145659436806979 888 112 0 0 0.888 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333336 0 32.25 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0174135067376869 0 NA NA 0.0181198187261349 0.16099326535287 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.4166666666667 0 31.916666666666668 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0180928809667769 0 NA NA 0.0184877351363083 0.165876601755103 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000003 0 31.916666666666668 0.0258367851740807 0 -Inf 0.0258367851740807 0.0175461027740404 0 NA NA 0.0173151106249712 0.135659177958825 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.75000000000003 1 32.25 0.03909679907621 0.03166697281676 1.23462382408456 0.00742982625944998 0.0222840486045756 0.0330823577173302 NA NA 0.0253096717034833 0.769096589790518 582 43 375 0.375 0.582 0.75 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000003 1 32.083333333333336 0.0393532888030902 0.0318350176854428 1.23616356026356 0.00751827111764741 0.021990313198319 0.0321437093323757 NA NA 0.0265015355919958 0.776646498846307 594 44 362 0.362 0.594 0.724 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 1 31.75 0.0394395350433882 0.0321765161581571 1.22572421605656 0.00726301888523109 0.0221196676149483 0.0342554273676257 NA NA 0.0265926067792262 0.78475964003740994 570 44 386 0.386 0.57 0.772 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA:GGGGATCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333336 1 32.25000000000001 0.0397005575048303 0.03166697281676 1.2536896953983 0.00803358468807025 0.0225475201873735 0.0339771645043024 NA NA 0.0277732146036248 0.772385047399846 565 53 382 0.382 0.565 0.764 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GATCAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.83333333333336 1 32.00000000000001 0.0395696157178212 0.0319197108140969 1.23966084618617 0.00764990490372429 0.0222737329584999 0.0327506875490204 NA NA 0.0276197043152313 0.781801045661861 604 45 351 0.351 0.604 0.702 N all ss13 291 GAA AAG AAT 2 CAAGAATTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.58333333333336 1 31.250000000000004 0.0391819232689515 0.0327027281115989 1.19812399550405 0.00647919515735262 0.0217852306901462 0.0332620525773056 NA NA 0.0282134273504176 0.818364258410212 576 48 376 0.376 0.576 0.752 N all ss13 292 CTA AAT TAA 2 GAATTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000003 1 30.833333333333336 0.0257536031856687 0.0331545693783718 0.77677387064689 -0.00740096619270308 0.0180745505587859 0.0340749341425582 NA NA 0.0259894547481956 0.77582185618595 346 122 532 0.532 0.346 0.692 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:TTAATCAGA 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333336 1 31.000000000000004 0.0251595918684029 0.032972342565837 0.763051391273332 -0.00781275069743418 0.017591254068208 0.0332825695134542 NA NA 0.0242087160474027 0.746903742046302 306 142 552 0.552 0.306 0.612 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000003 1 32.00000000000001 0.0249503257372043 0.0319197108140969 0.781658890411542 -0.00696938507689263 0.0187003438363366 0.0328060624000775 NA NA 0.0247419862615072 0.778186957850495 333 146 521 0.521 0.333 0.666 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 1 31.833333333333336 0.0247445123657617 0.0320904564039067 0.771086333404384 -0.00734594403814507 0.018152507240937 0.0328617106188107 NA NA 0.0249413910191319 0.768354286306392 332 124 544 0.544 0.332 0.664 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333336 1 32.5 0.0251595918684029 0.0314182062818701 0.800796571347271 -0.00625861441346724 0.0165586501276398 0.0323673627553009 NA NA 0.0232319448117974 0.787624254889726 320 144 536 0.536 0.32 0.64 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.83333333333336 1 32.16666666666667 0.0505454383004815 0.0317507728699206 1.59194355701389 0.0187946654305609 0.0307500575816821 0.0326043202470393 NA NA 0.0338877378850087 0.579157669863141 659 58 283 0.283 0.659 0.566 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.00000000000003 1 32.00000000000001 0.0504391702568755 0.0319197108140969 1.58018882284484 0.0185194594427786 0.0299709695536994 0.0342498489102585 NA NA 0.0358645896729509 0.605594821526791 674 45 281 0.281 0.674 0.562 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.00000000000003 1 32.00000000000001 0.0504391702568755 0.0319197108140969 1.58018882284484 0.0185194594427786 0.031818702438839 0.0328446515393006 NA NA 0.0345574888762726 0.592025641366175 680 49 271 0.271 0.68 0.542 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAA:TACAAACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000003 1 31.666666666666668 0.0498108321742552 0.0322630388127681 1.54389772343895 0.0175477933614871 0.0312498746679052 0.0333651456123772 NA NA 0.0346956566464891 0.613022753051107 682 41 277 0.277 0.682 0.554 N all ss13 301 CAA AAC AAT 2 AAACAATGG:AAACATTGG 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.25000000000003 2 31.416666666666668 0.062601492219649807 0.0665255778124882 0.941013881850091 -0.00392408559283841 0.033569857863398 0.0482099168239804 NA NA 0.0427329020545143 0.926834536192102 457 14 529 0.529 0.457 0.914 N all ss13 302 TGG AAT GGC 2 CAATGGCCG:CATTGGCCG 1:1 FALSE 2.5 0 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.08333333333336 2 31.916666666666668 0.0503862036875865 0.0654365742860851 0.770000634007838 -0.0150503705984986 0.0311887122461305 0.048949241129118 NA NA 0.0414293158778755 0.716397016983893 352 33 615 0.615 0.352 0.704 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.91666666666669 2 32.41666666666667 0.0511380136321413 0.0643826713791053 0.794282258513702 -0.0132446577469641 0.0314599121234689 0.048346335675349 NA NA 0.0379244034380031 0.726910344441101 348 46 606 0.606 0.348 0.696 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.58333333333336 2 31.416666666666668 0.0507056829412418 0.0665255778124882 0.762198309410599 -0.0158198948712465 0.0318288069728446 0.0486478114441536 NA NA 0.0394591855711614 0.688480550938115 313 60 627 0.627 0.313 0.626 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.41666666666669 2 30.416666666666668 0.051467132797986 0.0688161477015357 0.747893256408443 -0.0173490149035498 0.0314812545335882 0.0535827462078727 NA NA 0.0421976599128125 0.680972157055169 286 39 675 0.675 0.286 0.572 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.25000000000003 2 29.750000000000004 0.0515777829948789 0.0704329495874262 0.732296223528975 -0.0188551665925473 0.0327591310791345 0.0556437695701775 NA NA 0.0438663405274069 0.667317692327505 324 44 632 0.632 0.324 0.648 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.50000000000003 2 30.16666666666667 0.0514119856124207 0.0694136680239339 0.740660839226849 -0.0180016824115131 0.032185619918443 0.0522124175362282 NA NA 0.0418216454554932 0.666876067105268 310 49 641 0.641 0.31 0.62 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.16666666666669 2 30.500000000000004 0.0516332867726302 0.0686192553184994 0.752460610844171 -0.0169859685458692 0.0318670494779698 0.0514218941157455 NA NA 0.0433865503030381 0.695425404443715 322 52 626 0.626 0.322 0.644 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA:TTTGCTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.50000000000003 2 31.166666666666664 0.0520816565415757 0.0670837952639451 0.776367173870492 -0.0150021387223694 0.031430029087257 0.053618819291502 NA NA 0.0433782388294556 0.729459347960103 346 38 616 0.616 0.346 0.692 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT:GCTCCTAGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.16666666666669 2 31.166666666666664 0.0516332867726302 0.0670837952639451 0.769683446940889 -0.0154505084913149 0.0323285229910584 0.0459318380634656 NA NA 0.0431588826724238 0.720349755318545 341 42 617 0.617 0.341 0.682 N all ss13 311 AGC CAA GCG 2 CCAAGTGCC:CCTAGCGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.33333333333336 2 30.999999999999996 0.0515223984646761 0.0674611774972046 0.763734052326778 -0.0159387790325285 0.0328806113392014 0.0489105769968647 NA NA 0.0392847908206006 0.684945470257858 323 49 628 0.628 0.323 0.646 N all ss13 312 GCC GCG CCT 2 AGCGCTTCT:AGTGCCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.00000000000001 2 30.66666666666666 0.0517446536152136 0.0682288336542951 0.758398624801293 -0.0164841800390815 0.0314194949007288 0.0509454747489023 NA NA 0.0425312352831552 0.698328196783361 309 38 653 0.653 0.309 0.618 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA:GCTTCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.66666666666669 2 30.66666666666666 0.0513020451633004 0.0682288336542951 0.751911507431593 -0.0169267884909947 0.0311722699871281 0.0538993046700305 NA NA 0.0424621113009016 0.690163821514844 325 42 633 0.633 0.325 0.65 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.6666666666667 2 29.666666666666664 0.0506521552428655 0.0706404112947758 0.717042190361815 -0.0199882560519103 0.0311419572299042 0.0531495091684987 NA NA 0.0450628780051052 0.657358068781753 293 37 670 0.67 0.293 0.586 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000003 2 28.999999999999996 0.0498108321742552 0.0723451996406717 0.688516064944994 -0.0225343674664164 0.0300727841676605 0.0536453544936834 NA NA 0.0448148907863496 0.615082294374339 306 40 654 0.654 0.306 0.612 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.6666666666667 2 29.666666666666664 0.0506521552428655 0.0706404112947758 0.717042190361815 -0.0199882560519103 0.0311379823031194 0.0537167827845184 NA NA 0.0451935133932924 0.658285497867363 321 34 645 0.645 0.321 0.642 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.00000000000003 2 28.83333333333333 0.0504391702568755 0.0727843418621031 0.692994797595853 -0.0223451716052276 0.0311217336583303 0.0550068771100329 NA NA 0.0456165988644417 0.624241897970368 303 47 650 0.65 0.303 0.606 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGAATGTCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.4166666666667 2 28.41666666666666 0.0501754455827152 0.0739059002893285 0.678909875751289 -0.0237304547066133 0.0293826608704939 0.0561631910367081 NA NA 0.0442906274558272 0.592104015311996 297 32 671 0.671 0.297 0.594 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCGCGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.9166666666667 2 28.58333333333333 0.0504922483436096 0.0734531512400294 0.687407517461185 -0.0229609028964198 0.0295415760764725 0.054507853064394 NA NA 0.0436416158054466 0.598802031776837 271 49 680 0.68 0.271 0.542 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCGCGCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.75000000000003 2 28.749999999999993 0.0505987404816737 0.073005919868405 0.693077226790364 -0.0224071793867313 0.0314016805902948 0.0553033432389545 NA NA 0.0434958142076511 0.606443214250427 282 41 677 0.677 0.282 0.564 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.08333333333337 2 29.08333333333333 0.0503862036875865 0.0721276112438599 0.69857025373034 -0.0217414075562734 0.0306737520737929 0.0543778969184666 NA NA 0.0456693816184624 0.634030981801797 259 55 686 0.686 0.259 0.518 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000003 2 28.583333333333332 0.0499664439235005 0.0734531512400294 0.680249153099242 -0.0234867073165289 0.030872797530239 0.0550327490967116 NA NA 0.0441716182183229 0.594923474475171 266 60 674 0.674 0.266 0.532 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.4166666666667 2 28.583333333333332 0.0495536228075988 0.0734531512400294 0.674628956975147 -0.0238995284324306 0.0309998378966315 0.0548962213424158 NA NA 0.0459945028137751 0.603330503529978 274 44 682 0.682 0.274 0.548 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.08333333333336 2 28.583333333333332 0.0497591768358708 0.0734531512400294 0.677427394139543 -0.0236939744041585 0.0315441236159929 0.0534204640903799 NA NA 0.0464031539561936 0.609623267179228 291 46 663 0.663 0.291 0.582 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.08333333333336 2 29.583333333333332 0.0503862036875865 0.0708490996895694 0.711176343924728 -0.0204628960019829 0.0316423530093536 0.0520541994417327 NA NA 0.0407236365885681 0.615328482582164 307 53 640 0.64 0.307 0.614 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.33333333333336 2 29.999999999999996 0.0502279695796377 0.069817817299509 0.719414778668409 -0.0195898477198713 0.0316176091448052 0.0530368712210441 NA NA 0.0422023741516551 0.642512853059066 317 45 638 0.638 0.317 0.634 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.08333333333336 2 29.916666666666664 0.0497591768358708 0.070021663193269107 0.710625463130301 -0.0202624863573983 0.0304924516605173 0.0521047932463706 NA NA 0.0449625119051042 0.652239734036623 324 49 627 0.627 0.324 0.648 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000003 3 30.25 0.0499664439235005 0.106372646579413 0.469730194088926 -0.0564062026559128 0.0304729842886376 0.0695732222871581 NA NA 0.060455694752593 0.350811091082018 151 11 838 0.838 0.151 0.302 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA:TCGGGAACG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.4166666666667 3 30.25 0.0495536228075988 0.106372646579413 0.465849298678529 -0.0568190237718145 0.0304432422424508 0.064308788940892 NA NA 0.0599015964104605 0.342854929445759 134 14 852 0.852 0.134 0.268 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG:GGAACGTGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.08333333333336 3 29.25 0.0485508200337835 0.110290063467372 0.440210282843354 -0.061739243433589 0.029834985024487 0.0716444940711223 NA NA 0.0609606573425555 0.311169104672884 128 18 854 0.854 0.128 0.256 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG:ACGTGGTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.08333333333336 4 29.25 0.0485508200337835 0.150978005779684 0.321575449238824 -0.1024271857459 0.02998731846739 0.0859778533421364 NA NA 0.0769801370362829 0.183331716145165 53 6 941 0.941 0.053 0.106 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT:TGGTTGACC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.4166666666667 4 29.583333333333332 0.0489470292290666 0.149095891727942 0.328292273259823 -0.100148862498876 0.0298308928365175 0.0864336946875738 NA NA 0.0796780318806511 0.20878282981054 53 7 940 0.94 0.053 0.106 N all ss13 333 ACC TGA CCT 2 CTGACTTAT:TTGACCTAC 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.08333333333337 4 29.249999999999996 0.0604556740990773 0.150978005779684 0.40042702767778 -0.0905223316806062 0.032947126334715 0.0839772114871235 NA NA 0.0805986368475718 0.261384474763662 91 2 907 0.907 0.091 0.182 N all ss13 334 TAC CCT ACA 2 ACCTACACA:ACTTATCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.75000000000004 4 29.916666666666664 0.0599719947335073 0.147260274111344 0.40725168478338 -0.087288279377837 0.0308590912061084 0.0842237502511762 NA NA 0.0734517373309359 0.234685320517084 90 2 908 0.908 0.09 0.18 N all ss13 335 ACA ACA ATG 2 TACACAGGT:TATCATGGA 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.00000000000004 4 29.666666666666664 0.0597926053740288 0.148632696437812 0.402284334517515 -0.0888400910637827 0.0321399067731779 0.0865553077407642 NA NA 0.0783446898450285 0.256809471442106 97 1 902 0.902 0.097 0.194 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 ACAGGTGCC:CATGGAGCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.66666666666671 3 30.333333333333332 0.0476350542917444 0.106058740537371 0.449138411887509 -0.058423686245627 0.0292258004911079 0.0703116763556832 NA NA 0.0694011615678839 0.399885485278886 178 6 816 0.816 0.178 0.356 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT:GGTGCCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.50000000000006 3 30.666666666666664 0.0477298200624741 0.104821456781369 0.455343987081065 -0.0570916367188949 0.0295806900344467 0.0668843112495328 NA NA 0.0665578643309603 0.391017010287932 191 4 805 0.805 0.191 0.382 N all ss13 338 ATC CCA TCA 2 GCCATCAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.5833333333334 3 30.249999999999996 0.0471204985826021 0.106372646579413 0.442975709431314 -0.0592521479968112 0.0301813757617561 0.0668913180298727 NA NA 0.0680815943828327 0.384130569411457 189 8 803 0.803 0.189 0.378 N all ss13 339 AAA TCA AAT 2 ATCAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.41666666666673 3 30.08333333333333 0.0466622764891086 0.107006075844546 0.436071280259802 -0.0603437993554372 0.0284311710022036 0.0698719018190631 NA NA 0.0639175245075569 0.345124429316353 142 6 852 0.852 0.142 0.284 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAC:AAATTGGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.66666666666673 3 29.83333333333333 0.0465265431895895 0.107970516691131 0.430918963949083 -0.0614439735015419 0.0281357966267303 0.0716471410579382 NA NA 0.0707723284056083 0.38528920086019 166 2 832 0.832 0.166 0.332 N all ss13 341 GAC TGG ACG 2 TTGGACGAC:TTGGATGAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.66666666666673 3 29.83333333333333 0.0465265431895895 0.107970516691131 0.430918963949083 -0.0614439735015419 0.0288473176372642 0.0693282555305772 NA NA 0.065826785355671 0.350603663618913 145 7 848 0.848 0.145 0.29 N all ss13 342 GAC ACG ACA 2 GACGACAAA:GATGACAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.66666666666673 3 30.16666666666666 0.0470742716623405 0.106688419438138 0.441231315547193 -0.0596141477757978 0.0293717864922219 0.0652840769751507 NA NA 0.0677904616195494 0.37919070195331 168 5 827 0.827 0.168 0.336 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.3333333333334 3 30.833333333333332 0.047824963769242 0.104213595070396 0.458912906103433 -0.0563886313011544 0.0287153822242133 0.0638048743662937 NA NA 0.0680291564972807 0.407167122201034 199 4 797 0.797 0.199 0.398 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.00000000000006 3 30.499999999999996 0.0485999949201866 0.105436462965892 0.460941059222637 -0.0568364680457055 0.0292933800378333 0.0656037257853352 NA NA 0.0682098365517123 0.404698609228078 171 5 824 0.824 0.171 0.342 N all ss13 345 CCA ATC CAA 2 GATCCAAAT:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.66666666666673 3 30.166666666666664 0.0494005687407186 0.106688419438138 0.463035903998586 -0.0572878506974196 0.029758884028328 0.0656573106918784 NA NA 0.0684501869107408 0.402633264914567 162 2 836 0.836 0.162 0.324 N all ss13 346 AAT CAA AAT 2 CCAAATTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.3333333333334 3 30.499999999999996 0.0496048518784087 0.105436462965892 0.470471509409942 -0.0558316110874834 0.0309556516828295 0.0679980436801068 NA NA 0.0677159219515882 0.409656912828521 190 2 808 0.808 0.19 0.38 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AATTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.50000000000007 3 30.666666666666664 0.0246428738683313 0.104821456781369 0.235093793055463 -0.0801785829130378 0.0181527151350466 0.0677597788425412 NA NA 0.0620053340256258 0.19597934472995 44 16 940 0.94 0.044 0.088 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC:TTCAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.3333333333334 3 30.833333333333332 0.0246935885223499 0.104213595070396 0.236951700070124 -0.0795200065480465 0.0174520587724316 0.0677981823805279 NA NA 0.0647370179267235 0.219313924612658 57 13 930 0.93 0.057 0.114 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGATCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.3333333333334 3 31.16666666666666 0.0250023152006938 0.103018812035868 0.242696597898922 -0.0780164968351745 0.0176328396780356 0.0638492965782182 NA NA 0.0591416888175178 0.187120450752356 49 18 933 0.933 0.049 0.098 N all ss13 350 AAC ACA AAG 2 GACAACGTC:GATCAAGTC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.8333333333334 3 31.999999999999996 0.0254801574935108 0.100148544468392 0.254423642687615 -0.0746683869748811 0.0179551420774091 0.0661161646873502 NA NA 0.0604135091684035 0.216475240346915 54 15 931 0.931 0.054 0.108 N all ss13 351 GTC AAG TCA 2 AACGTCATA:CAAGTCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666673 2 31.916666666666664 0.0126185941874855 0.0654365742860851 0.192837023104506 -0.0528179800985996 0.0128106949067461 0.050550239873336 NA NA 0.0536225041169996 0.324625778971787 96 42 862 0.862 0.096 0.192 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTCATTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000007 3 31.916666666666664 0.0124872811774231 0.100428343016685 0.124340209171315 -0.0879410618392615 0.0127818089374107 0.0643822801620213 NA NA 0.0664278229299699 0.185549924038298 48 17 935 0.935 0.048 0.096 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATTTTGCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333341 3 30.916666666666664 0.012282771960992 0.103912304538584 0.118203248552064 -0.091629532577592 0.0130016759383108 0.0670886309578626 NA NA 0.0716977046434543 0.201250085042389 37 12 951 0.951 0.037 0.074 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.08333333333341 3 30.916666666666664 0.0121337327973564 0.103912304538584 0.116768970250785 -0.0917785717412276 0.0120628707913934 0.0669982350996574 NA NA 0.0635182093973737 0.148481062762752 31 9 960 0.96 0.031 0.062 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.58333333333341 3 31.583333333333332 0.0119168346205006 0.101563372279023 0.117333979298775 -0.089646537658522 0.0125073325286416 0.0672334570061664 NA NA 0.0671794056464154 0.182061396954774 44 12 944 0.944 0.044 0.088 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.91666666666674 3 32.58333333333333 0.0120122687914307 0.0982328346145694 0.122283642109714 -0.0862205658231387 0.0124422800888884 0.0631630956303638 NA NA 0.0645388523596392 0.18156619390958 44 16 940 0.94 0.044 0.088 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.66666666666674 3 32.58333333333333 0.0242936218434266 0.0982328346145694 0.247306533897205 -0.0739392127711428 0.0170425265777125 0.060754453451628 NA NA 0.0676693153611232 0.274545324018966 78 1 921 0.921 0.078 0.156 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 84.00000000000007 3 32.25 0.0241956466636661 0.0993184392369987 0.243616863590951 -0.0751227925733326 0.0169168077826708 0.0621230954416715 NA NA 0.0679310358060436 0.268783441326592 96 4 900 0.9 0.096 0.192 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 84.83333333333341 4 31.083333333333336 0.0239541318808744 0.141177857059553 0.169673434487463 -0.117223725178678 0.0178182835339924 0.0815283232602872 NA NA 0.0870906638515129 0.178303658476935 43 4 953 0.953 0.043 0.086 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 2 85.16666666666674 4 30.750000000000004 0.0238588707262606 0.142863650574837 0.167004487357423 -0.119004779848576 0.0172722829723278 0.0853432385250142 NA NA 0.083805279136481 0.15560322248296 39 0 961 0.961 0.039 0.078 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.66666666666674 4 29.916666666666668 0.0476350542917444 0.147260274111344 0.32347525209499 -0.0996252198195999 0.0291617350593148 0.0844570238471439 NaN NaN 0.0926738291143485 0.282370604938693 116 0 884 0.884 0.116 0.232 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.50000000000007 4 30.083333333333336 0.047729820062474 0.146359364647636 0.326113878516656 -0.0986295445851619 0.0281647554954547 0.0839577941968916 NaN NaN 0.0933077757859047 0.290495810793516 114 1 885 0.885 0.114 0.228 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.83333333333341 4 30.083333333333336 0.0486986442466361 0.146359364647636 0.332733367378844 -0.0976607204009999 0.0303928471453376 0.081652609302067 NA NA 0.09252576410217 0.291197814202 96 0 904 0.904 0.096 0.192 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.00000000000007 4 30.583333333333336 0.0491979618643599 0.143721781908901 0.342313887365691 -0.0945238200445409 0.0321040113485435 0.0845407110655524 NaN NaN 0.091985982400146 0.304143014618781 108 2 890 0.89 0.108 0.216 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.66666666666674 4 30.250000000000004 0.0506521552428654 0.145469445655623 0.348197898291141 -0.0948172904127578 0.0299847379067504 0.0864924013521528 NA NA 0.096168956120748 0.324160159263672 131 2 867 0.867 0.131 0.262 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.66666666666674 4 29.250000000000004 0.0513020451633003 0.150978005779684 0.339798137472841 -0.0996759606163832 0.0320715089445248 0.0883637333475307 NaN NaN 0.0997085849428528 0.317468877844486 97 0 903 0.903 0.097 0.194 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.16666666666674 5 30.08333333333334 0.0651167959941863 0.187892466749351 0.346564165773885 -0.122775670755165 0.0351068704731419 0.0982445761387722 NA NA 0.103644338789293 0.236181029842957 71 0 929 0.929 0.071 0.142 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.16666666666674 5 31.08333333333334 0.0659765797094678 0.181054357970061 0.364402052782279 -0.115077778260593 0.0358958257864572 0.0981730433135452 NA NA 0.09985630579519 0.249142873527571 86 0 914 0.914 0.086 0.172 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.66666666666674 5 31.58333333333334 0.0664150480060837 0.177819473768805 0.373497045056125 -0.111404425762721 0.0365015881669935 0.0946297531084071 NaN NaN 0.0987873766634866 0.259438507660735 86 1 913 0.913 0.086 0.172 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.66666666666674 5 31.58333333333334 0.0673097158922066 0.177819473768805 0.378528371868429 -0.110509757876598 0.0371030656618621 0.0927504378200181 NA NA 0.0974913378550691 0.256990021067976 89 0 911 0.911 0.089 0.178 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.66666666666674 5 30.91666666666667 0.0673097158922066 0.182159096576957 0.369510593525425 -0.11484938068475 0.0372621300742557 0.0962097687114004 NaN NaN 0.101355303774796 0.257156991390309 89 0 911 0.911 0.089 0.178 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.16666666666674 5 31.416666666666668 0.067766156279967 0.178884786483983 0.378825710178739 -0.111118630204016 0.036656662596662 0.0982990072600675 NaN NaN 0.0973340099766244 0.253611247670015 89 0 911 0.911 0.089 0.178 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.50000000000009 5 31.416666666666668 0.0683844676038054 0.178884786483983 0.382282188149792 -0.110500318880178 0.0357752979130915 0.098209022798217 NA NA 0.0971609700575898 0.255416560887404 97 0 903 0.903 0.097 0.194 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA:AAAAAGAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG:AAGAAGAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAGAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAA 2 GATGAAACT:GATGAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 ACT AAA CTC 2 GAAACTCAA:GAAGCTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCC:GCTCAGCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AAG CCT 2 CAAGCCTTA:CAGCCTTTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CCT TAC 2 CCTTTGCCG:GCCTTACCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAA:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAA AAC AAC 2 AAACAACCC:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AAC CCA 2 CAACCCACA:CAGCCCACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACA CCA CAG 2 CCCACAGTG:CCCACTGTG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CAG TGA 2 ACAGTGACT:ACTGTGACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG:CTTCCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT:CCTGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CGG CAG 2 GCGGCTGAC:GCTGCAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAAA:TTCTCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAATTG:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TGC 2 CAACTTCAA:CAATTGCAA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TGC AAA 2 CTTCAAAAT:TTGCAACAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA AAT 2 CAAAATTCC:CAACAATCC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC AAT CCA 2 AATTCCATG:CAATCCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGC:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGC TGA GC- 1 ATGAGC---:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 --- GTG GAG 1 AGC------:AGTGGAGCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 --- GAG CTT 1 ------AGT:GGAGCTTCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 AGT --A CTG 1 ---AGTGCT:GCTTCTGCT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 AGTGCTGAT:TCTGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA:ACTCAGGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCTTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_EPI_ISL_410721 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666673 2 33.916666666666664 0.0130296436641525 0.0614153696041381 0.212156073441177 -0.0483857259399856 0.0133142090707356 0.0480783556137859 NA NA 0.0511045265159693 0.343741098367439 105 49 846 0.846 0.105 0.21 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000006 2 34.08333333333333 0.0130580012294226 0.0611024764460933 0.213706579322408 -0.0480444752166707 0.0133574334438726 0.0486818421239281 NA NA 0.0489324176795697 0.326171929625018 109 43 848 0.848 0.109 0.218 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333339 2 34.08333333333333 0.0130014090011593 0.0611024764460933 0.212780393813165 -0.0481010674449339 0.0132015195074818 0.0488766473007268 NA NA 0.0488892477589355 0.325175379840401 136 40 824 0.824 0.136 0.272 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333339 2 34.416666666666664 0.0131726767040263 0.0604861633757489 0.217780000728359 -0.0473134866717226 0.0133243648213219 0.0485353019076127 NA NA 0.0506162583531128 0.349917772074081 128 44 828 0.828 0.128 0.256 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333339 2 35.416666666666664 0.0133485169832455 0.0587096677913667 0.227364887000917 -0.0453611508081212 0.0129133940815709 0.0453812834420917 NA NA 0.0472757010530549 0.33730568791414 125 39 836 0.836 0.125 0.25 N all ss13 7 CAA CCC AAC 2 CCCCAACCA:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333339 2 35.416666666666664 0.0133485169832455 0.0587096677913667 0.227364887000917 -0.0453611508081212 0.0128990843478564 0.0455193599418429 NA NA 0.0502108535676353 0.366306606128822 109 41 850 0.85 0.109 0.218 N all ss13 8 CCA AAC CAA 2 CAACCAAAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666671 2 35.416666666666664 0.0134683754007452 0.0587096677913667 0.229406431809613 -0.0452412923906215 0.013266193449822 0.046716203490728 NA NA 0.0493655325113372 0.359428264433934 128 35 837 0.837 0.128 0.256 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 CCAAACCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 1 36.08333333333333 0.0135904058348962 0.0282386296527663 0.481270019190355 -0.0146482238178701 0.0139835553388846 0.0318472658576498 NA NA 0.0337339329112982 0.664122761705034 288 102 610 0.61 0.288 0.576 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333339 1 36.75 0.0137146678675636 0.0277167798918218 0.494814618476307 -0.0140021120242582 0.0140981417621932 0.0289854686241985 NA NA 0.0334224313893893 0.675257388990367 309 142 549 0.549 0.309 0.618 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 1 36.08333333333333 0.0135904058348962 0.0282386296527663 0.481270019190355 -0.0146482238178701 0.0136014920661496 0.0307171736175875 NA NA 0.0344367897854189 0.670570219872155 271 130 599 0.599 0.271 0.542 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333339 1 36.25 0.0136212597557268 0.0281063333749098 0.484633110055058 -0.014485073619183 0.0143280173777946 0.0288928898756384 NA NA 0.0333483746341411 0.664029791500849 302 119 579 0.579 0.302 0.604 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.75000000000004 1 36.58333333333333 0.0136833898069031 0.02784542552167 0.491405304481857 -0.0141620357147669 0.014067246117478 0.028641076768564 NA NA 0.0336849316989463 0.674173960733581 299 138 563 0.563 0.299 0.598 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 1 36.41666666666666 0.0135291154422588 0.0279752710599065 0.4836098071503 -0.0144461556176478 0.0132551965817189 0.0287499780637456 NA NA 0.0332068321690668 0.663536555237947 294 131 575 0.575 0.294 0.588 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 1 35.91666666666666 0.0133188849757348 0.0283721774047871 0.469434713653227 -0.0150532924290523 0.0136611648307559 0.0304397199851803 NA NA 0.0332147286130974 0.650396550920839 274 108 618 0.618 0.274 0.548 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333337 1 35.58333333333333 0.0132600139021293 0.0286430990492925 0.462939218947985 -0.0153830851471632 0.0133153420638289 0.0306590296727506 NA NA 0.0332060322111827 0.643176747378412 262 144 594 0.594 0.262 0.524 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333337 1 34.75 0.0130864825012098 0.0293435958691742 0.445974057152188 -0.0162571133679644 0.0130858804953248 0.0302085430439963 NA NA 0.034606780058158 0.638521697665613 267 138 595 0.595 0.267 0.534 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000003 1 34.75 0.0129732964431592 0.0293435958691742 0.442116791036774 -0.0163702994260149 0.0134171955590541 0.0309829586029391 NA NA 0.0333564146648025 0.623589728605036 281 131 588 0.588 0.281 0.562 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.9166666666667 1 35.08333333333333 0.0131150882907867 0.0290593249318817 0.451321161848387 -0.0159442366410951 0.0132532394828231 0.0298661380759643 NA NA 0.0348728571127362 0.647519747790301 260 136 604 0.604 0.26 0.52 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 1 35.25 0.0132307731029258 0.0289192452027623 0.457507552847958 -0.0156884720998365 0.0134418997853405 0.0309030580091109 NA NA 0.0337616387860843 0.642158218938058 259 125 616 0.616 0.259 0.518 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.9166666666667 1 34.58333333333333 0.0131150882907867 0.0294878275056261 0.444762785196176 -0.0163727392148394 0.0136267460989054 0.0336112925034566 NA NA 0.0326954728163896 0.616536719262907 258 130 612 0.612 0.258 0.516 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333336 1 35.58333333333333 0.0131726767040263 0.0286430990492925 0.459890065713809 -0.0154704223452662 0.0133624849487183 0.030791890969232 NA NA 0.0336932676711876 0.646123075439883 306 120 574 0.574 0.306 0.612 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000003 1 34.91666666666666 0.0130580012294226 0.0292007684815911 0.447180054102161 -0.0161427672521685 0.0132221129578506 0.0304543486937071 NA NA 0.035456453067214 0.648904702733932 271 127 602 0.602 0.271 0.542 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.9166666666667 1 35.58333333333333 0.0132893842388272 0.0286430990492925 0.463964608576649 -0.0153537148104653 0.0132100150246552 0.0308766786837834 NA NA 0.033903379618971 0.650644663608668 283 118 599 0.599 0.283 0.566 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000004 1 35.24999999999999 0.0130580012294226 0.0289192452027623 0.451533265749803 -0.0158612439733397 0.0130371781682283 0.0321728062328294 NA NA 0.0329647950197441 0.630404874163602 273 141 586 0.586 0.273 0.546 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333339 1 34.91666666666666 0.0130014090011593 0.0292007684815911 0.445242015098191 -0.0161993594804317 0.0128352661548584 0.0328465574815463 NA NA 0.0337055054943948 0.630790406573696 292 127 581 0.581 0.292 0.584 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333339 1 34.91666666666666 0.0130014090011593 0.0292007684815911 0.445242015098191 -0.0161993594804317 0.0134780422831848 0.0298806676912786 NA NA 0.0352166708225999 0.645522520498946 280 129 591 0.591 0.28 0.56 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666671 1 34.91666666666666 0.0131150882907867 0.0292007684815911 0.449135038999222 -0.0160856801908044 0.0133235865691797 0.0304566355663066 NA NA 0.0348492426423569 0.644383223573784 273 106 621 0.621 0.273 0.546 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AACCAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333339 1 35.24999999999999 0.0131726767040263 0.0289192452027623 0.455498634617477 -0.015746568498736 0.0136443838522741 0.0291102016354501 NA NA 0.0353011565641355 0.655551151471731 287 122 591 0.591 0.287 0.574 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA:CAGGATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333339 1 34.49999999999999 0.0130438070339019 0.0295604764056575 0.44125834965926 -0.0165166693717556 0.0136101170556826 0.0314983499912429 NA NA 0.0321281985818217 0.607191597937523 254 120 626 0.626 0.254 0.508 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA:GATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000006 0 35.16666666666666 0.0132746828245506 0 -Inf 0.0132746828245506 0.0131879886450184 0 NA NA 0.0130462238215679 0.308910162371371 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333339 1 36.16666666666666 0.0270299523623976 0.0281723261817365 0.959450497201774 -0.00114237381933885 0.0185535368929488 0.0287105875322218 NA NA 0.0205681997276601 0.955707643752447 414 125 461 0.461 0.414 0.828 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT:GGACGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.16666666666671 1 35.99999999999999 0.0267288865855191 0.0283052459871353 0.944308577910515 -0.00157635940161626 0.0192066724672841 0.028638761761411 NA NA 0.021159739092823 0.940614088945392 360 143 497 0.497 0.36 0.72 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.16666666666671 1 35.66666666666666 0.0263763446044989 0.0285748846742028 0.923060404450601 -0.00219854006970388 0.0192107287842641 0.0308652304268611 NA NA 0.0202331228116699 0.913471818646852 357 144 499 0.499 0.357 0.714 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666671 1 35.66666666666666 0.0130722263514627 0.0285748846742028 0.457472584771768 -0.0155026583227401 0.0130930526102965 0.0295052144181104 NA NA 0.0165049663047702 0.347590936127267 0 352 648 0.648 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000004 1 35.83333333333332 0.0130155110198637 0.0284394261467203 0.45765730126607 -0.0154239151268566 0.0134443287936444 0.0293663410934347 NA NA 0.0160122369501832 0.335418071564418 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCACGGCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.16666666666671 1 35.16666666666666 0.0129035440872231 0.0289891158257094 0.445116855746922 -0.0160855717384863 0.0126824756781572 0.0279907491981372 NA NA 0.0167297828338024 0.33630426376853 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000004 1 35.83333333333332 0.0130155110198637 0.0284394261467203 0.45765730126607 -0.0154239151268566 0.0133023324011456 0.0291947204148908 NA NA 0.0162558816631321 0.34271187116104 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:CCAAAGCAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000004 1 35.83333333333332 0.0130155110198637 0.0284394261467203 0.45765730126607 -0.0154239151268566 0.013349580564554 0.0292001579459523 NA NA 0.0164094764911662 0.34724859463356 0 336 664 0.664 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAGCGC:AAGCAACGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333337 1 35.83333333333332 0.0132162010123647 0.0284394261467203 0.464714053799176 -0.0152232251343556 0.0129192013309424 0.0290854287955214 NA NA 0.0156084283626231 0.329401146598116 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 36.33333333333332 0.0133932130500048 0.0280406490537152 0.477635629059389 -0.0146474360037104 0.0135213398397116 0.0271280082870167 NA NA 0.0145278397932823 0.313342998805296 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 36.66666666666666 0.0134532755150005 0.0277809537602618 0.484262550202441 -0.0143276782452613 0.0137550615038923 0.0283186432081558 NA NA 0.0146668803573114 0.328632069672497 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 37.16666666666666 0.0134532755150005 0.027400307499342 0.490989946566241 -0.0139470319843415 0.0136786218451304 0.0273934816560982 NA NA 0.014697716450225 0.342658709983364 0 386 614 0.614 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333336 1 37.33333333333332 0.0135750312327134 0.0272757331281561 0.497696291752474 -0.0137007018954427 0.0142875049252106 0.0267263812093595 NA NA 0.0149155168775901 0.358329105077332 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.33333333333332 0.0136058153029875 0.0280406490537152 0.48521755958373 -0.0144348337507277 0.0145830004078064 0.0295749031334051 NA NA 0.015212655992453 0.342686705532296 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 36.33333333333332 0.0136058153029875 0.0280406490537152 0.48521755958373 -0.0144348337507277 0.0138677681465346 0.0288374956837568 NA NA 0.0147832975658065 0.328852141031492 0 395 605 0.605 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 35.99999999999999 0.0136058153029875 0.0283052459871353 0.480681754511914 -0.0146994306841478 0.0141419250298458 0.0290000791718127 NA NA 0.0161706688923432 0.363340572611892 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 35.99999999999999 0.0136058153029875 0.0283052459871353 0.480681754511914 -0.0146994306841478 0.0139616599651685 0.029610100803853 NA NA 0.0153163441526626 0.337195205664032 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000001 1 35.99999999999999 0.0137303605832671 0.0283052459871353 0.485081832163109 -0.0145748854038682 0.0136496133328707 0.0285483999341381 NA NA 0.0151752878708308 0.336836071569135 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666669 1 36.33333333333332 0.0137934922285677 0.0280406490537152 0.491910590305687 -0.0142471568251476 0.0135637253554757 0.0278827727917992 NA NA 0.0151073940041388 0.345650964426723 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666669 1 36.33333333333332 0.0137934922285677 0.0280406490537152 0.491910590305687 -0.0142471568251476 0.0142399563540162 0.0286016843634312 NA NA 0.0153164292521257 0.35227381705076 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 36.33333333333332 0.0136678042173386 0.0280406490537152 0.487428240022415 -0.0143728448363766 0.0144823891797139 0.0290366798743703 NA NA 0.0145956336598213 0.324753800692247 0 333 667 0.667 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000003 1 35.66666666666666 0.0137303605832671 0.0285748846742028 0.480504496861986 -0.0148445240909357 0.0143618750894324 0.0285922480975253 NA NA 0.0157451168215165 0.345782303528726 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.1666666666667 1 34.66666666666666 0.0137934922285677 0.029415534864961 0.468918627245433 -0.0156220426363933 0.0132638296158526 0.0294955339356251 NA NA 0.0157403047904135 0.320960180363338 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333337 1 34.16666666666666 0.0135750312327134 0.0298546878003148 0.454703506648972 -0.0162796565676014 0.014533725193183 0.029099227413891 NA NA 0.0167921426165187 0.332305452997445 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 33.49999999999999 0.0134532755150005 0.0304610393656427 0.441655169855254 -0.0170077638506422 0.0133589298922779 0.0311985407296834 NA NA 0.018377058722759 0.354711655257847 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 34.16666666666666 0.0134532755150005 0.0298546878003148 0.450625228606766 -0.0164014122853143 0.013077984064346 0.029645767970499 NA NA 0.0160054342628341 0.305485778289069 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 34.16666666666666 0.0134532755150005 0.0298546878003148 0.450625228606766 -0.0164014122853143 0.0142189074790497 0.0304196495717088 NA NA 0.0178267611883595 0.357549543296785 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAC:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.66666666666666 0.013333684515963 0.0303071537534075 0.439951723096525 -0.0169734692374445 0.013870192368483 0.0309796929790291 NA NA 0.0170452184691836 0.319351872506423 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 60 CAC AGC ACG 2 CAGCACGGC:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666671 1 32.99999999999999 0.0131582322381821 0.0309322189005369 0.425389212474303 -0.0177739866623547 0.013760175683756 0.0314678563103183 NA NA 0.0173370345721296 0.305267227766069 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 61 GGC ACG GCA 2 CACGGCAAG:CATGGCAAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 33.66666666666666 0.0133932130500048 0.0303071537534075 0.441915897447117 -0.0169139407034027 0.0143589675999534 0.0306859543908155 NA NA 0.0172996539774325 0.328220748262155 0 339 661 0.661 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 1 34.16666666666666 0.0133633824875953 0.0298546878003148 0.447614209767568 -0.0164913053127194 0.0140883742678312 0.0293437348205915 NA NA 0.0169880799035823 0.331669070430502 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666671 1 33.83333333333333 0.013423177093157 0.0301548153585304 0.445142075438369 -0.0167316382653734 0.0133906110878998 0.0305503730776256 NA NA 0.0183131144951718 0.360904768279116 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666671 1 33.66666666666666 0.0135138791270087 0.0303071537534075 0.445897336218492 -0.0167932746263988 0.0133068210261575 0.0320753692859048 NA NA 0.0174159585802699 0.334922427703397 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000004 1 33.83333333333333 0.0139215133950447 0.0301548153585304 0.4616680032533 -0.0162333019634857 0.01362480293257 0.0313915391078481 NA NA 0.0169969364435176 0.339541172080476 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666671 1 33.16666666666666 0.0139864193085547 0.0307735475083969 0.454494864615086 -0.0167871281998421 0.0146414998927224 0.0317133573091894 NA NA 0.017148587356212 0.327618556492545 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.33333333333333 0.0140519332931024 0.0306164958901914 0.458966086239941 -0.016564562597089 0.0145811331709707 0.0318627370523828 NA NA 0.0177768056387867 0.351435966291175 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000004 1 33.99999999999999 0.0143202441116848 0.0300040009602743 0.477277818069828 -0.0156837568485896 0.0142666870197408 0.0295582023204123 NA NA 0.0167965454959097 0.350433404484726 0 377 623 0.623 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000004 1 33.99999999999999 0.0143202441116848 0.0300040009602743 0.477277818069828 -0.0156837568485896 0.0149555844381619 0.0301437145107675 NA NA 0.0165376739893425 0.342943496854221 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666671 1 33.99999999999999 0.0140849209886972 0.0300040009602743 0.469434759962373 -0.0159190799715772 0.0146906005452622 0.0304338460940505 NA NA 0.0162550651514507 0.32741673872883 0 332 668 0.668 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666671 1 33.99999999999999 0.0140849209886972 0.0300040009602743 0.469434759962373 -0.0159190799715772 0.0138404583067502 0.0300782705737941 NA NA 0.0166641768262774 0.33943232243276 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 1 33.666666666666664 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.0147004583917852 0.0311113450337468 NA NA 0.0168018536329971 0.336276650092311 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 1 33.666666666666664 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.014172402140159 0.031787625159701 NA NA 0.0176563242729929 0.360184083486446 0 343 657 0.657 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.00000000000006 1 33 0.0140190997591144 0.0309322189005369 0.453219984127006 -0.0169131191414225 0.0142824626097476 0.031346409602177 NA NA 0.0176622347801092 0.338271264819367 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 1 33.666666666666664 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.0148378051222301 0.0314633392640488 NA NA 0.0177573711109279 0.362924005655912 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 34.33333333333333 0.0142861462280209 0.0297068535712844 0.480904051105241 -0.0154207073432635 0.0141709133436504 0.0311037236280476 NA NA 0.0148770758786591 0.299949564038335 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.66666666666671 1 34.666666666666664 0.0144932046198021 0.029415534864961 0.492705799379023 -0.0149223302451588 0.0149022694008288 0.0289698095478146 NA NA 0.0155342922437866 0.336750443142325 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.33333333333339 1 34.666666666666664 0.014354505158023 0.029415534864961 0.487990622095462 -0.0150610297069379 0.013997638209602 0.0305924289505477 NA NA 0.01580866893366 0.340738540757761 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.33333333333339 1 34.666666666666664 0.014354505158023 0.029415534864961 0.487990622095462 -0.0150610297069379 0.0154721755524699 0.030579946148748 NA NA 0.0159468555277365 0.344939036257685 0 326 674 0.674 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTA 2 AGTGGTAAA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.75000000000006 1 34.24999999999999 0.0288150685885083 0.0297805871963345 0.967578926450951 -9.65518607826239e-4 0.0192221527002953 0.030639889233016 NA NA 0.0202819916412411 0.962031267345038 396 137 467 0.467 0.396 0.792 N all ss13 81 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.41666666666673 1 33.58333333333333 0.0285408991973241 0.0303839016876759 0.939342797074038 -0.00184300249035182 0.0213617681793305 0.0320522334391403 NA NA 0.021960326914014 0.933116712287835 409 124 467 0.467 0.409 0.818 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.5833333333334 0 33.58333333333333 0.0141014729867999 0 -Inf 0.0141014729867999 0.0147543655711734 0 NA NA 0.0133340004258177 0.290257198637456 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.25000000000007 0 34.24999999999999 0.0143716972336231 0 -Inf 0.0143716972336231 0.0137993547658516 0 NA NA 0.0135840271335328 0.29006227139117 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.5833333333334 0 35.24999999999999 0.0145107307483395 0 -Inf 0.0145107307483395 0.0139500348160018 0 NA NA 0.0143061509772421 0.310439563630528 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.75000000000006 0 35.416666666666664 0.014688351957142 0 -Inf 0.014688351957142 0.0142580026567338 0 NA NA 0.0147824967329514 0.320402383277967 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.25000000000006 0 35.416666666666664 0.0147970274297308 0 -Inf 0.0147970274297308 0.0148098964604591 0 NA NA 0.0142123936751822 0.297812671052927 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.91666666666671 0 35.75 0.014870375605941 0 -Inf 0.014870375605941 0.01472853939268 0 NA NA 0.0149021771602361 0.318344350869514 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.25000000000004 0 36.08333333333333 0.0147970274297308 0 -Inf 0.0147970274297308 0.0150115813004859 0 NA NA 0.0148143579235912 0.317876975209222 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.75000000000004 0 35.58333333333333 0.014688351957142 0 -Inf 0.014688351957142 0.0148174015019933 0 NA NA 0.0139601720126085 0.292725577145787 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.41666666666671 0 35.416666666666664 0.0145459104801299 0 -Inf 0.0145459104801299 0.0141812531147203 0 NA NA 0.0151607579540223 0.337334712050168 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.75000000000004 0 35.58333333333333 0.0149073230681966 0 -Inf 0.0149073230681966 0.0144649409430704 0 NA NA 0.0137595978742649 0.278625281586556 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.08333333333339 0 34.916666666666664 0.0148336108437327 0 -Inf 0.0148336108437327 0.0149259819211557 0 NA NA 0.0148366010301107 0.317408051831936 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.25000000000006 0 34.74999999999999 0.0147970274297308 0 -Inf 0.0147970274297308 0.014918022149299 0 NA NA 0.0148909136829241 0.320371346386922 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.75000000000006 0 34.74999999999999 0.014688351957142 0 -Inf 0.014688351957142 0.0141088323106948 0 NA NA 0.0146296173283234 0.315371491779098 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.91666666666673 0 35.74999999999999 0.0146524806812088 0 -Inf 0.0146524806812088 0.0139936417696512 0 NA NA 0.0139868086334973 0.294826234311326 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.58333333333339 0 35.74999999999999 0.0145107307483395 0 -Inf 0.0145107307483395 0.014746196743434 0 NA NA 0.0142863868192111 0.309770679063562 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000004 0 36.24999999999999 0.0144757207777853 0 -Inf 0.0144757207777853 0.0141548517123097 0 NA NA 0.0141050075121253 0.304758496920481 668 332 0 0 0.668 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 0 36.58333333333332 0.0144408793426023 0 -Inf 0.0144408793426023 0.0140958989768144 0 NA NA 0.0137802234019631 0.294665180557137 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.58333333333339 0 35.91666666666666 0.0143031748474547 0 -Inf 0.0143031748474547 0.0137201600697368 0 NA NA 0.0147459803713422 0.332060896129425 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 0 35.91666666666666 0.0144408793426023 0 -Inf 0.0144408793426023 0.0137059120958539 0 NA NA 0.014216977116968 0.309748959477227 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 0 35.91666666666666 0.0144408793426023 0 -Inf 0.0144408793426023 0.0143079895282033 0 NA NA 0.0142076484242601 0.309431391195464 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 0 35.91666666666666 0.0144408793426023 0 -Inf 0.0144408793426023 0.0149684516813508 0 NA NA 0.0149838537943663 0.335164912760691 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.25000000000006 0 36.58333333333332 0.0143716972336231 0 -Inf 0.0143716972336231 0.0132874919959002 0 NA NA 0.0143036233522752 0.315012811735375 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.25000000000006 0 37.58333333333332 0.0143716972336231 0 -Inf 0.0143716972336231 0.0143795590752508 0 NA NA 0.0139295324382642 0.302192539703271 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333339 0 37.74999999999999 0.0144062052287003 0 -Inf 0.0144062052287003 0.014131122369359 0 NA NA 0.0143396776506259 0.315070515465158 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333339 0 38.41666666666666 0.0144062052287003 0 -Inf 0.0144062052287003 0.014424678817421 0 NA NA 0.0134154935813775 0.282890669659197 597 403 0 0 0.597 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333339 0 37.74999999999999 0.0144062052287003 0 -Inf 0.0144062052287003 0.0139227698947541 0 NA NA 0.0145588494884746 0.322411057321467 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333339 0 37.74999999999999 0.0144062052287003 0 -Inf 0.0144062052287003 0.0145715558329695 0 NA NA 0.014455646848144 0.318968528896293 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.66666666666671 0 38.24999999999999 0.0292720079293014 0 -Inf 0.0292720079293014 0.0206031024573739 0 NA NA 0.0209780253700896 0.162905720251445 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 68.00000000000004 0 38.91666666666666 0.0300040009602743 0 -Inf 0.0300040009602743 0.0207600023975669 0 NA NA 0.0216517371499586 0.16582175646297 876 124 0 0 0.876 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 68.50000000000004 0 37.91666666666666 0.0297805871963345 0 -Inf 0.0297805871963345 0.020533195477519 0 NA NA 0.0211133698917907 0.158389595351993 856 144 0 0 0.856 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 68.50000000000004 0 36.91666666666666 0.0297805871963345 0 -Inf 0.0297805871963345 0.0212158921678528 0 NA NA 0.0211360242061668 0.158836160170947 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.16666666666671 0 36.24999999999999 0.0294878275056261 0 -Inf 0.0294878275056261 0.0225295452221328 0 NA NA 0.0208887626241574 0.158050140772541 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 69.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0293435958691742 0 -Inf 0.0293435958691742 0.0206375419791457 0 NA NA 0.0206798015735495 0.155913714549743 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.16666666666671 0 36.24999999999999 0.0286430990492924 0 -Inf 0.0286430990492924 0.0211632434354672 0 NA NA 0.0197507899159722 0.146995648176859 880 120 0 0 0.88 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.66666666666671 0 36.74999999999999 0.0284394261467203 0 -Inf 0.0284394261467203 0.0193082555650908 0 NA NA 0.019036688366102 0.135194653727468 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.00000000000006 0 36.41666666666666 0.0283052459871352 0 -Inf 0.0283052459871352 0.0192346677702881 0 NA NA 0.0204187798900056 0.165674878649255 853 147 0 0 0.853 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666673 0 35.74999999999999 0.0280406490537152 0 -Inf 0.0280406490537152 0.0194426333099978 0 NA NA 0.0203550471837629 0.168333862119841 883 117 0 0 0.883 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000006 0 34.74999999999999 0.0275260251378209 0 -Inf 0.0275260251378209 0.0191070555378577 0 NA NA 0.0197359138483264 0.163101034622584 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333339 0 34.74999999999999 0.0277809537602618 0 -Inf 0.0277809537602618 0.0197376996883219 0 NA NA 0.0191520542494276 0.14690605830479 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666671 0 35.08333333333332 0.0276529018562458 0 -Inf 0.0276529018562458 0.0190190387824465 0 NA NA 0.0188304346287613 0.141962566461467 877 123 0 0 0.877 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333339 0 34.41666666666666 0.027400307499342 0 -Inf 0.027400307499342 0.0188163814301325 0 NA NA 0.0189740014628025 0.148711559797466 876 124 0 0 0.876 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333339 0 35.08333333333332 0.027400307499342 0 -Inf 0.027400307499342 0.020309266407809 0 NA NA 0.0184291562640425 0.137069964391083 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666671 0 35.74999999999999 0.0276529018562458 0 -Inf 0.0276529018562458 0.0194721697688336 0 NA NA 0.0194937806548832 0.156030262121462 881 119 0 0 0.881 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666671 0 35.74999999999999 0.0276529018562458 0 -Inf 0.0276529018562458 0.0199065532849942 0 NA NA 0.018961664086311 0.144741784321689 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.50000000000006 0 35.58333333333332 0.0273378783823658 0 -Inf 0.0273378783823658 0.0199122846663368 0 NA NA 0.018987886663421 0.149937119892103 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666671 0 34.66666666666666 0.0269995408952429 0 -Inf 0.0269995408952429 0.0189920420069468 0 NA NA 0.018967755416338 0.154607435311574 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAC 2 AACAAACAA:AACAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000004 0 34.33333333333333 0.0268785763539719 0 -Inf 0.0268785763539719 0.0188609334817194 0 NA NA 0.0189840711231496 0.156819746783304 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 129 CAA AAC AAG 2 AAACAAGGC:AAAGAAGGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000004 0 33.83333333333333 0.0268785763539719 0 -Inf 0.0268785763539719 0.0186231406166618 0 NA NA 0.0188999182431148 0.154981825359213 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 CAAGGCATC:GAAGGCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 0 33.91666666666666 0.0134532755150005 0 -Inf 0.0134532755150005 0.0139484975339585 0 NA NA 0.0134668949236503 0.317800177472266 608 392 0 0 0.608 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333337 0 34.58333333333333 0.0135750312327134 0 -Inf 0.0135750312327134 0.0139230380369849 0 NA NA 0.0143144257041003 0.342953238043789 604 396 0 0 0.604 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000004 0 34.58333333333333 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0135585797302833 0 NA NA 0.0125487549799601 0.280435727540981 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666671 0 34.58333333333333 0.013423177093157 0 -Inf 0.013423177093157 0.013428942157882 0 NA NA 0.0141807007907669 0.343852503519041 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333339 0 33.91666666666666 0.0134835092215562 0 -Inf 0.0134835092215562 0.0140872932382427 0 NA NA 0.0138686898422216 0.330937828351804 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000006 0 33.74999999999999 0.0134532755150005 0 -Inf 0.0134532755150005 0.0139918705968522 0 NA NA 0.0130426387716777 0.302313824709753 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666671 0 34.08333333333332 0.0135138791270087 0 -Inf 0.0135138791270087 0.0133523466329938 0 NA NA 0.0132906043287982 0.309248845430978 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333339 0 34.41666666666666 0.0135750312327134 0 -Inf 0.0135750312327134 0.0135488553348152 0 NA NA 0.013601596432798 0.318256614150502 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000006 0 34.08333333333333 0.0136367393123929 0 -Inf 0.0136367393123929 0.0140587620136935 0 NA NA 0.0139493017602867 0.328275676550881 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCC 2 GGAGCCCTG:GGAGCCTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 0 34.58333333333333 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0129859303550848 0 NA NA 0.0140844757503336 0.329630817608691 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 140 CTG CCC TGA 2 GCCCTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 0 34.58333333333333 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0140394325481496 0 NA NA 0.0140671765714223 0.329036415094833 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 CTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666673 0 34.24999999999999 0.013423177093157 0 -Inf 0.013423177093157 0.0135159880614669 0 NA NA 0.0143827998224855 0.350675502138672 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666673 0 35.24999999999999 0.013423177093157 0 -Inf 0.013423177093157 0.0132661162103355 0 NA NA 0.0130704974091811 0.304428524836579 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000006 0 35.41666666666666 0.0134532755150005 0 -Inf 0.0134532755150005 0.0135521157299768 0 NA NA 0.0132626265129002 0.310403893898127 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0137877522321382 0 NA NA 0.0146031706646139 0.353668933488503 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0142578467229111 0 NA NA 0.0141519748737927 0.338533509357418 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 36.24999999999999 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0142484646023985 0 NA NA 0.0141226362860827 0.324251473884013 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.3333333333334 0 35.91666666666666 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.0140942390660209 0 NA NA 0.0140189276865795 0.319560823825447 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000007 0 34.916666666666664 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.013467652258008 0 NA NA 0.0133205386499912 0.302650487021048 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 35.25 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0145017857843287 0 NA NA 0.0141745822785281 0.323777311311617 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.8333333333334 0 34.58333333333333 0.0138572071256798 0 -Inf 0.0138572071256798 0.0137158941552345 0 NA NA 0.0139258899200034 0.319703203572287 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0147307131626291 0 NA NA 0.01478771312773 0.346487433942794 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.8333333333334 0 34.91666666666666 0.0140519332931024 0 -Inf 0.0140519332931024 0.013265276486144 0 NA NA 0.0139849186888636 0.314997055637554 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0140953225639407 0 NA NA 0.0150048570807589 0.353511082161436 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0140374958794807 0 NA NA 0.0145649567252509 0.33916191724188 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 34.91666666666666 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0139349494843364 0 NA NA 0.0139430992514895 0.315809277499489 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0141180639342267 0 -Inf 0.0141180639342267 0.0145413329923831 0 NA NA 0.0143432882858457 0.324969219550183 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 34.91666666666666 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0153781977465413 0 NA NA 0.014021367967355 0.31851824899036 609 391 0 0 0.609 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATCGTG 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000006 0 34.58333333333333 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0133791363935204 0 NA NA 0.0136125992353692 0.306452902419964 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 35.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000006 0 36.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000006 0 37.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA:TTGCCAAAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000006 0 38.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC:CCAAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000006 0 38.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666671 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.66666666666671 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333337 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000004 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666671 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333337 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000004 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000006 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000006 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000007 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTAGACCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GACCGATTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTA GAT TAA 2 AGATTGAAC:CGATTAAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 35.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TAA ACC 2 TTAAACCAG:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666674 0 36.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666674 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000009 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000007 0 36.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.3333333333334 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 37.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666673 0 36.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.8333333333334 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666673 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.8333333333334 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.8333333333334 0 34.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCC:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666673 0 33.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCCAAA:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000006 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000004 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 32.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000003 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333336 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333336 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000003 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.4166666666667 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000003 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000003 0 31.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGGAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333337 0 31.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGGAGGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.9166666666667 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT:AGGCGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.9166666666667 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 32.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 32.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000004 0 31.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000004 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333337 0 32.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.4166666666667 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000003 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000003 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.9166666666667 0 31.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.9166666666667 0 31.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.58333333333337 0 31.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333337 0 30.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.4166666666667 0 29.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333337 0 29.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000004 0 30.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.4166666666667 0 29.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333337 0 30.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000003 0 30.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 29.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 29.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.58333333333337 0 29.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.58333333333337 0 29.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 30.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 30.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 29.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 28.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.91666666666671 0 27.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.91666666666671 0 28.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 28.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 29.416666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 29.416666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 29.416666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 29.416666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333339 0 29.416666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333339 0 28.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 27.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA:TTCTTTGGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333339 0 28.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG:TTTGGGATG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 27.416666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGGATGTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666673 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666673 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.75000000000007 0 29.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.41666666666674 0 30.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666674 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000007 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666674 0 30.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333341 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 31.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_FJ588686.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.25000000000006 2 34.49999999999999 0.0409658133601688 0.0603340239140544 0.678983609953224 -0.0193682105538856 0.0235483065292122 0.0456130623564391 NA NA 0.0513839790713587 0.706224941749302 380 4 616 0.616 0.38 0.76 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333339 2 34.666666666666664 0.0410592825874941 0.0600320307551523 0.683956249205681 -0.0189727481676582 0.0231505424064676 0.0466603512687966 NA NA 0.0539647433626038 0.725155716924218 350 3 647 0.647 0.35 0.7 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666671 2 34.666666666666664 0.0408727688266097 0.0600320307551523 0.680849345132336 -0.0191592619285426 0.0229726003728064 0.0472174921196566 NA NA 0.0503567659095417 0.703596219698698 349 3 648 0.648 0.349 0.698 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666671 2 34.99999999999999 0.0414374651394939 0.0594370287406054 0.697165824360685 -0.0179995636011115 0.0250311837543389 0.0439474033993872 NA NA 0.0512732429219253 0.725549496524504 364 6 630 0.63 0.364 0.728 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666671 2 35.99999999999999 0.0420179878270026 0.0577207808520962 0.727952519122524 -0.0157027930250936 0.0249100899199707 0.0428288344087527 NA NA 0.0510055359687986 0.758185451513847 401 2 597 0.597 0.401 0.802 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666671 2 35.99999999999999 0.0420179878270026 0.0577207808520962 0.727952519122524 -0.0157027930250936 0.0232018894746724 0.0412798377894535 NA NA 0.0504983037165947 0.755833431656461 382 7 611 0.611 0.382 0.764 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AGT:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.58333333333339 2 35.166666666666664 0.0419201068148284 0.0591439311842398 0.708781205027489 -0.0172238243694114 0.0238603707207465 0.0440973240657501 NA NA 0.0517731158386636 0.739376661873753 360 7 633 0.633 0.36 0.72 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AGTCAA:TCAAACCAA 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.58333333333339 2 36.166666666666664 0.0413422677171007 0.0574443341110379 0.719692696536225 -0.0161020663939372 0.0239215968293059 0.0413720578034796 NA NA 0.0512948486790052 0.753587907818234 392 7 601 0.601 0.392 0.784 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AGTCAACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000006 2 36.5 0.0274316291149154 0.0568993130810351 0.48210826510063 -0.0294676839661197 0.0198712389432886 0.043469829942351 NA NA 0.0462354241111608 0.523903418852798 254 19 727 0.727 0.254 0.508 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666671 2 35.83333333333333 0.0271830432683088 0.0579999025523778 0.468673947232251 -0.030816859284069 0.0202557941909748 0.0420496550403649 NA NA 0.0502750109924714 0.53989899362051 274 11 715 0.715 0.274 0.548 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000004 2 35.5 0.0270604324233619 0.0585663277285774 0.462047621438245 -0.0315058953052155 0.0192770885793155 0.0426932989330672 NA NA 0.0487144256404725 0.517795876327419 251 24 725 0.725 0.251 0.502 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333337 2 35.666666666666664 0.0271215992572094 0.0582817382454872 0.465353300599428 -0.0311601389882778 0.018696727481224 0.0419884279472095 NA NA 0.0470874649981744 0.508131332034226 241 18 741 0.741 0.241 0.482 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.9166666666667 2 35.5 0.0268184996810859 0.0585663277285774 0.457916702672137 -0.0317478280474915 0.0184269361666063 0.0458337988566653 NA NA 0.0503289522902714 0.528167081351266 266 14 720 0.72 0.266 0.532 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.08333333333337 2 35 0.0264053674769446 0.0594370287406054 0.444257864776227 -0.0330316612636608 0.0185371228543575 0.050476129911174 NA NA 0.0488334924533549 0.498777788145309 216 16 768 0.768 0.216 0.432 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.4166666666667 2 34.666666666666664 0.0262896575662818 0.0600320307551523 0.437927173803386 -0.0337423731888705 0.0182793868634055 0.0444681133925522 NA NA 0.0485296551884192 0.486871136709284 212 16 772 0.772 0.212 0.424 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.4166666666667 2 33.833333333333336 0.0259485340559256 0.0615730216404005 0.421427004305076 -0.0356244875844749 0.0181100971603826 0.0449355423211602 NA NA 0.0486153924919345 0.463691363275667 224 19 757 0.757 0.224 0.448 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333336 2 33.833333333333336 0.0257259947650973 0.0615730216404005 0.417812770588758 -0.0358470268753033 0.0181946833926922 0.0457501482337771 NA NA 0.0525946429817355 0.495509734840631 217 16 767 0.767 0.217 0.434 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000003 2 34.16666666666667 0.0260047718198447 0.0609472230590743 0.42667689378791 -0.0349424512392296 0.0188245461630068 0.0446619147387023 NA NA 0.049368351287749 0.479075351677284 223 16 761 0.761 0.223 0.446 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.58333333333336 2 34.333333333333336 0.0262321821040851 0.0606390724718212 0.432595371841729 -0.0344068903677361 0.018379261438895 0.043241722313818 NA NA 0.0532314148933555 0.518043404397187 230 9 761 0.761 0.23 0.46 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000003 2 33.66666666666667 0.0260047718198447 0.0618907677660026 0.420172066990086 -0.0358859959461579 0.0183262627856301 0.0439569338155918 NA NA 0.0507917489984104 0.479857360533892 232 8 760 0.76 0.232 0.464 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCGCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.9166666666667 2 34.666666666666664 0.0261179819037762 0.0600320307551523 0.435067439419157 -0.0339140488513761 0.0185423762054157 0.0448854184951527 NA NA 0.0501713331503638 0.499063074063952 239 19 742 0.742 0.239 0.478 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:GCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333336 1 34 0.0258925390301244 0.0300040009602743 0.862969544108681 -0.00411146193014997 0.0181992392147368 0.0318338883974607 NA NA 0.0360970644001506 0.90931692732427 449 41 510 0.51 0.449 0.898 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAAAT:GATTCAACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000003 1 34.666666666666664 0.0263473854682498 0.029415534864961 0.895696290725421 -0.00306814939671111 0.0187442373002583 0.032118255557766 NA NA 0.0379530662239354 0.935568703839777 445 48 507 0.507 0.445 0.89 N all ss13 25 AAT CAA ATG 2 TCAAATGAC:TCAACTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333337 1 34.333333333333336 0.0258925390301244 0.0297068535712844 0.871601530198842 -0.00381431454115999 0.0190362066929978 0.0317361227227817 NA NA 0.0368656548023441 0.917593720375892 431 52 517 0.517 0.431 0.862 N all ss13 26 GAC ATG ACA 2 AATGACAAT:ACTGACAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666671 1 34.166666666666664 0.0128620515547158 0.0298546878003148 0.43082184080251 -0.0169926362455989 0.0127131465446667 0.0313484594299314 NA NA 0.0340345452424014 0.617584864353794 261 147 592 0.592 0.261 0.522 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666671 1 34.666666666666664 0.0129453051997499 0.029415534864961 0.440083964448665 -0.016470229665211 0.0126888335066551 0.031349114621178203 NA NA 0.0358624590656011 0.646046733407525 270 124 606 0.606 0.27 0.54 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000004 1 34.666666666666664 0.0130580012294226 0.029415534864961 0.443915138356942 -0.0163575336355384 0.0132967968656165 0.0320118433545876 NA NA 0.0324321423649552 0.614007158149986 281 135 584 0.584 0.281 0.562 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AACCAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666671 1 35 0.0131150882907867 0.0291298749871979 0.450228100757402 -0.0160147866964113 0.0140831069421921 0.0304973766458122 NA NA 0.0326356924194097 0.623628840147279 265 127 608 0.608 0.265 0.53 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA:CAGGATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666671 1 34.25 0.0129873375085957 0.0297805871963345 0.436100786830497 -0.0167932496877388 0.0129330898058846 0.0309368166767565 NA NA 0.0348684818561205 0.630078127683634 259 148 593 0.593 0.259 0.518 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA:GATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333339 0 34.916666666666664 0.0132162010123647 0 -Inf 0.0132162010123647 0.0132800841662382 0 NA NA 0.0133861259683859 0.323492704085501 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666671 1 35.916666666666664 0.0269087157486763 0.0283721774047871 0.948419127822603 -0.00146346165611077 0.0192546109425374 0.0296064270301767 NA NA 0.0207460952754299 0.943762633124201 383 149 468 0.468 0.383 0.766 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT:GGACGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.50000000000004 1 35.75 0.0266103300115572 0.0285069944752381 0.933466698310534 -0.00189666446368097 0.0184853019769398 0.0305705827243898 NA NA 0.0207267503740559 0.927088911859348 370 127 503 0.503 0.37 0.74 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000004 1 35.416666666666664 0.0262608883838265 0.0287805096612113 0.912453903456041 -0.00251962127738475 0.0182860883018598 0.0294826935940798 NA NA 0.0217723221910593 0.90786978996873 383 135 482 0.482 0.383 0.766 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000004 1 35.416666666666664 0.0130155110198637 0.0287805096612113 0.452233514036941 -0.0157649986413476 0.0139344062986309 0.0290761150676607 NA NA 0.0161115764718451 0.327832581587877 0 392 608 0.608 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0129592857062641 0.0286430990492925 0.452440068861342 -0.0156838133430284 0.012748807017225 0.0299515024953764 NA NA 0.0160078224578889 0.327204933890675 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCACGGCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000004 1 34.916666666666664 0.0128482799476378 0.0292007684815911 0.439998007440717 -0.0163524885339533 0.0125311090048356 0.0292250249427562 NA NA 0.0166073009573379 0.32479277645165 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0129592857062641 0.0286430990492925 0.452440068861342 -0.0156838133430284 0.0133943120564397 0.028765857059405 NA NA 0.0166919335745408 0.347420545796102 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0129592857062641 0.0286430990492925 0.452440068861342 -0.0156838133430284 0.0134719697595724 0.0296181080439253 NA NA 0.0169612909943868 0.355130950509641 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.6666666666667 1 35.58333333333333 0.0131582322381821 0.0286430990492925 0.459385774407227 -0.0154848668111104 0.0135978812983243 0.0290312515549417 NA NA 0.0161615157663684 0.337996157853161 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA:CAGCGCCGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 36.08333333333333 0.013333684515963 0.0282386296527663 0.47217887977991 -0.0149049451368034 0.0134220415920742 0.0285645423082404 NA NA 0.0167844395187416 0.374529122936396 0 338 662 0.662 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGCCGGCCC 1:1 FALSE 1 1 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.416666666666664 0.0133932130500048 0.0279752710599065 0.478751859859534 -0.0145820580099017 0.0135667432537104 0.0292245941984892 NA NA 0.0152201441404365 0.338024330821336 0 352 648 0.648 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGGCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333336 1 36.83333333333333 0.0133932130500048 0.0276529018562458 0.484333004891485 -0.0142596888062409 0.0132042473602427 0.0283476094375661 NA NA 0.0142736888782065 0.317785405266129 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 36.666666666666664 0.0134532755150005 0.0277809537602618 0.484262550202441 -0.0143276782452613 0.0126192451983566 0.0308505987219181 NA NA 0.0156563993557542 0.360122130024391 0 347 653 0.653 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0134835092215562 0.0285748846742028 0.471865744176705 -0.0150913754526466 0.0140025866022045 0.0290211020365908 NA NA 0.0157572879029667 0.338194184086986 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0134835092215562 0.0285748846742028 0.471865744176705 -0.0150913754526466 0.0138613278355601 0.0301238931547619 NA NA 0.0153679476844263 0.326098218864173 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.33333333333333 0.0134835092215562 0.028849710620847 0.467370692162608 -0.0153662013992908 0.013779034803202 0.0291505262152151 NA NA 0.0153435924552208 0.316597940447441 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.33333333333333 0.0134835092215562 0.028849710620847 0.467370692162608 -0.0153662013992908 0.0139576101472715 0.0295960329400609 NA NA 0.0166252269670506 0.355345668258678 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 35.33333333333333 0.0136058153029875 0.028849710620847 0.471610113591776 -0.0152438953178595 0.0139231076330546 0.0270651757566739 NA NA 0.0157738231845749 0.333841762147478 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0136678042173386 0.0285748846742028 0.478315288868963 -0.0149070804568642 0.0136803184652874 0.0293416494409848 NA NA 0.0149954767213963 0.320171684165029 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0136678042173386 0.0285748846742028 0.478315288868963 -0.0149070804568642 0.0135231133686743 0.0286064388767155 NA NA 0.015692759958889 0.342145976689245 0 377 623 0.623 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000003 1 35.666666666666664 0.0135443861537981 0.0285748846742028 0.473996179100101 -0.0150304985204047 0.0139680201520728 0.0268789977505884 NA NA 0.015775239656151602 0.340696227302477 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.1666666666667 1 35 0.0136058153029875 0.0291298749871979 0.467074277145613 -0.0155240596842104 0.014282411409529 0.0289985936671106 NA NA 0.0153900278504669 0.313114211697086 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333337 1 34 0.0136678042173386 0.0300040009602743 0.455532721633857 -0.0163361967429357 0.0143318376216769 0.0305762837987626 NA NA 0.016180078611493 0.312663586827613 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 33.5 0.0134532755150005 0.0304610393656427 0.441655169855254 -0.0170077638506422 0.0129726662902388 0.0304360235064653 NA NA 0.0178355193801228 0.34029147724639 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 32.83333333333333 0.013333684515963 0.0310925352587596 0.428838768051457 -0.0177588507427966 0.0137861570790312 0.0320213750857745 NA NA 0.0183954219265382 0.334346939776788 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.5 0.013333684515963 0.0304610393656427 0.437729138389222 -0.0171273548496797 0.0137239122383422 0.0318534182150955 NA NA 0.0173739329582903 0.324227544152707 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.5 0.013333684515963 0.0304610393656427 0.437729138389222 -0.0171273548496797 0.0135880080484084 0.0309925775573334 NA NA 0.0186626554671881 0.358758103696047 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333337 1 33 0.0132162010123647 0.0309322189005369 0.427263270535542 -0.0177160178881722 0.0138367662970424 0.0318396744238736 NA NA 0.0182965780943652 0.332909810288388 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333337 1 32.33333333333333 0.0130438070339019 0.0315836140125951 0.412992858534182 -0.0185398069786932 0.0131446121153101 0.0334663161095422 NA NA 0.0200276516054538 0.35459646013979 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAA:CATGGCAAG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000004 1 33 0.0132746828245506 0.0309322189005369 0.429153914474602 -0.0176575360759862 0.0141298626230015 0.0311213671048527 NA NA 0.0180990529703372 0.329259985526801 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 62 AAA GCA AAG 2 GGCAAAGAG:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0133041182530361 0.0301548153585304 0.441193822441118 -0.0168506971054942 0.014102530225741 0.0313771666232217 NA NA 0.0171500054198931 0.325830132175043 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 63 GAG AAG AGG 2 AAAGAGGAA:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 33.66666666666666 0.0133932130500048 0.0303071537534075 0.441915897447117 -0.0169139407034027 0.013375497797926 0.0310243032600091 NA NA 0.0171689554530349 0.324551991484434 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 33.49999999999999 0.0134835092215562 0.0304610393656427 0.442647706787196 -0.0169775301440864 0.0135910219640066 0.0327967908750022 NA NA 0.0175346155486545 0.332929819166318 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666671 1 33.66666666666666 0.0138892858254281 0.0303071537534075 0.458284071755387 -0.0164178679279794 0.0144745279870451 0.0306914071160042 NA NA 0.0172195577455014 0.340365630073738 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333337 1 32.99999999999999 0.0139538908732759 0.0309322189005369 0.451111862299464 -0.016978328027261 0.0140626668800205 0.0317271033304373 NA NA 0.0189762462013145 0.37093957346428 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.00000000000004 1 33.16666666666666 0.0140190997591144 0.0307735475083969 0.45555683027084 -0.0167544477492825 0.0138291738668647 0.0313570494712584 NA NA 0.0167590371497609 0.317443051588688 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.0137678937572218 0.0295687673425156 NA NA 0.0167139128827627 0.342402602528887 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.0142316369687 0.0312434317562866 NA NA 0.017022592403833 0.351226846988277 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0138089957326058 0.0309327144803428 NA NA 0.0168952857941404 0.340539850682252 0 377 623 0.623 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0140303885913671 0.03131877483507 NA NA 0.0165294390609937 0.32996017191487 0 335 665 0.665 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0133925205911959 0.0307516711778258 NA NA 0.0175393029862741 0.351444229535287 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0138693461020414 0.0320529493592337 NA NA 0.0165852705236231 0.324432074647154 0 347 653 0.653 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666671 1 32.83333333333333 0.0139864193085547 0.0310925352587596 0.449832063939346 -0.0171061159502049 0.0133415368995942 0.0324001012217648 NA NA 0.0172176297809792 0.320455013017651 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0136901193564247 0.0310164111260875 NA NA 0.0174148117884514 0.348011864376679 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333337 1 33.666666666666664 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.0146614011958877 0.0286792297873251 NA NA 0.0168434235500897 0.337470600248499 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.33333333333337 1 33.99999999999999 0.014354505158023 0.0300040009602743 0.478419700660208 -0.0156494958022513 0.0153651120092484 0.0290797184047906 NA NA 0.0157554756007922 0.320576706400078 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000004 1 33.99999999999999 0.0142184353084605 0.0300040009602743 0.473884643827532 -0.0157855656518138 0.0138991450732048 0.030242464165245 NA NA 0.0170562468731656 0.354705604147832 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.25000000000004 1 33.74999999999999 0.0141680718521655 0.0302307926160697 0.468663591858134 -0.0160627207639041 0.0139444620724555 0.0301182372807343 NA NA 0.0166181217130029 0.333754738522625 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTA 2 AGTGGTAAA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.41666666666671 1 33.58333333333333 0.0141346939686238 0.0303839016876759 0.465203386777578 -0.0162492077190521 0.0146064899338193 0.0312578718349125 NA NA 0.0164800681062355 0.324137264700977 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 81 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333339 1 32.91666666666666 0.014002740465399 0.0310121698640216 0.451524047714059 -0.0170094293986226 0.0146262060148945 0.0324983150698812 NA NA 0.0176575597261331 0.335399774477796 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 32.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666673 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666671 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666671 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333337 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666671 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666671 0 34.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333337 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.41666666666671 0 34.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000004 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.08333333333337 0 33.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333337 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000004 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333337 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333337 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333337 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.25000000000003 0 37.666666666666664 0.0143716972336231 0 -Inf 0.0143716972336231 0.0146301817154342 0 NA NA 0.0146583509311327 0.326866830760942 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.58333333333336 0 38.33333333333333 0.0147243993053407 0 -Inf 0.0147243993053407 0.0150724896279384 0 NA NA 0.0149283285323302 0.323966568723731 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.08333333333336 0 37.33333333333333 0.0146167841906133 0 -Inf 0.0146167841906133 0.0147612780169872 0 NA NA 0.0149304885700255 0.32758541082902 663 337 0 0 0.663 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.9166666666667 0 36.49999999999999 0.0146524806812088 0 -Inf 0.0146524806812088 0.0149838335464974 0 NA NA 0.0146164836696077 0.316120139843505 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.58333333333337 0 35.83333333333333 0.0145107307483395 0 -Inf 0.0145107307483395 0.0145126917819711 0 NA NA 0.0140635180358569 0.302166057871796 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 0 35.49999999999999 0.0144408793426023 0 -Inf 0.0144408793426023 0.0144124563533516 0 NA NA 0.0153134616972371 0.345671384784542 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.58333333333339 0 35.83333333333333 0.0141014729867999 0 -Inf 0.0141014729867999 0.0148255214091982 0 NA NA 0.0142593870889719 0.322699542432922 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333339 0 36.33333333333333 0.014002740465399 0 -Inf 0.014002740465399 0.0148350177468847 0 NA NA 0.0145367978615385 0.335416213899793 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.41666666666673 0 35.99999999999999 0.0139376833302847 0 -Inf 0.0139376833302847 0.0145511693891365 0 NA NA 0.0140704008787042 0.321896761542788 608 392 0 0 0.608 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.0833333333334 0 35.33333333333333 0.0138093659583391 0 -Inf 0.0138093659583391 0.0131506184286798 0 NA NA 0.0146952870489436 0.347364317435367 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666673 0 34.33333333333333 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0142701655735782 0 NA NA 0.01355423175147 0.317115616141121 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.75000000000006 0 34.33333333333333 0.0136833898069031 0 -Inf 0.0136833898069031 0.0146054842028478 0 NA NA 0.0133305854918284 0.304672086615595 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 0 34.49999999999999 0.0135904058348962 0 -Inf 0.0135904058348962 0.0139283130169438 0 NA NA 0.0143749421804776 0.344442791535977 666 334 0 0 0.666 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666673 0 33.83333333333333 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0141033984623149 0 NA NA 0.0134447250843398 0.316459965982837 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666673 0 34.49999999999999 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0137699854646641 0 NA NA 0.0136550899545452 0.323972980213894 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 0 35.16666666666666 0.0135904058348962 0 -Inf 0.0135904058348962 0.0146086813421829 0 NA NA 0.0140684705752171 0.334034817483461 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGCGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 0 35.16666666666666 0.0135904058348962 0 -Inf 0.0135904058348962 0.0141002330084347 0 NA NA 0.0131667348172073 0.301989029996231 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGCGCTAAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333339 0 35.49999999999999 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0137745718084766 0 NA NA 0.0136180120619773 0.320479926037804 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA:GCTAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 0 34.58333333333333 0.0133633824875953 0 -Inf 0.0133633824875953 0.0131237321594525 0 NA NA 0.0136634735971 0.328056033364192 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AATAAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 0 34.25 0.0133041182530361 0 -Inf 0.0133041182530361 0.013778705633167 0 NA NA 0.0122388889192649 0.27702070517615 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 0 34 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0137329745771926 0 NA NA 0.0142916421414265 0.350299445465266 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 33.83333333333333 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0141979933658549 0 NA NA 0.0134345880929093 0.317180076715093 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666671 0 34.5 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0139245449435965 0 NA NA 0.0141021331980867 0.336283352445217 663 337 0 0 0.663 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 0 34.5 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0134545360604059 0 NA NA 0.0139217314318113 0.331150883768606 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 0 34.5 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0133731328535048 0 NA NA 0.0138978308047011 0.334661174960778 613 387 0 0 0.613 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666671 0 33.83333333333333 0.0271830432683088 0 -Inf 0.0271830432683088 0.0193858298647574 0 NA NA 0.0193948533655982 0.161046792953925 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333339 0 33.66666666666666 0.0271215992572094 0 -Inf 0.0271215992572094 0.0191546072298164 0 NA NA 0.0192421803227611 0.158691272533008 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333339 0 33.66666666666666 0.0271215992572094 0 -Inf 0.0271215992572094 0.0191740495874822 0 NA NA 0.0190926792978075 0.155455337584142 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000006 0 33.99999999999999 0.0272447663451876 0 -Inf 0.0272447663451876 0.0197028583424513 0 NA NA 0.0197894990652149 0.168596219789577 855 145 0 0 0.855 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666673 0 33.666666666666664 0.0273690573365762 0 -Inf 0.0273690573365762 0.0194193262170332 0 NA NA 0.0199058518558175 0.169154635846246 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.91666666666673 0 34.166666666666664 0.0275576350296145 0 -Inf 0.0275576350296145 0.0198266570487362 0 NA NA 0.0191017239712452 0.149111227528819 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.91666666666673 0 34.166666666666664 0.0275576350296145 0 -Inf 0.0275576350296145 0.0196942387206357 0 NA NA 0.0198247616700033 0.164510247604028 852 148 0 0 0.852 0.001 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.5833333333334 0 33.83333333333333 0.0269389228181416 0 -Inf 0.0269389228181416 0.019519187790703 0 NA NA 0.0183888868033148 0.142932733328973 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.5833333333334 0 34.83333333333333 0.0269389228181416 0 -Inf 0.0269389228181416 0.0197482406720348 0 NA NA 0.0193018480398454 0.162815257062059 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 0 35.166666666666664 0.0270604324233619 0 -Inf 0.0270604324233619 0.0200301020601033 0 NA NA 0.0195965924704194 0.167317589471359 892 108 0 0 0.892 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.8333333333334 0 35.58333333333333 0.0272138698048233 0 -Inf 0.0272138698048233 0.0189378928966492 0 NA NA 0.0195277256642068 0.163437943941471 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.8333333333334 0 35.58333333333333 0.0272138698048233 0 -Inf 0.0272138698048233 0.019765683905268 0 NA NA 0.0204091460684973 0.182395519214822 876 124 0 0 0.876 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.8333333333334 0 35.916666666666664 0.0279752710599065 0 -Inf 0.0279752710599065 0.0199693618891288 0 NA NA 0.0191243628282447 0.143519921709047 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666674 0 35.5 0.0424641704996309 0 -Inf 0.0424641704996309 0.0241817632091515 0 NA NA 0.024818248341248 0.0870800150505461 958 42 0 0 0.958 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.8333333333334 0 34.5 0.0417741375922484 0 -Inf 0.0417741375922484 0.0249558774115312 0 NA NA 0.0233109087212038 0.0731261690386571 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.50000000000006 0 34.833333333333336 0.0425646124443371 0 -Inf 0.0425646124443371 0.0247185598479189 0 NA NA 0.0245377444340537 0.0828012714016148 959 41 0 0 0.959 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAC:ACCCGCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.16666666666673 0 34.166666666666664 0.0421656696333547 0 -Inf 0.0421656696333547 0.0254010308204898 0 NA NA 0.0242449456726768 0.0820078568023871 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 151 AAC GCA ACC 2 CGCAACCCT:CGCAATCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.8333333333334 0 34.5 0.042364201600918 0 -Inf 0.042364201600918 0.0257706189189482 0 NA NA 0.0246060009522571 0.0851235108113238 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 152 CCT ACC CTA 2 AACCCTAAT:AATCCTAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.16666666666673 0 34.5 0.0427669289697661 0 -Inf 0.0427669289697661 0.0252925412676361 0 NA NA 0.0254359125182411 0.0926929864502481 950 50 0 0 0.95 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000007 0 34.33333333333333 0.0422647024133488 0 -Inf 0.0422647024133488 0.0239406915454678 0 NA NA 0.0238440269292071 0.0763034945540926 959 41 0 0 0.959 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000007 0 34.33333333333333 0.0422647024133488 0 -Inf 0.0422647024133488 0.0240310472419867 0 NA NA 0.0248146400652462 0.088527574946067 950 50 0 0 0.95 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666673 0 34.33333333333333 0.042464170499631 0 -Inf 0.042464170499631 0.0250619207921985 0 NA NA 0.0241211155487665 0.0783304660310121 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000007 0 34.33333333333333 0.0428688103799614 0 -Inf 0.0428688103799614 0.0243385972443134 0 NA NA 0.0248521439302948 0.0845357243143811 946 54 0 0 0.946 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666673 0 34.33333333333333 0.0571705240409131 0 -Inf 0.0571705240409131 0.0289456095019737 0 NA NA 0.0277967441243831 0.0397117667552153 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATCGTG 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 0 34.16666666666666 0.0570345959917882 0 -Inf 0.0570345959917882 0.0278244534008632 0 NA NA 0.028060966449624 0.0421006070264114 990 10 0 0 0.99 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 0 34.49999999999999 0.0427161696956043 0 -Inf 0.0427161696956043 0.0247645305990605 0 NA NA 0.0244021669408692 0.0800308274087933 950 50 0 0 0.95 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 0 34.49999999999999 0.0427161696956043 0 -Inf 0.0427161696956043 0.0239677719072686 0 NA NA 0.0240987763708654 0.0763041038899542 953 47 0 0 0.953 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.75000000000006 0 34.99999999999999 0.0430225461599401 0 -Inf 0.0430225461599401 0.0246494110273636 0 NA NA 0.0251785465306593 0.0875068012914542 945 55 0 0 0.945 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.16666666666666 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.0266961565313707 0 NA NA 0.028280950685108 0.0434753146617046 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.16666666666666 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.027906929271845 0 NA NA 0.0273572396231233 0.0368619731115831 991 9 0 0 0.991 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.83333333333332 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.0274625130047709 0 NA NA 0.0275767307631651 0.0383890691455954 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333339 0 35.83333333333332 0.05765141989764 0 -Inf 0.05765141989764 0.0287591879265114 0 NA NA 0.0288693043032545 0.0458273684917785 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25000000000006 0 35.66666666666666 0.0575131971253351 0 -Inf 0.0575131971253351 0.0283027526821634 0 NA NA 0.0277267348533264 0.0380526929942834 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.58333333333339 0 36.33333333333332 0.0580701054974425 0 -Inf 0.0580701054974425 0.028969462882756 0 NA NA 0.02791628504207 0.0375116283377205 988 12 0 0 0.988 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.58333333333339 0 36.99999999999999 0.0580701054974425 0 -Inf 0.0580701054974425 0.0273098361912224 0 NA NA 0.0268808657496371 0.0307512626664173 988 12 0 0 0.988 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.58333333333339 0 37.66666666666666 0.0589259989959384 0 -Inf 0.0589259989959384 0.0299138854656077 0 NA NA 0.0292415321612251 0.0438892016394948 977 23 0 0 0.977 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.08333333333339 0 38.16666666666666 0.0593634822039754 0 -Inf 0.0593634822039754 0.0296443387526494 0 NA NA 0.0286388206545038 0.038187857709945 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.91666666666671 0 38.66666666666666 0.0604099978044257 0 -Inf 0.0604099978044257 0.029715000683284 0 NA NA 0.0295081152993642 0.0406351781816695 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.25000000000006 0 39.33333333333333 0.0610247509530335 0 -Inf 0.0610247509530335 0.0294024129978773 0 NA NA 0.0293223071758335 0.0374182082551753 987 13 0 0 0.987 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.58333333333339 0 38.99999999999999 0.0616521517369467 0 -Inf 0.0616521517369467 0.0286638333177457 0 NA NA 0.029025429127617 0.0336639781473592 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.25000000000006 0 37.99999999999999 0.0610247509530335 0 -Inf 0.0610247509530335 0.0289344209650823 0 NA NA 0.0301802981376334 0.0431757079241899 976 24 0 0 0.976 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.75000000000006 0 36.99999999999999 0.0605625213547463 0 -Inf 0.0605625213547463 0.030082035745928 0 NA NA 0.0295851243209868 0.0406522045133621 984 16 0 0 0.984 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.41666666666671 0 36.16666666666666 0.0618110240091991 0 -Inf 0.0618110240091991 0.0298478386092212 0 NA NA 0.0294087322890039 0.0355715426925667 984 16 0 0 0.984 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.50000000000006 0 35.74999999999999 0.0617314855970426 0 -Inf 0.0617314855970426 0.0298067379006667 0 NA NA 0.0310727712549575 0.0469584676400187 984 16 0 0 0.984 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGCAGAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.16666666666673 0 35.58333333333333 0.0620508745044358 0 -Inf 0.0620508745044358 0.0301767909142151 0 NA NA 0.0307379968010873 0.043518138104944 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC:AGAGGTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.16666666666673 0 35.08333333333333 0.0630291953285241 0 -Inf 0.0630291953285241 0.0302511681720483 0 NA NA 0.0290318288630199 0.0299283217404951 987 13 0 0 0.987 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT:GGTGGCAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.16666666666673 0 34.74999999999999 0.0630291953285241 0 -Inf 0.0630291953285241 0.0287553095923743 0 NA NA 0.0305886108161299 0.0393465114321466 987 13 0 0 0.987 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.0833333333334 0 34.49999999999999 0.0621312390918573 0 -Inf 0.0621312390918573 0.030424552977607 0 NA NA 0.0302737547718228 0.0401391936937996 979 21 0 0 0.979 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.75000000000006 0 34.16666666666666 0.0624547911592669 0 -Inf 0.0624547911592669 0.0297760524215994 0 NA NA 0.0300112975622806 0.0374299995131883 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAATCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.75000000000006 0 34.16666666666666 0.0624547911592669 0 -Inf 0.0624547911592669 0.0290446743385724 0 NA NA 0.0298387687740117 0.0363424294725507 979 21 0 0 0.979 0.001 N all ss13 184 TCA CCT CAT 2 GCCTCTTCT:TCTTCATCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 67.41666666666671 0 34.16666666666666 0.0458741693976044 0 -Inf 0.0458741693976044 0.0256734234698671 0 NA NA 0.0254941698782666 0.0719556768640013 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 185 TCT CAT CTC 2 TCATCTCGC:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.08333333333339 0 34.16666666666666 0.0454110940157691 0 -Inf 0.0454110940157691 0.0253980538473181 0 NA NA 0.0255498377282762 0.0755100931131084 940 60 0 0 0.94 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.41666666666673 0 33.83333333333333 0.0451830456487546 0 -Inf 0.0451830456487546 0.0254537324607929 0 NA NA 0.0257994674762368 0.0798913232409578 948 52 0 0 0.948 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000006 0 33.49999999999999 0.0449572769752751 0 -Inf 0.0449572769752751 0.0245418145195912 0 NA NA 0.0247440667879025 0.0692337757924909 955 45 0 0 0.955 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000006 0 33.49999999999999 0.0449572769752751 0 -Inf 0.0449572769752751 0.0249644489066987 0 NA NA 0.0256684242713679 0.0798663126770056 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 33.49999999999999 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.0244655286788573 0 NA NA 0.0242711805126881 0.0666595095095496 965 35 0 0 0.965 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 33.49999999999999 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.0248061714581833 0 NA NA 0.0253386157212824 0.0789683043578755 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 34.16666666666666 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.024418428973977 0 NA NA 0.0249015863903665 0.0738511508611227 960 40 0 0 0.96 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.41666666666673 0 33.16666666666666 0.0438614614252191 0 -Inf 0.0438614614252191 0.0247641013888667 0 NA NA 0.0236979752164834 0.0641907469867214 961 39 0 0 0.961 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.0833333333334 0 32.16666666666666 0.0428178090539073 0 -Inf 0.0428178090539073 0.0232524792071069 0 NA NA 0.0237886840804891 0.0718727347402663 954 46 0 0 0.954 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000007 0 31.333333333333325 0.0566975883332356 0 -Inf 0.0566975883332356 0.0273320200320622 0 NA NA 0.0279041512644874 0.0421668890839395 977 23 0 0 0.977 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAACA:AATTCAAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000007 0 30.66666666666666 0.0566975883332356 0 -Inf 0.0566975883332356 0.0274210585554739 0 NA NA 0.0274652267570995 0.0389854146345487 973 27 0 0 0.973 0.001 N all ss13 196 ACA CAA CAA 2 TCAACAAAT:TCAAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.5833333333334 0 30.999999999999993 0.0556454425645553 0 -Inf 0.0556454425645553 0.0263308069346711 0 NA NA 0.026284654105266 0.0342571684848828 990 10 0 0 0.99 0.001 N all ss13 197 AAT CAA ATT 2 ACAAATTCA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666673 0 31.083333333333325 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0221434958351627 0 NA NA 0.0230047543080169 0.071662447634736 948 52 0 0 0.948 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 0 31.749999999999993 0.042215127927666 0 -Inf 0.042215127927666 0.0229579961976129 0 NA NA 0.023188681736169 0.0686820247422324 957 43 0 0 0.957 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666674 0 32.41666666666666 0.0420179878270026 0 -Inf 0.0420179878270026 0.0227639379175558 0 NA NA 0.0226330004203089 0.063383439544691 963 37 0 0 0.963 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666674 0 33.58333333333332 0.0423143935004423 0 -Inf 0.0423143935004423 0.0233373830536745 0 NA NA 0.0225186388712883 0.0602331487814838 950 50 0 0 0.95 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666674 0 32.74999999999999 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0240131748725865 0 NA NA 0.0219797429068893 0.0593951426295338 951 49 0 0 0.951 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000007 0 32.41666666666666 0.0412475068105866 0 -Inf 0.0412475068105866 0.0231001020597395 0 NA NA 0.022305005035649 0.0644218756102247 959 41 0 0 0.959 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000007 0 32.74999999999999 0.0418226808888406 0 -Inf 0.0418226808888406 0.0232007557130969 0 NA NA 0.0240490129849776 0.0820241776640787 945 55 0 0 0.945 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000007 0 33.08333333333332 0.0424141271286908 0 -Inf 0.0424141271286908 0.0224969703151935 0 NA NA 0.0232177181912368 0.0677298488970053 943 57 0 0 0.943 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666673 0 33.749999999999986 0.0426150118597228 0 -Inf 0.0426150118597228 0.0238411954186558 0 NA NA 0.0231104997665516 0.0651878680254588 957 43 0 0 0.957 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAAGTTCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 0 33.083333333333314 0.042215127927666 0 -Inf 0.042215127927666 0.024503917419561 0 NA NA 0.0229415452702527 0.0657510589684734 955 45 0 0 0.955 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:AGTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.25000000000007 0 33.249999999999986 0.0282054389472648 0 -Inf 0.0282054389472648 0.019775004538188 0 NA NA 0.0189868553142643 0.137404935504981 895 105 0 0 0.895 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000007 0 33.66666666666665 0.0281063333749098 0 -Inf 0.0281063333749098 0.0197958692451054 0 NA NA 0.0187596686139275 0.134073018273449 886 114 0 0 0.886 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000007 0 32.83333333333332 0.0275260251378209 0 -Inf 0.0275260251378209 0.0189111451205306 0 NA NA 0.0197110179025303 0.162570260890547 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG:GCTCGATTG 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666674 0 32.16666666666665 0.0272757331281561 0 -Inf 0.0272757331281561 0.0193088151948381 0 NA NA 0.0187533530438264 0.145822785973407 846 154 0 0 0.846 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT:CGATTGGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666674 0 32.66666666666665 0.0272757331281561 0 -Inf 0.0272757331281561 0.0182900718557622 0 NA NA 0.0180269374827422 0.130265896834813 876 124 0 0 0.876 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:TTGGCTAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666674 0 33.499999999999986 0.0136990109829699 0 -Inf 0.0136990109829699 0.0132964557734254 0 NA NA 0.0133918270957447 0.306337084964506 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666674 0 33.66666666666665 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0136526587466755 0 NA NA 0.0138034380042111 0.324288654346074 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666674 0 32.999999999999986 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0132027807109223 0 NA NA 0.0135873993211431 0.316655031636859 593 407 0 0 0.593 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.8333333333334 0 33.333333333333314 0.0136678042173386 0 -Inf 0.0136678042173386 0.0132364948663676 0 NA NA 0.0135725618057403 0.313926472233186 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000007 0 34.16666666666665 0.0138252762666285 0 -Inf 0.0138252762666285 0.0133506427827733 0 NA NA 0.013899016159805 0.319884823459414 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.8333333333334 0 34.33333333333332 0.0138572071256798 0 -Inf 0.0138572071256798 0.0137374307440905 0 NA NA 0.0138653061141405 0.317593269807553 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.0833333333334 0 34.08333333333332 0.0138093659583391 0 -Inf 0.0138093659583391 0.0138000587671144 0 NA NA 0.0138018675383836 0.317047658617045 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666674 0 33.41666666666666 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0131845460638662 0 NA NA 0.0134827173105025 0.314555528500798 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333341 0 32.749999999999986 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.013371126942816 0 NA NA 0.0136757944541299 0.325790886205194 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0143575914143286 0 NA NA 0.0135937597117318 0.327195050317212 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0134313627821851 0 NA NA 0.0132673654616827 0.315434926763185 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 33.08333333333332 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0135725242416222 0 NA NA 0.0135462605228987 0.325501690614005 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 34.08333333333332 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0131979831537819 0 NA NA 0.0133009425306108 0.316658130311471 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666676 0 34.41666666666666 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.013465784952152 0 NA NA 0.0132497478946855 0.315864972503965 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.08333333333332 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.01320641055068 0 NA NA 0.0130044691216989 0.315322492464747 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.41666666666666 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0131955337861571 0 NA NA 0.0127303930302039 0.305016825450395 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:AGATTGAAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.41666666666666 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0131855584676062 0 NA NA 0.0139623636772397 0.349670524731604 609 391 0 0 0.609 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG:TTGAATCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000009 0 35.749999999999986 0.012889683529058 0 -Inf 0.012889683529058 0.0127633162476128 0 NA NA 0.0132629392107331 0.331121573654294 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT:AATCAGCTT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333341 0 36.749999999999986 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.013088623789308 0 NA NA 0.013143758590218 0.322580073555206 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666674 0 36.999999999999986 0.0131582322381821 0 -Inf 0.0131582322381821 0.0130108365771684 0 NA NA 0.0128808047558068 0.306999588905968 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000009 0 36.83333333333332 0.0130155110198637 0 -Inf 0.0130155110198637 0.0128681047889275 0 NA NA 0.012777166461274 0.308367284364554 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000009 0 35.83333333333332 0.0128482799476378 0 -Inf 0.0128482799476378 0.0123568141712212 0 NA NA 0.0129650478758809 0.321688687338881 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333343 0 35.83333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0128721895307245 0 NA NA 0.0125971150073118 0.303597031827035 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333343 0 35.83333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.013092099809491 0 NA NA 0.012863751346421 0.31372979808595 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666676 0 35.999999999999986 0.0129873375085957 0 -Inf 0.0129873375085957 0.0125774855120531 0 NA NA 0.0124072492464627 0.295213061145331 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666676 0 35.66666666666665 0.0128208250194751 0 -Inf 0.0128208250194751 0.0126660652984885 0 NA NA 0.0126973553006095 0.312627516677422 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666676 0 35.66666666666665 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0133679492778074 0 NA NA 0.0128673019111735 0.322153953201413 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.33333333333332 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0127032778993771 0 NA NA 0.0123871297658933 0.301695253300787 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.999999999999986 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0128191209203787 0 NA NA 0.0131416476641124 0.330301338056325 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.999999999999986 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.012495539867227 0 NA NA 0.0124690955008251 0.304884205300248 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA:CAACAACCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666674 0 36.41666666666666 0.0259485340559255 0 -Inf 0.0259485340559255 0.017978308424039 0 NA NA 0.0178683542728906 0.146444291775445 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC:CAACCAGGC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333341 0 36.749999999999986 0.0267586909940917 0 -Inf 0.0267586909940917 0.0185831764543795 0 NA NA 0.0193681265249525 0.167099512707848 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA:CCAGGCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666674 0 36.58333333333332 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.013492488936516 0 NA NA 0.0130236147001216 0.3010658917699 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACC:GGCCAAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666674 0 36.749999999999986 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0128182239545615 0 NA NA 0.0138248920466133 0.329951299465438 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 246 ACC AAA CCG 2 CAAACCGTC:CAAACTGTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 35.749999999999986 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0131874439248244 0 NA NA 0.0130659770250231 0.309106624570093 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 247 GTC CCG TCA 2 ACCGTCACT:ACTGTCACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 35.749999999999986 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.012909809483068 0 NA NA 0.0133135094247084 0.318188244546092 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000007 0 35.41666666666666 0.0132307731029257 0 -Inf 0.0132307731029257 0.0125189230968527 0 NA NA 0.0130912927609191 0.312181851898868 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000007 0 35.08333333333332 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0127385147348549 0 NA NA 0.0129196561060768 0.312156153391534 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666673 0 34.24999999999999 0.0130296436641525 0 -Inf 0.0130296436641525 0.0127375686664476 0 NA NA 0.0126456288113935 0.3028375711147 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666673 0 34.74999999999999 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0133068592059496 0 NA NA 0.0125217578635256 0.29492252825058 666 334 0 0 0.666 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666673 0 34.41666666666666 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0130489669215284 0 NA NA 0.0127595434570341 0.310316258038238 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.5833333333334 0 33.74999999999999 0.0126718959543504 0 -Inf 0.0126718959543504 0.0122430220776391 0 NA NA 0.0127203572356714 0.319157711994298 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666673 0 33.416666666666664 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0124310721235306 0 NA NA 0.01287333149488 0.3269814755463 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCG:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000007 0 33.083333333333336 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0126320360276363 0 NA NA 0.0128941894196336 0.329794815595705 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 256 TCG CAT CGA 2 GCATCGAAG:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.41666666666673 0 33.41666666666667 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0122753132654523 0 NA NA 0.0121951119596463 0.303837906148817 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 257 AAA CGA AAA 2 TCGAAGAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.5833333333334 0 33.25 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0130337648123937 0 NA NA 0.0118631657823973 0.29151459073706 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT:AAGAAGCCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.8333333333334 0 32 0.0123206056064609 0 -Inf 0.0123206056064609 0.0123815186629626 0 NA NA 0.0125365737011483 0.325719194365689 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0122788302183747 0 NA NA 0.0122368060243945 0.312016287570479 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.012694431235703 0 NA NA 0.0124000103957724 0.318427820078977 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0122536544747566 0 NA NA 0.0125488742248783 0.324202545953778 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.16666666666671 0 31.5 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0119067176903527 0 NA NA 0.0117580393066743 0.296689289755221 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.00000000000004 0 32 0.0124484185567784 0 -Inf 0.0124484185567784 0.0124522354999717 0 NA NA 0.013166774528779 0.344433388092543 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 33 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0125208119418553 0 NA NA 0.012139551407801 0.299098109045923 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333337 0 32.66666666666667 0.0125525942666428 0 -Inf 0.0125525942666428 0.0126791558030937 0 NA NA 0.0124403063345778 0.312962098532031 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.83333333333337 0 31.833333333333332 0.0123206056064609 0 -Inf 0.0123206056064609 0.0120950881682805 0 NA NA 0.0119626558238611 0.303046497007888 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACTAAACAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.33333333333337 0 31.833333333333332 0.0122451699655716 0 -Inf 0.0122451699655716 0.0126345006334223 0 NA NA 0.0122953770581887 0.319290674947786 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 31.833333333333332 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0124970642505838 0 NA NA 0.0125071087593751 0.323586142505177 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 32.166666666666664 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0122180939227448 0 NA NA 0.0131152188051223 0.346527614670093 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 32.33333333333333 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0127027338326514 0 NA NA 0.0123757994884827 0.317482007137681 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 31.666666666666664 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.012054575887174 0 NA NA 0.0125266079955344 0.323343248676119 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 31.999999999999993 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0120463001258647 0 NA NA 0.0123349178123244 0.316877565200904 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.33333333333337 0 31.33333333333333 0.0122451699655716 0 -Inf 0.0122451699655716 0.0124043856095957 0 NA NA 0.0120871471535424 0.311024995896434 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.6666666666667 0 31.33333333333333 0.0121953906538352 0 -Inf 0.0121953906538352 0.012260039348819 0 NA NA 0.0116746507692487 0.296205881143865 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.6666666666667 0 30.999999999999993 0.012048451877855 0 -Inf 0.012048451877855 0.0119292498323489 0 NA NA 0.0116498663385851 0.301036250508287 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.50000000000004 0 30.66666666666666 0.012072695281631 0 -Inf 0.012072695281631 0.0115214024431411 0 NA NA 0.0122623645527251 0.32485380582934 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.33333333333333 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0119872895446994 0 NA NA 0.012040134993986 0.312092919137192 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.16666666666666 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0119932560601592 0 NA NA 0.0121227841514553 0.315403377814246 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.83333333333333 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0120414110760467 0 NA NA 0.0123694211860916 0.321207522312797 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA:GGTCCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.83333333333333 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0117017880709972 0 NA NA 0.0122551690682246 0.316716832721808 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCAGAGCAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.16666666666666 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0116717051029647 0 NA NA 0.0118864931972959 0.305879645669841 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC:GAGCAAACC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.33333333333337 0 30.999999999999993 0.0120970364474127 0 -Inf 0.0120970364474127 0.0117952664547882 0 NA NA 0.0120440315614417 0.315185404094381 610 390 0 0 0.61 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.6666666666667 0 31.66666666666666 0.0125002893639087 0 -Inf 0.0125002893639087 0.0125966455859978 0 NA NA 0.0119822432002523 0.296839703643822 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 31.33333333333333 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0126259910732806 0 NA NA 0.0127369288104659 0.322336118568773 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.33333333333336 0 31.33333333333333 0.0127121687353299 0 -Inf 0.0127121687353299 0.0128944404028952 0 NA NA 0.0126127048696265 0.313509190497621 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 31.499999999999993 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0128153576498275 0 NA NA 0.0118486101352724 0.286375605990101 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 31.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0130173454887922 0 NA NA 0.0122815916323248 0.301664576576684 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 30.499999999999993 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0125595689111679 0 NA NA 0.0123613469645792 0.30581582448185 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 30.999999999999996 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0126003827740463 0 NA NA 0.0133812341075252 0.341088458025428 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAA:GACCAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 30.749999999999996 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0128304525878246 0 NA NA 0.0123551638685082 0.304040921723252 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 291 GAA AAG AAC 2 CAAGAACTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.4166666666667 0 29.749999999999996 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0123714361606426 0 NA NA 0.0123433610468467 0.309682543318925 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 292 CTA AAC TAA 2 GAACTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 29.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 28.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 29.833333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.1666666666667 0 30.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333337 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666671 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666671 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 27.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.91666666666671 0 29.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666673 0 28.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000006 0 27.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666673 0 28.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000007 0 27.249999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 26.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666673 0 26.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000006 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666673 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000006 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666673 0 27.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666673 0 27.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.16666666666673 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.8333333333334 0 28.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.50000000000007 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.75000000000007 0 28.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.91666666666673 0 29.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATC:GGAGCCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.5833333333334 0 29.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATC CCA TCA 2 GCCATCAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 29.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TCA AAT 2 ATCAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000007 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333341 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000009 0 31.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC:GACGCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333343 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA:GCATATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.66666666666676 0 30.666666666666654 0.0117649471257746 0 -Inf 0.0117649471257746 0.0123020145470343 0 NA NA 0.0117593226070022 0.317079092593482 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA:TATAAAACA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.33333333333341 0 30.999999999999986 0.0118112677261044 0 -Inf 0.0118112677261044 0.0117388464103296 0 NA NA 0.0115719236883855 0.30740457187328 666 334 0 0 0.666 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.0123653378701104 0 NA NA 0.0120609233552249 0.316351265216338 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.0122883000697667 0 NA NA 0.0123434541398826 0.327555481849975 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0120152844476672 0 NA NA 0.0119353663546796 0.303429283071131 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.0118967373435446 0 NA NA 0.0120508654539893 0.312032951043582 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0120928082144749 0 NA NA 0.0126779689061982 0.33064720304994 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0.0124872811774231 0 -Inf 0.0124872811774231 0.0127093916219699 0 NA NA 0.0122240181510456 0.307000307472097 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.012598894104422 0 NA NA 0.0122629484044459 0.305508776375486 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666674 0 33.74999999999998 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0118184246862446 0 NA NA 0.0121164055763826 0.297668140897678 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.5833333333334 0 33.41666666666665 0.0126718959543504 0 -Inf 0.0126718959543504 0.0130491623241971 0 NA NA 0.0126819031830836 0.31769253439816 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.0833333333334 0 33.91666666666664 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0128635757189661 0 NA NA 0.0123287272161662 0.300954401393363 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666674 0 33.91666666666664 0.0128620515547158 0 -Inf 0.0128620515547158 0.0130943547121274 0 NA NA 0.0126758791779173 0.310254987515002 613 387 0 0 0.613 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT:CTTCAACAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC:CAACATTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG:CATTCCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA:GCTGATTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG:TCTACTCAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153541.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000006 2 34.49999999999999 0.0551338852123344 0.0603340239140544 0.913810842301392 -0.00520013870171999 0.0279866539486412 0.0451442979596236 NA NA 0.054936852181874 0.924587547076887 455 2 543 0.543 0.455 0.91 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333339 2 34.666666666666664 0.0552608903391469 0.0600320307551523 0.920523421313781 -0.00477114041600538 0.0275899830878975 0.0447884922385753 NaN NaN 0.0542744639671674 0.929950078761847 460 3 537 0.537 0.46 0.92 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666671 2 34.666666666666664 0.0550074627952335 0.0600320307551523 0.916301882566457 -0.00502456795991879 0.0281118633222381 0.0446784050239835 NA NA 0.0531256234342138 0.924649236287504 448 1 551 0.551 0.448 0.896 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666671 2 34.99999999999999 0.055774819305903 0.0594370287406054 0.938385052007143 -0.00366220943470233 0.0279393285189717 0.0439864779047989 NA NA 0.0551992881819995 0.947102974704241 481 2 517 0.517 0.481 0.962 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666671 2 35.99999999999999 0.0565638983071325 0.0577207808520962 0.979957261009199 -0.00115688254496378 0.028421467546908 0.0400389370181662 NA NA 0.0540934062886325 0.982937137395888 511 3 486 0.486 0.511 0.972 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666671 2 35.99999999999999 0.0565638983071325 0.0577207808520962 0.979957261009199 -0.00115688254496378 0.0274724403650804 0.0412154459256076 NaN NaN 0.0541375574015416 0.982951050651283 475 2 523 0.523 0.475 0.95 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AGT:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.58333333333339 2 35.166666666666664 0.0564308375631679 0.0591439311842398 0.95412726941298 -0.00271309362107187 0.0282252871987695 0.0492764301598623 NA NA 0.0562211583333525 0.961511009945438 493 1 506 0.506 0.493 0.986 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AGTCAA:TCAAACCAA 1:1 TRUE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333339 2 36.166666666666664 0.0556454425645553 0.0574443341110379 0.968684613124676 -0.00179889154648254 0.0265674474085415 0.0408654262047422 NA NA 0.0521188542012004 0.97246633901232 523 2 475 0.475 0.523 0.95 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AGTCAACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.25000000000006 2 36.5 0.0415331021017154 0.0568993130810351 0.729940307760211 -0.0153662109793197 0.0230721578337803 0.0443806645319072 NA NA 0.0499755960824021 0.758482388579315 425 7 568 0.568 0.425 0.85 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.91666666666671 2 35.83333333333333 0.0411531794236846 0.0579999025523778 0.709538768388801 -0.0168467231286932 0.0226813521680246 0.0441715863877778 NA NA 0.0477590673389961 0.724280390509662 388 9 603 0.603 0.388 0.776 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.25000000000004 2 35.5 0.0409658133601689 0.0585663277285774 0.699477241428263 -0.0176005143684085 0.0236194544132537 0.0445954684153328 NA NA 0.0528670105075323 0.73919425461299 384 4 612 0.612 0.384 0.768 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333337 2 35.666666666666664 0.0410592825874941 0.0582817382454872 0.704496533966595 -0.0172224556579931 0.0239361888016664 0.0426955903386696 NA NA 0.0517599061678882 0.73933252927998 394 6 600 0.6 0.394 0.788 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.9166666666667 2 35.5 0.0405961546323978 0.0585663277285774 0.69316544517762 -0.0179701730961797 0.0226755509582334 0.0431858653414006 NA NA 0.0530775092648783 0.734937649172848 362 2 636 0.636 0.362 0.724 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333337 2 35 0.0399650588551816 0.0594370287406054 0.672393282470375 -0.0194719698854237 0.0238090738311294 0.0451964524810104 NA NA 0.0507778953864713 0.701368822999396 347 4 649 0.649 0.347 0.694 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.4166666666667 2 34.666666666666664 0.0397883346582442 0.0600320307551523 0.662785085857342 -0.0202436960969081 0.0233473533301426 0.0441935930701543 NA NA 0.0510967947430803 0.691969819776992 364 2 634 0.634 0.364 0.728 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.4166666666667 2 33.833333333333336 0.0392674190316604 0.0615730216404005 0.637737404881482 -0.0223056026087401 0.0232015136666643 0.0515224633310352 NA NA 0.0522747272644661 0.66959817824458 336 6 658 0.658 0.336 0.672 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.08333333333336 2 33.833333333333336 0.0389276557511924 0.0615730216404005 0.632219350522346 -0.0226453658892081 0.0218906008065248 0.0485357538596662 NA NA 0.0529898126205524 0.669122090713778 359 3 638 0.638 0.359 0.718 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000003 2 34.16666666666667 0.0393532888030902 0.0609472230590743 0.645694534186508 -0.0215939342559841 0.0224763107276867 0.0470506831467519 NA NA 0.0538443265043276 0.688387863708144 343 4 653 0.653 0.343 0.686 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333336 2 34.333333333333336 0.0397005575048303 0.0606390724718212 0.65470258509114 -0.0209385149669909 0.0233669515708862 0.0462543976591416 NA NA 0.0530826750892303 0.693248087296614 338 7 655 0.655 0.338 0.676 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000003 2 33.66666666666667 0.0393532888030902 0.0618907677660026 0.635850712853937 -0.0225374789629124 0.0221605310992092 0.0464705304679163 NA NA 0.0520232887297002 0.664855651171522 349 5 646 0.646 0.349 0.698 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCGCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.9166666666667 2 34.666666666666664 0.0395261602343306 0.0600320307551523 0.658417843559927 -0.0205058705208217 0.022562726971399 0.0441982131392553 NA NA 0.0533504294668564 0.700710261732569 365 4 631 0.631 0.365 0.73 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:GCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.58333333333336 1 34 0.0391819232689515 0.0300040009602743 1.30588994850483 0.0091779223086772 0.0224908160889 0.031685310832652 NA NA 0.0397979184447719 0.817615370791393 581 19 400 0.4 0.581 0.8 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAAAT:GATTCAACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.25000000000003 1 34.666666666666664 0.0398765009105086 0.029415534864961 1.35562725932305 0.0104609660455476 0.0225365607273794 0.0320043388173917 NA NA 0.0413385055179248 0.800224767488514 596 11 393 0.393 0.596 0.786 N all ss13 25 AAT CAA ATG 2 TCAAATGAC:TCAACTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.58333333333337 1 34.333333333333336 0.0391819232689515 0.0297068535712844 1.318952314318 0.00947506969766718 0.0235037781116521 0.0312982311946222 NA NA 0.0401116963190517 0.813264189446792 577 10 413 0.413 0.577 0.826 N all ss13 26 GAC ATG ACA 2 AATGACAAT:ACTGACAAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666671 1 34.166666666666664 0.0259485340559255 0.0298546878003148 0.869161125699394 -0.00390615374438923 0.0180690429627097 0.03210531951631 NA NA 0.0382370958523071 0.918632748504609 462 32 506 0.506 0.462 0.924 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.91666666666671 1 34.666666666666664 0.0261179819037762 0.029415534864961 0.88789756921562 -0.0032975529611848 0.0184240339833498 0.0323622417395955 NA NA 0.0375275398267391 0.929979830670162 463 38 499 0.499 0.463 0.926 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000004 1 34.666666666666664 0.0263473854682498 0.029415534864961 0.895696290725421 -0.00306814939671111 0.0189516504796125 0.0304655496242399 NA NA 0.0391089387753655 0.937469020791866 468 37 495 0.495 0.468 0.936 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AACCAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.91666666666671 1 35 0.0264636052740321 0.0291298749871979 0.908469579277715 -0.00266626971316578 0.018798644179989 0.0316282974202548 NA NA 0.0388584322444174 0.945296111823075 470 46 484 0.484 0.47 0.94 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA:CAGGATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.66666666666671 1 34.25 0.0262035385209603 0.0297805871963345 0.879886563290651 -0.00357704867537417 0.0184286579747939 0.0326330114972197 NA NA 0.0383940782264104 0.925771147310491 465 52 483 0.483 0.465 0.93 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA:GATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.33333333333339 0 34.916666666666664 0.0266694765273651 0 -Inf 0.0266694765273651 0.0197064180186494 0 NA NA 0.0184889893494186 0.149174951216463 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.66666666666671 1 35.916666666666664 0.0407339920153049 0.0283721774047871 1.43570200602341 0.0123618146105178 0.0238428335190271 0.0283591351263771 NA NA 0.0251319843102012 0.622807154764361 641 54 305 0.305 0.641 0.61 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT:GGACGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.50000000000004 1 35.75 0.0402781342288957 0.0285069944752381 1.41292110832246 0.0117711397536576 0.0236993053271476 0.0298118452285133 NA NA 0.0260805176722348 0.651745655268811 680 41 279 0.279 0.68 0.558 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.50000000000004 1 35.416666666666664 0.0397443976053828 0.0287805096612113 1.38094835960977 0.0109638879441715 0.0235915751842974 0.0288930148167822 NA NA 0.0255124211640255 0.667379647901916 650 41 309 0.309 0.65 0.618 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000004 1 35.416666666666664 0.0262608883838265 0.0287805096612113 0.912453903456041 -0.00251962127738475 0.0194198828047902 0.0296123309450369 NA NA 0.0216128565228007 0.907193090316867 398 136 466 0.466 0.398 0.796 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0261464386246643 0.0286430990492925 0.912835534299844 -0.00249666042462824 0.0187317030514498 0.0294117524447203 NA NA 0.0215531976310247 0.907781627921665 393 102 505 0.505 0.393 0.786 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCACGGCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.50000000000004 1 34.916666666666664 0.0259205062991005 0.0292007684815911 0.887665210435864 -0.00328026218249058 0.0190368509585956 0.0299992798358631 NA NA 0.0210221484550997 0.876002761609945 357 149 494 0.494 0.357 0.714 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0261464386246643 0.0286430990492925 0.912835534299844 -0.00249666042462824 0.019091384819647 0.028886132809353 NA NA 0.0205760288417091 0.903423082631417 384 137 479 0.479 0.384 0.768 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333337 1 35.58333333333333 0.0261464386246643 0.0286430990492925 0.912835534299844 -0.00249666042462824 0.0187647017667825 0.0295177843027425 NA NA 0.0193248917148208 0.897204128808386 370 133 497 0.497 0.37 0.74 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.6666666666667 1 35.58333333333333 0.026551445288187 0.0286430990492925 0.926975298395402 -0.00209165376110553 0.0187383897581777 0.0302913396636499 NA NA 0.0217659235078233 0.923443030035044 380 130 490 0.49 0.38 0.76 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA:CAGCGCCGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.6666666666667 1 36.08333333333333 0.0269087157486763 0.0282386296527663 0.952904446127764 -0.00132991390408998 0.0198561246147757 0.0296058348415059 NA NA 0.0203230277909033 0.947824657678518 412 124 464 0.464 0.412 0.824 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGCCGGCCC 1:1 FALSE 1 1 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 1 36.416666666666664 0.0270299523623976 0.0279752710599065 0.966208774331994 -9.4531869750894e-4 0.0198184863415782 0.0296748220896186 NA NA 0.0203000277099764 0.962858046776421 410 131 459 0.459 0.41 0.82 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGGCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 1 36.83333333333333 0.0270299523623976 0.0276529018562458 0.977472545301518 -6.22949493848154e-4 0.0193035532379523 0.0288724211197075 NA NA 0.0196831581307018 0.974752079139884 427 125 448 0.448 0.427 0.854 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGCT:CCCCAAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000003 1 36.666666666666664 0.0271522864979704 0.0277809537602618 0.977370565902218 -6.28667262291382e-4 0.0199127662756624 0.0280278017490375 NA NA 0.0201143712389622 0.975066471479068 413 122 465 0.465 0.413 0.826 N all ss13 45 GCT AAG CTT 2 CAAGCTTTA:CAAGGTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0272138698048234 0.0285748846742028 0.952370241038692 -0.00136101486937944 0.0200464576591502 0.0285273509477656 NA NA 0.0212193946005659 0.948858643196545 414 121 465 0.465 0.414 0.828 N all ss13 46 TTA CTT TAC 2 GCTTTACCC:GGTTTACCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0134835092215562 0.0285748846742028 0.471865744176705 -0.0150913754526466 0.0137399377021825 0.0295624356412826 NA NA 0.0157989011716221 0.339468083470997 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.33333333333333 0.0134835092215562 0.028849710620847 0.467370692162608 -0.0153662013992908 0.0135288009301887 0.0290943990365795 NA NA 0.0169197936685399 0.363783653961468 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 35.33333333333333 0.0134835092215562 0.028849710620847 0.467370692162608 -0.0153662013992908 0.0139516206253445 0.0306614551911741 NA NA 0.0158198441369888 0.331386737274889 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666669 1 35.33333333333333 0.0136058153029875 0.028849710620847 0.471610113591776 -0.0152438953178595 0.0136889187583645 0.029288836465131 NA NA 0.0154773746239549 0.324665923419568 0 341 659 0.659 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0136678042173386 0.0285748846742028 0.478315288868963 -0.0149070804568642 0.0135446509052452 0.0297692928993064 NA NA 0.0150648809610047 0.32240621058016 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333336 1 35.666666666666664 0.0136678042173386 0.0285748846742028 0.478315288868963 -0.0149070804568642 0.0139220151430179 0.0305441745314382 NA NA 0.0169007344700429 0.377756564510034 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000003 1 35.666666666666664 0.0135443861537981 0.0285748846742028 0.473996179100101 -0.0150304985204047 0.0133177918940766 0.0296380740689433 NA NA 0.0161236172085384 0.351231170715615 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.1666666666667 1 35 0.0136058153029875 0.0291298749871979 0.467074277145613 -0.0155240596842104 0.0135771092489763 0.0291907738687633 NA NA 0.0160572326382178 0.333646292320221 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333337 1 34 0.0136678042173386 0.0300040009602743 0.455532721633857 -0.0163361967429357 0.0139531914161521 0.0297685183149978 NA NA 0.0188473580692552 0.386071758975419 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 33.5 0.0134532755150005 0.0304610393656427 0.441655169855254 -0.0170077638506422 0.0136728394056551 0.032969421294432 NA NA 0.0169567121193193 0.31585569413788 0 402 598 0.598 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 32.83333333333333 0.013333684515963 0.0310925352587596 0.428838768051457 -0.0177588507427966 0.0133374178769566 0.0294263654163503 NA NA 0.0199723071626308 0.37390972190157 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.5 0.013333684515963 0.0304610393656427 0.437729138389222 -0.0171273548496797 0.0127004580779409 0.030252671581833 NA NA 0.0179923374813356 0.341135048076355 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.5 0.013333684515963 0.0304610393656427 0.437729138389222 -0.0171273548496797 0.0142885374902498 0.0308988436570555 NA NA 0.0174511435246649 0.326372855818713 0 400 600 0.6 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.33333333333337 1 33 0.0132162010123647 0.0309322189005369 0.427263270535542 -0.0177160178881722 0.013317691093688 0.0306380770421151 NA NA 0.0196019174291405 0.366106739980717 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333337 1 32.33333333333333 0.0130438070339019 0.0315836140125951 0.412992858534182 -0.0185398069786932 0.0131857858610059 0.033282513438907 NA NA 0.0193954161849552 0.339129828042864 0 387 613 0.613 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAA:CATGGCAAG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000004 1 33 0.0132746828245506 0.0309322189005369 0.429153914474602 -0.0176575360759862 0.0140734779432353 0.0318085656998699 NA NA 0.0187410326253094 0.346097488306715 0 404 596 0.596 0 0.001 N all ss13 62 AAA GCA AAG 2 GGCAAAGAG:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0133041182530361 0.0301548153585304 0.441193822441118 -0.0168506971054942 0.0131786052136023 0.0303575921921841 NA NA 0.0175246815644936 0.336280299077122 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 63 GAG AAG AGG 2 AAAGAGGAA:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 33.66666666666666 0.0133932130500048 0.0303071537534075 0.441915897447117 -0.0169139407034027 0.0138872847098859 0.0321251614473736 NA NA 0.0179525626550264 0.346117736327117 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 33.49999999999999 0.0134835092215562 0.0304610393656427 0.442647706787196 -0.0169775301440864 0.0139097740947839 0.0319409249788357 NA NA 0.0184695409349262 0.357981680740341 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666671 1 33.66666666666666 0.0138892858254281 0.0303071537534075 0.458284071755387 -0.0164178679279794 0.014612361218562 0.0310935468360021 NA NA 0.0172938843646296 0.342445018418543 0 335 665 0.665 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333337 1 32.99999999999999 0.0139538908732759 0.0309322189005369 0.451111862299464 -0.016978328027261 0.0133043765425301 0.032452376168827 NA NA 0.0180108621893884 0.345848911269009 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.00000000000004 1 33.16666666666666 0.0140190997591144 0.0307735475083969 0.45555683027084 -0.0167544477492825 0.0141249760445707 0.031369415318969 NA NA 0.017060148518803 0.326059944113439 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.01508246842082 0.0314033042383872 NA NA 0.0169011375385919 0.347776283585712 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.0149716691214045 0.0306451007538575 NA NA 0.0164653253181968 0.335164827582739 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0141520865515808 0.03169662017472 NA NA 0.0170854276218406 0.345940708735923 0 343 657 0.657 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0138381816279952 0.0304138535858695 NA NA 0.0164967365682925 0.329002371223978 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0148106083472477 0.032083417590826 NA NA 0.0167374740712694 0.328851313661632 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0138365087515177 0.0308333901278674 NA NA 0.0167093190247943 0.328036987987852 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666671 1 32.83333333333333 0.0139864193085547 0.0310925352587596 0.449832063939346 -0.0171061159502049 0.0147000763755168 0.032991758113142 NA NA 0.0169425077072764 0.3126598076715 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0142762575098573 0.0300851226037 NA NA 0.0169241352144649 0.334213897014008 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333337 1 33.666666666666664 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.013707620830515 0.0297577726205865 NA NA 0.0163799052870114 0.323977236258338 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.33333333333337 1 33.99999999999999 0.014354505158023 0.0300040009602743 0.478419700660208 -0.0156494958022513 0.0148965007350155 0.0306715620506037 NA NA 0.0153765529952871 0.308796501097184 0 347 653 0.653 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000004 1 33.99999999999999 0.0142184353084605 0.0300040009602743 0.473884643827532 -0.0157855656518138 0.014165043738509 0.0295985454196467 NA NA 0.0154999132201939 0.308473987449821 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.25000000000004 1 33.74999999999999 0.0141680718521655 0.0302307926160697 0.468663591858134 -0.0160627207639041 0.0145380246441931 0.0310989270570508 NA NA 0.0159020227871783 0.312444744879617 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTA 2 AGTGGTAAA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.41666666666671 1 33.58333333333333 0.0141346939686238 0.0303839016876759 0.465203386777578 -0.0162492077190521 0.0140178450033583 0.0298465988003699 NA NA 0.0181545624890664 0.370761344884032 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 81 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333339 1 32.91666666666666 0.014002740465399 0.0310121698640216 0.451524047714059 -0.0170094293986226 0.0141070190213233 0.030830772506007 NA NA 0.0180840433041702 0.346921837501132 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 32.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666673 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666671 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666671 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333337 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666671 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666671 0 34.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333337 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.41666666666671 0 34.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000004 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.08333333333337 0 33.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333337 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000004 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333337 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333337 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333337 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.6666666666667 0 37.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.00000000000003 1 37.666666666666664 0.0144235214459157 0.0270299523623977 0.533612536660656 -0.012606430916482 0.0153115482212406 0.0281227130110489 NA NA 0.0127968335574812 0.324564583824482 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.33333333333336 1 38.33333333333333 0.0147788033094993 0.026551445288187 0.556610126081332 -0.0117726419786876 0.015422877747214 0.028300494485478 NA NA 0.0122723850226261 0.337418181015677 0 341 659 0.659 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.83333333333336 1 37.33333333333333 0.0146703943908702 0.0272757331281561 0.537855181451613 -0.0126053387372859 0.0150865893260419 0.0273744606191523 NA NA 0.0132473778925977 0.341333050987611 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.6666666666667 1 36.49999999999999 0.0147063535412822 0.0279101972553257 0.526916861487821 -0.0132038437140435 0.01496565917622 0.02865819434442 NA NA 0.0140689691542359 0.34798327581274 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.33333333333337 1 35.83333333333333 0.0145635643928261 0.0284394261467203 0.512090656038277 -0.0138758617538942 0.0144280139853836 0.0289830905450982 NA NA 0.0143623260276721 0.333979562718635 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.66666666666671 1 35.49999999999999 0.0144932046198021 0.0287116399282627 0.504784981144025 -0.0142184353084606 0.0151173377314193 0.0295603531410619 NA NA 0.0150077091956767 0.34343052398667 0 391 609 0.609 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 1 35.83333333333333 0.0141513632282871 0.0284394261467203 0.497596651749567 -0.0142880629184332 0.014343660831311 0.0294192927183466 NA NA 0.0144919282293713 0.324166241046997 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333339 1 36.33333333333333 0.0140519332931024 0.0280406490537152 0.501127248024259 -0.0139887157606129 0.0146792277298943 0.0270741213326175 NA NA 0.0142714122457593 0.326991641530426 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 1 35.99999999999999 0.0139864193085547 0.0283052459871353 0.494128166733175 -0.0143188266785806 0.0139030149968622 0.0294265635968708 NA NA 0.0151201113586106 0.343636041662576 0 387 613 0.613 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.8333333333334 1 35.33333333333333 0.0138572071256798 0.028849710620847 0.480323955681777 -0.0149925034951672 0.0142596171919313 0.0300089403654056 NA NA 0.0155400696513626 0.334662910626633 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666673 1 34.33333333333333 0.0136058153029875 0.0297068535712844 0.458002570697671 -0.0161010382682968 0.0137660940040224 0.0292236818274348 NA NA 0.0168725630475169 0.339945264070275 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 1 34.33333333333333 0.0137303605832671 0.0297068535712844 0.462195047022392 -0.0159764929880173 0.0138996853496181 0.0308186059453378 NA NA 0.0164350404392483 0.331001099464834 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000006 1 34.49999999999999 0.0136367393123929 0.0295604764056575 0.461316628502745 -0.0159237370932646 0.0145468596278983 0.0302956488162878 NA NA 0.0165695090627516 0.3365388499729 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666673 1 33.83333333333333 0.0135138791270087 0.0301548153585304 0.448149954371576 -0.0166409362315217 0.0141467831015694 0.0312888272421468 NA NA 0.0182272637185633 0.361258571613769 0 339 661 0.661 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666673 1 34.49999999999999 0.0135138791270087 0.0295604764056575 0.457160396928593 -0.0160465972786488 0.0143209602371938 0.030202299969453 NA NA 0.0168423984044226 0.340716687067926 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000006 1 35.16666666666666 0.0136367393123929 0.0289891158257094 0.470408942252006 -0.0153523765133166 0.0139621021878374 0.0303786390230358 NA NA 0.0159058382630483 0.334442713177905 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGCGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000006 1 35.16666666666666 0.0136367393123929 0.0289891158257094 0.470408942252006 -0.0153523765133166 0.0129332423234133 0.0300047572324791 NA NA 0.0163493809706485 0.347721079053972 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGCGCTAAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333339 1 35.49999999999999 0.0135750312327134 0.0287116399282627 0.472805846918923 -0.0151366086955493 0.0138788626618101 0.0306336755986891 NA NA 0.0153426479035489 0.323853081955721 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA:GCTAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 1 34.58333333333333 0.0134081783305544 0.0294878275056261 0.454702142027798 -0.0160796491750717 0.0132670117919691 0.0288523121096957 NA NA 0.0166276801639777 0.333523516242795 0 337 663 0.663 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AATAAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 1 34.25 0.0133485169832455 0.0297805871963345 0.448228804060938 -0.016432070213089 0.0138631729381206 0.0299668535599117 NA NA 0.0163553859049546 0.315046806072245 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 34 0.0133932130500048 0.0300040009602743 0.446380903258123 -0.0166107879102695 0.0128994012263094 0.0286488959258468 NA NA 0.0162116161472917 0.305541307539954 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0134835092215562 0.0301548153585304 0.447142821510991 -0.0166713061369741 0.0133666389581082 0.0310562477159826 NA NA 0.0162085620765193 0.303691485066253 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 1 34.5 0.0136058153029875 0.0295604764056575 0.460270501607463 -0.0159546611026699 0.0132524857099963 0.0307463709336444 NA NA 0.0172041314783368 0.35373247936668 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333337 1 34.5 0.0135750312327134 0.0295604764056575 0.459229108706629 -0.0159854451729441 0.0141261268570294 0.030365117028325 NA NA 0.0163363045015558 0.327815858211932 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000004 1 34.5 0.0134532755150005 0.0295604764056575 0.455110240118651 -0.016107200890657 0.0138611721360636 0.0311012148265848 NA NA 0.0159197749363063 0.311646528986101 0 400 600 0.6 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0272757331281561 0.0301548153585304 0.90452330096726 -0.00287908223037424 0.0196535873044195 0.0300846333330279 NA NA 0.0211503209518549 0.891722659039364 364 116 520 0.52 0.364 0.728 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333339 1 33.66666666666666 0.0272138698048233 0.0303071537534075 0.897935518005004 -0.00309328394858423 0.0198714144508047 0.031646198853355 NA NA 0.0229144832610257 0.892617784622826 361 117 522 0.522 0.361 0.722 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333339 1 33.66666666666666 0.0272138698048233 0.0303071537534075 0.897935518005004 -0.00309328394858423 0.0196758012432418 0.0312614354324832 NA NA 0.0212258849114544 0.884133208310602 370 139 491 0.491 0.37 0.74 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.50000000000006 1 33.99999999999999 0.0273378783823658 0.0300040009602743 0.911141098100931 -0.00266612257790858 0.0196343888405655 0.0309410479659272 NA NA 0.021478401268911 0.901212027210911 360 143 497 0.497 0.36 0.72 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.16666666666673 1 33.666666666666664 0.0274630224286674 0.0303071537534075 0.906156435939804 -0.00284413132474011 0.0195982094228834 0.0333962537382135 NA NA 0.0224405329085253 0.89914554431172 368 137 495 0.495 0.368 0.736 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666673 1 34.166666666666664 0.0276529018562458 0.0298546878003148 0.926249908932365 -0.00220178594406902 0.0197529454809835 0.0303142897563728 NA NA 0.0214456185872551 0.918226206158557 384 136 480 0.48 0.384 0.768 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666673 1 34.166666666666664 0.0276529018562458 0.0298546878003148 0.926249908932365 -0.00220178594406902 0.0194333984816824 0.0283793743490303 NA NA 0.0215709379671229 0.91869963003278 361 133 506 0.506 0.361 0.722 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.3333333333334 1 33.83333333333333 0.0270299523623976 0.0301548153585304 0.896372670202778 -0.00312486299613275 0.0203344515527527 0.0288644532318232 NA NA 0.02089884880293 0.881140794869791 378 117 505 0.505 0.378 0.756 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.3333333333334 1 34.83333333333333 0.0270299523623976 0.0292720079293014 0.923406157434813 -0.00224205556690382 0.0186217948918647 0.030308297770992 NA NA 0.0207063452886615 0.913774640525757 397 125 478 0.478 0.397 0.794 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000007 1 35.166666666666664 0.0271522864979704 0.0289891158257093 0.936637276597795 -0.00183682932773889 0.0198530081411634 0.0300659192079365 NA NA 0.0214988684075799 0.931912850839571 383 134 483 0.483 0.383 0.766 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.5833333333334 1 35.58333333333333 0.0273067703935705 0.0286430990492925 0.953345528239726 -0.00133632865572195 0.0200808952582143 0.0285410175515339 NA NA 0.0213810493240014 0.950164175044467 411 118 471 0.471 0.411 0.822 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.5833333333334 1 35.58333333333333 0.0273067703935705 0.0286430990492925 0.953345528239726 -0.00133632865572195 0.0196249318778899 0.0297721722533693 NA NA 0.0199975212756077 0.946721247826614 390 125 485 0.485 0.39 0.78 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.5833333333334 1 35.916666666666664 0.0280734527889724 0.0283721774047871 0.989471212887444 -2.98724615814688e-4 0.020501323802067 0.028465842799814 NA NA 0.0198856134251403 0.988014511313084 430 123 447 0.447 0.43 0.86 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666674 1 35.5 0.0426150118597228 0.0287116399282627 1.48424165133717 0.0139033719314601 0.0247970424587636 0.0289154594736725 NA NA 0.0255608687310671 0.586488335225424 673 52 275 0.275 0.673 0.55 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.5833333333334 1 34.5 0.0419201068148284 0.0295604764056575 1.4181133700134 0.0123596304091709 0.0235147283141224 0.0296372357079304 NA NA 0.0255251891247695 0.628234655974299 656 36 308 0.308 0.656 0.616 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 1 34.833333333333336 0.0427161696956043 0.0292720079293014 1.45928389329402 0.0134441617663029 0.0250734991927052 0.0300615556434332 NA NA 0.025309251269256 0.595283273124208 677 36 287 0.287 0.677 0.574 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAC:ACCCGCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666673 1 34.166666666666664 0.0423143935004423 0.0298546878003148 1.41734503416901 0.0124597057001275 0.0240937055234487 0.0313182788041863 NA NA 0.0267113303660515 0.640887919420003 642 43 315 0.315 0.642 0.63 N all ss13 151 AAC GCA ACC 2 CGCAACCCT:CGCAATCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.5833333333334 1 34.5 0.0425143321315747 0.0295604764056575 1.43821539098869 0.0129538557259172 0.0246725246226733 0.0306085444962723 NA NA 0.0260653022477207 0.619205270371418 644 57 299 0.299 0.644 0.598 N all ss13 152 CCT ACC CTA 2 AACCCTAAT:AATCCTAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.91666666666673 1 34.5 0.0429199333819239 0.0295604764056575 1.4519364570765 0.0133594569762664 0.0242303342595162 0.0303035611878091 NA NA 0.0259417477286766 0.60656764963275 676 39 285 0.285 0.676 0.57 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000007 1 34.33333333333333 0.0424141271286908 0.0297068535712844 1.42775561965572 0.0127072735574065 0.0261720628014903 0.0315028964729978 NA NA 0.0260302939256517 0.625427664338689 650 47 303 0.303 0.65 0.606 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000007 1 34.33333333333333 0.0424141271286908 0.0297068535712844 1.42775561965572 0.0127072735574065 0.0251500327774231 0.0304561628497666 NA NA 0.026344771088297102 0.629560751720325 628 54 318 0.318 0.628 0.636 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666673 1 34.33333333333333 0.0426150118597228 0.0297068535712844 1.43451785486013 0.0129081582884384 0.0264032251365142 0.030343935504436 NA NA 0.0253109345856935 0.610063041400484 671 53 276 0.276 0.671 0.552 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.75000000000007 1 34.33333333333333 0.0430225461599401 0.0297068535712844 1.44823638278297 0.0133156925886558 0.025398568407404 0.0300521254163291 NA NA 0.0255127733109748 0.601724232802738 661 50 289 0.289 0.661 0.578 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCGTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.41666666666673 1 34.33333333333333 0.0573756358851215 0.0297068535712844 1.93139390368096 0.0276687823138371 0.0284068482811101 0.0291854354798697 NA NA 0.0298647688105446 0.354202303317782 825 14 161 0.161 0.825 0.322 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCGTCGTG 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.5833333333334 1 34.16666666666666 0.0572387314369154 0.0298546878003148 1.91724434768036 0.0273840436366006 0.0283485360978789 0.0297826766943413 NA NA 0.0287195437080423 0.340337524255264 804 19 177 0.177 0.804 0.354 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:GTCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 0 34.49999999999999 0.0427161696956043 0 -Inf 0.0427161696956043 0.0241061510291435 0 NA NA 0.0240393898522683 0.0755807387272026 961 39 0 0 0.961 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 0 34.49999999999999 0.0427161696956043 0 -Inf 0.0427161696956043 0.0238550894479411 0 NA NA 0.024432910703085 0.0804113005244654 962 38 0 0 0.962 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.75000000000006 0 34.99999999999999 0.0430225461599401 0 -Inf 0.0430225461599401 0.0243068811727371 0 NA NA 0.0253778799526856 0.0900228113480317 961 39 0 0 0.961 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.16666666666666 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.0273190008550375 0 NA NA 0.0273287674339757 0.0366659642324751 983 17 0 0 0.983 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.16666666666666 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.0274905190745293 0 NA NA 0.027336598158196 0.0367198246219495 983 17 0 0 0.983 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000006 0 35.83333333333332 0.0571024790858329 0 -Inf 0.0571024790858329 0.0267992536055268 0 NA NA 0.0267756119042081 0.0329550723236606 979 21 0 0 0.979 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333339 0 35.83333333333332 0.05765141989764 0 -Inf 0.05765141989764 0.0285047260544459 0 NA NA 0.0274960364931729 0.0360185936393446 988 12 0 0 0.988 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25000000000006 0 35.66666666666666 0.0575131971253351 0 -Inf 0.0575131971253351 0.0289953912354973 0 NA NA 0.0278015735581813 0.0385739705907116 981 19 0 0 0.981 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.58333333333339 0 36.33333333333332 0.0580701054974425 0 -Inf 0.0580701054974425 0.0280103451574199 0 NA NA 0.0279098444081737 0.0374676350282223 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.58333333333339 0 36.99999999999999 0.0580701054974425 0 -Inf 0.0580701054974425 0.0282346945291858 0 NA NA 0.0280150158713913 0.038188966954763 983 17 0 0 0.983 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.58333333333339 0 37.66666666666666 0.0589259989959384 0 -Inf 0.0589259989959384 0.0286339649208549 0 NA NA 0.0286471288777509 0.0396900710628083 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.08333333333339 0 38.16666666666666 0.0593634822039754 0 -Inf 0.0593634822039754 0.0290463210482589 0 NA NA 0.0272312815426318 0.0292593985300122 983 17 0 0 0.983 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.91666666666671 0 38.66666666666666 0.0604099978044257 0 -Inf 0.0604099978044257 0.0292981517700628 0 NA NA 0.0297707366676239 0.042440594741208 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.25000000000006 0 39.33333333333333 0.0610247509530335 0 -Inf 0.0610247509530335 0.0300376448661858 0 NA NA 0.0299123645970724 0.0413385825950392 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.58333333333339 0 38.99999999999999 0.0616521517369467 0 -Inf 0.0616521517369467 0.0296021710576194 0 NA NA 0.0295571688881587 0.0369911978827145 976 24 0 0 0.976 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.25000000000006 0 37.99999999999999 0.0610247509530335 0 -Inf 0.0610247509530335 0.0291623196916424 0 NA NA 0.030190288060158 0.0432448755225181 980 20 0 0 0.98 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.75000000000006 0 36.99999999999999 0.0605625213547463 0 -Inf 0.0605625213547463 0.0288662664876874 0 NA NA 0.029425876294186 0.039576864774515 982 18 0 0 0.982 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.41666666666671 0 36.16666666666666 0.0618110240091991 0 -Inf 0.0618110240091991 0.0301431384578344 0 NA NA 0.0299274535274358 0.0388887652420277 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.50000000000006 0 35.74999999999999 0.0617314855970426 0 -Inf 0.0617314855970426 0.0299376895273151 0 NA NA 0.0288330924558214 0.0322745005275867 987 13 0 0 0.987 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGCAGAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.16666666666673 0 35.58333333333333 0.0620508745044358 0 -Inf 0.0620508745044358 0.0305360790363921 0 NA NA 0.0301741122084678 0.039741326667601 982 18 0 0 0.982 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC:AGAGGTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.16666666666673 0 35.08333333333333 0.0630291953285241 0 -Inf 0.0630291953285241 0.0291005760128685 0 NA NA 0.0293558184343176 0.0317871716841453 988 12 0 0 0.988 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT:GGTGGCAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.16666666666673 0 34.74999999999999 0.0630291953285241 0 -Inf 0.0630291953285241 0.0300447911136716 0 NA NA 0.0296725674583269 0.033657007781186 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 67.0833333333334 0 34.49999999999999 0.0621312390918573 0 -Inf 0.0621312390918573 0.031070070360398 0 NA NA 0.0302694242169103 0.040110685476301 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.75000000000006 0 34.16666666666666 0.0624547911592669 0 -Inf 0.0624547911592669 0.0299646371428211 0 NA NA 0.0309515467408757 0.0436095361663662 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAATCTTCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 66.75000000000006 0 34.16666666666666 0.0624547911592669 0 -Inf 0.0624547911592669 0.0303129607867409 0 NA NA 0.0301959322085364 0.0386101269970486 986 14 0 0 0.986 0.001 N all ss13 184 TCA CCT CAT 2 GCCTCTTCT:TCTTCATCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 67.41666666666671 0 34.16666666666666 0.0458741693976044 0 -Inf 0.0458741693976044 0.0260707285410139 0 NA NA 0.0260701180272034 0.0784679088184675 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 185 TCT CAT CTC 2 TCATCTCGC:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.08333333333339 0 34.16666666666666 0.0454110940157691 0 -Inf 0.0454110940157691 0.0251059863065207 0 NA NA 0.025837586741874 0.078822502844843 959 41 0 0 0.959 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.41666666666673 0 33.83333333333333 0.0451830456487546 0 -Inf 0.0451830456487546 0.0248842762999978 0 NA NA 0.0256185400798635 0.0777849569966582 943 57 0 0 0.943 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000006 0 33.49999999999999 0.0449572769752751 0 -Inf 0.0449572769752751 0.0259594864253989 0 NA NA 0.0250362037436452 0.0725437297240161 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000006 0 33.49999999999999 0.0449572769752751 0 -Inf 0.0449572769752751 0.0242049307087708 0 NA NA 0.0256793299402108 0.0799944179798234 937 63 0 0 0.937 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 33.49999999999999 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.0248660058582276 0 NA NA 0.0237706350667312 0.0611262455136206 954 46 0 0 0.954 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 33.49999999999999 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.0252460689996458 0 NA NA 0.0250207947990696 0.0752368177340901 953 47 0 0 0.953 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.41666666666673 0 34.16666666666666 0.0445124432883257 0 -Inf 0.0445124432883257 0.0256156040766377 0 NA NA 0.0248919218181907 0.0737391546877807 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.41666666666673 0 33.16666666666666 0.0438614614252191 0 -Inf 0.0438614614252191 0.024590498714529 0 NA NA 0.0248541395391638 0.0776049884322286 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.0833333333334 0 32.16666666666666 0.0428178090539073 0 -Inf 0.0428178090539073 0.0229703929038924 0 NA NA 0.0238196102710901 0.0722425646160394 945 55 0 0 0.945 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000007 0 31.333333333333325 0.0566975883332356 0 -Inf 0.0566975883332356 0.0271549645895961 0 NA NA 0.0272278033239286 0.0373112759968545 991 9 0 0 0.991 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAACA:AATTCAAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000007 0 30.66666666666666 0.0566975883332356 0 -Inf 0.0566975883332356 0.0266610925119019 0 NA NA 0.0262330021191666 0.0306715818825267 989 11 0 0 0.989 0.001 N all ss13 196 ACA CAA CAA 2 TCAACAAAT:TCAAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.5833333333334 0 30.999999999999993 0.0556454425645553 0 -Inf 0.0556454425645553 0.0257687352066071 0 NA NA 0.0261402085286036 0.0332766164888476 987 13 0 0 0.987 0.001 N all ss13 197 AAT CAA ATT 2 ACAAATTCA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666673 0 31.083333333333325 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0219610569947092 0 NA NA 0.0234346134056757 0.0770247521471028 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 0 31.749999999999993 0.042215127927666 0 -Inf 0.042215127927666 0.0244911050626181 0 NA NA 0.0225264966350078 0.0609275296425744 969 31 0 0 0.969 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.41666666666674 0 32.41666666666666 0.0420179878270026 0 -Inf 0.0420179878270026 0.0236270069604367 0 NA NA 0.0235774982855034 0.0747292737205009 955 45 0 0 0.955 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666674 0 33.58333333333332 0.0423143935004423 0 -Inf 0.0423143935004423 0.0235321712178327 0 NA NA 0.0239112279073346 0.0767862375846741 958 42 0 0 0.958 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666674 0 32.74999999999999 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0238593522513121 0 NA NA 0.0235902174205011 0.0789940448393227 952 48 0 0 0.952 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000007 0 32.41666666666666 0.0412475068105866 0 -Inf 0.0412475068105866 0.0228316219771108 0 NA NA 0.0233765736664062 0.0776511269448418 949 51 0 0 0.949 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000007 0 32.74999999999999 0.0418226808888406 0 -Inf 0.0418226808888406 0.0220667940799355 0 NA NA 0.0227198078672161 0.0656504949353292 962 38 0 0 0.962 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000007 0 33.08333333333332 0.0424141271286908 0 -Inf 0.0424141271286908 0.0235228178427559 0 NA NA 0.0244718140884119 0.0830631841183471 947 53 0 0 0.947 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666673 0 33.749999999999986 0.0426150118597228 0 -Inf 0.0426150118597228 0.0229163026729708 0 NA NA 0.0230192885527531 0.0641301354177641 954 46 0 0 0.954 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAAGTTCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 0 33.083333333333314 0.042215127927666 0 -Inf 0.042215127927666 0.0228673675186082 0 NA NA 0.0234480506415816 0.0718024970538733 955 45 0 0 0.955 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:AGTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.25000000000007 0 33.249999999999986 0.0282054389472648 0 -Inf 0.0282054389472648 0.0193540845826036 0 NA NA 0.0201819204529362 0.162245323547015 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000007 0 33.66666666666665 0.0281063333749098 0 -Inf 0.0281063333749098 0.0193672287082819 0 NA NA 0.0193505650113804 0.146367831504674 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000007 0 32.83333333333332 0.0275260251378209 0 -Inf 0.0275260251378209 0.0187988492416313 0 NA NA 0.0197425395377777 0.163242286193473 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG:GCTCGATTG 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666674 0 32.16666666666665 0.0272757331281561 0 -Inf 0.0272757331281561 0.0197946415868849 0 NA NA 0.0185814325201607 0.142130681559824 845 155 0 0 0.845 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT:CGATTGGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666674 0 32.66666666666665 0.0272757331281561 0 -Inf 0.0272757331281561 0.0184413653801247 0 NA NA 0.0185989011501686 0.142505613843795 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:TTGGCTAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666674 0 33.499999999999986 0.0136990109829699 0 -Inf 0.0136990109829699 0.0137042873755493 0 NA NA 0.0131455603717245 0.297364524434806 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666674 0 33.66666666666665 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0132443907281365 0 NA NA 0.0138106299039886 0.32454067919429 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666674 0 32.999999999999986 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0134052414511572 0 NA NA 0.0133277438936451 0.307318828909658 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.8333333333334 0 33.333333333333314 0.0136678042173386 0 -Inf 0.0136678042173386 0.0134685745338338 0 NA NA 0.0136885970063869 0.318046166517137 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000007 0 34.16666666666665 0.0138252762666285 0 -Inf 0.0138252762666285 0.0139311111741974 0 NA NA 0.0132941571109894 0.298362516595548 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.8333333333334 0 34.33333333333332 0.0138572071256798 0 -Inf 0.0138572071256798 0.0135042641158898 0 NA NA 0.0145958431266696 0.342420217763464 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.0833333333334 0 34.08333333333332 0.0138093659583391 0 -Inf 0.0138093659583391 0.0135740370358056 0 NA NA 0.0138391148632192 0.318351918534593 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666674 0 33.41666666666666 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0137991605747041 0 NA NA 0.0130966165386049 0.30050158592642 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333341 0 32.749999999999986 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0138125405363422 0 NA NA 0.0134725911910845 0.318547091089183 599 401 0 0 0.599 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.013317737600187 0 NA NA 0.0134715701438921 0.322826524617353 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0136256308670411 0 NA NA 0.0133019542291376 0.316694938484242 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 33.08333333333332 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0135153848037118 0 NA NA 0.0133621481256628 0.318879920595728 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000009 0 34.08333333333332 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0134701145784398 0 NA NA 0.0132679351057028 0.315455704387031 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666676 0 34.41666666666666 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0131140205985002 0 NA NA 0.0131450036495812 0.312024238155989 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.08333333333332 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0126264549070166 0 NA NA 0.0134570126842899 0.331872470758611 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.41666666666666 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0127483431090469 0 NA NA 0.0134261788450015 0.330763264045151 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:AGATTGAAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 35.41666666666666 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0128593896977638 0 NA NA 0.0129877962109353 0.314701651618646 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG:TTGAATCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000009 0 35.749999999999986 0.012889683529058 0 -Inf 0.012889683529058 0.0128279140549001 0 NA NA 0.013294815386494 0.332282276118424 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT:AATCAGCTT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333341 0 36.749999999999986 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.01284340335964 0 NA NA 0.0132897011192767 0.327922457937733 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.66666666666674 0 36.999999999999986 0.0131582322381821 0 -Inf 0.0131582322381821 0.0129109280392463 0 NA NA 0.0133325660985892 0.3236797956501 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000009 0 36.83333333333332 0.0130155110198637 0 -Inf 0.0130155110198637 0.0130788846306101 0 NA NA 0.0135934403884844 0.338322671654125 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000009 0 35.83333333333332 0.0128482799476378 0 -Inf 0.0128482799476378 0.0126608308527859 0 NA NA 0.0125643457993288 0.306497765057135 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333343 0 35.83333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0131932782743178 0 NA NA 0.0133599591662903 0.332041816691834 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333343 0 35.83333333333332 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0128521959002591 0 NA NA 0.0128627732851317 0.313693003525144 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666676 0 35.999999999999986 0.0129873375085957 0 -Inf 0.0129873375085957 0.0122560225000775 0 NA NA 0.0125481804658642 0.300670000684085 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666676 0 35.66666666666665 0.0128208250194751 0 -Inf 0.0128208250194751 0.0128129851277645 0 NA NA 0.0131890214409198 0.33100920249774 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666676 0 35.66666666666665 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.012679819666721 0 NA NA 0.0133390248857198 0.339562873407126 608 392 0 0 0.608 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.33333333333332 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0128480668398939 0 NA NA 0.0129848635086201 0.32449559783183 611 389 0 0 0.611 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.999999999999986 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0121454366004395 0 NA NA 0.0129265985914555 0.32231954376896 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.999999999999986 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0122525723645049 0 NA NA 0.0129894361061969 0.324665948913593 671 329 0 0 0.671 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA:CAACAACCA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666674 0 36.41666666666666 0.0259485340559255 0 -Inf 0.0259485340559255 0.0177184662883805 0 NA NA 0.018695542397686 0.165151359032921 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC:CAACCAGGC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333341 0 36.749999999999986 0.0267586909940917 0 -Inf 0.0267586909940917 0.0182072451152688 0 NA NA 0.0184630637222603 0.147251209424339 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA:CCAGGCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666674 0 36.58333333333332 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0130844731158168 0 NA NA 0.0139396533604016 0.333948336286359 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACC:GGCCAAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666674 0 36.749999999999986 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0137933098358891 0 NA NA 0.0128621244731315 0.295037509230282 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 246 ACC AAA CCG 2 CAAACCGTC:CAAACTGTC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 35.749999999999986 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0131863626638629 0 NA NA 0.0129782432761174 0.305847535304411 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 247 GTC CCG TCA 2 ACCGTCACT:ACTGTCACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 35.749999999999986 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0133026478088324 0 NA NA 0.0131636451305922 0.312709977480146 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000007 0 35.41666666666666 0.0132307731029257 0 -Inf 0.0132307731029257 0.0127296908989235 0 NA NA 0.0132541770800623 0.318165797051421 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000007 0 35.08333333333332 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0129452435683621 0 NA NA 0.0132562732869844 0.324602874890041 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666673 0 34.24999999999999 0.0130296436641525 0 -Inf 0.0130296436641525 0.012892481644164 0 NA NA 0.0129209273909221 0.313255769943091 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666673 0 34.74999999999999 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0130898908122964 0 NA NA 0.0129396394267891 0.310793219052288 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666673 0 34.41666666666666 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0129492112302985 0 NA NA 0.012675030583742 0.307101248403809 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.5833333333334 0 33.74999999999999 0.0126718959543504 0 -Inf 0.0126718959543504 0.0126542238461223 0 NA NA 0.0124150709587689 0.307402968508576 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666673 0 33.416666666666664 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0123508166509362 0 NA NA 0.0117533358897828 0.282993880342042 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCG:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000007 0 33.083333333333336 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0127421235015163 0 NA NA 0.012087721336246 0.298551007078551 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 256 TCG CAT CGA 2 GCATCGAAG:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.41666666666673 0 33.41666666666667 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0129647953578966 0 NA NA 0.0122553874768288 0.306222373652814 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 257 AAA CGA AAA 2 TCGAAGAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.5833333333334 0 33.25 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0124244406357296 0 NA NA 0.0128274549917276 0.329306800254405 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT:AAGAAGCCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.8333333333334 0 32 0.0123206056064609 0 -Inf 0.0123206056064609 0.0129850663896821 0 NA NA 0.0126293425484849 0.329285530770302 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0126355436244179 0 NA NA 0.0125490102730688 0.324207791505079 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0127465594590922 0 NA NA 0.012389360703367 0.318012012079798 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 32.16666666666667 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0120516577751218 0 NA NA 0.0126039321013987 0.326320613805526 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.16666666666671 0 31.5 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0124650064986697 0 NA NA 0.0123579539424916 0.320758695337509 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.00000000000004 0 32 0.0124484185567784 0 -Inf 0.0124484185567784 0.012429932177102 0 NA NA 0.0120760953058188 0.302619877967469 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000004 0 33 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0118842834508251 0 NA NA 0.0128255912553775 0.325692538682994 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333337 0 32.66666666666667 0.0125525942666428 0 -Inf 0.0125525942666428 0.0122380907391024 0 NA NA 0.0118096167425615 0.287821441371286 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.83333333333337 0 31.833333333333332 0.0123206056064609 0 -Inf 0.0123206056064609 0.0119787380908084 0 NA NA 0.0123983980574662 0.320356473685811 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACTAAACAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.33333333333337 0 31.833333333333332 0.0122451699655716 0 -Inf 0.0122451699655716 0.0119284881110288 0 NA NA 0.0113251533285201 0.279591893559953 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 31.833333333333332 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0126114560940854 0 NA NA 0.012219199979928 0.312316303102161 610 390 0 0 0.61 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 32.166666666666664 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0121664830140446 0 NA NA 0.0123545292849873 0.31764637985803 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 32.33333333333333 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0123639262662388 0 NA NA 0.0120055599152705 0.302787661505774 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 31.666666666666664 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0119137010413173 0 NA NA 0.0124529044052155 0.320487707352692 667 333 0 0 0.667 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 31.999999999999993 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0121012261327614 0 NA NA 0.0123726776060239 0.318356747748049 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.33333333333337 0 31.33333333333333 0.0122451699655716 0 -Inf 0.0122451699655716 0.0121227218627618 0 NA NA 0.0126173889065332 0.331797560575612 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.6666666666667 0 31.33333333333333 0.0121953906538352 0 -Inf 0.0121953906538352 0.0121721816861833 0 NA NA 0.012269175023228 0.32022958614289 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.6666666666667 0 30.999999999999993 0.012048451877855 0 -Inf 0.012048451877855 0.0116998509880198 0 NA NA 0.0116031228777141 0.299093131122591 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.50000000000004 0 30.66666666666666 0.012072695281631 0 -Inf 0.012072695281631 0.0123167636987025 0 NA NA 0.0117829248780212 0.30555555196047 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.33333333333333 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0120068948084845 0 NA NA 0.0126012087503351 0.334128181072831 669 331 0 0 0.669 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.16666666666666 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0124663243404666 0 NA NA 0.0119894263855938 0.310050777589904 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.83333333333333 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0115602653891473 0 NA NA 0.011818390234316 0.299162790634791 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA:GGTCCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.83333333333333 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0119241118193728 0 NA NA 0.0126790911479394 0.333168378695891 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCAGAGCAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333337 0 31.16666666666666 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0123032001078746 0 NA NA 0.0116082378898944 0.294431507801234 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC:GAGCAAACC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.33333333333337 0 30.999999999999993 0.0120970364474127 0 -Inf 0.0120970364474127 0.0124973143246059 0 NA NA 0.0124077894524126 0.329582578863749 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.6666666666667 0 31.66666666666666 0.0125002893639087 0 -Inf 0.0125002893639087 0.0127381711438865 0 NA NA 0.0121009193740896 0.30160236526355 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 31.33333333333333 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0131291889678892 0 NA NA 0.0125883170728899 0.316656574568653 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.33333333333336 0 31.33333333333333 0.0127121687353299 0 -Inf 0.0127121687353299 0.012693250710757 0 NA NA 0.0126730020407855 0.315817168159616 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333336 0 31.499999999999993 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0127948872823742 0 NA NA 0.0127554012960287 0.32201970548847 617 383 0 0 0.617 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 31.16666666666666 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0132831370037675 0 NA NA 0.0132636646262005 0.338873117242406 617 383 0 0 0.617 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 30.499999999999993 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0131774866540705 0 NA NA 0.0123395235715496 0.304961220795663 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.1666666666667 0 30.999999999999996 0.0127391597743079 0 -Inf 0.0127391597743079 0.0128582664854603 0 NA NA 0.0121760240383521 0.295445827356341 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAA:GACCAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 30.749999999999996 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0129284535109565 0 NA NA 0.0123231401008467 0.302786005817073 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 291 GAA AAG AAC 2 CAAGAACTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.4166666666667 0 29.749999999999996 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0129086495041613 0 NA NA 0.0124035929946089 0.312037864266009 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 292 CTA AAC TAA 2 GAACTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 29.333333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 28.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 29.833333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.1666666666667 0 30.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333337 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666671 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666671 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 29.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 30.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 29.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 27.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000006 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.91666666666671 0 29.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666673 0 28.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000006 0 27.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666673 0 28.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000007 0 27.249999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 26.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666673 0 26.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 27.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000006 0 28.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666673 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000006 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666673 0 27.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666673 0 27.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.16666666666673 0 28.499999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.8333333333334 0 28.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.50000000000007 0 28.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.75000000000007 0 28.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.91666666666673 0 29.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATC:GGAGCCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.5833333333334 0 29.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATC CCA TCA 2 GCCATCAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 29.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TCA AAT 2 ATCAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000007 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333341 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000009 0 31.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC:GACGCATAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333343 0 31.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA:GCATATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.66666666666676 0 30.666666666666654 0.0117649471257746 0 -Inf 0.0117649471257746 0.0118935182502288 0 NA NA 0.0115486025249894 0.308329551024993 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA:TATAAAACA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.33333333333341 0 30.999999999999986 0.0118112677261044 0 -Inf 0.0118112677261044 0.011333323617528 0 NA NA 0.0118484829139255 0.318832918452021 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.0119738514146937 0 NA NA 0.012341607053333 0.327483090741639 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.0122699038825221 0 NA NA 0.0126057177783947 0.337719813501171 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0123326058281171 0 NA NA 0.0120907260137142 0.309684752764643 611 389 0 0 0.611 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.0117815880746588 0 NA NA 0.0118927187460813 0.305642097684447 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0117735315331555 0 NA NA 0.0115797854211055 0.286844777097714 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0.0124872811774231 0 -Inf 0.0124872811774231 0.0123427124148427 0 NA NA 0.012739887147092 0.327001203485161 590 410 0 0 0.59 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0123939640898001 0 NA NA 0.0127817456836884 0.32555804037138403 666 334 0 0 0.666 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.91666666666674 0 33.74999999999998 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0125672981813203 0 NA NA 0.0118356313253 0.286354471268497 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.5833333333334 0 33.41666666666665 0.0126718959543504 0 -Inf 0.0126718959543504 0.012307679700335 0 NA NA 0.0131345105792766 0.334655670021651 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.0833333333334 0 33.91666666666664 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0127820368134617 0 NA NA 0.0124911150803114 0.307282134621546 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666674 0 33.91666666666664 0.0128620515547158 0 -Inf 0.0128620515547158 0.012848483094013 0 NA NA 0.0126195501547516 0.308100277199493 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT:CTTCAACAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC:CAACATTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG:CATTCCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA:GCTGATTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG:TCTACTCAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GQ153547.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 ACT TGA CTG 2 ATGACTGAT:ATGTCTGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.91666666666667 8 34 0.118619025918598 0.282358178426184 0.420101257841228 -0.163739152507586 0.0431004788196301 0.132017420292405 NaN NaN 0.127293193167163 0.198333125654476 50 0 950 0.95 0.05 0.1 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 ACTGATAAT:TCTGATAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.08333333333333 8 33.833333333333336 0.118326006641223 0.284049034433322 0.41656894513753 -0.165723027792099 0.042657724855517803 0.124056945601372 NaN NaN 0.127473854493478 0.193582103468582 57 0 943 0.943 0.057 0.114 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.41666666666666 8 33.833333333333336 0.117744298602214 0.284049034433322 0.414521030980142 -0.166304735831107 0.0415706924926107 0.135688292120108 0.328421405918329 0.206890485648889 0.127447712846297 0.191931670137613 44 0 956 0.956 0.044 0.088 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACAA:AATGGACCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.41666666666666 8 34.16666666666667 0.119506874976979 0.28068756657018 0.425764761999527 -0.161180691593201 0.0428731599055668 0.130494004720444 NaN NaN 0.127379509913863 0.205742996588077 56 0 944 0.944 0.056 0.112 N all ss13 6 CAA GAC AA- 1 GGACAA---:GGACCCCAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.5 1 0.166666666666667 0 0 2 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.41666666666666 8 35.16666666666667 0.121323139941841 0.271069160022998 0.447572641356723 -0.149746020081156 0.0425731595579724 0.124809542275725 0.414055683687334 0.27972026867704203 0.126769233568262 0.237503853129159 63 0 937 0.937 0.063 0.126 N all ss13 7 --- CCC AAT 1 CAA---TCA:CCCCAATCA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.75 6 34.5 0.120711601905809 0.197860943283853 0.610083020440449 -0.0771493413780436 0.0421509140699509 0.0893499235197031 NaN NaN 0.0842769669188606 0.359967942908827 156 0 844 0.844 0.156 0.312 N all ss13 8 TCA --T CAA 1 ---TCAAAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.75 6 35.5 0.118913503095032 0.191510018856633 0.620925755242351 -0.0725965157616013 0.0416136488418733 0.0832137001254123 NaN NaN 0.0759871962711774 0.339386441234261 171 0 829 0.829 0.171 0.342 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA:TCAAACTCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.41666666666667 6 35.833333333333336 0.117744298602214 0.189483161783181 0.621397160012272 -0.0717388631809663 0.040794409565236 0.0859580690578422 NaN NaN 0.0775269075003582 0.354788309578731 166 0 834 0.834 0.166 0.332 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACTCGCGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.75000000000001 6 36.5 0.118913503095032 0.185556129985381 0.640849230388674 -0.0666426268903488 0.040561325393508 0.0840067633568242 0.425818159160288 0.132328363047913 0.0717485338826316 0.352974043606 179 0 821 0.821 0.179 0.358 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:TCGCGTAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 73.75000000000001 6 35.833333333333336 0.101481447315381 0.189483161783181 0.535569738019795 -0.0880017144678001 0.0374616325795007 0.0811765152190786 NaN NaN 0.0769452462683607 0.252751112604211 116 0 884 0.884 0.116 0.232 N all ss13 12 AAT GTA ATG 2 CGTAATGCG:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.41666666666669 6 35.16666666666667 0.10050857327761 0.193580949501978 0.519206944361965 -0.0930723762243682 0.0373082627234926 0.085941571248051 NaN NaN 0.0818868865844768 0.255706863244782 99 0 901 0.901 0.099 0.198 N all ss13 13 GCC ATG CCC 2 AATGCGCCT:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.25000000000001 6 35.333333333333336 0.085501734612358 0.19253988513586 0.44407284522906 -0.107038150523502 0.0362457753848094 0.0890974326411931 NaN NaN 0.0761009302308523 0.159567157037314 53 0 947 0.947 0.053 0.106 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC:GCGCCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.75000000000001 6 35.50000000000001 0.0848961862428276 0.191510018856633 0.443298928952547 -0.106613832613806 0.0353616390764446 0.08268232955443 NaN NaN 0.0734656338733861 0.146722264362252 68 0 932 0.932 0.068 0.136 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT:CCTCGCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.66666666666669 6 34.91666666666667 0.0987338945676827 0.195163947524611 0.505902323764137 -0.0964300529569282 0.0377947938062697 0.0881676266490072 0.39271302492834 0.197668017640923 0.0786873007104158 0.220392795557121 73 0 927 0.927 0.073 0.146 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA:CGCATTACG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.83333333333336 6 34.75000000000001 0.0985020015458152 0.196233824001589 0.501962401471714 -0.0977318224557738 0.0373822604155088 0.0894490770552276 NaN NaN 0.0819441672308975 0.233001161206187 75 0 925 0.925 0.075 0.15 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT:ATTACGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.50000000000001 7 34.16666666666668 0.112623333869567 0.239297754894712 0.470640996691007 -0.126674421025144 0.0391974893704086 0.0992526204684615 0.238006206274456 0.04799286338812 0.0890631761019186 0.154939616613936 37 0 963 0.963 0.037 0.074 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT:ACGTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.83333333333334 7 34.50000000000001 0.112096321732094 0.236579217337833 0.473821508894506 -0.12448289560574 0.0403944799196004 0.0980648121094411 0.291944634213779 0.104592796904835 0.0873200672882507 0.153985795419455 39 0 961 0.961 0.039 0.078 N all ss13 19 GGT TTG GT- 1 TTTGGT---:TTTGGTGGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.66666666666667 7 34.16666666666668 0.112359208671495 0.239297754894712 0.469537245432711 -0.126938546223217 0.0395782676011022 0.0954568874482342 NaN NaN 0.0871336137540506 0.145164314824834 31 1 968 0.968 0.031 0.062 N all ss13 20 --- GTG GAC 1 GGT---GTC:GGTGGACCC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.5 7 33.83333333333334 0.112623333869567 0.242080044197288 0.465231796544876 -0.129456710327721 0.0386023947136754 0.0993191640805523 NaN NaN 0.0893957121329278 0.147580391211693 41 0 959 0.959 0.041 0.082 N all ss13 21 CCC --G CCA 1 ---GTCTCA:GGACCCACA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 78.08333333333333 7 34.250000000000014 0.110163273884948 0.238612230829161 0.4616832653638 -0.128448956944213 0.0380469139530894 0.0985054496416139 NaN NaN 0.0912047824330177 0.159025180199993 38 0 962 0.962 0.038 0.076 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:GTCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.58333333333333 6 34.41666666666668 0.094827365833507 0.198409364312814 0.477937955004993 -0.103581998479307 0.0353300153504711 0.0897105036732376 NaN NaN 0.0752705956787144 0.16878190868824 57 0 943 0.943 0.057 0.114 N all ss13 23 GAT CAG ATA 2 ACAGATTCA:TCAGATACC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.16666666666666 5 33.83333333333334 0.0940829130843776 0.164591833676269 0.571613493713344 -0.0705089205918911 0.0367908660115136 0.0807384513894385 NaN NaN 0.06695155644484 0.292279854810948 128 0 872 0.872 0.128 0.256 N all ss13 24 ACC ATA CAA 2 GATACCTCA:GATTCAACT 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.16666666666666 5 34.16666666666668 0.095366381613935 0.162798378928371 0.585794417866379 -0.0674319973144357 0.0360830716810529 0.0747591596377634 NaN NaN 0.0689398042638671 0.328010702135024 118 0 882 0.882 0.118 0.236 N all ss13 25 ACT CAA CAG 2 ACCTCAGAC:TCAACTGAC 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.41666666666666 4 33.91666666666668 0.0950422383375635 0.128312053707491 0.740711691469207 -0.0332698153699277 0.0360999920538832 0.0660678989310742 NaN NaN 0.0541807488169697 0.539180743713253 280 1 719 0.719 0.28 0.56 N all ss13 26 GAC CAG ACA 2 ACTGACAAT:TCAGACAAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.58333333333333 4 33.750000000000014 0.094827365833507 0.129003442367267 0.735076243651995 -0.0341760765337596 0.0373188076993353 0.0689376592261977 NaN NaN 0.0574833086114795 0.552151575814437 267 0 733 0.733 0.267 0.534 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC:GACAATAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.58333333333333 4 33.750000000000014 0.094827365833507 0.129003442367267 0.735076243651995 -0.0341760765337596 0.0363865285171922 0.0658406486799946 NaN NaN 0.0540671135003339 0.527318464541525 292 1 707 0.707 0.292 0.584 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG:AATAATCAG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.08333333333333 4 33.58333333333334 0.0954749219278059 0.129702340924675 0.736107931800966 -0.0342274189968686 0.0356553285789966 0.0677731711778486 NaN NaN 0.0555187565683715 0.537563317272788 270 1 729 0.729 0.27 0.54 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AATCAGAAT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.75 4 33.91666666666668 0.0959115685461867 0.128312053707491 0.747486816514005 -0.0324004851613046 0.0361538423826632 0.0649227772380281 NaN NaN 0.0570563159136464 0.570124255049132 280 0 720 0.72 0.28 0.56 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGCA:CAGAATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.33333333333333 4 33.33333333333334 0.0951500406590924 0.130765040358583 0.727641274748759 -0.0356149996994909 0.0367382132404592 0.0718553471730322 NaN NaN 0.0601620250544031 0.553860818862451 273 0 727 0.727 0.273 0.546 N all ss13 31 GCA ATG CAG 2 AATGCAGAA:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 77 5 34.000000000000014 0.111834664347976 0.163690174515013 0.683209390418962 -0.0518555101670376 0.0396580123375847 0.0753102400404665 NaN NaN 0.0588028700546549 0.377856096527464 179 0 821 0.821 0.179 0.358 N all ss13 32 GAA CAG AAC 2 GCAGAACGT:GGAGGACGC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.33333333333333 5 34.83333333333334 0.112888706112188 0.159326652781303 0.70853623133063 -0.0464379466691147 0.0392202815706042 0.0726406539772947 NaN NaN 0.059455317459865 0.434769418169279 188 0 812 0.812 0.188 0.376 N all ss13 33 CGC AAC GCA 2 GAACGTGCT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.5 5 35.000000000000014 0.0975852360853966 0.158481820250405 0.615750348722709 -0.0608965841650085 0.0385356649206917 0.0724438611190503 NaN NaN 0.0577402767337448 0.291579077871088 132 0 868 0.868 0.132 0.264 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGTGCTGGA 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77 5 35.16666666666668 0.0969087986100047 0.157645932730055 0.614724382239195 -0.0607371341200503 0.0372088395295131 0.0747352101011354 NaN NaN 0.0601336540016146 0.312478211841352 122 1 877 0.877 0.122 0.244 N all ss13 35 GGA ATG GAG 2 AATGGGGCA:GCTGGAGCG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.5 4 35.00000000000001 0.0817133878414162 0.123992985319038 0.659016214757353 -0.0422795974776214 0.0337992599200421 0.0631227578445149 NaN NaN 0.050768306398626 0.404960291233054 203 0 797 0.797 0.203 0.406 N all ss13 36 GCA GAG CAA 2 GGAGCGCGG:GGGGCAAGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.83333333333333 4 35.16666666666668 0.0813437533100697 0.123354245726484 0.659432132481562 -0.0420104924164139 0.0335672464758909 0.064884974312223 NA NA 0.054753209952101 0.442921033695371 196 2 802 0.802 0.196 0.392 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCGCGGCCA 1:1 FALSE 1.5 0.833333333333333 0.5 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.16666666666667 4 34.83333333333334 0.0809774510729235 0.124638389543236 0.649699112526104 -0.0436609384703128 0.0339116809602428 0.0651814060856279 NaN NaN 0.0529671803135984 0.409768134745692 216 0 784 0.784 0.216 0.432 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666667 4 35.33333333333334 0.0815281512006671 0.122722067836352 0.664331628679725 -0.0411939166356844 0.0341287562266937 0.0655971196773215 NA NA 0.0515375615963259 0.424117112707537 205 1 794 0.794 0.205 0.41 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:CCAAAGCAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666667 4 35.33333333333334 0.0815281512006671 0.122722067836352 0.664331628679725 -0.0411939166356844 0.03372703237789 0.0642630347199938 NaN NaN 0.0541021748369941 0.446412440511461 191 1 808 0.808 0.191 0.382 N all ss13 40 CAA AAC AAA 2 AAACAGCGC:AAGCAAAGA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.66666666666667 4 35.41666666666667 0.0826523551002107 0.122408407943652 0.675217956745732 -0.0397560528434413 0.0343259505250517 0.0662371291727178 NA NA 0.0530967432822382 0.454009418998323 213 0 787 0.787 0.213 0.426 N all ss13 41 AGA AAA GAA 2 CAAAGAAGA:CAGCGCCGA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.66666666666667 4 35.91666666666667 0.0838080288297114 0.120559681536883 0.695158014365456 -0.0367516527071717 0.0348313351753592 0.0651457415839658 NaN NaN 0.0534076147719849 0.491367727888791 223 0 777 0.777 0.223 0.446 N all ss13 42 AGA GAA GAC 2 AGAAGACCG:CGCCGACCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333333 4 36.16666666666667 0.0694941228620286 0.119656146346601 0.580781890306988 -0.0501620234845725 0.0332825524516842 0.0629316024341313 NA NA 0.0475348413746676 0.291302517107138 128 1 871 0.871 0.128 0.256 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 AGACCGCAA:CGACCCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75 4 36.66666666666667 0.069817817299509 0.117889187641809 0.592232576168404 -0.0480713703423002 0.0316551983812524 0.0601170771263879 NA NA 0.0482628191005063 0.319234012384924 121 5 874 0.874 0.121 0.242 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT:CCGCAAGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.33333333333333 4 36.83333333333334 0.0704743443137486 0.117311764843583 0.600744046496234 -0.0468374205298342 0.0337396216694837 0.0642944814504551 NaN NaN 0.0470637526375393 0.31964340425121 151 0 849 0.849 0.151 0.302 N all ss13 45 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCCT:CAAGGTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.16666666666666 4 35.83333333333334 0.0706404112947758 0.120863906464681 0.584462420262895 -0.0502234951699056 0.0304410355371365 0.0653327050781914 NaN NaN 0.0486701365158382 0.302111445089588 124 2 874 0.874 0.124 0.248 N all ss13 46 CCT GCC CTC 2 GGCCCTCCT:GGTTTACCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.16666666666666 4 35.83333333333334 0.0706404112947758 0.120863906464681 0.584462420262895 -0.0502234951699056 0.0330119544933166 0.0635078745308632 NA NA 0.0509133871413443 0.323912489619924 129 0 871 0.871 0.129 0.258 N all ss13 47 CCC CTC CCA 2 CCTCCTAAC:TTACCCAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.5 3 35.33333333333334 0.0557100557871529 0.0901082338815474 0.618257104676883 -0.0343981780943945 0.0285924740286302 0.0531293253849629 NA NA 0.0457680135506123 0.452305587264653 233 6 761 0.761 0.233 0.466 N all ss13 48 AAC CCA ACA 2 CCCAATAAT:CCTAACAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.66666666666667 3 35.16666666666667 0.0555809791152914 0.0905621374661099 0.61373307510648 -0.0349811583508185 0.0284790862381293 0.0531815347774354 NA NA 0.0446980696614697 0.433856140387658 211 5 784 0.784 0.211 0.422 N all ss13 49 AAC ACA ACA 2 AACAACACA:AATAATACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74 3 35.16666666666667 0.0561009098120238 0.0905621374661099 0.619474223794882 -0.0344612276540861 0.0282548986631928 0.0571411555388939 NA NA 0.0452658575302165 0.446473543013399 191 9 800 0.8 0.191 0.382 N all ss13 50 ACA ACA CAG 2 AACACAGCA:AATACTGCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.83333333333334 3 35.333333333333336 0.0562324166616758 0.0901082338815474 0.624054142883287 -0.0338758172198716 0.0276049297966562 0.0539700003117791 NA NA 0.0447386713120518 0.448934129895568 223 6 771 0.771 0.223 0.446 N all ss13 51 GCA CAG CAT 2 ACAGCATCC:ACTGCGTCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.33333333333334 3 34.833333333333336 0.0558397336460622 0.0914838201648646 0.61037824552399 -0.0356440865188023 0.0272927247847384 0.0558326000888317 NA NA 0.0470694803430073 0.448890905347544 192 4 804 0.804 0.192 0.384 N all ss13 52 TCC CAT CCT 2 GCATCCTGG:GCGTCTTGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666669 3 35.41666666666667 0.055774819305903 0.0898829861073045 0.620526995390626 -0.0341081668014015 0.0293547264047093 0.0548779577125807 NA NA 0.0453477641265868 0.451962900071133 218 4 778 0.778 0.218 0.436 N all ss13 53 TGG CCT GGT 2 TCCTGGTTC:TCTTGGTTC 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 3 35.083333333333336 0.056298401666626 0.0907908105289243 0.620089206590906 -0.0344924088622983 0.0287255824280884 0.0550867102470354 NA NA 0.0473229199885128 0.466079220213795 208 3 789 0.789 0.208 0.416 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666669 3 34.083333333333336 0.0565638983071325 0.0936278982824406 0.604135085212531 -0.0370639999753082 0.0280924292950206 0.0567207165308239 NA NA 0.0466810127055113 0.427204461838302 196 6 798 0.798 0.196 0.392 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333336 3 33.583333333333336 0.0556454425645553 0.0951140793534504 0.585038965238501 -0.0394686367888951 0.0286594871818673 0.0580218974248423 NA NA 0.0488058999045524 0.418695914838524 193 5 802 0.802 0.193 0.386 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000003 3 32.91666666666667 0.0551338852123344 0.097170738715697 0.567391850067597 -0.0420368535033626 0.0276507876561849 0.0603593525393916 NA NA 0.0461262039771613 0.362113986895959 175 11 814 0.814 0.175 0.35 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000003 3 33.583333333333336 0.0551338852123344 0.0951140793534504 0.579660609523992 -0.039980194141116 0.0283337151889896 0.0589737925334089 NA NA 0.0498973263714169 0.422987378385244 184 6 810 0.81 0.184 0.368 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000003 3 33.583333333333336 0.0551338852123344 0.0951140793534504 0.579660609523992 -0.039980194141116 0.0272454748176821 0.0574654808009559 NA NA 0.0504836568230016 0.428393733694704 176 8 816 0.816 0.176 0.352 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.58333333333336 3 33.333333333333336 0.0692533163185839 0.0958750286324137 0.722329028803759 -0.0266217123138297 0.0320167978902469 0.0576477051271827 NA NA 0.0498597535158027 0.593388659225768 319 4 677 0.677 0.319 0.638 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC:CAGCATGGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.25000000000001 3 33.00000000000001 0.0686192553184994 0.0969087986100047 0.708080755336237 -0.0282895432915053 0.0309019908694472 0.0592157151805565 NA NA 0.0524109937618095 0.589360117280233 301 4 695 0.695 0.301 0.602 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG:CATGGTAAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.91666666666669 3 33.66666666666667 0.0698992129639131 0.0948631103318397 0.73684293841304 -0.0249638973679265 0.0314639693234844 0.0601930786130512 NA NA 0.0509410091984424 0.624094964646715 305 2 693 0.693 0.305 0.61 N all ss13 62 AAA GCA AAG 2 GGCAAGGAG:GGTAAAGAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.58333333333336 3 34.66666666666667 0.0702267037754945 0.0919517415692493 0.763734352139556 -0.0217250377937548 0.0319706479373079 0.0555897342164467 NA NA 0.0505169577053909 0.667156100458303 321 2 677 0.677 0.321 0.642 N all ss13 63 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGT:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.08333333333336 3 34.5 0.0707237388415596 0.0924244803179611 0.765205696567122 -0.0217007414764014 0.0332353401222292 0.054790800404139 NA NA 0.0492298362598374 0.65935441607214 326 4 670 0.67 0.326 0.652 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGGTCTC:GAGGAACTT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.25000000000003 3 34.666666666666664 0.0715679639391767 0.0919517415692493 0.778320918318644 -0.0203837776300726 0.0346702748462315 0.0553867098226191 NA NA 0.0501264583774823 0.684267217832323 376 5 619 0.619 0.376 0.752 N all ss13 65 CTC AAC TCT 2 GAACTTAGA:GGTCTCTCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.50000000000003 3 34.75 0.0581404786806199 0.0917171833187057 0.633910425253565 -0.0335767046380858 0.0303369037127846 0.0553360955519636 NA NA 0.0479478935806186 0.483755666467155 201 6 793 0.793 0.201 0.402 N all ss13 66 AGA TCT CCT 2 CTCTCCTTT:CTTAGATTC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.75 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.33333333333336 3 33.916666666666664 0.0582817382454872 0.0941180977157371 0.619240503792526 -0.0358363594702499 0.0300852003889646 0.05787656971213 NA NA 0.0508197978147518 0.48070735462528 199 6 795 0.795 0.199 0.398 N all ss13 67 TTC CCT TCC 2 AGATTCCCT:TCCTTTCCG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333336 2 33.833333333333336 0.043281238215485 0.0615730216404005 0.702925356956763 -0.0182917834249155 0.0256328764540986 0.043492976951546 NA NA 0.0429425309288994 0.67013728251448 354 17 629 0.629 0.354 0.708 N all ss13 68 CCG TCC CGC 2 TTCCCTCGA:TTTCCGCGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333336 2 34.166666666666664 0.0439149815636805 0.0609472230590743 0.720541139685971 -0.0170322414953938 0.0251741254896335 0.0441375949294497 NA NA 0.0416777192915077 0.682785234578121 331 23 646 0.646 0.331 0.662 N all ss13 69 CGA CGC GAG 2 CCGCGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333336 2 34.166666666666664 0.0439149815636805 0.0609472230590743 0.720541139685971 -0.0170322414953938 0.0259318627132008 0.0441391170137466 NA NA 0.0422824672296103 0.687080332954534 327 17 656 0.656 0.327 0.654 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 CGAGGACAG:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333336 2 34.333333333333336 0.043281238215485 0.0606390724718212 0.713751653038521 -0.0173578342563361 0.0264211339440381 0.0437435685137496 NA NA 0.0408571410098666 0.670951773184735 322 11 667 0.667 0.322 0.644 N all ss13 71 CAG GAC AGG 2 GGACAGGGA:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.4166666666667 2 34.25 0.0432292511544661 0.0607927570603562 0.711092130787015 -0.0175635059058902 0.0256326013317206 0.0451319616608095 NA NA 0.0430923932603443 0.683583613261744 353 10 637 0.637 0.353 0.706 N all ss13 72 GGA AGG GAG 2 CAGGGAGTG:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.58333333333337 3 34.416666666666664 0.0437548116643347 0.0926626795339059 0.472194543525202 -0.0489078678695712 0.0257265205042683 0.0552992754778866 NA NA 0.0542845111306411 0.367612577908226 157 6 837 0.837 0.157 0.314 N all ss13 73 GTG GAG TGC 2 GGAGTGCCC:GGCGTTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.00000000000003 3 34.166666666666664 0.0585663277285774 0.0933847109044368 0.62715113813984 -0.0348183831758594 0.0286754587151018 0.0549177434650025 NaN NaN 0.0563826456743717 0.536880428525348 290 1 709 0.709 0.29 0.58 N all ss13 74 CCA TGC CAA 2 GTGCCCGTT:GTTCCAATC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.00000000000003 3 34.166666666666664 0.0585663277285774 0.0933847109044368 0.62715113813984 -0.0348183831758594 0.0287880718297684 0.0565202713499546 NaN NaN 0.0576369864136095 0.545778547323543 295 2 703 0.703 0.295 0.59 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCCGTTAAT 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.4166666666667 3 34.75 0.0590711081381159 0.0917171833187057 0.644057154839255 -0.0326460751805897 0.0309014619556946 0.0558595751341809 NA NA 0.0527870066794216 0.536279360275464 284 2 714 0.714 0.284 0.568 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:GTTAATACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.75000000000003 2 34.416666666666664 0.0587816013967042 0.0604861633757489 0.971818976706198 -0.00170456197904471 0.0293059270154904 0.0428445533888953 NA NA 0.0454485326511847 0.970082094554237 504 9 487 0.487 0.504 0.974 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT:AATACCAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.4166666666667 2 35.08333333333333 0.059957004495899 0.0592901175479514 1.01124786010769 6.66886947947656e-4 0.0305994437773489 0.0450060886390623 NA NA 0.0446790386924971 0.98809108123106 510 8 482 0.482 0.51 0.964 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.9166666666667 2 35.25 0.0595107578353943 0.0589984642956841 1.0086831673642 5.12293539710197e-4 0.0302502995292891 0.0423629169180059 NA NA 0.0437274132341108 0.990652505480429 492 8 500 0.5 0.492 0.984 N all ss13 79 AGT ATA GTA 2 AATAGTACC:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.9166666666667 2 35.25 0.0595107578353943 0.0589984642956841 1.0086831673642 5.12293539710197e-4 0.0299177895464652 0.0403142847252392 NA NA 0.0430715958501528 0.990510185179123 507 8 485 0.485 0.507 0.97 N all ss13 80 ACC GTA CCA 2 AGTACCAGG:AGTGGTCCA 1:1 TRUE 1 1 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.1666666666667 2 35 0.0748750939167603 0.0594370287406054 1.25973817169646 0.015438065176155 0.0340275127152782 0.0440258850063549 NA NA 0.0462030568159452 0.738277579315825 665 2 333 0.333 0.665 0.666 N all ss13 81 AGG CCA CAG 2 ACCAGGGAC:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.00000000000003 1 34.166666666666664 0.0585663277285774 0.0298546878003148 1.96171295175828 0.0287116399282627 0.0286328366874294 0.0312168333897174 NA NA 0.0413171904434332 0.487113053630179 783 5 212 0.212 0.783 0.424 N all ss13 82 GAC CAG ACG 2 AGGGACGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.1666666666667 1 34.33333333333333 0.0433855884614561 0.0297068535712844 1.46045720922104 0.0136787348901718 0.023975908170304 0.0296024415132358 NA NA 0.0399862984934136 0.73228651203721 626 16 358 0.358 0.626 0.716 N all ss13 83 GAC ACG ACC 2 GACGACCAA:GATGACCAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 34.666666666666664 0.0440224147463932 0.029415534864961 1.49657026290661 0.0146068798814323 0.0259606311456327 0.0300285008823272 NA NA 0.0407056877908195 0.719713852099743 666 20 314 0.314 0.666 0.628 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333336 1 34.83333333333333 0.0439149815636805 0.0292720079293014 1.50023810015853 0.0146429736343791 0.0251611593710445 0.0305794808736979 NA NA 0.0390961084968124 0.708004178981292 673 12 315 0.315 0.673 0.63 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.50000000000003 1 35 0.0444574574471551 0.0291298749871979 1.52618085270512 0.0153275824599572 0.0255208504418045 0.0298906365648626 NA NA 0.0381724479840354 0.688026109873342 678 18 304 0.304 0.678 0.608 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.83333333333337 1 35.166666666666664 0.0449011870069398 0.0289891158257093 1.54889812013924 0.0159120711812305 0.0254879934481941 0.0295660499831956 NA NA 0.039477361687776 0.686898015122118 685 14 301 0.301 0.685 0.602 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC:GGCTACTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.33333333333337 1 35.666666666666664 0.0452398426751419 0.0285748846742028 1.58320298370212 0.0166649580009391 0.025853736283725 0.0286309955312914 NA NA 0.0399410923424179 0.676504030503055 665 18 317 0.317 0.665 0.634 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA:TACTATCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.08333333333337 1 35.583333333333336 0.0447337539717067 0.0286430990492925 1.56176375659364 0.0160906549224142 0.0251425543443928 0.0282404285631792 NA NA 0.0395644946679639 0.684232518941159 681 16 303 0.303 0.681 0.606 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA:TATCGCAGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.58333333333337 1 35.083333333333336 0.0444026073250892 0.0290593249318817 1.52799858321464 0.0153432823932074 0.0263759338576924 0.0287178545391858 NA NA 0.0401075868910235 0.702051137465172 633 14 353 0.353 0.633 0.706 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT:CGCAGAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333337 1 34.833333333333336 0.044076328753575 0.0292720079293014 1.5057500961338 0.0148043208242736 0.0254823979091039 0.0297796578413613 NA NA 0.0386496312065433 0.70169075653967 665 14 321 0.321 0.665 0.642 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.4166666666667 1 35 0.0451830456487547 0.0291298749871979 1.55108958306934 0.0160531706615568 0.0267821240219672 0.030592594447053 NA NA 0.0401329816720016 0.689156920667193 669 23 308 0.308 0.669 0.616 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000003 1 34.333333333333336 0.0449572769752751 0.0297068535712844 1.51336380567521 0.0152504234039907 0.0248520788399036 0.0308560977638904 NA NA 0.0414991339602229 0.71325522702735 657 16 327 0.327 0.657 0.654 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.9166666666667 1 34.166666666666664 0.0448452368647073 0.0298546878003148 1.50211709345808 0.0149905490643925 0.0256523954544646 0.031563029508513 NA NA 0.0401822732599084 0.709101006440331 664 22 314 0.314 0.664 0.628 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.08333333333337 1 34.5 0.0447337539717067 0.0295604764056575 1.51329611058451 0.0151732775660492 0.0249313157242809 0.0304092216827829 NA NA 0.0389947696659722 0.697194344956205 648 12 340 0.34 0.648 0.68 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.25000000000004 1 35.5 0.0446228241484838 0.0287116399282627 1.5541719058882 0.0159111842202211 0.0245577939441148 0.0281857674474663 NA NA 0.0400043696453172 0.690824682566015 686 17 297 0.297 0.686 0.594 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 1 35.5 0.0441845540246642 0.0287116399282627 1.53890736074502 0.0154729140964015 0.0255860092071768 0.0279256913179048 NA NA 0.0387531346493724 0.689695219745463 687 13 300 0.3 0.687 0.6 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333337 1 36 0.044076328753575 0.0283052459871352 1.55717879200229 0.0157710827664398 0.0240208670037319 0.02943920696841 NA NA 0.0381690459916488 0.67946713287662 681 4 315 0.315 0.681 0.63 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC:GGTGGTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.25000000000003 1 36.33333333333333 0.0439686325106426 0.0280406490537152 1.56803191061717 0.0159279834569274 0.0251689002570599 0.0284697051784427 NA NA 0.038099311037853 0.675899690096703 706 16 278 0.278 0.706 0.556 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGATGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.9166666666667 1 35.666666666666664 0.0435430609699594 0.0285748846742028 1.52382280686052 0.0149681762957566 0.0251225467239595 0.028876364930307 NA NA 0.0400184375969364 0.708380507856284 664 13 323 0.323 0.664 0.646 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GATGGTAAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.25000000000003 1 35.666666666666664 0.0439686325106426 0.0285748846742028 1.5387160092491 0.0153937478364398 0.024650771546788 0.0276328763839999 NA NA 0.0385543450824574 0.68969131769615 663 20 317 0.317 0.663 0.634 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAGATG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.75000000000003 1 36.166666666666664 0.0442933122327008 0.0281723261817364 1.5722277225874 0.0161209860509644 0.024695099304846 0.0287389836804113 NA NA 0.0394806425294627 0.68303410787609 667 21 312 0.312 0.667 0.624 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA:AAGATGAAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.00000000000003 1 35.916666666666664 0.0441303750172001 0.0283721774047871 1.55541023121314 0.015758197612413 0.0255404457145287 0.0294566885006867 NA NA 0.0375661369402378 0.674866253567062 703 16 281 0.281 0.703 0.562 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAA:ATGAAAGAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 36.416666666666664 0.0438080716173109 0.0279752710599065 1.56595700265065 0.0158328005574043 0.0244982044406282 0.0283076821881651 NA NA 0.038316596033277 0.679452763878987 676 17 307 0.307 0.676 0.614 N all ss13 104 GAA AAG AAC 2 AAAGAACTC:AAAGAGCTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 37.416666666666664 0.0438080716173109 0.0272138698048234 1.60977001549211 0.0165942018124875 0.0242579939150881 0.0274298051092247 NA NA 0.036769135757914 0.651767644657576 697 14 289 0.289 0.697 0.578 N all ss13 105 CTC AAC TCA 2 GAACTCAGC:GAGCTCAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 37.74999999999999 0.0440224147463932 0.0269691977905829 1.63232199519724 0.0170532169558104 0.0254429601595553 0.0277275441505825 NA NA 0.0365230049148146 0.640559162709371 676 20 304 0.304 0.676 0.608 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTCAGCCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 38.416666666666664 0.0440224147463932 0.0264928206228063 1.6616733783528 0.017529594123587 0.0247473662478752 0.0270544129419353 NA NA 0.0365313810586557 0.63133384401238 697 14 289 0.289 0.697 0.578 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA:AGCCCGCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 37.74999999999999 0.0440224147463932 0.0269691977905829 1.63232199519724 0.0170532169558104 0.0255942838637841 0.0279733298825718 NA NA 0.036930299301416 0.644247963011547 710 14 276 0.276 0.71 0.552 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG:CCGCGCTGG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 37.74999999999999 0.0440224147463932 0.0269691977905829 1.63232199519724 0.0170532169558104 0.0242112752947417 0.0268804064930313 NA NA 0.0385616661529157 0.65832106546303 687 24 289 0.289 0.687 0.578 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:CGCTGGTAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 1 38.166666666666664 0.0441845540246642 0.0266694765273651 1.65674620494809 0.0175150774972991 0.0258828942679307 0.0266162110527686 NA NA 0.0377517490391366 0.642680655035127 673 15 312 0.312 0.673 0.624 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.9166666666667 1 38.166666666666664 0.0448452368647073 0.0266694765273651 1.68151920112464 0.0181757603373422 0.0250017685062838 0.0279517539561763 NA NA 0.0378081901293604 0.630704099379624 704 17 279 0.279 0.704 0.558 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAC:TACTTCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.33333333333337 2 37.666666666666664 0.0445675653531006 0.0550706014161129 0.809280527306185 -0.0105030360630123 0.0253498508749817 0.039208808665914 NA NA 0.0491307183366145 0.83072066819418 439 4 557 0.557 0.439 0.878 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTACTAT:TTCTATTAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.33333333333337 2 36.666666666666664 0.0445675653531006 0.0566306643811089 0.786986447009928 -0.0120630990280083 0.0259581173680256 0.0427826986051964 NA NA 0.0484142787035571 0.803233866275362 451 3 546 0.546 0.451 0.902 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTATCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 3 35.833333333333336 0.0439149815636805 0.0887734500607747 0.494685984758012 -0.0448584684970942 0.0263239601270037 0.0558306894078017 NA NA 0.0623404386834531 0.47178821744886 227 5 768 0.768 0.227 0.454 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA:TATCTAGGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000003 3 35.666666666666664 0.0438080716173109 0.089213957146024 0.491045045178374 -0.0454058855287132 0.0249074915136114 0.0572878606461485 NA NA 0.0615867829315085 0.460960165571001 212 3 785 0.785 0.212 0.424 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.50000000000003 3 35.666666666666664 0.0425646124443371 0.089213957146024 0.47710710079442 -0.0466493447016869 0.0231765689524719 0.0570395094189897 NA NA 0.0625268519738528 0.455625746440975 193 3 804 0.804 0.193 0.386 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGA:GGAACTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.08333333333336 3 36.083333333333336 0.042215127927666 0.0881207952860292 0.479059770064954 -0.0459056673583632 0.0237094246667846 0.0542257497824271 NA NA 0.061725049836478 0.457050658554054 237 0 763 0.763 0.237 0.474 N all ss13 117 GGA CTG GAC 2 ACTGGACCA:ACTGGCCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.9166666666667 3 36.25 0.0423143935004423 0.0876910035441767 0.482539733726793 -0.0453766100437344 0.0236492602441556 0.0546355492489642 NA NA 0.0637849479801718 0.476836417935725 204 0 796 0.796 0.204 0.408 N all ss13 118 CCA GAC CAG 2 GGACCAGAG:GGCCCAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000003 3 35.916666666666664 0.0421163271222965 0.0885548256923263 0.475596070491121 -0.0464384985700298 0.0246297505642239 0.0573488717377641 NA NA 0.0591380695923256 0.432303739731537 212 2 786 0.786 0.212 0.424 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT:CCAGAGGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.9166666666667 3 35.583333333333336 0.0417257068817799 0.0894358561096487 0.466543383121688 -0.0477101492278687 0.0241855327962595 0.0554383598874002 NA NA 0.065202640603974 0.464338802680571 230 2 768 0.768 0.23 0.46 N all ss13 120 GCC AAG CCG 2 GAAGCTTCA:GAGGCCGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.4166666666667 3 35.416666666666664 0.0420179878270026 0.0898829861073045 0.467474320188256 -0.0478649982803019 0.0248572434502272 0.0554759319094893 NA NA 0.0633403358235179 0.449841330832504 221 0 779 0.779 0.221 0.442 N all ss13 121 GCA CCG CAC 2 GCCGCATTA:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.9166666666667 3 35.583333333333336 0.0417257068817799 0.0894358561096487 0.466543383121688 -0.0477101492278687 0.024038390872714 0.0581336062460999 NA NA 0.0637100046974565 0.453938988613368 223 2 775 0.775 0.223 0.446 N all ss13 122 CTT CAC TAC 2 GCATTACCT:TCACTTCCC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.58333333333337 2 34.916666666666664 0.0413422677171007 0.059584670169267 0.693840674113935 -0.0182424024521663 0.0241981578387462 0.0457498446613925 NA NA 0.0482956623075087 0.705636072272096 377 4 619 0.619 0.377 0.754 N all ss13 123 CCC TAC CCT 2 CTTCCCTAC:TTACCTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000004 2 35.75 0.0274316291149154 0.0581404786806199 0.471816361636858 -0.0307088495657045 0.0189522888396727 0.0442902831970533 NA NA 0.0512350596050759 0.548924982106743 279 9 712 0.712 0.279 0.558 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCTTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.91666666666671 2 36.08333333333333 0.0275576350296145 0.0575822255219405 0.47857884581265703 -0.0300245904923261 0.0195300283275626 0.0440877500948386 NA NA 0.049377083884196 0.543142833432159 261 28 711 0.711 0.261 0.522 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.75000000000004 2 36.25 0.0276210731371878 0.0573071018565008 0.481983423387071 -0.029686028719313 0.0191610024971085 0.0448563443967441 NA NA 0.0505872663970386 0.557319171841242 282 22 696 0.696 0.282 0.564 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.00000000000004 2 36.66666666666667 0.0275260251378209 0.0566306643811089 0.486062196844069 -0.0291046392432879 0.0198916136818035 0.0446170084231151 NA NA 0.0475910325411216 0.540830753888248 251 14 735 0.735 0.251 0.502 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.83333333333337 2 35.833333333333336 0.0272138698048234 0.0579999025523778 0.4692054401341 -0.0307860327475544 0.020041562690941 0.0450310693747111 NA NA 0.0473682197902757 0.515737361593759 246 12 742 0.742 0.246 0.492 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AACAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000004 2 35.16666666666667 0.0269691977905829 0.0591439311842398 0.455992647945076 -0.0321747333936569 0.0199056422454112 0.0469862787574246 NA NA 0.0501854771047509 0.5214470470557 229 24 747 0.747 0.229 0.458 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC:AAAGATGGC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.1666666666667 2 34.91666666666667 0.0410124947055404 0.059584670169267 0.688306146346583 -0.0185721754637266 0.0240946710959701 0.0451101585521105 NA NA 0.0516018952568875 0.718912448124623 353 5 642 0.642 0.353 0.706 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC:GATGGCATA 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000003 2 35.16666666666667 0.0274316291149154 0.0591439311842398 0.463811393082122 -0.0317123020693244 0.0195639993730346 0.0456543033841328 NA NA 0.0507424026610625 0.531993041534099 278 14 708 0.708 0.278 0.556 N all ss13 131 ATA GCA TAG 2 GGCATAGTT:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.4166666666667 2 36.00000000000001 0.0277488297186241 0.0577207808520962 0.480742452007497 -0.0299719511334721 0.0207504713844891 0.0412601260720084 NA NA 0.0534562374253444 0.57501432707179 263 18 719 0.719 0.263 0.526 N all ss13 132 GTA TAG TAT 2 ATAGTTTGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333337 2 36.00000000000001 0.0276848040229394 0.0577207808520962 0.4796332207265 -0.0300359768291568 0.0198892021515775 0.0441088679863084 NA NA 0.0492686387499129 0.542102407561681 275 19 706 0.706 0.275 0.55 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTT:GTTTGGGTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000004 2 36.00000000000001 0.0274316291149154 0.0577207808520962 0.475247020396454 -0.0302891517371808 0.0200075071534952 0.0448769641591849 NA NA 0.0514929998697151 0.556385425145983 267 14 719 0.719 0.267 0.534 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCT:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333337 2 35.66666666666667 0.0276848040229394 0.0582817382454872 0.475016786670447 -0.0305969342225478 0.0200573143664995 0.0470979863874068 NA NA 0.0508589806990468 0.547438184607504 261 14 725 0.725 0.261 0.522 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCTACA:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.75000000000004 2 35.5 0.0276210731371878 0.0585663277285774 0.47162036973184 -0.0309452545913896 0.0190748663960204 0.0422856650763585 NA NA 0.0496999962336186 0.533520472128522 252 13 735 0.735 0.252 0.504 N all ss13 136 ACA CAA CAG 2 GCAACTGAG:GCTACAGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333337 2 35.66666666666667 0.0276848040229394 0.0582817382454872 0.475016786670447 -0.0305969342225478 0.0202783239395043 0.04485608754843 NA NA 0.0506581526944126 0.545851385524494 243 19 738 0.738 0.243 0.486 N all ss13 137 GAA CAG AAG 2 ACAGAAGGA:ACTGAGGGA 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.4166666666667 2 35.833333333333336 0.0277488297186241 0.0579999025523778 0.478428902420398 -0.0302510728337537 0.0193391345878371 0.0459684539873147 NA NA 0.0505850178006006 0.549823679854586 250 23 727 0.727 0.25 0.5 N all ss13 138 GGA AAG GAG 2 GAAGGAGCC:GAGGGAGCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000004 2 36.083333333333336 0.0281063333749098 0.0575822255219405 0.488107799240939 -0.0294758921470307 0.0202025557153482 0.0430588523859727 NA NA 0.0495865148664112 0.552222119373111 253 11 736 0.736 0.253 0.506 N all ss13 139 GCC GAG CCC 2 GGAGCCCTA:GGAGCCTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333337 3 36.583333333333336 0.0281723261817364 0.0868438898173542 0.324401938247895 -0.0586715636356178 0.0206630187874745 0.0516998482289791 NA NA 0.060850270852389 0.334947868113268 128 7 865 0.865 0.128 0.256 N all ss13 140 CTA CCC TAA 2 GCCCTAAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.00000000000003 3 36.91666666666667 0.0283052459871352 0.0860130038580103 0.32908100772601 -0.0577077578708751 0.0210574516669182 0.05303991502214 NA NA 0.0623115899379106 0.354385721158211 134 5 861 0.861 0.134 0.268 N all ss13 141 AAC TAA ACA 2 CTAAACACG:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.6666666666667 3 36.583333333333336 0.0276529018562458 0.0868438898173542 0.318420811347856 -0.0591909879611084 0.0198832708864534 0.0557771179849591 NA NA 0.0603425595133874 0.326634118776317 138 7 855 0.855 0.138 0.276 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACGCCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.6666666666667 3 37.583333333333336 0.0276529018562458 0.0843980831669965 0.327648458573752 -0.0567451813107508 0.0202090183231327 0.0522259868037677 NaN NaN 0.0573098746584521 0.322102436811196 131 6 863 0.863 0.131 0.262 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACGCCTAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.50000000000003 3 37.75000000000001 0.0277167798918218 0.0840037937823711 0.329946763638173 -0.0562870138905493 0.0201533153183913 0.0529900328549006 NA NA 0.0548048249009772 0.304399339488814 141 5 854 0.854 0.141 0.282 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333336 3 37.91666666666667 0.0277809537602618 0.0836131751312665 0.332255696744535 -0.0558322213710047 0.0205340277259236 0.0524343898781724 NA NA 0.0570433332578299 0.327694345683186 137 5 858 0.858 0.137 0.274 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333336 3 37.91666666666667 0.0277809537602618 0.0836131751312665 0.332255696744535 -0.0558322213710047 0.0202016509104863 0.0509552396820053 NA NA 0.059741718971965 0.350015097019414 159 4 837 0.837 0.159 0.318 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333336 3 38.25000000000001 0.0281723261817364 0.0828427466732329 0.340069919372182 -0.0546704204914965 0.0203298022027871 0.0511028686038156 NA NA 0.0570174973090245 0.337641445890948 149 10 841 0.841 0.149 0.298 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.1666666666667 3 37.91666666666667 0.0282386296527662 0.0836131751312665 0.337729426115366 -0.0553745454785003 0.0209759459580524 0.052897354887603 NA NA 0.0603880573615005 0.359153948014029 153 6 841 0.841 0.153 0.306 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC:ATTGGCACG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333336 3 36.91666666666668 0.0277809537602618 0.0860130038580103 0.322985508169468 -0.0582320500977485 0.0192206447875555 0.0539257724598511 NA NA 0.0558736870613134 0.297314869456876 133 4 863 0.863 0.133 0.266 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC:GGCACGCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.00000000000001 3 37.25000000000001 0.0283052459871352 0.085197883292779 0.332229450934425 -0.0568926373056438 0.0212737426896184 0.0543372955857027 NA NA 0.0596841889521379 0.340474585980329 150 3 847 0.847 0.15 0.3 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT:ACGCGCAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666669 3 36.58333333333334 0.0280406490537152 0.0868438898173542 0.322885687325717 -0.0588032407636389 0.0203201252411081 0.0541894727320679 NA NA 0.0566445201202753 0.299218862949183 142 8 850 0.85 0.142 0.284 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCC:CGCAATCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666669 3 36.58333333333334 0.0280406490537152 0.0868438898173542 0.322885687325717 -0.0588032407636389 0.020592151742471 0.0570326165297867 NA NA 0.0617342686901125 0.340832382304431 133 5 862 0.862 0.133 0.266 N all ss13 152 CCC ATC CCA 2 AATCCCAAC:AATCCTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333334 4 36.58333333333334 0.0281723261817364 0.11818004032857 0.2383848076495 -0.090007714146834 0.0193256673349243 0.0648120830122267 NA NA 0.0655315480867315 0.16959633142604 77 1 922 0.922 0.077 0.154 N all ss13 153 AAC CCA ACA 2 CCCAACAAC:CCTAATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.83333333333334 4 36.75000000000001 0.0279752710599065 0.117599765999126 0.23788543133763 -0.0896244949392199 0.0196668458372695 0.0661018307446137 NA NA 0.0691618857271344 0.195021860373434 64 0 936 0.936 0.064 0.128 N all ss13 154 AAC ACA ACA 2 AACAACAAT:AATAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.83333333333334 4 36.75000000000001 0.0279752710599065 0.117599765999126 0.23788543133763 -0.0896244949392199 0.0205926672510905 0.0657337423778152 NA NA 0.0695092067379711 0.197262441882024 58 1 941 0.941 0.058 0.116 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666669 4 36.50000000000001 0.0280406490537152 0.118472334721436 0.236685206885197 -0.0904316856677204 0.020767043481013 0.0637300527078506 NA NA 0.0677486155661579 0.181937785315922 78 1 921 0.921 0.078 0.156 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333334 4 36.16666666666668 0.0281723261817364 0.119656146346601 0.235444037284397 -0.0914838201648646 0.0201692122440232 0.0646324034231372 NA NA 0.0734361559067125 0.212852545761146 75 4 921 0.921 0.075 0.15 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.33333333333334 4 36.500000000000014 0.0725202186018533 0.118472334721436 0.612127875865453 -0.0459521161195823 0.0479421360582364 0.0618142438518054 NA NA 0.0851068802642031 0.589242404725709 283 0 717 0.717 0.283 0.566 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATTGTC 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.83333333333334 4 36.000000000000014 0.0719976858062998 0.120256987556385 0.598698564376913 -0.0482593017500848 0.0480465764736064 0.0654166684759039 NaN NaN 0.0864711427472739 0.576778019595664 289 1 710 0.71 0.289 0.578 N all ss13 159 GTC CCG TCA 2 ACCGTGCTA:ATTGTCATA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000001 4 35.83333333333334 0.0571024790858329 0.120863906464681 0.472452701191809 -0.0637614273788485 0.0487653269830648 0.0678746712843855 NA NA 0.084241683897352 0.449117621439874 230 1 769 0.769 0.23 0.46 N all ss13 160 ATA TCA TAC 2 GTCATACAG:GTGCTACAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.833333333333333 0.5 0.25 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.41666666666669 4 36.16666666666667 0.0573756358851215 0.119656146346601 0.479504293234756 -0.0622805104614796 0.0474276912228828 0.063915086391617 NA NA 0.0838101266845091 0.457412433299627 205 2 793 0.793 0.205 0.41 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 ATACAGTTA:CTACAACTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.33333333333334 3 36.08333333333334 0.0574443341110379 0.0881207952860292 0.651881703116508 -0.0306764611749914 0.0479225820351009 0.054596619010616 NA NA 0.0733205640290449 0.675663288964062 337 4 659 0.659 0.337 0.674 N all ss13 162 CTT AAC TAC 2 CAACTTCCT:CAGTTACCA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000001 3 36.75000000000001 0.0568993130810351 0.0864264476831886 0.658355336894206 -0.0295271346021535 0.0464658790054316 0.0542369424647813 NA NA 0.072094180455445 0.682126281145441 339 5 656 0.656 0.339 0.678 N all ss13 163 CCA TAC CAC 2 CTTCCTCAA:TTACCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666669 2 36.91666666666667 0.0571705240409132 0.0562324166616758 1.01668267940326 9.38107379237392e-4 0.0479320960550873 0.0406202773568445 NA NA 0.065879191435144 0.988638656868065 461 14 525 0.525 0.461 0.922 N all ss13 164 CAA CAC AAG 2 CCACAAGGT:CCTCAAGGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.16666666666669 3 37.75000000000001 0.0726960870999215 0.0840037937823711 0.865390523769146 -0.0113077066824497 0.0494613284327295 0.0497247375703906 NA NA 0.0657347416812787 0.863421609283901 443 5 552 0.552 0.443 0.886 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA:CAAGGTACT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.00000000000001 3 37.25000000000001 0.0750625939177369 0.085197883292779 0.881038249034749 -0.0101352893750421 0.0528352375851609 0.0508814038302614 NA NA 0.0675399771251707 0.880714469691151 456 6 538 0.538 0.456 0.912 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA:GGTACTACC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.75000000000001 3 37.50000000000001 0.0753456127890199 0.0845966206090083 0.890645657552385 -0.00925100781998842 0.0517949871076215 0.0501168501474894 NA NA 0.0678669325941492 0.891575447281774 455 7 538 0.538 0.455 0.91 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG:ACTACCTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.83333333333334 3 37.41666666666667 0.0752510361297835 0.0847960953267638 0.887435156534058 -0.00954505919698029 0.0541098229061282 0.049765421384856 NA NA 0.0673281555947092 0.887262307966637 409 7 584 0.584 0.409 0.818 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA:ACCTTGCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.50000000000001 3 37.41666666666667 0.0903346148069003 0.0847960953267638 1.0653157372258 0.00553851948013651 0.0537581626783514 0.0490022966967637 NA NA 0.0729227685697596 0.939458493343916 530 2 468 0.468 0.53 0.936 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.66666666666669 3 37.91666666666667 0.0914838201648646 0.0836131751312665 1.09413163680534 0.00787064503359805 0.0575057170476238 0.0487696806796035 NA NA 0.07168242618027 0.912568935473662 529 2 469 0.469 0.529 0.938 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.16666666666669 3 38.41666666666667 0.092187504132096 0.0824628375267118 1.11792786783785 0.00972466660538426 0.0573659549676558 0.0483482866870944 NaN NaN 0.0694987330319584 0.888718607424918 542 3 455 0.455 0.542 0.91 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.16666666666669 3 38.75000000000001 0.0936278982824406 0.0817133878414162 1.14580854809431 0.0119145104410244 0.05661662077316 0.0468608463983379 NA NA 0.0698796271770135 0.864616551670776 546 2 452 0.452 0.546 0.904 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 67.83333333333334 3 39.08333333333334 0.0941180977157371 0.0809774510729234 1.16227537998177 0.0131406466428137 0.0589681426657668 0.0447386855127185 NA NA 0.0664131575103349 0.843152959711343 583 1 416 0.416 0.583 0.832 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA:TTCTACGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 67.83333333333334 3 38.41666666666667 0.0941180977157371 0.0824628375267118 1.14133954807521 0.0116552601890253 0.0556204935316607 0.0480455579407564 NA NA 0.0678371097414752 0.863584975498945 568 3 429 0.429 0.568 0.858 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG:TACGCTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.50000000000001 3 37.41666666666667 0.0931427851735378 0.0847960953267638 1.09843247869622 0.00834668984677403 0.0577089003709603 0.0489056209486275 NA NA 0.0708435372946788 0.906211352785668 531 1 468 0.468 0.531 0.936 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAGGGA:GCTGAAGGA 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.16666666666669 3 36.25000000000001 0.092187504132096 0.0876910035441767 1.05127664647667 0.00449650058791931 0.0541781556233956 0.0507583455626829 NaN NaN 0.072355302963305 0.950447578391161 532 5 463 0.463 0.532 0.926 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGAAGT:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 67.91666666666669 3 35.333333333333336 0.093995066639862 0.0901082338815474 1.04313515636567 0.0038868327583146 0.0594290213834563 0.053057788032709 NA NA 0.0719828810604316 0.956937851816095 524 3 473 0.473 0.524 0.946 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGAAGTCGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.08333333333334 3 34.833333333333336 0.0937499681812904 0.0914838201648646 1.02477102521891 0.0022661480164258 0.0581678310189513 0.0521174000033483 NA NA 0.0726262073597011 0.975107730132402 505 3 492 0.492 0.505 0.984 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGTCGTGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 67.41666666666669 3 35.083333333333336 0.0947381224831468 0.0907908105289243 1.04347699873177 0.00394731195422243 0.0601257431337462 0.0529177058639099 NA NA 0.0755488203948496 0.95833069447255 501 2 497 0.497 0.501 0.994 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC:CGTGGTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.41666666666669 3 34.66666666666667 0.079334128642946 0.0919517415692493 0.862780054940004 -0.0126176129263033 0.055627817687346 0.0538347745410461 NA NA 0.071374231133861 0.859680359070819 414 0 586 0.586 0.414 0.828 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT:GGTGGCAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.75000000000003 3 34 0.0789163573375576 0.0938723572155045 0.840677273676934 -0.0149559998779469 0.055641353127172 0.0569543212648536 NA NA 0.0714160126617547 0.834119741681662 401 6 593 0.593 0.401 0.802 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.4166666666667 3 34 0.0780938887873751 0.0938723572155045 0.831915710906178 -0.0157784684281294 0.0575108652182532 0.0531122980095245 NA NA 0.0750200852763728 0.833415387341464 399 4 597 0.597 0.399 0.798 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.08333333333336 3 33.66666666666667 0.0785029669229164 0.0948631103318397 0.827539458155082 -0.0163601434089233 0.0573076496074915 0.0561235785938949 NA NA 0.0714166065918778 0.818806442154813 365 9 626 0.626 0.365 0.73 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCC:CAAGCCTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.08333333333336 3 33.66666666666667 0.0785029669229164 0.0948631103318397 0.827539458155082 -0.0163601434089233 0.0561532524458977 0.05644499860299 NA NA 0.0719538016000385 0.820135964480535 378 4 618 0.618 0.378 0.756 N all ss13 184 TCC CCT CCT 2 GCCTCCTCG:GCCTCTTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.75000000000003 3 33.66666666666667 0.0776890557458693 0.0948631103318397 0.818959608999811 -0.0171740545859704 0.0556058640310096 0.0563475772237737 NA NA 0.0723650058510633 0.812404351831123 347 8 645 0.645 0.347 0.694 N all ss13 185 TCG CCT CGC 2 TCCTCGCGT:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.41666666666669 3 33.66666666666667 0.076891863117256 0.0948631103318397 0.810555998514927 -0.0179712472145837 0.057270808835773 0.0545163944359848 NA NA 0.0704249441493754 0.798581774903512 359 10 631 0.631 0.359 0.718 N all ss13 186 CGC CGC GCT 2 TCGCGTTCT:TCTCGCTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.08333333333336 3 33 0.0761108787135566 0.0969087986100047 0.785386670820817 -0.0207979198964481 0.0518428856058809 0.0559309676695989 NA NA 0.0759750503354255 0.78427928069601 390 6 604 0.604 0.39 0.78 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGTTCTAAC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.41666666666669 3 32.66666666666667 0.0757263107752118 0.0979651368127982 0.772992446485502 -0.0222388260375864 0.05369808850062 0.0565994498423687 NA NA 0.0704706491571552 0.752324567173196 333 8 659 0.659 0.333 0.666 N all ss13 188 AAC CCT ACT 2 TCCTCATCA:TCTAACTCA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.91666666666669 3 32.166666666666664 0.0751566968036821 0.0995936054863591 0.754633758228344 -0.0244369086826769 0.0525425229349321 0.0577762901726286 NA NA 0.0757114516890793 0.746874201998288 359 2 639 0.639 0.359 0.718 N all ss13 189 TCA ACT CAC 2 AACTCACGT:TCATCACGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.00000000000003 2 32.416666666666664 0.0750625939177369 0.0643826713791054 1.16588194167565 0.0106799225386315 0.0511420782620806 0.0464358684626074 NA NA 0.0618550937222732 0.862918406567654 529 18 453 0.453 0.529 0.906 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGC:TCACGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.33333333333337 3 32.083333333333336 0.0905621374661099 0.0998703029515669 0.906797464207442 -0.00930816548545706 0.0546331543530466 0.0618453543083018 NA NA 0.0700644722737159 0.894310877837839 423 5 572 0.572 0.423 0.846 N all ss13 191 AGC GTA GCC 2 CGTAGCCGT:CGTAGTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 70.33333333333337 3 32.416666666666664 0.106778985475984 0.0987726497511971 1.08105822558122 0.00800633572478698 0.0613505856560864 0.0573198797793681 NA NA 0.0699255634943532 0.908843048113653 553 2 445 0.445 0.553 0.89 N all ss13 192 CGC GCC GCG 2 AGCCGTGGT:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 70.50000000000003 3 32.25 0.106507748243781 0.0993184392369987 1.07238644769303 0.00718930900678208 0.0557140818189433 0.0591488748408516 NaN NaN 0.0713203538543085 0.919706807727912 550 1 449 0.449 0.55 0.898 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT:CGTGGTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 69.50000000000003 3 31.25 0.10815619759944 0.102724391304868 1.05287747365133 0.00543180629457228 0.0594345483431522 0.0608041540413608 NA NA 0.0742531242315312 0.941684715013797 540 2 458 0.458 0.54 0.916 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA:GGTAATTCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 70.6666666666667 3 30.75 0.10623788779727 0.104516640682884 1.01646864176977 0.00172124711438659 0.0574489175042321 0.0605250243190364 NA NA 0.073476915996905 0.981310716681672 492 6 502 0.502 0.492 0.984 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AATTCCAGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 70.6666666666667 3 30.083333333333332 0.139576709725395 0.107006075844546 1.30438116362819 0.0325706338808496 0.0670873442344832 0.0675753391472124 NA NA 0.0815886943883289 0.689741986534193 636 1 363 0.363 0.636 0.726 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT:TCCAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.33333333333337 3 30.083333333333332 0.138144348547325 0.107006075844546 1.29099537065554 0.0311382727027788 0.0698758562375487 0.0664454464193228 NA NA 0.0825021028520146 0.705858542709311 657 0 343 0.343 0.657 0.686 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.00000000000003 5 30.25 0.138856824851697 0.18671695246621 0.743675510003977 -0.047860127614513 0.0709683854847373 0.108516282836779 NaN NaN 0.131265122088279 0.715405100235079 370 1 629 0.629 0.37 0.74 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACA:AATTCAACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 70.00000000000003 5 30.583333333333332 0.141039173627205 0.184409724221212 0.764814188746461 -0.0433705505940072 0.0670780427856981 0.107182372589445 NaN NaN 0.129192288541021 0.737093023432826 352 0 648 0.648 0.352 0.704 N all ss13 199 ACA CAA CAC 2 TCAACACCT:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 70.50000000000003 5 31.083333333333336 0.139939466685309 0.181054357970061 0.772914103003526 -0.041114891284752 0.0676969721094376 0.113723207795288 NaN NaN 0.124031026983424 0.740275330060835 369 0 631 0.631 0.369 0.738 N all ss13 200 CCT CAC CTA 2 ACACCTAGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 70.25000000000003 5 32.00000000000001 0.140487161826034 0.175211138386129 0.801816386332868 -0.034723976560095 0.0693083352073134 0.106480254882408 NaN NaN 0.119650395171022 0.771654081494386 370 0 630 0.63 0.37 0.74 N all ss13 201 AGC CTA GCA 2 CCTAGCAGC:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 71.4166666666667 5 31.500000000000004 0.137967373637613 0.178350531835637 0.773574220483735 -0.0403831581980246 0.0675674138171557 0.102715478041926 NaN NaN 0.121056083230036 0.738688594985592 408 1 591 0.591 0.408 0.816 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 AGCAGCAGC:GGCAGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 71.58333333333337 4 31.000000000000004 0.154588634812834 0.141595553474679 1.09176193050778 0.0129930813381548 0.069636069604507 0.100071516636053 NaN NaN 0.116238032881089 0.910997886588857 552 0 448 0.448 0.552 0.896 N all ss13 203 AGC GCA GCA 2 AGCAGCAGA:AGCAGTAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 70.9166666666667 4 31.000000000000004 0.156204228604278 0.141595553474679 1.10317184947627 0.014608675129599 0.0733769380750052 0.101011533649646 NaN NaN 0.113561829772755 0.897641946988874 580 2 418 0.418 0.58 0.836 N all ss13 204 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGT:AGTAGGGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.9166666666667 4 31.333333333333332 0.158692184181382 0.139939466685309 1.13400592370588 0.0187527174960733 0.0737107035282816 0.0986193405034431 NaN NaN 0.112968080602885 0.868156837903785 579 0 421 0.421 0.579 0.842 N all ss13 205 GGA GAG GAA 2 AGAGGTTCA:AGGGGAAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.58333333333336 4 32.08333333333333 0.159539275483744 0.136351658368326 1.17005746312803 0.0231876171154179 0.0735791852537183 0.0943983007761968 NaN NaN 0.113798171234665 0.83854035367596 601 0 399 0.399 0.601 0.798 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGTTCATCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 3 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 69.9166666666667 4 31.749999999999996 0.158692184181382 0.137923200937065 1.15058368065134 0.0207689832443172 0.0693864093162294 0.0954081809168143 NaN NaN 0.112578396646818 0.853633287929868 584 0 416 0.416 0.584 0.832 N all ss13 207 TCA ATT CAC 2 AATTCTCCT:TCATCACCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 69.25000000000003 4 32.08333333333333 0.108576327850801 0.136351658368326 0.796296349821461 -0.0277753305175252 0.048583164241504 0.0921189968064802 NaN NaN 0.0950402887959114 0.770097044588124 396 1 603 0.603 0.396 0.792 N all ss13 208 CCT CAC CTG 2 TCACCTGCA:TCTCCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 69.4166666666667 4 32.58333333333333 0.10829587866142 0.134060541816084 0.807813225236622 -0.025764663154664202 0.0477973924311293 0.0952968816943623 NaN NaN 0.103460417171281 0.803338207640553 418 1 581 0.581 0.418 0.836 N all ss13 209 GCA CTG CAC 2 CCTGCACGC:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 70.58333333333337 4 32.08333333333333 0.106372646579413 0.136351658368326 0.780134600872027 -0.0299790117889131 0.0475076741428703 0.0950352169146718 NaN NaN 0.0992060220094691 0.762507657262663 410 1 589 0.589 0.41 0.82 N all ss13 210 CGA CAC GAA 2 GCACGCATG:GCTCGAATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.416666666666667 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 71.25000000000004 4 31.416666666666664 0.105304068164251 0.139531497680893 0.754697469134029 -0.0342274295166424 0.0458174729013562 0.0940407473029098 NA NA 0.0999086459980848 0.731908985985807 370 1 629 0.629 0.37 0.74 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT:CGCATGGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.25000000000004 4 31.749999999999996 0.121631243552431 0.137923200937065 0.881876600354797 -0.0162919573846347 0.0478834447701568 0.0974916814035791 NaN NaN 0.0990128882547558 0.869303065192825 450 1 549 0.549 0.45 0.9 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATGGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 70.83333333333337 4 31.83333333333333 0.122408407943652 0.137526919369799 0.890068711671681 -0.0151185114261469 0.0479977423720666 0.0962464355149841 NaN NaN 0.0991994680251617 0.878867382522009 499 0 501 0.501 0.499 0.998 N all ss13 213 AGC CTA CC- 1 GCTAGCGGA:GCTGCC--- 1:1 TRUE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.5 0.5 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 71.33333333333337 4 31.999999999999996 0.121476995958792 0.136741167595466 0.888371790989591 -0.015264171636674 0.048808484922913 0.0942561077956644 NA NA 0.0938670050200092 0.870821671411001 502 0 498 0.498 0.502 0.996 N all ss13 214 --- GCG GAG 1 AGCGGAGGT:GCC---GGA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.16666666666671 3 30.916666666666664 0.119955812971472 0.103912304538584 1.15439469371917 0.0160435084328879 0.0487389165081894 0.089434064079283 NA NA 0.0975248823001389 0.869332176896152 627 0 373 0.373 0.627 0.746 N all ss13 215 GGA --G GAG 1 ---GGAGGA:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.33333333333339 3 31.749999999999996 0.117889187641809 0.100992663859693 1.16730446684316 0.0168965237821163 0.0469378051420713 0.0878381686210791 NaN NaN 0.0942338773596507 0.85769890092282 585 0 415 0.415 0.585 0.83 N all ss13 216 GGA GAG GAG 2 GGAGGAGAT:GGTGGTGAA 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 73.16666666666673 3 31.91666666666666 0.11818004032857 0.100428343016685 1.17675983471057 0.0177516973118857 0.0491223985071235 0.0921430029880134 NaN NaN 0.0947852385885635 0.851438474324154 606 0 394 0.394 0.606 0.788 N all ss13 217 GAA GAG AAA 2 GGAGATACG:GGTGAAACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 72.91666666666673 3 32.166666666666664 0.118619025918598 0.0995936054863591 1.19103054196431 0.0190254204322387 0.0487976389741457 0.0924805946222264 NA NA 0.0936173079426543 0.838958814153384 593 0 407 0.407 0.593 0.814 N all ss13 218 ACG AAA CGG 2 GAAACTGCC:GATACGGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 72.8333333333334 3 32.24999999999999 0.102850364976667 0.0993184392369987 1.03556163152383 0.00353192573966807 0.0466477971359726 0.0802198440737139 NA NA 0.0892848111077369 0.968445537518914 556 0 444 0.444 0.556 0.888 N all ss13 219 GCA CGG CAC 2 ACGGCACTT:ACTGCCCTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.8333333333334 3 31.58333333333333 0.149375201835213 0.101563372279023 1.47075858632223 0.0478118295561908 0.0671751276599356 0.0844509163848261 NaN NaN 0.105893968134494 0.651624441800198 684 1 315 0.315 0.684 0.63 N all ss13 220 CTC CAC TCG 2 GCACTTGCA:GCCCTCGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.16666666666673 3 31.249999999999996 0.148632696437811 0.102724391304868 1.44690754113787 0.0459083051329433 0.0643372800126044 0.0858237081005518 NaN NaN 0.108019968143195 0.670837898450647 689 0 311 0.311 0.689 0.622 N all ss13 221 GCA TCG CAT 2 CTCGCGCTA:CTTGCATTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.83333333333339 3 31.249999999999996 0.147169682776295 0.102724391304868 1.43266541574845 0.0444452914714271 0.0660936710636571 0.0837355259392505 NaN NaN 0.101583079995958 0.661729547551204 691 1 308 0.308 0.691 0.616 N all ss13 222 CTA CAT TAT 2 GCATTATTG:GCGCTATTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.83333333333339 3 31.249999999999996 0.147169682776295 0.102724391304868 1.43266541574845 0.0444452914714271 0.0644532251617966 0.0885126641675367 NaN NaN 0.103932874467783 0.66891718335098 688 0 312 0.312 0.688 0.624 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:TTATTGCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.50000000000004 3 31.58333333333333 0.147897559919249 0.101563372279023 1.45620962164326 0.0463341876402261 0.066316980454833 0.0880941038258576 NaN NaN 0.105006166093508 0.659030524385395 688 0 312 0.312 0.688 0.624 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA:TTGCTGTTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.33333333333337 3 32.75 0.148264213964023 0.0976988961284261 1.51756283683214 0.0505653178355971 0.0643299386056955 0.0786179080412436 NA NA 0.0989164549440862 0.609216496777815 716 0 284 0.284 0.716 0.568 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGTTAGAC 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.50000000000004 3 33.083333333333336 0.147897559919249 0.0966482688635724 1.53026600122574 0.0512492910556763 0.0632878396183246 0.0842833693950422 NaN NaN 0.0994499739353072 0.606324293419406 713 1 286 0.286 0.713 0.572 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:TTAGACAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.50000000000004 3 34.083333333333336 0.145735279379414 0.0936278982824406 1.55653690890064 0.0521073810969732 0.0661364249706759 0.0752517211017436 NaN NaN 0.097724376668519 0.593889875817659 719 0 281 0.281 0.719 0.562 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GACAGGCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.50000000000004 3 34.416666666666664 0.145735279379414 0.0926626795339059 1.572750541129 0.0530725998455078 0.0654473312049255 0.0787273438695178 NaN NaN 0.0989419613680487 0.59168121119445 723 1 276 0.276 0.723 0.552 N all ss13 228 CTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:AGGCTGAAC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.50000000000004 3 34.416666666666664 0.145735279379414 0.0926626795339059 1.572750541129 0.0530725998455078 0.0635666106918056 0.0851755930991512 NaN NaN 0.100298030478286 0.596702110823014 736 0 264 0.264 0.736 0.528 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 CTGAACCAG:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.50000000000004 3 34.5 0.143635503733589 0.0924244803179611 1.55408505668034 0.051211023415628 0.0602137823377378 0.0788959239760983 NaN NaN 0.0882979725889954 0.5619283702939 719 0 281 0.281 0.719 0.562 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.1666666666667 3 35.166666666666664 0.144328652584645 0.09056213746611 1.59369750563425 0.0537665151185354 0.0663752144652045 0.0754753071135596 NaN NaN 0.0965496357290524 0.577609745903307 753 1 246 0.246 0.753 0.492 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 75.50000000000003 3 35.166666666666664 0.145735279379414 0.09056213746611 1.60922967872695 0.0551731419133038 0.0615050478356083 0.0775974356651609 NaN NaN 0.0963419246586525 0.566861040687913 746 0 254 0.254 0.746 0.508 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.08333333333337 3 35.25 0.144502989596306 0.0903346148069003 1.59964139887236 0.0541683747894057 0.0673129042043795 0.0771132356262773 NaN NaN 0.0948992740785385 0.568136157739675 737 0 263 0.263 0.737 0.526 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.4166666666667 3 34.583333333333336 0.176201863051342 0.092187504132096 1.91134215759721 0.0840143589192464 0.0711973707392341 0.0780420787613175 NaN NaN 0.102002875241045 0.410140180413024 794 0 206 0.206 0.794 0.412 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.4166666666667 3 34.916666666666664 0.178840142464223 0.091251642986027 1.95985668435151 0.0875884994781956 0.0774581222261953 0.0761565321049185 NaN NaN 0.100365188182726 0.382827705506953 806 0 194 0.194 0.806 0.388 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCA:AAAGTTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.75000000000003 3 34.583333333333336 0.177951940183394 0.092187504132096 1.93032604428042 0.0857644360512977 0.0724678765683848 0.0761897859278345 NaN NaN 0.0969742650821636 0.376478119302191 809 0 191 0.191 0.809 0.382 N all ss13 236 TCA TTT CAG 2 GTTTCAGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 75.58333333333336 3 34.75 0.178394930565847 0.0917171833187057 1.94505461365889 0.086677747247141 0.0721642315926654 0.0786053212544555 NaN NaN 0.103120428278767 0.400600779246517 833 0 167 0.167 0.833 0.334 N all ss13 237 GGT CAG GTA 2 TCAGGTAAG:TCTGGTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.58333333333336 3 34.416666666666664 0.175769733616626 0.0926626795339059 1.89687730271506 0.0831070540827198 0.0705251563406003 0.0751027838951331 NaN NaN 0.0978505973653923 0.395699930707011 820 0 180 0.18 0.82 0.36 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC:GGTAAGACA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 77.08333333333336 3 34.416666666666664 0.17448602671933 0.0926626795339059 1.88302375451472 0.0818233471854242 0.0749977721551612 0.0804998367220145 NaN NaN 0.103787479271937 0.430477991249796 809 0 191 0.191 0.809 0.382 N all ss13 239 ACA AAG CAC 2 AAAGGCCAA:AAGACACCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 76.66666666666669 3 34.166666666666664 0.1755544663848 0.0933847109044368 1.87990587200564 0.0821697554803631 0.0716506798431753 0.0805558585612385 NaN NaN 0.105640256546552 0.436671501489089 787 0 213 0.213 0.787 0.426 N all ss13 240 CAA CAC AAC 2 ACACCACAA:GGCCAACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.66666666666669 2 34.833333333333336 0.159249476407496 0.0597330472949441 2.66601962597302 0.0995164291125515 0.0703738587011097 0.0645039171971556 NaN NaN 0.0946603259483118 0.29312068913527 849 0 151 0.151 0.849 0.302 N all ss13 241 CAA AAC AA- 1 CAACAACAA:CCACAA--- 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.50000000000001 2 35.333333333333336 0.143635503733589 0.0588537115811214 2.44055132420337 0.0847817921524676 0.0678960746310984 0.0649861379200152 NA NA 0.0893140702443621 0.342491137227135 833 1 166 0.166 0.833 0.332 N all ss13 242 --- AAC AAC 1 CAA---CAA:CAACAACAA 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.91666666666669 2 34.91666666666667 0.158673037027526 0.059584670169267 2.66298423028559 0.0990883668582591 0.0689346444955191 0.0617379649876549 NaN NaN 0.0964176211827554 0.304091077301977 868 0 132 0.132 0.868 0.264 N all ss13 243 CAA --C AAG 1 ---CAATCA:CAACAAGGC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.25000000000003 2 35.25000000000001 0.15791093535129 0.0589984642956841 2.67652619837499 0.0989124710556061 0.0663732626222164 0.0636055678166862 NaN NaN 0.0967318577311921 0.306524035050018 854 0 146 0.146 0.854 0.292 N all ss13 244 GGC AAG CAC 2 CAAGGCCAA:CAATCACAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.08333333333336 2 34.75000000000001 0.160610991304224 0.0598821656332629 2.68211728159358 0.100728825670961 0.0699794771737805 0.0654047776383414 NaN NaN 0.0970672055903374 0.299399255115746 848 1 151 0.151 0.848 0.302 N all ss13 245 CAA CAC AAA 2 GGCCAAACT:TCACAGGTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.08333333333336 2 34.91666666666667 0.128733683316993 0.059584670169267 2.16051684017532 0.0691490131477264 0.0598577787326613 0.065473818299602 NaN NaN 0.0919300206028896 0.451935688343425 789 2 209 0.209 0.789 0.418 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC:CAGGTTGTC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 2 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.58333333333336 2 34.25000000000001 0.127817319751755 0.0607927570603562 2.10250901476397 0.0670245626913988 0.0626712415390775 0.066925120084365 NaN NaN 0.0905224766274825 0.459045786362281 801 2 197 0.197 0.801 0.394 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT:GTTGTCACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.75000000000003 0 34.083333333333336 0.127514764415745 0 -Inf 0.127514764415745 0.0601977943001421 0 NA NA 0.0612211967404266 0.0372646082707941 999 1 0 0 0.999 0.001 N all ss13 248 ACA TCA CAA 2 GTCACAAAG:GTCACTAAG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.4166666666667 0 34.41666666666667 0.128121317751782 0 -Inf 0.128121317751782 0.0615142922927883 0 NA NA 0.0608642964511204 0.0352884853680791 999 1 0 0 0.999 0.001 N all ss13 249 AAG CAA AGA 2 ACAAAGAAA:ACTAAGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.25000000000003 0 34.25 0.126615652181289 0 -Inf 0.126615652181289 0.0596924892326766 0 NA NA 0.0593214681321017 0.0328101748520143 998 2 0 0 0.998 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAA 2 AAGAAAACA:AAGAAATCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.16666666666669 0 33.666666666666664 0.126764620575651 0 -Inf 0.126764620575651 0.0608190904586499 0 NaN NaN 0.0598294481083427 0.0341102190207504 1000 0 0 0 1 0.001 N all ss13 251 ACA AAA CAG 2 AAAACAGCT:AAATCTGCT 1:1 TRUE 1.5 1 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 76.66666666666669 0 34.166666666666664 0.1276658623949 0 -Inf 0.1276658623949 0.0638001500989293 0 NA NA 0.0619942159578249 0.0394636963423781 997 3 0 0 0.997 0.001 N all ss13 252 GCT CAG CTG 2 ACAGCTGCT:TCTGCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.50000000000001 0 34 0.126170845288571 0 -Inf 0.126170845288571 0.0568437051490993 0 NaN NaN 0.0611069552876523 0.0389462591907517 998 2 0 0 0.998 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.83333333333336 0 33.666666666666664 0.123850470889023 0 -Inf 0.123850470889023 0.0609054050646892 0 NA NA 0.0580642203234747 0.0329254482311132 1000 0 0 0 1 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA:GCTGAGGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.16666666666669 0 33.333333333333336 0.123283681565969 0 -Inf 0.123283681565969 0.0591576378623756 0 NA NA 0.0577437269186943 0.0327598436796902 1000 0 0 0 1 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT:GAGGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.75000000000003 0 32.75000000000001 0.122304211428858 0 -Inf 0.122304211428858 0.0570605228268998 0 NA NA 0.0574313491697625 0.033206938403726 998 2 0 0 0.998 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA:GCTTCTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.91666666666669 0 33.08333333333334 0.122027221231932 0 -Inf 0.122027221231932 0.0590483123211645 0 NaN NaN 0.0571382300122776 0.0327080093723706 997 3 0 0 0.997 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.58333333333336 0 32.41666666666667 0.120931721082168 0 -Inf 0.120931721082168 0.0574404654753793 0 NA NA 0.0567513830436549 0.0330970925231154 997 3 0 0 0.997 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCC:AAAAAGCCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.58333333333336 0 31.416666666666675 0.119324938259741 0 -Inf 0.119324938259741 0.0570266563456248 0 NA NA 0.0580511646071027 0.0398294568249258 999 1 0 0 0.999 0.001 N all ss13 259 CCC AGC CCA 2 AAGCCCAGA:AAGCCTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.25000000000001 0 31.58333333333334 0.119855757106799 0 -Inf 0.119855757106799 0.057730973154715703 0 NA NA 0.0563199704193935 0.0333269858716928 996 4 0 0 0.996 0.001 N all ss13 260 AGA CCA GAC 2 CCCAGACAG:CCTCGCCAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.25000000000001 0 31.58333333333334 0.119855757106799 0 -Inf 0.119855757106799 0.056609738283704 0 NA NA 0.0586728404995458 0.0410741335042196 996 4 0 0 0.996 0.001 N all ss13 261 CAA GAC AAA 2 AGACAGAAA:CGCCAAAAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.25000000000001 0 31.500000000000007 0.105552582259345 0 -Inf 0.105552582259345 0.0527931553437781 0 NA NA 0.0529702547360995 0.0462968813549043 996 4 0 0 0.996 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAA 2 CAAAAACGT:CAGAAAAGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 81.33333333333334 0 31.416666666666675 0.105436462965892 0 -Inf 0.105436462965892 0.053419204162998 0 NA NA 0.053924161093025 0.0505508415425517 997 3 0 0 0.997 0.001 N all ss13 263 AGA AAA GAA 2 AAAAGAACA:AAACGTACT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 80.16666666666667 0 31.916666666666675 0.10708578623022 0 -Inf 0.10708578623022 0.0540474998453751 0 NA NA 0.0585426329678781 0.0673706705284747 993 7 0 0 0.993 0.001 N all ss13 264 ACA GAA CAG 2 AGAACAGCT:CGTACTGCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.16666666666667 0 32.833333333333336 0.0940829130843776 0 -Inf 0.0940829130843776 0.0532045531748596 0 NA NA 0.0554706247360086 0.0898697206673346 979 21 0 0 0.979 0.001 N all ss13 265 GCC CAG CCA 2 ACAGCTACC:ACTGCCACA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79 0 33.00000000000001 0.0942944168777401 0 -Inf 0.0942944168777401 0.0551614470506014 0 NA NA 0.0554606652873192 0.0890926553705046 984 16 0 0 0.984 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.16666666666666 0 32.50000000000001 0.0928335758860083 0 -Inf 0.0928335758860083 0.0502775722422676 0 NA NA 0.0498837950126192 0.0627446484209903 980 20 0 0 0.98 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAAGCC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.33333333333333 0 32.833333333333336 0.0926285758359224 0 -Inf 0.0926285758359224 0.0544849208735135 0 NA NA 0.0523684444847507 0.0769295799743447 992 8 0 0 0.992 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC:AAAGCCTAT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 3 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.99999999999999 0 32.5 0.0930394865024842 0 -Inf 0.0930394865024842 0.0540229620649387 0 NA NA 0.0530949655224776 0.0797184217518203 980 20 0 0 0.98 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:GCCTATAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.16666666666664 0 33 0.0516332867726302 0 -Inf 0.0516332867726302 0.0316589775862757 0 NA NA 0.0312083818995447 0.0980323455471837 966 34 0 0 0.966 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TATAATGTT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.33333333333331 0 32.833333333333336 0.0515223984646761 0 -Inf 0.0515223984646761 0.030201192254218 0 NA NA 0.0317333904811448 0.104460763451687 957 43 0 0 0.957 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT:AATGTTACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.83333333333331 0 32.66666666666667 0.0518565020980098 0 -Inf 0.0518565020980098 0.032026879355558 0 NA NA 0.0311347228428108 0.0958026642564571 963 37 0 0 0.963 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA:GTTACTCAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 79.66666666666666 0 33.33333333333333 0.0519688353535439 0 -Inf 0.0519688353535439 0.0328332965011285 0 NA NA 0.0309254967642857 0.0928692647119097 971 29 0 0 0.971 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA:ACTCAGGCT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80 0 33 0.0517446536152136 0 -Inf 0.0517446536152136 0.0319139569182016 0 NA NA 0.0306257802561869 0.0911086611265232 949 51 0 0 0.949 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAGGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.83333333333333 0 32.49999999999999 0.0511925740908369 0 -Inf 0.0511925740908369 0.0311372862352459 0 NA NA 0.0307650930723122 0.0961159421793085 953 47 0 0 0.953 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.83333333333333 0 32.166666666666664 0.0505454383004816 0 -Inf 0.0505454383004816 0.0301861558662484 0 NA NA 0.0307256083734152 0.0999576465034689 956 44 0 0 0.956 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGTAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82 0 31.499999999999993 0.0504391702568756 0 -Inf 0.0504391702568756 0.0311063750093542 0 NA NA 0.0330589470504182 0.127076042478095 943 57 0 0 0.943 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGTAGGCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.33333333333333 0 32.166666666666664 0.0508669472540708 0 -Inf 0.0508669472540708 0.0300934682526643 0 NA NA 0.0310079695944482 0.100912148851378 953 47 0 0 0.953 0.001 N all ss13 278 CGA GAC GAG 2 AGACGTGGT:AGGCGAGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.416666666666667 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.16666666666666 0 32.08333333333333 0.0509750280987295 0 -Inf 0.0509750280987295 0.0326933971524078 0 NA NA 0.030816089062298 0.098093121145114 962 38 0 0 0.962 0.001 N all ss13 279 GGT GAG GTC 2 CGAGGTCCC:CGTGGTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.83333333333333 1 32.666666666666664 0.0511925740908369 0.0312545223004261 1.63792534081185 0.0199380517904108 0.0328023544930833 0.0326886050671543 NA NA 0.0442441607312721 0.652251261376106 703 16 281 0.281 0.703 0.562 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA:GGTCCCGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.83333333333333 1 32.666666666666664 0.0511925740908369 0.0312545223004261 1.63792534081185 0.0199380517904108 0.0309377676925944 0.0316082472937282 NA NA 0.0443547230488507 0.653061190540719 648 22 330 0.33 0.648 0.66 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCCGAACCT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.16666666666666 1 32.33333333333333 0.0509750280987295 0.0315836140125951 1.61397071527031 0.0193914140861344 0.0308062238209738 0.0318595540544473 NA NA 0.0461830814911376 0.674572140874854 683 17 300 0.3 0.683 0.6 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC:GAACCTACA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.58333333333331 1 32.24999999999999 0.0507056829412418 0.03166697281676 1.60121661248294 0.0190387101244818 0.0315586926143699 0.0312694432968659 NA NA 0.0458824922217625 0.678182176178526 670 20 310 0.31 0.67 0.62 N all ss13 283 ACA AAA CAC 2 CAAACCCAA:CCTACACAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.58333333333331 1 32.58333333333333 0.0255615794834085 0.0313361505112163 0.815721748408733 -0.00577457102780771 0.0176048621622196 0.0312315387362106 NA NA 0.0365132177413714 0.874338480270443 443 50 507 0.507 0.443 0.886 N all ss13 284 CAA CAC AAG 2 ACACAGGGA:ACCCAAGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.24999999999999 1 31.91666666666666 0.0256709551422775 0.0320048558445568 0.802095634079959 -0.00633390070227932 0.0178629954549613 0.0321733243695112 NA NA 0.0396229766764698 0.87299589846356 424 33 543 0.543 0.424 0.848 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT:CAGGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.24999999999999 1 32.24999999999999 0.0260047718198447 0.03166697281676 0.821195381393748 -0.00566220099691533 0.0176950246741402 0.0320862309130309 NA NA 0.0362481851632383 0.875870278135063 439 51 510 0.51 0.439 0.878 N all ss13 286 AAT GAA ATT 2 GGAAATTTC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.74999999999999 2 32.416666666666664 0.0258367851740807 0.0643826713791054 0.40130029743478 -0.0385458862050248 0.0178740244069462 0.0474643354909175 NA NA 0.0516113039728588 0.455154299332629 220 21 759 0.759 0.22 0.44 N all ss13 287 TTC ATT TCG 2 AATTTCGGG:AATTTCGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666666 2 32.08333333333333 0.0259485340559256 0.0650814580158656 0.398708554587082 -0.03913292395994 0.0181378190112389 0.0479138926415978 NA NA 0.0526256357560838 0.457112739651969 221 18 761 0.761 0.221 0.442 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTCGGTGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.91666666666666 2 32.08333333333333 0.0261179819037762 0.0650814580158656 0.401312181687895 -0.0389634761120895 0.0177997781470386 0.0499399145896907 NA NA 0.0509528216655867 0.444451920044206 203 15 782 0.782 0.203 0.406 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA:GGTGACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.58333333333333 2 32.41666666666666 0.0262321821040851 0.0643826713791054 0.407441653820509 -0.0381504892750204 0.0187258846285572 0.0466868894426816 NA NA 0.0542684541856898 0.482058436833232 239 22 739 0.739 0.239 0.478 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GACCAGGAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.08333333333333 2 31.91666666666666 0.0260612539038721 0.0654365742860851 0.398267393857351 -0.039375320382213 0.0183988641534246 0.0488331525457637 NA NA 0.0521772746240748 0.450462004202417 228 13 759 0.759 0.228 0.456 N all ss13 291 GAA AAG AAT 2 CAAGACCTA:CAGGAATTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.25 2 30.74999999999999 0.0256709551422775 0.0680352852661241 0.377318255400326 -0.0423643301238467 0.0175812018761465 0.0496998468495437 NA NA 0.0546733838601289 0.438421180861969 217 17 766 0.766 0.217 0.434 N all ss13 292 CTA AAT TAA 2 GAATTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666667 2 30.33333333333332 0.0126585283405138 0.0690141740401891 0.183419254327993 -0.0563556456996753 0.0135023536826632 0.0502136253853198 NA NA 0.0533768639741378 0.291056578613591 121 46 833 0.833 0.121 0.242 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:TTAATCAGA 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82 2 29.99999999999999 0.0122953573317573 0.069817817299509 0.176106297895448 -0.0575224599677517 0.0121189712789109 0.0523655944248098 NA NA 0.0557068030651233 0.301794362776945 91 32 877 0.877 0.091 0.182 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA:ATCAGATTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.91666666666667 2 30.74999999999999 0.0121583209710618 0.0680352852661241 0.178706107037014 -0.0558769642950624 0.0126559847480253 0.0502160676138343 NA NA 0.0500757000876014 0.264486395502827 96 47 857 0.857 0.096 0.192 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA:AGATTAGGT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.58333333333333 2 30.58333333333332 0.0120605613963404 0.0684234871721279 0.17626347172281 -0.0563629257757875 0.0115729486920609 0.0534422121569242 NA NA 0.0525843896870373 0.283784440762025 103 51 846 0.846 0.103 0.206 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT:TTAGGTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.25 2 31.416666666666654 0.0122576783566175 0.0665255778124882 0.184255120506695 -0.0542678994558707 0.012025213095906 0.0465237042217005 NA NA 0.0499505683886714 0.277287879098033 98 46 856 0.856 0.098 0.196 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT:GGTACTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.25 2 31.08333333333332 0.0369305370773724 0.0672719567702241 0.548973730666307 -0.0303414196928517 0.0276552003159051 0.0489509563731196 NA NA 0.0583003489288475 0.60276188389937 300 20 680 0.68 0.3 0.6 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.75 2 30.58333333333332 0.0367045717801664 0.0684234871721279 0.536432346510365 -0.0317189153919615 0.0281125341600941 0.0500281614820039 NA NA 0.0561294199964956 0.572003565557995 271 6 723 0.723 0.271 0.542 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.75 2 30.58333333333332 0.0367045717801664 0.0684234871721279 0.536432346510365 -0.0317189153919615 0.0270450848858896 0.0511555824438084 NA NA 0.0583275358031257 0.586574372386419 288 10 702 0.702 0.288 0.576 N all ss13 300 AAA ACA AAA 2 TACAAAAAT:TACAAACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.75 2 30.24999999999999 0.0362608381183453 0.0692133441658409 0.523899524800612 -0.0329525060474956 0.0263757882696605 0.0520139669306138 NA NA 0.0565533144862322 0.560108492158025 258 24 718 0.718 0.258 0.516 N all ss13 301 AAT AAA ATT 2 AAAAATTGG:AAACATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.75 3 30.24999999999999 0.0487481192957683 0.106372646579413 0.458276830212879 -0.0576245272836449 0.030522852749399 0.0666941400355041 NA NA 0.0667294201317831 0.387832369713929 197 3 800 0.8 0.197 0.394 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 AATTGGCCA:CATTGGCCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.58333333333334 3 30.74999999999999 0.036779585610904 0.104516640682884 0.351901719865813 -0.0677370550719796 0.0288209218029686 0.0606591449243081 NA NA 0.0641559600508759 0.291051104831506 116 20 864 0.864 0.116 0.232 N all ss13 303 CCA GGC CAC 2 TGGCCACAG:TGGCCGCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.91666666666669 3 30.74999999999999 0.0370827329793859 0.104516640682884 0.354802189747941 -0.0674339077034977 0.0271518576860635 0.0674682863817732 NA NA 0.0639569143442509 0.2917160137983 110 20 870 0.87 0.11 0.22 N all ss13 304 CAA CAC AAA 2 CCACAGATT:CCGCAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.25000000000001 3 29.74999999999999 0.0369305370773724 0.10829587866142 0.341015166355806 -0.0713653415840478 0.027369613106579 0.0694021401081807 NA NA 0.0641215980863401 0.265721806058736 110 16 874 0.874 0.11 0.22 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA:CAGATTGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.50000000000001 3 29.58333333333332 0.0372747514142044 0.108952531416164 0.342119186490736 -0.0716777800019596 0.02937676729215 0.069227716594084 NA NA 0.0615286804247194 0.244039602719601 96 11 893 0.893 0.096 0.192 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA:ATTGCACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.00000000000001 3 29.249999999999986 0.0370445664971823 0.110290063467373 0.335883082596478 -0.0732454969701903 0.0279516055389944 0.064809118353584 NA NA 0.0694920608425301 0.291877219342618 119 13 868 0.868 0.119 0.238 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCACAGTTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.25000000000001 3 29.666666666666654 0.0369305370773724 0.108623210908842 0.339987529077602 -0.0716926738314697 0.0280853803263897 0.0693406941803432 NA NA 0.067078034302843 0.285162011461999 113 12 875 0.875 0.113 0.226 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT:CAGTTTGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.91666666666667 3 29.999999999999986 0.0370827329793859 0.107325632730505 0.345516090014588 -0.0702428997511192 0.0273910632386045 0.0672151970960854 NA NA 0.0666545736763361 0.291958623571754 104 22 874 0.874 0.104 0.208 N all ss13 309 GCA TTG CAC 2 TTTGCACCC:TTTGCTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.25000000000001 3 30.66666666666665 0.037390920168914 0.104821456781369 0.356710556378757 -0.0674305366124551 0.0274350005055228 0.0647667056891225 NA NA 0.0651937933106167 0.300991663027176 99 16 885 0.885 0.099 0.198 N all ss13 310 CCA CAC CAA 2 GCACCCAGT:GCTCCAAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.91666666666667 3 30.66666666666665 0.0370827329793859 0.104821456781369 0.353770440881498 -0.0677387238019833 0.028109238154638 0.064165738915443 NA NA 0.0642153738274106 0.29148583575291 111 14 875 0.875 0.111 0.222 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCCAGTGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.08333333333334 3 30.499999999999982 0.0370064785139329 0.105436462965892 0.350983686980321 -0.0684299844519592 0.0287371294793284 0.063030808858446 NA NA 0.0626812983483143 0.274959296069204 90 16 894 0.894 0.09 0.18 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT:AGTGCTTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.41666666666667 3 30.499999999999982 0.0373133940279994 0.105436462965892 0.353894591855476 -0.0681230689378927 0.0276092872269148 0.0642524599959139 NA NA 0.0630967933998937 0.280293718427846 108 20 872 0.872 0.108 0.216 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA:GCTTCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.08333333333334 3 30.499999999999982 0.0370064785139329 0.105436462965892 0.350983686980321 -0.0684299844519592 0.0273133811310935 0.0627680453070934 NA NA 0.0622343321554652 0.271526664661101 104 21 875 0.875 0.104 0.208 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.08333333333334 3 29.499999999999986 0.0365554585374873 0.109283858386045 0.334500072356113 -0.072728399848558 0.0272977603708075 0.0668975322438971 NA NA 0.0651065117164737 0.26396525793691 84 16 900 0.9 0.084 0.168 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.41666666666667 3 28.833333333333318 0.0359709296472944 0.11200896641424 0.321143304851721 -0.0760380367669455 0.0276164305558925 0.0716555457936406 NA NA 0.0695552607810839 0.274304572773994 102 12 886 0.886 0.102 0.204 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA:TTCTTTGGC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.41666666666667 3 29.166666666666654 0.0364075521822731 0.110629602831442 0.329094123547966 -0.0742220506491693 0.0278781319015689 0.0641259940171494 NA NA 0.0661612538934436 0.261932342152555 110 22 868 0.868 0.11 0.22 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG:TTTGGCATG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.75 3 28.333333333333325 0.0362608381183453 0.114143861506444 0.317676637532524 -0.0778830233880987 0.0263062595061055 0.0683790286037369 NA NA 0.0670657369993155 0.24552244717399 85 9 906 0.906 0.085 0.17 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGCATGTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.5 3 28.58333333333332 0.0363707624539579 0.11306631811959 0.321676367098896 -0.0766955556656322 0.0273263131909454 0.067272160394549 NA NA 0.0672641337699371 0.254196855056986 101 17 882 0.882 0.101 0.202 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCCCGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.33333333333334 3 28.416666666666657 0.0364444164276489 0.113782401199837 0.320299238224382 -0.0773379847721883 0.0265048231512603 0.0678001794563529 NA NA 0.0721137401299139 0.28352042458036403 96 17 887 0.887 0.096 0.192 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCCCGTATA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.16666666666667 3 28.58333333333332 0.036518369377199 0.11306631811959 0.322981856883087 -0.0765479487423911 0.0277579769616058 0.0681156151962555 NA NA 0.0688022245730161 0.265889043078833 113 14 873 0.873 0.113 0.226 N all ss13 321 ATA GCA TAG 2 CGCATTGGC:CGTATAGGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.50000000000001 3 28.916666666666657 0.0363707624539579 0.11166090491713 0.325725127169181 -0.0752901424631717 0.0262847758758682 0.0694710440166788 NA NA 0.0699870550086524 0.28202905661684 124 13 863 0.863 0.124 0.248 N all ss13 322 GGA TAG GAA 2 ATAGGAATG:ATTGGCATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.16666666666667 3 28.41666666666666 0.036079100340836 0.113782401199837 0.317088582771864 -0.0777033008590011 0.0270274992009038 0.0679447644006013 NA NA 0.0716060009218814 0.277854922407854 90 13 897 0.897 0.09 0.18 N all ss13 323 ATG GAA TGG 2 GGAATGGAA:GGCATGGAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.83333333333334 3 28.41666666666666 0.0357920796519117 0.113782401199837 0.314566042502915 -0.0779903215479254 0.0262336493730864 0.0729812659331209 NA NA 0.0671335731642819 0.245349782316214 82 15 903 0.903 0.082 0.164 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.91666666666667 3 28.999999999999993 0.03618792369855 0.111315003838705 0.325094753183372 -0.075127080140155 0.0268871292042358 0.0689458436005782 NA NA 0.0681147934849912 0.270049716468308 105 15 880 0.88 0.105 0.21 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.91666666666667 3 29.999999999999993 0.0366298633763431 0.107325632730505 0.341296505265622 -0.0706957693541619 0.0266874425767297 0.0652558922903664 NA NA 0.0632459576445053 0.26365621820159 97 10 893 0.893 0.097 0.194 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.41666666666667 3 30.16666666666666 0.0364075521822731 0.106688419438138 0.34125120958778 -0.0702808672558652 0.0268620681364676 0.0632401643349053 NA NA 0.0659677732716575 0.286703174118721 89 16 895 0.895 0.089 0.178 N all ss13 327 CCT CAC CTA 2 ACACCTACA:ACACCTTCG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.16666666666667 3 30.083333333333325 0.036079100340836 0.107006075844546 0.337168708001686 -0.0709269755037099 0.0272348835664124 0.0683081957948225 NA NA 0.0643698926668579 0.270520071360459 131 13 856 0.856 0.131 0.262 N all ss13 328 ACA CTA CAG 2 CCTACAGGG:CCTTCGGGA 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85 4 30.249999999999993 0.0361515763634083 0.145469445655623 0.248516629732622 -0.109317869292215 0.0280954527065987 0.0808727838402456 NA NA 0.0803048695622516 0.173423425328093 65 3 932 0.932 0.065 0.13 N all ss13 329 GGA CAG GAA 2 ACAGGGACT:TCGGGAACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.66666666666667 3 30.249999999999993 0.0358634057628697 0.106372646579413 0.337148758784483 -0.0705092408165436 0.026709353802974 0.0652129151107144 NA NA 0.0638031481787574 0.269113668211616 95 6 899 0.899 0.095 0.19 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG:GGGACTTGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 87.00000000000001 3 29.583333333333325 0.0353006331434893 0.108952531416164 0.324000118993584 -0.0736518982726747 0.026719493244197 0.0649302625553147 NA NA 0.0701867293303806 0.294007531551871 98 16 886 0.886 0.098 0.196 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG:ACTTGGTTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.33333333333336 3 29.249999999999993 0.0472597258715505 0.110290063467372 0.428503932138289 -0.0630303375958219 0.0286427201701829 0.068226271665747 NA NA 0.0677782222009206 0.352397127004108 176 6 818 0.818 0.176 0.352 N all ss13 332 CTG GGC TAA 2 TGGCTGACT:TGGTTAACC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.6666666666667 3 29.583333333333325 0.0476350542917444 0.108952531416164 0.43720924766579 -0.0613174771244196 0.029453485613333 0.0676664643774544 NA NA 0.0685439446814305 0.371016054356292 153 4 843 0.843 0.153 0.306 N all ss13 333 ACC TAA CCT 2 CTGACTTAT:TTAACCTAT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.33333333333337 4 29.249999999999993 0.0467076971411359 0.150978005779684 0.30936755920127 -0.104270308638548 0.028193781690729 0.0852911044639397 NA NA 0.0817926717425744 0.202375665942218 67 0 933 0.933 0.067 0.134 N all ss13 334 TAT CCT ATA 2 ACCTATAAT:ACTTATCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.00000000000004 4 29.583333333333325 0.0463467894513492 0.149095891727942 0.310852223453071 -0.102749102276593 0.0284273082639657 0.0856342121285221 NA NA 0.0895582503396062 0.251262628670698 77 4 919 0.919 0.077 0.154 N all ss13 335 AAT ATA ATG 2 TATAATGGT:TATCATGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.50000000000004 4 29.083333333333325 0.0460797489251286 0.151937056450333 0.303281832633054 -0.105857307525204 0.0277729418179144 0.083106871736146 NA NA 0.0864195183615582 0.22060400762779 69 1 930 0.93 0.069 0.138 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 AATGGTGCC:CATGGAGCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.91666666666671 3 29.666666666666657 0.0463915975048633 0.108623210908842 0.42708733351471 -0.0622316134039788 0.028461417259745 0.069581175756642 NA NA 0.0681113070863382 0.360887529176395 158 4 838 0.838 0.158 0.316 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT:GGTGCCATA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 88.58333333333337 3 30.083333333333325 0.058680943646086 0.107006075844546 0.548388894583288 -0.0483251321984598 0.0318325887852687 0.067893425849471 NA NA 0.0696846441773923 0.488006345770511 243 0 757 0.757 0.243 0.486 N all ss13 338 ATA CCA TAA 2 GCCATAAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 89.16666666666671 3 30.166666666666657 0.0582817382454872 0.106688419438138 0.546279891973477 -0.0484066811926512 0.0314325034493884 0.0691691035472998 NA NA 0.0719024172222534 0.500802598523559 233 0 767 0.767 0.233 0.466 N all ss13 339 AAA TAA AAT 2 ATAAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 90.16666666666671 3 29.83333333333333 0.0576098833212125 0.107970516691131 0.533570506900654 -0.0503606333699188 0.0297811005298237 0.0662808946418815 NA NA 0.0702269038609018 0.473304307659342 220 1 779 0.779 0.22 0.44 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 90.16666666666671 3 29.83333333333333 0.0576098833212125 0.107970516691131 0.533570506900654 -0.0503606333699188 0.0297118600092988 0.0683226223651944 NA NA 0.0720074119943099 0.484313806176 240 2 758 0.758 0.24 0.48 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 90.00000000000006 3 29.999999999999993 0.0577207808520961 0.107325632730505 0.537809835205288 -0.0496048518784088 0.0305957405604871 0.0655964593934138 NaN NaN 0.0692517743172745 0.47380785678522 205 3 792 0.792 0.205 0.41 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA:GATGATAAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 89.00000000000006 3 30.33333333333333 0.0706404112947758 0.106058740537371 0.666049878933689 -0.0354183292425956 0.0335395609360381 0.0698348156562351 NA NA 0.0679552132097057 0.602226714945338 296 1 703 0.703 0.296 0.592 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT:GATAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.33333333333339 3 31.33333333333333 0.0720553725672166 0.102431651254313 0.703448315875729 -0.0303762786870965 0.0327848299086551 0.061230034720942 NA NA 0.069293723623621 0.661118204370258 329 0 671 0.671 0.329 0.658 N all ss13 344 GAC AAG ACC 2 AAAGACCCA:AAAGATCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.41666666666671 3 31.58333333333333 0.0737543645690025 0.101563372279023 0.726190583416026 -0.0278090077100201 0.0351044731029743 0.0627862042986897 NaN NaN 0.0692874877676687 0.688157414883578 362 0 638 0.638 0.362 0.724 N all ss13 345 CCA ACC CAA 2 GACCCAAAT:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.08333333333339 3 31.249999999999993 0.0749843548189804 0.102724391304868 0.729956672086183 -0.0277400364858877 0.0358892275121413 0.0645594409904375 NA NA 0.0685635391429868 0.685779830521469 367 0 633 0.633 0.367 0.734 N all ss13 346 AAT CAA AAT 2 CCAAATTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.91666666666671 3 31.249999999999993 0.075140996593953 0.102724391304868 0.73148154629554 -0.0275833947109151 0.0352933097264321 0.0679159823648086 NaN NaN 0.0650812540099633 0.671689721137795 329 2 669 0.669 0.329 0.658 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AATTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333339 3 31.249999999999993 0.0625362067042883 0.102724391304868 0.608776610013602 -0.0401881846005798 0.0274150888519068 0.0647607191311276 NA NA 0.0624641440311576 0.519977520144408 283 0 717 0.717 0.283 0.566 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.83333333333339 3 31.749999999999993 0.062929976401818 0.100992663859693 0.623114333227663 -0.0380626874578748 0.028361205403738 0.06308958699594 NA NA 0.0654904101904161 0.561109155389001 277 1 722 0.722 0.277 0.554 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGACCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.00000000000004 3 31.916666666666664 0.0635974024950577 0.100428343016685 0.633261493565536 -0.0368309405216269 0.0283956204957524 0.063581454843855 NaN NaN 0.0642318096645899 0.566369454928937 278 2 720 0.72 0.278 0.556 N all ss13 350 AAC ACA AAG 2 GACAACGTC:GACCAAGTT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.83333333333339 3 32.416666666666664 0.0645559565784322 0.0987726497511971 0.653581297464886 -0.0342166931727649 0.0281086920866737 0.0607387486894152 NaN NaN 0.0613403555936451 0.576969352531144 281 2 717 0.717 0.281 0.562 N all ss13 351 GTC AAG TCA 2 AACGTCATA:CAAGTTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.16666666666671 2 32.08333333333333 0.0509750280987295 0.0650814580158656 0.7832496328878 -0.0141064299171361 0.025964717666158 0.0507563086831343 NA NA 0.0574699909374501 0.806102351676316 418 1 581 0.581 0.418 0.836 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTTATTCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.16666666666671 3 31.916666666666664 0.0503333482845312 0.100428343016685 0.501186684680928 -0.0500949947321534 0.0256550404397833 0.063449649384187 NA NA 0.0670209397315551 0.454790232886066 230 0 770 0.77 0.23 0.46 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATTCTGCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0 0.666666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.16666666666671 3 31.25 0.049707628561966 0.102724391304868 0.483893142909384 -0.0530167627429021 0.0248848400747224 0.0659303592709242 NaN NaN 0.0731016420488999 0.468300378338512 210 0 790 0.79 0.21 0.42 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:CTGCTTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.50000000000006 3 31.25 0.0488971496674065 0.102724391304868 0.476003304047704 -0.0538272416374616 0.0250175611982073 0.0644369056606512 NaN NaN 0.0734466478419354 0.463634426419933 222 1 777 0.777 0.222 0.444 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTTAATAAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.33333333333339 3 31.333333333333332 0.0484038908531784 0.102431651254313 0.472548184671974 -0.0540277604011347 0.0248636005257739 0.0644868452618717 NA NA 0.0692751416701318 0.43544908067036 240 1 759 0.759 0.24 0.48 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.33333333333339 3 31.666666666666668 0.0489970106942918 0.101277212852957 0.483791065275757 -0.0522802021586654 0.0243261573983136 0.0663904335494235 NaN NaN 0.0683381807946235 0.444258527944287 225 0 775 0.775 0.225 0.45 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.08333333333339 3 31.666666666666668 0.0619547111548277 0.101277212852957 0.611733966699684 -0.0393225016981294 0.0282293326574396 0.0654269889864456 NaN NaN 0.0705355544898679 0.577196220003578 292 0 708 0.708 0.292 0.584 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC:CACATTGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.41666666666673 3 31.333333333333332 0.0616997275510046 0.102431651254313 0.602350218857832 -0.0407319237033085 0.0265568081158191 0.0666969802574301 NaN NaN 0.0752855127869785 0.588485049041153 288 0 712 0.712 0.288 0.576 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA:ATTGATGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.91666666666673 3 30.333333333333336 0.0613211655108464 0.106058740537371 0.578181158857331 -0.044737575026525 0.0269851679383388 0.0656480571882262 NaN NaN 0.0739514207097445 0.545206261677539 266 0 734 0.734 0.266 0.532 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC:GATGCTTAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.00000000000007 3 30.250000000000004 0.0612585232607003 0.106372646579413 0.575886049943933 -0.0451141233187129 0.0272957757470056 0.0696169944242876 NaN NaN 0.0750166928372954 0.547581727436319 260 1 739 0.739 0.26 0.52 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA:GCTTATAAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.8333333333334 3 30.083333333333336 0.0606390724718212 0.107006075844546 0.566688124886621 -0.0463670033727246 0.0264576268675386 0.0683191449132561 NaN NaN 0.077125144059567 0.547712252433504 267 0 733 0.733 0.267 0.534 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA:TATAAGACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.8333333333334 3 30.083333333333336 0.0606390724718212 0.107006075844546 0.566688124886621 -0.0463670033727246 0.0273384914859412 0.0694265771927148 NaN NaN 0.0785443572299256 0.554970173055022 278 0 722 0.722 0.278 0.556 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC:AAGACATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 84.16666666666673 3 30.083333333333336 0.0618907677660026 0.107006075844546 0.578385547526433 -0.0451153080785431 0.0280190105158248 0.0690293746164263 NaN NaN 0.0748321791285236 0.546584219487751 282 1 717 0.717 0.282 0.564 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA:ACATTTCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.33333333333339 4 30.583333333333336 0.0625362067042883 0.143721781908901 0.435119895353979 -0.0811855752046125 0.0268770790933305 0.080566598873329 NaN NaN 0.0870676224898826 0.351107749361767 154 1 845 0.845 0.154 0.308 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA:TTTCCACCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.00000000000006 4 30.250000000000004 0.0644172539103222 0.145469445655623 0.442823258313779 -0.081052191745301 0.0287415019465211 0.0822406824988103 NaN NaN 0.090186327725284 0.368802203524459 147 0 853 0.853 0.147 0.294 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA:CCACCTACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.00000000000006 4 30.250000000000004 0.0644172539103222 0.145469445655623 0.442823258313779 -0.081052191745301 0.0285811771297021 0.0808610835076323 NaN NaN 0.0909160217123359 0.372657698096635 144 0 856 0.856 0.144 0.288 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG:CCTACAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.33333333333339 4 30.916666666666675 0.0649756739796766 0.142015736265178 0.457524466572852 -0.0770400622855018 0.0283638858186034 0.0799499709191877 NaN NaN 0.0892329915841445 0.387940386033769 172 0 828 0.828 0.172 0.344 N all ss13 368 GAA CAG AAC 2 ACAGAACCT:ACAGAGCCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.00000000000006 4 31.250000000000007 0.0790203867433696 0.140349835343382 0.563024434977333 -0.0613294486000129 0.0340549963874049 0.0799700750793661 NaN NaN 0.0899435223091267 0.495323553848937 226 0 774 0.774 0.226 0.452 N all ss13 369 CCT AAC CTA 2 GAACCTAAA:GAGCCTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.50000000000006 4 31.750000000000007 0.0795446789702432 0.137923200937065 0.57673167697536 -0.0583785219668221 0.0340373381280753 0.0809384421385505 NaN NaN 0.0861329789110655 0.497916262635642 256 0 744 0.744 0.256 0.512 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 79.16666666666673 4 32.08333333333334 0.0798980931045124 0.136351658368326 0.5859708203085 -0.0564535652638138 0.0329271205487482 0.0745005774068531 NaN NaN 0.0849194678548484 0.506185179447633 250 0 750 0.75 0.25 0.5 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.83333333333339 4 31.750000000000007 0.080254664675637 0.137923200937065 0.581879365693213 -0.0576685362614282 0.0324317392365602 0.0747096443827521 NaN NaN 0.0890897108850804 0.517432234986119 236 0 764 0.764 0.236 0.472 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA:AAGGACAAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333339 4 32.25000000000001 0.0807955355010693 0.135579277355344 0.595928353337581 -0.0547837418542746 0.0328207684049411 0.0761666263722947 NaN NaN 0.0892378333048513 0.539276700406866 232 0 768 0.768 0.232 0.464 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG:GACAAGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666673 4 32.25000000000001 0.0815281512006671 0.135579277355344 0.601331949771258 -0.0540511261546768 0.0344321359780819 0.0762975603818151 NaN NaN 0.0856086388705183 0.527795573786881 276 0 724 0.724 0.276 0.552 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA:AAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAAAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT:GATGAAGTA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG:GAAGTACAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT:GTACAGTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CAC 2 CAGCCTTTG:CAGTCACTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 CTG CAC TGC 2 CCTTTGCCG:TCACTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TGC CGC 2 CTGCCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA:CCGCAGCGT 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGCGTCAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:CGTCAGAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAG:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AAC AGC 2 AAACAGGCA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CAA 2 CAGCCCACT:CAGGCAACT 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CAA CTG 2 CCCACTGTG:GCAACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTG:GTGACTCTT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTG CTC TGT 2 ACTCTGTTA:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TGT TAC 2 CTGTTACCT:CTTCTTCCT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TAC CTG 2 CTTCCTGCG:TTACCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCA CTG CAG 2 CCTGCAGCA:CCTGCGGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CAG CAG 2 GCAGCAGAT:GCGGCTGAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC:GATGATTTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC:GATTTTTCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA:TTTTCCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAACTT:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA:CAACTTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT:CTTCAGAAT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC:CAGAATTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAAT:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AAT TGA AT- 1 ATGAAT---:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 --- GTG GAG 1 AAT---GCT:AGTGGAGCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT --G CTT 1 ---GCTTCA:GGAGCTTCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCA CTT CAC 2 GCTTCACCT:GCTTCTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 CCT CAC CTG 2 TCACCTGAT:TCTGCTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 CCTGATTCT:GCTGATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCTACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG:TCTACTCAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA:ACTCAGGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCCTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_GU190215.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAT 2 CCCCAATCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 8 TCA AAT CAA 2 CAATCAAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA:TCAAACCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.8333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.3333333333334 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 36 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666673 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.8333333333334 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666673 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.3333333333334 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666673 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666673 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666673 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 37.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 38.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 38.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000006 0 39.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 36.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666673 0 36.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.16666666666673 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000007 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666674 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000007 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666673 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000006 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.0833333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000007 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 33.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666674 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666674 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666674 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 TTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333341 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCC:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333341 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666674 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666673 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000007 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 38.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 38.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333341 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000009 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333343 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333343 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666676 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333343 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333341 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 37.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000007 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000007 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000007 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 34.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666673 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666673 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000007 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000007 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 31.833333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666671 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000006 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333337 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000004 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000004 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA:ACTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.91666666666671 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666671 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333337 0 31.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC:GAACAAACT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666671 0 31.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA:CAAACTCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000004 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA:ACTCAAGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.58333333333337 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.9166666666667 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.4166666666667 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000003 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000003 0 30.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000003 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333337 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000003 0 30.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.4166666666667 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000004 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000004 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333337 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 28.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666671 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCAAGTGCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT:AGTGCGTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666671 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA:GCGTCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333339 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.8333333333334 0 26.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.3333333333334 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666673 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666673 0 27.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000004 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.33333333333339 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.33333333333339 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.00000000000006 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666673 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.91666666666673 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.0833333333334 0 29.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.75000000000007 0 30.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.75000000000007 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.75000000000007 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.75000000000007 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.75000000000007 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.75000000000007 0 29.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000007 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.0833333333334 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000007 0 30.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666674 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666674 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTCATATTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATATTGCTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 1 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGCTGAAC 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333341 0 34.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333341 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666676 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666676 0 32.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.7500000000001 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333343 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000009 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666676 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666674 0 32.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.91666666666674 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666674 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666674 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.41666666666674 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.75000000000009 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAA:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAA AGC AAC 2 AAGCAACCC:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AAC CCA 2 CAACCCACT:CAGCCCACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTC:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTC TTC TCC 2 CTTCTCCCT:CTTCTTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TCC CTG 2 CTCCCTGCG:CTTCCTGCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KC881006.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 2 35.33333333333333 0.0135904058348962 0.0588537115811214 0.230918415674834 -0.0452633057462252 0.0139522243706473 0.0452234172457688 NA NA 0.0463038901560056 0.328308286439982 129 36 835 0.835 0.129 0.258 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333339 2 35.49999999999999 0.0136212597557268 0.0585663277285774 0.232578348071503 -0.0449450679728506 0.0135856054075514 0.0433696928799371 NA NA 0.0460937569123565 0.329520928419169 133 57 810 0.81 0.133 0.266 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666671 2 35.49999999999999 0.013559691378237 0.0585663277285774 0.231527089099366 -0.0450066363503404 0.013471309331993 0.0428487975762419 NA NA 0.0463882599826962 0.331938790833403 131 48 821 0.821 0.131 0.262 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.41666666666671 2 35.83333333333333 0.0137460892532251 0.0579999025523778 0.23700193704311 -0.0442538132991527 0.0132680438373124 0.0423573544883598 NA NA 0.0461471605080992 0.337573085785396 123 40 837 0.837 0.123 0.246 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.41666666666671 2 36.83333333333333 0.0139376833302847 0.0563645417845084 0.24727750619478 -0.0424268584542237 0.0146652369044129 0.0433557925294053 NA NA 0.0443526347552691 0.338779115648491 145 47 808 0.808 0.145 0.29 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.41666666666671 2 36.83333333333333 0.0139376833302847 0.0563645417845084 0.24727750619478 -0.0424268584542237 0.0141088424782388 0.0417937229691851 NA NA 0.0442899038943314 0.338095429493784 134 50 816 0.816 0.134 0.268 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333339 2 36 0.0139053809368069 0.0577207808520962 0.240907706575177 -0.0438153999152893 0.0139911966477391 0.0442222491197106 NA NA 0.047024672626131 0.351463968021494 132 51 817 0.817 0.132 0.264 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AACCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333339 2 37 0.0137146678675636 0.0561009098120238 0.244464268289357 -0.0423862419444602 0.0139137399364951 0.041728528033318 NA NA 0.0442129934523438 0.337718502255259 133 38 829 0.829 0.133 0.266 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.25000000000006 2 37.33333333333333 0.0137776549513118 0.0555809791152914 0.247884351276591 -0.0418033241639796 0.014177452961798 0.0424355079898001 NA NA 0.0428238248848651 0.32898033100428 151 47 802 0.802 0.151 0.302 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666671 2 36.666666666666664 0.0136522540928075 0.0566306643811089 0.241075294489423 -0.0429784102883014 0.0138941745264259 0.0424439291464664 NA NA 0.0452447781218374 0.342158624239285 138 43 819 0.819 0.138 0.276 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000004 2 36.33333333333333 0.0135904058348962 0.0571705240409132 0.237717006497447 -0.043580118206017 0.0137335472963759 0.0454627889065459 NA NA 0.0440563912172291 0.322570450194288 132 55 813 0.813 0.132 0.264 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.9166666666667 2 36.666666666666664 0.0136522540928075 0.0566306643811089 0.241075294489423 -0.0429784102883014 0.013702584856819 0.0410079908802489 NA NA 0.0467730877777399 0.358163314596935 160 53 787 0.787 0.16 0.32 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000003 2 36.49999999999999 0.0134986770919624 0.0568993130810351 0.237237962306115 -0.0434006359890727 0.0134016008740806 0.041951407567364 NA NA 0.0460647321404801 0.346107529642966 134 35 831 0.831 0.134 0.268 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.9166666666667 2 35.99999999999999 0.0132893842388272 0.0577207808520962 0.23023569748441 -0.0444313966132691 0.0133764409656205 0.0421527973553705 NA NA 0.0434491579433934 0.306493877590055 133 40 827 0.827 0.133 0.266 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 2 35.666666666666664 0.0132307731029258 0.0582817382454872 0.227014044213932 -0.0450509651425614 0.0129277033883637 0.0425492504271903 NA NA 0.0465271404566256 0.332908139112056 126 42 832 0.832 0.126 0.252 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000003 2 34.83333333333333 0.0130580012294226 0.0597330472949441 0.218605978110342 -0.0466750460655215 0.0128510935905707 0.0450243128100975 NA NA 0.0460704353983079 0.311001119746137 112 34 854 0.854 0.112 0.224 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.9166666666667 2 34.83333333333333 0.0129453051997499 0.0597330472949441 0.21671931679343 -0.0467877420951941 0.012559880083404 0.0445544007540961 NA NA 0.0489570880504141 0.33922946855733 95 40 865 0.865 0.095 0.19 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333336 2 35.166666666666664 0.0130864825012098 0.0591439311842398 0.221265009599108 -0.04605744868303 0.0136657348722977 0.043549881724578 NA NA 0.0452560318034156 0.308816501969436 123 39 838 0.838 0.123 0.246 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.4166666666667 2 35.33333333333333 0.0132016609860952 0.0588537115811214 0.224313142390325 -0.0456520505950262 0.0131045660892811 0.0454834327505292 NA NA 0.0465897870953312 0.327149064947131 131 52 817 0.817 0.131 0.262 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333336 2 34.666666666666664 0.0130864825012098 0.0600320307551523 0.217991667724595 -0.0469455482539425 0.0132823260910334 0.0442097246535979 NA NA 0.0480786054435259 0.328849818406673 117 39 844 0.844 0.117 0.234 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000003 2 35.666666666666664 0.0131438194165355 0.0582817382454872 0.225522089975641 -0.0451379188289516 0.0133241446053763 0.0438335734974457 NA NA 0.0479777721306528 0.346802758504858 129 50 821 0.821 0.129 0.258 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.4166666666667 1 34.99999999999999 0.0130296436641525 0.0291298749871979 0.44729487063981 -0.0161002313230454 0.0137050783338177 0.0321437162298511 NA NA 0.0356488119322197 0.651532352805707 274 129 597 0.597 0.274 0.548 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.08333333333336 1 35.666666666666664 0.0132600139021293 0.0285748846742028 0.464044354100239 -0.0153148707720736 0.0133729255045279 0.0304276455640042 NA NA 0.0323425841988592 0.635842008413511 283 135 582 0.582 0.283 0.566 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.4166666666667 1 35.33333333333333 0.0130296436641525 0.028849710620847 0.451638625960331 -0.0158200669566945 0.0131276052136813 0.0319064174315326 NA NA 0.0334711101469626 0.636464039424378 263 127 610 0.61 0.263 0.526 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000004 1 34.99999999999999 0.0129732964431592 0.0291298749871979 0.445360525881446 -0.0161565785440387 0.0133476905850348 0.0326049311523661 NA NA 0.0333195832892985 0.627749143030723 269 128 603 0.603 0.269 0.538 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000004 1 34.99999999999999 0.0129732964431592 0.0291298749871979 0.445360525881446 -0.0161565785440387 0.0131494091086805 0.029970029051612 NA NA 0.0354191059293351 0.648279003721856 255 146 599 0.599 0.255 0.51 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.08333333333337 1 34.99999999999999 0.0130864825012098 0.0291298749871979 0.449246092094837 -0.0160433924859881 0.0129009546723026 0.0311803169053384 NA NA 0.0334917073925714 0.6319202626185 249 127 624 0.624 0.249 0.498 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AACCAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.75000000000004 1 35.33333333333333 0.0131438194165355 0.028849710620847 0.455596230730915 -0.0157058912043115 0.0142335487475804 0.0294712368155868 NA NA 0.0352507757070191 0.655924218590408 287 126 587 0.587 0.287 0.574 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA:CAGGATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.50000000000004 1 34.58333333333332 0.0130155110198637 0.0294878275056261 0.441385891089482 -0.0164723164857624 0.0137195159373273 0.03232936797112 NA NA 0.0350220677361539 0.6381113660837 268 135 597 0.597 0.268 0.536 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA:GATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666671 0 35.24999999999999 0.0132453773639628 0 -Inf 0.0132453773639628 0.013339178544373 0 NA NA 0.0128019019194882 0.300836425350648 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000004 1 36.24999999999999 0.0269691977905829 0.0281063333749098 0.959541660267148 -0.0011371355843269 0.0193235989978392 0.0293497103957475 NA NA 0.0209063372931095 0.956622925425007 417 146 437 0.437 0.417 0.834 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT:GGACGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.33333333333337 1 36.08333333333332 0.0266694765273651 0.0282386296527663 0.944432391206791 -0.00156915312540123 0.0189848540412632 0.0287883979734884 NA NA 0.0206765250206123 0.939506164816143 392 124 484 0.484 0.392 0.784 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.33333333333337 1 35.74999999999999 0.0263184898584525 0.0285069944752381 0.923229205425827 -0.00218850461678558 0.0185580416889435 0.0290044471967874 NA NA 0.0208479520616899 0.916395994499595 368 141 491 0.491 0.368 0.736 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.33333333333337 1 35.74999999999999 0.0130438070339019 0.0285069944752381 0.457565144064278 -0.0154631874413362 0.0131744752009051 0.0301711840889198 NA NA 0.0151205942058059 0.306469863465767 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 35.91666666666666 0.0129873375085957 0.0283721774047871 0.457749058992011 -0.0153848398961914 0.0128428494094491 0.0284588311841612 NA NA 0.015506783888951 0.321131144693983 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCACGGCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.33333333333337 1 35.24999999999999 0.0128758527167741 0.0289192452027623 0.445234743386187 -0.0160433924859882 0.0132558161116743 0.0292108217754165 NA NA 0.0162514655433481 0.323546239422525 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 35.91666666666666 0.0129873375085957 0.0283721774047871 0.457749058992011 -0.0153848398961914 0.0131954541935174 0.0276134757086773 NA NA 0.0153201070626154 0.315270005288791 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.6666666666667 1 35.91666666666666 0.0129873375085957 0.0283721774047871 0.457749058992011 -0.0153848398961914 0.0126786854285931 0.029080425386225 NA NA 0.0162249933176589 0.34301819742388 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.50000000000003 1 35.91666666666666 0.0131871529184001 0.0283721774047871 0.464791712326425 -0.015185024486387 0.0135408041928793 0.0292880502212706 NA NA 0.0146769653302368 0.300848236655501 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGT:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000003 1 36.41666666666666 0.0133633824875953 0.0279752710599065 0.477685540882834 -0.0146118885723112 0.0136569383452442 0.0269662460171945 NA NA 0.0152517559858034 0.338039406070101 0 385 615 0.615 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGCCGTCCC 1:1 FALSE 1 1 0.75 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666669 1 36.74999999999999 0.013423177093157 0.0277167798918218 0.484297856588949 -0.0142936027986648 0.013876227030431 0.0288077855114312 NA NA 0.0154465295065258 0.35477860232661 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGTCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666669 1 36.99999999999999 0.013423177093157 0.0275260251378209 0.48765403017501 -0.0141028480446639 0.0133384691275035 0.028965097767899 NA NA 0.0140166499037805 0.314343565872063 0 389 611 0.611 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333336 1 36.83333333333332 0.0134835092215562 0.0276529018562458 0.48759834651895 -0.0141693926346895 0.0142412147327024 0.028366743407827 NA NA 0.0146862138128767 0.3346404404281 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0135138791270087 0.0284394261467203 0.475181146669063 -0.0149255470197116 0.0143109357259787 0.0294190501939861 NA NA 0.0161514117696749 0.355433370034581 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 35.83333333333332 0.0135138791270087 0.0284394261467203 0.475181146669063 -0.0149255470197116 0.0136700269432719 0.0291154020971182 NA NA 0.0144723139041993 0.3023920702461 0 339 661 0.661 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 35.49999999999999 0.0135138791270087 0.0287116399282627 0.470675975345669 -0.015197760801254 0.0141199780915085 0.0302460713328728 NA NA 0.0157940325379249 0.335925533187084 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666669 1 35.49999999999999 0.0135138791270087 0.0287116399282627 0.470675975345669 -0.015197760801254 0.0138478448870373 0.0295808077490878 NA NA 0.0148331523842656 0.305561102073436 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000001 1 35.49999999999999 0.0136367393123929 0.0287116399282627 0.474955082554144 -0.0150749006158698 0.0147902988257855 0.0301089208413426 NA NA 0.0157724667481246 0.339186843840841 0 397 603 0.603 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666669 1 35.83333333333332 0.01369901098297 0.0284394261467203 0.481690836949247 -0.0147404151637503 0.0139536681376845 0.0297039497900146 NA NA 0.0155509406841775 0.343190891197273 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666669 1 35.83333333333332 0.01369901098297 0.0284394261467203 0.481690836949247 -0.0147404151637503 0.0135985968447446 0.0291945857369867 NA NA 0.015780423375825 0.350254871592469 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333336 1 35.83333333333332 0.0135750312327134 0.0284394261467203 0.477331404743514 -0.0148643949140069 0.013364586911428 0.0288194051347156 NA NA 0.0159256796016848 0.350634041428712 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.00000000000003 1 35.16666666666666 0.0136367393123929 0.0289891158257094 0.470408942252006 -0.0153523765133166 0.0138512076758012 0.0307593368161026 NA NA 0.016933381874648 0.364600476673001 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.6666666666667 1 34.16666666666666 0.0136990109829699 0.0298546878003148 0.458856279944936 -0.0161556768173449 0.0137615585950468 0.0309829668256651 NA NA 0.0179522283850194 0.368159640456398 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 33.66666666666666 0.0134835092215562 0.0303071537534075 0.444895265694168 -0.0168236445318513 0.0138797799632071 0.031361075798148 NA NA 0.0172422835680865 0.329203134609879 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 1 32.99999999999999 0.0133633824875953 0.0309322189005369 0.432021463787178 -0.0175688364129415 0.0135022376382252 0.0320684816271506 NA NA 0.0178415134232731 0.324763242065383 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 1 33.66666666666666 0.0133633824875953 0.0303071537534075 0.440931622821654 -0.0169437712658122 0.0133723937312298 0.0313987332834245 NA NA 0.0177965467070216 0.341055411697997 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 1 33.66666666666666 0.0133633824875953 0.0303071537534075 0.440931622821654 -0.0169437712658122 0.0136307729478641 0.0315914825007386 NA NA 0.0177971274617575 0.341071167059402 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.16666666666671 1 33.16666666666666 0.0132453773639628 0.0307735475083969 0.43041437976394 -0.0175281701444341 0.0145842287958193 0.0334018236642383 NA NA 0.0184936050963575 0.343233173858119 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666671 1 32.49999999999999 0.0130722263514627 0.0314182062818701 0.416071695315276 -0.0183459799304074 0.0131094736622864 0.0315722563221126 NA NA 0.0199758479604774 0.358405268456631 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 33.16666666666666 0.0133041182530361 0.0307735475083969 0.432323190864036 -0.0174694292553607 0.0138186802135943 0.031721233200347 NA NA 0.0179816794355475 0.33129305091484 0 392 608 0.608 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666671 1 33.99999999999999 0.013333684515963 0.0300040009602743 0.444396883389549 -0.0166703164443114 0.0142194885241092 0.0311293421741798 NA NA 0.0179211204013465 0.352264935057792 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.33333333333337 1 33.66666666666666 0.0133932130500048 0.0303071537534075 0.441915897447117 -0.0169139407034027 0.0134616938622893 0.0331605009306634 NA NA 0.0172907870174012 0.327972761313202 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 33.49999999999999 0.0134835092215562 0.0304610393656427 0.442647706787196 -0.0169775301440864 0.0132387629994958 0.0327017957406893 NA NA 0.0181729331560874 0.35019006545311 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666671 1 33.66666666666666 0.0138892858254281 0.0303071537534075 0.458284071755387 -0.0164178679279794 0.0145237104878042 0.0304522105185963 NA NA 0.0170756666272484 0.336312172486824 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333337 1 32.99999999999999 0.0139538908732759 0.0309322189005369 0.451111862299464 -0.016978328027261 0.0137377184035238 0.0316374866669782 NA NA 0.0178292972873925 0.340959411389203 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.00000000000004 1 33.16666666666666 0.0140190997591144 0.0307735475083969 0.45555683027084 -0.0167544477492825 0.0143449296476272 0.0320244318582363 NA NA 0.0173980142059753 0.335542906162062 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.0147890478762119 0.0312996262515367 NA NA 0.0157966482746548 0.31510912797158 0 385 615 0.615 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 33.83333333333333 0.0142861462280209 0.0301548153585304 0.473760029970786 -0.0158686691305095 0.0144665278957963 0.0320135080341793 NA NA 0.0164256389132669 0.333998428093073 0 338 662 0.662 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0141965018594675 0.0320121499429031 NA NA 0.016594816438959 0.331869001665166 0 331 669 0.669 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.83333333333337 1 33.83333333333333 0.0140519332931024 0.0301548153585304 0.465993013919327 -0.016102882065428 0.0143565480821051 0.0319557188370971 NA NA 0.0162953218481126 0.323059365282791 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0144348316723748 0.0328208693687739 NA NA 0.0171028134068122 0.339288341352514 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.014589431342518 0.032365640945781 NA NA 0.0171298993736139 0.340052573664724 0 385 615 0.615 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666671 1 32.83333333333333 0.0139864193085547 0.0310925352587596 0.449832063939346 -0.0171061159502049 0.0141679724392802 0.0303434051346014 NA NA 0.0185427123469434 0.356254789401632 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000004 1 33.5 0.0141180639342267 0.0304610393656427 0.463479389680662 -0.016342975431416 0.0149012231744034 0.0312115778943 NA NA 0.0174982995762926 0.350316757031552 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.83333333333337 1 34.166666666666664 0.0142522103442115 0.0298546878003148 0.477386011856444 -0.0156024774561033 0.0144853228418965 0.0294956537154784 NA NA 0.014987311557029 0.297854301557246 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.83333333333337 1 34.49999999999999 0.0144582790694273 0.0295604764056575 0.489108459248654 -0.0151021973362302 0.0146469933479297 0.0308388273468211 NA NA 0.0157959223201052 0.339030797354569 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000004 1 34.49999999999999 0.0143202441116848 0.0295604764056575 0.484438880996657 -0.0152402322939727 0.0148467826175678 0.0306939629793622 NA NA 0.0155245969848403 0.326256063595288 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000004 1 34.49999999999999 0.0143202441116848 0.0295604764056575 0.484438880996657 -0.0152402322939727 0.0142966996469276 0.0298124720542564 NA NA 0.0162054191116837 0.346991661250618 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTA 2 AGTGGTAAA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666671 1 34.33333333333333 0.0142861462280209 0.0297068535712844 0.480904051105241 -0.0154207073432635 0.0143256931978218 0.0294470366707572 NA NA 0.01605488767508 0.336804015401283 0 327 673 0.673 0 0.001 N all ss13 81 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 1 33.66666666666666 0.0141513632282871 0.0303071537534075 0.466931449367661 -0.0161557905251204 0.0144995681827977 0.0316186815480965 NA NA 0.0167164198624335 0.333812874785949 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333339 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000004 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 35.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000004 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666671 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666671 0 36.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 0 37.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 0 37.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 0 37.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 0 37.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.33333333333337 0 37.58333333333332 0.014354505158023 0 -Inf 0.014354505158023 0.0146632057046508 0 NA NA 0.0146493205480339 0.327147751138874 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.6666666666667 0 38.24999999999999 0.0147063535412822 0 -Inf 0.0147063535412822 0.014486948493435 0 NA NA 0.0140668059759581 0.295808101075771 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.1666666666667 0 37.24999999999999 0.0145990010910775 0 -Inf 0.0145990010910775 0.0150723896108452 0 NA NA 0.0159550978419377 0.360188781836457 652 348 0 0 0.652 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.00000000000004 0 36.41666666666666 0.0146346106676863 0 -Inf 0.0146346106676863 0.0152908439496753 0 NA NA 0.0146528811186908 0.31791430317322 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.66666666666671 0 35.74999999999999 0.0144932046198021 0 -Inf 0.0144932046198021 0.0139634069237125 0 NA NA 0.0148041580651088 0.327582186526851 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.00000000000006 0 35.41666666666666 0.0144235214459156 0 -Inf 0.0144235214459156 0.0145669814110624 0 NA NA 0.0149909830590957 0.335976033511592 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666671 0 35.74999999999999 0.0140849209886972 0 -Inf 0.0140849209886972 0.0147987100581478 0 NA NA 0.0137718547987544 0.306434426358527 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666671 0 36.24999999999999 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0145152768463715 0 NA NA 0.0145731167677724 0.337185525953637 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0135792655017973 0 NA NA 0.0136424324993612 0.30751185417281 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666673 0 35.24999999999999 0.0137934922285677 0 -Inf 0.0137934922285677 0.0147683201748833 0 NA NA 0.0142817689266328 0.334138668593091 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000006 0 34.24999999999999 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0137876857202109 0 NA NA 0.0136126541564849 0.319743579190954 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.83333333333339 0 34.24999999999999 0.0136678042173386 0 -Inf 0.0136678042173386 0.0137177785004015 0 NA NA 0.0132065588825421 0.300703716743858 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 0 34.58333333333332 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0139570324722139 0 NA NA 0.0138788844141274 0.326925791287887 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333339 0 33.91666666666666 0.0134835092215562 0 -Inf 0.0134835092215562 0.0144615595945083 0 NA NA 0.0130229143855635 0.300497069777059 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333339 0 34.58333333333332 0.0134835092215562 0 -Inf 0.0134835092215562 0.013441402246005 0 NA NA 0.0129395762063522 0.297394809883478 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 0 35.24999999999999 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0134214469347498 0 NA NA 0.0144162219643661 0.345279482775906 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 0 35.24999999999999 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0137856689089571 0 NA NA 0.0142618999886061 0.34008496575116 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000006 0 35.08333333333332 0.0134532755150005 0 -Inf 0.0134532755150005 0.0142714758528393 0 NA NA 0.0139510191279637 0.334884483930401 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666671 0 34.16666666666666 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0143030952529599 0 NA NA 0.0141186524231383 0.346569405569519 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000004 0 33.83333333333333 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0134577118044015 0 NA NA 0.0137859018601954 0.337190042851248 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000004 0 33.33333333333333 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0135618480338674 0 NA NA 0.0133937090870988 0.323233518618591 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 0 33.16666666666666 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0132894470126066 0 NA NA 0.0136826871156546 0.330348826111705 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA:GGCATCGTT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 33.83333333333333 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0137687589720571 0 NA NA 0.0133889313918327 0.315532635632549 652 348 0 0 0.652 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG:ATCGTTTGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 0 33.83333333333333 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0134340254339335 0 NA NA 0.0140950077181305 0.341466599604782 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTT:GTTTGGGTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666671 0 33.83333333333333 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0128857685350471 0 NA NA 0.0140327182485619 0.343624251960866 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000006 0 33.49999999999999 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0138412422856709 0 NA NA 0.0138604367313371 0.333358825848232 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666671 0 33.33333333333332 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0138304566438195 0 NA NA 0.0134269162776616 0.319066621169336 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333339 0 33.66666666666666 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0133349989450041 0 NA NA 0.0138415351701865 0.331617401534937 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000006 0 33.99999999999999 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.0143028947332852 0 NA NA 0.0134750650322766 0.316463250885359 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666673 0 33.66666666666666 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0143919341463374 0 NA NA 0.0138781681442883 0.328543429474086 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTA:GGAGCCTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666673 0 34.16666666666666 0.0136522540928075 0 -Inf 0.0136522540928075 0.0137630333248044 0 NA NA 0.0135645747523927 0.314192494001977 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 140 TTA CCT TAA 2 GCCTTAAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666673 0 34.16666666666666 0.0136522540928075 0 -Inf 0.0136522540928075 0.0144139755757043 0 NA NA 0.01337923207975 0.307535758016485 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 141 AAC TAA ACA 2 TTAAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.5833333333334 0 33.83333333333333 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0137757854239795 0 NA NA 0.0135700848750689 0.325276649795357 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCA:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.5833333333334 0 34.83333333333333 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0139189502649889 0 NA NA 0.013575974248431 0.325486575502223 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 143 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666673 0 34.99999999999999 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0138697947274646 0 NA NA 0.0124339706649278 0.281951402612353 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 144 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGAT:CCCAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000006 0 35.66666666666666 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.013880602338056 0 NA NA 0.0145475580176934 0.353459515483716 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.0132244560528053 0 NA NA 0.0136762957036974 0.322000692307481 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 36.24999999999999 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0140682827762207 0 NA NA 0.0133427240588 0.296772958386775 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.3333333333334 0 35.91666666666666 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.014703136605638 0 NA NA 0.0139895168494678 0.318544491830519 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000007 0 34.916666666666664 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0138723687447435 0 NA NA 0.0143226362432362 0.337736314120527 664 336 0 0 0.664 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 35.25 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0133269635007829 0 NA NA 0.0140879794897282 0.320811814622688 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.8333333333334 0 34.58333333333333 0.0138572071256798 0 -Inf 0.0138572071256798 0.0135644072329366 0 NA NA 0.0139575291935564 0.320801418421123 680 320 0 0 0.68 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0144246246107832 0 NA NA 0.0139588214948018 0.318605679076336 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.8333333333334 0 34.91666666666666 0.0140519332931024 0 -Inf 0.0140519332931024 0.0141663279684457 0 NA NA 0.0145049490529179 0.332660859343301 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0135335179605158 0 NA NA 0.0146166680665784 0.340873393784763 652 348 0 0 0.652 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0138441343548455 0 NA NA 0.0135623757953203 0.304665181559365 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 34.91666666666666 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0147666379054322 0 NA NA 0.0138256442971822 0.311715592438321 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.50000000000007 0 34.91666666666666 0.0141180639342267 0 -Inf 0.0141180639342267 0.0145368620014164 0 NA NA 0.0135534229109172 0.297569154663802 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.16666666666673 0 34.91666666666666 0.0139864193085547 0 -Inf 0.0139864193085547 0.0143571133716035 0 NA NA 0.0141198191853155 0.321904241354494 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATCGTG 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000006 0 34.58333333333333 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0144761410229086 0 NA NA 0.0145996815862699 0.340311925646694 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 35.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666671 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000006 0 36.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000006 0 37.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA:TTGCCAAAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000006 0 38.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC:CCAAAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000006 0 38.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC:AAGGGCTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCC:GCCTCTTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCC CTT CCC 2 TCTTCCCGC:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CCC GCT 2 TCCCGCTCT:TCTCGCTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000006 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000007 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666674 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666674 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000007 0 33.083333333333314 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.0136194502470478 0 NA NA 0.0139216897031565 0.332238507379506 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.0833333333334 0 32.749999999999986 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0142246442547973 0 NA NA 0.0138904519927959 0.3333230220844 613 387 0 0 0.613 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000007 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0131059199638822 0 NA NA 0.0138371342382157 0.335775162601159 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000007 0 32.749999999999986 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0132409716475655 0 NA NA 0.0134175184072463 0.320881082308229 660 340 0 0 0.66 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000007 0 33.083333333333314 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0134520970678037 0 NA NA 0.0131655797047123 0.311708108813154 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000007 0 34.083333333333314 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0128096474250984 0 NA NA 0.0136562003532587 0.329411732986253 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 34.41666666666665 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0128281954313928 0 NA NA 0.0136055463184662 0.328686861523826 679 321 0 0 0.679 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666674 0 35.41666666666665 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0124863630429507 0 NA NA 0.0131237368699156 0.317629531709114 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAC 2 GACAGACTG:GACAGATTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666674 0 35.74999999999998 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0130425294218401 0 NA NA 0.0129638825601567 0.311698918215389 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 228 CTG GAC TGA 2 AGACTGAAC:AGATTGAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666674 0 35.74999999999998 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0127048136240012 0 NA NA 0.0129501120836878 0.311184669726875 607 393 0 0 0.607 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 CTGAACCAG:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666674 0 36.083333333333314 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0125581356082973 0 NA NA 0.0125952809133543 0.304048567809452 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.25000000000009 0 37.083333333333314 0.0130580012294226 0 -Inf 0.0130580012294226 0.0137580115813902 0 NA NA 0.012997125496101 0.31504913876008 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333341 0 37.083333333333314 0.0131726767040262 0 -Inf 0.0131726767040262 0.0137150870651437 0 NA NA 0.0130072943726359 0.311196509953375 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.41666666666674 0 36.91666666666665 0.0130296436641525 0 -Inf 0.0130296436641525 0.0134447769923886 0 NA NA 0.0129893755906759 0.315812577224944 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666674 0 35.91666666666665 0.0128620515547158 0 -Inf 0.0128620515547158 0.0127142690768002 0 NA NA 0.0124431479772886 0.301292612809739 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000009 0 35.91666666666665 0.0129732964431592 0 -Inf 0.0129732964431592 0.013159193832726 0 NA NA 0.0129156743027382 0.315156262037416 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.75000000000009 0 35.91666666666665 0.0129732964431592 0 -Inf 0.0129732964431592 0.0123693518063817 0 NA NA 0.0130773264321818 0.321175569001216 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.58333333333341 0 36.083333333333314 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.013252633345192 0 NA NA 0.0125927345613786 0.301859864298546 667 333 0 0 0.667 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.58333333333341 0 35.74999999999998 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.012411207461358 0 NA NA 0.0118163674448292 0.277405510317381 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333341 0 35.74999999999998 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0131122364233937 0 NA NA 0.0129833601811035 0.325984561373683 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000009 0 35.41666666666665 0.0128071415099282 0 -Inf 0.0128071415099282 0.0125800798491244 0 NA NA 0.0127309907458424 0.314424456387189 606 394 0 0 0.606 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000009 0 36.083333333333314 0.0128071415099282 0 -Inf 0.0128071415099282 0.0132148466906205 0 NA NA 0.0127073327015233 0.31352435291691 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000009 0 36.083333333333314 0.0128071415099282 0 -Inf 0.0128071415099282 0.0129591215926026 0 NA NA 0.0135553524444237 0.344759314807731 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333341 0 36.49999999999998 0.0259766224970672 0 -Inf 0.0259766224970672 0.0182057448671146 0 NA NA 0.018204577203431 0.153600624437865 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.00000000000007 0 36.833333333333314 0.0267885619515594 0 -Inf 0.0267885619515594 0.0186017707506056 0 NA NA 0.0183882692435584 0.145163617803398 877 123 0 0 0.877 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.3333333333334 0 36.833333333333314 0.027400307499342 0 -Inf 0.027400307499342 0.0184699684282562 0 NA NA 0.0194328206382627 0.15853922099589501 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.3333333333334 0 36.99999999999998 0.027400307499342 0 -Inf 0.027400307499342 0.0189572651948653 0 NA NA 0.0188631045224341 0.146338353218573 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.3333333333334 0 35.99999999999998 0.0270299523623976 0 -Inf 0.0270299523623976 0.0186469108487526 0 NA NA 0.0188002478647185 0.150506570958221 879 121 0 0 0.879 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.50000000000007 0 35.833333333333314 0.0269691977905829 0 -Inf 0.0269691977905829 0.018394488269047 0 NA NA 0.0191205150843798 0.158396552276007 853 147 0 0 0.853 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.8333333333334 0 35.49999999999998 0.0268485044068343 0 -Inf 0.0268485044068343 0.0186949878160235 0 NA NA 0.0181278995436566 0.138590622270687 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.8333333333334 0 35.16666666666665 0.0264928206228062 0 -Inf 0.0264928206228062 0.0183222583999063 0 NA NA 0.0187045346676376 0.156662840046236 852 148 0 0 0.852 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000007 0 34.33333333333332 0.026434454296256 0 -Inf 0.026434454296256 0.0182940116217582 0 NA NA 0.0192197772759414 0.169014358979308 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.50000000000007 0 34.83333333333332 0.0266103300115572 0 -Inf 0.0266103300115572 0.0178761693142949 0 NA NA 0.0184202631045442 0.148563896278464 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000007 0 34.499999999999986 0.0262608883838265 0 -Inf 0.0262608883838265 0.0186846922090201 0 NA NA 0.017977367131532 0.144077200113833 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.16666666666673 0 33.83333333333332 0.025698445480572 0 -Inf 0.025698445480572 0.0178769976624931 0 NA NA 0.0179515032230109 0.152273109762655 882 118 0 0 0.882 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.50000000000006 0 33.49999999999999 0.0255888359187695 0 -Inf 0.0255888359187695 0.0175314273385791 0 NA NA 0.0178855443144616 0.152516410931609 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCC:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.8333333333334 0 33.166666666666664 0.0254801574935108 0 -Inf 0.0254801574935108 0.0179099603310186 0 NA NA 0.0179457541558938 0.155653327154104 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCCAAA:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.00000000000006 0 33.49999999999999 0.025426163756761 0 -Inf 0.025426163756761 0.0176978978097839 0 NA NA 0.0176848697424841 0.150509137038629 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.16666666666673 0 33.33333333333333 0.0253723983888037 0 -Inf 0.0253723983888037 0.0173180176272805 0 NA NA 0.0176610090601123 0.15082214139067401 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.16666666666673 0 32.33333333333333 0.025054521799629 0 -Inf 0.025054521799629 0.0174233012446502 0 NA NA 0.0171035587788748 0.142955884135964 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333339 0 32.49999999999999 0.0251595918684029 0 -Inf 0.0251595918684029 0.0172722627498854 0 NA NA 0.0178294751192371 0.158208193036686 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333339 0 32.49999999999999 0.0251595918684029 0 -Inf 0.0251595918684029 0.0172287277174586 0 NA NA 0.017057491639731 0.140215826548271 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333339 0 32.49999999999999 0.0251595918684029 0 -Inf 0.0251595918684029 0.0176407604300335 0 NA NA 0.0175718809471212 0.152198253316085 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000006 0 31.83333333333333 0.0249503257372043 0 -Inf 0.0249503257372043 0.01718945930414 0 NA NA 0.0172474292312206 0.148005824182784 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACG:AAACGTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.33333333333339 0 32.33333333333333 0.0253188599437158 0 -Inf 0.0253188599437158 0.0181631269990707 0 NA NA 0.0178754479846122 0.156657189350412 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 264 ACG GTA CGG 2 CGTACGGCA:CGTACTGCC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.33333333333337 0 33.33333333333333 0.0256435235612095 0 -Inf 0.0256435235612095 0.0176975666872342 0 NA NA 0.0170426391514616 0.132409306267834 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 265 GCA CGG CAA 2 ACGGCAACT:ACTGCCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.66666666666671 0 32.99999999999999 0.0255343810572878 0 -Inf 0.0255343810572878 0.0177867775025178 0 NA NA 0.0170718268726525 0.134731092803728 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 266 ACA CAA CAA 2 GCAACTAAG:GCCACAAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000004 0 32.33333333333333 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.0172272233826397 0 NA NA 0.0162409947475514 0.122128822935976 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACTAAGTCG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000004 0 32.83333333333333 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.0175231262463718 0 NA NA 0.0178542352539241 0.159659402293635 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC:AAGTCGTAC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333337 0 32.58333333333333 0.0252389746234554 0 -Inf 0.0252389746234554 0.0174235019518328 0 NA NA 0.0171189756873083 0.140393465847949 881 119 0 0 0.881 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:TCGTACAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333337 0 32.74999999999999 0.0124355180497881 0 -Inf 0.0124355180497881 0.0127859445208799 0 NA NA 0.0122345009582587 0.309424500698836 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.25000000000004 0 32.58333333333332 0.0124097970858067 0 -Inf 0.0124097970858067 0.0118554528604208 0 NA NA 0.0128899929445162 0.335674696834553 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.25000000000004 0 31.916666666666657 0.0124097970858067 0 -Inf 0.0124097970858067 0.0120865193369179 0 NA NA 0.0125291806290909 0.321943683294467 605 395 0 0 0.605 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666671 0 32.249999999999986 0.0123841823043677 0 -Inf 0.0123841823043677 0.0126250044651666 0 NA NA 0.0124937911565678 0.321574781494948 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA:ACTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333339 0 31.58333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.011947451156076 0 NA NA 0.0122523933770096 0.316112110935539 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666671 0 31.58333333333332 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0121403972768692 0 NA NA 0.0120558095526943 0.310262415653782 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666671 0 31.249999999999986 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.012241519326855 0 NA NA 0.0126235251343852 0.338401745422223 612 388 0 0 0.612 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.58333333333339 0 30.58333333333332 0.0120605613963404 0 -Inf 0.0120605613963404 0.0118977477511379 0 NA NA 0.0122473956049497 0.324749350268768 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.91666666666671 0 31.249999999999986 0.0121583209710618 0 -Inf 0.0121583209710618 0.012307832031343 0 NA NA 0.0121940472546804 0.318730443054792 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.91666666666671 0 31.08333333333332 0.0121583209710618 0 -Inf 0.0121583209710618 0.012176123989378 0 NA NA 0.0121264152864423 0.316038889642742 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.25000000000004 0 31.749999999999986 0.0122576783566175 0 -Inf 0.0122576783566175 0.0126861092019513 0 NA NA 0.0120875835552826 0.310548463640102 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.25000000000004 0 31.749999999999986 0.0122576783566175 0 -Inf 0.0122576783566175 0.0115561003039199 0 NA NA 0.0124639509408201 0.3253857831178 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.91666666666671 0 31.08333333333332 0.0121583209710618 0 -Inf 0.0121583209710618 0.0122833452623488 0 NA NA 0.0132394731760311 0.358441557214921 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.41666666666671 0 30.916666666666654 0.0120848536073488 0 -Inf 0.0120848536073488 0.0119714885835108 0 NA NA 0.011948371362379 0.311814177742748 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000004 0 31.58333333333332 0.0124872811774231 0 -Inf 0.0124872811774231 0.0121486431588388 0 NA NA 0.0123071654818879 0.310279836245509 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333337 0 31.249999999999986 0.0125921111074123 0 -Inf 0.0125921111074123 0.0129188525403493 0 NA NA 0.0124335263871427 0.311177388463882 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.4166666666667 0 31.249999999999986 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0129236984607613 0 NA NA 0.0125252251763391 0.310653703416263 667 333 0 0 0.667 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.9166666666667 0 31.416666666666654 0.0126185941874855 0 -Inf 0.0126185941874855 0.0128185794932259 0 NA NA 0.0126582943669107 0.318830672421299 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333337 0 31.08333333333332 0.0126718959543505 0 -Inf 0.0126718959543505 0.0123622193986842 0 NA NA 0.0126414619660237 0.316146833953402 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000004 0 30.416666666666654 0.0126451889006809 0 -Inf 0.0126451889006809 0.0121939664259995 0 NA NA 0.0119048755912224 0.288151379408533 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333337 0 31.083333333333318 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0123031201208749 0 NA NA 0.0130595083471357 0.328813394333723 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAA:GACCAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333337 0 30.583333333333318 0.0126718959543505 0 -Inf 0.0126718959543505 0.0136246352398739 0 NA NA 0.0125505182690595 0.312652878872356 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 291 GAA AAG AAC 2 CAAGAACTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333337 0 29.583333333333318 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0127954470595576 0 NA NA 0.012332194828148 0.310254785865718 672 328 0 0 0.672 0.001 N all ss13 292 CTA AAC TAA 2 GAACTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333337 0 30.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 30.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 28.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000006 0 27.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000006 0 27.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 28.249999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 28.916666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 28.916666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 28.916666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 28.916666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666673 0 28.916666666666647 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000006 0 27.249999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666673 0 26.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.0833333333334 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.5833333333334 0 26.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000004 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.91666666666671 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.58333333333339 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.58333333333339 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.58333333333339 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.25000000000006 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.91666666666673 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.16666666666673 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATA:GGAGCCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666673 0 30.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATA CCA TAA 2 GCCATAAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000006 0 30.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TAA AAT 2 ATAAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000007 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000007 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000007 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000007 0 30.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000006 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333339 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000006 0 31.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666673 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.91666666666673 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000006 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000006 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTCATATTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000007 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATATTGCTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 1 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 32.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 32.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000007 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000007 0 34.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.58333333333341 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666676 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 31.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.41666666666674 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333341 0 31.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.08333333333341 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333341 0 34.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333341 0 34.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333341 0 33.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333341 0 34.08333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666676 0 34.08333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GA- 1 CAGAGA---:CAGAGACAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.666666666666667 1.33333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 --- GAC AAA 1 AGA---AAG:AGACAAAAG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG --A AGA 1 ---AAGAAG:CAAAAGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTG:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTG TTC TGC 2 CTTCTGCCT:CTTCTTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TGC CTG 2 CTGCCTGCG:CTTCCTGCG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC:GCGGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG:GCTGATATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATATGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KJ473814.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.5833333333334 3 34.75 0.0273067703935705 0.0917171833187057 0.297727965529458 -0.0644104129251351 0.0198378349528396 0.0572763281655066 NA NA 0.0628996978940695 0.305826847500782 110 4 886 0.886 0.11 0.22 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666673 3 34.916666666666664 0.0273690573365762 0.091251642986027 0.299929474593319 -0.0638825856494508 0.019325850537564 0.0546604505416641 NA NA 0.0583812747659185 0.273853791457557 116 7 877 0.877 0.116 0.232 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000006 3 34.916666666666664 0.0272447663451876 0.091251642986027 0.298567406061494 -0.0640068766408394 0.0194858549198225 0.0566201406434275 NA NA 0.0597357442799708 0.283944470249325 106 4 890 0.89 0.106 0.212 N all ss13 5 GGA ATG GAA 2 AATGGAACC:AATGGACCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.75000000000006 3 35.25 0.0276210731371878 0.0903346148069003 0.305763999727355 -0.0627135416697125 0.0196772447555194 0.0572776998031599 NA NA 0.0598738677929361 0.294902407576476 124 8 868 0.868 0.124 0.248 N all ss13 6 ACC GAA CCC 2 GGAACCCAA:GGACCCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.75000000000006 3 36.25 0.0280079218999906 0.0876910035441767 0.319393333044488 -0.0596830816441861 0.0201610602151785 0.0531656903127759 NA NA 0.0558136112511451 0.284921701481534 120 11 869 0.869 0.12 0.24 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 ACCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000006 3 36.25 0.0138732279313668 0.0876910035441767 0.158205829226002 -0.07381777561281 0.0136884245713145 0.0547023687020532 NA NA 0.0567607962983055 0.193427483750379 54 16 930 0.93 0.054 0.108 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.91666666666671 3 35.416666666666664 0.0138412232800193 0.0898829861073045 0.153991582606026 -0.0760417628272853 0.0135802441952185 0.0541597922180433 NA NA 0.0589411050625865 0.19700508384914 63 15 922 0.922 0.063 0.126 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AACCAA:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666671 3 36.416666666666664 0.0136522540928075 0.0872653886078579 0.156445233449383 -0.0736131345150504 0.0136353978660073 0.0524271275708629 NA NA 0.0541620019274738 0.174105790817163 59 15 926 0.926 0.059 0.118 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333339 3 36.75 0.0137146678675636 0.0864264476831886 0.158686006832505 -0.072711779815625 0.0145227052463996 0.054120270054766 NA NA 0.053869725687125 0.177089531364469 50 13 937 0.937 0.05 0.1 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 3 36.083333333333336 0.0135904058348962 0.0881207952860292 0.154224729710886 -0.074530389451133 0.012542913370080601 0.0517219535176738 NA NA 0.0577717263950924 0.197021436954535 60 12 928 0.928 0.06 0.12 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333339 3 35.75 0.0135291154422588 0.088993157850987 0.152024220389082 -0.0754640424087282 0.0138610674246702 0.0541901749818566 NA NA 0.0563810268277927 0.180744836846671 57 12 931 0.931 0.057 0.114 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC:AGTGCCTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000004 3 36.08333333333333 0.0135904058348962 0.0881207952860292 0.154224729710886 -0.074530389451133 0.0135775652367578 0.0522729784520869 NA NA 0.0575117083900842 0.195004148501254 61 16 923 0.923 0.061 0.122 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC:GCCTCCCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 3 35.75 0.0134081783305544 0.088993157850987 0.150665271964003 -0.0755849795204326 0.013876895739676 0.0551324557888051 NA NA 0.0575143776032729 0.188781339169928 52 15 933 0.933 0.052 0.104 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT:TCCCGCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333337 2 35.25 0.0267586909940917 0.0589984642956841 0.453548940867079 -0.0322397733015924 0.0191160674652756 0.0440628078588602 NA NA 0.049577125934134 0.51550147526063 227 16 757 0.757 0.227 0.454 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.58333333333337 2 34.75 0.0265808550345806 0.0598821656332629 0.443886001006879 -0.0333013105986822 0.0184978241506544 0.043153258157024 NA NA 0.0508719523652205 0.512718607278658 252 8 740 0.74 0.252 0.504 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333337 2 34.166666666666664 0.0397005575048303 0.0609472230590743 0.651392393486898 -0.021246665554244 0.0222788723444479 0.0455342319987028 NA NA 0.0514425167398058 0.679593708282456 345 5 650 0.65 0.345 0.69 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000003 2 34.166666666666664 0.0393532888030902 0.0609472230590743 0.645694534186508 -0.0215939342559841 0.0229550491656759 0.0466355084506407 NA NA 0.0539757309514092 0.689106821264393 339 1 660 0.66 0.339 0.678 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.4166666666667 2 34.5 0.0397883346582442 0.0603340239140544 0.659467611756221 -0.0205456892558102 0.0225013598471528 0.0435602695787573 NA NA 0.0508276289676012 0.686048849153014 335 7 658 0.658 0.335 0.67 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC:GGTGGACCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.08333333333336 2 34.916666666666664 0.0537744248135208 0.059584670169267 0.902487580459192 -0.0058102453557462 0.0259461014068408 0.0428937322474829 NA NA 0.0544855092621606 0.915075885142561 466 2 532 0.532 0.466 0.932 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCTTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000003 2 34.25 0.0532965566864638 0.0607927570603562 0.876692541408345 -0.00749620037389241 0.0270498140945725 0.0470010826718991 NA NA 0.0559172136057769 0.893355996046842 456 2 542 0.542 0.456 0.912 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCTTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.4166666666667 2 35.25 0.0535344239114693 0.0589984642956841 0.907386735410086 -0.0054640403842148 0.027766381472925 0.0422875144777474 NA NA 0.0537291144402663 0.918997912780298 481 3 516 0.516 0.481 0.962 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.00000000000003 1 34.666666666666664 0.0531195394264593 0.029415534864961 1.80583285907658 0.0237040045614983 0.0265165994845464 0.0301528167348674 NA NA 0.043883576090904 0.589089019502997 711 8 281 0.281 0.711 0.562 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.00000000000003 1 35 0.053834761795598 0.0291298749871979 1.84809450158154 0.0247048868084001 0.0271975867449044 0.0324020853727508 NA NA 0.0437898061103203 0.572638568446071 707 8 285 0.285 0.707 0.57 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.16666666666669 1 34.83333333333333 0.0530021800130169 0.0292720079293014 1.81067797402314 0.0237301720837154 0.0258750121423867 0.0300661010380403 NA NA 0.0447835129474922 0.596190732782831 696 7 297 0.297 0.696 0.594 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.16666666666669 1 34.83333333333333 0.0530021800130169 0.0292720079293014 1.81067797402314 0.0237301720837154 0.0268488632144419 0.0312439520007284 NA NA 0.0436076438970068 0.586321330309164 725 8 267 0.267 0.725 0.534 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.16666666666669 1 34.83333333333333 0.0530021800130169 0.0292720079293014 1.81067797402314 0.0237301720837154 0.0253408166605883 0.0300621880779274 NA NA 0.0408007535456543 0.560828649099478 718 7 275 0.275 0.718 0.55 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000001 1 34.83333333333333 0.0534747581886499 0.0292720079293014 1.82682234569639 0.0242027502593484 0.0276120621900681 0.0321193709007163 NA NA 0.0426085837848148 0.570017841860675 717 2 281 0.281 0.717 0.562 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT:AACCAGGAT 1:1 FALSE 1.25 0.333333333333333 1.41666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.16666666666669 1 35.166666666666664 0.0537142229868647 0.0289891158257093 1.85291001318597 0.0247251071611554 0.027199243166992 0.0301532030725993 NA NA 0.0420508881620744 0.556545303182856 721 5 274 0.274 0.721 0.548 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA:CAGGATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.91666666666669 1 34.416666666666664 0.0531784143271381 0.0296334842053817 1.79453802862238 0.0235449301217564 0.0261822929477636 0.0314171003759998 NA NA 0.0420664775266678 0.575678849844705 726 4 270 0.27 0.726 0.54 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA:GATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.58333333333336 0 35.08333333333333 0.0541384900641951 0 -Inf 0.0541384900641951 0.0275924588889747 0 NA NA 0.0260404598602412 0.0376160303517851 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333336 1 36.08333333333333 0.0548816190849608 0.0282386296527663 1.94349441739233 0.0266429894321945 0.027259068537369 0.0286005453582294 NA NA 0.0419911972749301 0.525761173664996 734 11 255 0.255 0.734 0.51 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT:GGACGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 1 35.916666666666664 0.0542609435735893 0.0283721774047871 1.91247019216911 0.0258887661688022 0.0289655082077045 0.0297393618257145 NA NA 0.041232055266156 0.530082818910021 706 6 288 0.288 0.706 0.576 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.41666666666669 1 35.58333333333333 0.0535344239114693 0.0286430990492925 1.86901647127432 0.0248913248621769 0.0266777488042842 0.0291088407772821 NA NA 0.0426815156979255 0.559767109852132 718 9 273 0.273 0.718 0.546 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666669 1 35.58333333333333 0.0397883346582442 0.0286430990492925 1.38910718388997 0.0111452356089517 0.0224195973444846 0.0310126986531196 NA NA 0.0378901357672759 0.768646266602658 615 23 362 0.362 0.615 0.724 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000001 1 35.74999999999999 0.0396131668795608 0.0285069944752381 1.38959464541131 0.0111061724043226 0.0238425668982589 0.0286237094324298 NA NA 0.036671959659462 0.762002734373182 627 14 359 0.359 0.627 0.718 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCACGGCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.41666666666669 1 35.08333333333333 0.0392674190316604 0.0290593249318817 1.35128462631901 0.0102080940997787 0.0235926209265131 0.0288588118949217 NA NA 0.0373559422542667 0.784649053939026 605 18 377 0.377 0.605 0.754 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:CGGCCAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000001 1 35.74999999999999 0.0396131668795608 0.0285069944752381 1.38959464541131 0.0111061724043226 0.0226756772938396 0.028494343670066 NA NA 0.0377476157450971 0.768588404197274 626 8 366 0.366 0.626 0.732 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000001 1 35.74999999999999 0.0396131668795608 0.0285069944752381 1.38959464541131 0.0111061724043226 0.0230788376851691 0.0300891917314971 NA NA 0.0379967353364294 0.770062758472459 596 15 389 0.389 0.596 0.778 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.16666666666669 1 35.49999999999999 0.039920730758297 0.0287116399282627 1.39040231968779 0.0112090908300343 0.0223238481123087 0.0295596639877859 NA NA 0.0379437867615288 0.767678344235054 643 16 341 0.341 0.643 0.682 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.16666666666669 1 35.99999999999999 0.0404592471687861 0.0283052459871353 1.42939041007362 0.0121540011816508 0.0236658112491339 0.0289779468870877 NA NA 0.037366888037357 0.744983346208366 646 16 338 0.338 0.646 0.676 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.83333333333334 1 36.33333333333333 0.040641996635402 0.0280406490537152 1.44939571682336 0.0126013475816867 0.0239622983945427 0.0296763420478231 NA NA 0.0369930677622091 0.73337402302255 644 12 344 0.344 0.644 0.688 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGACCCCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.83333333333334 1 36.83333333333333 0.040641996635402 0.0276529018562458 1.46971904962019 0.0129890947791562 0.0240373791085847 0.0281353184545962 NA NA 0.0376124697646995 0.729838689212842 650 8 342 0.342 0.65 0.684 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT:CCCCAGGGT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 37 0.0410124947055404 0.0275260251378209 1.48995339865431 0.0134864695677194 0.0236082656886345 0.0279545485946164 NA NA 0.0357076908600266 0.705660235571007 662 14 324 0.324 0.662 0.648 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA:CAGGGTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 35.83333333333333 0.0410124947055404 0.0284394261467203 1.44209993879465 0.0125730685588201 0.0245393299456537 0.0289549268439941 NA NA 0.0399827662996741 0.753170023165531 636 16 348 0.348 0.636 0.696 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 35.83333333333333 0.0410124947055404 0.0284394261467203 1.44209993879465 0.0125730685588201 0.023971379499367 0.0299734942305632 NA NA 0.0365590878737262 0.73091329955817 641 13 346 0.346 0.641 0.692 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 35.49999999999999 0.0410124947055404 0.0287116399282627 1.42842745339562 0.0123008547772777 0.0238653097153083 0.0283780822691614 NA NA 0.0373769830171621 0.742078291037384 643 20 337 0.337 0.643 0.674 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 35.49999999999999 0.0410124947055404 0.0287116399282627 1.42842745339562 0.0123008547772777 0.0241908866039177 0.0300194345418558 NA NA 0.0365687949605046 0.736587555592536 628 16 356 0.356 0.628 0.712 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACC:AATAATACT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.5 1 35.49999999999999 0.0413898116754682 0.0287116399282627 1.44156905627413 0.0126781717472055 0.0236480861924936 0.0285635122429189 NA NA 0.0366518046106423 0.729411460121179 635 16 349 0.349 0.635 0.698 N all ss13 50 ACC ATA CCG 2 AATACCGCG:AATACTGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.16666666666667 1 35.83333333333333 0.0415810863628941 0.0284394261467203 1.46209301651782 0.0131416602161738 0.0233673591286894 0.0303408593880844 NA NA 0.0380434266096254 0.729764816774565 653 15 332 0.332 0.653 0.664 N all ss13 51 GCG CCG CGT 2 ACCGCGTCT:ACTGCGTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74 1 35.99999999999999 0.0416773883661081 0.0283052459871353 1.47242629105044 0.0133721423789728 0.0221018657487794 0.0292919116940207 NA NA 0.0366823486069424 0.715455643994532 659 13 328 0.328 0.659 0.656 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.66666666666667 1 35.99999999999999 0.0412948328872706 0.0283052459871353 1.45891093495669 0.0129895869001353 0.0244270084583567 0.0297522694684811 NA NA 0.0365642084884527 0.722399199120747 646 15 339 0.339 0.646 0.678 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.33333333333334 1 35.33333333333333 0.0414852284880391 0.028849710620847 1.43797728279678 0.0126355178671921 0.0246950303254144 0.0294977185269687 NA NA 0.0389933441911984 0.745905525698875 648 15 337 0.337 0.648 0.674 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74 1 34.33333333333333 0.0416773883661081 0.0297068535712844 1.40295532362925 0.0119705347948237 0.0250536938482022 0.0309015637652313 NA NA 0.0387382311882928 0.757313252793098 677 12 311 0.311 0.677 0.622 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.16666666666667 1 33.83333333333333 0.0410124947055404 0.0301548153585304 1.3600645276025 0.01085767934701 0.024561208914771 0.0316265715595982 NA NA 0.0392429759888506 0.782027146232537 578 22 400 0.4 0.578 0.8 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.66666666666667 1 33.33333333333333 0.0407339920153049 0.0306164958901914 1.33045898398696 0.0101174961251135 0.0239891859424342 0.032338814016147 NA NA 0.0396268573606152 0.798476598974993 611 19 370 0.37 0.611 0.74 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76 1 33.66666666666666 0.0405504159527068 0.0303071537534075 1.33798166210668 0.0102432621992993 0.0238109623412614 0.0313553162511392 NA NA 0.0409987478363197 0.802708537624014 593 18 389 0.389 0.593 0.778 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76 1 33.66666666666666 0.0405504159527068 0.0303071537534075 1.33798166210668 0.0102432621992993 0.0225675091758031 0.0308167640208737 NA NA 0.040622155395554 0.800917784749353 603 24 373 0.373 0.603 0.746 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.66666666666667 1 33.16666666666666 0.0401881846005798 0.0307735475083969 1.30593278495481 0.00941463709218295 0.0239013114432099 0.0325496188172618 NA NA 0.0395935887052896 0.812050290277815 616 16 368 0.368 0.616 0.736 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC:CAGCATGGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.66666666666667 1 32.49999999999999 0.0396568140359608 0.0314182062818701 1.26222400095593 0.00823860775409074 0.0244467302612264 0.0339521337736766 NA NA 0.039130055222426303 0.833242926528225 594 17 389 0.389 0.594 0.778 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG:CATGGTAAG 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.33333333333334 1 33.16666666666666 0.0403684875103351 0.0307735475083969 1.31179180753601 0.00959494000193823 0.0242894572232988 0.0310876708337759 NA NA 0.0403562501415507 0.812070358703513 617 17 366 0.366 0.617 0.732 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG:GGTAAGGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.00000000000001 1 34.16666666666666 0.0405504159527068 0.0298546878003148 1.35825958803961 0.010695728152392 0.0240065269860498 0.0304599368603947 NA NA 0.0379967312312333 0.778334026248067 616 14 370 0.37 0.616 0.74 N all ss13 63 GAA AGG AAG 2 AAGGAAGGA:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.66666666666669 1 33.83333333333333 0.0407339920153049 0.0301548153585304 1.35082876585354 0.0105791766567745 0.0235559909736616 0.0310770727855105 NA NA 0.0389219161532078 0.785771857012056 601 13 386 0.386 0.601 0.772 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGGACTC:GAGGAACTT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.00000000000001 1 33.83333333333333 0.0411061773712463 0.0301548153585304 1.36317125084362 0.0109513620127159 0.0238876305847582 0.0297253389587621 NA NA 0.0387978776601136 0.777738758109349 592 21 387 0.387 0.592 0.774 N all ss13 65 CTC AAC TCA 2 GAACTTAGA:GGACTCAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.16666666666669 1 34 0.02784542552167 0.0300040009602743 0.92805708007201 -0.00215857543860434 0.0200883877904045 0.0293061854941408 NA NA 0.0368249127579332 0.953256963845837 473 46 481 0.481 0.473 0.946 N all ss13 66 AAA TCA AAT 2 CTCAAATTC:CTTAGATTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.75 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666669 1 33.5 0.0280406490537152 0.0304610393656427 0.920541440399522 -0.00242039031192744 0.0203210804833419 0.0321857974627656 NA NA 0.0374709172095612 0.948497391964422 459 41 500 0.5 0.459 0.918 N all ss13 67 TTC AAT TCC 2 AAATTCCCT:AGATTCCCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333334 1 33.416666666666664 0.0139538908732759 0.0305385697640887 0.456926797196793 -0.0165846788908128 0.0138733884933366 0.0311949218260614 NA NA 0.0354604174694442 0.640002335150503 306 137 557 0.557 0.306 0.612 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCAA:TTCCCTCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000001 1 34.08333333333333 0.0142184353084606 0.0299291581301553 0.475069671075536 -0.0157107228216947 0.0141837593570938 0.031867670039705 NA NA 0.0332168715044188 0.636231594753288 280 129 591 0.591 0.28 0.56 N all ss13 69 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGC:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000001 1 34.08333333333333 0.0142184353084606 0.0299291581301553 0.475069671075536 -0.0157107228216947 0.0142463967918274 0.0318379202583031 NA NA 0.0343380425295222 0.647289344412094 290 119 591 0.591 0.29 0.58 N all ss13 70 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAG:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333336 1 33.83333333333333 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0297314641866778 NA NA 0.0318532404806615 0.343802030225677 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGA:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333336 1 33.83333333333333 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0304718359803101 NA NA 0.0297793245540216 0.311246906314742 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 72 GGA AGG GAG 2 CAGGGAGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000003 1 33.5 0 0.0304610393656427 0 -0.0304610393656427 0 0.0318781892075188 NA NA 0.0310855549553843 0.327130654164216 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 73 GTT GAG TTC 2 GGAGTTCCT:GGCGTTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333337 1 33.416666666666664 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0315588410501273 NA NA 0.0305444490761977 0.317403667724658 0 391 609 0.609 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC:GTTCCTATC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 1 33.083333333333336 0 0.0308526791703671 0 -0.0308526791703671 0 0.0324118099426315 NA NA 0.0312225014771668 0.323076614030333 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCTATCAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 1 33.583333333333336 0 0.0303839016876759 0 -0.0303839016876759 0 0.0321176243470693 NA NA 0.0326954937536858 0.352733962567984 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333337 1 33.416666666666664 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0319506313452323 NA NA 0.0307008919261102 0.319875973664729 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 1 33.583333333333336 0 0.0303839016876759 0 -0.0303839016876759 0 0.0311803927067729 NA NA 0.0331956880090498 0.360035922705753 0 394 606 0.606 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 1 33.583333333333336 0 0.0303839016876759 0 -0.0303839016876759 0 0.0307661595643429 NA NA 0.0316285464306966 0.336729156428202 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGC:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 1 33.333333333333336 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0314521908051675 NA NA 0.0319374615194308 0.337740642765251 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 80 GGC GTG GCA 2 AGTGGCACA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 1 33.333333333333336 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0314729277897693 NA NA 0.0312242391495804 0.32682152413197 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 81 ACA GCA CAG 2 GGCACAGAT:GGTCCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 1 32.66666666666667 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0326089018973229 NA NA 0.031473264660658 0.32068563772498 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 ACAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 32.66666666666667 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.333333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333339 0 34.333333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333337 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC:GGCTACTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333337 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA:TACTATAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 AGA ACC GAA 2 TACCGAAGA:TATAGAAGA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0.25 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000004 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 AGAAGAGCT:CGAAGAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 35 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333337 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000004 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000004 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.4166666666667 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGAGCTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.4166666666667 0 36.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GAGCTTAGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000003 0 36.583333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTTAGCCCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.4166666666667 0 37.083333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 36.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 36.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000003 0 37.41666666666667 0.0143202441116848 0 -Inf 0.0143202441116848 0.0146968330590516 0 NA NA 0.0142745434891587 0.315763626719141 589 411 0 0 0.589 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.16666666666669 0 37.75 0.0145990010910775 0 -Inf 0.0145990010910775 0.0147071407214515 0 NA NA 0.0147810030845425 0.323306079255711 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000001 0 36.75 0.0144757207777853 0 -Inf 0.0144757207777853 0.0140384200740718 0 NA NA 0.0146760597795317 0.323961752342442 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000001 0 35.75 0.0144757207777853 0 -Inf 0.0144757207777853 0.015433008637763 0 NA NA 0.0149199092326687 0.331932620310034 611 389 0 0 0.611 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.41666666666669 0 35.083333333333336 0.0143373541664091 0 -Inf 0.0143373541664091 0.0144153387842475 0 NA NA 0.0145713475759112 0.325144257812808 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.75000000000003 0 34.75 0.0142691581083785 0 -Inf 0.0142691581083785 0.0148865615509932 0 NA NA 0.0151055577418552 0.344847971241821 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.4166666666667 0 35.083333333333336 0.0139376833302847 0 -Inf 0.0139376833302847 0.0130161873317856 0 NA NA 0.0145983418587559 0.339707033335898 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.9166666666667 0 35.583333333333336 0.0138412232800193 0 -Inf 0.0138412232800193 0.0143428156274534 0 NA NA 0.0137426604960118 0.313852111286856 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.25000000000004 0 35.25 0.0137776549513118 0 -Inf 0.0137776549513118 0.0140488227027023 0 NA NA 0.0142308202203477 0.332966431673608 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666671 0 34.583333333333336 0.0136522540928075 0 -Inf 0.0136522540928075 0.0140938594569178 0 NA NA 0.0143635214339488 0.341867908004124 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 0 33.583333333333336 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0132914231014429 0 NA NA 0.0130801995137361 0.30532805982233 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 0 33.583333333333336 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0140340180088411 0 NA NA 0.0144019096954002 0.347526785932813 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 33.75 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0135336996262957 0 NA NA 0.0135787039892039 0.322343599815047 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 0 33.083333333333336 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0133465097462064 0 NA NA 0.013651488666968 0.329244835157915 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000004 0 33.75 0.0133188849757348 0 -Inf 0.0133188849757348 0.0130498779604907 0 NA NA 0.0140811458276812 0.344216651009066 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 34.416666666666664 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0137193481242606 0 NA NA 0.0141422088807459 0.34200048809733 652 348 0 0 0.652 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.9166666666667 0 34.583333333333336 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.013724066205455 0 NA NA 0.0137661629802055 0.327892275112147 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 126 GCC GCG CCA 2 GGCGCTAAC:GGTGCCAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 0 35.00000000000001 0.013423177093157 0 -Inf 0.013423177093157 0.0134366932953275 0 NA NA 0.0138069305325656 0.330948206368392 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 127 AAC CCA ACA 2 GCCAATAAA:GCTAACAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.9166666666667 0 34.25 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0145837132168931 0 NA NA 0.0132229336300285 0.314884616518769 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AATAAAGAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000003 0 33.91666666666667 0.0132307731029258 0 -Inf 0.0132307731029258 0.0132050984158997 0 NA NA 0.0139582065911919 0.343188058589181 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC:AAAGAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.00000000000003 0 33.75 0.0132746828245506 0 -Inf 0.0132746828245506 0.0129253428788781 0 NA NA 0.0141761668314564 0.349062913884215 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC:GAGGGCATC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.6666666666667 1 33.75 0.013333684515963 0.0302307926160697 0.441063014301359 -0.0168971081001067 0.0132957222710039 0.0298413468587261 NA NA 0.0357353990962703 0.636327693581667 289 118 593 0.593 0.289 0.578 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.00000000000003 1 34.41666666666667 0.0134532755150005 0.0296334842053817 0.453988988326835 -0.0161802086903812 0.013996402559044 0.0310044330431835 NA NA 0.0345422467740505 0.639485728523685 281 135 584 0.584 0.281 0.562 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 1 34.41666666666667 0.013423177093157 0.0296334842053817 0.45297329872264 -0.0162103071122247 0.013543832113893 0.0316580202203871 NA NA 0.0330265626517644 0.62354927343305 299 130 571 0.571 0.299 0.598 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 34.41666666666667 0.0133041182530361 0.0296334842053817 0.448955585540629 -0.0163293659523456 0.0134964750373661 0.0302430416882478 NA NA 0.033770500649857 0.628712826365065 272 126 602 0.602 0.272 0.544 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.50000000000004 1 33.75 0.0133633824875953 0.0302307926160697 0.442045389193396 -0.0168674101284743 0.0139311772365512 0.0311221114521724 NA NA 0.0345632894905354 0.625539085038028 301 128 571 0.571 0.301 0.602 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333337 1 33.41666666666667 0.0133041182530361 0.0305385697640887 0.435649683525156 -0.0172344515110525 0.0132069331464321 0.0319683621736592 NA NA 0.0332890588918979 0.604652804720244 263 119 618 0.618 0.263 0.526 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.1666666666667 1 34.083333333333336 0.013423177093157 0.0299291581301553 0.448498318421873 -0.0165059810369983 0.0133360500253117 0.0304398456152293 NA NA 0.0334352675619085 0.621539413985225 279 122 599 0.599 0.279 0.558 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA:ACTGAGGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.83333333333337 1 34.41666666666667 0.0134835092215562 0.0296334842053817 0.455009243196165 -0.0161499749838255 0.0138576614546218 0.0306183147161867 NA NA 0.0350884840494117 0.64532655464193 252 136 612 0.612 0.252 0.504 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC:GAGGGTGCC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000004 1 34.08333333333334 0.0135443861537981 0.0299291581301553 0.452548183777723 -0.0163847719763573 0.0144101791740561 0.0316652368179949 NA NA 0.0349524013274766 0.639231288586211 310 140 550 0.55 0.31 0.62 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG:GGTGCCTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.91666666666671 1 34.66666666666667 0.0136522540928075 0.029415534864961 0.464117146109408 -0.0157632807721535 0.0139090834396798 0.0290996883950087 NA NA 0.0351794778799321 0.654094224016682 271 147 582 0.582 0.271 0.542 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.25000000000006 1 34.33333333333334 0.0135904058348962 0.0297068535712844 0.457483853087461 -0.0161164477363882 0.0137007895282692 0.0310657903123486 NA NA 0.0343381509494027 0.638822882437236 273 145 582 0.582 0.273 0.546 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 TTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666673 1 34.00000000000001 0.0132893842388272 0.0300040009602743 0.44292040439615 -0.0167146167214472 0.0135705055752827 0.0303509371997821 NA NA 0.035225026784521 0.63513648597657 270 127 603 0.603 0.27 0.54 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCA:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666673 1 35.00000000000001 0.0132893842388272 0.0291298749871979 0.456211509478418 -0.0158404907483707 0.013639989896324 0.0286837376654657 NA NA 0.0330014841529535 0.631232168705601 288 136 576 0.576 0.288 0.576 N all ss13 143 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.75000000000006 1 35.16666666666667 0.0133188849757348 0.0289891158257093 0.459444332687194 -0.0156702308499745 0.0130317696131265 0.0324532055464535 NA NA 0.0344450047891781 0.649156156753795 288 130 582 0.582 0.288 0.576 N all ss13 144 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGAT:CCCAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333339 1 35.83333333333334 0.0134382094503063 0.0284394261467203 0.472520415179194 -0.015001216696414 0.0129476639025409 0.0311457749371849 NA NA 0.0336919554547104 0.656141809293816 300 140 560 0.56 0.3 0.6 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666671 1 35.75000000000001 0.013423177093157 0.0285069944752381 0.470873108170583 -0.0150838173820811 0.0140309594693641 0.0295135902981397 NA NA 0.0318721609873948 0.63602773015757 299 138 563 0.563 0.299 0.598 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCATATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666671 1 36.08333333333334 0.0137934922285677 0.0282386296527663 0.488461812707559 -0.0144451374241987 0.0139720353419354 0.0294966696212205 NA NA 0.0331512505950387 0.663029506764661 321 127 552 0.552 0.321 0.642 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC:CATATTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000006 1 35.75000000000001 0.0138252762666285 0.0285069944752381 0.484978389378701 -0.0146817182086096 0.0141978461805358 0.0289073831711387 NA NA 0.0329334784407554 0.65574230266891 305 117 578 0.578 0.305 0.61 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.66666666666673 1 34.91666666666667 0.0276529018562458 0.0292007684815911 0.946992264045341 -0.00154786662534531 0.0197342107129047 0.0306299750012962 NA NA 0.0370986920592392 0.966719563774616 480 42 478 0.478 0.48 0.956 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.16666666666673 1 35.41666666666667 0.0282386296527662 0.0287805096612113 0.981171980106546 -5.41880008445038e-4 0.0198395511221773 0.0305630808589604 NA NA 0.0377636034200075 0.988551334706687 519 36 445 0.445 0.519 0.89 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.8333333333334 1 34.75000000000001 0.0279752710599065 0.0293435958691742 0.953368877646482 -0.00136832480926764 0.0196589987563614 0.0303633994708765 NA NA 0.0386374529412316 0.971749248803723 481 37 482 0.482 0.481 0.962 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000006 1 35.083333333333336 0.0281063333749098 0.0290593249318817 0.967205309854724 -9.52991556971951e-4 0.0201844669345764 0.0282969613230715 NA NA 0.0369590141718277 0.979428753268088 502 55 443 0.443 0.502 0.886 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.83333333333339 1 35.083333333333336 0.0283721774047871 0.0290593249318817 0.976353630763779 -6.87147527094603e-4 0.0207905157137892 0.0322725613763672 NA NA 0.0366809513112758 0.985054031642944 498 46 456 0.456 0.498 0.912 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000006 1 35.083333333333336 0.0281063333749098 0.0290593249318817 0.967205309854724 -9.52991556971951e-4 0.0206613063603102 0.0303487455620892 NA NA 0.0376783384800593 0.979821398287859 475 42 483 0.483 0.475 0.95 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000006 1 35.083333333333336 0.0281063333749098 0.0290593249318817 0.967205309854724 -9.52991556971951e-4 0.0201218402931885 0.0274779563102546 NA NA 0.0371341570210282 0.979525755981321 511 37 452 0.452 0.511 0.904 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.16666666666673 1 35.083333333333336 0.0282386296527662 0.0290593249318817 0.971757937218456 -8.2069527911548e-4 0.0204959463803249 0.0292258870439138 NA NA 0.0358475843102449 0.98173481123067 506 53 441 0.441 0.506 0.882 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000006 1 35.083333333333336 0.0285069944752381 0.0290593249318817 0.98099300455401806 -5.52330456643591e-4 0.0195910555092821 0.0274051206438483 NA NA 0.0367090027691991 0.987995334029377 501 43 456 0.456 0.501 0.912 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.16666666666671 1 35.083333333333336 0.0282386296527662 0.0290593249318817 0.971757937218456 -8.2069527911548e-4 0.0199958610009018 0.0306758664144086 NA NA 0.0364401265794838 0.982031765509428 514 37 449 0.449 0.514 0.898 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATTGTT 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000006 1 34.75 0.0281063333749098 0.0293435958691742 0.957835348476695 -0.00123726249426442 0.0195509703180919 0.0324171448169704 NA NA 0.0372745925208308 0.9735205316651 471 45 484 0.484 0.471 0.942 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATTGTTCTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333339 1 34.916666666666664 0.014002740465399 0.0292007684815911 0.479533286058094 -0.0151980280161921 0.0135812586693202 0.0291659807790344 NA NA 0.0352215520672357 0.66610633249008 288 125 587 0.587 0.288 0.576 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA:GTTCTACAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0 0.416666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.75000000000006 1 35.24999999999999 0.014068407802917701 0.0289192452027623 0.486472164272597 -0.0148508373998446 0.0138501310790577 0.0300235478599767 NA NA 0.0330806339715281 0.653483279358841 282 124 594 0.594 0.282 0.564 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.16666666666673 1 35.74999999999999 0.0141848199798651 0.0285069944752381 0.497590862908625 -0.014322174495373 0.0145109282873384 0.0289607163989311 NA NA 0.0332604828754062 0.666754637111472 298 108 594 0.594 0.298 0.596 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666673 2 36.08333333333333 0.0140849209886972 0.0575822255219405 0.244605359744743 -0.0434973045332434 0.0139932930927746 0.0423049513157776 NA NA 0.0478704477454772 0.363536866082877 149 38 813 0.813 0.149 0.298 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666673 2 36.08333333333333 0.0140849209886972 0.0575822255219405 0.244605359744743 -0.0434973045332434 0.0147077019841032 0.0433313150023926 NA NA 0.0464731325610757 0.349290333050613 145 35 820 0.82 0.145 0.29 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666673 2 36.74999999999999 0.0140849209886972 0.0564972895530332 0.249302596640072 -0.042412368564336 0.0141640403678582 0.0424504404388357 NA NA 0.046570745420967 0.362449042474632 143 45 812 0.812 0.143 0.286 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000006 2 36.74999999999999 0.0142184353084605 0.0564972895530332 0.251665795314196 -0.0422788542445727 0.0136703614011089 0.0427471122901267 NA NA 0.0466746061175487 0.365030424082798 153 49 798 0.798 0.153 0.306 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.16666666666673 2 36.58333333333333 0.0141848199798651 0.0567646707244323 0.249888175142004 -0.0425798507445672 0.0138485336515262 0.0430534844405688 NA NA 0.0476113665719906 0.371150102262217 138 43 819 0.819 0.138 0.276 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000006 2 37.24999999999999 0.0143202441116848 0.0557100557871529 0.257049538173091 -0.0413898116754681 0.0133266483974209 0.0427506386529063 NA NA 0.0444530533160207 0.351806798453848 160 48 792 0.792 0.16 0.32 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000006 2 37.916666666666664 0.0143202441116848 0.054693929928504303 0.261825108022118 -0.0403736858168195 0.0147263973908216 0.0399062167650625 NA NA 0.0447770307049167 0.367237171667128 130 47 823 0.823 0.13 0.26 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.50000000000006 2 38.58333333333333 0.0145282993169998 0.0537142229868647 0.270473973356229 -0.0391859236698649 0.0143993445061602 0.0412962524437299 NA NA 0.0460250500254841 0.394544826011355 147 58 795 0.795 0.147 0.294 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.00000000000006 2 39.08333333333333 0.0146346106676863 0.0530021800130169 0.276113372395101 -0.0383675693453306 0.0139403654597997 0.0402542567217212 NA NA 0.0446798077208143 0.390493471375212 145 38 817 0.817 0.145 0.29 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.83333333333339 2 39.58333333333333 0.0148888264145486 0.0523087754921291 0.284633434341986 -0.0374199490775805 0.0146662198923076 0.0395354234708057 NA NA 0.0457367827142429 0.413266544471452 179 49 772 0.772 0.179 0.358 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.16666666666671 2 40.24999999999999 0.0150380977841708 0.0514119856124207 0.292501789320849 -0.0363738878282499 0.0142609707895247 0.0391289402825788 NA NA 0.0422335185712901 0.389096847561805 167 47 786 0.786 0.167 0.334 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA:TTCTACGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.50000000000004 2 39.916666666666664 0.0151903926783733 0.0518565020980098 0.292931302031578 -0.0366661094196366 0.0145863623104355 0.0396336201357731 NA NA 0.0408848242417734 0.369817828281277 164 50 786 0.786 0.164 0.328 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG:TACGCTGAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.16666666666671 2 38.916666666666664 0.0150380977841708 0.0532374199351599 0.282472324964026 -0.0381993221509891 0.014974930014959 0.0410284217093005 NA NA 0.043832802786754 0.383493227436401 138 48 814 0.814 0.138 0.276 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAGGGA:GCTGAAGGG 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.83333333333339 2 37.74999999999999 0.0148888264145486 0.0549444688504895 0.270979531262062 -0.0400556424359409 0.0153828019258394 0.040720037286804 NA NA 0.0452283661136966 0.375816409091365 153 43 804 0.804 0.153 0.306 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.58333333333339 2 36.83333333333333 0.0151711873316037 0.0563645417845084 0.269161903056105 -0.0411933544529048 0.015663619103198 0.0443029790248898 NA NA 0.0437264303728104 0.346156847210873 164 46 790 0.79 0.164 0.328 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.66666666666673 2 36.41666666666666 0.0151520304881396 0.0570345959917882 0.265663852345358 -0.0418825655036486 0.014751285427548 0.0434418867136942 NA NA 0.049121325859054 0.393861703708777 156 41 803 0.803 0.156 0.312 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGCAGGAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.3333333333334 2 36.24999999999999 0.0152289496205592 0.0573071018565008 0.265742798487577 -0.0420781522359417 0.0146085125325501 0.0442425536201292 NA NA 0.0451418724076477 0.351268673740188 133 52 815 0.815 0.133 0.266 N all ss13 179 AGT GAG GCG 2 AGAGGCGGC:AGGAGTGGT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 65.33333333333339 2 35.66666666666666 0.0154644654020518 0.0582817382454872 0.265339810849743 -0.0428172728434354 0.015197559212017 0.0442967658471103 NA NA 0.0465453754610185 0.35762297584906 139 44 817 0.817 0.139 0.278 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 AGTGGTAGT:GGCGGCAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 65.33333333333339 1 34.99999999999999 0.0154644654020518 0.0291298749871979 0.530879909675141 -0.0136654095851461 0.0159000581794992 0.029995898994131 NA NA 0.0353945549142249 0.69943156649865 306 119 575 0.575 0.306 0.612 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA:GGTAGTCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.00000000000006 1 34.99999999999999 0.015306653723405301 0.0291298749871979 0.525462389733301 -0.0138232212637926 0.0149174358227807 0.0288741539031166 NA NA 0.0355280070333709 0.697217294982626 317 143 540 0.54 0.317 0.634 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 65.83333333333339 1 34.33333333333332 0.015345803903505 0.0297068535712844 0.516574529398792 -0.0143610496677793 0.0150046810865967 0.0313452397141469 NA NA 0.0339088965397346 0.671916903396795 319 134 547 0.547 0.319 0.638 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.08333333333339 1 34.08333333333332 0.0152871534504004 0.0299291581301553 0.510777930469007 -0.0146420046797549 0.0148818963135675 0.0329194612541134 NA NA 0.0332177579223054 0.65936614170018 261 135 604 0.604 0.261 0.522 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 66.75000000000006 1 34.08333333333332 0.015132921964463 0.0299291581301553 0.505624712150381 -0.0147962361656923 0.0145633218048209 0.03376993086758 NA NA 0.0349706052846697 0.672218691734141 319 122 559 0.559 0.319 0.638 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.41666666666673 1 34.08333333333332 0.0149817715677328 0.0299291581301553 0.500574439901728 -0.0149473865624226 0.0149721210038079 0.032739820456618 NA NA 0.0356021828578859 0.674598932994415 283 125 592 0.592 0.283 0.566 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.08333333333339 1 33.41666666666666 0.0148336108437327 0.0305385697640887 0.485733646281499 -0.015704958920356 0.0144611563599372 0.0326265813698655 NA NA 0.0349620612097251 0.653287366352444 303 140 557 0.557 0.303 0.606 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.41666666666673 1 33.08333333333332 0.0147606240253986 0.0308526791703671 0.478422763348722 -0.0160920551449685 0.0143649958117469 0.0349225040869427 NA NA 0.0376228534743833 0.668854827248651 304 108 588 0.588 0.304 0.608 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.41666666666673 1 33.08333333333332 0.0147606240253986 0.0308526791703671 0.478422763348722 -0.0160920551449685 0.0148222943657362 0.0335612078991463 NA NA 0.0346811505399201 0.642647718890275 316 116 568 0.568 0.316 0.632 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.08333333333339 1 33.08333333333332 0.0146167841906133 0.0308526791703671 0.473760612810968 -0.0162358949797538 0.0154822729288729 0.0350519210019529 NA NA 0.0351623910530705 0.644267526935701 292 119 589 0.589 0.292 0.584 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.08333333333339 1 33.08333333333332 0.0146167841906133 0.0308526791703671 0.473760612810968 -0.0162358949797538 0.0146726948867818 0.0323281560122122 NA NA 0.0360911123189104 0.652812446408147 304 125 571 0.571 0.304 0.608 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC:CGTAGTCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.08333333333339 1 33.74999999999999 0.0146167841906133 0.0302307926160697 0.483506482156988 -0.0156140084254564 0.0144753471885549 0.033436459841527 NA NA 0.0351866918166837 0.657225110202086 259 135 606 0.606 0.259 0.518 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT:AGTCGTGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333339 1 32.74999999999999 0.0144062052287003 0.0311733183159379 0.462132554599902 -0.0167671130872376 0.0145179069065745 0.0335274658387242 NA NA 0.0386525446861124 0.664440460575256 299 118 583 0.583 0.299 0.598 N all ss13 193 GGA GCG GAA 2 CGCGGTAAT:CGTGGAAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.75000000000006 1 31.749999999999993 0.014068407802917701 0.0321765161581571 0.437225948693988 -0.0181081083552394 0.0139029597345401 0.0328579563837021 NA NA 0.0372428402092313 0.626813199204619 299 111 590 0.59 0.299 0.598 N all ss13 194 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.41666666666673 1 30.749999999999993 0.0137460892532251 0.0332464403304228 0.413460482283467 -0.0195003510771977 0.0133161633241569 0.0347840391848181 NA NA 0.0372195873039203 0.6003292331387 238 146 616 0.616 0.238 0.476 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.0833333333334 1 30.416666666666657 0.0138093659583391 0.0336190735350483 0.410759860587553 -0.0198097075767091 0.0133586295745702 0.0350038155371446 NA NA 0.0402732423641301 0.622802332306856 230 152 618 0.618 0.23 0.46 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT:TCAAGAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666674 1 30.74999999999999 0.013559691378237 0.0332464403304228 0.407853930931334 -0.0196867489521858 0.0128957382370975 0.0371058093496296 NA NA 0.0379492536539845 0.603924547333385 277 116 607 0.607 0.277 0.554 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA:AGAACTTCA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.0833333333334 1 30.916666666666657 0.0136212597557268 0.0330632048490145 0.411976389401126 -0.0194419450932877 0.0133368270198627 0.0339310393149335 NA NA 0.036163331792592 0.590842958817106 248 126 626 0.626 0.248 0.496 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT:ACTTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.0833333333334 1 31.583333333333325 0 0.0323500281131817 0 -0.0323500281131817 0 0.0337855876399545 NA NA 0.0350033806230795 0.355383627151458 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 1 32.08333333333332 0 0.0318350176854428 0 -0.0318350176854428 0 0.0362162608178914 NA NA 0.0333525584323053 0.339830599265602 0 386 614 0.614 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.0833333333334 1 33.249999999999986 0 0.0306948207819131 0 -0.0306948207819131 0 0.0342211283951558 NA NA 0.0321056511122501 0.339043621835257 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 1 32.41666666666666 0 0.031500692980973 0 -0.031500692980973 0 0.034649579681891 NA NA 0.0336673925036325 0.349456524645055 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 1 32.08333333333333 0 0.0318350176854428 0 -0.0318350176854428 0 0.035364729999387 NA NA 0.0334610715344846 0.341399021460292 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.0833333333334 1 32.24999999999999 0 0.03166697281676 0 -0.03166697281676 0 0.0328340325598544 NA NA 0.0339358436379645 0.350746476602833 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.08333333333339 2 32.58333333333333 0 0.0640388786228151 0 -0.0640388786228151 0 0.0479715172008925 NA NA 0.0496796565928458 0.197385481761372 0 133 867 0.867 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 2 32.999999999999986 0 0.063195257713305 0 -0.063195257713305 0 0.0472443930097631 NA NA 0.0494303835292161 0.201083789709347 0 144 856 0.856 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 2 32.33333333333332 0 0.0645559565784323 0 -0.0645559565784323 0 0.0506086327312103 NA NA 0.0484365332106459 0.182599173095007 0 114 886 0.886 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 2 32.66666666666666 0 0.0638683562552301 0 -0.0638683562552301 0 0.0441969212931219 NA NA 0.0469141296492539 0.17339095066211 0 118 882 0.882 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 2 32.999999999999986 0 0.063195257713305 0 -0.063195257713305 0 0.0456416739540299 NA NA 0.0463210689599831 0.17247708253918 0 144 856 0.856 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 2 32.16666666666666 0 0.0649053422482924 0 -0.0649053422482924 0 0.0479181502370666 NA NA 0.0489604054113677 0.184949017737173 0 131 869 0.869 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG:GCTCGAGTG 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 2 31.499999999999993 0 0.0663415654213976 0 -0.0663415654213976 0 0.049607040710072 NA NA 0.0487435652239246 0.173503490458261 0 136 864 0.864 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT:CGAGTGGCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 2 31.833333333333325 0 0.0656155905923368 0 -0.0656155905923368 0 0.0508544310900413 NA NA 0.0486728407670963 0.177627979265278 0 125 875 0.875 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:GTGGCTAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666674 1 32.49999999999999 0 0.0314182062818701 0 -0.0314182062818701 0 0.0318422959348692 NA NA 0.0312748690951655 0.315097617788241 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 1 32.66666666666666 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0321421616855668 NA NA 0.0322776181053509 0.332892945431013 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 1 31.999999999999993 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0325627410464396 NA NA 0.0324403448975174 0.325139590654321 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 1 32.166666666666664 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0312427065892305 NA NA 0.0326862541366814 0.331359094464149 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 1 32.83333333333333 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.0308287849925595 NA NA 0.0302610495653014 0.30419586611829 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 1 32.49999999999999 0 0.0314182062818701 0 -0.0314182062818701 0 0.0312534197052215 NA NA 0.0310924134130006 0.3122662334224 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 1 32.24999999999999 0 0.03166697281676 0 -0.03166697281676 0 0.0316620660117648 NA NA 0.0335701249821223 0.345523303440582 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.25000000000007 1 31.58333333333333 0 0.0323500281131817 0 -0.0323500281131817 0 0.0323397814727494 NA NA 0.0326488083458166 0.32175948295555 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.91666666666674 1 30.91666666666666 0 0.0330632048490145 0 -0.0330632048490145 0 0.0325926209018906 NA NA 0.0334003323595646 0.322219840512678 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.58333333333341 1 30.91666666666666 0 0.0330632048490145 0 -0.0330632048490145 0 0.0338310321200257 NA NA 0.0326065669546521 0.310580616353755 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 1 30.41666666666666 0 0.0336190735350483 0 -0.0336190735350483 0 0.0338734951188996 NA NA 0.0323190083713551 0.298234904221314 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 1 30.749999999999993 0 0.0332464403304228 0 -0.0332464403304228 0 0.0345194201115051 NA NA 0.0333859595350573 0.319337114468696 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA:TTGCTGTTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 1 31.749999999999993 0 0.0321765161581571 0 -0.0321765161581571 0 0.033201535430828 NA NA 0.0311131877703129 0.301053830492128 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGTTAGAC 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.25000000000009 1 32.08333333333333 0 0.0318350176854428 0 -0.0318350176854428 0 0.032038504163551 NA NA 0.0329265380820239 0.333619110885138 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:TTAGACAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 1 33.08333333333333 0 0.0308526791703671 0 -0.0308526791703671 0 0.0315873659756766 NA NA 0.030353905057806 0.309423733393757 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 1 33.41666666666666 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0303975120625172 NA NA 0.0304263836062776 0.315529440397887 0 392 608 0.608 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666674 1 33.41666666666666 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0304006141037337 NA NA 0.0293362864963799 0.297883529344263 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.91666666666674 1 33.74999999999999 0 0.0302307926160697 0 -0.0302307926160697 0 0.0306178682867677 NA NA 0.0301270743125193 0.3156473133164 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTG:AACCAGCTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000007 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0311574909758304 NA NA 0.0319480786340441 0.358368859869632 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 231 CTG AGC TGG 2 CAGCTGGAG:CAGCTTGAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.5833333333334 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0282106522941318 NA NA 0.0285489647328519 0.304027932184977 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 232 GAG TGG AGA 2 CTGGAGAGC:CTTGAGAGC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.3333333333334 1 34.83333333333333 0.0127121687353299 0.0292720079293014 0.434277305678268 -0.0165598391939715 0.0125876155724601 0.0290888946585379 NA NA 0.0334444262902379 0.620497797574144 279 124 597 0.597 0.279 0.558 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.8333333333334 1 34.33333333333333 0.0126318775458731 0.0297068535712844 0.425217619077757 -0.0170749760254113 0.012229332265037 0.0291225241190324 NA NA 0.0317792767666744 0.591061043971423 272 141 587 0.587 0.272 0.544 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666674 1 34.33333333333333 0.0127391597743079 0.0297068535712844 0.428828981963341 -0.0169676937969765 0.0123635137186906 0.0304223866002476 NA NA 0.033108002608487 0.608304449683118 283 105 612 0.612 0.283 0.566 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.16666666666674 1 34.33333333333333 0.0127391597743079 0.0297068535712844 0.428828981963341 -0.0169676937969765 0.012266135349163 0.029824018333609 NA NA 0.032261045672263 0.598923015863762 259 136 605 0.605 0.259 0.518 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.00000000000007 1 34.49999999999999 0.012766265677073 0.0295604764056575 0.431869415833558 -0.0167942107285845 0.0120488129923053 0.0305001338758369 NA NA 0.031889869031802 0.598449487450969 270 116 614 0.614 0.27 0.54 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000007 1 34.16666666666666 0.0126053387372859 0.0298546878003148 0.422223096808032 -0.0172493490630289 0.012641577629388 0.030230309191404 NA NA 0.0323874004739981 0.594314359367199 263 123 614 0.614 0.263 0.526 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000007 1 34.16666666666666 0.0125263872134486 0.0298546878003148 0.419578569946276 -0.0173283005868662 0.0126953744899132 0.0296398554196104 NA NA 0.0324089593661008 0.592873753004394 281 118 601 0.601 0.281 0.562 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.0833333333334 1 33.91666666666666 0.0125921111074123 0.0300792190929219 0.418631583104343 -0.0174871079855096 0.0125663709916231 0.0316546539815876 NA NA 0.0329140350515702 0.595213406997382 263 124 613 0.613 0.263 0.526 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.41666666666673 1 34.24999999999999 0.0125394770467935 0.0297805871963345 0.421062115536021 -0.017241110149541 0.012806760588046 0.0294676858825092 NA NA 0.0311287205354174 0.579671210119724 259 130 611 0.611 0.259 0.518 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000006 1 34.416666666666664 0.0125657389590355 0.0296334842053817 0.424038525876528 -0.0170677452463463 0.0121820105720143 0.0291315294406124 NA NA 0.0329814816010732 0.604810797508029 250 124 626 0.626 0.25 0.5 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.83333333333339 1 34.83333333333333 0.0254801574935108 0.0292720079293014 0.870461553407994 -0.00379185043579058 0.0172668483662596 0.0284201905496051 NA NA 0.034062509986533 0.91136232100881 451 46 503 0.503 0.451 0.902 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000006 1 35.166666666666664 0.0262608883838265 0.0289891158257093 0.905887869837574 -0.00272822744188281 0.0191376672920272 0.028807854081509002 NA NA 0.033708289774376 0.935492536205055 503 30 467 0.467 0.503 0.934 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.83333333333339 1 35.166666666666664 0.0268485044068343 0.0289891158257093 0.926158099069147 -0.00214061141887504 0.0180888704393488 0.0279871422659694 NA NA 0.0351830308532003 0.95148491760004394 502 37 461 0.461 0.502 0.922 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.83333333333339 1 35.33333333333333 0.0268485044068343 0.028849710620847 0.930633404254438 -0.00200120621401275 0.0179382619787862 0.0297866879376012 NA NA 0.0349717854460098 0.954367198407829 533 33 434 0.434 0.533 0.868 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.83333333333339 1 34.33333333333333 0.0264928206228062 0.0297068535712844 0.891808368706372 -0.00321403294847819 0.0180970515869809 0.0275093726243457 NA NA 0.036078416858094 0.929014640595982 467 36 497 0.497 0.467 0.934 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000006 1 34.166666666666664 0.026434454296256 0.0298546878003148 0.885437304622469 -0.00342023350405874 0.0184457049119191 0.029448127726096 NA NA 0.0357424158286789 0.923765855929886 455 35 510 0.51 0.455 0.91 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.33333333333339 1 33.83333333333333 0.0263184898584525 0.0301548153585304 0.872779008776369 -0.00383632550007781 0.0179381670171975 0.0312104828275491 NA NA 0.0339035140042432 0.909908293895564 475 48 477 0.477 0.475 0.95 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333339 1 33.5 0.0259766224970672 0.0304610393656427 0.852781882628945 -0.00448441686857552 0.0184310282190192 0.0318217090728467 NA NA 0.0366183799171282 0.902531910068269 466 57 477 0.477 0.466 0.932 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.50000000000004 1 32.66666666666667 0.0259205062991005 0.0312545223004261 0.829336185334919 -0.00533401600132556 0.0177422787877653 0.0294651798368424 NA NA 0.0372547114409983 0.886150432552719 431 42 527 0.527 0.431 0.862 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000004 1 32.91666666666667 0.0260047718198447 0.0310121698640216 0.838534418386951 -0.00500739804417694 0.018009961473359 0.0316751858293957 NA NA 0.0363547886095305 0.890448308364703 445 50 505 0.505 0.445 0.89 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT:TCTGCTTCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.25000000000004 1 32.583333333333336 0.0256709551422775 0.0313361505112163 0.819212147104315 -0.00566519536893879 0.0172693277941829 0.0304450761169563 NA NA 0.0356928049647223 0.873888743693558 467 34 499 0.499 0.467 0.934 N all ss13 253 GCT CTG CAG 2 GCTGCTGAG:GCTTCAGAG 1:1 TRUE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333339 1 32.25 0.0252389746234554 0.03166697281676 0.797012545831267 -0.00642799819330458 0.0173598401321052 0.0324122206421651 NA NA 0.0359180583484701 0.857966869824306 478 37 485 0.485 0.478 0.956 N all ss13 254 GAG CAG AGG 2 GCTGAGGCA:TCAGAGGCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.91666666666671 0 31.916666666666668 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.0178763279512012 0 NA NA 0.0176434531580433 0.154299444018806 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000006 0 31.83333333333334 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.017407250458999 0 NA NA 0.0174405371444311 0.149987909965975 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.16666666666671 0 32.16666666666667 0.025054521799629 0 -Inf 0.025054521799629 0.0176428212702874 0 NA NA 0.0172899891305296 0.14731614136536 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000006 0 31.83333333333334 0.0249503257372043 0 -Inf 0.0249503257372043 0.0172322227005296 0 NA NA 0.0168117424733157 0.137782097671517 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.50000000000006 0 30.83333333333334 0.0246428738683313 0 -Inf 0.0246428738683313 0.017135792496766 0 NA NA 0.0163158840574922 0.130951351469729 889 111 0 0 0.889 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC:AAGCCTCGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.16666666666671 0 31.000000000000004 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0170732593304527 0 NA NA 0.0172755745199906 0.152046276562592 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA:CCTCGGCAA 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.16666666666671 0 31.000000000000004 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0173655083048521 0 NA NA 0.0172454675446503 0.151332271560823 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA:CGGCAAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.16666666666671 0 31.16666666666667 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0171933262316801 0 NA NA 0.0173933706606783 0.154840416613555 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.83333333333337 0 30.500000000000004 0.0245420669931506 0 -Inf 0.0245420669931506 0.0169458635134492 0 NA NA 0.0175005308308352 0.160807386642914 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACC:AAACGTACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.6666666666667 0 31.000000000000004 0.0248985520571968 0 -Inf 0.0248985520571968 0.0177245621369826 0 NA NA 0.0172281585804301 0.148394915245762 879 121 0 0 0.879 0.001 N all ss13 264 ACC GTA CCG 2 CGTACCGCA:CGTACTGCC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.6666666666667 0 32 0.0252124580992387 0 -Inf 0.0252124580992387 0.0175421937355913 0 NA NA 0.0173632239172155 0.146484679746425 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 265 GCA CCG CAA 2 ACCGCAACC:ACTGCCACA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.83333333333337 0 31.833333333333332 0.0251595918684029 0 -Inf 0.0251595918684029 0.0174422984835005 0 NA NA 0.0168293311994146 0.134918447401034 880 120 0 0 0.88 0.001 N all ss13 266 ACA CAA CAA 2 GCAACCAAA:GCCACAAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 0 31.166666666666664 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0176041097534306 0 NA NA 0.0169617892946145 0.144609545218547 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAACAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 0 31.666666666666668 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0164576034001019 0 NA NA 0.0172711594616056 0.151941566567885 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000003 0 31.666666666666668 0.0249503257372043 0 -Inf 0.0249503257372043 0.0177369028034161 0 NA NA 0.0180057004425469 0.165841469496469 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:CAGTACAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.50000000000003 0 32 0.0249503257372043 0 -Inf 0.0249503257372043 0.0177229499319847 0 NA NA 0.0174018242352475 0.151636068126457 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.33333333333336 0 32.166666666666664 0.0250023152006939 0 -Inf 0.0250023152006939 0.0170228875343994 0 NA NA 0.0179285261985252 0.163150084034977 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT:AATGTCACC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.33333333333336 0 31.5 0.0250023152006939 0 -Inf 0.0250023152006939 0.0171387982548825 0 NA NA 0.0175117316782835 0.153364810660265 874 126 0 0 0.874 0.001 N all ss13 272 ACC TCA CCC 2 GTCACCCAA:GTCACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000003 0 32.33333333333333 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.0179469329027022 0 NA NA 0.0174387473685747 0.1499460883291 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 273 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGCT:ACTCAAGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.6666666666667 0 31.666666666666664 0.0248985520571968 0 -Inf 0.0248985520571968 0.0175501838672162 0 NA NA 0.0178137477854155 0.162198506609909 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.00000000000003 0 31.666666666666664 0.0247956466956661 0 -Inf 0.0247956466956661 0.016566760682624 0 NA NA 0.017571190643277 0.158199365835877 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.00000000000003 0 31.333333333333332 0.0244919722305394 0 -Inf 0.0244919722305394 0.0171369402466813 0 NA NA 0.0171363712457107 0.15293551618922 865 135 0 0 0.865 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGGCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 83.1666666666667 0 30.666666666666664 0.0244420815742095 0 -Inf 0.0244420815742095 0.0164714586523904 0 NA NA 0.0176161144843217 0.165294147349051 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGGCGACGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.50000000000003 0 31.333333333333332 0.0246428738683313 0 -Inf 0.0246428738683313 0.0177043054457739 0 NA NA 0.0171043220693713 0.149658267325422 867 133 0 0 0.867 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT:CGACGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.83333333333337 0 31.166666666666664 0.0245420669931506 0 -Inf 0.0245420669931506 0.0173170629105757 0 NA NA 0.018410907314316 0.182525965563885 849 151 0 0 0.849 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 0 31.833333333333332 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0179531398797639 0 NA NA 0.0171609033523288 0.149327202280018 878 122 0 0 0.878 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA:GGTCCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 0 31.833333333333332 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.016640745942215 0 NA NA 0.0168264407855027 0.141406584230125 873 127 0 0 0.873 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCAGATCAA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.83333333333337 0 31.166666666666664 0.0245420669931506 0 -Inf 0.0245420669931506 0.0176387497462298 0 NA NA 0.017302811790836 0.156078084059189 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC:GATCAAACT 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.25000000000004 0 31.08333333333333 0.0121092438760402 0 -Inf 0.0121092438760402 0.0123876223993598 0 NA NA 0.0121155291809144 0.317561632555529 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA:CAAACTCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.83333333333337 0 31.499999999999996 0.0124743000368564 0 -Inf 0.0124743000368564 0.0128226389388893 0 NA NA 0.0127560519598547 0.328117704048804 670 330 0 0 0.67 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA:ACTCAAGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.1666666666667 0 31.166666666666664 0.0125789112103712 0 -Inf 0.0125789112103712 0.012274750398184 0 NA NA 0.0121620537000569 0.301007500852159 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.50000000000003 0 31.166666666666664 0.0126852918315464 0 -Inf 0.0126852918315464 0.0130425134635383 0 NA NA 0.0128898761060904 0.32505243491193 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000003 0 31.333333333333332 0.0126053387372859 0 -Inf 0.0126053387372859 0.0125289736261139 0 NA NA 0.0127534240297975 0.322962375569294 667 333 0 0 0.667 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGA:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.6666666666667 0 30.999999999999996 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0122410632900402 0 NA NA 0.0125835243858921 0.314434576881473 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 288 GGA TCG GAG 2 TTCGGGGAC:TTTGGAGAC 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.83333333333337 0 30.333333333333332 0.0126318775458731 0 -Inf 0.0126318775458731 0.0128857216524095 0 NA NA 0.0125375931435289 0.313684886380414 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 289 GAC GAG ACC 2 GGAGACCAG:GGGGACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000004 0 30.91666666666666 0.0127256499425275 0 -Inf 0.0127256499425275 0.0133098549487987 0 NA NA 0.0130370570896231 0.329008126426265 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GACCAGGAG 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.41666666666671 0 30.749999999999993 0.012698716061835 0 -Inf 0.012698716061835 0.0127041279885486 0 NA NA 0.0121547189298318 0.296135735263583 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA:CAGGAGCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333337 0 29.583333333333325 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0126157513978444 0 NA NA 0.0124708759329341 0.315666056675796 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC:GAGCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000006 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.91666666666671 0 29.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333337 0 30.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 30.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC:ACTGATTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA:GATTATAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT:TATAAACAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.58333333333339 0 29.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAC AAC ACT 2 AAACACTGG:AAACATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.33333333333339 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ACT GGC 2 CACTGGCCG:CATTGGCCG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 30.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATA:CCGCAAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATA AAA TAG 2 CAAATAGCA:CAAATTGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TAG CAC 2 ATAGCACAG:ATTGCACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 27.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCACAGTTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333339 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT:CAGTTTGCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 28.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333339 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333339 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 29.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000006 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000006 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000007 0 27.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000007 0 27.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.5833333333334 0 27.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.5833333333334 0 28.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333339 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333339 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000006 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000006 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.41666666666673 0 28.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.0833333333334 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.75000000000007 0 29.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.5833333333334 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666673 0 30.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666673 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666673 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666673 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA:GATGATAAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT:GATAAAGAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666673 0 32.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA:AAAGATCCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000006 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA:GATCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.41666666666673 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC:CCCCAATTC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.5833333333334 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666673 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 33.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000007 0 32.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:CTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 32.66666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000007 0 34.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000007 0 34.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.58333333333341 0 33.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666676 0 32.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA:GCATACAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA:TACAAGACA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC:AAGACATTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 32.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 31.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 32.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333341 0 33.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333341 0 33.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 33.99999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333341 0 33.83333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666676 0 33.83333333333331 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTG CTT TGC 2 CCTTTGCCG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TGC CGC 2 TTGCCGCAG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GA- 1 CAGAGA---:CAGAGACAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.666666666666667 1.33333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 --- GAC AAA 1 AGA---AAG:AGACAAAAG 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG --A AGA 1 ---AAGAAA:CAAAAGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAG:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AAC AGC 2 AAACAGCCC:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTG:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTG TTC TGC 2 CTTCTGCCT:CTTCTTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TGC CTG 2 CTGCCTGCG:CTTCCTGCG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC:GCGGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG:GCTGATATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATATGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KU182964.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 ACT TGA CTG 2 ATGACTGAT:ATGTCTGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 73.83333333333337 7 35.33333333333334 0.218588546001054 0.230047700566857 0.95018791955944 -0.0114591545658022 0.0738849757427153 0.122679530216257 0.754711031304951 0.208027110432351 0.113559544596906 0.919622877008286 465 1 534 0.534 0.465 0.93 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 ACTGATAAT:TCTGATAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 74.00000000000003 7 35.16666666666667 0.218017195136802 0.231324762417615 0.942472361619512 -0.0133075672808128 0.0716154813090179 0.114074476702164 NaN NaN 0.119790001870045 0.911544343187253 468 0 532 0.532 0.468 0.936 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 74.33333333333336 7 35.16666666666667 0.216883469282523 0.231324762417615 0.937571347813507 -0.0144412931350923 0.0695960256190288 0.114566101125804 NaN NaN 0.114165494423227 0.899340599500173 451 0 549 0.549 0.451 0.902 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACAA:AATGGACCC 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 73.33333333333336 7 35.50000000000001 0.220320838896122 0.228784770270838 0.963004830414648 -0.00846393137471552 0.0701875224459853 0.112847194257538 NaN NaN 0.111748456766755 0.939625216815862 470 1 529 0.529 0.47 0.94 N all ss13 6 CAA GAC AAC 2 GGACAACAA:GGACCCCAA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 72.33333333333336 7 36.50000000000001 0.223869741416997 0.221491146757304 1.01073900557434 0.00237859465969342 0.0720929042188489 0.111223205264734 NaN NaN 0.10933085921205 0.982642647602635 530 0 470 0.47 0.53 0.94 N all ss13 7 CAA AAC AA- 1 CAACAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.166666666666667 1.33333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 71.50000000000001 7 37.00000000000001 0.18998582171068 0.218017195136802 0.871425859742242 -0.0280313734261222 0.0635062429468017 0.116569572620035 NaN NaN 0.10720193977482 0.793720858860381 411 0 589 0.589 0.411 0.822 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---GGA:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 71.16666666666669 7 36.66666666666668 0.190999228388671 0.220320838896122 0.866914039296684 -0.029321610507451 0.0643089569854713 0.109553171864078 NaN NaN 0.112799743822518 0.794907012168088 382 0 618 0.618 0.382 0.764 N all ss13 9 AAC --G ACC 1 ---GGACCG:TCAAACCAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 72.16666666666669 7 37.66666666666668 0.187991098237596 0.213552421666518 0.880304221186317 -0.025561323428922 0.0629491017991827 0.106421687445671 NaN NaN 0.108286129723637 0.813391130830924 412 0 588 0.588 0.412 0.824 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:GGACCGCGC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 72.16666666666669 6 38.000000000000014 0.170394983228347 0.177291583548173 0.961100238478318 -0.0068966003198252 0.0641268724593402 0.0909346391172199 NaN NaN 0.0967755958342097 0.943187775649513 492 0 508 0.508 0.492 0.984 N all ss13 11 CGC AAC GCA 2 CAACGTAGT:CCGCGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 72.83333333333334 6 37.66666666666668 0.151648059986963 0.17906358673515 0.846895020656897 -0.0274155267481871 0.0576564514045568 0.0940334699880938 NaN NaN 0.0941887605813475 0.770997749416992 375 0 625 0.625 0.375 0.75 N all ss13 12 AAT GCA ATG 2 CGCAATGCG:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.50000000000001 6 37.00000000000001 0.150125187835474 0.182716561993313 0.821628790503228 -0.0325913741578391 0.056196735587598703 0.0933656031401997 NaN NaN 0.0955215955417647 0.732957706258997 361 0 639 0.639 0.361 0.722 N all ss13 13 GCC ATG CCC 2 AATGCGCCT:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.33333333333334 6 37.16666666666668 0.134018841557532 0.181789348152453 0.737220540804954 -0.0477705065949216 0.0550530189575169 0.097169002910599 NaN NaN 0.0926926452248212 0.606298275610035 289 0 711 0.711 0.289 0.578 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC:GCGCCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 73.83333333333334 6 37.33333333333335 0.133025780578275 0.180871542612666 0.735471034617913 -0.0478457620343906 0.0535645461133167 0.0979506025427096 NaN NaN 0.093869362222758 0.610257561623431 292 2 706 0.706 0.292 0.584 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT:CCTCGCATT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.75000000000001 7 36.750000000000014 0.147350977402095 0.219740343511105 0.670568613153404 -0.0723893661090108 0.0552500180359565 0.111747508221608 NaN NaN 0.10885571827039 0.506048651279261 201 0 799 0.799 0.201 0.402 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA:CGCATTACG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 74.91666666666669 7 36.58333333333335 0.146988835142564 0.220904431633438 0.665395592363997 -0.0739155964908745 0.0548041242476828 0.114985788543001 0.467092363792131 0.154287838801864 0.107509052277599 0.491749401496153 214 0 786 0.786 0.214 0.428 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT:ATTACGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.58333333333334 7 36.000000000000014 0.161796742774019 0.225078444337753 0.718846014997446 -0.0632817015637349 0.0609639586883296 0.112613530369371 NaN NaN 0.103288825700835 0.540096248569818 253 1 746 0.746 0.253 0.506 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT:ACGTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.91666666666669 7 36.33333333333335 0.161004298535341 0.222674045667528 0.723049235723387 -0.0616697471321873 0.0594096778267551 0.111078029570762 0.641310230125436 0.259549622391012 0.106133960978467 0.561202887806416 225 0 775 0.775 0.225 0.45 N all ss13 19 GGT TTG GT- 1 TTTGGT---:TTTGGTGGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.16666666666669 7 36.58333333333335 0.162798378928371 0.220904431633438 0.73696293788489 -0.0581060527050677 0.0578886334855062 0.110640980011819 NaN NaN 0.101400434367436 0.566620630285163 282 0 718 0.718 0.282 0.564 N all ss13 20 --- GTG GAC 1 GGT---GTC:GGTGGACCC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.33333333333334 7 36.25000000000002 0.162396234146618 0.22327028089952 0.727352666428999 -0.0608740467529026 0.0582526368538373 0.113400623334747 NaN NaN 0.106066674010199 0.566020271855877 289 0 711 0.711 0.289 0.578 N all ss13 21 CCC --G CCA 1 ---GTCTCA:GGACCCACA 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 76.91666666666667 7 36.666666666666686 0.158673037027526 0.220320838896122 0.72019078096529 -0.0616478018685961 0.0566529157398604 0.111332338435245 NaN NaN 0.106052449348326 0.561041374587697 290 0 710 0.71 0.29 0.58 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:GTCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 77.58333333333334 6 36.666666666666686 0.141428177785303 0.184599802154181 0.76613396187272 -0.0431716243688781 0.0547216088575944 0.0956881463872235 NaN NaN 0.0960302490894389 0.6530257411112 327 0 673 0.673 0.327 0.654 N all ss13 23 GAT CAG ATA 2 ACAGATTCA:TCAGATAAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.25000000000001 5 36.00000000000002 0.140103325003136 0.15359580948451 0.912155907595027 -0.0134924844813739 0.0545634466446566 0.0940617137815805 NaN NaN 0.0913487893111965 0.882577213596929 463 0 537 0.537 0.463 0.926 N all ss13 24 AAC ATA ACT 2 GATAACTTT:GATTCAACT 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 2 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 76.91666666666669 5 36.666666666666686 0.142778402413796 0.150503021596613 0.948674657153921 -0.00772461918281694 0.054699540421884 0.0861540131877935 NaN NaN 0.0869504204601642 0.929209581363644 518 0 482 0.482 0.518 0.964 N all ss13 25 ACT ACT CTG 2 AACTTTGAC:TCAACTGAC 1:1 TRUE 1.25 0.75 1 0 0 0 2 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.58333333333334 4 36.666666666666686 0.112491115941025 0.117889187641809 0.954210629415942 -0.0053980717007843 0.0418725077259127 0.0796471267886596 NaN NaN 0.0840722866750342 0.948805002229711 493 0 507 0.507 0.493 0.986 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT:TTTGACAAT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.50000000000001 2 36.50000000000002 0.112623333869567 0.0568993130810351 1.97934435006572 0.0557240207885323 0.0447224215936946 0.0435233602124712 NaN NaN 0.0477672467061223 0.243382509759276 893 0 107 0.107 0.893 0.214 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.50000000000001 2 36.50000000000002 0.112623333869567 0.0568993130810351 1.97934435006572 0.0557240207885323 0.046302141102449 0.0411419444669717 NaN NaN 0.047456902085475 0.240313859798609 886 2 112 0.112 0.886 0.224 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.00000000000001 2 36.33333333333335 0.113423227292943 0.0571705240409132 1.98394590911521 0.0562527032520295 0.0440231842239006 0.0422169506187198 NaN NaN 0.048748517491992 0.248526122828058 877 2 121 0.121 0.877 0.242 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.66666666666669 2 36.666666666666686 0.113962844188242 0.0566306643811088 2.01238755422863 0.0573321798071331 0.0446414030257711 0.041529086739608 NaN NaN 0.0487780103661302 0.239846968207378 889 0 111 0.111 0.889 0.222 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 76.33333333333334 2 36.000000000000014 0.112888706112188 0.0577207808520962 1.95577233096438 0.0551679252600921 0.045226283083704 0.0400858910484593 NA NA 0.0471545615785591 0.242025819549463 885 1 114 0.114 0.885 0.228 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGAC:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.00000000000001 2 36.666666666666686 0.115057659974651 0.0566306643811088 2.03172011545449 0.0584269955935422 0.045667714651502 0.043353937928116 NaN NaN 0.0498534522329104 0.241207126357536 884 0 116 0.116 0.884 0.232 N all ss13 32 GAC GAG ACC 2 GGAGACCGT:GGAGGACGC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 74.33333333333334 3 37.666666666666686 0.132047365954149 0.0842004764033108 1.56824962986738 0.0478468895508383 0.0492759407881169 0.048840803771945 NaN NaN 0.0517983445194324 0.355634903830618 813 1 186 0.186 0.813 0.372 N all ss13 33 CGC ACC GCA 2 GACCGTACT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.75 3 37.58333333333335 0.100029108207291 0.0843980831669965 1.18520592475264 0.0156310250402942 0.0378060486544989 0.0539481217845536 NaN NaN 0.0400319426135102 0.696193607363725 645 0 355 0.355 0.645 0.71 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGTACTGGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.08333333333334 3 36.916666666666686 0.0981562001449569 0.0860130038580103 1.141178609539 0.0121431962869467 0.0372107322422634 0.0515605291477996 NA NA 0.0415956322629523 0.770336774919452 633 1 366 0.366 0.633 0.732 N all ss13 35 GGA ATG GAG 2 AATGGGGCA:ACTGGAGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.58333333333334 3 36.750000000000014 0.082747441258963 0.0864264476831885 0.957431937527832 -0.00367900642422553 0.0325162609341107 0.05115100562297 NaN NaN 0.037382798901925 0.921603225773403 483 0 517 0.517 0.483 0.966 N all ss13 36 GCA GAG CAA 2 GGAGCTAGG:GGGGCAAGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.91666666666667 3 36.91666666666668 0.0823684046093706 0.0860130038580103 0.957627346038791 -0.00364459924863964 0.0329395619994388 0.0543497818182882 NA NA 0.0371872481622926 0.921926977975183 462 2 536 0.536 0.462 0.924 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA:GCTAGGCCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.5 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.41666666666667 3 36.41666666666668 0.0818063224852469 0.0872653886078579 0.937442940326064 -0.00545906612261099 0.0322797600931484 0.050363963984313 NaN NaN 0.0389838441171231 0.888633076356267 457 5 538 0.538 0.457 0.914 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA:AGGCCTAAG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.58333333333334 3 36.91666666666668 0.082747441258963 0.0860130038580103 0.96203408260874 -0.00326556259904733 0.0337049506359451 0.0533775877295029 NaN NaN 0.0383194612932433 0.93208694490752 455 5 540 0.54 0.455 0.91 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:CCTAAGCAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.75 3 36.75000000000001 0.0825574874404694 0.0864264476831886 0.955234070745317 -0.00386896024271915 0.033317809584038 0.0510334774327203 NA NA 0.0380363448907247 0.918980946025838 462 2 536 0.536 0.462 0.924 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC:AAGCATAGA 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.41666666666667 3 36.25000000000001 0.0829382721030275 0.0876910035441767 0.945801379285676 -0.00475273144114927 0.0338374589374562 0.0537714692944264 NA NA 0.0386355682599554 0.902095691068721 441 3 556 0.556 0.441 0.882 N all ss13 41 AGA AGC GAA 2 CAGCGCCGA:CATAGAAGA 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.25 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.58333333333334 3 36.58333333333334 0.0692533163185839 0.0868438898173542 0.797446043287951 -0.0175905734987703 0.03146700750596 0.0533607863283423 NA NA 0.0362723871168004 0.627706350046368 304 8 688 0.688 0.304 0.608 N all ss13 42 AGA GAA GAC 2 AGAAGACCG:CGCCGACCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.5 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.16666666666667 3 36.91666666666668 0.0551973146854054 0.0860130038580103 0.641732205708393 -0.0308156891726048 0.0283511135002687 0.0538908548559683 NA NA 0.0325083216242258 0.343163903243887 134 14 852 0.852 0.134 0.268 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 AGACCGCAA:CGACCCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333334 4 37.41666666666668 0.0554524994575896 0.115334665090852 0.480796466646936 -0.0598821656332629 0.029140423180902 0.0606488736777994 NA NA 0.0451649708862086 0.184888001209433 58 2 940 0.94 0.058 0.116 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT:CCGCAAGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666667 4 37.58333333333334 0.0559700169039056 0.114781984854672 0.48762022171659 -0.0588119679507668 0.0281733934704406 0.0628606564233901 NA NA 0.0447313624701072 0.188583345876684 57 5 938 0.938 0.057 0.114 N all ss13 45 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCCT:CAAGGTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74 4 36.58333333333334 0.0561009098120238 0.11818004032857 0.474707147298724 -0.0620791305165466 0.0277986489122042 0.0611038214525745 NA NA 0.0486093270386291 0.201565790544158 75 4 921 0.921 0.075 0.15 N all ss13 46 CCT GCC CTC 2 GGCCCTCCT:GGTTTACCC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74 4 36.58333333333334 0.0561009098120238 0.11818004032857 0.474707147298724 -0.0620791305165466 0.0276750163798523 0.0612465636043303 NA NA 0.046933627147188 0.185935008390939 57 2 941 0.941 0.057 0.114 N all ss13 47 CCC CTC CCA 2 CCTCCTAAC:TTACCCAAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.33333333333334 3 36.08333333333334 0.0414852284880391 0.0881207952860292 0.470776828027746 -0.0466355667979901 0.0242876329807335 0.0530663667039463 NA NA 0.0424734551440591 0.272207439373752 99 13 888 0.888 0.099 0.198 N all ss13 48 AAC CCA ACA 2 CCCAATAAT:CCTAACAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.5 3 35.91666666666667 0.0413898116754682 0.0885548256923263 0.467391938856865 -0.0471650140168582 0.0252071493237954 0.0530616975541004 NA NA 0.0421962225638442 0.263671895922944 78 25 897 0.897 0.078 0.156 N all ss13 49 AAC ACA ACA 2 AACAACACG:AATAATACT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.83333333333333 3 35.91666666666667 0.0417741375922484 0.0885548256923263 0.471731915970202 -0.0467806881000779 0.0241958538234423 0.0544813931445681 NA NA 0.0430331572379637 0.276999365818432 90 15 895 0.895 0.09 0.18 N all ss13 50 ACG ACA CGG 2 AACACGGCA:AATACTGCG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.66666666666667 3 36.08333333333334 0.0418713371647064 0.0881207952860292 0.475158412140939 -0.0462494581213228 0.0246104122013279 0.0513091771241444 NA NA 0.0445775961419756 0.299500783675654 108 16 876 0.876 0.108 0.216 N all ss13 51 GCA CGG CAT 2 ACGGCATCC:ACTGCGTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.83333333333334 3 35.91666666666667 0.0417741375922484 0.0885548256923263 0.471731915970202 -0.0467806881000779 0.0244168403645149 0.0533115328566795 NA NA 0.040476973112805 0.247789227908147 90 17 893 0.893 0.09 0.18 N all ss13 52 TCC CAT CCT 2 GCATCCTGG:GCGTCTTGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000001 3 35.66666666666667 0.0412475068105866 0.089213957146024 0.462343652608899 -0.0479664503354374 0.0239294720414476 0.0519390976424414 NA NA 0.0419216218944116 0.252543367967003 95 20 885 0.885 0.095 0.19 N all ss13 53 TGG CCT GGT 2 TCCTGGTTC:TCTTGGTTC 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333334 3 35.333333333333336 0.0416291816557173 0.0901082338815474 0.461990873225208 -0.0484790522258301 0.0244399126210643 0.0542272312455987 NA NA 0.0431565140334186 0.261296921323525 99 16 885 0.885 0.099 0.198 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.75000000000001 3 34.333333333333336 0.0418226808888407 0.0929021112845893 0.450180090748683 -0.0510794303957486 0.0243623958918603 0.0579579757754053 NA NA 0.048749787966112 0.294736410040344 82 14 904 0.904 0.082 0.164 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.91666666666669 3 33.833333333333336 0.0411531794236846 0.0943651299007742 0.436105788938748 -0.0532119504770896 0.0241041176533155 0.0592816051854444 NA NA 0.0466614913712825 0.254126959941099 81 11 908 0.908 0.081 0.162 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333336 4 33 0.0407801460981609 0.132209431753494 0.308451110917684 -0.091429285655333 0.024216813468868 0.0737183731781816 NA NA 0.0634744475395338 0.149751183672456 21 8 971 0.971 0.021 0.042 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.9166666666667 4 33.333333333333336 0.0405961546323978 0.130765040358583 0.310451130677398 -0.0901688857261855 0.0245300501149234 0.0700025309675931 NA NA 0.062533016179946 0.149319172665445 30 7 963 0.963 0.03 0.06 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.9166666666667 4 33.333333333333336 0.0405961546323978 0.130765040358583 0.310451130677398 -0.0901688857261855 0.0240289466197012 0.0702740656536843 NA NA 0.064637045325512 0.163014871517655 33 9 958 0.958 0.033 0.066 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333337 4 32.833333333333336 0.0402331091273882 0.132943691128056 0.302632707020556 -0.0927105820006678 0.0246601747316411 0.0739561954058199 NA NA 0.0638235400954236 0.146332636351577 32 4 964 0.964 0.032 0.064 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGT:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333337 4 32.16666666666667 0.0397005575048303 0.135964367940317 0.291992366134172 -0.0962638104354866 0.0237067051204573 0.0762722050052418 NA NA 0.0644873835078755 0.135501548749241 25 5 970 0.97 0.025 0.05 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG:CATGGTAAA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000004 4 32.833333333333336 0.0404138163712346 0.132943691128056 0.303991983585792 -0.0925298747568213 0.023811439659899 0.0749005140069723 NA NA 0.0638878858002592 0.14752857442041 25 9 966 0.966 0.025 0.05 N all ss13 62 AAA GCA AAG 2 GGCAAGGAG:GGTAAAGAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 4 33.833333333333336 0.0405961546323978 0.128656816904346 0.31553831043854 -0.0880606622719479 0.0232959667524251 0.0731824580505477 NA NA 0.0612333510815897 0.150401141976712 41 1 958 0.958 0.041 0.082 N all ss13 63 GAA AAG AAA 2 AAAGAAACT:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666671 4 33.666666666666664 0.0408727688266097 0.129351945263207 0.315981091304357 -0.0884791764365976 0.0234322165564462 0.0709749679974154 NA NA 0.0633184594078381 0.162302996403742 33 1 966 0.966 0.033 0.066 N all ss13 64 ACT AAA AAC 2 GAAACTCTC:GAGGAACTT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.416666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.58333333333337 4 33.83333333333333 0.0413422677171007 0.128656816904346 0.321337560743773 -0.0873145491872449 0.023376511779497 0.071391526868349 NA NA 0.0622930504885224 0.161012618399572 32 4 964 0.964 0.032 0.064 N all ss13 65 CTC AAC TCA 2 ACTCTCACC:GAACTTAGA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.66666666666671 3 34.08333333333333 0.0280406490537152 0.0936278982824406 0.299490318250304 -0.0655872492287254 0.020581157891244 0.0586714667665218 NA NA 0.0565347515903073 0.245998849135176 65 18 917 0.917 0.065 0.13 N all ss13 66 ACC TCA CCT 2 CTCACCTTC:CTTAGATTC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.916666666666667 0.75 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000004 3 33.25 0.0281063333749098 0.0961313950679982 0.292374133913576 -0.0680250616930885 0.0205754904013729 0.0624192094637252 NA NA 0.0559025540305692 0.223661027993434 61 19 920 0.92 0.061 0.122 N all ss13 67 TTC CCT TCC 2 ACCTTCCCG:AGATTCCCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666671 3 33 0.0138892858254281 0.0969087986100047 0.143323269142192 -0.0830195127845765 0.0151071138941129 0.0610575683451121 NA NA 0.0548500122576649 0.130134103118672 0 42 958 0.958 0 0.001 N all ss13 68 CCG TCC CGA 2 TTCCCGAGA:TTCCCTCGA 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.91666666666671 3 33.08333333333333 0.0140354973235301 0.0966482688635724 0.145222438938275 -0.0826127715400423 0.0146531949589573 0.0593664151807184 NA NA 0.056675005401973 0.144934851058985 0 52 948 0.948 0 0.001 N all ss13 69 AGA CGA GAG 2 CCGAGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000004 3 32.5 0.0139215133950447 0.0985020015458152 0.141332289461849 -0.0845804881507706 0.0133847665803369 0.0616067129640698 NA NA 0.0558862559788928 0.13016796324591 0 48 952 0.952 0 0.001 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 AGAGGACAA:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.16666666666671 3 32.666666666666664 0.0137934922285677 0.0979651368127982 0.140800009853767 -0.0841716445842305 0.0146874451531826 0.0627106909564588 NA NA 0.0548758325996266 0.125064995198575 0 46 954 0.954 0 0.001 N all ss13 71 CAA GAC AAG 2 GGACAAGGT:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.08333333333337 3 32.75 0.0138093659583391 0.0976988961284261 0.141346182050886 -0.083889530170087 0.014149182833617 0.0614718042595553 NA NA 0.0520133482113335 0.106777929525469 0 46 954 0.954 0 0.001 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGTGTG:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.08333333333337 4 33.08333333333333 0.014002740465399 0.13184534303006 0.106205802522782 -0.117842602564661 0.0144007451136146 0.0735379353456153 NA NA 0.0671860966976209 0.0794351260900999 0 15 985 0.985 0 0.001 N all ss13 73 GTG GCG TGC 2 GGCGTTCCA:GGTGTGCCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.41666666666671 4 32.916666666666664 0.0281392910819375 0.132575542143044 0.212250997635568 -0.104436251061107 0.0199956849628533 0.0747660047900804 NA NA 0.0662468964004206 0.114917505397444 21 5 974 0.974 0.021 0.042 N all ss13 74 CCA TGC CAA 2 GTGCCGATT:GTTCCAATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.75000000000004 4 32.583333333333336 0.0280079218999906 0.134060541816084 0.208919951542597 -0.106052619916094 0.0204170902539646 0.072653948709008 NA NA 0.0699248517463232 0.129351123987769 20 4 976 0.976 0.02 0.04 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCGATTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.41666666666671 4 32.916666666666664 0.0281392910819375 0.132575542143044 0.212250997635568 -0.104436251061107 0.0193204047539672 0.0669291115603093 NA NA 0.0681932908743094 0.125652290672358 28 3 969 0.969 0.028 0.056 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:ATTAATACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.75000000000004 4 32.583333333333336 0.0280079218999906 0.134060541816084 0.208919951542597 -0.106052619916094 0.019177755322925 0.0720414383754618 NA NA 0.0663316989075396 0.109860023869216 19 5 976 0.976 0.019 0.038 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT:AATACCAAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.4166666666667 4 33.24999999999999 0.0285408991973241 0.131123163798598 0.217664815052528 -0.102582264601274 0.0195925972726607 0.0688302315933202 NA NA 0.0681915804039182 0.132497835569937 24 3 973 0.973 0.024 0.048 N all ss13 78 AAC CCA ACA 2 ACCAACAGT:ACCAATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.9166666666667 4 33.416666666666664 0.0283386721709848 0.130408872715656 0.217306319584363 -0.102070200544671 0.0198729477489564 0.0730002421997308 NA NA 0.0665394717243147 0.125034640753517 27 6 967 0.967 0.027 0.054 N all ss13 79 AGT ACA GTG 2 AACAGTGGC:AATAGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.1666666666667 4 33.166666666666664 0.0282386296527662 0.131483259230803 0.214769772349472 -0.103244629578037 0.0194215389357579 0.0706979701219014 NA NA 0.066920525914783 0.12288060716842 19 3 978 0.978 0.019 0.038 N all ss13 80 GGC GTG GCA 2 AGTGGCAAA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000004 4 32.83333333333333 0.0281063333749098 0.132943691128056 0.211415322806381 -0.104837357753146 0.0197622659350605 0.069816945056859 NA NA 0.0657206810424113 0.110668446182547 20 8 972 0.972 0.02 0.04 N all ss13 81 AAA GCA AAG 2 GGCAAAGAT:GGTCCAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.08333333333337 4 32.25 0.0278777737612569 0.135579277355344 0.205619725263701 -0.107701503594087 0.0208376072359743 0.070950799246078 NA NA 0.0728486780795426 0.139293335687993 31 2 967 0.967 0.031 0.062 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333337 3 31.916666666666664 0.0137146678675636 0.100428343016685 0.1365617260586 -0.086713675149121 0.0140084005287732 0.0624411064495974 NA NA 0.0649654551728849 0.181952972812622 38 8 954 0.954 0.038 0.076 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.25000000000004 3 32.58333333333333 0.0139701361553758 0.0982328346145694 0.142214527456014 -0.0842626984591936 0.0138672713914872 0.0629777709581543 NA NA 0.0619022277082855 0.173443419977234 54 13 933 0.933 0.054 0.108 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.9166666666667 3 33.25 0.0140354973235301 0.0961313950679982 0.146003262655267 -0.0820958977444681 0.0142806877438947 0.0610948106100634 NA NA 0.0637843276525424 0.198064409618778 53 23 924 0.924 0.053 0.106 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.9166666666667 3 33.58333333333333 0.0142353027918889 0.0951140793534504 0.14966556884801 -0.0808787765615615 0.0134614667165727 0.0561775350718789 NA NA 0.0582767270229573 0.165185752044524 47 15 938 0.938 0.047 0.094 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.75000000000004 3 33.24999999999999 0.0142691581083785 0.0961313950679982 0.148433902350894 -0.0818622369596197 0.0144745434242322 0.0591349482462733 NA NA 0.0609696291089781 0.179378082300822 48 15 937 0.937 0.048 0.096 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC:GGCTACTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.08333333333337 3 33.91666666666666 0.0144062052287003 0.0941180977157372 0.153065197643614 -0.0797118924870369 0.0149217019682344 0.0591020161293864 NA NA 0.0593660990286513 0.179363507313397 63 23 914 0.914 0.063 0.126 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA:TACTATAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.58333333333337 3 34.08333333333333 0.0143031748474547 0.0936278982824406 0.152766163823386 -0.0793247234349859 0.0139612266188131 0.0562537219050871 NA NA 0.0600052950174627 0.186180784867239 55 22 923 0.923 0.055 0.11 N all ss13 89 AGA ACC GAA 2 TACCGAAGA:TATAGAAGA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0.25 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.1666666666667 3 33.5 0.0141848199798651 0.095366381613935 0.148740255631052 -0.0811815616340698 0.014089080382505101 0.0585633586252056 NA NA 0.0600754998886337 0.176591151222446 41 15 944 0.944 0.041 0.082 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 AGAAGAGCT:CGAAGAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.9166666666667 3 33.916666666666664 0.0142353027918889 0.0941180977157371 0.151249367947103 -0.0798827949238481 0.0141615086775373 0.0584080462235681 NA NA 0.061008433931009 0.190408039617723 62 17 921 0.921 0.062 0.124 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC:AGAGCTTCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.58333333333337 3 33.75 0.0145107307483395 0.094613463995175 0.153368560198573 -0.0801027332468355 0.0144808146119363 0.0590896380273355 NA NA 0.0592391410756421 0.176313683065155 62 13 925 0.925 0.062 0.124 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA:GCTTCCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000003 3 33.25 0.0144757207777853 0.0961313950679982 0.150582655827953 -0.0816556742902129 0.0148685033127622 0.0590678792471857 NA NA 0.0599555451656452 0.173217773501771 60 21 919 0.919 0.06 0.12 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA:TCCCGACGA 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.9166666666667 2 33.08333333333333 0.0144408793426023 0.0630291953285242 0.229114131432787 -0.0485883159859219 0.014316781169397901 0.0474202974435483 NA NA 0.050877390835786 0.339573644201677 116 42 842 0.842 0.116 0.232 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.4166666666667 2 33.08333333333333 0.0143373541664091 0.0630291953285242 0.227471635829701 -0.0486918411621151 0.0145022867821354 0.0467469123807272 NA NA 0.0515060558166235 0.344474360725695 120 46 834 0.834 0.12 0.24 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.58333333333337 2 34.08333333333333 0.0143031748474547 0.0611024764460933 0.234085026980427 -0.0467993015986386 0.0146347264716309 0.0416142520423397 NA NA 0.0512325720742532 0.360996595134189 120 54 826 0.826 0.12 0.24 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.1666666666667 2 34.166666666666664 0.0286430990492924 0.0609472230590743 0.469965613060492 -0.0323041240097819 0.0208031688951308 0.0464950120121294 NA NA 0.0526110980944132 0.539203900183632 271 19 710 0.71 0.271 0.542 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000003 2 34.5 0.0285069944752381 0.0603340239140544 0.472486213017157 -0.0318270294388163 0.020298153168324 0.0458257106466249 NA NA 0.0504763862264079 0.528345890500284 241 14 745 0.745 0.241 0.482 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.6666666666667 2 34.83333333333333 0.0284394261467203 0.0597330472949441 0.476108744398973 -0.0312936211482238 0.0199072124778854 0.0462544699947503 NA NA 0.0484126043437785 0.518024169293531 252 16 732 0.732 0.252 0.504 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGA:GGTGACGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.33333333333337 2 34.166666666666664 0.0281723261817364 0.0609472230590743 0.462241342061307 -0.0327748968773379 0.0202405294544049 0.0464614542189287 NA NA 0.0502166040595054 0.513968714324768 238 12 750 0.75 0.238 0.476 N all ss13 100 GGA ACG GAA 2 GACGGAAAA:GACGGCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.6666666666667 2 34.166666666666664 0.0284394261467203 0.0609472230590743 0.466623821714647 -0.032507796912354 0.0197577718497236 0.046997554726444 NA NA 0.0485324430399708 0.502975223461257 272 14 714 0.714 0.272 0.544 N all ss13 101 AAA GAA AAA 2 GGAAAAATG:GGCAAAATG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.6666666666667 2 34.166666666666664 0.0284394261467203 0.0609472230590743 0.466623821714647 -0.032507796912354 0.0199910560247495 0.047183826832205 NA NA 0.0533346302697467 0.542188851529037 258 15 727 0.727 0.258 0.516 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.4166666666667 2 34.416666666666664 0.0285408991973241 0.0604861633757489 0.47185831609163 -0.0319452641784248 0.0193899633316953 0.0453982853379751 NA NA 0.0481256828607788 0.506825828832532 232 7 761 0.761 0.232 0.464 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.91666666666671 2 34.916666666666664 0.0283386721709848 0.059584670169267 0.475603407562395 -0.0312459979982822 0.0193927944097973 0.0450082149009318 NA NA 0.0499042221730262 0.531236676336439 270 17 713 0.713 0.27 0.54 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGAGTTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.91666666666671 2 35.916666666666664 0.0283386721709848 0.0578600049104132 0.489779982128632 -0.0295213327394285 0.020009778947301 0.0433748094636531 NA NA 0.0473071696199691 0.532604556033961 263 18 719 0.719 0.263 0.526 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GAGTTGAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.166666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.58333333333337 2 36.24999999999999 0.0284731702204231 0.0573071018565008 0.49685238474842 -0.0288339316360778 0.0199040267442941 0.0433275223455968 NA NA 0.0482155585392303 0.549825711955407 263 16 721 0.721 0.263 0.526 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:TTGAGCCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.58333333333337 1 37.08333333333333 0.0284731702204231 0.0274630224286674 1.0367821056251 0.00101014779175566 0.0203886465904029 0.0289853969119244 NA NA 0.0343653780912479 0.976550082613328 526 43 431 0.431 0.526 0.862 N all ss13 107 CCA GCC CAA 2 AGCCCAAGA:AGCCCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.25000000000003 1 36.74999999999999 0.0286089511947678 0.0277167798918218 1.03218885117348 8.92171302945999e-4 0.0194730343127295 0.0293717377135263 NA NA 0.0347862052348776 0.979538680039632 511 50 439 0.439 0.511 0.878 N all ss13 108 AGA CAA GAT 2 CCAAGATGG:CCCAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.58333333333336 1 36.416666666666664 0.0284731702204231 0.0279752710599065 1.01779783150091 4.97899160516506e-4 0.0185543751767466 0.0278133473044025 NA NA 0.0355394556660627 0.988822196330909 496 48 456 0.456 0.496 0.912 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.00000000000001 1 37.08333333333333 0.043490443237762 0.0274630224286674 1.58360003348955 0.0160274208090947 0.0244500081274515 0.0278408621428468 NA NA 0.0382469865865724 0.675179188348647 659 16 325 0.325 0.659 0.65 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.66666666666667 1 37.416666666666664 0.0443478924201168 0.0272138698048234 1.62960625365587 0.0171340226152935 0.0252992922109377 0.0289778244959364 NA NA 0.0399611487952357 0.668092783220549 692 13 295 0.295 0.692 0.59 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAC:TACTTCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.25 1 36.75 0.0439686325106427 0.0277167798918218 1.58635428365963 0.0162518526188209 0.0256484219230977 0.0280576717867746 NA NA 0.0390508532037215 0.677284504236255 688 16 296 0.296 0.688 0.592 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTACTAC:TTCTATTAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.25 1 35.75 0.0433333505001085 0.0285069944752381 1.52009537651361 0.0148263560248704 0.025041026770493 0.0291696243146024 NA NA 0.0390367316283943 0.704089977147435 624 17 359 0.359 0.624 0.718 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTACCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25 2 34.916666666666664 0.0427161696956043 0.059584670169267 0.71689865151988 -0.0168685004736627 0.025041711316968 0.0455205061298514 NA NA 0.0518007716092878 0.744695324760894 359 1 640 0.64 0.359 0.718 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666667 2 34.5 0.042464170499631 0.0603340239140544 0.703817974417238 -0.0178698534144235 0.0242830197289186 0.0448422131913387 NA NA 0.0519534366052369 0.7308771011387 387 9 604 0.604 0.387 0.774 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACA:CTAGGAACT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.33333333333334 2 34.833333333333336 0.0414852284880391 0.0597330472949441 0.69451049907428 -0.0182478188069049 0.0238868588239496 0.0437948243786554 NA NA 0.0530188341519355 0.730713809027961 361 5 634 0.634 0.361 0.722 N all ss13 116 ACA GAA CAG 2 GGAACAGGA:GGAACTGGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.91666666666667 2 35.25 0.0411531794236846 0.0589984642956841 0.697529671576469 -0.0178452848719995 0.0237913384582895 0.0445957968454363 NA NA 0.0526671600639553 0.73473678395124 377 1 622 0.622 0.377 0.754 N all ss13 117 GGA CAG GAC 2 ACAGGACCA:ACTGGCCCA 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75 2 35.416666666666664 0.0412475068105866 0.0587096677913667 0.702567538913106 -0.0174621609807801 0.024157957936327 0.0445032514925991 NA NA 0.0520303449975763 0.737161258304913 361 5 634 0.634 0.361 0.722 N all ss13 118 CCA GAC CAG 2 GGACCAGAG:GGCCCAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333333 2 35.333333333333336 0.0554524994575896 0.0588537115811214 0.942209046257963 -0.0034012121235318 0.0268881909751087 0.0424429870325048 NA NA 0.0551016108491906 0.95078088857837 489 2 509 0.509 0.489 0.978 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT:CCAGAGGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.5 2 35 0.0549444688504895 0.0594370287406054 0.924414796881548 -0.0044925598901159 0.0271294976551636 0.0451378789371343 NA NA 0.0538255627350328 0.93348166888317 419 1 580 0.58 0.419 0.838 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTTCA:GAGGCTGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75 2 34.833333333333336 0.0553246126797069 0.0597330472949441 0.926197727809371 -0.0044084346152372 0.0287081866826385 0.046291851531067 NA NA 0.0541473805698391 0.935111544073508 502 2 496 0.496 0.502 0.992 N all ss13 121 GCA CTG CAC 2 GCTGCATTA:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.66666666666667 2 34.833333333333336 0.0548189130040021 0.0597330472949441 0.917731732876821 -0.00491413429094192 0.0289964645285898 0.0436555948502821 NaN NaN 0.0534210966084756 0.926707061323212 481 4 515 0.515 0.481 0.962 N all ss13 122 CTT CAC TAC 2 GCATTACCT:TCACTTCCC 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 1 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.25 1 34.25 0.0543839525266103 0.0297805871963345 1.82615447331757 0.0246033653302758 0.027274154012177 0.032159226867399 NA NA 0.0429896943764849 0.567113026460466 729 4 267 0.267 0.729 0.534 N all ss13 123 CCC TAC CCT 2 CTTCCCTAC:TTACCTTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25 1 34.75 0.0404138163712346 0.0293435958691742 1.37726189221716 0.0110702205020604 0.0254719648720849 0.0342699376198167 NA NA 0.0388344200776264 0.775596582217051 605 14 381 0.381 0.605 0.762 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCTTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666667 1 35.083333333333336 0.0405961546323978 0.0290593249318817 1.3970095564009 0.0115368297005161 0.0233601296803957 0.0326114388770569 NA NA 0.0396334321230911 0.770983762438705 623 14 363 0.363 0.623 0.726 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666667 1 35.083333333333336 0.0405961546323978 0.0290593249318817 1.3970095564009 0.0115368297005161 0.0240507224948858 0.0316272289494091 NA NA 0.0403173153951914 0.774762669383057 637 14 349 0.349 0.637 0.698 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.41666666666667 1 35.25 0.0403232602433046 0.0289192452027623 1.39433999610242 0.0114040150405423 0.0234055700878268 0.0312250198853885 NA NA 0.0401306678530261 0.776278516776741 600 18 382 0.382 0.6 0.764 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA:GCTAATAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.25 1 34.41666666666667 0.0398765009105087 0.0296334842053817 1.34565684663117 0.0102430167051269 0.0219646371554836 0.0331163664867807 NA NA 0.0408552609047979 0.802034652560165 625 16 359 0.359 0.625 0.718 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AATAAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666666 1 33.75 0.0395261602343307 0.0302307926160697 1.30748011593053 0.00929536761826102 0.0235180402595516 0.0316902408563094 NA NA 0.0401624092190978 0.816969518781769 624 11 365 0.365 0.624 0.73 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGA:AAAGAAGGC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333331 1 33.75 0.0535942229866087 0.0302307926160697 1.77283552129294 0.0233634303705391 0.0258328301994294 0.0334189281225675 NA NA 0.0426904021220238 0.584189164124994 718 5 277 0.277 0.718 0.554 N all ss13 130 GGA AAG GAA 2 GAAGGAATA:GAAGGCATC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.49999999999999 1 33.91666666666667 0.0541996476239405 0.0300792190929219 1.80189676655184 0.0241204285310186 0.0269169789043022 0.0325909365848031 NA NA 0.0417544441146108 0.56348469237244 741 10 249 0.249 0.741 0.498 N all ss13 131 ATA GAA TAG 2 GGAATAGTT:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666664 1 34.5 0.054631651955928 0.0295604764056575 1.84813164734626 0.0250711755502705 0.0279808255246714 0.0307057741038164 NA NA 0.0427934798292518 0.557966655448529 738 4 258 0.258 0.738 0.516 N all ss13 132 GTA TAG TAT 2 ATAGTTTGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 1 34.833333333333336 0.0547563501152288 0.0292720079293014 1.87060451225204 0.0254843421859273 0.0271792376250767 0.0326148924999712 NA NA 0.0420682192932946 0.544656806030783 742 3 255 0.255 0.742 0.51 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTT:GTTTGGGTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666666 1 34.833333333333336 0.0542609435735893 0.0292720079293014 1.85368027040174 0.0249889356442879 0.0288088387234773 0.0319264836767979 NA NA 0.041862565736111 0.550555484042307 729 7 264 0.264 0.729 0.528 N all ss13 134 GTA GGG TAG 2 TGGGTAGCC:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75 2 34.5 0.0547563501152288 0.0603340239140544 0.907553426127006 -0.00557767379882564 0.0272390607252341 0.0480006222748423 NA NA 0.0589045046013464 0.924560976741534 466 1 533 0.533 0.466 0.932 N all ss13 135 GCA TAG CAA 2 GTAGCCACG:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333333 3 34.16666666666667 0.0545075207127158 0.0933847109044368 0.583687845524252 -0.038877190191721 0.0273573095887312 0.0638402491427025 NA NA 0.0676133448681608 0.565296129339927 275 1 724 0.724 0.275 0.55 N all ss13 136 ACG CAA CGG 2 GCAACTGAG:GCCACGGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666666 3 34.833333333333336 0.0550074627952336 0.0914838201648646 0.60128078053697 -0.036476357369631 0.028117201948019 0.0594177666715447 NaN NaN 0.0657545548426805 0.579075886934073 297 0 703 0.703 0.297 0.594 N all ss13 137 GAA CGG AAG 2 ACGGAAGGG:ACTGAGGGA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.74999999999999 3 34.50000000000001 0.0547563501152288 0.0924244803179611 0.592444230433913 -0.0376681302027323 0.02859645575877 0.0600659938087863 NA NA 0.0667503506361579 0.57254073216669 284 2 714 0.714 0.284 0.568 N all ss13 138 GGA AAG GAG 2 GAAGGGGCA:GAGGGAGCC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.24999999999999 3 34.333333333333336 0.0551338852123344 0.0929021112845893 0.593462133959921 -0.0377682260722548 0.0278916461133246 0.0593590502756653 NA NA 0.0677455163164834 0.57718484351165 272 1 727 0.727 0.272 0.544 N all ss13 139 GCA GAG CAC 2 GGAGCCTTG:GGGGCACTA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.99999999999999 4 34.91666666666667 0.0845966206090083 0.124314847835041 0.680502949424538 -0.0397182272260331 0.0408858626844645 0.0698597884386658 NaN NaN 0.071217628659006 0.577047764325346 308 0 692 0.692 0.308 0.616 N all ss13 140 CTA CAC TAA 2 GCACTAAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.99999999999999 4 34.91666666666667 0.0845966206090083 0.124314847835041 0.680502949424538 -0.0397182272260331 0.0401974958840113 0.065157404295854 NaN NaN 0.0725240887030658 0.583928367332534 293 0 707 0.707 0.293 0.586 N all ss13 141 AAC TAA ACA 2 CTAAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.33333333333333 4 34.91666666666667 0.0830340183118736 0.124314847835041 0.667933233703949 -0.0412808295231678 0.0404820200813767 0.0675859062202534 NaN NaN 0.070728283043996 0.559453271735464 258 2 740 0.74 0.258 0.516 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.33333333333333 4 35.91666666666667 0.0830340183118736 0.120559681536883 0.688737870350718 -0.0375256632250095 0.040864240253065 0.0653204992665542 NA NA 0.0679754563771395 0.580915986589407 287 0 713 0.713 0.287 0.574 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.16666666666666 4 36.083333333333336 0.0832261761385522 0.119955812971472 0.69380694504855 -0.0367296368329197 0.0415650954965237 0.0639600325777562 NaN NaN 0.0686579148742342 0.592673501730687 263 1 736 0.736 0.263 0.526 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.66666666666666 4 36.583333333333336 0.0838080288297115 0.11818004032857 0.709155527419893 -0.0343720114988588 0.0412515794599743 0.0633337211324207 NaN NaN 0.0683350411175699 0.614969562395989 306 0 694 0.694 0.306 0.612 N all ss13 145 GAA AAG AAC 2 AAAGAACAC:AAAGACCAC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 75.99999999999999 4 36.25 0.0834192263326683 0.119357976360937 0.698899469277276 -0.0359387500282684 0.0426404083985126 0.0630478664471959 NaN NaN 0.0653699760155483 0.582474007304134 273 1 726 0.726 0.273 0.546 N all ss13 146 CAC AAC ACA 2 GAACACATT:GACCACATT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.08333333333331 4 36.5 0.0697366111169323 0.118472334721436 0.588632031949942 -0.0487357236045033 0.0393530800292282 0.0654248760787161 NaN NaN 0.0694015132556554 0.482536647323259 241 3 756 0.756 0.241 0.482 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.74999999999999 4 36.333333333333336 0.0700625753990949 0.119061291806916 0.588458048252297 -0.0489987164078209 0.0366165403245789 0.0653664081451002 NaN NaN 0.0650545208338954 0.451332959729019 237 2 761 0.761 0.237 0.474 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC:ATTGGCACG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.91666666666664 4 35.333333333333336 0.0689348268033826 0.122722067836352 0.561715003819088 -0.0537872410329689 0.0365759317424078 0.0693415399834992 NaN NaN 0.067898754296692 0.428262547355503 182 1 817 0.817 0.182 0.364 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC:GGCACGCGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.58333333333331 4 35.66666666666667 0.0702267037754945 0.121476995958792 0.578107017062861 -0.0512502921832976 0.0390804188710575 0.067240576818697 NaN NaN 0.0674501975350752 0.447359677193365 193 1 806 0.806 0.193 0.386 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT:ACGCGTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.24999999999999 4 35.00000000000001 0.0695747645549368 0.123992985319038 0.561118553407831 -0.0544182207641008 0.0395710343458233 0.0674323830902854 NaN NaN 0.0685263483186498 0.427124921033048 202 0 798 0.798 0.202 0.404 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT:CGTAATCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.91666666666664 4 35.333333333333336 0.0698992129639131 0.122722067836352 0.569573298399135 -0.0528228548724384 0.0378442314022219 0.0657722787359903 NA NA 0.0646006305304749 0.413538065335364 182 0 818 0.818 0.182 0.364 N all ss13 152 CCC ATC CCA 2 AATCCCAAC:AATCCTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.58333333333331 5 35.333333333333336 0.0702267037754945 0.15681884839392 0.447820555339682 -0.086592144618425 0.0369311272552203 0.0828325322580306 0.420808585398364 0.287242348988626 0.0770004812200407 0.260772869971972 96 0 904 0.904 0.096 0.192 N all ss13 153 AAC CCA ACA 2 CCCAACAAC:CCTAATAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.08333333333331 5 35.5 0.0697366111169323 0.156000428408735 0.447028330808274 -0.0862638172918024 0.039241043402822 0.075857026185815 NA NA 0.0803860061219696 0.28321735444962 114 0 886 0.886 0.114 0.228 N all ss13 154 AAC ACA ACA 2 AACAACAAC:AATAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.08333333333331 5 35.5 0.0697366111169323 0.156000428408735 0.447028330808274 -0.0862638172918024 0.0396727325946928 0.0758363232012667 NaN NaN 0.0757338641651088 0.254686929950984 105 1 894 0.894 0.105 0.21 N all ss13 155 AAC ACA ACG 2 AACAACGCA:AACAATGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.91666666666664 5 35.25 0.0698992129639131 0.157231298910254 0.444562968368092 -0.0873320859463404 0.039791440880183 0.0807218967124953 NaN NaN 0.0802570431144163 0.276526779110655 127 1 872 0.872 0.127 0.254 N all ss13 156 GCA ACG CAG 2 AACGCAGCC:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.58333333333331 5 34.91666666666667 0.0702267037754945 0.158903109406266 0.441946693415211 -0.0886764056307711 0.0391557420937049 0.0782376041058175 NaN NaN 0.0823021865359031 0.281279739393146 122 0 878 0.878 0.122 0.244 N all ss13 157 GCC CAG CCA 2 GCAGCCATT:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 74.91666666666664 5 34.91666666666667 0.115195995681218 0.158903109406266 0.724944880636023 -0.0437071137250474 0.0609879445267153 0.0734156448490422 NaN NaN 0.091168668764675 0.631647431484052 298 0 702 0.702 0.298 0.596 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATTGTC 1:1 TRUE 1.08333333333333 0.75 1.16666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 8 75.08333333333331 5 34.75 0.114919656765687 0.15975246858483 0.719360757199591 -0.0448328118191427 0.0615599201540597 0.0795019417785546 NaN NaN 0.0922057569172257 0.626807127781941 285 1 714 0.714 0.285 0.57 N all ss13 159 GTC CCG TCT 2 ACCGTGCTA:ATTGTCTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.16666666666666 5 34.416666666666664 0.0994361809511673 0.161478827235442 0.615784636621035 -0.0620426462842744 0.0600114955095387 0.0820941414661842 NaN NaN 0.0956092637679096 0.516390878794068 241 0 759 0.759 0.241 0.482 N all ss13 160 CTA TCT TAC 2 GTCTTGCAA:GTGCTACAA 1:1 TRUE 1.58333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 75.16666666666666 5 34.416666666666664 0.0994361809511673 0.161478827235442 0.615784636621035 -0.0620426462842744 0.064220714723503 0.0797215177098011 NaN NaN 0.0947223611527765 0.512471154473666 234 0 766 0.766 0.234 0.468 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT:TTGCAATTG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 74.83333333333333 5 34.333333333333336 0.0999099569047448 0.161916285324778 0.617046992551375 -0.0620063284200335 0.0595072940361104 0.0777150824174672 NaN NaN 0.0960614088047731 0.51861205935812 231 0 769 0.769 0.231 0.462 N all ss13 162 CTT AAC TGC 2 CAACTTCCT:CAATTGCCT 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 74.66666666666666 5 34.666666666666664 0.131403066768818 0.160180575223544 0.820343331801842 -0.0287775084547263 0.0678725708501418 0.0809949271921759 NaN NaN 0.0997313980552819 0.772925658777139 370 0 630 0.63 0.37 0.74 N all ss13 163 CCT TGC CTC 2 CTTCCTCAA:TTGCCTCAA 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.99999999999999 5 35 0.149003021096613 0.158481820250405 0.940189990632267 -0.00947879915379207 0.0723196430965227 0.0759552717577163 NaN NaN 0.0921817345074761 0.918100035385414 454 0 546 0.546 0.454 0.908 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA:CCTCAAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 74.58333333333333 5 35.08333333333333 0.181100119848143 0.158062767299148 1.14574812868735 0.0230373525489944 0.0792108674328389 0.071824789726929 NaN NaN 0.0962597353944158 0.810853650850569 580 0 420 0.42 0.58 0.84 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA:CAAGGTACG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.08333333333333 5 34.916666666666664 0.199901197023294 0.158903109406266 1.25800683051588 0.0409980876170286 0.0817618186923429 0.0812075527358428 NaN NaN 0.102991167800739 0.690575771563391 643 0 357 0.357 0.643 0.714 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA:GGTACGTCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 73.83333333333333 5 35.166666666666664 0.200677246998514 0.157645932730055 1.27296177911639 0.0430313142684591 0.0810673999601765 0.0780417716854552 NaN NaN 0.102336817227128 0.674129631446425 674 0 326 0.326 0.674 0.652 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG:ACGTCCTTG 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 73.83333333333333 5 35.166666666666664 0.200677246998514 0.157645932730055 1.27296177911639 0.0430313142684591 0.0845208111635074 0.0816575421329005 NaN NaN 0.101589819398907 0.671872872017498 687 1 312 0.312 0.687 0.624 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA:TCCTTGCCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 74.16666666666667 5 35.5 0.199643853662043 0.156000428408735 1.27976477820278 0.0436434252533079 0.08337537736826 0.0740883373063765 NaN NaN 0.0997245248163707 0.661647384919481 662 0 338 0.338 0.662 0.676 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 73.33333333333334 5 36 0.202247675211827 0.15359580948451 1.31675255913947 0.0486518657273171 0.0826753273101422 0.0711088524822149 NaN NaN 0.102881632142585 0.636290475887886 684 1 315 0.315 0.684 0.63 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGA:CCAAAAGGC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 73.16666666666667 5 36.166666666666664 0.202776660937579 0.152810715724973 1.326979328482 0.0499659452126059 0.0844479142768737 0.0727759077179891 NaN NaN 0.100286934635684 0.618322039718947 718 0 282 0.282 0.718 0.564 N all ss13 171 GGA AAG GAT 2 AAAGGATTC:AAAGGCTTC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 72.16666666666667 5 36.5 0.206009982927838 0.151264442981809 1.36191942314304 0.0547455399460291 0.0842214291894809 0.0764146938094908 NaN NaN 0.102340515124389 0.592694693629844 693 0 307 0.307 0.693 0.614 N all ss13 172 TTC GAT TCT 2 GGATTCTAC:GGCTTCTAC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 71.91666666666667 5 36.75 0.206834591586132 0.150125187835474 1.37774742911767 0.0567094037506581 0.0818838137166191 0.0730676810172845 NaN NaN 0.101362094354893 0.575838624938723 717 0 283 0.283 0.717 0.566 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 70.91666666666667 5 36.916666666666664 0.210200553251816 0.149375201835214 1.40719845509366 0.0608253514166024 0.0883925455749157 0.0720415099834369 NaN NaN 0.109633841889455 0.579028372707347 706 0 294 0.294 0.706 0.588 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 71.91666666666667 5 35.916666666666664 0.206834591586132 0.153991399978411 1.34315677119066 0.0528431916077205 0.0859616677691005 0.0771822358010663 NaN NaN 0.0991045626041125 0.593890679896053 722 1 277 0.277 0.722 0.554 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGA:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 72.41666666666667 5 34.916666666666664 0.205191964060279 0.158903109406266 1.29130238437102 0.0462888546540138 0.0835473083682262 0.0760114678284712 NaN NaN 0.100923652733179 0.646483949844704 669 2 329 0.329 0.669 0.658 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGAAGT:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 70.91666666666667 5 34.25 0.210200553251816 0.162356129339379 1.29468812854257 0.0478444239124373 0.0875095991342002 0.0796087461064829 NaN NaN 0.109209665294675 0.661315987790562 679 0 321 0.321 0.679 0.642 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGAAGTCGT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 71.08333333333334 5 33.75 0.20963192302193 0.165046413582601 1.27013922006257 0.0445855094393287 0.0900008984412814 0.0815955598559637 NaN NaN 0.103202303106629 0.665726521922404 654 0 346 0.346 0.654 0.692 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGTCGTGGT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 70.58333333333334 5 33.83333333333333 0.21134718020589 0.164591833676269 1.28406844668602 0.0467553465296209 0.0891495647922464 0.0852611900411938 NaN NaN 0.110444205990062 0.672047898675886 690 1 309 0.309 0.69 0.618 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC:CGTGGTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 69.58333333333334 5 33.416666666666664 0.195965250459927 0.166890228132415 1.17421644546164 0.0290750223275121 0.0857522103377552 0.0804661897996134 NaN NaN 0.104123404082338 0.780063574488986 594 0 406 0.406 0.594 0.812 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT:GGTGGCAGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 69.91666666666669 5 32.75 0.194898308974729 0.170704815996831 1.14172706749145 0.0241934929778981 0.0853895719015898 0.0891321025908117 NaN NaN 0.109159929014839 0.824599231347264 602 0 398 0.398 0.602 0.796 N all ss13 181 AGC GCA GCC 2 GGCAGCCAA:GGCAGTCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 70.58333333333336 5 32.75 0.192799094262602 0.170704815996831 1.12942973012654 0.0220942782657708 0.08216548518881 0.0847851620053336 NaN NaN 0.109414269282328 0.839969627458613 600 0 400 0.4 0.6 0.8 N all ss13 182 CAA GCC AAA 2 AGCCAAACC:AGTCAAGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 70.91666666666669 6 32.08333333333333 0.19176644555315 0.215112484631514 0.891470552635029 -0.0233460390783641 0.083714809074529 0.103726413936162 NaN NaN 0.126913345707077 0.854050645175485 449 0 551 0.551 0.449 0.898 N all ss13 183 ACC AAA CCG 2 CAAACCGCC:CAAGCCTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 71.16666666666669 6 31.83333333333333 0.190999228388671 0.217071598340042 0.87989045941179 -0.0260723699513708 0.0854525336749259 0.101538505708844 NaN NaN 0.128604775482429 0.839344105284566 400 0 600 0.6 0.4 0.8 N all ss13 184 GCC CCG CCT 2 ACCGCCTCA:GCCTCTTCT 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 71.83333333333334 5 31.83333333333333 0.188983168709011 0.176245193423779 1.07227417121444 0.0127379752852319 0.0818357576972155 0.0838069489714666 NaN NaN 0.105774466503332 0.904145850656476 546 0 454 0.454 0.546 0.908 N all ss13 185 TCA CCT CAC 2 GCCTCACGT:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 72.50000000000001 4 31.83333333333333 0.187009442781175 0.137526919369799 1.35980245640726 0.0494825234113767 0.0779326889049817 0.0733351147478608 NaN NaN 0.0971795294063543 0.610621368109652 691 0 309 0.309 0.691 0.618 N all ss13 186 CGC CAC GCT 2 TCACGTTCC:TCTCGCTCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 73.16666666666669 4 31.166666666666664 0.185076724431923 0.140762624951505 1.31481438695595 0.0443140994804185 0.0801148217588356 0.0774113301661236 NaN NaN 0.101268108061759 0.661682175023453 673 0 327 0.327 0.673 0.654 N all ss13 187 TCC GCT CCA 2 CGCTCCTCA:CGTTCCAGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 73.16666666666669 4 31.166666666666664 0.185076724431923 0.140762624951505 1.31481438695595 0.0443140994804185 0.0818526579517637 0.0766896934914243 NaN NaN 0.100201312008822 0.658307808100695 693 1 306 0.306 0.693 0.612 N all ss13 188 AGC CCA CAT 2 TCCAGCTCA:TCCTCATCA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 2 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 73.50000000000001 4 30.83333333333333 0.184125343811615 0.142438427764417 1.2926662186706 0.0416869160471976 0.0822564626788063 0.0762660853727447 NaN NaN 0.0975894077539871 0.669258131972935 649 0 351 0.351 0.649 0.702 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 AGCTCACGT:TCATCACGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 73.58333333333336 3 31.08333333333333 0.149936983833896 0.103314927985559 1.45126156265486 0.0466220558483379 0.0676096900798599 0.0694696696969586 NaN NaN 0.0955140120788083 0.625466652845155 695 0 305 0.305 0.695 0.61 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 73.9166666666667 4 30.749999999999996 0.165879414379754 0.142863650574837 1.16110300774416 0.0230157638049171 0.0706555083524727 0.0811192151015525 NaN NaN 0.104332475050908 0.825403753214657 596 0 404 0.404 0.596 0.808 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC:CGTAGTCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 74.4166666666667 4 30.916666666666664 0.164633055207659 0.142015736265178 1.15925924504766 0.0226173189424804 0.0724032685509926 0.0827039747962186 NA NA 0.10201521628161 0.824543267261513 614 1 385 0.385 0.614 0.77 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT:AGTCGTGGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 75.4166666666667 4 29.916666666666664 0.162195908768451 0.147260274111344 1.10142337943642 0.0149356346571066 0.0687498875344638 0.0844278358810925 NaN NaN 0.105339076116321 0.887248829679849 563 1 436 0.436 0.563 0.872 N all ss13 193 GGA GCG GAA 2 CGCGGTAAT:CGTGGAAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.08333333333336 4 28.916666666666664 0.158291065496404 0.152908411727716 1.03520181596205 0.00538265376868804 0.0696850225097744 0.0839708907157739 NaN NaN 0.106592914202308 0.959726105417485 487 0 513 0.513 0.487 0.974 N all ss13 194 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCC:GGTAATTCA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.75000000000003 4 27.916666666666664 0.154570468491074 0.159008783209024 0.972087612845161 -0.00443831471795017 0.0677478824779804 0.0917683327921392 NaN NaN 0.101964475976541 0.965280605752304 494 0 506 0.506 0.494 0.988 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AATTCCAGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.4166666666667 4 27.58333333333333 0.187348078274046 0.16115228773261 1.16255301683896 0.0261957905414361 0.074799544517979 0.0961521886486796 NaN NaN 0.117008091595979 0.822850552116203 592 0 408 0.408 0.592 0.816 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT:TCCAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 79.25000000000004 4 27.41666666666666 0.185113513370723 0.162245943584362 1.14094386140675 0.022867569786361 0.0771432101433975 0.0959045748820002 NaN NaN 0.11542601252878 0.842955459802605 581 0 419 0.419 0.581 0.838 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.9166666666667 6 27.58333333333333 0.186000879178407 0.256899645924678 0.724021547437018 -0.0708987667462707 0.0813244154045379 0.15743069259489 NaN NaN 0.181492091733062 0.696060519441959 311 0 689 0.689 0.311 0.622 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACG:AATTCAACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 77.9166666666667 6 27.916666666666664 0.188715038816376 0.253250234920167 0.745172216230579 -0.0645351961037912 0.0754880496960733 0.157322314581782 NaN NaN 0.174689212320548 0.711808262438739 357 0 643 0.643 0.357 0.714 N all ss13 199 ACG CAA CGC 2 TCAACGCCT:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 13 78.4166666666667 6 28.416666666666664 0.187348078274046 0.247968200054092 0.75553267811428 -0.0606201217800463 0.0765965490674155 0.147242470274069 NaN NaN 0.169038215930361 0.719880990557611 365 0 635 0.635 0.365 0.73 N all ss13 200 CCT CGC CTA 2 ACGCCTAGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.1666666666667 6 29.083333333333332 0.20465023999998 0.24126182510618 0.848249572471371 -0.0366115851062001 0.0726369099200361 0.152896077640423 NaN NaN 0.194274247197155 0.850521473592259 414 0 586 0.586 0.414 0.828 N all ss13 201 AGC CTA GCA 2 CCTAGCAGT:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.6666666666667 6 28.250000000000004 0.200233049317567 0.249703998029926 0.801881631440959 -0.0494709487123591 0.0769095731743826 0.150318756046564 NaN NaN 0.165832116528439 0.765459347374275 394 0 606 0.606 0.394 0.788 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 AGCAGTAGC:GGCAGCAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.6666666666667 5 27.91666666666667 0.200233049317567 0.20465023999998 0.978415902749915 -0.00441719068241286 0.0806988295372441 0.143833403794901 NaN NaN 0.161239315563826 0.978144490129551 522 0 478 0.478 0.522 0.956 N all ss13 203 AGC GCA GCA 2 AGCAGTAGG:AGTAGCAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 79.1666666666667 5 27.750000000000004 0.201683977327343 0.206064750939693 0.978740790977725 -0.00438077361234987 0.0794483881882738 0.142187413991698 NaN NaN 0.156129476867217 0.977615418212675 510 1 489 0.489 0.51 0.978 N all ss13 204 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGT:AGTAGGGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.1666666666667 6 28.083333333333332 0.20465023999998 0.25146449764628 0.813833530838414 -0.0468142576463 0.0827072895524594 0.150264133178619 NaN NaN 0.172935135999006 0.786618590717637 402 0 598 0.598 0.402 0.804 N all ss13 205 GGA GAG GAA 2 AGAGGTTCA:AGGGGAAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.00000000000003 6 28.66666666666667 0.205153173799212 0.245409683406312 0.83596201646025 -0.0402565096071 0.0815777842625084 0.138992156701344 NaN NaN 0.17108877673538 0.813978977764316 399 0 601 0.601 0.399 0.798 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGTTCATCA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 3 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 14 78.33333333333337 6 28.333333333333336 0.204149781227553 0.248833044237754 0.820428741097958 -0.044683263010200903 0.0802568079112913 0.14867656890348 NaN NaN 0.16723449281823 0.78932343283539 397 0 603 0.603 0.397 0.794 N all ss13 207 TCA ATT CAC 2 AATTCTCCT:TCATCACCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.6666666666667 6 28.666666666666668 0.156968578879544 0.245409683406312 0.639618521570964 -0.0884411045267685 0.0609578474536127 0.156707376046699 NaN NaN 0.160156299224774 0.580799374349559 242 0 758 0.758 0.242 0.484 N all ss13 208 CCA CAC CAG 2 TCACCAGCA:TCTCCTGCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 77.58333333333337 6 29.416666666666668 0.157156146021032 0.238043979028558 0.660197946036593 -0.0808878330075259 0.0614184812461311 0.14347077436033 NaN NaN 0.155086396848661 0.601972355598669 280 0 720 0.72 0.28 0.56 N all ss13 209 GCA CAG CAC 2 CCAGCACGA:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.58333333333337 6 29.083333333333336 0.154934610949651 0.24126182510618 0.642184526629788 -0.0863272141565292 0.0572864667500238 0.159923009869776 NaN NaN 0.168337875443316 0.608076469937149 264 0 736 0.736 0.264 0.528 N all ss13 210 CGA CAC GAA 2 GCACGAAAC:GCTCGAATG 1:1 FALSE 1.25 1.25 0.25 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 11 78.91666666666671 6 28.75 0.154208039717061 0.244568640424989 0.630530715013555 -0.0903606007079276 0.0630004717176657 0.159091027874618 NaN NaN 0.155463967072563 0.561084241235129 251 0 749 0.749 0.251 0.502 N all ss13 211 AAC GAA ACC 2 CGAAACCTG:CGAATGGCT 1:1 TRUE 2.5 0.166666666666667 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 12 79.00000000000004 6 29.25 0.169734844556616 0.23964200873058 0.70828501837273 -0.0699071641739632 0.0655929754445637 0.145923046715763 NaN NaN 0.149090373704418 0.639147407028584 313 0 687 0.687 0.313 0.626 N all ss13 212 CTG ACC CTA 2 AACCTGCAA:ATGGCTAGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 10 78.66666666666671 6 29.416666666666668 0.13928785934632 0.238043979028558 0.585134981841357 -0.0987561196822381 0.0538855087900998 0.134412242879583 NaN NaN 0.141671347429506 0.485753362237909 220 0 780 0.78 0.22 0.44 N all ss13 213 AGC CTA AAG 2 CTGCAAGCT:GCTAGCGGA 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.50000000000006 5 29.416666666666668 0.122722067836351 0.192747196311253 0.636699626168242 -0.0700251284749014 0.0531595915874618 0.120730786337886 NaN NaN 0.138457283951733 0.613030352076854 296 1 703 0.703 0.296 0.592 N all ss13 214 GCT AAG CTG 2 AGCGGAGGT:CAAGCTGGA 1:1 TRUE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.91666666666671 5 29.083333333333336 0.0944005262514171 0.195270406950441 0.483434882559422 -0.100869880699024 0.0423787702696312 0.123422985690147 NaN NaN 0.130988361169213 0.441259849429299 180 0 820 0.82 0.18 0.36 N all ss13 215 GGA CTG GAG 2 GCTGGAGGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.75000000000004 5 29.250000000000004 0.0803443058867966 0.194000551939624 0.414144728370675 -0.113656246052827 0.0375591941650233 0.127849192249541 NaN NaN 0.122456482081647 0.353337126720289 167 1 832 0.832 0.167 0.334 N all ss13 216 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGAC:GGTGGTGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.25000000000004 5 29.750000000000007 0.0808863909048056 0.190288706694225 0.425071946254708 -0.10940231578942 0.03883415136389 0.12680244253953 NaN NaN 0.120691276145756 0.364690228555911 160 0 840 0.84 0.16 0.32 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT:GGTGACACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666671 5 30.08333333333334 0.0812518671161105 0.187892466749351 0.432438130819266 -0.106640599633241 0.0395546106998935 0.125398693853472 NaN NaN 0.127401641853744 0.402568631432947 163 0 837 0.837 0.163 0.326 N all ss13 218 ACA AAA CAG 2 GAAACTGCC:GACACAGCA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.16666666666671 5 29.83333333333334 0.0668593871386967 0.189683904532547 0.352477914789151 -0.122824517393851 0.0359732851140598 0.121885729792282 NA NA 0.12482564696284 0.325130950800837 101 2 897 0.897 0.101 0.202 N all ss13 219 GCA CAG CAC 2 ACAGCACTT:ACTGCCCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.66666666666671 5 29.000000000000007 0.0655438665862574 0.195911624447713 0.334558333488528 -0.130367757861456 0.0375627378446315 0.116998452759888 NaN NaN 0.139090342977677 0.348610254714856 110 1 889 0.889 0.11 0.22 N all ss13 220 CTC CAC TCG 2 GCACTTGCC:GCCCTCGCG 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.00000000000006 5 28.66666666666667 0.0652585327422223 0.198519415670312 0.328726197998686 -0.133260882928089 0.0361521665795955 0.125254528900162 NA NA 0.134124833783421 0.320437804920916 90 1 909 0.909 0.09 0.18 N all ss13 221 GCC TCG CCC 2 CTCGCGCTA:CTTGCCCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.50000000000006 5 28.83333333333334 0.0648351627055778 0.197206849707019 0.328767295871824 -0.132371687001441 0.0347506956080116 0.120012478103151 NA NA 0.126867281549587 0.296769038284131 99 1 900 0.9 0.099 0.198 N all ss13 222 CTA CCC TAT 2 GCCCTTTTG:GCGCTATTG 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.66666666666673 5 28.66666666666667 0.0646952582133052 0.198519415670312 0.325888820470573 -0.133824157457006 0.0338511348648083 0.141850570735825 NaN NaN 0.128510930268039 0.297715665327762 115 0 885 0.885 0.115 0.23 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:CTTTTGCTG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.66666666666673 5 28.83333333333334 0.0646952582133052 0.197206849707019 0.328057865684787 -0.132511591493714 0.0345613221754335 0.134684265270886 NA NA 0.13433966523879 0.323940714728791 87 0 913 0.913 0.087 0.174 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.3333333333334 5 29.83333333333334 0.0649756739796766 0.189683904532547 0.342547113524477 -0.124708230552871 0.0358422147089967 0.126153141674406 NaN NaN 0.125589380224553 0.320717808376703 94 1 905 0.905 0.094 0.188 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTAGAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 80.50000000000007 5 30.16666666666667 0.0648351627055777 0.187302855665743 0.346151490724099 -0.122467692960165 0.0349909103133402 0.120158402733776 NA NA 0.126567775853138 0.333241362598439 112 0 888 0.888 0.112 0.224 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTAGATAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000007 5 31.16666666666667 0.0640047012994632 0.180507022556888 0.354582887650766 -0.116502321257424 0.0367501895194714 0.117620320792157 NaN NaN 0.113618845162676 0.30518462785296 106 1 893 0.893 0.106 0.212 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GATAGGTTA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.50000000000007 5 31.500000000000004 0.0640047012994632 0.178350531835637 0.358870257580438 -0.114345830536174 0.0340126340817603 0.111762330698191 NaN NaN 0.116950551317818 0.328208861461441 125 0 875 0.875 0.125 0.25 N all ss13 228 TTA GAT TAA 2 AGATTGAAC:AGGTTAAAC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.33333333333341 5 31.58333333333334 0.0641416300786214 0.177819473768805 0.360712067802069 -0.113677843690184 0.0348608894445659 0.114953467324634 NaN NaN 0.117292468762914 0.332453989561976 124 1 875 0.875 0.124 0.248 N all ss13 229 AAC TAA ACC 2 TTAAACCAG:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.5833333333334 5 31.41666666666667 0.0631287278025222 0.178884786483983 0.352901602441047 -0.115756058681461 0.0342663093788371 0.115838933065403 NA NA 0.117501906872842 0.324554345748133 118 2 880 0.88 0.118 0.236 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT:AACCAGTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.16666666666673 5 32.16666666666667 0.063462786419742 0.174189200634338 0.364332497012629 -0.110726414214596 0.0342173679054506 0.121984289241997 NA NA 0.111952653920153 0.322640244163678 109 0 891 0.891 0.109 0.218 N all ss13 231 CTT AGC TGG 2 CAGCTTGAG:CAGTTGGAG 1:1 TRUE 2 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.8333333333334 5 31.83333333333334 0.0637325912188816 0.176245193423779 0.36161321611556 -0.112512602204898 0.0332963319786657 0.105701193247491 NaN NaN 0.113637723244787 0.322125706049456 108 0 892 0.892 0.108 0.216 N all ss13 232 GAG TGG AGA 2 CTTGAGAGC:TTGGAGAGC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.75000000000007 4 32.25000000000001 0.0638004014677688 0.135579277355344 0.470576349957615 -0.0717788758875751 0.0350201573689516 0.0964115598321676 NA NA 0.0945392966030617 0.447703559339905 192 0 808 0.808 0.192 0.384 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000007 4 31.500000000000007 0.0631952577133049 0.139125907283501 0.45423069611708 -0.0759306495701958 0.0348270800688127 0.0999820108017316 NA NA 0.0990378331314606 0.443269854105063 222 2 776 0.776 0.222 0.444 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.8333333333334 4 31.500000000000007 0.0637325912188816 0.139125907283501 0.458092906370141 -0.0753933160646191 0.0331340036278032 0.0971820597258395 NA NA 0.0985292963760983 0.444160324384269 208 2 790 0.79 0.208 0.416 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCA:AAAGTTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.3333333333334 4 31.000000000000007 0.0633287393599308 0.141595553474679 0.447250904466118 -0.0782668141147482 0.0348032630178013 0.0993782953161677 NA NA 0.10304922435454 0.447548127838589 207 1 792 0.792 0.207 0.414 N all ss13 236 TCA TTT CAG 2 GTTTCAGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.25000000000007 4 31.08333333333334 0.0633956919887586 0.141177857059552 0.449048408221813 -0.0777821650707938 0.034424071847356 0.100635925249715 NA NA 0.104448147194134 0.456455241996175 215 0 785 0.785 0.215 0.43 N all ss13 237 GGT CAG GTA 2 TCAGGTAAG:TCTGGTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.91666666666673 4 31.08333333333334 0.0628640039123035 0.141177857059552 0.445282321333053 -0.078313853147249 0.0349275191229715 0.0996994956689599 NA NA 0.10755301922036 0.466526764831884 193 1 806 0.806 0.193 0.386 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC:GGTAAGACA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.0833333333334 4 31.41666666666667 0.0627324732790301 0.139531497680893 0.449593635284404 -0.076799024401863 0.0339075639111317 0.101659080560839 NA NA 0.101441547587309 0.449003957725176 214 1 785 0.785 0.214 0.428 N all ss13 239 ACA AAG CAC 2 AAAGGCCAA:AAGACACAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.00000000000007 4 30.83333333333334 0.0627981696828509 0.142438427764417 0.440879407814825 -0.0796402580815662 0.0333069645897438 0.107474208894639 NA NA 0.103067202028286 0.439698619524136 191 1 808 0.808 0.191 0.382 N all ss13 240 CAA CAC AAC 2 ACACAACAA:GGCCAACAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000007 3 31.500000000000007 0.0498108321742552 0.101851155869296 0.489055148654145 -0.0520403236950411 0.0318111211622945 0.0833254551821697 NA NA 0.0918223908547867 0.570884166029413 268 7 725 0.725 0.268 0.536 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.3333333333334 3 32.16666666666668 0.0502279695796377 0.0995936054863591 0.504329262248842 -0.0493656359067214 0.0303227494913941 0.0812328069481666 NA NA 0.0878140630704129 0.574006373942328 288 3 709 0.709 0.288 0.576 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.91666666666673 3 32.58333333333334 0.0636649250476358 0.0982328346145694 0.648102289803957 -0.0345679095669336 0.0345912724483101 0.082182339501064 NA NA 0.0854580821603517 0.685844085660008 384 1 615 0.615 0.384 0.768 N all ss13 243 CAA AAC AAC 2 CAACAACCA:CAACAAGGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.58333333333339 3 32.91666666666668 0.0656155905923368 0.097170738715697 0.675260798256516 -0.0315551481233601 0.0355507022101187 0.0823610121154308 NA NA 0.0830300149024699 0.703911956966476 367 1 632 0.632 0.367 0.734 N all ss13 244 CCA AAC CAC 2 CAACCACAA:CAAGGCCAA 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.91666666666671 3 32.91666666666668 0.067083795263945 0.097170738715697 0.690370333194846 -0.030086943451752 0.0372687887733207 0.083298036195726 NA NA 0.0879739748948251 0.732352226416296 381 2 617 0.617 0.381 0.762 N all ss13 245 CAA CAC AAA 2 CCACAAGTT:GGCCAAACT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666671 3 33.08333333333334 0.0395261602343306 0.0966482688635724 0.408969148636539 -0.0571221086292419 0.0224245298770025 0.0770350602918102 NA NA 0.0865734445948991 0.509375141382791 262 6 732 0.732 0.262 0.524 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC:CAAGTTGTC 1:1 TRUE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 2 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000004 3 32.58333333333334 0.0393532888030902 0.0982328346145694 0.400612371184222 -0.0588795458114792 0.0228003410540788 0.0774571923514382 NA NA 0.085062009276269 0.488814521718102 216 4 780 0.78 0.216 0.432 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT:GTTGTCACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.41666666666671 1 32.41666666666668 0.0392674190316604 0.031500692980973 1.24655730765601 0.00776672605068737 0.0236991102567283 0.0317587260118159 NA NA 0.0385454944068572 0.840311505109506 586 10 404 0.404 0.586 0.808 N all ss13 248 ACA TCA CAA 2 GTCACAAGA:GTCACTAAG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333339 1 32.75000000000001 0.0394395350433882 0.0311733183159379 1.26516961215592 0.0082662167274503 0.0239080182355224 0.030120944454431 NA NA 0.0386129565636693 0.830485581014651 615 13 372 0.372 0.615 0.744 N all ss13 249 AAG CAA AGA 2 ACAAGAAAA:ACTAAGAAA 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.583333333333333 1 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.91666666666673 1 32.58333333333334 0.0390120440358434 0.0313361505112163 1.24495330151927 0.0076758935246272 0.023138456223965 0.0311062793797362 NA NA 0.0394562756890354 0.84575169637511 591 21 388 0.388 0.591 0.776 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT:AGAAAATCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.83333333333339 1 32.25000000000001 0.0258089981982962 0.03166697281676 0.815013116272248 -0.00585797461846387 0.0191219802696509 0.0308810020731645 NA NA 0.0367340749372238 0.87329877061871 437 37 526 0.526 0.437 0.874 N all ss13 251 TCA AAT CAG 2 AAATCAGCT:AAATCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333339 1 32.75000000000001 0.0259766224970672 0.0311733183159379 0.833296674861405 -0.00519669581887072 0.0190745416116851 0.0321815861422032 NA NA 0.0367865264726063 0.887659585594324 428 49 523 0.523 0.428 0.856 N all ss13 252 GCT CAG CTG 2 TCAGCTTCT:TCTGCTGCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.33333333333339 1 32.41666666666667 0.0388017557993916 0.031500692980973 1.23177467311048 0.00730106281841852 0.0221117914611028 0.0300890302325506 NA NA 0.0357611725748984 0.838227117388278 606 17 377 0.377 0.606 0.754 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG:GCTTCTGAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.50000000000004 1 32.25000000000001 0.0382248326940206 0.03166697281676 1.2070883098049 0.00655785987726061 0.0212953909846526 0.0312961643371103 NA NA 0.0386003824235055 0.865095812186882 585 13 402 0.402 0.585 0.804 N all ss13 254 GAA CTG AAG 2 GCTGAGGCA:TCTGAAGCT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.83333333333337 0 31.91666666666668 0.038063135955626 0 -Inf 0.038063135955626 0.0215440408441874 0 NA NA 0.0213052658509571 0.074008630079946 963 37 0 0 0.963 0.001 N all ss13 255 GCA AAG CAT 2 GAAGCTTCT:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.25000000000004 0 31.500000000000007 0.037862929073994 0 -Inf 0.037862929073994 0.0211384696292122 0 NA NA 0.0220823435492839 0.0864140788818551 947 53 0 0 0.947 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA:GCTTCTAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.4166666666667 0 31.83333333333334 0.0377834349217082 0 -Inf 0.0377834349217082 0.021653485841315 0 NA NA 0.0209963298680796 0.0719355644408918 965 35 0 0 0.965 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG:TCTAAGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.08333333333337 0 31.166666666666675 0.03746876920025 0 -Inf 0.03746876920025 0.0213886085838386 0 NA NA 0.0217005757448644 0.0842349287015043 961 39 0 0 0.961 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT:AAGAAGCCC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.83333333333337 0 30.416666666666675 0.0371209782035218 0 -Inf 0.0371209782035218 0.022008903299971 0 NA NA 0.0210009886922116 0.0771307408054229 951 49 0 0 0.951 0.001 N all ss13 259 CCC AGC CCA 2 AAGCCCAGA:AAGCCTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.50000000000004 0 30.58333333333334 0.0372747514142044 0 -Inf 0.0372747514142044 0.0209829285471241 0 NA NA 0.0221519668751019 0.092436357795057 943 57 0 0 0.943 0.001 N all ss13 260 AGA CCA GAC 2 CCCAGACAA:CCTCGCCAA 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.75 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.50000000000004 0 30.58333333333334 0.0372747514142044 0 -Inf 0.0372747514142044 0.0205526585431623 0 NA NA 0.0218478777891427 0.08798872029973 951 49 0 0 0.951 0.001 N all ss13 261 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAA:CGCCAAAAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.33333333333337 0 30.666666666666675 0.0246935885223499 0 -Inf 0.0246935885223499 0.0166543555256828 0 NA NA 0.0173857672337199 0.155510597751355 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGA:CAAAAACGT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.1666666666667 0 30.83333333333334 0.0247445123657617 0 -Inf 0.0247445123657617 0.0176930815530479 0 NA NA 0.0170204630729445 0.145999105188016 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 263 CGA AAC GAA 2 AAACGAACG:AAACGTACT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000004 0 31.33333333333334 0.0251069468972921 0 -Inf 0.0251069468972921 0.0175652138960111 0 NA NA 0.0179343055928865 0.161531367914573 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 264 ACG GAA CGG 2 CGAACGGCT:CGTACTGCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 32.50000000000001 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.016986355268618 0 NA NA 0.0170837852040749 0.137081857436748 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 265 GCC CGG CCA 2 ACGGCTACC:ACTGCCACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.4166666666667 0 32.16666666666667 0.0252921753687316 0 -Inf 0.0252921753687316 0.0176094781994548 0 NA NA 0.0176206290397911 0.151180832419307 883 117 0 0 0.883 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACCAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333337 0 31.666666666666668 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.0180846475710099 0 NA NA 0.0169467749112724 0.141359651862561 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAGCAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.75000000000004 0 31.999999999999996 0.0248727457165764 0 -Inf 0.0248727457165764 0.0163460086933359 0 NA NA 0.0174848248850231 0.154871490345474 856 144 0 0 0.856 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC:AAGCAGTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.4166666666667 0 31.666666666666664 0.02497629341178 0 -Inf 0.02497629341178 0.0174499396508392 0 NA NA 0.0175012390111518 0.153546540412567 855 145 0 0 0.855 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:CAGTACAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.08333333333336 0 32.33333333333333 0.025080706950469 0 -Inf 0.025080706950469 0.0182593812923225 0 NA NA 0.0172546594416137 0.146067944898583 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.91666666666669 0 32.5 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.0179497760536468 0 NA NA 0.0174335988126741 0.149399612331344 861 139 0 0 0.861 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT:AATGTCACG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 0 32.166666666666664 0.0252389746234555 0 -Inf 0.0252389746234555 0.0180736573367067 0 NA NA 0.0184551371376469 0.17144191417124 850 150 0 0 0.85 0.001 N all ss13 272 ACG TCA CGC 2 GTCACGCAA:GTCACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000001 0 32.99999999999999 0.0253456008907939 0 -Inf 0.0253456008907939 0.0179872072274277 0 NA NA 0.0176992658284481 0.152139743007277 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 273 CAA CGC AAG 2 ACGCAAGCT:ACTCAAGCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.91666666666669 0 32.33333333333333 0.0251332418122965 0 -Inf 0.0251332418122965 0.0174255753041254 0 NA NA 0.0180786577731701 0.164463254022431 869 131 0 0 0.869 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.25000000000001 0 32.33333333333333 0.0250283912732922 0 -Inf 0.0250283912732922 0.0172183289654038 0 NA NA 0.0167582572768853 0.135307383934798 859 141 0 0 0.859 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.25000000000001 0 31.999999999999996 0.0247190242145635 0 -Inf 0.0247190242145635 0.0171853703943961 0 NA NA 0.0171858336574591 0.15033839596993 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGTAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 82.41666666666669 0 31.33333333333333 0.0246682051273183 0 -Inf 0.0246682051273183 0.0171685586569779 0 NA NA 0.0174842046547124 0.158278474437411 864 136 0 0 0.864 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGTAGACGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.75000000000001 0 31.999999999999996 0.0248727457165765 0 -Inf 0.0248727457165765 0.0175558587024463 0 NA NA 0.0173956238726931 0.15276646289529 853 147 0 0 0.853 0.001 N all ss13 278 CGA GAC GAG 2 AGACGAGGA:AGACGTGGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.58333333333336 0 31.999999999999996 0.0249244120083241 0 -Inf 0.0249244120083241 0.0179517516644113 0 NA NA 0.0168308630776818 0.138639764935722 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 279 GGA GAG GAC 2 CGAGGACCC:CGTGGTCCA 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.00000000000001 1 32.83333333333333 0.0251069468972921 0.0310925352587596 0.807491145007829 -0.00598558836146751 0.0175806373347686 0.0310048028319429 NA NA 0.0367186540978564 0.870508833752153 439 38 523 0.523 0.439 0.878 N all ss13 280 CCA GAC CAG 2 GGACCCGAA:GGTCCAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.08333333333336 1 32.74999999999999 0.025080706950469 0.0311733183159379 0.804556855201587 -0.00609261136546885 0.0174336248026142 0.0317739810970906 NA NA 0.0351310205635592 0.862317059674038 445 44 511 0.511 0.445 0.89 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA:CCCGAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.08333333333336 1 32.74999999999999 0.025080706950469 0.0311733183159379 0.804556855201587 -0.00609261136546885 0.0172966791094854 0.0322223551643554 NA NA 0.0382886752650862 0.873571916445252 438 55 507 0.507 0.438 0.876 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACA:GAACAAACC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 81.83333333333336 1 32.33333333333333 0.0248469928199095 0.0315836140125951 0.786705182313868 -0.00673662119268564 0.0165841378885899 0.0329578416709071 NA NA 0.0380671171952755 0.859534358810661 409 41 550 0.55 0.409 0.818 N all ss13 283 ACA AAA CAC 2 CAAACACAA:CAAACCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.16666666666669 1 33.166666666666664 0.0253723983888037 0.0307735475083969 0.824487276999201 -0.0054011491195932 0.0170568030148244 0.0329761805189957 NA NA 0.0356727526937161 0.879653680569654 438 59 503 0.503 0.438 0.876 N all ss13 284 CAA CAC AAG 2 ACACAAGGC:ACCCAAGGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.50000000000001 1 33.83333333333333 0.0255888359187695 0.0301548153585304 0.848582079330519 -0.00456597943976081 0.0176194510057156 0.0297158205373911 NA NA 0.0351767610879366 0.896723856569175 449 48 503 0.503 0.449 0.898 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT:CAAGGCAAC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333334 1 34.33333333333333 0.0259766224970673 0.0297068535712844 0.874431970209633 -0.00373023107421712 0.0171172459506137 0.0317123403802324 NA NA 0.0351012627514043 0.915367683926476 466 40 494 0.494 0.466 0.932 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAATTTC:GGCAACTTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000001 1 34.58333333333333 0.0258367851740807 0.0294878275056261 0.876184763667353 -0.00365104233154543 0.0184257205591175 0.0300467491380979 NA NA 0.0335579264502674 0.913362543547001 471 42 487 0.487 0.471 0.942 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000001 1 33.916666666666664 0.0258367851740807 0.0300792190929219 0.858957976743501 -0.00424243391884123 0.0184819843060479 0.0304169372122462 NA NA 0.0355406781481344 0.904983494665897 451 57 492 0.492 0.451 0.902 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.91666666666669 1 33.24999999999999 0.0257812709329177 0.0306948207819131 0.839922510579026 -0.00491354984899539 0.0186546048373117 0.0315224215880378 NA NA 0.0366072505440972 0.893225918140237 438 42 520 0.52 0.438 0.876 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA:GGGGACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000001 1 33.91666666666666 0.0260047718198447 0.0300792190929219 0.864542784156388 -0.00407444727307721 0.0175146612767392 0.0312723114585199 NA NA 0.0373055928667749 0.913029476808168 460 54 486 0.486 0.46 0.92 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GACCAGGAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000001 1 33.41666666666666 0.0258367851740807 0.0305385697640887 0.84603782605638 -0.004701784590008 0.0181458602954755 0.0300598279922668 NA NA 0.0361623722051736 0.896551632536647 488 47 465 0.465 0.488 0.93 N all ss13 291 GAA AAG AAT 2 CAAGACCTA:CAGGAATTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.91666666666669 1 32.249999999999986 0.0254531319881873 0.03166697281676 0.803775344598647 -0.00621384082857276 0.0174113553977256 0.0311278728435479 NA NA 0.0378381176067715 0.869556601608834 433 45 522 0.522 0.433 0.866 N all ss13 292 CTA AAT TAA 2 GAATTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.33333333333336 1 31.83333333333332 0.0125525942666428 0.0320904564039067 0.391162846319463 -0.0195378621372639 0.0121374102125377 0.0345233014847554 NA NA 0.0355288251500492 0.582377129906061 257 133 610 0.61 0.257 0.514 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:TTAATCAGA 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.6666666666667 1 31.499999999999986 0.0121953906538352 0.0324374878453625 0.375965941381579 -0.0202420971915273 0.0121558308555897 0.0325723376955928 NA NA 0.0354866001559418 0.568396102217444 269 117 614 0.614 0.269 0.538 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA:ATCAGATTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.33333333333337 1 32.499999999999986 0.0120970364474127 0.0314182062818701 0.385032688972869 -0.0193211698344574 0.0117356137766332 0.0326633978663455 NA NA 0.0335824888100434 0.565064983830767 249 129 622 0.622 0.249 0.498 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA:AGATTAGGT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.00000000000003 1 32.33333333333332 0.0120002560098308 0.0315836140125951 0.379951958792469 -0.0195833580027643 0.0118480081167376 0.0326620620727658 NA NA 0.035162522286336 0.57756953468742 245 142 613 0.613 0.245 0.49 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT:TTAGGTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333336 1 32.999999999999986 0.0121706524663175 0.0309322189005369 0.393461992023672 -0.0187615664342193 0.0117571086923998 0.0320366815510512 NA NA 0.0349126640916915 0.591001218936312 265 141 594 0.594 0.265 0.53 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT:GGTACTGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.83333333333336 1 32.66666666666666 0.0366671795166179 0.0312545223004261 1.17317996941896 0.00541265721619189 0.0271803910618406 0.0324660020826844 NA NA 0.0417301015714071 0.89679879529344 562 49 389 0.389 0.562 0.778 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.16666666666669 1 32.33333333333332 0.036518369377199 0.0315836140125951 1.15624416390841 0.00493475536460388 0.0275866950215882 0.0321702868855139 NA NA 0.0424948439280509 0.907552699628026 529 55 416 0.416 0.529 0.832 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.16666666666669 1 32.33333333333332 0.036518369377199 0.0315836140125951 1.15624416390841 0.00493475536460388 0.0273094567768497 0.0317326583984728 NA NA 0.0421517041752673 0.906803542076745 526 53 421 0.421 0.526 0.842 N all ss13 300 AAA ACA AAA 2 TACAAAAAT:TACAAACAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.16666666666669 1 31.999999999999986 0.036079100340836 0.031919710814097 1.13030786998553 0.00415938952673898 0.0273462448287018 0.0322385892078386 NA NA 0.0418427282701597 0.920816463997464 546 47 407 0.407 0.546 0.814 N all ss13 301 AAT AAA ATT 2 AAAAATTGG:AAACATTGG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.00000000000001 2 32.16666666666666 0.0485999949201866 0.0649053422482924 0.748782661591546 -0.0163053473281058 0.0290256129168408 0.0469043861450735 NA NA 0.0473321858653421 0.730479679906094 333 12 655 0.655 0.333 0.666 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 AATTGGCCA:CATTGGCCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.83333333333336 2 32.66666666666666 0.0366671795166179 0.0638683562552301 0.574105576947822 -0.0272011767386122 0.0280227481267866 0.0446384451607691 NA NA 0.0447054614494775 0.542887000781597 243 46 711 0.711 0.243 0.486 N all ss13 303 CCA GGC CAC 2 TGGCCACAG:TGGCCGCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.1666666666667 2 32.66666666666666 0.036968468787658 0.0638683562552301 0.578822925079283 -0.0268998874675721 0.0280617851313324 0.0452653711141898 NA NA 0.0453711607491276 0.553258016519836 248 44 708 0.708 0.248 0.496 N all ss13 304 CAA CAC AAA 2 CCACAGATA:CCGCAAATT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.83333333333337 2 31.666666666666657 0.0366671795166179 0.0659765797094679 0.55576053924111 -0.0293094001928499 0.0273877666445294 0.0479289246705015 NA NA 0.0460728750692673 0.52467666831216 224 46 730 0.73 0.224 0.448 N all ss13 305 ATA AAA TAG 2 CAAATTGCA:CAGATAGCG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.4166666666667 2 30.916666666666657 0.0373133940279994 0.0676514664202387 0.551553366134228 -0.0303380723922393 0.0283517297177808 0.0476207576370742 NA NA 0.0464401814937546 0.513580910386115 213 48 739 0.739 0.213 0.426 N all ss13 306 GCA TAG CAC 2 ATAGCGCAG:ATTGCACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.25000000000003 2 30.24999999999999 0.037390920168914 0.0692133441658409 0.540227041758339 -0.0318224239969269 0.0297232338918396 0.0509090839310405 NA NA 0.0480346878825642 0.507658260237965 226 40 734 0.734 0.226 0.452 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT:GCGCAGTTT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.50000000000003 2 30.666666666666657 0.0372747514142044 0.0682288336542951 0.54631963376466 -0.0309540822400907 0.0279206654912748 0.0481009074600737 NA NA 0.0476964394915583 0.51635066746671 228 49 723 0.723 0.228 0.456 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT:CAGTTTGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.6666666666667 2 30.49999999999999 0.037197705854529 0.0686192553184994 0.542088451439384 -0.0314215494639703 0.027674669273658 0.0493598549872366 NA NA 0.0489545266812287 0.520969433875852 227 55 718 0.718 0.227 0.454 N all ss13 309 GCA TTG CAC 2 TTTGCACCT:TTTGCTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.00000000000003 2 31.166666666666654 0.037507815430996 0.0670837952639451 0.559118864450339 -0.0295759798329491 0.0281187046583117 0.0482158324042511 NA NA 0.0497295651409568 0.552019722895334 251 44 705 0.705 0.251 0.502 N all ss13 310 CCA CAC CAA 2 GCACCTAGT:GCTCCAAGT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.6666666666667 2 31.166666666666654 0.037197705854529 0.0670837952639451 0.554496144831587 -0.029886089409416 0.0278436974813313 0.0497652222119884 NA NA 0.0467652154054231 0.522779576189684 222 52 726 0.726 0.222 0.444 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCTAGTGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.00000000000003 2 30.83333333333332 0.0370445664971823 0.0678428326164385 0.546035079440452 -0.0307982661192562 0.0279683601649425 0.0482594328743031 NA NA 0.050230648058735 0.539785793095645 216 53 731 0.731 0.216 0.432 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT:AGTGCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.33333333333336 2 30.83333333333332 0.0373521168628637 0.0678428326164385 0.550568356631577 -0.0304907157535748 0.0292655902352477 0.0498001693463995 NA NA 0.0482202484946242 0.527176602001434 227 37 736 0.736 0.227 0.454 N all ss13 313 TCA CCT CAG 2 GCCTCTGCA:GCTTCAGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.25000000000003 2 30.58333333333332 0.0369305370773724 0.0684234871721279 0.539734798731742 -0.0314929500947555 0.0274970107569325 0.0505629457266012 NA NA 0.050009778542613 0.528867426941121 248 36 716 0.716 0.248 0.496 N all ss13 314 GCA CAG CAT 2 TCAGCTTTC:TCTGCATTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.25000000000003 2 29.583333333333325 0.0364813554167594 0.0708490996895694 0.514916287950096 -0.0343677442728101 0.0276413004430773 0.0507790389700584 NA NA 0.0491402730262698 0.484314327475644 230 51 719 0.719 0.23 0.46 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT:GCTTTCTTT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.25000000000003 2 29.24999999999999 0.0360429712153345 0.071696340510766 0.502717027934253 -0.0356533692954315 0.0275004109613812 0.0501528766826665 NA NA 0.0528911363183251 0.500254298493725 205 52 743 0.743 0.205 0.41 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA:TTCTTTGGC 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.58333333333336 2 29.24999999999999 0.0363340470169451 0.071696340510766 0.506776869755146 -0.0353622934938209 0.0265905961217039 0.0529968260640482 NA NA 0.0517544085160756 0.494435529646237 196 51 753 0.753 0.196 0.392 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG:TTTGGCATG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.91666666666669 2 28.41666666666666 0.03618792369855 0.0739059002893285 0.489648641811826 -0.0377179765907786 0.0271977218559326 0.0504467777102751 NA NA 0.0523523712745049 0.471239618634928 216 43 741 0.741 0.216 0.432 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGCATGTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.50000000000003 2 28.833333333333325 0.0363707624539579 0.0727843418621032 0.499705864248463 -0.0364135794081454 0.0281575386230453 0.0546973085531422 NA NA 0.0518789421174002 0.482744535146158 197 52 751 0.751 0.197 0.394 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCCCGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.08333333333337 2 28.916666666666657 0.0365554585374873 0.0725641058409196 0.503767780417868 -0.0360086473034323 0.0278916172226321 0.0515894346518845 NA NA 0.0511433489614274 0.481387360170309 207 56 737 0.737 0.207 0.414 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCCCGTATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.9166666666667 2 29.083333333333325 0.0366298633763431 0.0721276112438599 0.507848003623734 -0.0354977478675169 0.0264179597040714 0.0511023234948306 NA NA 0.0506802482546944 0.483661497128565 216 51 733 0.733 0.216 0.432 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC:CGTATTGGT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.25000000000004 2 29.416666666666657 0.0364813554167594 0.0712702003524607 0.511873900120162 -0.0347888449357013 0.0286021643505405 0.0506212736597351 NA NA 0.0509800315429732 0.494985170272077 218 54 728 0.728 0.218 0.436 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG:ATTGGTATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.9166666666667 2 28.91666666666666 0.03618792369855 0.0725641058409196 0.498702812901516 -0.0363761821423697 0.0267924332182178 0.0518016669542709 NA NA 0.0490524315055739 0.458343327667169 198 55 747 0.747 0.198 0.396 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA:GGTATGGAA 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.58333333333336 2 28.91666666666666 0.0358991755485359 0.0725641058409196 0.494723598293028 -0.0366649302923838 0.0266670017572656 0.0507493622633734 NA NA 0.0520209786466775 0.480928193403247 204 52 744 0.744 0.204 0.408 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.25000000000003 2 28.91666666666666 0.0360429712153345 0.0725641058409196 0.496705234601119 -0.0365211346255852 0.0255620521752196 0.0529469121197777 NA NA 0.0510767282717545 0.474593631911245 196 50 754 0.754 0.196 0.392 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.25000000000003 2 29.91666666666666 0.0364813554167594 0.070021663193269107 0.521000983882173 -0.0335403077765097 0.0269285822947738 0.0515238022087844 NA NA 0.0496624209551621 0.499443297285273 213 60 727 0.727 0.213 0.426 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.50000000000003 2 30.33333333333333 0.0363707624539579 0.0690141740401891 0.527004241661692 -0.0326434115862312 0.0277014684692507 0.0510110008792376 NA NA 0.0475170195033855 0.49209308350287 220 40 740 0.74 0.22 0.44 N all ss13 327 CCT CAC CTA 2 ACACCTACA:ACACCTTCG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.25000000000003 2 30.249999999999996 0.0360429712153345 0.0692133441658409 0.520751766147472 -0.0331703729505065 0.0269453532695192 0.0495239436812204 NA NA 0.0492594492104598 0.500704987551718 226 52 722 0.722 0.226 0.452 N all ss13 328 ACA CTA CAG 2 CCTACAGGG:CCTTCGGGA 1:1 TRUE 1 1 1 0 0 1 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.08333333333336 3 30.41666666666666 0.0361153019839953 0.105746684778908 0.341526564728758 -0.0696313827949128 0.0271528686485688 0.0604944131391045 NA NA 0.0644462404740894 0.279938786213687 110 20 870 0.87 0.11 0.22 N all ss13 329 GGA CAG GAA 2 ACAGGGACA:TCGGGAACA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.75000000000003 2 30.41666666666666 0.0358277072015149 0.0688161477015357 0.520629363865356 -0.0329884405000208 0.0266241996135525 0.0532162610532442 NA NA 0.0487788413521508 0.498859170811716 212 38 750 0.75 0.212 0.424 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG:GGGACATGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 87.08333333333337 2 29.749999999999996 0.0352660458278048 0.0704329495874262 0.500703804602562 -0.0351669037596215 0.0268445929843137 0.0533258483562897 NA NA 0.0524517075376899 0.502562994369215 239 35 726 0.726 0.239 0.478 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTC:ACATGGCTG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.41666666666671 2 29.41666666666666 0.0472132254181562 0.0712702003524607 0.662453945473245 -0.0240569749343045 0.0282508409731508 0.0528258152861483 NA NA 0.0530165271529093 0.649998921160812 325 11 664 0.664 0.325 0.65 N all ss13 332 CTC GGC TCA 2 TGGCTCACT:TGGCTGACT 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.41666666666671 2 30.08333333333333 0.0477773445326416 0.0696151556756318 0.686306653615165 -0.0218378111429902 0.0302046302498152 0.04990114301665 NA NA 0.0517435527610447 0.672996355391574 353 17 630 0.63 0.353 0.706 N all ss13 333 ACT TCA CTT 2 CTCACTTAT:CTGACTTAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.08333333333337 2 29.58333333333333 0.0473997786251612 0.0708490996895694 0.669024431260903 -0.0234493210644082 0.02952925710831 0.0531046829152756 NA NA 0.0521650238281942 0.653055207453088 321 15 664 0.664 0.321 0.642 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.41666666666671 2 29.249999999999996 0.0472132254181562 0.071696340510766 0.658516530715632 -0.0244831150926097 0.028477569749168 0.0547391739346125 NA NA 0.0525041463636191 0.640994894999239 288 18 694 0.694 0.288 0.576 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.91666666666671 2 28.749999999999996 0.0469361336851341 0.073005919868405 0.642908599326434 -0.0260697861832708 0.0282478195572261 0.0542160261458013 NA NA 0.0541654483783854 0.630303875913178 296 17 687 0.687 0.296 0.592 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.08333333333337 2 29.58333333333333 0.0473997786251612 0.0708490996895694 0.669024431260903 -0.0234493210644082 0.0301871893224603 0.0532481236284983 NA NA 0.0504936265186542 0.642360042284483 331 22 647 0.647 0.331 0.662 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATA:GGAGCCATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.75000000000004 2 30.08333333333333 0.0475878124291396 0.0696151556756318 0.68358408405883 -0.0220273432464922 0.0301576655552158 0.0507508150253722 NA NA 0.0505964870151548 0.663306064589139 355 12 633 0.633 0.355 0.71 N all ss13 338 ATA CCA TAA 2 GCCATAAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.50000000000004 2 29.999999999999996 0.0471668164117002 0.069817817299509 0.675569908027358 -0.0226510008878088 0.0287455408382996 0.0511318420973697 NA NA 0.0525270167643071 0.666304250616857 341 15 644 0.644 0.341 0.682 N all ss13 339 AAA TAA AAT 2 ATAAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.50000000000006 2 29.666666666666664 0.0466169441178151 0.0706404112947758 0.659918922658689 -0.0240234671769607 0.0293434432835101 0.0537354970949852 NA NA 0.0506592701190142 0.635345452213912 306 23 671 0.671 0.306 0.612 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.50000000000006 2 29.666666666666664 0.0466169441178151 0.0706404112947758 0.659918922658689 -0.0240234671769607 0.029328011256251 0.0528141318061478 NA NA 0.0536729510184337 0.654449242108576 320 18 662 0.662 0.32 0.64 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.50000000000006 2 29.666666666666664 0.0466169441178151 0.0706404112947758 0.659918922658689 -0.0240234671769607 0.0285292647902169 0.0526115305345807 NA NA 0.0524859194456004 0.647158927280246 344 28 628 0.628 0.344 0.688 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.50000000000006 2 30 0.0471668164117002 0.069817817299509 0.675569908027358 -0.0226510008878088 0.0289834830734918 0.0510054083188294 NA NA 0.0511176639013458 0.65768259498429 322 16 662 0.662 0.322 0.644 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.83333333333339 2 31 0.0481126852583725 0.0674611774972046 0.713190712693477 -0.0193484922388321 0.030479309886815 0.0491288836605631 NA NA 0.0499266763643093 0.698357840885486 338 20 642 0.642 0.338 0.676 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.83333333333337 2 31.33333333333333 0.0486986442466362 0.0667106145123721 0.729998435820203 -0.018011970265736 0.0315305630695598 0.0479283799024025 NA NA 0.0501761939228685 0.719614223203702 353 16 631 0.631 0.353 0.706 N all ss13 345 CCA ATC CAA 2 GATCCAAAC:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.16666666666671 2 31.33333333333333 0.0490972805875701 0.0667106145123721 0.735974041709128 -0.017613333924802 0.0289002403607967 0.04978941182639 NA NA 0.0482657296979837 0.71516797179247 389 12 599 0.599 0.389 0.778 N all ss13 346 AAC CAA AAT 2 CCAAACTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.16666666666671 2 31.16666666666666 0.0490972805875701 0.0670837952639451 0.731879888345524 -0.017986514676375 0.0317792837211333 0.0509766053742947 NA NA 0.0486701126519442 0.711710545714083 376 11 613 0.613 0.376 0.752 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AACTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.58333333333339 2 31.16666666666666 0.036779585610904 0.0670837952639451 0.548263339398025 -0.0303042096530411 0.0210238593019388 0.0478524080636797 NA NA 0.0442891986500417 0.493826929620534 229 12 759 0.759 0.229 0.458 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.25000000000006 2 31.499999999999993 0.0369305370773723 0.0663415654213976 0.55667268088704 -0.0294110283440252 0.021678116940557 0.047292869685877 NA NA 0.0458252990149081 0.520998069583508 272 22 706 0.706 0.272 0.544 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGACCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.41666666666671 2 31.666666666666664 0.0373133940279994 0.0659765797094679 0.565555143845154 -0.0286631856814685 0.022616311068 0.0473213471024474 NA NA 0.0446994188444585 0.521364870745709 278 28 694 0.694 0.278 0.556 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC:GACCAGGTT 1:1 TRUE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.08333333333339 2 32.33333333333333 0.0379427585051849 0.0645559565784323 0.587749922953838 -0.0266131980732474 0.0221212750837226 0.0474365276781434 NA NA 0.0424426552099328 0.530633701937125 264 13 723 0.723 0.264 0.528 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA:CAGGTTATT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.25000000000006 1 32.166666666666664 0.037862929073994 0.0317507728699206 1.19250417081544 0.0061121562040734 0.0220007371350444 0.0346571423384804 NA NA 0.0402980823054058 0.879444361049574 557 15 428 0.428 0.557 0.856 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTTATTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.41666666666671 1 31.83333333333333 0.0501754455827152 0.0320904564039067 1.5635628534285 0.0180849891788084 0.0250844465721184 0.0344216342253572 NA NA 0.0408190238572309 0.657727431530999 693 3 304 0.304 0.693 0.608 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATTTTGTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.41666666666671 1 31.16666666666666 0.0495536228075988 0.0327921082603737 1.51114476733659 0.0167615145472251 0.0244012776700154 0.0351184023275147 NA NA 0.0448540200848189 0.708634704263474 660 6 334 0.334 0.66 0.668 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGTTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.41666666666671 1 31.16666666666666 0.0489470292290666 0.0327921082603737 1.49264660998374 0.016154920968693 0.0243988266790932 0.0336668020070381 NA NA 0.0440292896855466 0.71368387683835 663 4 333 0.333 0.663 0.666 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:TTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.91666666666671 1 31.83333333333333 0.0480644914227491 0.0320904564039067 1.49778148424519 0.0159740350188424 0.0242355941659 0.03311296929925 NA NA 0.0418970725247598 0.703004006804597 675 5 320 0.32 0.675 0.64 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.58333333333339 1 32.49999999999999 0.0482578485978244 0.0314182062818701 1.5359835684086 0.0168396423159543 0.023785667593752 0.0313970944935977 NA NA 0.0406693859266801 0.678828790688783 698 4 298 0.298 0.698 0.596 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.33333333333339 1 32.49999999999999 0.0610092295904643 0.0314182062818701 1.94184317981481 0.0295910233085942 0.0280458856199799 0.0320074932107085 NA NA 0.0456876837649352 0.517191598617565 776 2 222 0.222 0.776 0.444 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC:CACATTGAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.66666666666671 1 32.166666666666664 0.0607619578200664 0.0317507728699206 1.91371586666572 0.0290111849501458 0.0277646381224279 0.0326806894934681 NA NA 0.0411596472519316 0.480906498377724 792 2 206 0.206 0.792 0.412 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA:ATTGATGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.16666666666671 1 31.166666666666664 0.0603947877150659 0.0327921082603737 1.84174763133627 0.0276026794546922 0.027569847858824 0.0349052663988435 NA NA 0.0433143154590903 0.523952512274047 753 0 247 0.247 0.753 0.494 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC:GATGCTTAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.33333333333339 1 31 0.0602733823260203 0.032972342565837 1.82799818380117 0.0273010397601832 0.0270763417487249 0.0351126647238686 NA NA 0.0435040652871898 0.530297814123705 735 0 265 0.265 0.735 0.53 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA:GCTTATAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.16666666666671 2 30.833333333333332 0.0596736078092626 0.0678428326164385 0.879586030062129 -0.00816922480717586 0.0273414447466728 0.0522426917466923 NaN NaN 0.0622927856245959 0.895662668078484 486 1 513 0.513 0.486 0.972 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA:TATAAAACA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.16666666666671 2 30.833333333333332 0.0596736078092626 0.0678428326164385 0.879586030062129 -0.00816922480717586 0.0269608769775387 0.0508384470140415 NaN NaN 0.0598468347472808 0.891424282825044 467 0 533 0.533 0.467 0.934 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC:AAAACATTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.25000000000006 2 31.083333333333332 0.0610713624886267 0.0672719567702241 0.907827948237386 -0.00620059428159743 0.0264255396254181 0.0526022167299922 NaN NaN 0.0584789205265143 0.915557541204427 471 1 528 0.528 0.471 0.942 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA:ACATTTCCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.25000000000006 2 30.75 0.0739059002893284 0.0680352852661241 1.08628779904782 0.0058706150232043 0.0294120339630362 0.0542786378740496 NaN NaN 0.060320977982276 0.922469937641061 568 1 431 0.431 0.568 0.862 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA:TTTCCACCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.41666666666671 2 30.916666666666668 0.0746730239941638 0.0676514664202386 1.10379017551975 0.00702155757392521 0.0311859241929983 0.05078802372416 NA NA 0.0628732494000999 0.911078738435331 560 0 440 0.44 0.56 0.88 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA:CCACCTACT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.75000000000006 2 30.583333333333332 0.0743642698449398 0.0684234871721278 1.08682373433946 0.00594078267281199 0.0304066579731125 0.0513900608760781 NaN NaN 0.0625647511565676 0.924351246482666 535 0 465 0.465 0.535 0.93 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG:CCTACTGAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.5833333333334 2 31.750000000000004 0.0754562533850991 0.0657955896932053 1.14682843845522 0.00966066369189378 0.0309102024480938 0.0494674146958508 NA NA 0.0601791234711798 0.872462164786883 581 0 419 0.419 0.581 0.838 N all ss13 368 GAA CAG AAC 2 ACAGAGCCT:ACTGAACCT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.41666666666673 2 30.91666666666667 0.0765808130596597 0.0676514664202386 1.13199043733884 0.0089293466394211 0.0304933885381512 0.052455878596513 NaN NaN 0.0658242663185089 0.892094554524446 573 0 427 0.427 0.573 0.854 N all ss13 369 CCT AAC CTA 2 GAACCTAAA:GAGCCTAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.16666666666673 2 31.16666666666667 0.0768261689073373 0.0670837952639451 1.1452269300665 0.00974237364339224 0.0312386961568183 0.0530230087595858 NaN NaN 0.0605710284209582 0.872217736851035 582 0 418 0.418 0.582 0.836 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.00000000000006 2 31.333333333333336 0.0779922851430357 0.0667106145123721 1.16911357679926 0.0112816706306636 0.0303941385053315 0.0517929560739112 NaN NaN 0.0654564985283286 0.863159458394693 580 0 420 0.42 0.58 0.84 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.00000000000006 2 30.666666666666668 0.0779922851430357 0.068228833654295 1.14309861338405 0.00976345148874076 0.0326287049589769 0.0521426076208872 NaN NaN 0.0637032373520462 0.878189612233881 578 0 422 0.422 0.578 0.844 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.00000000000006 2 30.666666666666668 0.0779922851430357 0.068228833654295 1.14309861338405 0.00976345148874076 0.0327059310268679 0.0547577868107171 NaN NaN 0.065481458926874 0.881472726006336 563 0 437 0.437 0.563 0.874 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 80.3333333333334 2 30.666666666666668 0.0786746849626465 0.068228833654295 1.15310024734233 0.0104458513083515 0.0327018694273567 0.0550726943429346 NaN NaN 0.0636699893199939 0.869682020483234 607 1 392 0.392 0.607 0.784 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA:AAAAAGAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG:AAGAAGAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAGAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT:GATGAAGTA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG:GAAGTACAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT:GTACAGCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTC 2 CAGCCTCTG:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 CTG CTC TGC 2 CCTCTGCCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TGC CGC 2 CTGCCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAG:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AAC AGC 2 AAACAGCCA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCA AGC CAA 2 CAGCCAACT:CAGCCCACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CAA CTG 2 CCAACTGTT:CCCACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT:ACTGTTACA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACA TGA CAC 2 GTGACTCTT:GTTACACTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTG CAC TGT 2 ACACTGTTA:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.5 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TGT TAC 2 CTGTTACCT:CTTCTTCCT 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0.25 1 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TAC CTG 2 CTTCCTGCG:TTACCTGCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCA CTG CAG 2 CCTGCAGCT:CCTGCGGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CAG CTG 2 GCAGCTGAA:GCGGCTGAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAA CTG AAT 2 GCTGAATTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG AAT TGG 2 GAATTGGAT:GACATGGAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.5 0.166666666666667 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC:GATGATTTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC:GATTTTTCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA:TTTTCCAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAACTT:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA:CAACTTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT:CTTCAGGAT 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC:CAGGATTCC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG:GATTCCATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAAT:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AAT TGA ATG 2 ATGAATGGA:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA ATG GAG 2 AATGGAGCC:AGTGGAGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTCA:GGAGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCA CCT CA- 1 GCCTCA---:GCTTCTGCT 1:1 FALSE 0.333333333333333 0.5 1.66666666666667 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 --- CTG CTG 1 TCA---GAC:TCTGCTGAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAC --G ACT 1 ---GACTCA:GCTGATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ACT CAA 2 GACTCAACA:GATTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACA CAA CAC 2 TCAACACAG:TCAACTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CAC AGG 2 ACACAGGCC:ACTCAGGCA 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCCTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY352407.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666673 2 33.49999999999999 0 0.0622118122355632 0 -0.0622118122355632 0 0.0478440044565652 NA NA 0.0481940083954766 0.19675154737147801 0 137 863 0.863 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000006 2 33.66666666666666 0 0.0618907677660027 0 -0.0618907677660027 0 0.0460959930338063 NA NA 0.0467975482685079 0.185994526161204 0 126 874 0.874 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333339 2 33.66666666666666 0 0.0618907677660027 0 -0.0618907677660027 0 0.0457332684005946 NA NA 0.0458113141331655 0.176697653704227 0 116 884 0.884 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333339 2 33.99999999999999 0 0.0612585232607004 0 -0.0612585232607004 0 0.0467619976717387 NA NA 0.0470915717576649 0.193313786505474 0 136 864 0.864 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 2 34.99999999999999 0 0.0594370287406054 0 -0.0594370287406054 0 0.0452645737911957 NA NA 0.0454041109496021 0.190511615841136 0 133 867 0.867 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAC 2 CCCCAACCA:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 2 34.99999999999999 0 0.0594370287406054 0 -0.0594370287406054 0 0.0443371559319006 NA NA 0.0464308684880476 0.200503349490686 0 142 858 0.858 0 0.001 N all ss13 8 CCA AAC CAA 2 CAACCAAAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666671 2 34.99999999999999 0 0.0594370287406054 0 -0.0594370287406054 0 0.044218297665119 NA NA 0.0471710836113636 0.207658171138672 0 145 855 0.855 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 CCAAACCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000004 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0287900983781222 NA NA 0.0300621063886554 0.341843850871389 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 1 36.33333333333333 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0289259488888055 NA NA 0.0285760069203627 0.326461842671848 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000004 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0305321292629894 NA NA 0.0298591576499199 0.338572819764433 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333337 1 35.33333333333333 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0298260248434144 NA NA 0.029939376803804 0.335244377093492 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000004 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0295135169693507 NA NA 0.0299750650875179 0.340443919284079 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 1 35.49999999999999 0 0.0287116399282627 0 -0.0287116399282627 0 0.0301904485346526 NA NA 0.0289463050415653 0.321249680654578 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0314114610578136 NA NA 0.0319330603126641 0.361654587092422 0 377 623 0.623 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0299125452658968 NA NA 0.0311258210644113 0.344632076214382 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 1 33.83333333333333 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0320564560729478 NA NA 0.0315154488758702 0.338654854902845 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000003 1 33.83333333333333 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0324452155793654 NA NA 0.0313203121144787 0.335654008967301 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.1666666666667 1 34.16666666666666 0 0.0298546878003148 0 -0.0298546878003148 0 0.0303098475495468 NA NA 0.0297454511100009 0.315536552796807 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 1 34.33333333333333 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.0321993570140219 NA NA 0.0318292135886548 0.350654578119739 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.1666666666667 1 33.66666666666666 0 0.0303071537534075 0 -0.0303071537534075 0 0.0308694116993798 NA NA 0.030913312851638 0.326892830523777 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333336 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0289810855033383 NA NA 0.0320518900362182 0.358751189278714 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATC 2 ACAGATCCA:ACAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000003 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.03181546076779 NA NA 0.0298169434056132 0.314284008827162 0 386 614 0.614 0 0.001 N all ss13 24 CCA ATC CAA 2 GATCCAACT:GATTCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0305186828932165 NA NA 0.032532782938335 0.365899259649595 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 CCAACTGAC:TCAACTGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000004 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000004 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666673 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.66666666666673 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.8333333333334 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000007 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.8333333333334 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666673 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000004 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333339 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 37.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 37.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 37.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 37.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 38.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TACTTTTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 37.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC:TTTTATTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333339 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACC:CTAGGAACT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.83333333333339 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 116 ACC GAA CCG 2 GGAACCGGC:GGAACTGGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 117 GGC CCG GCC 2 ACCGGCCCA:ACTGGCCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.83333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333339 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.58333333333339 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666671 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333339 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333339 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666673 0 34.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.0833333333334 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 TTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000007 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000007 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 0 35.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 1 35.58333333333333 0 0.0286430990492925 0 -0.0286430990492925 0 0.0292091282776055 NA NA 0.028103084983518 0.30810068253793 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 35.91666666666666 0 0.0283721774047871 0 -0.0283721774047871 0 0.0297592783030093 NA NA 0.0275452039780428 0.302999485496901 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666674 1 35.58333333333333 0 0.0286430990492925 0 -0.0286430990492925 0 0.0280499370821112 NA NA 0.0293752630174107 0.329522814311441 0 386 614 0.614 0 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.5833333333334 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0297039129584936 NA NA 0.0290591331079527 0.310223828939223 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 1 34.916666666666664 0 0.0292007684815911 0 -0.0292007684815911 0 0.0288605773229878 NA NA 0.0290820272843389 0.315338620717155 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.91666666666674 1 34.25 0 0.0297805871963345 0 -0.0297805871963345 0 0.0297700777959532 NA NA 0.0298474550905945 0.318395906737895 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0310010145746484 NA NA 0.0310081056016794 0.341618797677907 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666673 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0292787847053215 NA NA 0.0298886009186964 0.323843137546629 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0299890941981613 NA NA 0.0301744366143213 0.328447707449634 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0295279072778091 NA NA 0.0292156206550599 0.312822549086147 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0303410858701372 NA NA 0.0299078221421291 0.324154199172243 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.5833333333334 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0300388155146274 NA NA 0.0298322396004168 0.322929844494661 0 339 661 0.661 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.0292495753804878 NA NA 0.0282517259418804 0.296599619560711 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 1 34.41666666666666 0 0.0296334842053817 0 -0.0296334842053817 0 0.0303546277056977 NA NA 0.0280033010335531 0.289957906212374 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0312185384923303 NA NA 0.0301868824089015 0.331018476176954 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0297073873987785 NA NA 0.0313216271919909 0.348836880712671 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.5833333333334 1 35.24999999999999 0 0.0289192452027623 0 -0.0289192452027623 0 0.0290315475939657 NA NA 0.0293955723906858 0.325215848773311 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 35.58333333333332 0 0.0286430990492925 0 -0.0286430990492925 0 0.0289528678468701 NA NA 0.0288538484708668 0.320858140260348 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 35.58333333333332 0 0.0286430990492925 0 -0.0286430990492925 0 0.0299036934314663 NA NA 0.0290542608492244 0.324207469134421 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.5833333333334 1 36.24999999999999 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0273507668968887 NA NA 0.029193011411894 0.335659902291771 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666673 1 36.24999999999999 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.028739437091896 NA NA 0.0282835249968804 0.32035181811373 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 1 36.08333333333332 0 0.0282386296527663 0 -0.0282386296527663 0 0.027787760453472 NA NA 0.0292025427787569 0.333547957498441 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 1 36.74999999999999 0 0.0277167798918218 0 -0.0277167798918218 0 0.0271337806829724 NA NA 0.0290909548974099 0.340710262013405 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 1 37.41666666666666 0 0.0272138698048234 0 -0.0272138698048234 0 0.0276774093621154 NA NA 0.0283867980858547 0.337719724543254 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666673 1 38.08333333333332 0 0.0267288865855191 0 -0.0267288865855191 0 0.0263175662672769 NA NA 0.0273921874264817 0.329171001890411 0 336 664 0.664 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666673 1 38.58333333333332 0 0.0263763446044989 0 -0.0263763446044989 0 0.0271460437228894 NA NA 0.0268971797606522 0.326772241207533 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 1 39.08333333333332 0 0.026032982222434 0 -0.026032982222434 0 0.0249812106023017 NA NA 0.0269660834730582 0.334345889596696 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 1 39.74999999999999 0 0.0255888359187695 0 -0.0255888359187695 0 0.0267524118815966 NA NA 0.0264251461664816 0.332868739462029 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 1 39.41666666666666 0 0.0258089981982962 0 -0.0258089981982962 0 0.0267789550311365 NA NA 0.0263418589986008 0.327199007669534 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 1 38.41666666666666 0 0.0264928206228063 0 -0.0264928206228063 0 0.0274946398880724 NA NA 0.0279810810401136 0.343734634669443 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 1 37.41666666666666 0 0.0272138698048234 0 -0.0272138698048234 0 0.0267769013092048 NA NA 0.0272647792713334 0.318214978877615 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.08333333333339 1 36.74999999999999 0 0.0277167798918218 0 -0.0277167798918218 0 0.028586313489653 NA NA 0.0276350293886353 0.315881019973793 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.16666666666673 1 36.33333333333332 0 0.0280406490537152 0 -0.0280406490537152 0 0.0268943279002176 NA NA 0.0288652585190899 0.331332971569381 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.8333333333334 1 36.16666666666666 0 0.0281723261817365 0 -0.0281723261817365 0 0.0283695029542017 NA NA 0.0281422215322981 0.3167930968529 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.8333333333334 1 35.66666666666666 0 0.0285748846742028 0 -0.0285748846742028 0 0.0296021389735943 NA NA 0.0294005623215271 0.331092208214815 0 383 617 0.617 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.8333333333334 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0296193831907186 NA NA 0.0297726581728163 0.332545107876943 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.50000000000007 1 35.33333333333332 0 0.028849710620847 0 -0.028849710620847 0 0.0295686991321415 NA NA 0.0286856553638955 0.314550727353675 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.16666666666673 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0288132599283491 NA NA 0.0292701736173424 0.319635709070455 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.16666666666673 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0290454492834906 NA NA 0.0300289768169259 0.332017154396507 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.83333333333339 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0318978116108372 NA NA 0.0294543247202476 0.322670652555363 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000006 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0303883887120163 NA NA 0.0299869591410154 0.331340116949043 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666673 1 34.33333333333332 0 0.0297068535712844 0 -0.0297068535712844 0 0.0309130258863588 NA NA 0.0297699763889429 0.31833772177147 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0293577836646243 NA NA 0.0298632776876971 0.315035427100217 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0305073269780058 NA NA 0.0310110969985907 0.333281821613024 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666673 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0307851766752837 NA NA 0.0319542304246041 0.347747156069424 0 394 606 0.606 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666673 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0303633643537082 NA NA 0.0314217525809545 0.339638419425592 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666673 1 34.66666666666666 0 0.029415534864961 0 -0.029415534864961 0 0.0300381423476291 NA NA 0.0304159315176375 0.333489320836146 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGC:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 1 33.66666666666666 0 0.0303071537534075 0 -0.0303071537534075 0 0.0315100090749684 NA NA 0.0298349716549961 0.309712031614275 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 193 GGC GCG GCG 2 CGCGGCGAT:CGCGGTAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.8333333333334 1 32.66666666666666 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.031945758590225 NA NA 0.0309711782440566 0.312903355461348 0 384 616 0.616 0 0.001 N all ss13 194 AAT GCG ATT 2 GGCGATTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000007 1 31.666666666666657 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0326365973764027 NA NA 0.0333811420115595 0.333791573869514 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:GATTCAAGA 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000007 0 30.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.50000000000007 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000007 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAC:AGGGGAAAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000006 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAC GAA ACT 2 GGAAACTCT:GGAAATTCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.49999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ACT CTC 2 AACTCTCCT:AATTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.3333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 35.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666674 0 36.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666674 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000009 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000007 0 36.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.3333333333334 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 37.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666673 0 36.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.8333333333334 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666673 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.8333333333334 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.8333333333334 0 34.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCC:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666673 0 33.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCCAAA:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000006 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000006 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333339 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.41666666666671 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000004 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.1666666666667 0 33.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.1666666666667 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGGAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGGAGGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT:AGGCGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333337 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000004 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 32.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000004 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000004 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.6666666666667 0 30.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333337 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.16666666666671 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.16666666666671 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 28.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA:TTTGCTCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT:GCTCCGAGT 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCGAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666671 0 29.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333339 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.0833333333334 0 27.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000007 0 26.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666673 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.75000000000007 0 29.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.41666666666674 0 30.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666674 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000007 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666674 0 30.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333341 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 31.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417143.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.41666666666673 1 33.24999999999999 0 0.0306948207819131 0 -0.0306948207819131 0 0.0321407072817419 NA NA 0.0316108908119185 0.331538105224674 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.25000000000006 1 33.41666666666666 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0323540338269072 NA NA 0.0332253915138906 0.358025758733786 0 328 672 0.672 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.58333333333339 1 33.41666666666666 0 0.0305385697640887 0 -0.0305385697640887 0 0.0316659058078823 NA NA 0.032430014958859 0.346358498801771 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.58333333333339 1 33.74999999999999 0 0.0302307926160697 0 -0.0302307926160697 0 0.0318499843717794 NA NA 0.0324525484004813 0.351575168849921 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333339 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0298159879480839 NA NA 0.0328631445369792 0.371909193384391 0 378 622 0.622 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAC 2 CCCCAACCA:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.58333333333339 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0289486283936543 NA NA 0.0280033434936425 0.294702910478958 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 8 CCA AAC CAA 2 CAACCAAAT:CAATCAAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.91666666666671 1 34.74999999999999 0 0.0293435958691742 0 -0.0293435958691742 0 0.0307418418507414 NA NA 0.032831109072897303 0.371442754671473 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 CCAAATCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 35.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AATCAGCGT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.58333333333339 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.4166666666667 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333336 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333336 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666669 0 36.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000001 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000001 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000001 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000001 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333336 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000001 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000001 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666669 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.58333333333336 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000003 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.4166666666667 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.75000000000004 0 32.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.75000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.41666666666671 0 32.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.08333333333337 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000004 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000004 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333337 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000004 0 32.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333337 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333337 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000004 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000004 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666671 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666671 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 32.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.91666666666671 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000004 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000004 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333339 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.75000000000006 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.8333333333334 1 34.24999999999999 0 0.0297805871963345 0 -0.0297805871963345 0 0.0315717010607649 NA NA 0.0300692639391071 0.321978837332982 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666673 1 35.24999999999999 0 0.0289192452027623 0 -0.0289192452027623 0 0.030693644507949 NA NA 0.0309768829851975 0.350523138338505 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 1 35.416666666666664 0 0.0287805096612113 0 -0.0287805096612113 0 0.0301553788704259 NA NA 0.0313644784687895 0.358820566401251 0 388 612 0.612 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 1 35.416666666666664 0 0.0287805096612113 0 -0.0287805096612113 0 0.0280769819084342 NA NA 0.0292548400721798 0.325220617136421 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000004 1 35.75 0 0.0285069944752381 0 -0.0285069944752381 0 0.0281764106696523 NA NA 0.0288584202273239 0.323239625887329 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333337 1 36.08333333333333 0 0.0282386296527663 0 -0.0282386296527663 0 0.0298248191974758 NA NA 0.0284042969315483 0.320141314271944 0 319 681 0.681 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA:TACCGACGA 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 1 35.58333333333333 0 0.0286430990492925 0 -0.0286430990492925 0 0.0278088675694662 NA NA 0.0297276419370352 0.335287956988832 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT:CGACGAGCT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.16666666666667 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 1 35.416666666666664 0 0.0287805096612113 0 -0.0287805096612113 0 0.0281842038743782 NA NA 0.0289718048614479 0.320516428385371 0 410 590 0.59 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC:CGAGCTACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 1 35.83333333333333 0 0.0284394261467203 0 -0.0284394261467203 0 0.0284204758488498 NA NA 0.0299509020917825 0.342348642032038 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.75000000000006 1 35.166666666666664 0 0.0289891158257093 0 -0.0289891158257093 0 0.0316085455872826 NA NA 0.0301337315880147 0.336041835247667 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 1 34.83333333333333 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0301747552344832 NA NA 0.0301317956999973 0.331316393711644 0 377 623 0.623 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 1 34.916666666666664 0 0.0292007684815911 0 -0.0292007684815911 0 0.0305593667731742 NA NA 0.029273537558679 0.318514999905583 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666673 1 35.916666666666664 0 0.0283721774047871 0 -0.0283721774047871 0 0.0286134486602816 NA NA 0.0292653419239571 0.332305520515978 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 1 35.916666666666664 0 0.0283721774047871 0 -0.0283721774047871 0 0.0277130051029946 NA NA 0.0304012907481785 0.350687970076386 0 353 647 0.647 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 1 36.416666666666664 0 0.0279752710599065 0 -0.0279752710599065 0 0.0273052122463811 NA NA 0.02990054292369 0.349473608905516 0 368 632 0.632 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333337 1 36.58333333333333 0 0.02784542552167 0 -0.02784542552167 0 0.0291316437098704 NA NA 0.027911746205407 0.318461760032208 0 376 624 0.624 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 1 36.25 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0293505100823323 NA NA 0.0296260013983996 0.342770709498176 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 1 36.25 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0289454909443946 NA NA 0.0286239970678175 0.326141703058491 0 392 608 0.608 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 1 36.25 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0270083420640759 NA NA 0.0288509091267481 0.329961069647502 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 1 36.25 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0283283019101261 NA NA 0.0287706112170915 0.328613098499534 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333337 1 36.916666666666664 0 0.0275893176123833 0 -0.0275893176123833 0 0.028557399435277 NA NA 0.0282952123050174 0.329534216621528 0 342 658 0.658 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333337 1 37.916666666666664 0 0.0268485044068343 0 -0.0268485044068343 0 0.0276454951733122 NA NA 0.0258359701686126 0.298715974162206 0 343 657 0.657 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.6666666666667 1 38.083333333333336 0 0.0267288865855191 0 -0.0267288865855191 0 0.0270509818926966 NA NA 0.0265143463089621 0.31341054792971 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.6666666666667 1 38.75 0 0.0262608883838265 0 -0.0262608883838265 0 0.0264842735586014 NA NA 0.0271905716716845 0.334139956544631 0 391 609 0.609 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.6666666666667 1 38.083333333333336 0 0.0267288865855191 0 -0.0267288865855191 0 0.0274393762512522 NA NA 0.0262043008833696 0.307719417191527 0 337 663 0.663 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.6666666666667 1 38.083333333333336 0 0.0267288865855191 0 -0.0267288865855191 0 0.0276205965419933 NA NA 0.0266358139447422 0.315622441749269 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000003 1 38.583333333333336 0 0.0263763446044989 0 -0.0263763446044989 0 0.0271754797382182 NA NA 0.0272474626648767 0.333029692952862 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333336 1 39.25 0 0.0259205062991005 0 -0.0259205062991005 0 0.0266980112777042 NA NA 0.0268662046244663 0.334645143665395 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333336 1 38.25 0 0.0266103300115572 0 -0.0266103300115572 0 0.0269651602222889 NA NA 0.0275663789005504 0.334385408681987 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333336 1 37.25 0 0.0273378783823658 0 -0.0273378783823658 0 0.0272003710111843 NA NA 0.0279765107092679 0.328483733934487 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000003 1 36.583333333333336 0 0.02784542552167 0 -0.02784542552167 0 0.0273101442738347 NA NA 0.0280069223273066 0.320109113480282 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333337 1 36.25 0 0.0281063333749098 0 -0.0281063333749098 0 0.0269216990769376 NA NA 0.0278814882446411 0.313423587076397 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000004 1 36.58333333333333 0 0.02784542552167 0 -0.02784542552167 0 0.0283846625034347 NA NA 0.0277534797742379 0.315709892309433 0 333 667 0.667 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000004 1 37.08333333333333 0 0.0274630224286674 0 -0.0274630224286674 0 0.0286280813206664 NA NA 0.0280825621289394 0.328104676119377 0 381 619 0.619 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 1 36.75 0 0.0277167798918218 0 -0.0277167798918218 0 0.0295740927570509 NA NA 0.0282297712508124 0.326184590646142 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 1 36.08333333333333 0 0.0282386296527663 0 -0.0282386296527663 0 0.0281255819833692 NA NA 0.0308433726544681 0.359903309628558 0 342 658 0.658 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 1 35.08333333333333 0 0.0290593249318817 0 -0.0290593249318817 0 0.0281980249377438 NA NA 0.0291571382668061 0.318936707432916 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 1 35.08333333333333 0 0.0290593249318817 0 -0.0290593249318817 0 0.0302057832003221 NA NA 0.0294733943563967 0.324157120356122 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666671 1 35.25 0 0.0289192452027623 0 -0.0289192452027623 0 0.0286131932460488 NA NA 0.0297930384466098 0.331712024092842 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333339 1 34.58333333333333 0 0.0294878275056261 0 -0.0294878275056261 0 0.030131809209583 NA NA 0.0305439529885585 0.334333104345298 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333339 1 35.25 0 0.0289192452027623 0 -0.0289192452027623 0 0.0298389875728936 NA NA 0.0292504972474095 0.322822013626752 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666671 1 35.916666666666664 0 0.0283721774047871 0 -0.0283721774047871 0 0.0275161190289325 NA NA 0.0291282758864757 0.330035458998442 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666671 1 35.916666666666664 0 0.0283721774047871 0 -0.0283721774047871 0 0.0280505405586677 NA NA 0.0283193918001226 0.3164093114348 0 402 598 0.598 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000004 1 35.75 0 0.0285069944752381 0 -0.0285069944752381 0 0.0278094363231273 NA NA 0.0292591017140945 0.329910120977445 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.9166666666667 1 34.833333333333336 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0294414177555264 NA NA 0.0305108112140219 0.33735833719329 0 345 655 0.655 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000003 1 34.5 0 0.0295604764056575 0 -0.0295604764056575 0 0.0299812689116946 NA NA 0.0312361633837112 0.343967924721762 0 338 662 0.662 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000003 1 34 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0300008303249722 NA NA 0.0300707204923428 0.318385446089191 0 328 672 0.672 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000003 1 33.833333333333336 0 0.0301548153585304 0 -0.0301548153585304 0 0.0307729252039626 NA NA 0.0308495330368194 0.328331352977753 0 337 663 0.663 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333336 1 34.5 0 0.0295604764056575 0 -0.0295604764056575 0 0.0278386038359902 NA NA 0.0288297963246242 0.305200611496203 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 1 34.5 0 0.0295604764056575 0 -0.0295604764056575 0 0.0302256167941319 NA NA 0.0303525202125205 0.330103625704045 0 364 636 0.636 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.6666666666667 0 33.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 34 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666671 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333339 0 34 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000004 0 34.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 35.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666671 0 36.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666671 0 36.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.583333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATC ACA TCG 2 CACATCGGC:CACATTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 36.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TCG GCA 2 ATCGGCACC:ATTGGCACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000006 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 35.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 35.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 35.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.25000000000006 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 36.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 36.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000006 0 36.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333339 0 37.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333339 0 37.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333339 0 38.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.75000000000004 0 40.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.08333333333337 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.75000000000004 0 38.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.25000000000004 0 37.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.91666666666671 0 36.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 36.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666671 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.66666666666671 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 65.66666666666671 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000004 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000004 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666671 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333337 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCGTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT:TCGTCACGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000004 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333341 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333341 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333341 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333341 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666674 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000007 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666676 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666676 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666676 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666674 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.8333333333334 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000007 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.3333333333334 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000007 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.25000000000007 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.25000000000007 0 34.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.91666666666673 0 33.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000006 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.5833333333334 0 32.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000006 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.0833333333334 0 32.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.0833333333334 0 31.749999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 31.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 31.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 31.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.249999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000006 0 31.749999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000004 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333339 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 31.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.749999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 31.999999999999996 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 31.833333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000004 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000004 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333337 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666671 0 31.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000004 0 31.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333337 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.1666666666667 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 0 31.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 0 30.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000003 0 30.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000003 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000004 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333337 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000003 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.6666666666667 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC:ACTGATTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000004 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA:GATTATAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000004 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT:TATAAACAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000004 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000004 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333339 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333339 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333339 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 27.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.3333333333334 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000007 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000007 0 26.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.0833333333334 0 27.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.0833333333334 0 27.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000006 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333339 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000006 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.25000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.25000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000006 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.91666666666673 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.8333333333334 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.00000000000007 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666674 0 29.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000007 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333341 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:CTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417146.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAT 2 CCCCAATCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 8 TCA AAT CAA 2 CAATCAAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA:TCAAACCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.8333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.3333333333334 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 36 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 36.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 38.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 39.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 38.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 37.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333339 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000007 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333339 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666673 0 34.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.0833333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75000000000007 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000007 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000007 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 TTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666674 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666674 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000007 0 35.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666673 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000007 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 38.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 38.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666673 0 34.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000007 0 33.583333333333314 0.0274316291149154 0 -Inf 0.0274316291149154 0.0272358425259966 0 NA NA 0.0286870471812295 0.338952278622009 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.5833333333334 0 33.249999999999986 0.0273067703935705 0 -Inf 0.0273067703935705 0.0273507648360008 0 NA NA 0.0271843325742891 0.315135751529998 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 0 33.249999999999986 0.0270604324233619 0 -Inf 0.0270604324233619 0.0264495852742735 0 NA NA 0.0271345850601833 0.318634816595339 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 0 33.249999999999986 0.0270604324233619 0 -Inf 0.0270604324233619 0.0283405601892685 0 NA NA 0.0271042501285974 0.318093497401619 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 0 33.583333333333314 0.0270604324233619 0 -Inf 0.0270604324233619 0.0279831936464416 0 NA NA 0.0268325834359245 0.31321856439557 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 0 34.583333333333314 0.0270604324233619 0 -Inf 0.0270604324233619 0.0278852773718636 0 NA NA 0.0256905858079724 0.292193917233634 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666674 0 34.91666666666665 0.0269995408952429 0 -Inf 0.0269995408952429 0.0267097909389404 0 NA NA 0.0275496280390153 0.327069896156009 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000007 0 35.583333333333314 0.0265221005560517 0 -Inf 0.0265221005560517 0.0267161070450696 0 NA NA 0.0257468119476814 0.302957421660292 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000007 0 35.91666666666665 0.0265221005560517 0 -Inf 0.0265221005560517 0.0280121849349024 0 NA NA 0.0273695197314059 0.332526304690991 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000007 0 35.99999999999998 0.0265221005560517 0 -Inf 0.0265221005560517 0.0278900588055149 0 NA NA 0.0275092535178441 0.334987970643119 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.41666666666673 0 36.66666666666665 0.0262896575662818 0 -Inf 0.0262896575662818 0.0261355048876344 0 NA NA 0.026688078254524 0.324589093330257 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000006 0 37.66666666666665 0.0265221005560517 0 -Inf 0.0265221005560517 0.026885657512436 0 NA NA 0.0264226421443612 0.315492314964453 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333339 0 37.66666666666665 0.0267586909940917 0 -Inf 0.0267586909940917 0.0273330218536011 0 NA NA 0.0260140658039722 0.303656421431906 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.91666666666673 0 37.49999999999998 0.0264636052740321 0 -Inf 0.0264636052740321 0.0268344582275876 0 NA NA 0.0260385791495511 0.309475628802163 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.91666666666673 0 36.49999999999998 0.0261179819037762 0 -Inf 0.0261179819037762 0.0268636471103169 0 NA NA 0.0266418967214195 0.326920818977367 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000007 0 36.49999999999998 0.0263473854682498 0 -Inf 0.0263473854682498 0.0263218304532602 0 NA NA 0.0263031869572484 0.316498000975192 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000007 0 36.49999999999998 0.0263473854682498 0 -Inf 0.0263473854682498 0.0272887209296996 0 NA NA 0.0261328017933028 0.313353045271391 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.0833333333334 0 36.66666666666665 0.0264053674769446 0 -Inf 0.0264053674769446 0.0259218086450284 0 NA NA 0.0271711107275393 0.331141227764809 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.0833333333334 0 36.333333333333314 0.026061253903872 0 -Inf 0.026061253903872 0.0276906377539111 0 NA NA 0.0263546444046748 0.322727925607453 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.75000000000007 0 36.16666666666665 0.0258367851740807 0 -Inf 0.0258367851740807 0.0260626985861222 0 NA NA 0.0278406414691567 0.353395088423321 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.0833333333334 0 36.16666666666665 0.026061253903872 0 -Inf 0.026061253903872 0.0266772609803372 0 NA NA 0.0275940740675161 0.344939173684018 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.0833333333334 0 36.833333333333314 0.026061253903872 0 -Inf 0.026061253903872 0.026522957336971 0 NA NA 0.0269789991154893 0.334052698823783 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.0833333333334 0 36.833333333333314 0.026061253903872 0 -Inf 0.026061253903872 0.0256244153427991 0 NA NA 0.0258301728107014 0.313000451450843 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.75000000000006 0 37.16666666666665 0.0261749574292545 0 -Inf 0.0261749574292545 0.0269862730905177 0 NA NA 0.0247759466285652 0.290755141628609 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333339 0 37.833333333333314 0.0271215992572094 0 -Inf 0.0271215992572094 0.0274198321385968 0 NA NA 0.0257673266165787 0.29254373087502 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.41666666666671 0 37.833333333333314 0.0277488297186241 0 -Inf 0.0277488297186241 0.0284960911937649 0 NA NA 0.0286141170646787 0.332166073400591 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.41666666666671 0 37.999999999999986 0.0277488297186241 0 -Inf 0.0277488297186241 0.0290879083050459 0 NA NA 0.0274206695262332 0.31155353498478 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666671 0 36.999999999999986 0.0273690573365762 0 -Inf 0.0273690573365762 0.0279694291821908 0 NA NA 0.0275506528789187 0.320510839872798 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333339 0 36.833333333333314 0.0273067703935705 0 -Inf 0.0273067703935705 0.0277969035065655 0 NA NA 0.0267285786030718 0.30695512081277 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666671 0 36.499999999999986 0.0271830432683088 0 -Inf 0.0271830432683088 0.0281991474440946 0 NA NA 0.0277173643071522 0.326729597165468 675 325 0 0 0.675 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666673 0 36.16666666666665 0.0268184996810859 0 -Inf 0.0268184996810859 0.0266379577054924 0 NA NA 0.0272775665473468 0.325523514146205 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333339 0 35.33333333333332 0.0267586909940917 0 -Inf 0.0267586909940917 0.028158587718735 0 NA NA 0.027684471668155 0.333764254675192 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.58333333333339 0 35.83333333333332 0.0269389228181416 0 -Inf 0.0269389228181416 0.0278762108936351 0 NA NA 0.028756586462924 0.348865871230005 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.58333333333339 0 35.499999999999986 0.0265808550345806 0 -Inf 0.0265808550345806 0.0264290685647117 0 NA NA 0.0272795644386036 0.329864383940645 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000004 0 34.83333333333332 0.0260047718198447 0 -Inf 0.0260047718198447 0.0270675721983966 0 NA NA 0.0257599280254087 0.312732585326049 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333337 0 34.49999999999999 0.0258925390301244 0 -Inf 0.0258925390301244 0.0276436798212753 0 NA NA 0.0253894466032082 0.30781619771081 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.91666666666671 0 34.166666666666664 0.0257812709329177 0 -Inf 0.0257812709329177 0.0259061682205736 0 NA NA 0.0260017469512051 0.321431378560814 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333337 0 34.5 0.0257259947650973 0 -Inf 0.0257259947650973 0.0253087069266758 0 NA NA 0.0262299270346922 0.326697351836792 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.41666666666671 0 34.166666666666664 0.0256161505491714 0 -Inf 0.0256161505491714 0.0265197810991747 0 NA NA 0.0260829353483643 0.326048701729732 658 342 0 0 0.658 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.41666666666671 0 33.166666666666664 0.0252921753687316 0 -Inf 0.0252921753687316 0.0254388149926378 0 NA NA 0.0247377168915992 0.306585240192353 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC:AAGCCTCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 33.33333333333333 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0261900762457195 0 NA NA 0.0256117973201438 0.321343258247807 661 339 0 0 0.661 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA:CCTCGTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 33.33333333333333 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0246850546382763 0 NA NA 0.0258987618754477 0.326734288194887 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA:CGTCAAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333337 0 33.33333333333333 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0254240836640096 0 NA NA 0.0247906433195884 0.305575586034038 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.75000000000004 0 32.666666666666664 0.025185997239258 0 -Inf 0.025185997239258 0.0261066748653034 0 NA NA 0.0257292673930779 0.327636740615531 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.58333333333337 0 33.166666666666664 0.0255615794834085 0 -Inf 0.0255615794834085 0.0249658684479476 0 NA NA 0.0268133049803904 0.340429480283646 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333337 0 34.16666666666666 0.0258925390301244 0 -Inf 0.0258925390301244 0.0248720379726927 0 NA NA 0.0257030537428518 0.313755997226826 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.9166666666667 0 33.83333333333333 0.0257812709329177 0 -Inf 0.0257812709329177 0.0253482450038582 0 NA NA 0.0262787609335892 0.326558843545561 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCCACCAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.25000000000003 0 33.166666666666664 0.0253456008907938 0 -Inf 0.0253456008907938 0.024796627513646 0 NA NA 0.0259218833579345 0.328188836042958 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAGGCG 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.58333333333336 0 33.333333333333336 0.0252389746234555 0 -Inf 0.0252389746234555 0.0260702597277444 0 NA NA 0.0262079950539417 0.33553459091281 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC:AAGGCGTAC 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 80.08333333333336 0 33.166666666666664 0.0253992526173405 0 -Inf 0.0253992526173405 0.0258225733000104 0 NA NA 0.0252465542925801 0.314392344302954 617 383 0 0 0.617 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:GCGTACAAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333336 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000003 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000003 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.9166666666667 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333337 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.9166666666667 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.9166666666667 0 31.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGGAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000004 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGGAGGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT:AGGCGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 32.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666671 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666671 0 31.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000004 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.58333333333337 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.9166666666667 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.4166666666667 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000003 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000003 0 30.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000003 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.58333333333337 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000003 0 30.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.4166666666667 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333337 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333337 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333337 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000004 0 29.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000004 0 29.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000004 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333337 0 27.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 26.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 27.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 28.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 28.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333339 0 28.666666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 27.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 26.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 27.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666673 0 26.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.0833333333334 0 26.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.5833333333334 0 26.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 27.416666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 26.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000004 0 26.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.41666666666671 0 26.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 27.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.91666666666671 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.58333333333339 0 27.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.58333333333339 0 27.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.58333333333339 0 28.083333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.25000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.91666666666673 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.16666666666673 0 28.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.00000000000007 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.00000000000007 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 89.00000000000007 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 89.00000000000007 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 89.00000000000007 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.00000000000007 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000007 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.3333333333334 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC:CCACAATTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA:CAATTTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC:TTTAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000007 0 30.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGACAAT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 31.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC:GACAATGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.5833333333334 0 32.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA:AATGTCATA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.5833333333334 0 32.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417147.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666673 1 33.49999999999999 0 0.0304610393656427 0 -0.0304610393656427 0 0.0331425866008824 NA NA 0.0314385494894876 0.332591454564885 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000006 1 33.66666666666666 0 0.0303071537534075 0 -0.0303071537534075 0 0.0324573081226267 NA NA 0.0304878928868197 0.320187926105212 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333339 1 33.66666666666666 0 0.0303071537534075 0 -0.0303071537534075 0 0.0342197035871692 NA NA 0.0327018106758712 0.354044429034782 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 1 33.99999999999999 0 0.0300040009602743 0 -0.0300040009602743 0 0.0317775680158033 NA NA 0.0315527571774285 0.34164735174128 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0296006419194629 NA NA 0.0321005017643798 0.364164356028564 0 337 663 0.663 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAC 2 CCCCAACCA:CCCCAATCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0310506463514443 NA NA 0.0304163466283222 0.338211738095853 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 8 CCA AAC CAA 2 CAACCAAAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666671 1 34.99999999999999 0 0.0291298749871979 0 -0.0291298749871979 0 0.0316855821913197 NA NA 0.0322932692482498 0.367034724885933 0 358 642 0.642 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 CCAAACCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333337 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333337 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000004 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666671 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.16666666666671 0 33.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.16666666666671 0 33.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.16666666666671 0 33.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000004 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000004 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333337 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666671 0 36.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333337 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000004 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.91666666666671 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333337 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000004 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333337 0 36.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.4166666666667 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000003 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000003 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000003 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333336 0 36.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.08333333333336 0 37.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666669 0 37.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666669 0 38.583333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666669 0 37.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666669 0 37.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000001 0 38.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.58333333333336 0 39.083333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTCTAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333336 0 38.083333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.91666666666669 0 37.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333336 0 36.583333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.9166666666667 0 36.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.58333333333337 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.08333333333337 0 37.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666671 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000004 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000004 0 35.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666671 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.91666666666671 0 35.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000004 0 35.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000004 0 35.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333337 0 35.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 34.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333336 0 34 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333336 0 33.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.1666666666667 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000003 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.6666666666667 0 33.833333333333336 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333337 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 34 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666671 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.83333333333339 0 34 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 34.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 34.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 35.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000006 0 35.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000006 0 35.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000006 0 36.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATC ACA TCG 2 CACATCGGC:CACATTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TCG GCA 2 ATCGGCACC:ATTGGCACC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000007 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 38.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 38.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000006 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 35.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666674 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000007 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 36.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666674 0 36.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666674 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 35.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000009 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000007 0 36.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.3333333333334 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 36.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 37.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666673 0 36.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.8333333333334 0 35.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666673 0 35.583333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 35.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.8333333333334 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.8333333333334 0 34.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000006 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCC:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666673 0 33.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCCAAA:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333339 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000006 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000006 0 32.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333339 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.41666666666671 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000004 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.1666666666667 0 33.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.1666666666667 0 33.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 0 33.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA:TTTGGGAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT:GGGAGGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT:AGGCGTGGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333337 0 32.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000004 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 32.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 31.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.6666666666667 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.6666666666667 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000004 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666671 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000004 0 30.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.6666666666667 0 30.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333337 0 30.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 30.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.16666666666671 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.16666666666671 0 29.833333333333325 0.0118345650779739 0 -Inf 0.0118345650779739 0.0123362991393329 0 NA NA 0.0120840919337685 0.327406679044093 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.83333333333339 0 30.49999999999999 0.0120243056482867 0 -Inf 0.0120243056482867 0.0127360715285074 0 NA NA 0.0125383999581947 0.33755954520391 660 340 0 0 0.66 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333339 0 30.833333333333325 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0123403996054331 0 NA NA 0.0122781615870906 0.321566511399907 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333339 0 29.833333333333325 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0126071653835543 0 NA NA 0.0118591620511546 0.304766311733281 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.66666666666671 0 28.833333333333325 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0128409971787729 0 NA NA 0.0124606049952307 0.321783627096682 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 28.166666666666657 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0123011538574136 0 NA NA 0.0120624033901119 0.305071816898386 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000006 0 28.833333333333325 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0126553192764134 0 NA NA 0.0124942249264847 0.322090726978702 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.16666666666671 0 29.166666666666657 0.0124226442537559 0 -Inf 0.0124226442537559 0.0124713113600336 0 NA NA 0.0124673314641956 0.319048229432088 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA:TTTGCTCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000006 0 29.833333333333318 0.0125263872134486 0 -Inf 0.0125263872134486 0.0128657476158645 0 NA NA 0.0131944959585194 0.342435214642596 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT:GCTCCGAGT 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.16666666666671 0 29.833333333333318 0.0124226442537559 0 -Inf 0.0124226442537559 0.0121286603243629 0 NA NA 0.012081777208209 0.303849494154654 655 345 0 0 0.655 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCGAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666671 0 29.583333333333318 0.0123841823043677 0 -Inf 0.0123841823043677 0.0121589326217435 0 NA NA 0.0123628796523392 0.316477339977276 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333339 0 29.249999999999986 0.0124355180497881 0 -Inf 0.0124355180497881 0.0126188890510468 0 NA NA 0.012582906189783 0.323012287740296 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000006 0 29.249999999999986 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0125441784488625 0 NA NA 0.0121725933373795 0.3109647542523 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.012640885505109 0 NA NA 0.0125633316782205 0.33218230812261 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.08333333333339 0 27.58333333333332 0.0119882672313273 0 -Inf 0.0119882672313273 0.0122061802731517 0 NA NA 0.0125429368628081 0.339184239362896 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.0121895038113607 0 NA NA 0.0125182289288248 0.330443248610014 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.0833333333334 0 27.41666666666665 0.0121337327973565 0 -Inf 0.0121337327973565 0.0119903647620085 0 NA NA 0.0122670142455089 0.322597108852177 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.50000000000007 0 26.999999999999986 0.012072695281631 0 -Inf 0.012072695281631 0.0119997344731255 0 NA NA 0.0122629985946968 0.324878821985943 667 333 0 0 0.667 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.00000000000007 0 27.16666666666665 0.0121460144399855 0 -Inf 0.0121460144399855 0.0122811020644358 0 NA NA 0.0125178382799526 0.33189873056262 652 348 0 0 0.652 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.8333333333334 0 27.333333333333318 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0121201042175863 0 NA NA 0.0122580367557267 0.32077269453314 610 390 0 0 0.61 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.8333333333334 0 27.999999999999986 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0124216612015771 0 NA NA 0.0126550031061522 0.336186982477296 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.50000000000006 0 27.49999999999999 0.012072695281631 0 -Inf 0.012072695281631 0.0120709586498033 0 NA NA 0.0119473662699273 0.312260542384083 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0.0119763023840483 0 -Inf 0.0119763023840483 0.0121320371911858 0 NA NA 0.0114267512454253 0.294595584062869 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0.0120243056482867 0 -Inf 0.0120243056482867 0.0118963755781849 0 NA NA 0.0116937570765855 0.303824203705479 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.83333333333339 0 28.49999999999999 0.0121706524663175 0 -Inf 0.0121706524663175 0.0124149922543369 0 NA NA 0.0123596996261559 0.324769216817523 611 389 0 0 0.611 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.33333333333339 0 28.666666666666657 0.0120970364474127 0 -Inf 0.0120970364474127 0.0124865839603756 0 NA NA 0.0121079671508431 0.317747592646438 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.00000000000006 0 28.666666666666657 0.0120002560098308 0 -Inf 0.0120002560098308 0.0123548583271052 0 NA NA 0.0124554067726821 0.335317944662934 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.66666666666671 0 28.99999999999999 0.012048451877855 0 -Inf 0.012048451877855 0.0122494562537548 0 NA NA 0.012822775444512 0.347415890509496 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 84.33333333333339 0 28.99999999999999 0.0119524441971095 0 -Inf 0.0119524441971095 0.0123441712224274 0 NA NA 0.012303806167723 0.331327812629452 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0.0117189884273107 0 -Inf 0.0117189884273107 0.0120558734175086 0 NA NA 0.0119912695887476 0.328423927839943 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0.0117189884273107 0 -Inf 0.0117189884273107 0.0122100834906943 0 NA NA 0.0116993270786061 0.316497901604764 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.00000000000006 0 28.666666666666657 0.0118579545199817 0 -Inf 0.0118579545199817 0.0121170070421365 0 NA NA 0.0124647743846838 0.34144336788453 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 86.66666666666673 0 28.33333333333332 0.0116281399019739 0 -Inf 0.0116281399019739 0.0117001934971649 0 NA NA 0.0114297887377556 0.308985114345824 612 388 0 0 0.612 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0.0115386891296096 0 -Inf 0.0115386891296096 0.0118132693908956 0 NA NA 0.0127104138940544 0.363976606379443 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0.0115054988831112 0 -Inf 0.0115054988831112 0.0119892554222776 0 NA NA 0.0116833891538048 0.324735051945144 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 86.75000000000007 0 29.58333333333332 0.0116168827818452 0 -Inf 0.0116168827818452 0.0115342511586989 0 NA NA 0.0117717014916289 0.323717046700826 664 336 0 0 0.664 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 86.41666666666674 0 30.08333333333332 0.0116620425486463 0 -Inf 0.0116620425486463 0.0110880795060896 0 NA NA 0.0114188758778732 0.307114623727651 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 87.41666666666674 0 29.74999999999999 0.011527604457494 0 -Inf 0.011527604457494 0.0120368904646221 0 NA NA 0.0115645267894801 0.318858065432963 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0.0113962306613038 0 -Inf 0.0113962306613038 0.0118536549372389 0 NA NA 0.0116392685954714 0.327521115377261 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0.0113962306613038 0 -Inf 0.0113962306613038 0.0111068838871595 0 NA NA 0.0110186864649497 0.301012764987493 657 343 0 0 0.657 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0.0113962306613038 0 -Inf 0.0113962306613038 0.0112822302779972 0 NA NA 0.0111222155883649 0.305534624720451 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 87.41666666666674 0 29.749999999999993 0.011527604457494 0 -Inf 0.011527604457494 0.0117833067661511 0 NA NA 0.0116048233103531 0.320541382664471 671 329 0 0 0.671 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 85.41666666666674 0 31.08333333333332 0.0117996534141747 0 -Inf 0.0117996534141747 0.0116868052082937 0 NA NA 0.0114233102236969 0.301629546558792 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.75000000000007 0 31.08333333333332 0.012036366652848 0 -Inf 0.012036366652848 0.012164954275442 0 NA NA 0.0119098321512604 0.31219624578959 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666674 0 30.74999999999999 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0122747693032367 0 NA NA 0.0128882143438652 0.342550702349221 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333341 0 31.08333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0130608207652819 0 NA NA 0.0120659548465619 0.308692532045418 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333341 0 31.416666666666657 0.0124355180497881 0 -Inf 0.0124355180497881 0.0122286071251274 0 NA NA 0.0125035024132236 0.319948960146894 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.75000000000007 0 31.74999999999999 0.0124872811774231 0 -Inf 0.0124872811774231 0.0128047787490237 0 NA NA 0.0125065564500232 0.318056939679391 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGACAGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000007 0 32.08333333333332 0.0126451889006809 0 -Inf 0.0126451889006809 0.0130653751814858 0 NA NA 0.0127364823424868 0.320791768908049 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC:GACAGCGTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0.0129174344873365 0 -Inf 0.0129174344873365 0.0138980884003558 0 NA NA 0.0129419322995373 0.31822742869906 621 379 0 0 0.621 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA:AGCGTCATA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_KY417151.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666673 2 33.99999999999999 0.0405961546323978 0.0612585232607004 0.662702142845185 -0.0206623686283026 0.0230428877440622 0.0457101327065867 NA NA 0.0522178046348806 0.692329416840611 363 4 633 0.633 0.363 0.726 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.08333333333339 2 33.83333333333333 0.0405047802473168 0.0615730216404005 0.657833238782292 -0.0210682413930837 0.0237803518659826 0.0443308039067465 NA NA 0.0532378690371439 0.692298408284564 343 4 653 0.653 0.343 0.686 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.41666666666671 2 33.83333333333333 0.0403232602433046 0.0615730216404005 0.654885194343733 -0.0212497613970959 0.022703983914112 0.0453774868615609 NA NA 0.0513230473491415 0.678845285562954 355 5 640 0.64 0.355 0.71 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666671 2 34.16666666666666 0.0408727688266097 0.0609472230590744 0.670625613032326 -0.0200744542324647 0.0243161725246091 0.0412429612685813 NA NA 0.0496420554909033 0.685930345312034 360 5 635 0.635 0.36 0.72 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666671 2 35.16666666666666 0.0414374651394939 0.0591439311842398 0.700620745185363 -0.0177064660447459 0.0233279363407057 0.0438630845810223 NA NA 0.049247503858022 0.71919087870932 371 9 620 0.62 0.371 0.742 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.08333333333337 2 35.49999999999999 0.0416291816557173 0.0585663277285774 0.710804028018379 -0.0169371460728601 0.0246896086414245 0.0433738119269564 NA NA 0.0488286276904798 0.728689601194961 386 5 609 0.609 0.386 0.772 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.25000000000004 2 34.666666666666664 0.0415331021017154 0.0600320307551523 0.691849027581843 -0.0184989286534369 0.0227561918470562 0.0411136060279601 NA NA 0.0489385628852069 0.705428288447624 354 4 642 0.642 0.354 0.708 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AACCAA:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.25000000000004 2 35.666666666666664 0.0409658133601689 0.0582817382454872 0.702892785860603 -0.0173159248853183 0.0239981752982308 0.0416514492584446 NA NA 0.0478954031878718 0.717698604680335 372 9 619 0.619 0.372 0.744 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.91666666666671 2 35.99999999999999 0.0411531794236846 0.0577207808520962 0.712969901241211 -0.0165676014284116 0.0226288640348484 0.0418424343077701 NA NA 0.0487201529685844 0.733814030174282 396 6 598 0.598 0.396 0.792 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 2 35.33333333333333 0.0407801460981609 0.0588537115811214 0.692906955272504 -0.0180735654829605 0.022419690857262 0.0446575333774664 NA NA 0.0489767024138971 0.712110036030392 390 8 602 0.602 0.39 0.78 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCA:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.9166666666667 2 34.99999999999999 0.0405961546323978 0.0594370287406054 0.683011171530246 -0.0188408741082076 0.0224131391709683 0.0416885271726789 NA NA 0.0497346676521499 0.704815751220707 375 6 619 0.619 0.375 0.75 N all ss13 13 GCA GTG CAC 2 AGTGCACCC:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333336 2 35.33333333333333 0.0407801460981609 0.0588537115811214 0.692906955272504 -0.0180735654829605 0.0234718687656662 0.0423368140708336 NaN NaN 0.0492748130724687 0.71377480756321 361 5 634 0.634 0.361 0.722 N all ss13 14 CCC CAC CCC 2 GCACCCCGC:GCCCCCCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333336 2 34.99999999999999 0.0402331091273882 0.0594370287406054 0.676903101986696 -0.0192039196132172 0.0226422048640349 0.0428407352536754 NA NA 0.0506108770718178 0.704359267819585 357 5 638 0.638 0.357 0.714 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000003 3 34.74999999999999 0.0534747581886499 0.0917171833187058 0.583039690641521 -0.0382424251300559 0.0253342686869915 0.055622095643955 NA NA 0.053350113526529 0.473485206994611 241 2 757 0.757 0.241 0.482 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000003 3 34.74999999999999 0.0534747581886499 0.0917171833187058 0.583039690641521 -0.0382424251300559 0.0264137196505153 0.0558481093549314 NA NA 0.0558749860119434 0.493704711857986 240 1 759 0.759 0.24 0.48 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.50000000000003 3 33.83333333333333 0.0665625029345024 0.0943651299007743 0.705371814827081 -0.0278026269662719 0.0293955086191412 0.0570969352543543 NaN NaN 0.0566958888228684 0.623863815969424 332 1 667 0.667 0.332 0.664 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.83333333333336 3 34.166666666666664 0.0662682453670823 0.0933847109044368 0.709626283845291 -0.0271164655373545 0.02947153278414 0.055801820330857 NaN NaN 0.0582513543922611 0.641567782321559 332 2 666 0.666 0.332 0.664 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.00000000000003 3 34.5 0.0670088252518874 0.0924244803179611 0.72501165298806 -0.0254156550660737 0.0289574721078724 0.056606261528118 NA NA 0.0566489793295754 0.653683006321256 319 0 681 0.681 0.319 0.638 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.33333333333336 3 34.666666666666664 0.0676133227457231 0.0919517415692493 0.735313128297882 -0.0243384188235262 0.0298306081406696 0.0558811435324341 NaN NaN 0.0595262525218933 0.682636052856969 327 0 673 0.673 0.327 0.654 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.00000000000003 3 34 0.0670088252518874 0.0938723572155045 0.713829153113243 -0.0268635319636171 0.02930304236482 0.0546832610612649 NA NA 0.0579294499315357 0.642842336847642 302 0 698 0.698 0.302 0.604 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.83333333333336 3 34.833333333333336 0.0671589333302045 0.0914838201648646 0.734107224743963 -0.02432488683466 0.0294553945554228 0.0533244607816012 NA NA 0.0573992684738436 0.67172340828225 339 0 661 0.661 0.339 0.678 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.50000000000003 2 34.166666666666664 0.0665625029345024 0.0609472230590743 1.09213348194692 0.00561527987542813 0.0297546251488977 0.043289629586795 NA NA 0.0459637449577705 0.902766294851964 564 0 436 0.436 0.564 0.872 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT:GATTCAAGT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 77.1666666666667 2 34.833333333333336 0.067766156279967 0.0597330472949441 1.13448349529797 0.0080331089850229909 0.0296596243870292 0.0435434233781195 NA NA 0.0440995570494241 0.855458343415141 571 2 427 0.427 0.571 0.854 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC:TCAAGTGAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.50000000000004 2 34.5 0.0665625029345024 0.0603340239140544 1.10323327728514 0.00622847902044803 0.0285694725107552 0.0446030955739994 NA NA 0.0465298598330108 0.893513417167382 582 3 415 0.415 0.582 0.83 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT:AGTGACAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333339 2 34.333333333333336 0.0528853382457436 0.0606390724718212 0.87213303386722 -0.00775373422607758 0.0258420041319343 0.0449298009593079 NA NA 0.0443915967585983 0.861341525959546 421 4 575 0.575 0.421 0.842 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC:GACAATAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.33333333333339 2 34.333333333333336 0.0528853382457436 0.0606390724718212 0.87213303386722 -0.00775373422607758 0.0252613129934443 0.0452521102267062 NA NA 0.0442480980897886 0.860896426431499 428 7 565 0.565 0.428 0.856 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG:AATAGCAAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.66666666666671 2 34.333333333333336 0.0533558250189307 0.0606390724718212 0.879891839436117 -0.00728324745289045 0.0264652836026426 0.0465768118310569 NA NA 0.0449991346555888 0.871421571313472 436 4 560 0.56 0.436 0.872 N all ss13 29 AAA ACC AAA 2 AACCAGAAT:AGCAAAAAC 1:1 TRUE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.33333333333339 2 34.666666666666664 0.0398323689854613 0.0600320307551523 0.663518599727574 -0.020199661769691 0.0222468540302161 0.0447732682112257 NA NA 0.0404319229278048 0.617358968743601 322 22 656 0.656 0.322 0.644 N all ss13 30 AAC AAA ACG 2 AAAAACGGA:CAGAATGGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666671 1 34.083333333333336 0.0395261602343306 0.0299291581301553 1.3206572688226 0.00959700210417523 0.0220714798871334 0.0299079683737617 NA NA 0.0267579156793868 0.719849229875726 644 42 314 0.314 0.644 0.628 N all ss13 31 GGA ACG GAG 2 AACGGAGAG:AATGGAGGA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666671 2 34.91666666666667 0.0542609435735893 0.059584670169267 0.91065274708152 -0.00532372659567768 0.0287946305728898 0.0428721206251831 NA NA 0.0310822447714194 0.864004624919449 411 17 572 0.572 0.411 0.822 N all ss13 32 GAG GAG AGC 2 GGAGAGCGC:GGAGGACGC 1:1 TRUE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.25000000000004 3 35.41666666666667 0.0686192553184994 0.0898829861073045 0.763428745419962 -0.0212637307888052 0.0291907030499051 0.0538445835419779 NA NA 0.0369990706695156 0.565487536745981 269 5 726 0.726 0.269 0.538 N all ss13 33 CGC AGC GCA 2 GAGCGCAAT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.75000000000004 3 35.25 0.0540165882431452 0.0903346148069003 0.597961128838722 -0.0363180265637551 0.0272414581486204 0.0557376954594185 NA NA 0.0349872103191761 0.299252726882588 110 22 868 0.868 0.11 0.22 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAATGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000004 3 34.91666666666667 0.0532965566864638 0.0912516429860269 0.584061337883253 -0.0379550862995631 0.0263164335758479 0.0538523809752433 NA NA 0.0358603772334859 0.289867235270336 115 14 871 0.871 0.115 0.23 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AATGGTGCA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000004 3 34.91666666666667 0.0532965566864638 0.0912516429860269 0.584061337883253 -0.0379550862995631 0.0263654422045466 0.057236227848009 NA NA 0.0358581669394219 0.289837505907507 95 21 884 0.884 0.095 0.19 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGTGCACGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333337 3 35.583333333333336 0.0534152253723938 0.0894358561096487 0.597246201869042 -0.0360206307372548 0.026468251001613 0.0553151111497172 NA NA 0.0356519994862846 0.312332563293965 116 19 865 0.865 0.116 0.232 N all ss13 37 AGG CAA GAC 2 GCAAGGCCA:GCACGACCT 1:1 TRUE 1.75 1.08333333333333 0.166666666666667 0 0 2 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.25000000000004 3 34.91666666666667 0.0529436946379863 0.0912516429860269 0.580194426155082 -0.0383079483480406 0.0283029481276045 0.0567995365682432 NA NA 0.0370692773185454 0.30140971554457 102 11 887 0.887 0.102 0.204 N all ss13 38 CCA GAC CAA 2 AGGCCAAAA:CGACCTAAA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.50000000000004 3 35.75 0.0534747581886498 0.088993157850987 0.600886174622431 -0.0355183996623372 0.027507242748401 0.0566355837355845 NA NA 0.0360774202672648 0.324867287571584 118 25 857 0.857 0.118 0.236 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:CCTAAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333337 3 35.91666666666667 0.0535942229866087 0.0885548256923263 0.605209513627362 -0.0349606027057177 0.0284145602788852 0.0541117895427094 NA NA 0.0336879494199025 0.299373560573389 119 15 866 0.866 0.119 0.238 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGT:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.4166666666667 3 35.91666666666667 0.0542609435735893 0.0885548256923263 0.612738415432184 -0.0342938821187371 0.0277273278508059 0.0528081302287264 NA NA 0.0333801192187296 0.304244170662527 143 12 845 0.845 0.143 0.286 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGTCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.4166666666667 3 36.41666666666667 0.0550074627952335 0.0872653886078579 0.63034684968194 -0.0322579258126244 0.0281995808905861 0.0522657786976822 NA NA 0.0347464344251637 0.353210026315816 145 25 830 0.83 0.145 0.29 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGTCGACCC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333336 3 36.75000000000001 0.0552608903391469 0.0864264476831886 0.639397913723302 -0.0311655573440417 0.0265589620151469 0.0533163731068579 NA NA 0.0327578815021831 0.341405869964383 125 15 860 0.86 0.125 0.25 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333336 3 37.25000000000001 0.0552608903391469 0.085197883292779 0.648618113542154 -0.0299369929536321 0.0273267226785564 0.0524519485133557 NA NA 0.031014136992507 0.33440996618207 133 22 845 0.845 0.133 0.266 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGC:CCCCAAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000003 3 37.41666666666667 0.0555166649189651 0.0847960953267638 0.654707798808781 -0.0292794304077987 0.027242635216421 0.0515704726409848 NA NA 0.0320849350152779 0.361473965230815 154 17 829 0.829 0.154 0.308 N all ss13 45 GGC AAG GCT 2 CAAGGCTTA:CAAGGTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333336 3 36.41666666666667 0.0556454425645553 0.0872653886078579 0.637657649295619 -0.0316199460433026 0.0282392128251793 0.0522311030090679 NA NA 0.0319959120096649 0.323030440445014 135 17 848 0.848 0.135 0.27 N all ss13 46 TTA GCT TAC 2 GGCTTACCC:GGTTTACCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000001 4 36.41666666666667 0.0555166649189651 0.118766081588831 0.467445453923151 -0.0632494166698658 0.0283011002735779 0.0677464374456741 NA NA 0.0479942948771582 0.187552923320571 49 2 949 0.949 0.049 0.098 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000001 4 36.083333333333336 0.0555166649189651 0.119955812971472 0.462809292386424 -0.0644391480525068 0.0270371471327942 0.0634253062251141 NA NA 0.0485064094994695 0.184023988977554 45 1 954 0.954 0.045 0.09 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.75000000000001 4 36.083333333333336 0.0555166649189651 0.119955812971472 0.462809292386424 -0.0644391480525068 0.027747318426712 0.0635544060807771 NA NA 0.0479715304890456 0.179181659153373 61 3 936 0.936 0.061 0.122 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.08333333333334 4 36.083333333333336 0.0560353868844177 0.119955812971472 0.467133567739181 -0.0639204260870543 0.0286781799247139 0.064904369544119 NA NA 0.0501186556400074 0.202174103155509 57 6 937 0.937 0.057 0.114 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCA:AATACTGCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 4 36.41666666666667 0.056298401666626 0.118766081588831 0.474027608838115 -0.0624676799222049 0.029002856307675 0.0644402510247786 NA NA 0.0480263834532983 0.193362852345527 58 6 936 0.936 0.058 0.116 N all ss13 51 GCA CTG CAT 2 ACTGCATCT:ACTGCGTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 4 36.41666666666667 0.056298401666626 0.118766081588831 0.474027608838115 -0.0624676799222049 0.0283052208537504 0.0684070071798568 NA NA 0.052943070221752 0.238038852624352 60 3 937 0.937 0.06 0.12 N all ss13 52 TCT CAT CTT 2 GCATCTTGG:GCGTCTTGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.41666666666669 4 36.41666666666667 0.055774819305903 0.118766081588831 0.469619091240173 -0.0629912622829279 0.0280531529693795 0.0652464130069764 NA NA 0.0472503766850922 0.182486593214896 56 0 944 0.944 0.056 0.112 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.75000000000001 4 36.083333333333336 0.056298401666626 0.119955812971472 0.469326164960551 -0.0636574113048459 0.028085144655529 0.0688995666345646 NA NA 0.0487479533897445 0.191604295849766 65 7 928 0.928 0.065 0.13 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.41666666666669 4 35.083333333333336 0.0565638983071325 0.123672788927057 0.457367370768151 -0.0671088906199243 0.0277569487259432 0.0655686934359091 NA NA 0.0516200300531044 0.193582036647773 39 5 956 0.956 0.039 0.078 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333336 4 34.583333333333336 0.0556454425645553 0.125619222573624 0.44296916844826 -0.069973780009069 0.0285271891528905 0.0676561894131916 NA NA 0.05181351510977 0.176857956009992 41 6 953 0.953 0.041 0.082 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.25000000000003 4 33.91666666666667 0.0551338852123344 0.128312053707491 0.429685938454553 -0.0731781684951568 0.0284694426063336 0.0708052090586395 NA NA 0.0570670141110781 0.199730445827297 52 5 943 0.943 0.052 0.104 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333337 4 34.25 0.0548816190849608 0.126951325912032 0.43230441817512 -0.0720697068270708 0.0276716265138681 0.0693342669322666 NA NA 0.0526795141426257 0.171287528673886 52 5 943 0.943 0.052 0.104 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.58333333333337 4 34.25 0.0548816190849608 0.126951325912032 0.43230441817512 -0.0720697068270708 0.02774409307228 0.0670862430070583 NA NA 0.0550524841585592 0.190497404339895 47 2 951 0.951 0.047 0.094 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.25000000000004 4 33.75 0.0543839525266103 0.129003442367267 0.421569777741138 -0.0746194898406564 0.0292464000962477 0.0702706223265996 NA NA 0.0558392285281929 0.181442291691361 39 6 955 0.955 0.039 0.078 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGC:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000004 4 33.083333333333336 0.0536541558618204 0.13184534303006 0.406947675425954 -0.0781911871682395 0.0270571973442773 0.0731725286085165 NA NA 0.0566902359131556 0.1678112752988 30 10 960 0.96 0.03 0.06 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666671 4 33.75 0.0546316519559279 0.129003442367267 0.423489877118117 -0.0743717904113388 0.0283302585561903 0.0680394462000311 NA NA 0.0555328593983121 0.18049276664532 54 0 946 0.946 0.054 0.108 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAA:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75000000000004 4 34.583333333333336 0.0547563501152287 0.125619222573624 0.435891490119169 -0.0708628724583957 0.0277102900507082 0.0699965548245769 NA NA 0.054469746042473 0.193272701998998 38 3 959 0.959 0.038 0.076 N all ss13 63 GAA AGG AAA 2 AAGGAAAAC:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.75000000000004 4 33.91666666666667 0.0547563501152287 0.128312053707491 0.426743618647512 -0.0735557035922626 0.0274915095737429 0.0679894827327431 NA NA 0.0529857234990788 0.16507085381694 50 5 945 0.945 0.05 0.1 N all ss13 64 AAC AAA AAC 2 GAAAACCTT:GAGGAACTT 1:1 TRUE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.91666666666671 4 34.083333333333336 0.0553884822155736 0.127628054258581 0.433983598177823 -0.0722395720430078 0.0283022817143259 0.0693802498929187 NA NA 0.0546477789477136 0.186197350719781 34 2 964 0.964 0.034 0.068 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 AACCTTACG:GAACTTAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333337 3 34.16666666666667 0.042364201600918 0.0933847109044368 0.453652436149537 -0.0510205093035188 0.0248901154369839 0.0561517402900005 NA NA 0.0444378644846387 0.25091430720192 89 21 890 0.89 0.089 0.178 N all ss13 66 ACG TTA CGT 2 CTTACGTTC:CTTAGATTC 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.916666666666667 0.416666666666667 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.83333333333337 3 33.16666666666667 0.042364201600918 0.0963891381007337 0.439512194378627 -0.0540249364998157 0.0248280888381361 0.0595288073550175 NA NA 0.0471159395596589 0.251531178488888 75 11 914 0.914 0.075 0.15 N all ss13 67 TTC CGT TCC 2 ACGTTCCCT:AGATTCCCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.50000000000004 3 33.41666666666667 0.0281063333749098 0.0956200277799543 0.293937724423062 -0.0675136944050445 0.0203162704734701 0.0575163193205738 NA NA 0.0474910821070549 0.155140129058894 0 42 958 0.958 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000004 3 33.75000000000001 0.0285069944752381 0.094613463995175 0.301299553694513 -0.0661064695199369 0.0209041526263874 0.058389374970205 NA NA 0.0450440309262755 0.142213814720296 0 49 951 0.951 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC:CCTCGAGGG 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.83333333333337 3 33.41666666666667 0.0283721774047871 0.0956200277799543 0.29671793727229 -0.0672478503751672 0.0212076177951342 0.0592619942439438 NA NA 0.0452070259069834 0.136868796501934 0 40 960 0.96 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG:CGAGGGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.00000000000004 3 33.41666666666667 0.0279101972553257 0.0956200277799543 0.291886521091106 -0.0677098305246286 0.0199114348765976 0.0583213611118484 NA NA 0.0465579037584068 0.145859156011223 0 40 960 0.96 0 0.001 N all ss13 71 CAA GCC AAG 2 GGCCAGGGC:GGGCAAGGT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.83333333333337 3 33.583333333333336 0.0279752710599065 0.0951140793534504 0.29412334377909 -0.0671388082935439 0.0206273411677649 0.0574449504184397 NA NA 0.0456084715367618 0.141002297785262 0 39 961 0.961 0 0.001 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGTGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.33333333333337 3 33.416666666666664 0.0426655308015385 0.0956200277799543 0.446198686531682 -0.0529544969784158 0.0274383708384906 0.0580824521698721 NA NA 0.0469216512773259 0.259078111755498 89 21 890 0.89 0.089 0.178 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA:GGTGTTCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.33333333333337 3 33.416666666666664 0.0426655308015385 0.0956200277799543 0.446198686531682 -0.0529544969784158 0.0249929048144571 0.056295453751302 NA NA 0.0489243177682459 0.279085582433878 91 10 899 0.899 0.091 0.182 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000004 3 32.75 0.0422647024133488 0.0976988961284261 0.432601637154543 -0.0554341937150773 0.0257831171927311 0.0588066640325778 NA NA 0.0495886246687027 0.263617714166048 79 12 909 0.909 0.079 0.158 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.33333333333337 3 33.416666666666664 0.0426655308015385 0.0956200277799543 0.446198686531682 -0.0529544969784158 0.0260760400898088 0.0588333139368193 NA NA 0.0481140947062955 0.271069660269562 92 9 899 0.899 0.092 0.184 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.1666666666667 3 33.583333333333336 0.0427669289697661 0.0951140793534504 0.449638258189319 -0.0523471503836843 0.026278061057274 0.0584599072432567 NA NA 0.0483227463344102 0.27868337254479 99 20 881 0.881 0.099 0.198 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.1666666666667 3 33.916666666666664 0.0433855884614561 0.0941180977157371 0.460969670174303 -0.0507325092542809 0.026414262143966 0.0572344341488885 NA NA 0.049242821461926 0.302891782779813 96 12 892 0.892 0.096 0.192 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGC:ACCAATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.83333333333337 3 33.916666666666664 0.0429711784958646 0.0941180977157371 0.456566585372874 -0.0511469192198725 0.0261641570467372 0.0558395461704804 NA NA 0.0465302323862277 0.271672518432753 111 15 874 0.874 0.111 0.222 N all ss13 79 AGC ATA GCT 2 AATAGCTCT:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.83333333333337 3 33.916666666666664 0.0429711784958646 0.0941180977157371 0.456566585372874 -0.0511469192198725 0.025574051557404 0.0565888703728694 NA NA 0.0456995312748383 0.263054789832222 101 15 884 0.884 0.101 0.202 N all ss13 80 GGT GCT CTA 2 AGCTCTAAA:AGTGGTCCA 1:1 TRUE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.00000000000003 3 33.75 0.0428688103799615 0.094613463995175 0.453094185222387 -0.0517446536152135 0.0258695672044293 0.059040979846372 NA NA 0.0459287819831564 0.259899778756094 90 20 890 0.89 0.09 0.18 N all ss13 81 AAA CTA AAG 2 GGTCCAGAT:TCTAAAGAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.83333333333337 2 32.91666666666666 0.0279752710599065 0.0633621979772033 0.441513583066856 -0.0353869269172968 0.0197369850910469 0.0493868726039729 NA NA 0.0431853869909822 0.412547394422286 150 58 792 0.792 0.15 0.3 N all ss13 82 GAT AAG ATG 2 AAAGATGAC:CCAGATGAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000004 1 32.91666666666666 0.0138732279313668 0.0310121698640216 0.447347863506372 -0.0171389419326549 0.0140287384270278 0.0344776679691251 NA NA 0.0367672113134893 0.641109958406928 253 129 618 0.618 0.253 0.506 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.58333333333339 2 33.58333333333333 0.0141014729867999 0.0620508745044359 0.227256635775404 -0.047949401517636 0.0146823968413563 0.047620996276153 NA NA 0.0517047794874906 0.353735061905315 129 49 822 0.822 0.129 0.258 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.91666666666671 2 34.58333333333333 0.0142353027918889 0.0601826482875393 0.236535001315925 -0.0459473454956503 0.014365370776568 0.0461358046918148 NA NA 0.0509594687914716 0.367245527782222 139 37 824 0.824 0.139 0.278 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.91666666666671 2 34.91666666666666 0.0144408793426023 0.059584670169267 0.242358970882593 -0.0451437908266647 0.0152286714927253 0.0459428091609278 NA NA 0.0477500892224463 0.344445548541028 155 44 801 0.801 0.155 0.31 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000004 2 34.58333333333332 0.0144757207777853 0.0601826482875393 0.240529807007222 -0.0457069275097539 0.0152689667948309 0.0456452663408006 NA NA 0.0483379984193259 0.344368306981374 145 43 812 0.812 0.145 0.29 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.41666666666671 2 34.91666666666666 0.0145459104801299 0.059584670169267 0.244121691683584 -0.0450387596891371 0.0144484711546111 0.0461836278312435 NA NA 0.0487563510151599 0.355615633886517 132 33 835 0.835 0.132 0.264 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA:TACTACCGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000004 2 35.249999999999986 0.0144757207777853 0.0589984642956841 0.245357586008289 -0.0445227435178988 0.0149942379124498 0.0457075956350016 NA NA 0.046129625639429 0.334461703387639 136 41 823 0.823 0.136 0.272 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA:TACCGTAGA 1:1 FALSE 1 1 0.75 0.25 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.25000000000004 2 34.749999999999986 0.0143716972336231 0.0598821656332629 0.239999623955483 -0.0455104683996398 0.01425862520542 0.0447210378428012 NA NA 0.0488300870686199 0.351327770203204 136 47 817 0.817 0.136 0.272 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT:CGTAGAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.91666666666671 2 34.33333333333332 0.0142353027918889 0.0606390724718212 0.23475462621075 -0.0464037696799322 0.0148387297252536 0.0472064432982857 NA NA 0.0473943572542642 0.327531046040996 134 41 825 0.825 0.134 0.268 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.25000000000004 2 34.499999999999986 0.0145812612109391 0.0603340239140544 0.241675596371793 -0.0457527627031153 0.01463415347171 0.0472466188585605 NA NA 0.0484619209055909 0.345119991966156 153 35 812 0.812 0.153 0.306 N all ss13 92 ACC CTA CCA 2 GCTACCAGA:GCTACCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.58333333333339 2 33.83333333333332 0.0145107307483395 0.0615730216404005 0.23566702366964 -0.047062290892061 0.0137940062573936 0.0463305044638994 NA NA 0.0489728959540637 0.336558965875254 142 43 815 0.815 0.142 0.284 N all ss13 93 AGA CCA GAC 2 ACCAGACGA:ACCCGACGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.75000000000004 2 33.66666666666665 0.0144757207777853 0.0618907677660027 0.23389143971384 -0.0474150469882174 0.0147429676578636 0.0474451628414112 NA NA 0.0490293103977524 0.333506270542166 131 46 823 0.823 0.131 0.262 N all ss13 94 CGA GAC GAA 2 AGACGAATT:CGACGAGTT 1:1 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.83333333333339 2 33.749999999999986 0.0144582790694273 0.0617314855970427 0.234212394689558 -0.0472732065276154 0.0149009441848012 0.047859204642971 NA NA 0.0510600892856318 0.354531849466856 131 54 815 0.815 0.131 0.262 N all ss13 95 ATT GAA TTC 2 CGAATTCGT:CGAGTTCGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.00000000000006 2 34.749999999999986 0.0144235214459156 0.0598821656332629 0.240865060463074 -0.0454586441873472 0.0148958886837149 0.0445154444492498 NA NA 0.0484203013163196 0.347815777761637 150 52 798 0.798 0.15 0.3 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 ATTCGTGGT:GTTCGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000006 1 34.749999999999986 0.0143202441116848 0.0293435958691742 0.488019402104988 -0.0150233517574894 0.0142808542169715 0.0298706780271335 NA NA 0.0332307744245672 0.651203042970484 310 137 553 0.553 0.31 0.62 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.50000000000006 1 35.41666666666665 0.0143202441116848 0.0287805096612114 0.49756742602042 -0.0144602655495266 0.0149951144112466 0.0302282482157303 NA NA 0.0325854230843586 0.657212600373588 290 133 577 0.577 0.29 0.58 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666673 1 35.749999999999986 0.0142861462280209 0.0285069944752382 0.501145297531457 -0.0142208482472174 0.0149331423432026 0.028811747946458 NA NA 0.0341845459012568 0.677408351709312 308 130 562 0.562 0.308 0.616 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.3333333333334 1 35.083333333333314 0.0141513632282871 0.0290593249318817 0.486981829807109 -0.0149079617035946 0.0141380814635237 0.0302624040630323 NA NA 0.0344413565227462 0.665123313153848 314 145 541 0.541 0.314 0.628 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666673 1 35.083333333333314 0.0142861462280209 0.0290593249318817 0.491620031143503 -0.0147731787038609 0.0143987724560018 0.031036762723419 NA NA 0.0340251255307892 0.66415454063116 312 118 570 0.57 0.312 0.624 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666673 1 35.083333333333314 0.0142861462280209 0.0290593249318817 0.491620031143503 -0.0147731787038609 0.0145095415470087 0.029104966597018 NA NA 0.0329762329866877 0.654156997559516 316 135 549 0.549 0.316 0.632 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.66666666666673 1 35.083333333333314 0.0142861462280209 0.0290593249318817 0.491620031143503 -0.0147731787038609 0.0148815817365097 0.0293576440434885 NA NA 0.0330200052442322 0.654585655853378 298 127 575 0.575 0.298 0.596 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.00000000000006 1 35.749999999999986 0.0142184353084605 0.0285069944752382 0.498770058724043 -0.0142885591667777 0.0143804780475864 0.0281020523743654 NA NA 0.0326685071167189 0.661835619119171 304 137 559 0.559 0.304 0.608 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.50000000000006 2 36.91666666666665 0.0289192452027622 0.0562324166616758 0.51428067509095 -0.0273131714589136 0.0210815625904783 0.041167466185896 NA NA 0.0348753262717225 0.433529609572639 218 48 734 0.734 0.218 0.436 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.16666666666673 2 37.249999999999986 0.0290593249318816 0.0557100557871529 0.521617229085291 -0.0266507308552712 0.0212061159035894 0.0394909732962867 NA NA 0.0352178181007877 0.449205659338462 201 48 751 0.751 0.201 0.402 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.16666666666673 2 37.91666666666666 0.0290593249318816 0.054693929928504303 0.53130804405293 -0.0256346049966227 0.0209161502303578 0.0402800274667274 NA NA 0.0333779898554404 0.442481688731448 237 40 723 0.723 0.237 0.474 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.16666666666673 2 37.249999999999986 0.0290593249318816 0.0557100557871529 0.521617229085291 -0.0266507308552712 0.0205641171578256 0.0404671491965924 NA NA 0.0335358823968909 0.426792107562855 226 50 724 0.724 0.226 0.452 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.16666666666673 2 37.249999999999986 0.0290593249318816 0.0557100557871529 0.521617229085291 -0.0266507308552712 0.0209824101921438 0.0381749966234599 NA NA 0.0355006088697949 0.452826037383243 203 46 751 0.751 0.203 0.406 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333339 2 37.41666666666665 0.044076328753575 0.0554524994575897 0.794848369049348 -0.0113761707040147 0.0264746489769934 0.0407782867112213 NA NA 0.0374953303744259 0.761583268109237 411 10 579 0.579 0.411 0.822 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.41666666666671 2 38.08333333333332 0.0451830456487546 0.0544456664773409 0.829874048241448 -0.00926262082858634 0.0272632515301799 0.0396374134690286 NA NA 0.0374389000651172 0.804593776544054 403 15 582 0.582 0.403 0.806 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTTTAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.91666666666671 2 37.08333333333332 0.0448452368647073 0.0559700169039056 0.801236793294196 -0.0111247800391983 0.0271846615979099 0.0419668229195122 NA NA 0.0392851664793269 0.777038730135712 408 8 584 0.584 0.408 0.816 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTATTAC:TTTTACTAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000006 2 36.249999999999986 0.0449572769752751 0.0573071018565008 0.784497479698936 -0.0123498248812257 0.025877270802517 0.041673805551361597 NA NA 0.0399186615341589 0.757036495494492 393 19 588 0.588 0.393 0.786 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTATCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.08333333333339 2 35.91666666666665 0.0447337539717067 0.0578600049104132 0.77313774931353 -0.0131262509387065 0.0268842880717675 0.041780057156074 NA NA 0.0408845043013848 0.74816729499219 393 13 594 0.594 0.393 0.786 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA:TATCTAGGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.58333333333339 2 35.41666666666665 0.0444026073250892 0.0587096677913667 0.756308270775441 -0.0143070604662776 0.0268889184994214 0.0435212045395375 NA NA 0.0417150698651471 0.731620254701561 355 12 633 0.633 0.355 0.71 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.0833333333334 2 35.91666666666665 0.0434379525548368 0.0578600049104132 0.750742289463911 -0.0144220523555765 0.0262156008742612 0.0419110586241912 NA NA 0.0414818649384867 0.728087080995619 385 13 602 0.602 0.385 0.77 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGA:GGAACTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.5833333333334 2 36.41666666666665 0.0431256509016318 0.0570345959917882 0.756131434819683 -0.0139089450901564 0.0264487864556199 0.0398991078617528 NA NA 0.0408395825902568 0.733423474196133 392 13 595 0.595 0.392 0.784 N all ss13 117 GGA CTG GAC 2 ACTGGACCA:ACTGGCCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.91666666666674 2 36.08333333333332 0.0429199333819239 0.0575822255219405 0.745367741397388 -0.0146622921400167 0.0248171551999984 0.0405607502670651 NA NA 0.0402241866380272 0.715473980608959 383 14 603 0.603 0.383 0.766 N all ss13 118 CCA GAC CAG 2 GGACCAGAA:GGCCCAGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.5833333333334 2 35.41666666666665 0.0425143321315747 0.0587096677913667 0.724145336380637 -0.016195335659792 0.0247248778885688 0.0443683933042419 NA NA 0.0374923533597532 0.665767796601308 379 19 602 0.602 0.379 0.758 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.5833333333334 2 34.749999999999986 0.0419201068148284 0.0598821656332629 0.700043266163088 -0.0179620588184345 0.0249578087437769 0.0434043059644102 NA NA 0.0422520499266171 0.670751487383717 360 14 626 0.626 0.36 0.72 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTGGA:GAAGCTTCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666674 2 34.749999999999986 0.0423143935004423 0.0598821656332629 0.70662764201931 -0.0175677721328206 0.0253307869479105 0.044711400069098003 NA NA 0.0417453372070217 0.673877791107701 329 14 657 0.657 0.329 0.658 N all ss13 121 GGA CTG CAC 2 GCTGGACTT:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.5833333333334 2 34.749999999999986 0.0419201068148284 0.0598821656332629 0.700043266163088 -0.0179620588184345 0.0247488657790602 0.04204798631749 NA NA 0.0421515749504256 0.670012979578985 324 23 653 0.653 0.324 0.648 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 GGACTTCCC:TCACTTCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000007 2 34.08333333333332 0.0274316291149154 0.0611024764460933 0.448944637114938 -0.0336708473311779 0.0206455885936088 0.0424400603288493 NA NA 0.0380708054716828 0.376465766480581 157 39 804 0.804 0.157 0.314 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.25000000000007 2 34.749999999999986 0.0274316291149154 0.0598821656332629 0.458093471149913 -0.0324505365183475 0.0205503143017157 0.0444937577984933 NA NA 0.0378902799297057 0.391757582270869 150 47 803 0.803 0.15 0.3 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.5833333333334 2 35.41666666666665 0.0276848040229394 0.0587096677913667 0.471554431568602 -0.0310248637684273 0.0205235814380693 0.041232496704511 NA NA 0.0372930320785348 0.405453428111985 164 44 792 0.792 0.164 0.328 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.5833333333334 2 35.41666666666665 0.0276848040229394 0.0587096677913667 0.471554431568602 -0.0310248637684273 0.0202642573666428 0.0422374886569676 NA NA 0.0379696675272285 0.413873563995835 192 44 764 0.764 0.192 0.384 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.0833333333334 2 35.58333333333332 0.0274944876870935 0.0584236862456271 0.470605150991332 -0.0309291985585336 0.0194500536353398 0.0424450927678821 NA NA 0.0372348939851915 0.406170865958001 182 47 771 0.771 0.182 0.364 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000007 2 34.66666666666666 0.0271522864979704 0.0600320307551524 0.452296651577792 -0.0328797442571819 0.0185806141896871 0.0422716376852414 NA NA 0.0391786676445637 0.40134267559236 157 58 785 0.785 0.157 0.314 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.3333333333334 2 34.33333333333332 0.0270299523623976 0.0606390724718212 0.445751415062596 -0.0336091201094236 0.0194630725064197 0.0437479087934108 NA NA 0.0385665925032611 0.383504772213219 172 50 778 0.778 0.172 0.344 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.3333333333334 2 33.83333333333332 0.0270299523623976 0.0615730216404005 0.438990188272036 -0.0345430692780029 0.0195059762234229 0.0434952272993941 NA NA 0.0403088351838095 0.391466855872454 154 48 798 0.798 0.154 0.308 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.8333333333334 2 33.66666666666666 0.0272138698048233 0.0618907677660027 0.439708066115996 -0.0346768979611794 0.0193088949426334 0.0445472831161412 NA NA 0.0392877718891786 0.377431648850975 149 51 800 0.8 0.149 0.298 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.16666666666673 2 34.33333333333332 0.0274630224286674 0.0606390724718212 0.452893181066208 -0.0331760500431538 0.0193548818938673 0.0432107871693244 NA NA 0.0365729568769697 0.364343496071796 139 42 819 0.819 0.139 0.278 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.5833333333334 2 34.33333333333332 0.0273067703935705 0.0606390724718212 0.450316426034714 -0.0333323020782506 0.0197390693804601 0.0429622446654889 NA NA 0.0371072541661514 0.369042069322826 161 53 786 0.786 0.161 0.322 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.0833333333334 1 34.33333333333332 0.0271215992572094 0.0297068535712844 0.912974482205884 -0.00258525431407499 0.0185389602758867 0.0316065938528859 NA NA 0.0212153212536272 0.903011564788249 400 130 470 0.47 0.4 0.8 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75000000000007 1 33.66666666666666 0.0272447663451876 0.0303071537534075 0.898954965116921 -0.0030623874082199 0.0191076495851424 0.0315833430876998 NA NA 0.0218966934711179 0.888773642086243 351 136 513 0.513 0.351 0.702 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.0833333333334 1 33.33333333333333 0.0271215992572094 0.0306164958901914 0.88584922828802 -0.00349489663298199 0.0189733662878331 0.0312280806640748 NA NA 0.0223625109144033 0.875809379801045 377 112 511 0.511 0.377 0.754 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666673 1 33.99999999999999 0.0273690573365762 0.0300040009602743 0.912180257986698 -0.00263494362369817 0.019680182173478 0.0298790041884529 NA NA 0.0223287029893704 0.906062098311939 359 132 509 0.509 0.359 0.718 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.41666666666673 1 33.99999999999999 0.0273690573365762 0.0300040009602743 0.912180257986698 -0.00263494362369817 0.0191908067759316 0.0284709221822233 NA NA 0.0218729245181177 0.904114015204526 355 152 493 0.493 0.355 0.71 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.0833333333334 1 33.666666666666664 0.0274944876870935 0.0303071537534075 0.907194648194315 -0.00281266606631397 0.0193628285401091 0.0297820359494237 NA NA 0.0225905565790199 0.900914431731816 364 126 510 0.51 0.364 0.728 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTA:GGAGCCTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.5833333333334 1 34.166666666666664 0.0276848040229394 0.0298546878003148 0.927318490419702 -0.00216988377737538 0.0200559484214246 0.0292698361077234 NA NA 0.0213532531851354 0.919059560810056 379 145 476 0.476 0.379 0.758 N all ss13 140 TTA CCT TAA 2 GCCTTAAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.5833333333334 1 34.166666666666664 0.0276848040229394 0.0298546878003148 0.927318490419702 -0.00216988377737538 0.0195475042859259 0.0301656535483749 NA NA 0.0219131762120482 0.921120902386702 377 132 491 0.491 0.377 0.754 N all ss13 141 AAC TAA ACA 2 TTAAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 1 33.83333333333333 0.0270604324233619 0.0301548153585304 0.897383456062414 -0.00309438293516844 0.018685092170163 0.0311201693555065 NA NA 0.0224268605888268 0.890258877222476 368 120 512 0.512 0.368 0.736 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCG:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000007 1 34.83333333333333 0.0270604324233619 0.0292720079293014 0.924447427341474 -0.0022115755059395 0.0191978176588363 0.0302928394837807 NA NA 0.0212975913237288 0.917295069765349 372 127 501 0.501 0.372 0.744 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.0833333333334 1 35 0.0271215992572094 0.0291298749871979 0.931057866507455 -0.00200827572998854 0.0199541909240034 0.0313848337737073 NA NA 0.0213232461727617 0.924964219580081 415 129 456 0.456 0.415 0.83 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.00000000000006 2 35.416666666666664 0.0411061773712463 0.0587096677913667 0.700160278837261 -0.0176034904201204 0.0235682804479856 0.0434880388254293 NA NA 0.0278712373436294 0.527647889928105 229 45 726 0.726 0.229 0.458 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.00000000000006 2 35.416666666666664 0.0553246126797068 0.0587096677913667 0.942342458422875 -0.00338505511165994 0.0287512505585714 0.0409999862533641 NA NA 0.0312383976010257 0.913708546477994 435 11 554 0.554 0.435 0.87 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 2 35.916666666666664 0.0570345959917882 0.0578600049104132 0.985734378697288 -8.25408918624995e-4 0.0290265374269664 0.0421215867208643 NA NA 0.0316184292024611 0.979173341170113 465 8 527 0.527 0.465 0.93 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 2 35.416666666666664 0.0570345959917882 0.0587096677913667 0.971468552580964 -0.00167507179957847 0.0285425348732774 0.0433256702057688 NA NA 0.0311366147065303 0.957096507235762 451 15 534 0.534 0.451 0.902 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000006 2 34.416666666666664 0.0561009098120237 0.0604861633757489 0.927499888917019 -0.00438525356372515 0.027966500627842 0.0426458595232405 NA NA 0.0309769641176671 0.887423623614835 439 21 540 0.54 0.439 0.878 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000006 2 34.916666666666664 0.0573071018565008 0.059584670169267 0.961775934878954 -0.00227756831276613 0.0299132873988625 0.0448889414031117 NA NA 0.0327008848272926 0.944473415309607 480 23 497 0.497 0.48 0.96 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666673 2 34.25 0.0567646707244322 0.0607927570603562 0.933740686708372 -0.004028086335924 0.0297977289113869 0.0431362531631078 NA NA 0.0340794153891557 0.905911528002509 415 19 566 0.566 0.415 0.83 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000006 2 34.41666666666667 0.0568993130810351 0.0604861633757488 0.940699656011712 -0.00358685029471367 0.0281219251651738 0.0450046389500911 NA NA 0.0309238198997007 0.907660558778833 434 21 545 0.545 0.434 0.868 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT:AATCCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666671 2 34.083333333333336 0.0571705240409132 0.0611024764460933 0.935649868321639 -0.00393195240518007 0.0290183958192155 0.0433023486081622 NA NA 0.032650857225712 0.90414714525154 450 19 531 0.531 0.45 0.9 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC:CCTGCTAAC 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333339 2 34.083333333333336 0.0566306643811088 0.0611024764460933 0.926814552779548 -0.00447181206498447 0.0280635288141054 0.0438462286661627 NA NA 0.0321026002702644 0.889215062777892 422 20 558 0.558 0.422 0.844 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT:GCTAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.83333333333339 1 33.916666666666664 0.0417741375922484 0.0300792190929219 1.38880392683062 0.0116949184993265 0.0238159860923599 0.0310974824062523 NA NA 0.0272301838313324 0.667571296396122 625 46 329 0.329 0.625 0.658 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.66666666666673 1 33.75 0.0418713371647063 0.0302307926160697 1.3850558831345 0.0116405445486366 0.0253105735253029 0.0302642794324503 NA NA 0.0269436391991627 0.665717340595622 645 51 304 0.304 0.645 0.608 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCA:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.00000000000006 1 33.75 0.0422647024133488 0.0302307926160697 1.39806795508505 0.0120339097972792 0.0240972682034345 0.0307092086052369 NA NA 0.027887011687835 0.666087536962735 667 39 294 0.294 0.667 0.588 N all ss13 157 GCA CTG CAA 2 GCTGCAATC:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.33333333333339 1 33.75 0.0566306643811088 0.0302307926160697 1.87327752534698 0.0263998717650391 0.0280728354333827 0.030236667880046 NA NA 0.0308847294575794 0.39266895934768 801 17 182 0.182 0.801 0.364 N all ss13 158 ACC CAA CCG 2 GCAATCGTG:GCCACCGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000006 1 33.583333333333336 0.0564972895530331 0.0303839016876759 1.85944814243357 0.0261133878653572 0.0276828978993026 0.0311613985060047 NA NA 0.0306528600379341 0.394265678240568 799 13 188 0.188 0.799 0.376 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.5833333333334 1 34.25 0.0425143321315747 0.0297805871963345 1.42758542171417 0.0127337449352402 0.0238204050096405 0.0312715493161221 NA NA 0.0270675927279876 0.638038933921143 647 55 298 0.298 0.647 0.596 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666673 1 34.416666666666664 0.0426150118597228 0.0296334842053817 1.43806956901759 0.0129815276543411 0.0244456499639051 0.0312700998266639 NA NA 0.026249551496449 0.620922861566232 679 48 273 0.273 0.679 0.546 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000006 1 34.916666666666664 0.0427161696956043 0.0292007684815911 1.46284402489385 0.0135154012140132 0.0240354730037616 0.029753169413418 NA NA 0.0245879316059464 0.582541472546824 684 51 265 0.265 0.684 0.53 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000006 1 35.25 0.0421163271222965 0.0289192452027623 1.45634254376299 0.0131970819195343 0.0242870817400928 0.0304098316006768 NA NA 0.0257863920587697 0.608801672452414 668 43 289 0.289 0.668 0.578 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.25000000000006 1 35.25 0.0421163271222965 0.0289192452027623 1.45634254376299 0.0131970819195343 0.0245760445648978 0.0304606685745117 NA NA 0.0253712851600488 0.602953319373048 667 41 292 0.292 0.667 0.584 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.91666666666671 2 35.916666666666664 0.0423143935004423 0.0578600049104132 0.73132371084239 -0.0155456114099709 0.0243156479727682 0.0415678072735753 NA NA 0.0404480379571477 0.700729899961767 361 15 624 0.624 0.361 0.722 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.58333333333337 3 35.916666666666664 0.0572387314369154 0.0885548256923263 0.646364904333784 -0.0313160942554109 0.0291635970274834 0.0520014022797363 NA NA 0.0439569266601617 0.47620050147543 242 3 755 0.755 0.242 0.484 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.91666666666671 3 35.583333333333336 0.0569668741816511 0.0894358561096487 0.63695788981781 -0.0324689819279976 0.0285961481688017 0.0521937220336721 NA NA 0.0457847775407512 0.47822181705607 217 5 778 0.778 0.217 0.434 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25000000000004 3 36.25 0.0575131971253351 0.0876910035441767 0.655862001811409 -0.0301778064188416 0.0293377329529563 0.0516046648714138 NA NA 0.042603247063652 0.478730901809694 228 7 765 0.765 0.228 0.456 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.25000000000004 3 36.916666666666664 0.0726080462723539 0.0860130038580103 0.844151965582028 -0.0134049575856564 0.0310030751526423 0.0508137666357045 NA NA 0.0464260691638084 0.772782091363362 410 1 589 0.589 0.41 0.82 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.91666666666671 3 37.916666666666664 0.0740428162575334 0.0836131751312666 0.885540061614591 -0.00957035887373323 0.0322763112602138 0.0510452352514173 NA NA 0.0450929062992074 0.83192256241875 430 2 568 0.568 0.43 0.86 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.41666666666671 3 38.416666666666664 0.0745955951479784 0.0824628375267119 0.904596511414187 -0.0078672423787334 0.0327313382090192 0.0488235342427139 NA NA 0.0426712059884745 0.853724082896721 429 2 569 0.569 0.429 0.858 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.08333333333337 3 39.083333333333336 0.0761108787135566 0.0809774510729235 0.939902129606619 -0.00486657235936688 0.0324900928837312 0.0494579933993957 NA NA 0.0429611893988044 0.909809886291773 462 1 537 0.537 0.462 0.924 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.75000000000003 3 39.41666666666667 0.0764993759663411 0.0802546646756371 0.953207844996005 -0.00375528870929606 0.0349293660187709 0.0476578636026008 NaN NaN 0.0454127486286374 0.934096136246594 486 1 513 0.513 0.486 0.972 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.41666666666669 3 39.083333333333336 0.076891863117256 0.0809774510729235 0.949546597212744 -0.00408558795566749 0.0338794369965283 0.0496864868095289 NA NA 0.0431784018706316 0.924615788283337 455 4 541 0.541 0.455 0.91 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.00000000000001 3 38.083333333333336 0.0762076323080868 0.0832261761385522 0.915669033997416 -0.00701854383046535 0.0344104940261007 0.0504888626576107 NA NA 0.0443388300201129 0.874225614397908 446 1 553 0.553 0.446 0.892 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.50000000000001 3 37.083333333333336 0.075630775763093 0.0856035011092873 0.883500964131567 -0.00997272534619434 0.0348338972029833 0.0515597642479938 NA NA 0.0465540820397305 0.830377009663312 415 1 584 0.584 0.415 0.83 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.00000000000001 3 36.41666666666667 0.0773881771764231 0.0872653886078579 0.886814101340684 -0.00987721143143482 0.033634189017123 0.0504932617032659 NA NA 0.0440051070885801 0.822402480650326 414 3 583 0.583 0.414 0.828 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.08333333333336 3 36.00000000000001 0.0772884020029997 0.0883372767422875 0.874923982867148 -0.0110488747392879 0.0335906070854169 0.0511007669694652 NA NA 0.047669842256753 0.816709564707443 423 1 576 0.576 0.423 0.846 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.91666666666669 3 35.75000000000001 0.0774882105210195 0.088993157850987 0.870720990154864 -0.0115049473299675 0.0373249468604474 0.0525317804436474 NA NA 0.0478513487972618 0.809996153438489 412 1 587 0.587 0.412 0.824 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.58333333333336 3 35.583333333333336 0.079124691033921 0.0894358561096487 0.884708823460178 -0.0103111650757277 0.0344630883512654 0.0530203674573912 NA NA 0.0483674837032952 0.831183585773934 441 1 558 0.558 0.441 0.882 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.58333333333336 3 35.25000000000001 0.079124691033921 0.0903346148069003 0.875906663276954 -0.0112099237729793 0.034617236382362 0.0544887690427929 NA NA 0.0511785494966463 0.826622324203254 430 2 568 0.568 0.43 0.86 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 67.25000000000003 3 35.25000000000001 0.078297893052322 0.0903346148069003 0.8667540479327 -0.0120367217545783 0.0342259927252037 0.0518594209904814 NA NA 0.0479883879351692 0.801948858653089 401 1 598 0.598 0.401 0.802 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.91666666666669 3 34.91666666666667 0.0787091188409977 0.0912516429860269 0.862550155431724 -0.0125425241450292 0.0343764460655107 0.0534466774792576 NA NA 0.0496608135761402 0.800605301074847 414 4 582 0.582 0.414 0.828 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAAGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 66.91666666666669 3 34.91666666666667 0.0787091188409977 0.0912516429860269 0.862550155431724 -0.0125425241450292 0.0349084120474881 0.0557754241072953 NA NA 0.0493120429759195 0.799225080924709 428 1 571 0.571 0.428 0.856 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT:GCTTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 67.58333333333334 3 34.91666666666667 0.094489133566054 0.0912516429860269 1.03547871001646 0.00323749058002708 0.0380532135131312 0.0523121411602095 NaN NaN 0.052464940872063 0.950795611766943 543 1 456 0.456 0.543 0.912 N all ss13 185 TCA CTT CAC 2 TCTTCACGC:TCTTCTCGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.25000000000001 3 34.91666666666667 0.0935061462707286 0.0912516429860269 1.02470644046428 0.00225450328470168 0.0372356244941043 0.0529325001180414 NaN NaN 0.0512330363733301 0.964900519140021 515 1 484 0.484 0.515 0.968 N all ss13 186 CGC CAC GCT 2 TCACGCTCC:TCTCGCTCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.91666666666669 3 34.25000000000001 0.0925434264554346 0.0931427851735378 0.993565162164879 -5.99358718103252e-4 0.0357033301583593 0.055353445108355 NaN NaN 0.0511649841214432 0.990653605412806 492 3 505 0.505 0.492 0.984 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.58333333333336 3 34.583333333333336 0.0930222923576628 0.092187504132096 1.00905532949857 8.34788225566777e-4 0.037360835205455 0.0551499198388561 NA NA 0.0494176945595701 0.986522378950022 521 1 478 0.478 0.521 0.956 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 68.58333333333336 3 34.583333333333336 0.0930222923576628 0.092187504132096 1.00905532949857 8.34788225566777e-4 0.0365122906497151 0.0539315175828316 NA NA 0.0524847406951324 0.987309901021945 532 0 468 0.468 0.532 0.936 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.25000000000003 3 34.583333333333336 0.0920694717319586 0.092187504132096 0.998719648598271 -1.18032400137413e-4 0.0369106310995259 0.0553950677572582 NaN NaN 0.0508508667914745 0.998147993316134 494 2 504 0.504 0.494 0.988 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.25000000000003 3 34.583333333333336 0.0920694717319586 0.092187504132096 0.998719648598271 -1.18032400137413e-4 0.0374641463150984 0.0554062924584253 NaN NaN 0.0504677266199698 0.998133933303584 505 3 492 0.492 0.505 0.984 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 69.25000000000003 3 35.25000000000001 0.0920694717319586 0.0903346148069003 1.01920478577084 0.0017348569250583 0.03736058368511 0.0520688282476105 NaN NaN 0.0494737010312081 0.972026917378645 512 1 487 0.487 0.512 0.974 N all ss13 192 CGC GTC GCA 2 AGTCGCAAC:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 70.25000000000003 3 34.25000000000001 0.0906763296517786 0.0931427851735378 0.973519628845499 -0.00246645552175927 0.0381318208045916 0.0513958115485839 NA NA 0.0517857724996883 0.962012674264232 487 2 511 0.511 0.487 0.974 N all ss13 193 AAC GCA ACA 2 CGCAACAGT:CGCGGTAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.9166666666667 3 33.25000000000001 0.0884459172871288 0.0961313950679982 0.920052364002071 -0.00768547778086942 0.0349539902783058 0.05545188131569 NaN NaN 0.051366090246315 0.88106314767318 423 1 576 0.576 0.423 0.846 N all ss13 194 AAT ACA ATT 2 AACAGTTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.08333333333336 2 32.41666666666667 0.071739235186476 0.0643826713791053 1.11426310294043 0.00735656380737061 0.0317331274645547 0.0471758604180203 NA NA 0.0497411829678664 0.88242418164351 602 0 398 0.398 0.602 0.796 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AGTTCAAGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.08333333333336 2 31.750000000000004 0.0568319121182793 0.0657955896932053 0.86376476574308 -0.00896367757492601 0.0281570672514293 0.046731864962496 NA NA 0.0464451978780935 0.846963109676093 429 4 567 0.567 0.429 0.858 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAC:TCAAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333337 2 31.91666666666667 0.0556454425645553 0.0654365742860851 0.850372183624352 -0.00979113172152979 0.0279720050846942 0.0489237092239368 NA NA 0.0479416601070704 0.838173663188277 444 7 549 0.549 0.444 0.888 N all ss13 197 AAC GAA ACT 2 AGAAACTCA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000003 2 32.083333333333336 0.0559047993353385 0.0650814580158656 0.858997340251812 -0.00917665868052712 0.0276680544930134 0.0475959375737801 NA NA 0.0447846089754707 0.837645155746113 438 6 556 0.556 0.438 0.876 N all ss13 198 TCA ACT CAA 2 AACTCAACT:AATTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.9166666666667 2 32.75000000000001 0.0569668741816511 0.0636987401522852 0.894317125353811 -0.00673186597063412 0.028538253509064 0.04843213838082 NA NA 0.0484083909136414 0.889399551165157 450 9 541 0.541 0.45 0.9 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCA:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.4166666666667 2 33.25 0.0565638983071325 0.0626996766264699 0.902140191952009 -0.00613577831933743 0.028220727978655 0.0456779295283933 NA NA 0.0465214241061883 0.895070147415605 460 7 533 0.533 0.46 0.92 N all ss13 200 CCA CTC CAG 2 ACTCCAGGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.9166666666667 2 34.41666666666667 0.0569668741816511 0.0604861633757488 0.941816623874201 -0.00351928919409771 0.0286889612056229 0.0442446030781857 NA NA 0.0442911105121359 0.93666822691808 530 4 466 0.466 0.53 0.932 N all ss13 201 GGC CAG GCA 2 CCAGGCAGC:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000003 2 33.75 0.0559047993353385 0.0617314855970427 0.905612408232998 -0.00582668626170422 0.0281687008594908 0.0441874577064482 NA NA 0.0456209498172787 0.898370934089507 457 4 539 0.539 0.457 0.914 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.25000000000003 2 33.75 0.0559047993353385 0.0617314855970427 0.905612408232998 -0.00582668626170422 0.0278595463271241 0.0445775208102362 NA NA 0.0438051125287199 0.894182434435276 464 5 531 0.531 0.464 0.928 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.25000000000003 2 34.08333333333333 0.0566975883332357 0.0611024764460933 0.927909826752379 -0.00440488811285754 0.0283982078568138 0.0440089089437866 NA NA 0.0446128778905268 0.921348044795328 479 3 518 0.518 0.479 0.958 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25000000000003 2 34.41666666666666 0.0575131971253351 0.0604861633757489 0.950848820879161 -0.00297296625041377 0.0276093636333719 0.042610446661141 NA NA 0.0473943385622639 0.949982862248549 476 4 520 0.52 0.476 0.952 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.91666666666669 2 35.08333333333332 0.0577903089878649 0.0592901175479514 0.974703903076706 -0.00149980856008648 0.0283818452561048 0.0412235089853557 NA NA 0.0435287695856716 0.972513871432152 511 4 485 0.485 0.511 0.97 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAACTTCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.58333333333336 2 34.41666666666666 0.0572387314369155 0.0604861633757489 0.946311160146498 -0.00324743193883335 0.0271129114595395 0.0423730215181374 NA NA 0.0438682153329718 0.940988909242013 485 10 505 0.505 0.485 0.97 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:ACTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.91666666666669 2 34.74999999999999 0.0429199333819239 0.0598821656332629 0.716739832770561 -0.016962232251339 0.0243406643608198 0.0452158946657796 NA NA 0.042275905470243 0.688253046881986 363 12 625 0.625 0.363 0.726 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666669 2 34.91666666666666 0.0426150118597228 0.059584670169267 0.715200935721603 -0.0169696583095442 0.0252390941485622 0.0418918015980841 NA NA 0.0415406555564416 0.682901320526505 341 20 639 0.639 0.341 0.682 N all ss13 209 GCT CTG CTA 2 CCTGCTAGA:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.91666666666669 2 34.08333333333333 0.0417257068817799 0.0611024764460933 0.682880781740357 -0.0193767695643133 0.0242940871883974 0.0453900917947584 NA NA 0.0436760769299959 0.657297669474308 318 18 664 0.664 0.318 0.636 N all ss13 210 AGA CTA GAA 2 GCTAGAATG:GCTCGAATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000003 2 33.24999999999999 0.0412475068105866 0.0626996766264699 0.657858365942084 -0.0214521698158833 0.0232196860133517 0.0467932212309585 NA NA 0.0424570253578856 0.613370722295303 308 21 671 0.671 0.308 0.616 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 AGAATGGCT:CGAATGGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.4166666666667 2 33.74999999999999 0.0414374651394939 0.0617314855970427 0.67125332783954506 -0.0202940204575488 0.0230796666092095 0.0448485782469658 NA NA 0.0408101549802863 0.618992536211316 325 23 652 0.652 0.325 0.65 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATGGCTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.4166666666667 2 34.41666666666666 0.0420179878270026 0.0604861633757489 0.694671069910332 -0.0184681755487463 0.0237015740019506 0.0452205603928425 NA NA 0.0435268083657832 0.671351214742493 335 13 652 0.652 0.335 0.67 N all ss13 213 AGC CTA GCA 2 GCTAGCGGA:GCTGGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.9166666666667 2 34.58333333333332 0.0417257068817799 0.0601826482875393 0.693317892599605 -0.0184569414057593 0.024631441321899 0.0426664017198138 NA NA 0.0401398134387807 0.645648066132138 316 21 663 0.663 0.316 0.632 N all ss13 214 AAT GCA ATG 2 AGCGGAGGT:GGCAATGGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.25000000000004 1 33.91666666666666 0.0415331021017154 0.0300792190929219 1.38079057083928 0.0114538830087935 0.0241787556370019 0.030088872516139 NA NA 0.0260417832615052 0.660062310566469 651 47 302 0.302 0.651 0.604 N all ss13 215 GGC ATG GCG 2 AATGGCGGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333337 0 34.249999999999986 0.0276848040229394 0 -Inf 0.0276848040229394 0.0189506689072474 0 NA NA 0.0201587601554487 0.169647099156728 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 216 GGT GCG GTG 2 GGCGGTGAC:GGTGGTGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.58333333333337 0 35.24999999999999 0.0280734527889724 0 -Inf 0.0280734527889724 0.0198524680456543 0 NA NA 0.01974791205962 0.155145037599863 863 137 0 0 0.863 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT:GGTGACACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.58333333333337 0 35.24999999999999 0.0280734527889724 0 -Inf 0.0280734527889724 0.0191996731863088 0 NA NA 0.018993972440431 0.139402683782026 858 142 0 0 0.858 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC:GACACTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.08333333333337 0 34.74999999999999 0.0138093659583391 0 -Inf 0.0138093659583391 0.0138990461268075 0 NA NA 0.013968951655009 0.322870787278118 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC:ACTGCTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000004 0 33.74999999999999 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.0134969825677432 0 NA NA 0.0136410924847048 0.322389314945431 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG:GCTCTTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666671 0 33.08333333333332 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0133836436463725 0 NA NA 0.0134729285099677 0.320722139574818 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA:CTTGCTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000006 0 32.91666666666665 0.0132307731029257 0 -Inf 0.0132307731029257 0.0132110422760172 0 NA NA 0.01321549110247 0.316751215940552 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG:GCTTTGCTG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666673 0 33.249999999999986 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.0128945912115096 0 NA NA 0.0135444745186362 0.326510656492703 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 223 CTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0 0.75 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.5833333333334 0 33.58333333333332 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0131828270472348 0 NA NA 0.0128510175659562 0.298938306659153 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTA:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.66666666666673 0 34.58333333333332 0.013333684515963 0 -Inf 0.013333684515963 0.0134973756359222 0 NA NA 0.0127641021819123 0.296196890106193 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTAGAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.8333333333334 0 34.91666666666665 0.0133041182530361 0 -Inf 0.0133041182530361 0.0133521833238599 0 NA NA 0.0131937644496922 0.313279706709142 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTAGATAGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666673 0 35.58333333333332 0.0130722263514627 0 -Inf 0.0130722263514627 0.013021411941645 0 NA NA 0.0128548365129403 0.309195707131402 612 388 0 0 0.612 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG:GATAGGTTG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.16666666666673 0 35.91666666666665 0.0130722263514627 0 -Inf 0.0130722263514627 0.0132586848531636 0 NA NA 0.013541991077274 0.334389307773492 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC:AGGTTGAAC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000007 0 35.999999999999986 0.0131007697802931 0 -Inf 0.0131007697802931 0.0131478648469346 0 NA NA 0.0133477363799842 0.326347470607303 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.33333333333341 0 35.999999999999986 0.0128758527167741 0 -Inf 0.0128758527167741 0.0131406773687899 0 NA NA 0.012893118248813 0.317959001189008 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666674 0 36.999999999999986 0.0129873375085957 0 -Inf 0.0129873375085957 0.0131028024742376 0 NA NA 0.0125256852372539 0.299802763467976 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000007 0 36.999999999999986 0.0131007697802931 0 -Inf 0.0131007697802931 0.0131038967494068 0 NA NA 0.0134869773776424 0.33136684636421 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAAC:CTTGAGAGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.83333333333341 0 36.833333333333314 0.0129592857062641 0 -Inf 0.0129592857062641 0.0135362928757284 0 NA NA 0.0124846422767096 0.299261589329335 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 233 AAC AGA ACA 2 GAGAACAAA:GAGAGCAAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333341 0 35.833333333333314 0.0127934871784325 0 -Inf 0.0127934871784325 0.0128875396779647 0 NA NA 0.0123451057776124 0.300052608166838 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 234 AAA ACA AAG 2 AACAAAGTA:AGCAAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666676 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTA AAG TAT 2 AAAGTATCT:AAAGTTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666676 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TAT CTG 2 GTATCTGGC:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGC CTG GCA 2 TCTGGCAAA:TCTGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GCA AAG 2 GGCAAAGGC:GGTAAAGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666674 0 34.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666674 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666674 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA:CAACAACAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000007 0 35.91666666666665 0.0127256499425275 0 -Inf 0.0127256499425275 0.012871990537388 0 NA NA 0.0127664749189737 0.318860543240733 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC:CAACAGGGC 1:1 FALSE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666673 0 36.249999999999986 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0128804175761982 0 NA NA 0.0132068880963089 0.320686028941109 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA:CAGGGCCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666673 0 36.083333333333314 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0128407575389184 0 NA NA 0.0129295559278386 0.30080652059856 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.41666666666673 0 36.249999999999986 0.0133782811395161 0 -Inf 0.0133782811395161 0.0136206952097645 0 NA NA 0.0130304615009893 0.30456513577095 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666673 0 35.249999999999986 0.0132016609860952 0 -Inf 0.0132016609860952 0.0129250609655453 0 NA NA 0.0127141563785116 0.299110187287086 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.5833333333334 0 35.083333333333314 0.0131726767040262 0 -Inf 0.0131726767040262 0.0127528714233527 0 NA NA 0.0128679393977235 0.305985545336654 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666673 0 34.749999999999986 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0130569883433869 0 NA NA 0.0128769229089774 0.308442528913098 608 392 0 0 0.608 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666674 0 34.41666666666666 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0130322771310964 0 NA NA 0.0133184080946365 0.331057551188872 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.0833333333334 0 33.58333333333332 0.0129174344873365 0 -Inf 0.0129174344873365 0.012747169085031 0 NA NA 0.0128329556138416 0.314135224976172 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.5833333333334 0 34.08333333333332 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.0137905406765989 0 NA NA 0.0128177388722387 0.310425613913765 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.5833333333334 0 33.749999999999986 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.0133752904625624 0 NA NA 0.0131037980660709 0.327356823494394 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000006 0 33.08333333333332 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0120116063624845 0 NA NA 0.0127809111695039 0.325526452069299 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.5833333333334 0 32.74999999999999 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0119577529488845 0 NA NA 0.0128808676813613 0.331316288668825 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.91666666666673 0 32.416666666666664 0.012461345857946 0 -Inf 0.012461345857946 0.0117099765368724 0 NA NA 0.0120749099710888 0.302070613463102 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.0833333333334 0 32.75 0.0124355180497881 0 -Inf 0.0124355180497881 0.0124399530455222 0 NA NA 0.0122830393633773 0.31134026257653 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666673 0 32.416666666666664 0.0123841823043676 0 -Inf 0.0123841823043676 0.0123591636885277 0 NA NA 0.0122819137046948 0.313297618364436 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666673 0 31.416666666666664 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0126312997132658 0 NA NA 0.0117400009826232 0.297427236667662 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.0833333333334 0 31.583333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0127738927759015 0 NA NA 0.0121806725324404 0.313271070165385 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.0833333333334 0 31.583333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0123681642490573 0 NA NA 0.0125258670781218 0.326793708791895 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.0833333333334 0 31.583333333333332 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0117946249225698 0 NA NA 0.0123268472441735 0.319043959159121 618 382 0 0 0.618 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000006 0 30.916666666666664 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.0120889704599834 0 NA NA 0.011644693315563 0.295455587920307 612 388 0 0 0.612 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.58333333333339 0 31.416666666666664 0.0123586730492886 0 -Inf 0.0123586730492886 0.0124117474341194 0 NA NA 0.0124994585512482 0.322791995529287 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333339 0 32.416666666666664 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.011769317243539 0 NA NA 0.0118877736385005 0.292514554811409 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.91666666666671 0 32.08333333333333 0.012461345857946 0 -Inf 0.012461345857946 0.0125850087478209 0 NA NA 0.0121071257031053 0.303358846935518 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666671 0 31.249999999999993 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0125825790465198 0 NA NA 0.0118447064872245 0.301718281865476 649 351 0 0 0.649 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.58333333333339 0 31.583333333333325 0.0122077974991056 0 -Inf 0.0122077974991056 0.0121583463898051 0 NA NA 0.0119432081457604 0.306708037508374 663 337 0 0 0.663 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.91666666666671 0 31.583333333333325 0.0123079685204042 0 -Inf 0.0123079685204042 0.0126654663702071 0 NA NA 0.012370523270444 0.319763870311813 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.91666666666671 0 31.916666666666657 0.0123079685204042 0 -Inf 0.0123079685204042 0.0121093018564157 0 NA NA 0.012292023745499 0.316683163419528 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000004 0 32.08333333333332 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0119040904515867 0 NA NA 0.0124752567196152 0.322849867239309 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000004 0 31.416666666666657 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0119967554372822 0 NA NA 0.0122448794972612 0.313829803940905 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.91666666666671 0 31.749999999999986 0.0123079685204042 0 -Inf 0.0123079685204042 0.0124092396834222 0 NA NA 0.0125445429624541 0.32652309269497 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.58333333333339 0 31.08333333333332 0.0122077974991056 0 -Inf 0.0122077974991056 0.0120755849618445 0 NA NA 0.0126071676157044 0.332883591130052 656 344 0 0 0.656 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.91666666666671 0 31.08333333333332 0.0121583209710618 0 -Inf 0.0121583209710618 0.0124541046147443 0 NA NA 0.0126083355954946 0.334891448158458 617 383 0 0 0.617 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.91666666666671 0 30.749999999999986 0.0120122687914307 0 -Inf 0.0120122687914307 0.011844698921946 0 NA NA 0.01217109857239 0.323667027746413 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.75000000000006 0 30.416666666666654 0.012036366652848 0 -Inf 0.012036366652848 0.0117633309344726 0 NA NA 0.0119389829591055 0.313379201344465 609 391 0 0 0.609 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.08333333333339 0 31.08333333333332 0.0121337327973565 0 -Inf 0.0121337327973565 0.0121967970627122 0 NA NA 0.011912195851959 0.308394096311574 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.08333333333339 0 30.916666666666654 0.0121337327973565 0 -Inf 0.0121337327973565 0.0120910815655705 0 NA NA 0.0118952463400688 0.307705275681922 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666671 0 31.58333333333332 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0120665533851805 0 NA NA 0.0119509001721972 0.306034301551293 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666671 0 31.58333333333332 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0121735251531375 0 NA NA 0.012731766497901 0.3366525084621 601 399 0 0 0.601 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.08333333333339 0 30.916666666666654 0.0121337327973565 0 -Inf 0.0121337327973565 0.0125640723884192 0 NA NA 0.0123014781353756 0.3239546192129 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 83.58333333333339 0 30.749999999999986 0.0120605613963404 0 -Inf 0.0120605613963404 0.0120446201967926 0 NA NA 0.0126898697357262 0.341904673185162 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.91666666666671 0 31.416666666666654 0.012461345857946 0 -Inf 0.012461345857946 0.0124358726083712 0 NA NA 0.0121134055762415 0.303609589737563 619 381 0 0 0.619 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000004 0 31.08333333333332 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0124798669811459 0 NA NA 0.0124936060933324 0.314524497843039 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333337 0 31.08333333333332 0.0126718959543505 0 -Inf 0.0126718959543505 0.0128598472822712 0 NA NA 0.012818799709727 0.322888266438355 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 286 AAT GAA ATT 2 GGAAATTTC:GGAAATTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.08333333333337 0 31.249999999999986 0.0125921111074123 0 -Inf 0.0125921111074123 0.0127212892203176 0 NA NA 0.0122544903411973 0.304161187192119 623 377 0 0 0.623 0.001 N all ss13 287 TTC ATT TCG 2 AATTTCGGG:AATTTTGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000004 0 30.916666666666654 0.0126451889006809 0 -Inf 0.0126451889006809 0.0131061738007734 0 NA NA 0.0123167763199889 0.304578780761427 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000004 0 30.416666666666654 0.0126451889006809 0 -Inf 0.0126451889006809 0.0126895463377645 0 NA NA 0.0125030809678074 0.311841367700907 599 401 0 0 0.599 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333337 0 31.083333333333318 0.012752698321938 0 -Inf 0.012752698321938 0.0126913057967949 0 NA NA 0.0123226743906473 0.300717032387824 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAA:GACCAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333337 0 30.583333333333318 0.0126718959543505 0 -Inf 0.0126718959543505 0.0130036754013366 0 NA NA 0.0128660326850368 0.324667834106301 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 291 GAA AAG AAT 2 CAAGAATTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.58333333333337 0 29.583333333333318 0.012513324680928 0 -Inf 0.012513324680928 0.0128212554078178 0 NA NA 0.0123675147662789 0.311638591595743 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 292 CTA AAT TAA 2 GAATTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:TTAATCAGA 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333337 0 30.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 0 29.499999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.83333333333339 0 29.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000004 0 28.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.66666666666671 0 29.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 29.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000004 0 27.999999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333339 0 27.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333339 0 27.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000004 0 28.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333339 0 28.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000004 0 28.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000004 0 28.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333339 0 28.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.25000000000006 0 28.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 27.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333339 0 27.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTT TCT TTG 2 TTCTTTGGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 27.749999999999982 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TTG GAA 2 TTTGGAATG 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000006 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666673 0 26.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666673 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 26.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 27.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 27.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.58333333333337 0 27.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 27.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000004 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.50000000000004 0 28.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 1 28.49999999999999 0 0.0359350167719231 0 -0.0359350167719231 0 0.0375632072907325 NA NA 0.0354677159685704 0.310976395756028 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333337 1 28.49999999999999 0 0.0359350167719231 0 -0.0359350167719231 0 0.0400416841176463 NA NA 0.0367558310386035 0.328238325256942 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.50000000000004 1 27.49999999999999 0 0.0372747514142044 0 -0.0372747514142044 0 0.0392292393944696 NA NA 0.0402181825327254 0.354023414507222 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 86.50000000000004 1 27.49999999999999 0.023485284799612 0.0372747514142044 0.630058790698264 -0.0137894666145924 0.0232807139753314 0.0382727280745214 NA NA 0.047300506269179 0.77064681108435 336 120 544 0.544 0.336 0.672 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 85.83333333333337 1 27.833333333333325 0.0236706036841631 0.0368172076473927 0.642922296304005 -0.0131466039632296 0.0243340432411302 0.0371363033454219 NA NA 0.0457292652906871 0.773738874039397 337 128 535 0.535 0.337 0.674 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 87.50000000000004 1 27.49999999999999 0.0350941211300692 0.0372747514142044 0.94149846205804 -0.00218063028413519 0.0262409438709062 0.039115454463191 NA NA 0.0473932533768954 0.963301157833748 507 44 449 0.449 0.507 0.898 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 88.16666666666671 1 28.166666666666657 0.0348225019372047 0.0363707624539579 0.957431177894245 -0.00154826051675322 0.0264120524260642 0.0378273509103765 NA NA 0.0470524883748324 0.973750372874228 482 49 469 0.469 0.482 0.938 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 88.41666666666671 1 27.916666666666657 0.0347217257739748 0.0367045717801664 0.945978228051061 -0.00198284600619161 0.027293214824213 0.0403034023392153 NA NA 0.0483571874147337 0.967292576876089 463 52 485 0.485 0.463 0.926 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 87.58333333333339 1 28.74999999999999 0.0350599371862616 0.0356149996994909 0.98441492298434 -5.55062513229281e-4 0.0272836840731652 0.0385019897899835 NA NA 0.0465394946396724 0.990484097137774 492 40 468 0.468 0.492 0.936 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 87.25000000000006 1 29.24999999999999 0.0351970741664875 0.0349917687305995 1.0058672494514 2.05305435887967e-4 0.026564642423467 0.037782950907740503 NA NA 0.0452694005208656 0.99638145250167 516 46 438 0.438 0.516 0.876 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 88.00000000000006 1 29.166666666666657 0.0348900117261696 0.0350941211300692 0.994183943141271 -2.04109403899595e-4 0.0270196776223003 0.0383756905633981 NA NA 0.0466471382672273 0.996508784279874 491 48 461 0.461 0.491 0.922 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 89.00000000000006 1 28.833333333333325 0.0344888349313675 0.0355095904478987 0.971254089285291 -0.0010207555165312 0.0265579743713561 0.0379749198179959 NA NA 0.046092223494068 0.982331542349894 491 38 471 0.471 0.491 0.942 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 89.00000000000006 1 28.833333333333325 0.0344888349313675 0.0355095904478987 0.971254089285291 -0.0010207555165312 0.0265283549234186 0.0359680799656166 NA NA 0.0449828293401122 0.98189586588868 516 42 442 0.442 0.516 0.884 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 89.00000000000006 1 28.833333333333325 0.0344888349313675 0.0355095904478987 0.971254089285291 -0.0010207555165312 0.0264989225864203 0.0394593219934735 NA NA 0.0456236870419923 0.982150124695501 519 40 441 0.441 0.519 0.882 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 88.50000000000006 1 28.999999999999993 0.0587384200855636 0.0353006331434894 1.66394806140742 0.0234377869420742 0.0357427334664624 0.0368770872322675 NA NA 0.0533603861419563 0.660490754541001 687 20 293 0.293 0.687 0.586 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.83333333333339 1 29.999999999999993 0.0599120787357042 0.034096780557568 1.75711834830125 0.0258152981781362 0.0380204186417068 0.0366769078333417 NA NA 0.0531980303292207 0.627486299665917 684 17 299 0.299 0.684 0.598 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 85.16666666666671 1 29.999999999999993 0.061133622140465 0.034096780557568 1.79294411791309 0.027036841582897 0.0368299235752873 0.0358036989035259 NA NA 0.0533768239584393 0.612486226615058 724 13 263 0.263 0.724 0.526 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.83333333333339 1 29.66666666666666 0.0621473370101288 0.0344888349313675 1.80195524533668 0.0276585020787612 0.0390384399402753 0.0358893182926962 NA NA 0.0544541363635525 0.611507424340707 677 13 310 0.31 0.677 0.62 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 83.50000000000006 1 29.999999999999993 0.0624060435661621 0.034096780557568 1.83026205247729 0.0283092630085941 0.0379849450174168 0.0339077254579753 NA NA 0.053897285320221 0.599413100422144 735 13 252 0.252 0.735 0.504 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.50000000000006 1 30.333333333333325 0.0631952577133049 0.0337135408966998 1.87447702117493 0.0294817168166051 0.0378404987696001 0.0346445143449696 NA NA 0.053948120490054 0.584734147493256 690 10 300 0.3 0.69 0.6 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC:TTCAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.16666666666671 1 30.66666666666666 0.063462786419742 0.0333388219281254 1.90357015483512 0.0301239644916166 0.0400957363701511 0.0348240053430638 NA NA 0.0531400467727544 0.570796547098499 723 15 262 0.262 0.723 0.524 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGATAAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.16666666666671 1 30.99999999999999 0.0642791463517656 0.032972342565837 1.94948679255704 0.0313068037859286 0.0387126976744183 0.034158512498167 NA NA 0.0530324191371776 0.554967208380316 732 17 251 0.251 0.732 0.502 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC:GATAACGTC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.66666666666671 1 31.83333333333333 0.0655438665862574 0.0320904564039067 2.04247224661716 0.0334534101823506 0.0395745759753133 0.0340975946225002 NA NA 0.0531481760577153 0.529063226768179 729 13 258 0.258 0.729 0.516 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 79.83333333333339 1 31.66666666666666 0.0654008882518079 0.0322630388127681 2.02711494820276 0.0331378494390398 0.0414773534284078 0.0333937865598003 NA NA 0.0535673611683802 0.536166618941869 749 13 238 0.238 0.749 0.476 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 81.00000000000006 2 31.33333333333333 0.0644172539103222 0.0667106145123721 0.965622253387809 -0.00229336060204989 0.0392567017514476 0.0488323712643062 NA NA 0.0629097994447209 0.970919764162072 497 5 498 0.498 0.497 0.994 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 82.3333333333334 2 30.33333333333333 0.0633287393599308 0.0690141740401891 0.917619318649709 -0.00568543468025831 0.0401454151133507 0.0550667680375647 NA NA 0.0639531048174143 0.929161338046351 487 6 507 0.507 0.487 0.974 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:CTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.00000000000007 2 30.33333333333333 0.0750625939177368 0.0690141740401891 1.08764025595707 0.0060484198775477 0.039875222170777 0.0532926492200413 NA NA 0.0687384951058057 0.929883240183381 534 3 463 0.463 0.534 0.926 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.66666666666674 2 30.83333333333333 0.0735282234971393 0.0678428326164385 1.08380238061173 0.00568539088070083 0.0377148500608771 0.0488846535376271 NA NA 0.0655333724541386 0.930865734067052 571 0 429 0.429 0.571 0.858 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.00000000000007 2 31.83333333333333 0.0741343759774744 0.0656155905923368 1.12982867803574 0.00851878538513751 0.0406867539648777 0.0500748674214475 NA NA 0.0663620561984442 0.89785750403084 570 1 429 0.429 0.57 0.858 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 84.75000000000007 2 31.83333333333333 0.0875080892614752 0.0656155905923368 1.33364781862826 0.0218924986691384 0.0423515069252881 0.0512946543114155 NaN NaN 0.0666659720074431 0.742616121208803 634 0 366 0.366 0.634 0.732 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 85.08333333333341 2 31.499999999999996 0.0871445429903899 0.0663415654213976 1.31357381208678 0.0208029775689924 0.0432695360142948 0.0482183492695955 NaN NaN 0.0655067340869753 0.750811086871794 663 0 337 0.337 0.663 0.674 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 85.91666666666674 3 30.333333333333332 0.0862487712459546 0.106058740537371 0.813217004171038 -0.0198099692914168 0.0408464112807971 0.0702113067953097 NaN NaN 0.0828721643880149 0.811072628205791 407 0 593 0.593 0.407 0.814 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 86.25000000000009 3 30 0.0858956033974629 0.107325632730505 0.80032701612994 -0.0214300293330421 0.0406053750592048 0.0711629034397001 NaN NaN 0.0813496037673281 0.792218192478322 384 1 615 0.615 0.384 0.768 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 87.75000000000009 3 29.166666666666668 0.110290063467372 0.110629602831442 0.99693084531283 -3.39539364069913e-4 0.0510367640298485 0.0736111500532708 NaN NaN 0.0863139470281518 0.996861312371928 519 0 481 0.481 0.519 0.962 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 87.58333333333341 3 29.333333333333332 0.110516190571361 0.109952605643907 1.00512570779159 5.63584927454244e-4 0.0483175081540133 0.0732484208124377 NaN NaN 0.0878376595206961 0.994880639700183 507 0 493 0.493 0.507 0.986 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 85.91666666666674 3 29.333333333333332 0.112829626280535 0.109952605643907 1.02616600688797 0.00287702063662863 0.0497555469118223 0.073421034094035 NaN NaN 0.0909621008493662 0.974768088585181 514 0 486 0.486 0.514 0.972 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 85.91666666666674 3 29 0.112829626280535 0.111315003838705 1.01360663333422 0.00151462244183019 0.0500443297905806 0.0689163855399496 NaN NaN 0.0932661567414905 0.987043094873598 517 0 483 0.483 0.517 0.966 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 84.08333333333341 3 30.166666666666668 0.115489135066297 0.106688419438138 1.08248988666724 0.00880071562815887 0.0500819999180827 0.0695844244066646 NaN NaN 0.0885807945391959 0.920858465166932 554 0 446 0.446 0.554 0.892 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 83.08333333333341 3 29.166666666666668 0.116993416852619 0.110629602831442 1.05752360903684 0.00636381402117694 0.0527620242089722 0.072127047729328 NaN NaN 0.0885146295415818 0.942684977102394 541 0 459 0.459 0.541 0.918 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 81.75000000000007 4 30.500000000000004 0.119061291806916 0.144154737019872 0.825927016123671 -0.0250934452129567 0.0504807732726407 0.0783991130872135 NaN NaN 0.0993554526385189 0.800606438066378 406 0 594 0.594 0.406 0.812 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 80.0833333333334 4 30.16666666666667 0.121751485582717 0.145913043990275 0.834411251065613 -0.0241615584075578 0.0545810081426641 0.0759500408458047 NaN NaN 0.0979186031212436 0.805100577308023 416 0 584 0.584 0.416 0.832 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 79.5833333333334 4 30.66666666666667 0.122582464773988 0.143291427572032 0.855476610506698 -0.020708962798044 0.0524041564914801 0.0786778766679111 NaN NaN 0.0981679801173416 0.832922890236787 436 0 564 0.564 0.436 0.872 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333341 4 30.66666666666667 0.124279002650387 0.143291427572032 0.867316382816499 -0.0190124249216448 0.0563262933617946 0.0821506133463515 NaN NaN 0.102386406445615 0.852685625662582 418 0 582 0.582 0.418 0.836 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.58333333333341 4 30.000000000000004 0.124279002650387 0.146808432844571 0.846538582575589 -0.0225294301941844 0.0525260040379806 0.0835299568611348 NaN NaN 0.1016979570168 0.824677623060185 425 0 575 0.575 0.425 0.85 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 78.08333333333341 4 30.5 0.12514504545268 0.144154737019872 0.868129955628365 -0.019009691567192 0.0580816706903583 0.083503758750891 NaN NaN 0.102818140461089 0.853318018377267 415 0 585 0.585 0.415 0.83 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS 1000 9 77.41666666666674 4 30.5 0.126318765773572 0.144154737019872 0.876272042008295 -0.0178359712463 0.054853170254496 0.0844640662935952 NaN NaN 0.102490990044889 0.861845993478775 422 0 578 0.578 0.422 0.844 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAAAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAC 2 GATGAACTT:GATGAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 CTT AAC CTC 2 GAACTTCAG:GAAGCTCAG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 CTTCAGGCT:GCTCAGCCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTG:CAGGCTTTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTGCCG:GCTTTACCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAA:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAA AAC AAC 2 AAACAACAA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CAA AAC AAA 2 CAACAAACT:CAGCCCACT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTG:CCCACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACC:ACTGTGACT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACC TGA CCC 2 GTGACCCTT:GTGACTCTT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CCC TTC 2 ACCCTTCTT:ACTCTTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG:CTTCCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT:CCTGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CGG CAG 2 GCGGCTGAC:GCTGCAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAA ATG AAT 2 GATGAATTC:GATGATTTC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC AAT TCT 2 GAATTCTCC:GATTTCTCC 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAAA:TTCTCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAG:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAGTTG:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TGC 2 CAACTTCAA:CAGTTGCAA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TGC AAA 2 CTTCAAAAT:TTGCAACAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA AAT 2 CAAAATTCC:CAACAATCC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC AAT CCA 2 AATTCCATG:CAATCCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA:ATGAGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 1 AGTGGAGCT:AGTGGT--- 1:1 FALSE 0.5 0.5 1.5 0.5 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 --- GAG CTT 1 GGAGCTTCT:GGT---ACT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 ACT --A CT- 1 ---ACT---:GCTTCTGCT 1:1 FALSE 0.333333333333333 0.5 1.66666666666667 0.5 0 0 1 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 --- CTG CTG 1 ACT---GAT:TCTGCTGAT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT --G ATT 1 ---GATTCA:GCTGATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACC:GATTCAACT 1:1 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACC CAA CCC 2 TCAACCCAG:TCAACTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CCC AGG 2 ACCCAGGCT:ACTCAGGCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCTTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MG772933.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAT 2 CCCCAATCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 8 TCA AAT CAA 2 CAATCAAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA:TCAAACCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGC:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGCCGA:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.8333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.3333333333334 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 36 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.16666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 34.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.25000000000004 0 36.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.41666666666671 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333337 0 36.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.25000000000004 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333337 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333337 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.58333333333337 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 36.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 37.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000004 0 38.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000004 0 38.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000004 0 38.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.75000000000004 0 38.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.33333333333337 0 38.58333333333333 0.0145635643928261 0 -Inf 0.0145635643928261 0.014850380915052 0 NA NA 0.0146626294229191 0.320591203678483 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 67.6666666666667 0 39.24999999999999 0.0149258657379712 0 -Inf 0.0149258657379712 0.0152675641539326 0 NA NA 0.0145483649000586 0.304916099890887 610 390 0 0 0.61 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.1666666666667 0 38.24999999999999 0.0148152965521744 0 -Inf 0.0148152965521744 0.0145581686807636 0 NA NA 0.0149841578924545 0.322794930244516 641 359 0 0 0.641 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.1666666666667 0 37.24999999999999 0.0148152965521744 0 -Inf 0.0148152965521744 0.0152383002163781 0 NA NA 0.0143852320119321 0.303058709728047 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 68.83333333333337 0 36.58333333333333 0.0146703943908702 0 -Inf 0.0146703943908702 0.0142980079784111 0 NA NA 0.0153939532188814 0.340591486867019 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 69.16666666666671 0 36.24999999999999 0.0145990010910774 0 -Inf 0.0145990010910774 0.0148454226980878 0 NA NA 0.0142713245978416 0.306326530751048 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 70.83333333333339 0 36.58333333333333 0.0142522103442115 0 -Inf 0.0142522103442115 0.0144132934720167 0 NA NA 0.0141797473186726 0.314843732030241 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.33333333333339 0 37.08333333333333 0.0141513632282871 0 -Inf 0.0141513632282871 0.0137718403110459 0 NA NA 0.0143000452953485 0.322368356832736 624 376 0 0 0.624 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666671 0 36.74999999999999 0.0140849209886972 0 -Inf 0.0140849209886972 0.0146799702172443 0 NA NA 0.0147278733428079 0.33889820352551703 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.33333333333339 0 36.08333333333333 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.0141726069263888 0 NA NA 0.0144400525725015 0.333877870974385 615 385 0 0 0.615 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666671 0 35.08333333333333 0.0136990109829699 0 -Inf 0.0136990109829699 0.0136489047271783 0 NA NA 0.0143348118020413 0.339250921763613 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000006 0 35.08333333333333 0.0138252762666285 0 -Inf 0.0138252762666285 0.0137043780174589 0 NA NA 0.0131086546628123 0.291577273207522 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 0 35.24999999999999 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0140353369270826 0 NA NA 0.0138209462584959 0.320492766429319 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 0 34.58333333333333 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0140921498776115 0 NA NA 0.0134552061517799 0.311923886626853 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.16666666666671 0 35.24999999999999 0.0136058153029875 0 -Inf 0.0136058153029875 0.0141680503174341 0 NA NA 0.0132353442831723 0.303954043562557 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0135938399081988 0 NA NA 0.0138554847956503 0.321700553087126 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.50000000000006 0 35.91666666666666 0.0137303605832671 0 -Inf 0.0137303605832671 0.0142979033045305 0 NA NA 0.0141329326337166 0.331291727497397 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.33333333333339 0 35.74999999999999 0.0135750312327134 0 -Inf 0.0135750312327134 0.0139270830164645 0 NA NA 0.0139600821901199 0.330842782152985 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 0 34.83333333333333 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.013833968680919 0 NA NA 0.0137364809733027 0.329014938335437 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 0 34.5 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0140364781894968 0 NA NA 0.0135034022873946 0.322893195866304 613 387 0 0 0.613 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.58333333333337 0 34 0.0133485169832455 0 -Inf 0.0133485169832455 0.0136110510291349 0 NA NA 0.013400876929265 0.319205059298134 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333337 0 33.83333333333333 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0137116784224912 0 NA NA 0.0134934402320538 0.319295410589727 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.4166666666667 0 34.5 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0141058856878797 0 NA NA 0.0135408009956496 0.316635845974845 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.58333333333337 0 34.5 0.0135291154422588 0 -Inf 0.0135291154422588 0.0134865622947826 0 NA NA 0.0138949198235168 0.330218671071591 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000004 0 34.5 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0131618703632021 0 NA NA 0.012944920926402 0.300301613169425 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666671 0 33.83333333333333 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0139710671141748 0 NA NA 0.0137435285467422 0.327096267855355 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.08333333333339 0 33.66666666666666 0.0134382094503063 0 -Inf 0.0134382094503063 0.0135702666741308 0 NA NA 0.0134486313785559 0.317685680411716 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.75000000000006 0 33.99999999999999 0.0134986770919624 0 -Inf 0.0134986770919624 0.0128863126532418 0 NA NA 0.0135775660049176 0.320130492295807 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.41666666666671 0 34.33333333333333 0.013559691378237 0 -Inf 0.013559691378237 0.0144587873835386 0 NA NA 0.0142538746311403 0.341452803330478 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.08333333333339 0 34 0.0136212597557268 0 -Inf 0.0136212597557268 0.0140729685262452 0 NA NA 0.0140369533898747 0.331854241413738 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333339 0 34.5 0.0137146678675636 0 -Inf 0.0137146678675636 0.0136351239788481 0 NA NA 0.0140241081837633 0.328106415704652 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.58333333333339 0 34.5 0.0137146678675636 0 -Inf 0.0137146678675636 0.0139300223872206 0 NA NA 0.0134229734023471 0.306908240642719 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000006 0 34.166666666666664 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0135945606932943 0 NA NA 0.0143772540461747 0.351028286289253 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCC:AATACACCG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.25000000000006 0 35.166666666666664 0.0134081783305544 0 -Inf 0.0134081783305544 0.0131491844045768 0 NA NA 0.0134463230983042 0.318685308810369 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.91666666666673 0 35.49999999999999 0.0134683754007452 0 -Inf 0.0134683754007452 0.0136302561076951 0 NA NA 0.0135422984225798 0.319959397524827 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCGAAGGAT 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.50000000000006 0 35.916666666666664 0.0135443861537981 0 -Inf 0.0135443861537981 0.014936234648997 0 NA NA 0.0132379005600389 0.306235922442515 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAGGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 74.66666666666673 0 35.74999999999999 0.0135138791270087 0 -Inf 0.0135138791270087 0.0132278393244666 0 NA NA 0.0135577600234996 0.318879362178754 636 364 0 0 0.636 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666673 0 36.08333333333333 0.0138892858254281 0 -Inf 0.0138892858254281 0.0137340049709928 0 NA NA 0.0138757196410173 0.316837593324412 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000007 0 35.74999999999999 0.0139215133950447 0 -Inf 0.0139215133950447 0.0133625886734773 0 NA NA 0.0146664710059524 0.342515465103798 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.66666666666673 0 34.75 0.0136990109829699 0 -Inf 0.0136990109829699 0.0139899877669118 0 NA NA 0.014233656863328 0.335829677618118 640 360 0 0 0.64 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.3333333333334 0 35.08333333333333 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.0141323316862219 0 NA NA 0.0142433408412473 0.327244977951392 650 350 0 0 0.65 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000007 0 34.416666666666664 0.0138252762666285 0 -Inf 0.0138252762666285 0.0142057249084622 0 NA NA 0.0142490957917053 0.331918708258665 611 389 0 0 0.611 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666673 0 34.74999999999999 0.0138892858254281 0 -Inf 0.0138892858254281 0.0143337379375562 0 NA NA 0.013898183740356 0.317620436724344 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.00000000000007 0 34.74999999999999 0.0140190997591144 0 -Inf 0.0140190997591144 0.0144889106802138 0 NA NA 0.0139712318223527 0.315655278398649 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666673 0 34.74999999999999 0.0138892858254281 0 -Inf 0.0138892858254281 0.0140745685730705 0 NA NA 0.0135743573047521 0.306213173450627 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666673 0 34.74999999999999 0.0138892858254281 0 -Inf 0.0138892858254281 0.0142803586045469 0 NA NA 0.0137416783687245 0.312140126340275 616 384 0 0 0.616 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.3333333333334 0 34.74999999999999 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.014148252344912 0 NA NA 0.0147127262597111 0.342914054922741 602 398 0 0 0.602 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666673 0 34.74999999999999 0.0140849209886972 0 -Inf 0.0140849209886972 0.0135934281344766 0 NA NA 0.0142208382269111 0.321957935109984 664 336 0 0 0.664 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC:GCTGCCATC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.3333333333334 0 34.74999999999999 0.0139538908732759 0 -Inf 0.0139538908732759 0.0144561106872676 0 NA NA 0.0141336208093717 0.323503668405885 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG:GCCATCGTG 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.66666666666673 0 34.41666666666666 0.0138892858254281 0 -Inf 0.0138892858254281 0.0139719686341055 0 NA NA 0.0150989935630582 0.357634653600347 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 38.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 38.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.33333333333339 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666673 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.8333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 33.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAC 2 GACAGACTG:GACAGATTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 CTG GAC TGA 2 AGACTGAAC:AGATTGAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000009 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 CTGAACCAG:TTGAACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333341 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000009 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333343 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333343 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666676 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333343 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.16666666666676 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333341 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333341 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666674 0 36.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666674 0 36.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.66666666666674 0 35.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.3333333333334 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.8333333333334 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.8333333333334 0 34.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000007 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.8333333333334 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.3333333333334 0 33.5 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 33.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666674 0 32.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.3333333333334 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.3333333333334 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.3333333333334 0 32.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000006 0 31.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 32.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 0 32.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 0 32.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333337 0 32.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333337 0 32.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.9166666666667 0 32.916666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.9166666666667 0 32.25 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333337 0 32.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA:ACTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333337 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333337 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000004 0 30.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333337 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333337 0 31.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.9166666666667 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.9166666666667 0 32.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333337 0 31.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333337 0 31.249999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.4166666666667 0 31.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000003 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333337 0 31.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.58333333333337 0 31.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000003 0 31.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000003 0 30.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.9166666666667 0 31.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GACCAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.4166666666667 0 30.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA:CAAGATCTA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.9166666666667 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC:GATCTAATC 1:1 FALSE 0.166666666666667 0 0.5 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000004 0 29.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000004 0 28.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333337 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000003 0 30.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.9166666666667 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.25000000000004 0 29.583333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.25000000000004 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 29.916666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666671 0 30.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666671 0 29.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000004 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.58333333333339 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.83333333333339 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333339 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 28.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.50000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000007 0 26.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000007 0 26.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.5833333333334 0 27.083333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.5833333333334 0 27.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000006 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.91666666666671 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333339 0 27.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.58333333333339 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.08333333333339 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000006 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666671 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.75000000000006 0 27.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.75000000000006 0 28.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.41666666666673 0 28.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.0833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.50000000000007 0 29.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.16666666666674 0 29.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.16666666666674 0 29.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAC 2 ATTAAACTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.16666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 CTG AAC TGG 2 AAACTGGAT:AAATTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.5 0 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.16666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 CTGGATGAC:TTGGATGAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.66666666666674 0 29.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.66666666666674 0 29.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.66666666666674 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000007 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.66666666666674 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 30.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333341 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000007 0 31.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000007 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.3333333333334 0 32.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.66666666666674 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:CTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333341 0 31.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333341 0 32.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.16666666666674 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211376.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666673 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000006 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 7 CAA CCC AAT 2 CCCCAATCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 8 TCA AAT CAA 2 CAATCAAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 9 AAC CAA ACC 2 TCAAACCAA:TCAAACCAG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AACCAGCGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 11 CGT AAC GTA 2 CAACGTAGT:CAGCGTAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 12 AGT GTA GTG 2 CGTAGTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.33333333333339 0 35.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 13 GCC GTG CCC 2 AGTGCCCCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000004 0 35.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 14 CCC CCC CCC 2 GCCCCCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.00000000000004 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333337 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000003 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000003 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.1666666666667 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333336 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000003 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.1666666666667 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333339 0 34.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGGA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 32 GGA GAG GAC 2 GGAGGACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.33333333333339 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 33 CGC GAC GCA 2 GGACGCAAT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666671 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 37 AGG CAA GGC 2 GCAAGGCCA 2 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 38 CCA GGC CAA 2 AGGCCAAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666671 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 40 CAG AAC AGC 2 AAACAGCGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000004 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 41 CGC AGC GCC 2 CAGCGCCGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.1666666666667 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000003 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333336 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666669 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333336 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000003 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.6666666666667 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333337 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000004 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 59 CAG CTC AGC 2 ACTCAGCAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333337 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 60 CAT AGC ATG 2 CAGCATGGC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.83333333333337 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.50000000000004 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAG 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666671 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 63 GAG AGG AGG 2 AAGGAGGAA 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.83333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 64 GAA AGG AAC 2 GAGGAACTT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.33333333333339 0 33.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.16666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 66 AGA TTA GAT 2 CTTAGATTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.83333333333339 0 33.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 67 TTC GAT TCC 2 AGATTCCCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.50000000000004 0 33.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGC 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666671 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 70 GGC GAG GCC 2 CGAGGCCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 71 CAG GCC AGG 2 GGCCAGGGC 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.33333333333339 0 33.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 72 GGC AGG GCG 2 CAGGGCGTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.66666666666673 0 33 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 33.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 34.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 79 AGT ATA GTG 2 AATAGTGGT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000006 0 34.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 80 GGT GTG GTC 2 AGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.8333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.00000000000007 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.3333333333334 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 36 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000004 0 36.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.16666666666671 0 35.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.50000000000004 0 35.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 92 ACC CTA CCC 2 GCTACCCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 35.166666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 93 CGA CCC GAC 2 ACCCGACGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.00000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 94 CGA GAC GAG 2 CGACGAGTT 2 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 34.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 95 GTT GAG TTC 2 CGAGTTCGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 GTTCGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 36.666666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.16666666666673 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.50000000000006 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 36.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.83333333333339 0 37.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 107 CCC GCC CCA 2 AGCCCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 108 AGA CCA GAT 2 CCCAGATGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.66666666666671 0 38.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.00000000000006 0 38.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 39.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 38.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 112 TAT TCT ATT 2 TTCTATTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.83333333333339 0 37.33333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 113 TAC ATT ACC 2 TATTACCTA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.50000000000006 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.83333333333339 0 36.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.50000000000006 0 36.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.00000000000006 0 37.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.3333333333334 0 36.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000007 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 120 GCT AAG CTT 2 GAAGCTTCA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 121 TCA CTT CAC 2 GCTTCACTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 TCACTTCCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 34.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 35.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 35.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 34.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.25000000000006 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 131 ATC GCA TCG 2 GGCATCGTA 2 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.08333333333339 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 132 GTA TCG TAT 2 ATCGTATGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000006 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 GTATGGGTC:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666673 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 134 GTC GGG TCG 2 TGGGTCGCA:TGGGTTGCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.5833333333334 0 33.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 135 GCA TCG CAA 2 GTCGCAACT:GTTGCAACT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000006 0 33.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.41666666666673 0 34.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.0833333333334 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.75000000000007 0 34.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000007 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAC:GCCTTGAAT 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.25000000000007 0 34.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 141 AAC TGA ACA 2 TTGAACACA:TTGAATACA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666674 0 34.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 142 ACA ACA CAC 2 AACACACCT:AATACACCC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.91666666666674 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 143 CCC CAC CCA 2 ACACCCAAA:ACACCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.75000000000007 0 35.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 144 AAA CCA AAG 2 CCCAAAGAC:CCTAAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.25000000000007 0 35.91666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.25000000000007 0 35.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.41666666666673 0 34.75 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 35.08333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.75000000000007 0 34.416666666666664 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.75000000000007 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666673 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 157 GCC CTG CCA 2 GCTGCCACC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.0833333333334 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 158 ACC CCA CCG 2 GCCACCGTG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.41666666666673 0 34.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 34.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.58333333333339 0 35.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 35.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.58333333333339 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.91666666666671 0 36.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.08333333333339 0 36.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 36.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 71.41666666666671 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.41666666666671 0 38.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.91666666666671 0 38.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.75000000000006 0 39.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 39.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.41666666666671 0 39.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.08333333333339 0 38.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 175 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGGA:GCAGAGGGG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.58333333333339 0 37.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 176 GGA AGG GAA 2 GAGGGAAGC:GAGGGGAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.25000000000006 0 36.58333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.33333333333339 0 36.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000006 0 35.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.00000000000006 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.66666666666673 0 35.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 66.33333333333339 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.00000000000004 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 67.66666666666671 0 34.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.33333333333339 0 34.16666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 68.66666666666671 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 33.83333333333333 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 69.33333333333339 0 34.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 192 CGC GTC GCG 2 AGTCGCGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 70.33333333333339 0 33.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 193 GGT GCG GTA 2 CGCGGTAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.00000000000006 0 32.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 194 AAT GTA ATT 2 GGTAATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 31.499999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 31.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 31.333333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 31.999999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.66666666666673 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 200 CCT CTC CTG 2 ACTCCTGGC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.16666666666673 0 33.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 201 GGC CTG GCA 2 CCTGGCAGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.66666666666673 0 32.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000006 0 32.66666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000006 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.00000000000006 0 33.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.66666666666671 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.33333333333339 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.50000000000006 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 72.8333333333334 0 33.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 209 GCT CTG CTC 2 CCTGCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.3333333333334 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 210 CGA CTC GAA 2 GCTCGAATG 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 CGAATGGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 32.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.00000000000007 0 33.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 213 AGC CTA GCG 2 GCTAGCGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 214 GGA GCG GAG 2 AGCGGAGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.50000000000007 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 215 GGT GAG GTG 2 GGAGGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 74.16666666666674 0 33.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 216 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.3333333333334 0 34.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 73.8333333333334 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.16666666666674 0 32.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.83333333333341 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG 2 FALSE 1 1 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 223 TTG TAT TGC 2 CTATTGCTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 32.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 TTGCTGCTA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000009 0 33.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000009 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.00000000000009 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333341 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 36.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000009 0 36.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000009 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAG 2 AGCAAAGTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333343 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 235 GTT AAG TTT 2 AAAGTTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.83333333333343 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 236 TCT TTT CTG 2 GTTTCTGGT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666676 0 35.333333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666676 0 34.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333343 0 34.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666676 0 34.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666676 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666676 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333341 0 35.833333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.66666666666674 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 36.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 75.00000000000007 0 36.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.00000000000007 0 35.66666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.16666666666674 0 35.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 76.50000000000007 0 35.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.50000000000007 0 34.83333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.66666666666674 0 33.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.16666666666674 0 34.499999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.8333333333334 1 34.16666666666665 0 0.0298546878003148 0 -0.0298546878003148 0 0.0321798842608446 NA NA 0.0311799284756888 0.338316462729898 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.50000000000007 1 33.49999999999999 0 0.0304610393656427 0 -0.0304610393656427 0 0.0329796001096232 NA NA 0.0317015411112155 0.336617860896578 0 366 634 0.634 0 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.8333333333334 1 33.16666666666666 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0342601600063946 NA NA 0.0333276409227218 0.355817488343662 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCC:GAGGCATCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 1 32.83333333333333 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.0335254332250985 NA NA 0.0343904307219994 0.36594011448598 0 396 604 0.604 0 0.001 N all ss13 256 TCC CAT CCA 2 GCATCCAAA:GCATCTAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.3333333333334 1 33.166666666666664 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0320358326904604 NA NA 0.0330207172116102 0.351364085978991 0 349 651 0.651 0 0.001 N all ss13 257 AAA CCA AAA 2 TCCAAAAAG:TCTAAAAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000007 1 33 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.033086223231033 NA NA 0.0322683248663923 0.337763374250901 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000007 1 31.999999999999996 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0344591521803021 NA NA 0.0333718792402619 0.338827124456968 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 1 32.166666666666664 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.034883318813178 NA NA 0.0321102411015815 0.322758467281009 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666673 1 32.166666666666664 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0335520301453069 NA NA 0.0322207641807552 0.324421048876802 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666673 1 32.416666666666664 0 0.031500692980973 0 -0.031500692980973 0 0.032914594032515 NA NA 0.0326479811643017 0.334615523640245 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000006 1 32.08333333333333 0 0.0318350176854428 0 -0.0318350176854428 0 0.0338965641989903 NA NA 0.0353131745190902 0.367319661501218 0 354 646 0.646 0 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.08333333333339 1 32.58333333333333 0 0.0313361505112163 0 -0.0313361505112163 0 0.0343896774221171 NA NA 0.0362842474830692 0.387791392694292 0 342 658 0.658 0 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC:CGTACTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.08333333333339 1 33.58333333333333 0 0.0303839016876759 0 -0.0303839016876759 0 0.0314083903435101 NA NA 0.0314985701956494 0.334739140627424 0 357 643 0.643 0 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCTACA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.41666666666671 1 33.25 0 0.0306948207819131 0 -0.0306948207819131 0 0.0332084704102176 NA NA 0.0337169381023614 0.362628479208815 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCTACAAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.91666666666671 1 32.416666666666664 0 0.031500692980973 0 -0.031500692980973 0 0.0346626170755244 NA NA 0.0333459641673294 0.344831037641647 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.25000000000004 1 32.58333333333333 0 0.0313361505112163 0 -0.0313361505112163 0 0.0339675806223715 NA NA 0.0340902762630397 0.357985317176466 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 1 32.83333333333333 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.0336316422912683 NA NA 0.0338434382962325 0.358243721319876 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 1 33.166666666666664 0 0.0307735475083969 0 -0.0307735475083969 0 0.0321411693318852 NA NA 0.0307442936340838 0.316850245966244 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 1 33.33333333333333 0 0.0306164958901914 0 -0.0306164958901914 0 0.0321368568803241 NA NA 0.0325220678628377 0.346496429343446 0 347 653 0.653 0 0.001 N all ss13 271 GTC ACG TCA 2 AACGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666671 1 32.666666666666664 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0337005224100557 NA NA 0.034572013259329 0.365973586822253 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 272 ACT TCA CTC 2 GTCACTCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.33333333333337 1 32.99999999999999 0 0.0309322189005369 0 -0.0309322189005369 0 0.0329238661873413 NA NA 0.0336719035983336 0.358286056578317 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 273 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.00000000000004 1 32.33333333333333 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.0342139140928181 NA NA 0.0331341030584835 0.340485887800393 0 340 660 0.66 0 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.33333333333337 1 32.33333333333333 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.034794984045119 NA NA 0.0326624828394929 0.333559444589936 0 374 626 0.626 0 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 1 31.999999999999993 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0355738683511247 NA NA 0.0338135554157349 0.345173962938735 0 344 656 0.656 0 0.001 N all ss13 276 GGG TTG GGA 2 TTTGGGAGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.16666666666671 1 31.66666666666666 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0334352898665251 NA NA 0.0343236276786298 0.347235063798974 0 397 603 0.603 0 0.001 N all ss13 277 AGA GGA GAC 2 GGGAGACGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 1 32.33333333333333 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.0336156792419411 NA NA 0.0337102979518885 0.348803347773355 0 351 649 0.649 0 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 1 32.16666666666666 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0332860694400607 NA NA 0.0342425320834763 0.353806070966564 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 1 32.83333333333333 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.035373806341884 NA NA 0.0339169907231469 0.359287041414698 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.83333333333337 1 32.83333333333333 0 0.0310925352587596 0 -0.0310925352587596 0 0.0330009296052675 NA NA 0.0318424176238461 0.328841411893112 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000004 1 32.16666666666666 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0342570483989026 NA NA 0.0339857761732604 0.35018160375266 0 390 610 0.61 0 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.00000000000004 1 31.999999999999993 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0339633514542847 NA NA 0.0335407954931907 0.341265246285752 0 362 638 0.638 0 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 1 32.66666666666666 0 0.0312545223004261 0 -0.0312545223004261 0 0.0315640979120414 NA NA 0.035012718732448 0.372038224756673 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.66666666666671 1 32.33333333333333 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.0344441031051712 NA NA 0.0353858951263348 0.372099214931081 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.00000000000004 1 32.33333333333333 0 0.0315836140125951 0 -0.0315836140125951 0 0.034422353335527 NA NA 0.0345672636769858 0.360882027714643 0 348 652 0.652 0 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTC:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.50000000000004 1 32.49999999999999 0 0.0314182062818701 0 -0.0314182062818701 0 0.0325692182336117 NA NA 0.0343227942640296 0.359995127126682 0 379 621 0.621 0 0.001 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTCGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 1 32.166666666666664 0 0.0317507728699206 0 -0.0317507728699206 0 0.0331043061191606 NA NA 0.0338748214802412 0.348605740103638 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.16666666666671 1 31.66666666666666 0 0.0322630388127681 0 -0.0322630388127681 0 0.0343227602943229 NA NA 0.0356379141673716 0.365305954530639 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 77.83333333333337 1 31.999999999999993 0 0.0319197108140969 0 -0.0319197108140969 0 0.0350922270593355 NA NA 0.0348706202469826 0.359994545203856 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.33333333333337 1 31.499999999999993 0 0.0324374878453625 0 -0.0324374878453625 0 0.0339778891061703 NA NA 0.0342879478349714 0.34413238423057 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 291 GAC AAG ACC 2 CAAGACCTA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.33333333333337 1 30.499999999999993 0 0.0335251341884302 0 -0.0335251341884302 0 0.0354939468862008 NA NA 0.0376615258674822 0.373374985476482 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 292 CTA ACC TAA 2 GACCTAATC 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.66666666666671 1 30.166666666666657 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0373209179939807 NA NA 0.0352573806530133 0.336242300117474 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333339 1 29.499999999999993 0 0.0346882632380668 0 -0.0346882632380668 0 0.0356821827515306 NA NA 0.0361836683352326 0.337724098192154 0 367 633 0.633 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000006 1 30.499999999999993 0 0.0335251341884302 0 -0.0335251341884302 0 0.0367983870038531 NA NA 0.0389192604432285 0.389016598465472 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 1 30.333333333333325 0 0.0337135408966998 0 -0.0337135408966998 0 0.0341194147501481 NA NA 0.0356147589983338 0.343833912589238 0 375 625 0.625 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.33333333333337 1 30.999999999999993 0 0.032972342565837 0 -0.032972342565837 0 0.0370280956538936 NA NA 0.0347155092142406 0.342220445647446 0 359 641 0.641 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000004 1 30.499999999999993 0 0.0335251341884302 0 -0.0335251341884302 0 0.0360242659353325 NA NA 0.0360255365620494 0.352063820205255 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 1 30.166666666666657 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0361323424793767 NA NA 0.0360236651557638 0.346622233367777 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 1 30.166666666666657 0 0.0339040775760351 0 -0.0339040775760351 0 0.0357912926922969 NA NA 0.0353487821193788 0.337493256341984 0 361 639 0.639 0 0.001 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT:TACAAATAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 1 29.833333333333325 0 0.0342916870035713 0 -0.0342916870035713 0 0.0365028797096995 NA NA 0.0356841214918473 0.336562788626101 0 346 654 0.654 0 0.001 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG:AAATATTGG 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.83333333333339 1 29.833333333333325 0 0.0342916870035713 0 -0.0342916870035713 0 0.0352256443781951 NA NA 0.0366464937819719 0.349405708489907 0 360 640 0.64 0 0.001 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG:TATTGGCCG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 30.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 30.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 29.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.66666666666671 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 28.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.50000000000006 0 28.833333333333325 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCT 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 29.166666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 309 GCT TTG CTC 2 TTTGCTCCA:TTTGCTCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000006 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT:GCTCCGAGT 1:1 FALSE 0.75 1 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.16666666666671 0 29.833333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 311 AGT CAA GTG 2 CCAAGTGCC:CCGAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.41666666666671 0 29.583333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 312 GCC GTG CCT 2 AGTGCCTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333339 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 313 TCT CCT CTG 2 GCCTCTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000006 0 29.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 314 GCA CTG CAT 2 TCTGCATTC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333339 0 27.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000006 0 28.24999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.0833333333334 0 27.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000007 0 26.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.00000000000007 0 27.16666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.333333333333318 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.8333333333334 0 27.999999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.50000000000006 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.16666666666671 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.83333333333339 0 27.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.83333333333339 0 28.49999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.33333333333339 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.66666666666671 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.33333333333339 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.00000000000006 0 27.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.00000000000006 0 28.666666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 333 ACT TGA CTT 2 CTGACTTAT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.66666666666673 0 28.33333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 334 TAT CTT ATC 2 ACTTATCAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.3333333333334 0 28.99999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 335 CAT ATC ATG 2 TATCATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.5833333333334 0 28.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 CATGGAGCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.75000000000007 0 29.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 86.41666666666674 0 30.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 88.41666666666674 0 29.41666666666666 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 87.41666666666674 0 29.749999999999993 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666674 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000007 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 345 CCA ATC CAC 2 GATCCACAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.41666666666674 0 30.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 346 CAA CAC AAT 2 CCACAATTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 CAATTCAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.08333333333341 0 31.416666666666657 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 31.74999999999999 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.75000000000007 0 32.08333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 350 AAC ACA ACG 2 GACAACGTC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 351 GTC ACG TCA 2 AACGTCATA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG 2 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.0833333333334 0 33.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG 2 FALSE 1 1 0 1 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC 2 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 32.083333333333314 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.58333333333341 0 32.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.749999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.91666666666674 0 33.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.25000000000009 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.75000000000009 0 31.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 84.08333333333343 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.41666666666676 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 85.08333333333341 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 31.249999999999986 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 83.41666666666674 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.08333333333341 0 31.58333333333332 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 82.75000000000009 0 30.916666666666654 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 81.75000000000009 0 31.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.75000000000007 0 32.91666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.25000000000007 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 33.41666666666665 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 79.25000000000009 0 32.74999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.75000000000009 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.08333333333341 0 33.24999999999998 0 0 NaN 0 0 0 NA NaN 0 NaN 0 1000 0 0 0 0.001 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAG 2 GATGAAGCT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 GCT AAG CTC 2 GAAGCTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAG CTC AGC 2 GCTCAGCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AGC CTT 2 CAGCCTTTA:CAGCCTTTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CTT TAC 2 CCTTTACCG:CCTTTGCCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAG AGA AGC 2 AAGAAGCAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AGC AGC 2 AAGCAGCCC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CCC AGC CCA 2 CAGCCCACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT CCA CTG 2 CCCACTGTG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCT CGG CTG 2 GCGGCTGAC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CTG ACA 2 GCTGACATG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AGA CCA GAC 2 TCCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA GAC AAC 2 AGACAACTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TTC 2 CAACTTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TTC AAA 2 CTTCAAAAT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA ATT 2 CAAAATTCC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC ATT CCA 2 AATTCCATG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGT TGA GTG 2 ATGAGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 GGA GTG GAG 2 AGTGGAGCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 GCT GAG CTT 2 GGAGCTTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 TCT CTT CTG 2 GCTTCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGAT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MK211377.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.50000000000003 1 33.58333333333333 0.069333399391501 0.0303839016876759 2.28191231344141 0.038949497703825 0.0308053948344191 0.0305507510057595 NaN NaN 0.0462095827511216 0.399291146948164 812 1 187 0.187 0.812 0.374 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333336 1 33.74999999999999 0.0694941228620285 0.0302307926160697 2.29878600090319 0.0392633302459589 0.0315567202631956 0.0309472275981142 NA NA 0.04371062208368 0.369049063656848 809 1 190 0.19 0.809 0.38 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.66666666666669 1 33.74999999999999 0.0691734181620252 0.0302307926160697 2.28817745669212 0.0389426255459556 0.0322842985501174 0.0312149303535265 NA NA 0.0441101133530334 0.377317174799076 817 2 181 0.181 0.817 0.362 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666669 1 34.08333333333333 0.0701445435081176 0.0299291581301553 2.34368581979735 0.0402153853779623 0.0320346007394261 0.0304670343771308 NA NA 0.0464143841716715 0.386247660223501 820 4 176 0.176 0.82 0.352 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.66666666666669 1 35.08333333333333 0.0711433450940078 0.0290593249318817 2.44821052315481 0.0420840201621261 0.0323763903669396 0.0300900148825445 NaN NaN 0.0457407189359038 0.357543527209302 825 1 174 0.174 0.825 0.348 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.33333333333334 1 35.41666666666666 0.0714826348532437 0.0287805096612113 2.48371678245795 0.0427021251920324 0.0303590607829326 0.0298788833580015 NA NA 0.0440542629161743 0.332391813940672 841 1 158 0.158 0.841 0.316 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAC:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.50000000000001 1 34.58333333333333 0.0713125861052076 0.0294878275056261 2.41837368628128 0.0418247585995815 0.0327579942303868 0.0296742455809228 NA NA 0.0428414095213814 0.328930963142914 849 2 149 0.149 0.849 0.298 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AACCAA:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.50000000000001 1 35.58333333333333 0.0703090568782304 0.0286430990492925 2.45465955891275 0.0416659578289379 0.0316035727568292 0.0289982990686951 NA NA 0.0443345705124911 0.347316357902004 829 2 169 0.169 0.829 0.338 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGA:AACCAACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.16666666666669 1 35.916666666666664 0.0706404112947758 0.0283721774047871 2.48977758340313 0.0422682338899887 0.0303283931157922 0.0281590342535567 NaN NaN 0.0433684127303518 0.329742936851152 835 3 162 0.162 0.835 0.324 N all ss13 11 CGA AAC GAA 2 CAACGAAAT:CAACGTAGT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.83333333333334 1 35.25 0.0699807987745894 0.0289192452027623 2.41986947736468 0.0410615535718271 0.0311186498085861 0.0304130504259728 NA NA 0.0415960550429397 0.323569016851527 851 0 149 0.149 0.851 0.298 N all ss13 12 AAT GAA ATG 2 CGAAATGCA:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.25000000000001 1 35.08333333333333 0.0695747645549367 0.0290593249318817 2.39423196230565 0.0405154396230549 0.0301277752328334 0.0294079957704638 NA NA 0.0444126948141867 0.361637617019411 838 6 156 0.156 0.838 0.312 N all ss13 13 GCA ATG CAC 2 AATGCACCC:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.58333333333334 1 35.74999999999999 0.0556454425645553 0.0285069944752381 1.95199261054652 0.0271384480893172 0.0289823213327618 0.0280335813743486 NaN NaN 0.0407381478565126 0.505303761713999 747 3 250 0.25 0.747 0.5 N all ss13 14 CCC CAC CCC 2 GCACCCCGC:GCCCCCCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.08333333333334 1 35.91666666666666 0.0552608903391469 0.0283721774047871 1.94771411269348 0.0268887129343598 0.0271317448691718 0.0296320505669587 NA NA 0.041413166834639 0.516157847989025 733 5 262 0.262 0.733 0.524 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.00000000000001 1 35.66666666666666 0.068855661939842 0.0285748846742028 2.40965668715382 0.0402807772656393 0.0304391533992752 0.0286260877785099 NA NA 0.0420157591115517 0.337706672162668 829 4 167 0.167 0.829 0.334 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA:CGCATTACG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.00000000000001 1 35.66666666666666 0.068855661939842 0.0285748846742028 2.40965668715382 0.0402807772656393 0.0309830613720213 0.0289523015800346 NA NA 0.0432727845463619 0.351927505859157 808 5 187 0.187 0.808 0.374 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT:ATTACGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.25000000000001 1 34.83333333333333 0.0819928280328052 0.0292720079293014 2.8010660638941 0.0527208201035038 0.0346200130934465 0.0293771028550124 NA NA 0.0456602475387405 0.248240823204418 873 1 126 0.126 0.873 0.252 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT:ACGTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666667 1 34.83333333333333 0.0812518671161106 0.0292720079293014 2.77575311240528 0.0519798591868092 0.0327474141805145 0.0293509427458322 NA NA 0.0441910666121989 0.239493931116478 876 1 123 0.123 0.876 0.246 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.41666666666667 1 34.83333333333333 0.0818063224852469 0.0292720079293014 2.79469459979745 0.0525343145559455 0.032633371907715 0.0282297799409248 NaN NaN 0.0447158225142963 0.240055354454131 885 1 114 0.114 0.885 0.228 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.75 1 35 0.0825574874404694 0.0291298749871979 2.83411746451888 0.0534276124532715 0.0343589260631355 0.0290760419327991 NaN NaN 0.0447007254475091 0.231997491717085 885 0 115 0.115 0.885 0.23 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.33333333333333 1 34.416666666666664 0.081899468973744 0.0296334842053817 2.76374753660828 0.0522659847683623 0.0330550717002728 0.029975964786562 NA NA 0.0457095179055781 0.25285691865699 881 0 119 0.119 0.881 0.238 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.66666666666666 1 34.75 0.0815281512006671 0.0293435958691742 2.77839674333552 0.052184555331493 0.0335742338917535 0.0297767562602792 NaN NaN 0.0473636703446274 0.270555393608642 866 0 134 0.134 0.866 0.268 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.33333333333333 0 34.08333333333333 0.0807955355010694 0 -Inf 0.0807955355010694 0.0319256479886381 0 NA NA 0.0323466955119539 0.0124967117811222 1000 0 0 0 1 0.001 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77 0 34.75 0.0822741879423184 0 -Inf 0.0822741879423184 0.0334917782267828 0 NaN NaN 0.0327675918643713 0.0120444194741457 999 1 0 0 0.999 0.001 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC:TCAACTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 78.08333333333334 0 34.666666666666664 0.0810687166991055 0 -Inf 0.0810687166991055 0.0337344179587564 0 NA NA 0.0324153252090153 0.0123864881383065 998 2 0 0 0.998 0.001 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT:ACTGGCAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666669 0 34.83333333333333 0.0812518671161106 0 -Inf 0.0812518671161106 0.0333092031393936 0 NA NA 0.0332032332079148 0.0144008047110837 1000 0 0 0 1 0.001 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC:GGCAGTAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.58333333333336 0 34.5 0.0664886936625221 0 -Inf 0.0664886936625221 0.0288301324083968 0 NA NA 0.0294960470027449 0.0241863507543022 994 6 0 0 0.994 0.001 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG:AGTAACCAG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.08333333333336 0 34.33333333333333 0.053060794799115 0 -Inf 0.053060794799115 0.0263375231431509 0 NA NA 0.0247788252306056 0.0322436860183635 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.91666666666669 0 34.5 0.0531784143271381 0 -Inf 0.0531784143271381 0.0250960949362315 0 NA NA 0.0267864196947558 0.0471138632883518 979 21 0 0 0.979 0.001 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.75000000000001 0 33.666666666666664 0.0525954761681725 0 -Inf 0.0525954761681725 0.0259030781622477 0 NA NA 0.0249025563713812 0.0346820507750716 985 15 0 0 0.985 0.001 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGAA:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000001 1 34.33333333333333 0.0532965566864638 0.0297068535712844 1.79408285561356 0.0235897031151794 0.0261785077996482 0.0305161296499103 NA NA 0.0412722811313288 0.567618161679732 713 3 284 0.284 0.713 0.568 N all ss13 32 GAA GAG AAC 2 GGAGAACGC:GGAGGACGC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.75000000000001 1 35.33333333333333 0.0540165882431453 0.028849710620847 1.8723441962053 0.0251668776222983 0.0262624879076831 0.0293747481922496 NA NA 0.0415108824961615 0.54433427862257 717 6 277 0.277 0.717 0.554 N all ss13 33 CGC AAC GCA 2 GAACGCAGT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.25000000000001 1 35.166666666666664 0.0398765009105086 0.0289891158257093 1.37556802871316 0.0108873850847992 0.0231510197669923 0.0300363003465201 NA NA 0.0379946876763149 0.774456755914849 611 22 367 0.367 0.611 0.734 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.25000000000001 1 34.83333333333333 0.0393532888030902 0.0292720079293014 1.34440004587787 0.0100812808737888 0.021869576599759 0.0300342582309303 NA NA 0.0375381586171528 0.788267620585845 601 16 383 0.383 0.601 0.766 N all ss13 35 GGA ATG GAG 2 AATGGGGCA:AGTGGAGCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000001 1 34.83333333333333 0.0260047718198447 0.0292720079293014 0.88838360124294 -0.00326723610945672 0.018468421335373 0.0276246889720158 NA NA 0.0359406132885668 0.92756686880109 460 52 488 0.488 0.46 0.92 N all ss13 36 GCA GAG CAA 2 GGAGCACGA:GGGGCAAGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333336 1 35 0.0258925390301244 0.0291298749871979 0.888865435965781 -0.00323733595707354 0.017140923941832 0.0301298675447329 NA NA 0.0347674733010033 0.925813053676284 463 54 483 0.483 0.463 0.926 N all ss13 37 AGG CAA GAC 2 GCAAGGCCA:GCACGACCA 1:1 TRUE 1.75 1.08333333333333 0.166666666666667 0 0 2 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.91666666666669 1 34.666666666666664 0.0257812709329177 0.029415534864961 0.876450863507082 -0.00363426393204325 0.0178948855136199 0.0297597214291386 NA NA 0.0348937142251883 0.917048411146308 452 44 504 0.504 0.452 0.904 N all ss13 38 CCA GAC CAA 2 AGGCCAAAA:CGACCAAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.16666666666669 1 35.5 0.026032982222434 0.0287116399282627 0.906704816843571 -0.00267865770582871 0.0183860484656203 0.0288537601898857 NA NA 0.0344627931881626 0.938045950662868 475 41 484 0.484 0.475 0.95 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAA:CCAAAACAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333336 1 35.83333333333333 0.0261464386246643 0.0284394261467203 0.919372932835339 -0.00229298752205604 0.0177971394963608 0.0294142534257712 NA NA 0.0335480167370654 0.945507483754106 434 49 517 0.517 0.434 0.868 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGT:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.66666666666669 1 35.83333333333333 0.026551445288187 0.0284394261467203 0.933613960816468 -0.00188798085853333 0.0183166434100295 0.0287117309131706 NA NA 0.0344225302110768 0.956260163026533 457 38 505 0.505 0.457 0.914 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGTCGG:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.66666666666669 1 36.33333333333333 0.0269087157486763 0.0280406490537152 0.959632414254372 -0.0011319333050389 0.0189934362785003 0.0300318039190124 NA NA 0.0342489257031547 0.97363456822964 460 44 496 0.496 0.46 0.92 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGTCGGCCT 1:1 FALSE 1 1 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 1 36.666666666666664 0.0270299523623976 0.0277809537602618 0.972967040500299 -7.51001397864215e-4 0.0184037662119479 0.027606268053725 NA NA 0.0327737654366315 0.981718304956227 492 45 463 0.463 0.492 0.926 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGGCCTCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 1 37.08333333333333 0.0270299523623976 0.0274630224286674 0.98423079370107 -4.33070066269785e-4 0.0189118181690723 0.028383361977788 NA NA 0.0324322530876898 0.989346110169584 503 44 453 0.453 0.503 0.906 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT:CCTCAAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333336 1 36.916666666666664 0.0270299523623976 0.0275893176123833 0.979725295933574 -5.59365249985719e-4 0.0200125822654027 0.0270811812596751 NA NA 0.0347034223650151 0.987139897403308 473 49 478 0.478 0.473 0.946 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.16666666666669 1 35.916666666666664 0.0270909813104956 0.0283721774047871 0.954843222780804 -0.00128119609429148 0.0198665935787912 0.0288758287671825 NA NA 0.0349791044382663 0.970782040423589 505 43 452 0.452 0.505 0.904 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333334 2 35.916666666666664 0.0270299523623976 0.0578600049104132 0.467161252479136 -0.0308300525480156 0.0192171571070352 0.0440293889450379 NA NA 0.0484030460349951 0.524161014267429 230 13 757 0.757 0.23 0.46 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333334 2 35.58333333333333 0.0270299523623976 0.058423686245627 0.462654003870233 -0.0313937338832294 0.0196221067451941 0.0450765189606738 NA NA 0.0497289244227639 0.527846176151768 245 16 739 0.739 0.245 0.49 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333334 2 35.58333333333333 0.0270299523623976 0.058423686245627 0.462654003870233 -0.0313937338832294 0.0200877672216367 0.0447205085150193 NA NA 0.0514740105375301 0.541931464922155 254 13 733 0.733 0.254 0.508 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666667 2 35.58333333333333 0.0272757331281561 0.058423686245627 0.466860872377729 -0.0311479531174709 0.0183200689548119 0.0450433633266981 NA NA 0.0494220089256161 0.528534578054843 267 18 715 0.715 0.267 0.534 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333334 2 35.916666666666664 0.027400307499342 0.0578600049104132 0.473562135740688 -0.0304596974110713 0.0189497693664552 0.044744768264174103 NA NA 0.046999233020439 0.516927230188547 227 21 752 0.752 0.227 0.454 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333334 2 35.916666666666664 0.027400307499342 0.0578600049104132 0.473562135740688 -0.0304596974110713 0.0191241653205069 0.0421283084312855 NA NA 0.0488875707196609 0.533247680232009 274 21 705 0.705 0.274 0.548 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000001 2 35.916666666666664 0.0271522864979704 0.0578600049104132 0.469275565047243 -0.0307077184124428 0.0183228035518712 0.0424179221113998 NA NA 0.0474785787901691 0.517780838308586 222 19 759 0.759 0.222 0.444 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.66666666666667 2 35.24999999999999 0.0272757331281561 0.0589984642956841 0.462312594976331 -0.031722731167528 0.0193212339267882 0.0439897625617822 NA NA 0.0496891075019157 0.523197549716236 258 20 722 0.722 0.258 0.516 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.33333333333334 2 34.24999999999999 0.027400307499342 0.0607927570603562 0.450716644947332 -0.0333924495610142 0.0182828729827134 0.0460846186031112 NA NA 0.0513728328701875 0.515690861200193 226 16 758 0.758 0.226 0.452 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333334 2 33.666666666666664 0.0407801460981609 0.0618907677660026 0.658905157750555 -0.0211106216678417 0.0237985619769778 0.0453285554812477 NA NA 0.0546309994970696 0.699184138006192 360 9 631 0.631 0.36 0.72 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.08333333333334 2 33.166666666666664 0.0405047802473168 0.0628640039123036 0.644323901223691 -0.0223592236649868 0.0230494507785928 0.0458144866277256 NA NA 0.054202980531129 0.679966299317075 307 5 688 0.688 0.307 0.614 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.41666666666669 2 33.49999999999999 0.0403232602433046 0.0622118122355632 0.648160836251189 -0.0218885519922586 0.022093110453314 0.0461220038977194 NA NA 0.05306387521842 0.679977075841514 341 4 655 0.655 0.341 0.682 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.41666666666669 2 33.49999999999999 0.0403232602433046 0.0622118122355632 0.648160836251189 -0.0218885519922586 0.0228006191077352 0.0479719116263492 NA NA 0.0515645120615754 0.6712094544931 346 7 647 0.647 0.346 0.692 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333336 2 32.99999999999999 0.0399650588551816 0.063195257713305 0.632405979519686 -0.0232301988581233 0.0235257512929456 0.0458151839710098 NA NA 0.0519766853152774 0.65492200598307 357 7 636 0.636 0.357 0.714 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGC:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 2 32.33333333333333 0.0394395350433882 0.0645559565784323 0.610935646123857 -0.0251164215350441 0.0225002562609593 0.0451268466242137 NA NA 0.0535178992982248 0.638848920203532 316 4 680 0.68 0.316 0.632 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000003 2 32.99999999999999 0.0401433603117785 0.063195257713305 0.635227416808632 -0.0230518974015265 0.0221777812705356 0.0439701285908321 NA NA 0.0503586753263244 0.647129011401568 323 6 671 0.671 0.323 0.646 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAA:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.4166666666667 2 33.99999999999999 0.0403232602433046 0.0612585232607004 0.65824734415649 -0.0209352630173958 0.0240378914201479 0.0452626078825301 NA NA 0.0530840186008574 0.69330067764206 337 5 658 0.658 0.337 0.674 N all ss13 63 GAA AGG AAG 2 AAGGAAGAC:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.4166666666667 2 33.333333333333336 0.0403232602433046 0.0625362067042883 0.644798627361252 -0.0222129464609837 0.0233511701764683 0.0484396767825449 NA NA 0.0545344296519615 0.68377321003366 354 4 642 0.642 0.354 0.708 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGACCTT:GAGGAACTT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 2 33.5 0.0407801460981609 0.0622118122355632 0.655504873314864 -0.0214316661374023 0.0228643731104159 0.0459249028141347 NA NA 0.0544392978873251 0.693817263732812 341 7 652 0.652 0.341 0.682 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA:GACCTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333337 2 33.75 0.0277809537602618 0.0617314855970427 0.450028919465899 -0.0339505318367809 0.0195211447246837 0.0479103969884616 NA NA 0.0512061624559151 0.507319971277309 250 16 734 0.734 0.25 0.5 N all ss13 66 AAA TTA AAT 2 CTTAAATTC:CTTAGATTC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.583333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.33333333333337 2 32.75 0.0277809537602618 0.0636987401522852 0.436130348792545 -0.0359177863920234 0.0200255129270446 0.0501861908469647 NA NA 0.0526580397384789 0.495178872702899 203 10 787 0.787 0.203 0.406 N all ss13 67 TTC AAT TCC 2 AAATTCCCT:AGATTCCCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000003 2 32.916666666666664 0.0138732279313668 0.0633621979772033 0.218951178687932 -0.0494889700458365 0.0136704956330796 0.0480150982028389 NA NA 0.0511781570205244 0.333547040178882 119 48 833 0.833 0.119 0.238 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.4166666666667 2 33.583333333333336 0.0141346939686238 0.0620508745044359 0.227792018750894 -0.0479161805358121 0.0137057685990228 0.0464171384677838 NA NA 0.0484096995403489 0.322269259870789 129 37 834 0.834 0.129 0.258 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.4166666666667 2 33.583333333333336 0.0141346939686238 0.0620508745044359 0.227792018750894 -0.0479161805358121 0.0142667572571686 0.0454633017788707 NA NA 0.0473079208760106 0.311128250565249 122 39 839 0.839 0.122 0.244 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 CGAGGACAA:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.58333333333337 2 33.583333333333336 0.0139053809368069 0.0620508745044359 0.224096453883383 -0.0481454935676289 0.013715530057976 0.0470576432625414 NA NA 0.0500978786298742 0.336537793768363 136 44 820 0.82 0.136 0.272 N all ss13 71 CAA GAC AAG 2 GGACAAGGC:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.50000000000004 2 33.666666666666664 0.0139215133950447 0.0618907677660026 0.224936834645181 -0.047969254370958 0.0137935845675675 0.0456577429702764 NA NA 0.0496647916143346 0.334114051380746 121 47 832 0.832 0.121 0.242 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGCGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000004 2 34 0.0285069944752381 0.0612585232607003 0.465355561281159 -0.0327515287854622 0.0201871728722367 0.0485313200528743 NA NA 0.0495404945314956 0.508544200427339 252 17 731 0.731 0.252 0.504 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA:GGCGTTCCG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.50000000000004 2 34 0.0285069944752381 0.0612585232607003 0.465355561281159 -0.0327515287854622 0.0202343639926813 0.0450995695611829 NA NA 0.050153017852238 0.513735607325707 240 29 731 0.731 0.24 0.48 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC:GTTCCGATT 1:1 FALSE 1.41666666666667 1 0.583333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.16666666666671 2 33.33333333333333 0.0282386296527662 0.0625362067042884 0.451556484490605 -0.0342975770515221 0.0200041734556025 0.047134406647007 NA NA 0.052791195896703 0.515896584618427 228 17 755 0.755 0.228 0.456 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCGATTAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000004 2 33.75 0.0284057619693268 0.0617314855970427 0.460150305708625 -0.0333257236277159 0.0201517764231971 0.0462930325553343 NA NA 0.0506204788938504 0.510316665644604 244 17 739 0.739 0.244 0.488 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:ATTAATACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.08333333333337 2 33.416666666666664 0.0282718985737775 0.062373587449531503 0.45326715569556 -0.0341016888757541 0.020019474584377 0.0475842895623847 NA NA 0.0527644278679727 0.518084607523535 249 8 743 0.743 0.249 0.498 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT:AATACCAAT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.75000000000003 2 34.08333333333333 0.0288150685885083 0.0611024764460933 0.471585936683433 -0.032287407857585 0.0207643471604057 0.0440123513081895 NA NA 0.0495917827757976 0.51500539028405 282 21 697 0.697 0.282 0.564 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGC:ACCAATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.25000000000003 2 34.24999999999999 0.0286089511947678 0.0607927570603562 0.47059802151043 -0.0321838058655884 0.0207236876513179 0.0446223306110793 NA NA 0.052612269880278 0.540725188787384 251 15 734 0.734 0.251 0.502 N all ss13 79 AGC ATA GCA 2 AATAGCAGT:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.25000000000003 2 34.24999999999999 0.0286089511947678 0.0607927570603562 0.47059802151043 -0.0321838058655884 0.0209465562121762 0.0454675770280598 NA NA 0.0502642440496479 0.52198261892877 265 15 720 0.72 0.265 0.53 N all ss13 80 AGT GCA GTC 2 AGCAGTCCA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.50000000000003 2 33.99999999999999 0.0431773888661084 0.0612585232607004 0.70483887903005 -0.0180811343945921 0.0235398108062735 0.0460938110709204 NA NA 0.0527351015327909 0.731698399818493 366 8 626 0.626 0.366 0.732 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 AGTCCAGAT:GGTCCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.50000000000003 1 33.666666666666664 0.0431773888661084 0.0303071537534075 1.42465997359629 0.0128702351127009 0.0251638172898602 0.0331421588072 NA NA 0.0429873556465472 0.764638041927348 625 17 358 0.358 0.625 0.716 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.75000000000003 1 33.666666666666664 0.0430225461599401 0.0303071537534075 1.41955085950963 0.0127153924065326 0.0242166515798664 0.0338417679484876 NA NA 0.0420509769845562 0.762362073260421 612 15 373 0.373 0.612 0.746 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.58333333333337 2 34.33333333333333 0.0437548116643347 0.0606390724718212 0.721561361029516 -0.0168842608074864 0.0252862760935358 0.0459256552522294 NA NA 0.0518473869547733 0.744686853816634 382 4 614 0.614 0.382 0.764 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 35.33333333333333 0.0441845540246642 0.0588537115811214 0.750752209803491 -0.0146691575564572 0.0258316098565967 0.044868220722485 NA NA 0.0520749183026356 0.778178663315972 423 5 572 0.572 0.423 0.846 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.9166666666667 2 35.66666666666666 0.0448452368647073 0.0582817382454872 0.769456063163656 -0.0134365013807799 0.0259847422714139 0.0437352645546428 NA NA 0.0517728752616503 0.795228020945776 411 11 578 0.578 0.411 0.822 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000004 2 35.33333333333333 0.0449572769752751 0.0588537115811214 0.763881763230989 -0.0138964346058463 0.0253069543575807 0.0439402239049266 NA NA 0.0526801266954589 0.791942559963314 426 6 568 0.568 0.426 0.852 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.4166666666667 2 35.66666666666666 0.0451830456487547 0.0582817382454872 0.775252197496928 -0.0130986925967325 0.0267445335117101 0.0443232635081574 NA NA 0.049345726532623 0.790664859972838 401 7 592 0.592 0.401 0.802 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000003 2 35.99999999999999 0.0449572769752751 0.0577207808520962 0.778875065645312 -0.0127635038768211 0.025658931517488 0.0429590842082685 NA NA 0.0506712378235025 0.801127221446883 407 6 587 0.587 0.407 0.814 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.25000000000003 2 35.49999999999999 0.0446228241484838 0.0585663277285774 0.761919448924404 -0.0139435035800937 0.0252348140752478 0.0432442329325845 NA NA 0.0501267278171723 0.780885665140432 400 10 590 0.59 0.4 0.8 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 35.33333333333332 0.0441845540246642 0.0588537115811214 0.750752209803491 -0.0146691575564572 0.024791698838871 0.0460718549334895 NA NA 0.0537239316168331 0.784817098397057 428 7 565 0.565 0.428 0.856 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.25000000000003 2 35.49999999999999 0.045296782717305 0.0585663277285774 0.773427060805836 -0.0132695450112725 0.0261417522556372 0.0453954388377097 NA NA 0.0513196488232596 0.795969687908491 407 9 584 0.584 0.407 0.814 N all ss13 92 ACC CTA CCA 2 GCTACCAGA:GCTACCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.58333333333337 2 34.83333333333332 0.0450698784927921 0.0597330472949441 0.754521668219107 -0.0146631688021521 0.0263177596597852 0.044654908168868 NA NA 0.0542808945051176 0.787056405577872 425 9 566 0.566 0.425 0.85 N all ss13 93 AGA CCA GAC 2 ACCAGACGA:ACCCGACGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.9166666666667 2 34.49999999999999 0.0448452368647073 0.0603340239140544 0.743282711071769 -0.0154887870493471 0.0250410392939237 0.0466505750176842 NA NA 0.0538422656502268 0.773599605212824 402 3 595 0.595 0.402 0.804 N all ss13 94 CGA GAC GAA 2 AGACGAATT:CGACGAGTT 1:1 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.25000000000004 2 34.33333333333332 0.0446228241484838 0.0606390724718212 0.735875770019732 -0.0160162483233374 0.0260451316779862 0.0473868202616101 NA NA 0.0536725651487933 0.765392843181789 391 7 602 0.602 0.391 0.782 N all ss13 95 ATT GAA TTC 2 CGAATTCGT:CGAGTTCGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.66666666666671 2 35.08333333333332 0.0443478924201168 0.0592901175479514 0.747981185637727 -0.0149422251278345 0.0252880026615953 0.04675616557989 NA NA 0.0516059134875848 0.772164483631082 402 5 593 0.593 0.402 0.804 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 ATTCGTGGT:GTTCGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.16666666666671 1 35.08333333333332 0.0440224147463932 0.0290593249318817 1.51491525868501 0.0149630898145115 0.0243613816790788 0.0293074692502537 NA NA 0.0398724431491882 0.707456726940508 665 15 320 0.32 0.665 0.64 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 1 35.58333333333332 0.0439149815636805 0.0286430990492925 1.53317842765918 0.015271882514388 0.0248129615668354 0.0287562979050208 NA NA 0.0403343813195392 0.704961247046054 654 23 323 0.323 0.654 0.646 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 35.91666666666665 0.0438080716173109 0.0283721774047871 1.54405039106795 0.0154358942125237 0.0246513327774886 0.0288304958509459 NA NA 0.0393181181668757 0.694622435548665 653 16 331 0.331 0.653 0.662 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.16666666666671 1 35.249999999999986 0.0433855884614561 0.0289192452027623 1.50023239393925 0.0144663432586939 0.0253775055150111 0.0300172514508554 NA NA 0.0388493491931021 0.709617174346069 654 14 332 0.332 0.654 0.664 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 35.249999999999986 0.0438080716173109 0.0289192452027623 1.51484145973237 0.0148888264145486 0.0242582626341951 0.0293160628902464 NA NA 0.038963623028937897 0.702371467042393 660 16 324 0.324 0.66 0.648 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 35.249999999999986 0.0438080716173109 0.0289192452027623 1.51484145973237 0.0148888264145486 0.025840461283252 0.0293003990683899 NA NA 0.0387259878503168 0.700633076422712 686 17 297 0.297 0.686 0.594 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.50000000000004 1 35.249999999999986 0.0438080716173109 0.0289192452027623 1.51484145973237 0.0148888264145486 0.0244394525474131 0.0291878153029604 NA NA 0.0381589097960667 0.696403779230077 657 19 324 0.324 0.657 0.648 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG:ATGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.83333333333337 1 35.91666666666665 0.0435958062133857 0.0283721774047871 1.53656892777041 0.0152236288085986 0.0251124857972618 0.0294599659972793 NA NA 0.0407282393008004 0.708563843911895 675 13 312 0.312 0.675 0.624 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGATCTC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.33333333333337 2 37.08333333333332 0.0591439311842397 0.0559700169039056 1.05670740256847 0.00317391428033409 0.0286493270394049 0.0403286732989949 NA NA 0.0418544847041438 0.939552662124454 546 4 450 0.45 0.546 0.9 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GATCTCAGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 37.499999999999986 0.0441845540246642 0.0553246126797069 0.798641904290658 -0.0111400586550427 0.0259787948271273 0.0385683619607476 NA NA 0.0379656108440265 0.76919733298015 388 14 598 0.598 0.388 0.776 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTCAGTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333337 2 37.999999999999986 0.044076328753575 0.0545695157118212 0.807709729115791 -0.0104931869582462 0.025403011235254 0.0383200075739825 NA NA 0.035651161142351 0.768506164339366 444 19 537 0.537 0.444 0.888 N all ss13 107 CCA GCC CAA 2 AGCCCCAGA:AGTCCAAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333337 2 37.33333333333332 0.044076328753575 0.0555809791152914 0.793011016631205 -0.0115046503617164 0.0260925312949506 0.0408507608152251 NA NA 0.0383959600357616 0.764458030211927 402 13 585 0.585 0.402 0.804 N all ss13 108 AGA CAA GAT 2 CCAAGATGG:CCCAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.08333333333337 2 37.33333333333332 0.044076328753575 0.0555809791152914 0.793011016631205 -0.0115046503617164 0.0262406735097686 0.0405817031178913 NA NA 0.0366643264974399 0.75368569106327 415 12 573 0.573 0.415 0.83 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC 2 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.00000000000003 2 37.499999999999986 0.0594370287406054 0.0553246126797069 1.07433248714648 0.00411241606089852 0.0305029931278287 0.0414237676081001 NA NA 0.0415896425471403 0.921232933915971 563 7 430 0.43 0.563 0.86 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTACTTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.33333333333337 2 38.16666666666666 0.0609472230590743 0.0543223783836109 1.12195424560906 0.00662484467546337 0.0312492017720851 0.0384478300717787 NA NA 0.0397164050495676 0.86752448030455 590 8 402 0.402 0.59 0.804 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TACTTTTAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.83333333333337 2 37.16666666666666 0.0604861633757488 0.0558397336460622 1.08321009837077 0.00464642972968653 0.0300872701108371 0.0411687599665095 NA NA 0.0440113629666126 0.915920821441544 573 5 422 0.422 0.573 0.844 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTATTAC:TTTTACTAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.83333333333337 2 36.16666666666666 0.0604861633757488 0.0574443341110379 1.0529526420975 0.00304182926471092 0.0303251911711313 0.0408930042348499 NA NA 0.0441106112155393 0.945022153511637 522 2 476 0.476 0.522 0.952 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTACCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.1666666666667 2 35.83333333333332 0.0601826482875392 0.0579999025523778 1.03763361038737 0.00218274573516138 0.030170185419149 0.041859046307009 NA NA 0.0436332270007339 0.960102583857041 546 9 445 0.445 0.546 0.89 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.6666666666667 2 35.33333333333332 0.0597330472949441 0.0588537115811214 1.01494104093351 8.79335713822649e-4 0.0298612459110466 0.0425663753011236 NA NA 0.0441110860003846 0.984095564452565 542 6 452 0.452 0.542 0.904 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.33333333333337 2 35.66666666666666 0.0582817382454872 0.0582817382454872 1 0 0.0281300764485924 0.0444851436679127 NA NA 0.0416850081243293 1 515 2 483 0.483 0.515 0.966 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC:GGAACTGGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.83333333333337 2 36.16666666666666 0.0578600049104132 0.0574443341110379 1.00723606263016 4.15670799375385e-4 0.0288056379469729 0.0431110110787229 NA NA 0.0437563143773388 0.992420469373461 496 7 497 0.497 0.496 0.992 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA:ACTGGGCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.16666666666671 2 35.83333333333332 0.0575822255219405 0.0579999025523778 0.992798659789814 -4.17677030437338e-4 0.0290930630608241 0.0413664704403745 NA NA 0.0438533676862271 0.992400742905284 522 3 475 0.475 0.522 0.95 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA:GGGCCAGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333339 2 35.16666666666665 0.0570345959917882 0.0591439311842398 0.964335559875438 -0.00210933519245153 0.0293708357269646 0.0437956294845646 NA NA 0.0435065619024343 0.961331192529002 506 1 493 0.493 0.506 0.986 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666671 2 34.16666666666665 0.0559700169039055 0.0609472230590744 0.918335800954465 -0.00497720615516889 0.0290683460991884 0.0448656148309509 NA NA 0.0451867422907002 0.912292407254912 470 3 527 0.527 0.47 0.94 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTGGA:GAAGCTTCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000004 2 34.16666666666665 0.0564972895530331 0.0609472230590744 0.92698709994173 -0.00444993350604127 0.0289742939806658 0.0430419600434851 NA NA 0.0422853602753051 0.916188708090052 471 6 523 0.523 0.471 0.942 N all ss13 121 GGA CTG CAC 2 GCTGGACTT:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666671 2 34.16666666666665 0.0559700169039055 0.0609472230590744 0.918335800954465 -0.00497720615516889 0.0276209325518442 0.045222886541295 NA NA 0.043924466030091 0.90978253499957 479 7 514 0.514 0.479 0.958 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 GGACTTCCC:TCACTTCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333339 2 33.499999999999986 0.0412002891133781 0.0622118122355633 0.66225830164494 -0.0210115231221852 0.0238535825015582 0.0441022515341652 NA NA 0.0423406195928289 0.619718194007767 313 14 673 0.673 0.313 0.626 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333339 2 34.16666666666665 0.0412002891133781 0.0609472230590744 0.675999447480056 -0.0197469339456964 0.0229986875703279 0.0439847390903491 NA NA 0.0423917935831369 0.64134453955428 317 12 671 0.671 0.317 0.634 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.16666666666671 2 34.83333333333332 0.041581086362894 0.0597330472949441 0.696115270288805 -0.0181519609320501 0.0238385028975444 0.0428572417979067 NA NA 0.0408490877130697 0.656777721575628 320 14 666 0.666 0.32 0.64 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.16666666666671 2 34.83333333333332 0.041581086362894 0.0597330472949441 0.696115270288805 -0.0181519609320501 0.0235922858857856 0.044838900050761 NA NA 0.0412527897299908 0.659924230272065 318 15 667 0.667 0.318 0.636 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.66666666666671 2 34.999999999999986 0.0412948328872705 0.0594370287406055 0.694766103929741 -0.018142195853335 0.0238305800519522 0.0454531269820883 NA NA 0.0427699816986357 0.671434118977342 320 14 666 0.666 0.32 0.64 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 2 34.08333333333332 0.0407801460981609 0.0611024764460933 0.667405782384918 -0.0203223303479323 0.0240755014080217 0.0442518694400538 NA NA 0.041406233803773 0.623565333963527 294 12 694 0.694 0.294 0.588 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AACAAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 2 33.74999999999999 0.0405961546323978 0.0617314855970427 0.657624779960626 -0.0211353309646449 0.0232196704017566 0.0440265465847717 NA NA 0.0432079557560324 0.624732893352453 312 14 674 0.674 0.312 0.624 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC:AAAGACGGC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 2 33.24999999999999 0.0405961546323978 0.0626996766264699 0.64746992036733 -0.0221035219940721 0.0232419133652208 0.0449901780333274 NA NA 0.041387757413525 0.593300419713218 319 15 666 0.666 0.319 0.638 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC:GACGGCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333337 2 33.16666666666666 0.0270299523623976 0.0628640039123036 0.429975036272027 -0.035834051549906 0.0202884632337272 0.0455626985879634 NA NA 0.0390597880252063 0.358924999306953 144 55 801 0.801 0.144 0.288 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000004 2 33.49999999999999 0.0271522864979704 0.0622118122355632 0.43644905239473 -0.0350595257375927 0.0199485269505929 0.0471640534183395 NA NA 0.0407100947485131 0.389128006393756 152 55 793 0.793 0.152 0.304 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666671 2 33.49999999999999 0.0269995408952429 0.0622118122355632 0.433993801579191 -0.0352122713403203 0.0188155476508979 0.0451880831821468 NA NA 0.0411581957156631 0.392255112530322 147 54 799 0.799 0.147 0.294 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 1 33.49999999999999 0.0268184996810859 0.0304610393656427 0.880419717763629 -0.00364253968455675 0.0189501824834461 0.0308079666228087 NA NA 0.0226800369933605 0.872404087923275 372 112 516 0.516 0.372 0.744 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.58333333333339 1 32.83333333333332 0.0269389228181416 0.0310925352587596 0.866411265403396 -0.004153612440618 0.0197336875101598 0.0324175032975882 NA NA 0.0227757553785472 0.855292438762616 368 129 503 0.503 0.368 0.736 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 1 32.49999999999999 0.0268184996810859 0.0314182062818701 0.853597415475675 -0.00459970660078417 0.0187467023174256 0.0307425903365449 NA NA 0.0226169334620025 0.838842361627297 365 114 521 0.521 0.365 0.73 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000006 1 33.16666666666666 0.0270604324233619 0.0307735475083969 0.879340687516713 -0.00371311508503493 0.0195914566243319 0.0303710811699032 NA NA 0.022503963721812 0.868945343636348 364 126 510 0.51 0.364 0.728 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666671 1 33.49999999999999 0.0271830432683088 0.0304610393656427 0.89238725382985 -0.00327799609733386 0.018589088112455 0.0300435597087322 NA NA 0.0221777889898232 0.882496378720306 364 133 503 0.503 0.364 0.728 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333339 1 33.166666666666664 0.0273067703935705 0.0307735475083969 0.887345548514341 -0.00346677711482632 0.0199061204272576 0.0321091305249492 NA NA 0.0224597248265978 0.877329612374892 361 143 496 0.496 0.361 0.722 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333339 1 33.666666666666664 0.0274944876870936 0.0303071537534075 0.907194648194318 -0.00281266606631388 0.0194469562305474 0.0297236040448115 NA NA 0.0228304319020317 0.901950221979571 394 124 482 0.482 0.394 0.788 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333339 1 33.666666666666664 0.0274944876870936 0.0303071537534075 0.907194648194318 -0.00281266606631388 0.0195177124415852 0.0296980828330222 NA NA 0.0211855770120183 0.89438061892491 374 127 499 0.499 0.374 0.748 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000006 1 33.33333333333333 0.0268785763539719 0.0306164958901914 0.877911582382717 -0.00373791953621951 0.0184129445329003 0.0291405673742368 NA NA 0.0224906750194952 0.868000631950523 370 133 497 0.497 0.37 0.74 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCA:AATACACCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000006 1 34.33333333333333 0.0268785763539719 0.0297068535712844 0.904793780649782 -0.00282827721731251 0.0186477238129184 0.030417297561408 NA NA 0.0219600724992835 0.897522395871873 359 134 507 0.507 0.359 0.718 N all ss13 143 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666673 1 34.666666666666664 0.0269995408952429 0.029415534864961 0.917866733315942 -0.00241599396971805 0.0196360318551651 0.0297206516523389 NA NA 0.0216932096605782 0.911322173290266 386 136 478 0.478 0.386 0.772 N all ss13 144 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGAT:CCCAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333339 2 35.33333333333333 0.0410592825874941 0.0588537115811214 0.697649842030774 -0.0177944289936273 0.0247741930772105 0.0438402168378138 NA NA 0.0276526689591972 0.519901203890322 232 35 733 0.733 0.232 0.464 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333339 2 35.58333333333333 0.0554524994575896 0.058423686245627 0.949144140348388 -0.00297118678803739 0.0294239803432518 0.0389159476052756 NA NA 0.0293338347912209 0.919321264613132 438 20 542 0.542 0.438 0.876 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666673 2 36.08333333333333 0.0571705240409131 0.0575822255219405 0.992850198524012 -4.11701481027447e-4 0.0283208516528566 0.0403315585595052 NA NA 0.028745300119295 0.988572774548599 506 25 469 0.469 0.506 0.938 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000007 2 35.75 0.0573071018565007 0.0581404786806199 0.985666151310911 -8.33376824119193e-4 0.0283205919784509 0.0436071770937963 NA NA 0.0307270019553481 0.978362451707563 485 14 501 0.501 0.485 0.97 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666673 2 34.75 0.0563645417845084 0.0598821656332629 0.941257571239199 -0.00351762384875444 0.0281929755568853 0.0441057623706425 NA NA 0.0317121517202081 0.911676985598164 449 18 533 0.533 0.449 0.898 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.16666666666673 2 35.25 0.0575822255219405 0.0589984642956841 0.975995328172512 -0.00141623877374368 0.0297388857693269 0.0407508497943904 NA NA 0.0317033760689819 0.964369115275239 487 14 499 0.499 0.487 0.974 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 2 34.583333333333336 0.0570345959917882 0.0601826482875392 0.947691695441679 -0.00314805229575094 0.0296214055318987 0.0423205523200544 NA NA 0.0333214186537928 0.924731572093931 479 15 506 0.506 0.479 0.958 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666673 2 34.75 0.0571705240409131 0.0598821656332629 0.954717041982804 -0.00271164159234979 0.0288635908653261 0.0415512788118895 NA NA 0.0309329600407495 0.930145414150682 438 18 544 0.544 0.438 0.876 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT:AATCCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.33333333333339 2 34.41666666666667 0.0574443341110378 0.0604861633757488 0.949710328859598 -0.00304182926471101 0.0294336267645055 0.0435174879669569 NA NA 0.0309331823504592 0.921665907518988 469 10 521 0.521 0.469 0.938 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC:CCTGCTAAC 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000006 2 34.41666666666667 0.0568993130810351 0.0604861633757488 0.940699656011712 -0.00358685029471367 0.0292818778076675 0.0437628856301578 NA NA 0.0319601525583375 0.910641976325111 474 15 511 0.511 0.474 0.948 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT:GCTAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.50000000000006 1 34.25 0.0419689902360334 0.0297805871963345 1.40927342900744 0.0121884030396989 0.0254301088991766 0.0306350674354302 NA NA 0.0266929268143281 0.647947465490089 643 47 310 0.31 0.643 0.62 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.3333333333334 1 34.083333333333336 0.0420670999882826 0.0299291581301553 1.40555573950133 0.0121379418581272 0.0236216030942821 0.0305201426710695 NA NA 0.0271917291994618 0.655320180223253 644 40 316 0.316 0.644 0.632 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCA:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.66666666666673 1 34.083333333333336 0.042464170499631 0.0299291581301553 1.4188227518784 0.0125350123694756 0.0258204309587864 0.0317766168738922 NA NA 0.0258009969171712 0.627084568193862 653 47 300 0.3 0.653 0.6 N all ss13 157 GCA CTG CAA 2 GCTGCAATC:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000006 1 34.083333333333336 0.0568993130810351 0.0299291581301553 1.90113309681457 0.0269701549508798 0.0277348355161336 0.0294935500825747 NA NA 0.0303611070312703 0.374372605716518 800 13 187 0.187 0.8 0.374 N all ss13 158 ACC CAA CCG 2 GCAATCGTG:GCCACCGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666673 1 33.916666666666664 0.0567646707244322 0.0300792190929219 1.8871723547434 0.0266854516315103 0.0280508083815099 0.0315749748212541 NA NA 0.0291058955504487 0.359226446192999 784 17 199 0.199 0.784 0.398 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000007 1 34.58333333333333 0.0427161696956043 0.0294878275056261 1.44860348519925 0.0132283421899782 0.0251541078794823 0.030234963616654 NA NA 0.0258469840457932 0.608794896528052 658 51 291 0.291 0.658 0.582 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.0833333333334 1 34.75 0.0428178090539073 0.0293435958691742 1.45918752578269 0.0134742131847331 0.025159896950887 0.0301688060617174 NA NA 0.026259707930122 0.607871861022012 651 63 286 0.286 0.651 0.572 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.91666666666673 1 35.333333333333336 0.0429199333819239 0.028849710620847 1.48770758729585 0.0140702227610768 0.0256200501557269 0.0285665519719376 NA NA 0.0251102102316955 0.57524842967676 716 40 244 0.244 0.716 0.488 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.58333333333339 1 36 0.0425143321315747 0.0283052459871352 1.50199479456556 0.0142090861444395 0.0244546939462817 0.0296913184398957 NA NA 0.0259868581813552 0.584530101083934 685 46 269 0.269 0.685 0.538 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.58333333333339 1 36 0.0425143321315747 0.0283052459871352 1.50199479456556 0.0142090861444395 0.0246039549509086 0.0297907122151162 NA NA 0.0246177400099115 0.563811858254647 666 46 288 0.288 0.666 0.576 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000004 2 36.666666666666664 0.0427161696956043 0.0566306643811089 0.754293988291152 -0.0139144946855046 0.0249262587416446 0.0411416563205191 NA NA 0.038838704595977 0.720146044856833 356 14 630 0.63 0.356 0.712 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.91666666666671 3 36.666666666666664 0.0577903089878649 0.0866346653413833 0.667057565930942 -0.0288443563535184 0.0288283078402223 0.0535002356696703 NA NA 0.0436434088212227 0.508670164454277 233 6 761 0.761 0.233 0.466 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.25000000000004 3 36.333333333333336 0.0575131971253351 0.0874776777943207 0.657461407018157 -0.0299644806689856 0.0294688081710432 0.0524229725879644 NA NA 0.0413181624462834 0.468321188755226 228 3 769 0.769 0.228 0.456 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.9166666666667 4 37 0.0577903089878649 0.116739982283845 0.495034416292371 -0.0589496732959801 0.028685100537115 0.0597525448820442 NaN NaN 0.054796976511377 0.282024173952068 118 1 881 0.881 0.118 0.236 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.9166666666667 4 37.66666666666667 0.0729614963194685 0.114507630156718 0.637175847754525 -0.0415461338372498 0.0333550203096496 0.0604398111063604 NaN NaN 0.0569928990870545 0.466019797009672 251 1 748 0.748 0.251 0.502 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.08333333333337 5 38.16666666666667 0.0738603741781928 0.143981241370948 0.512986090930426 -0.070120867192755107 0.0335057743958345 0.0694805145249459 NaN NaN 0.0660032224906568 0.28806070911556 126 2 872 0.872 0.126 0.252 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.58333333333337 5 38.66666666666667 0.0744104199635986 0.141931499728896 0.524269947867318 -0.0675210797652976 0.0324192050837832 0.0667926614535266 NaN NaN 0.0627106959099209 0.281610938246547 147 1 852 0.852 0.147 0.294 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.25000000000003 5 39.333333333333336 0.0759181073184851 0.13928785934632 0.5450446842587 -0.0633697520278346 0.0334287332668231 0.0654744083799453 NaN NaN 0.0629700805629884 0.314248676292178 139 0 861 0.861 0.139 0.278 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.91666666666669 5 39.66666666666667 0.0763046324181554 0.138002732232705 0.552921171803238 -0.0616980998145491 0.0341600052118281 0.0641876775714963 NaN NaN 0.0628520250917186 0.32627693687972 137 0 863 0.863 0.137 0.274 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.58333333333336 5 39.333333333333336 0.0766951169694829 0.13928785934632 0.550623129175898 -0.0625927423768367 0.0336120579892227 0.0681983944610697 NA NA 0.0621979616075375 0.314248599382016 150 0 850 0.85 0.15 0.3 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.16666666666669 5 38.333333333333336 0.0760143706952156 0.143291427572032 0.530487915315126 -0.0672770568768163 0.0338083698858861 0.0657114842716423 NaN NaN 0.0670407435687467 0.315607659103711 129 0 871 0.871 0.129 0.258 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.66666666666669 5 37.333333333333336 0.0754404276788764 0.147532720684541 0.511347091877914 -0.0720922930056643 0.0338350173549449 0.0689153036299892 NaN NaN 0.0658934677503524 0.273922769601449 121 0 879 0.879 0.121 0.242 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.83333333333336 5 37.25000000000001 0.0764018799879129 0.147897559919249 0.516586480734556 -0.0714956799313359 0.0340912091615931 0.0680823563273107 NA NA 0.0682521339174224 0.29485843095334 140 0 860 0.86 0.14 0.28 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.58333333333336 5 37.16666666666667 0.0755354817013731 0.148264213964023 0.509465363770801 -0.0727287322626503 0.0321235285502982 0.0686732830753302 NaN NaN 0.0657641609309183 0.268768839258141 119 1 880 0.88 0.119 0.238 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC:AGCAGAGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.25000000000001 5 37.00000000000001 0.0759181073184851 0.149003021096613 0.509507168108088 -0.073084913778128 0.0321520001061912 0.0694406284301457 NaN NaN 0.0692759859925819 0.291433586696485 120 0 880 0.88 0.12 0.24 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC:AGAGGTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.25000000000001 5 36.50000000000001 0.0770896221786507 0.151264442981809 0.50963478699301 -0.0741748208031586 0.0339226938850986 0.0750887089004499 NaN NaN 0.0697659528181605 0.287693473535064 141 0 859 0.859 0.141 0.282 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT:GGTGGCAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.25000000000001 5 36.16666666666667 0.0770896221786507 0.152810715724973 0.504477855580468 -0.0757210935463221 0.0341147357242819 0.0743542746250161 NaN NaN 0.0700869449596974 0.279969441992642 115 0 885 0.885 0.115 0.23 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.91666666666669 5 36.16666666666667 0.0763046324181554 0.152810715724973 0.499340848291606 -0.0765060833068174 0.0343652903908456 0.078274887222253 NaN NaN 0.0715308052888033 0.284819956544581 131 1 868 0.868 0.131 0.262 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC:AGTCAAGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.58333333333334 5 35.833333333333336 0.076695116969483 0.154389040653112 0.496765292698496 -0.0776939236836285 0.0342328410131543 0.0755460248257999 NaN NaN 0.0710242129192454 0.273995521336357 124 0 876 0.876 0.124 0.248 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT:CAAGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.58333333333334 5 35.833333333333336 0.076695116969483 0.154389040653112 0.496765292698496 -0.0776939236836285 0.0341232869844842 0.076239063377764 NaN NaN 0.0704730665926787 0.270260588057371 112 0 888 0.888 0.112 0.224 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT:GCTTCTTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.25000000000001 5 35.833333333333336 0.0759181073184851 0.154389040653112 0.491732489542839 -0.0784709333346265 0.0324650129490679 0.0742749390639454 NaN NaN 0.0707567684320028 0.267419956795555 114 0 886 0.886 0.114 0.228 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.91666666666667 5 35.833333333333336 0.0751566968036822 0.154389040653112 0.486800724233709 -0.0792323438494293 0.0331355559457159 0.0705970828498433 NA NA 0.0726694014579857 0.275575589116727 95 0 905 0.905 0.095 0.19 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.08333333333334 6 35.16666666666667 0.0895472205406727 0.193580949501978 0.462582814946663 -0.104033728961305 0.0369669058440967 0.088854477871621207 NaN NaN 0.0784471488236009 0.184785616048528 80 0 920 0.92 0.08 0.16 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGCTCTTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.33333333333334 6 34.91666666666667 0.089213957146024 0.195163947524611 0.457123143273036 -0.105949990378587 0.0359500761088886 0.0908183999803795 0.267857321963253 0.0878979267166686 0.0819101604602667 0.19584156905461 53 1 946 0.946 0.053 0.106 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA:TCTTCATCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.33333333333334 6 34.91666666666667 0.089213957146024 0.195163947524611 0.457123143273036 -0.105949990378587 0.0354415422918838 0.0873273380411224 NaN NaN 0.0818069202443561 0.195277943425275 69 0 931 0.931 0.069 0.138 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.00000000000001 6 34.91666666666667 0.0883372767422875 0.195163947524611 0.452631123026182 -0.106826670782323 0.0360398647581621 0.0915784223476363 NaN NaN 0.0786756357132864 0.174523553961369 58 0 942 0.942 0.058 0.116 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.00000000000001 6 34.91666666666667 0.0883372767422875 0.195163947524611 0.452631123026182 -0.106826670782323 0.0343686609640598 0.0905371477308444 NaN NaN 0.0806662670622694 0.185402058796671 49 0 951 0.951 0.049 0.098 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.00000000000001 6 35.583333333333336 0.0883372767422875 0.190999228388671 0.462500699544853 -0.102661951646384 0.0365090112140057 0.0854930598157188 NaN NaN 0.0807210719631642 0.203440260338509 93 0 907 0.907 0.093 0.186 N all ss13 192 CGC GTC GCA 2 AGTCGCAAC:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.00000000000001 6 34.583333333333336 0.0870541284395655 0.19731556308439 0.441192408134239 -0.110261434644825 0.0345495827025378 0.0921197076033964 NaN NaN 0.0841605478528681 0.190151153498388 66 0 934 0.934 0.066 0.132 N all ss13 193 AAC GCA ACA 2 CGCAACAGT:CGCGGTAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.66666666666669 6 33.583333333333336 0.0849965139802523 0.204066610769614 0.416513576913428 -0.119070096789362 0.0350406698500268 0.0933177969231468 NaN NaN 0.0856093603424286 0.164269790967412 56 0 944 0.944 0.056 0.112 N all ss13 194 AAT ACA ATT 2 AACAGTTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.75000000000003 5 32.833333333333336 0.0690937042816379 0.17021844254226 0.405911975516307 -0.101124738260622 0.0312174289713031 0.0831580468106262 NaN NaN 0.0828371719188675 0.222174926502864 72 0 928 0.928 0.072 0.144 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AGTTCAAGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.08333333333336 6 32.16666666666667 0.0545075207127158 0.214467334863233 0.254153019374608 -0.159959814150518 0.0272417185539985 0.100866819331894 NaN NaN 0.0983629389686504 0.103902786192007 11 0 989 0.989 0.011 0.022 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAC:TCAAGAAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333336 6 32.333333333333336 0.0534152253723939 0.213188653016244 0.250553791755155 -0.15977342764385 0.0275409191420024 0.103426123132823 NaN NaN 0.0929219914199489 0.085534991458766 19 0 981 0.981 0.019 0.038 N all ss13 197 AAC GAA ACT 2 AGAAACTCA:AGAAATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000001 6 32.50000000000001 0.0536541558618204 0.211925228838758 0.253174934177577 -0.158271072976937 0.0273394699759025 0.102661784523562 0.191725330349255 0.186665289919016 0.102177616339396 0.12138655425873 14 1 985 0.985 0.014 0.028 N all ss13 198 TCA ACT CAA 2 AACTCAACT:AATTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666669 6 33.16666666666667 0.0546316519559279 0.207018740932176 0.263897131776231 -0.152387088976248 0.0274468696966056 0.0984562456411939 NaN NaN 0.0961602976050415 0.113030102439558 11 0 989 0.989 0.011 0.022 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCA:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.41666666666669 6 33.66666666666667 0.0542609435735893 0.203486321240682 0.266656467337723 -0.149225377667092 0.0272001970003627 0.100194244010867 NaN NaN 0.0877134213451858 0.0888898050171878 16 0 984 0.984 0.016 0.032 N all ss13 200 CCA CTC CAG 2 ACTCCAGGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.91666666666669 6 34.833333333333336 0.0546316519559279 0.195697415235261 0.279163891307668 -0.141065763279333 0.0271033189308028 0.0953723076886461 NaN NaN 0.0898907423022174 0.116577478731537 27 0 973 0.973 0.027 0.054 N all ss13 201 GGC CAG GCA 2 CCAGGCAGC:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 6 34.166666666666664 0.0536541558618204 0.200073130342575 0.268172721494141 -0.146418974480755 0.0266988701641771 0.0945906294594258 NaN NaN 0.0934502888962841 0.117158790680918 12 0 988 0.988 0.012 0.024 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.25000000000003 6 34.166666666666664 0.0536541558618204 0.200073130342575 0.268172721494141 -0.146418974480755 0.0261054944129704 0.107077042662553 NA NA 0.0904508223887289 0.105497004966263 12 0 988 0.988 0.012 0.024 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.25000000000003 6 34.49999999999999 0.0543839525266103 0.197860943283853 0.274859462529654 -0.143476990757243 0.0275224248408859 0.0913644025936176 0.201288421190072 0.172095760551496 0.0889897054802244 0.106899389729271 15 0 985 0.985 0.015 0.03 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.41666666666669 6 34.666666666666664 0.0550074627952336 0.196773198350618 0.279547536231124 -0.141765735555385 0.0262640237863031 0.0970620921250556 NaN NaN 0.0860075574499834 0.0992923681242867 18 0 982 0.982 0.018 0.036 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.33333333333334 6 35.08333333333333 0.0550706014161129 0.194105738514483 0.283714442641292 -0.13903513709837 0.0261268803592948 0.0960342278861615 NaN NaN 0.0863947810956326 0.107550718925462 19 0 981 0.981 0.019 0.038 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAACTTCC 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000001 6 34.416666666666664 0.0545695157118212 0.198409364312814 0.275034980837832 -0.143839848600993 0.0271731789753723 0.0995351627956897 NaN NaN 0.0893247573166585 0.107331910490456 15 0 985 0.985 0.015 0.03 N all ss13 207 TCC ATT CCC 2 AATTCTCCT:ACTTCCCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.00000000000001 6 35.08333333333333 0.0411061773712463 0.194105738514483 0.211772087140944 -0.152999561143237 0.0249949508573099 0.0931616465306172 0.160793286372078 0.187823346662431 0.084147664451326 0.0690294346403228 3 0 997 0.997 0.003 0.006 N all ss13 208 CCT CCC CTG 2 TCCCCTGCT:TCTCCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.25000000000001 6 35.49999999999999 0.0409658133601689 0.191510018856633 0.21390950512535 -0.150544205496465 0.0235580496265492 0.091075835685811 NaN NaN 0.0853338086545641 0.0777016651629412 7 0 993 0.993 0.007 0.014 N all ss13 209 GCT CTG CTA 2 CCTGCTAGG:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000001 6 34.666666666666664 0.0401433603117785 0.196773198350618 0.204008272713286 -0.15662983803884 0.0231428997430285 0.0882069440991114 NA NA 0.0866120938920541 0.0705433208405898 5 2 993 0.993 0.005 0.01 N all ss13 210 AGG CTA GAA 2 GCTAGGATG:GCTCGAATG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.58333333333336 6 33.83333333333333 0.0397005575048303 0.202335646591906 0.196211385257799 -0.162635089087075 0.0232095711548732 0.096050075220313 NA NA 0.0934341408159886 0.0817469151402771 8 2 990 0.99 0.008 0.016 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 AGGATGGCT:CGAATGGCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.25000000000003 6 34.08333333333333 0.0398765009105086 0.200633974126986 0.19875248488708 -0.160757473216478 0.0235180693296983 0.0956262979915597 NA NA 0.087994916393694 0.0677155574510514 6 3 991 0.991 0.006 0.012 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATGGCTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333337 6 34.416666666666664 0.0402331091273882 0.198409364312814 0.202778277460515 -0.158176255185426 0.0222027667647246 0.0926320781850911 NaN NaN 0.0925617863363766 0.0874746416013408 9 1 990 0.99 0.009 0.018 N all ss13 213 AGC CTA GCA 2 GCTAGCGGA:GCTGGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333337 6 34.58333333333333 0.0399650588551816 0.19731556308439 0.202543875558812 -0.157350504229209 0.0224640999948094 0.0912952002385157 NaN NaN 0.0921868961790853 0.0878473135422356 5 0 995 0.995 0.005 0.01 N all ss13 214 AAT GCA ATG 2 AGCGGAGGT:GGCAATGGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666671 5 33.916666666666664 0.0397883346582442 0.164139760909006 0.242405218808023 -0.124351426250762 0.0223727940279346 0.0822239710731585 NA NA 0.0743607358361106 0.0944705663295969 12 2 986 0.986 0.012 0.024 N all ss13 215 GGC ATG GCA 2 AATGGCAGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.75000000000004 4 34.24999999999999 0.0265221005560517 0.126951325912032 0.208915506518062 -0.10042922535598 0.0181702574904129 0.0701579485505956 NA NA 0.0696341209878935 0.149234231623803 29 5 966 0.966 0.029 0.058 N all ss13 216 AGT GCA GTG 2 GGCAGTGAT:GGTGGTGAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 4 35.08333333333332 0.0268184996810859 0.123672788927057 0.216850447974483 -0.0968542892459709 0.0190552037845735 0.0721418530369885 NA NA 0.0674503620718655 0.151021033837201 36 5 959 0.959 0.036 0.072 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 AGTGATGCT:GGTGAAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.58333333333339 3 35.08333333333332 0.0269389228181416 0.0907908105289244 0.296714201153203 -0.0638518877107828 0.0186887158042151 0.0610952610657187 NA NA 0.05542042782321 0.249265060765649 65 9 926 0.926 0.065 0.13 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC:GATGCTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.83333333333339 3 34.83333333333332 0.0133041182530361 0.0914838201648647 0.145425914976665 -0.0781797019118285 0.0139517871227716 0.0588454290326791 NA NA 0.0539645064583538 0.147414539370355 0 53 947 0.947 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC:GCTGCTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.00000000000006 2 34.33333333333332 0.0131007697802931 0.0606390724718212 0.216045022561666 -0.047538302691528 0.0129584085916463 0.0476578650485425 NA NA 0.0412976581915427 0.24968543694969 0 142 858 0.858 0 0.001 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG:GCTCTTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666673 2 33.66666666666666 0.0129873375085957 0.0618907677660027 0.209842888970102 -0.048903430257407 0.0125967771589535 0.0507469433857045 NA NA 0.0437059102275603 0.263174141095254 0 134 866 0.866 0 0.001 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA:CTTGCTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.50000000000006 2 33.499999999999986 0.0128482799476378 0.0622118122355633 0.206524765730793 -0.0493635322879255 0.0124900752446788 0.0512529308467173 NA NA 0.0412218588563732 0.231108360546022 0 115 885 0.885 0 0.001 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG:GCTTTGCTG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.66666666666673 2 33.33333333333332 0.0128208250194751 0.0625362067042884 0.205014433959837 -0.0497153816848133 0.0129893974034118 0.0482625172409155 NA NA 0.0404629110786352 0.219197257400728 0 141 859 0.859 0 0.001 N all ss13 223 CTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0 0.75 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.3333333333334 2 33.66666666666665 0.0128758527167741 0.0618907677660027 0.208041573590673 -0.0490149150492286 0.0132749675122386 0.0470737508418619 NA NA 0.0438306820635475 0.263448011358857 0 128 872 0.872 0 0.001 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTT:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.91666666666674 2 34.16666666666665 0.0127798619317583 0.0609472230590744 0.209687353915554 -0.0481673611273161 0.0128413527865824 0.0510757661299084 NA NA 0.0399438980791602 0.227865565621351 0 126 874 0.874 0 0.001 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTTGAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333341 2 34.499999999999986 0.012752698321938 0.0603340239140544 0.211368271078757 -0.0475813255921164 0.0128843391243612 0.0478796725229391 NA NA 0.0388812848416476 0.221043122893338 0 122 878 0.878 0 0.001 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTTGACAGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.41666666666674 2 34.91666666666665 0.012698716061835 0.059584670169267 0.213120522875443 -0.046885954107432 0.0128989483459261 0.0477189949324422 NA NA 0.039254869052837 0.23232214928402 0 140 860 0.86 0 0.001 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000009 2 34.91666666666665 0.0128071415099282 0.059584670169267 0.21494020984837 -0.0467775286593388 0.012679528884303 0.0449562764877962 NA NA 0.0396999207356607 0.238685941470073 0 139 861 0.861 0 0.001 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000009 2 34.91666666666665 0.0128071415099282 0.059584670169267 0.21494020984837 -0.0467775286593388 0.0124763079355399 0.0469516851774203 NA NA 0.0404180909612875 0.247132918750217 0 139 861 0.861 0 0.001 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.75000000000009 2 35.249999999999986 0.0126451889006809 0.0589984642956841 0.214330814397248 -0.0463532753950032 0.0129496886107286 0.0472300133347671 NA NA 0.0384250749720897 0.227690729046941 0 108 892 0.892 0 0.001 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.08333333333341 2 36.249999999999986 0.012752698321938 0.0573071018565008 0.222532599081197 -0.0445544035345628 0.0128746956120302 0.0445513644507945 NA NA 0.0377384944050796 0.237758114105914 0 116 884 0.884 0 0.001 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.41666666666674 2 36.249999999999986 0.0128620515547158 0.0573071018565008 0.224440795957941 -0.044445050301785 0.0130696484296474 0.046076229908158003 NA NA 0.0362180404682087 0.219765367893189 0 133 867 0.867 0 0.001 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.25000000000009 2 36.08333333333332 0.0127256499425275 0.0575822255219405 0.220999619712139 -0.0448565755794131 0.0125092512237905 0.0451419663211101 NA NA 0.0373150110450559 0.229322701716885 0 125 875 0.875 0 0.001 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000009 2 35.08333333333332 0.0125657389590355 0.0592901175479514 0.211936482481635 -0.0467243785889159 0.0123572173486224 0.0476179428058077 NA NA 0.0398121532045851 0.240546870628392 0 113 887 0.887 0 0.001 N all ss13 234 AAA GCA AAA 2 AGCAAAATG:AGCAAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333343 2 35.08333333333332 0.0126718959543504 0.0592901175479514 0.213726949421241 -0.0466182215936009 0.0126710431374954 0.0460613463389987 NA NA 0.0393844657667759 0.23654360831654 0 141 859 0.859 0 0.001 N all ss13 235 ATG AAA TGT 2 AAAATGTCT:AAAGTTTCT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333343 2 35.08333333333332 0.0126718959543504 0.0592901175479514 0.213726949421241 -0.0466182215936009 0.0126881577609679 0.0471050282693834 NA NA 0.0402219806602732 0.246446598196354 0 113 887 0.887 0 0.001 N all ss13 236 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 78.91666666666676 1 35.249999999999986 0 0.0289192452027623 0 -0.0289192452027623 0 0.0306487192755508 NA NA 0.0326938143635265 0.37640051102013 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.00000000000009 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0323535763897054 NA NA 0.0304585774783812 0.336530460922129 0 382 618 0.618 0 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.50000000000009 1 34.83333333333332 0 0.0292720079293014 0 -0.0292720079293014 0 0.0317145044819554 NA NA 0.0317578648167871 0.3566722014478 0 356 644 0.644 0 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 1 34.499999999999986 0 0.0295604764056576 0 -0.0295604764056576 0 0.0313013999841685 NA NA 0.0338863539032925 0.383022046029573 0 373 627 0.627 0 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.16666666666674 1 35.16666666666665 0 0.0289891158257094 0 -0.0289891158257094 0 0.0317111432678854 NA NA 0.0318422932461818 0.362613384904726 0 379 621 0.621 0 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 0 80.41666666666674 1 34.91666666666665 0 0.0292007684815911 0 -0.0292007684815911 0 0.0324674028564409 NA NA 0.0307007750819473 0.341532761600505 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA:CAACAACAG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.00000000000007 1 35.33333333333332 0.0126053387372859 0.028849710620847 0.436931201943397 -0.0162443718835612 0.0128720283672754 0.0318944887203711 NA NA 0.0353746157189169 0.646083479771376 270 136 594 0.594 0.27 0.54 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC:CAACAGAGC 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.66666666666674 1 35.66666666666665 0.0129873375085957 0.0285748846742028 0.454501834624046 -0.0155875471656071 0.0128061291188932 0.0313743548543446 NA NA 0.0337318569969127 0.644008418718653 272 122 606 0.606 0.272 0.544 N all ss13 244 AGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA:CAGAGCCAA 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.25000000000007 1 35.41666666666665 0.0132307731029257 0.0287805096612114 0.459712953615876 -0.0155497365582856 0.013772986854717 0.0314420921656309 NA NA 0.034110989228749 0.648492741959047 261 135 604 0.604 0.261 0.522 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 AGCCAAACT:GGCCAAACT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.91666666666674 0 35.66666666666665 0.0132893842388272 0 -Inf 0.0132893842388272 0.013469897977977 0 NA NA 0.013624244564076 0.32935110777915 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.41666666666674 0 35.16666666666665 0.0132016609860952 0 -Inf 0.0132016609860952 0.0135317926960997 0 NA NA 0.012560316964767 0.293230513252432 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.58333333333341 0 34.999999999999986 0.0131726767040262 0 -Inf 0.0131726767040262 0.012962785057072 0 NA NA 0.0133275945670443 0.322968459976523 647 353 0 0 0.647 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 76.91666666666674 0 34.66666666666665 0.0131150882907867 0 -Inf 0.0131150882907867 0.0129221580502618 0 NA NA 0.0131072058119425 0.317019560177402 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.91666666666674 0 34.33333333333332 0.0129453051997499 0 -Inf 0.0129453051997499 0.0131325192467291 0 NA NA 0.0133728362986504 0.333029444105605 638 362 0 0 0.638 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.0833333333334 0 33.49999999999999 0.0129174344873365 0 -Inf 0.0129174344873365 0.0128922480130191 0 NA NA 0.0121512115608878 0.287755954537516 604 396 0 0 0.604 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 77.5833333333334 0 33.99999999999999 0.0130014090011593 0 -Inf 0.0130014090011593 0.0121240709765957 0 NA NA 0.012515775996797 0.298896984742862 668 332 0 0 0.668 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCA:TCTGCTGCT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.5833333333334 0 33.66666666666666 0.0128345378007017 0 -Inf 0.0128345378007017 0.0127137492563375 0 NA NA 0.0128144373893232 0.3165520045577 663 337 0 0 0.663 0.001 N all ss13 253 GCA CTG CAG 2 GCTGCAGAG:GCTGCTGAG 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000007 0 32.99999999999999 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0128021615034251 0 NA NA 0.0119565357542915 0.293280874271947 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 254 GAG CAG AGG 2 GCAGAGGCT:GCTGAGGCA 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.333333333333333 1.08333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.41666666666673 0 32.83333333333332 0.0125394770467935 0 -Inf 0.0125394770467935 0.0117851720414546 0 NA NA 0.0124953408536444 0.315604143006692 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT:GAGGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.50000000000007 0 32.74999999999999 0.0125263872134486 0 -Inf 0.0125263872134486 0.0130204625563277 0 NA NA 0.0124225004691114 0.31328033019137 642 358 0 0 0.642 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA:GCTTCTAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.66666666666673 0 33.08333333333333 0.0125002893639087 0 -Inf 0.0125002893639087 0.0124281818753965 0 NA NA 0.0123630801107035 0.311969380806559 651 349 0 0 0.651 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG:TCTAAGAAA 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.3333333333334 0 32.41666666666666 0.0123969764634079 0 -Inf 0.0123969764634079 0.0126481312926474 0 NA NA 0.0115744731184569 0.28414162539575 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 258 AAA AAA AAC 2 AAAAAGCCT:AAGAAACCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.5833333333334 0 31.16666666666666 0.0122077974991056 0 -Inf 0.0122077974991056 0.0130108045940847 0 NA NA 0.0123951956850495 0.324682337841607 632 368 0 0 0.632 0.001 N all ss13 259 CCT AAC CTC 2 AAACCTCGG:AAGCCTCGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666673 0 31.16666666666666 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0129195386241753 0 NA NA 0.0124012083345609 0.323931518299039 637 363 0 0 0.637 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA:CCTCGGCAA 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333339 0 31.499999999999993 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0124943577668379 0 NA NA 0.0122318530423369 0.315300143138351 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA:CGGCAAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333339 0 31.66666666666666 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0114924464338292 0 NA NA 0.0124747224526983 0.324814277917123 610 390 0 0 0.61 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666671 0 31.33333333333333 0.0122326870775303 0 -Inf 0.0122326870775303 0.0119898519629299 0 NA NA 0.0120367068847757 0.309495175746602 644 356 0 0 0.644 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.25000000000006 0 31.83333333333333 0.0124097970858067 0 -Inf 0.0124097970858067 0.0124791502256911 0 NA NA 0.0128248854490183 0.333227117416452 602 398 0 0 0.602 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.25000000000004 0 32.83333333333333 0.0125657389590355 0 -Inf 0.0125657389590355 0.0123044115220499 0 NA NA 0.0130256729432164 0.334700008242563 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 80.91666666666671 0 32.166666666666664 0.012461345857946 0 -Inf 0.012461345857946 0.012528015246287 0 NA NA 0.0125750669506286 0.321706762406465 653 347 0 0 0.653 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCCACCAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.25000000000004 0 31.499999999999996 0.0122576783566175 0 -Inf 0.0122576783566175 0.0120877223935167 0 NA NA 0.0120623724974908 0.309538284027257 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACCAAACAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.58333333333337 0 31.666666666666664 0.0122077974991056 0 -Inf 0.0122077974991056 0.0123433326533414 0 NA NA 0.011829274957977 0.302072682127114 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 268 CAA AAC AAT 2 AAACAATAC:AAACAGTAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.9166666666667 0 31.666666666666664 0.0123079685204042 0 -Inf 0.0123079685204042 0.0123082279893547 0 NA NA 0.0124191255650658 0.321661396852174 626 374 0 0 0.626 0.001 N all ss13 269 TAC AAT ACA 2 CAATACAAT:CAGTACAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.9166666666667 0 32 0.0123079685204042 0 -Inf 0.0123079685204042 0.0114237462035287 0 NA NA 0.01243975567368 0.322464555130897 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000003 0 32.166666666666664 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0128241836309652 0 NA NA 0.0116137574769057 0.288256863213952 612 388 0 0 0.612 0.001 N all ss13 271 GTA ACG TAA 2 AACGTCACT:AATGTAACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666669 0 31.833333333333332 0.0123841823043677 0 -Inf 0.0123841823043677 0.0125522909553968 0 NA NA 0.0125834874243783 0.325036172997694 645 355 0 0 0.645 0.001 N all ss13 272 ACA TAA CAC 2 GTAACACAA:GTCACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333336 0 32.666666666666664 0.0124355180497881 0 -Inf 0.0124355180497881 0.0125149180554793 0 NA NA 0.0121968363750553 0.307932844030679 654 346 0 0 0.654 0.001 N all ss13 273 CAA CAC AAG 2 ACACAAGCT:ACTCAAGCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000003 0 31.999999999999996 0.0123332686697829 0 -Inf 0.0123332686697829 0.0120611474813427 0 NA NA 0.0120859160117441 0.307507416041937 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.58333333333336 0 32.49999999999999 0.0123586730492886 0 -Inf 0.0123586730492886 0.0122561719787057 0 NA NA 0.0119381510453162 0.300563821330299 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 275 TTT CAT TTG 2 GCATTTGGG:GCTTTTGGC 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.58333333333336 0 32.166666666666664 0.0122077974991056 0 -Inf 0.0122077974991056 0.0126783372678899 0 NA NA 0.0120020104792385 0.309083958419188 665 335 0 0 0.665 0.001 N all ss13 276 GGC TTG GCA 2 TTTGGCAGA:TTTGGGAGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.75000000000003 0 31.499999999999996 0.0121830090017924 0 -Inf 0.0121830090017924 0.01185510686132 0 NA NA 0.0119592595601052 0.308340993461097 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 277 AGA GCA GAC 2 GGCAGACGT:GGGAGACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333336 0 32.166666666666664 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0119669489432321 0 NA NA 0.0122636494714161 0.316556494923153 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333336 0 31.999999999999996 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0125367827838159 0 NA NA 0.0122169783309753 0.31471129490612 643 357 0 0 0.643 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666669 0 32.666666666666664 0.0123841823043677 0 -Inf 0.0123841823043677 0.0123167193503175 0 NA NA 0.0123693566801604 0.316730814471152 625 375 0 0 0.625 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.41666666666669 0 32.666666666666664 0.0123841823043677 0 -Inf 0.0123841823043677 0.0118623137137325 0 NA NA 0.0124151600070727 0.318519521456417 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.08333333333336 0 31.999999999999996 0.012282771960992 0 -Inf 0.012282771960992 0.0123490139744945 0 NA NA 0.0125754817099218 0.328705921848158 617 383 0 0 0.617 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.25000000000001 0 32.166666666666664 0.0122576783566175 0 -Inf 0.0122576783566175 0.0126913302610228 0 NA NA 0.0119431868271803 0.304734979179934 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.58333333333336 0 32.83333333333333 0.0126718959543505 0 -Inf 0.0126718959543505 0.0127395179413886 0 NA NA 0.0126216790689094 0.315388918191222 674 326 0 0 0.674 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.91666666666669 0 32.49999999999999 0.0127798619317583 0 -Inf 0.0127798619317583 0.0128437707779289 0 NA NA 0.0128636564868849 0.320473196122309 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAC:CAAGGAAAT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.25000000000001 0 32.49999999999999 0.0128896835290581 0 -Inf 0.0128896835290581 0.0127498728158448 0 NA NA 0.0117918683578551 0.274350185387773 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 286 AAC GAA ACT 2 GGAAACTTT:GGAAATTTC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666669 1 32.666666666666664 0.0259485340559256 0.0312545223004261 0.830232943780168 -0.00530598824450042 0.0190945497594619 0.0332955092699212 NA NA 0.0229646938650418 0.817276102901183 349 131 520 0.52 0.349 0.698 N all ss13 287 TTC ACT TCG 2 AACTTTGGG:AATTTCGGG 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.91666666666669 1 32.5 0.0261179819037762 0.0314182062818701 0.831300860063662 -0.00530022437809395 0.0190177597928112 0.0339039041127755 NA NA 0.0245867457223071 0.829321052709675 332 119 549 0.549 0.332 0.664 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.75000000000001 1 32.166666666666664 0.0261749574292545 0.0317507728699206 0.824388040457799 -0.00557581544066612 0.0183543167000545 0.0335982985087865 NA NA 0.0241250106066869 0.817220193643218 351 130 519 0.519 0.351 0.702 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA:GGGGATCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.08333333333334 1 32.83333333333333 0.0264053674769446 0.0310925352587596 0.849251026241274 -0.00468716778181501 0.0188778887069942 0.0333667937579908 NA NA 0.0231725646656559 0.839703859515399 351 125 524 0.524 0.351 0.702 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GATCAAGAA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.58333333333334 1 32.33333333333333 0.0262321821040851 0.0315836140125951 0.830563028462291 -0.00535143190851008 0.0177520951631285 0.0344589550168201 NA NA 0.0229247761204735 0.815424084946355 333 138 529 0.529 0.333 0.666 N all ss13 291 GAA AAG AAC 2 CAAGAACTA:CAAGACCTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333334 1 31.58333333333333 0.0259766224970673 0.0323500281131817 0.802986087251112 -0.00637340561611445 0.0177827508770747 0.0348502360693254 NA NA 0.0245308267853855 0.795008717126546 348 137 515 0.515 0.348 0.696 N all ss13 292 CTA AAC TAA 2 GAACTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.75000000000001 1 31.16666666666666 0.0128071415099282 0.0327921082603737 0.390555599787539 -0.0199849667504455 0.0137972554856698 0.0336191293161278 NA NA 0.0227325267820486 0.379327919960595 0 371 629 0.629 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA:CTAATCAGG 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.08333333333336 1 30.83333333333333 0.0124355180497881 0.0331545693783718 0.375077049195529 -0.0207190513285836 0.0124824572953647 0.0356409513004952 NA NA 0.0218830607399634 0.343736755966034 0 372 628 0.628 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA:ATCAGGCAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.75000000000003 1 31.83333333333333 0.0123332686697829 0.0320904564039067 0.384328241223812 -0.0197571877341239 0.0123064931597319 0.032368038110283 NA NA 0.0218030618057488 0.364848131279491 0 350 650 0.65 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA:AGGCAAGGA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.41666666666669 1 31.58333333333333 0.0122326870775303 0.0323500281131817 0.378135284295033 -0.0201173410356514 0.0124403916005693 0.0335628638796305 NA NA 0.0216557243645994 0.352908875182079 0 355 645 0.645 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.58333333333334 1 31.749999999999993 0.0123586730492886 0.0321765161581571 0.384089843305038 -0.0198178431088685 0.0129272488957231 0.0329226917932849 NA NA 0.0216982587319911 0.361064829878023 0 365 635 0.635 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.58333333333334 1 31.41666666666666 0.0372361887723979 0.0325254218363474 1.14483338478292 0.00471076693605048 0.0272741416148551 0.0342016221070124 NA NA 0.0337056321017486 0.888848029187273 499 131 370 0.37 0.499 0.74 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.75000000000001 1 31.249999999999993 0.0371593024135724 0.0327027281115989 1.13627530665837 0.00445657430197349 0.0280918054558339 0.034187787083219 NA NA 0.0322641385515843 0.890139419426318 506 121 373 0.373 0.506 0.746 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.75000000000001 1 31.249999999999993 0.0371593024135724 0.0327027281115989 1.13627530665837 0.00445657430197349 0.0265657024654172 0.0346758977414165 NA NA 0.0323749772406654 0.890513163402125 480 137 383 0.383 0.48 0.766 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.75000000000001 1 30.91666666666666 0.0367045717801664 0.0330632048490145 1.11013351391012 0.00364136693115195 0.0279142176176283 0.0367042915087386 NA NA 0.0323186244093896 0.910291511205665 481 120 399 0.399 0.481 0.798 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.00000000000001 2 30.66666666666666 0.0491979618643599 0.0682288336542951 0.721072884136322 -0.0190308717899351 0.0300935587614351 0.0515984675931204 NA NA 0.0417543450436613 0.648546871436582 330 40 630 0.63 0.33 0.66 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000001 2 30.999999999999993 0.0498108321742553 0.0674611774972046 0.738362922531545 -0.0176503453229493 0.0303920747366851 0.051005922356744 NA NA 0.0432773022068721 0.683388932799063 320 36 644 0.644 0.32 0.64 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.00000000000001 2 31.33333333333333 0.0504391702568756 0.0667106145123721 0.75608912652905 -0.0162714442554965 0.0302159963160944 0.0479755010718857 NA NA 0.0417767822431222 0.696917152862968 316 41 643 0.643 0.316 0.632 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.66666666666669 2 30.33333333333333 0.0500185308740041 0.0690141740401891 0.724757364260808 -0.018995643166185 0.0307591845830748 0.0517647375265539 NA NA 0.0435590631335084 0.662771909887186 327 36 637 0.637 0.327 0.654 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.50000000000001 2 29.33333333333333 0.0507593239355005 0.0714826348532437 0.710093074209018 -0.0207233109177432 0.0312305113284526 0.0568673916297466 NA NA 0.0459155888152437 0.651748144304414 313 40 647 0.647 0.313 0.626 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.33333333333336 2 28.66666666666666 0.0508669472540708 0.073228852172937 0.694629858924233 -0.0223619049188662 0.0308923695258018 0.0557150140719944 NA NA 0.0465967472043901 0.631296579381732 293 44 663 0.663 0.293 0.586 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTC:GCACAATTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.58333333333336 2 29.08333333333333 0.0507056829412418 0.0721276112438599 0.702999615082334 -0.0214219283026181 0.0311168170413844 0.0557107119025286 NA NA 0.0461763494411176 0.642708224245364 274 46 680 0.68 0.274 0.548 N all ss13 308 TTC AAT TCG 2 CAATTCGCT:CAATTTGCT 1:1 FALSE 2 0.5 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.25000000000001 2 29.41666666666666 0.0509209303034166 0.0712702003524607 0.71447715948028 -0.0203492700490441 0.0308819769475186 0.0589704397703805 NA NA 0.0429259668663441 0.635460673344081 296 64 640 0.64 0.296 0.592 N all ss13 309 GCT TCG CTC 2 TTCGCTCCC:TTTGCTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.41666666666669 2 30.24999999999999 0.051467132797986 0.0692133441658409 0.743601301429194 -0.0177462113678549 0.0321074638720664 0.0523577542954884 NA NA 0.0423757125611603 0.675375017525043 330 46 624 0.624 0.33 0.66 N all ss13 310 CCA CTC CAA 2 GCTCCAAGT:GCTCCCAGC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.41666666666669 2 29.916666666666657 0.0508130785858607 0.070021663193269107 0.725676544494663 -0.0192085846074084 0.0307687320676926 0.0533496572778945 NA NA 0.042810559766011 0.653656739558312 314 36 650 0.65 0.314 0.628 N all ss13 311 AGC CAA GCG 2 CCAAGTGCC:CCCAGCGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.41666666666669 2 29.916666666666657 0.0508130785858607 0.070021663193269107 0.725676544494663 -0.0192085846074084 0.0311788237222578 0.054086550304174 NA NA 0.0467208561389508 0.680973462003861 324 45 631 0.631 0.324 0.648 N all ss13 312 GCC GCG CCT 2 AGCGCTTCA:AGTGCCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.08333333333336 2 29.58333333333332 0.0510292410063947 0.0708490996895694 0.720252497632053 -0.0198198586831748 0.0313186753449203 0.0518116664745839 NA NA 0.0453734741601044 0.662244807342248 300 38 662 0.662 0.3 0.6 N all ss13 313 TCA CCT CAG 2 GCCTCTGCA:GCTTCAGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.75000000000003 2 29.58333333333332 0.0505987404816737 0.0708490996895694 0.714176195652109 -0.0202503592078958 0.0315473192253959 0.0550032860112558 NA NA 0.0471638131968955 0.667659648392815 305 43 652 0.652 0.305 0.61 N all ss13 314 GCA CAG CAT 2 TCAGCATTC:TCTGCATTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000003 2 28.583333333333325 0.0499664439235005 0.0734531512400294 0.680249153099242 -0.0234867073165289 0.0315839886951367 0.0560880022660703 NA NA 0.0481326727938315 0.625579817835262 279 45 676 0.676 0.279 0.558 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTC:GCATTCTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.75000000000003 2 28.249999999999993 0.0493497606808473 0.0743642698449398 0.663621935423405 -0.0250145091640925 0.0283686315826312 0.0569404885457955 NA NA 0.0491333351275715 0.61067174309468 256 39 705 0.705 0.256 0.512 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.4166666666667 2 28.916666666666657 0.0501754455827152 0.0725641058409196 0.691463706487522 -0.0223886602582045 0.0313707285076511 0.0571128290714878 NA NA 0.0433751060970316 0.605740000325769 273 48 679 0.679 0.273 0.546 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000004 2 28.08333333333332 0.0499664439235005 0.0748283653087126 0.667747367156271 -0.0248619213852121 0.0308809040152662 0.0552513907930916 NA NA 0.0472683893571325 0.59890660176146 271 35 694 0.694 0.271 0.542 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGAATGTCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.16666666666671 2 27.666666666666654 0.049707628561966 0.0760143706952157 0.653924094975038 -0.0263067421332497 0.0291700337980456 0.0610835838118109 NA NA 0.0480573111420466 0.584101525333061 271 45 684 0.684 0.271 0.542 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCGCGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.66666666666671 2 27.83333333333332 0.0500185308740041 0.0755354817013732 0.662185899227473 -0.025516950827369 0.0302973094261018 0.0555892379457899 NA NA 0.0469012417744426 0.586402220998515 257 47 696 0.696 0.257 0.514 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCGCGCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.50000000000004 2 27.99999999999999 0.0501230313618422 0.0750625939177369 0.667749790485169 -0.0249395625558947 0.0302740070996534 0.0559173333393525 NA NA 0.047769757366653 0.601615685789147 298 49 653 0.653 0.298 0.596 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.83333333333337 2 28.33333333333332 0.0499144653819543 0.0741343759774745 0.673297167795958 -0.0242199105955202 0.0301529847587949 0.0560913029172725 NA NA 0.048623602865224 0.618406399939501 266 45 689 0.689 0.266 0.532 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.50000000000004 2 27.833333333333325 0.049502499478939 0.0755354817013732 0.655354256886126 -0.0260329822224342 0.029401916025618 0.0577059168720541 NA NA 0.0481244325572057 0.588541037574426 273 48 679 0.679 0.273 0.546 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.1666666666667 2 27.833333333333325 0.0490972805875701 0.0755354817013732 0.649989640387473 -0.0264382011138031 0.0304985327556091 0.0543956415718735 NA NA 0.0477379119435759 0.579702172400396 242 42 716 0.716 0.242 0.484 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.83333333333337 2 27.833333333333325 0.049299057062491 0.0755354817013732 0.652660921093919 -0.0262364246388821 0.0309298452712737 0.0551118679267666 NA NA 0.0465682636677563 0.573164512413033 225 47 728 0.728 0.225 0.45 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.83333333333337 2 28.833333333333325 0.0499144653819543 0.0727843418621032 0.685785762499879 -0.0228698764801489 0.0313742357114277 0.0543172386521292 NA NA 0.0461257462059912 0.620024334693166 262 50 688 0.688 0.262 0.524 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.33333333333337 2 28.999999999999993 0.0496048518784087 0.0723451996406717 0.6856688781673 -0.022740347762263 0.0286296124119445 0.0551853594043396 NA NA 0.0462210828188916 0.622725843500464 293 45 662 0.662 0.293 0.586 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.08333333333337 2 28.916666666666657 0.0491475696448996 0.0725641058409196 0.677298632365767 -0.02341653619602 0.0293813964824446 0.0556001039916188 NA NA 0.0479233750702892 0.625107549462691 311 45 644 0.644 0.311 0.622 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.75000000000003 3 29.249999999999993 0.0493497606808473 0.110290063467372 0.447454277650739 -0.0609403027865251 0.0295114485997002 0.0683828121736415 NA NA 0.0618480430292721 0.324465410927295 122 21 857 0.857 0.122 0.244 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA:TCGGGAACG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.4166666666667 3 29.249999999999993 0.0489470292290666 0.110290063467372 0.443802711597376 -0.0613430342383058 0.0301342247819947 0.0687981841038363 NA NA 0.0639705842310627 0.337596200590276 127 15 858 0.858 0.127 0.254 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG:GGAACGTGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.08333333333337 3 28.249999999999993 0.0479683929216542 0.114507630156718 0.418910013734485 -0.0665392372350641 0.0309682760469668 0.0737358260360905 NA NA 0.0636445873547141 0.295800496809067 112 18 870 0.87 0.112 0.224 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG:ACGTGGTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 86.08333333333337 4 28.249999999999993 0.0479683929216542 0.156921757285409 0.30568350591696 -0.108953364363755 0.0289169928818676 0.0892453336825881 NA NA 0.0804792842263188 0.175798173863099 48 6 946 0.946 0.048 0.096 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT:TGGTTGACC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.41666666666671 4 28.583333333333325 0.048355111951662 0.154888999008431 0.312192035982039 -0.106533887056769 0.0299980543147393 0.0877210507552433 NA NA 0.0811901609142558 0.189468625041134 43 2 955 0.955 0.043 0.086 N all ss13 333 ACC TGA CCT 2 CTGACTTAT:TTGACCTAT 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.08333333333337 4 28.249999999999993 0.0597330472949441 0.156921757285409 0.380654973078727 -0.0971887099904652 0.0315263253544957 0.0908364130864491 NA NA 0.0842902844888086 0.248900587309915 85 2 913 0.913 0.085 0.17 N all ss13 334 TAT CCT ATA 2 ACCTATACA:ACTTATCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.75000000000004 4 28.916666666666657 0.0592608224609778 0.152908411727716 0.387557635262757 -0.0936475892667384 0.0321904332850138 0.0871780274134362 NA NA 0.0850036682305328 0.270596987669275 82 3 915 0.915 0.082 0.164 N all ss13 335 ACA ATA ATG 2 TATACAGGT:TATCATGGA 1:1 TRUE 1.66666666666667 0.666666666666667 0.666666666666667 0 1 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 5 88.00000000000004 4 28.666666666666657 0.0590856583898357 0.154389040653112 0.382706299228791 -0.095303382263276 0.0312852444653594 0.0878038897406252 NA NA 0.0816118772900766 0.24290212146737 84 3 913 0.913 0.084 0.168 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 ACAGGTGCC:CATGGAGCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.50000000000004 3 29.499999999999993 0.0471668164117002 0.109283858386045 0.431599113613681 -0.0621170419743452 0.0292396526846015 0.0676165810936587 NA NA 0.0718713601575344 0.387433614190078 157 4 839 0.839 0.157 0.314 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT:GGTGCCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.33333333333339 3 29.833333333333325 0.0472597258715505 0.107970516691131 0.437709546271278 -0.0607107908195808 0.0282013399847808 0.067563479197399 NA NA 0.0698627671586811 0.384846769387643 151 11 838 0.838 0.151 0.302 N all ss13 338 ATT CCA TTA 2 GCCATTAAA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.41666666666673 3 29.416666666666657 0.0466622764891086 0.109617210244414 0.425683853703862 -0.0629549337553053 0.0295398778739689 0.0716013591725269 NA NA 0.0709312556960972 0.37478363496962 148 11 841 0.841 0.148 0.296 N all ss13 339 AAA TTA AAT 2 ATTAAATTG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.41666666666673 3 29.08333333333333 0.0461240417078171 0.110971243090164 0.415639587549196 -0.0648472013823464 0.0276436962806751 0.0702744979337545 NA NA 0.0745079485505088 0.384114966869271 167 8 825 0.825 0.167 0.334 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.41666666666673 3 29.08333333333333 0.0461240417078171 0.110971243090164 0.415639587549196 -0.0648472013823464 0.0295352536907108 0.0718050412244495 NA NA 0.0737134876095645 0.379011217431084 165 4 831 0.831 0.165 0.33 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.41666666666673 3 29.08333333333333 0.0461240417078171 0.110971243090164 0.415639587549196 -0.0648472013823464 0.0283025829001999 0.0739160109466785 NA NA 0.0690023937938657 0.347329440178369 147 6 847 0.847 0.147 0.294 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 88.91666666666673 3 29.249999999999993 0.0707098372578213 0.110290063467372 0.641126090916972 -0.0395802262095512 0.0379169946399074 0.0725720086684807 NA NA 0.0757389282650963 0.601261258046429 270 1 729 0.729 0.27 0.54 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.25000000000006 3 30.249999999999993 0.0721276112438599 0.106372646579413 0.678065400864239 -0.0342450353355534 0.0392836419789759 0.0694076156996506 NA NA 0.0736265380698208 0.641846886400234 296 1 703 0.703 0.296 0.592 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.58333333333339 3 30.249999999999993 0.0736034494886183 0.106372646579413 0.691939627859773 -0.0327691970907949 0.0394337435213616 0.0650764264788857 NA NA 0.0734318465422479 0.655414352143476 320 1 679 0.679 0.32 0.64 N all ss13 345 CCA ATC CAA 2 GATCCAAAT:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.25000000000006 3 29.91666666666666 0.0748283653087125 0.107647107231784 0.695126578251598 -0.032818741923071 0.039909292197536 0.0698675962975673 NA NA 0.0746576233463747 0.660234111131569 330 2 668 0.668 0.33 0.66 N all ss13 346 AAT CAA AAT 2 CCAAATTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.91666666666673 3 30.249999999999993 0.075140996593953 0.106372646579413 0.70639397448719 -0.0312316499854603 0.0393731974533338 0.0685088246573567 NA NA 0.0694172281815572 0.652773832045495 327 3 670 0.67 0.327 0.654 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AATTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.0833333333334 3 30.41666666666666 0.0497591768358708 0.105746684778908 0.470550702746906 -0.0559875079430373 0.0332043313293418 0.071957710260851 NA NA 0.0756147838880009 0.459038691810292 190 7 803 0.803 0.19 0.38 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC:TTCAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.91666666666673 3 30.58333333333333 0.0498625949111442 0.105128058952294 0.474303391578562 -0.0552654640411501 0.0325205068099527 0.0654870012002365 NA NA 0.0662336840100767 0.404054952982637 177 1 822 0.822 0.177 0.354 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGATCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.91666666666673 3 30.916666666666657 0.0504922483436096 0.103912304538584 0.485912121454886 -0.0534200561949744 0.0320155243165585 0.0690189148238448 NA NA 0.0673504797415337 0.427681584517205 199 7 794 0.794 0.199 0.398 N all ss13 350 AAC ACA AAG 2 GACAACGTC:GATCAAGTC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.41666666666673 3 31.749999999999993 0.051467132797986 0.100992663859693 0.509612587994394 -0.0495255310617069 0.0308385395879623 0.0670715810654552 NA NA 0.0640647717564155 0.439490395448008 204 7 789 0.789 0.204 0.408 N all ss13 351 GTC AAG TCA 2 AACGTCATA:CAAGTCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.50000000000006 2 31.66666666666666 0.0382248326940206 0.0659765797094679 0.579369722746256 -0.0277517470154472 0.0298200170114377 0.0506909506203766 NA NA 0.0584524180538454 0.634947351067922 286 15 699 0.699 0.286 0.572 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTCATTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.3333333333334 3 31.66666666666666 0.0378231402201689 0.101277212852957 0.373461503873371 -0.0634540726327883 0.0271757136708091 0.0651812907616358 NA NA 0.0777141107543935 0.41421053642379 172 6 822 0.822 0.172 0.344 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATTTTGCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.66666666666674 3 30.66666666666666 0.037197705854529 0.104821456781369 0.354867285732481 -0.06762375092684 0.0288406714028585 0.0669065816096637 NA NA 0.0746203248270431 0.364810056947415 163 9 828 0.828 0.163 0.326 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.66666666666674 3 30.66666666666666 0.0367420404002049 0.104821456781369 0.350520222942898 -0.0680794163811642 0.0279959446169572 0.0672855287664358 NA NA 0.0721953858113055 0.345686800686932 142 7 851 0.851 0.142 0.284 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.00000000000007 3 31.499999999999993 0.0361515763634082 0.101851155869296 0.354945175190754 -0.0656995795058881 0.0284176114750638 0.0668506145342563 NA NA 0.0686758274915978 0.338737700041647 139 7 854 0.854 0.139 0.278 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.3333333333334 3 32.49999999999999 0.0364444164276489 0.0985020015458152 0.369986557183794 -0.0620575851181663 0.0272334580610218 0.0649235445307718 NA NA 0.0696513364190673 0.372942692818937 172 5 823 0.823 0.172 0.344 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.0833333333334 3 32.49999999999999 0.0491475696448996 0.0985020015458152 0.498949959123827 -0.0493544319009156 0.0315971531242475 0.0646197072915723 NA NA 0.0711315207906378 0.48777781502151 213 2 785 0.785 0.213 0.426 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.41666666666674 3 32.166666666666664 0.0489470292290666 0.0995936054863591 0.491467589611169 -0.0506465762572925 0.0307366985280742 0.0627595662698854 NA NA 0.0719265940947051 0.481343996488084 221 1 778 0.778 0.221 0.442 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.25000000000007 4 31 0.0484527683011411 0.141595553474679 0.342191312595178 -0.0931427851735379 0.0305310332439317 0.08338439784703 NaN NaN 0.0893179105931073 0.297030205902883 110 0 890 0.89 0.11 0.22 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.58333333333341 4 30.666666666666664 0.0482578485978244 0.143291427572032 0.336781127911964 -0.0950335789742075 0.0294487305395652 0.0804134010894937 NA NA 0.0904956087613165 0.29365110703291 109 2 889 0.889 0.109 0.218 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.08333333333341 4 29.833333333333332 0.0722725243417375 0.147714914296514 0.489270326465898 -0.0754423899547765 0.0385144663717909 0.0884475916348313 NaN NaN 0.0975289233938544 0.43920367497741 206 1 793 0.793 0.206 0.412 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 86.91666666666674 4 30 0.0724180213610206 0.146808432844572 0.493282435878127 -0.0743904114835509 0.0370905610409903 0.0871363654588364 NA NA 0.0973359038557113 0.444709418330568 214 0 786 0.786 0.214 0.428 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.25000000000007 4 30 0.0739059002893284 0.146808432844572 0.503417268731244 -0.0729025325552431 0.0406829089025559 0.0854030167675471 NaN NaN 0.095409477758096 0.444806711735602 205 0 795 0.795 0.205 0.41 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.41666666666673 4 30.5 0.0746730239941638 0.144154737019872 0.518006036692848 -0.0694817130257086 0.0392070461931599 0.0849881364841537 NA NA 0.0945843796294817 0.46258295927478 194 0 806 0.806 0.194 0.388 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.0833333333334 4 30.166666666666668 0.0769083042436381 0.145913043990275 0.527083132120553 -0.0690047397466368 0.04106303316097 0.0862548711983242 NA NA 0.102329295369559 0.500095162199181 243 0 757 0.757 0.243 0.486 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.0833333333334 4 29.166666666666668 0.0779078173603665 0.151456007747705 0.514392387062949 -0.0735481903873386 0.0424489577820864 0.092048755370114893 NaN NaN 0.0996171863256988 0.46032715501942 229 0 771 0.771 0.229 0.458 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.5833333333334 5 30.000000000000004 0.0923227698874005 0.18848582121068 0.489812810822555 -0.096163051323279 0.0452359245425579 0.0985884276801572 NA NA 0.102877579375746 0.349926001337914 159 0 841 0.841 0.159 0.318 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.5833333333334 5 31 0.093558286859156 0.181605039003649 0.515174509322268 -0.0880467521444926 0.0462914674514801 0.0959320016574451 NA NA 0.104051713138767 0.397450871110676 187 0 813 0.813 0.187 0.374 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.0833333333334 5 31.5 0.0941885460903393 0.178350531835637 0.52810914058356 -0.0841619857452981 0.0444697749039451 0.0972490487363004 NaN NaN 0.101367529715653 0.406388561157373 177 0 823 0.823 0.177 0.354 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.0833333333334 5 31.5 0.0954749219278059 0.178350531835637 0.535321767449467 -0.0828756099078315 0.0467847236446106 0.0919889428672028 NaN NaN 0.106065840197515 0.434590762397768 190 0 810 0.81 0.19 0.38 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 78.0833333333334 5 30.833333333333332 0.0954749219278059 0.182716561993313 0.522530201347047 -0.0872416400655069 0.0453637789184157 0.0975589920181534 NaN NaN 0.105059591720501 0.40631183120097 174 0 826 0.826 0.174 0.348 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.5833333333334 5 31.333333333333332 0.0961313950679981 0.179422266799376 0.535782970435265 -0.0832908717313774 0.0450873352820656 0.0956934513941912 NaN NaN 0.104715706214942 0.426380865455463 192 0 808 0.808 0.192 0.384 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.91666666666674 5 31.333333333333332 0.0970208852905793 0.179422266799376 0.540740494595719 -0.0824013815087963 0.0492195335654356 0.0944427885597759 NaN NaN 0.0995185172331111 0.407670219687449 196 0 804 0.804 0.196 0.392 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAAAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAA 2 GATGAAACT:GATGAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 ACT AAA CTC 2 GAAACTCAA:GAAGCTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCC:GCTCAGCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AAG CCT 2 CAAGCCTTA:CAGCCTTTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CCT TAC 2 CCTTTGCCG:GCCTTACCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAG:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AAC AGC 2 AAACAGCAA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CAA AGC AAA 2 CAGCAAACT:CAGCCCACT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTG:CCCACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG:CTTCCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT:CCTGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CGG CAG 2 GCGGCTGAC:GCTGCAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAC ATG ACT 2 GATGACTTC:GATGATTTC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ACT TCT 2 GACTTCTCC:GATTTCTCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAAA:TTCTCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAATTG:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TGC 2 CAACTTCAA:CAATTGCAA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TGC AAA 2 CTTCAAAAT:TTGCAACAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA AAT 2 CAAAATTCC:CAACAATCC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC AAT CCA 2 AATTCCATG:CAATCCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGC:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGC TGA GC- 1 ATGAGC---:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 --- GTG GAG 1 AGC------:AGTGGAGCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 --- GAG CTT 1 ------AGT:GGAGCTTCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 AGT --A CTG 1 ---AGTGCT:GCTTCTGCT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 AGTGCTGAT:TCTGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAT CTG ATT 2 GCTGATTCA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA:ACTCAGGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCCTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_MN996532.1 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 2 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGAT 2 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.1666666666667 2 33.91666666666666 0.0696555937548328 0.0614153696041381 1.13417201921617 0.00824022415069464 0.0302324549685394 0.0441490534094119 NA NA 0.0593566903548876 0.889588017266135 569 0 431 0.431 0.569 0.862 N all ss13 3 GAT CTG ATA 2 TCTGATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.00000000000003 2 34.08333333333333 0.0698178172995089 0.0611024764460933 1.14263482202893 0.00871534085341563 0.0308343025865973 0.0459319773196693 NA NA 0.0575414052653552 0.879611222488489 577 1 422 0.422 0.577 0.844 N all ss13 4 AAT ATA ATG 2 GATAATGGA 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.33333333333336 2 34.08333333333333 0.0694941228620285 0.0611024764460933 1.13733725544395 0.00839164641593526 0.0308226035120658 0.0462667423774606 NaN NaN 0.0547677561036427 0.878222902481941 575 1 424 0.424 0.575 0.848 N all ss13 5 GGA ATG GAC 2 AATGGACCC 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.33333333333336 2 34.41666666666666 0.0704743443137485 0.0604861633757489 1.16513166616225 0.00998818093799964 0.0319779612113619 0.0445782244845865 NaN NaN 0.0542854899743131 0.854018501541321 590 2 408 0.408 0.59 0.816 N all ss13 6 CCC GAC CCC 2 GGACCCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.33333333333336 2 35.41666666666666 0.0714826348532436 0.0587096677913667 1.21756156255674 0.0127729670618769 0.0312209555221385 0.0428232286473393 NaN NaN 0.0556827747389916 0.818567268214612 598 0 402 0.402 0.598 0.804 N all ss13 7 CAA CCC AA- 1 CCCCAA---:CCCCAATCA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 1.83333333333333 0.166666666666667 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.00000000000001 2 35.74999999999999 0.0718251788190063 0.0581404786806199 1.23537302149781 0.0136847001383864 0.0322879218954063 0.0422942990482118 NaN NaN 0.0554261650116545 0.804985895634288 603 0 397 0.397 0.603 0.794 N all ss13 8 --- AAT CAA 1 CAA---AAT:CAATCAAAC 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.16666666666669 2 34.916666666666664 0.0716534971389809 0.059584670169267 1.20254919487561 0.012068826969714 0.0315579528329063 0.0424121607770605 NA NA 0.0550096806105115 0.826342674785842 625 0 375 0.375 0.625 0.75 N all ss13 9 AAC --A ACC 1 ---AATCAG:TCAAACCAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.16666666666669 2 35.916666666666664 0.0706404112947758 0.0578600049104132 1.22088498616879 0.0127804063843626 0.0311666998903137 0.0445373131255549 NA NA 0.0540768784157704 0.813170616122763 596 1 403 0.403 0.596 0.806 N all ss13 10 CAA ACC AAC 2 AACCAACGT:AATCAGCGA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 73.83333333333336 2 36.25 0.0709749060738395 0.0573071018565008 1.23850105439921 0.0136678042173386 0.0320372735481006 0.0417493095311223 NA NA 0.0546166189152526 0.802394086685639 609 2 389 0.389 0.609 0.778 N all ss13 11 CGA AAC GAA 2 CAACGTAGT:CAGCGAAAT 1:1 FALSE 1.58333333333333 1.25 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.25000000000001 2 35.83333333333333 0.0705572800165473 0.0579999025523778 1.21650687176292 0.0125573774641695 0.0318827835047855 0.042643438086196 NA NA 0.0530755153361242 0.812971351614917 632 0 368 0.368 0.632 0.736 N all ss13 12 AAT GAA ATG 2 CGAAATGCA:CGTAGTGCC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 74.66666666666669 2 35.666666666666664 0.0701445435081176 0.0582817382454872 1.20354240658821 0.0118628052626304 0.031322933317744 0.0413867030380652 NA NA 0.0546454823221611 0.828140809557092 622 2 376 0.376 0.622 0.752 N all ss13 13 GCA ATG CAC 2 AATGCACCC:AGTGCCCCC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.00000000000001 2 36.33333333333333 0.0561009098120237 0.0571705240409132 0.98129080943662494 -0.00106961422888947 0.0284915681597282 0.0414789608970718 NA NA 0.0546452418542078 0.984383376167871 481 4 515 0.515 0.481 0.962 N all ss13 14 CCC CAC CCC 2 GCACCCCGC:GCCCCCCGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.50000000000001 2 36.49999999999999 0.0557100557871529 0.0568993130810351 0.979098916498543 -0.00118925729388224 0.0296617893237492 0.0421653564111408 NA NA 0.0509808011548743 0.981388994311209 524 3 473 0.473 0.524 0.946 N all ss13 15 CGC CCC GCA 2 CCCCGCATT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.41666666666669 2 36.24999999999999 0.0694136680239339 0.0573071018565008 1.21125769364063 0.012106566167433 0.0302853271606766 0.0425166608389178 NA NA 0.052680730019925 0.818239301673334 612 0 388 0.388 0.612 0.776 N all ss13 16 ATT GCA TTA 2 CGCATTACA:CGCATTACG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 75.41666666666669 2 36.24999999999999 0.0694136680239339 0.0573071018565008 1.21125769364063 0.012106566167433 0.0300133980545863 0.0421998884899195 NaN NaN 0.0569117787472246 0.831541355746791 594 2 404 0.404 0.594 0.808 N all ss13 17 ACA TTA CAT 2 ATTACATTT:ATTACGTTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.66666666666669 2 35.416666666666664 0.0826523551002107 0.0587096677913667 1.40781507049108 0.023942687308844 0.0342786712843449 0.0430364000932283 NaN NaN 0.0586925343521068 0.683322042785246 690 1 309 0.309 0.69 0.618 N all ss13 18 TTT CAT TTG 2 ACATTTGGT:ACGTTTGGT 1:1 FALSE 1.5 0.5 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.33333333333334 2 35.416666666666664 0.081899468973744 0.0587096677913667 1.39499118381636 0.0231898011823773 0.032759343790653 0.0441410062041214 NaN NaN 0.0557551959676623 0.677467230550178 647 0 353 0.353 0.647 0.706 N all ss13 19 GGT TTG GTG 2 TTTGGTGGA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.83333333333334 2 35.416666666666664 0.0824628375267118 0.0587096677913667 1.40458702338012 0.0237531697353451 0.0328592648849368 0.0406383532214627 NaN NaN 0.056018344328041 0.671547694555853 657 1 342 0.342 0.657 0.684 N all ss13 20 GGA GTG GAC 2 GGTGGACCC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.16666666666667 2 35.58333333333333 0.0832261761385522 0.058423686245627 1.42452798662258 0.0248024898929252 0.0334456940341425 0.0427231918735098 NaN NaN 0.0540558564916799 0.646355701471656 703 1 296 0.296 0.703 0.592 N all ss13 21 CCC GAC CCA 2 GGACCCACA:GGACCCTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.75 2 35 0.0825574874404694 0.0594370287406054 1.38899082255215 0.0231204586998641 0.0319167766207289 0.0437641825353351 NaN NaN 0.057592825928284 0.68809116026132 690 1 309 0.309 0.69 0.618 N all ss13 22 ACA CCA CAG 2 CCCACAGAT:CCCTCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.08333333333333 2 35.33333333333333 0.0821801867828477 0.0588537115811214 1.39634671416728 0.0233264752017263 0.0325541912954907 0.0428566945614682 NaN NaN 0.0562150367596406 0.678177910987186 680 0 320 0.32 0.68 0.64 N all ss13 23 GAT CAG ATT 2 ACAGATTCA:TCAGATTCA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.75 1 34.666666666666664 0.0814358477684013 0.029415534864961 2.76846394744315 0.0520203129034404 0.0326170657285297 0.0314321113722639 NA NA 0.0454614212019877 0.252510107950242 875 0 125 0.125 0.875 0.25 N all ss13 24 TCA ATT CAA 2 GATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 76.41666666666667 1 35.33333333333333 0.0829382721030275 0.028849710620847 2.87483896088357 0.0540885614821804 0.0334782207138322 0.0293408307401572 NaN NaN 0.0469861322842497 0.249666370131617 883 1 116 0.116 0.883 0.232 N all ss13 25 ACT CAA CTG 2 TCAACTGAC:TCAACTGGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.75000000000001 1 35 0.0814358477684013 0.0291298749871979 2.79561267613373 0.0523059727812034 0.0327436376327353 0.0292992020640227 NaN NaN 0.0455465180856329 0.250800290086745 882 0 118 0.118 0.882 0.236 N all ss13 26 GAC CTG ACA 2 ACTGACAAT:ACTGGCAGT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 77.91666666666669 1 34.83333333333333 0.0812518671161106 0.0292720079293014 2.77575311240528 0.0519798591868092 0.0329702019883772 0.0324218401200873 NaN NaN 0.0461026702881022 0.259539404027775 866 1 133 0.133 0.866 0.266 N all ss13 27 AAT ACA ATA 2 GACAATAAC:GGCAGTAAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 78.58333333333336 1 34.5 0.0664886936625221 0.0295604764056575 2.24924296720052 0.0369282172568646 0.0290929536516753 0.0333601540722842 NA NA 0.0426053401346076 0.386078505451694 812 5 183 0.183 0.812 0.366 N all ss13 28 AAC ATA ACC 2 AATAACCAG:AGTAACCAG 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.91666666666669 1 34.5 0.0531784143271381 0.0295604764056575 1.79897013828101 0.0236179379214806 0.025666375709357 0.0301990714808036 NA NA 0.0425168166926546 0.578555182939266 721 1 278 0.278 0.721 0.556 N all ss13 29 CAG ACC AGA 2 AACCAGAAT 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.75000000000001 1 34.666666666666664 0.0532965566864638 0.029415534864961 1.8118506745206 0.0238810218215028 0.0263945376683605 0.0296588457489398 NA NA 0.0406369521662695 0.556755399432435 723 3 274 0.274 0.723 0.548 N all ss13 30 AAT AGA ATG 2 CAGAATGGA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 78.58333333333336 1 33.83333333333333 0.0527110387112104 0.0301548153585304 1.74801397668977 0.02255622335268 0.0259035794518554 0.0326792918799905 NA NA 0.0399689111909191 0.572519903731817 722 8 270 0.27 0.722 0.54 N all ss13 31 GGA ATG GAG 2 AATGGAGAA:AATGGAGGA 1:1 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.58333333333336 2 34.5 0.0534152253723939 0.0603340239140544 0.885325093656669 -0.00691879854166048 0.0262676864465642 0.0438427860210589 NA NA 0.053634212364346 0.897357867962495 465 5 530 0.53 0.465 0.93 N all ss13 32 GAA GAG AAC 2 GGAGAACGC:GGAGGACGC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.666666666666667 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.58333333333336 2 35.5 0.0541384900641951 0.0585663277285774 0.924396187432087 -0.00442783766438236 0.0261146067940927 0.0423211778533662 NA NA 0.0510517902486558 0.930884325176695 514 0 486 0.486 0.514 0.972 N all ss13 33 CGC AAC GCA 2 GAACGCAGT:GGACGCAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333336 2 35.33333333333333 0.0399650588551816 0.0588537115811214 0.679057578214002 -0.0188886527259398 0.0221363330134219 0.0412512218198488 NA NA 0.0488832388076053 0.699197886295031 343 7 650 0.65 0.343 0.686 N all ss13 34 AAT GCA ATG 2 CGCAATGGG:CGCAGTGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.08333333333336 2 35 0.0394395350433882 0.0594370287406054 0.663551591979974 -0.0199974936972172 0.0220501223155829 0.042813044778402 NA NA 0.0501666727617601 0.690172420543876 359 5 636 0.636 0.359 0.718 N all ss13 35 GGG ATG GGG 2 AATGGGGCA:AGTGGGGCG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.08333333333336 2 35 0.026061253903872 0.0594370287406054 0.438468316066207 -0.0333757748367334 0.0185393461198326 0.0445111492761072 NA NA 0.0477222592893643 0.484317448713662 214 13 773 0.773 0.214 0.428 N all ss13 36 GCA GGG CAA 2 GGGGCAAGG:GGGGCGCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666669 2 35.166666666666664 0.0259485340559256 0.0591439311842398 0.438735361961198 -0.0331953971283142 0.0184046296095617 0.0415004922813251 NA NA 0.0481332181938703 0.490410092434834 224 13 763 0.763 0.224 0.448 N all ss13 37 AGG CAA GAT 2 GCAAGGCCA:GCGCGATCA 1:1 TRUE 1.5 0.833333333333333 0.416666666666667 0.25 0 2 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.08333333333336 2 34.5 0.0257259947650973 0.0603340239140544 0.426392822758579 -0.0346080291489571 0.018499687730406 0.0442308339233778 NA NA 0.0478314289588015 0.469347199329695 212 10 778 0.778 0.212 0.424 N all ss13 38 CCA GAT CAA 2 AGGCCAAAA:CGATCAAAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.58333333333336 2 35.08333333333333 0.0258925390301244 0.0592901175479514 0.436709186976794 -0.033397578517827 0.017973573622064 0.0431005950886926 NA NA 0.0484592806157766 0.490704657977009 206 16 778 0.778 0.206 0.412 N all ss13 39 AAA CAA AAC 2 CCAAAACAG:TCAAAACAA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.25000000000001 1 35.416666666666664 0.0260047718198447 0.0287805096612113 0.903554944855353 -0.00277573784136658 0.0184099361631567 0.0294299292153606 NA NA 0.0333334752092214 0.933635437994298 442 50 508 0.508 0.442 0.884 N all ss13 40 CAA AAC AAC 2 AAACAACGT:AAACAGCGC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.08333333333336 1 35.416666666666664 0.0264053674769446 0.0287805096612113 0.917473935930059 -0.00237514218426668 0.0181193936409638 0.0301756949918103 NA NA 0.0352292234944072 0.946247620318375 448 52 500 0.5 0.448 0.896 N all ss13 41 CGC AAC GCC 2 CAACGTCGG:CAGCGCCGA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 76.08333333333336 1 35.916666666666664 0.0267586909940917 0.0283721774047871 0.943131385805336 -0.00161348641069542 0.0190014714672973 0.0302126798632724 NA NA 0.0335307932166373 0.961620972023635 472 42 486 0.486 0.472 0.944 N all ss13 42 CGA GCC GAC 2 CGCCGACCC:CGTCGGCCC 1:1 FALSE 1 1 0.583333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000001 1 36.25 0.0268785763539719 0.0281063333749098 0.956317424810953 -0.00122775702093791 0.0175715662666452 0.0295754975154072 NA NA 0.0344944116067619 0.971606949418121 444 50 506 0.506 0.444 0.888 N all ss13 43 CCC GAC CCC 2 CGACCCCAA:CGGCCCCAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000001 1 36.666666666666664 0.0268785763539719 0.0277809537602618 0.967518127200487 -9.02377406289963e-4 0.0184020942132475 0.0280468328111422 NA NA 0.0329187753305996 0.978130934927258 478 35 487 0.487 0.478 0.956 N all ss13 44 CAA CCC AAG 2 CCCCAAGGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000001 1 36.5 0.0268785763539719 0.0279101972553257 0.963037849861236 -0.00103162090135388 0.0185246456162036 0.0290826578093556 NA NA 0.033734984932387 0.975604372706722 457 50 493 0.493 0.457 0.914 N all ss13 45 GGT AAG GTT 2 CAAGGTTTA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.58333333333334 1 35.5 0.0269389228181416 0.0287116399282627 0.938257894200738 -0.0017727171101211 0.0181667478741591 0.0303181297150444 NA NA 0.0344954894756769 0.959014893859213 474 49 477 0.477 0.474 0.948 N all ss13 46 TTA GTT TAC 2 GGTTTACCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75 2 35.5 0.0268785763539719 0.0585663277285774 0.458942491298741 -0.0316877513746056 0.0181849339050173 0.0453469699840824 NA NA 0.0497191302086821 0.523906532850967 221 16 763 0.763 0.221 0.442 N all ss13 47 CCC TAC CCA 2 TTACCCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75 2 35.166666666666664 0.0268785763539719 0.0591439311842398 0.454460429257605 -0.0322653548302679 0.019751260298795 0.040241942332211 NA NA 0.0492682420373401 0.512537588431705 262 17 721 0.721 0.262 0.524 N all ss13 48 AAT CCA ATA 2 CCCAATAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75 2 35.166666666666664 0.0268785763539719 0.0591439311842398 0.454460429257605 -0.0322653548302679 0.0182560812082069 0.0432077007629485 NA NA 0.0504805566122926 0.522716244422942 244 18 738 0.738 0.244 0.488 N all ss13 49 AAT ATA ATA 2 AATAATACT 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333333 2 35.166666666666664 0.0271215992572094 0.0591439311842398 0.458569437542504 -0.0320223319270304 0.018803131799729 0.0437061405926931 NA NA 0.0494584517751891 0.517334761998234 217 14 769 0.769 0.217 0.434 N all ss13 50 ACT ATA CTG 2 AATACTGCG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75 2 35.5 0.0272447663451876 0.0585663277285774 0.465195060059972 -0.0313215613833898 0.0189644740989284 0.0463581373050081 NA NA 0.0483185750598591 0.516836047572091 250 16 734 0.734 0.25 0.5 N all ss13 51 GCG CTG CGT 2 ACTGCGTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75 2 35.5 0.0272447663451876 0.0585663277285774 0.465195060059972 -0.0313215613833898 0.0192828511455503 0.0436807127477952 NA NA 0.0490878470748195 0.523427069264657 258 12 730 0.73 0.258 0.516 N all ss13 52 TCT CGT CTT 2 GCGTCTTGG 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666667 2 35.5 0.0269995408952429 0.0585663277285774 0.461007919437443 -0.0315667868333345 0.0194183929169677 0.0451837971898722 NA NA 0.0496614674915401 0.525011464101999 250 12 738 0.738 0.25 0.5 N all ss13 53 TGG CTT GGT 2 TCTTGGTTC 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333334 2 34.83333333333333 0.0271215992572094 0.0597330472949441 0.454046804665615 -0.0326114480377347 0.0191323139206527 0.0467486691230304 NA NA 0.048867211387009 0.504549712700483 242 11 747 0.747 0.242 0.484 N all ss13 54 TTC GGT TCA 2 TGGTTCACA:TGGTTCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.75 2 33.83333333333333 0.0272447663451876 0.0615730216404005 0.442478956194529 -0.0343282552952129 0.0193954802407034 0.0453298651736163 NA NA 0.0512796717265651 0.503219918451134 249 18 733 0.733 0.249 0.498 N all ss13 55 ACA TCA CAG 2 TTCACAGCT:TTCACCGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76 2 33.25 0.0405504159527068 0.0626996766264699 0.646740432080437 -0.0221492606737631 0.0220802739000599 0.0461669343299512 NA NA 0.0520701984173188 0.670564727098733 342 4 654 0.654 0.342 0.684 N all ss13 56 GCT CAG CTC 2 ACAGCTCTC:ACCGCTCTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.5 2 32.75 0.0402781342288958 0.0636987401522852 0.632322305474214 -0.0234206059233894 0.0226654734621618 0.048559122770135 NA NA 0.0528870373215679 0.657879959738916 308 6 686 0.686 0.308 0.616 N all ss13 57 CTC CTC TCA 2 GCTCTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333334 2 33.08333333333333 0.0400986359257937 0.0630291953285242 0.63619146201676 -0.0229305594027304 0.0233836117737139 0.0480385497567351 NA NA 0.0549309128315963 0.676353950950976 342 3 655 0.655 0.342 0.684 N all ss13 58 ACT TCA CTC 2 CTCACTCAA:CTCACTCAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.83333333333334 2 33.08333333333333 0.0400986359257937 0.0630291953285242 0.63619146201676 -0.0229305594027304 0.0224186152388331 0.0458346835293214 NA NA 0.0554491374501403 0.679209396191659 365 5 630 0.63 0.365 0.73 N all ss13 59 CAA CTC AAC 2 ACTCAACAT:ACTCAGCAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.50000000000001 2 32.58333333333333 0.0397443976053828 0.0640388786228151 0.620629193703948 -0.0242944810174324 0.0222933139260311 0.045642502337068 NA NA 0.0551883389091636 0.65978472446246 351 4 645 0.645 0.351 0.702 N all ss13 60 CAT AAC ATG 2 CAACATGGC:CAGCATGGC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.50000000000001 2 31.916666666666664 0.0392246245521367 0.0654365742860851 0.599429676447437 -0.0262119497339484 0.0224860830818906 0.0497246459082703 NA NA 0.056315701497215 0.64161169556403 297 3 700 0.7 0.297 0.594 N all ss13 61 GGC ATG GCA 2 CATGGCAAG 2 FALSE 2 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.16666666666669 2 32.58333333333333 0.039920730758297 0.0640388786228151 0.623382726506308 -0.0241181478645181 0.0227841067051493 0.0496934267384269 NA NA 0.0560165996848619 0.666792995691447 351 3 646 0.646 0.351 0.702 N all ss13 62 AAG GCA AGG 2 GGCAAGGAA:GGCAAGGAG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.00000000000001 2 33.416666666666664 0.0400094855289696 0.062373587449531503 0.64144916406071 -0.022364101920562 0.0215972090328766 0.0453732484003687 NA NA 0.0509084325882641 0.660443783059055 334 4 662 0.662 0.334 0.668 N all ss13 63 GAA AGG AAG 2 AAGGAAGAC:AAGGAGGAA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.66666666666669 2 33.083333333333336 0.0401881846005798 0.0630291953285242 0.637612211152447 -0.0228410107279444 0.0221222410249886 0.0472427390813595 NA NA 0.0528860505714619 0.665820616205158 332 4 664 0.664 0.332 0.664 N all ss13 64 GAA AAG AAC 2 GAAGACCTT:GAGGAACTT 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.83333333333336 2 33.25 0.040641996635402 0.0626996766264699 0.648201056562454 -0.0220576799910679 0.0229436123224838 0.0483427993754904 NA NA 0.0509153449527958 0.664853035112106 361 6 633 0.633 0.361 0.722 N all ss13 65 CTT AAC TTA 2 GAACTTAGA:GACCTTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333336 2 33.5 0.0276848040229394 0.0622118122355632 0.445008801835119 -0.0345270082126238 0.0194799616863759 0.0473978723765116 NA NA 0.0528219253602885 0.513337851455885 245 12 743 0.743 0.245 0.49 N all ss13 66 AAA TTA AAT 2 CTTAAATTC:CTTAGATTC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.583333333333333 0.5 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 73.58333333333336 2 32.5 0.0276848040229394 0.0642103145422439 0.43115820597212 -0.0365255105193045 0.0191152356293914 0.0470401399429667 NA NA 0.0524375208791567 0.486082601399843 208 15 777 0.777 0.208 0.416 N all ss13 67 TTC AAT TCC 2 AAATTCCCT:AGATTCCCT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 73.00000000000001 2 32.666666666666664 0.0138252762666285 0.0638683562552301 0.216465196182286 -0.0500430799886016 0.0144800285466973 0.0473973106341877 NA NA 0.0501387741589997 0.318235033240897 101 53 846 0.846 0.101 0.202 N all ss13 68 CCT TCC CTC 2 TTCCCTCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666669 2 33.333333333333336 0.0140849209886972 0.0625362067042883 0.225228259451358 -0.0484512857155911 0.0134003284517012 0.047942628138063 NA NA 0.0495021664437476 0.327693134092091 113 48 839 0.839 0.113 0.226 N all ss13 69 CGA CTC GAG 2 CCTCGAGGA:CCTCGAGGC 1:1 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 71.66666666666669 2 33.333333333333336 0.0140849209886972 0.0625362067042883 0.225228259451358 -0.0484512857155911 0.013730835080356 0.0474911730456174 NA NA 0.0483658509323692 0.316456415251028 106 43 851 0.851 0.106 0.212 N all ss13 70 GGA GAG GAC 2 CGAGGACAA:CGAGGCCAG 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.83333333333336 2 33.333333333333336 0.0138572071256798 0.0625362067042883 0.221586947081803 -0.0486789995786084 0.0148343458136567 0.0441540307168794 NA NA 0.0487398572567341 0.31791514524853 110 41 849 0.849 0.11 0.22 N all ss13 71 CAA GAC AAG 2 GGACAAGGC:GGCCAGGGC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 72.75000000000003 2 33.416666666666664 0.0138732279313668 0.062373587449531503 0.222421516841436 -0.0485003595181648 0.0133812910722246 0.047498276695165 NA NA 0.0462466458350375 0.294301261584607 113 44 843 0.843 0.113 0.226 N all ss13 72 GGC AAG GCG 2 CAAGGCGTT:CAGGGCGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000003 2 33.75 0.0284057619693269 0.0617314855970427 0.46015030570862703 -0.0333257236277158 0.0200892092875115 0.0461997482479965 NA NA 0.0541149150458672 0.538005072531555 246 13 741 0.741 0.246 0.492 N all ss13 73 GTT GCG TTC 2 GGCGTTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000003 2 33.75 0.0284057619693269 0.0617314855970427 0.46015030570862703 -0.0333257236277158 0.0206320675598702 0.0473611212749984 NA NA 0.0550356830498599 0.54482730222852 226 9 765 0.765 0.226 0.452 N all ss13 74 CCA TTC CAA 2 GTTCCAATC:GTTCCAATT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 72.4166666666667 2 33.08333333333333 0.0281392910819376 0.0630291953285242 0.446448521756758 -0.0348899042465866 0.0202690273098292 0.0498526042753638 NA NA 0.0510067519586404 0.49395924647505 225 19 756 0.756 0.225 0.45 N all ss13 75 ATC CAA TCA 2 CCAATCAAC:CCAATTAAC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000003 2 33.75 0.0284057619693269 0.0617314855970427 0.46015030570862703 -0.0333257236277158 0.0205443577491119 0.0450094925824438 NA NA 0.0516917525363265 0.519120979747592 240 18 742 0.742 0.24 0.48 N all ss13 76 AAC TCA ACA 2 ATCAACACC:ATTAACACC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.75000000000003 2 33.75 0.0284057619693269 0.0617314855970427 0.46015030570862703 -0.0333257236277158 0.0203523783661896 0.0448724877495718 NA NA 0.0528923046525185 0.528650404084367 242 16 742 0.742 0.242 0.484 N all ss13 77 ACC ACA CCA 2 AACACCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 70.4166666666667 2 34.416666666666664 0.0289541383570224 0.0604861633757489 0.478690277926128 -0.0315320250187264 0.0205748810302931 0.0446988929206107 NA NA 0.0515450723687701 0.540711815168664 252 20 728 0.728 0.252 0.504 N all ss13 78 AAT CCA ATA 2 ACCAATAGC:ACCAATAGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.08333333333337 2 34.416666666666664 0.0286773285294381 0.0604861633757489 0.474113862228133 -0.0318088348463107 0.0198662600918136 0.0451931531263412 NA NA 0.0518754052196775 0.539758935000735 259 11 730 0.73 0.259 0.518 N all ss13 79 AGC ATA GCA 2 AATAGCAGT:AATAGTGGT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 71.08333333333337 2 34.416666666666664 0.0286773285294381 0.0604861633757489 0.474113862228133 -0.0318088348463107 0.0197986577031049 0.0469869882421239 NA NA 0.0487284073883931 0.513899375164385 249 19 732 0.732 0.249 0.498 N all ss13 80 AGT GCA GTC 2 AGCAGTCCA:AGTGGTCCA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333337 2 34.166666666666664 0.043281238215485 0.0609472230590743 0.710142907963729 -0.0176659848435893 0.0248073607310052 0.0462505971735944 NA NA 0.054041117267542 0.743744310349647 371 4 625 0.625 0.371 0.742 N all ss13 81 CCA GTC CAG 2 AGTCCAGAT:GGTCCAGAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.33333333333337 1 33.83333333333333 0.043281238215485 0.0301548153585304 1.43530105228256 0.0131264228569547 0.0242159366476464 0.032804080480746 NA NA 0.0423233929157713 0.756450079424122 638 15 347 0.347 0.638 0.694 N all ss13 82 GAT CAG ATG 2 CCAGATGAC 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.58333333333337 1 33.83333333333333 0.0431256509016318 0.0301548153585304 1.43014143475537 0.0129708355431015 0.0248082975644636 0.0317070237830357 NA NA 0.0411403124189195 0.752546894250626 621 23 356 0.356 0.621 0.712 N all ss13 83 GAC ATG ACC 2 GATGACCAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.4166666666667 2 34.49999999999999 0.0438614614252191 0.0603340239140544 0.72697722743803 -0.0164725624888354 0.0246793912160058 0.0469002846348731 NA NA 0.0552102684793119 0.765428044637136 405 5 590 0.59 0.405 0.81 N all ss13 84 CAA ACC AAA 2 GACCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.75000000000003 2 35.49999999999999 0.0442933122327008 0.0585663277285774 0.756293145747089 -0.0142730154958766 0.0254182599888745 0.0434732592700798 NA NA 0.0526121938261342 0.786170139466103 403 6 591 0.591 0.403 0.806 N all ss13 85 ATT AAA TTG 2 CAAATTGGC 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000003 2 35.83333333333333 0.0449572769752751 0.0579999025523778 0.775126767405784 -0.0130426255771027 0.0244524184501077 0.0415650928067103 NA NA 0.0506214535984785 0.796676914805016 411 7 582 0.582 0.411 0.822 N all ss13 86 GGC TTG GCT 2 ATTGGCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.58333333333337 2 35.49999999999999 0.0450698784927921 0.0585663277285774 0.769552748836602 -0.0134964492357854 0.0258308338960268 0.042268216838156 NA NA 0.050046197629923 0.7874065919443 403 3 594 0.594 0.403 0.806 N all ss13 87 TAC GCT ACT 2 GGCTACTAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.25000000000003 2 35.83333333333333 0.045296782717305 0.0579999025523778 0.780980324516906 -0.0127031198350728 0.0255957926316147 0.0422395119468835 NA NA 0.052064837649422 0.807241240888896 434 6 560 0.56 0.434 0.868 N all ss13 88 TAC ACT ACC 2 TACTACCGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.58333333333336 2 36.16666666666666 0.0450698784927921 0.0574443341110379 0.78458353100018 -0.0123744556182457 0.0257374351875111 0.0438389556027641 NA NA 0.0532521376994886 0.816246908718785 411 3 586 0.586 0.411 0.822 N all ss13 89 CGA ACC GAA 2 TACCGAAGA 2 FALSE 1 1 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.08333333333336 2 35.66666666666666 0.0447337539717067 0.0582817382454872 0.76754323598388 -0.0135479842737805 0.0246111455642462 0.0428067627719069 NA NA 0.0523645389987496 0.795847886915581 389 12 599 0.599 0.389 0.778 N all ss13 90 AGA GAA GAG 2 CGAAGAGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.75000000000003 2 35.499999999999986 0.0442933122327008 0.0585663277285774 0.756293145747089 -0.0142730154958766 0.0251275226736078 0.0452893993502728 NA NA 0.0514053439437699 0.781276240917544 387 3 610 0.61 0.387 0.774 N all ss13 91 GCT GAG CTA 2 AGAGCTACC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.08333333333336 2 35.66666666666666 0.0454110940157692 0.0582817382454872 0.779165058950269 -0.012870644229718 0.0257030440641928 0.0446176553083852 NA NA 0.05248886424451 0.8062960489955 414 3 583 0.583 0.414 0.828 N all ss13 92 ACC CTA CCA 2 GCTACCAGA:GCTACCCGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.4166666666667 2 34.999999999999986 0.0451830456487547 0.0594370287406055 0.760183451395966 -0.0142539830918508 0.0252687301588638 0.0435890347815275 NA NA 0.0556082487356876 0.797697135366265 423 5 572 0.572 0.423 0.846 N all ss13 93 AGA CCA GAC 2 ACCAGACGA:ACCCGACGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 68.75000000000003 2 34.66666666666666 0.0449572769752751 0.0600320307551524 0.748888158700454 -0.0150747537798773 0.0261341415105448 0.0434253664719909 NA NA 0.0547539627857508 0.783071905024497 403 2 595 0.595 0.403 0.806 N all ss13 94 CGA GAC GAA 2 AGACGAATT:CGACGAGTT 1:1 FALSE 1.5 1.5 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.08333333333337 2 34.499999999999986 0.0447337539717067 0.0603340239140544 0.741434949464497 -0.0156002699423477 0.0261904232148801 0.0448424818261651 NA NA 0.0512321103635379 0.760745619847842 394 5 601 0.601 0.394 0.788 N all ss13 95 ATT GAA TTC 2 CGAATTCGT:CGAGTTCGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.833333333333333 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.50000000000004 2 35.249999999999986 0.0444574574471551 0.0589984642956841 0.753535841616937 -0.014541006848529 0.0250381376435194 0.043928206992781 NA NA 0.0543968827769213 0.789227995399887 404 6 590 0.59 0.404 0.808 N all ss13 96 CGT TTC GTG 2 ATTCGTGGT:GTTCGTGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.00000000000004 1 35.249999999999986 0.0441303750172001 0.0289192452027623 1.52598640482446 0.0152111298144378 0.0254849260767617 0.0296600325336733 NA NA 0.0391993110731829 0.697982106705028 673 17 310 0.31 0.673 0.62 N all ss13 97 GGT GTG GTG 2 CGTGGTGGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.1666666666667 1 35.749999999999986 0.0440224147463932 0.0285069944752382 1.54426713712777 0.015515420271155 0.02563290656559 0.0306733234241024 NA NA 0.0414539550496128 0.708195400537905 660 10 330 0.33 0.66 0.66 N all ss13 98 GGT GTG GTG 2 GGTGGTGAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 1 36.08333333333332 0.0439149815636805 0.0282386296527663 1.55513854969866 0.0156763519109142 0.0251921639375649 0.0301317492200606 NA NA 0.0385049421920363 0.683915661565229 678 16 306 0.306 0.678 0.612 N all ss13 99 GAC GTG ACG 2 GGTGACGGC:GGTGACGGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 71.00000000000004 1 35.41666666666665 0.043490443237762 0.0287805096612114 1.51110747341545 0.0147099335765506 0.0237966701200786 0.030057290027613 NA NA 0.0387852487811194 0.7044902030865 636 17 347 0.347 0.636 0.694 N all ss13 100 GGC ACG GCA 2 GACGGCAAA:GACGGTAAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 1 35.41666666666665 0.0439149815636805 0.0287805096612114 1.52585837014785 0.0151344719024691 0.0246822379979298 0.0297221386060756 NA NA 0.0395432579714711 0.701918453458599 656 14 330 0.33 0.656 0.66 N all ss13 101 AAA GCA AAA 2 GGCAAAATG:GGTAAAATG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 1 35.41666666666665 0.0439149815636805 0.0287805096612114 1.52585837014785 0.0151344719024691 0.0250608393351494 0.0285607799131346 NA NA 0.0401447296782698 0.706175292935304 650 22 328 0.328 0.65 0.656 N all ss13 102 ATG AAA TGA 2 AAAATGAAA 2 FALSE 0.666666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.33333333333337 1 35.41666666666665 0.0439149815636805 0.0287805096612114 1.52585837014785 0.0151344719024691 0.0261270664033594 0.0290429894971893 NA NA 0.0389653561740795 0.697713824089905 652 16 332 0.332 0.652 0.664 N all ss13 103 AAA TGA AAG 2 ATGAAAGAG:ATGAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 70.6666666666667 1 36.08333333333332 0.0437016810929818 0.0282386296527663 1.54758505034966 0.0154630514402155 0.024628954773993 0.028777723986306 NA NA 0.0390325990625573 0.691988944411038 686 17 297 0.297 0.686 0.594 N all ss13 104 GAG AAG AGC 2 AAAGAGCTC:AAAGATCTC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 70.1666666666667 2 37.249999999999986 0.0592901175479513 0.0557100557871529 1.06426239769848 0.00358006176079841 0.0303229713141074 0.0398003940910129 NA NA 0.0415161824908608 0.931281259543642 543 4 453 0.453 0.543 0.906 N all ss13 105 CTC AGC TCA 2 GAGCTCAGC:GATCTCAGT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.75000000000003 2 37.66666666666666 0.0442933122327008 0.0550706014161129 0.804300499608148 -0.0107772891834121 0.0260802455512513 0.0413605099804983 NA NA 0.039723338340299 0.786153578941122 415 14 571 0.571 0.415 0.83 N all ss13 106 AGC TCA GCC 2 CTCAGCCCC:CTCAGTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 38.16666666666666 0.0441845540246642 0.0543223783836109 0.813376647698376 -0.0101378243589468 0.0257045028916876 0.0385229944238278 NA NA 0.0366803374913225 0.782253857115595 430 13 557 0.557 0.43 0.86 N all ss13 107 CCA GCC CAA 2 AGCCCCAGA:AGTCCAAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 37.499999999999986 0.0441845540246642 0.0553246126797069 0.798641904290658 -0.0111400586550427 0.0257260924128542 0.0404949542087058 NA NA 0.0389263262803799 0.774737848986344 413 18 569 0.569 0.413 0.826 N all ss13 108 AGA CAA GAT 2 CCAAGATGG:CCCAGATGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.583333333333333 0.5 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 69.9166666666667 2 37.499999999999986 0.0441845540246642 0.0553246126797069 0.798641904290658 -0.0111400586550427 0.0257169441476433 0.0396903699096019 NA NA 0.0379324071616685 0.769001041869063 388 19 593 0.593 0.388 0.776 N all ss13 109 TGG GAT GGT 2 AGATGGTAC:AGATGGTAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.83333333333337 2 37.66666666666666 0.0595846701692669 0.0550706014161129 1.08196875714223 0.00451406875315397 0.0299968275054412 0.0410308697874616 NA NA 0.0416096127628867 0.913610027071405 557 7 436 0.436 0.557 0.872 N all ss13 110 TAC GGT ACT 2 TGGTACTTC:TGGTATTTC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.1666666666667 2 38.33333333333332 0.0611024764460932 0.054077470426008 1.12990633557273 0.00702500602008521 0.0302064860388515 0.0384671812285368 NA NA 0.0430471523024907 0.870366256311081 605 3 392 0.392 0.605 0.784 N all ss13 111 TTC ACT TCT 2 TACTTCTAT:TATTTCTAC 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.6666666666667 2 37.33333333333332 0.0606390724718212 0.0555809791152914 1.09100403478028 0.00505809335652978 0.0308835147145086 0.0393151642697376 NA NA 0.0419117773491028 0.903941097801047 582 2 416 0.416 0.582 0.832 N all ss13 112 TAC TCT ACT 2 TTCTACTAC:TTCTATTAC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 68.50000000000003 2 36.499999999999986 0.0607927570603561 0.0568993130810351 1.06842690655643 0.003893443979321 0.0306228516937375 0.0396118139737452 NA NA 0.0453270181338824 0.931548487468908 519 6 475 0.475 0.519 0.95 N all ss13 113 TAC ACT ACC 2 TACTACCTA:TATTACCTA 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.1666666666667 2 35.83333333333332 0.0601826482875392 0.0579999025523778 1.03763361038737 0.00218274573516138 0.0306929010892416 0.0409969884251011 NA NA 0.0423171663280035 0.958862860663227 532 3 465 0.465 0.532 0.93 N all ss13 114 CTA ACC TAG 2 TACCTAGGA 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 69.6666666666667 2 35.33333333333332 0.0597330472949441 0.0588537115811214 1.01494104093351 8.79335713822649e-4 0.0314477155106684 0.0439580992722712 NA NA 0.0419363453094388 0.983270907963662 522 5 473 0.473 0.522 0.946 N all ss13 115 GGA TAG GAA 2 CTAGGAACT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.33333333333337 2 35.66666666666666 0.0582817382454872 0.0582817382454872 1 0 0.0284618529135727 0.043555561399004 NA NA 0.0421434700575455 1 477 8 515 0.515 0.477 0.954 N all ss13 116 ACT GAA CTG 2 GGAACTGGC:GGAACTGGG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 71.83333333333337 2 36.16666666666666 0.0578600049104132 0.0574443341110379 1.00723606263016 4.15670799375385e-4 0.0294962557858239 0.040793024459561 NA NA 0.0417113963265521 0.992048891836531 522 4 474 0.474 0.522 0.948 N all ss13 117 GGC CTG GCC 2 ACTGGCCCA:ACTGGGCCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.16666666666671 2 35.83333333333332 0.0575822255219405 0.0579999025523778 0.992798659789814 -4.17677030437338e-4 0.0293468148697709 0.0403085334255498 NA NA 0.0430489045808286 0.992258738551071 510 5 485 0.485 0.51 0.97 N all ss13 118 CCA GCC CAG 2 GGCCCAGAA:GGGCCAGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.83333333333339 2 35.16666666666665 0.0570345959917882 0.0591439311842398 0.964335559875438 -0.00210933519245153 0.0289923301329403 0.0423821223849535 NA NA 0.0431144743824652 0.960979813585371 486 9 505 0.505 0.486 0.972 N all ss13 119 GAA CAG AAG 2 CCAGAAGCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666671 2 34.16666666666665 0.0559700169039055 0.0609472230590744 0.918335800954465 -0.00497720615516889 0.029311407068745 0.0437499746769844 NA NA 0.0430337046225238 0.907923337089293 463 2 535 0.535 0.463 0.926 N all ss13 120 GCT AAG CTG 2 GAAGCTGGA:GAAGCTTCA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.50000000000004 2 34.16666666666665 0.0564972895530331 0.0609472230590744 0.92698709994173 -0.00444993350604127 0.0293251973869811 0.0432121140380791 NA NA 0.0442014573494003 0.919809323524331 490 9 501 0.501 0.49 0.98 N all ss13 121 GGA CTG CAC 2 GCTGGACTT:GCTTCACTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.16666666666671 2 34.16666666666665 0.0559700169039055 0.0609472230590744 0.918335800954465 -0.00497720615516889 0.0275581558156626 0.0437933330440314 NA NA 0.0448407542875522 0.911618425907732 454 2 544 0.544 0.454 0.908 N all ss13 122 CTT CAC TTC 2 GGACTTCCC:TCACTTCCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333339 2 33.499999999999986 0.0412002891133781 0.0622118122355633 0.66225830164494 -0.0210115231221852 0.0236072102379676 0.0450965667866223 NA NA 0.0415144583124308 0.612768598523896 310 16 674 0.674 0.31 0.62 N all ss13 123 CCC TTC CCT 2 CTTCCCTAC:CTTCCCTAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.83333333333339 2 34.16666666666665 0.0412002891133781 0.0609472230590744 0.675999447480056 -0.0197469339456964 0.0235365190670013 0.0404535519729956 NA NA 0.0413615280049123 0.633061126001716 292 13 695 0.695 0.292 0.584 N all ss13 124 TAC CCT ACG 2 CCCTACGGC:CCCTATGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.16666666666671 2 34.83333333333332 0.041581086362894 0.0597330472949441 0.696115270288805 -0.0181519609320501 0.0236694663650277 0.0439378563065103 NA NA 0.0420660765575914 0.666097095093283 335 13 652 0.652 0.335 0.67 N all ss13 125 GGC ACG GCG 2 TACGGCGCT:TATGGTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.16666666666671 2 34.83333333333332 0.041581086362894 0.0597330472949441 0.696115270288805 -0.0181519609320501 0.0242340929408959 0.0429605119037502 NA NA 0.0404226472820277 0.653392533530853 319 22 659 0.659 0.319 0.638 N all ss13 126 GCT GCG CTA 2 GGCGCTAAC:GGTGCTAAC 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.66666666666671 2 34.999999999999986 0.0412948328872705 0.0594370287406055 0.694766103929741 -0.018142195853335 0.0233743333443784 0.0403952051701898 NA NA 0.0403397347252624 0.652901437285559 332 10 658 0.658 0.332 0.664 N all ss13 127 AAC CTA ACA 2 GCTAACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.58333333333337 2 34.08333333333332 0.0407801460981609 0.0611024764460933 0.667405782384918 -0.0203223303479323 0.0235177361041644 0.044053159871888 NA NA 0.040488339637432 0.615716448306606 307 16 677 0.677 0.307 0.614 N all ss13 128 AAA ACA AAG 2 AACAAAGAA:AACAAAGAC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 2 33.74999999999999 0.0405961546323978 0.0617314855970427 0.657624779960626 -0.0211353309646449 0.0227106646745106 0.045095369462302 NA NA 0.0404513472588191 0.601330815571933 327 20 653 0.653 0.327 0.654 N all ss13 129 GAA AAG AAG 2 AAAGAAGGC:AAAGACGGC 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666671 2 33.24999999999999 0.0405961546323978 0.0626996766264699 0.64746992036733 -0.0221035219940721 0.0234350210246754 0.0441577992587641 NA NA 0.0415646217019423 0.594873585667717 311 19 670 0.67 0.311 0.622 N all ss13 130 GGC AAG GCA 2 GAAGGCATC:GACGGCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.33333333333337 2 33.16666666666666 0.0270299523623976 0.0628640039123036 0.429975036272027 -0.035834051549906 0.0195023952059642 0.0464427556438199 NA NA 0.038146860078053 0.347540331233862 147 43 810 0.81 0.147 0.294 N all ss13 131 ATC GCA TCA 2 GGCATCATA:GGCATCGTA 1:1 FALSE 1.25 0.75 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.00000000000004 2 33.49999999999999 0.0271522864979704 0.0622118122355632 0.43644905239473 -0.0350595257375927 0.0198713054157789 0.0443415040779773 NA NA 0.0406647514470653 0.388599428695711 150 43 807 0.807 0.15 0.3 N all ss13 132 ATA TCA TAT 2 ATCATATGG:ATCGTATGG 1:1 FALSE 1.16666666666667 0.833333333333333 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666671 2 33.49999999999999 0.0269995408952429 0.0622118122355632 0.433993801579191 -0.0352122713403203 0.0184564276056339 0.044864793970217 NA NA 0.0394613273953899 0.372219540560156 150 41 809 0.809 0.15 0.3 N all ss13 133 TGG TAT GGG 2 ATATGGGTT:GTATGGGTT 1:1 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 1 33.49999999999999 0.0268184996810859 0.0304610393656427 0.880419717763629 -0.00364253968455675 0.0191925619476576 0.0317655482304087 NA NA 0.0217173432408498 0.866799689609252 349 152 499 0.499 0.349 0.698 N all ss13 134 GTT GGG TTG 2 TGGGTTGCA 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.58333333333339 1 32.83333333333332 0.0269389228181416 0.0310925352587596 0.866411265403396 -0.004153612440618 0.0192868148090145 0.0318224946354194 NA NA 0.0230209511979675 0.856816974602043 364 135 501 0.501 0.364 0.728 N all ss13 135 GCA TTG CAA 2 GTTGCAACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 1 32.49999999999999 0.0268184996810859 0.0314182062818701 0.853597415475675 -0.00459970660078417 0.0189059769140752 0.0304524056182027 NA NA 0.0228667042634222 0.84057892585254 356 128 516 0.516 0.356 0.712 N all ss13 136 ACT CAA CTG 2 GCAACTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.25000000000006 1 33.16666666666666 0.0270604324233619 0.0307735475083969 0.879340687516713 -0.00371311508503493 0.0195060533444705 0.0296560975160186 NA NA 0.0233454129399428 0.873628564382465 373 138 489 0.489 0.373 0.746 N all ss13 137 GAG CTG AGG 2 ACTGAGGGA 2 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666671 1 33.49999999999999 0.0271830432683088 0.0304610393656427 0.89238725382985 -0.00327799609733386 0.0200338325245108 0.0305993083943546 NA NA 0.0236373070379282 0.88970388034761 364 109 527 0.527 0.364 0.728 N all ss13 138 GGA AGG GAG 2 GAGGGAGCC 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.58333333333339 1 33.166666666666664 0.0273067703935705 0.0307735475083969 0.887345548514341 -0.00346677711482632 0.0197958117820576 0.0309726978333541 NA NA 0.0221899907931837 0.875850492473369 355 128 517 0.517 0.355 0.71 N all ss13 139 GCC GAG CCT 2 GGAGCCTTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333339 1 33.666666666666664 0.0274944876870936 0.0303071537534075 0.907194648194318 -0.00281266606631388 0.0196681879604168 0.0296402078030253 NA NA 0.0225175178277448 0.900594699056141 376 126 498 0.498 0.376 0.752 N all ss13 140 TTG CCT TGA 2 GCCTTGAAT 2 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.08333333333339 1 33.666666666666664 0.0274944876870936 0.0303071537534075 0.907194648194318 -0.00281266606631388 0.0206794969159625 0.0311362664433247 NA NA 0.0226811668354174 0.901308245163369 368 133 499 0.499 0.368 0.736 N all ss13 141 AAT TGA ATA 2 TTGAATACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000006 1 33.33333333333333 0.0268785763539719 0.0306164958901914 0.877911582382717 -0.00373791953621951 0.0197792051487873 0.0298062381529311 NA NA 0.0211887024394934 0.859971087530748 348 123 529 0.529 0.348 0.696 N all ss13 142 ACA ATA CAC 2 AATACACCA:AATACACCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.75000000000006 1 34.33333333333333 0.0268785763539719 0.0297068535712844 0.904793780649782 -0.00282827721731251 0.0194776620190655 0.0295996438329276 NA NA 0.0224549315357317 0.899768733034477 383 107 510 0.51 0.383 0.766 N all ss13 143 CCA CAC CAA 2 ACACCAAAA:ACACCCAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.41666666666673 1 34.666666666666664 0.0269995408952429 0.029415534864961 0.917866733315942 -0.00241599396971805 0.0197673746175961 0.0294968891770709 NA NA 0.0209498139046617 0.908189162313433 365 127 508 0.508 0.365 0.73 N all ss13 144 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGAT:CCCAAAGAC 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.08333333333339 2 35.33333333333333 0.0410592825874941 0.0588537115811214 0.697649842030774 -0.0177944289936273 0.0245584318574566 0.0418639351260434 NA NA 0.0256671948126347 0.48813687868162 193 43 764 0.764 0.193 0.386 N all ss13 145 GAC AAG ACC 2 AAAGACCAC:AAAGATCAC 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333339 2 35.58333333333333 0.0554524994575896 0.058423686245627 0.949144140348388 -0.00297118678803739 0.028590467404581 0.040207619082744 NA NA 0.0303418965715311 0.921992984950771 457 12 531 0.531 0.457 0.914 N all ss13 146 CAC ACC ACA 2 GACCACATT:GATCACATT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.66666666666673 2 36.08333333333333 0.0571705240409131 0.0575822255219405 0.992850198524012 -4.11701481027447e-4 0.0287753011462486 0.0423861173692214 NA NA 0.03004981153706 0.989068817334133 496 17 487 0.487 0.496 0.974 N all ss13 147 ATT ACA TTG 2 CACATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000007 2 35.75 0.0573071018565007 0.0581404786806199 0.985666151310911 -8.33376824119193e-4 0.0280345004989687 0.0404624376078702 NA NA 0.0313661450659084 0.978803251880659 466 10 524 0.524 0.466 0.932 N all ss13 148 GGC TTG GCA 2 ATTGGCACC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.66666666666673 2 34.75 0.0563645417845084 0.0598821656332629 0.941257571239199 -0.00351762384875444 0.0274538176364043 0.042948374716487 NA NA 0.0315591963623916 0.911250683224759 464 14 522 0.522 0.464 0.928 N all ss13 149 ACC GCA CCC 2 GGCACCCGC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.33333333333339 2 35.083333333333336 0.0574443341110378 0.0592901175479514 0.968868615660598 -0.0018457834369136 0.0291813482793935 0.0417516323099203 NA NA 0.031263391385124 0.952920431459916 471 13 516 0.516 0.471 0.942 N all ss13 150 CGC CCC GCA 2 ACCCGCAAT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.00000000000006 2 34.416666666666664 0.0568993130810351 0.0604861633757489 0.940699656011711 -0.00358685029471375 0.0282831673749045 0.0426745474335364 NA NA 0.0316219223293479 0.909690267216284 440 20 540 0.54 0.44 0.88 N all ss13 151 AAT GCA ATC 2 CGCAATCCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.8333333333334 2 34.583333333333336 0.0570345959917882 0.0601826482875392 0.947691695441679 -0.00314805229575094 0.0289047727572023 0.0432102230843802 NA NA 0.0314251886306667 0.920204533709032 466 17 517 0.517 0.466 0.932 N all ss13 152 CCT ATC CTA 2 AATCCTAAT:AATCCTGCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.50000000000006 2 34.25000000000001 0.0573071018565008 0.0607927570603562 0.942663314309059 -0.00348565520385537 0.029400575250955 0.0444243471153375 NA NA 0.0317987115120224 0.912713730340564 442 19 539 0.539 0.442 0.884 N all ss13 153 AAT CTA ATA 2 CCTAATAAC:CCTGCTAAC 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666673 2 34.25000000000001 0.0567646707244322 0.0607927570603562 0.933740686708372 -0.004028086335924 0.0281650461318657 0.0437654600397564 NA NA 0.0312227376251749 0.897348698188406 451 19 530 0.53 0.451 0.902 N all ss13 154 AAC ATA ACA 2 AATAACAAT:GCTAACAAT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.66666666666673 1 34.083333333333336 0.0418713371647063 0.0299291581301553 1.39901486645956 0.0119421790345509 0.0232121905046633 0.0295019047189903 NA NA 0.0264488903380989 0.651615465740553 648 48 304 0.304 0.648 0.608 N all ss13 155 AAT ACA ATG 2 AACAATGCT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.50000000000007 1 33.916666666666664 0.0419689902360334 0.0300792190929219 1.39528190896117 0.0118897711431115 0.0248492970499697 0.030111853062776 NA NA 0.0272641916330082 0.662767977873265 645 55 300 0.3 0.645 0.6 N all ss13 156 GCT ATG CTG 2 AATGCTGCA:AATGCTGCC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.8333333333334 1 33.916666666666664 0.042364201600918 0.0300792190929219 1.40842092575757 0.0122849825079961 0.0250742932454838 0.0316395102325994 NA NA 0.0263803976117027 0.641440256784421 662 45 293 0.293 0.662 0.586 N all ss13 157 GCA CTG CAA 2 GCTGCAATC:GCTGCCACC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.16666666666673 1 33.916666666666664 0.0567646707244322 0.0300792190929219 1.8871723547434 0.0266854516315103 0.0282672285936459 0.0299591998741842 NA NA 0.030206767928394 0.377006014659964 790 11 199 0.199 0.79 0.398 N all ss13 158 ACC CAA CCG 2 GCAATCGTG:GCCACCGTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.75 0.666666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 73.3333333333334 1 33.75 0.0566306643811088 0.0302307926160697 1.87327752534698 0.0263998717650391 0.0266830760437344 0.0311873158199184 NA NA 0.0288263925971954 0.359759766847743 800 17 183 0.183 0.8 0.366 N all ss13 159 GTG CCG TGC 2 ACCGTGCTA:ATCGTGCTA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.41666666666673 1 34.416666666666664 0.0426150118597228 0.0296334842053817 1.43806956901759 0.0129815276543411 0.0237904990616279 0.0298728687363956 NA NA 0.0261740197875379 0.619915602473267 655 42 303 0.303 0.655 0.606 N all ss13 160 CTA TGC TAC 2 GTGCTACAA 2 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.25000000000007 1 34.583333333333336 0.0427161696956043 0.0294878275056261 1.44860348519925 0.0132283421899782 0.0248479477261032 0.0307547060577913 NA NA 0.0253120347078267 0.601245137567315 671 35 294 0.294 0.671 0.588 N all ss13 161 CAA TAC AAC 2 CTACAACTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.0833333333334 1 35.083333333333336 0.0428178090539073 0.0290593249318817 1.47346193190231 0.0137584841220256 0.0245679880770417 0.0288733787244848 NA NA 0.0253355990260186 0.587095728419287 682 48 270 0.27 0.682 0.54 N all ss13 162 CTT AAC TTC 2 CAACTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 1 35.416666666666664 0.042215127927666 0.0287805096612113 1.46679570391907 0.0134346182664547 0.0251060720752137 0.0301669816034774 NA NA 0.0254450972349957 0.597510057911658 673 49 278 0.278 0.673 0.556 N all ss13 163 CCT TTC CTC 2 CTTCCTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 73.0833333333334 1 35.416666666666664 0.042215127927666 0.0287805096612113 1.46679570391907 0.0134346182664547 0.0248806786811122 0.0298256289791338 NA NA 0.0248982667952253 0.589486394648038 681 53 266 0.266 0.681 0.532 N all ss13 164 CAA CTC AAG 2 CCTCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 72.75000000000006 2 36.083333333333336 0.0424141271286908 0.0575822255219405 0.73658367220506 -0.0151680983932496 0.0252359452155711 0.0405819785480338 NA NA 0.0391375599698528 0.698342702804548 344 11 645 0.645 0.344 0.688 N all ss13 165 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.41666666666671 3 36.083333333333336 0.0573756358851215 0.0881207952860292 0.651102111583165 -0.0307451594009078 0.0305532489245284 0.0527628328968888 NA NA 0.0440815777508731 0.485514648908324 235 10 755 0.755 0.235 0.47 N all ss13 166 ACA GAA CAA 2 GGAACAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.75000000000004 3 35.75 0.0571024790858329 0.088993157850987 0.641650217440841 -0.0318906787651541 0.0290857949697351 0.0536679101591795 NA NA 0.0436244855283646 0.464762633509794 213 5 782 0.782 0.213 0.426 N all ss13 167 ACA CAA CAT 2 ACAACATTG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 72.08333333333337 3 36.416666666666664 0.05765141989764 0.0872653886078579 0.66064473919559 -0.0296139687102178 0.029040951923275 0.0519435537263344 NA NA 0.0434161846287118 0.495178790921356 252 5 743 0.743 0.252 0.504 N all ss13 168 TTG CAT TGC 2 ACATTGCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 72.08333333333337 3 37.083333333333336 0.0727843418621031 0.0856035011092873 0.850249591651416 -0.0128191592471842 0.0328231555917619 0.0520770973401762 NA NA 0.0446953805693727 0.7742564839091 396 2 602 0.602 0.396 0.792 N all ss13 169 CCA TGC CAA 2 TTGCCAAAA 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 71.25000000000004 4 37.583333333333336 0.0736788296875599 0.114781984854672 0.64190238373074 -0.0411031551671125 0.0324831136091211 0.0605703029814245 NaN NaN 0.0552767092034076 0.457125135426103 242 1 757 0.757 0.242 0.484 N all ss13 170 AAA CAA AAG 2 CCAAAAGGC 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.75000000000004 4 38.083333333333336 0.0742261626042775 0.113155334268708 0.655966977464926 -0.0389291716644301 0.0328123133155642 0.0565067537383944 NA NA 0.0573027864309258 0.496910333267218 202 0 798 0.798 0.202 0.404 N all ss13 171 GGC AAG GCT 2 AAAGGCTTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.4166666666667 4 38.75000000000001 0.0757263107752118 0.11105698371059 0.681868967129085 -0.0353306729353785 0.033567522778316 0.058865083456232 NA NA 0.0542860386389976 0.515159913979076 250 0 750 0.75 0.25 0.5 N all ss13 172 TTC GCT TCT 2 GGCTTCTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.08333333333337 4 39.083333333333336 0.0761108787135566 0.110036776004805 0.691685829746892 -0.0339258972912486 0.0334622169577741 0.0600755365688265 NaN NaN 0.0542163583941724 0.531478798626795 240 1 759 0.759 0.24 0.48 N all ss13 173 TAC TCT ACG 2 TTCTACGCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.75000000000003 4 38.75000000000001 0.0764993759663411 0.11105698371059 0.688829944865918 -0.0345576077442492 0.033934093434836 0.0600836856203437 NA NA 0.0544697962524798 0.525796224826436 289 0 711 0.711 0.289 0.578 N all ss13 174 GCA ACG CAG 2 TACGCAGAA:TACGCAGAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.33333333333336 4 37.75000000000001 0.0758220876535266 0.114234586398441 0.663740203768633 -0.0384124987449142 0.0339887017827973 0.0620318464963458 NaN NaN 0.0541544717875255 0.478129943282008 244 1 755 0.755 0.244 0.488 N all ss13 175 GAA CAG AAG 2 GCAGAAGGG:GCAGAGGGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.83333333333336 4 36.75000000000001 0.0752510361297835 0.117599765999126 0.639891036265689 -0.0423487298693429 0.0339055438671808 0.0603194174895363 NA NA 0.0564769985638154 0.453350890363036 209 0 791 0.791 0.209 0.418 N all ss13 176 GGA AAG GAA 2 GAAGGGAGC:GAGGGAAGC 1:1 FALSE 1.58333333333333 1 0.416666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.00000000000003 4 36.66666666666667 0.0762076323080868 0.117889187641809 0.646434451135873 -0.0416815553337224 0.033688787388652 0.061188774497391 NA NA 0.0594922898728429 0.483539488459667 225 2 773 0.773 0.225 0.45 N all ss13 177 AGC GAA GCA 2 GGAAGCAGA:GGGAGCAGA 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.75000000000003 4 36.583333333333336 0.0753456127890199 0.11818004032857 0.637549391416182 -0.0428344275395505 0.0339262846488267 0.0627780323185294 NA NA 0.05692642431417 0.451779013805513 212 0 788 0.788 0.212 0.424 N all ss13 178 AGA GCA GAG 2 AGCAGAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.4166666666667 4 36.41666666666667 0.0757263107752118 0.118766081588831 0.637608901145505 -0.0430397708136191 0.032665020213803 0.0616516902846415 NaN NaN 0.060389284553831 0.476028057769519 239 1 760 0.76 0.239 0.478 N all ss13 179 GGC GAG GCG 2 AGAGGCGGC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.4166666666667 4 35.91666666666667 0.076891863117256 0.120559681536883 0.637790861231931 -0.0436678184196271 0.0348316341418313 0.0634600744041026 NaN NaN 0.0603982257576216 0.469680889229408 240 2 758 0.758 0.24 0.48 N all ss13 180 GGC GCG GCA 2 GGCGGCAGT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.4166666666667 4 35.583333333333336 0.076891863117256 0.12178588422283 0.631369256034368 -0.0448940211055743 0.0336089486221853 0.0650069721790733 NaN NaN 0.0603613239015214 0.457024862694961 232 1 767 0.767 0.232 0.464 N all ss13 181 AGT GCA GTC 2 GGCAGTCAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.08333333333336 4 35.583333333333336 0.0761108787135566 0.12178588422283 0.62495648982026 -0.0456750055092737 0.0332903533795837 0.0673767553978035 NA NA 0.05948736742637 0.4425999734698 207 0 793 0.793 0.207 0.414 N all ss13 182 CAA GTC AAG 2 AGTCAAGCC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.75000000000003 4 35.25000000000001 0.0764993759663411 0.12303734291849899 0.621757379928261 -0.0465379669521583 0.034969708654763 0.0656122421622911 NaN NaN 0.065210616319138 0.475439736823843 234 1 765 0.765 0.234 0.468 N all ss13 183 GCC AAG CCT 2 CAAGCCTCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 68.75000000000003 4 35.25000000000001 0.0764993759663411 0.12303734291849899 0.621757379928261 -0.0465379669521583 0.0341736708941959 0.0649777617917091 NaN NaN 0.0591045898805622 0.431057520487444 205 0 795 0.795 0.205 0.41 N all ss13 184 TCT CCT CTT 2 GCCTCTTCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 69.41666666666669 4 35.25000000000001 0.0757263107752118 0.12303734291849899 0.615474204651619 -0.0473110321432875 0.0348281045998196 0.0688045466464814 NaN NaN 0.0666506909008341 0.477806099467819 230 0 770 0.77 0.23 0.46 N all ss13 185 TCT CTT CTC 2 TCTTCTCGC:TCTTCTCGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 70.08333333333336 4 35.25000000000001 0.0749687265834466 0.12303734291849899 0.609316852958263 -0.0480686163350527 0.0339973582205222 0.0669767844987301 NaN NaN 0.0621301259170603 0.439122139666248 193 0 807 0.807 0.193 0.386 N all ss13 186 CGC CTC GCT 2 TCTCGCTCC:TCTCGTTCC 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.25000000000003 5 34.583333333333336 0.0893247686558476 0.160610991304224 0.55615601354861 -0.0712862226483762 0.03537389740918 0.079578837863048 NaN NaN 0.073315196233679 0.330888724423282 134 1 865 0.865 0.134 0.268 N all ss13 187 TCC GCT CCT 2 CGCTCCTCA:CGTTCCTCA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.50000000000003 5 34.333333333333336 0.088993157850987 0.161916285324778 0.549624503010805 -0.0729231274737913 0.035764037153609 0.0782167628298425 NaN NaN 0.0694847044379431 0.293955137855208 118 0 882 0.882 0.118 0.236 N all ss13 188 TCA CCT CAT 2 TCCTCATCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 71.50000000000003 5 34.333333333333336 0.088993157850987 0.161916285324778 0.549624503010805 -0.0729231274737913 0.0364689490632048 0.078268096172835 NaN NaN 0.0715103070942585 0.307843779253229 140 1 859 0.859 0.14 0.28 N all ss13 189 TCA CAT CAC 2 TCATCACGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.1666666666667 5 34.333333333333336 0.0881207952860292 0.161916285324778 0.544236764753298 -0.0737954900387491 0.0357047867683335 0.080240371624959 NA NA 0.0710095922622079 0.298696527545457 128 0 872 0.872 0.128 0.256 N all ss13 190 CGT CAC GTA 2 TCACGTAGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.1666666666667 5 34.333333333333336 0.0881207952860292 0.161916285324778 0.544236764753298 -0.0737954900387491 0.0362057385920674 0.0811393437451911 NaN NaN 0.0699151875063611 0.291196646560138 126 0 874 0.874 0.126 0.252 N all ss13 191 AGT GTA GTC 2 CGTAGTCGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 72.1666666666667 5 35.00000000000001 0.0881207952860292 0.158481820250405 0.556030938733516 -0.070361024964376 0.0352922798474773 0.0745103480861833 NaN NaN 0.0700584171175744 0.315224702711796 141 0 859 0.859 0.141 0.282 N all ss13 192 CGC GTC GCA 2 AGTCGCAAC:AGTCGCGGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 73.1666666666667 5 34.00000000000001 0.0868438898173541 0.163690174515013 0.530538195555463 -0.0768462846976593 0.0337877150921003 0.0799248942079097 NaN NaN 0.0737873145821835 0.297663692311604 122 0 878 0.878 0.122 0.244 N all ss13 193 AAC GCA ACA 2 CGCAACAGT:CGCGGTAAT 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 74.83333333333336 5 33.00000000000001 0.0847960953267638 0.169253998250676 0.500999067692187 -0.0844579029239125 0.0341150100924097 0.0801529331179504 NaN NaN 0.0760998413381212 0.267072198489129 106 0 894 0.894 0.106 0.212 N all ss13 194 AAT ACA ATT 2 AACAGTTCA:GGTAATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 76.1666666666667 4 32.00000000000001 0.0686978768215524 0.136741167595466 0.502393522225784 -0.0680432907739135 0.0297402787063966 0.0758782792870323 NaN NaN 0.070255964452516 0.33279195367086 132 2 866 0.866 0.132 0.264 N all ss13 195 TCA ATT CAA 2 AATTCAAGA:AGTTCAAGA 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.1666666666667 4 31.33333333333334 0.0544456664773409 0.139939466685309 0.389065842302918 -0.0854938002079682 0.0271004724667362 0.0796154737314077 NA NA 0.0713414593583073 0.230771175936142 69 2 929 0.929 0.069 0.138 N all ss13 196 AGA CAA GAA 2 TCAAGAAAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.6666666666667 4 31.500000000000004 0.0533558250189307 0.139125907283501 0.383507472193558 -0.08577008226457 0.0267222912205517 0.0740944874871495 NA NA 0.0716918847099223 0.23155186491244 73 1 926 0.926 0.073 0.146 N all ss13 197 AAT GAA ATT 2 AGAAATTCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.33333333333337 4 31.66666666666667 0.0535942229866087 0.138321779350139 0.387460479748048 -0.0847275563635308 0.0269209780857233 0.0756328726733631 NaN NaN 0.06559841951844 0.196492335700079 54 0 946 0.946 0.054 0.108 N all ss13 198 TCA ATT CAA 2 AATTCAACT 2 FALSE 0.333333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.00000000000004 4 32.333333333333336 0.0545695157118212 0.135196367873208 0.403631521839392 -0.0806268521613868 0.026359397109757 0.0721557465436955 NA NA 0.0657920210840981 0.220394156876942 57 1 942 0.942 0.057 0.114 N all ss13 199 ACT CAA CTC 2 TCAACTCCA:TCAACTCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.33333333333337 4 33 0.0543223783836108 0.132209431753494 0.410881263637042 -0.0778870533698831 0.0271477938198627 0.0702134764273272 NA NA 0.0680828295519811 0.252621831754529 86 3 911 0.911 0.086 0.172 N all ss13 200 CCA CTC CAG 2 ACTCCAGGC:ACTCCTGGC 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.83333333333337 4 34.16666666666667 0.054693929928504303 0.127288788480472 0.429683796832549 -0.0725948585519675 0.028494292773305 0.071091554734751 NA NA 0.0662376135736468 0.273089120442821 96 1 903 0.903 0.096 0.192 N all ss13 201 GGC CAG GCA 2 CCAGGCAGC:CCTGGCAGC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.16666666666671 4 33.5 0.0537142229868647 0.130054644852002 0.413012722828853 -0.0763404218651369 0.0265935435028281 0.0720928688229029 NA NA 0.0633564839111998 0.228228536361119 88 4 908 0.908 0.088 0.176 N all ss13 202 AGC GCA GCA 2 GGCAGCAGT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 77.16666666666671 4 33.5 0.0537142229868647 0.130054644852002 0.413012722828853 -0.0763404218651369 0.0270471053383121 0.0714239185391704 NaN NaN 0.0672276320721095 0.256144419942108 81 3 916 0.916 0.081 0.162 N all ss13 203 AGT GCA GTA 2 AGCAGTAGG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 76.1666666666667 4 33.83333333333333 0.0544456664773409 0.128656816904346 0.423185244181973 -0.0742111504270048 0.0273291987811719 0.0700821304994609 NA NA 0.06994207523484 0.288672951795543 93 3 904 0.904 0.093 0.186 N all ss13 204 AGG GTA GGG 2 AGTAGGGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.1666666666667 4 34.16666666666666 0.0551973146854054 0.127288788480472 0.433638463719635 -0.0720914737950665 0.0274745961106343 0.0689713756304233 NA NA 0.0652757163354306 0.269413199829901 100 2 898 0.898 0.1 0.2 N all ss13 205 GGA GGG GAA 2 AGGGGAAAT:AGGGGAACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 74.83333333333336 4 34.83333333333332 0.0554524994575896 0.124638389543236 0.444907060022253 -0.0691858900856468 0.0271251482160749 0.0681235411347423 NaN NaN 0.0632708269628033 0.274179594532192 102 2 896 0.896 0.102 0.204 N all ss13 206 AAT GAA ATT 2 GGAAATTCT:GGAACTTCT 1:1 FALSE 2 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 75.50000000000003 4 34.16666666666666 0.0549444688504894 0.127288788480472 0.431652068547409 -0.0723443196299826 0.0284400777060104 0.0695873780034387 NA NA 0.063590904496885 0.255265824323825 109 1 890 0.89 0.109 0.218 N all ss13 207 TCT ATT CTC 2 AATTCTCCT:ACTTCTCCT 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.50000000000003 4 34.83333333333332 0.0413898116754681 0.124638389543236 0.332079159776933 -0.0832485778677683 0.0234028766211962 0.0715934235977578 NA NA 0.0595064597194934 0.161817817273344 44 6 950 0.95 0.044 0.088 N all ss13 208 CCT CTC CTG 2 TCTCCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.75000000000003 4 35.249999999999986 0.0412475068105866 0.12303734291849899 0.335243803484192 -0.0817898361079128 0.0235597873981744 0.0689125348169349 NA NA 0.0604118301594061 0.175777477887873 38 9 953 0.953 0.038 0.076 N all ss13 209 GCT CTG CTA 2 CCTGCTAGA:CCTGCTCGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000003 4 34.41666666666666 0.0404138163712346 0.126281753068954 0.320028946297311 -0.0858679366977196 0.0228964592316267 0.0691924733065437 NA NA 0.05905661786691 0.14594811681263 32 3 965 0.965 0.032 0.064 N all ss13 210 AGA CTA GAA 2 GCTAGAATG:GCTCGAATG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.5 0.5 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333337 4 33.58333333333332 0.0399650588551816 0.129702340924675 0.308129048174941 -0.0897372820694929 0.0225115394023389 0.072321415429582 NA NA 0.063387930375333107 0.156868029989739 41 0 959 0.959 0.041 0.082 N all ss13 211 ATG GAA TGG 2 AGAATGGCT:CGAATGGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.75000000000004 4 33.91666666666666 0.0401433603117785 0.128312053707491 0.312857281540298 -0.0881686933957128 0.0235879971748656 0.0696436966329482 NA NA 0.0642450284351738 0.169944682426589 26 7 967 0.967 0.026 0.052 N all ss13 212 GCT TGG CTA 2 ATGGCTAGC:ATGGCTGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.75000000000004 4 34.58333333333332 0.040687942312311 0.125619222573624 0.323899013850879 -0.0849312802613135 0.0229870639414544 0.0755293369002632 NA NA 0.0592104439793334 0.151459017495967 34 5 961 0.961 0.034 0.068 N all ss13 213 AGC CTA GCA 2 GCTAGCGGA:GCTGGCAAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.25000000000004 4 34.749999999999986 0.0404138163712346 0.124963623649129 0.32340464521666 -0.084549807277893907 0.0227087032008529 0.0681473143952059 NA NA 0.0602692772369178 0.160656368797798 32 5 963 0.963 0.032 0.064 N all ss13 214 AAT GCA ATG 2 AGCGGAGGT:GGCAATGGC 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.58333333333339 3 34.08333333333332 0.0402331091273882 0.0936278982824407 0.429712829887731 -0.0533947891550525 0.0226571754224799 0.0621036012798462 NA NA 0.0478450938861305 0.264425137273919 66 16 918 0.918 0.066 0.132 N all ss13 215 GGC ATG GCG 2 AATGGCGGT:GGAGGTGGT 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.91666666666671 2 34.41666666666665 0.0268184996810859 0.0604861633757489 0.443382390026716 -0.0336676636946629 0.0190130672098465 0.0455445409664433 NA NA 0.0418208974795284 0.420794274230248 154 46 800 0.8 0.154 0.308 N all ss13 216 GGT GCG GTG 2 GGCGGTGAT:GGTGGTGAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 75.08333333333339 2 35.249999999999986 0.0271215992572094 0.0589984642956841 0.459700088485072 -0.0318768650384748 0.0187008467555686 0.0458808602816759 NA NA 0.0406606936113498 0.433056255128566 173 49 778 0.778 0.173 0.346 N all ss13 217 GAA GTG AAA 2 GGTGAAACT:GGTGATGCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 74.91666666666673 2 35.41666666666666 0.0271830432683088 0.0587096677913667 0.463007955774979 -0.0315266245230579 0.0197177928725943 0.0441173000484295 NA NA 0.0395983106775504 0.425938552082194 177 48 775 0.775 0.177 0.354 N all ss13 218 ACT AAA CTG 2 GAAACTGCC:GATGCTGCT 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 75.16666666666673 2 35.16666666666666 0.013423177093157 0.0591439311842398 0.226957809945747 -0.0457207540910828 0.0135253855414092 0.0444367977844514 NA NA 0.0385312448916591 0.235389748774624 0 129 871 0.871 0 0.001 N all ss13 219 GCC CTG CCC 2 ACTGCCCTC:GCTGCTCTT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.83333333333339 1 34.83333333333332 0.0406419966354019 0.0292720079293014 1.38842530835471 0.0113699887061005 0.030188071205132 0.0301767540885734 NA NA 0.0328332288369368 0.729120894807693 539 121 340 0.34 0.539 0.68 N all ss13 220 CTC CCC TCG 2 GCCCTCGCG:GCTCTTGCT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.50000000000006 1 34.16666666666666 0.0402781342288957 0.0298546878003148 1.34913935453953 0.010423446428581 0.0299781906219056 0.0321583780179972 NA NA 0.0330777083466092 0.752670567276496 547 132 321 0.321 0.547 0.642 N all ss13 221 GCG TCG CGC 2 CTCGCGCTA:CTTGCTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.3333333333334 1 33.999999999999986 0.0398323689854613 0.0300040009602743 1.32756858121021 0.00982836802518695 0.0306758720727849 0.0311754874318692 NA NA 0.0327733649546017 0.764261909328385 536 133 331 0.331 0.536 0.662 N all ss13 222 CTA CGC TAT 2 GCGCTATTG:GCTTTGCTG 1:1 TRUE 1.33333333333333 0.666666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.50000000000007 1 33.833333333333314 0.0397443976053827 0.0301548153585304 1.31801163869967 0.00958958224685223 0.0308163997993974 0.0325015097576094 NA NA 0.0338631784384796 0.777034164660277 525 156 319 0.319 0.525 0.638 N all ss13 223 CTG TAT TGC 2 CTATTGCTG:TTGCTGCTG 1:1 FALSE 1.58333333333333 0.666666666666667 0 0.75 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.16666666666674 1 34.16666666666665 0.039920730758297 0.0298546878003148 1.33716791899851 0.0100660429579822 0.0297377159921345 0.0294525518167999 NA NA 0.033568918116164 0.764282420068993 516 142 342 0.342 0.516 0.684 N all ss13 224 CTG TGC TGC 2 CTGCTGCTT:TTGCTGCTA 1:1 FALSE 1.5 1 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000009 1 34.66666666666665 0.0396131668795607 0.029415534864961 1.34667504981345 0.0101976320145997 0.0296313657912345 0.031014553272664 NA NA 0.0329105827937017 0.756668373383403 518 121 361 0.361 0.518 0.722 N all ss13 225 CTA TGC TAG 2 CTGCTAGAC:CTGCTTGAC 1:1 FALSE 1.16666666666667 1 0.583333333333333 0.25 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666674 1 34.999999999999986 0.0395261602343306 0.0291298749871979 1.35689426239219 0.0103962852471327 0.0300938115647433 0.030588827923569 NA NA 0.0327345642748686 0.750793295854679 543 134 323 0.323 0.543 0.646 N all ss13 226 GAC TAG ACA 2 CTAGACAGA:CTTGACAGA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.41666666666674 1 35.249999999999986 0.0392674190316604 0.0289192452027623 1.35783001099592 0.0103481738288981 0.0286907580788017 0.0323561353043529 NA NA 0.0319978470117831 0.746390670490351 539 121 340 0.34 0.539 0.68 N all ss13 227 AGA ACA GAT 2 GACAGATTG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666674 1 35.583333333333314 0.0397883346582442 0.0286430990492925 1.38910718388997 0.0111452356089517 0.0293265342191189 0.0299376801560993 NA NA 0.0312518811415545 0.72137175673248 532 127 341 0.341 0.532 0.682 N all ss13 228 TTG GAT TGA 2 AGATTGAAC 2 FALSE 0.666666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.41666666666674 1 35.583333333333314 0.0397883346582442 0.0286430990492925 1.38910718388997 0.0111452356089517 0.0300304753647595 0.0294336710402427 NA NA 0.031267575067667 0.721505782147048 528 140 332 0.332 0.528 0.664 N all ss13 229 AAC TGA ACC 2 TTGAACCAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.41666666666676 1 35.91666666666665 0.0392674190316604 0.0283721774047871 1.38401147262793 0.0108952416268733 0.0298047108888263 0.029686127258226 NA NA 0.0314380312387334 0.728920048144663 547 130 323 0.323 0.547 0.646 N all ss13 230 CAG ACC AGC 2 AACCAGCTT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.75000000000009 1 36.91666666666665 0.0396131668795607 0.0275893176123833 1.43581539188851 0.0120238492671774 0.0307170808061398 0.0284692809195499 NA NA 0.0306876442170986 0.695195634685114 537 139 324 0.324 0.537 0.648 N all ss13 231 CTT AGC TTG 2 CAGCTTGAG 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.08333333333341 1 36.91666666666665 0.0399650588551815 0.0275893176123833 1.44857003774691 0.0123757412427982 0.0291905438252455 0.0291371248861225 NA NA 0.0324745741918596 0.703136335699437 548 133 319 0.319 0.548 0.638 N all ss13 232 GAG TTG AGA 2 CTTGAGAGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.91666666666676 1 36.749999999999986 0.0395261602343306 0.0277167798918218 1.42607331690768 0.0118093803425087 0.0290028574963715 0.0313000050079123 NA NA 0.0305940072803005 0.699494404624614 564 139 297 0.297 0.564 0.594 N all ss13 233 AGC AGA GCA 2 GAGAGCAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.91666666666676 1 35.749999999999986 0.0390120440358434 0.0285069944752382 1.36850779094689 0.0105050495606052 0.0285249307185806 0.0299844318090488 NA NA 0.0313797481893725 0.737797360199001 512 135 353 0.353 0.512 0.706 N all ss13 234 AAA GCA AAA 2 AGCAAAATG:AGCAAAGTT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.2500000000001 1 35.749999999999986 0.0393532888030901 0.0285069944752382 1.38047835373432 0.0108462943278519 0.0294158727937938 0.030603470658389 NA NA 0.0318192127518001 0.73319957452152 551 131 318 0.318 0.551 0.636 N all ss13 235 ATG AAA TGT 2 AAAATGTCT:AAAGTTTCT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.5 0.333333333333333 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.2500000000001 1 35.749999999999986 0.0393532888030901 0.0285069944752382 1.38047835373432 0.0108462943278519 0.029679944551504 0.0290428699692067 NA NA 0.0311611223789991 0.727786590480906 552 117 331 0.331 0.552 0.662 N all ss13 236 TCT TGT CTG 2 ATGTCTGGT:GTTTCTGGT 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.58333333333343 0 35.91666666666665 0.0262321821040851 0 -Inf 0.0262321821040851 0.0260677060539011 0 NA NA 0.0279343423647591 0.347697025554993 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 237 GGT CTG GTA 2 TCTGGTAAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.66666666666676 0 35.499999999999986 0.0258646320533769 0 -Inf 0.0258646320533769 0.0262180805351458 0 NA NA 0.0262906950913928 0.325216735841788 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 238 AAA GTA AAG 2 GGTAAAGGC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.33333333333343 0 35.333333333333314 0.0256435235612095 0 -Inf 0.0256435235612095 0.0263383472604574 0 NA NA 0.0269543275364627 0.341416866734017 627 373 0 0 0.627 0.001 N all ss13 239 GGC AAG GCC 2 AAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000009 0 34.999999999999986 0.0257536031856686 0 -Inf 0.0257536031856686 0.0259752743632626 0 NA NA 0.0262449666863184 0.326455766977039 628 372 0 0 0.628 0.001 N all ss13 240 CAA GCC AAC 2 GGCCAACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 79.00000000000009 0 35.66666666666665 0.0257536031856686 0 -Inf 0.0257536031856686 0.0256995554760983 0 NA NA 0.0269225942846447 0.33877951365509 622 378 0 0 0.622 0.001 N all ss13 241 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.83333333333341 0 35.83333333333332 0.0258089981982962 0 -Inf 0.0258089981982962 0.0275407672349351 0 NA NA 0.0275514114794651 0.348883183284187 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 242 CAA AAC AAC 2 CAACAACAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 78.41666666666674 0 36.249999999999986 0.0392674190316604 0 -Inf 0.0392674190316604 0.0283694556591389 0 NA NA 0.0296887171527602 0.185955863105007 886 114 0 0 0.886 0.001 N all ss13 243 CAA AAC AAG 2 CAACAAGGC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.0833333333334 0 36.58333333333332 0.0405047802473168 0 -Inf 0.0405047802473168 0.0299523074251018 0 NA NA 0.0299433163151535 0.176146620552602 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 244 GGC AAG GCC 2 CAAGGCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666673 0 36.58333333333332 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0300246335824282 0 NA NA 0.0310953438283313 0.182665111916551 880 120 0 0 0.88 0.001 N all ss13 245 CAA GCC AAA 2 GGCCAAACT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 74.41666666666673 0 36.749999999999986 0.0414374651394939 0 -Inf 0.0414374651394939 0.0318048169462691 0 NA NA 0.0319529758338127 0.194690897791188 854 146 0 0 0.854 0.001 N all ss13 246 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTC 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.41666666666673 0 35.749999999999986 0.0408727688266097 0 -Inf 0.0408727688266097 0.0312442096540521 0 NA NA 0.0312173949079356 0.190434553732971 884 116 0 0 0.884 0.001 N all ss13 247 GTC CTG TCA 2 ACTGTCACT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.5833333333334 0 35.58333333333332 0.0407801460981609 0 -Inf 0.0407801460981609 0.0301971450049615 0 NA NA 0.0315977637045211 0.19684162260737 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 248 ACT TCA CTA 2 GTCACTAAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 75.91666666666673 0 35.249999999999986 0.0405961546323978 0 -Inf 0.0405961546323978 0.0312242850368739 0 NA NA 0.0307999600020438 0.187484005101285 860 140 0 0 0.86 0.001 N all ss13 249 AAG CTA AGA 2 ACTAAGAAA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.91666666666674 0 34.91666666666666 0.0400540111089282 0 -Inf 0.0400540111089282 0.0298287148165322 0 NA NA 0.0303579747322082 0.187038732065932 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 250 AAA AGA AAT 2 AAGAAATCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.0833333333334 0 34.08333333333332 0.0399650588551815 0 -Inf 0.0399650588551815 0.0295905819608786 0 NA NA 0.0305275686222516 0.190484738983805 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 251 TCT AAT CTG 2 AAATCTGCT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 76.5833333333334 0 34.58333333333332 0.0402331091273881 0 -Inf 0.0402331091273881 0.0315634311843402 0 NA NA 0.0309298514315502 0.193331810522845 894 106 0 0 0.894 0.001 N all ss13 252 GCT CTG CTG 2 TCTGCTGCT 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 77.5833333333334 0 34.24999999999999 0.0397005575048303 0 -Inf 0.0397005575048303 0.03027850424439 0 NA NA 0.0287618008362527 0.167487405911118 849 151 0 0 0.849 0.001 N all ss13 253 GCT CTG CTG 2 GCTGCTGAG 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.25000000000006 0 33.58333333333333 0.0388436318463036 0 -Inf 0.0388436318463036 0.0281496182815212 0 NA NA 0.0304789754464654 0.202507449796434 870 130 0 0 0.87 0.001 N all ss13 254 GAG CTG AGG 2 GCTGAGGCA:GCTGAGGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.5833333333334 0 33.25 0.0386766677741952 0 -Inf 0.0386766677741952 0.0284466484606573 0 NA NA 0.0298447456578002 0.19499998883675 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 255 GCA AGG CAT 2 GAGGCATCT:GAGGCTTCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.91666666666673 0 32.916666666666664 0.0385111332176099 0 -Inf 0.0385111332176099 0.0285140990111683 0 NA NA 0.0287417946012798 0.180277828349919 856 144 0 0 0.856 0.001 N all ss13 256 TCT CAT CTA 2 GCATCTAAA:GCTTCTAAG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.0833333333334 0 33.25 0.038428896281493 0 -Inf 0.038428896281493 0.0286545486466153 0 NA NA 0.0281295542455373 0.171895170013487 872 128 0 0 0.872 0.001 N all ss13 257 AAA CTA AAA 2 TCTAAAAAG:TCTAAGAAG 1:1 FALSE 1.41666666666667 0.333333333333333 1.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.75000000000007 0 32.583333333333336 0.0381034317265945 0 -Inf 0.0381034317265945 0.0285989295041211 0 NA NA 0.0282797043575308 0.177858747420436 887 113 0 0 0.887 0.001 N all ss13 258 AAG AAA AGC 2 AAAAAGCCT:AAGAAGCCT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.00000000000007 0 31.333333333333336 0.037507815430996 0 -Inf 0.037507815430996 0.0281237812194316 0 NA NA 0.0270799334879936 0.166028671050009 881 119 0 0 0.881 0.001 N all ss13 259 CCT AGC CTC 2 AAGCCTCGC:AAGCCTCGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.66666666666673 0 31.5 0.0376648177342698 0 -Inf 0.0376648177342698 0.0283614484794607 0 NA NA 0.0269299241852857 0.161925994410255 866 134 0 0 0.866 0.001 N all ss13 260 CGC CTC GCC 2 CCTCGCCAA:CCTCGGCAA 1:1 FALSE 1 1 0.833333333333333 0.166666666666667 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.66666666666673 0 31.5 0.0376648177342698 0 -Inf 0.0376648177342698 0.0278614637179614 0 NA NA 0.0292074188550025 0.197202297762196 885 115 0 0 0.885 0.001 N all ss13 261 CAA GCC AAA 2 CGCCAAAAA:CGGCAAAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.66666666666673 0 31.666666666666668 0.0376648177342698 0 -Inf 0.0376648177342698 0.0282090996680609 0 NA NA 0.0275424741184426 0.171463128705793 862 138 0 0 0.862 0.001 N all ss13 262 AAA AAA AAC 2 CAAAAACGT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.00000000000006 0 31.333333333333336 0.037507815430996 0 -Inf 0.037507815430996 0.0278757856887774 0 NA NA 0.0283007503799729 0.185061934626911 892 108 0 0 0.892 0.001 N all ss13 263 CGT AAC GTA 2 AAACGTACT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.83333333333339 0 31.833333333333336 0.038063135955626 0 -Inf 0.038063135955626 0.028052817741634 0 NA NA 0.029158843574966 0.191766231273202 855 145 0 0 0.855 0.001 N all ss13 264 ACT GTA CTG 2 CGTACTGCC 2 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 79.83333333333339 0 32.833333333333336 0.0385523838449736 0 -Inf 0.0385523838449736 0.0295514531853254 0 NA NA 0.0303901189383453 0.204589882463316 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 265 GCC CTG CCA 2 ACTGCCACA:ACTGCCACT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.50000000000004 0 32.16666666666667 0.0382248326940206 0 -Inf 0.0382248326940206 0.0278140478003236 0 NA NA 0.0287188647559185 0.183188739348348 868 132 0 0 0.868 0.001 N all ss13 266 ACA CCA CAA 2 GCCACAAAA:GCCACTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.50000000000004 0 31.833333333333336 0.0377438129156367 0 -Inf 0.0377438129156367 0.0280081115668848 0 NA NA 0.0277161569310177 0.173261576433334 882 118 0 0 0.882 0.001 N all ss13 267 AAA CAA AAC 2 ACAAAACAG:ACTAAAGCA 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.00000000000004 0 31.833333333333336 0.037507815430996 0 -Inf 0.037507815430996 0.0277932465776501 0 NA NA 0.0279864370371997 0.180175773168876 871 129 0 0 0.871 0.001 N all ss13 268 CAG AAC AGT 2 AAACAGTAC:AAAGCATAC 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.33333333333337 0 31.833333333333336 0.0378231402201689 0 -Inf 0.0378231402201689 0.0280897453612888 0 NA NA 0.0282444616531472 0.180526808110236 875 125 0 0 0.875 0.001 N all ss13 269 TAC AGT ACA 2 CAGTACAAC:GCATACAAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.83333333333337 0 32 0.0123206056064609 0 -Inf 0.0123206056064609 0.0118722014158438 0 NA NA 0.0123406109441654 0.318095660187683 602 398 0 0 0.602 0.001 N all ss13 270 AAC ACA ACG 2 TACAACGTC:TACAATGTA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 32.16666666666667 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0120011554954903 0 NA NA 0.0123233515210037 0.316423567616045 648 352 0 0 0.648 0.001 N all ss13 271 GTA ACG TAA 2 AACGTCACT:AATGTAACA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.33333333333336 0 31.833333333333336 0.0123969764634079 0 -Inf 0.0123969764634079 0.0121183129568113 0 NA NA 0.0127558527049445 0.33111733652309 662 338 0 0 0.662 0.001 N all ss13 272 ACA TAA CAC 2 GTAACACAA:GTCACTCAA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.00000000000003 0 32.666666666666664 0.0124484185567784 0 -Inf 0.0124484185567784 0.0125627233076653 0 NA NA 0.0124708697789284 0.318182528606422 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 273 CAA CAC AAG 2 ACACAAGCT:ACTCAAGCA 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.6666666666667 0 32 0.012345957790554 0 -Inf 0.012345957790554 0.0118520935760884 0 NA NA 0.0125902551180256 0.326791851598923 646 354 0 0 0.646 0.001 N all ss13 274 GCA AAG CAT 2 CAAGCATTT:CAAGCTTTC 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 32.5 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.012132730469647 0 NA NA 0.0123471011040664 0.316358487780337 596 404 0 0 0.596 0.001 N all ss13 275 TTC CAT TCG 2 GCATTTGGG:GCTTTCGGC 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.50000000000003 0 32.166666666666664 0.0122202296145754 0 -Inf 0.0122202296145754 0.0114724067260585 0 NA NA 0.0120250247499018 0.309518340866871 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 276 GGC TCG GCA 2 TTCGGCAGA:TTTGGGAGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.50000000000003 0 31.666666666666668 0.0122202296145754 0 -Inf 0.0122202296145754 0.0120563072273224 0 NA NA 0.0119626468101871 0.307002333675919 629 371 0 0 0.629 0.001 N all ss13 277 AGA GCA GAC 2 GGCAGACGT:GGGAGACGT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 32 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.012524199295769 0 NA NA 0.0122365120775449 0.315979532959155 620 380 0 0 0.62 0.001 N all ss13 278 CGT GAC GTG 2 AGACGTGGT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.833333333333332 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0127526089805046 0 NA NA 0.0122287543939507 0.315672630171234 639 361 0 0 0.639 0.001 N all ss13 279 GGT GTG GTC 2 CGTGGTCCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 32.5 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.0125402161709182 0 NA NA 0.0124294135320961 0.319573978224175 630 370 0 0 0.63 0.001 N all ss13 280 CCA GTC CAG 2 GGTCCAGAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.50000000000003 0 32.5 0.0123714145268331 0 -Inf 0.0123714145268331 0.01247890708124 0 NA NA 0.012577228315999 0.325294518852203 634 366 0 0 0.634 0.001 N all ss13 281 GAA CAG AAC 2 CCAGAACAA 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.1666666666667 0 31.833333333333332 0.0122702123289052 0 -Inf 0.0122702123289052 0.0124493395429258 0 NA NA 0.0120542918601873 0.308719620884828 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 282 CAA AAC AAA 2 GAACAAACC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.33333333333336 0 32 0.0122451699655716 0 -Inf 0.0122451699655716 0.0123503862176338 0 NA NA 0.0116376395318289 0.292706000192366 659 341 0 0 0.659 0.001 N all ss13 283 ACC AAA CCC 2 CAAACCCAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.66666666666669 0 32.666666666666664 0.0126585283405138 0 -Inf 0.0126585283405138 0.0123912384871733 0 NA NA 0.0126735581916525 0.317884764971283 631 369 0 0 0.631 0.001 N all ss13 284 CAA CCC AAG 2 ACCCAAGGA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 79.00000000000001 0 32.333333333333336 0.012766265677073 0 -Inf 0.012766265677073 0.0128731072314288 0 NA NA 0.0128334068951202 0.31984899311375 633 367 0 0 0.633 0.001 N all ss13 285 GGA AAG GAA 2 CAAGGAAAT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.33333333333336 0 32.333333333333336 0.0128758527167741 0 -Inf 0.0128758527167741 0.0129576313403092 0 NA NA 0.0129390380444298 0.319679513931082 635 365 0 0 0.635 0.001 N all ss13 286 AAT GAA ATT 2 GGAAATTTC:GGAAATTTT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.33333333333336 1 32.666666666666664 0.0259766224970672 0.0312545223004261 0.831131643842563 -0.00527789980335889 0.0192164390172108 0.0318978068799556 NA NA 0.0234658085887377 0.822042500235825 367 127 506 0.506 0.367 0.734 N all ss13 287 TTC ATT TCG 2 AATTTCGGG:AATTTTGGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.5 0.833333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.83333333333336 1 32.5 0.0261464386246643 0.0314182062818701 0.832206599895936 -0.00527176765720586 0.0179628071970396 0.0325061257954616 NA NA 0.0243584704943887 0.828656939025893 342 127 531 0.531 0.342 0.684 N all ss13 288 GGG TCG GGG 2 TTCGGGGAC:TTTGGGGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.50000000000001 1 32.333333333333336 0.0262608883838265 0.0315836140125951 0.831471926339843 -0.00532272562876861 0.0199068620536433 0.0316487615663476 NA NA 0.0234041257234745 0.820091875898981 337 134 529 0.529 0.337 0.674 N all ss13 289 GAC GGG ACC 2 GGGGACCAA:GGGGACCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.00000000000001 1 32.833333333333336 0.026434454296256 0.0310925352587596 0.850186518283637 -0.00465808096250356 0.0189382497932004 0.0334305446475028 NA NA 0.02325190565129 0.841221603347738 352 131 517 0.517 0.352 0.704 N all ss13 290 CAA ACC AAG 2 GACCAAGAC:GACCAGGAA 1:1 FALSE 1.5 0.333333333333333 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 77.25000000000001 1 32.583333333333336 0.0263473854682498 0.0313361505112163 0.840798408177776 -0.00498876504296641 0.019284624092119 0.032389454081333 NA NA 0.0253156157740381 0.843778427412075 364 134 502 0.502 0.364 0.728 N all ss13 291 GAA AAG AAC 2 CAAGACCTA:CAGGAACTA 1:1 FALSE 2.25 0.333333333333333 0.416666666666667 0 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 2 78.41666666666669 1 31.416666666666668 0.0259485340559256 0.0325254218363474 0.797792391025286 -0.00657688778042175 0.0192395306997487 0.0343764722218064 NA NA 0.025406527654404 0.795738583887421 358 130 512 0.512 0.358 0.716 N all ss13 292 CTA AAC TAA 2 GAACTAATC:GACCTAATC 1:1 FALSE 0.333333333333333 0 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 78.83333333333336 1 31 0.0127934871784325 0.032972342565837 0.388006619574792 -0.0201788553874046 0.0134170604525621 0.0328292370015624 NA NA 0.0199999842842287 0.313001701747281 0 369 631 0.631 0 0.001 N all ss13 293 ATC TAA TCA 2 CTAATCAGA 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.16666666666669 1 30.666666666666668 0.0124226442537559 0.0333388219281254 0.372617973140674 -0.0209161776743694 0.0119299084025144 0.033908228185853 NA NA 0.0224007769209476 0.350445483673938 0 380 620 0.62 0 0.001 N all ss13 294 AGA TCA GAC 2 ATCAGACAA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.5 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.83333333333336 1 31.666666666666668 0.0123206056064609 0.0322630388127681 0.381879886701344 -0.0199424332063072 0.0123552807998164 0.0345890447420876 NA NA 0.0224644731549707 0.374684891952366 0 370 630 0.63 0 0.001 N all ss13 295 CAA GAC AAG 2 AGACAAGGA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 82.50000000000001 1 31.5 0.0122202296145754 0.0324374878453625 0.376731689976494 -0.0202172582307871 0.0120885380777389 0.0327370880669352 NA NA 0.0216269702289792 0.349882645576426 0 352 648 0.648 0 0.001 N all ss13 296 GGA AAG GAA 2 CAAGGAACT 2 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 1 81.16666666666669 1 32.166666666666664 0.0124226442537559 0.0317507728699206 0.391254861878485 -0.0193281286161646 0.0126484252019645 0.0322916086047085 NA NA 0.0199877059612449 0.333543609691925 0 363 637 0.637 0 0.001 N all ss13 297 ACT GAA CTG 2 GGAACTGAT 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.16666666666669 1 31.833333333333336 0.0374298041973081 0.0320904564039067 1.1663842896529 0.00533934779340132 0.0279000323524008 0.0349358925282179 NA NA 0.0322910824867854 0.868668084318031 467 149 384 0.384 0.467 0.768 N all ss13 298 GAT CTG ATT 2 ACTGATTAC 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.33333333333336 1 31.666666666666668 0.0373521168628637 0.0322630388127681 1.15773709598866 0.00508907805009558 0.0288285582871597 0.0328281086520157 NA NA 0.0318292532591673 0.872970231969563 503 121 376 0.376 0.503 0.752 N all ss13 299 TAC ATT ACA 2 GATTACAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.33333333333336 1 31.666666666666668 0.0373521168628637 0.0322630388127681 1.15773709598866 0.00508907805009558 0.0274647129530886 0.0337670125016439 NA NA 0.0316923436867239 0.872426159115096 507 139 354 0.354 0.507 0.708 N all ss13 300 AAA ACA AAC 2 TACAAACAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.33333333333336 1 31.333333333333332 0.0368926831430788 0.0326138339548042 1.13119736839907 0.00427884918827467 0.0279044021260665 0.0341861482629887 NA NA 0.0317519743526622 0.892802799922104 498 143 359 0.359 0.498 0.718 N all ss13 301 CAT AAC ATT 2 AAACATTGG 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.58333333333336 2 31.083333333333332 0.0494514815652544 0.0672719567702241 0.735098010217872 -0.0178204752049697 0.0311351897339434 0.0480252209582959 NA NA 0.0406185393634246 0.660858909623561 304 52 644 0.644 0.304 0.608 N all ss13 302 TGG ATT GGC 2 CATTGGCCG 2 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.58333333333336 2 31.416666666666668 0.0500707265730996 0.0665255778124882 0.752653764454795 -0.0164548512393886 0.0306226836939634 0.0488431238185041 NA NA 0.0400356020083103 0.681068527072717 354 47 599 0.599 0.354 0.708 N all ss13 303 CCG GGC CGC 2 TGGCCGCAA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.58333333333336 2 31.75 0.0507056829412418 0.0657955896932053 0.770654738070964 -0.0150899067519635 0.0308369077154141 0.0480310593028042 NA NA 0.0408285306977291 0.711686358821345 327 55 618 0.618 0.327 0.654 N all ss13 304 CAA CGC AAA 2 CCGCAAATT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.25000000000001 2 30.75 0.050280603697972 0.0680352852661241 0.739037155518587 -0.0177546815681521 0.030787100923444 0.0493607648458312 NA NA 0.0434655473647158 0.682923425510381 305 36 659 0.659 0.305 0.61 N all ss13 305 ATT AAA TTG 2 CAAATTGCA 2 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.08333333333336 2 29.75 0.0510292410063947 0.0704329495874262 0.724508079035561 -0.0194037085810315 0.0307012324953718 0.0522093284370567 NA NA 0.0430990307954624 0.652557455148763 333 40 627 0.627 0.333 0.666 N all ss13 306 GCA TTG CAC 2 ATTGCACAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.91666666666669 2 29.083333333333332 0.0511380136321413 0.0721276112438599 0.70899358442977 -0.0209895976117187 0.0310675855201836 0.0524105960996643 NA NA 0.0451524718175993 0.642031406741115 299 31 670 0.67 0.299 0.598 N all ss13 307 CAA CAC AAT 2 GCACAATTT 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.16666666666669 2 29.5 0.0509750280987295 0.0710590256920247 0.717361765128321 -0.0200839975932952 0.0324851941888661 0.0538153212634334 NA NA 0.0423558363993127 0.635376485184445 303 55 642 0.642 0.303 0.606 N all ss13 308 TTT AAT TTG 2 CAATTTGCC:CAATTTGCT 1:1 FALSE 1.83333333333333 0.5 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.83333333333336 2 29.833333333333332 0.0511925740908369 0.0702267037754945 0.728961653312005 -0.0190341296846576 0.0316223705885489 0.0531719621158995 NA NA 0.0419831422041477 0.650278347889225 286 54 660 0.66 0.286 0.572 N all ss13 309 GCC TTG CCC 2 TTTGCCCCC:TTTGCTCCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.33333333333336 2 30.333333333333336 0.0515223984646761 0.0690141740401891 0.746548070468438 -0.017491775575513 0.0342906679214894 0.0507802690298084 NA NA 0.0421968802827195 0.678487687808085 324 49 627 0.627 0.324 0.648 N all ss13 310 CCA CCC CAA 2 GCCCCCAGC:GCTCCAAGT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.00000000000001 2 30.333333333333336 0.0510835693943593 0.0690141740401891 0.740189535045536 -0.0179306046458298 0.0318256437098011 0.0534790147634074 NA NA 0.0424271339461888 0.67257168427859 325 48 627 0.627 0.325 0.65 N all ss13 311 AGC CAA GCG 2 CCAAGTGCC:CCCAGCGCT 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.00000000000001 2 30.333333333333336 0.0510835693943593 0.0690141740401891 0.740189535045536 -0.0179306046458298 0.0321204823376701 0.0513468133445057 NA NA 0.041780129896193 0.667802538827048 323 48 629 0.629 0.323 0.646 N all ss13 312 GCC GCG CCT 2 AGCGCTTCA:AGTGCCTCT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.66666666666669 2 30.000000000000004 0.0513020451633004 0.069817817299509 0.734798754066194 -0.0185157721362086 0.0303249227509269 0.05257361193452 NA NA 0.0426077075919939 0.663878993730059 299 47 654 0.654 0.299 0.598 N all ss13 313 TCA CCT CAG 2 GCCTCTGCA:GCTTCAGCG 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.33333333333336 2 30.000000000000004 0.0508669472540708 0.069817817299509 0.728566850433872 -0.0189508700454382 0.0298749220761528 0.0526768200366642 NA NA 0.0450483542346668 0.673989928425083 308 39 653 0.653 0.308 0.616 N all ss13 314 GCA CAG CAT 2 TCAGCGTTC:TCTGCATTC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.33333333333336 2 29.000000000000007 0.0502279695796377 0.0723451996406717 0.694281995614262 -0.022117230061034 0.0298529775739139 0.0544205863070477 NA NA 0.0454780013151044 0.626734557774976 300 53 647 0.647 0.3 0.6 N all ss13 315 TTC CAT TCT 2 GCATTCTTT:GCGTTCTTC 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.33333333333336 2 28.66666666666667 0.0496048518784087 0.073228852172937 0.677394912066382 -0.0236240002945282 0.0289528744422906 0.0545840448765379 NA NA 0.045372293747477 0.60259655197706 290 51 659 0.659 0.29 0.58 N all ss13 316 TTC TCT TCG 2 TTCTTCGGA:TTCTTTGGA 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.33333333333336 2 29.000000000000004 0.0502279695796377 0.0723451996406717 0.694281995614262 -0.022117230061034 0.0310151414253896 0.0557870931050865 NA NA 0.044117424141717 0.616141418270551 274 43 683 0.683 0.274 0.548 N all ss13 317 GGA TCG GAA 2 TTCGGAATG:TTTGGAATG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.6666666666667 2 28.166666666666668 0.0500185308740041 0.0745955951479785 0.67052928225561 -0.0245770642739744 0.0300938706418589 0.0533437818445425 NA NA 0.0440091795444397 0.576534998162211 254 43 703 0.703 0.254 0.508 N all ss13 318 ATG GAA TGT 2 GGAATGTCA:GGAATGTCG 1:1 FALSE 2.66666666666667 0 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.08333333333336 2 27.75 0.0497591768358708 0.0757741689236761 0.656677302340208 -0.0260149920878053 0.0313124767209572 0.0596971053247326 NA NA 0.0468286313008108 0.578528070450555 249 45 706 0.706 0.249 0.498 N all ss13 319 TCA TGT CAC 2 ATGTCACGC:ATGTCGCGC 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.58333333333336 2 27.916666666666668 0.0500707265730996 0.075298294736773 0.664964947056721 -0.0252275681636733 0.0316742865560532 0.0577035277896052 NA NA 0.046102062961436 0.584233598232495 242 40 718 0.718 0.242 0.484 N all ss13 320 CGC CAC GCA 2 TCACGCATT:TCGCGCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.4166666666667 2 28.083333333333336 0.0501754455827152 0.0748283653087125 0.670540447806269 -0.0246529197259974 0.0306146850614483 0.0582120884701156 NA NA 0.0462168886130816 0.593744268520396 268 42 690 0.69 0.268 0.536 N all ss13 321 ATT GCA TTG 2 CGCATTGGC 2 FALSE 1.16666666666667 0.5 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000003 2 28.416666666666668 0.0499664439235005 0.0739059002893285 0.676081932942982 -0.023939456365828 0.0316672887538776 0.057589261805212 NA NA 0.0475972273162003 0.614993061303575 299 39 662 0.662 0.299 0.598 N all ss13 322 GGC TTG GCA 2 ATTGGCATG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.4166666666667 2 27.91666666666667 0.0495536228075988 0.075298294736773 0.658097543653914 -0.0257446719291742 0.0309402605121201 0.0578913342100896 NA NA 0.0475743903225839 0.588407230884328 268 41 691 0.691 0.268 0.536 N all ss13 323 ATG GCA TGG 2 GGCATGGAA 2 FALSE 2 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.08333333333336 2 27.91666666666667 0.0491475696448996 0.075298294736773 0.65270494925163 -0.0261507250918733 0.0300359968569192 0.0566492498818975 NA NA 0.0459438279566999 0.569227831641023 234 54 712 0.712 0.234 0.468 N all ss13 324 GAA TGG AAG 2 ATGGAAGTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.75000000000003 2 27.91666666666667 0.0493497606808473 0.075298294736773 0.655390149981002 -0.0259485340559256 0.0299196380114545 0.0566294490589149 NA NA 0.0457088304492692 0.570244173991017 244 53 703 0.703 0.244 0.488 N all ss13 325 GTC AAG TCA 2 GAAGTCACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.75000000000003 2 28.91666666666667 0.0499664439235005 0.0725641058409195 0.688583471737951 -0.022597661917419 0.0300389025354247 0.0540923595895565 NA NA 0.0458338861668089 0.621988599437219 263 38 699 0.699 0.263 0.526 N all ss13 326 ACA TCA CAC 2 GTCACACCT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000003 2 29.33333333333334 0.0498108321742552 0.0714826348532436 0.696824232577865 -0.0216718026789884 0.0307956103672085 0.0543117512478315 NA NA 0.0421625623509025 0.607247917562836 273 39 688 0.688 0.273 0.546 N all ss13 327 CCT CAC CTT 2 ACACCTTCG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.75000000000003 2 29.250000000000004 0.0493497606808473 0.071696340510766 0.688316311952309 -0.0223465798299186 0.0310137726466543 0.0565015534341663 NA NA 0.0448824425257838 0.61856062554883 282 42 676 0.676 0.282 0.564 N all ss13 328 TCG CTT CGG 2 CCTTCGGGA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.41666666666669 3 29.58333333333334 0.0495536228075988 0.108952531416164 0.454818462347788 -0.0593989086085652 0.0301140489686716 0.066197457015448 NA NA 0.0605891770000766 0.326910865610528 123 20 857 0.857 0.123 0.246 N all ss13 329 GGA CGG GAA 2 TCGGGAACA:TCGGGAACG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.08333333333336 3 29.58333333333334 0.0491475696448996 0.108952531416164 0.451091580948878 -0.0598049617712643 0.030435124679728 0.0691248579129426 NA NA 0.0612405118225385 0.328787616017669 119 15 866 0.866 0.119 0.238 N all ss13 330 ACA GAA CAT 2 GGAACATGG:GGAACGTGG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.75000000000003 3 28.58333333333334 0.0481609758712978 0.11306631811959 0.425953340236639 -0.0649053422482923 0.0301800340909255 0.0698986631086247 NA NA 0.0637968019393365 0.308974541921063 115 15 870 0.87 0.115 0.23 N all ss13 331 TGG CAT GGC 2 ACATGGCTG:ACGTGGTTG 1:1 FALSE 2.33333333333333 0 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.75000000000003 4 28.58333333333334 0.0481609758712978 0.154888999008431 0.310938647545113 -0.106728023137133 0.0286893122916127 0.0912943743035107 NA NA 0.0857270505479313 0.213140989795228 43 7 950 0.95 0.043 0.086 N all ss13 332 CTG GGC TGA 2 TGGCTGACT:TGGTTGACC 1:1 FALSE 0 0 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.08333333333336 4 28.91666666666667 0.0485508200337835 0.152908411727716 0.317515691159214 -0.104357591693933 0.0286823101351643 0.084023042822662 NA NA 0.081431352940344 0.200003819637837 59 4 937 0.937 0.059 0.118 N all ss13 333 ACC TGA CCT 2 CTGACTTAT:TTGACCTAC 1:1 FALSE 1 1 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 86.75000000000003 4 28.58333333333334 0.0599719947335073 0.154888999008431 0.387193377950896 -0.0949170042749234 0.0335503430019192 0.0904005628417142 NA NA 0.0799655420513443 0.235237950402497 97 0 903 0.903 0.097 0.194 N all ss13 334 TAC CCT ACA 2 ACCTACACA:ACTTATCAT 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.4166666666667 4 29.250000000000004 0.0594959973791482 0.150978005779684 0.394070626856526 -0.0914820084005354 0.0306417662907271 0.0822800225080563 NA NA 0.0837807601851416 0.274867632535876 108 2 890 0.89 0.108 0.216 N all ss13 335 ACA ACA ATG 2 TACACAGGT:TATCATGGA 1:1 TRUE 1.5 0.666666666666667 0.833333333333333 0 1 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 5 87.6666666666667 4 29.000000000000004 0.0593194416279121 0.152421181209951 0.389181091217257 -0.0931017395820392 0.032839058446209 0.0891918102426351 NA NA 0.0810277554922997 0.250551662602984 99 1 900 0.9 0.099 0.198 N all ss13 336 GGA ATG GAG 2 ACAGGTGCC:CATGGAGCC 1:1 FALSE 1.83333333333333 1 0.166666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.33333333333337 3 29.66666666666667 0.0472597258715505 0.108623210908842 0.435079440905236 -0.0613634850372915 0.0292556383703214 0.0704968748444905 NA NA 0.0736777017913349 0.404921591030253 178 6 816 0.816 0.178 0.356 N all ss13 337 GCC GAG CCA 2 GGAGCCATT:GGTGCCATC 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 87.16666666666671 3 30.000000000000004 0.0473530022028017 0.107325632730505 0.441208693562565 -0.0599726305277032 0.029633220385693 0.0670058148396259 NA NA 0.0706713527866417 0.396096656435547 186 4 810 0.81 0.186 0.372 N all ss13 338 ATC CCA TCA 2 GCCATCAAA:GCCATTAAA 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 88.25000000000006 3 29.58333333333334 0.0467532063321102 0.108952531416164 0.429115374598575 -0.0621993250840537 0.0277920051001625 0.0676121261288005 NA NA 0.0693406806550775 0.36971326447213 155 2 843 0.843 0.155 0.31 N all ss13 339 AAA TCA AAT 2 ATCAAATTG:ATTAAATTG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.08333333333339 3 29.416666666666668 0.0463020678989018 0.109617210244414 0.422397794978197 -0.063315142345512 0.0283917719827452 0.0663258929905211 NA NA 0.0715226001007096 0.376023615409334 161 9 830 0.83 0.161 0.322 N all ss13 340 TTG AAT TGG 2 AAATTGGAT 2 FALSE 2.66666666666667 0 0 0.333333333333333 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.33333333333339 3 29.166666666666668 0.046168419749575 0.110629602831442 0.417324283627034 -0.0644611830818673 0.0304034485640006 0.0725148371194382 NA NA 0.0693100803582894 0.352350105921909 150 12 838 0.838 0.15 0.3 N all ss13 341 GAT TGG ATG 2 TTGGATGAC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 89.33333333333339 3 29.166666666666668 0.046168419749575 0.110629602831442 0.417324283627034 -0.0644611830818673 0.0279753478758309 0.0701782015504441 NA NA 0.0732082585833254 0.378578805402297 141 9 850 0.85 0.141 0.282 N all ss13 342 GAC ATG ACA 2 GATGACAAA 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 88.83333333333339 3 29.333333333333336 0.070779399921271 0.109952605643907 0.643726444741999 -0.0391732057226356 0.038315747492758 0.0701406059621982 NaN NaN 0.0735993129480346 0.594553126187027 293 6 701 0.701 0.293 0.586 N all ss13 343 AAA ACA AAG 2 GACAAAGAT 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.16666666666671 3 30.333333333333336 0.0721999950227112 0.106058740537371 0.680754784159166 -0.0338587455146602 0.0375473749903487 0.0682095854957874 NA NA 0.0723159606812958 0.639637491205435 302 4 694 0.694 0.302 0.604 N all ss13 344 GAT AAG ATC 2 AAAGATCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.50000000000006 3 30.333333333333336 0.0736788296875599 0.106058740537371 0.694698327683781 -0.0323799108498115 0.0404105685864453 0.0670792973319108 NA NA 0.0735255923825872 0.659654910405322 324 1 675 0.675 0.324 0.648 N all ss13 345 CCA ATC CAA 2 GATCCAAAT:GATCCACAA 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.16666666666671 3 30 0.0749062787858663 0.107325632730505 0.69793465810685 -0.0324193539446386 0.0376585523176632 0.0673356011929491 NaN NaN 0.0725913290220594 0.655163235015167 327 2 671 0.671 0.327 0.654 N all ss13 346 AAT CAA AAT 2 CCAAATTTC:CCACAATTC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 83.83333333333339 3 30.333333333333336 0.0752195633615915 0.106058740537371 0.709225500703421 -0.0308391771757799 0.0416549558245865 0.0684524566595281 NaN NaN 0.0747422623210729 0.679894605671003 325 0 675 0.675 0.325 0.65 N all ss13 347 TTC AAT TCA 2 AATTTCAAA:CAATTCAAA 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 83.00000000000006 3 30.5 0.0498108321742552 0.105436462965892 0.472425105822913 -0.0556256307916368 0.0303349446078293 0.068260375231099693 NA NA 0.0673638008128783 0.408946156165531 193 2 805 0.805 0.193 0.386 N all ss13 348 AAA TCA AAG 2 TTCAAAGAC:TTCAAAGAT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 82.83333333333339 3 30.666666666666668 0.0499144653819543 0.104821456781369 0.476185572254193 -0.0549069913994147 0.0308480065857992 0.066739015351288 NA NA 0.0686921693951429 0.424105167045719 202 7 791 0.791 0.202 0.404 N all ss13 349 GAC AAG ACA 2 AAAGACAAC:AAAGATCAA 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 81.83333333333339 3 30.999999999999996 0.0505454383004815 0.103612753860613 0.487830275879732 -0.0530673155601314 0.0301777999835038 0.0650700551418912 NA NA 0.0699760789454749 0.448233304765989 192 6 802 0.802 0.192 0.384 N all ss13 350 AAC ACA AAG 2 GACAACGTC:GATCAAGTC 1:1 TRUE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 80.33333333333339 3 31.833333333333336 0.0515223984646761 0.100709711722406 0.511593148103644 -0.0491873132577299 0.0323642103150114 0.0616657161065404 NA NA 0.0630197267017042 0.43509273828892 214 2 784 0.784 0.214 0.428 N all ss13 351 GTC AAG TCA 2 AACGTCATA:CAAGTCATT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 80.41666666666671 2 31.75 0.0382654718118908 0.0657955896932053 0.581581105820569 -0.0275301178813146 0.0294748904691823 0.0507006056989039 NA NA 0.0575178933846606 0.63219780761197 313 15 672 0.672 0.313 0.626 N all ss13 352 ATA TCA TAC 2 GTCATACTG:GTCATTTTG 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.666666666666667 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 81.25000000000006 3 31.75 0.037862929073994 0.100992663859693 0.374907717322876 -0.0631297347856989 0.0286051023539725 0.0686711836962191 NA NA 0.0741640852163151 0.394648786142713 169 4 827 0.827 0.169 0.338 N all ss13 353 CTG TAC TGC 2 ATACTGCTG:ATTTTGCTG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 82.5833333333334 3 30.75 0.0372361887723979 0.104516640682884 0.356270432431684 -0.0672804519104857 0.0271963975672212 0.0677073511108266 NA NA 0.0730602293155252 0.357107736132415 145 5 850 0.85 0.145 0.29 N all ss13 354 CTG TGC TGA 2 CTGCTGAAC:TTGCTGAAT 1:1 FALSE 0.5 0 0 0.5 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 83.5833333333334 3 30.75 0.036779585610904 0.104516640682884 0.351901719865813 -0.0677370550719796 0.0271860148196622 0.0664576150619585 NA NA 0.0752549530815318 0.368066528322391 164 5 831 0.831 0.164 0.328 N all ss13 355 AAC TGA ACA 2 CTGAACAAG:CTGAATAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 85.0833333333334 3 31.416666666666668 0.0361153019839953 0.102140577511979 0.35358427437675 -0.0660252755279838 0.0270204707730839 0.0627401061869697 NA NA 0.0725439246164216 0.362747606213151 152 4 844 0.844 0.152 0.304 N all ss13 356 AAG ACA AGC 2 AACAAGCAC:AATAAGCAT 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 3 84.41666666666673 3 32.41666666666667 0.0364075521822731 0.0987726497511971 0.368599529059732 -0.062365097568924 0.0285797075356873 0.0600721687518948 NA NA 0.0692309322091244 0.367680274153134 169 6 825 0.825 0.169 0.338 N all ss13 357 CAC AGC ACA 2 AAGCACATT:AAGCATATT 1:1 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.16666666666673 3 32.41666666666667 0.0490972805875701 0.0987726497511971 0.497073640438355 -0.049675369163627 0.0301597111178635 0.0608055021066049 NaN NaN 0.0728526617832715 0.49532701865504303 215 2 783 0.783 0.215 0.43 N all ss13 358 ATT ACA TTG 2 CACATTGAC:CATATTGAC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.5 1.16666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 84.50000000000007 3 32.083333333333336 0.0488971496674064 0.0998703029515669 0.489606501855907 -0.0509731532841605 0.0307927663573879 0.0672627561743679 NA NA 0.0749023075626257 0.49616989694543 255 2 743 0.743 0.255 0.51 N all ss13 359 GAC TTG ACG 2 ATTGACGCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.16666666666674 4 31.083333333333332 0.0485017445945919 0.141177857059553 0.343550650256241 -0.0926761124649607 0.0315435107774605 0.0792921582019359 NaN NaN 0.0918836547532185 0.313154715643445 105 1 894 0.894 0.105 0.21 N all ss13 360 GCA ACG CAT 2 GACGCATAC 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 4 85.50000000000009 4 30.75 0.0483064312987563 0.142863650574837 0.338129615926703 -0.0945572192760804 0.0306325328111752 0.0824812641941114 NA NA 0.0948431684202382 0.318771775498811 115 0 885 0.885 0.115 0.23 N all ss13 361 TAC CAT ACA 2 GCATACAAA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 87.00000000000009 4 29.916666666666668 0.0723451996406716 0.147260274111344 0.491274378492403 -0.0749150744706727 0.038492374339756 0.0858851499207355 NaN NaN 0.0935023476919835 0.423009720985198 181 0 819 0.819 0.181 0.362 N all ss13 362 AAA ACA AAA 2 TACAAAACA 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 86.83333333333341 4 30.083333333333332 0.0724909899460754 0.146359364647636 0.495294511018132 -0.0738683747015606 0.0372196566827541 0.0843987146307084 NA NA 0.0950530572924968 0.437083365099666 196 0 804 0.804 0.196 0.392 N all ss13 363 ACA AAA CAT 2 AAAACATTC 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 85.16666666666674 4 30.083333333333332 0.0739819020881027 0.146359364647636 0.505481164571984 -0.0723774625595333 0.0389854849677566 0.088444471574683 NaN NaN 0.101734016472368 0.476812752534286 217 0 783 0.783 0.217 0.434 N all ss13 364 TTC CAT TCC 2 ACATTCCCA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 84.3333333333334 4 30.583333333333332 0.0747506138799603 0.143721781908901 0.520106367226518 -0.0689711680289405 0.0402835467545842 0.0856270252247751 NaN NaN 0.0941198435453707 0.463679470667664 208 0 792 0.792 0.208 0.416 N all ss13 365 CCA TCC CAC 2 TTCCCACCA 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 82.00000000000007 4 30.25 0.0769906155450624 0.145469445655623 0.529256265451963 -0.0684788301105608 0.0405346790683417 0.0834562073250779 NaN NaN 0.0997789250721976 0.492520449508825 214 0 786 0.786 0.214 0.428 N all ss13 366 CCA CAC CAA 2 CCACCAACA 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 6 81.00000000000007 4 29.25 0.0779922851430356 0.150978005779684 0.516580443225928 -0.0729857206366479 0.0415729989671531 0.089697205020497 NaN NaN 0.101475799098848 0.471991437228021 217 0 783 0.783 0.217 0.434 N all ss13 367 ACA CAA CAG 2 CCAACAGAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 80.50000000000007 5 30.08333333333334 0.092424480317961 0.187892466749351 0.491900936301269 -0.0954679864313903 0.0440002895153392 0.0952892334986159 NaN NaN 0.103168888482429 0.35478057443323 164 0 836 0.836 0.164 0.328 N all ss13 368 GAG CAG AGC 2 ACAGAGCCT 2 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.50000000000007 5 31.083333333333336 0.0936627429044698 0.181054357970061 0.517318356512345 -0.0873916150655913 0.0446120174421091 0.0913104433776536 NaN NaN 0.10541116307792 0.40707348295369 196 0 804 0.804 0.196 0.392 N all ss13 369 CCT AGC CTA 2 GAGCCTAAA 2 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 79.00000000000007 5 31.583333333333336 0.09429441687774 0.177819473768805 0.530281722688813 -0.0835250568910649 0.0440856689810898 0.0910038017306827 NaN NaN 0.0984861265084929 0.396388088600206 167 0 833 0.833 0.167 0.334 N all ss13 370 AAA CTA AAA 2 CCTAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.83333333333341 5 31.75 0.0958020323794969 0.176766832783369 0.541968370824996 -0.080964800403872 0.0449050144520629 0.0964662522209579 NaN NaN 0.106271385988457 0.446138610122536 195 0 805 0.805 0.195 0.39 N all ss13 371 AAG AAA AGG 2 AAAAAGGAC 2 FALSE 1.83333333333333 0.333333333333333 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.83333333333341 5 31.083333333333332 0.0958020323794969 0.181054357970061 0.529134086876487 -0.0852523255905641 0.0471339996424242 0.0981701883607628 NaN NaN 0.106657159326338 0.424109640618691 181 0 819 0.819 0.181 0.362 N all ss13 372 GAC AGG ACA 2 AAGGACAAA 2 FALSE 2.33333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 77.33333333333341 5 31.583333333333332 0.0964630333665701 0.177819473768805 0.54247733008134 -0.0813564404022348 0.0451688356391511 0.0920150384762202 NaN NaN 0.105316102917514 0.439819747254604 175 0 825 0.825 0.175 0.35 N all ss13 373 AAA ACA AAA 2 GACAAAAAG 2 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS 1000 7 76.66666666666674 5 31.583333333333332 0.0973587086414928 0.177819473768805 0.54751432212692 -0.0804607651273121 0.046257550911142 0.0954346751404812 NaN NaN 0.108331900563289 0.457648446326847 208 0 792 0.792 0.208 0.416 N all ss13 374 AAG AAA AGA 2 AAAAAGAAA:AAAAAGAAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 375 AAA AGA AAA 2 AAGAAAAAG:AAGAAGAAG 1:1 FALSE 1.91666666666667 0.333333333333333 0.75 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 376 AAG AAA AGA 2 AAAAAGACT:AAGAAGGCT 1:1 FALSE 1.75 0.333333333333333 0.916666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 377 ACT AGA CTG 2 AAGACTGAT:AAGGCTGAT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 378 GAT CTG ATG 2 ACTGATGAA:GCTGATGAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 379 GAA ATG AAA 2 GATGAAACT:GATGAAGCT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 380 ACT AAA CTC 2 GAAACTCAA:GAAGCTCAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 381 CAA CTC AAG 2 ACTCAAGCC:GCTCAGCCT 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 382 CCT AAG CCT 2 CAAGCCTTA:CAGCCTTTG 1:1 TRUE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 1 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 383 TTA CCT TAC 2 CCTTTGCCG:GCCTTACCG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 384 CCG TAC CGC 2 TTACCGCAG:TTGCCGCAG 1:1 FALSE 1.25 1 0.75 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 385 CAG CGC AGA 2 CCGCAGAGA 2 FALSE 1.16666666666667 0.333333333333333 1.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 386 AGA AGA GAC 2 CAGAGACAA:CAGAGACAG 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.833333333333333 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 387 CAA GAC AAA 2 AGACAAAAG:AGACAGAAG 1:1 FALSE 2.41666666666667 0.333333333333333 0.25 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 388 AAG AAA AGA 2 CAAAAGAAG:CAGAAGAAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 389 AAA AGA AAC 2 AAGAAACAG:AAGAAGCAG 1:1 FALSE 2.16666666666667 0.333333333333333 0.5 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 390 CAG AAC AGC 2 AAACAGCAA:AAGCAGCCC 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 391 CAA AGC AAA 2 CAGCAAACT:CAGCCCACT 1:1 TRUE 2.16666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 392 ACT AAA CTG 2 CAAACTGTG:CCCACTGTG 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 393 GTG CTG TGA 2 ACTGTGACT 2 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 394 ACT TGA CTC 2 GTGACTCTT 2 FALSE 1 1 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 395 CTT CTC TTC 2 ACTCTTCTT 2 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 396 CTT TTC TTC 2 CTTCTTCCT 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 397 CCT TTC CTG 2 CTTCCTGCG:CTTCCTGCT 1:1 FALSE 1.33333333333333 1 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 398 GCG CTG CGG 2 CCTGCGGCT:CCTGCTGCA 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 399 GCA CGG CAG 2 GCGGCTGAC:GCTGCAGAT 1:1 FALSE 0.833333333333333 1 1.16666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 400 GAC CAG ACA 2 GCAGATTTG:GCTGACATG 1:1 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 401 ATG ACA TGG 2 GACATGGAT:GATTTGGAT 1:1 FALSE 2.16666666666667 0 0.666666666666667 0.166666666666667 0 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 402 GAT TGG ATG 2 ATGGATGAT:TTGGATGAT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 403 GAT ATG ATT 2 GATGATTTC 2 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 404 TTC ATT TCT 2 GATTTCTCC 2 FALSE 2 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 405 TCC TCT CCA 2 TTCTCCAAA:TTCTCCAGA 1:1 FALSE 1 1 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 406 AAA CCA AAC 2 TCCAAACAA:TCCAGACAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 0.75 0.25 1 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 407 CAA AAC AAC 2 AAACAATTG:AGACAACTT 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 408 CTT AAC TGC 2 CAACTTCAA:CAATTGCAA 1:1 TRUE 2 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 0 1 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 409 CAA TGC AAA 2 CTTCAAAAT:TTGCAACAA 1:1 FALSE 2.66666666666667 0.333333333333333 0 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 410 AAT AAA AAT 2 CAAAATTCC:CAACAATCC 1:1 TRUE 2.5 0.333333333333333 0.166666666666667 0 2 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 411 TCC AAT CCA 2 AATTCCATG:CAATCCATG 1:1 FALSE 1.5 1 0.5 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 412 ATG CCA TGA 2 TCCATGAGC:TCCATGAGT 1:1 FALSE 0 0 1 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 413 AGC TGA GC- 1 ATGAGC---:ATGAGTGGA 1:1 FALSE 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0 0 1 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 414 --- GTG GAG 1 AGC------:AGTGGAGCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 415 --- GAG CTT 1 ------AGT:GGAGCTTCT 1:1 FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 416 AGT --A CTG 1 ---AGTGCT:GCTTCTGCT 1:1 TRUE 1.16666666666667 0.666666666666667 1.16666666666667 0 1 0 1 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 417 GCT CTG CTG 2 AGTGCTGAC:TCTGCTGAT 1:1 FALSE 0.666666666666667 1 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 418 GAC CTG ACT 2 GCTGACTCA:GCTGATTCA 1:1 FALSE 1.66666666666667 0.333333333333333 1 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 419 TCA ACT CAA 2 GACTCAACT:GATTCAACT 1:1 FALSE 0.166666666666667 1 0.833333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 420 ACT CAA CTC 2 TCAACTCAG 2 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 421 CAG CTC AGG 2 ACTCAGGCA:ACTCAGGCC 1:1 FALSE 1.33333333333333 0.333333333333333 1.33333333333333 0 0 0 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N all ss13 422 GCA AGG CAT 2 CAGGCATAA:CAGGCCTAA 1:1 FALSE 1.66666666666667 1 0.333333333333333 0 0 1 0 0 SARSCOV2_NC_045512.2 ORF2 dNNdNS NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA