product	sequences	frame	codon	ref_codon_maj	alt_codon1_maj	alt_codon2_maj	num_defined_seqs	nonamers	nonamer_counts	multiple_variants	NN_sites	SN_sites	NS_sites	SS_sites	NN_diffs	SN_diffs	NS_diffs	SS_diffs	pair	which_gene	ratio_name	sw_num_replicates	sw_N_diffs	sw_S_diffs	sw_N_sites	sw_S_sites	sw_dN	sw_dS	sw_dNdS	sw_dN_m_dS	sw_boot_dN_SE	sw_boot_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_SE	sw_boot_dN_over_dS_P	sw_boot_dN_m_dS_SE	sw_boot_dN_m_dS_P	sw_boot_dN_gt_dS_count	sw_boot_dN_eq_dS_count	sw_boot_dN_lt_dS_count	sw_ASL_dN_gt_dS_P	sw_ASL_dN_lt_dS_P	sw_ASL_dNdS_P
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0309990153000232	0.047204354480147	NaN	NaN	0.0593000885668558	0.889483305557526	578	1	421	0.421	0.578	0.842
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0300690101387874	0.0445321475346792	NaN	NaN	0.0573880229020059	0.879291919276278	586	0	414	0.414	0.586	0.828
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0311056346785337	0.0467629383837478	NaN	NaN	0.0574140521306609	0.883794964118068	565	1	434	0.434	0.565	0.868
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0315134574091295	0.0447475683168538	NA	NA	0.0582439346199885	0.863839456782092	586	2	412	0.412	0.586	0.824
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0302694581430332	0.0429527508324107	NaN	NaN	0.0536711868734602	0.811892299751984	614	0	386	0.386	0.614	0.772
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0319576472951953	0.0416157129937311	NA	NA	0.0559882297425805	0.806904764924626	627	2	371	0.371	0.627	0.742
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0334956245580432	0.0440503520088058	NA	NA	0.0547547739472733	0.825547203881207	613	0	387	0.387	0.613	0.774
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0312660732154802	0.0416954838762245	NaN	NaN	0.0536777823538906	0.811807487876209	600	2	398	0.398	0.6	0.796
N	all	ss13	10	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0316029779604815	0.0428396068405238	NA	NA	0.0534168316649138	0.798050649203568	644	0	356	0.356	0.644	0.712
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0311742585125659	0.0414836358049556	NaN	NaN	0.0574317052752073	0.826923580944644	619	2	379	0.379	0.619	0.758
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0319652200680751	0.0429587931696398	NA	NA	0.0561612593479777	0.832709713287248	588	2	410	0.41	0.588	0.82
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0282248595452228	0.0420743874661255	NA	NA	0.0532443153696442	0.98397253725176	495	3	502	0.502	0.495	0.99
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0276408034144058	0.0419795526887013	NA	NA	0.0516657056392426	0.98163566654524	500	2	498	0.498	0.5	0.996
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0311947527479632	0.0430806408797002	NaN	NaN	0.0539724527525355	0.822516019309557	596	0	404	0.404	0.596	0.808
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.030587465803955	0.0422412640602486	NaN	NaN	0.0540191864136873	0.822667011447595	619	0	381	0.381	0.619	0.762
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0321114903631975	0.0428221988876949	NaN	NaN	0.0559191248275503	0.668530016750563	695	0	305	0.305	0.695	0.61
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0322342092797158	0.0423293199661424	NaN	NaN	0.0552844991257057	0.674877798943476	689	1	310	0.31	0.689	0.62
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0331218975864123	0.0433340710748379	NaN	NaN	0.0569642466136711	0.676690235069905	658	1	341	0.341	0.658	0.682
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0328619531852069	0.0404828361627109	NaN	NaN	0.0548439063018357	0.65109764857503	687	0	313	0.313	0.687	0.626
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0345554241681227	0.0432870236758731	NaN	NaN	0.0615500594692164	0.707187033424659	658	0	342	0.342	0.658	0.684
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.033617189352701	0.0421838585722979	NaN	NaN	0.0568487614633688	0.681567463046752	688	1	311	0.311	0.688	0.622
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0337405256829346	0.0284159171127408	NA	NA	0.0457534279324114	0.255550480377718	858	1	141	0.141	0.858	0.282
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0349678766436967	0.02930775797345	NaN	NaN	0.0477210654446241	0.25703306843034	872	1	127	0.127	0.872	0.254
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0329926787027961	0.0300024935449756	NaN	NaN	0.0438721214349624	0.233168272671104	883	0	117	0.117	0.883	0.234
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0338271522174943	0.0306662292130525	NA	NA	0.0444002551392919	0.241715033796619	877	2	121	0.121	0.877	0.242
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0297626265010978	0.031436608395907	NA	NA	0.0416893409054811	0.375727907313881	802	2	196	0.196	0.802	0.392
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0257876303754439	0.0318154991882452	NA	NA	0.0399713857616385	0.554606770273055	745	5	250	0.25	0.745	0.5
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0257602792891907	0.0304818037043615	NA	NA	0.0413311492841275	0.563401054195191	703	2	295	0.295	0.703	0.59
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0270128986427874	0.0310000656068815	NA	NA	0.0417368665148738	0.588894434576435	715	3	282	0.282	0.715	0.564
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0249579648610938	0.0460343600667713	NA	NA	0.0535827540393612	0.897259841698699	445	0	555	0.555	0.445	0.89
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0258643027912484	0.042565438650813	NA	NA	0.0516874195364891	0.931732189464428	487	2	511	0.511	0.487	0.974
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0233242909228457	0.0420585239503852	NA	NA	0.0499288770054209	0.705199435882225	350	11	639	0.639	0.35	0.7
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0240235270659509	0.0422126171705995	NA	NA	0.0512461990946593	0.696370960864668	335	5	660	0.66	0.335	0.67
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0170599361121516	0.043857605640269	NA	NA	0.0461931099580508	0.469970455954558	246	12	742	0.742	0.246	0.492
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0175825603428822	0.0428359373966884	NA	NA	0.0491706773807412	0.499608708677198	242	15	743	0.743	0.242	0.484
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0176541020897716	0.0457936018664558	NA	NA	0.0490344802538497	0.48031895321345	213	17	770	0.77	0.213	0.426
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0190472266305664	0.04552268109556	NA	NA	0.0481883358641766	0.488269678816348	241	20	739	0.739	0.241	0.482
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0190655465894226	0.0288011346819887	NA	NA	0.0352424086615577	0.937222488313541	474	52	474	0.474	0.474	0.948
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0185582686105568	0.0295653831199047	NA	NA	0.0359189103031639	0.947278213294562	487	37	476	0.476	0.487	0.952
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0181436496779811	0.028481274686938	NA	NA	0.0354505104953386	0.96369779873388	456	41	503	0.503	0.456	0.912
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0192204262979951	0.0305186468609998	NA	NA	0.0335534149909922	0.970811024322369	497	41	462	0.462	0.497	0.924
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0197551411792859	0.0286049305972118	NA	NA	0.0356515074564962	0.979806853004896	482	34	484	0.484	0.482	0.964
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0190164965470993	0.0291962242874286	NA	NA	0.0340008888686427	0.975795099931232	478	55	467	0.467	0.478	0.934
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.0186930477029943	0.0294662019270094	NA	NA	0.0348106096202161	0.959385586046319	470	50	480	0.48	0.47	0.94
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0179913964331369	0.0451119858288661	NA	NA	0.0492945977083564	0.520338296455806	250	20	730	0.73	0.25	0.5
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0190429291404777	0.0437184251645868	NA	NA	0.0485929550281931	0.506695149014196	238	14	748	0.748	0.238	0.476
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0191449277020082	0.0446218425696267	NA	NA	0.0476641001801607	0.49844909750149	222	13	765	0.765	0.222	0.444
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0187801291027663	0.0446495455398883	NA	NA	0.0490378038175149	0.513747785360095	237	16	747	0.747	0.237	0.474
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0189725121864499	0.0425795574384635	NA	NA	0.0498862685504927	0.530096066150386	272	17	711	0.711	0.272	0.544
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0187957991278174	0.0432763347557233	NA	NA	0.046634041563979003	0.501809169627304	259	18	723	0.723	0.259	0.518
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0196603640521393	0.045349434914894	NA	NA	0.0478246344114213	0.509219906715346	230	12	758	0.758	0.23	0.46
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0191223955595522	0.046493381014499	NA	NA	0.0502926636317123	0.516704607200373	223	17	760	0.76	0.223	0.446
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0184169403029317	0.0468535911205013	NA	NA	0.049724148015182	0.489959069179158	211	19	770	0.77	0.211	0.422
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0223876723729048	0.0453693932070734	NA	NA	0.0528572500828049	0.675187471743531	338	3	659	0.659	0.338	0.676
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0224422599646126	0.0480204490495128	NA	NA	0.0522154291574378	0.653764943567423	376	5	619	0.619	0.376	0.752
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0228740784276297	0.0477058952172331	NA	NA	0.0553374999559746	0.678598398472061	332	3	665	0.665	0.332	0.664
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0221811839174591	0.0476143415784216	NA	NA	0.0539699110917156	0.670926538113312	334	8	658	0.658	0.334	0.668
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0218629081846507	0.0462588375073606	NA	NA	0.0538628893471839	0.651958533609714	318	6	676	0.676	0.318	0.636
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0223131698229511	0.0498703334978532	NA	NA	0.0554267701573257	0.636276413735818	334	7	659	0.659	0.334	0.668
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0230757694880971	0.0477445234858796	NA	NA	0.0558188673083732	0.66568415970776	339	4	657	0.657	0.339	0.678
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0225837183221991	0.0457061358561406	NA	NA	0.052572008414449	0.670545528320113	341	6	653	0.653	0.341	0.682
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0230522524524202	0.0497002108824374	NA	NA	0.0521852540799523	0.661610368372057	329	4	667	0.667	0.329	0.658
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0217718170674847	0.0478023747933927	NA	NA	0.0529000550782044	0.676701125113225	376	6	618	0.618	0.376	0.752
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.0189380149141618	0.0458441404573817	NA	NA	0.0514831495960847	0.502445577496006	229	22	749	0.749	0.229	0.458
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.0197454753624763	0.0502797533175874	NA	NA	0.0502705375849826	0.467483974635725	213	15	772	0.772	0.213	0.426
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.0133871229044224	0.0472916178938457	NA	NA	0.0513902157134304	0.330162734393044	139	52	809	0.809	0.139	0.278
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0142749897247192	0.0464880574548407	NA	NA	0.0511221757825932	0.343254313585317	131	40	829	0.829	0.131	0.262
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0138556812985373	0.0494630638947446	NA	NA	0.051207051411019	0.344054815338694	116	53	831	0.831	0.116	0.232
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0131004198836863	0.0471750403895112	NA	NA	0.0492971990561466	0.323417308174257	126	43	831	0.831	0.126	0.252
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0133598083212083	0.0469884835021124	NA	NA	0.0500723696098146	0.332742188575129	126	42	832	0.832	0.126	0.252
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0202684761676011	0.045971219814947	NA	NA	0.0518197259978394	0.520153481950564	261	11	728	0.728	0.261	0.522
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0207049976972321	0.044239083781988	NA	NA	0.0518729859795351	0.520581997692203	227	21	752	0.752	0.227	0.454
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.0196245080295364	0.046971695156844497	NA	NA	0.0523795074056447	0.505348229480596	217	13	770	0.77	0.217	0.434
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0190176938004389	0.0449243936909532	NA	NA	0.0511751354201192	0.514911393915928	230	18	752	0.752	0.23	0.46
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0202618674781878	0.0464967809757392	NA	NA	0.0506478884596526	0.510545578230857	221	16	763	0.763	0.221	0.442
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0195118210368653	0.0447550702098172	NA	NA	0.0481351353118131	0.512420787915987	266	14	720	0.72	0.266	0.532
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.021268319560251	0.0450988286980235	NA	NA	0.0522879979841449	0.54296257815253	282	8	710	0.71	0.282	0.564
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0210305577314481	0.0478645493169886	NA	NA	0.0525340341209462	0.544853435192592	264	16	720	0.72	0.264	0.528
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.0246257469851166	0.0473754041326943	NA	NA	0.0540657448231768	0.743856941441168	397	5	598	0.598	0.397	0.794
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0245700730911543	0.0321910118537692	NA	NA	0.0411755622425377	0.749884557855682	643	12	345	0.345	0.643	0.69
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0249048855581354	0.0314302328455375	NA	NA	0.0397237442840986	0.74106545252424	647	18	335	0.335	0.647	0.67
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	34.49999999999999	0.0439149815636805	0.0295604764056575	1.48559789636123	0.014354505158023	0.0244955449297705	0.0297664873438273	NA	NA	0.0402177595229579	0.721152023743919	649	16	335	0.335	0.649	0.67
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.6666666666667	1	35.49999999999999	0.0443478924201168	0.0287116399282627	1.5445962867646	0.0156362524918542	0.0250068527890452	0.0300250830290331	NA	NA	0.0394860728176262	0.692109369082438	661	23	316	0.316	0.661	0.632
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.66666666666669	1	35.83333333333333	0.0450135072946897	0.0284394261467203	1.5827853579908	0.0165740811479694	0.025425216553727	0.0304861331921573	NA	NA	0.0401224769198837	0.679542736213024	667	14	319	0.319	0.667	0.638
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.50000000000003	1	35.49999999999999	0.0451263910998395	0.0287116399282627	1.5717106794523	0.0164147511715768	0.0255986772949809	0.0307202876952107	NA	NA	0.0400183173422252	0.681673218827564	667	29	304	0.304	0.667	0.608
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.16666666666669	1	35.83333333333333	0.0453538663162631	0.0284394261467203	1.59475321626676	0.0169144401695428	0.0256234059717003	0.0301911368664659	NA	NA	0.0419051602561812	0.68648025247718	669	15	316	0.316	0.669	0.632
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.50000000000003	1	36.16666666666666	0.0451263910998395	0.0281723261817365	1.60179854544969	0.0169540649181031	0.0252736036333109	0.030986848171305	NA	NA	0.0396433655384177	0.668895310760964	702	11	287	0.287	0.702	0.574
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	1	35.66666666666666	0.0447894260262167	0.0285748846742028	1.56744030769973	0.0162145413520139	0.0252206011811354	0.030900505261878	NA	NA	0.0422210772732182	0.700949523357641	661	17	322	0.322	0.661	0.644
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666669	1	35.499999999999986	0.0443478924201168	0.0287116399282627	1.5445962867646	0.0156362524918542	0.0252884470200402	0.0287487931795497	NA	NA	0.0412378226279232	0.704559695866131	657	16	327	0.327	0.657	0.654
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.00000000000003	1	35.66666666666666	0.0454684663623261	0.0285748846742028	1.59120384494061	0.0168935816881233	0.0259076368945583	0.0319837489675675	NA	NA	0.0388531996492588	0.663703672381592	685	18	297	0.297	0.685	0.594
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.33333333333336	1	34.999999999999986	0.0452398426751419	0.0291298749871979	1.55303936920512	0.016109967687944	0.0254713275410887	0.031364869944859	NA	NA	0.0426327017996844	0.705521093895439	672	8	320	0.32	0.672	0.64
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.66666666666669	1	34.66666666666666	0.0450135072946897	0.029415534864961	1.5302630906198	0.0155979724297287	0.0266718356744038	0.0311457898298978	NA	NA	0.0398443941205681	0.695448237194102	662	16	322	0.322	0.662	0.644
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	1	34.499999999999986	0.0447894260262167	0.0295604764056576	1.51517943796212	0.0152289496205592	0.0253237094799275	0.0333136652870833	NA	NA	0.0414098927759634	0.713051342762516	672	13	315	0.315	0.672	0.63
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	1	35.249999999999986	0.0445124432883257	0.0289192452027623	1.53919796233388	0.0155931980855634	0.0259150567144195	0.0303032899461745	NA	NA	0.039656048808549	0.694163581147216	678	13	309	0.309	0.678	0.618
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	0	35.249999999999986	0.0441845540246642	0	-Inf	0.0441845540246642	0.0260786946280057	0	NA	NA	0.0265118199143833	0.0955943069703692	949	51	0	0	0.949	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	0	35.749999999999986	0.044076328753575	0	-Inf	0.044076328753575	0.0254455240187035	0	NA	NA	0.0246923777175422	0.0742584625269383	951	49	0	0	0.951	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	0	36.08333333333332	0.0439686325106426	0	-Inf	0.0439686325106426	0.0254266423300691	0	NA	NA	0.0257044085833352	0.0871645291229771	951	49	0	0	0.951	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.9166666666667	0	35.41666666666665	0.0435430609699594	0	-Inf	0.0435430609699594	0.024639332146828	0	NA	NA	0.0246079986041613	0.0768158409961625	954	46	0	0	0.954	0.001
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	0	35.41666666666665	0.0439686325106426	0	-Inf	0.0439686325106426	0.0251360307851555	0	NA	NA	0.0238244953374359	0.064961627649071	960	40	0	0	0.96	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	0	35.41666666666665	0.0439686325106426	0	-Inf	0.0439686325106426	0.0249581621083692	0	NA	NA	0.0246566730813587	0.0745481226891702	949	51	0	0	0.949	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	0	35.41666666666665	0.0439686325106426	0	-Inf	0.0439686325106426	0.0260145009003571	0	NA	NA	0.0259039422256916	0.0896263069020032	956	44	0	0	0.956	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	0	36.08333333333332	0.0437548116643347	0	-Inf	0.0437548116643347	0.0243359223453732	0	NA	NA	0.0251164316889397	0.081494597520216	959	41	0	0	0.959	0.001
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333337	1	37.249999999999986	0.0593634822039754	0.0273378783823658	2.1714736371886	0.0320256038216096	0.0297443499469576	0.026438954941093	NA	NA	0.028675859745134	0.264073828828455	889	17	94	0.094	0.889	0.188
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.6666666666667	1	37.66666666666666	0.0443478924201168	0.0270299523623977	1.64069443503018	0.0173179400577191	0.025245214303518	0.0267097015274061	NA	NA	0.0248292867596993	0.48550222146828	764	46	190	0.19	0.764	0.38
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	38.16666666666666	0.0442388662657619	0.0266694765273651	1.65878269940428	0.0175693897383968	0.0258265284920768	0.0275197039671309	NA	NA	0.0240249484898653	0.464597330847607	755	49	196	0.196	0.755	0.392
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	37.499999999999986	0.0442388662657619	0.0271522864979704	1.62928695780625	0.0170865797677914	0.0251189380519901	0.0275913151154421	NA	NA	0.0242499462505003	0.481057462208786	757	41	202	0.202	0.757	0.404
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	37.499999999999986	0.0442388662657619	0.0271522864979704	1.62928695780625	0.0170865797677914	0.0257898965465492	0.0285490049718984	NA	NA	0.0245392365607289	0.486243286125396	764	35	201	0.201	0.764	0.402
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75000000000003	1	37.66666666666666	0.05965876642654	0.0270299523623977	2.20713546315877	0.0326288140641423	0.030521354659103	0.0263201127977786	NA	NA	0.0280297147790507	0.244391828773564	885	13	102	0.102	0.885	0.204
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.08333333333336	1	38.33333333333332	0.061180400295082	0.026551445288187	2.30422109346725	0.034628955006895	0.0294997150363716	0.0271381182768843	NA	NA	0.0306196205044624	0.258080326832052	878	11	111	0.111	0.878	0.222
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.58333333333336	1	37.33333333333332	0.0607158174610799	0.0272757331281561	2.22600130217597	0.0334400843329238	0.0316354258905354	0.0284382635458572	NA	NA	0.0295053458808708	0.257064448688968	891	17	92	0.092	0.891	0.184
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.4166666666667	1	36.499999999999986	0.0608698920112345	0.0279101972553257	2.18091944870148	0.0329596947559088	0.0308178509079062	0.0292374368749148	NA	NA	0.0310261094138783	0.288089879105326	861	15	124	0.124	0.861	0.248
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.08333333333337	1	35.83333333333332	0.0602582409815693	0.0284394261467203	2.11882759767002	0.031818814834849	0.0302076286730069	0.028943728525084	NA	NA	0.029734573126057	0.284576597850397	849	12	139	0.139	0.849	0.278
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.58333333333337	1	35.33333333333332	0.0598075134656444	0.028849710620847	2.07307152060052	0.0309578028447974	0.0307009418631714	0.0299493607730187	NA	NA	0.0306519682964645	0.312505999084366	849	19	132	0.132	0.849	0.264
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.25000000000003	1	35.66666666666666	0.0583526258768297	0.0285748846742028	2.04209488654595	0.0297777412026269	0.0291278353296851	0.0295202060991142	NA	NA	0.0302475008344372	0.32488473398369	837	28	135	0.135	0.837	0.27
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000003	1	36.16666666666666	0.0579298692281368	0.0281723261817365	2.05626858266647	0.0297575430464003	0.0300863799989864	0.0268212409806291	NA	NA	0.0311492170322539	0.339414711133983	841	13	146	0.146	0.841	0.292
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333337	1	35.83333333333332	0.05765141989764	0.0284394261467203	2.02716537247319	0.0292119937509198	0.0290248075855743	0.0278288956110929	NA	NA	0.0299244186668155	0.328969067904543	837	21	142	0.142	0.837	0.284
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000004	1	35.16666666666665	0.0571024790858329	0.0289891158257094	1.96979029747402	0.0281133632601234	0.0288225597695905	0.0283762845578952	NA	NA	0.0308112114328445	0.361537456902658	809	19	172	0.172	0.809	0.344
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333337	1	34.16666666666665	0.0560353868844177	0.0298546878003148	1.87693762732387	0.0261806990841029	0.0283396314672733	0.0306139750809475	NA	NA	0.0295398161350622	0.37546391265881	806	25	169	0.169	0.806	0.338
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.4166666666667	1	34.16666666666665	0.0565638983071325	0.0298546878003148	1.89464042248454	0.0267092105068177	0.0292945488658784	0.0302717147247058	NA	NA	0.0288131487558118	0.353936956811537	831	12	157	0.157	0.831	0.314
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333337	1	34.16666666666665	0.0560353868844177	0.0298546878003148	1.87693762732387	0.0261806990841029	0.028618869744643	0.0307259055510894	NA	NA	0.0294799688275951	0.374495377903339	815	10	175	0.175	0.815	0.35
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000004	1	33.499999999999986	0.0412475068105866	0.0304610393656427	1.35410700585319	0.0107864674449439	0.0239426480420779	0.0301187555797645	NA	NA	0.02567095730851	0.674352694920749	629	43	328	0.328	0.629	0.656
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000004	1	34.16666666666665	0.0412475068105866	0.0298546878003148	1.3816090486852	0.0113928190102718	0.0247735040551873	0.029447009327347	NA	NA	0.0264050953685179	0.666131823285394	654	47	299	0.299	0.654	0.598
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333337	1	34.83333333333332	0.0416291816557173	0.0292720079293014	1.42214984897043	0.0123571737264159	0.0236244618298041	0.0294022529560024	NA	NA	0.0258524297920524	0.632658126156107	621	50	329	0.329	0.621	0.658
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333337	1	34.83333333333332	0.0416291816557173	0.0292720079293014	1.42214984897043	0.0123571737264159	0.0229477397453147	0.0287962866353511	NA	NA	0.0254876401783812	0.627796908575443	655	52	293	0.293	0.655	0.586
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333337	1	34.999999999999986	0.0413422677171007	0.0291298749871979	1.41923944868524	0.0122123927299028	0.0240185251561916	0.0294360866251224	NA	NA	0.025360194405369	0.630120297960767	663	50	287	0.287	0.663	0.574
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000004	1	34.08333333333332	0.0408264049162627	0.0299291581301553	1.36410134687777	0.0108972467861074	0.0233239531115607	0.0302330586674582	NA	NA	0.0254054661865681	0.667971870561215	648	50	302	0.302	0.648	0.604
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333337	1	33.74999999999999	0.0406419966354019	0.0302307926160697	1.34439070624295	0.0104112040193323	0.0236351439302715	0.030876669237949	NA	NA	0.0265353060272528	0.694797489068682	614	51	335	0.335	0.614	0.67
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333337	1	33.24999999999999	0.0406419966354019	0.0306948207819131	1.32406691422516	0.00994717585348881	0.0231301254908521	0.0306594360099498	NA	NA	0.0267311191402685	0.709803734479065	622	45	333	0.333	0.622	0.666
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000004	1	33.16666666666666	0.0270604324233619	0.0307735475083969	0.879340687516713	-0.00371311508503493	0.0200158441150885	0.0325718366735926	NA	NA	0.0211943927056407	0.860927767819114	359	138	503	0.503	0.359	0.718
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	33.49999999999999	0.0271830432683088	0.0304610393656427	0.89238725382985	-0.00327799609733386	0.019328246975955	0.0311630686246944	NA	NA	0.0215791024552733	0.879261040821672	365	137	498	0.498	0.365	0.73
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333337	1	33.49999999999999	0.0269389228181416	0.0304610393656427	0.884373067339465	-0.00352211654750109	0.0188555261356323	0.0307961940119519	NA	NA	0.0223253976708806	0.874643737508928	371	127	502	0.502	0.371	0.742
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	1	33.49999999999999	0.0268184996810859	0.0304610393656427	0.880419717763629	-0.00364253968455675	0.0188238785473163	0.0301218619230391	NA	NA	0.0226562688285406	0.872271378778158	360	117	523	0.523	0.36	0.72
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333339	1	32.83333333333332	0.0269389228181416	0.0310925352587596	0.866411265403396	-0.004153612440618	0.019813189104483	0.0311639336683694	NA	NA	0.0221896543196757	0.851514101368826	372	128	500	0.5	0.372	0.744
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	1	32.49999999999999	0.0268184996810859	0.0314182062818701	0.853597415475675	-0.00459970660078417	0.0199098605055096	0.0320450730475306	NA	NA	0.0225823887199371	0.838599223349075	354	128	518	0.518	0.354	0.708
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	1	33.16666666666666	0.0270604324233619	0.0307735475083969	0.879340687516713	-0.00371311508503493	0.0198185258011354	0.0300452012819888	NA	NA	0.0228099525134397	0.870687823756023	378	139	483	0.483	0.378	0.756
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	33.49999999999999	0.0271830432683088	0.0304610393656427	0.89238725382985	-0.00327799609733386	0.0195472574188742	0.0310103308645762	NA	NA	0.0217526103364001	0.880216807830543	367	128	505	0.505	0.367	0.734
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	1	33.166666666666664	0.0273067703935705	0.0307735475083969	0.887345548514341	-0.00346677711482632	0.0194171362467338	0.0316558337596587	NA	NA	0.0235008737054237	0.882724005164907	381	124	495	0.495	0.381	0.762
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.666666666666664	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.0203025764823851	0.0305539598383915	NA	NA	0.0215942661728831	0.89636816468081	387	126	487	0.487	0.387	0.774
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.666666666666664	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.021498533602149	0.0308927810451447	NA	NA	0.0213082906139352	0.894985342048893	403	123	474	0.474	0.403	0.806
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000006	1	33.33333333333333	0.0268785763539719	0.0306164958901914	0.877911582382717	-0.00373791953621951	0.019113790828709	0.0307408212168356	NA	NA	0.0224408522938873	0.867710266934599	363	115	522	0.522	0.363	0.726
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000006	1	34.33333333333333	0.0268785763539719	0.0297068535712844	0.904793780649782	-0.00282827721731251	0.0190551063943903	0.0298800582668055	NA	NA	0.0225471254463441	0.900176423484568	366	134	500	0.5	0.366	0.732
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666673	1	34.666666666666664	0.0269995408952429	0.029415534864961	0.917866733315942	-0.00241599396971805	0.0194129186427176	0.0295667881068912	NA	NA	0.0214621927525425	0.910371657600303	364	142	494	0.494	0.364	0.728
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCCAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333339	2	35.33333333333333	0.0410592825874941	0.0588537115811214	0.697649842030774	-0.0177944289936273	0.0234498714573822	0.0417924051757897	NA	NA	0.0266603940302004	0.504485958840436	207	46	747	0.747	0.207	0.414
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333339	2	35.58333333333333	0.0554524994575896	0.058423686245627	0.949144140348388	-0.00297118678803739	0.0296714597918803	0.0420867408277911	NA	NA	0.0306211848961104	0.922702227505584	446	12	542	0.542	0.446	0.892
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.66666666666673	2	36.08333333333333	0.0571705240409131	0.0575822255219405	0.992850198524012	-4.11701481027447e-4	0.0301569720630879	0.0425264283625908	NA	NA	0.0287805395708588	0.988586765310427	504	16	480	0.48	0.504	0.96
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000007	2	35.75	0.0573071018565007	0.0581404786806199	0.985666151310911	-8.33376824119193e-4	0.028415012875971	0.0397756320314234	NA	NA	0.0303117447523342	0.978066101251905	459	20	521	0.521	0.459	0.918
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666673	2	34.75	0.0563645417845084	0.0598821656332629	0.941257571239199	-0.00351762384875444	0.0281623679560686	0.0436083564747353	NA	NA	0.0317360501630805	0.911743224130988	430	17	553	0.553	0.43	0.86
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	2	35.083333333333336	0.0574443341110378	0.0592901175479514	0.968868615660598	-0.0018457834369136	0.0299213183605727	0.0424107959338771	NA	NA	0.0309649370918463	0.952467191576407	443	18	539	0.539	0.443	0.886
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000006	2	34.416666666666664	0.0568993130810351	0.0604861633757489	0.940699656011711	-0.00358685029471375	0.0282893579705092	0.043033672682198	NA	NA	0.0325940714756191	0.912372818146369	447	15	538	0.538	0.447	0.894
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.8333333333334	2	34.583333333333336	0.0570345959917882	0.0601826482875392	0.947691695441679	-0.00314805229575094	0.0278789760427475	0.0430008587335542	NA	NA	0.0299390620641577	0.916257847172597	443	17	540	0.54	0.443	0.886
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	2	34.25000000000001	0.0573071018565008	0.0607927570603562	0.942663314309059	-0.00348565520385537	0.0290335783880505	0.0427285075622513	NA	NA	0.0323739786873172	0.914258719337132	435	13	552	0.552	0.435	0.87
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666673	2	34.25000000000001	0.0567646707244322	0.0607927570603562	0.933740686708372	-0.004028086335924	0.0278848887449489	0.0439902605340179	NA	NA	0.0307570708949388	0.895803340866699	423	16	561	0.561	0.423	0.846
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666673	1	34.083333333333336	0.0418713371647063	0.0299291581301553	1.39901486645956	0.0119421790345509	0.024174600585819	0.0312530796344002	NA	NA	0.0269524091866755	0.657705037748943	649	43	308	0.308	0.649	0.616
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000007	1	33.916666666666664	0.0419689902360334	0.0300792190929219	1.39528190896117	0.0118897711431115	0.02500374253024	0.0296610135310721	NA	NA	0.0273080053131253	0.663275681355708	639	49	312	0.312	0.639	0.624
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	33.916666666666664	0.042364201600918	0.0300792190929219	1.40842092575757	0.0122849825079961	0.0249695577108995	0.0299391813584062	NA	NA	0.0272513851598559	0.652132165166734	652	38	310	0.31	0.652	0.62
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666673	1	33.916666666666664	0.0567646707244322	0.0300792190929219	1.8871723547434	0.0266854516315103	0.0297126877547032	0.0315369330260099	NA	NA	0.0312267909527475	0.392789722504428	790	14	196	0.196	0.79	0.392
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.3333333333334	1	33.75	0.0566306643811088	0.0302307926160697	1.87327752534698	0.0263998717650391	0.0283834991594814	0.0322564744687282	NA	NA	0.0294972514942285	0.370790138405611	801	18	181	0.181	0.801	0.362
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.41666666666673	1	34.416666666666664	0.0426150118597228	0.0296334842053817	1.43806956901759	0.0129815276543411	0.0258652854801216	0.0309032147205258	NA	NA	0.025006657203087	0.603675060988684	694	44	262	0.262	0.694	0.524
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000007	1	34.583333333333336	0.0427161696956043	0.0294878275056261	1.44860348519925	0.0132283421899782	0.0246583607062761	0.0309419694496395	NA	NA	0.0255179217477178	0.604183272609914	682	45	273	0.273	0.682	0.546
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.0833333333334	1	35.083333333333336	0.0428178090539073	0.0290593249318817	1.47346193190231	0.0137584841220256	0.0252687916550788	0.0296370571541064	NA	NA	0.0256597694008795	0.591827988207178	703	43	254	0.254	0.703	0.508
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.0833333333334	1	35.416666666666664	0.042215127927666	0.0287805096612113	1.46679570391907	0.0134346182664547	0.024289768357301	0.0303613246887875	NA	NA	0.0254246984284587	0.597216070988764	652	39	309	0.309	0.652	0.618
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.0833333333334	1	35.416666666666664	0.042215127927666	0.0287805096612113	1.46679570391907	0.0134346182664547	0.025165578604836	0.0318196173196778	NA	NA	0.0249746726349332	0.590625580216733	692	49	259	0.259	0.692	0.518
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000006	2	36.083333333333336	0.0424141271286908	0.0575822255219405	0.73658367220506	-0.0151680983932496	0.0243435943140052	0.0417415584493579	NA	NA	0.0394915399013869	0.70091563093083	361	15	624	0.624	0.361	0.722
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666671	3	36.083333333333336	0.0573756358851215	0.0881207952860292	0.651102111583165	-0.0307451594009078	0.0289198613112382	0.0518619369177537	NA	NA	0.0442704752168337	0.487378410071342	239	3	758	0.758	0.239	0.478
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000004	3	35.75	0.0571024790858329	0.088993157850987	0.641650217440841	-0.0318906787651541	0.0287472714829452	0.0527343625337389	NA	NA	0.0428250964266263	0.456469626730862	270	3	727	0.727	0.27	0.54
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333337	3	36.416666666666664	0.05765141989764	0.0872653886078579	0.66064473919559	-0.0296139687102178	0.0288586779415036	0.0534657124945447	NA	NA	0.0460094150053493	0.519802296333669	226	4	770	0.77	0.226	0.452
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.08333333333337	3	37.083333333333336	0.0727843418621031	0.0856035011092873	0.850249591651416	-0.0128191592471842	0.0326610809755474	0.0510466011988972	NA	NA	0.0454386391158368	0.777851322919782	429	3	568	0.568	0.429	0.858
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.25000000000004	4	37.583333333333336	0.0736788296875599	0.114781984854672	0.64190238373074	-0.0411031551671125	0.0341916187618505	0.0592309319216938	NA	NA	0.058133300627169	0.479535353328061	234	3	763	0.763	0.234	0.468
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.75000000000004	4	38.083333333333336	0.0742261626042775	0.113155334268708	0.655966977464926	-0.0389291716644301	0.0330318128021624	0.0613905673704109	NaN	NaN	0.0558913644217965	0.486106389474988	269	0	731	0.731	0.269	0.538
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	38.75000000000001	0.0757263107752118	0.11105698371059	0.681868967129085	-0.0353306729353785	0.033267765084452	0.0601137518409899	NA	NA	0.0551926777430401	0.522085917974968	274	1	725	0.725	0.274	0.548
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	39.083333333333336	0.0761108787135566	0.110036776004805	0.691685829746892	-0.0339258972912486	0.0335143189487662	0.0578431770786442	NaN	NaN	0.0543416423296947	0.53242563010306	279	0	721	0.721	0.279	0.558
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	38.75000000000001	0.0764993759663411	0.11105698371059	0.688829944865918	-0.0345576077442492	0.0345763920310009	0.058937916993946	NA	NA	0.0558857636178233	0.536337033557233	270	0	730	0.73	0.27	0.54
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.33333333333336	4	37.75000000000001	0.0758220876535266	0.114234586398441	0.663740203768633	-0.0384124987449142	0.0342494485398032	0.0615918522683599	NaN	NaN	0.0593867962246541	0.517749196489546	261	2	737	0.737	0.261	0.522
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.83333333333336	4	36.75000000000001	0.0752510361297835	0.117599765999126	0.639891036265689	-0.0423487298693429	0.0347412518490202	0.0630754296984452	NA	NA	0.0584776004810272	0.468950814538808	228	1	771	0.771	0.228	0.456
N	all	ss13	176	GGA	AAG	GAA	2	GAAGGGAGC:GAGGGAAGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.00000000000003	4	36.66666666666667	0.0762076323080868	0.117889187641809	0.646434451135873	-0.0416815553337224	0.0336320705413862	0.0619061180794666	NaN	NaN	0.0591874933472156	0.481290109843158	273	2	725	0.725	0.273	0.546
N	all	ss13	177	AGC	GAA	GCA	2	GGAAGCAGA:GGGAGCAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.75000000000003	4	36.583333333333336	0.0753456127890199	0.11818004032857	0.637549391416182	-0.0428344275395505	0.0337162929595089	0.0662047530592872	NaN	NaN	0.0598243912343914	0.473989662231557	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0325304374993323	0.0651036666871034	NA	NA	0.0580843769713629	0.458701295758821	217	2	781	0.781	0.217	0.434
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.035049001673813	0.0657988835910171	NaN	NaN	0.060929351210225	0.473561733809141	257	1	742	0.742	0.257	0.514
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0355723200738189	0.0643281751634859	NaN	NaN	0.0575354031855784	0.435223047581908	217	0	783	0.783	0.217	0.434
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0344403715174131	0.0651601066286541	NaN	NaN	0.0584387631774637	0.4344570485121	216	1	783	0.783	0.216	0.432
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0352807394533282	0.0676706977745646	NaN	NaN	0.0617063452965117	0.450738465104619	209	1	790	0.79	0.209	0.418
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0330573638104893	0.0661397030197748	NaN	NaN	0.0613572322507546	0.448166281526531	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0346617488327853	0.065772450361666	NaN	NaN	0.0574354604486495	0.410095756981104	202	1	797	0.797	0.202	0.404
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0337444180074852	0.065910024383093	NaN	NaN	0.0629403775576614	0.445036097119859	217	0	783	0.783	0.217	0.434
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0358245012617932	0.0797168456634533	NaN	NaN	0.0693686229496632	0.30411749867272	124	1	875	0.875	0.124	0.248
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0372909207819153	0.0812187495094934	NaN	NaN	0.072721174869917	0.315968429306819	109	0	891	0.891	0.109	0.218
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0362875069227154	0.0803124617931693	NaN	NaN	0.0729003333787067	0.317159215237287	132	1	867	0.867	0.132	0.264
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0353617573768887	0.0780550603213093	NA	NA	0.0699078405972419	0.291145943730693	130	1	869	0.869	0.13	0.26
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.035953701627396	0.0783801417467876	NaN	NaN	0.0704232727866821	0.294691601635505	120	1	879	0.879	0.12	0.24
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0349229892586046	0.0775409750712711	NA	NA	0.0677780543387761	0.299219196808999	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0334335941911644	0.0813111386909255	NaN	NaN	0.0699071506742112	0.271653737150195	114	0	886	0.886	0.114	0.228
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0348915129696909	0.0854530260052031	NaN	NaN	0.0743120484437136	0.255734645712376	95	0	905	0.905	0.095	0.19
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.030039223398622	0.0769142729296143	NaN	NaN	0.0695575547516871	0.327960553639917	136	1	863	0.863	0.136	0.272
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0268318879372507	0.0779568183945057	NA	NA	0.0744011047684821	0.25051757063355	88	2	910	0.91	0.088	0.176
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0263121844818694	0.0795248553366684	NA	NA	0.0702266543120082	0.221960223020873	78	2	920	0.92	0.078	0.156
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0256949955125226	0.0793629760061903	NA	NA	0.0709023386780841	0.232091098826431	82	2	916	0.916	0.082	0.164
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0274315473541479	0.0706998149410035	NaN	NaN	0.0666806556504785	0.226605583612605	78	1	921	0.921	0.078	0.156
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0264181440441721	0.0750795481648897	NA	NA	0.0683672136580808	0.254600694326749	83	3	914	0.914	0.083	0.166
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.026324191707137	0.0718978138864974	NA	NA	0.0603525735322288	0.229035876002315	77	1	922	0.922	0.077	0.154
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0276040487690154	0.0724856346288379	NA	NA	0.0667376902878076	0.252670220032791	83	3	914	0.914	0.083	0.166
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0262046375443934	0.0713043399573915	NA	NA	0.0658770854645477	0.24652499805368	104	1	895	0.895	0.104	0.208
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0271942513973791	0.0726564719319125	NaN	NaN	0.0659517475470263	0.260489877957129	80	1	919	0.919	0.08	0.16
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0269106019767437	0.0736372793962988	NA	NA	0.0623933651845661	0.247912363069397	79	2	919	0.919	0.079	0.158
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0271174215208246	0.0674569269988819	NA	NA	0.0665636745437188	0.298621490422367	101	3	896	0.896	0.101	0.202
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0272455636581327	0.0731355559639907	NaN	NaN	0.0626923156667494	0.248517254866683	95	0	905	0.905	0.095	0.19
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0236594026307955	0.0679975140531897	NA	NA	0.062650349925724	0.183920320650538	44	8	948	0.948	0.044	0.088
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.0244306141480485	0.0683082315965127	NA	NA	0.0594701950190077	0.169035971442005	37	7	956	0.956	0.037	0.074
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0228887107490998	0.0706356332434867	NA	NA	0.0600051736443311	0.15242766840087	22	4	974	0.974	0.022	0.044
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0231177687812258	0.0712534617995179	NA	NA	0.0631774824184057	0.155491327099647	26	4	970	0.97	0.026	0.052
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0233226256675664	0.0712063050175012	NA	NA	0.0616779072607341	0.152859993004867	26	6	968	0.968	0.026	0.052
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0231192632053821	0.0659564466201356	NA	NA	0.063969454256298	0.184282214765207	36	6	958	0.958	0.036	0.072
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0223562890607679	0.0704461682744085	NA	NA	0.0583614481665421	0.147413829709132	31	8	961	0.961	0.031	0.062
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.02361066683499	0.0592857937448336	NA	NA	0.0481599945400242	0.267561385276973	91	19	890	0.89	0.091	0.182
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0193099696351369	0.0482895905388366	NA	NA	0.0391878892271553	0.39026637044986	157	62	781	0.781	0.157	0.314
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.0179038019554207	0.0489540625057334	NA	NA	0.041865936948744	0.446416181512562	187	45	768	0.768	0.187	0.374
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0190432839841051	0.0460957114046028	NA	NA	0.0413403230812124	0.4456948539003	199	49	752	0.752	0.199	0.398
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	2	35.16666666666666	0.013423177093157	0.0591439311842398	0.226957809945747	-0.0457207540910828	0.0135510771211616	0.0457228569993757	NA	NA	0.0377317858029894	0.225615576038184	0	129	871	0.871	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333339	1	34.83333333333332	0.0406419966354019	0.0292720079293014	1.38842530835471	0.0113699887061005	0.0284894883691956	0.0311281842176743	NA	NA	0.0335639479433355	0.734793551266451	538	152	310	0.31	0.538	0.62
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000006	1	34.16666666666666	0.0402781342288957	0.0298546878003148	1.34913935453953	0.010423446428581	0.0301112286929779	0.0321650063998307	NA	NA	0.0338851722993884	0.758378468240371	531	122	347	0.347	0.531	0.694
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0300378192558629	0.0318461589582376	NA	NA	0.033430034252928	0.768759321586502	547	131	322	0.322	0.547	0.644
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	1	33.833333333333314	0.0397443976053827	0.0301548153585304	1.31801163869967	0.00958958224685223	0.0298441684277136	0.0320212272952184	NA	NA	0.0334143888660849	0.77412027995659	544	119	337	0.337	0.544	0.674
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666674	1	34.16666666666665	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0284328050241353	0.0340734078082782	NA	NA	0.0335119584729021	0.763893670011359	526	123	351	0.351	0.526	0.702
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	34.66666666666665	0.0396131668795607	0.029415534864961	1.34667504981345	0.0101976320145997	0.0280556172243775	0.0328593889151955	NA	NA	0.0328562893689443	0.75627901526042	484	172	344	0.344	0.484	0.688
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	34.999999999999986	0.0395261602343306	0.0291298749871979	1.35689426239219	0.0103962852471327	0.0300768845162818	0.0306430311869305	NA	NA	0.0325263190561914	0.749251209873577	518	148	334	0.334	0.518	0.668
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	1	35.249999999999986	0.0392674190316604	0.0289192452027623	1.35783001099592	0.0103481738288981	0.0292972999943779	0.0321282474021637	NA	NA	0.0334627575832657	0.757135543528054	537	125	338	0.338	0.537	0.676
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	35.583333333333314	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0290107998096181	0.0320055145721712	NA	NA	0.0327740658506898	0.73380935005906	545	141	314	0.314	0.545	0.628
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	35.583333333333314	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0291585032522263	0.0299603648088442	NA	NA	0.0321710842671275	0.729014750366559	536	144	320	0.32	0.536	0.64
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.91666666666665	0.0392674190316604	0.0283721774047871	1.38401147262793	0.0108952416268733	0.0307432521308905	0.0306095320063458	NA	NA	0.031434008833614	0.728886726709399	533	133	334	0.334	0.533	0.668
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.91666666666665	0.0396131668795607	0.0275893176123833	1.43581539188851	0.0120238492671774	0.0298847614885702	0.03052688900876	NA	NA	0.0306031671003516	0.694396601932523	533	121	346	0.346	0.533	0.692
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333341	1	36.91666666666665	0.0399650588551815	0.0275893176123833	1.44857003774691	0.0123757412427982	0.0318404732245205	0.0299270414303282	NA	NA	0.0320509308935696	0.699402349860885	547	137	316	0.316	0.547	0.632
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.749999999999986	0.0395261602343306	0.0277167798918218	1.42607331690768	0.0118093803425087	0.031191905401026	0.0291059266275903	NA	NA	0.0328578192009803	0.719289497984162	539	109	352	0.352	0.539	0.704
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666676	1	35.749999999999986	0.0390120440358434	0.0285069944752382	1.36850779094689	0.0105050495606052	0.0293063649594683	0.0310928062319262	NA	NA	0.0333388361921176	0.752686132144674	526	128	346	0.346	0.526	0.692
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.0305573623091782	0.0308264964592237	NA	NA	0.0321000542650899	0.735445919520703	544	119	337	0.337	0.544	0.674
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.0292473822992529	0.0300370723038679	NA	NA	0.0335006940693933	0.746117264353236	525	118	357	0.357	0.525	0.714
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333343	0	35.91666666666665	0.0262321821040851	0	-Inf	0.0262321821040851	0.0265241583932602	0	NA	NA	0.0263847975066421	0.320117825981724	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666676	0	35.499999999999986	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0257038690658321	0	NA	NA	0.0260570907092781	0.320898117922005	676	324	0	0	0.676	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.33333333333343	0	35.333333333333314	0.0256435235612095	0	-Inf	0.0256435235612095	0.0269168017488778	0	NA	NA	0.0242232517999992	0.289767143023182	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000009	0	34.999999999999986	0.0257536031856686	0	-Inf	0.0257536031856686	0.0254422636382792	0	NA	NA	0.0262243178223229	0.326074993297239	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000009	0	35.66666666666665	0.0257536031856686	0	-Inf	0.0257536031856686	0.0260754469024253	0	NA	NA	0.0268728324996166	0.337885845735655	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.83333333333332	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0257909711593736	0	NA	NA	0.0258061037026842	0.317256230477238	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	0	36.249999999999986	0.0392674190316604	0	-Inf	0.0392674190316604	0.0308593187260094	0	NA	NA	0.029411351582671	0.181840019680297	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.0833333333334	0	36.58333333333332	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0293470716294993	0	NA	NA	0.0309875975169713	0.1911689815529	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	0	36.58333333333332	0.0414374651394939	0	-Inf	0.0414374651394939	0.0312888914366752	0	NA	NA	0.0306225256107391	0.176001513024254	846	154	0	0	0.846	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	0	36.749999999999986	0.0414374651394939	0	-Inf	0.0414374651394939	0.0303926190041255	0	NA	NA	0.0309027306220328	0.179952988976235	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.749999999999986	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0309782603253165	0	NA	NA	0.0311813023219099	0.189921898928425	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	35.58333333333332	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0298646022812316	0	NA	NA	0.0326426465876434	0.211558865730214	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666673	0	35.249999999999986	0.0405961546323978	0	-Inf	0.0405961546323978	0.0296636568094809	0	NA	NA	0.0302225260333002	0.179193751046515	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	0	34.91666666666666	0.0400540111089282	0	-Inf	0.0400540111089282	0.0288624751190437	0	NA	NA	0.0290632502639639	0.168151747332835	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.0833333333334	0	34.08333333333332	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.0306611157212941	0	NA	NA	0.0294142938056132	0.174243203998389	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5833333333334	0	34.58333333333332	0.0402331091273881	0	-Inf	0.0402331091273881	0.0299059066631448	0	NA	NA	0.0300083002682443	0.180007257067474	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.5833333333334	0	34.24999999999999	0.0397005575048303	0	-Inf	0.0397005575048303	0.0304962452171859	0	NA	NA	0.0294790050255986	0.178063959869558	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000006	0	33.58333333333333	0.0388436318463036	0	-Inf	0.0388436318463036	0.0287222243050216	0	NA	NA	0.0282262165744107	0.16877383951201	855	145	0	0	0.855	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5833333333334	0	33.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0291727819605451	0	NA	NA	0.0303069980910661	0.201897926371085	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.91666666666673	0	32.916666666666664	0.0385111332176099	0	-Inf	0.0385111332176099	0.029883355286757	0	NA	NA	0.0306996067225924	0.209678351738754	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.0833333333334	0	33.25	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0284915595122776	0	NA	NA	0.0299202185539333	0.199009425083327	888	112	0	0	0.888	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000007	0	32.583333333333336	0.0381034317265945	0	-Inf	0.0381034317265945	0.0296948037922335	0	NA	NA	0.0279290262307377	0.172474728953456	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000007	0	31.333333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0277934499061296	0	NA	NA	0.0289311902738668	0.194820807319213	852	148	0	0	0.852	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.5	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0280663393212986	0	NA	NA	0.0273469191690218	0.16842057794938	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.5	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0276084961547792	0	NA	NA	0.0278352413436919	0.176012753455239	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.666666666666668	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0278826693318383	0	NA	NA	0.0294802827133374	0.201380825354773	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000006	0	31.333333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0289973977723597	0	NA	NA	0.0285774569957444	0.189352629088024	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333339	0	31.833333333333336	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.0294675917309317	0	NA	NA	0.0286975457158875	0.184722105647818	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333339	0	32.833333333333336	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0294240963569287	0	NA	NA	0.0292402820122126	0.187346942305219	850	150	0	0	0.85	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACA:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000004	0	32.16666666666667	0.0382248326940206	0	-Inf	0.0382248326940206	0.0287198020175542	0	NA	NA	0.0281784269226949	0.174931147229907	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACAAAA:GCCACTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000004	0	31.833333333333336	0.0377438129156367	0	-Inf	0.0377438129156367	0.0291713960012664	0	NA	NA	0.0279884446755932	0.177481597559828	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	0	31.833333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0277961850034481	0	NA	NA	0.0278227786461241	0.177627059000675	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333337	0	31.833333333333336	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0292712891530755	0	NA	NA	0.0286714472425362	0.18710497422102	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333337	0	32	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.0119495007460864	0	NA	NA	0.0123609230895706	0.318891548444985	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32.16666666666667	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0123670589725672	0	NA	NA	0.0120086703915914	0.303908910137848	660	340	0	0	0.66	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	31.833333333333336	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0119253145993377	0	NA	NA	0.0127775403651548	0.331938744996352	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	32.666666666666664	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0131403323517602	0	NA	NA	0.0125120425896778	0.319777618315535	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0128191468918702	0	NA	NA	0.011797832383503	0.295348777231877	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0127948248990912	0	NA	NA	0.0127047728463126	0.330175134977869	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	32.166666666666664	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0124680477117317	0	NA	NA	0.0121775521534148	0.315617458121878	667	333	0	0	0.667	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	31.666666666666668	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.011944833614608	0	NA	NA	0.0123401251323676	0.322035279754628	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	32	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0123408991427812	0	NA	NA	0.0124380188331619	0.32388360574147	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.833333333333332	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0121331197529879	0	NA	NA	0.0118851631335367	0.301885957485555	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0125300612562133	0	NA	NA	0.0126091851570677	0.326522197882952	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0122452497490368	0	NA	NA	0.0124207809346353	0.319237756015711	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.833333333333332	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0127391646580489	0	NA	NA	0.0122937605960834	0.318238368524194	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	0	32	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0121608240406927	0	NA	NA	0.0123321931138422	0.320737529942984	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666669	0	32.666666666666664	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0127620941168811	0	NA	NA	0.012927991244487	0.327502594097363	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000001	0	32.333333333333336	0.012766265677073	0	-Inf	0.012766265677073	0.0127464844918487	0	NA	NA	0.0128784630980528	0.321544980350719	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333336	0	32.333333333333336	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0125693816696469	0	NA	NA	0.0127185233780461	0.311361131540527	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	286	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	32.666666666666664	0.0259766224970672	0.0312545223004261	0.831131643842563	-0.00527789980335889	0.0190704849771906	0.0329572279665873	NA	NA	0.0240225796706469	0.82610029640555	342	116	542	0.542	0.342	0.684
N	all	ss13	287	TTC	ATT	TCG	2	AATTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333336	1	32.5	0.0261464386246643	0.0314182062818701	0.832206599895936	-0.00527176765720586	0.0179590030639968	0.03275707650101	NA	NA	0.023983744333445	0.826022352116757	363	117	520	0.52	0.363	0.726
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	32.333333333333336	0.0262608883838265	0.0315836140125951	0.831471926339843	-0.00532272562876861	0.0189286748388547	0.0332422048221022	NA	NA	0.0238160446166349	0.823151622435183	315	138	547	0.547	0.315	0.63
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000001	1	32.833333333333336	0.026434454296256	0.0310925352587596	0.850186518283637	-0.00465808096250356	0.0193340524223624	0.0313857070163086	NA	NA	0.0224804247013956	0.835848909357535	361	129	510	0.51	0.361	0.722
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	1	32.583333333333336	0.0263473854682498	0.0313361505112163	0.840798408177776	-0.00498876504296641	0.0185569929996934	0.0325505891304227	NA	NA	0.0247231720238575	0.840084815685017	324	138	538	0.538	0.324	0.648
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	1	31.416666666666668	0.0259485340559256	0.0325254218363474	0.797792391025286	-0.00657688778042175	0.0178203226999957	0.0351556636725385	NA	NA	0.0243486101749757	0.787072953392228	330	136	534	0.534	0.33	0.66
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	1	31	0.0127934871784325	0.032972342565837	0.388006619574792	-0.0201788553874046	0.0129540016992878	0.0323265740066298	NA	NA	0.0210017683657399	0.336644205820329	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	30.666666666666668	0.0124226442537559	0.0333388219281254	0.372617973140674	-0.0209161776743694	0.0119407339927738	0.0343369152051053	NA	NA	0.0233339965540112	0.370048704834814	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	1	31.666666666666668	0.0123206056064609	0.0322630388127681	0.381879886701344	-0.0199424332063072	0.0123769201781965	0.0348083809901325	NA	NA	0.0210688131956342	0.343874228116556	0	343	657	0.657	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000001	1	31.5	0.0122202296145754	0.0324374878453625	0.376731689976494	-0.0202172582307871	0.0128068318603481	0.0335439734652071	NA	NA	0.022302502103283	0.364670314256553	0	349	651	0.651	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	32.166666666666664	0.0124226442537559	0.0317507728699206	0.391254861878485	-0.0193281286161646	0.0131434398043492	0.0311995341812916	NA	NA	0.020400210428433	0.343410790309109	0	387	613	0.613	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.833333333333336	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0282902634059893	0.0329511228880395	NA	NA	0.0338872133300487	0.874801700551195	507	118	375	0.375	0.507	0.75
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.0278896132422645	0.0325534436735931	NA	NA	0.0319732759466937	0.873537607181709	544	115	341	0.341	0.544	0.682
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.027770746120962	0.0349419387777694	NA	NA	0.0330542730854794	0.877640269013457	512	125	363	0.363	0.512	0.726
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.33333333333336	1	31.333333333333332	0.0368926831430788	0.0326138339548042	1.13119736839907	0.00427884918827467	0.0272685379410266	0.0314171881778113	NA	NA	0.0341637880446089	0.900329464132001	488	124	388	0.388	0.488	0.776
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	31.083333333333332	0.0494514815652544	0.0672719567702241	0.735098010217872	-0.0178204752049697	0.0295572857263754	0.0515539247905766	NA	NA	0.0436118928683837	0.682822194005836	324	36	640	0.64	0.324	0.648
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	31.416666666666668	0.0500707265730996	0.0665255778124882	0.752653764454795	-0.0164548512393886	0.0309091836189442	0.0469690271986484	NA	NA	0.039163310074721	0.674368669097462	293	50	657	0.657	0.293	0.586
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	31.75	0.0507056829412418	0.0657955896932053	0.770654738070964	-0.0150899067519635	0.0301037154602794	0.0483771946620704	NA	NA	0.0398970627468324	0.705266430466437	336	51	613	0.613	0.336	0.672
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000001	2	30.75	0.050280603697972	0.0680352852661241	0.739037155518587	-0.0177546815681521	0.0300757683153509	0.051523038576389	NA	NA	0.0402820971952179	0.659387753576826	313	59	628	0.628	0.313	0.626
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333336	2	29.75	0.0510292410063947	0.0704329495874262	0.724508079035561	-0.0194037085810315	0.031822512278315	0.0529629846217818	NA	NA	0.0426853339381305	0.649414637617554	328	54	618	0.618	0.328	0.656
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	29.083333333333332	0.0511380136321413	0.0721276112438599	0.70899358442977	-0.0209895976117187	0.0324959347664102	0.0555636976637159	NA	NA	0.044885017113161	0.640048935587558	296	51	653	0.653	0.296	0.592
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	29.5	0.0509750280987295	0.0710590256920247	0.717361765128321	-0.0200839975932952	0.0320117544291531	0.0525796921732438	NA	NA	0.0446019950047099	0.652498677232515	285	41	674	0.674	0.285	0.57
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.833333333333332	0.0511925740908369	0.0702267037754945	0.728961653312005	-0.0190341296846576	0.0334801225674034	0.053114007071271	NA	NA	0.0421243366201862	0.651372802011672	317	53	630	0.63	0.317	0.634
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	30.333333333333336	0.0515223984646761	0.0690141740401891	0.746548070468438	-0.017491775575513	0.0317996532272438	0.0547148081371935	NA	NA	0.0424210370999791	0.680092218430435	304	43	653	0.653	0.304	0.608
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	30.333333333333336	0.0510835693943593	0.0690141740401891	0.740189535045536	-0.0179306046458298	0.0321359193169825	0.0513998196137091	NA	NA	0.0421489706330721	0.670537626393817	341	44	615	0.615	0.341	0.682
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	30.333333333333336	0.0510835693943593	0.0690141740401891	0.740189535045536	-0.0179306046458298	0.030269526127588	0.0514326672921448	NA	NA	0.0438941667147225	0.682909347212303	337	52	611	0.611	0.337	0.674
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	30.000000000000004	0.0513020451633004	0.069817817299509	0.734798754066194	-0.0185157721362086	0.0318698849798733	0.05023148169845	NA	NA	0.0452435274515713	0.682358499091905	313	56	631	0.631	0.313	0.626
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333336	2	30.000000000000004	0.0508669472540708	0.069817817299509	0.728566850433872	-0.0189508700454382	0.0309616635723781	0.0511942658466107	NA	NA	0.0419620315285886	0.651543148038371	291	54	655	0.655	0.291	0.582
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	29.000000000000007	0.0502279695796377	0.0723451996406717	0.694281995614262	-0.022117230061034	0.0289636591882648	0.0543720505651324	NA	NA	0.045840125334087	0.629460565550749	270	52	678	0.678	0.27	0.54
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	28.66666666666667	0.0496048518784087	0.073228852172937	0.677394912066382	-0.0236240002945282	0.0292378427798616	0.0545372476655632	NA	NA	0.0453163345922303	0.602148654764888	273	55	672	0.672	0.273	0.546
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	29.000000000000004	0.0502279695796377	0.0723451996406717	0.694281995614262	-0.022117230061034	0.0311127298891337	0.0518432663213828	NA	NA	0.0449375895342945	0.62259450459217	282	46	672	0.672	0.282	0.564
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGAATG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.6666666666667	2	28.166666666666668	0.0500185308740041	0.0745955951479785	0.67052928225561	-0.0245770642739744	0.0298871053343163	0.0530068370697894	NA	NA	0.0460815803041118	0.593799531286786	284	53	663	0.663	0.284	0.568
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.75	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0294504450261697	0.0554917042379213	NA	NA	0.0469497927703866	0.579508778890345	226	48	726	0.726	0.226	0.452
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0311445792139649	0.0590137110035673	NA	NA	0.0461470632363834	0.584600210481201	246	46	708	0.708	0.246	0.492
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0501754455827152	0.0748283653087125	0.670540447806269	-0.0246529197259974	0.0306374085094117	0.0567430731489535	NA	NA	0.0491338981430445	0.615843584071779	262	35	703	0.703	0.262	0.524
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.0309382046707172	0.0565714564645386	NA	NA	0.046356808051278	0.605563004833861	275	51	674	0.674	0.275	0.55
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0495536228075988	0.075298294736773	0.658097543653914	-0.0257446719291742	0.0295041728969546	0.0568722640868778	NA	NA	0.0462081039918051	0.577427509043435	258	46	696	0.696	0.258	0.516
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.0305139282533976	0.0567730578826818	NA	NA	0.0457333388691442	0.567451522667798	253	51	696	0.696	0.253	0.506
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.030486688514712	0.0559188218068184	NA	NA	0.0461930345558057	0.574292309230088	246	48	706	0.706	0.246	0.492
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0499664439235005	0.0725641058409195	0.688583471737951	-0.022597661917419	0.0295106749449808	0.0538144059789393	NA	NA	0.0463117639444188	0.625587755010494	306	52	642	0.642	0.306	0.612
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.0498108321742552	0.0714826348532436	0.696824232577865	-0.0216718026789884	0.0310697234051079	0.0527321677731989	NA	NA	0.0459213824095442	0.63697481587214	300	47	653	0.653	0.3	0.6
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0493497606808473	0.071696340510766	0.688316311952309	-0.0223465798299186	0.0306043654495	0.0502283898155358	NA	NA	0.0432159533656937	0.605092647444321	302	40	658	0.658	0.302	0.604
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0495536228075988	0.108952531416164	0.454818462347788	-0.0593989086085652	0.0307375649118534	0.0675670926349621	NA	NA	0.0598108744279274	0.320655283106846	132	17	851	0.851	0.132	0.264
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0491475696448996	0.108952531416164	0.451091580948878	-0.0598049617712643	0.0304315022012348	0.0679022880551361	NA	NA	0.062058388294475	0.335202067949674	139	12	849	0.849	0.139	0.278
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.11306631811959	0.425953340236639	-0.0649053422482923	0.0303061263694617	0.0688235265503174	NA	NA	0.0653658985616085	0.32073228408295	126	8	866	0.866	0.126	0.252
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.154888999008431	0.310938647545113	-0.106728023137133	0.0291458305541209	0.0874547880831019	NA	NA	0.0852317007382473	0.210493202842278	56	6	938	0.938	0.056	0.112
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0485508200337835	0.152908411727716	0.317515691159214	-0.104357591693933	0.0325510104244621	0.0882625107660662	NA	NA	0.082282630982976	0.204697211083069	63	3	934	0.934	0.063	0.126
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0599719947335073	0.154888999008431	0.387193377950896	-0.0949170042749234	0.0318968664447055	0.0869374440893253	NA	NA	0.0841041151944718	0.259081163974288	73	1	926	0.926	0.073	0.146
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0316921370832385	0.0870181152260325	NaN	NaN	0.0790089863333536	0.246917745824277	65	2	933	0.933	0.065	0.13
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.6666666666667	4	29.000000000000004	0.0593194416279121	0.152421181209951	0.389181091217257	-0.0931017395820392	0.0308251293847614	0.083279678231914	NA	NA	0.0841782991013654	0.26872373880717	71	1	928	0.928	0.071	0.142
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.33333333333337	3	29.66666666666667	0.0472597258715505	0.108623210908842	0.435079440905236	-0.0613634850372915	0.0292368427968575	0.0672096707035728	NA	NA	0.0682404269269905	0.368532927064758	142	2	856	0.856	0.142	0.284
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.16666666666671	3	30.000000000000004	0.0473530022028017	0.107325632730505	0.441208693562565	-0.0599726305277032	0.0284558765892527	0.0702856902547585	NA	NA	0.0703771111395635	0.394124730421794	175	5	820	0.82	0.175	0.35
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.25000000000006	3	29.58333333333334	0.0467532063321102	0.108952531416164	0.429115374598575	-0.0621993250840537	0.0284324325897312	0.0712925498911873	NA	NA	0.0701713990284641	0.375406648310206	163	5	832	0.832	0.163	0.326
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0288250111216977	0.069639951494335	NA	NA	0.070538049727436	0.369397410746054	142	7	851	0.851	0.142	0.284
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0280601488854321	0.0732934742591841	NA	NA	0.070445824764829107	0.360167385531946	146	8	846	0.846	0.146	0.292
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0270385233898543	0.070118976907683	NA	NA	0.0726274604688169	0.374777816947729	153	3	844	0.844	0.153	0.306
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.037306547425219	0.0698352517377461	NA	NA	0.0737297751150791	0.595205490683819	272	2	726	0.726	0.272	0.544
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0373970176092159	0.0676963974339411	NA	NA	0.072646562454836	0.641161827946084	314	2	684	0.684	0.314	0.628
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0407132728173447	0.0688765759892424	NA	NA	0.0761144578807753	0.6705372493917	334	1	665	0.665	0.334	0.668
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0391295485405284	0.0674747292087721	NA	NA	0.0716442189378268	0.650905354206545	321	1	678	0.678	0.321	0.642
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.038129384438862	0.0689607724927195	NA	NA	0.0762854041183165	0.686021153715457	318	1	681	0.681	0.318	0.636
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.030142755033708	0.0717744375792695	NA	NA	0.065918473307425507	0.398750458116145	157	5	838	0.838	0.157	0.314
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0302952462978404	0.069515581964062	NA	NA	0.0681840679632254	0.420660445981467	178	3	819	0.819	0.178	0.356
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.0316339122374947	0.0684248564664857	NA	NA	0.0690145509591308	0.441935237713491	191	5	804	0.804	0.191	0.382
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0326989751250738	0.0643082744190051	NA	NA	0.0693772393443727	0.478334758309448	216	6	778	0.778	0.216	0.432
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.0288363958233411	0.052761066660558	NA	NA	0.0584903133009437	0.637870523867555	321	12	667	0.667	0.321	0.642
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.0290407687256761	0.0659859630329105	NA	NA	0.0709494044423603	0.373581198928617	164	7	829	0.829	0.164	0.328
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.028901892874144	0.0685761949345608	NA	NA	0.0749461932244724	0.369336585030141	141	5	854	0.854	0.141	0.282
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0260167246354068	0.0687405574442193	NA	NA	0.0771659012194681	0.380046447605802	168	9	823	0.823	0.168	0.336
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.0280191157211401	0.0691311876752702	NA	NA	0.0718529270047502	0.358150639831842	157	9	834	0.834	0.157	0.314
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0280793752994414	0.0633493177886448	NA	NA	0.065267875792158	0.339312187220096	149	0	851	0.851	0.149	0.298
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.16666666666673	3	32.41666666666667	0.0490972805875701	0.0987726497511971	0.497073640438355	-0.049675369163627	0.0305833586536924	0.0636290152856807	NA	NA	0.0711465111919171	0.485044435864918	257	2	741	0.741	0.257	0.514
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.50000000000007	3	32.083333333333336	0.0488971496674064	0.0998703029515669	0.489606501855907	-0.0509731532841605	0.0294247668986911	0.0628014890694557	NaN	NaN	0.074300414117034	0.492687060114143	216	2	782	0.782	0.216	0.432
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.16666666666674	4	31.083333333333332	0.0485017445945919	0.141177857059553	0.343550650256241	-0.0926761124649607	0.0316057445114217	0.0820556571665867	NaN	NaN	0.0863927090094329	0.283391955325639	110	1	889	0.889	0.11	0.22
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000009	4	30.75	0.0483064312987563	0.142863650574837	0.338129615926703	-0.0945572192760804	0.0302239604388877	0.0838544830696115	NA	NA	0.0896023883664611	0.291289065546378	110	0	890	0.89	0.11	0.22
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.00000000000009	4	29.916666666666668	0.0723451996406716	0.147260274111344	0.491274378492403	-0.0749150744706727	0.036954638215954	0.0882562906948198	NaN	NaN	0.0999549763209394	0.453563013084671	191	0	809	0.809	0.191	0.382
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.83333333333341	4	30.083333333333332	0.0724909899460754	0.146359364647636	0.495294511018132	-0.0738683747015606	0.0399922805152518	0.0910740956310082	NaN	NaN	0.0978716822215945	0.450400700933704	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.16666666666674	4	30.083333333333332	0.0739819020881027	0.146359364647636	0.505481164571984	-0.0723774625595333	0.0378106948634818	0.0873480188609204	NA	NA	0.092430239081023	0.433597980717284	180	0	820	0.82	0.18	0.36
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.3333333333334	4	30.583333333333332	0.0747506138799603	0.143721781908901	0.520106367226518	-0.0689711680289405	0.0396432790832068	0.0836034986978302	NaN	NaN	0.0996949888228287	0.489049235681569	219	0	781	0.781	0.219	0.438
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.00000000000007	4	30.25	0.0769906155450624	0.145469445655623	0.529256265451963	-0.0684788301105608	0.0412618996587869	0.0881202336894028	NaN	NaN	0.104996447544768	0.514271256768572	240	0	760	0.76	0.24	0.48
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.00000000000007	4	29.25	0.0779922851430356	0.150978005779684	0.516580443225928	-0.0729857206366479	0.0426666586643336	0.089325434835507	NaN	NaN	0.100668145688038	0.468444016636372	220	0	780	0.78	0.22	0.44
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.50000000000007	5	30.08333333333334	0.092424480317961	0.187892466749351	0.491900936301269	-0.0954679864313903	0.0438999621228343	0.097023687390777	NaN	NaN	0.107385330616592	0.373990930921957	177	0	823	0.823	0.177	0.354
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.50000000000007	5	31.083333333333336	0.0936627429044698	0.181054357970061	0.517318356512345	-0.0873916150655913	0.0454394560918698	0.0978511657611842	NaN	NaN	0.106160366913293	0.410392121084121	162	0	838	0.838	0.162	0.324
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.00000000000007	5	31.583333333333336	0.09429441687774	0.177819473768805	0.530281722688813	-0.0835250568910649	0.0471084881766401	0.0967608772451766	NaN	NaN	0.102337111203029	0.414399689090331	194	0	806	0.806	0.194	0.388
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333341	5	31.75	0.0958020323794969	0.176766832783369	0.541968370824996	-0.080964800403872	0.0472382519756181	0.0932568278010913	NaN	NaN	0.102746887637816	0.430695265887998	188	0	812	0.812	0.188	0.376
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333341	5	31.083333333333332	0.0958020323794969	0.181054357970061	0.529134086876487	-0.0852523255905641	0.0464874586842377	0.0917872435703945	NaN	NaN	0.107921600192274	0.429558822662827	182	0	818	0.818	0.182	0.364
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333341	5	31.583333333333332	0.0964630333665701	0.177819473768805	0.54247733008134	-0.0813564404022348	0.046589645162328	0.0952282124238709	NA	NA	0.101692101140223	0.423695075350187	181	0	819	0.819	0.181	0.362
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.66666666666674	5	31.583333333333332	0.0973587086414928	0.177819473768805	0.54751432212692	-0.0804607651273121	0.0479493292880934	0.0943365447629804	NaN	NaN	0.109955271602168	0.464315647216004	220	0	780	0.78	0.22	0.44
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTGCCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG:TTGCCGCAG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_AY502924.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.50000000000001	1	35.75	0.0451263910998395	0.0285069944752381	1.58299364526265	0.0166193966246014	0.0260916632165365	0.0290962655129386	NA	NA	0.0408181071318767	0.683892346927635	672	16	312	0.312	0.672	0.624
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.33333333333334	1	35.916666666666664	0.045239842675142	0.0283721774047871	1.59451430285745	0.0168676652703549	0.0253274930113536	0.0310392994272912	NA	NA	0.0396659957237093	0.670659940506697	681	14	305	0.305	0.681	0.61
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.66666666666667	1	35.916666666666664	0.0450135072946897	0.0283721774047871	1.58653693202605	0.0166413298899026	0.0251932348800747	0.0307175654085787	NA	NA	0.0410793724563155	0.685402644694812	675	18	307	0.307	0.675	0.614
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.66666666666667	1	36.25	0.0456994132463681	0.0281063333749098	1.62594717129355	0.0175930798714584	0.0261596220618212	0.0298536760681321	NA	NA	0.0407737897834834	0.666119301686956	691	21	288	0.288	0.691	0.576
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	66.66666666666667	1	37.25	0.0464065527885656	0.0273378783823658	1.69751844453665	0.0190686744061999	0.0270533922720111	0.0285859514598402	NA	NA	0.0392551085826986	0.627135298954039	730	14	256	0.256	0.73	0.512
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	66	1	37.916666666666664	0.0468902677360004	0.0268485044068343	1.74647596847385	0.0200417633291662	0.0280546139950536	0.0301443599654011	NA	NA	0.0402041148870087	0.618131457867894	702	14	284	0.284	0.702	0.568
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAT	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	67	1	36.25	0.046168419749575	0.0281063333749098	1.64263403318161	0.0180620863746652	0.0276582122377589	0.02816700929049	NA	NA	0.0406501649943625	0.656804040125596	673	19	308	0.308	0.673	0.616
N	all	ss13	9	AAT	--A	AT-	0	---AAT---:---AATCAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	68	1	37.25	0.0454684663623261	0.0273378783823658	1.66320391532854	0.0181305879799604	0.0258844734221158	0.0282591015707887	NA	NA	0.0413221164957586	0.66083376053104	710	13	277	0.277	0.71	0.554
N	all	ss13	10	---	ATC	AGC	1	AAT---CGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.83333333333334	1	36.416666666666664	0.0449011870069398	0.0279752710599065	1.60503134753504	0.0169259159470333	0.0257752912771009	0.029643776216494	NA	NA	0.0387690379227003	0.662413549231547	704	20	276	0.276	0.704	0.552
N	all	ss13	11	CGA	--C	GAA	1	---CGT---:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	0.75	0.75	1	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.16666666666667	1	36.75	0.0433855884614561	0.0277167798918218	1.56531850491974	0.0156688085696343	0.0249258340671988	0.0286298212247312	NA	NA	0.0382696509122421	0.682222873646349	671	14	315	0.315	0.671	0.63
N	all	ss13	12	---	GAA	ATG	1	CGAAATGCA:CGT---GCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.41666666666667	1	35.75	0.0426150118597229	0.0285069944752381	1.49489669620343	0.0141080173844848	0.0246011669006819	0.0288460156926959	NA	NA	0.0388817275156079	0.716721116834273	665	14	321	0.321	0.665	0.642
N	all	ss13	13	GCA	--G	CAC	1	---GCACCC:AATGCACCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75	1	37.08333333333333	0.0418226808888407	0.0274630224286674	1.52287247324912	0.0143596584601733	0.0237269226827605	0.0292932915885037	NA	NA	0.0399211141386824	0.719070860602499	636	18	346	0.346	0.636	0.692
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666667	1	37.08333333333333	0.0414374651394939	0.0274630224286674	1.50884576696261	0.0139744427108265	0.0238735401039636	0.0281502939633168	NA	NA	0.0391250961661665	0.72096201547055	670	15	315	0.315	0.67	0.63
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333333	1	37.08333333333333	0.0410592825874941	0.0274630224286674	1.49507515766488	0.0135962601588267	0.0245623380384261	0.0293901123176589	NA	NA	0.039140828749482	0.728315086394077	632	10	358	0.358	0.632	0.716
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75	1	37.41666666666666	0.0412475068105866	0.0272138698048234	1.5156795820077	0.0140336370057632	0.024149192358246	0.0284300435507904	NA	NA	0.0394851917267494	0.722278569149523	644	13	343	0.343	0.644	0.686
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76	1	36.58333333333333	0.0545695157118212	0.02784542552167	1.9597299983566	0.0267240901901512	0.0279819433424828	0.0290930014610885	NA	NA	0.0397127003869088	0.50098825728511	778	2	220	0.22	0.778	0.44
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666666	1	36.58333333333333	0.054077470426008	0.02784542552167	1.94205940160345	0.0262320449043379	0.0278360623159874	0.0293561439944822	NA	NA	0.0409852753361599	0.522149302728246	730	4	266	0.266	0.73	0.532
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666666	1	36.58333333333333	0.0544456664773409	0.02784542552167	1.95528225758195	0.0266002409556709	0.0262182647363257	0.0295376178652046	NA	NA	0.0406527510277062	0.512900388545177	746	7	247	0.247	0.746	0.494
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.49999999999999	1	36.75	0.0549444688504895	0.0277167798918218	1.98235397708308	0.0272276889586676	0.0275815155543746	0.0283581819937093	NA	NA	0.0395987772728514	0.491711552998781	749	1	250	0.25	0.749	0.5
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.99999999999999	1	36.25	0.0545695157118212	0.0281063333749098	1.9415380506564	0.0264631823369115	0.0271070077865417	0.0289449706961254	NA	NA	0.0400521539887483	0.508793125943081	753	5	242	0.242	0.753	0.484
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.99999999999999	1	35.916666666666664	0.053834761795598	0.0283721774047871	1.8974490758159	0.0254625843908109	0.0270985625934692	0.0285040078405009	NA	NA	0.0401268586574222	0.525720545041775	747	5	248	0.248	0.747	0.496
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA:TCAGATTCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.66666666666666	1	35.25	0.0526531940049364	0.0289192452027623	1.82069738113037	0.0237339488021741	0.0263190695274564	0.0305230531066002	NA	NA	0.0401472866493017	0.554405230622229	730	7	263	0.263	0.73	0.526
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT:GATTCGACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333333	1	35.916666666666664	0.0535942229866087	0.0283721774047871	1.88897109382821	0.0252220455818216	0.0273103909427707	0.030285243490659	NA	NA	0.0406896373537814	0.535347260574426	729	7	264	0.264	0.729	0.528
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGGC:TCGACTGAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.41666666666667	1	35.83333333333333	0.0535344239114693	0.0284394261467203	1.88240169247026	0.0250949977647491	0.0261571796120148	0.0293053573532847	NA	NA	0.0413218198103346	0.543647718140327	742	4	254	0.254	0.742	0.508
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.41666666666667	1	35.83333333333333	0.0535344239114693	0.0284394261467203	1.88240169247026	0.0250949977647491	0.0272148834004382	0.0297688891302764	NA	NA	0.0408581528850565	0.539084462831171	750	6	244	0.244	0.75	0.488
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666667	1	35.166666666666664	0.0392674190316604	0.0289891158257093	1.35455731964186	0.0102783032059511	0.0233608379164973	0.0294851436912742	NA	NA	0.037788582247005	0.785625909108995	625	21	354	0.354	0.625	0.708
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75	1	35.166666666666664	0.0261749574292545	0.0289891158257093	0.902923620941929	-0.00281415839645487	0.0189783200756354	0.0305325855254079	NA	NA	0.0353311574552383	0.936514913526778	491	37	472	0.472	0.491	0.944
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333334	1	35.33333333333333	0.0262321821040851	0.028849710620847	0.909270198541592	-0.00261752851676198	0.0180089493120094	0.0289289054818477	NA	NA	0.0351984782113616	0.940720100381222	481	31	488	0.488	0.481	0.962
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666667	1	34.5	0.0259485340559256	0.0295604764056575	0.877811767978118	-0.00361194234973184	0.0176079534722529	0.0302710067861175	NA	NA	0.0347322387110084	0.917174157648807	448	47	505	0.505	0.448	0.896
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGAC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666667	1	35.166666666666664	0.0397883346582442	0.0289891158257093	1.37252667164679	0.0107992188325349	0.0229750936243882	0.030868168460696	NA	NA	0.0375727608036726	0.773789609671246	655	12	333	0.333	0.655	0.666
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGACCGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75	2	36.166666666666664	0.0540165882431453	0.0574443341110379	0.940329260997841	-0.00342774586789255	0.0266002438183284	0.0414472499862583	NA	NA	0.0423522421215086	0.935494262094693	489	6	505	0.505	0.489	0.978
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GACCGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333333	2	36.08333333333333	0.0400986359257937	0.0575822255219405	0.696371763375401	-0.0174835895961468	0.0240100597178527	0.0421995125326964	NA	NA	0.0406977320265279	0.667489427372475	344	13	643	0.643	0.344	0.688
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGA:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666667	2	35.416666666666664	0.0393963647100293	0.0587096677913667	0.671037091370198	-0.0193133030813374	0.0237658657768987	0.0414594561963134	NA	NA	0.0383529759843287	0.614565503447847	327	13	660	0.66	0.327	0.654
N	all	ss13	35	GGA	GTG	GAG	2	AGTGGAGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666667	2	35.416666666666664	0.0393963647100293	0.0587096677913667	0.671037091370198	-0.0193133030813374	0.0217788785249018	0.0424978126027434	NA	NA	0.0412417388149154	0.639573591477403	310	22	668	0.668	0.31	0.62
N	all	ss13	36	GCA	GAG	CAA	2	GGAGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79	2	35.08333333333333	0.0389698041980333	0.0592901175479514	0.657273181597526	-0.020320313349918	0.0215602427735891	0.042408064237613	NA	NA	0.0427337933999735	0.634424053406828	319	22	659	0.659	0.319	0.638
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.33333333333334	2	34.74999999999999	0.0388017557993917	0.0598821656332629	0.647968479246822	-0.0210804098338712	0.0222248045134843	0.0423015140384092	NA	NA	0.0405872690102393	0.603492441963337	291	17	692	0.692	0.291	0.582
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333334	2	35.33333333333333	0.039054375562259	0.0588537115811214	0.663583901729429	-0.0197993360188624	0.0214996473957931	0.0417379649876542	NA	NA	0.0409375840999995	0.628636477482759	317	22	661	0.661	0.317	0.634
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.5	1	35.666666666666664	0.0392246245521367	0.0285748846742028	1.37269581310151	0.0106497398779339	0.0230964339090952	0.0295662011010852	NA	NA	0.0255874796790097	0.67725705889734	624	43	333	0.333	0.624	0.666
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGA:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333334	1	35.666666666666664	0.0398323689854613	0.0285748846742028	1.39396429555573	0.0112574843112585	0.0242084101944716	0.0290361912709202	NA	NA	0.0254908933217756	0.658758643874916	648	36	316	0.316	0.648	0.632
N	all	ss13	41	CGA	AAC	GAA	2	CAACGAAGG:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.33333333333334	1	36.166666666666664	0.0403684875103351	0.0281723261817364	1.43291282551262	0.0121961613285987	0.0247790939300802	0.0286398658893409	NA	NA	0.0251874921752514	0.628233298035641	667	39	294	0.294	0.667	0.588
N	all	ss13	42	AGG	GAA	GGC	2	CGAAGGCCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1.5	0.833333333333333	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333334	1	36.666666666666664	0.0405047802473168	0.0277809537602618	1.45800538731882	0.012723826487055	0.0227169687048468	0.028262342424317	NA	NA	0.0242923158697887	0.600431643419869	676	47	277	0.277	0.676	0.554
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	AGGCCCCAG:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	1	37.166666666666664	0.0407801460981609	0.027400307499342	1.48830979722181	0.013379838598819	0.0251110828747555	0.0284720523192849	NA	NA	0.0245470956493097	0.585706686733565	670	44	286	0.286	0.67	0.572
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT:CCCCAGGGA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	1	36.666666666666664	0.0404138163712346	0.0277809537602618	1.45473106215104	0.0126328626109728	0.0229200059214813	0.0276111484154118	NA	NA	0.0251144667874346	0.614956270821862	664	52	284	0.284	0.664	0.568
N	all	ss13	45	GGA	AAG	GAT	2	CAAGGTTTA:CAGGGATTA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	1	35.49999999999999	0.0404138163712346	0.0287116399282627	1.40757603787907	0.0117021764429719	0.0229733403625197	0.0296076132139273	NA	NA	0.0258271844789064	0.650480104427416	663	51	286	0.286	0.663	0.572
N	all	ss13	46	TTA	GAT	TAC	2	GGATTACCC:GGTTTACCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	35.41666666666666	0.0402781342288958	0.0587096677913667	0.686056244978766	-0.0184315335624709	0.0231291887553243	0.0426509806381146	NA	NA	0.043476339129849	0.671606646708054	325	21	654	0.654	0.325	0.65
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666667	2	35.41666666666666	0.0404592471687861	0.0587096677913667	0.689141136219062	-0.0182504206225806	0.0248374045808516	0.0424004096611897	NA	NA	0.042621575870282	0.668507876203783	354	15	631	0.631	0.354	0.708
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666667	2	35.41666666666666	0.0404592471687861	0.0587096677913667	0.689141136219062	-0.0182504206225806	0.0237615283641576	0.0442476745940292	NA	NA	0.0402708319409534	0.65041046121952	327	13	660	0.66	0.327	0.654
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5	2	35.41666666666666	0.0408264049162628	0.0587096677913667	0.69539492305331	-0.0178832628751039	0.0223517740347418	0.043823546734368	NA	NA	0.0430062398480552	0.677534776388524	369	15	616	0.616	0.369	0.738
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666667	2	35.74999999999999	0.0410124947055404	0.0581404786806199	0.705403457904641	-0.0171279839750796	0.0233347158521649	0.0438011238153793	NA	NA	0.0414826382141527	0.679683366671123	367	10	623	0.623	0.367	0.734
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666667	2	35.74999999999999	0.0410124947055404	0.0581404786806199	0.705403457904641	-0.0171279839750796	0.0236330244013262	0.0433990772581361	NA	NA	0.040553840766791	0.672768320038945	336	14	650	0.65	0.336	0.672
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333334	2	35.74999999999999	0.040641996635402	0.0581404786806199	0.699030994544413	-0.0174984820452179	0.0241540132381396	0.0462110927266495	NA	NA	0.0419050074530857	0.676257903539892	348	17	635	0.635	0.348	0.696
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000001	2	35.08333333333332	0.0408264049162628	0.0592901175479514	0.688587012553047	-0.0184637126316885	0.0235858578025088	0.0461642876801323	NA	NA	0.0414124862386961	0.655706375406165	321	17	662	0.662	0.321	0.642
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666669	2	34.08333333333332	0.0410124947055404	0.0611024764460933	0.671208387792973	-0.0200899817405529	0.024217422085314	0.0468371725883246	NA	NA	0.0449725292708468	0.655079592365892	299	12	689	0.689	0.299	0.598
N	all	ss13	55	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000001	2	33.41666666666666	0.0402781342288958	0.062373587449531503	0.645756254784706	-0.0220954532206357	0.0245504071017584	0.046621200257865	NA	NA	0.0456300989855427	0.628222797723132	291	18	691	0.691	0.291	0.582
N	all	ss13	56	GCT	CCG	CTC	2	ACCGCTCTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333332	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.636191462016759	-0.0229305594027305	0.0237560386100254	0.0505031872702945	NA	NA	0.0450435655129061	0.610699556692712	337	12	651	0.651	0.337	0.674
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	33.08333333333332	0.0397443976053828	0.0630291953285242	0.630571236047435	-0.0232847977231415	0.0231895964607185	0.0477289798874416	NA	NA	0.0446585570878885	0.602090864214838	285	22	693	0.693	0.285	0.57
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	33.08333333333332	0.0397443976053828	0.0630291953285242	0.630571236047435	-0.0232847977231415	0.0235167000268854	0.0454542432769376	NA	NA	0.0457917225224805	0.611107227991362	300	15	685	0.685	0.3	0.6
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333334	2	32.33333333333332	0.0394395350433882	0.0645559565784323	0.610935646123857	-0.0251164215350441	0.0229486642499042	0.04556573797499	NA	NA	0.0443231503633915	0.570941136919186	259	14	727	0.727	0.259	0.518
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAACATGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333334	2	31.666666666666657	0.0389276557511925	0.0659765797094679	0.59002233705677	-0.0270489239582754	0.0220170033852281	0.0464367342815161	NA	NA	0.0471804938515908	0.566436608876528	273	13	714	0.714	0.273	0.546
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG:CATGGTAAG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000001	2	32.33333333333332	0.0396131668795608	0.0645559565784323	0.613625279201505	-0.0249427896988715	0.0224766218272695	0.0502733386126262	NA	NA	0.0471844934556677	0.597067278093143	277	15	708	0.708	0.277	0.554
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGTAAGGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333334	2	33.16666666666666	0.0397005575048303	0.0628640039123036	0.631530844904713	-0.0231634464074733	0.0230018473291528	0.0492036782348474	NA	NA	0.0466321389289075	0.619381520250209	326	8	666	0.666	0.326	0.652
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	2	32.83333333333333	0.0398765009105086	0.0635300231041221	0.627679622359861	-0.0236535221936135	0.0232380518746944	0.0506892250973764	NA	NA	0.0435785690745977	0.587282130955881	294	11	695	0.695	0.294	0.588
N	all	ss13	64	GAC	AAG	ACC	2	GAAGACCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	2	33.16666666666666	0.0404138163712346	0.0628640039123036	0.642876906593678	-0.022450187541069	0.0228101738509856	0.0455912059801168	NA	NA	0.0436738471308872	0.607222693672197	282	18	700	0.7	0.282	0.564
N	all	ss13	65	CTT	ACC	TTA	2	GACCTTAAA:GACCTTAGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333336	2	34	0.0413422677171007	0.0612585232607003	0.674881886087243	-0.0199162555435997	0.0237184121895958	0.0440701598443834	NA	NA	0.0441038811916874	0.651574441841053	322	13	665	0.665	0.322	0.644
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666669	2	33.166666666666664	0.0408727688266098	0.0628640039123036	0.650177626032666	-0.0219912350856938	0.0235030487831615	0.0491974759589982	NA	NA	0.0481793400073434	0.648069770351524	317	18	665	0.665	0.317	0.634
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333334	2	33.333333333333336	0.0272138698048234	0.0625362067042883	0.435169819837461	-0.0353223368994649	0.0194243319001594	0.0472123250988337	NA	NA	0.0419114573482996	0.399348841156191	177	44	779	0.779	0.177	0.354
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	2	34	0.0277167798918218	0.0612585232607003	0.452455893751575	-0.0335417433688785	0.0207617672589076	0.0440997370799185	NA	NA	0.0402511267394667	0.404668840095282	181	30	789	0.789	0.181	0.362
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	2	34	0.0277167798918218	0.0612585232607003	0.452455893751575	-0.0335417433688785	0.0192712784601921	0.0477455891642341	NA	NA	0.0425573154915216	0.430606289475143	173	40	787	0.787	0.173	0.346
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666669	2	34	0.0272757331281561	0.0612585232607003	0.445256132147974	-0.0339827901325442	0.0194078064230316	0.0424876422386088	NA	NA	0.0404788318093973	0.401177553485085	166	36	798	0.798	0.166	0.332
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGACAAGGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000001	2	34.166666666666664	0.0273378783823658	0.0609472230590743	0.448550024270474	-0.0336093446767085	0.0203018967259122	0.0431254621143479	NA	NA	0.0417963297137416	0.421326569379966	179	68	753	0.753	0.179	0.358
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAAGGTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.83333333333334	2	35.166666666666664	0.0279752710599065	0.0591439311842398	0.473003239719736	-0.0311686601243332	0.0211688051163039	0.0426486995909362	NA	NA	0.0411245389864288	0.448505434280841	203	51	746	0.746	0.203	0.406
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA:GGTGTTCCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.83333333333334	2	35.166666666666664	0.0279752710599065	0.0591439311842398	0.473003239719736	-0.0311686601243332	0.0196117983253245	0.0442798714873208	NA	NA	0.0387043277367772	0.4206456129426	173	55	772	0.772	0.173	0.346
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATT:GTTCCGATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	2	34.5	0.0277167798918218	0.0603340239140544	0.459388883647215	-0.0326172440222326	0.0199152229203629	0.0446615230492777	NA	NA	0.0396911622931142	0.411204403490311	191	42	767	0.767	0.191	0.382
N	all	ss13	75	ATT	CAA	TTA	2	CCAATTAAC:CCGATTAAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333334	2	34.916666666666664	0.0278777737612569	0.059584670169267	0.467868223186639	-0.0317068964080101	0.0199863514556621	0.0422600149162682	NA	NA	0.040466105930301	0.433308858894244	182	49	769	0.769	0.182	0.364
N	all	ss13	76	AAC	TTA	ACA	2	ATTAACACC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333334	2	33.916666666666664	0.0274944876870936	0.0614153696041381	0.447680895911128	-0.0339208819170445	0.0206167435296545	0.0454713411852142	NA	NA	0.039949084856693	0.395824063153639	167	40	793	0.793	0.167	0.334
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.41666666666669	2	34.916666666666664	0.0281392910819376	0.059584670169267	0.472257226598721	-0.0314453790873294	0.0201868519300273	0.0456491112316331	NA	NA	0.0394730394912617	0.425666366320671	165	50	785	0.785	0.165	0.33
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333336	2	34.916666666666664	0.0278777737612569	0.059584670169267	0.467868223186639	-0.0317068964080101	0.02053019896283	0.0441370924127307	NA	NA	0.0373642354906172	0.396109774051217	187	38	775	0.775	0.187	0.374
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333336	2	34.916666666666664	0.0278777737612569	0.059584670169267	0.467868223186639	-0.0317068964080101	0.0198252018311061	0.0454266902185487	NA	NA	0.040006663245173	0.428045651901665	185	49	766	0.766	0.185	0.37
N	all	ss13	80	ACC	GCA	CCA	2	AGCAGTCCA:AGTACCAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333336	2	34.666666666666664	0.0420670999882827	0.0600320307551523	0.700744243683148	-0.0179649307668696	0.024139548960134	0.0467923059802443	NA	NA	0.0433046617537301	0.678251852306564	322	16	662	0.662	0.322	0.644
N	all	ss13	81	AAA	CCA	AAG	2	ACCAAAGAT:AGTCCAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333336	2	34.33333333333333	0.0277809537602618	0.0606390724718212	0.458136192191455	-0.0328581187115594	0.0191442525349732	0.0455235543511461	NA	NA	0.0404475323980883	0.416582803914944	161	54	785	0.785	0.161	0.322
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000003	1	34.33333333333333	0.0138252762666285	0.0297068535712844	0.465390123981103	-0.0158815773046559	0.0134182273846664	0.0288432235417117	NA	NA	0.0358074824783002	0.657384755351659	276	122	602	0.602	0.276	0.552
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000003	1	35	0.0140190997591144	0.0291298749871979	0.481261926639766	-0.0151107752280835	0.0134998360367465	0.0305468519167951	NA	NA	0.0352387377022502	0.668060424537307	305	139	556	0.556	0.305	0.61
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.33333333333336	1	36	0.0141513632282871	0.0283052459871352	0.499955493575958	-0.0141538827588481	0.0142912864080794	0.0313463050336623	NA	NA	0.0316814914689337	0.655051554519336	296	130	574	0.574	0.296	0.592
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.33333333333334	1	36.33333333333333	0.014354505158023	0.0280406490537152	0.511917720967345	-0.0136861438956922	0.014467054737523	0.0312111225206643	NA	NA	0.0335027581590848	0.682900776723918	284	121	595	0.595	0.284	0.568
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.16666666666669	1	35.99999999999999	0.0143889305410115	0.0283052459871353	0.50834854244161	-0.0139163154461239	0.0137945665072093	0.0300040713865221	NA	NA	0.0319637268931163	0.663287804968046	264	131	605	0.605	0.264	0.528
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.83333333333334	1	36.33333333333333	0.0144582790694273	0.0280406490537152	0.515618559389646	-0.0135823699842879	0.0145768220962033	0.0300049689806389	NA	NA	0.0342090919768783	0.691338134154581	326	114	560	0.56	0.326	0.652
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.16666666666667	1	36.66666666666666	0.0143889305410115	0.0277809537602618	0.517942280354447	-0.0133920232192504	0.0144227878138874	0.0299251296527245	NA	NA	0.0325835078373821	0.68106800017621	323	119	558	0.558	0.323	0.646
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.66666666666667	1	36.16666666666666	0.0142861462280209	0.0281723261817365	0.507098566723335	-0.0138861799537156	0.0147929154465198	0.0301845692919515	NA	NA	0.034315913376804	0.685729538290136	290	118	592	0.592	0.29	0.58
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.33333333333334	1	35.99999999999999	0.0141513632282871	0.0283052459871353	0.499955493575957	-0.014153882758848201	0.0144610538726248	0.0318583582338237	NA	NA	0.0312396309366066	0.650495036874879	284	131	585	0.585	0.284	0.568
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.66666666666667	1	36.16666666666666	0.0144932046198021	0.0281723261817365	0.514448275456847	-0.0136791215619343	0.0143151787059651	0.0303681100945481	NA	NA	0.0352331307728897	0.697834005785631	307	126	567	0.567	0.307	0.614
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.00000000000001	1	35.49999999999999	0.0144235214459157	0.0287116399282627	0.502357980315772	-0.014288118482347	0.0143160651937804	0.0303130618132352	NA	NA	0.0341409970751165	0.675579205536162	315	148	537	0.537	0.315	0.63
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.33333333333334	1	35.16666666666666	0.014354505158023	0.0289891158257094	0.495168781425632	-0.0146346106676864	0.0136984023647732	0.0311451694902687	NA	NA	0.0351291641659078	0.676975156107415	285	139	576	0.576	0.285	0.57
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:AGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.33333333333334	1	34.99999999999999	0.014354505158023	0.0291298749871979	0.492776064584266	-0.0147753698291749	0.0142536914973874	0.0303539323122158	NA	NA	0.0331512304912518	0.655816876064708	303	124	573	0.573	0.303	0.606
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.00000000000001	1	35.49999999999999	0.0142184353084606	0.0287116399282627	0.495215018855977	-0.0144932046198021	0.0141908302886581	0.0323532864865254	NA	NA	0.034480523232938	0.674244263812073	308	127	565	0.565	0.308	0.616
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.50000000000001	0	35.49999999999999	0.0141180639342267	0	-Inf	0.0141180639342267	0.0136006608266097	0	NA	NA	0.0144888528057496	0.329853661478905	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.83333333333334	0	35.83333333333333	0.0140519332931024	0	-Inf	0.0140519332931024	0.0139743285214014	0	NA	NA	0.0135796886196293	0.300773622320338	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000001	0	36.16666666666666	0.0140190997591144	0	-Inf	0.0140190997591144	0.0135482687065903	0	NA	NA	0.0137403764557091	0.307593323218873	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666669	0	35.499999999999986	0.0138892858254281	0	-Inf	0.0138892858254281	0.0148120360965871	0	NA	NA	0.0138257310429103	0.315091015703853	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000001	0	35.499999999999986	0.0140190997591144	0	-Inf	0.0140190997591144	0.0149625135803219	0	NA	NA	0.0133830253072393	0.294855917646327	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000001	0	35.499999999999986	0.0140190997591144	0	-Inf	0.0140190997591144	0.0137844295550849	0	NA	NA	0.0136298766401371	0.303688074621292	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000001	0	35.499999999999986	0.0140190997591144	0	-Inf	0.0140190997591144	0.0143804310380637	0	NA	NA	0.0140806493122662	0.319430543694639	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.50000000000003	0	35.999999999999986	0.0139215133950447	0	-Inf	0.0139215133950447	0.0139393043434916	0	NA	NA	0.0145564039108211	0.338878209825438	620	380	0	0	0.62	0.001
N	all	ss13	104	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.33333333333336	1	36.83333333333332	0.0281723261817364	0.0276529018562458	1.01878371854755	5.19424325490611e-4	0.0199482421088089	0.0292807345336978	NA	NA	0.020511040945562	0.979796424883132	454	136	410	0.41	0.454	0.82
N	all	ss13	105	CTC	ATC	TCA	2	GATCTCAGT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	1	37.499999999999986	0.0284394261467203	0.0271522864979704	1.04740446624435	0.00128713964874985	0.0196229282881652	0.0283781491015858	NA	NA	0.0204691036525749	0.949860411094776	465	134	401	0.401	0.465	0.802
N	all	ss13	106	AGT	TCA	GTC	2	CTCAGTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000003	1	37.83333333333332	0.0283052459871352	0.0269087157486764	1.05189880674731	0.0013965302384588	0.020613764108672	0.0280328616528731	NA	NA	0.0200294829504513	0.944413554840476	454	122	424	0.424	0.454	0.848
N	all	ss13	107	CCA	GTC	CAA	2	AGTCCAAGA:AGTCCACGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000003	1	37.16666666666666	0.0283052459871352	0.027400307499342	1.03302658146501	9.04938487793265e-4	0.0196626383691316	0.0274823512392111	NA	NA	0.0205285587288224	0.964839096595209	469	135	396	0.396	0.469	0.792
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCACGATGG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.16666666666667	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000003	1	37.16666666666666	0.0283052459871352	0.027400307499342	1.03302658146501	9.04938487793265e-4	0.020472436944935	0.0277223446021667	NA	NA	0.0199643663247113	0.963846121479216	468	129	403	0.403	0.468	0.806
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT:CGATGGTAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.58333333333337	1	37.249999999999986	0.0280734527889724	0.0273378783823658	1.02690678465675	7.35574406606657e-4	0.0199094026776106	0.0283733576641263	NA	NA	0.0197578247678203	0.970301998369289	452	127	421	0.421	0.452	0.842
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.9166666666667	1	37.91666666666666	0.0287460335402285	0.0268485044068343	1.07067541285135	0.00189752913339423	0.0209048001640583	0.0296481328717773	NA	NA	0.0205507291163488	0.926432748671084	477	136	387	0.387	0.477	0.774
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.4166666666667	1	36.91666666666666	0.0285408991973241	0.0275893176123833	1.0344909431364	9.51581584940762e-4	0.0197640401760979	0.0275704701755877	NA	NA	0.0198875974309063	0.961837388961222	460	125	415	0.415	0.46	0.83
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.25000000000004	1	36.08333333333332	0.0286089511947678	0.0282386296527663	1.01311400540873	3.70321542001423e-4	0.0197341428355737	0.0286715949080152	NA	NA	0.0205385392662064	0.98561446712349	432	129	439	0.439	0.432	0.864
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.91666666666671	1	35.41666666666666	0.0283386721709848	0.0287805096612113	0.9846480310659	-4.41837490226492e-4	0.0197900954372677	0.0293746333116333	NA	NA	0.0199197262537176	0.982303652066807	425	119	456	0.456	0.425	0.85
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA:TACCTTGGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.16666666666667	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.41666666666671	1	34.91666666666666	0.0281392910819375	0.0292007684815911	0.963648990939304	-0.00106147739965359	0.0195844291471743	0.0296757778189442	NA	NA	0.0216120401636772	0.960827574081276	435	127	438	0.438	0.435	0.87
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT:CTTGGAACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.41666666666671	1	34.749999999999986	0.0277488297186241	0.0293435958691742	0.945651986291654	-0.00159476615055004	0.0196920625932908	0.0303498946791202	NA	NA	0.0219929481984324	0.942193967841652	348	133	519	0.519	0.348	0.696
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.41666666666671	1	34.749999999999986	0.0277488297186241	0.0293435958691742	0.945651986291654	-0.00159476615055004	0.0195736124921247	0.0297049380646279	NA	NA	0.0217389532532937	0.941519773823986	410	126	464	0.464	0.41	0.82
N	all	ss13	117	GGG	CTG	GGC	2	ACTGGGCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.75000000000006	1	34.41666666666665	0.0276210731371878	0.0296334842053817	0.932089960996607	-0.00201241106819391	0.0194350124276697	0.030334454013803	NA	NA	0.0221140211397782	0.92749132826746306	383	133	484	0.484	0.383	0.766
N	all	ss13	118	CCA	GGC	CAG	2	GGGCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	33.749999999999986	0.0273690573365762	0.0617314855970427	0.443356531466453	-0.0343624282604665	0.0186962934265267	0.0479250935795681	NA	NA	0.0405981254291324	0.397327236054484	146	50	804	0.804	0.146	0.292
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666673	2	33.083333333333314	0.0269995408952429	0.0630291953285242	0.428365628888556	-0.0360296544332813	0.0184761265271326	0.0495805442858828	NA	NA	0.0401034893877099	0.368963305758213	143	48	809	0.809	0.143	0.286
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	2	33.249999999999986	0.0273067703935705	0.0626996766264699	0.435516925489891	-0.0353929062328993	0.0177722269392507	0.0480788595905571	NA	NA	0.0425544477569851	0.405573364726317	149	55	796	0.796	0.149	0.298
N	all	ss13	121	GGA	CTG	GAC	2	GCTGGACTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	2	33.333333333333314	0.0270909813104956	0.0625362067042884	0.433204742311911	-0.0354452253937927	0.0189223738374805	0.0450877226164553	NA	NA	0.0431987524407497	0.411922568066705	151	49	800	0.8	0.151	0.302
N	all	ss13	122	CTT	GAC	TTC	2	GGACTTCCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	2	32.66666666666665	0.0268485044068343	0.0638683562552302	0.420372559762498	-0.0370198518483959	0.0183559479345595	0.0483150351894213	NA	NA	0.0455013925045336	0.415875159216159	131	54	815	0.815	0.131	0.262
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	2	33.333333333333314	0.0268485044068343	0.0625362067042884	0.429327358050215	-0.0356877022974541	0.0192619608888526	0.0467882095336244	NA	NA	0.0432936226739121	0.409759026871822	137	61	802	0.802	0.137	0.274
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	2	33.999999999999986	0.0270909813104956	0.0612585232607004	0.442240195624753	-0.0341675419502048	0.0196841468268541	0.0488595983236418	NA	NA	0.0406031134157257	0.400067581466241	150	39	811	0.811	0.15	0.3
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	2	33.999999999999986	0.0270909813104956	0.0612585232607004	0.442240195624753	-0.0341675419502048	0.0189610646511182	0.0464502752160355	NA	NA	0.0407285060691699	0.401519940839816	149	40	811	0.811	0.149	0.298
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	2	34.499999999999986	0.0270299523623976	0.0603340239140544	0.448005132243486	-0.0333040715516568	0.0185144851133927	0.0449398268668734	NA	NA	0.0419719143860658	0.427495484707086	154	41	805	0.805	0.154	0.308
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	2	33.499999999999986	0.0266694765273651	0.0622118122355633	0.428688308039989	-0.0355423357081982	0.0190754457965214	0.0489161166275983	NA	NA	0.0421117396203118	0.39866904110853	175	44	781	0.781	0.175	0.35
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	2	33.499999999999986	0.0266694765273651	0.0622118122355633	0.428688308039989	-0.0355423357081982	0.0191190823249933	0.0452825104506158	NA	NA	0.0413006323067793	0.389471572107499	152	42	806	0.806	0.152	0.304
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	2	32.999999999999986	0.0266694765273651	0.063195257713305	0.42201705463969	-0.0365257811859399	0.0187817328609235	0.0491713692007374	NA	NA	0.0397048795347555	0.357608401288946	119	50	831	0.831	0.119	0.238
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000007	2	32.91666666666665	0.0133188849757348	0.0633621979772033	0.210202382507733	-0.0500433130014685	0.0139091138678871	0.0494419631773718	NA	NA	0.0408740405749688	0.220827774284921	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666674	2	33.249999999999986	0.0133782811395161	0.0626996766264699	0.213370815597927	-0.0493213954869537	0.013633612779141	0.0464360854195724	NA	NA	0.0412618108227671	0.23195892612723	0	113	887	0.887	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333341	2	33.249999999999986	0.0132600139021293	0.0626996766264699	0.211484566038914	-0.0494396627243406	0.0135113492914133	0.0469492591142665	NA	NA	0.0408094078903964	0.225712609784421	0	119	881	0.881	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666674	2	33.249999999999986	0.0132016609860952	0.0626996766264699	0.210553892721703	-0.0494980156403747	0.0135783387822353	0.0483668933293725	NA	NA	0.0385517176210049	0.199163646009239	0	125	875	0.875	0	0.001
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333341	2	32.58333333333332	0.0132600139021293	0.0640388786228152	0.207061931553016	-0.050778864720686	0.0132911189145331	0.0520129486985894	NA	NA	0.0400474283172106	0.204809314806257	0	135	865	0.865	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666676	2	32.249999999999986	0.0132016609860952	0.0647301776657746	0.203949092404167	-0.0515285166796794	0.0125235740609449	0.0505272997206091	NA	NA	0.0411636626473118	0.210644133401252	0	133	867	0.867	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000009	2	32.91666666666666	0.0133188849757348	0.0633621979772033	0.210202382507733	-0.0500433130014685	0.0133500559777028	0.0488077306091463	NA	NA	0.0424741684050901	0.238714557400615	0	126	874	0.874	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000009	2	32.91666666666666	0.0133188849757348	0.0633621979772033	0.210202382507733	-0.0500433130014685	0.0137046269915355	0.0454057475596577	NA	NA	0.0408205240981133	0.220223101511934	0	140	860	0.86	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666676	2	32.58333333333333	0.0133782811395161	0.0640388786228151	0.208908735243685	-0.050660597483299	0.0132192435316052	0.0484623881226019	NA	NA	0.0400389812552983	0.205770299642876	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666676	2	33.08333333333333	0.0134683754007452	0.0630291953285242	0.213684711196845	-0.049560819927779	0.0136949303486663	0.0472287977736189	NA	NA	0.0416697574219026	0.234293529214957	0	124	876	0.876	0	0.001
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666676	2	33.08333333333333	0.0134683754007452	0.0630291953285242	0.213684711196845	-0.049560819927779	0.0141349464438767	0.045676572459815	NA	NA	0.039648650146593	0.211299480587023	0	131	869	0.869	0	0.001
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333343	2	32.74999999999999	0.0131726767040262	0.0636987401522853	0.206796502921943	-0.0505260634482591	0.0128528038634775	0.0470720329800728	NA	NA	0.041666490678597	0.22527106715151	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.58333333333343	2	33.74999999999999	0.0131726767040262	0.0617314855970427	0.213386679044335	-0.0485588088930166	0.013173158595336	0.0454693681063919	NA	NA	0.0390136715110366	0.213256260238467	0	136	864	0.864	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000009	2	34.08333333333332	0.0132307731029257	0.0611024764460933	0.216534154955215	-0.0478717033431675	0.0130449403453724	0.0453224341149244	NA	NA	0.0384119215763651	0.212664544040474	0	137	863	0.863	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000009	2	34.74999999999999	0.0132307731029257	0.0598821656332629	0.220946803827288	-0.0466513925303372	0.0132070925699954	0.0442373426529718	NA	NA	0.0375987580693488	0.21469090869534	0	120	880	0.88	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666676	2	35.08333333333332	0.0132893842388272	0.0592901175479514	0.224141640941752	-0.0460007333091242	0.0135160863869783	0.0452442780437532	NA	NA	0.0376343513653099	0.221591531069277	0	125	875	0.875	0	0.001
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333343	2	35.74999999999999	0.0135291154422588	0.0581404786806199	0.232697008164958	-0.0446113632383612	0.0129454536331844	0.0435926115787945	NA	NA	0.0352482703186139	0.205644616192377	0	120	880	0.88	0	0.001
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25000000000009	2	35.58333333333332	0.0135904058348962	0.0584236862456271	0.232618081949826	-0.0448332804107309	0.0135971193530115	0.0416957896166467	NA	NA	0.0356272261476963	0.208247344709854	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666676	2	34.58333333333333	0.0133782811395161	0.0601826482875393	0.222294656685723	-0.0468043671480231	0.0134599918201772	0.0459284860711739	NA	NA	0.035522995167679	0.187644480707933	0	111	889	0.889	0	0.001
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666674	2	35.08333333333333	0.0136522540928075	0.0592901175479514	0.230261882712007	-0.0456378634551439	0.0141878108129556	0.044200808699028	NA	NA	0.0375169140357687	0.223809351930275	0	132	868	0.868	0	0.001
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333341	2	34.416666666666664	0.0135291154422588	0.0604861633757489	0.223672897852918	-0.0469570479334901	0.0137827237968949	0.0466635825288064	NA	NA	0.0361313073806291	0.193730498974835	0	140	860	0.86	0	0.001
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCA:CGCAATCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333341	2	34.416666666666664	0.0135291154422588	0.0604861633757489	0.223672897852918	-0.0469570479334901	0.0137258809751188	0.0452205955958657	NA	NA	0.0374750008192528	0.210197239510618	0	113	887	0.887	0	0.001
N	all	ss13	152	CCA	ATC	CAA	2	AATCCAAAC:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333341	2	33.74999999999999	0.0135291154422588	0.0617314855970427	0.219160697517814	-0.048202370154784	0.0135687670078055	0.0469958407277787	NA	NA	0.0395279748067411	0.222673622008745	0	148	852	0.852	0	0.001
N	all	ss13	153	AAC	CAA	ACA	2	CCAAACAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333341	2	33.91666666666666	0.0134382094503063	0.0614153696041381	0.218808574090236	-0.0479771601538318	0.013598230604065	0.045926575894487	NA	NA	0.0372275859761291	0.19748399802791	0	134	866	0.866	0	0.001
N	all	ss13	154	AAC	ACA	ACA	2	AACAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000009	1	34.08333333333333	0	0.0299291581301553	0	-0.0299291581301553	0	0.0317352596211339	NA	NA	0.0300601046149323	0.319423223626467	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000009	1	33.74999999999999	0	0.0302307926160697	0	-0.0302307926160697	0	0.0324397683481998	NA	NA	0.030701955102263	0.32479421971006	0	390	610	0.61	0	0.001
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333341	1	33.74999999999999	0	0.0302307926160697	0	-0.0302307926160697	0	0.0309313099385067	NA	NA	0.031793740059967	0.341685079647892	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333341	1	33.74999999999999	0	0.0302307926160697	0	-0.0302307926160697	0	0.0316303068051982	NA	NA	0.0301664321725796	0.316279114418146	0	400	600	0.6	0	0.001
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333341	1	33.74999999999999	0	0.0302307926160697	0	-0.0302307926160697	0	0.0321003613187516	NA	NA	0.0300492581182381	0.314395736992438	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333341	1	34.74999999999999	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0311515517838723	NA	NA	0.0287912684113845	0.308115690972429	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.91666666666674	1	34.916666666666664	0	0.0292007684815911	0	-0.0292007684815911	0	0.0300429724650018	NA	NA	0.0305229974849099	0.33872834517357	0	366	634	0.634	0	0.001
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000009	1	35.416666666666664	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0304014040085393	NA	NA	0.0303333943712914	0.342719238040807	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.33333333333341	1	35.916666666666664	0.0137618540011474	0.0283721774047871	0.485047509918129	-0.0146103234036397	0.0133097549440471	0.0289028451991255	NA	NA	0.0336542046370269	0.664193533445443	285	137	578	0.578	0.285	0.57
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666674	1	36.08333333333333	0.0137934922285677	0.0282386296527663	0.488461812707559	-0.0144451374241987	0.0128886234970164	0.0293454412420513	NA	NA	0.032258850226818	0.654305949595529	287	111	602	0.602	0.287	0.574
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.50000000000007	1	36.74999999999999	0.0139215133950447	0.0277167798918218	0.502277445265291	-0.0137952664967772	0.0139749433135432	0.0310602274952227	NA	NA	0.0339401124049309	0.684405325490803	291	133	576	0.576	0.291	0.582
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.50000000000007	1	36.74999999999999	0.0139215133950447	0.0277167798918218	0.502277445265291	-0.0137952664967772	0.013534775684721	0.0289799582753814	NA	NA	0.0336997817275254	0.682277147706007	258	117	625	0.625	0.258	0.516
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA:GGAACAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000007	1	36.24999999999999	0.0138252762666285	0.0281063333749098	0.491891848083258	-0.0142810571082813	0.0130539466265529	0.0302048903360753	NA	NA	0.0341588817725491	0.675890514594534	314	141	545	0.545	0.314	0.628
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG:ACAGCTTTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.3333333333334	1	36.916666666666664	0.0139538908732759	0.0275893176123833	0.505771511616247	-0.0136354267391075	0.0136898902545035	0.0275662408555065	NA	NA	0.0344803997743416	0.692507548328801	314	130	556	0.556	0.314	0.628
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA:GCTTTGCCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.3333333333334	0	37.58333333333333	0.0139538908732759	0	-Inf	0.0139538908732759	0.0131751130956514	0	NA	NA	0.0134665523456732	0.300114065355194	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA:TTGCCTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.00000000000007	0	37.58333333333333	0.0140190997591144	0	-Inf	0.0140190997591144	0.0139353931280716	0	NA	NA	0.0139510350691851	0.314955200734017	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC:CCTAAAGGT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666674	0	37.916666666666664	0.0140849209886972	0	-Inf	0.0140849209886972	0.0139355713429596	0	NA	NA	0.0142713861105103	0.323674829778843	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC:AAAGGTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.41666666666674	0	38.49999999999999	0.0143373541664091	0	-Inf	0.0143373541664091	0.0143845417474331	0	NA	NA	0.0148750439468256	0.335119683207137	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC:GGTTTCTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.41666666666674	0	38.49999999999999	0.0143373541664091	0	-Inf	0.0143373541664091	0.0140930444042843	0	NA	NA	0.0141187624592278	0.30987595293127	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.41666666666674	0	38.16666666666666	0.0143373541664091	0	-Inf	0.0143373541664091	0.0145639069733029	0	NA	NA	0.0138424448964388	0.300317378052065	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.91666666666674	0	37.16666666666666	0.0142353027918889	0	-Inf	0.0142353027918889	0.0138911247366724	0	NA	NA	0.0143473494200855	0.321104639932101	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.16666666666674	0	36.16666666666666	0.0141848199798651	0	-Inf	0.0141848199798651	0.0137541509859438	0	NA	NA	0.0141664381878675	0.316682972586709	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.16666666666674	0	36.49999999999999	0.0143889305410115	0	-Inf	0.0143889305410115	0.0143297649606882	0	NA	NA	0.0129317444239238	0.265844653726371	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.8333333333334	0	36.49999999999999	0.0142522103442115	0	-Inf	0.0142522103442115	0.0141202754901273	0	NA	NA	0.0136732875265503	0.297254214996766	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.66666666666673	0	35.91666666666666	0.0142861462280209	0	-Inf	0.0142861462280209	0.0143817273781034	0	NA	NA	0.0142200763532814	0.315067223714277	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.33333333333339	0	35.74999999999999	0.0145635643928261	0	-Inf	0.0145635643928261	0.0142754620521207	0	NA	NA	0.013776542546354	0.290453322212121	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.33333333333339	0	35.41666666666666	0.0145635643928261	0	-Inf	0.0145635643928261	0.0143029570269815	0	NA	NA	0.0137336423962987	0.288949086693816	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.16666666666671	1	34.91666666666666	0.0290593249318817	0.0292007684815911	0.995156170297418	-1.41443549709356e-4	0.0210936649458701	0.0310965538330249	NA	NA	0.0215757655639009	0.994769371411302	417	135	448	0.448	0.417	0.834
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.83333333333337	1	34.58333333333333	0.0292007684815911	0.0294878275056261	0.990265168772428	-2.87059024035034e-4	0.0200994049453768	0.0322490997690782	NA	NA	0.0224237365595225	0.989786104246693	394	133	473	0.473	0.394	0.788
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAAGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.83333333333337	1	34.58333333333333	0.0292007684815911	0.0294878275056261	0.990265168772428	-2.87059024035034e-4	0.0197807104662195	0.0333737187199724	NA	NA	0.022247724001086	0.989705301619411	431	122	447	0.447	0.431	0.862
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT:GCTTCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.50000000000004	1	34.58333333333333	0.0289192452027622	0.0294878275056261	0.980718067387113	-5.68582302863916e-4	0.0203310723089599	0.0310553812820161	NA	NA	0.023025205260565	0.980299114226269	394	121	485	0.485	0.394	0.788
N	all	ss13	185	TCA	CTT	CAC	2	TCTTCACGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.16666666666671	1	34.58333333333333	0.0286430990492924	0.0294878275056261	0.9713533166805	-8.44728456333699e-4	0.0199198591647027	0.0301617253681705	NA	NA	0.0229288161345153	0.970611506800514	402	139	459	0.459	0.402	0.804
N	all	ss13	186	CGC	CAC	GCT	2	TCACGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.83333333333337	1	33.91666666666666	0.0279752710599065	0.0300792190929219	0.930053103223333	-0.00210394803301536	0.0202620650809373	0.0332103230468141	NA	NA	0.0236990464578375	0.929258540403886	414	106	480	0.48	0.414	0.828
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.66666666666671	1	34.08333333333333	0.0280406490537152	0.0299291581301553	0.93690069502699	-0.0018885090764401	0.0185074664719235	0.0319330404598301	NA	NA	0.0231903847894624	0.935096012433003	395	134	471	0.471	0.395	0.79
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.66666666666671	1	34.08333333333333	0.0280406490537152	0.0299291581301553	0.93690069502699	-0.0018885090764401	0.0203048364440232	0.0333564748643031	NA	NA	0.0230064384542655	0.934578237120427	396	155	449	0.449	0.396	0.792
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333339	1	34.08333333333333	0.0277809537602618	0.0299291581301553	0.928223695415973	-0.00214820436989353	0.018782201915935	0.0313901010231726	NA	NA	0.022708614225219	0.924633617946287	395	124	481	0.481	0.395	0.79
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333339	1	34.08333333333333	0.0277809537602618	0.0299291581301553	0.928223695415973	-0.00214820436989353	0.0190499521953778	0.0309570166890929	NA	NA	0.0228931023035145	0.925239183370489	362	132	506	0.506	0.362	0.724
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000004	1	34.74999999999999	0.0422647024133488	0.0293435958691742	1.44033821218716	0.0129211065441746	0.0243200342534887	0.028782415512409	NA	NA	0.0260163809423488	0.619433963915205	661	44	295	0.295	0.661	0.59
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000004	1	33.74999999999999	0.0416773883661081	0.0302307926160697	1.37864027898342	0.0114465957500384	0.0234174599138934	0.0341467685124236	NA	NA	0.0279853581044389	0.682524339421673	607	50	343	0.343	0.607	0.686
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666671	1	32.99999999999999	0.0550074627952335	0.0309322189005369	1.77832256302437	0.0240752438946966	0.0267659187080005	0.0339523060295679	NA	NA	0.0316060110846284	0.446221221702718	768	17	215	0.215	0.768	0.43
N	all	ss13	194	AGT	ACA	GTT	2	AACAGTTCA:AATAGTTCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666671	1	32.24999999999999	0.0544456664773409	0.03166697281676	1.71932021391464	0.0227786936605808	0.0274383467209202	0.0339179085045197	NA	NA	0.0311494119066301	0.464613011579823	771	14	215	0.215	0.771	0.43
N	all	ss13	195	TCA	GTT	CAA	2	AGTTCAAGA:AGTTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333339	2	31.749999999999993	0.0543223783836108	0.0657955896932053	0.825623398724864	-0.0114732113095945	0.0260624487128944	0.0509159715453883	NA	NA	0.0497638427250088	0.817661958330767	456	8	536	0.536	0.456	0.912
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT:TCCAGAAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000006	2	31.749999999999993	0.053834761795598	0.0657955896932053	0.818212315546091	-0.0119608278976073	0.0277177854537326	0.0505820046617465	NA	NA	0.0524890555915027	0.81974513141639	434	7	559	0.559	0.434	0.868
N	all	ss13	197	AAC	GAA	ACT	2	AGAAACTCA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333339	2	31.749999999999993	0.0539558430514737	0.0657955896932053	0.820052579558317	-0.0118397466417317	0.026317120670182	0.0497213739878545	NA	NA	0.0505181003946865	0.814700520964426	427	8	565	0.565	0.427	0.854
N	all	ss13	198	TCA	ACT	CAA	2	AACTCAACT:AATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333339	2	32.08333333333333	0.054693929928504303	0.0650814580158656	0.84039189649333	-0.0103875280873613	0.0277269812134351	0.0512418088849806	NA	NA	0.0500112421703417	0.83546020285907	428	6	566	0.566	0.428	0.856
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333339	2	32.58333333333332	0.0543223783836108	0.0640388786228152	0.848271855345345	-0.00971650023920439	0.0263762267266814	0.0502801342781093	NA	NA	0.0498562163166719	0.845478713686791	433	3	564	0.564	0.433	0.866
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333339	2	33.74999999999999	0.054693929928504303	0.0617314855970427	0.885997305905181	-0.00703755566853841	0.0268643660613702	0.0475911194112577	NA	NA	0.0478842585296488	0.883155597604522	439	9	552	0.552	0.439	0.878
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCAGGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000006	2	33.24999999999999	0.053834761795598	0.0626996766264699	0.858613069351472	-0.00886491483087185	0.0250831048040724	0.0484189792097454	NA	NA	0.0482431052042545	0.854205610366498	430	6	564	0.564	0.43	0.86
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT:GGCAGTAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666671	2	33.58333333333332	0.0540774704260079	0.062050874504436	0.871502148162987	-0.00797340407842809	0.0255589491050419	0.0474937549059097	NA	NA	0.047449694125998	0.866552516036615	438	6	556	0.556	0.438	0.876
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG:AGTAGTAGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666671	2	33.91666666666666	0.0548189130040021	0.0614153696041381	0.892592739526695	-0.00659645660013598	0.0268752851649055	0.0491432889526407	NA	NA	0.0460672645552384	0.886138670297295	434	2	564	0.564	0.434	0.868
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.66666666666671	2	34.249999999999986	0.0555809791152914	0.0607927570603562	0.914269755196487	-0.00521177794506482	0.027646864784551	0.0493078726279158	NA	NA	0.0439863876294644	0.905682464483468	462	6	532	0.532	0.462	0.924
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.33333333333337	2	34.91666666666665	0.0558397336460622	0.059584670169267	0.93714932863493	-0.00374493652320472	0.026875608227644	0.0467410173717893	NA	NA	0.045495214973107	0.934396263282253	463	2	535	0.535	0.463	0.926
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000004	2	34.24999999999998	0.0553246126797069	0.0607927570603562	0.910052699613204	-0.00546814438064935	0.0265470391655023	0.0494845525801746	NA	NA	0.0463929173087938	0.906173888325365	474	5	521	0.521	0.474	0.948
N	all	ss13	207	TCT	CTT	CTC	2	ACTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.1666666666667	2	35.083333333333314	0.0559700169039055	0.0592901175479514	0.94400246143279	-0.00332010064404585	0.027639705074019	0.0460438554384624	NA	NA	0.0465435864041884	0.943132612303727	453	5	542	0.542	0.453	0.906
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.33333333333337	2	35.583333333333314	0.0558397336460622	0.0584236862456271	0.95577217451324	-0.00258395259956484	0.0272209422780115	0.0445387683840499	NA	NA	0.0448925885428214	0.954100261936438	470	8	522	0.522	0.47	0.94
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	2	34.749999999999986	0.054693929928504303	0.0598821656332629	0.913359250623417	-0.00518823570475857	0.0268784431260705	0.0466639080548648	NA	NA	0.0443298061713871	0.906830586964824	468	5	527	0.527	0.468	0.936
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666671	2	33.91666666666665	0.0540774704260079	0.0614153696041381	0.880520149509353	-0.00733789917813025	0.0266034124051394	0.04494054266307	NA	NA	0.04523214342	0.871126676362072	448	5	547	0.547	0.448	0.896
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATTGCT	1:1	FALSE	2.25	0.25	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333339	2	34.249999999999986	0.0543223783836108	0.0607927570603562	0.893566618958876	-0.00647037867674536	0.026702813117144	0.045362368395977	NA	NA	0.0463112605119527	0.888885158770261	476	4	520	0.52	0.476	0.952
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTG	2	ATGGCTGGC:ATTGCTGGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000006	2	34.749999999999986	0.040687942312311	0.0598821656332629	0.679466780835828	-0.0191942233209519	0.022243050477449	0.0462210498010741	NA	NA	0.0459602205030432	0.676219943357344	338	10	652	0.652	0.338	0.676
N	all	ss13	213	GGC	CTG	GCA	2	GCTGGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	2	34.749999999999986	0.0403232602433046	0.0598821656332629	0.673376786174649	-0.0195589053899583	0.0227806094931991	0.0446223909518872	NA	NA	0.0445080089229067	0.660337768478872	326	15	659	0.659	0.326	0.652
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	GGCAATGGC:GGCAATGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.0833333333334	2	34.083333333333314	0.0399650588551815	0.0611024764460933	0.654066106313058	-0.0211374175909117	0.0223054451619464	0.0458490089265658	NA	NA	0.0437059753945024	0.628650157448158	311	21	668	0.668	0.311	0.622
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:AATGGTGGT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333339	2	34.41666666666664	0.0405047802473168	0.0604861633757489	0.669653652781632	-0.019981383128432	0.0231486105216681	0.0468160486848094	NA	NA	0.0448816970507162	0.656174395945788	289	17	694	0.694	0.289	0.578
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333339	2	35.41666666666664	0.0410592825874941	0.0587096677913667	0.6993615214006	-0.0176503852038727	0.0241544440371704	0.0450821118537255	NA	NA	0.0462557573552353	0.702771104069401	332	14	654	0.654	0.332	0.664
N	all	ss13	217	GAT	GTG	ATG	2	GGTGATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000006	2	35.74999999999998	0.0412475068105866	0.0581404786806199	0.709445600494096	-0.0168929718700334	0.0239431308328758	0.0463518133803079	NA	NA	0.0411248124491087	0.681238827414035	352	14	634	0.634	0.352	0.704
N	all	ss13	218	GCT	ATG	CTG	2	GATGCTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000006	2	35.74999999999998	0.0412475068105866	0.0581404786806199	0.709445600494096	-0.0168929718700334	0.0234233658897923	0.0454681798895279	NA	NA	0.04302943192393	0.694621516454685	350	11	639	0.639	0.35	0.7
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	GCTGCCCTT:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.25000000000006	2	35.58333333333331	0.0695747645549367	0.0584236862456271	1.19086570919931	0.0111510783093096	0.0370424737230687	0.0441171812180111	NA	NA	0.0527865723335867	0.832693454503115	570	6	424	0.424	0.57	0.848
N	all	ss13	220	CTT	CCC	TTG	2	GCCCTTGCT:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.91666666666673	2	34.91666666666664	0.0689348268033825	0.059584670169267	1.15692218497734	0.00935015663411556	0.0376946048548836	0.0454549058829888	NA	NA	0.0524929986983797	0.858627183954491	572	5	423	0.423	0.572	0.846
N	all	ss13	221	GCT	TTG	CTT	2	CTTGCTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666673	2	34.583333333333314	0.0679967073757475	0.0601826482875393	1.12983907007339	0.00781405908820818	0.0368558293252231	0.0450903570917205	NA	NA	0.0515400786702293	0.879493508718257	551	9	440	0.44	0.551	0.88
N	all	ss13	222	TTG	CTT	TGC	2	GCTTTGCTA:GCTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.25000000000006	2	34.24999999999998	0.0676896531853505	0.0607927570603562	1.11344930643871	0.00689689612499431	0.0352207162089238	0.04720568226251	NA	NA	0.0498783264106883	0.890023549572692	562	6	432	0.432	0.562	0.864
N	all	ss13	223	CTA	TGC	TAC	2	TTGCTACTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.58333333333339	2	34.583333333333314	0.0683065619163606	0.0601826482875393	1.13498763946058	0.00812391362882137	0.0361640276114278	0.0451744401583164	NA	NA	0.0547033675306298	0.881941498910593	552	5	443	0.443	0.552	0.886
N	all	ss13	224	CTG	TAC	TGC	2	CTACTGCTT:CTGCTGCTT	1:1	FALSE	1.25	1	0	0.75	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.08333333333339	2	35.24999999999998	0.0678428326164385	0.0589984642956841	1.14990844975945	0.00884436832075436	0.0354767537845002	0.04529189662804	NA	NA	0.0525586456521735	0.86636600918179	592	7	401	0.401	0.592	0.802
N	all	ss13	225	CTT	TGC	TTG	2	CTGCTTGAC:CTGCTTGAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.50000000000006	2	35.583333333333314	0.0674611774972046	0.0584236862456271	1.15468882284459	0.00903749125157747	0.0358786965558873	0.0456398663674837	NA	NA	0.0479946825982185	0.850639974316779	577	4	419	0.419	0.577	0.838
N	all	ss13	226	GAC	TTG	ACA	2	CTTGACAGA:CTTGATCGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.00000000000006	2	35.583333333333314	0.0670088252518874	0.0584236862456271	1.14694620551956	0.00858513900626031	0.0376090865199462	0.0423249773805757	NA	NA	0.0528684582427746	0.87100127610404	582	9	409	0.409	0.582	0.818
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GATCGGTTG	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.416666666666667	0.416666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.00000000000006	2	35.91666666666665	0.0679196827842952	0.0578600049104132	1.17386237504573	0.010059677873882	0.0363530155849139	0.0443419221452435	NA	NA	0.0500100183146564	0.840578742896426	589	2	409	0.409	0.589	0.818
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:CGGTTGAAT	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.16666666666673	2	35.99999999999998	0.067766156279967	0.0577207808520962	1.17403394894485	0.0100453754278708	0.0357001829715078	0.0465056957169736	NA	NA	0.0516412205678074	0.845766838871885	541	3	456	0.456	0.541	0.912
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG:TTGAATGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.50000000000007	2	35.99999999999998	0.0665625029345024	0.0577207808520962	1.15318091598695	0.0088417220824062	0.035941612899124	0.0448025573162702	NA	NA	0.0483219507465417	0.854817421114757	578	4	418	0.418	0.578	0.836
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT:AATGCACTT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.8333333333334	2	36.99999999999998	0.0671589333302045	0.0561009098120238	1.19710952202438	0.0110580235181807	0.0374383967669784	0.0436103152952687	NA	NA	0.0492839824090299	0.822466627551233	589	5	406	0.406	0.589	0.812
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG:GCACTTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.8333333333334	1	37.66666666666665	0.0539558430514736	0.0270299523623977	1.99615013478653	0.0269258906890759	0.0336155844995819	0.0293070467375895	NA	NA	0.0448795657328241	0.548533689277551	754	19	227	0.227	0.754	0.454
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.41666666666674	1	37.749999999999986	0.0535344239114693	0.0269691977905829	1.98502099792388	0.0265652261208865	0.0326244779207585	0.02824450774405	NA	NA	0.0453601707915009	0.558110116956301	705	15	280	0.28	0.705	0.56
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666674	1	36.749999999999986	0.0528271104098974	0.0277167798918218	1.9059613207624	0.0251103305180756	0.0326489023648432	0.0285835988937705	NA	NA	0.0451059463958864	0.577734686994793	710	17	273	0.273	0.71	0.546
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000009	1	36.749999999999986	0.0532965566864638	0.0277167798918218	1.92289857965028	0.025579776794642	0.0329259958519454	0.0291574968451082	NA	NA	0.0444925532924696	0.565343608442378	695	19	286	0.286	0.695	0.572
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000009	1	36.749999999999986	0.0532965566864638	0.0277167798918218	1.92289857965028	0.025579776794642	0.0324548613341551	0.0270945435713001	NA	NA	0.0444512451679213	0.564982315633146	711	11	278	0.278	0.711	0.556
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333341	1	36.91666666666665	0.0541384900641951	0.0275893176123833	1.96229898922528	0.0265491724518118	0.0333069032169812	0.0308197669769584	NA	NA	0.0458186344011252	0.562291982991078	701	14	285	0.285	0.701	0.57
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000007	1	36.41666666666665	0.0532965566864638	0.0279752710599065	1.90513101990447	0.0253212856265572	0.0339519293403301	0.0285534421862326	NA	NA	0.0442743902272128	0.567378065727541	732	10	258	0.258	0.732	0.516
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000007	1	36.41666666666665	0.0529436946379863	0.0279752710599065	1.89251766406882	0.0249684235780797	0.0324708591403679	0.0288747208390679	NA	NA	0.0457002794151891	0.584824230999216	703	14	283	0.283	0.703	0.566
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA:AAAGGCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000007	1	35.749999999999986	0.0529436946379863	0.0285069944752382	1.85721769736106	0.0244367001627481	0.0337243223746821	0.0293920550773755	NA	NA	0.0465628849474199	0.59971479370216	697	25	278	0.278	0.697	0.556
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA:GGCTCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000007	1	36.41666666666665	0.0529436946379863	0.0279752710599065	1.89251766406882	0.0249684235780797	0.032051654788352	0.0313846971941549	NA	NA	0.0443039128087605	0.573045772250086	695	17	288	0.288	0.695	0.576
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAA	2	CAACAACAA:TCACAAAAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	1	36.58333333333332	0.0392674190316604	0.02784542552167	1.41019281609116	0.0114219935099904	0.029290281196111	0.0309260362214449	NA	NA	0.0430198717896038	0.790620414719473	594	42	364	0.364	0.594	0.728
N	all	ss13	242	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACAG:CAACAACAA	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	37.08333333333332	0.0395261602343306	0.0274630224286674	1.43925018948646	0.0120631378056632	0.0293048792213604	0.0282620965891379	NA	NA	0.0416454768397887	0.772074358087383	604	42	354	0.354	0.604	0.708
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	AAACAGAGC:CAACAAGGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	1	36.83333333333332	0.026728886585519	0.0276529018562458	0.966585233060519	-9.24015270726799e-4	0.0266668103337183	0.0293965908274916	NA	NA	0.0396812656790931	0.981422192979486	411	119	470	0.47	0.411	0.822
N	all	ss13	244	AGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA:CAGAGCCAA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000007	1	36.58333333333332	0.0272447663451876	0.02784542552167	0.978428802389285	-6.00659176482402e-4	0.0272913278229227	0.0300610325225653	NA	NA	0.0423197141893851	0.988675712922155	384	143	473	0.473	0.384	0.768
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	AGCCAAACA:GGCCAAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666674	0	36.749999999999986	0.0273690573365762	0	-Inf	0.0273690573365762	0.0276456985285574	0	NA	NA	0.0296704809363432	0.356302295867804	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	246	ACA	AAA	CAG	2	CAAACAGTC:CAAACTGTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666674	0	35.749999999999986	0.0269995408952429	0	-Inf	0.0269995408952429	0.027791280361121	0	NA	NA	0.0281611622687333	0.337684227816851	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CAG	TCA	2	ACAGTCACT:ACTGTCACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666674	0	35.749999999999986	0.0269995408952429	0	-Inf	0.0269995408952429	0.028454832370764	0	NA	NA	0.0267499250505193	0.312815697356881	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666674	0	35.749999999999986	0.0269995408952429	0	-Inf	0.0269995408952429	0.0276361619692138	0	NA	NA	0.0287946343012939	0.348419807269936	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666674	0	35.41666666666666	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.0300792479761305	0	NA	NA	0.0299182319220567	0.177728446727017	857	143	0	0	0.857	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000007	0	34.41666666666666	0.0401433603117784	0	-Inf	0.0401433603117784	0.0313248744442052	0	NA	NA	0.0280029413164221	0.151703333391858	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000007	0	34.91666666666666	0.0404138163712345	0	-Inf	0.0404138163712345	0.031560837443808	0	NA	NA	0.0305119114236802	0.185328453350614	884	116	0	0	0.884	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000007	0	34.58333333333332	0.0398765009105086	0	-Inf	0.0398765009105086	0.0325339405361447	0	NA	NA	0.0300474785842863	0.184470188754778	898	102	0	0	0.898	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666674	0	33.91666666666666	0.0390120440358434	0	-Inf	0.0390120440358434	0.0295065195108472	0	NA	NA	0.0292178285194323	0.181806424157713	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000007	0	33.58333333333333	0.0388436318463036	0	-Inf	0.0388436318463036	0.0289925312804199	0	NA	NA	0.0295379521728868	0.188495967862491	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	255	GCT	AGG	CTT	2	GAGGCTTCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333341	0	33.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0295898148255566	0	NA	NA	0.0291212234697799	0.184136329742759	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	256	TCC	CTT	CCA	2	GCTTCCAAG:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000007	0	33.583333333333336	0.0385937229566065	0	-Inf	0.0385937229566065	0.0311332301694917	0	NA	NA	0.0299837570836132	0.198040499594734	849	151	0	0	0.849	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CCA	AGA	2	TCCAAGAAA:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.5833333333334	0	32.75	0.0381842798232054	0	-Inf	0.0381842798232054	0.0297491772352775	0	NA	NA	0.0289532154444756	0.187226983750019	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	258	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.0833333333334	0	31.249999999999996	0.03746876920025	0	-Inf	0.03746876920025	0.0280098895643395	0	NA	NA	0.0282337182971859	0.184477928997748	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AAC	CTC	2	AAACCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000007	0	31.416666666666664	0.0376254440385144	0	-Inf	0.0376254440385144	0.0271847806542852	0	NA	NA	0.0286266449309986	0.188728292363635	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000007	0	31.416666666666664	0.0376254440385144	0	-Inf	0.0376254440385144	0.0274567385806498	0	NA	NA	0.0298068895445235	0.206838354303717	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666674	0	31.416666666666664	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0298956815925461	0	NA	NA	0.0283048695675431	0.184667894234427	896	104	0	0	0.896	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666674	0	31.416666666666664	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0283629674091864	0	NA	NA	0.0278979271966102	0.17834490937884	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000007	0	31.916666666666664	0.0381034317265945	0	-Inf	0.0381034317265945	0.0279923429525801	0	NA	NA	0.0278723165248172	0.171603095918415	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000006	0	32.916666666666664	0.0385937229566065	0	-Inf	0.0385937229566065	0.0293643529285518	0	NA	NA	0.0301535486680504	0.200578021132632	848	152	0	0	0.848	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666673	0	32.25	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0297427980159105	0	NA	NA	0.0288770309750247	0.185132036634008	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	266	ACT	CCA	CTA	2	GCCACTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.41666666666673	0	31.916666666666664	0.0377834349217081	0	-Inf	0.0377834349217081	0.0280801591904713	0	NA	NA	0.0303448952058237	0.21308281089539	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CTA	AAC	2	ACTAAACAA:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000006	0	31.583333333333336	0.037390920168914	0	-Inf	0.037390920168914	0.0288617572032801	0	NA	NA	0.0275093102664119	0.17408016207129	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	268	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333339	0	31.583333333333336	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.0279925098025783	0	NA	NA	0.0281311685958635	0.180147038192173	851	149	0	0	0.851	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AAT	ACA	2	CAATACAAT:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	31.75	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.012041643743151101	0	NA	NA	0.011970614695432	0.304855308511391	666	334	0	0	0.666	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA:TACAATGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666671	0	31.916666666666668	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.013534243818368	0	NA	NA	0.0123005362715797	0.317018188360537	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA:AATGTCACT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000004	0	31.916666666666668	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.0128036105455932	0	NA	NA	0.0124013739341998	0.316981921056527	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666671	0	33.25	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0128929882744496	0	NA	NA	0.0124462251459026	0.31369821568484	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAGGCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333339	0	32.58333333333333	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0127882207637568	0	NA	NA	0.0124148643922781	0.316506081286807	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCTTTC:CAGGCATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333339	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0123428581546087	0	NA	NA	0.0128521880441118	0.333254249685198	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGC:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	32.58333333333333	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.012551762030129	0	NA	NA	0.0118684633347098	0.300711708656612	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGCAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	32.08333333333333	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0130076320844155	0	NA	NA	0.0118194612969305	0.298712211179707	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000006	0	32.416666666666664	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0126129750217411	0	NA	NA	0.0122237421529958	0.312993747899264	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000006	0	32.25	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0116981997445576	0	NA	NA	0.0116558315114898	0.290000728386357	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA:CGTGGTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333339	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0119129479758687	0	NA	NA	0.0128530527475644	0.333286773828945	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA:GGTCCTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333339	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0124029672891549	0	NA	NA	0.0128293030385521	0.332392628347964	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCTGAACAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666673	0	32.08333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0133102683982596	0	NA	NA	0.0126378185037211	0.33010630849753	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333339	0	31.999999999999993	0.0122451699655715	0	-Inf	0.0122451699655715	0.0112260780492865	0	NA	NA	0.0122913027277166	0.319130286713413	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666671	0	32.666666666666664	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0131666879512731	0	NA	NA	0.0122541629826207	0.301604739606226	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000004	0	32.33333333333333	0.012766265677073	0	-Inf	0.012766265677073	0.0132619242904622	0	NA	NA	0.0122137423958101	0.295913060249873	661	339	0	0	0.661	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333337	0	32.33333333333333	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0130553200919891	0	NA	NA	0.0133254231232373	0.333912993619037	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	286	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	32.83333333333333	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0133573629145603	0	NA	NA	0.0127693425264694	0.310165446148904	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ATT	TTG	2	AATTTTGGG	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666671	0	32.83333333333333	0.0130722263514627	0	-Inf	0.0130722263514627	0.0130655465330891	0	NA	NA	0.0127033331640742	0.303461308173817	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666671	0	32.83333333333333	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0137748118653796	0	NA	NA	0.0131631547693305	0.317491517835747	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000004	0	33.49999999999999	0.0132746828245506	0	-Inf	0.0132746828245506	0.0129601152593271	0	NA	NA	0.0135164200497283	0.326043052633534	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAA:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000004	0	33.49999999999999	0.0132746828245506	0	-Inf	0.0132746828245506	0.0135705101828374	0	NA	NA	0.0138711325837217	0.338566929630703	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAATTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000004	0	32.66666666666666	0.0266103300115572	0	-Inf	0.0266103300115572	0.0186277804652709	0	NA	NA	0.0186375884959099	0.15335590322439	889	111	0	0	0.889	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAATTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333337	0	32.33333333333333	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0189911279877027	0	NA	NA	0.0190057000023604	0.163335483016868	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:TTAATCAGA	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333337	0	32.33333333333333	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0183401433928633	0	NA	NA	0.0192544089079506	0.180108779559765	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000004	0	33.33333333333333	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0171508827329794	0	NA	NA	0.0185939285203373	0.168761861303926	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666671	0	33.16666666666666	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.01776799740698	0	NA	NA	0.0185279873097652	0.170871364490836	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333337	0	33.83333333333333	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0187876942479889	0	NA	NA	0.018428562453533	0.161366948175339	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAG:GGAACTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.6666666666667	0	33.66666666666666	0.038635150837581	0	-Inf	0.038635150837581	0.0226925235301321	0	NA	NA	0.0224430277843017	0.0851643451298315	950	50	0	0	0.95	0.001
N	all	ss13	298	GAG	CTG	AGT	2	ACTGAGTAC:ACTGATTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000004	0	33.83333333333332	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0217553877249653	0	NA	NA	0.0218718213729967	0.0766879223038319	958	42	0	0	0.958	0.001
N	all	ss13	299	TAC	AGT	ACA	2	GAGTACAAA:GATTACAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000004	0	33.83333333333332	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0177611171385942	0	NA	NA	0.017630009942615	0.146658415496423	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.33333333333337	0	33.66666666666666	0.0253188599437158	0	-Inf	0.0253188599437158	0.0172759843261856	0	NA	NA	0.0179751643011954	0.158969222709194	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.58333333333337	1	33.41666666666666	0.0381842798232054	0.0305385697640887	1.2503624144215	0.00764571005911674	0.0224666199684672	0.0339007150159732	NA	NA	0.0270425429247513	0.777384614101598	579	42	379	0.379	0.579	0.758
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333337	1	33.74999999999999	0.0386766677741952	0.0302307926160697	1.27937987817217	0.00844587515812559	0.0223162666404138	0.0323057591495758	NA	NA	0.0255256203011896	0.740736375040283	609	48	343	0.343	0.609	0.686
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333337	1	34.08333333333332	0.0391819232689515	0.0299291581301553	1.30915554318494	0.0092527651387962	0.0227807426751629	0.0320822168310794	NA	NA	0.0270554799478991	0.732356705793843	633	41	326	0.326	0.633	0.652
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000004	1	33.08333333333332	0.0388436318463037	0.0308526791703671	1.25900352548999	0.00799095267593656	0.0221048455895017	0.0341065441356656	NA	NA	0.0258108110800104	0.756867349593812	585	46	369	0.369	0.585	0.738
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333337	1	32.08333333333332	0.0394395350433882	0.0318350176854428	1.23887272289541	0.00760451735794539	0.0217188757562359	0.0334368115739217	NA	NA	0.0272100067265719	0.779880300552211	626	43	331	0.331	0.626	0.662
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666671	1	31.416666666666657	0.0395261602343306	0.0325254218363474	1.21523897317021	0.0070007383979832	0.0223479816495508	0.03412374601498	NA	NA	0.0277027664076075	0.80049309253423	598	34	368	0.368	0.598	0.736
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666671	1	31.833333333333325	0.0393963647100293	0.0320904564039067	1.22766607661065	0.00730590830612259	0.0219985312433177	0.0346781084300153	NA	NA	0.0269935543156059	0.786657305867102	573	55	372	0.372	0.573	0.744
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCA:CAATTTGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333337	1	32.16666666666666	0.0395696157178212	0.0317507728699206	1.24625677239208	0.00781884284790063	0.0226212059102804	0.0335699425339305	NA	NA	0.0275348733357114	0.776439915437261	594	44	362	0.362	0.594	0.724
N	all	ss13	309	GCA	TTG	CAC	2	TTTGCACCT:TTTGCCCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333337	1	32.66666666666666	0.0398323689854613	0.0312545223004261	1.27445137707059	0.00857784668503525	0.0230153355885456	0.0321000954635782	NA	NA	0.0253072261376805	0.734648516683897	589	50	361	0.361	0.589	0.722
N	all	ss13	310	CCC	CAC	CCA	2	GCACCTAGC:GCCCCCAGC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000003	1	32.66666666666666	0.0394828001140665	0.0312545223004261	1.26326679174771	0.00822827781364047	0.0221505771346637	0.0343333413539492	NA	NA	0.0272740947707455	0.762889617537531	610	39	351	0.351	0.61	0.702
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCTAGCGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333336	1	32.83333333333333	0.0395696157178212	0.0310925352587596	1.272640374563	0.00847708045906161	0.0225853683323354	0.033060799685359	NA	NA	0.0264928225112968	0.748986149725579	597	39	364	0.364	0.597	0.728
N	all	ss13	312	GCT	GCG	CTT	2	AGCGCTTCA:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333336	1	32.16666666666666	0.0395696157178212	0.0317507728699206	1.24625677239208	0.00781884284790063	0.0221169892121166	0.0333340847586256	NA	NA	0.027053881855421	0.772573712250763	592	49	359	0.359	0.592	0.718
N	all	ss13	313	TCA	CTT	CAG	2	GCTTCAGCG:GCTTCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000003	1	32.16666666666666	0.0392246245521367	0.0317507728699206	1.23539117340027	0.00747385168221611	0.0227036357080849	0.0321206208207766	NA	NA	0.0274950137896628	0.785756034531207	596	38	366	0.366	0.596	0.732
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000003	1	31.166666666666664	0.0387182740539804	0.0327921082603737	1.1807192677748	0.00592616579360671	0.0219401783221729	0.0342938351656124	NA	NA	0.0283674599323665	0.834520706282728	600	30	370	0.37	0.6	0.74
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000003	1	30.83333333333333	0.0382248326940206	0.0331545693783718	1.15292804010769	0.00507026331564888	0.021058673229511	0.0345677594319632	NA	NA	0.0288621437091917	0.860551829770188	557	42	401	0.401	0.557	0.802
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000003	1	31.166666666666664	0.0387182740539804	0.0327921082603737	1.1807192677748	0.00592616579360671	0.0213691755778375	0.0322626534581347	NA	NA	0.0288989790098694	0.837521431475379	561	43	396	0.396	0.561	0.792
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.6666666666667	1	30.499999999999996	0.038635150837581	0.0335251341884302	1.15242345102721	0.00511001664915081	0.0231712422406774	0.0347269674776784	NA	NA	0.0285248952262017	0.857825932513378	539	56	405	0.405	0.539	0.81
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333337	1	29.83333333333333	0.0383061974523115	0.0342916870035713	1.1170694940824	0.00401451044874013	0.0220752780239687	0.0336150866180716	NA	NA	0.0289262863457139	0.889620708700476	539	58	403	0.403	0.539	0.806
N	all	ss13	319	TCG	TGT	CGC	2	ATGTCGCGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333337	1	29.999999999999996	0.0385523838449736	0.034096780557568	1.13067519028322	0.00445560328740551	0.0222793877575966	0.0352448988086582	NA	NA	0.030116001012705	0.882383775828892	570	30	400	0.4	0.57	0.8
N	all	ss13	320	CGC	CGC	GCA	2	TCGCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.6666666666667	1	30.166666666666664	0.038635150837581	0.0339040775760351	1.13954289866568	0.00473107326154591	0.0216402927344178	0.0346142017383893	NA	NA	0.0292623942582046	0.871559756149124	532	42	426	0.426	0.532	0.852
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333337	1	30.166666666666664	0.0383061974523115	0.0339040775760351	1.12984042601967	0.00440211987627636	0.0220196354610262	0.0374860927761407	NA	NA	0.0294032120197071	0.880988990579627	563	44	393	0.393	0.563	0.786
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000003	1	29.666666666666664	0.0379827996140662	0.0344888349313675	1.10130712416501	0.00349396468269865	0.0211885680592178	0.035780651286947	NA	NA	0.0297902442555447	0.90663378871224	519	42	439	0.439	0.519	0.878
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	1	29.666666666666664	0.0376648177342698	0.0344888349313675	1.09208727430841	0.00317598280290231	0.0208771452664928	0.0364904720924653	NA	NA	0.030495332275687	0.917053072107808	532	38	430	0.43	0.532	0.86
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333336	1	29.666666666666664	0.0378231402201689	0.0344888349313675	1.09667781748605	0.00333430528880135	0.0217143434232396	0.0361983643416363	NA	NA	0.0290793332157256	0.908712740874328	565	51	384	0.384	0.565	0.768
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333336	1	30.666666666666664	0.0383061974523115	0.0333388219281254	1.14899673224493	0.00496737552418619	0.0213503356651555	0.0364600754765841	NA	NA	0.0285140095748406	0.861701807196568	609	47	344	0.344	0.609	0.688
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.58333333333336	1	31.083333333333332	0.0381842798232054	0.0328819783981324	1.16125250618662	0.00530230142507306	0.0223416601900192	0.0345930589422478	NA	NA	0.029207579745819	0.85594488402854	537	51	412	0.412	0.537	0.824
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333336	1	31	0.0378231402201689	0.032972342565837	1.14711716780954	0.00485079765433184	0.022531447564381	0.0356650760593277	NA	NA	0.0288549748410851	0.8664970741447	539	43	418	0.418	0.539	0.836
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000001	2	31.333333333333332	0.0379827996140662	0.0667106145123721	0.569366657640695	-0.0287278148983059	0.0202342049654867	0.0532642293462403	NA	NA	0.0449762645844282	0.522996778551962	270	16	714	0.714	0.27	0.54
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	2	31.333333333333332	0.0376648177342698	0.0667106145123721	0.564600071661527	-0.0290457967781023	0.02070489140551	0.05067976415696	NA	NA	0.0464834733202384	0.532061060110255	268	16	716	0.716	0.268	0.536
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.83333333333336	2	30.833333333333332	0.0371209782035218	0.0678428326164385	0.54716138421566	-0.0307218544129167	0.0208774152143792	0.052965794021521	NA	NA	0.0472953025039417	0.515966672792878	215	15	770	0.77	0.215	0.43
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	2	30.833333333333332	0.049707628561966	0.0678428326164385	0.73268798847178	-0.0181352040544725	0.0247024513399206	0.0528942311957539	NA	NA	0.0481678485970958	0.706545075713724	369	5	626	0.626	0.369	0.738
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	31.166666666666668	0.0501230313618422	0.0670837952639451	0.747170477827472	-0.0169607639021029	0.0241419056457036	0.0492365529747751	NA	NA	0.0453769537606395	0.708571835306554	381	5	614	0.614	0.381	0.762
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAC:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.1666666666667	2	30.833333333333332	0.0618907677660026	0.0678428326164385	0.912266858253296	-0.0059520648504359	0.0263292852190983	0.048532860338536	NA	NA	0.0475584643563761	0.900402752080568	486	4	510	0.51	0.486	0.972
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTACACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.83333333333337	2	31.5	0.0613839360781825	0.0663415654213976	0.925271143185655	-0.0049576293432151	0.0260788822692907	0.049763464324573	NA	NA	0.048558039511972	0.918679695578015	504	1	495	0.495	0.504	0.99
N	all	ss13	335	ACA	ACA	CAG	2	TACACAGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.83333333333337	2	31.5	0.0613839360781825	0.0663415654213976	0.925271143185655	-0.0049576293432151	0.0262250959618344	0.048724004193702	NA	NA	0.0475650897715673	0.916988161159904	489	0	511	0.511	0.489	0.978
N	all	ss13	336	GGT	CAG	GTG	2	ACAGGTGCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.00000000000004	2	32	0.0612585232607003	0.0652585327422224	0.938705188219256	-0.00400000948152202	0.0273131757291425	0.0492239062765165	NA	NA	0.0487967794010681	0.934668329361832	495	3	502	0.502	0.495	0.99
N	all	ss13	337	GCC	GTG	CCA	2	GGTGCCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.00000000000004	2	32.166666666666664	0.0612585232607003	0.0649053422482923	0.943813269273873	-0.00364681898759193	0.0255494022551805	0.0473620678697036	NaN	NaN	0.0491039716732025	0.940797702581064	459	3	538	0.538	0.459	0.918
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATCAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.16666666666671	2	31.666666666666668	0.0603947877150659	0.0659765797094679	0.915397372537622	-0.00558179199440197	0.025585004934849	0.0484584016365576	NA	NA	0.0528115383225557	0.915826203745945	508	3	489	0.489	0.508	0.978
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATCAAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.83333333333339	2	31.666666666666668	0.0599120787357042	0.0659765797094679	0.908081003888515	-0.00606450097376364	0.0273290686865851	0.0474080174846959	NA	NA	0.0494880935373104	0.902467688893674	472	1	527	0.527	0.472	0.944
N	all	ss13	340	CTT	AAT	TGG	2	AAATTGGAT:AAGCTTGAT	1:1	TRUE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.33333333333339	2	31.166666666666668	0.0595550832033078	0.0670837952639451	0.887771524687666	-0.00752871206063732	0.025822766195663	0.0510149875531652	NaN	NaN	0.0508069128207433	0.882198482896538	474	3	523	0.523	0.474	0.948
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	CTTGATGAC:TTGGATGAC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.00000000000006	2	30.833333333333332	0.0468902677360004	0.0678428326164385	0.69116022912992	-0.0209525648804381	0.0228672857992983	0.0539948196544144	NA	NA	0.0469419247383066	0.655343878352984	358	10	632	0.632	0.358	0.716
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.16666666666671	2	30.666666666666668	0.0467988043212529	0.068228833654295	0.68590948745182	-0.021430029333042	0.0227742645769007	0.0518757263156631	NA	NA	0.0486506181927789	0.659583466071276	385	5	610	0.61	0.385	0.77
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.83333333333339	2	31.333333333333332	0.0475406642088711	0.0667106145123721	0.712640178124191	-0.019169950303501	0.0229577270781462	0.0517339579890759	NA	NA	0.0478016539084967	0.688397219817987	381	5	614	0.614	0.381	0.762
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.16666666666671	2	31.333333333333332	0.0485017445945919	0.0667106145123721	0.727046886752884	-0.0182088699177802	0.0240691647352251	0.0492507561511019	NA	NA	0.0461017950376059	0.692864324996281	399	7	594	0.594	0.399	0.798
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCAAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333339	2	31	0.049299057062491	0.0674611774972046	0.730776705825122	-0.0181621204347136	0.0239251056567162	0.0515641164555694	NA	NA	0.0493171107809336	0.712670286125922	365	4	631	0.631	0.365	0.73
N	all	ss13	346	AAT	CAA	ATT	2	CCAAATTTC:CCAAGCTTC	1:1	TRUE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000006	2	31.333333333333332	0.049502499478939	0.0667106145123721	0.742048320807452	-0.0172081150334331	0.0247523150373266	0.0508096282549007	NA	NA	0.0471434225677475	0.715099280696413	388	7	605	0.605	0.388	0.776
N	all	ss13	347	TTC	ATT	TCA	2	AATTTCAAA:AGCTTCAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.83333333333339	2	31.333333333333332	0.0371209782035218	0.0667106145123721	0.556447852787166	-0.0295896363088503	0.0214615546044383	0.0493006987185234	NA	NA	0.0466395874845078	0.525799077750917	253	21	726	0.726	0.253	0.506
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.00000000000006	2	31.166666666666668	0.0370445664971823	0.0670837952639451	0.552213337832606	-0.0300392287667628	0.0220628665674693	0.051211051589827	NA	NA	0.0476246750119781	0.528204481282189	261	14	725	0.725	0.261	0.522
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	2	31.499999999999996	0.037507815430996	0.0663415654213976	0.56537428974955	-0.0288337499904016	0.0214306702594705	0.0490642940692168	NA	NA	0.0465394949240396	0.535551180121665	246	11	743	0.743	0.246	0.492
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666671	2	32.166666666666664	0.0381438129251182	0.0649053422482923	0.587683719149048	-0.0267615293231741	0.0219575602960027	0.0503565975383836	NA	NA	0.0439927668463798	0.542977528887476	258	16	726	0.726	0.258	0.516
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.08333333333337	1	31.749999999999996	0.025080706950469	0.0321765161581571	0.77947242104117	-0.00709580920768807	0.0183985083959514	0.0334008756162815	NA	NA	0.0390646069320971	0.855862965111816	410	59	531	0.531	0.41	0.82
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.08333333333337	1	31.416666666666664	0.0247700531384151	0.0325254218363474	0.76155978123962	-0.0077553686979323	0.0172892704924669	0.0335384431821111	NA	NA	0.0389738702370275	0.842271404787878	446	51	503	0.503	0.446	0.892
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	83.41666666666671	1	30.416666666666664	0.0243676255683408	0.0336190735350483	0.724815499241443	-0.00925144796670749	0.0167719339399339	0.0349934194984334	NA	NA	0.0387654948141356	0.811375737842194	452	49	499	0.499	0.452	0.904
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	84.41666666666671	1	30.416666666666664	0.0240742835124902	0.0336190735350483	0.716090034051429	-0.00954479002255806	0.017383652852452	0.0341227281312742	NA	NA	0.0393580107279836	0.80838345722066	422	45	533	0.533	0.422	0.844
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	85.91666666666671	1	31.083333333333332	0.0236472790263048	0.0328819783981324	0.719156211952501	-0.00923469937182754	0.016839750190014	0.0317413488591816	NA	NA	0.0392148403050527	0.813828506216611	444	37	519	0.519	0.444	0.888
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	85.25000000000004	1	32.08333333333333	0.0238351737162288	0.0318350176854428	0.748709297156382	-0.00799984396921394	0.0169470131879286	0.034402455871087	NA	NA	0.0388236668118237	0.836747279136311	436	33	531	0.531	0.436	0.872
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	85.00000000000004	1	32.33333333333333	0.0239064063978367	0.0315836140125951	0.756924346539416	-0.00767720761475842	0.0164711082087705	0.0319909822228962	NA	NA	0.0395334467843842	0.846023001371278	439	48	513	0.513	0.439	0.878
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	85.33333333333339	1	31.999999999999996	0.0238115237359352	0.0319197108140969	0.745981812761887	-0.0081081870781617	0.0162261677066659	0.0340250516973783	NA	NA	0.0385374299435319	0.833357278418707	404	54	542	0.542	0.404	0.808
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	86.33333333333339	1	30.83333333333333	0.0235313419258154	0.0331545693783718	0.709746570895471	-0.00962322745255641	0.0171299420089508	0.0354220364980049	NA	NA	0.0385842056125059	0.803044838735206	419	57	524	0.524	0.419	0.838
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	86.66666666666673	1	30.499999999999993	0.0234394076280783	0.0335251341884302	0.699159248590493	-0.0100857265603519	0.0164629074816203	0.037469686376831	NA	NA	0.0390895903093446	0.796394819066058	429	48	523	0.523	0.429	0.858
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	88.3333333333334	1	29.499999999999993	0.0229903058182518	0.0346882632380668	0.662769008078281	-0.011697957419815	0.0168945178138796	0.037674990148593	NA	NA	0.0393098362152807	0.766021093229944	389	47	564	0.564	0.389	0.778
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	88.3333333333334	1	29.499999999999993	0.0229903058182518	0.0346882632380668	0.662769008078281	-0.011697957419815	0.0161347654815652	0.0372529621419302	NA	NA	0.0396630843148737	0.768044966463823	397	33	570	0.57	0.397	0.794
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	86.66666666666673	1	29.499999999999993	0.0234394076280783	0.0346882632380668	0.67571580240881	-0.0112488556099885	0.0166113168802196	0.0355755606712688	NA	NA	0.0395990298212872	0.776357526246549	384	65	551	0.551	0.384	0.768
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	85.00000000000006	1	30.833333333333332	0.0239064063978367	0.0331545693783718	0.721059173624253	-0.00924816298053505	0.0165997521740538	0.0359727732512802	NA	NA	0.0390280191259623	0.812686160763331	430	48	522	0.522	0.43	0.86
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.66666666666673	1	30.5	0.0245923671172431	0.0335251341884302	0.733550147152883	-0.00893276707118707	0.017361400946311	0.0366502593542678	NA	NA	0.0405674680235617	0.825719032301335	430	38	532	0.532	0.43	0.86
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666673	1	29.5	0.0248985520571968	0.0346882632380668	0.717780301836306	-0.00978971118086996	0.0167590632132777	0.0379377164172608	NA	NA	0.042382004075163	0.817324549413582	388	46	566	0.566	0.388	0.776
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666673	1	30.166666666666664	0.0248985520571968	0.0339040775760351	0.734382228844244	-0.00900552551883829	0.0178175567971561	0.0362797292177591	NA	NA	0.0404763729266958	0.823933662672326	425	39	536	0.536	0.425	0.85
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.66666666666673	1	31.166666666666664	0.0252124580992387	0.0327921082603737	0.768857491535722	-0.00757965016113495	0.0173839375722734	0.034073665621518	NA	NA	0.0403448292254645	0.850977256799516	450	47	503	0.503	0.45	0.9
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666673	1	31.666666666666664	0.0253723983888037	0.0322630388127681	0.786423081100548	-0.00689064042396446	0.0174484650049769	0.0354112400931287	NA	NA	0.0385311511379583	0.858068851605074	441	38	521	0.521	0.441	0.882
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000006	1	31.83333333333333	0.0257536031856687	0.0320904564039067	0.802531533410456	-0.00633685321823806	0.0191773562106926	0.0332784313657356	NA	NA	0.0379419203003087	0.867358590667585	431	44	525	0.525	0.431	0.862
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000006	1	31.16666666666666	0.0257536031856687	0.0327921082603737	0.785359787823999	-0.00703850507470501	0.0186612728513073	0.0349761043532355	NA	NA	0.0409420655098153	0.86350531622964	418	45	537	0.537	0.418	0.836
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000006	1	31.666666666666657	0.0259205062991005	0.0322630388127681	0.803411806603984	-0.00634253251366762	0.0184263327987955	0.0351412274583337	NA	NA	0.0395825087113252	0.87269537787478	460	54	486	0.486	0.46	0.92
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.8333333333334	1	31.666666666666657	0.0261464386246642	0.0322630388127681	0.81041462883889	-0.00611660018810395	0.0187167498633355	0.0345707278761954	NA	NA	0.0388438953801403	0.874877452365297	449	45	506	0.506	0.449	0.898
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAC:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAC	CTG	ACG	2	ACTGACGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ACG	AAA	2	GACGAAAGC:GATGAAACT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAAGCCAG	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:AGCCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAA:AAGAAACAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACAA:AAACAGCAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AAC	AAA	2	CAACAAACT:CAGCAAACT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCT	CTG	CTG	2	CCTGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	ATT	TGG	2	GATTTGGAT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	TTG	AAT	TGC	2	CAATTGCAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	TTGCAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	0	ATGAGC---	2	FALSE	0	0	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	NA	NA	0	AGC------	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	NA	NA	0	------AGT	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	GTG	0	---AGTGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	GTG	CTG	2	AGTGCTGAC:AGTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCC:ACTCAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA:CAGGCTTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410540	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000006	2	34.66666666666666	0	0.0600320307551524	0	-0.0600320307551524	0	0.0457110539784639	NA	NA	0.0461723952594911	0.193542208526546	0	137	863	0.863	0	0.001
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333339	2	34.83333333333333	0	0.0597330472949441	0	-0.0597330472949441	0	0.0428893726854708	NA	NA	0.0480365000620522	0.21368625164718	0	129	871	0.871	0	0.001
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666671	2	34.83333333333333	0	0.0597330472949441	0	-0.0597330472949441	0	0.0450544131641776	NA	NA	0.044387117180474	0.178389810494155	0	126	874	0.874	0	0.001
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCA:AATGGACCC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666671	2	35.16666666666666	0	0.0591439311842398	0	-0.0591439311842398	0	0.0447138817424581	NA	NA	0.0462039339217555	0.200523094828867	0	148	852	0.852	0	0.001
N	all	ss13	6	CCA	GAC	CAC	2	GGACCACAA:GGACCCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.16666666666671	2	36.16666666666666	0	0.0574443341110379	0	-0.0574443341110379	0	0.0460101959037578	NA	NA	0.043535171879675	0.187004505640417	0	147	853	0.853	0	0.001
N	all	ss13	7	CAA	CAC	AA-	0	CCACAA---:CCCCAA---	1:1	FALSE	0.5	0	2.16666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.50000000000006	2	36.83333333333333	0	0.0563645417845084	0	-0.0563645417845084	0	0.0444543877927832	NA	NA	0.0439472507755966	0.199649814477867	0	133	867	0.867	0	0.001
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAT	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000006	2	35.66666666666666	0	0.0582817382454872	0	-0.0582817382454872	0	0.04287576735396	NA	NA	0.0444649327703672	0.189947350654902	0	125	875	0.875	0	0.001
N	all	ss13	9	AAT	--A	ATC	0	---AATCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000006	2	36.66666666666666	0	0.0566306643811089	0	-0.0566306643811089	0	0.0437771120126524	NA	NA	0.0427163331931512	0.184926509442176	0	147	853	0.853	0	0.001
N	all	ss13	10	CAG	ATC	AGC	2	AATCAGCGA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000006	2	36.66666666666666	0	0.0566306643811089	0	-0.0566306643811089	0	0.0436223811641719	NA	NA	0.0414118624258882	0.171469072079133	0	122	878	0.878	0	0.001
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT	2	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666671	2	36.49999999999999	0	0.0568993130810351	0	-0.0568993130810351	0	0.0420837532801072	NA	NA	0.04239369943957	0.179542704934342	0	127	873	0.873	0	0.001
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666671	2	36.49999999999999	0	0.0568993130810351	0	-0.0568993130810351	0	0.0441941464469534	NA	NA	0.0441888443151894	0.197871390571409	0	148	852	0.852	0	0.001
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666671	2	37.499999999999986	0	0.0553246126797069	0	-0.0553246126797069	0	0.043904659087539	NA	NA	0.0408287166442891	0.175404278847601	0	121	879	0.879	0	0.001
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.83333333333339	2	37.999999999999986	0	0.0545695157118212	0	-0.0545695157118212	0	0.0401079512252992	NA	NA	0.0423927466545834	0.198011664274007	0	137	863	0.863	0	0.001
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000004	2	37.999999999999986	0	0.0545695157118212	0	-0.0545695157118212	0	0.0419578580066702	NA	NA	0.040661202966207	0.179578601979034	0	111	889	0.889	0	0.001
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666671	2	38.333333333333314	0	0.054077470426008	0	-0.054077470426008	0	0.0432204733260445	NA	NA	0.0404162667637188	0.180892359687764	0	128	872	0.872	0	0.001
N	all	ss13	17	ACG	TTA	CGT	2	ATTACGTTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.41666666666671	2	37.499999999999986	0.0137460892532251	0.0553246126797069	0.248462457980609	-0.0415785234264817	0.0136543528772215	0.0407247699737771	NA	NA	0.0446571388472186	0.351821975403455	129	58	813	0.813	0.129	0.258
N	all	ss13	18	TTT	CGT	TTG	2	ACGTTTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333337	2	37.499999999999986	0.0136212597557268	0.0553246126797069	0.246206147607123	-0.0417033529239801	0.0131149226232204	0.0428248383716584	NA	NA	0.0437342528518113	0.340305036060801	122	52	826	0.826	0.122	0.244
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.9166666666667	2	37.16666666666666	0.0136522540928075	0.0558397336460622	0.24448995726487	-0.0421874795532548	0.0145257979100899	0.0414353060846932	NA	NA	0.0441258799096591	0.339036302938563	143	45	812	0.812	0.143	0.286
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25000000000003	2	37.33333333333332	0.0137776549513118	0.0555809791152914	0.247884351276591	-0.0418033241639796	0.0138417737683002	0.0424982003860122	NA	NA	0.0452580425142089	0.355660135025836	135	53	812	0.812	0.135	0.27
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.75000000000003	2	36.83333333333332	0.0136833898069031	0.0563645417845084	0.242765919382741	-0.0426811519776053	0.0138645304184023	0.0414824896248529	NA	NA	0.046502806663239	0.358713718183085	133	50	817	0.817	0.133	0.266
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000003	2	36.49999999999999	0.0134986770919624	0.0568993130810351	0.237237962306115	-0.0434006359890727	0.0129276137422785	0.0430184056816345	NA	NA	0.0460467333787831	0.345919043516762	124	41	835	0.835	0.124	0.248
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.4166666666667	2	35.83333333333332	0.0132016609860952	0.0579999025523778	0.227615227011342	-0.0447982415662826	0.0136506265466936	0.0450661565520613	NA	NA	0.0427640786524887	0.29483810523633	125	50	825	0.825	0.125	0.25
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT:GATTCAGCT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.08333333333337	2	36.49999999999999	0.0134382094503063	0.0568993130810351	0.236175249271776	-0.0434611036307288	0.0131147005467099	0.0419378018008451	NA	NA	0.0470648377200277	0.35578293653805	154	43	803	0.803	0.154	0.308
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGGC:TCAGCTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666671	2	36.41666666666666	0.0132453773639628	0.0570345959917882	0.232234087638138	-0.0437892186278255	0.0134954846019657	0.0440424783150226	NA	NA	0.0438058458809265	0.317494230923442	136	59	805	0.805	0.136	0.272
N	all	ss13	26	GGC	CTG	GCA	2	ACTGGCAGT:GCTGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	1	36.74999999999999	0.0133041182530361	0.0277167798918218	0.480002305641633	-0.0144126616387857	0.0140039238638192	0.0292274942355666	NA	NA	0.0316735084418398	0.649081635098707	305	117	578	0.578	0.305	0.61
N	all	ss13	27	AGT	GCA	GTA	2	GGCAGTAAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666671	1	36.08333333333332	0.0130722263514627	0.0282386296527663	0.462919996905096	-0.0151664033013036	0.0119027061406354	0.0302982461543602	NA	NA	0.0332256330320585	0.648054233270267	288	126	586	0.586	0.288	0.576
N	all	ss13	28	AAC	GTA	ACC	2	AGTAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000004	1	36.08333333333332	0.0131871529184001	0.0282386296527663	0.466989832033449	-0.0150514767343662	0.012603602401989	0.0301762604687435	NA	NA	0.0314937552296397	0.632707569951563	299	130	571	0.571	0.299	0.598
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000004	1	36.08333333333332	0.0131871529184001	0.0282386296527663	0.466989832033449	-0.0150514767343662	0.0138010595684147	0.028749845176286	NA	NA	0.0325318320935379	0.643601498451623	248	140	612	0.612	0.248	0.496
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333337	1	35.24999999999999	0.0130438070339019	0.0289192452027623	0.451042443965862	-0.0158754381688604	0.013211371346898	0.0304441530784222	NA	NA	0.0317489192951741	0.617053375878189	274	138	588	0.588	0.274	0.548
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666671	1	35.91666666666666	0.0131582322381821	0.0283721774047871	0.463772379907719	-0.015213945166605	0.0136994273703982	0.0297975413702397	NA	NA	0.034156347408627503	0.656015734669638	295	126	579	0.579	0.295	0.59
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666671	1	36.91666666666666	0.013333684515963	0.0275893176123833	0.483291566079844	-0.0142556330964204	0.0130871023602438	0.0281644112202946	NA	NA	0.0311667967956558	0.647384942245247	298	134	568	0.568	0.298	0.596
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	1	36.74999999999999	0.0133041182530361	0.0277167798918218	0.480002305641633	-0.0144126616387857	0.0146293030208427	0.02882704771843	NA	NA	0.0323441614320453	0.655883903049143	276	141	583	0.583	0.276	0.552
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	1	36.41666666666666	0.0131294381352109	0.0279752710599065	0.469322999841373	-0.0148458329246957	0.0129008931064808	0.0282060677796951	NA	NA	0.0315357659995921	0.637810870127591	287	133	580	0.58	0.287	0.574
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	1	36.41666666666666	0.0131294381352109	0.0279752710599065	0.469322999841373	-0.0148458329246957	0.0129105649841544	0.0289495322956191	NA	NA	0.0321849138017324	0.644607184977685	284	120	596	0.596	0.284	0.568
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	1	36.08333333333332	0.0129873375085957	0.0282386296527663	0.459913872177697	-0.0152512921441706	0.0136551355845462	0.0295915936960937	NA	NA	0.0312461910207709	0.625478414765855	267	131	602	0.602	0.267	0.534
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAC	2	GCACGACCT:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.25	1.25	0.25	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333337	1	35.41666666666666	0.0128758527167741	0.0287805096612113	0.447380983462132	-0.0159046569444372	0.0129709825713567	0.0307348225012154	NA	NA	0.0317336789708424	0.616236205474194	265	136	599	0.599	0.265	0.53
N	all	ss13	38	CCT	GAC	CAA	2	CGACCTAAA:CGATCAAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333337	1	36.16666666666666	0.0129174344873365	0.0281723261817365	0.458515012356723	-0.0152548916943999	0.0133841847185108	0.0274633952327947	NA	NA	0.0333185770126264	0.647060616150025	291	134	575	0.575	0.291	0.582
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCTAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.75000000000004	0	36.49999999999999	0.0129732964431592	0	-Inf	0.0129732964431592	0.0127563443223245	0	NA	NA	0.0133566216587673	0.331398542566614	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333337	0	36.24999999999999	0.0131294381352109	0	-Inf	0.0131294381352109	0.0135764360106234	0	NA	NA	0.0138932933429145	0.344648736777938	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	41	CGT	AAC	GTC	2	CAACGTCGG:CAACGTCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	0	36.74999999999999	0.0133041182530361	0	-Inf	0.0133041182530361	0.0129928357032867	0	NA	NA	0.0130432345857957	0.307727770778605	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	42	CGG	GTC	GGC	2	CGTCGGCCC:CGTCGTCCC	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000003	0	37.08333333333332	0.0133633824875953	0	-Inf	0.0133633824875953	0.013492056152377	0	NA	NA	0.0137136844049747	0.329830160077741	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	CGGCCCCAA:CGTCCCCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000003	0	37.24999999999999	0.0133633824875953	0	-Inf	0.0133633824875953	0.0132999326994825	0	NA	NA	0.0129188302495451	0.300943978400475	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.1666666666667	0	36.74999999999999	0.0132453773639628	0	-Inf	0.0132453773639628	0.0133564880049397	0	NA	NA	0.0133237976349906	0.3201672386633	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000003	0	35.74999999999999	0.0132746828245506	0	-Inf	0.0132746828245506	0.0136363120527693	0	NA	NA	0.0132757075720615	0.317347864586273	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	0	35.74999999999999	0.0132162010123647	0	-Inf	0.0132162010123647	0.0130985584764983	0	NA	NA	0.0129168624596271	0.306225467261583	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	0	35.41666666666666	0.0132162010123647	0	-Inf	0.0132162010123647	0.0134685309445656	0	NA	NA	0.0129814739344373	0.308639132721895	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.33333333333336	0	35.41666666666666	0.0132162010123647	0	-Inf	0.0132162010123647	0.0130749302735347	0	NA	NA	0.0134347790252122	0.325248071318525	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666669	0	35.41666666666666	0.013333684515963	0	-Inf	0.013333684515963	0.0132311698847973	0	NA	NA	0.0129122086600274	0.301771627121841	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	0	35.74999999999999	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0128893159265502	0	NA	NA	0.0138118384873465	0.332200625427395	669	331	0	0	0.669	0.001
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333336	0	35.74999999999999	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0136008119186939	0	NA	NA	0.0137329621776341	0.329431149247788	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000003	0	35.74999999999999	0.0132746828245506	0	-Inf	0.0132746828245506	0.0129556875806949	0	NA	NA	0.0126221524705755	0.292938481029351	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.6666666666667	0	35.08333333333332	0.013333684515963	0	-Inf	0.013333684515963	0.0135079230842241	0	NA	NA	0.0136626166562442	0.329101800693146	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333337	0	34.08333333333332	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0143645638974444	0	NA	NA	0.0130037490224496	0.303033414584857	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	55	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	0	33.41666666666666	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.012496797005829	0	NA	NA	0.0135644870111894	0.332021510696839	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	56	GCT	CCG	CTC	2	ACCGCTCTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.00000000000003	0	33.08333333333332	0.0131007697802931	0	-Inf	0.0131007697802931	0.0134603983414299	0	NA	NA	0.012899309879926	0.30981138606906	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	0	33.08333333333332	0.0129873375085957	0	-Inf	0.0129873375085957	0.0130273734504797	0	NA	NA	0.0129512401416528	0.31596355828028	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.6666666666667	0	33.08333333333332	0.0129873375085957	0	-Inf	0.0129873375085957	0.013558314551962	0	NA	NA	0.0121358400959656	0.284545557528741	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333337	0	32.58333333333332	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0122030704810599	0	NA	NA	0.0129420079436293	0.319790577554076	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.33333333333337	0	31.916666666666657	0.0127121687353299	0	-Inf	0.0127121687353299	0.0129935497329755	0	NA	NA	0.0126379320865376	0.314476130016577	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	0	32.58333333333332	0.0129313548258795	0	-Inf	0.0129313548258795	0.0126713341578536	0	NA	NA	0.0128804887178873	0.315403156912223	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	33.41666666666666	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0126578430619077	0	NA	NA	0.0127787423750906	0.310521482573089	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	32.74999999999999	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0126741546562627	0	NA	NA	0.0133096338411139	0.330216890127865	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	64	GAC	AAG	ACC	2	GAAGACCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.6666666666667	0	33.24999999999999	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0128619349205952	0	NA	NA	0.0133819674168272	0.325469234586535	678	322	0	0	0.678	0.001
N	all	ss13	65	CTT	ACC	TTA	2	GACCTTAAA:GACCTTAGA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.33333333333337	0	33.58333333333333	0.0135750312327134	0	-Inf	0.0135750312327134	0.0138415390910248	0	NA	NA	0.0134882068553802	0.314205374580877	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.6666666666667	0	32.25	0.0135138791270087	0	-Inf	0.0135138791270087	0.0129681495612239	0	NA	NA	0.0138618467871849	0.32961112964491	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.08333333333336	0	32.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000003	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000003	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.9166666666667	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.75000000000003	0	33.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.08333333333336	0	34.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA:GGCGTTCCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.08333333333336	0	34.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATT:GTTCCGATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000003	0	33.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	75	ATT	CAA	TTA	2	CCAATTAAC:CCGATTAAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333336	0	34	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	76	AAC	TTA	ACA	2	ATTAACACC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333336	0	33	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.6666666666667	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333337	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333337	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.58333333333337	0	33.74999999999999	0.0139053809368069	0	-Inf	0.0139053809368069	0.0136449882783094	0	NA	NA	0.0139513688187365	0.318908352686414	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.25000000000003	0	33.416666666666664	0.0139701361553758	0	-Inf	0.0139701361553758	0.0138861762159487	0	NA	NA	0.0145816963720851	0.338032637985698	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.25000000000003	0	33.416666666666664	0.0139701361553758	0	-Inf	0.0139701361553758	0.0141596048925956	0	NA	NA	0.0142233377003911	0.326002232617777	620	380	0	0	0.62	0.001
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.25000000000003	0	34.08333333333333	0.0141680718521655	0	-Inf	0.0141680718521655	0.0145579976111355	0	NA	NA	0.0150982282324067	0.348042476296311	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.58333333333336	0	35.08333333333333	0.0143031748474547	0	-Inf	0.0143031748474547	0.0142481426689731	0	NA	NA	0.0145408252175223	0.325284515795502	613	387	0	0	0.613	0.001
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.58333333333336	0	35.41666666666666	0.0145107307483395	0	-Inf	0.0145107307483395	0.0146258115964588	0	NA	NA	0.0135435993481419	0.283985683538071	670	330	0	0	0.67	0.001
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.41666666666669	0	35.08333333333333	0.0145459104801299	0	-Inf	0.0145459104801299	0.0145748238634141	0	NA	NA	0.0148184261788205	0.326292180082492	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.58333333333336	0	35.24999999999999	0.0293077581780704	0	-Inf	0.0293077581780704	0.0200608463203488	0	NA	NA	0.0199842813983694	0.142501094190499	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.41666666666669	0	35.08333333333333	0.0289541383570224	0	-Inf	0.0289541383570224	0.0202944718093606	0	NA	NA	0.0205762517629451	0.159379086330813	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.91666666666669	0	34.58333333333333	0.0287460335402285	0	-Inf	0.0287460335402285	0.0191988981914224	0	NA	NA	0.0196386934757171	0.143263716442787	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.58333333333336	0	34.41666666666666	0.0284731702204231	0	-Inf	0.0284731702204231	0.0200615606679804	0	NA	NA	0.0196752816448251	0.147853687339237	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.91666666666669	0	34.58333333333333	0.029165278647943	0	-Inf	0.029165278647943	0.02035955464526	0	NA	NA	0.02031385812029	0.151078300555895	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.25000000000003	0	33.91666666666666	0.0290241779148319	0	-Inf	0.0290241779148319	0.0214818425616734	0	NA	NA	0.0195646529351868	0.137941409026789	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.58333333333336	0	33.58333333333333	0.0288844360583938	0	-Inf	0.0288844360583938	0.0202173811693438	0	NA	NA	0.020317228181886	0.155121468855027	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT	2	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.41666666666669	0	33.58333333333333	0.0289541383570224	0	-Inf	0.0289541383570224	0.020211191395705	0	NA	NA	0.0194382318643648	0.136343678934984	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.83333333333336	0	34.33333333333333	0.0287805096612113	0	-Inf	0.0287805096612113	0.019990176583327	0	NA	NA	0.0196506892177352	0.143028550642794	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.16666666666669	0	34.33333333333333	0.0286430990492925	0	-Inf	0.0286430990492925	0.0207144186556545	0	NA	NA	0.0200665982539654	0.15346410395453	894	106	0	0	0.894	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.50000000000001	0	34.66666666666666	0.0285069944752381	0	-Inf	0.0285069944752381	0.0190635815342474	0	NA	NA	0.0200355322622037	0.154787785383816	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	0	34.99999999999999	0.0284394261467203	0	-Inf	0.0284394261467203	0.0203317934122196	0	NA	NA	0.0201984071787535	0.159130060809565	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.33333333333336	0	34.33333333333332	0.0281723261817364	0	-Inf	0.0281723261817364	0.019613184246529	0	NA	NA	0.0193034418864816	0.144442462373965	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	0	34.33333333333332	0.0284394261467203	0	-Inf	0.0284394261467203	0.0200006898938029	0	NA	NA	0.0193925012504237	0.142507586104388	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	0	34.08333333333332	0.0284394261467203	0	-Inf	0.0284394261467203	0.0195818895869571	0	NA	NA	0.0200576121141422	0.156223777634904	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000001	0	33.749999999999986	0.0283052459871352	0	-Inf	0.0283052459871352	0.0201910467666839	0	NA	NA	0.0198958658971443	0.154831922095536	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.33333333333334	0	34.41666666666666	0.0281723261817364	0	-Inf	0.0281723261817364	0.020199002600092	0	NA	NA	0.0199798140335335	0.158528031733295	849	151	0	0	0.849	0.001
N	all	ss13	104	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.33333333333334	0	35.749999999999986	0.0285748846742028	0	-Inf	0.0285748846742028	0.0197748985762518	0	NA	NA	0.0200088261447054	0.153259049467869	855	145	0	0	0.855	0.001
N	all	ss13	105	CTC	ATC	TCA	2	GATCTCAGT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.66666666666669	0	36.41666666666665	0.028849710620847	0	-Inf	0.028849710620847	0.0204574273106834	0	NA	NA	0.0197166162473877	0.143407697722734	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	106	AGT	TCA	GTC	2	CTCAGTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	36.749999999999986	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0202433910843277	0	NA	NA	0.0195268509516935	0.141462346853696	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	107	CCA	GTC	CAA	2	AGTCCAAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	36.08333333333332	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0214873560278203	0	NA	NA	0.0196405338472848	0.143780567335322	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	36.08333333333332	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0200881241039295	0	NA	NA	0.0202433628686234	0.156096300538193	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.50000000000003	0	35.91666666666665	0.0285069944752381	0	-Inf	0.0285069944752381	0.0195383911736219	0	NA	NA	0.0199532019605946	0.153092569798659	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTT:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.83333333333336	0	36.58333333333332	0.0292007684815911	0	-Inf	0.0292007684815911	0.0208577702788067	0	NA	NA	0.0192640765685858	0.129566239716969	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTTTAC:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.33333333333336	0	35.58333333333332	0.0289891158257093	0	-Inf	0.0289891158257093	0.0197987194557477	0	NA	NA	0.0191977442590004	0.131036486253712	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.16666666666669	0	34.749999999999986	0.0290593249318817	0	-Inf	0.0290593249318817	0.0207572006576584	0	NA	NA	0.0212099063965349	0.170661100631174	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.50000000000003	0	34.41666666666665	0.0289192452027622	0	-Inf	0.0289192452027622	0.0198976233336712	0	NA	NA	0.0202723191656207	0.15371294166065	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.1666666666667	0	33.749999999999986	0.0286430990492924	0	-Inf	0.0286430990492924	0.0198119294996598	0	NA	NA	0.0192526005575425	0.136816252824529	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.83333333333337	0	34.08333333333332	0.0279752710599065	0	-Inf	0.0279752710599065	0.0197305674847627	0	NA	NA	0.0191882221400842	0.144857161313774	893	107	0	0	0.893	0.001
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333337	0	34.58333333333332	0.0277809537602618	0	-Inf	0.0277809537602618	0.0190528864087024	0	NA	NA	0.0186317829657873	0.135947892321983	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	117	GGG	CTG	GGC	2	ACTGGGCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666671	0	34.249999999999986	0.0276529018562458	0	-Inf	0.0276529018562458	0.019939633011537	0	NA	NA	0.0193998334360143	0.154035960005188	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	118	CCA	GGC	CAG	2	GGGCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333339	0	33.583333333333314	0.027400307499342	0	-Inf	0.027400307499342	0.0195413123611212	0	NA	NA	0.0196244914932274	0.162645188010081	849	151	0	0	0.849	0.001
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666671	0	32.583333333333314	0.0269087157486763	0	-Inf	0.0269087157486763	0.0183711941011578	0	NA	NA	0.0195855539773778	0.169470777508899	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000004	0	32.583333333333314	0.0271522864979704	0	-Inf	0.0271522864979704	0.0185380559857388	0	NA	NA	0.0191606602986946	0.156458043992993	859	141	0	0	0.859	0.001
N	all	ss13	121	GGA	CTG	GAC	2	GCTGGACTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333339	0	32.41666666666665	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0182253772974828	0	NA	NA	0.0190847817841459	0.159486183604906	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	122	CTT	GAC	TTC	2	GGACTTCCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000006	0	31.749999999999982	0.0266103300115572	0	-Inf	0.0266103300115572	0.0180921706361417	0	NA	NA	0.0190688369446901	0.162868780239396	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000006	0	32.41666666666665	0.0266103300115572	0	-Inf	0.0266103300115572	0.0188147667238216	0	NA	NA	0.0191005602967252	0.163568350993289	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333339	0	33.083333333333314	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0192320065330651	0	NA	NA	0.0184495036554907	0.145602100103356	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333339	0	33.083333333333314	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0194462314739421	0	NA	NA	0.0184261778656447	0.145092962886476	895	105	0	0	0.895	0.001
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000006	0	33.583333333333314	0.0267885619515594	0	-Inf	0.0267885619515594	0.0179865300958141	0	NA	NA	0.0185973926489023	0.14974092130605	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000006	0	32.58333333333332	0.026434454296256	0	-Inf	0.026434454296256	0.0185426075221473	0	NA	NA	0.0186333355810006	0.155996811068421	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000006	0	32.58333333333332	0.026434454296256	0	-Inf	0.026434454296256	0.0187796725508993	0	NA	NA	0.017609785189314	0.13332374032417	883	117	0	0	0.883	0.001
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000006	0	32.08333333333332	0.026434454296256	0	-Inf	0.026434454296256	0.0177243786945533	0	NA	NA	0.0188284627680818	0.160330038175446	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666673	0	31.999999999999986	0.0132016609860952	0	-Inf	0.0132016609860952	0.0131765720760583	0	NA	NA	0.0137453895147767	0.33683238435318	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.0833333333334	0	32.33333333333332	0.0132600139021293	0	-Inf	0.0132600139021293	0.0141107631783372	0	NA	NA	0.0131911027440331	0.314788970567034	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000007	0	32.33333333333332	0.0131438194165355	0	-Inf	0.0131438194165355	0.0131303556373513	0	NA	NA	0.0139494392441779	0.346066117606447	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.0833333333334	0	32.33333333333332	0.0130864825012097	0	-Inf	0.0130864825012097	0.0132984902573082	0	NA	NA	0.0134903416472133	0.332015045626947	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000007	0	31.666666666666654	0.0131438194165355	0	-Inf	0.0131438194165355	0.0127849870709687	0	NA	NA	0.0130807395523745	0.314982401318757	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAAAT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.08333333333341	0	31.33333333333332	0.0130864825012097	0	-Inf	0.0130864825012097	0.0131535597112885	0	NA	NA	0.0137259409492507	0.340381153830185	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	136	AAT	CAA	ATG	2	GCAAATGAG:GCAACTGAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666674	0	31.99999999999999	0.0132016609860952	0	-Inf	0.0132016609860952	0.0137252054398443	0	NA	NA	0.0129313481219234	0.307300071759053	666	334	0	0	0.666	0.001
N	all	ss13	137	GAG	ATG	AGG	2	AATGAGGGA:ACTGAGGGA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333341	0	32.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.75000000000009	0	32.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25000000000009	0	33.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25000000000009	0	33.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.91666666666674	0	32.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.91666666666674	0	33.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333341	0	34.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000009	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000009	0	34.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	35.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000009	0	34.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGA:GGCACCCGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000009	1	34.91666666666666	0	0.0292007684815911	0	-0.0292007684815911	0	0.028988302336716	NA	NA	0.0302724518478395	0.334745837839379	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	150	CGA	CCC	GAA	2	ACCCGAAAT:ACCCGCAAT	1:1	FALSE	1	1	0.75	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666676	1	34.24999999999999	0	0.0297805871963345	0	-0.0297805871963345	0	0.0293806211731552	NA	NA	0.0329576056174996	0.366206016145719	0	359	641	0.641	0	0.001
N	all	ss13	151	AAT	GAA	ATC	2	CGAAATCCT:CGCAATCCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666676	1	34.49999999999999	0	0.0295604764056575	0	-0.0295604764056575	0	0.0284128449315399	NA	NA	0.028352043541409	0.297123198792898	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTG	2	AATCCTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	1	34.16666666666666	0	0.0298546878003148	0	-0.0298546878003148	0	0.0309748325027293	NA	NA	0.0310831368605114	0.336814395903238	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	153	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.5000000000001	1	34.16666666666666	0	0.0298546878003148	0	-0.0298546878003148	0	0.0308533415144716	NA	NA	0.0301485842018706	0.322051091360873	0	377	623	0.623	0	0.001
N	all	ss13	154	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5000000000001	1	33.83333333333333	0	0.0301548153585304	0	-0.0301548153585304	0	0.0289748343793945	NA	NA	0.0300756582085272	0.316038482015393	0	345	655	0.655	0	0.001
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5000000000001	1	33.49999999999999	0	0.0304610393656427	0	-0.0304610393656427	0	0.0320765382253254	NA	NA	0.0312560836152248	0.32977680857837	0	355	645	0.645	0	0.001
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333343	1	33.49999999999999	0	0.0304610393656427	0	-0.0304610393656427	0	0.0303196655557391	NA	NA	0.0319759424265191	0.340780784052146	0	395	605	0.605	0	0.001
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333343	1	33.49999999999999	0	0.0304610393656427	0	-0.0304610393656427	0	0.0307377247198487	NA	NA	0.0304284863114306	0.316793053750904	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333343	1	33.49999999999999	0	0.0304610393656427	0	-0.0304610393656427	0	0.0310144961841073	NA	NA	0.0311975390258049	0.328870056387129	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333343	1	34.49999999999999	0	0.0295604764056575	0	-0.0295604764056575	0	0.0306862352184175	NA	NA	0.029254289362537	0.31227189024466	0	377	623	0.623	0	0.001
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.0000000000001	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0304720260061488	NA	NA	0.0300649059400272	0.330241713212677	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666677	1	35.41666666666666	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0293180846256512	NA	NA	0.0279550296973869	0.303231228591815	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	1	36.08333333333332	0	0.0282386296527663	0	-0.0282386296527663	0	0.0297413450868681	NA	NA	0.030052661783883	0.347403164124364	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	1	36.08333333333332	0	0.0282386296527663	0	-0.0282386296527663	0	0.0295196715176055	NA	NA	0.0297895305926709	0.343160990925686	0	355	645	0.645	0	0.001
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	1	36.749999999999986	0	0.0277167798918218	0	-0.0277167798918218	0	0.0282579769487067	NA	NA	0.0288988485180551	0.337510213217106	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	1	36.749999999999986	0	0.0277167798918218	0	-0.0277167798918218	0	0.0278647694413458	NA	NA	0.028004399708899	0.322306362901212	0	379	621	0.621	0	0.001
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.66666666666676	1	36.249999999999986	0	0.0281063333749098	0	-0.0281063333749098	0	0.0280469747414247	NA	NA	0.0291800341773334	0.335445025157181	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000009	1	36.91666666666666	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0295352680561038	NA	NA	0.028830687327912	0.338596145106365	0	341	659	0.659	0	0.001
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000009	1	37.58333333333332	0	0.0270909813104957	0	-0.0270909813104957	0	0.0275154083217942	NA	NA	0.0278112797977234	0.330006645691775	0	383	617	0.617	0	0.001
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333343	1	37.91666666666666	0	0.0268485044068343	0	-0.0268485044068343	0	0.0271198466840618	NA	NA	0.0272018495240359	0.323637611801961	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.83333333333343	1	38.41666666666666	0	0.0264928206228063	0	-0.0264928206228063	0	0.0260605171482496	NA	NA	0.0278897961269109	0.342157540919492	0	396	604	0.604	0	0.001
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333343	1	39.249999999999986	0	0.0259205062991005	0	-0.0259205062991005	0	0.0267317943936106	NA	NA	0.0268034794883109	0.333515281795507	0	379	621	0.621	0	0.001
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333343	1	39.249999999999986	0	0.0259205062991005	0	-0.0259205062991005	0	0.0270718144958762	NA	NA	0.027633725863447	0.34824308154757	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333343	1	38.91666666666665	0	0.0261464386246643	0	-0.0261464386246643	0	0.028024468543487	NA	NA	0.0280003411545948	0.350412227790024	0	363	637	0.637	0	0.001
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.83333333333343	1	37.91666666666665	0	0.0268485044068343	0	-0.0268485044068343	0	0.0286412366230756	NA	NA	0.0281887002945071	0.340865632399087	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.33333333333343	1	36.91666666666665	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0285119249403258	NA	NA	0.0279376021487103	0.32338117585859	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333343	1	37.249999999999986	0	0.0273378783823658	0	-0.0273378783823658	0	0.026553473294851	NA	NA	0.0285594711334784	0.338453018680154	0	381	619	0.619	0	0.001
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000009	1	37.249999999999986	0	0.0273378783823658	0	-0.0273378783823658	0	0.0274039697240005	NA	NA	0.0284606331553353	0.336778175149974	0	386	614	0.614	0	0.001
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000009	1	36.83333333333332	0	0.0276529018562458	0	-0.0276529018562458	0	0.0291266556482426	NA	NA	0.028025431022514	0.323786071927976	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666674	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.0296328586274031	NA	NA	0.0295465029049874	0.347091867134328	0	361	639	0.639	0	0.001
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666674	1	36.33333333333332	0	0.0280406490537152	0	-0.0280406490537152	0	0.0296099834002177	NA	NA	0.02859837480378	0.32684036060927	0	348	652	0.652	0	0.001
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333341	1	36.33333333333332	0	0.0280406490537152	0	-0.0280406490537152	0	0.027542832863578198	NA	NA	0.0292888628660769	0.338374153978607	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000007	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0283079461895041	NA	NA	0.028564003352142	0.321714323240732	0	344	656	0.656	0	0.001
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAAGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000007	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0285276234648321	NA	NA	0.0304096981772252	0.351958749371948	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT:GCTTCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.66666666666673	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0298850578196866	NA	NA	0.0280575443464362	0.313056965361041	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.3333333333334	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0291558629640903	NA	NA	0.0276072076050776	0.305228899874151	0	414	586	0.586	0	0.001
N	all	ss13	186	CGT	CTC	GTT	2	TCTCGTTCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000007	1	35.33333333333332	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0292210108714962	NA	NA	0.0293961817052677	0.326390530809767	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	187	TCC	GTT	CCT	2	CGTTCCTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666674	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0291818909585168	NA	NA	0.0289502212064153	0.31666076932964	0	338	662	0.662	0	0.001
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666674	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0294641691191795	NA	NA	0.0312615999274755	0.353766905535044	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333341	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0310142155507702	NA	NA	0.0311960319174736	0.352756166434681	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333341	1	35.16666666666665	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0301442574418147	NA	NA	0.0301693476766538	0.336612624149627	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333341	1	35.83333333333332	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.0289438874129017	NA	NA	0.0292160085883274	0.33034495874858	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333341	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0303173275933118	NA	NA	0.0303522044576942	0.334839776133356	0	377	623	0.623	0	0.001
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000009	1	33.83333333333332	0	0.0301548153585304	0	-0.0301548153585304	0	0.0320956440340798	NA	NA	0.0295565015137628	0.307613203478599	0	389	611	0.611	0	0.001
N	all	ss13	194	AGT	ACA	GTT	2	AACAGTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000009	1	32.83333333333332	0	0.0310925352587596	0	-0.0310925352587596	0	0.0321344403253934	NA	NA	0.0320301296730757	0.331683876330276	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	195	TCA	GTT	CAA	2	AGTTCAAGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000009	1	32.16666666666665	0	0.0317507728699206	0	-0.0317507728699206	0	0.0321200494597065	NA	NA	0.0330592679110426	0.336844016566672	0	386	614	0.614	0	0.001
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAC:TCAAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.16666666666676	1	32.16666666666665	0	0.0317507728699206	0	-0.0317507728699206	0	0.0336681043596614	NA	NA	0.0340759649207782	0.351458268157564	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	197	AAC	GAA	ACA	2	AGAAACACA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.83333333333341	1	32.33333333333332	0	0.0315836140125951	0	-0.0315836140125951	0	0.0331538225877651	NA	NA	0.0346456004568519	0.361968916121822	0	396	604	0.604	0	0.001
N	all	ss13	198	ACA	ACA	CAA	2	AACACAACT:AATTCAACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000009	1	32.999999999999986	0	0.0309322189005369	0	-0.0309322189005369	0	0.0332513981843181	NA	NA	0.0311484695967171	0.320681972124573	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	ACAACTCCA:TCAACTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000009	0	33.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000009	0	34.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.66666666666676	0	34.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGC:GGCAGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000009	0	34.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	203	AGC	GCA	GCA	2	AGCAGCAGG:AGCAGTAGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.50000000000009	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	204	AGG	GCA	GGG	2	AGCAGGGGA:AGTAGGGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666674	0	34.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.5833333333334	0	35.24999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000007	0	34.583333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	207	TCT	CTT	CTC	2	ACTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000007	0	35.58333333333331	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.41666666666674	0	36.08333333333331	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTAGG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666674	0	35.24999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTAGGATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.91666666666674	0	34.249999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:AGGATGGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000007	0	34.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTG	2	ATGGCTGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333341	0	34.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	213	GGC	CTG	GCA	2	GCTGGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.08333333333341	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	GGCAATGGC:GGCAATGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000009	0	34.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:AATGGTGGT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000009	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000009	0	35.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	217	GAT	GTG	ATG	2	GGTGATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333341	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	218	GCT	ATG	CTG	2	GATGCTGCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333341	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	219	GCT	CTG	CTC	2	GCTGCTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333341	0	35.66666666666665	0.0267586909940917	0	-Inf	0.0267586909940917	0.0266737492540248	0	NA	NA	0.0265755467606169	0.313986937879972	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	220	CTT	CTC	TTG	2	GCTCTTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000009	0	34.999999999999986	0.0265221005560517	0	-Inf	0.0265221005560517	0.0271026122938838	0	NA	NA	0.0264610281564748	0.316194853618401	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	221	GCT	TTG	CTT	2	CTTGCTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000009	0	34.66666666666665	0.0261749574292544	0	-Inf	0.0261749574292544	0.0265698758813337	0	NA	NA	0.0261276884753038	0.31643577630901	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	222	TTG	CTT	TGC	2	GCTTTGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333341	0	34.33333333333332	0.0264053674769446	0	-Inf	0.0264053674769446	0.0259416583764826	0	NA	NA	0.0268844754266742	0.326011666097105	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	223	CTG	TGC	TGC	2	TTGCTGCTG	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.41666666666674	0	33.66666666666665	0.0266398704364015	0	-Inf	0.0266398704364015	0.0267667316025385	0	NA	NA	0.0271827900447447	0.327072750130884	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333341	0	33.66666666666665	0.0262321821040851	0	-Inf	0.0262321821040851	0.0268355935207379	0	NA	NA	0.0278203202219282	0.345724660155306	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	225	CTT	TGC	TTG	2	CTGCTTGAC	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000009	0	33.999999999999986	0.0261749574292544	0	-Inf	0.0261749574292544	0.0257588183302306	0	NA	NA	0.0260231454749609	0.31449555983995803	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	226	GAC	TTG	ACA	2	CTTGACAGA:CTTGACAGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.91666666666674	0	34.33333333333332	0.0261179819037762	0	-Inf	0.0261179819037762	0.0270131806007819	0	NA	NA	0.0277930706595679	0.347356079897769	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GACAGGTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666674	0	34.66666666666666	0.0264636052740321	0	-Inf	0.0264636052740321	0.0277637109272674	0	NA	NA	0.0267792378723499	0.323048081675329	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:AGGTTGAAC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666674	0	34.58333333333332	0.0264636052740321	0	-Inf	0.0264636052740321	0.0285248359907098	0	NA	NA	0.0276886828524118	0.33919587857036	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAA:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000009	0	34.58333333333332	0.0260047718198447	0	-Inf	0.0260047718198447	0.026894049499475	0	NA	NA	0.0262673636642635	0.322172597041784	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	230	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACTT:AACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333341	0	35.58333333333332	0.0262321821040851	0	-Inf	0.0262321821040851	0.0277220909124753	0	NA	NA	0.0282951885470498	0.353879885658531	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	231	CTT	AAC	TTG	2	CAACTTGAG:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666674	0	35.58333333333332	0.0264636052740321	0	-Inf	0.0264636052740321	0.027410435161564	0	NA	NA	0.0260901772188141	0.310433434722456	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000009	0	35.41666666666666	0.0261749574292544	0	-Inf	0.0261749574292544	0.027194679790386	0	NA	NA	0.0241489527849943	0.278410838050369	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.75000000000009	0	34.41666666666666	0.0258367851740807	0	-Inf	0.0258367851740807	0.0249997070675752	0	NA	NA	0.025032894090972	0.302019002010866	666	334	0	0	0.666	0.001
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333343	0	34.41666666666666	0.026061253903872	0	-Inf	0.026061253903872	0.026596853459909	0	NA	NA	0.0270737279016154	0.335746750569903	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333343	0	34.41666666666666	0.026061253903872	0	-Inf	0.026061253903872	0.0266603892245071	0	NA	NA	0.0268840949087589	0.332349134515903	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666676	0	34.58333333333332	0.0264636052740321	0	-Inf	0.0264636052740321	0.0263658750922115	0	NA	NA	0.0289665932198791	0.360932043916696	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333341	0	34.08333333333332	0.026061253903872	0	-Inf	0.026061253903872	0.0255052013299702	0	NA	NA	0.0254825821989466	0.30644568224130603	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666674	0	34.24999999999999	0.0259485340559255	0	-Inf	0.0259485340559255	0.026569822798643	0	NA	NA	0.0266212225603392	0.329693652478629	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666674	0	33.58333333333333	0.0259485340559255	0	-Inf	0.0259485340559255	0.0283531318146871	0	NA	NA	0.0261136686370646	0.320380476620814	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666674	0	34.24999999999999	0.0259485340559255	0	-Inf	0.0259485340559255	0.0258832890591661	0	NA	NA	0.0253985359850221	0.306944351169817	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	34.16666666666666	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0263339772735561	0	NA	NA	0.0258988723688706	0.316906429157721	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000007	0	34.66666666666666	0.0260895870640617	0	-Inf	0.0260895870640617	0.027567344230639	0	NA	NA	0.0246299933263802	0.289481010556615	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000007	0	34.66666666666666	0.0267885619515594	0	-Inf	0.0267885619515594	0.0259797692362446	0	NA	NA	0.0268422257359834	0.318278985289682	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.3333333333334	0	34.66666666666666	0.027400307499342	0	-Inf	0.027400307499342	0.0275964162411211	0	NA	NA	0.0256234204930686	0.284913697139045	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.3333333333334	0	34.83333333333333	0.027400307499342	0	-Inf	0.027400307499342	0.0289826290933712	0	NA	NA	0.0274581912474028	0.318331764893604	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	0	33.83333333333333	0.0270299523623976	0	-Inf	0.0270299523623976	0.0262799132359623	0	NA	NA	0.0270453211918632	0.31758559155689	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	0	33.66666666666666	0.0269691977905829	0	-Inf	0.0269691977905829	0.0281392785857465	0	NA	NA	0.0277613114599632	0.331315781518195	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	0	33.33333333333333	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.027658296873124998	0	NA	NA	0.0267309090590814	0.315186222269975	664	336	0	0	0.664	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.8333333333334	0	33	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0260082818106526	0	NA	NA	0.0262728269313674	0.313275223172729	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCC:AAGAAATCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000007	0	32.166666666666664	0.026434454296256	0	-Inf	0.026434454296256	0.026671748815025	0	NA	NA	0.026855395226215	0.324955422914469	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	251	TCC	AAT	CCG	2	AAATCCGCT:AAATCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000007	0	32.666666666666664	0.0266103300115572	0	-Inf	0.0266103300115572	0.0270552698533742	0	NA	NA	0.027222768160279	0.328320330215764	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CCG	CTG	2	TCCGCTGCA:TCTGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	0	32.33333333333333	0.0397443976053827	0	-Inf	0.0397443976053827	0.0295932425505574	0	NA	NA	0.0280434413676637	0.156411616293518	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	253	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAG:GCTGCTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.3333333333334	0	31.5	0.0388017557993916	0	-Inf	0.0388017557993916	0.0288418755058574	0	NA	NA	0.0284925231838883	0.173253946163312	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CAG	AGG	2	GCAGAGGCT:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.333333333333333	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000007	0	31.333333333333332	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0292829015779291	0	NA	NA	0.0288830145212226	0.180076173026988	860	140	0	0	0.86	0.001
N	all	ss13	255	GCT	AGG	CTT	2	GAGGCTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5833333333334	0	31.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.029766770335245	0	NA	NA	0.0289645725713377	0.181775083553943	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CTT	CTA	2	GCTTCTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000007	0	31.583333333333336	0.0385937229566065	0	-Inf	0.0385937229566065	0.027787122098481	0	NA	NA	0.0285729510174579	0.176788882796194	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CTA	AGA	2	TCTAAGAAA:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000007	0	30.58333333333334	0.0381034317265945	0	-Inf	0.0381034317265945	0.0300713380280199	0	NA	NA	0.0302511375816016	0.207824447548976	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	258	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000007	0	29.08333333333334	0.037390920168914	0	-Inf	0.037390920168914	0.0287306845454666	0	NA	NA	0.0271288911284359	0.168120130905939	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AAC	CTC	2	AAACCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666673	0	29.250000000000007	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0283336392652981	0	NA	NA	0.0283708688956909	0.185691435211305	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666673	0	29.250000000000007	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0285663026462487	0	NA	NA	0.0280573653622447	0.180824549328439	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000006	0	29.583333333333343	0.0376254440385144	0	-Inf	0.0376254440385144	0.0295563909501901	0	NA	NA	0.0271348352505935	0.165560603448726	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000006	0	29.583333333333343	0.0376254440385144	0	-Inf	0.0376254440385144	0.0285038818565612	0	NA	NA	0.0268284214137107	0.160781752062609	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.58333333333339	0	30.083333333333343	0.0381842798232054	0	-Inf	0.0381842798232054	0.0286236057960061	0	NA	NA	0.0284823293630217	0.180040445386968	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	0	31.08333333333334	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0281998422884608	0	NA	NA	0.0285933767067788	0.17616929550552	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000006	0	30.41666666666668	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0283641708404888	0	NA	NA	0.0290980345247991	0.187551966603522	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CCA	CCA	2	GCCACCAAA:GCCACTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	0	30.083333333333343	0.037862929073994	0	-Inf	0.037862929073994	0.0278588064264581	0	NA	NA	0.0278470633146355	0.1739330967231	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAC	2	ACCAAACAA:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666671	0	29.916666666666675	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0284054813621758	0	NA	NA	0.0283052151028288	0.18467325442785	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	268	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000004	0	29.916666666666675	0.037862929073994	0	-Inf	0.037862929073994	0.0281216367332161	0	NA	NA	0.0292714575528518	0.195834656685946	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AAT	ACA	2	CAATACAAT:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000004	0	30.08333333333334	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0124230818147391	0	NA	NA	0.0121406052736375	0.309691610718721	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333337	0	30.250000000000007	0.0123586730492886	0	-Inf	0.0123586730492886	0.0116761513295869	0	NA	NA	0.0120036137967379	0.303207506831717	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA	2	FALSE	1	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666671	0	30.250000000000007	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0126823264676199	0	NA	NA	0.0127664859537252	0.329015729607978	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333337	0	31.583333333333336	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0124092198388593	0	NA	NA	0.0120729566968298	0.302995516139198	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000004	0	31.916666666666668	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0117107285099783	0	NA	NA	0.0123321469885754	0.317266492547275	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333337	0	32.91666666666667	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0123496531077178	0	NA	NA	0.0124098915976575	0.316312199576438	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333337	0	32.583333333333336	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0120133026194685	0	NA	NA	0.0118067821732841	0.298193602523263	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGCAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.41666666666671	0	31.75	0.0122326870775303	0	-Inf	0.0122326870775303	0.0121833083482164	0	NA	NA	0.0121087519659891	0.31238263388244	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	32.083333333333336	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0122976695023955	0	NA	NA	0.0122109871118727	0.314473918816405	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	31.916666666666664	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0119901936380501	0	NA	NA	0.0123657662671727	0.320569437954744	672	328	0	0	0.672	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666671	0	32.583333333333336	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0122200410931673	0	NA	NA	0.0123760403077569	0.316992235343852	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666671	0	32.583333333333336	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0125251216938527	0	NA	NA	0.0125244862141388	0.322762163314742	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333339	0	31.916666666666664	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0114830856946337	0	NA	NA	0.0116561292501733	0.291992449565847	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666671	0	32.416666666666664	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0125405408485993	0	NA	NA	0.0121014070703066	0.309120506652694	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000004	0	33.083333333333336	0.0127256499425275	0	-Inf	0.0127256499425275	0.0123430222532495	0	NA	NA	0.0126658332765872	0.315030404523862	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333337	0	32.75	0.0128345378007017	0	-Inf	0.0128345378007017	0.013067493921893	0	NA	NA	0.0138576690237199	0.354358372364065	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666671	0	32.75	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0124495161154138	0	NA	NA	0.0127907559730008	0.311498425166206	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666671	0	33.25	0.0130296436641525	0	-Inf	0.0130296436641525	0.0129334884099227	0	NA	NA	0.0125803577274471	0.300335921347989	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000004	0	33.25	0.0131438194165355	0	-Inf	0.0131438194165355	0.0132281597689245	0	NA	NA	0.0133614279652934	0.325256313760264	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC:TTTGGGGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.41666666666671	0	33.08333333333333	0.0132016609860952	0	-Inf	0.0132016609860952	0.0130820911327923	0	NA	NA	0.0129758177713204	0.308960837165007	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAG:GGGGATCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000004	0	33.75	0.0133188849757348	0	-Inf	0.0133188849757348	0.0125061259646821	0	NA	NA	0.0137445031591299	0.332528439655207	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAGGAA:GATCAAGAA	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000004	0	33.75	0.0133188849757348	0	-Inf	0.0133188849757348	0.013222723252668	0	NA	NA	0.0129514034695966	0.303773992594977	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAATTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666671	0	32.83333333333333	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.0127689994327131	0	NA	NA	0.0131116406968389	0.315593902153119	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAATTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666671	0	32.33333333333333	0.0130722263514627	0	-Inf	0.0130722263514627	0.012785754937131	0	NA	NA	0.012820692664607	0.307909023228425	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:TTAATCAGA	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666671	0	32.83333333333333	0.0128208250194751	0	-Inf	0.0128208250194751	0.0125491813636623	0	NA	NA	0.0132250564873199	0.33232848376419	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.33333333333339	0	33.83333333333333	0.0127121687353299	0	-Inf	0.0127121687353299	0.0131107801297022	0	NA	NA	0.0123829212576359	0.304614112539556	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.00000000000006	0	33.666666666666664	0.0126053387372859	0	-Inf	0.0126053387372859	0.0121514827555535	0	NA	NA	0.0124979998397971	0.313172031518654	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666671	0	34.33333333333333	0.0128208250194751	0	-Inf	0.0128208250194751	0.0120578355172291	0	NA	NA	0.0130853263279733	0.327191557507693	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000004	0	34.166666666666664	0.0126852918315464	0	-Inf	0.0126852918315464	0.0132130532592623	0	NA	NA	0.0125398570319294	0.311730396484551	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000004	0	34.166666666666664	0.0126852918315464	0	-Inf	0.0126852918315464	0.0126069427010951	0	NA	NA	0.0126653729059723	0.316550008061597	601	399	0	0	0.601	0.001
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000004	0	34.166666666666664	0.0126852918315464	0	-Inf	0.0126852918315464	0.0125861751594073	0	NA	NA	0.0119028104312891	0.286541545866292	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAA:TACAAACAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000004	0	33.83333333333333	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0123952280996792	0	NA	NA	0.0126904921923874	0.323608976895945	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	301	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATGG:AAACATTGG	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000004	0	33.33333333333333	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.012161872159358	0	NA	NA	0.0121574466176333	0.305866620177987	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	302	TGG	AAT	GGC	2	CAATGGCCG:CATTGGCCG	1:1	FALSE	2.5	0	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.16666666666671	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000004	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.33333333333337	0	32.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.1666666666667	0	31.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000004	0	31.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000004	0	31.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.1666666666667	0	31.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.6666666666667	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	310	CCC	CCC	CCA	2	GCCCCCAGC:GCTCCTAGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.33333333333336	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCTAGCGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	32.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	312	GCT	GCG	CTT	2	AGCGCTTCA:AGCGCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.50000000000003	0	31.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	313	TCA	CTT	CAG	2	GCTTCAGCG:GCTTCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.1666666666667	0	31.499999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.1666666666667	0	30.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.1666666666667	0	30.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.1666666666667	0	30.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333337	0	29.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000004	0	29.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	319	TCG	TGT	CGC	2	ATGTCGCGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.50000000000004	0	29.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	320	CGC	CGC	GCA	2	TCGCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.33333333333337	0	29.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000004	0	29.499999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.6666666666667	0	29	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.33333333333336	0	29	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.00000000000003	0	29	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000003	0	30	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000003	0	30.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.83333333333336	0	30.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.50000000000001	0	30.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.16666666666669	0	30.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	330	ACG	GAA	CGT	2	GGAACGTGG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.83333333333336	0	29.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	331	TGG	CGT	GGT	2	ACGTGGTTG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.83333333333336	0	29.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	332	TTG	GGT	TGA	2	TGGTTGACC	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.50000000000003	0	29.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	TTGACCTAC	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.1666666666667	0	29.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.83333333333337	0	30.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	335	ACA	ACA	CAG	2	TACACAGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.83333333333337	0	30.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	336	GGT	CAG	GTG	2	ACAGGTGCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.00000000000004	0	30.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	337	GCC	GTG	CCA	2	GGTGCCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.00000000000004	0	30.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	88.16666666666671	0	30.333333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	88.83333333333339	0	30.333333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAC:AAATTGGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	89.33333333333339	0	29.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	341	GAC	TGG	ACG	2	TTGGACGAC:TTGGATGAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	0	89.33333333333339	0	29.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	342	GAC	ACG	ACA	2	GACGACAAA:GATGACAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	88.83333333333339	0	30	0.0113423711806656	0	-Inf	0.0113423711806656	0.0108928967168902	0	NA	NA	0.0115045571759168	0.324180981334588	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	87.83333333333339	0	30.333333333333332	0.0114724990316052	0	-Inf	0.0114724990316052	0.0115331220006828	0	NA	NA	0.0111094325634254	0.301753245775152	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.50000000000004	0	30	0.0116507197216382	0	-Inf	0.0116507197216382	0.0114793314199394	0	NA	NA	0.0118691603124643	0.326298942315251	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.16666666666671	0	29.666666666666668	0.0118345650779739	0	-Inf	0.0118345650779739	0.0121916415339	0	NA	NA	0.0119934700071688	0.3237648623003	603	397	0	0	0.603	0.001
N	all	ss13	346	AAT	CAA	ATT	2	CCAAATTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.83333333333339	0	30	0.0118814365992435	0	-Inf	0.0118814365992435	0.0121983683045701	0	NA	NA	0.0122956428639394	0.333887702691277	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	347	TTC	ATT	TCA	2	AATTTCAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.16666666666673	0	30	0.0119763023840483	0	-Inf	0.0119763023840483	0.0121513176717107	0	NA	NA	0.0112724634432071	0.288036533440506	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.16666666666673	0	30	0.0119763023840483	0	-Inf	0.0119763023840483	0.0121445372567976	0	NA	NA	0.011486983028451	0.29713464289754	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	349	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.16666666666671	0	30.33333333333333	0.0121214759677486	0	-Inf	0.0121214759677486	0.0118437568106237	0	NA	NA	0.0118557501653607	0.306585355547793	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	350	CAA	ATC	AAG	2	GATCAAGTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333339	0	30.999999999999996	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.0120741901647801	0	NA	NA	0.0127918048777826	0.335465241770207	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	CAAGTCATT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.00000000000006	0	30.83333333333333	0.0122953573317573	0	-Inf	0.0122953573317573	0.0123377257660747	0	NA	NA	0.0122477400372632	0.315432676782024	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	352	ATT	TCA	TTT	2	GTCATTTTG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.66666666666671	0	30.83333333333333	0.0121953906538352	0	-Inf	0.0121953906538352	0.0118845887890183	0	NA	NA	0.0121477161263617	0.31541497403532	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	353	TTG	TTT	TGC	2	ATTTTGCTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.00000000000006	0	29.83333333333333	0.0120002560098308	0	-Inf	0.0120002560098308	0.0119925605192685	0	NA	NA	0.011901768371483	0.313322440912911	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	TTGCTGAAT	2	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.33333333333339	0	29.83333333333333	0.0119524441971095	0	-Inf	0.0119524441971095	0.0123621418614959	0	NA	NA	0.0121608734337596	0.325676017629855	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.83333333333339	0	30.499999999999996	0.0117419228044148	0	-Inf	0.0117419228044148	0.0119912476088587	0	NA	NA	0.0114320708751047	0.30437161561324	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.16666666666671	0	31.499999999999996	0.0118345650779739	0	-Inf	0.0118345650779739	0.0117195406602322	0	NA	NA	0.011750169450163	0.313847079696651	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.66666666666671	0	31.999999999999996	0.0119050118672176	0	-Inf	0.0119050118672176	0.0122145940457577	0	NA	NA	0.0125576841518313	0.343116186108251	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.00000000000006	0	31.666666666666664	0.0118579545199817	0	-Inf	0.0118579545199817	0.0118759238434909	0	NA	NA	0.0115414823923029	0.304222547022198	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.00000000000006	0	30.499999999999993	0.0117189884273107	0	-Inf	0.0117189884273107	0.0119095682444365	0	NA	NA	0.0117494834764673	0.318568177596431	620	380	0	0	0.62	0.001
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.3333333333334	0	30.16666666666666	0.0116733874058337	0	-Inf	0.0116733874058337	0.011656376326379	0	NA	NA	0.0123336131835305	0.343909225231144	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	88.00000000000007	0	29.16666666666666	0.0114506040980913	0	-Inf	0.0114506040980913	0.01118116585992	0	NA	NA	0.0115576869491862	0.321815033164408	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	88.00000000000007	0	29.16666666666666	0.0114506040980913	0	-Inf	0.0114506040980913	0.0115742610298971	0	NA	NA	0.0107175567157853	0.285341526265861	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.3333333333334	0	29.16666666666666	0.0116733874058337	0	-Inf	0.0116733874058337	0.0117977235912587	0	NA	NA	0.0119174408876332	0.327322460581894	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.66666666666673	0	30.499999999999996	0.0119050118672176	0	-Inf	0.0119050118672176	0.0120209582654173	0	NA	NA	0.0118264216267603	0.314105252192015	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.3333333333334	0	30.166666666666664	0.0122451699655715	0	-Inf	0.0122451699655715	0.0125134213708952	0	NA	NA	0.0123059900426626	0.319708209331542	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.3333333333334	0	29.166666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0129573426785896	0	NA	NA	0.0126476480214399	0.326997086766758	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.3333333333334	0	29.833333333333332	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.012619099324429	0	NA	NA	0.0121891056928062	0.309127828829806	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.3333333333334	0	30.83333333333333	0.0125525942666428	0	-Inf	0.0125525942666428	0.0127391790770125	0	NA	NA	0.0123624650665997	0.30992493542794203	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.8333333333334	0	31.33333333333333	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.012404638214549	0	NA	NA	0.0121445071044688	0.29827907256792	611	389	0	0	0.611	0.001
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666673	0	31.499999999999996	0.0128208250194751	0	-Inf	0.0128208250194751	0.012572808010595	0	NA	NA	0.0130699224702577	0.326621754299507	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666673	0	30.83333333333333	0.0128208250194751	0	-Inf	0.0128208250194751	0.0128656519376697	0	NA	NA	0.0130511095920227	0.325924902294314	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666673	0	31.333333333333325	0.0129035440872231	0	-Inf	0.0129035440872231	0.0128237624665392	0	NA	NA	0.0132419651124052	0.329836482526318	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000007	0	31.333333333333325	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0124970908561687	0	NA	NA	0.0132345195373291	0.325385165391557	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAG	AGA	AGA	2	AAGAAGAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AGA	AGG	2	AAGAAGGCT	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	GCT	AGG	CTG	2	AAGGCTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	GCTGATGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	GCCTTACCG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAA:AAGAAACAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACCC:AAACAGCAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AAC	AAA	2	CAACCCACA:CAGCAAACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACA	AAA	CAG	2	CAAACTGTG:CCCACAGTG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CAG	TGA	2	ACAGTGACT:ACTGTGACT	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCT	CTG	CTG	2	CCTGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	ATT	TGG	2	GATTTGGAT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	TTG	AAT	TGC	2	CAATTGCAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	TTGCAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	0	ATGAGC---	2	FALSE	0	0	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	NA	NA	0	AGC------	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	NA	NA	0	------AGT	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	GTG	0	---AGTGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	GTG	CTG	2	AGTGCTGAC:AGTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCC:ACTCAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA:CAGGCTTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_EPI_ISL_410721	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.4166666666667	3	34.33333333333333	0.055774819305903	0.0929021112845893	0.600361160092978	-0.0371272919786863	0.0274601192381101	0.0602733732649271	NA	NA	0.0658974512370559	0.573155636564442	305	0	695	0.695	0.305	0.61
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000003	3	34.5	0.0559047993353385	0.0924244803179611	0.604870042471577	-0.0365196809826226	0.0273310342775195	0.0564763562844572	NA	NA	0.0656085192771836	0.577780138819699	272	0	728	0.728	0.272	0.544
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333336	3	34.5	0.0556454425645553	0.0924244803179611	0.602063894469544	-0.0367790377534057	0.0264343629865253	0.059493977317918	NA	NA	0.0686541549654554	0.592155765475393	278	0	722	0.722	0.278	0.556
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.58333333333336	3	34.83333333333333	0.0564308375631679	0.0914838201648647	0.616839540166478	-0.0350529826016968	0.0281049400351006	0.0622230944037538	NA	NA	0.0657022908712885	0.593678974841976	284	0	716	0.716	0.284	0.568
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333336	3	35.83333333333333	0.0572387314369155	0.0887734500607747	0.644773086972846	-0.0315347186238592	0.0298250400651743	0.0569075793209921	NA	NA	0.0641221444610339	0.622866823049205	322	0	678	0.678	0.322	0.644
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAACCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000001	3	36.166666666666664	0.0575131971253351	0.0879053734766805	0.654262587719876	-0.0303921763513454	0.0285222871939067	0.0562361527498441	NA	NA	0.0634618615961047	0.632006510583117	316	3	681	0.681	0.316	0.632
N	all	ss13	8	---	AAC	CAA	1	CAA---AAT:CAACCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666669	3	35.333333333333336	0.0573756358851215	0.0901082338815474	0.636741321115506	-0.032732597996426	0.0291452858057608	0.0560545379798366	NaN	NaN	0.066589417131459	0.623031444686987	344	2	654	0.654	0.344	0.688
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:CCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666669	3	36.333333333333336	0.0565638983071325	0.0874776777943207	0.646609509229619	-0.0309137794871882	0.0289629231671952	0.055977139419479	NaN	NaN	0.0621728898387933	0.619031932253889	316	1	683	0.683	0.316	0.632
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.08333333333336	3	36.666666666666664	0.0568319121182793	0.0866346653413833	0.655995055724329	-0.0298027532231039	0.0283509996796743	0.0523607755233635	NA	NA	0.067570586995309	0.65916880924328	312	1	687	0.687	0.312	0.624
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000001	3	36.25	0.0564972895530331	0.0876910035441767	0.644276918607404	-0.0311937139911436	0.0281190749931813	0.0552748338254566	NaN	NaN	0.0640047768438933	0.625999405132212	324	1	675	0.675	0.324	0.648
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666669	3	36.583333333333336	0.0565638983071325	0.0868438898173542	0.651328474877103	-0.0302799915102217	0.0274899611204491	0.0550596530310764	NaN	NaN	0.0661806233631322	0.647286117022972	344	0	656	0.656	0.344	0.688
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000001	3	37.24999999999999	0.0424141271286909	0.0851978832927791	0.497830761627451	-0.0427837561640881	0.0257451333340643	0.0529989678735973	NA	NA	0.0603525877854296	0.478388522989027	238	3	759	0.759	0.238	0.476
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000001	3	37.416666666666664	0.0421163271222966	0.0847960953267638	0.496677670829068	-0.0426797682044672	0.0245112634303469	0.0504247627143252	NA	NA	0.060054456554459	0.477279800094306	238	2	760	0.76	0.238	0.476
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666669	3	37.166666666666664	0.0559700169039056	0.0854002100517197	0.655385002800453	-0.0294301931478141	0.0281390271809816	0.0523437832285873	NA	NA	0.060574321390362	0.627071658559954	323	1	676	0.676	0.323	0.646
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666669	3	37.166666666666664	0.0559700169039056	0.0854002100517197	0.655385002800453	-0.0294301931478141	0.0271636818961984	0.0539906348881364	NaN	NaN	0.0624034270562834	0.637203895848918	354	2	644	0.644	0.354	0.708
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	3	36.333333333333336	0.0694136680239339	0.0874776777943207	0.793501494028462	-0.0180640097703868	0.0298435706997687	0.0543793306772164	NaN	NaN	0.065892696757819	0.783974867497983	416	1	583	0.583	0.416	0.832
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333334	3	36.333333333333336	0.0687766788210944	0.0874776777943207	0.786219759774642	-0.0187009989732263	0.0299193864332304	0.0517261999405735	NaN	NaN	0.0653896885410939	0.77488341525493	407	0	593	0.593	0.407	0.814
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333334	3	36.333333333333336	0.0692533163185839	0.0874776777943207	0.79166843547692	-0.0182243614757368	0.0301859497397424	0.0532004197354254	NA	NA	0.0627017450610771	0.77131780454189	398	1	601	0.601	0.398	0.796
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.91666666666667	3	36.5	0.0698992129639131	0.0870541284395655	0.802939667731421	-0.0171549154756524	0.0298628682134061	0.0542433407140342	NA	NA	0.0662897128970584	0.795799594087551	409	1	590	0.59	0.409	0.818
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.5	3	35.916666666666664	0.069333399391501	0.0885548256923263	0.782943208904187	-0.0192214263008254	0.0310291809945079	0.0527826659786933	NaN	NaN	0.0655308541296272	0.769278545570992	384	1	615	0.615	0.384	0.768
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.83333333333333	3	36.25	0.0690141740401891	0.0876910035441767	0.787015443441941	-0.0186768295039876	0.0304394001491115	0.055330373724122	NaN	NaN	0.0619709119153068	0.763124299650882	417	1	582	0.582	0.417	0.834
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.5	2	35.583333333333336	0.0683844676038056	0.058423686245627	1.17049217531912	0.00996078135817863	0.0306767692993631	0.0445953363971545	NaN	NaN	0.0573608671342103	0.862139619593917	584	0	416	0.416	0.584	0.832
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.16666666666667	2	36.25	0.0696555937548328	0.0573071018565008	1.21547925995722	0.0123484918983319	0.0318273791086148	0.044299534296726	NaN	NaN	0.0532780606114333	0.816713221583197	605	1	394	0.394	0.605	0.788
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.50000000000001	2	35.916666666666664	0.0683844676038055	0.0578600049104132	1.18189529554461	0.0105244626933923	0.0299178117391592	0.0447695785691445	NaN	NaN	0.0553484977236109	0.849192357018873	589	1	410	0.41	0.589	0.82
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.66666666666669	2	35.75	0.068228833654295	0.0581404786806199	1.17351688879434	0.010088354973675	0.0301013384189164	0.0462213953274226	NaN	NaN	0.054832761960398	0.85402594818886	593	1	406	0.406	0.593	0.812
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333336	2	35.416666666666664	0.0535942229866087	0.0587096677913667	0.912868782992666	-0.00511544480475806	0.0273700934863526	0.0442579598485018	NA	NA	0.0510147474734084	0.920126922669023	466	3	531	0.531	0.466	0.932
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0401881846005798	0.0587096677913667	0.684524135673776	-0.0185214831907869	0.0226376234620848	0.0443900081341389	NA	NA	0.0520210396107377	0.721811872939796	355	5	640	0.64	0.355	0.71
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AACCAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000001	2	35.583333333333336	0.0402781342288958	0.058423686245627	0.68941446213368	-0.0181455520167312	0.0226786037825997	0.0463053518627468	NA	NA	0.051235687802774	0.723220136705627	351	3	646	0.646	0.351	0.702
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA:CAGGATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	2	34.83333333333333	0.0398765009105086	0.0597330472949441	0.667578546823675	-0.0198565463844355	0.0220590639083824	0.0467491316831105	NA	NA	0.0530236089570151	0.708043511787523	332	7	661	0.661	0.332	0.664
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:GATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	2	35.5	0.0404138163712346	0.0585663277285774	0.690052081778634	-0.0181525113573428	0.0228330716484662	0.0414673340837932	NA	NA	0.0488937891125379	0.710440792379782	369	3	628	0.628	0.369	0.738
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333336	3	36.5	0.0548816190849608	0.0870541284395655	0.630430975172654	-0.0321725093546047	0.0282420651447746	0.0519742073816732	NA	NA	0.0537396134654338	0.549390298486887	257	2	741	0.741	0.257	0.514
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333336	3	36.33333333333333	0.0405047802473168	0.0874776777943207	0.463029898239326	-0.0469728975470038	0.0239686585321119	0.0510034853856396	NA	NA	0.0499391412015771	0.346908431057477	151	6	843	0.843	0.151	0.302
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	3	36	0.0399650588551816	0.0883372767422876	0.452414431698799	-0.048372217887106	0.0233877099182765	0.0531489798435431	NA	NA	0.0520538359164428	0.352747687516457	149	6	845	0.845	0.149	0.298
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	3	36	0.0399650588551816	0.0883372767422876	0.452414431698799	-0.048372217887106	0.0232840091009065	0.0518330102966233	NA	NA	0.0526944243871348	0.358631421216695	137	8	855	0.855	0.137	0.274
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666669	3	35.666666666666664	0.0395261602343306	0.089213957146024	0.443049064280769	-0.0496877969116934	0.0229477930390669	0.0514243959829825	NA	NA	0.0522868049384959	0.341963276338192	148	6	846	0.846	0.148	0.296
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAT	2	GCACGGCCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333336	3	35	0.0391819232689515	0.0910206427532006	0.430472935410839	-0.0518387194842491	0.0223978141713157	0.0537799857452107	NA	NA	0.0534893587154108	0.332474947237345	157	6	837	0.837	0.157	0.314
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666669	3	35.58333333333333	0.0392674190316604	0.0894358561096487	0.439056780353491	-0.0501684370779883	0.0214582526136614	0.0524631799135032	NA	NA	0.0518641723066415	0.333391932919587	137	5	858	0.858	0.137	0.274
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAGCAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35.916666666666664	0.0394395350433882	0.0578600049104132	0.681637257107977	-0.0184204698670251	0.0237345353064549	0.041140596756190403	NA	NA	0.0405673984104243	0.649777890201897	323	15	662	0.662	0.323	0.646
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAGCAACGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666669	2	35.916666666666664	0.0400540111089283	0.0578600049104132	0.692257305732092	-0.0178059938014849	0.0231703818822525	0.0407636432365989	NA	NA	0.0402570448693313	0.658266687767337	317	16	667	0.667	0.317	0.634
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666669	2	36.416666666666664	0.0405961546323978	0.0570345959917882	0.711781225525692	-0.0164384413593905	0.0228304513014241	0.0408793100070604	NA	NA	0.0375492838304527	0.661543533012193	326	19	655	0.655	0.326	0.652
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	2	36.75	0.0407801460981609	0.0564972895530331	0.721807124214007	-0.0157171434548722	0.0238783583420089	0.0396168273106433	NA	NA	0.0383616727334852	0.682019027865514	329	20	651	0.651	0.329	0.658
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	2	37.166666666666664	0.0407801460981609	0.0558397336460622	0.730306959496693	-0.0150595875479013	0.0234561910086668	0.0394364240759708	NA	NA	0.0369212887929536	0.683359146335817	353	15	632	0.632	0.353	0.706
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	2	37	0.0407801460981609	0.0561009098120238	0.726907036531175	-0.0153207637138629	0.0236308882293512	0.0426690836982768	NA	NA	0.0378779585352667	0.685861974568307	347	15	638	0.638	0.347	0.694
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666667	2	36	0.0408727688266098	0.0577207808520962	0.708111848509849	-0.0168480120254865	0.0240987149201083	0.0425938810570816	NA	NA	0.0394762883873049	0.669533639538885	326	14	660	0.66	0.326	0.652
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	36	0.0407801460981609	0.0883372767422876	0.461641422534811	-0.0475571306441267	0.0229823550219228	0.052968050344499903	NA	NA	0.0507518565765071	0.348731790737146	171	5	824	0.824	0.171	0.342
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	35.666666666666664	0.0407801460981609	0.089213957146024	0.457105002431543	-0.0484338110478631	0.0239043770950501	0.0560049951787529	NA	NA	0.0519425858651047	0.351104543647195	173	6	821	0.821	0.173	0.346
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	35.666666666666664	0.0407801460981609	0.089213957146024	0.457105002431543	-0.0484338110478631	0.0233398232771343	0.0532061652144313	NA	NA	0.0514079057585718	0.346117316013456	153	4	843	0.843	0.153	0.306
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666666	3	35.666666666666664	0.0411531794236846	0.089213957146024	0.461286336131528	-0.0480607777223394	0.0232635141578592	0.0517114157495104	NA	NA	0.0515261424041489	0.350951383801485	148	3	849	0.849	0.148	0.296
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333333	3	36	0.0413422677171007	0.0883372767422876	0.468004779428636	-0.046995009025187	0.023178704737057	0.0528785994388903	NA	NA	0.0541754647051084	0.385690419463802	187	5	808	0.808	0.187	0.374
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333333	3	36	0.0413422677171007	0.0883372767422876	0.468004779428636	-0.046995009025187	0.0246588906954526	0.0528980744679377	NA	NA	0.0518665704796168	0.364896093623776	136	4	860	0.86	0.136	0.272
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	36	0.0409658133601689	0.0883372767422876	0.463743222237666	-0.0473714633821187	0.0233669471401316	0.0548790947985751	NA	NA	0.0522170343856259	0.364299324573806	165	5	830	0.83	0.165	0.33
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666667	3	35.33333333333333	0.0411531794236846	0.0901082338815474	0.456708312336727	-0.0489550544578628	0.0232921754604814	0.0514606465967667	NA	NA	0.0523314026449148	0.349540258120258	142	6	852	0.852	0.142	0.284
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333334	3	34.33333333333333	0.0413422677171007	0.0929021112845893	0.445008914710839	-0.0515598435674887	0.0228866222115349	0.0570355919651127	NA	NA	0.0562672856276184	0.359489721403406	165	6	829	0.829	0.165	0.33
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333334	3	33.75	0.054693929928504303	0.094613463995175	0.578077660609631	-0.0399195340666707	0.0265763558832847	0.0576089283318563	NA	NA	0.060548951338271	0.509707272979878	229	0	771	0.771	0.229	0.458
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333334	3	33.25	0.0543223783836108	0.0961313950679982	0.565084677541464	-0.0418090166843874	0.0250303974314975	0.0610639491046699	NA	NA	0.0572155759486699	0.464945380867889	195	0	805	0.805	0.195	0.39
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666667	3	33.58333333333333	0.054077470426008	0.0951140793534504	0.568553791337793	-0.0410366089274424	0.0264671798895801	0.0569288755398747	NA	NA	0.0575227444831695	0.475599531224951	228	2	770	0.77	0.228	0.456
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666667	3	33.58333333333333	0.054077470426008	0.0951140793534504	0.568553791337793	-0.0410366089274424	0.0281554825544722	0.0596230449695595	NaN	NaN	0.0548610348262408	0.454454056884003	235	3	762	0.762	0.235	0.47
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	33.08333333333333	0.0535942229866087	0.0966482688635724	0.554528535449111	-0.0430540458769637	0.0262172251320204	0.061258464990523	NA	NA	0.0584867123392448	0.461649274046747	207	2	791	0.791	0.207	0.414
N	all	ss13	60	CAC	AAC	ACG	2	CAACATGGC:CAGCACGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333334	3	32.416666666666664	0.0528853382457436	0.0987726497511971	0.535424921564409	-0.0458873115054535	0.025769232207042	0.061132000637293	NA	NA	0.0610938563807289	0.452595273381829	193	0	807	0.807	0.193	0.386
N	all	ss13	61	GGC	ACG	GCA	2	CACGGCAAG:CATGGCAAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000001	3	33.08333333333333	0.053834761795598	0.0966482688635724	0.557017341630718	-0.0428135070679744	0.0251835345572624	0.059165251585968	NA	NA	0.0598286847390127	0.474237338485566	215	1	784	0.784	0.215	0.43
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	33.416666666666664	0.0535942229866087	0.0956200277799543	0.560491606527688	-0.0420258047933456	0.0249318717916063	0.061461743136831	NA	NA	0.0572275479517666	0.462727413705896	218	1	781	0.781	0.218	0.436
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000001	3	33.083333333333336	0.053834761795598	0.0966482688635724	0.557017341630718	-0.0428135070679744	0.0272212736281357	0.0590007171843246	NA	NA	0.0595424418034406	0.472115138926034	213	2	785	0.785	0.213	0.426
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666669	3	33.25	0.0544456664773409	0.0961313950679982	0.566367173167818	-0.0416857285906574	0.0269378207317382	0.060406939666663	NA	NA	0.054345799292727	0.443054159457021	239	0	761	0.761	0.239	0.478
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666669	3	33.5	0.0417257068817799	0.095366381613935	0.437530565547671	-0.053640674732155	0.0247714290621301	0.0613213075935036	NA	NA	0.0573554051739063	0.349668171690564	157	5	838	0.838	0.157	0.314
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666669	3	32.5	0.0417257068817799	0.0985020015458152	0.423602629662023	-0.0567762946640353	0.023295870894929	0.061425306036649	NA	NA	0.0554807455230606	0.306141762844446	118	5	877	0.877	0.118	0.236
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333334	3	32.666666666666664	0.0277809537602618	0.0979651368127982	0.283580002683491	-0.0701841830525363	0.0198453601995058	0.0604201191828662	NA	NA	0.0542708167641237	0.195934487213404	56	13	931	0.931	0.056	0.112
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000001	3	33.333333333333336	0.0283052459871352	0.0958750286324137	0.295230639206982	-0.0675697826452784	0.0199696871572056	0.0579760817624235	NA	NA	0.0562353621938504	0.22953666053751	63	12	925	0.925	0.063	0.126
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000001	3	33.333333333333336	0.0283052459871352	0.0958750286324137	0.295230639206982	-0.0675697826452784	0.0199849987135915	0.0577950379489606	NA	NA	0.0528586379582662	0.201139762152424	61	18	921	0.921	0.061	0.122
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.16666666666669	3	33.333333333333336	0.02784542552167	0.0958750286324137	0.290434599278502	-0.0680296031107437	0.0191309944919731	0.0556179830842505	NA	NA	0.0550287987822836	0.216363957998262	67	7	926	0.926	0.067	0.134
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333336	3	33.416666666666664	0.0278777737612569	0.0956200277799543	0.291547434240562	-0.0677422540186974	0.0204113714773212	0.0613525452157886	NA	NA	0.0550784154090441	0.218725640588742	59	18	923	0.923	0.059	0.118
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333336	3	33.75	0.0428178090539073	0.094613463995175	0.452555135874646	-0.0517956549412677	0.0253389952571434	0.0573338509734408	NA	NA	0.058273471118813	0.374090339998679	185	3	812	0.812	0.185	0.37
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333336	3	33.75	0.0428178090539073	0.094613463995175	0.452555135874646	-0.0517956549412677	0.0240818823746749	0.0583519375755318	NA	NA	0.0570593039217814	0.364009655543194	168	4	828	0.828	0.168	0.336
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000003	3	33.08333333333333	0.0424141271286909	0.0966482688635724	0.4388503552874	-0.0542341417348815	0.0252490387060918	0.0580844645427679	NA	NA	0.0584531029172349	0.353499316511182	151	9	840	0.84	0.151	0.302
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333336	3	33.75	0.0428178090539073	0.094613463995175	0.452555135874646	-0.0517956549412677	0.0247541376408022	0.0569579428861038	NA	NA	0.0580605564025253	0.372340880393972	168	5	827	0.827	0.168	0.336
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333336	3	33.75	0.0428178090539073	0.094613463995175	0.452555135874646	-0.0517956549412677	0.0243602716960298	0.059487686263056	NA	NA	0.0580383999688003	0.372158382953232	153	5	842	0.842	0.153	0.306
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.75000000000003	3	34.416666666666664	0.043648679432241	0.0926626795339059	0.471049182387065	-0.0490140001016649	0.0260548292810048	0.0566111966165845	NA	NA	0.0602772242138659	0.416136102158922	178	10	812	0.812	0.178	0.356
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.4166666666667	3	34.416666666666664	0.0432292511544661	0.0926626795339059	0.46652278319502	-0.0494334283794399	0.0252529959641899	0.0586578264546639	NA	NA	0.0543106886797396	0.362718601976745	160	4	836	0.836	0.16	0.32
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.4166666666667	3	34.416666666666664	0.0432292511544661	0.0926626795339059	0.46652278319502	-0.0494334283794399	0.0254870794423367	0.0563146052862517	NA	NA	0.0579529926306983	0.393663843119961	198	5	797	0.797	0.198	0.396
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTCCA:AGTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	3	33.916666666666664	0.0729614963194685	0.0941180977157371	0.775212186500333	-0.0211566013962685	0.039133398019307	0.0568123986839686	NaN	NaN	0.0636499013962742	0.739594661988179	371	0	629	0.629	0.371	0.742
N	all	ss13	81	AAA	GTA	AAG	2	AGTCCAGAT:GGTAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.9166666666667	2	33.58333333333333	0.0729614963194685	0.0620508745044359	1.17583348989308	0.0109106218150327	0.0378979215052335	0.0470940160916721	NA	NA	0.0520388052803871	0.833930558618057	587	7	406	0.406	0.587	0.812
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333337	1	33.58333333333333	0.0578600049104132	0.0303839016876759	1.90429805576556	0.0274761032227373	0.0360806336082541	0.0328293517467485	NA	NA	0.0481714196726722	0.568418740525018	705	17	278	0.278	0.705	0.556
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.6666666666667	2	34.24999999999999	0.0588537115811214	0.0607927570603562	0.968104004934178	-0.0019390454792348	0.0349802510189218	0.0440160393164376	NA	NA	0.0586388925553776	0.973620706779269	477	5	518	0.518	0.477	0.954
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.00000000000003	2	35.24999999999999	0.0594370287406054	0.0589984642956841	1.00743348916208	4.38564444921227e-4	0.0361286852121994	0.0442885463737371	NA	NA	0.0598585588992709	0.994154208265036	536	5	459	0.459	0.536	0.918
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.1666666666667	2	35.416666666666664	0.0601826482875392	0.0587096677913667	1.02508923234597	0.00147298049617247	0.0369739904796811	0.0444475636820203	NA	NA	0.0561266041132029	0.979062807747845	509	6	485	0.485	0.509	0.97
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	35.416666666666664	0.0606390724718212	0.0587096677913667	1.03286349170482	0.00192940468045446	0.0372751909231329	0.0435566981454089	NA	NA	0.0560056128771035	0.972518151747181	529	12	459	0.459	0.529	0.918
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.33333333333336	2	35.75	0.0609472230590743	0.0581404786806199	1.04827521964297	0.00280674437845437	0.0363822985920441	0.0447026067619343	NA	NA	0.0587207818401066	0.961877115845841	536	3	461	0.461	0.536	0.922
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.66666666666669	2	36.08333333333333	0.0606390724718212	0.0575822255219405	1.0530866412712	0.00305684694988063	0.0379258983934706	0.0448655564491748	NA	NA	0.0587318301964222	0.958490817776856	551	5	444	0.444	0.551	0.888
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.16666666666669	2	35.58333333333333	0.0601826482875392	0.058423686245627	1.03010700205593	0.00175896204191219	0.0374998766889944	0.0428550182579268	NA	NA	0.0585741804799711	0.976043407868322	539	7	454	0.454	0.539	0.908
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333336	2	35.416666666666664	0.059584670169267	0.0587096677913667	1.01490388910068	8.75002377900252e-4	0.036374767530531	0.0436931687735668	NA	NA	0.0578917414160551	0.987940865310071	499	5	496	0.496	0.499	0.992
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.16666666666669	2	35.58333333333333	0.0611024764460932	0.058423686245627	1.04585109863154	0.00267879020046617	0.0361695934527792	0.0447657407874871	NA	NA	0.0611179918180098	0.965040061947251	517	7	476	0.476	0.517	0.952
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.50000000000003	2	34.916666666666664	0.0607927570603561	0.059584670169267	1.02027512928505	0.00120808689108914	0.0374426627717501	0.0434529829650968	NA	NA	0.0588479698425324	0.98362142006891	522	5	473	0.473	0.522	0.946
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	34.74999999999999	0.0606390724718212	0.0598821656332629	1.01263993762674	7.56906838558287e-4	0.0369131657178068	0.0441845121395589	NA	NA	0.0576603925869672	0.989526485871142	529	3	468	0.468	0.529	0.936
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.83333333333337	2	34.74999999999999	0.0604861633757488	0.0598821656332629	1.01008643785839	6.03997742485894e-4	0.0370492452535459	0.044864754432589	NA	NA	0.0601749144692459	0.991991473760876	484	2	514	0.514	0.484	0.968
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.25000000000004	2	35.49999999999999	0.060107245116144	0.0585663277285774	1.02631063697058	0.00154091738756652	0.0378421386679371	0.0450838569544356	NA	NA	0.0564018032070399	0.978204220552243	507	4	489	0.489	0.507	0.978
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75000000000004	1	35.49999999999999	0.05965876642654	0.0287116399282627	2.0778599402751	0.0309471264982773	0.0372465196745822	0.0286807106115295	NA	NA	0.0462015044891057	0.502966543069722	764	12	224	0.224	0.764	0.448
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333337	1	35.83333333333333	0.0593634822039754	0.0284394261467203	2.08736568374188	0.0309240560572551	0.0367921458930042	0.0300425756690711	NA	NA	0.0495245550248655	0.532352676623092	739	16	245	0.245	0.739	0.49
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000004	1	36.16666666666666	0.0592169340983304	0.0281723261817365	2.10195401389039	0.0310446079165939	0.0371098207962009	0.0293504577129318	NA	NA	0.0449230168788548	0.489526327110449	750	18	232	0.232	0.75	0.464
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.91666666666671	1	35.49999999999999	0.0586379101169781	0.0287116399282627	2.04230445434282	0.0299262701887155	0.0355323912365819	0.0295534232520316	NA	NA	0.0463114242086888	0.518152246377977	727	11	262	0.262	0.727	0.524
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000004	1	35.49999999999999	0.0592169340983304	0.0287116399282627	2.06247132683074	0.0305052941700677	0.0364448071520609	0.0296386102936538	NA	NA	0.0498325520850952	0.540434570743419	740	12	248	0.248	0.74	0.496
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000004	1	35.49999999999999	0.0592169340983304	0.0287116399282627	2.06247132683074	0.0305052941700677	0.0352226525147281	0.0290438339509762	NA	NA	0.0474865337403231	0.520614252973596	746	16	238	0.238	0.746	0.476
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000004	1	35.49999999999999	0.0592169340983304	0.0287116399282627	2.06247132683074	0.0305052941700677	0.0370829633127703	0.0299902101389436	NA	NA	0.0467436298387739	0.514008648939096	741	18	241	0.241	0.741	0.482
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.58333333333337	1	36.16666666666666	0.0589259989959384	0.0281723261817365	2.09162703199635	0.030753672814202	0.0370877069737454	0.0295568983594666	NA	NA	0.0467747095653426	0.510869073014517	735	15	250	0.25	0.735	0.5
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333337	2	37.33333333333333	0.0749687265834466	0.0555809791152914	1.34881982607646	0.0193877474681552	0.0399643471454902	0.0397864048738312	NA	NA	0.0500222117666161	0.698324820637591	671	8	321	0.321	0.671	0.642
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	2	37.74999999999999	0.0597330472949441	0.0549444688504895	1.08715305734386	0.00478857844445458	0.0388108730769446	0.0393034497995241	NA	NA	0.0470254908681497	0.918892073508021	534	24	442	0.442	0.534	0.884
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	38.24999999999999	0.0595846701692669	0.0541996476239405	1.09935530545678	0.00538502254532639	0.0380055601805039	0.0380902597034726	NA	NA	0.0452450339470185	0.905260235537827	544	17	439	0.439	0.544	0.878
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	37.58333333333333	0.0595846701692669	0.0551973146854054	1.07948494431055	0.00438735548386144	0.0375762323779493	0.0400467599492693	NA	NA	0.0466513854224735	0.925072968557091	536	10	454	0.454	0.536	0.908
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	37.58333333333333	0.0595846701692669	0.0551973146854054	1.07948494431055	0.00438735548386144	0.0363818180481482	0.041889843193799	NA	NA	0.0446878448610584	0.921791089200854	532	26	442	0.442	0.532	0.884
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.00000000000003	2	37.74999999999999	0.0594370287406054	0.0549444688504895	1.08176546218584	0.0044925598901159	0.0368226408788283	0.0395461892135304	NA	NA	0.0451286168352774	0.920701483727272	522	22	456	0.456	0.522	0.912
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.33333333333336	2	38.416666666666664	0.0609472230590743	0.0539558430514737	1.12957595715687	0.00699138000760065	0.0398620403059854	0.0411783406164647	NA	NA	0.0475719016211143	0.883160052988644	547	17	436	0.436	0.547	0.872
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.83333333333336	2	37.416666666666664	0.0604861633757488	0.0554524994575896	1.09077433780977	0.00503366391815918	0.0360045391551129	0.0418808741861045	NA	NA	0.0473411771747959	0.915322598851403	515	21	464	0.464	0.515	0.928
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	36.58333333333333	0.0606390724718212	0.0567646707244323	1.0682537518133	0.00387440174738887	0.0381050487362947	0.0406679391231512	NA	NA	0.0462744694428031	0.933273846243019	557	10	433	0.433	0.557	0.866
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333337	2	35.916666666666664	0.0600320307551523	0.0578600049104132	1.03753933045982	0.00217202584473903	0.0371031056441322	0.0412327812526979	NA	NA	0.048887126368238	0.964562124483967	516	8	476	0.476	0.516	0.952
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	35.416666666666664	0.0595846701692669	0.0587096677913667	1.01490388910068	8.75002377900162e-4	0.0373934083122863	0.0414123685517591	NA	NA	0.0468757104456221	0.985107204989174	523	14	463	0.463	0.523	0.926
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.50000000000004	2	35.74999999999999	0.0581404786806199	0.0581404786806199	0.999999999999999	-8.32667268468867e-17	0.0361649851797575	0.0435483997630992	NA	NA	0.0465890208433735	0.999999999999999	492	14	494	0.494	0.492	0.984
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.00000000000004	2	36.24999999999999	0.0577207808520962	0.0573071018565008	1.00721863402954	4.13678995595405e-4	0.0352869966161149	0.0417240692899536	NA	NA	0.0462222239431277	0.992859199552196	521	15	464	0.464	0.521	0.928
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	2	35.916666666666664	0.0574443341110378	0.0578600049104132	0.992815921809563	-4.15670799375475e-4	0.0352789873410882	0.0413794481280582	NA	NA	0.046864680865621	0.99292317885115	485	20	495	0.495	0.485	0.97
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000006	2	35.24999999999999	0.0568993130810351	0.0589984642956841	0.964420239751858	-0.00209915121464903	0.0352600479735784	0.0415169885614884	NA	NA	0.0459294931272698	0.963546355029154	441	17	542	0.542	0.441	0.882
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.33333333333339	2	34.24999999999999	0.0558397336460622	0.0607927570603562	0.918526093340749	-0.00495302341429396	0.0353791308213561	0.0459301861278444	NA	NA	0.0506797760212859	0.922145300023964	440	12	548	0.548	0.44	0.88
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	2	34.24999999999999	0.0563645417845084	0.0607927570603562	0.927158834539264	-0.00442821527584776	0.0352372300420144	0.0433197097711558	NA	NA	0.0479177707837162	0.926370071544016	418	11	571	0.571	0.418	0.836
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666671	2	34.416666666666664	0.0559700169039055	0.0604861633757489	0.925335874854743	-0.00451614647184335	0.0358858229459577	0.044746469342654	NA	NA	0.0513195144174055	0.929876223866031	451	10	539	0.539	0.451	0.902
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	33.74999999999999	0.0412002891133781	0.0617314855970427	0.66741126857559	-0.0205311964836647	0.0324094812740409	0.0433250614366827	NA	NA	0.0459233866155686	0.654820933903418	281	39	680	0.68	0.281	0.562
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	34.416666666666664	0.0412002891133781	0.0604861633757489	0.681152296888726	-0.0192858742623708	0.0301446558570895	0.0437255279985216	NA	NA	0.0457827916879054	0.673574558096554	293	46	661	0.661	0.293	0.586
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	35.08333333333333	0.041581086362894	0.0592901175479514	0.701315633743937	-0.0177090311850573	0.030551437146693	0.0432406263954341	NA	NA	0.0445347181353448	0.690891500841613	314	49	637	0.637	0.314	0.628
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	35.08333333333333	0.041581086362894	0.0592901175479514	0.701315633743937	-0.0177090311850573	0.0301991937325315	0.0433787523411423	NA	NA	0.0428119800526725	0.679132919683836	340	44	616	0.616	0.34	0.68
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.66666666666671	2	35.24999999999999	0.0412948328872705	0.0589984642956841	0.699930640233483	-0.0177036314084137	0.0303914779598897	0.0425136564627576	NA	NA	0.043853256149256	0.686432133782234	319	67	614	0.614	0.319	0.638
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666671	2	34.25	0.0407339920153049	0.0607927570603562	0.670046794799311	-0.0200587650450513	0.0321631175101117	0.0443390820402226	NA	NA	0.0437737341621075	0.646781845104923	279	55	666	0.666	0.279	0.558
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAC	2	AACAAACAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666671	2	34.25	0.0407339920153049	0.0607927570603562	0.670046794799311	-0.0200587650450513	0.0291051756789511	0.0447015437123434	NA	NA	0.045329839018863	0.658122462242835	293	42	665	0.665	0.293	0.586
N	all	ss13	129	CAA	AAC	AAG	2	AAACAAGGC:AAAGACGGC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666671	2	33.75	0.0407339920153049	0.0617314855970427	0.659857633772161	-0.0209974935817378	0.0303807202873243	0.0461737475584068	NA	NA	0.0437561031286533	0.631315732892223	299	47	654	0.654	0.299	0.598
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	CAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333339	2	33.916666666666664	0.0134835092215562	0.0614153696041381	0.219546170746284	-0.0479318603825819	0.0139482233511883	0.0455631710309715	NA	NA	0.0367766975039284	0.192465025555419	0	110	890	0.89	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000006	2	34.25	0.0135443861537981	0.0607927570603562	0.222796050199713	-0.0472483709065581	0.0145051683785856	0.0427082703740046	NA	NA	0.035371309768197	0.18162042708311	0	118	882	0.882	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666673	2	34.25	0.0134683754007452	0.0607927570603562	0.221545724392357	-0.047324381659611	0.0136885802018503	0.0443481864966981	NA	NA	0.0360394020309594	0.189139504760656	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666673	1	34.25	0.0133782811395161	0.0297805871963345	0.449228252328174	-0.0164023060568184	0.0141002051887372	0.0293560791300055	NA	NA	0.0164431377055612	0.318513724778799	0	353	647	0.647	0	0.001
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.0833333333334	1	33.58333333333333	0.0134382094503063	0.0303839016876759	0.442280573062708	-0.0169456922373696	0.0136887442736206	0.0295543086437068	NA	NA	0.0166586577435845	0.309043861519388	0	341	659	0.659	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000006	1	33.41666666666666	0.0134081783305544	0.0305385697640887	0.439057180284898	-0.0171303914335343	0.0138297159472442	0.0311633282798944	NA	NA	0.0177712887985484	0.335077833227962	0	385	615	0.615	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666673	1	33.74999999999999	0.0134683754007452	0.0302307926160697	0.445518434524468	-0.0167624172153245	0.0130540773796673	0.0298235283902039	NA	NA	0.0173709744724814	0.334561338196505	0	335	665	0.665	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.5833333333334	1	34.08333333333333	0.0135291154422588	0.0299291581301553	0.452037955208216	-0.0164000426878966	0.01317484382742	0.0300337214779956	NA	NA	0.015766944726019	0.29826859274059	0	359	641	0.641	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25000000000007	1	33.75	0.0135904058348962	0.0302307926160697	0.449555061539207	-0.0166403867811735	0.0139734288617102	0.0299474026789669	NA	NA	0.0165356463714715	0.314254824981606	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCC	2	GGAGCCCTG:GGAGCCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.75000000000007	1	34.25	0.0136833898069031	0.0297805871963345	0.459473472322511	-0.0160971973894314	0.0140831135170183	0.0299910815449524	NA	NA	0.0166948521929182	0.334945036720582	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	140	CTG	CCC	TGA	2	GCCCTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.75000000000007	1	34.25	0.0136833898069031	0.0297805871963345	0.459473472322511	-0.0160971973894314	0.0141281801350051	0.029225241110368	NA	NA	0.0172916097714507	0.351892195060213	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666674	1	33.916666666666664	0.0133782811395161	0.0300792190929219	0.444768233450058	-0.0167009379534058	0.013633516196979	0.0285451978568332	NA	NA	0.0173319073636312	0.335249052862164	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666674	1	34.916666666666664	0.0133782811395161	0.0292007684815911	0.458148255514239	-0.0158224873420749	0.0135305749181461	0.0304907474641762	NA	NA	0.0154671786915574	0.306321188037842	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000007	1	35.08333333333333	0.0134081783305544	0.0290593249318817	0.461407082304378	-0.0156511466013273	0.0139075940055375	0.0293878589668581	NA	NA	0.0164899504295586	0.342553266021014	0	359	641	0.641	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.0833333333334	2	35.58333333333333	0.0271215992572094	0.058423686245627	0.464222663787146	-0.0313020869884176	0.0190491955779344	0.0406149186211248	NA	NA	0.0229514478345857	0.172618142333248	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.8333333333334	2	35.83333333333333	0.0412002891133781	0.0579999025523778	0.710351005782664	-0.0167996134389998	0.0236788421348134	0.0428627034131212	NA	NA	0.0275012328819851	0.541287204410558	227	33	740	0.74	0.227	0.454
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666674	2	36.33333333333333	0.0424641704996309	0.0571705240409132	0.742763359475978	-0.0147063535412823	0.0244923106741073	0.0413844421241083	NA	NA	0.0257695284701662	0.568211341944245	249	47	704	0.704	0.249	0.498
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.33333333333341	2	36.166666666666664	0.0426655308015385	0.0574443341110379	0.742728268362682	-0.0147788033094993	0.0249458783059459	0.0391884371516402	NA	NA	0.0264672241616853	0.576584032335617	266	42	692	0.692	0.266	0.532
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000007	2	35.166666666666664	0.0419689902360334	0.0591439311842398	0.709607721294268	-0.0171749409482064	0.0248789293100392	0.041784567124508	NA	NA	0.027046031545779	0.525411271779401	216	38	746	0.746	0.216	0.432
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666673	2	35.5	0.0427669289697661	0.0585663277285774	0.730230673979887	-0.0157993987588114	0.0240771494318537	0.0414260162814886	NA	NA	0.0282973352364057	0.576615502345888	228	44	728	0.728	0.228	0.456
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	2	34.833333333333336	0.042364201600918	0.0597330472949441	0.709225521204973	-0.0173688456940261	0.0253102684960965	0.0440751043097589	NA	NA	0.0281204688379176	0.536800494810604	233	52	715	0.715	0.233	0.466
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	2	35	0.042464170499631	0.0594370287406054	0.714439658229767	-0.0169728582409744	0.024857752226785	0.0430125365934033	NA	NA	0.0283730030987722	0.549703486633176	242	38	720	0.72	0.242	0.484
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.3333333333334	2	34.66666666666667	0.0426655308015385	0.0600320307551523	0.710712768914231	-0.0173664999536138	0.0251383207062443	0.0419264518995204	NA	NA	0.0287499667769756	0.545808492086053	228	48	724	0.724	0.228	0.456
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000007	2	34.66666666666667	0.0422647024133488	0.0600320307551523	0.704035860218196	-0.0177673283418035	0.0244935392715208	0.0429625218384765	NA	NA	0.0284022031586314	0.531602516449497	233	39	728	0.728	0.233	0.466
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.5	0.0277167798918218	0.0295604764056575	0.937629675228009	-0.00184369651383563	0.0191451084128698	0.0298398115275901	NA	NA	0.0226092427211356	0.935007631154578	394	133	473	0.473	0.394	0.788
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.3333333333334	1	34.333333333333336	0.0277809537602618	0.0297068535712844	0.935169848721906	-0.00192589981102255	0.0203536750525507	0.0328520154538234	NA	NA	0.022291181418092	0.931150524630699	413	137	450	0.45	0.413	0.826
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.66666666666673	1	34.333333333333336	0.0280406490537152	0.0297068535712844	0.943911780708418	-0.00166620451756912	0.0198511465310958	0.0299841426983385	NA	NA	0.0215944312014844	0.938497064978701	418	123	459	0.459	0.418	0.836
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000007	1	34.333333333333336	0.0422647024133488	0.0297068535712844	1.42272564517581	0.0125578488420644	0.0246272751310169	0.0314572414252343	NA	NA	0.0269055738425098	0.640687468718883	627	47	326	0.326	0.627	0.652
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATCGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666673	1	34.166666666666664	0.0421656696333547	0.0298546878003148	1.41236344239748	0.01231098183304	0.0240357618715181	0.0304028013228872	NA	NA	0.0264365072659987	0.641443781403459	647	42	311	0.311	0.647	0.622
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.83333333333333	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0244658494952493	0.0288392743200141	NA	NA	0.025980700421093898	0.600735990916985	660	58	282	0.282	0.66	0.564
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35	0.0429711784958646	0.0291298749871979	1.47515835597474	0.0138413035086667	0.0250345508414943	0.02944421263809	NA	NA	0.0253796417487393	0.585498844592986	675	48	277	0.277	0.675	0.554
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.66666666666673	1	35.5	0.0430740368144066	0.0287116399282627	1.50022906814201	0.0143623968861439	0.0252083029217468	0.0292789754623206	NA	NA	0.0256282002735996	0.575197226668132	704	38	258	0.258	0.704	0.516
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	1	35.833333333333336	0.042464170499631	0.0284394261467203	1.49314442142947	0.0140247443529107	0.0251568022999815	0.0297215847999137	NA	NA	0.0251686890303461	0.57737041008216	694	49	257	0.257	0.694	0.514
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	1	35.833333333333336	0.042464170499631	0.0284394261467203	1.49314442142947	0.0140247443529107	0.0238067791379384	0.0287159214207881	NA	NA	0.0253457781080504	0.580033006407664	669	49	282	0.282	0.669	0.564
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.3333333333334	2	36.5	0.0426655308015385	0.0568993130810351	0.749842634141733	-0.0142337822794966	0.0253795426848092	0.0422044639061871	NA	NA	0.0389980242247057	0.715120911045602	356	12	632	0.632	0.356	0.712
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.00000000000006	3	36.5	0.0577207808520961	0.0870541284395655	0.663044727306264	-0.0293333475874694	0.0306655028694995	0.0510985901040852	NA	NA	0.0439879610038837	0.504868302878686	226	3	771	0.771	0.226	0.452
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	3	36.166666666666664	0.0574443341110378	0.0879053734766805	0.65347921110052	-0.0304610393656427	0.0291005088459792	0.0540960694716067	NA	NA	0.0456092602167135	0.504216820225125	245	5	750	0.75	0.245	0.49
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666671	3	36.833333333333336	0.0579999025523778	0.0862192295848232	0.672702630627394	-0.0282193270324454	0.028592295251224	0.0532550179640959	NA	NA	0.0412153090052818	0.493545424176701	255	6	739	0.739	0.255	0.51
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.66666666666671	3	37.5	0.073228852172937	0.0845966206090083	0.865623846978341	-0.0113677684360713	0.0322430444158049	0.0484786864969425	NA	NA	0.0443053747197418	0.797504838817031	424	3	573	0.573	0.424	0.848
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA:TTGCCAAAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.83333333333339	4	38	0.0741343759774744	0.113423227292943	0.653608416431359	-0.0392888513154683	0.0328561557650479	0.0611067342115048	NA	NA	0.0562059412900062	0.484542042241735	233	0	767	0.767	0.233	0.466
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC:CCAAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.33333333333339	4	38.5	0.0746885290720774	0.111834664347976	0.667847751030776	-0.0371461352758985	0.0333874651624813	0.0606013339154758	NaN	NaN	0.0528373554786906	0.482038360003761	252	0	748	0.748	0.252	0.504
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0331892047965754	0.058122830734301	NA	NA	0.0532269488231311	0.519605431961804	265	0	735	0.735	0.265	0.53
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0336348290167096	0.0583060231875994	NaN	NaN	0.055854471053787	0.556057116906707	231	0	769	0.769	0.231	0.462
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0353788026516417	0.057840889069453	NaN	NaN	0.0541388330801091	0.536101796657425	271	2	727	0.727	0.271	0.542
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0338615424585075	0.061225095663173	NaN	NaN	0.057811163461182	0.518656531388558	258	1	741	0.741	0.258	0.516
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0329412733799198	0.0623217875592915	NaN	NaN	0.0587151016242855	0.482822571127199	246	0	754	0.754	0.246	0.492
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0351527654078974	0.0641244407592107	NA	NA	0.0544408943353042	0.456634563287269	238	0	762	0.762	0.238	0.476
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0329751932066454	0.064902108830145	NaN	NaN	0.0564271708259696	0.464231589930666	225	4	771	0.771	0.225	0.45
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	36.41666666666667	0.0761108787135566	0.118766081588831	0.640846929488278	-0.0426552028752743	0.0327245675236523	0.0640859031527413	NA	NA	0.0581642047590359	0.463339919797823	247	0	753	0.753	0.247	0.494
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.08333333333336	4	35.91666666666667	0.0772884020029997	0.120559681536883	0.64108001130838	-0.0432712795338834	0.0349352932221329	0.0643450259854467	NaN	NaN	0.0602495565921887	0.472633486914655	243	1	756	0.756	0.243	0.486
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0772884020029997	0.12178588422283	0.634625289262473	-0.0444974822198306	0.0367332708037397	0.0610598251731543	NA	NA	0.0615659141493168	0.469826326967366	240	0	760	0.76	0.24	0.48
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.583333333333336	0.0764993759663411	0.12178588422283	0.628146492136732	-0.0452865082564892	0.0338731842008484	0.0617805428161455	NaN	NaN	0.0605205220399075	0.454289172763869	230	0	770	0.77	0.23	0.46
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.41666666666669	4	35.25000000000001	0.076891863117256	0.12303734291849899	0.624947363892519	-0.0461454798012433	0.0341418803098397	0.0685857919019635	NA	NA	0.0598761512568743	0.440895366459668	221	0	779	0.779	0.221	0.442
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.41666666666669	4	35.25000000000001	0.076891863117256	0.12303734291849899	0.624947363892519	-0.0461454798012433	0.0344114157569137	0.0655542155324525	NaN	NaN	0.0611493741621164	0.450467802897287	211	2	787	0.787	0.211	0.422
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333334	4	35.25000000000001	0.0761108787135566	0.12303734291849899	0.618599824314907	-0.0469264642049427	0.0338417088862077	0.0615351899213865	NA	NA	0.0602542220927155	0.436092883082656	213	1	786	0.786	0.213	0.426
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.75000000000001	4	35.25000000000001	0.0753456127890199	0.12303734291849899	0.612380038464658	-0.0476917301294794	0.0323377368446659	0.0647310848183001	NA	NA	0.0607095925941089	0.432118524092452	203	1	796	0.796	0.203	0.406
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.91666666666669	5	34.583333333333336	0.089770784493262007	0.160610991304224	0.558933008035678	-0.0708402068109618	0.0367537556963182	0.0786740393026882	NaN	NaN	0.0694568854252494	0.307768177322814	135	0	865	0.865	0.135	0.27
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.16666666666669	5	34.333333333333336	0.0894358561096487	0.161916285324778	0.552358621186588	-0.0724804292151296	0.0361698670726789	0.079242921592196	NaN	NaN	0.0703357804377691	0.302779304805038	106	0	894	0.894	0.106	0.212
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.16666666666669	5	34.333333333333336	0.0894358561096487	0.161916285324778	0.552358621186588	-0.0724804292151296	0.0359193692893195	0.0792307862746493	NaN	NaN	0.0702467461585815	0.302166909666746	112	2	886	0.886	0.112	0.224
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333336	5	34.333333333333336	0.0885548256923263	0.161916285324778	0.546917350004043	-0.073361459632452	0.0357241554584645	0.0778530163019011	NaN	NaN	0.0763134914484304	0.336392783182546	113	1	886	0.886	0.113	0.226
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333336	5	34.333333333333336	0.0885548256923263	0.161916285324778	0.546917350004043	-0.073361459632452	0.0357762477348789	0.0792184745676056	NA	NA	0.0693969099817641	0.290452891348422	109	0	891	0.891	0.109	0.218
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333336	5	35.00000000000001	0.0885548256923263	0.158481820250405	0.558769615041066	-0.0699269945580789	0.0359738898495649	0.0793357996641835	NaN	NaN	0.0685291551753701	0.307539868791113	124	2	874	0.874	0.124	0.248
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.83333333333336	5	34.00000000000001	0.0872653886078579	0.163690174515013	0.53311317473031306	-0.0764247859071556	0.0351315784320917	0.0829360635849186	NaN	NaN	0.0705821278963667	0.27890690596402	104	1	895	0.895	0.104	0.208
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.50000000000003	5	33.00000000000001	0.085197883292779	0.169253998250676	0.503372943465686	-0.0840561149578973	0.034406417937977	0.0844166679580501	NaN	NaN	0.080194172248026	0.294566094673473	94	1	905	0.905	0.094	0.188
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.83333333333336	4	32.00000000000001	0.069014174040189	0.136741167595466	0.504706631176063	-0.0677269935552769	0.0310027861390377	0.076722168277731	NaN	NaN	0.070050806196743	0.333630647683253	151	1	848	0.848	0.151	0.302
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333336	4	31.33333333333334	0.054693929928504303	0.139939466685309	0.390839919745429	-0.0852455367568047	0.0265234520691999	0.0805248736987072	NaN	NaN	0.0679820292425019	0.209863007210984	66	2	932	0.932	0.066	0.132
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.500000000000004	0.0535942229866087	0.139125907283501	0.385221013347271	-0.0855316842968921	0.0264053360495956	0.0742324758222192	NaN	NaN	0.0743059250541636	0.249701428370948	68	2	930	0.93	0.068	0.136
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000003	4	31.66666666666667	0.053834761795598	0.138321779350139	0.389199459756254	-0.0844870175545414	0.0263939966607831	0.0774385389144631	NA	NA	0.0723991698604111	0.243226064474542	94	1	905	0.905	0.094	0.188
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.6666666666667	4	32.333333333333336	0.0548189130040021	0.135196367873208	0.405476225925043	-0.0803774548692059	0.0268816175896553	0.0746463958703975	NA	NA	0.0705498957002088	0.254578292493609	88	2	910	0.91	0.088	0.176
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000003	4	33	0.0545695157118212	0.132209431753494	0.412750550305418	-0.0776399160416727	0.026770870692617	0.0733142742333154	NA	NA	0.064990517629976	0.232229854714974	75	1	924	0.924	0.075	0.15
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666667	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.43165206854741	-0.0723443196299825	0.0274548978470808	0.0713594986370849	NA	NA	0.0621257514206209	0.244228731392386	85	2	913	0.913	0.085	0.17
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333337	4	33.5	0.0539558430514737	0.130054644852002	0.4148705577788	-0.076098801800528	0.0264751045964105	0.0710002706504005	NA	NA	0.0651058176310479	0.242464895418537	82	2	916	0.916	0.082	0.164
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333337	4	33.5	0.0539558430514737	0.130054644852002	0.4148705577788	-0.076098801800528	0.0259981751893161	0.0731336778892977	NA	NA	0.0674488072095489	0.259216324491826	79	2	919	0.919	0.079	0.158
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	33.83333333333333	0.054693929928504303	0.128656816904346	0.425114900589904	-0.0739628869758413	0.0267741977357077	0.0690916187009014	NaN	NaN	0.064642257535496	0.252545732431014	81	3	916	0.916	0.081	0.162
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.16666666666666	0.0554524994575896	0.127288788480472	0.435643233937267	-0.0718362890228824	0.0274695413735417	0.0681697847332562	NA	NA	0.0621934616711911	0.248071722076276	85	3	912	0.912	0.085	0.17
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0557100557871529	0.124638389543236	0.446973488596203	-0.0689283337560835	0.0286236963890587	0.0674665477013024	NA	NA	0.0590512409292645	0.243104140878712	83	2	915	0.915	0.083	0.166
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666669	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0268998155291579	0.0701374154038782	NA	NA	0.0656062389357855	0.271833112232491	96	2	902	0.902	0.096	0.192
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333336	4	34.66666666666666	0.0414852284880391	0.125290563497375	0.331112155057938	-0.0838053350093355	0.024066615080556	0.0694236715281875	NA	NA	0.0620189223628271	0.176603662050816	39	4	957	0.957	0.039	0.078
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.58333333333336	4	35.08333333333332	0.0413422677171007	0.123672788927057	0.334287502333959	-0.0823305212099561	0.0239023673835266	0.0710639253685776	NA	NA	0.0608431568731025	0.176004546869626	44	2	954	0.954	0.044	0.088
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333337	4	34.24999999999999	0.0405047802473168	0.126951325912032	0.319057559709016	-0.0864465456647148	0.0229757344170803	0.0707271899494541	NA	NA	0.0599260312880266	0.149146104646898	35	4	961	0.961	0.035	0.07
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.9166666666667	4	33.41666666666666	0.0400540111089283	0.130408872715656	0.30714176324691	-0.0903548616067273	0.0228701645420323	0.0717417100210095	NA	NA	0.0601174301501483	0.132846061293971	39	6	955	0.955	0.039	0.078
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333337	4	33.749999999999986	0.0402331091273882	0.129003442367267	0.311876244455915	-0.0887703332398786	0.0231335862022568	0.0688524011323285	NA	NA	0.0628045372676668	0.157526915046871	34	8	958	0.958	0.034	0.068
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333337	4	34.41666666666666	0.0407801460981609	0.126281753068954	0.322929838294956	-0.0855016069707933	0.0235970561092002	0.0679346641970626	NA	NA	0.0607794504180406	0.159500971932404	40	5	955	0.955	0.04	0.08
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333337	4	34.58333333333332	0.0405047802473168	0.125619222573624	0.322440940307343	-0.0851144423263076	0.0240791385921003	0.0697801545365789	NA	NA	0.0612932224754622	0.164941146335319	44	7	949	0.949	0.044	0.088
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	3	33.91666666666666	0.0403232602433046	0.0941180977157372	0.428432588651463	-0.0537948374724326	0.0229118954156837	0.0639705998388612	NA	NA	0.0489092353022223	0.271379529676913	71	17	912	0.912	0.071	0.142
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000004	2	34.249999999999986	0.0268785763539719	0.0607927570603562	0.442134518217134	-0.0339141807063843	0.0190150024422256	0.0464648103160553	NA	NA	0.0418127319420157	0.417309978617295	160	55	785	0.785	0.16	0.32
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	35.249999999999986	0.0272447663451876	0.0589984642956841	0.461787720586155	-0.0317536979504965	0.0191759226504325	0.0449797372572851	NA	NA	0.0417670862094321	0.447101290098968	175	48	777	0.777	0.175	0.35
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	2	35.41666666666666	0.0273067703935705	0.0587096677913667	0.465115396166251	-0.0314028973977962	0.0182767516418871	0.0470996682069338	NA	NA	0.0389872397924938	0.42055079947752	205	59	736	0.736	0.205	0.41
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333339	2	35.16666666666666	0.0134835092215562	0.0591439311842398	0.227977899871986	-0.0456604219626835	0.0136316318506025	0.0446150273932023	NA	NA	0.0381739015987594	0.231651218208557	0	113	887	0.887	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000006	1	34.83333333333332	0.0408264049162627	0.0292720079293014	1.39472512493396	0.0115543969869613	0.0311795575071226	0.0309006369205705	NA	NA	0.0321061890677221	0.718936369395679	523	131	346	0.346	0.523	0.692
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666673	1	34.16666666666666	0.0404592471687861	0.0298546878003148	1.35520583699956	0.0106045593684714	0.0298019786868777	0.0325500750061445	NA	NA	0.0335217746874841	0.751738087552784	540	137	323	0.323	0.54	0.646
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000006	1	33.999999999999986	0.0400094855289696	0.0300040009602743	1.3334716787252	0.0100054845686952	0.0313856263610838	0.0343245268048606	NA	NA	0.0332236680667379	0.763296054435147	534	116	350	0.35	0.534	0.7
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666673	1	33.83333333333332	0.039920730758297	0.0301548153585304	1.32385923387868	0.00976591539976666	0.0302244230623653	0.0323738066328232	NA	NA	0.0332032166219349	0.768661943711681	514	132	354	0.354	0.514	0.708
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.8333333333334	1	34.16666666666665	0.0400986359257937	0.0298546878003148	1.34312695527069	0.010243948125479	0.0296048977380739	0.0303431816855532	NA	NA	0.0314916473364589	0.744960873687374	527	131	342	0.342	0.527	0.684
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	34.66666666666665	0.0397883346582442	0.029415534864961	1.35262999095213	0.0103727997932833	0.0311095817438202	0.0326037178504276	NA	NA	0.0330186582029247	0.753407384490934	539	132	329	0.329	0.539	0.658
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	34.999999999999986	0.0397005575048303	0.0291298749871979	1.36288114941372	0.0105706825176324	0.0289502795656487	0.0301102760013553	NA	NA	0.0327984906085558	0.747231692182144	550	119	331	0.331	0.55	0.662
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACCGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333341	1	35.249999999999986	0.0394395350433882	0.0289192452027623	1.36378161901753	0.0105202898406259	0.0297729270920885	0.0283419391053675	NA	NA	0.0337211485656916	0.75505649125102	558	117	325	0.325	0.558	0.65
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GACCGATTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333341	1	35.58333333333332	0.0399650588551815	0.0286430990492925	1.39527705386924	0.0113219598058891	0.0282624115320241	0.0295888056508511	NA	NA	0.0319166830789805	0.722788239622814	536	129	335	0.335	0.536	0.67
N	all	ss13	228	TTA	GAT	TAA	2	AGATTGAAC:CGATTAAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.66666666666665	0.0397883346582442	0.0285748846742028	1.39242328050985	0.0112134499840414	0.0295700502001767	0.030806556490518	NA	NA	0.0318882060116342	0.725101648358364	537	145	318	0.318	0.537	0.636
N	all	ss13	229	AAC	TAA	ACC	2	TTAAACCAG:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333341	1	36.33333333333332	0.0394395350433882	0.0280406490537152	1.40651291515532	0.0113988859896729	0.0291911107788381	0.0301224398398214	NA	NA	0.0317422259812563	0.71951432769932	558	120	322	0.322	0.558	0.644
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	37.33333333333332	0.0397883346582442	0.0272757331281561	1.45874482901329	0.0125126015300881	0.0307591218349496	0.0272528054013106	NA	NA	0.0296543375709858	0.673062650744739	565	140	295	0.295	0.565	0.59
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000007	1	37.33333333333332	0.0401433603117784	0.0272757331281561	1.47176100173598	0.0128676271836223	0.030154572653803	0.0288981285639297	NA	NA	0.0328772435992237	0.695513415491103	528	126	346	0.346	0.528	0.692
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	37.16666666666665	0.0397005575048303	0.027400307499342	1.44890919584693	0.0123002500054883	0.0292265539892775	0.0278049315221	NA	NA	0.0307292946329357	0.688952023806299	527	144	329	0.329	0.527	0.658
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333341	1	36.16666666666665	0.0391819232689515	0.0281723261817365	1.39079474716406	0.0110095970872151	0.0299135526094757	0.0310679404222383	NA	NA	0.0313179979868997	0.725181638839377	563	147	290	0.29	0.563	0.58
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0302356382646156	0.0293960047474743	NA	NA	0.0323202624291058	0.725369657588352	548	119	333	0.333	0.548	0.666
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0305813365832	0.0299571314719016	NA	NA	0.0306696460632543	0.71123515082409	568	128	304	0.304	0.568	0.608
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000009	0	36.33333333333332	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0264391262845997	0	NA	NA	0.0262293720822542	0.315138016325429	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333341	0	35.91666666666665	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0276667607382725	0	NA	NA	0.0263918844052875	0.324984965598434	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.91666666666665	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0269284892125295	0	NA	NA	0.0260197693799558	0.321246516303075	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	35.58333333333332	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0267398172523168	0	NA	NA	0.0266570221842152	0.330866181959891	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	36.249999999999986	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0253552383231891	0	NA	NA	0.0260831746334019	0.320338031336532	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	36.41666666666666	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0266183297176664	0	NA	NA	0.0279733028405482	0.35308505224994	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	0	36.83333333333332	0.0395261602343306	0	-Inf	0.0395261602343306	0.0302576804542442	0	NA	NA	0.0305407313282397	0.195592437418904	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	37.16666666666666	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0315141723826546	0	NA	NA	0.0308782218681242	0.186609208547804	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.16666666666666	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0307802009763413	0	NA	NA	0.0308089394506315	0.175628677268598	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.33333333333332	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0324706137406493	0	NA	NA	0.0311390311677321	0.18025155594254	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666673	0	36.33333333333332	0.0411531794236845	0	-Inf	0.0411531794236845	0.029881136380517	0	NA	NA	0.029549929399775	0.163720840791497	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.0833333333334	0	36.16666666666666	0.0410592825874941	0	-Inf	0.0410592825874941	0.0308912758608855	0	NA	NA	0.0308609301716983	0.183366229702936	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.83333333333332	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0294973735663	0	NA	NA	0.0317820743229148	0.198431847627513	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	0	35.49999999999999	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.0298484107286814	0	NA	NA	0.0306149562092602	0.187801807301193	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	0	34.666666666666664	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.02961945603997	0	NA	NA	0.0297564502685283	0.176349640212899	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333339	0	35.166666666666664	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0294527913376361	0	NA	NA	0.0293250429725046	0.167206669159066	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333339	0	34.83333333333333	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.029005019572453	0	NA	NA	0.0308853398971844	0.195671806505558	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000006	0	34.166666666666664	0.0390967990762099	0	-Inf	0.0390967990762099	0.0305629273056477	0	NA	NA	0.0279473780660136	0.161829967531554	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	0	33.833333333333336	0.0389276557511924	0	-Inf	0.0389276557511924	0.028831116390695	0	NA	NA	0.0303208452892075	0.199191691810619	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666673	0	33.50000000000001	0.038759969965707	0	-Inf	0.038759969965707	0.0296616761301445	0	NA	NA	0.0291629639106699	0.183820923010894	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	256	TCC	CAT	CCA	2	GCATCCAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	0	33.833333333333336	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0295732824354332	0	NA	NA	0.0296006333445437	0.191343083691667	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333339	0	33.333333333333336	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0291271241748915	0	NA	NA	0.0283481186010123	0.175224375179027	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333339	0	32.083333333333336	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0292390441139381	0	NA	NA	0.0286210297563857	0.186329470584323	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0289866129641179	0	NA	NA	0.0279910027337784	0.174792461280856	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0291106517549333	0	NA	NA	0.0274812995236029	0.166930994245547	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.41666666666667	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0278816807070153	0	NA	NA	0.0276364798329849	0.16932627410799	855	145	0	0	0.855	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333337	0	32.08333333333334	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0279220579052931	0	NA	NA	0.0286249426389383	0.186389669637091	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.1666666666667	0	32.58333333333334	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0299666281655607	0	NA	NA	0.0276385809168834	0.164855630049714	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.1666666666667	0	33.583333333333336	0.0388855983989721	0	-Inf	0.0388855983989721	0.0294820410289976	0	NA	NA	0.0293436743018195	0.185112043809624	852	148	0	0	0.852	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333337	0	32.91666666666667	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0287229328246747	0	NA	NA	0.029607878729082	0.19288260778186	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000003	0	32.41666666666667	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0281499704549197	0	NA	NA	0.0286505548907295	0.1849303092106	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000003	0	32.41666666666667	0.0377438129156367	0	-Inf	0.0377438129156367	0.0281711592444917	0	NA	NA	0.0275908674769353	0.171317678199439	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.91666666666669	0	32.333333333333336	0.0380229253413546	0	-Inf	0.0380229253413546	0.0275995974965198	0	NA	NA	0.0275534554592472	0.16759606729739	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.833333333333336	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0124881534999648	0	NA	NA	0.012983646908317	0.338172124764526	658	342	0	0	0.658	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	33.00000000000001	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0125378229982313	0	NA	NA	0.0122118425078381	0.307523973873501	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333334	0	32.66666666666667	0.012513324680928	0	-Inf	0.012513324680928	0.0125118751216618	0	NA	NA	0.0123797619781233	0.312117527602001	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000001	0	33.5	0.0125657389590355	0	-Inf	0.0125657389590355	0.012929181448849	0	NA	NA	0.0124864525325921	0.314247334553987	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	32.833333333333336	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0122764565043236	0	NA	NA	0.012410344020409	0.315325777495839	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000001	0	33.333333333333336	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.0125865681048543	0	NA	NA	0.0118501344128234	0.291989582766393	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000001	0	33	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0121248766700554	0	NA	NA	0.0122623999936089	0.314521723831085	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000001	0	32.5	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0125061571341436	0	NA	NA	0.0118907480627089	0.299635417443704	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGGCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666669	0	32.833333333333336	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0122452608759893	0	NA	NA	0.0121160708238175	0.306720046465404	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT:AGGCGTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666669	0	32.583333333333336	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.012272061868857	0	NA	NA	0.012390348823778	0.31755141931659	608	392	0	0	0.608	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0120915695977047	0	NA	NA	0.0119445475478705	0.297827212629098	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0117689381102408	0	NA	NA	0.0125082157270589	0.320131346308319	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000001	0	32.25	0.0123332686697829	0	-Inf	0.0123332686697829	0.0122427616869069	0	NA	NA	0.0124954855905747	0.32363383516407	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666669	0	32.416666666666664	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0118647172916551	0	NA	NA	0.0121603774767596	0.311472532232406	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000001	0	33.083333333333336	0.0127256499425275	0	-Inf	0.0127256499425275	0.0127020971190974	0	NA	NA	0.0123406240621188	0.302447101082578	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333334	0	32.75	0.0128345378007018	0	-Inf	0.0128345378007018	0.0129974471009849	0	NA	NA	0.0123789656005914	0.299828086497921	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666667	0	32.75	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0125625213467909	0	NA	NA	0.0128555588759128	0.313943842472695	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.91666666666667	1	33.083333333333336	0.0261179819037762	0.0308526791703671	0.846538537530366	-0.00473469726659096	0.018271616122657	0.0314207937463786	NA	NA	0.0242454793856943	0.845172460180049	347	125	528	0.528	0.347	0.694
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666667	1	32.91666666666667	0.0262896575662818	0.0310121698640216	0.847720674869041	-0.00472251229773987	0.0182981310608879	0.0304737549980566	NA	NA	0.0241048016346756	0.844676044274812	377	105	518	0.518	0.377	0.754
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25	1	32.583333333333336	0.0263473854682498	0.0313361505112163	0.840798408177776	-0.00498876504296641	0.0185615394076946	0.032113683328967	NA	NA	0.0237169223865111	0.833397461509654	331	115	554	0.554	0.331	0.662
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75	1	33.083333333333336	0.0265221005560517	0.0308526791703671	0.859636870094745	-0.00433057861431541	0.0186426428901341	0.0326093785579388	NA	NA	0.0231866497829258	0.851840697824821	347	133	520	0.52	0.347	0.694
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77	1	32.833333333333336	0.0264344542962561	0.0310925352587596	0.850186518283639	-0.00465808096250348	0.0186487068939049	0.0312000758167863	NA	NA	0.0227377210259604	0.837680427635465	378	111	511	0.511	0.378	0.756
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666667	1	31.666666666666668	0.026032982222434	0.0322630388127681	0.806898022641668	-0.00623005659033412	0.0184757871995127	0.0329296681923318	NA	NA	0.0240404422078297	0.795520278191352	345	133	522	0.522	0.345	0.69
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333334	1	31.25	0.0128345378007018	0.0327027281115989	0.39246076831583	-0.0198681903108971	0.0135527311210247	0.0355021450242366	NA	NA	0.0219258621923497	0.364854767116558	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	1	30.916666666666668	0.012461345857946	0.0330632048490145	0.376894675360468	-0.0206018589910685	0.0124686062737624	0.0346839583514802	NA	NA	0.021817605415792	0.345028209675574	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333336	1	31.916666666666668	0.0123586730492886	0.0320048558445568	0.38614993641318	-0.0196461827952682	0.0128307341903669	0.0330065233568058	NA	NA	0.0215152221216227	0.361174466755452	0	344	656	0.656	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.25000000000001	1	31.75	0.0122576783566175	0.0321765161581571	0.380951073023798	-0.0199188378015396	0.0122912067887302	0.0324998761214709	NA	NA	0.0208015807796395	0.338282831707963	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666667	1	32.41666666666667	0.012461345857946	0.031500692980973	0.395589578472856	-0.0190393471230271	0.0131853949720608	0.0337785068442284	NA	NA	0.0204130586168884	0.35097267487618	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666667	1	32.083333333333336	0.0375469431438597	0.0318350176854428	1.17942271981299	0.00571192545841687	0.0298125241736882	0.033937749506179	NA	NA	0.0311071825165082	0.854310951613553	523	129	348	0.348	0.523	0.696
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333334	1	31.916666666666668	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0274503232305113	0.0336349947837918	NA	NA	0.0338394650832978	0.871726614084085	482	136	382	0.382	0.482	0.764
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333334	1	31.916666666666668	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0272384297614179	0.0329473759749749	NA	NA	0.0313427981802136	0.861608045480646	528	125	347	0.347	0.528	0.694
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.08333333333334	1	31.583333333333336	0.0370064785139329	0.0323500281131817	1.14393960909276	0.00465645040075115	0.0282414965975448	0.0346338802821416	NA	NA	0.0308097095396816	0.879868584809399	488	135	377	0.377	0.488	0.754
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333334	2	31.333333333333336	0.0496048518784087	0.0667106145123721	0.743582595378566	-0.0171057626339634	0.0295210865005926	0.0501148822006305	NA	NA	0.0392912565365132	0.663302595520492	305	49	646	0.646	0.305	0.61
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333334	2	31.666666666666668	0.0502279695796377	0.0659765797094679	0.761299991615507	-0.0157486101298302	0.0308728197885051	0.0506053847965834	NA	NA	0.0411187642998358	0.701717538860252	324	49	627	0.627	0.324	0.648
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333334	2	32	0.0508669472540708	0.0652585327422224	0.779468141813734	-0.0143915854881516	0.0304347346548918	0.0497728388164918	NA	NA	0.0421890395670191	0.733012169291548	368	44	588	0.588	0.368	0.736
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000001	2	31	0.0504391702568756	0.0674611774972046	0.747676991836759	-0.0170220072403291	0.0316709821581346	0.0515850649691815	NA	NA	0.0414523839623696	0.681336523508199	310	50	640	0.64	0.31	0.62
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30	0.0511925740908369	0.069817817299509	0.733230800831651	-0.0186252432086721	0.0322195761818203	0.0549032290619143	NA	NA	0.0439219182648958	0.671526795849486	317	36	647	0.647	0.317	0.634
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	29.333333333333336	0.0513020451633004	0.0714826348532437	0.717685424839547	-0.0201805896899433	0.0319215004374951	0.0558364730472602	NA	NA	0.043048018269504	0.639217935037671	311	58	631	0.631	0.311	0.622
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	29.75	0.0511380136321413	0.0704329495874262	0.726052421937338	-0.019294935955285	0.0300558803280997	0.0549771318880044	NA	NA	0.0448334185509979	0.666926877708183	323	46	631	0.631	0.323	0.646
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333334	2	30.083333333333336	0.0513569565272317	0.0696151556756318	0.737726663523195	-0.0182581991484001	0.0322083780784569	0.0527667257757794	NA	NA	0.0442034280947058	0.679570425826447	329	45	626	0.626	0.329	0.658
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333334	2	30.58333333333334	0.0516889101836223	0.0684234871721278	0.75542642329223	-0.0167345769885055	0.0308244821811436	0.0505364628700272	NA	NA	0.0423356958900731	0.692634111864711	319	53	628	0.628	0.319	0.638
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75	2	30.58333333333334	0.0512472511431301	0.0684234871721278	0.748971636219172	-0.0171762360289977	0.0329276538006554	0.0522464996945757	NA	NA	0.0414313663978694	0.678456104514776	320	46	634	0.634	0.32	0.64
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75	2	30.58333333333334	0.0512472511431301	0.0684234871721278	0.748971636219172	-0.0171762360289977	0.030871436313922	0.0519033862975883	NA	NA	0.0431060697509667	0.690287864088721	347	41	612	0.612	0.347	0.694
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.41666666666667	2	30.250000000000004	0.051467132797986	0.0692133441658409	0.743601301429194	-0.0177462113678549	0.0338428535883874	0.0495308759704854	NA	NA	0.0443119186932668	0.688800116956418	339	35	626	0.626	0.339	0.678
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333334	2	30.250000000000004	0.0510292410063947	0.0692133441658409	0.737274605372692	-0.0181841031594462	0.0314639930207857	0.0501119391337882	NA	NA	0.0421102301926855	0.665871145273435	318	42	640	0.64	0.318	0.636
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333334	2	29.250000000000007	0.0503862036875865	0.0716963405107659	0.702772321831692	-0.0213101368231793	0.0309604492641986	0.0521195473554527	NA	NA	0.0473559118216521	0.652710798340922	303	43	654	0.654	0.303	0.606
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333334	2	28.91666666666667	0.0497591768358708	0.0725641058409195	0.68572714097734	-0.0228049290050487	0.0308796481118331	0.0533183308325818	NA	NA	0.0450850393616728	0.612982792838571	282	42	676	0.676	0.282	0.564
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333334	2	29.250000000000007	0.0503862036875865	0.0716963405107659	0.702772321831692	-0.0213101368231793	0.0310574646375707	0.0539653492746747	NA	NA	0.0454572800551208	0.639216312302723	298	54	648	0.648	0.298	0.596
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGGATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	28.416666666666668	0.0501754455827152	0.0739059002893285	0.678909875751289	-0.0237304547066133	0.0306353919431289	0.0585411526632427	NA	NA	0.0459424539167053	0.605487346646572	285	42	673	0.673	0.285	0.57
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG:GGGATGTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.083333333333336	0.0499664439235005	0.0748283653087125	0.667747367156272	-0.024861921385212	0.0305574796610481	0.0571280709940688	NA	NA	0.0473986801715272	0.599911548636802	253	44	703	0.703	0.253	0.506
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0310625401255307	0.0579052821072712	NA	NA	0.0450387481068532	0.575390554187104	280	45	675	0.675	0.28	0.56
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0501754455827152	0.0748283653087125	0.670540447806269	-0.0246529197259974	0.0304649723537885	0.05465166479857	NA	NA	0.0482555578306156	0.609433340137327	293	40	667	0.667	0.293	0.586
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.0290994541490062	0.0558873123949918	NA	NA	0.04696461154549	0.610237873511881	251	58	691	0.691	0.251	0.502
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0495536228075988	0.075298294736773	0.658097543653914	-0.0257446719291742	0.0313601208225852	0.0558583636697919	NA	NA	0.0496839154026184	0.604340261029068	241	54	705	0.705	0.241	0.482
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.030651658261044	0.0583069146313527	NA	NA	0.0468086051470811	0.576384599780404	260	52	688	0.688	0.26	0.52
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.0306211941945088	0.0565860069469966	NA	NA	0.0485486752897614	0.593006090997298	260	58	682	0.682	0.26	0.52
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0499664439235005	0.0725641058409195	0.688583471737951	-0.022597661917419	0.03104225251882	0.0538987285744609	NA	NA	0.0461912446120761	0.62468623924946	293	43	664	0.664	0.293	0.586
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.0498108321742552	0.0714826348532436	0.696824232577865	-0.0216718026789884	0.0305832171270753	0.0538242872933993	NA	NA	0.041776159687865	0.603928080288607	283	41	676	0.676	0.283	0.566
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0493497606808473	0.071696340510766	0.688316311952309	-0.0223465798299186	0.0321172061708192	0.0551258867337662	NA	NA	0.0461222645174963	0.628025792861072	291	47	662	0.662	0.291	0.582
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0495536228075988	0.108952531416164	0.454818462347788	-0.0593989086085652	0.0303413845511473	0.0688064346167824	NA	NA	0.0615700363200176	0.334676423853225	134	15	851	0.851	0.134	0.268
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0491475696448996	0.108952531416164	0.451091580948878	-0.0598049617712643	0.030457202790778	0.070186569961427	NA	NA	0.0596422494658143	0.315992049580342	135	20	845	0.845	0.135	0.27
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.11306631811959	0.425953340236639	-0.0649053422482923	0.0303129169051805	0.0689827918933657	NA	NA	0.0690062192584242	0.346924053725907	136	16	848	0.848	0.136	0.272
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.154888999008431	0.310938647545113	-0.106728023137133	0.0290611502137854	0.0883071030755453	NA	NA	0.0818125663754759	0.192048456869408	56	5	939	0.939	0.056	0.112
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0485508200337835	0.152908411727716	0.317515691159214	-0.104357591693933	0.0293585514828658	0.0852458307699157	NA	NA	0.0827830276482216	0.207447307346762	53	8	939	0.939	0.053	0.106
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0599719947335073	0.154888999008431	0.387193377950896	-0.0949170042749234	0.0327405133217314	0.0900693824753816	NaN	NaN	0.0816451722426315	0.245010092199879	71	1	928	0.928	0.071	0.142
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0318016368871397	0.0842054193812872	NA	NA	0.0828846409362034	0.269711619897131	75	2	923	0.923	0.075	0.15
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0316006975121386	0.0890392901280202	NA	NA	0.076806471049001	0.233625467411463	79	4	917	0.917	0.079	0.158
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333337	3	29.91666666666667	0.0473997786251612	0.107647107231784	0.440325614353027	-0.0602473286066223	0.0296139952111658	0.0684244357680772	NA	NA	0.0717618247760194	0.401163177456652	187	3	810	0.81	0.187	0.374
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.91666666666671	3	30.250000000000004	0.0474936093526965	0.106372646579413	0.44648329133411	-0.0588790372267168	0.0295568436992318	0.0693797585666072	NA	NA	0.066417265167263	0.375347086463048	168	4	828	0.828	0.168	0.336
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.00000000000006	3	29.83333333333334	0.0468902677360004	0.107970516691131	0.43428770346759	-0.0610802489551308	0.0290092358817632	0.0681821734995799	NA	NA	0.0724469918018171	0.399171050836661	173	5	822	0.822	0.173	0.346
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0464364923107347	0.108623210908842	0.427500641181606	-0.0621867185981073	0.0287878931692001	0.0672927539108947	NA	NA	0.0692074423502007	0.368889542734965	162	5	833	0.833	0.162	0.324
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0280092877149532	0.0740107678692981	NA	NA	0.0686385189484171	0.356297389615427	122	6	872	0.872	0.122	0.244
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0290352163345742	0.0683692187400795	NA	NA	0.0685747276414486	0.355850156160204	153	4	843	0.843	0.153	0.306
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.58333333333339	3	29.583333333333336	0.0709889121664901	0.108952531416164	0.651558171653076	-0.0379636192496739	0.038294979986296	0.0732822771106665	NA	NA	0.0735944745549472	0.605960036330309	283	3	714	0.714	0.283	0.566
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.91666666666671	3	30.583333333333336	0.0724180213610206	0.105128058952294	0.68885530735313	-0.0327100375912736	0.0385431838768119	0.068904468264622	NA	NA	0.0746327397234922	0.661183318080524	332	0	668	0.668	0.332	0.664
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.25000000000006	3	30.583333333333336	0.0739059002893284	0.105128058952294	0.703008321716146	-0.0312221586629658	0.0404766141244128	0.0685948861329861	NA	NA	0.0697624941493129	0.654478466875684	296	6	698	0.698	0.296	0.592
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.91666666666671	3	30.25	0.075140996593953	0.106372646579413	0.70639397448719	-0.0312316499854603	0.0414441378630385	0.0680174628384084	NaN	NaN	0.0772506773071936	0.685999728910151	319	5	676	0.676	0.319	0.638
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.58333333333339	3	30.583333333333336	0.0754562533850991	0.105128058952294	0.717755603376452	-0.0296718055671951	0.0410390842914049	0.0685963464030789	NA	NA	0.0727659049978002	0.68344201085364	338	1	661	0.661	0.338	0.676
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000006	3	30.75	0.0499664439235005	0.104516640682884	0.478071660139795	-0.054550196759383	0.0296984195137755	0.0683270016186394	NA	NA	0.0658552373340028	0.407480817423168	195	5	800	0.8	0.195	0.39
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333339	3	30.916666666666668	0.0500707265730995	0.103912304538584	0.481855606950837	-0.0538415779654844	0.029747170959891	0.0697345405348371	NA	NA	0.0654861764160264	0.410973126408188	188	5	807	0.807	0.188	0.376
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333339	3	31.249999999999996	0.0507056829412418	0.102724391304868	0.493608989035099	-0.0520187083636263	0.0312448315049951	0.0625723934406889	NA	NA	0.0678303347369044	0.44314426398593	211	8	781	0.781	0.211	0.422
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333339	3	32.083333333333336	0.0516889101836222	0.0998703029515669	0.51756036235005	-0.0481813927679447	0.0326303860547924	0.0643266963463029	NA	NA	0.0676266436854937	0.476178927128716	191	8	801	0.801	0.191	0.382
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	2	32	0.0383879094086674	0.0652585327422224	0.58824352610414	-0.026870623333555	0.0285981932033297	0.0508964305293353	NA	NA	0.0587040959247096	0.647146462534522	319	14	667	0.667	0.319	0.638
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	32	0.0379827996140662	0.100148544468392	0.379264619527785	-0.0621657448543258	0.0286909774059547	0.0592891431144136	NA	NA	0.0689976558675338	0.367597128271811	135	7	858	0.858	0.135	0.27
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.3333333333334	3	31	0.0373521168628637	0.103612753860613	0.360497288906271	-0.0662606369977492	0.0287488227904443	0.0668622386189202	NA	NA	0.0761555478960277	0.384262298681666	148	8	844	0.844	0.148	0.296
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.3333333333334	3	31	0.0368926831430787	0.103612753860613	0.356063146364292	-0.0667200707175341	0.0280911084589202	0.0658121769412328	NA	NA	0.0744776153866821	0.370337909258199	173	5	822	0.822	0.173	0.346
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.8333333333334	3	31.666666666666668	0.0362243442097796	0.101277212852957	0.357675168869163	-0.0650528686431775	0.0263107158108592	0.0627120526199038	NA	NA	0.0721859771654694	0.367490341929988	146	5	849	0.849	0.146	0.292
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666673	3	32.66666666666667	0.0365183693771989	0.0979651368127982	0.372769033610212	-0.0614467674355992	0.0262344036086767	0.0633074751169071	NA	NA	0.0699730974986769	0.379863160429635	162	6	832	0.832	0.162	0.324
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0303005794062317	0.0621010133561777	NA	NA	0.0696751904899911	0.484428969264589	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0319155254239411	0.0639903084721214	NaN	NaN	0.0734123514859356	0.495837998823465	243	1	756	0.756	0.243	0.486
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0295358030545133	0.083935668367966	NA	NA	0.0911323076474375	0.316472790968356	114	0	886	0.886	0.114	0.228
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0313299844451607	0.0846976098643207	NaN	NaN	0.0894384324006572	0.297681634744796	108	1	891	0.891	0.108	0.216
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0384754684131662	0.0937464892301997	NaN	NaN	0.0973296727036828	0.451081441486275	206	0	794	0.794	0.206	0.412
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0394106995959645	0.0823775813317296	NaN	NaN	0.0945961254164852	0.444575473373198	208	0	792	0.792	0.208	0.416
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0401841517873078	0.0862765319834501	NaN	NaN	0.0903622591343367	0.433211010582166	200	0	800	0.8	0.2	0.4
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0396222320616689	0.083432426941016	NaN	NaN	0.0996334166143889	0.498391626894364	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0407271175366375	0.0800808399995885	NaN	NaN	0.0988724981789004	0.498537868463823	221	0	779	0.779	0.221	0.442
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.042105493000378	0.0876431553462916	NaN	NaN	0.0986897651019838	0.469913361671388	219	0	781	0.781	0.219	0.438
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0438811601893938	0.0978909759225026	NaN	NaN	0.110727632240044	0.398923612833162	152	1	847	0.847	0.152	0.304
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.046001720899939	0.0948478872045094	NaN	NaN	0.0998376864457087	0.392088147402384	156	1	843	0.843	0.156	0.312
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0468462800127278	0.088745818402692	NaN	NaN	0.103394461218675	0.429809645830737	185	1	814	0.814	0.185	0.37
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0454971550189754	0.0946082875541127	NaN	NaN	0.0989136340935875	0.424010550232123	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0475531467057401	0.0947438873704028	NaN	NaN	0.103020660124204	0.418810246041167	172	0	828	0.828	0.172	0.344
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0466144634047767	0.0942342829525721	NA	NA	0.105022930988311	0.449358744931605	183	0	817	0.817	0.183	0.366
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0446077983505557	0.0873166057941605	NaN	NaN	0.10496447555254	0.454271294803703	196	0	804	0.804	0.196	0.392
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_FJ588686.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.9166666666667	3	35.25	0.0859102609064442	0.0903346148069003	0.951022607337025	-0.0044243539004561	0.0350878370842562	0.0577207234737253	NaN	NaN	0.0693737730166242	0.94914890820104	481	0	519	0.519	0.481	0.962
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.75000000000003	3	35.41666666666667	0.0861159931215414	0.0898829861073045	0.95809003295389	-0.00376699298576311	0.0343378674200628	0.0571112630124545	NaN	NaN	0.0696614568208927	0.956874841694396	495	1	504	0.504	0.495	0.99
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.08333333333336	3	35.41666666666667	0.0857055104092924	0.0898829861073045	0.953523176310309	-0.00417747569801209	0.0327427888756105	0.0559133940918995	NaN	NaN	0.0675074042599279	0.950657008292416	482	0	518	0.518	0.482	0.964
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.08333333333336	3	35.75	0.0869488818993728	0.088993157850987	0.977028841306686	-0.00204427595161419	0.03320569801582	0.0579413994626433	NaN	NaN	0.068530891211076	0.976202639073017	500	0	500	0.5	0.5	1
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.08333333333336	3	36.75	0.0882289030696765	0.0864264476831886	1.02085536817497	0.00180245538648788	0.0351809923523193	0.051853475049508	NaN	NaN	0.0664047424949977	0.978345300462764	550	0	450	0.45	0.55	0.9
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.75000000000001	3	37.083333333333336	0.0886640029508962	0.0856035011092873	1.03575206389867	0.00306050184160886	0.0348533967167105	0.0537493780479067	NaN	NaN	0.0668314483254732	0.96347417279723	557	0	443	0.443	0.557	0.886
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAT:CAA---AGT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.75000000000001	3	35.416666666666664	0.087371404103966	0.0898829861073045	0.972057203347249	-0.00251158200333849	0.0335767049498712	0.0580272721192108	NaN	NaN	0.0675349658554247	0.970334024058523	506	0	494	0.494	0.506	0.988
N	all	ss13	9	AAT	--A	ATC	0	---AATCAG:---AGTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.75000000000001	3	36.416666666666664	0.0861159931215414	0.0872653886078579	0.986828735829259	-0.00114939548631646	0.0341153802618217	0.0547055767526007	NaN	NaN	0.0682184722136721	0.986557284346687	504	0	496	0.496	0.504	0.992
N	all	ss13	10	CAA	ATC	AAC	2	AATCAGCGA:AGTCAACGT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.75000000000001	3	36.416666666666664	0.0710590256920246	0.0872653886078579	0.814286475149278	-0.0162063629158333	0.0315732459407429	0.0535272822185999	NaN	NaN	0.0628703855067192	0.796581182210581	404	1	595	0.595	0.404	0.808
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	3	36	0.0706404112947758	0.0883372767422876	0.799667070345171	-0.0176968654475118	0.0312134522859054	0.0528599280176611	NaN	NaN	0.0634698542277668	0.780380538375911	415	1	584	0.584	0.415	0.83
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333336	3	35.833333333333336	0.0702267037754945	0.0887734500607747	0.79107777975754	-0.0185467462852802	0.030502927798206	0.0524503290392022	NaN	NaN	0.0652877893660359	0.776351525748138	388	0	612	0.612	0.388	0.776
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.08333333333336	3	36.333333333333336	0.0560353868844177	0.0874776777943207	0.640567837387833	-0.031442290909903	0.027895154825777	0.0509573854233323	NA	NA	0.0638914903266436	0.622634396145484	302	1	697	0.697	0.302	0.604
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333336	3	36.5	0.0556454425645553	0.0870541284395655	0.639205096438193	-0.0314086858750102	0.0276770489007926	0.0541531247080449	NaN	NaN	0.063560240744851	0.621195882984603	325	1	674	0.674	0.325	0.65
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.50000000000001	3	36.25	0.069333399391501	0.0876910035441767	0.790655786674541	-0.0183576041526758	0.0295358689253924	0.0536522832433226	NaN	NaN	0.0665991551814192	0.78282212688109	388	1	611	0.611	0.388	0.776
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.50000000000001	3	36.25	0.069333399391501	0.0876910035441767	0.790655786674541	-0.0183576041526758	0.0300725862441536	0.052538504762059	NA	NA	0.0666320225433901	0.782926569718815	396	1	603	0.603	0.396	0.792
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75000000000003	3	35.41666666666667	0.0825574874404693	0.0898829861073045	0.91849960727729	-0.00732549866683518	0.0327168686948816	0.0559888344721213	NaN	NaN	0.0672556526148342	0.913265790190216	493	0	507	0.507	0.493	0.986
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0818063224852469	0.0898829861073045	0.910142464421292	-0.00807666362205764	0.0314297226026585	0.0577686131454449	NaN	NaN	0.0685229286138193	0.90617221323768	461	0	539	0.539	0.461	0.922
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666669	3	35.41666666666667	0.0823684046093706	0.0898829861073045	0.916395951854973	-0.00751458149793388	0.0332400449142827	0.0538278198063883	NaN	NaN	0.0675733844590396	0.911452809529662	511	3	486	0.486	0.511	0.972
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.25000000000001	3	35.58333333333334	0.0831299860668389	0.0894358561096487	0.929492819579222	-0.00630587004280972	0.033692703008576	0.0586630417164979	NaN	NaN	0.0669892358398479	0.925003834950591	456	0	544	0.544	0.456	0.912
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCG	2	GGACCCGCA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	3	35.00000000000001	0.0824628375267118	0.0910206427532006	0.905979512255335	-0.00855780522648884	0.0330021671681913	0.0557646723138215	NaN	NaN	0.0687350018864175	0.900915973721238	513	0	487	0.487	0.513	0.974
N	all	ss13	22	GCA	CCG	CAG	2	CCCGCAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.16666666666667	3	35.33333333333334	0.0820864003916518	0.0901082338815474	0.910975577432349	-0.00802183348989563	0.0327908257962765	0.0575220354532356	NaN	NaN	0.0675202104513001	0.905428733921988	458	0	542	0.542	0.458	0.916
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	2	34.66666666666667	0.0813437533100697	0.0600320307551523	1.35500585748698	0.0213117225549174	0.0322780428559579	0.0441293893024394	NA	NA	0.0618355932213204	0.730356473829588	642	1	357	0.357	0.642	0.714
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAAAT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.50000000000001	2	35.33333333333334	0.0828427466732329	0.0588537115811214	1.40760445599163	0.0239890350921115	0.0326195833696743	0.0451752558935147	NaN	NaN	0.0594676465530221	0.686656627803749	658	1	341	0.341	0.658	0.682
N	all	ss13	25	AAT	CAA	ATG	2	TCAAATGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333336	2	35.00000000000001	0.0813437533100697	0.0594370287406054	1.36857031775713	0.0219067245694643	0.0325840501030453	0.046055059493747	NA	NA	0.0556992864789005	0.694095330173251	660	0	340	0.34	0.66	0.68
N	all	ss13	26	GAC	ATG	ACA	2	AATGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.50000000000001	2	35.00000000000001	0.0674611774972046	0.0594370287406054	1.13500252160346	0.00802414875659918	0.0299918165085382	0.0425653933687056	NaN	NaN	0.0561391126447021	0.886342857190326	603	1	396	0.396	0.603	0.792
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666669	2	35.16666666666667	0.0533558250189307	0.0591439311842398	0.902135247870513	-0.00578810616530906	0.0259302731354421	0.0449345818978792	NA	NA	0.0528143817767361	0.912731867728306	472	1	527	0.527	0.472	0.944
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	35.16666666666667	0.0400094855289696	0.0591439311842398	0.676476600859278	-0.0191344456552702	0.0224705281579177	0.0460546198190418	NA	NA	0.0507562989464847	0.706183547250343	358	5	637	0.637	0.358	0.716
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AACCAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333336	2	35.33333333333334	0.0400986359257937	0.0588537115811214	0.681327223866307	-0.0187550756553277	0.0233048107758842	0.0433877379756585	NA	NA	0.0517886676020665	0.717242687280006	376	3	621	0.621	0.376	0.752
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA:CAGGATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333336	2	34.583333333333336	0.0397005575048303	0.0601826482875392	0.659667838396707	-0.0204820907827089	0.0226170433784259	0.0454257412630721	NA	NA	0.0538974746931607	0.703930948487454	366	4	630	0.63	0.366	0.732
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:GATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333336	2	35.25000000000001	0.0402331091273882	0.0589984642956841	0.681934853859092	-0.0187653551682959	0.0224789936669324	0.0442580467412308	NA	NA	0.0485222540386767	0.698950857204664	367	6	627	0.627	0.367	0.734
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666669	3	36.25000000000001	0.0546316519559279	0.0876910035441767	0.623001787502703	-0.0330593515882488	0.0273925507560388	0.0515709364554558	NA	NA	0.0519736961720597	0.524725246993568	236	2	762	0.762	0.236	0.472
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666669	3	36.083333333333336	0.0403232602433046	0.0881207952860292	0.457590743619826	-0.0477975350427246	0.0232402212825995	0.05393401286717	NA	NA	0.0525290753236574	0.362861901897862	153	9	838	0.838	0.153	0.306
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666669	3	35.75000000000001	0.0397883346582442	0.088993157850987	0.447094311731999	-0.0492048231927428	0.0227282512757695	0.054067712550894	NA	NA	0.051286615371056	0.337352911548701	152	7	841	0.841	0.152	0.304
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666669	3	35.75000000000001	0.0397883346582442	0.088993157850987	0.447094311731999	-0.0492048231927428	0.0226085084829455	0.0530232540580423	NA	NA	0.0497642963528138	0.322781783464466	151	6	843	0.843	0.151	0.302
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000001	3	35.41666666666667	0.0393532888030902	0.0898829861073045	0.437828008474365	-0.0505296973042143	0.0228142965264935	0.0554223113000777	NA	NA	0.0505504042042453	0.31750878480637	135	7	858	0.858	0.135	0.27
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAT	2	GCACGGCCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666669	3	34.75000000000001	0.0390120440358434	0.0917171833187057	0.425351527644297	-0.0527051392828622	0.0232978913506558	0.0573611947837203	NA	NA	0.0532074564844092	0.3219008340483	142	4	854	0.854	0.142	0.284
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000001	3	35.333333333333336	0.03909679907621	0.0901082338815474	0.433887086585284	-0.0510114348053374	0.0224262632562249	0.0552373101094395	NA	NA	0.0505398367791688	0.312815815160641	139	5	856	0.856	0.139	0.278
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666669	2	35.66666666666667	0.0392674190316604	0.0582817382454872	0.673751679578653	-0.0190143192138268	0.0238987487061946	0.042775004202998	NA	NA	0.0394552816071034	0.62986223947985	311	9	680	0.68	0.311	0.622
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	2	35.66666666666667	0.0398765009105086	0.0582817382454872	0.684202326679854	-0.0184052373349786	0.0229567015357334	0.0407330970870251	NA	NA	0.0388732386471001	0.635879274865615	292	18	690	0.69	0.292	0.584
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	2	36.16666666666667	0.0404138163712346	0.0574443341110379	0.703530069529854	-0.0170305177398032	0.0235264577613989	0.0409553890361984	NA	NA	0.0386334843537402	0.659341342433688	362	20	618	0.618	0.362	0.724
N	all	ss13	42	CGG	GCC	GGC	2	CGCCGGCCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666669	2	36.50000000000001	0.0405961546323978	0.0568993130810351	0.713473545358647	-0.0163031584486373	0.023486475786679	0.0420351714855979	NA	NA	0.0386586476010545	0.673228770322107	338	20	642	0.642	0.338	0.676
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	CGGCCCCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666669	2	36.833333333333336	0.0405961546323978	0.0563645417845084	0.720242786459686	-0.0157683871521107	0.0234930578501781	0.0404735386667625	NA	NA	0.04008353517199	0.694032831519074	338	16	646	0.646	0.338	0.676
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	2	36.333333333333336	0.0404138163712346	0.0571705240409132	0.706899526446759	-0.0167567076696786	0.0234214711585962	0.0408119180861937	NA	NA	0.0382838040319338	0.661605916168472	346	18	636	0.636	0.346	0.692
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333334	2	35.333333333333336	0.0405047802473168	0.0588537115811214	0.688228136495466	-0.0183489313338046	0.0227697834581028	0.0438361617091164	NA	NA	0.0387819785612901	0.636120180563189	302	14	684	0.684	0.302	0.604
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.333333333333336	0.0404138163712346	0.0901082338815474	0.448503034965272	-0.0496944175103128	0.022930476418149	0.0548608975725084	NA	NA	0.0539895111705687	0.357339856624623	160	8	832	0.832	0.16	0.32
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.00000000000001	0.0404138163712346	0.0910206427532006	0.444007152100819	-0.050606826381966	0.0229372932069128	0.0561925819349023	NA	NA	0.0557173081555389	0.363731162215451	151	4	845	0.845	0.151	0.302
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.00000000000001	0.0404138163712346	0.0910206427532006	0.444007152100819	-0.050606826381966	0.0226908685239285	0.0558485342324231	NA	NA	0.055384487113809	0.360855329708287	155	8	837	0.837	0.155	0.31
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	35.00000000000001	0.0407801460981609	0.0910206427532006	0.44803184052144	-0.0502404966550397	0.0245282631748692	0.056227391336482	NA	NA	0.0537096237228485	0.349577260875592	166	6	828	0.828	0.166	0.332
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	35.333333333333336	0.0409658133601689	0.0901082338815474	0.454628967803552	-0.0491424205213785	0.023321872786708	0.0533352939002147	NA	NA	0.0532645085019217	0.35620997029317	152	6	842	0.842	0.152	0.304
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	35.333333333333336	0.0409658133601689	0.0901082338815474	0.454628967803552	-0.0491424205213785	0.0230413516658666	0.0591826248256566	NA	NA	0.0514923667471801	0.339899821094551	145	7	848	0.848	0.145	0.29
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666667	3	35.333333333333336	0.0405961546323978	0.0901082338815474	0.450526582129707	-0.0495120792491496	0.0210707570425773	0.0534159306189705	NA	NA	0.0535446435799206	0.355128321686022	150	3	847	0.847	0.15	0.3
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	3	34.66666666666667	0.0407801460981609	0.0919517415692493	0.443495092123396	-0.0511715954710884	0.0232967997681551	0.0553482924759712	NA	NA	0.0545574089772834	0.348275063622413	153	4	843	0.843	0.153	0.306
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	33.66666666666667	0.0409658133601689	0.0948631103318397	0.43184134714608	-0.0538972969716708	0.0238094567272867	0.058514061629385	NA	NA	0.0550525622524387	0.32757245369604	143	10	847	0.847	0.143	0.286
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	3	33.083333333333336	0.0541996476239405	0.0966482688635724	0.560792741155541	-0.042448621239632	0.0275165432182268	0.061815001127471	NA	NA	0.0562975535682207	0.450846386219874	226	1	773	0.773	0.226	0.452
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77	3	32.583333333333336	0.053834761795598	0.0982328346145694	0.548032254254155	-0.0443980728189714	0.0267477662849141	0.063861476378275	NA	NA	0.0615190545453011	0.470481229658532	228	3	769	0.769	0.228	0.456
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	32.91666666666667	0.0535942229866087	0.097170738715697	0.55154693372678	-0.0435765157290883	0.0268170112408291	0.0606368522402685	NA	NA	0.0583014395860131	0.454801239927938	195	4	801	0.801	0.195	0.39
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	32.91666666666667	0.0535942229866087	0.097170738715697	0.55154693372678	-0.0435765157290883	0.0271204390167769	0.0609012701554763	NaN	NaN	0.0569337381632926	0.444039326255521	211	2	787	0.787	0.211	0.422
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.00000000000001	3	32.41666666666667	0.0531195394264593	0.0987726497511971	0.537796035241177	-0.0456531103247378	0.0265086878036769	0.0585830611786925	NA	NA	0.060095236753788	0.447446275802837	214	3	783	0.783	0.214	0.428
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.00000000000001	3	31.750000000000004	0.0524230797130337	0.100992663859693	0.519078096463166	-0.0485695841466591	0.0249194156245269	0.0620335118876622	NaN	NaN	0.0626784322187129	0.438398120264669	206	0	794	0.794	0.206	0.412
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAA:CATGGCAAG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666669	3	32.41666666666667	0.0533558250189307	0.0987726497511971	0.540188252044783	-0.0454168247322664	0.026349832851176	0.061298353179619	NaN	NaN	0.062427037067198	0.466908382985634	209	3	788	0.788	0.209	0.418
N	all	ss13	62	AAA	GCA	AAG	2	GGCAAAGAG:GGCAAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666669	3	33.083333333333336	0.0533558250189307	0.0966482688635724	0.552061880117555	-0.0432924438446417	0.0256775933289422	0.0579957467674145	NaN	NaN	0.057045546520422	0.447906311223468	234	4	762	0.762	0.234	0.468
N	all	ss13	63	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAGGAA:AAGGAAGAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666669	3	32.916666666666664	0.0537142229868647	0.097170738715697	0.55278187339938	-0.0434565157288323	0.0277760436735637	0.059792918662616	NA	NA	0.05846393013527	0.457297209324094	219	1	780	0.78	0.219	0.438
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333336	3	33.083333333333336	0.0543223783836108	0.0966482688635724	0.562062611388225	-0.0423258904799616	0.0265640810742941	0.0631485844879567	NA	NA	0.0567544627402842	0.455805143125195	245	4	751	0.751	0.245	0.49
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	33.333333333333336	0.0416291816557173	0.0958750286324137	0.434202547311086	-0.0542458469766963	0.023699817277639	0.0597887519848511	NA	NA	0.0560284781695287	0.332952743813341	128	5	867	0.867	0.128	0.256
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	32.333333333333336	0.0416291816557173	0.0990447915097998	0.420306621086667	-0.0574156098540824	0.0241726184013326	0.0597470776460389	NA	NA	0.0578102203539843	0.320625149159008	140	6	854	0.854	0.14	0.28
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	3	32.5	0.0277167798918218	0.0985020015458152	0.28138291056888	-0.0707852216539934	0.0206799031941147	0.0583848867235656	NA	NA	0.0557323019816074	0.204051408719547	73	13	914	0.914	0.073	0.146
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.0199317727937201	0.059623294881265	NA	NA	0.0541209545065675	0.207948743738244	61	13	926	0.926	0.061	0.122
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.019438166914025	0.059588285251848	NA	NA	0.0540543799221646	0.20738927269937	53	13	934	0.934	0.053	0.106
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333336	3	33.166666666666664	0.0277809537602618	0.0963891381007337	0.288216642535269	-0.0686081843404719	0.0201839473376589	0.0569110826951777	NA	NA	0.0555488469194429	0.216794605708826	66	15	919	0.919	0.066	0.132
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.25000000000003	3	33.25	0.0278131522748419	0.0961313950679982	0.289324338372166	-0.0683182427931563	0.0187109090617423	0.0606676897016019	NA	NA	0.0545770145592566	0.210651191745221	53	16	931	0.931	0.053	0.106
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0239220973163359	0.0588184031210913	NA	NA	0.0572109238484654	0.359733792046978	158	7	835	0.835	0.158	0.316
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0259631814697015	0.0574173088637737	NA	NA	0.0581771015707527	0.36776801304014	142	6	852	0.852	0.142	0.284
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.9166666666667	3	32.916666666666664	0.0423143935004423	0.097170738715697	0.435464359535705	-0.0548563452152547	0.0255662995542112	0.0596735028469604	NA	NA	0.0587904504557447	0.350777332383464	156	2	842	0.842	0.156	0.312
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0255912348467235	0.0575381627944792	NA	NA	0.0595057747129766	0.37856052377175903	153	5	842	0.842	0.153	0.306
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000003	3	33.083333333333336	0.0424141271286909	0.0966482688635724	0.4388503552874	-0.0542341417348815	0.025624347230277	0.0598619521101574	NA	NA	0.0573388385578498	0.344223308189096	138	6	856	0.856	0.138	0.276
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.4166666666667	3	33.74999999999999	0.0432292511544661	0.0946134639951751	0.456903799195753	-0.051384212840709	0.0258466268040362	0.0611543831522309	NA	NA	0.0581493847251822	0.376880452174085	165	8	827	0.827	0.165	0.33
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333337	3	33.74999999999999	0.0428178090539073	0.0946134639951751	0.452555135874645	-0.0517956549412678	0.0257772763247096	0.0612439771634369	NA	NA	0.0582817512201415	0.374158219178342	169	8	823	0.823	0.169	0.338
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.33333333333337	3	33.49999999999999	0.0426655308015385	0.095366381613935	0.44738544211794	-0.0527008508123965	0.0254828665558569	0.0572935558102232	NA	NA	0.057269121425986	0.357451784704553	162	3	835	0.835	0.162	0.324
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTCCA:AGTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333337	3	33.24999999999999	0.0572387314369154	0.0961313950679982	0.595421832757423	-0.0388926636310828	0.0291201701016774	0.0582531976880302	NA	NA	0.0598071657777726	0.515497768958228	274	1	725	0.725	0.274	0.548
N	all	ss13	81	AAA	GTA	AAG	2	AGTCCAGAT:GGTAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333337	2	32.916666666666664	0.0572387314369154	0.0633621979772033	0.903357731647961	-0.00612346654028788	0.0274709001116336	0.0438992121188117	NA	NA	0.0478185418857996	0.898104402323364	478	5	517	0.517	0.478	0.956
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000003	1	32.916666666666664	0.0425646124443371	0.0310121698640216	1.37251319823699	0.0115524425803155	0.0245812306836023	0.0308311285986058	NA	NA	0.0432050089334603	0.789171477512856	593	15	392	0.392	0.593	0.784
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	33.58333333333333	0.043281238215485	0.0620508745044359	0.697512139210721	-0.0187696362889508	0.0245039746281079	0.0488889571846404	NA	NA	0.0533311321994883	0.724879356123306	372	7	621	0.621	0.372	0.744
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.6666666666667	2	34.58333333333333	0.0437016810929818	0.0601826482875393	0.726150848068117	-0.0164809671945574	0.0258889070359982	0.0437460682699715	NA	NA	0.0503240569419144	0.743292169139637	412	4	584	0.584	0.412	0.824
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	2	34.75	0.0442388662657619	0.0598821656332629	0.738765303457703	-0.015643299367501	0.0250499866427089	0.0464217344479286	NA	NA	0.0529885905412223	0.767825714181428	386	5	609	0.609	0.386	0.772
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.33333333333337	2	34.75	0.0445675653531006	0.0598821656332629	0.744254401653512	-0.0153146002801623	0.0250748895670899	0.0454930772739172	NA	NA	0.0550851062200613	0.780999248909202	425	6	569	0.569	0.425	0.85
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	2	35.083333333333336	0.0447894260262167	0.0592901175479514	0.755428187336497	-0.0145006915217346	0.0249636859581409	0.0452854795919096	NA	NA	0.0526375610161813	0.782946085198187	419	6	575	0.575	0.419	0.838
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.33333333333336	2	35.416666666666664	0.0445675653531006	0.0587096677913667	0.759117995889158	-0.0141421024382661	0.0258821733832047	0.04102818290086	NA	NA	0.0511355469716315	0.782117147911627	400	1	599	0.599	0.4	0.8
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333336	2	34.916666666666664	0.0442388662657619	0.059584670169267	0.74245382478562	-0.0153458039035051	0.0250627043578486	0.0461494771958277	NA	NA	0.0524511652557254	0.769848420914722	399	10	591	0.591	0.399	0.798
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000003	2	34.75	0.0438080716173109	0.0598821656332629	0.73157126423258	-0.016074094015952	0.0242827311780209	0.0466932214670119	NA	NA	0.0564041855562891	0.775659067721447	403	6	591	0.591	0.403	0.806
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.83333333333336	2	34.916666666666664	0.0449011870069398	0.059584670169267	0.753569447970181	-0.0146834831623272	0.0265545893664981	0.0441269925112062	NA	NA	0.0540276958952821	0.78579351881326	419	9	572	0.572	0.419	0.838
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.1666666666667	2	34.25	0.0446782201839994	0.0607927570603562	0.734926697593959	-0.0161145368763568	0.0258721600319241	0.0462687266975058	NA	NA	0.0512038852164698	0.752979446123917	359	7	634	0.634	0.359	0.718
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	33.916666666666664	0.0444574574471551	0.0614153696041381	0.723881623341393	-0.016957912156983	0.0251253167627375	0.0472998613155909	NA	NA	0.0562756765304866	0.763157954591921	357	7	636	0.636	0.357	0.714
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333337	2	34	0.0444026073250892	0.0612585232607003	0.724839662492731	-0.0168559159356112	0.0257075282311533	0.0480102553150134	NA	NA	0.054351339065297	0.756463006785463	366	7	627	0.627	0.366	0.732
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	2	34.75	0.0441303750172001	0.0598821656332629	0.736953557883466	-0.0157517906160628	0.0244653451976283	0.0449886957809341	NA	NA	0.0528253215638187	0.765560927874079	409	5	586	0.586	0.409	0.818
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	34.75	0.0438080716173109	0.0293435958691742	1.4929346700597	0.0144644757481367	0.0257055431491768	0.0303750608704603	NA	NA	0.0396408003043311	0.715194571476077	648	9	343	0.343	0.648	0.686
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333337	1	35.08333333333333	0.0435958062133857	0.0290593249318817	1.50023465154745	0.014536481281504	0.0243672157319046	0.0310224423930626	NA	NA	0.0384794858997405	0.705599803284345	641	21	338	0.338	0.641	0.676
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	35.41666666666666	0.043490443237762	0.0287805096612113	1.51110747341545	0.0147099335765507	0.0247933609129967	0.0299014510528545	NA	NA	0.0395097119621603	0.709660683884634	644	15	341	0.341	0.644	0.682
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.66666666666671	1	34.74999999999999	0.0430740368144066	0.0293435958691742	1.46791950810829	0.0137304409452324	0.0248556759249422	0.0308784726234874	NA	NA	0.0389605846653437	0.724524234709494	639	11	350	0.35	0.639	0.7
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.0253771803431403	0.0292826353573051	NA	NA	0.0390787258440252	0.717345364111846	643	14	343	0.343	0.643	0.686
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.0254023265830999	0.0305917451900427	NA	NA	0.0407224617275936	0.72829333894828	627	8	365	0.365	0.627	0.73
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.025296119887811	0.0287023689488279	NA	NA	0.0393680245664013	0.71933426712564	659	19	322	0.322	0.659	0.644
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.1666666666667	1	35.58333333333333	0.0433855884614561	0.0286430990492925	1.51469603155696	0.0147424894121636	0.0247755500181263	0.0291571197372059	NA	NA	0.0390067317990104	0.705469735137064	669	17	314	0.314	0.669	0.628
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.6666666666667	2	36.75	0.0588537115811214	0.0564972895530331	1.04170858543358	0.00235642202808827	0.0298372873913849	0.0397268334243446	NA	NA	0.0423358076798802	0.955612458975687	555	2	443	0.443	0.555	0.886
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	37.166666666666664	0.0439686325106426	0.0558397336460622	0.787407633233638	-0.0118711011354196	0.0255785564047209	0.0405080284894761	NA	NA	0.0373555411762132	0.750646598300049	389	19	592	0.592	0.389	0.778
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37.666666666666664	0.0438614614252191	0.0550706014161129	0.796458732923621	-0.0112091399908939	0.0259507528118432	0.0387335777417696	NA	NA	0.037138572919601	0.762789778121331	413	15	572	0.572	0.413	0.826
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37	0.0438614614252191	0.0561009098120238	0.781831552682207	-0.0122394483868048	0.0253703019178384	0.038054161405585	NA	NA	0.0387611566697428	0.752180264048047	394	12	594	0.594	0.394	0.788
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37	0.0438614614252191	0.0561009098120238	0.781831552682207	-0.0122394483868048	0.0244818088313719	0.0410838940390794	NA	NA	0.0375647780433653	0.744558684692675	389	12	599	0.599	0.389	0.778
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333336	2	37.166666666666664	0.0437548116643347	0.0558397336460622	0.78357844508487	-0.0120849219817275	0.0268367328198098	0.0390246078982945	NA	NA	0.0380051194829467	0.750499028293816	394	9	597	0.597	0.394	0.788
N	all	ss13	110	TAT	GGT	ATT	2	TGGTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	37.833333333333336	0.0448452368647073	0.0548189130040021	0.818061402666508	-0.00997367613929485	0.0255189162313153	0.0395777918869519	NA	NA	0.039044309221268	0.798379367476062	423	21	556	0.556	0.423	0.846
N	all	ss13	111	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTAC:TATTTCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	36.833333333333336	0.0445124432883257	0.0563645417845084	0.78972421098542	-0.0118520984961828	0.025717553337058	0.0399569728811553	NA	NA	0.0385224954476441	0.758335774322319	401	18	581	0.581	0.401	0.802
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333336	2	36.166666666666664	0.0447337539717067	0.0574443341110379	0.778732222489305	-0.0127105801393312	0.0266268827278222	0.0433969899631202	NA	NA	0.0402543074733182	0.752186943907221	413	19	568	0.568	0.413	0.826
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.5	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0258361548517448	0.0420503171264071	NA	NA	0.0404618422227864	0.724274006164145	390	16	594	0.594	0.39	0.78
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	35	0.0439686325106426	0.0594370287406054	0.739751522616149	-0.0154683962299628	0.0260853520434722	0.0425159340230215	NA	NA	0.0413984163267144	0.708666922636584	326	19	655	0.655	0.326	0.652
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.9166666666667	2	35.333333333333336	0.0429199333819239	0.0588537115811214	0.729264684059304	-0.0159337781991975	0.0260524287604021	0.0407829019581436	NA	NA	0.0399930513578706	0.690325286076816	329	17	654	0.654	0.329	0.658
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.4166666666667	2	35.833333333333336	0.0426150118597228	0.0579999025523778	0.734742818252817	-0.015384890692655	0.0250166806586009	0.0426763113913208	NA	NA	0.0398434263153234	0.69939763275336	343	19	638	0.638	0.343	0.686
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000004	2	35.5	0.0424141271286909	0.0585663277285774	0.724206703299838	-0.0161522005998865	0.0248043393640979	0.0437233178189022	NA	NA	0.039046001657745	0.679115029747519	369	17	614	0.614	0.369	0.738
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666671	2	34.83333333333333	0.0420179878270026	0.0597330472949441	0.703429503931555	-0.0177150594679414	0.0239563126071278	0.0435577096656342	NA	NA	0.0407968656005457	0.664124339628608	326	17	657	0.657	0.326	0.652
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000004	2	33.83333333333333	0.0412475068105866	0.0615730216404005	0.669895771097295	-0.020325514829814	0.0232288808256297	0.0444006100538876	NA	NA	0.0443573281356889	0.646792774083619	338	10	652	0.652	0.338	0.676
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333337	2	33.83333333333333	0.0416291816557173	0.0615730216404005	0.676094506110818	-0.0199438399846832	0.0241953361656737	0.0444043923207705	NA	NA	0.0415133873933332	0.630929145495825	317	18	665	0.665	0.317	0.634
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000004	2	33.83333333333333	0.0412475068105866	0.0615730216404005	0.669895771097295	-0.020325514829814	0.023883790754065	0.0463464592829232	NA	NA	0.0396326480003175	0.608057816770702	321	16	663	0.663	0.321	0.642
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666671	2	33.166666666666664	0.0269995408952429	0.0628640039123036	0.429491270280966	-0.0358644630170607	0.0196106819725301	0.043920151836484	NA	NA	0.0399689273286862	0.369554258153464	152	32	816	0.816	0.152	0.304
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666671	2	33.83333333333333	0.0269995408952429	0.0615730216404005	0.438496279310863	-0.0345734807451576	0.0185097763879845	0.0435447375846079	NA	NA	0.0398279516612906	0.385355590455181	153	51	796	0.796	0.153	0.306
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000004	2	34.5	0.0272447663451876	0.0603340239140544	0.451565544244118	-0.0330892575688668	0.0195112328236205	0.0423450557821348	NA	NA	0.038639311525804	0.391797298174771	168	35	797	0.797	0.168	0.336
N	all	ss13	125	GGC	ATG	GCG	2	TATGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000004	2	34.5	0.0272447663451876	0.0603340239140544	0.451565544244118	-0.0330892575688668	0.018428729192505	0.0435292940890746	NA	NA	0.0373833311837765	0.376084362194368	136	42	822	0.822	0.136	0.272
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAT:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000004	2	35.166666666666664	0.0272447663451876	0.0591439311842398	0.460651935028079	-0.0318991648390522	0.0191735491982506	0.0432968940916398	NA	NA	0.0365028571565323	0.382182890888086	149	36	815	0.815	0.149	0.298
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA:GCTAATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000004	2	34.16666666666667	0.0268785763539719	0.0609472230590743	0.441013962652888	-0.0340686467051024	0.0201914630413765	0.0454239163443211	NA	NA	0.03658957274798	0.351800488356936	135	43	822	0.822	0.135	0.27
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC:AATAAAGAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000004	2	34.16666666666667	0.0268785763539719	0.0609472230590743	0.441013962652888	-0.0340686467051024	0.0197052726327103	0.0443583138752155	NA	NA	0.0374499264367333	0.362974424893977	142	45	813	0.813	0.142	0.284
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	2	33.91666666666667	0.0269691977905829	0.0614153696041381	0.439127826868369	-0.0344461718135552	0.01890121679185	0.0436745323031279	NA	NA	0.0388252672528632	0.37496576005796	136	48	816	0.816	0.136	0.272
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666671	2	33.833333333333336	0.0134683754007452	0.0615730216404005	0.21873825649492	-0.0481046462396553	0.013577573469421	0.0470590344839024	NA	NA	0.0374485009814091	0.198947953138144	0	137	863	0.863	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333339	2	34.166666666666664	0.0135291154422588	0.0609472230590743	0.221980834617279	-0.0474181076168155	0.0129938356169805	0.0436152500148645	NA	NA	0.0341079239070712	0.164456834117813	0	129	871	0.871	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	2	34.166666666666664	0.0134532755150005	0.0609472230590743	0.220736480511354	-0.0474939475440738	0.0140136856634893	0.0444612504355279	NA	NA	0.0356565046310607	0.182864949674669	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000006	1	34.166666666666664	0.0133633824875953	0.0298546878003148	0.447614209767568	-0.0164913053127194	0.0138092626198942	0.0299058561395641	NA	NA	0.016273239673698	0.310869015380578	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	1	33.5	0.0270909813104956	0.0304610393656427	0.889364968322513	-0.00337005805514705	0.0195965502714149	0.0330849292790725	NA	NA	0.0218033222734526	0.877163268149408	366	128	506	0.506	0.366	0.732
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	1	33.33333333333333	0.0270299523623976	0.0306164958901914	0.882855845402517	-0.00358654352779376	0.0196651717188973	0.0310776346155049	NA	NA	0.0232280157908251	0.877289673259868	364	128	508	0.508	0.364	0.728
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	1	33.33333333333333	0.0270299523623976	0.0306164958901914	0.882855845402517	-0.00358654352779376	0.0195739710059606	0.0318527371922656	NA	NA	0.0222428448170594	0.871900581016839	342	131	527	0.527	0.342	0.684
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	1	33.666666666666664	0.0271522864979704	0.0303071537534075	0.895903545377225	-0.00315486725543706	0.0194458260843178	0.0319267138831654	NA	NA	0.0225394667386842	0.888683059197751	366	143	491	0.491	0.366	0.732
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	1	33.333333333333336	0.0272757331281561	0.0306164958901914	0.890883568974804	-0.00334076276203525	0.0195654625788779	0.0298990968668964	NA	NA	0.0217216382602845	0.877768348692981	360	131	509	0.509	0.36	0.72
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666673	1	33.833333333333336	0.0274630224286674	0.0301548153585304	0.910734226097607	-0.00269179292986297	0.0195452465406504	0.0313651141060145	NA	NA	0.0219417087013027	0.902361075524329	356	134	510	0.51	0.356	0.712
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666673	1	33.833333333333336	0.0274630224286674	0.0301548153585304	0.910734226097607	-0.00269179292986297	0.0204042829774936	0.0299632792327701	NA	NA	0.0213354319130133	0.899601013053007	393	121	486	0.486	0.393	0.786
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	1	33.5	0.0268485044068343	0.0304610393656427	0.881404737525699	-0.00361253495880839	0.0189678688588331	0.0315189027033133	NA	NA	0.0215960102867518	0.867151402945382	364	125	511	0.511	0.364	0.728
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	1	34.5	0.0268485044068343	0.0295604764056575	0.908256823685556	-0.00271197199882318	0.0188964417117306	0.0305667541999783	NA	NA	0.020606508115725	0.895294715294684	383	112	505	0.505	0.383	0.766
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	1	34.833333333333336	0.0269691977905829	0.0292720079293014	0.921330639692352	-0.00230281013871855	0.0194150197901691	0.029605529769976	NA	NA	0.0205787087980303	0.910900668975262	334	130	536	0.536	0.334	0.668
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	2	35.25	0.0408727688266097	0.0589984642956841	0.692776825880867	-0.0181256954690745	0.0238008999088395	0.0427171928974952	NA	NA	0.0267853398590841	0.49859499004429497	222	44	734	0.734	0.222	0.444
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666673	2	35.5	0.0551973146854054	0.0585663277285774	0.942475255426881	-0.003369013043172	0.0277147454808189	0.0408968661741148	NA	NA	0.0302908664262353	0.911440246243002	447	16	537	0.537	0.447	0.894
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000007	2	36	0.056899313081035	0.0577207808520962	0.985768249165476	-8.21467771061221e-4	0.029472309403596	0.0429389272917753	NA	NA	0.0297324253733878	0.977958304249316	476	11	513	0.513	0.476	0.952
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.66666666666674	2	35.75	0.0721710240709152	0.0581404786806199	1.24132146326776	0.0140305453902953	0.0323248135133394	0.0421227684195792	NA	NA	0.0327309597983876	0.668168624777175	632	8	360	0.36	0.632	0.72
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.8333333333334	2	34.75	0.0709749060738394	0.0598821656332629	1.18524280682352	0.011092740440576499	0.0306992147073635	0.0453311279179466	NA	NA	0.0331894402412639	0.738209785462552	624	9	367	0.367	0.624	0.734
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.50000000000007	2	35.083333333333336	0.0723451996406716	0.0592901175479514	1.22018985005658	0.0130550820927202	0.0322628168416566	0.0434137714812924	NA	NA	0.0350481925985673	0.709528463188348	641	5	354	0.354	0.641	0.708
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAC:ACCCGCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666673	2	34.41666666666667	0.0716534971389809	0.0604861633757488	1.18462625400555	0.0111673337632321	0.0318575570606858	0.0423385210661833	NA	NA	0.0351860493918252	0.750955595704988	593	5	402	0.402	0.593	0.804
N	all	ss13	151	AAC	GCA	ACC	2	CGCAACCCT:CGCAATCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000007	2	34.58333333333334	0.0718251788190062	0.0601826482875392	1.19345327702832	0.011642530531467	0.0321338370059657	0.0442087405797087	NA	NA	0.0347491573861616	0.737591160539318	610	9	381	0.381	0.61	0.762
N	all	ss13	152	CCT	ACC	CTA	2	AACCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.66666666666673	2	34.25000000000001	0.0721710240709152	0.0607927570603562	1.18716484595792	0.011378267010559	0.0326348281403634	0.0447132397848911	NA	NA	0.0351320637857109	0.746035476575245	641	4	355	0.355	0.641	0.71
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.50000000000007	2	34.083333333333336	0.0713125861052075	0.0611024764460933	1.16709813174466	0.0102101096591143	0.0324760113906651	0.0442134637074866	NA	NA	0.035011631487539	0.77057679577059	602	2	396	0.396	0.602	0.792
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000007	1	33.916666666666664	0.0561009098120237	0.0300792190929219	1.86510526216504	0.0260216907191018	0.0273921217961375	0.0300321525362961	NA	NA	0.0301770224647702	0.388521646091229	787	20	193	0.193	0.787	0.386
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.8333333333334	1	33.75	0.0562324166616757	0.0302307926160697	1.86010394685399	0.0260016240456061	0.0271648559550203	0.0307011063020856	NA	NA	0.0302036079407565	0.3893051949435	817	9	174	0.174	0.817	0.348
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666673	1	33.75	0.0567646707244322	0.0302307926160697	1.87771030172256	0.0265338781083626	0.028190606935518	0.0312182673420549	NA	NA	0.0300110124266621	0.376621693368045	806	15	179	0.179	0.806	0.358
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.50000000000007	1	33.75	0.0713125861052075	0.0302307926160697	2.35893868251738	0.0410817934891379	0.0318177408787122	0.0313806146072453	NA	NA	0.0337965556194038	0.224151989184374	885	9	106	0.106	0.885	0.212
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATCGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.50000000000007	1	33.75	0.0713125861052075	0.0302307926160697	2.35893868251738	0.0410817934891379	0.0314692841575687	0.0316361116851363	NA	NA	0.0330467944692479	0.213816232272096	884	10	106	0.106	0.884	0.212
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.3333333333334	1	34.416666666666664	0.0725202186018532	0.0296334842053817	2.44723901176234	0.0428867343964715	0.0313828566395438	0.0291747968525636	NA	NA	0.0352126515866387	0.223248527846835	888	10	102	0.102	0.888	0.204
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666673	1	34.583333333333336	0.0726960870999214	0.0294878275056261	2.46529138459086	0.0432082595942953	0.0330464129122002	0.030747512193298	NA	NA	0.0335365266256431	0.197608847232153	908	5	87	0.087	0.908	0.174
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.00000000000007	1	35.083333333333336	0.0728728113402358	0.0290593249318817	2.50772554114928	0.0438134864083541	0.0316181706457493	0.029967901757236	NA	NA	0.0329481232123959	0.18359345693733	919	6	75	0.075	0.919	0.15
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000007	1	35.25	0.0870541284395654	0.0289192452027623	3.01024898226771	0.0581348832368031	0.0345935433075252	0.0280943886772269	NaN	NaN	0.0358325813574405	0.104717112649612	964	4	32	0.032	0.964	0.064
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000007	1	35.25	0.0870541284395654	0.0289192452027623	3.01024898226771	0.0581348832368031	0.034269222959593	0.0300061943530353	NaN	NaN	0.036069704262021	0.107019144555033	957	1	42	0.042	0.957	0.084
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.66666666666673	2	35.916666666666664	0.0874776777943206	0.0578600049104132	1.5118850738047	0.0296176728839073	0.0343775825269501	0.0424202856581641	NA	NA	0.0458111307945538	0.517944618936999	745	1	254	0.254	0.745	0.508
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.33333333333339	3	35.916666666666664	0.103612753860613	0.0885548256923263	1.17004074086943	0.0150579281682864	0.0371813264728443	0.0521891666392046	NaN	NaN	0.0510006419330794	0.767803079154735	602	1	397	0.397	0.602	0.794
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.66666666666671	3	35.583333333333336	0.103103242971452	0.0894358561096487	1.15281775628163	0.0136673868618034	0.036352982815545	0.0555492462737767	NaN	NaN	0.0507442344165511	0.787669042731758	622	1	377	0.377	0.622	0.754
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.00000000000004	3	36.25	0.104127333640662	0.0876910035441767	1.18743462193593	0.0164363300964851	0.0378966481812887	0.0535348009779854	NA	NA	0.0484004885430567	0.734165182432326	648	2	350	0.35	0.648	0.7
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.00000000000004	3	36.91666666666667	0.120256987556384	0.0860130038580103	1.39812565731228	0.0342439836983742	0.0422931359971961	0.0526867580619795	NaN	NaN	0.0522197825419553	0.511974378094727	741	0	259	0.259	0.741	0.518
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.16666666666671	4	37.41666666666667	0.12178588422283	0.115334665090852	1.05593478011919	0.00645121913197781	0.0419813542389143	0.0607370695283656	NaN	NaN	0.0632732324649629	0.918789925922739	538	0	462	0.462	0.538	0.924
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	70.66666666666671	4	37.91666666666667	0.122722067836351	0.113692394224188	1.07942196726333	0.00902967361216299	0.0421950467724194	0.0606634285863095	NaN	NaN	0.0640744140843342	0.887929354750163	539	0	461	0.461	0.539	0.922
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.33333333333337	4	38.583333333333336	0.125290563497375	0.111574227897278	1.12293462261486	0.0137163356000966	0.0416639940442158	0.0587433932862116	NaN	NaN	0.0610846762474278	0.822332275410953	595	0	405	0.405	0.595	0.81
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.00000000000004	4	38.91666666666667	0.125949614506391	0.110544521791661	1.13935645534533	0.0154050927147305	0.0417668530455004	0.0569075518120992	NaN	NaN	0.0615628523684146	0.802406720901664	618	0	382	0.382	0.618	0.764
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.6666666666667	4	38.58333333333334	0.126615652181289	0.111574227897278	1.13481091975702	0.0150414242840111	0.0425823124777939	0.0583626610498351	NaN	NaN	0.0589713594569276	0.798674278155341	602	0	398	0.398	0.602	0.796
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.25000000000003	4	37.58333333333334	0.125454677283587	0.114781984854672	1.09298229545715	0.010672692428915	0.0440942672653424	0.0618455576966687	NaN	NaN	0.0618687114148009	0.863040145022089	581	0	419	0.419	0.581	0.838
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.75000000000003	4	36.58333333333334	0.124476407968011	0.11818004032857	1.05327775842634	0.00629636763944047	0.0413109835460764	0.0620283605127252	NaN	NaN	0.0609843504283379	0.917768026413847	552	1	447	0.447	0.552	0.894
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.9166666666667	4	36.50000000000001	0.126115464592411	0.118472334721436	1.06451404784878	0.00764312987097508	0.0422462610793446	0.0628684388153198	NaN	NaN	0.06259285137656	0.902812955119014	594	0	406	0.406	0.594	0.812
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.58333333333336	4	36.50000000000001	0.124800794215712	0.118472334721436	1.05341719236948	0.00632845949427636	0.0434243396183535	0.0612746365810665	NaN	NaN	0.0664970112735826	0.92418052777525	543	0	457	0.457	0.543	0.914
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGCAGAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.58333333333336	4	36.00000000000001	0.124800794215712	0.120256987556385	1.03778413838279	0.00454380665932747	0.0411145837167643	0.063457747561439	NaN	NaN	0.0655318445314156	0.944721069311613	532	0	468	0.468	0.532	0.936
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:AGAGGTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.58333333333336	4	35.50000000000001	0.126783266334208	0.122096350832699	1.03838702360508	0.00468691550150874	0.0428901836029337	0.0633654037569102	NaN	NaN	0.0663201885647959	0.943659584291507	545	0	455	0.455	0.545	0.91
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT:GGTGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.58333333333336	4	35.16666666666667	0.126783266334208	0.123354245726484	1.02779815633852	0.0034290206077246	0.0421902351270945	0.0649797186146776	NaN	NaN	0.0682086903554747	0.959905246963414	546	0	454	0.454	0.546	0.908
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.50000000000003	4	34.91666666666667	0.124963623649128	0.124314847835041	1.00521881195517	6.48775814087038e-4	0.0422966711336887	0.0675509963764089	NaN	NaN	0.0698167930240955	0.992585727112146	531	0	469	0.469	0.531	0.938
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAATCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.16666666666669	4	34.58333333333334	0.125619222573624	0.125619222573624	1	0	0.043727296416189	0.0648697347367531	NaN	NaN	0.0696544440304305	1	515	0	485	0.485	0.515	0.97
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAATCTTCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.16666666666669	4	34.58333333333334	0.125619222573624	0.125619222573624	1	0	0.0432177340578791	0.0678935303018496	NaN	NaN	0.0693129878594311	1	514	0	486	0.486	0.514	0.972
N	all	ss13	184	TCA	CCT	CAT	2	GCCTCTTCT:TCTTCATCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.83333333333334	4	34.58333333333334	0.107601064242965	0.125619222573624	0.856565277498841	-0.0180181583306591	0.0381732908581573	0.0637167015229583	NaN	NaN	0.0666330685156794	0.786845883530995	431	0	569	0.569	0.431	0.862
N	all	ss13	185	TCT	CAT	CTC	2	TCATCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.50000000000001	4	34.58333333333334	0.106507748243781	0.125619222573624	0.847861864304705	-0.0191114743298435	0.0411296169771427	0.0685264543174061	NaN	NaN	0.0695456561686273	0.783466274289728	399	0	601	0.601	0.399	0.798
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.33333333333336	5	34.25000000000001	0.121476995958792	0.162356129339379	0.748213180820937	-0.0408791333805867	0.0417767398829484	0.0805617915917456	NaN	NaN	0.0757313669443684	0.589340964233023	299	1	700	0.7	0.299	0.598
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.58333333333336	5	34.00000000000001	0.121016596675858	0.163690174515013	0.739302753109095	-0.0426735778391558	0.0433468084320461	0.077007122303512393	NaN	NaN	0.0720715834500023	0.553783689382265	289	0	711	0.711	0.289	0.578
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.58333333333336	5	34.00000000000001	0.121016596675858	0.163690174515013	0.739302753109095	-0.0426735778391558	0.0407343375441702	0.0803337369209786	NaN	NaN	0.0750730419570907	0.56974475536616	272	0	728	0.728	0.272	0.544
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.00000000000001	0.119805791874255	0.163690174515013	0.731905822870673	-0.0438843826407585	0.0412490244879702	0.0843198543324882	NaN	NaN	0.0779858750241537	0.573624069409497	270	0	730	0.73	0.27	0.54
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.00000000000001	0.119805791874255	0.163690174515013	0.731905822870673	-0.0438843826407585	0.0422013791796986	0.0819942916657633	NaN	NaN	0.0756599415655286	0.561900209669554	291	0	709	0.709	0.291	0.582
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.66666666666667	0.119805791874255	0.160180575223544	0.747942075417427	-0.0403747833492893	0.039770807718668	0.0828122593847707	0.621087572542599	0.228494604325345	0.0733835038551944	0.582189871398346	264	0	736	0.736	0.264	0.528
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.25000000000003	5	33.66666666666667	0.118034434440782	0.165503521626615	0.713183824009941	-0.0474690871858338	0.0407947057198102	0.0794278219427855	NaN	NaN	0.08006721643897	0.553271194422477	250	0	750	0.75	0.25	0.5
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.9166666666667	5	32.66666666666667	0.115195995681218	0.171193988985735	0.67289743269442	-0.0559979933045171	0.039809095973321	0.0910319324167862	NaN	NaN	0.0774506399731545	0.469670519203802	221	0	779	0.779	0.221	0.442
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000003	4	31.83333333333334	0.113827458253345	0.137526919369799	0.827674020293233	-0.0236994611164541	0.0377358137995053	0.0735506428670144	NaN	NaN	0.0746234531726277	0.750798007818406	382	0	618	0.618	0.382	0.764
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.75000000000003	4	31.16666666666667	0.0986178115404479	0.140762624951505	0.700596565135264	-0.0421448134110572	0.0350743247383464	0.0765348360741827	NaN	NaN	0.0756049997376022	0.577230796441487	273	0	727	0.727	0.273	0.546
N	all	ss13	196	ACA	CAA	CAA	2	TCAACAAAT:TCAAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.25000000000004	4	31.33333333333334	0.0965740892437443	0.139939466685309	0.690113314930067	-0.0433653774415648	0.0352814082309469	0.078318059335077	NaN	NaN	0.0705717389647691	0.538893923444719	288	0	712	0.712	0.288	0.576
N	all	ss13	197	AAT	CAA	ATT	2	ACAAATTCA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333337	4	31.41666666666667	0.0821801867828476	0.139531497680893	0.588972297644169	-0.0573513108980455	0.0323006619903478	0.0773084160264822	NaN	NaN	0.0771880394883199	0.457476993451104	212	0	788	0.788	0.212	0.424
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.75000000000004	4	32.08333333333334	0.0837104884722511	0.136351658368326	0.613930842308674	-0.0526411698960751	0.0334264262363154	0.077896237417401	NaN	NaN	0.0719618623550685	0.464464746296138	225	1	774	0.774	0.225	0.45
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.08333333333337	4	32.75	0.0833225893012241	0.133313895827917	0.625010534601568	-0.0499913065266929	0.0321674689816093	0.0734652591861224	NaN	NaN	0.0657704415005211	0.447202137878993	209	0	791	0.791	0.209	0.418
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.58333333333337	4	33.91666666666667	0.0839057969997928	0.128312053707491	0.653919835084785	-0.0444062567076985	0.0321858710844957	0.0725636842304577	NaN	NaN	0.0640638622734891	0.488211596797651	245	0	755	0.755	0.245	0.49
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666671	4	33.25	0.0823684046093706	0.131123163798598	0.628175847982791	-0.0487547591892272	0.0336794843069954	0.0733367855867709	NaN	NaN	0.0674630521007721	0.469871398439816	235	0	765	0.765	0.235	0.47
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666671	4	33.25	0.0823684046093706	0.131123163798598	0.628175847982791	-0.0487547591892272	0.0312875530289853	0.0760950254327544	NaN	NaN	0.0688607388836662	0.478933028336412	220	0	780	0.78	0.22	0.44
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.9166666666667	4	33.58333333333333	0.0835160880143217	0.129702340924675	0.643905787813223	-0.0461862529103528	0.0312500878665635	0.0708969438421873	NaN	NaN	0.0700181097424847	0.509489398236433	238	1	761	0.761	0.238	0.476
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.9166666666667	4	33.91666666666666	0.0846962403936439	0.128312053707491	0.660080155732859	-0.0436158133138474	0.0335544333948067	0.0707759413451771	NaN	NaN	0.0645385244426635	0.499160959051626	249	0	751	0.751	0.249	0.498
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT:AGGGGAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.58333333333336	4	34.58333333333332	0.0850970793814355	0.125619222573624	0.677420840839552	-0.0405221431921889	0.0325125853919184	0.0701584549815592	NaN	NaN	0.0633327885370819	0.522283895490151	259	0	741	0.741	0.259	0.518
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCT:GGAAGTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.25000000000003	4	33.91666666666666	0.0842991638602774	0.128312053707491	0.656985539740884	-0.0440128898472139	0.0318232497816565	0.0759517472751445	NA	NA	0.0667990283497795	0.509969502943113	245	1	754	0.754	0.245	0.49
N	all	ss13	207	TCT	CTT	CTC	2	ACTTCTCCT:AGTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.4166666666667	4	34.41666666666666	0.0703916034965163	0.126281753068954	0.557417059755894	-0.0558901495724379	0.0303446208004947	0.0693429061670821	NA	NA	0.0642767331316488	0.384560693316752	189	1	810	0.81	0.189	0.378
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333337	4	34.91666666666666	0.0702267037754944	0.124314847835042	0.564910024816031	-0.0540881440595471	0.0310704891264402	0.0679067042807392	NaN	NaN	0.0628328207668739	0.389333722547734	157	2	841	0.841	0.157	0.314
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333337	4	34.08333333333333	0.0687766788210943	0.127628054258582	0.538883705629084	-0.0588513754374873	0.0288401451607375	0.0705586888852346	NA	NA	0.0639623356564762	0.357523523736707	156	1	843	0.843	0.156	0.312
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGATTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666671	4	33.249999999999986	0.0679967073757475	0.131123163798598	0.518571283714515	-0.0631264564228503	0.0292550248379131	0.070357547157159	NA	NA	0.0673832205750175	0.348847279220833	148	1	851	0.851	0.148	0.296
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGATTGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.58333333333339	4	33.58333333333332	0.0683065619163606	0.129702340924675	0.526640933612988	-0.0613957790083139	0.0303516425113733	0.072082827175655	NaN	NaN	0.0654933866918053	0.348534953868419	164	0	836	0.836	0.164	0.328
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTGGC:TTGGCTAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333339	4	34.41666666666666	0.0548816190849608	0.126281753068954	0.434596588590226	-0.0714001339839934	0.0268076991575026	0.0725922597427984	NA	NA	0.0616665927206095	0.246928765484898	84	1	915	0.915	0.084	0.168
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333339	4	34.58333333333332	0.0545075207127158	0.125619222573624	0.433910667459905	-0.0711117018609086	0.0273428651645918	0.0704660212285931	NA	NA	0.0631702830476379	0.260286395854495	85	4	911	0.911	0.085	0.17
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666673	3	33.91666666666666	0.0542609435735893	0.0941180977157372	0.576519764960321	-0.0398571541421479	0.0277934722466136	0.0604058392361525	NA	NA	0.0518959589089343	0.4424750764875	183	2	815	0.815	0.183	0.366
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000006	2	34.249999999999986	0.040687942312311	0.0607927570603562	0.669289308131152	-0.0201048147480452	0.0231274159647351	0.0465366747669555	NA	NA	0.0456449255627521	0.659603170500576	295	17	688	0.688	0.295	0.59
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000006	2	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.0589984642956841	0.699128482461261	-0.0177509574850976	0.0246196967982265	0.0468591965803138	NA	NA	0.0436294102001091	0.684112572647359	322	11	667	0.667	0.322	0.644
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	2	35.583333333333314	0.0414374651394939	0.0584236862456271	0.709257970564899	-0.0169862211061332	0.0234862386291074	0.044286738058811	NA	NA	0.0427384389941406	0.691038608756623	363	13	624	0.624	0.363	0.726
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	35.583333333333314	0.0273690573365762	0.0584236862456271	0.468458241773895	-0.0310546289090509	0.01879953824529	0.0439395556890183	NA	NA	0.0411435321715843	0.45037642054303	173	38	789	0.789	0.173	0.346
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.0833333333334	1	35.249999999999986	0.0552608903391469	0.0289192452027623	1.91086904072685	0.0263416451363846	0.0341981872214655	0.0330122865018437	NA	NA	0.0357171757613226	0.460814462483919	758	30	212	0.212	0.758	0.424
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000007	1	34.583333333333314	0.0547563501152287	0.0294878275056261	1.85691367411796	0.0252685226096026	0.032123952877649	0.0314941208050487	NA	NA	0.0360068497636932	0.48282268593545	738	39	223	0.223	0.738	0.446
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5833333333334	1	34.41666666666665	0.0541384900641951	0.0296334842053817	1.82693636998524	0.0245050058588134	0.0335003112770345	0.031665429595436	NA	NA	0.0357504663033649	0.493062671020648	741	40	219	0.219	0.741	0.438
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75000000000007	1	34.24999999999998	0.0540165882431452	0.0297805871963346	1.81381877687736	0.0242360010468106	0.0328770234893742	0.0322225387779115	NA	NA	0.0356558180293766	0.496681265099428	727	50	223	0.223	0.727	0.446
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666674	1	34.583333333333314	0.0542609435735893	0.0294878275056261	1.84011329974162	0.0247731160679632	0.0348625280035756	0.033550517721894	NA	NA	0.0353406151763405	0.483314584770183	711	47	242	0.242	0.711	0.484
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000009	1	35.083333333333314	0.053834761795598	0.0290593249318817	1.85258129436223	0.0247754368637162	0.0328871190646733	0.0302675469720878	NA	NA	0.0346557525504541	0.474670135082135	707	50	243	0.243	0.707	0.486
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666676	1	35.41666666666664	0.0537142229868647	0.0287805096612114	1.86634022882706	0.0249337133256533	0.0333190507623683	0.0310012433999724	NA	NA	0.0349933966271771	0.476138968506851	744	41	215	0.215	0.744	0.43
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666676	1	35.66666666666664	0.0533558250189307	0.0285748846742028	1.867228009046	0.0247809403447279	0.0332353423941365	0.0303830782990045	NA	NA	0.0357646664690552	0.488379277236831	699	52	249	0.249	0.699	0.498
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666676	1	35.99999999999998	0.0540774704260079	0.0283052459871353	1.91051052693857	0.0257722244388725	0.0340825563346678	0.0282996314796061	NA	NA	0.0330679099035221	0.435760232390888	747	44	209	0.209	0.747	0.418
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:AGATTGAAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666676	1	35.99999999999998	0.0540774704260079	0.0283052459871353	1.91051052693857	0.0257722244388725	0.0336810486482248	0.0320528466685617	NA	NA	0.0351652048924213	0.463625567398131	733	46	221	0.221	0.733	0.442
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG:TTGAATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666676	1	36.333333333333314	0.0533558250189307	0.0280406490537152	1.90280278165891	0.0253151759652155	0.032248300293917	0.0314161463112905	NA	NA	0.0356622287150555	0.47779119580538	729	45	226	0.226	0.729	0.452
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT:AATCAGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000009	1	37.333333333333314	0.053834761795598	0.0272757331281561	1.97372373247139	0.0265590286674418	0.0334528197639614	0.027370522251125	NA	NA	0.0343666196276897	0.439632055329259	762	47	191	0.191	0.762	0.382
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333341	1	37.583333333333314	0.0545075207127158	0.0270909813104957	2.01201721296077	0.0274165394022201	0.0316446337733225	0.0285754798387429	NA	NA	0.0361187925110739	0.447813208371752	738	41	221	0.221	0.738	0.442
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666676	1	37.41666666666664	0.0538952343889475	0.0272138698048234	1.98043257998519	0.0266813645841241	0.0339909118967265	0.0289760437085402	NA	NA	0.0350905946418467	0.447041469026315	744	50	206	0.206	0.744	0.412
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666676	1	36.41666666666664	0.0531784143271381	0.0279752710599065	1.90090792018641	0.0252031432672315	0.0328104323960123	0.029380859165981	NA	NA	0.0343268532098225	0.462820327079488	731	38	231	0.231	0.731	0.462
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.2500000000001	1	36.41666666666664	0.0536541558618203	0.0279752710599065	1.91791370839356	0.0256788848019138	0.0329592224130163	0.0299965443786819	NA	NA	0.0351925932636624	0.465593568645483	727	60	213	0.213	0.727	0.426
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.2500000000001	1	36.41666666666664	0.0536541558618203	0.0279752710599065	1.91791370839356	0.0256788848019138	0.0317070811520647	0.0296199939299482	NA	NA	0.0340395321205587	0.450618563292998	729	47	224	0.224	0.729	0.448
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333343	0	36.583333333333314	0.0402331091273881	0	-Inf	0.0402331091273881	0.0292073847903892	0	NA	NA	0.0309360166589114	0.193420583578961	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.66666666666676	0	36.16666666666664	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.0298286327615438	0	NA	NA	0.0294399666763201	0.177967335864396	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	36.333333333333314	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0305620968181447	0	NA	NA	0.0289336045773946	0.172378768830509	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	35.66666666666665	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0302572621725717	0	NA	NA	0.0301944846424927	0.191003487402375	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	36.333333333333314	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0304111646568891	0	NA	NA	0.0293352051270611	0.178328748717179	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333341	0	36.499999999999986	0.0395696157178212	0	-Inf	0.0395696157178212	0.0286148544025657	0	NA	NA	0.0301666924083034	0.189621765200676	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA:CAACAACCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333341	0	36.999999999999986	0.0398323689854613	0	-Inf	0.0398323689854613	0.0294662663859808	0	NA	NA	0.029931268381256	0.18325662008052	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC:CAACCAGGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.33333333333341	0	36.999999999999986	0.0409192381878258	0	-Inf	0.0409192381878258	0.031362734110112	0	NA	NA	0.030527658648949	0.18011571322531	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA:CCAGGCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666674	0	36.83333333333332	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0261444658890304	0	NA	NA	0.0289041269359293	0.34204014947147	663	337	0	0	0.663	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACC:GGCCAAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666674	0	36.999999999999986	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0278338932208752	0	NA	NA	0.0295065923603107	0.351987079664265	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	246	ACC	AAA	CCG	2	CAAACCGTC:CAAACTGTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	0	35.999999999999986	0.0270909813104956	0	-Inf	0.0270909813104956	0.0284272319784574	0	NA	NA	0.028174894939899	0.336286202214659	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CCG	TCA	2	ACCGTCACT:ACTGTCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	0	35.999999999999986	0.0270909813104956	0	-Inf	0.0270909813104956	0.0276756823191761	0	NA	NA	0.0283823892711803	0.339830774175229	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	0	35.66666666666665	0.0269691977905829	0	-Inf	0.0269691977905829	0.0263394916912458	0	NA	NA	0.0296044018019891	0.362302710918904	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000009	0	35.33333333333332	0.0266103300115571	0	-Inf	0.0266103300115571	0.0269284359381127	0	NA	NA	0.028274943527776	0.346639468283817	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.66666666666674	0	34.49999999999999	0.026551445288187	0	-Inf	0.026551445288187	0.0251581126541233	0	NA	NA	0.0263696885579669	0.313986369973145	612	388	0	0	0.612	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	0	34.99999999999999	0.026728886585519	0	-Inf	0.026728886585519	0.026824704961043	0	NA	NA	0.0265291234058385	0.313680168849262	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	0	34.66666666666666	0.0263763446044989	0	-Inf	0.0263763446044989	0.0278988737496295	0	NA	NA	0.0253814711840162	0.298713200645547	600	400	0	0	0.6	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.8333333333334	0	33.99999999999999	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0262090275687936	0	NA	NA	0.0255997925098656	0.313371818900861	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.16666666666674	0	33.666666666666664	0.025698445480572	0	-Inf	0.025698445480572	0.0270176655043643	0	NA	NA	0.025760930342814	0.318485763869413	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCG:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000007	0	33.333333333333336	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0244391026455127	0	NA	NA	0.026300204509229	0.33057717133206	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	256	TCG	CAT	CGA	2	GCATCGAAG:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666674	0	33.666666666666664	0.0255343810572878	0	-Inf	0.0255343810572878	0.0271484847197956	0	NA	NA	0.0258340813015738	0.322957259397405	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CGA	AGA	2	TCGAAGAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666674	0	33.166666666666664	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.0255425648462951	0	NA	NA	0.0245838758735032	0.302037085370925	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AGA	AGC	2	AAGAAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666674	0	31.666666666666668	0.0248985520571968	0	-Inf	0.0248985520571968	0.0249899877443077	0	NA	NA	0.0249424758119311	0.31816348020047	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	31.833333333333336	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0243187747940572	0	NA	NA	0.0262615377810004	0.341071274244413	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	31.833333333333336	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0260382565872466	0	NA	NA	0.0255090222638244	0.327018910553677	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	32	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0265427097235527	0	NA	NA	0.0252282151242986	0.321663244646918	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666673	0	31.666666666666668	0.0248985520571968	0	-Inf	0.0248985520571968	0.0246486126025995	0	NA	NA	0.0260216067976924	0.33864728577835	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.50000000000006	0	32.16666666666667	0.0252655469877565	0	-Inf	0.0252655469877565	0.0265382230019123	0	NA	NA	0.0246753076142622	0.305872947627597	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000006	0	33.166666666666664	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0264663273805444	0	NA	NA	0.0265328090616299	0.334834186407961	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666671	0	32.5	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.0257312264637217	0	NA	NA	0.0263859269713982	0.33625645614696	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	266	ACT	CCA	CTA	2	GCCACTAAA:GCTACTAAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.33333333333339	0	32	0.0250023152006939	0	-Inf	0.0250023152006939	0.0251217519079465	0	NA	NA	0.0269548158815493	0.353633810558838	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CTA	AAC	2	ACTAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.16666666666671	0	31.666666666666668	0.0247445123657617	0	-Inf	0.0247445123657617	0.0260195715924819	0	NA	NA	0.0259392317456083	0.340113201949767	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.50000000000004	0	31.666666666666668	0.0249503257372043	0	-Inf	0.0249503257372043	0.0262070159221683	0	NA	NA	0.0242220873866569	0.302979468746764	612	388	0	0	0.612	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000004	0	31.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333337	0	32	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.50000000000003	0	31.666666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.1666666666667	0	32.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333337	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.6666666666667	0	32	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.6666666666667	0	31.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA:GGTCCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCAGAGCAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC:GAGCAAACC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.50000000000003	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	32.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.1666666666667	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000003	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	1	32.5	0.0128482799476378	0.0314182062818701	0.408943777132556	-0.0185699263342324	0.0130196332862167	0.0325314392880958	NA	NA	0.0204292291170595	0.363356402815829	0	387	613	0.613	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	1	32.333333333333336	0.0129313548258795	0.0315836140125951	0.4094323981012	-0.0186522591867156	0.0137189085992515	0.0314079131127849	NA	NA	0.0210950217816061	0.376587211217611	0	385	615	0.615	0	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	1	31.83333333333333	0.0129313548258795	0.0320904564039067	0.402965749789249	-0.0191591015780272	0.0127093536096592	0.0326057084581456	NA	NA	0.020483625864212	0.349614441345353	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	1	32.5	0.0130438070339019	0.0314182062818701	0.415167145981496	-0.0183743992479682	0.0137450874215866	0.0315698230748056	NA	NA	0.0195522953155889	0.347342407342525	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAA:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	1	32.5	0.0130438070339019	0.0314182062818701	0.415167145981496	-0.0183743992479682	0.0134602711832114	0.032984783245888	NA	NA	0.0198821806910984	0.355400841281798	0	366	634	0.634	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAACTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	1	31.33333333333333	0.0128482799476378	0.0326138339548042	0.393951841584854	-0.0197655540071664	0.0132625454269181	0.0332888428981073	NA	NA	0.019981143692263	0.322560238946858	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000003	1	30.83333333333333	0.012766265677073	0.0331545693783718	0.385052978109286	-0.0203883037012988	0.0138846154064196	0.0344781379928879	NA	NA	0.0218846509899829	0.351529987100669	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	1	30.83333333333333	0.0124484185567784	0.0331545693783718	0.375466151127242	-0.0207061508215934	0.0127689785595743	0.0339943841894954	NA	NA	0.0212451637925613	0.329744367992077	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	1	31.83333333333333	0.012345957790554	0.0320904564039067	0.38472365849714	-0.0197444986133528	0.0129341137081927	0.0314398090094064	NA	NA	0.0219479992284932	0.368331252966944	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	1	31.66666666666666	0.0122451699655716	0.0322630388127681	0.3795417423831	-0.0200178688471965	0.012661969863578	0.0336608899573412	NA	NA	0.0233479544010827	0.391239648377382	0	352	648	0.648	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000001	1	32.33333333333333	0.0124484185567784	0.0315836140125951	0.394141675864393	-0.0191351954558168	0.0129452294743331	0.0301631847363419	NA	NA	0.0193684430826283	0.323173542623233	0	335	665	0.665	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000001	1	31.999999999999993	0.0375078154309961	0.0319197108140969	1.17506752017412	0.00558810461689915	0.0290144643224626	0.0316569832832967	NA	NA	0.0318218709883232	0.860603657659573	543	130	327	0.327	0.543	0.654
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.83333333333333	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0290328460073035	0.0334966697227838	NA	NA	0.0334837970932983	0.873305964343691	489	135	376	0.376	0.489	0.752
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.83333333333333	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0278723720430924	0.0328168525952574	NA	NA	0.0323556325747082	0.868927721847915	529	120	351	0.351	0.529	0.702
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.16666666666669	1	31.499999999999993	0.0369684687876581	0.0324374878453625	1.13968347252709	0.00453098094229566	0.0260338099627372	0.0347518430767104	NA	NA	0.0330582107209009	0.890982829484743	509	136	355	0.355	0.509	0.71
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	2	31.249999999999993	0.0495536228075988	0.0668966841033532	0.740748565818898	-0.0173430612957545	0.0297091564451222	0.0520084528919416	NA	NA	0.0416085638319014	0.676813945053739	333	45	622	0.622	0.333	0.666
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	31.58333333333333	0.0501754455827152	0.0661585688516753	0.758411895142508	-0.0159831232689602	0.0305239635636634	0.0521173356273445	NA	NA	0.040616803824626	0.693942752388127	316	42	642	0.642	0.316	0.632
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	31.91666666666666	0.0508130785858607	0.0654365742860851	0.776524124929106	-0.0146234957002244	0.0313006578532124	0.0481796816441325	NA	NA	0.0407495361155728	0.719697673380734	319	47	634	0.634	0.319	0.638
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333336	2	30.91666666666666	0.0503862036875865	0.0676514664202387	0.744791005336034	-0.0172652627326522	0.0314665909287246	0.0503852479520464	NA	NA	0.0409776212679194	0.673511247937307	299	37	664	0.664	0.299	0.598
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	29.91666666666666	0.0511380136321413	0.070021663193269107	0.730317037614396	-0.0188836495611278	0.0321533385093292	0.0497587062398361	NA	NA	0.0416675510172436	0.650406193651061	310	41	649	0.649	0.31	0.62
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75000000000003	2	29.249999999999993	0.0512472511431301	0.071696340510766	0.714781964854047	-0.0204490893676359	0.0307807994880426	0.0557176577045448	NA	NA	0.0441393547504329	0.643160284461866	314	43	643	0.643	0.314	0.628
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000003	2	29.66666666666666	0.0510835693943593	0.0706404112947758	0.723149376653433	-0.0195568419004165	0.0317205004991718	0.0530995092980359	NA	NA	0.0424656650908478	0.645133660638205	303	40	657	0.657	0.303	0.606
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	29.999999999999993	0.0513020451633004	0.069817817299509	0.734798754066194	-0.0185157721362086	0.0318223452376668	0.050944355555811	NA	NA	0.0444813891052545	0.677220596205444	328	40	632	0.632	0.328	0.656
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666669	2	30.499999999999996	0.0516332867726302	0.0686192553184994	0.752460610844171	-0.0169859685458692	0.029813212270548	0.0519338658126869	NA	NA	0.042481851168419	0.689273930494243	333	58	609	0.609	0.333	0.666
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30.499999999999996	0.0511925740908369	0.0686192553184994	0.746038030480282	-0.0174266812276625	0.0307808826565426	0.0493775682757417	NA	NA	0.0414314398603151	0.674036306507961	315	43	642	0.642	0.315	0.63
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30.499999999999996	0.0511925740908369	0.0686192553184994	0.746038030480282	-0.0174266812276625	0.0330815443078649	0.0560518195255485	NA	NA	0.0438287763222774	0.690919008960927	325	44	631	0.631	0.325	0.65
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000001	2	30.16666666666666	0.0514119856124207	0.0694136680239339	0.740660839226849	-0.0180016824115131	0.0301743407064477	0.0507981337311882	NA	NA	0.0431781990584292	0.676739843694149	313	52	635	0.635	0.313	0.626
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	29.91666666666666	0.0508130785858607	0.070021663193269107	0.725676544494663	-0.0192085846074084	0.031405222573438	0.0506815971362762	NA	NA	0.0410443079749116	0.639787229749253	293	52	655	0.655	0.293	0.586
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	28.916666666666664	0.0501754455827152	0.0725641058409196	0.691463706487522	-0.0223886602582045	0.0309614481860276	0.0550803274430002	NA	NA	0.0465154112253181	0.630291184884538	277	53	670	0.67	0.277	0.554
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	2	28.583333333333332	0.0495536228075988	0.0734531512400294	0.674628956975147	-0.0238995284324306	0.0307482756246322	0.0559477892468291	NA	NA	0.0451808167077579	0.596822701753275	284	45	671	0.671	0.284	0.568
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	28.916666666666664	0.0501754455827152	0.0725641058409196	0.691463706487522	-0.0223886602582045	0.0300763126112226	0.0559206766614785	NA	NA	0.0442562564060916	0.612936050728946	275	54	671	0.671	0.275	0.55
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	28.249999999999996	0.0500707265730996	0.0743642698449398	0.673316993194504	-0.0242935432718402	0.0308019517449828	0.056965630572296	NA	NA	0.0456080874106105	0.594269879562503	259	44	697	0.697	0.259	0.518
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	27.583333333333332	0.0496561870198999	0.0762561014897823	0.651176575379393	-0.0265999144698824	0.0319552437933812	0.0561511502685899	NA	NA	0.046044302788908	0.563464908337975	223	59	718	0.718	0.223	0.446
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	27.749999999999996	0.0499664439235005	0.0757741689236761	0.659412628778937	-0.0258077250001756	0.0309295566604992	0.0560651574484277	NA	NA	0.045356685022056	0.569359562957296	231	45	724	0.724	0.231	0.462
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666664	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0303850823549316	0.0561203200265314	NA	NA	0.0461156794279569	0.584344594274437	248	44	708	0.708	0.248	0.496
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.9166666666667	2	28.249999999999996	0.0498625949111442	0.0743642698449398	0.670518180506779	-0.0245016749337956	0.0296975860865332	0.0577675378482082	NA	NA	0.0465473064442557	0.598622660259212	278	42	680	0.68	0.278	0.556
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	27.75	0.0494514815652544	0.0757741689236761	0.652616614179757	-0.0263226873584217	0.0304630103197104	0.0542450258336474	NA	NA	0.0467087144028437	0.573060548947008	252	46	702	0.702	0.252	0.504
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	2	27.75	0.0490470943757949	0.0757741689236761	0.647279872184383	-0.0267270745478812	0.0292570454622595	0.0593242925135865	NA	NA	0.0484108731547599	0.580887887476357	231	45	724	0.724	0.231	0.462
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	2	27.75	0.0492484575638286	0.0757741689236761	0.649937284214022	-0.0265257113598475	0.0297021928981139	0.0556018049365596	NA	NA	0.046921034478241	0.571851603437358	247	57	696	0.696	0.247	0.494
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.91666666666669	2	28.75	0.0498625949111442	0.073005919868405	0.682993858594246	-0.0231433249572607	0.0306209695015844	0.0539235030200688	NA	NA	0.0462485776449568	0.616785283751418	269	50	681	0.681	0.269	0.538
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	2	29.166666666666668	0.049707628561966	0.0719113287774619	0.691235016888537	-0.0222037002154959	0.0288456919778766	0.0553039065607553	NA	NA	0.043388316432039	0.60883035514256	292	45	663	0.663	0.292	0.584
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	2	29.083333333333336	0.0492484575638286	0.0721276112438599	0.682796181857762	-0.0228791536800314	0.0298827037854756	0.054473810730688	NA	NA	0.0448182964727439	0.609710382887788	280	49	671	0.671	0.28	0.56
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	3	29.416666666666668	0.0494514815652544	0.109617210244414	0.451128809563684	-0.0601657286791594	0.0289954655118242	0.0673229785328854	NA	NA	0.0598938465473727	0.315118690079294	140	12	848	0.848	0.14	0.28
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	3	29.416666666666668	0.0490470943757949	0.109617210244414	0.447439724715074	-0.0605701158686189	0.030929328915869	0.0667616438626644	NA	NA	0.061351589182366	0.323514028767765	127	15	858	0.858	0.127	0.254
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.91666666666669	3	28.416666666666668	0.0480644914227491	0.113782401199837	0.422424653689045	-0.065717909777088	0.0287971793590963	0.0727969982359731	NA	NA	0.0644248384463865	0.307694786296107	120	19	861	0.861	0.12	0.24
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.91666666666669	4	28.416666666666668	0.0480644914227491	0.155898728322134	0.308305859451486	-0.107834236899385	0.0296472975132224	0.0912382155637028	NA	NA	0.0819608939526237	0.188281764941194	56	4	940	0.94	0.056	0.112
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000003	4	28.75	0.0484527683011411	0.153892310773211	0.314848533092374	-0.105439542472069	0.0308185099266857	0.0878301019667609	NA	NA	0.0808939732803203	0.192428375921401	45	3	952	0.952	0.045	0.09
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.9166666666667	4	28.416666666666668	0.0598522824019851	0.155898728322134	0.383917707643595	-0.0960464459201485	0.0321002364316389	0.0860259076426101	NaN	NaN	0.0872293234618514	0.270861928277127	80	4	916	0.916	0.08	0.16
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.58333333333337	4	29.083333333333336	0.0593781769392197	0.151937056450332	0.390807735298137	-0.0925588795111128	0.0308861012510698	0.087344201168767	NA	NA	0.08413814671253	0.271296298404792	77	0	923	0.923	0.077	0.154
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.58333333333337	4	29.083333333333336	0.0593781769392197	0.151937056450332	0.390807735298137	-0.0925588795111128	0.0318354867693041	0.0843979133633508	NA	NA	0.0803007392009608	0.249052883012934	103	2	895	0.895	0.103	0.206
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.25000000000004	3	29.75	0.0473063180425278	0.10829587866142	0.436824730795415	-0.0609895606188924	0.0287077520448519	0.0682745890889545	NA	NA	0.0675828333961868	0.366822328578812	162	5	833	0.833	0.162	0.324
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATC:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333339	3	30.083333333333336	0.0473997786251612	0.107006075844546	0.442963432226239	-0.0596062972193845	0.0288920462863083	0.0700172100586423	NA	NA	0.0669688620256585	0.373433734710136	160	7	833	0.833	0.16	0.32
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.16666666666671	3	29.666666666666668	0.0467988043212529	0.108623210908842	0.430836134650145	-0.0618244065875891	0.0286040734570242	0.0704917753746289	NA	NA	0.0673431618249915	0.358592558585953	140	8	852	0.852	0.14	0.28
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0464364923107347	0.108623210908842	0.427500641181606	-0.0621867185981073	0.0277775537055541	0.0698682467446394	NA	NA	0.0698946914921295	0.373616147002967	161	7	832	0.832	0.161	0.322
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0287364477182229	0.0702639142102289	NA	NA	0.0699108215249684	0.356503166479794	162	9	829	0.829	0.162	0.324
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0296190695238552	0.0706319989528951	NA	NA	0.0668613206611203	0.334994414391295	176	11	813	0.813	0.176	0.352
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.0372004437441157	0.0678504610229264	NA	NA	0.074132160719032	0.59720515062004	277	3	720	0.72	0.277	0.554
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0389324151029663	0.0666312746352199	NA	NA	0.0717208172727228	0.636861904185168	301	3	696	0.696	0.301	0.602
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0399833624842638	0.0693273723541528	NA	NA	0.0730988262536791	0.657794125424683	341	5	654	0.654	0.341	0.682
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.039326198514805	0.0679399126813326	NA	NA	0.0709015529458783	0.647495227017794	309	0	691	0.691	0.309	0.618
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.040402315171125	0.0678055317507204	NaN	NaN	0.0724288842222767	0.670264068192281	315	3	682	0.682	0.315	0.63
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.0300221394558675	0.0633210217815996	NA	NA	0.0669762522036777	0.406240509322853	174	3	823	0.823	0.174	0.348
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0313422913641241	0.0692953966730182	NA	NA	0.0681454217484542	0.420397018019431	192	3	805	0.805	0.192	0.384
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.032742773873808	0.0663999968147619	NA	NA	0.0664310700452349	0.424387387406463	210	7	783	0.783	0.21	0.42
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0317340413724364	0.0653484066331926	NA	NA	0.0647310322622789	0.447330967772165	195	8	797	0.797	0.195	0.39
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.030238354067825	0.0503748372815934	NA	NA	0.0600668841499424	0.646719405759031	320	12	668	0.668	0.32	0.64
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.029156867978766	0.0630228848125702	NA	NA	0.0743473546545395	0.395815203605053	162	5	833	0.833	0.162	0.324
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.0274300899771655	0.0672572477950921	NA	NA	0.074701879677305	0.367772988772396	157	5	838	0.838	0.157	0.314
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0268625346984388	0.0669955721746509	NA	NA	0.0699057491463513	0.332556722130505	139	4	857	0.857	0.139	0.278
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.0282603930615272	0.0661178245431564	NA	NA	0.0676378809298268	0.328986048665312	173	7	820	0.82	0.173	0.346
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0266392509540089	0.0619806336117375	NA	NA	0.0673208865549933	0.354245642739441	156	7	837	0.837	0.156	0.312
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.16666666666673	3	32.41666666666667	0.0490972805875701	0.0987726497511971	0.497073640438355	-0.049675369163627	0.0306305294362877	0.0621778456776197	NA	NA	0.0729257814687545	0.495759463788406	223	1	776	0.776	0.223	0.446
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.50000000000007	3	32.083333333333336	0.0488971496674064	0.0998703029515669	0.489606501855907	-0.0509731532841605	0.0319510649633571	0.0634436726611973	NA	NA	0.0718360064658597	0.477966699644096	216	3	781	0.781	0.216	0.432
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.16666666666674	4	31.083333333333332	0.0485017445945919	0.141177857059553	0.343550650256241	-0.0926761124649607	0.030100591680113	0.0819516524501769	NaN	NaN	0.0915604214934286	0.311449464635741	124	1	875	0.875	0.124	0.248
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC:GACGCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000009	4	30.75	0.0483064312987563	0.142863650574837	0.338129615926703	-0.0945572192760804	0.0304310743847813	0.0831552160811749	NaN	NaN	0.0919258617863484	0.30365602933856	113	1	886	0.886	0.113	0.226
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA:GCATATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.00000000000009	4	29.916666666666668	0.0597926053740288	0.147260274111344	0.406033505878302	-0.0874676687373155	0.0320082065073589	0.0876544144487989	NA	NA	0.0910115654404656	0.336521482996023	118	0	882	0.882	0.118	0.236
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA:TATAAAACA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.83333333333341	4	30.083333333333332	0.0599120787357042	0.146359364647636	0.409349131023793	-0.0864472859119317	0.032615041022495	0.0920481284974747	NA	NA	0.0927816166016982	0.351476801179203	146	1	853	0.853	0.146	0.292
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0613211655108464	0.145028544735405	0.42282135301518	-0.0837073792245584	0.0329089179080329	0.081871436741069	NaN	NaN	0.0953772687248727	0.380136422090847	153	0	847	0.847	0.153	0.306
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0619547111548277	0.142438427764417	0.434957841975737	-0.0804837166095893	0.0325897042645235	0.0894077407524141	NaN	NaN	0.0897951644478685	0.37009071154023	158	0	842	0.842	0.158	0.316
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.75000000000007	4	30.5	0.0638004014677688	0.144154737019872	0.442582760627378	-0.0803543355521036	0.0345379043279519	0.0834795806366385	NaN	NaN	0.0934297764958645	0.389761149252029	161	0	839	0.839	0.161	0.322
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000007	4	29.5	0.0646255322826462	0.149561992614941	0.432098631161124	-0.0849364603322949	0.0337111866319679	0.0895063869040982	NaN	NaN	0.0949059579860891	0.370811714426372	149	0	851	0.851	0.149	0.298
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0787608262631877	0.186134722106651	0.423138817797034	-0.107373895843463	0.0376391220162852	0.100667686679341	NaN	NaN	0.105075238279217	0.306839450299155	121	0	879	0.879	0.121	0.242
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.0798094452064725	0.179422266799376	0.44481349294128	-0.0996128215929031	0.0390628864683633	0.0975013241492964	NaN	NaN	0.0997443968610207	0.31794930788924	121	0	879	0.879	0.121	0.242
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.0803443058867965	0.176245193423779	0.455866649898416	-0.0959008875369827	0.0384528291356756	0.0921858734615588	NaN	NaN	0.100701370439939	0.340929892367346	135	0	865	0.865	0.135	0.27
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.25000000000007	5	32.333333333333336	0.0808863909048055	0.173179167487274	0.467067673776347	-0.0922927765824687	0.0393979936879721	0.0916252822919039	NaN	NaN	0.0961787948986005	0.337258636841743	150	0	850	0.85	0.15	0.3
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666673	5	32.00000000000001	0.0812518671161105	0.175211138386129	0.463736882623571	-0.0939592712700183	0.0371279289830497	0.0917287896168061	NaN	NaN	0.0980148965852913	0.337749025104842	137	0	863	0.863	0.137	0.274
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666673	5	32.5	0.0818063224852468	0.172180831233375	0.475118640671248	-0.0903745087481283	0.0379949881974838	0.0920579918953007	NaN	NaN	0.0973025036587142	0.352993046255257	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75000000000007	5	32.5	0.0825574874404693	0.172180831233375	0.47948129213391	-0.0896233437929057	0.0391648094666233	0.0936873464585174	NaN	NaN	0.100121853718657	0.370710824842015	139	0	861	0.861	0.139	0.278
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	CTTCAACAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC:CAACATTCC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG:CATTCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCTACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG:TCTACTCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153541.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.9166666666667	3	35.25	0.101236464717174	0.0903346148069003	1.12068297333838	0.010901849910274	0.0380774478122803	0.05729885166395	NaN	NaN	0.0737190255671559	0.882434470384311	571	0	429	0.429	0.571	0.858
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.75000000000003	3	35.41666666666667	0.101481447315381	0.0898829861073045	1.12903956255113	0.0115984612080761	0.0375648951679185	0.0577014490548578	NaN	NaN	0.0768590591253324	0.880050195487881	569	0	431	0.431	0.569	0.862
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.08333333333336	3	35.41666666666667	0.100992663859693	0.0898829861073045	1.12360156502951	0.0111096777523883	0.0378793306109089	0.0554210070781471	NaN	NaN	0.0722124585745465	0.877730290910191	600	0	400	0.4	0.6	0.8
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.08333333333336	3	35.75	0.102473368909235	0.088993157850987	1.1514746906815	0.0134802110582484	0.0379091159672892	0.0586396225090875	NaN	NaN	0.0719901471010294	0.851464013705506	574	1	425	0.425	0.574	0.85
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.08333333333336	3	36.75	0.103998209348989	0.0864264476831886	1.20331463500864	0.0175717616658007	0.0373358891827724	0.0562749431098369	NaN	NaN	0.0687090940870938	0.798150505643908	626	0	374	0.374	0.626	0.748
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.75000000000001	3	37.083333333333336	0.104516640682883	0.0856035011092873	1.22093885563688	0.0189131395735961	0.0386619479336838	0.0546261161620829	NaN	NaN	0.0687201440772118	0.783147428881487	628	0	372	0.372	0.628	0.744
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAT:CAA---AGT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.75000000000001	3	35.416666666666664	0.102976648483437	0.0898829861073045	1.14567453689735	0.0130936623761327	0.0399986115187317	0.0547054579524774	NaN	NaN	0.0716927754024802	0.855083847301338	579	0	421	0.421	0.579	0.842
N	all	ss13	9	AAT	--A	ATC	0	---AATCAG:---AGTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.75000000000001	3	36.416666666666664	0.101481447315381	0.0872653886078579	1.1629060379414	0.0142160587075228	0.0380798252998851	0.0537481523623815	NaN	NaN	0.0678964248237998	0.83415269342766	613	0	387	0.387	0.613	0.774
N	all	ss13	10	CAA	ATC	AAC	2	AATCAGCGA:AGTCAACGT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.75000000000001	3	36.416666666666664	0.0861159931215414	0.0872653886078579	0.986828735829259	-0.00114939548631646	0.0340769061029614	0.0551298791885517	NaN	NaN	0.0671497537718451	0.986343358229383	487	1	512	0.512	0.487	0.974
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.16666666666669	3	36	0.0856035011092873	0.0883372767422876	0.969052978155805	-0.00273377563300031	0.0343608173876526	0.0526552621602083	NaN	NaN	0.0651429212607873	0.966525951600889	489	0	511	0.511	0.489	0.978
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.58333333333336	3	35.833333333333336	0.0850970793814355	0.0887734500607747	0.958587047401872	-0.00367637067933918	0.0356254038482909	0.0579276062806831	NaN	NaN	0.0655952543434602	0.955304930615563	481	0	519	0.519	0.481	0.962
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.08333333333336	3	36.333333333333336	0.0707237388415596	0.0874776777943207	0.808477552500271	-0.016753938952761	0.0306387022785648	0.0532582858734098	NaN	NaN	0.0655848867963676	0.798372264380122	407	1	592	0.592	0.407	0.814
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333336	3	36.5	0.0702267037754945	0.0870541284395655	0.806701589393857	-0.016827424664071	0.0324936764575014	0.0520311651680471	NaN	NaN	0.0626743264828804	0.788322235750881	426	0	574	0.574	0.426	0.852
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.50000000000001	3	36.25	0.0840037937823711	0.0876910035441767	0.957952245808796	-0.00368720976180557	0.0333001181555802	0.0558171232514602	NaN	NaN	0.065116883825382	0.954844332677893	504	1	495	0.495	0.504	0.99
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.50000000000001	3	36.25	0.0840037937823711	0.0876910035441767	0.957952245808796	-0.00368720976180557	0.0339022204959742	0.0543698254302583	NaN	NaN	0.0673839018174187	0.95636197708108	491	1	508	0.508	0.491	0.982
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.75000000000003	3	35.41666666666667	0.0972458393976113	0.0898829861073045	1.08191598442799	0.00736285329030678	0.0357864988479814	0.0586094463051113	NaN	NaN	0.070411963018742807	0.916718437118705	562	0	438	0.438	0.562	0.876
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.41666666666669	3	35.41666666666667	0.0963522329653767	0.0898829861073045	1.07197409808291	0.00646924685807221	0.035010933460583	0.0548032430006259	NaN	NaN	0.0694498858099945	0.925784510269091	547	0	453	0.453	0.547	0.906
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.91666666666669	3	35.41666666666667	0.0970208852905793	0.0898829861073045	1.07941324039628	0.00713789918327482	0.0357646680672983	0.0558146406891166	NaN	NaN	0.0691657599430606	0.917804323021421	556	0	444	0.444	0.556	0.888
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.25000000000001	3	35.58333333333334	0.0979270134965697	0.0894358561096487	1.09494131052439	0.00849115738692105	0.0361163358832699	0.0547681846356204	NaN	NaN	0.0686348232855332	0.901540932035823	553	0	447	0.447	0.553	0.894
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCG	2	GGACCCGCA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.83333333333334	3	35.00000000000001	0.097133231917582	0.0910206427532006	1.06715607558338	0.00611258916438139	0.0362690502500916	0.0556386700810447	NaN	NaN	0.0716870106449363	0.932048540300455	540	1	459	0.459	0.54	0.918
N	all	ss13	22	GCA	CCG	CAG	2	CCCGCAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.16666666666667	3	35.33333333333334	0.0966854014827293	0.0901082338815474	1.07299186009825	0.00657716760118193	0.0350180604366381	0.0564887211235919	NaN	NaN	0.0711815372812366	0.926380311349289	560	0	440	0.44	0.56	0.88
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333334	2	34.66666666666667	0.095802032379497	0.0600320307551523	1.59584860239423	0.0357700016243448	0.0346535598125864	0.047546439122907	NaN	NaN	0.0600713248976502	0.551536802339359	736	0	264	0.264	0.736	0.528
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAAAT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.50000000000001	2	35.33333333333334	0.0975852360853966	0.0588537115811214	1.6580982484153	0.0387315245042752	0.0375808670340121	0.045912288638619	NaN	NaN	0.059062396677023	0.511970197186965	744	1	255	0.255	0.744	0.51
N	all	ss13	25	AAT	CAA	ATG	2	TCAAATGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333336	2	35.00000000000001	0.095802032379497	0.0594370287406054	1.61182404991332	0.0363650036388917	0.0360654609304419	0.0450214117559762	NaN	NaN	0.0580353347071715	0.530920757575449	744	0	256	0.256	0.744	0.512
N	all	ss13	26	GAC	ATG	ACA	2	AATGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.50000000000001	2	35.00000000000001	0.0817133878414162	0.0594370287406054	1.37478924456384	0.0222763591008108	0.0315480847442137	0.0470413149715448	NA	NA	0.055743821397694	0.689436248995268	658	1	341	0.341	0.658	0.682
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.66666666666669	2	35.16666666666667	0.0673097158922066	0.0591439311842398	1.13806631626378	0.00816578470796677	0.0286280102706108	0.0462769523718254	NaN	NaN	0.0569411222919601	0.885968350168933	592	2	406	0.406	0.592	0.812
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000001	2	35.16666666666667	0.053834761795598	0.0591439311842398	0.910233065636048	-0.00530916938864174	0.0266480032417094	0.047596004802073	NA	NA	0.0554236028701598	0.92368531805882	462	3	535	0.535	0.462	0.924
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AACCAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333336	2	35.33333333333334	0.0539558430514737	0.0588537115811214	0.916778935464474	-0.00489786852964775	0.0269948785523499	0.046380067574924	NA	NA	0.0534361976237049	0.92696956686397	477	3	520	0.52	0.477	0.954
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA:CAGGATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.583333333333336	0.0534152253723939	0.0601826482875392	0.887551925551497	-0.00676742291514525	0.0268342413910743	0.0431970104372639	NA	NA	0.0542339790118001	0.900696159145231	462	3	535	0.535	0.462	0.924
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:GATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.25000000000001	0.0541384900641951	0.0589984642956841	0.917625411279653	-0.00485997423148907	0.0261307997241703	0.0419915872964946	NA	NA	0.0504254625342967	0.923219277446921	481	4	515	0.515	0.481	0.962
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.91666666666669	3	36.25000000000001	0.0689348268033826	0.0876910035441767	0.786110593074178	-0.0187561767407941	0.0307776850994992	0.0536629364207555	NaN	NaN	0.056143149736967	0.738320894783403	371	1	628	0.628	0.371	0.742
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666669	3	36.083333333333336	0.0542609435735893	0.0881207952860292	0.615756398900679	-0.0338598517124399	0.0273984745577518	0.052967656034703	NaN	NaN	0.0526054066395856	0.519797713020732	260	4	736	0.736	0.26	0.52
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.41666666666669	3	35.75000000000001	0.0535344239114693	0.088993157850987	0.601556627545559	-0.0354587339395176	0.0261997636182968	0.0533885176472156	NA	NA	0.052772517376479	0.501636749752819	246	1	753	0.753	0.246	0.492
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.41666666666669	3	35.75000000000001	0.0535344239114693	0.088993157850987	0.601556627545559	-0.0354587339395176	0.0258789834051683	0.0538843008243327	NA	NA	0.0534330949857322	0.506939981966859	265	1	734	0.734	0.265	0.53
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000001	3	35.41666666666667	0.0529436946379863	0.0898829861073045	0.589029102513136	-0.0369392914693182	0.0256841869572434	0.056034879925062	NA	NA	0.0551576660236323	0.503046710484268	234	3	763	0.763	0.234	0.468
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAT	2	GCACGGCCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.91666666666669	3	34.75000000000001	0.0524804194365887	0.0917171833187057	0.572198333372557	-0.039236763882117	0.0256568995908134	0.0539853335254645	NaN	NaN	0.0556172944218453	0.480512972047658	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000001	3	35.333333333333336	0.0525954761681725	0.0901082338815474	0.583692232136214	-0.037512757713375	0.0259652176725709	0.0519987621219318	NA	NA	0.0548627251473969	0.494128792122947	242	4	754	0.754	0.242	0.484
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.41666666666669	2	35.66666666666667	0.0528271104098974	0.0582817382454872	0.90640931448176	-0.00545462783558977	0.0267590050877378	0.0424443158803927	NA	NA	0.0406795932632341	0.893333328070638	472	4	524	0.524	0.472	0.944
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000001	2	35.66666666666667	0.0536541558618204	0.0582817382454872	0.920599787807031	-0.00462758238366678	0.0260221324323904	0.0417067132852751	NA	NA	0.0403255626428672	0.908638877000593	472	5	523	0.523	0.472	0.944
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25000000000001	2	36.16666666666667	0.0543839525266103	0.0574443341110379	0.946724396203951	-0.00306038158442752	0.0255583402827106	0.0425307424264825	NA	NA	0.0407422004964856	0.94012260409101	479	6	515	0.515	0.479	0.958
N	all	ss13	42	CGG	GCC	GGC	2	CGCCGGCCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666669	2	36.50000000000001	0.0546316519559279	0.0568993130810351	0.960146072029417	-0.0022676611251072	0.027286621757818	0.0436316609053708	NA	NA	0.0402027632507088	0.955018693085429	483	9	508	0.508	0.483	0.966
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	CGGCCCCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666669	2	36.833333333333336	0.0546316519559279	0.0563645417845084	0.969255674335016	-0.00173288982858053	0.0289275877932208	0.0416625730274055	NA	NA	0.0403792256299228	0.965768988251535	478	5	517	0.517	0.478	0.956
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGCT:CCCCAAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25000000000001	2	36.333333333333336	0.0543839525266103	0.0571705240409132	0.951258597659369	-0.00278657151430285	0.0269932938916043	0.0419135850112526	NA	NA	0.0400376406720667	0.944512996685893	486	5	509	0.509	0.486	0.972
N	all	ss13	45	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTA:CAAGGTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333334	2	35.333333333333336	0.0545075207127158	0.0588537115811214	0.926152646083926	-0.00434619086840559	0.0264982185784667	0.04166528550786	NA	NA	0.0440811361866017	0.921459637529154	457	7	536	0.536	0.457	0.914
N	all	ss13	46	TTA	CTT	TAC	2	GCTTTACCC:GGTTTACCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.333333333333336	0.0404138163712346	0.0901082338815474	0.448503034965272	-0.0496944175103128	0.024229025765148	0.0553596750198855	NA	NA	0.0553239645752285	0.369055497059653	139	2	859	0.859	0.139	0.278
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.00000000000001	0.0404138163712346	0.0910206427532006	0.444007152100819	-0.050606826381966	0.0224715690329905	0.0564345608316304	NA	NA	0.0534288094321046	0.343545857043315	140	5	855	0.855	0.14	0.28
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25	3	35.00000000000001	0.0404138163712346	0.0910206427532006	0.444007152100819	-0.050606826381966	0.024225713141251	0.0551101610935585	NA	NA	0.0510286230081076	0.321327243665188	142	6	852	0.852	0.142	0.284
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	35.00000000000001	0.0407801460981609	0.0910206427532006	0.44803184052144	-0.0502404966550397	0.0236871354690965	0.0549620001497741	NA	NA	0.054181548228328	0.353790462657265	160	6	834	0.834	0.16	0.32
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	35.333333333333336	0.0409658133601689	0.0901082338815474	0.454628967803552	-0.0491424205213785	0.0232970400033981	0.0559504448039386	NA	NA	0.055006783043228	0.371649225863385	144	5	851	0.851	0.144	0.288
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	35.333333333333336	0.0409658133601689	0.0901082338815474	0.454628967803552	-0.0491424205213785	0.023086882038769	0.0546968993926928	NA	NA	0.0534683613973723	0.358046697130024	152	10	838	0.838	0.152	0.304
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666667	3	35.333333333333336	0.0405961546323978	0.0901082338815474	0.450526582129707	-0.0495120792491496	0.022683874062827	0.0557854239353043	NA	NA	0.0531820107216614	0.351857189597215	149	3	848	0.848	0.149	0.298
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333334	3	34.66666666666667	0.0407801460981609	0.0919517415692493	0.443495092123396	-0.0511715954710884	0.0237634762287409	0.0550906421030279	NA	NA	0.0558667899579737	0.359689278310441	145	5	850	0.85	0.145	0.29
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	3	33.66666666666667	0.0409658133601689	0.0948631103318397	0.43184134714608	-0.0538972969716708	0.0230897075327474	0.0609370017722344	NA	NA	0.0560673803432826	0.336403820135435	146	3	851	0.851	0.146	0.292
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	3	33.083333333333336	0.0541996476239405	0.0966482688635724	0.560792741155541	-0.042448621239632	0.0269005835764493	0.0572262259971141	NA	NA	0.0602775030122674	0.481295797697286	235	0	765	0.765	0.235	0.47
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77	3	32.583333333333336	0.053834761795598	0.0982328346145694	0.548032254254155	-0.0443980728189714	0.0274207012756389	0.0595888212681241	NaN	NaN	0.060439512790226	0.462591133866538	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	32.91666666666667	0.0535942229866087	0.097170738715697	0.55154693372678	-0.0435765157290883	0.0269352303268813	0.0570355961265857	NA	NA	0.0611875893737334	0.476353944127592	247	4	749	0.749	0.247	0.494
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333334	3	32.91666666666667	0.0535942229866087	0.097170738715697	0.55154693372678	-0.0435765157290883	0.0263708925931285	0.0608673261641528	NA	NA	0.0594239057408159	0.463365566056543	239	1	760	0.76	0.239	0.478
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.00000000000001	3	32.41666666666667	0.0531195394264593	0.0987726497511971	0.537796035241177	-0.0456531103247378	0.0252500304894103	0.0605088034556557	NaN	NaN	0.0627164873142205	0.466657436068854	202	1	797	0.797	0.202	0.404
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.00000000000001	3	31.750000000000004	0.0524230797130337	0.100992663859693	0.519078096463166	-0.0485695841466591	0.0250891290744318	0.0616532145386855	NA	NA	0.0617892019795355	0.431836470254198	225	4	771	0.771	0.225	0.45
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAA:CATGGCAAG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666669	3	32.41666666666667	0.0533558250189307	0.0987726497511971	0.540188252044783	-0.0454168247322664	0.0255199929101733	0.0593662389885228	NaN	NaN	0.0582989561936504	0.435960134347361	243	3	754	0.754	0.243	0.486
N	all	ss13	62	AAA	GCA	AAG	2	GGCAAAGAG:GGCAAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666669	3	33.083333333333336	0.0533558250189307	0.0966482688635724	0.552061880117555	-0.0432924438446417	0.0264148940922379	0.0606365057702795	NA	NA	0.0624526878398593	0.488181630497203	252	1	747	0.747	0.252	0.504
N	all	ss13	63	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAGGAA:AAGGAAGAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666669	3	32.916666666666664	0.0537142229868647	0.097170738715697	0.55278187339938	-0.0434565157288323	0.0268429085891421	0.0592105928080953	NA	NA	0.0590037845633969	0.461424112717218	213	3	784	0.784	0.213	0.426
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333336	3	33.083333333333336	0.0543223783836108	0.0966482688635724	0.562062611388225	-0.0423258904799616	0.0257723421177083	0.0566002107981623	NA	NA	0.058640335137816	0.47042482560282	239	3	758	0.758	0.239	0.478
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	33.333333333333336	0.0416291816557173	0.0958750286324137	0.434202547311086	-0.0542458469766963	0.0241449985235148	0.0584519258437205	NA	NA	0.0572989874815991	0.343783704227221	135	10	855	0.855	0.135	0.27
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	32.333333333333336	0.0416291816557173	0.0990447915097998	0.420306621086667	-0.0574156098540824	0.0232938107136876	0.060580646028182	NA	NA	0.0580737743816392	0.322826215321524	145	4	851	0.851	0.145	0.29
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	3	32.5	0.0277167798918218	0.0985020015458152	0.28138291056888	-0.0707852216539934	0.0197634705131529	0.0593560710102761	NA	NA	0.0545080969766064	0.194074895198653	66	13	921	0.921	0.066	0.132
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.0200921540282923	0.0593351442002395	NA	NA	0.0524978740493039	0.194233222133412	67	15	918	0.918	0.067	0.134
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.0197853750824359	0.0588056427593743	NA	NA	0.0566275652789337	0.228788125356554	69	22	909	0.909	0.069	0.138
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333336	3	33.166666666666664	0.0277809537602618	0.0963891381007337	0.288216642535269	-0.0686081843404719	0.0186706080109847	0.0597156868277243	NA	NA	0.0559682629669247	0.220258562679298	63	13	924	0.924	0.063	0.126
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.25000000000003	3	33.25	0.0278131522748419	0.0961313950679982	0.289324338372166	-0.0683182427931563	0.019365995207734	0.0601918686391592	NA	NA	0.0560275597570796	0.222704351371191	67	13	920	0.92	0.067	0.134
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0247854887064489	0.0580870797213783	NA	NA	0.0588215322188902	0.37303931434159	149	5	846	0.846	0.149	0.298
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0247991579396421	0.0540390485810014	NA	NA	0.0557001489504351	0.34685144498592	160	1	839	0.839	0.16	0.32
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.9166666666667	3	32.916666666666664	0.0423143935004423	0.097170738715697	0.435464359535705	-0.0548563452152547	0.0237698331270434	0.0614315315116882	NA	NA	0.0591705727650874	0.353880694711869	147	6	847	0.847	0.147	0.294
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0253945289633823	0.0570957717950126	NA	NA	0.0557165277475337	0.346993216578953	155	12	833	0.833	0.155	0.31
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000003	3	33.083333333333336	0.0424141271286909	0.0966482688635724	0.4388503552874	-0.0542341417348815	0.0233566556079881	0.0568378588259477	NA	NA	0.0588690798842881	0.356911035748313	140	2	858	0.858	0.14	0.28
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.4166666666667	3	33.74999999999999	0.0432292511544661	0.0946134639951751	0.456903799195753	-0.051384212840709	0.0254045511826078	0.0593662361245852	NA	NA	0.0573503144989337	0.370268305844293	153	8	839	0.839	0.153	0.306
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333337	3	33.74999999999999	0.0428178090539073	0.0946134639951751	0.452555135874645	-0.0517956549412678	0.0249442845190895	0.0577078581061048	NA	NA	0.0551891891741661	0.347981924185956	153	4	843	0.843	0.153	0.306
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.33333333333337	3	33.49999999999999	0.0426655308015385	0.095366381613935	0.44738544211794	-0.0527008508123965	0.0255533454118047	0.0578274905593934	NA	NA	0.0580626115967425	0.36406024309899	172	9	819	0.819	0.172	0.344
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTCCA:AGTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333337	3	33.24999999999999	0.0572387314369154	0.0961313950679982	0.595421832757423	-0.0388926636310828	0.0289376770188394	0.0599235251204874	NaN	NaN	0.0615944843509258	0.527758786016221	256	2	742	0.742	0.256	0.512
N	all	ss13	81	AAA	GTA	AAG	2	AGTCCAGAT:GGTAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333337	2	32.916666666666664	0.0572387314369154	0.0633621979772033	0.903357731647961	-0.00612346654028788	0.0285531326959668	0.049859219203876	NA	NA	0.0475339775954637	0.897497756666558	470	7	523	0.523	0.47	0.94
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000003	1	32.916666666666664	0.0425646124443371	0.0310121698640216	1.37251319823699	0.0115524425803155	0.0246763665970186	0.0316990020968048	NA	NA	0.0429220016651923	0.787814509093457	596	21	383	0.383	0.596	0.766
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	33.58333333333333	0.043281238215485	0.0620508745044359	0.697512139210721	-0.0187696362889508	0.0251026908521434	0.0448838491599134	NA	NA	0.0542456260801616	0.729333714208184	370	4	626	0.626	0.37	0.74
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.6666666666667	2	34.58333333333333	0.0437016810929818	0.0601826482875393	0.726150848068117	-0.0164809671945574	0.0259366226858446	0.0442837473179598	NA	NA	0.0526926041461296	0.754451063239915	408	9	583	0.583	0.408	0.816
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	2	34.75	0.0442388662657619	0.0598821656332629	0.738765303457703	-0.015643299367501	0.0242737543019621	0.0452859262334796	NaN	NaN	0.0545279014949961	0.774199500697222	399	4	597	0.597	0.399	0.798
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.33333333333337	2	34.75	0.0445675653531006	0.0598821656332629	0.744254401653512	-0.0153146002801623	0.0251344190620722	0.045526050213328	NA	NA	0.0533301530881681	0.773985311231017	398	4	598	0.598	0.398	0.796
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	2	35.083333333333336	0.0447894260262167	0.0592901175479514	0.755428187336497	-0.0145006915217346	0.0256055711672667	0.0443404669754882	NA	NA	0.0519627447418103	0.780199252503269	419	4	577	0.577	0.419	0.838
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.33333333333336	2	35.416666666666664	0.0445675653531006	0.0587096677913667	0.759117995889158	-0.0141421024382661	0.0253381725876311	0.0436257634951446	NA	NA	0.0546463308140012	0.795794753711149	407	5	588	0.588	0.407	0.814
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333336	2	34.916666666666664	0.0442388662657619	0.059584670169267	0.74245382478562	-0.0153458039035051	0.0255442404671076	0.045780915017201	NA	NA	0.0500863488350489	0.759310039543511	383	6	611	0.611	0.383	0.766
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000003	2	34.75	0.0438080716173109	0.0598821656332629	0.73157126423258	-0.016074094015952	0.0258128132467911	0.0457286359118566	NA	NA	0.0518799547374124	0.756688365691494	391	8	601	0.601	0.391	0.782
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.83333333333336	2	34.916666666666664	0.0449011870069398	0.059584670169267	0.753569447970181	-0.0146834831623272	0.0265531989467238	0.0436076834345772	NA	NA	0.0504578492120433	0.771047544700291	399	3	598	0.598	0.399	0.798
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.1666666666667	2	34.25	0.0446782201839994	0.0607927570603562	0.734926697593959	-0.0161145368763568	0.0253194829605387	0.0479805614467969	NA	NA	0.0536720992675579	0.763993729535293	362	7	631	0.631	0.362	0.724
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	33.916666666666664	0.0444574574471551	0.0614153696041381	0.723881623341393	-0.016957912156983	0.0251850307297679	0.0462179057497636	NA	NA	0.0545409226782171	0.755860763993988	380	9	611	0.611	0.38	0.76
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333337	2	34	0.0444026073250892	0.0612585232607003	0.724839662492731	-0.0168559159356112	0.024897941984689	0.0457147437205197	NA	NA	0.0533126817485586	0.751872831609364	406	6	588	0.588	0.406	0.812
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	2	34.75	0.0441303750172001	0.0598821656332629	0.736953557883466	-0.0157517906160628	0.0252863185084211	0.0475078831454785	NA	NA	0.0500364273211395	0.752908605663707	386	8	606	0.606	0.386	0.772
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	34.75	0.0438080716173109	0.0293435958691742	1.4929346700597	0.0144644757481367	0.0249038492368326	0.0307849439888132	NA	NA	0.0400736247110864	0.718138673519394	656	15	329	0.329	0.656	0.658
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333337	1	35.08333333333333	0.0435958062133857	0.0290593249318817	1.50023465154745	0.014536481281504	0.0242571854170754	0.0293176872720469	NA	NA	0.0386592137467543	0.706905032594721	672	18	310	0.31	0.672	0.62
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	35.41666666666666	0.043490443237762	0.0287805096612113	1.51110747341545	0.0147099335765507	0.0247138881824706	0.0294745697438252	NA	NA	0.0396637246854439	0.710737215134834	674	19	307	0.307	0.674	0.614
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.66666666666671	1	34.74999999999999	0.0430740368144066	0.0293435958691742	1.46791950810829	0.0137304409452324	0.0252448893983212	0.0303418766405722	NA	NA	0.0386165501051401	0.722171260040705	674	21	305	0.305	0.674	0.61
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.0244279895008285	0.03093189751982	NA	NA	0.0395100194011195	0.720300499368758	664	14	322	0.322	0.664	0.644
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.025350544797546	0.0290187530147896	NA	NA	0.0408025852792732	0.72880582653592	617	20	363	0.363	0.617	0.726
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	34.74999999999999	0.043490443237762	0.0293435958691742	1.48211021688208	0.0141468473685878	0.0260596402557029	0.0298948808085897	NA	NA	0.0406683473787044	0.727946138370734	638	18	344	0.344	0.638	0.688
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.1666666666667	1	35.58333333333333	0.0433855884614561	0.0286430990492925	1.51469603155696	0.0147424894121636	0.0238809765185281	0.0285681546953722	NA	NA	0.0390480605499821	0.705766928246122	647	11	342	0.342	0.647	0.684
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.6666666666667	2	36.75	0.0588537115811214	0.0564972895530331	1.04170858543358	0.00235642202808827	0.0288902759854974	0.0397819624272017	NA	NA	0.0405915910677528	0.95370722826976	561	8	431	0.431	0.561	0.862
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	37.166666666666664	0.0439686325106426	0.0558397336460622	0.787407633233638	-0.0118711011354196	0.0260462768267473	0.0391956286497941	NA	NA	0.0400063182497062	0.766672148989962	407	18	575	0.575	0.407	0.814
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37.666666666666664	0.0438614614252191	0.0550706014161129	0.796458732923621	-0.0112091399908939	0.0244144401156744	0.0389234547708524	NA	NA	0.0368451042433969	0.760957758449901	392	14	594	0.594	0.392	0.784
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37	0.0438614614252191	0.0561009098120238	0.781831552682207	-0.0122394483868048	0.0249324184624313	0.0406155681071741	NA	NA	0.0378585477277517	0.746472456373301	437	20	543	0.543	0.437	0.874
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	37	0.0438614614252191	0.0561009098120238	0.781831552682207	-0.0122394483868048	0.0252963550497014	0.0409446443004696	NA	NA	0.0376559712432505	0.745155792917388	388	17	595	0.595	0.388	0.776
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333336	3	37.166666666666664	0.0439149815636805	0.0854002100517197	0.51422568559357	-0.0414852284880392	0.0255080298996481	0.0517077738885112	NA	NA	0.0527366498565872	0.431487415348804	207	4	789	0.789	0.207	0.414
N	all	ss13	110	TAT	GGT	ATT	2	TGGTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.6666666666667	3	37.833333333333336	0.0450135072946897	0.0838080288297114	0.537102565508993	-0.0387945215350218	0.0270323569375023	0.0512644663048611	NA	NA	0.0507377035509001	0.444504211544299	239	1	760	0.76	0.239	0.478
N	all	ss13	111	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTAC:TATTTCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.1666666666667	3	36.833333333333336	0.0446782201839994	0.0862192295848232	0.518193219762473	-0.0415410094008238	0.0262104821847091	0.0535824170643549	NA	NA	0.0496453785614845	0.402730402353586	213	6	781	0.781	0.213	0.426
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.83333333333336	3	36.166666666666664	0.0449011870069398	0.0879053734766805	0.510790014661063	-0.0430041864697407	0.0272150211217894	0.0540291720172416	NA	NA	0.0519538132790783	0.407818446968842	202	4	794	0.794	0.202	0.404
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	3	35.5	0.0444574574471551	0.089658862987337	0.495851229492327	-0.0452014055401819	0.0262365905292098	0.053820958738889	NA	NA	0.0519044212968968	0.383831428564881	182	3	815	0.815	0.182	0.364
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000003	3	35	0.0441303750172001	0.0910206427532006	0.48483919342185	-0.0468902677360005	0.0262914478003769	0.0535872309003814	NaN	NaN	0.0577300185262517	0.416657533879664	208	6	786	0.786	0.208	0.416
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.6666666666667	3	35.333333333333336	0.0430740368144066	0.0901082338815474	0.478025536168314	-0.0470341970671409	0.0259366483451909	0.054045693682907	NA	NA	0.0545930320742281	0.38893952865488	146	9	845	0.845	0.146	0.292
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.1666666666667	3	35.833333333333336	0.0427669289697661	0.0887734500607747	0.481753597956232	-0.0460065210910086	0.0253981133523806	0.053073775223098	NA	NA	0.0491563965847051	0.349313683387955	171	3	826	0.826	0.171	0.342
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000004	3	35.5	0.0425646124443371	0.089658862987337	0.474739596578965	-0.0470942505429999	0.0249702282862461	0.0571138397985088	NA	NA	0.0516029213718866	0.361438430747004	167	5	828	0.828	0.167	0.334
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666671	3	34.83333333333333	0.0421656696333547	0.0914838201648647	0.460908492423767	-0.0493181505315099	0.0244978624761843	0.056231667335849	NA	NA	0.0555230951816261	0.374408601292803	160	4	836	0.836	0.16	0.32
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000004	3	33.83333333333333	0.0413898116754681	0.0943651299007743	0.438613412803965	-0.0529753182253062	0.0238802286387942	0.055451516764547	NA	NA	0.0562348978702012	0.346174027156008	154	4	842	0.842	0.154	0.308
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333337	3	33.83333333333333	0.0417741375922484	0.0943651299007743	0.442686166343163	-0.0525909923085259	0.0245822117364239	0.0595237733679113	NA	NA	0.055194397370928	0.340675158806624	143	7	850	0.85	0.143	0.286
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000004	3	33.83333333333333	0.0413898116754681	0.0943651299007743	0.438613412803965	-0.0529753182253062	0.0242190349723569	0.0559097681263463	NA	NA	0.05709293707361	0.35347051260562	157	8	835	0.835	0.157	0.314
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666671	3	33.166666666666664	0.0270909813104956	0.0963891381007337	0.281058445425496	-0.0692981567902381	0.0187351062507353	0.0596479554567868	NA	NA	0.0513235364069074	0.176944853226765	36	16	948	0.948	0.036	0.072
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666671	3	33.83333333333333	0.0270909813104956	0.0943651299007743	0.287086780243741	-0.0672741485902787	0.0194890036546194	0.0567285832518508	NA	NA	0.0520751482694996	0.196403320602137	59	14	927	0.927	0.059	0.118
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000004	3	34.5	0.0273378783823658	0.0924244803179611	0.295786119525014	-0.0650866019355953	0.0189418177046641	0.0564756364228356	NA	NA	0.0523765038665138	0.213990224282288	52	16	932	0.932	0.052	0.104
N	all	ss13	125	GGC	ATG	GCG	2	TATGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000004	3	34.5	0.0273378783823658	0.0924244803179611	0.295786119525014	-0.0650866019355953	0.019617861026961	0.0557220910800602	NA	NA	0.0525478144931711	0.215487470970754	71	10	919	0.919	0.071	0.142
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAT:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000004	3	35.166666666666664	0.0273378783823658	0.09056213746611	0.301868740593674	-0.0632242590837442	0.0194452103759673	0.0567065298227604	NA	NA	0.049391123637257	0.200519354619079	71	19	910	0.91	0.071	0.142
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA:GCTAATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	3	34.16666666666667	0.0269691977905829	0.0933847109044368	0.288796715537099	-0.0664155131138539	0.0193746524338995	0.0564718403744596	NA	NA	0.0502925542109604	0.186640305005537	55	12	933	0.933	0.055	0.11
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC:AATAAAGAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	3	34.16666666666667	0.0269691977905829	0.0933847109044368	0.288796715537099	-0.0664155131138539	0.0186094065065754	0.0567930069859302	NA	NA	0.0510467448075402	0.193233658316472	53	16	931	0.931	0.053	0.106
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000004	3	33.91666666666667	0.0270604324233619	0.0941180977157371	0.287515717806919	-0.0670576652923751	0.0193474740198526	0.0570992425608109	NA	NA	0.0542683203834335	0.216581733950983	62	11	927	0.927	0.062	0.124
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666671	3	33.833333333333336	0.0135138791270087	0.0943651299007742	0.143208398496549	-0.0808512507737655	0.013244539547632	0.0572820353350737	NA	NA	0.0513330748249892	0.115248989759335	0	39	961	0.961	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.33333333333339	3	34.166666666666664	0.0135750312327134	0.0933847109044368	0.145366742598851	-0.0798096796717234	0.0137313017568541	0.0573222657872899	NA	NA	0.0482577925050342	0.0981641867750149	0	42	958	0.958	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000006	3	34.166666666666664	0.0134986770919624	0.0933847109044368	0.144549112603411	-0.0798860338124744	0.0140500750421939	0.0563217945735103	NA	NA	0.0530176589945981	0.131866643721441	0	57	943	0.943	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000006	2	34.166666666666664	0.0134081783305544	0.0609472230590743	0.219996542214209	-0.0475390447285199	0.0141192413338139	0.0447375221678759	NA	NA	0.0378862808159242	0.20955770244108	0	140	860	0.86	0	0.001
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	33.5	0.0271830432683088	0.0622118122355632	0.436943440345075	-0.0350287689672544	0.0195756328066339	0.0462731036002788	NA	NA	0.0417645196811967	0.4016260355502	150	48	802	0.802	0.15	0.3
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.0833333333334	2	33.33333333333333	0.0271215992572094	0.0625362067042884	0.433694345828455	-0.035414607447079	0.019569641559271	0.0476267352190133	NA	NA	0.0418335867654042	0.397240867386661	160	54	786	0.786	0.16	0.32
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.0833333333334	2	33.33333333333333	0.0271215992572094	0.0625362067042884	0.433694345828455	-0.035414607447079	0.0188571325279969	0.0466789506084117	NA	NA	0.0419750020743362	0.398833096734828	162	44	794	0.794	0.162	0.324
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000007	2	33.666666666666664	0.0272447663451876	0.0618907677660026	0.440207276926907	-0.034646001420815	0.0194096418487192	0.0450736513189323	NA	NA	0.040306961051123	0.390035053019419	148	44	808	0.808	0.148	0.296
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	33.333333333333336	0.0273690573365762	0.0625362067042883	0.437651382758069	-0.0351671493677121	0.0192251421522902	0.0471470693026988	NA	NA	0.0397556308187794	0.376381657656997	160	55	785	0.785	0.16	0.32
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666673	2	33.833333333333336	0.0275576350296145	0.0615730216404005	0.447560218671042	-0.0340153866107861	0.0195525076246149	0.0452303310398268	NA	NA	0.0398878543781494	0.393783789966653	175	44	781	0.781	0.175	0.35
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666673	2	33.833333333333336	0.0275576350296145	0.0615730216404005	0.447560218671042	-0.0340153866107861	0.0189335993270993	0.0434944558911362	NA	NA	0.0405874692644685	0.401987983406589	156	50	794	0.794	0.156	0.312
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.5833333333334	2	33.5	0.0269389228181416	0.0622118122355632	0.433019419465522	-0.0352728894174216	0.0190920659688987	0.0456466096151237	NA	NA	0.0401399000144443	0.379537486622256	139	57	804	0.804	0.139	0.278
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.5833333333334	2	34.5	0.0269389228181416	0.0603340239140544	0.446496372536266	-0.0333951010959128	0.0190579504172638	0.0446913604105511	NA	NA	0.0422498398974738	0.42928276567306	147	59	794	0.794	0.147	0.294
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000007	2	34.833333333333336	0.0270604324233619	0.0597330472949441	0.453022801427584	-0.0326726148715821	0.0195247293064892	0.045001394123879	NA	NA	0.0395393669950424	0.408616206538266	161	43	796	0.796	0.161	0.322
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666673	3	35.25	0.0410124947055404	0.0903346148069003	0.454006415959252	-0.04932212010136	0.023413291790215	0.055497436816255	NA	NA	0.0424700570506377	0.245504194316431	85	13	902	0.902	0.085	0.17
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.91666666666673	3	35.5	0.0553884822155735	0.089658862987337	0.617769179421741	-0.0342703807717635	0.0272360455909779	0.0548705904758585	NA	NA	0.0442705288934704	0.43886411951685	212	7	781	0.781	0.212	0.424
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	3	36	0.0571024790858329	0.0883372767422876	0.646414301998711	-0.0312347976564548	0.0296686310086238	0.0528888369554056	NA	NA	0.0452169528232557	0.489706155329587	249	4	747	0.747	0.249	0.498
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.41666666666674	3	35.75	0.0724326033146382	0.088993157850987	0.813912047439891	-0.0165605545363488	0.0337953904073012	0.0561338130757421	NaN	NaN	0.0461423984589114	0.719669125778903	343	0	657	0.657	0.343	0.686
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.5833333333334	3	34.75	0.0712278649928987	0.0917171833187057	0.776603275586766	-0.0204893183258069	0.0311978545966691	0.0551232852847408	NA	NA	0.0504743780032421	0.684790335922013	345	2	653	0.653	0.345	0.69
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.25000000000007	3	35.083333333333336	0.0726080462723539	0.0907908105289243	0.799729023778483	-0.0181827642565704	0.0322692871153092	0.0525519566078127	NA	NA	0.0476593237075547	0.702820872557876	335	1	664	0.664	0.335	0.67
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAC:ACCCGCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.91666666666673	3	34.41666666666667	0.0719113287774619	0.0926626795339059	0.776054924584272	-0.020751350756444	0.0331103897706347	0.0538994067705266	NA	NA	0.0486079044975849	0.669442630155067	336	1	663	0.663	0.336	0.672
N	all	ss13	151	AAC	GCA	ACC	2	CGCAACCCT:CGCAATCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.75000000000007	3	34.58333333333334	0.0720842506535656	0.092187504132096	0.781930819498873	-0.0201032534785305	0.0323406653789729	0.0564439281164166	NA	NA	0.050735663682277	0.691931560446082	337	2	661	0.661	0.337	0.674
N	all	ss13	152	CCT	ACC	CTA	2	AACCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.41666666666673	3	34.25000000000001	0.0724326033146382	0.0931427851735378	0.777651249956573	-0.0207101818588996	0.0332130559132942	0.0560551236286331	NA	NA	0.0482769446944154	0.667932682539183	333	4	663	0.663	0.333	0.666
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.25000000000007	3	34.083333333333336	0.0715679639391767	0.0936278982824406	0.764387167201838	-0.022059934343264	0.0319930344035608	0.0587421453746225	NA	NA	0.0491374578031266	0.65347253164929	327	0	673	0.673	0.327	0.654
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000007	2	33.916666666666664	0.0562984016666259	0.0614153696041381	0.916682615923434	-0.0051169679375122	0.0278860794627986	0.0447732239817682	NA	NA	0.0449938876575407	0.90945512331703	476	5	519	0.519	0.476	0.952
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.5833333333334	2	33.75	0.0564308375631679	0.0617314855970427	0.914133800886063	-0.00530064803387481	0.0275053988815143	0.0485846806498462	NA	NA	0.0434373669764558	0.902875511921008	452	7	541	0.541	0.452	0.904
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	2	33.75	0.0569668741816511	0.0617314855970427	0.922817159358629	-0.00476461141539165	0.0287662631599508	0.044375259976622	NA	NA	0.0444159745409514	0.91457282212769	471	2	527	0.527	0.471	0.942
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCGTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.25000000000007	2	33.75	0.0715679639391767	0.0617314855970427	1.15934297137027	0.00983647834213393	0.0316757664830173	0.0454460873728982	NA	NA	0.0472418896152588	0.835060959836613	639	3	358	0.358	0.639	0.716
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCGTCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.25000000000007	2	33.75	0.0715679639391767	0.0617314855970427	1.15934297137027	0.00983647834213393	0.0311692660225731	0.0440411154079085	NaN	NaN	0.0480643021952422	0.837843654859832	582	3	415	0.415	0.582	0.83
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA:GTCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.3333333333334	1	34.416666666666664	0.0725202186018532	0.0296334842053817	2.44723901176234	0.0428867343964715	0.0323149515112258	0.0287653814003913	NA	NA	0.0327961757061442	0.190983614644634	892	5	103	0.103	0.892	0.206
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666673	1	34.583333333333336	0.0726960870999214	0.0294878275056261	2.46529138459086	0.0432082595942953	0.0325488604402303	0.0311432398590631	NA	NA	0.033067193360245	0.19132121485415	912	3	85	0.085	0.912	0.17
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.00000000000007	1	35.083333333333336	0.0728728113402358	0.0290593249318817	2.50772554114928	0.0438134864083541	0.0310468673493082	0.0292871810965809	NA	NA	0.033067345356946	0.185178635891084	926	3	71	0.071	0.926	0.142
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000007	1	35.25	0.0870541284395654	0.0289192452027623	3.01024898226771	0.0581348832368031	0.035102083877279	0.0302178911950124	NA	NA	0.0364752872280579	0.110977333606052	956	0	44	0.044	0.956	0.088
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000007	1	35.25	0.0870541284395654	0.0289192452027623	3.01024898226771	0.0581348832368031	0.035518698250827	0.0287884828336483	NaN	NaN	0.0339952176562241	0.0872492236621919	957	1	42	0.042	0.957	0.084
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.66666666666673	2	35.916666666666664	0.0874776777943206	0.0578600049104132	1.5118850738047	0.0296176728839073	0.0347040322737248	0.0416807406079825	NA	NA	0.0452517109530087	0.512783634664392	745	1	254	0.254	0.745	0.508
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.33333333333339	3	35.916666666666664	0.103612753860613	0.0885548256923263	1.17004074086943	0.0150579281682864	0.0383640998039379	0.0527238652838245	NaN	NaN	0.0513056267409251	0.769144070276831	621	0	379	0.379	0.621	0.758
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.66666666666671	3	35.583333333333336	0.103103242971452	0.0894358561096487	1.15281775628163	0.0136673868618034	0.0374324996656129	0.0515450412353153	NaN	NaN	0.0510372834648826	0.788859268371948	596	2	402	0.402	0.596	0.804
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.00000000000004	3	36.25	0.104127333640662	0.0876910035441767	1.18743462193593	0.0164363300964851	0.0371676728361752	0.0499541965388255	NaN	NaN	0.0509080220373062	0.746798799586466	618	1	381	0.381	0.618	0.762
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.00000000000004	3	36.91666666666667	0.120256987556384	0.0860130038580103	1.39812565731228	0.0342439836983742	0.0410928978264252	0.0498707475090972	NaN	NaN	0.0532604277478587	0.520254208839254	741	1	258	0.258	0.741	0.516
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.16666666666671	4	37.41666666666667	0.12178588422283	0.115334665090852	1.05593478011919	0.00645121913197781	0.0419865871787189	0.0629304461160459	NaN	NaN	0.0621376497592101	0.9173110663676	524	0	476	0.476	0.524	0.952
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	70.66666666666671	4	37.91666666666667	0.122722067836351	0.113692394224188	1.07942196726333	0.00902967361216299	0.0416151727690169	0.0601254287836831	NaN	NaN	0.0652024651186272	0.889855787638949	546	0	454	0.454	0.546	0.908
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.33333333333337	4	38.583333333333336	0.125290563497375	0.111574227897278	1.12293462261486	0.0137163356000966	0.0434987412542229	0.0605822763807101	NaN	NaN	0.0608211094540772	0.821575292731561	584	0	416	0.416	0.584	0.832
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.00000000000004	4	38.91666666666667	0.125949614506391	0.110544521791661	1.13935645534533	0.0154050927147305	0.0427296833438634	0.0604546761359643	NaN	NaN	0.0608393896077367	0.800106563350611	597	0	403	0.403	0.597	0.806
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.6666666666667	4	38.58333333333334	0.126615652181289	0.111574227897278	1.13481091975702	0.0150414242840111	0.0442170556032249	0.0554459518176641	NaN	NaN	0.0611757790661867	0.805781153150372	601	1	398	0.398	0.601	0.796
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.25000000000003	4	37.58333333333334	0.125454677283587	0.114781984854672	1.09298229545715	0.010672692428915	0.0428199990762479	0.0597307841421863	NaN	NaN	0.0636958648933638	0.866931747573733	562	0	438	0.438	0.562	0.876
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.75000000000003	4	36.58333333333334	0.124476407968011	0.11818004032857	1.05327775842634	0.00629636763944047	0.0435909754801487	0.0605447018968151	NaN	NaN	0.0651915817531617	0.923057933845289	573	1	426	0.426	0.573	0.852
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.9166666666667	4	36.50000000000001	0.126115464592411	0.118472334721436	1.06451404784878	0.00764312987097508	0.0435980075413924	0.0643710406898149	NaN	NaN	0.0640475531357107	0.905009768627821	566	1	433	0.433	0.566	0.866
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.58333333333336	4	36.50000000000001	0.124800794215712	0.118472334721436	1.05341719236948	0.00632845949427636	0.0432801544048829	0.0605314446855756	NaN	NaN	0.0646123259641115	0.921975902665973	593	1	406	0.406	0.593	0.812
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGCAGAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.58333333333336	4	36.00000000000001	0.124800794215712	0.120256987556385	1.03778413838279	0.00454380665932747	0.0396545843910354	0.0642087603658613	NaN	NaN	0.0674723226160776	0.946308432698232	532	0	468	0.468	0.532	0.936
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:AGAGGTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.58333333333336	4	35.50000000000001	0.126783266334208	0.122096350832699	1.03838702360508	0.00468691550150874	0.0442322245781426	0.0667590747058272	NaN	NaN	0.0670635383852347	0.944283054445153	541	1	458	0.458	0.541	0.916
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT:GGTGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	68.58333333333336	4	35.16666666666667	0.126783266334208	0.123354245726484	1.02779815633852	0.0034290206077246	0.0450731450320082	0.0695845082935809	NaN	NaN	0.0702717110415508	0.961081391384557	557	1	442	0.442	0.557	0.884
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.50000000000003	4	34.91666666666667	0.124963623649128	0.124314847835041	1.00521881195517	6.48775814087038e-4	0.0436488908840292	0.0664347851239309	NaN	NaN	0.0658502707211318	0.992139138906193	527	1	472	0.472	0.527	0.944
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAATCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.16666666666669	4	34.58333333333334	0.125619222573624	0.125619222573624	1	0	0.0421225005270318	0.0677557235719346	NaN	NaN	0.0696614556887617	1	530	0	470	0.47	0.53	0.94
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAATCTTCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	69.16666666666669	4	34.58333333333334	0.125619222573624	0.125619222573624	1	0	0.0429176910178223	0.0655515621677798	NaN	NaN	0.0678582437983589	1	524	1	475	0.475	0.524	0.95
N	all	ss13	184	TCA	CCT	CAT	2	GCCTCTTCT:TCTTCATCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.83333333333334	4	34.58333333333334	0.107601064242965	0.125619222573624	0.856565277498841	-0.0180181583306591	0.0405547713722982	0.0669125962389736	NaN	NaN	0.065424754499411	0.783006819537059	387	0	613	0.613	0.387	0.774
N	all	ss13	185	TCT	CAT	CTC	2	TCATCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.50000000000001	4	34.58333333333334	0.106507748243781	0.125619222573624	0.847861864304705	-0.0191114743298435	0.0388531449892888	0.0639513087354731	NaN	NaN	0.0634042624820425	0.76309230280381	376	0	624	0.624	0.376	0.752
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.33333333333336	5	34.25000000000001	0.121476995958792	0.162356129339379	0.748213180820937	-0.0408791333805867	0.0410880429150956	0.0800323793343211	NaN	NaN	0.0748787328915791	0.58510866917463	274	0	726	0.726	0.274	0.548
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.58333333333336	5	34.00000000000001	0.121016596675858	0.163690174515013	0.739302753109095	-0.0426735778391558	0.0396750447569778	0.0827605194668743	NaN	NaN	0.0736120779343989	0.562110930331808	279	1	720	0.72	0.279	0.558
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.58333333333336	5	34.00000000000001	0.121016596675858	0.163690174515013	0.739302753109095	-0.0426735778391558	0.0401766617248511	0.083970802194102	NaN	NaN	0.0769246266448846	0.579068861937626	282	0	718	0.718	0.282	0.564
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.00000000000001	0.119805791874255	0.163690174515013	0.731905822870673	-0.0438843826407585	0.0388060520476179	0.0816886364780193	NA	NA	0.0734511264604067	0.55019782781933	233	0	767	0.767	0.233	0.466
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.00000000000001	0.119805791874255	0.163690174515013	0.731905822870673	-0.0438843826407585	0.0412179535711816	0.0783969545366933	NaN	NaN	0.0725390704524105	0.545195072137558	274	1	725	0.725	0.274	0.548
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.25000000000003	5	34.66666666666667	0.119805791874255	0.160180575223544	0.747942075417427	-0.0403747833492893	0.0407776503435816	0.0826923608840495	NaN	NaN	0.0752236627918771	0.591454251399108	300	0	700	0.7	0.3	0.6
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.25000000000003	5	33.66666666666667	0.118034434440782	0.165503521626615	0.713183824009941	-0.0474690871858338	0.0402180934923663	0.0814447679046331	NaN	NaN	0.0783121519725365	0.544413656877349	248	0	752	0.752	0.248	0.496
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.9166666666667	5	32.66666666666667	0.115195995681218	0.171193988985735	0.67289743269442	-0.0559979933045171	0.0414471283077184	0.0891822207481179	NaN	NaN	0.0775516826357081	0.470249461084367	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000003	4	31.83333333333334	0.113827458253345	0.137526919369799	0.827674020293233	-0.0236994611164541	0.037384915574122	0.0774036066660461	NaN	NaN	0.077973180105791	0.761170742377868	377	1	622	0.622	0.377	0.754
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.75000000000003	4	31.16666666666667	0.0986178115404479	0.140762624951505	0.700596565135264	-0.0421448134110572	0.0350558755022164	0.0785288812910906	NaN	NaN	0.0785488198060133	0.591583378892673	279	0	721	0.721	0.279	0.558
N	all	ss13	196	ACA	CAA	CAA	2	TCAACAAAT:TCAAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.25000000000004	4	31.33333333333334	0.0965740892437443	0.139939466685309	0.690113314930067	-0.0433653774415648	0.036054939024649	0.0751301478107311	NaN	NaN	0.0726099181596606	0.550348720494555	269	1	730	0.73	0.269	0.538
N	all	ss13	197	AAT	CAA	ATT	2	ACAAATTCA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333337	4	31.41666666666667	0.0821801867828476	0.139531497680893	0.588972297644169	-0.0573513108980455	0.0317742016047451	0.078020729845967	NaN	NaN	0.0737532960108625	0.436798880894431	218	0	782	0.782	0.218	0.436
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.75000000000004	4	32.08333333333334	0.0837104884722511	0.136351658368326	0.613930842308674	-0.0526411698960751	0.0320708010353766	0.07597597708298	NaN	NaN	0.0727177730626136	0.469120595171856	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.08333333333337	4	32.75	0.0833225893012241	0.133313895827917	0.625010534601568	-0.0499913065266929	0.0326692561141534	0.0761125313334227	NaN	NaN	0.0658202668769812	0.44754612048201	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.58333333333337	4	33.91666666666667	0.0839057969997928	0.128312053707491	0.653919835084785	-0.0444062567076985	0.0325815596522135	0.0746292152718652	NaN	NaN	0.0665712184040653	0.504740911336849	253	0	747	0.747	0.253	0.506
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666671	4	33.25	0.0823684046093706	0.131123163798598	0.628175847982791	-0.0487547591892272	0.032570860225629	0.0698485159773848	NaN	NaN	0.068632304585767	0.477470846723137	224	0	776	0.776	0.224	0.448
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.91666666666671	4	33.25	0.0823684046093706	0.131123163798598	0.628175847982791	-0.0487547591892272	0.0327230453500233	0.074089918912368	NaN	NaN	0.0664232318230794	0.462947756018191	214	0	786	0.786	0.214	0.428
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.9166666666667	4	33.58333333333333	0.0835160880143217	0.129702340924675	0.643905787813223	-0.0461862529103528	0.03143950124252	0.0714028447343859	NaN	NaN	0.0673798769416678	0.493053295944361	257	0	743	0.743	0.257	0.514
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.9166666666667	4	33.91666666666666	0.0846962403936439	0.128312053707491	0.660080155732859	-0.0436158133138474	0.0328015994937839	0.0696418181781907	NA	NA	0.0655334968270192	0.505698828100487	252	1	747	0.747	0.252	0.504
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT:AGGGGAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.58333333333336	4	34.58333333333332	0.0850970793814355	0.125619222573624	0.677420840839552	-0.0405221431921889	0.0332812216821676	0.0714822635400134	NaN	NaN	0.061751120541552	0.511684427631532	254	0	746	0.746	0.254	0.508
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCT:GGAAGTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.25000000000003	4	33.91666666666666	0.0842991638602774	0.128312053707491	0.656985539740884	-0.0440128898472139	0.0335760119173644	0.0747493110317476	NaN	NaN	0.0679151417598344	0.516948019307339	260	0	740	0.74	0.26	0.52
N	all	ss13	207	TCT	CTT	CTC	2	ACTTCTCCT:AGTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.4166666666667	4	34.41666666666666	0.0703916034965163	0.126281753068954	0.557417059755894	-0.0558901495724379	0.0315151619435659	0.0673571081306584	NA	NA	0.0648474191122482	0.388758172738102	153	1	846	0.846	0.153	0.306
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333337	4	34.91666666666666	0.0702267037754944	0.124314847835042	0.564910024816031	-0.0540881440595471	0.0300841585495177	0.0724226207957235	NA	NA	0.062461337117991	0.386519784055506	164	0	836	0.836	0.164	0.328
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333337	4	34.08333333333333	0.0687766788210943	0.127628054258582	0.538883705629084	-0.0588513754374873	0.0292915598962308	0.0722229098711602	NaN	NaN	0.0691095770910322	0.394454942324592	167	0	833	0.833	0.167	0.334
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGATTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666671	4	33.249999999999986	0.0679967073757475	0.131123163798598	0.518571283714515	-0.0631264564228503	0.0303520328922061	0.0752556524823416	NA	NA	0.0687975990941688	0.358845221893462	130	1	869	0.869	0.13	0.26
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGATTGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.58333333333339	4	33.58333333333332	0.0683065619163606	0.129702340924675	0.526640933612988	-0.0613957790083139	0.030105281926381	0.0713293415983178	NaN	NaN	0.0670060217694436	0.359523957124014	139	1	860	0.86	0.139	0.278
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTGGC:TTGGCTAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.58333333333339	4	34.41666666666666	0.0548816190849608	0.126281753068954	0.434596588590226	-0.0714001339839934	0.0271791500380516	0.0696852026211173	NaN	NaN	0.0629565992897735	0.256745577049697	88	2	910	0.91	0.088	0.176
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333339	4	34.58333333333332	0.0545075207127158	0.125619222573624	0.433910667459905	-0.0711117018609086	0.0275849008351653	0.0683089767996944	NaN	NaN	0.0648875501464495	0.27311285563161	81	2	917	0.917	0.081	0.162
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666673	3	33.91666666666666	0.0542609435735893	0.0941180977157372	0.576519764960321	-0.0398571541421479	0.0263771692493479	0.0645891238472161	NA	NA	0.0503812850264136	0.428879621860246	193	3	804	0.804	0.193	0.386
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000006	2	34.249999999999986	0.040687942312311	0.0607927570603562	0.669289308131152	-0.0201048147480452	0.0222667417377264	0.0460768053972339	NA	NA	0.0431308500413512	0.641118607112544	304	17	679	0.679	0.304	0.608
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000006	2	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.0589984642956841	0.699128482461261	-0.0177509574850976	0.0229748425114826	0.0460558352395854	NA	NA	0.0434664670020305	0.682992659277044	354	16	630	0.63	0.354	0.708
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	2	35.583333333333314	0.0414374651394939	0.0584236862456271	0.709257970564899	-0.0169862211061332	0.0236265012015568	0.0469276915795859	NA	NA	0.0438692617717386	0.698607425425777	347	8	645	0.645	0.347	0.694
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	35.583333333333314	0.0273690573365762	0.0584236862456271	0.468458241773895	-0.0310546289090509	0.0189276187168864	0.0469287609627742	NA	NA	0.0397786850384187	0.43498769361244	180	35	785	0.785	0.18	0.36
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.0833333333334	1	35.249999999999986	0.0552608903391469	0.0289192452027623	1.91086904072685	0.0263416451363846	0.0334875993466981	0.0315554853537692	NA	NA	0.0344171233908106	0.444054513858483	730	44	226	0.226	0.73	0.452
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000007	1	34.583333333333314	0.0547563501152287	0.0294878275056261	1.85691367411796	0.0252685226096026	0.0332566478162521	0.0311236971348357	NA	NA	0.0359403821207026	0.482013546050595	723	47	230	0.23	0.723	0.46
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5833333333334	1	34.41666666666665	0.0541384900641951	0.0296334842053817	1.82693636998524	0.0245050058588134	0.033975726075435	0.0316128597224002	NA	NA	0.0360008937853548	0.496075444866602	689	43	268	0.268	0.689	0.536
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75000000000007	1	34.24999999999998	0.0540165882431452	0.0297805871963346	1.81381877687736	0.0242360010468106	0.0335981606675856	0.032798511645666	NA	NA	0.03787228938434	0.522211467212145	723	46	231	0.231	0.723	0.462
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666674	1	34.583333333333314	0.0542609435735893	0.0294878275056261	1.84011329974162	0.0247731160679632	0.0329014167990356	0.0319942054056427	NA	NA	0.0368765369962442	0.501720378014146	732	34	234	0.234	0.732	0.468
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000009	1	35.083333333333314	0.053834761795598	0.0290593249318817	1.85258129436223	0.0247754368637162	0.0315174151802216	0.0315025467654336	NA	NA	0.0358561330920125	0.489585715970006	733	41	226	0.226	0.733	0.452
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666676	1	35.41666666666664	0.0537142229868647	0.0287805096612114	1.86634022882706	0.0249337133256533	0.0330340412986806	0.0308800130052444	NA	NA	0.0360335185002352	0.488963148639886	717	50	233	0.233	0.717	0.466
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666676	1	35.66666666666664	0.0533558250189307	0.0285748846742028	1.867228009046	0.0247809403447279	0.0325740400883412	0.0296829348987916	NA	NA	0.0337546395694439	0.462857833800333	741	45	214	0.214	0.741	0.428
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666676	1	35.99999999999998	0.0540774704260079	0.0283052459871353	1.91051052693857	0.0257722244388725	0.0334680675392035	0.0315997543161447	NA	NA	0.0356515742474862	0.469746469344344	713	49	238	0.238	0.713	0.476
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:AGATTGAAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666676	1	35.99999999999998	0.0540774704260079	0.0283052459871353	1.91051052693857	0.0257722244388725	0.032649905631698	0.0296015279341298	NA	NA	0.0339338636102903	0.447563117466182	764	42	194	0.194	0.764	0.388
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG:TTGAATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666676	1	36.333333333333314	0.0533558250189307	0.0280406490537152	1.90280278165891	0.0253151759652155	0.031714441179673	0.028697522659155	NA	NA	0.0344329023112986	0.462215821186058	723	46	231	0.231	0.723	0.462
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT:AATCAGCTT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000009	1	37.333333333333314	0.053834761795598	0.0272757331281561	1.97372373247139	0.0265590286674418	0.0329586769445014	0.0273204905922633	NA	NA	0.0340450523484993	0.435323660787206	743	47	210	0.21	0.743	0.42
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333341	1	37.583333333333314	0.0545075207127158	0.0270909813104957	2.01201721296077	0.0274165394022201	0.0324565835084128	0.029143895454113	NA	NA	0.0346635262149646	0.428982877606592	749	53	198	0.198	0.749	0.396
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666676	1	37.41666666666664	0.0538952343889475	0.0272138698048234	1.98043257998519	0.0266813645841241	0.0331030756096641	0.0283455413642961	NA	NA	0.0354065413366136	0.451106493081106	743	49	208	0.208	0.743	0.416
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666676	1	36.41666666666664	0.0531784143271381	0.0279752710599065	1.90090792018641	0.0252031432672315	0.0324982573825163	0.0296492341137477	NA	NA	0.0330338202678847	0.445493394319143	721	59	220	0.22	0.721	0.44
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.2500000000001	1	36.41666666666664	0.0536541558618203	0.0279752710599065	1.91791370839356	0.0256788848019138	0.0327776680855883	0.0282456154641325	NA	NA	0.0346717588657165	0.458918861920499	701	45	254	0.254	0.701	0.508
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.2500000000001	1	36.41666666666664	0.0536541558618203	0.0279752710599065	1.91791370839356	0.0256788848019138	0.0325348469937673	0.0282215483875326	NA	NA	0.035205768469380803	0.465760539040401	732	43	225	0.225	0.732	0.45
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333343	0	36.583333333333314	0.0402331091273881	0	-Inf	0.0402331091273881	0.0295400343339635	0	NA	NA	0.0299156524029123	0.178662407957313	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.66666666666676	0	36.16666666666664	0.0396568140359608	0	-Inf	0.0396568140359608	0.0298079997632961	0	NA	NA	0.0295679410077774	0.1798523257959	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	36.333333333333314	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0305443425522995	0	NA	NA	0.031540173449086	0.210633378542401	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	35.66666666666665	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0299419446144255	0	NA	NA	0.0309646772540456	0.202276819336082	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000009	0	36.333333333333314	0.0394828001140664	0	-Inf	0.0394828001140664	0.0310016194210998	0	NA	NA	0.0305262284665265	0.195870754652763	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333341	0	36.499999999999986	0.0395696157178212	0	-Inf	0.0395696157178212	0.0296656925985986	0	NA	NA	0.030133279275664	0.189131289942542	859	141	0	0	0.859	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA:CAACAACCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333341	0	36.999999999999986	0.0398323689854613	0	-Inf	0.0398323689854613	0.0296707016390732	0	NA	NA	0.0298663601253321	0.182306536609392	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC:CAACCAGGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.33333333333341	0	36.999999999999986	0.0409192381878258	0	-Inf	0.0409192381878258	0.030364319581127	0	NA	NA	0.0310274909076178	0.187234010044325	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA:CCAGGCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666674	0	36.83333333333332	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0278454100589369	0	NA	NA	0.0273119771672471	0.314641534596435	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACC:GGCCAAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666674	0	36.999999999999986	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0268258209122177	0	NA	NA	0.0283848319139105	0.333281862250869	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	246	ACC	AAA	CCG	2	CAAACCGTC:CAAACTGTC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	0	35.999999999999986	0.0270909813104956	0	-Inf	0.0270909813104956	0.0271067072965294	0	NA	NA	0.0280157441738574	0.333548375164126	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CCG	TCA	2	ACCGTCACT:ACTGTCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	0	35.999999999999986	0.0270909813104956	0	-Inf	0.0270909813104956	0.0286276962342187	0	NA	NA	0.0262887189840131	0.302767206807083	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	0	35.66666666666665	0.0269691977905829	0	-Inf	0.0269691977905829	0.0270220376255548	0	NA	NA	0.0279350474957682	0.334331902892484	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000009	0	35.33333333333332	0.0266103300115571	0	-Inf	0.0266103300115571	0.0273986813994498	0	NA	NA	0.0282843685357048	0.346800183126209	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.66666666666674	0	34.49999999999999	0.026551445288187	0	-Inf	0.026551445288187	0.0276864951583457	0	NA	NA	0.0266892164554092	0.319815087302689	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	0	34.99999999999999	0.026728886585519	0	-Inf	0.026728886585519	0.0266587528447379	0	NA	NA	0.027612172605519	0.333038880254278	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	0	34.66666666666666	0.0263763446044989	0	-Inf	0.0263763446044989	0.0269454598144177	0	NA	NA	0.0252832691752039	0.296840322604641	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.8333333333334	0	33.99999999999999	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0258885516786927	0	NA	NA	0.0255774148916112	0.312948636141326	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.16666666666674	0	33.666666666666664	0.025698445480572	0	-Inf	0.025698445480572	0.0265819161973117	0	NA	NA	0.0266629450119475	0.335133059230089	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCG:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000007	0	33.333333333333336	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0264912444865976	0	NA	NA	0.0252768407556367	0.311374022825278	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	256	TCG	CAT	CGA	2	GCATCGAAG:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.66666666666674	0	33.666666666666664	0.0255343810572878	0	-Inf	0.0255343810572878	0.0253271659392319	0	NA	NA	0.0259309089757511	0.32476737909875403	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CGA	AGA	2	TCGAAGAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666674	0	33.166666666666664	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.0257934533473785	0	NA	NA	0.025150773613082	0.313064878185811	613	387	0	0	0.613	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AGA	AGC	2	AAGAAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666674	0	31.666666666666668	0.0248985520571968	0	-Inf	0.0248985520571968	0.0256968723453458	0	NA	NA	0.0255700340571093	0.330185901714056	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	31.833333333333336	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0266917134196958	0	NA	NA	0.0256402038458502	0.329499972421166	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	31.833333333333336	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0251959142902048	0	NA	NA	0.0251639602772278	0.320429174461894	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.3333333333334	0	32	0.0250023152006938	0	-Inf	0.0250023152006938	0.0253139731136496	0	NA	NA	0.0263704598639744	0.343069240260174	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.66666666666673	0	31.666666666666668	0.0248985520571968	0	-Inf	0.0248985520571968	0.0252663035384886	0	NA	NA	0.0255048989248428	0.328952353330264	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.50000000000006	0	32.16666666666667	0.0252655469877565	0	-Inf	0.0252655469877565	0.0260582177720098	0	NA	NA	0.0262892584211649	0.336522147837485	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000006	0	33.166666666666664	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0263107235853967	0	NA	NA	0.026374758141899	0.331945949688133	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666671	0	32.5	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.0254882635912414	0	NA	NA	0.0258229680720833	0.325828179221216	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	266	ACT	CCA	CTA	2	GCCACTAAA:GCTACTAAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.33333333333339	0	32	0.0250023152006939	0	-Inf	0.0250023152006939	0.0263569710036617	0	NA	NA	0.0264760481260766	0.344997399660901	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CTA	AAC	2	ACTAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.16666666666671	0	31.666666666666668	0.0247445123657617	0	-Inf	0.0247445123657617	0.0255406517352968	0	NA	NA	0.025704363161779	0.335719150538995	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.50000000000004	0	31.666666666666668	0.0249503257372043	0	-Inf	0.0249503257372043	0.0252395348578193	0	NA	NA	0.0246928710480869	0.312291104232781	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.00000000000004	0	31.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333337	0	32	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.50000000000003	0	31.666666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.1666666666667	0	32.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.83333333333337	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.6666666666667	0	32	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.6666666666667	0	31.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA:GGTCCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.6666666666667	0	32.333333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCAGAGCAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.33333333333337	0	31.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC:GAGCAAACC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.50000000000003	0	31.833333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.83333333333337	0	32.5	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.1666666666667	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000003	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	1	32.5	0.0128482799476378	0.0314182062818701	0.408943777132556	-0.0185699263342324	0.0137078015868314	0.0318803616451565	NA	NA	0.0199910576515261	0.352934875307145	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	1	32.333333333333336	0.0129313548258795	0.0315836140125951	0.4094323981012	-0.0186522591867156	0.0129532504297537	0.0334984530290681	NA	NA	0.0202048414007278	0.3559249188919	0	355	645	0.645	0	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000003	1	31.83333333333333	0.0129313548258795	0.0320904564039067	0.402965749789249	-0.0191591015780272	0.0128467550489585	0.0327856960813569	NA	NA	0.0204628179897946	0.349124657074383	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	1	32.5	0.0130438070339019	0.0314182062818701	0.415167145981496	-0.0183743992479682	0.012972072197939	0.0334140646037932	NA	NA	0.01831173197516	0.315657174513023	0	390	610	0.61	0	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAA:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	1	32.5	0.0130438070339019	0.0314182062818701	0.415167145981496	-0.0183743992479682	0.0136487479506257	0.0337448973296756	NA	NA	0.0199100743951672	0.356075246993484	0	349	651	0.651	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAACTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	1	31.33333333333333	0.0128482799476378	0.0326138339548042	0.393951841584854	-0.0197655540071664	0.0128542053341415	0.0340733967796206	NA	NA	0.0209468767184584	0.345372112147203	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000003	1	30.83333333333333	0.012766265677073	0.0331545693783718	0.385052978109286	-0.0203883037012988	0.012378656712693	0.034271781781515	NA	NA	0.0206597676762561	0.323711148370146	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	1	30.83333333333333	0.0124484185567784	0.0331545693783718	0.375466151127242	-0.0207061508215934	0.0130069972570975	0.0343127991283073	NA	NA	0.0217084191804222	0.340169482963147	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	1	31.83333333333333	0.012345957790554	0.0320904564039067	0.38472365849714	-0.0197444986133528	0.0124001363309248	0.0325588080515185	NA	NA	0.0211684299505616	0.350957709229504	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	1	31.66666666666666	0.0122451699655716	0.0322630388127681	0.3795417423831	-0.0200178688471965	0.0127645478521105	0.0327925660314602	NA	NA	0.0222837520624334	0.369016678415211	0	340	660	0.66	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000001	1	32.33333333333333	0.0124484185567784	0.0315836140125951	0.394141675864393	-0.0191351954558168	0.012263243136726	0.0302471635957895	NA	NA	0.0205785098684212	0.352442008840861	0	347	653	0.653	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000001	1	31.999999999999993	0.0375078154309961	0.0319197108140969	1.17506752017412	0.00558810461689915	0.0280239570951343	0.0326774664032858	NA	NA	0.0317801686569087	0.860422616229562	519	131	350	0.35	0.519	0.7
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.83333333333333	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.028153943086186	0.0339534727240727	NA	NA	0.0317629519189455	0.866504718926727	532	123	345	0.345	0.532	0.69
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.83333333333333	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0280236706225952	0.03178275072693	NA	NA	0.033672214623026	0.874008959739554	520	126	354	0.354	0.52	0.708
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.16666666666669	1	31.499999999999993	0.0369684687876581	0.0324374878453625	1.13968347252709	0.00453098094229566	0.027775375978972	0.0322649924665651	NA	NA	0.0314636320178179	0.885495000123047	484	133	383	0.383	0.484	0.766
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	2	31.249999999999993	0.0495536228075988	0.0668966841033532	0.740748565818898	-0.0173430612957545	0.0308163976970831	0.048735188118977	NA	NA	0.0400073131070647	0.664653543807429	334	44	622	0.622	0.334	0.668
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	31.58333333333333	0.0501754455827152	0.0661585688516753	0.758411895142508	-0.0159831232689602	0.030665032734868	0.0484978799272119	NA	NA	0.0387569905073808	0.680051172143996	330	35	635	0.635	0.33	0.66
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	31.91666666666666	0.0508130785858607	0.0654365742860851	0.776524124929106	-0.0146234957002244	0.0309709670687768	0.0479747170244579	NA	NA	0.0392375379429827	0.70937808567581	331	48	621	0.621	0.331	0.662
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333336	2	30.91666666666666	0.0503862036875865	0.0676514664202387	0.744791005336034	-0.0172652627326522	0.0313055475821274	0.0517752492045717	NA	NA	0.0423321042414659	0.683381825290769	319	43	638	0.638	0.319	0.638
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	29.91666666666666	0.0511380136321413	0.070021663193269107	0.730317037614396	-0.0188836495611278	0.0313865156803357	0.0521527556841081	NA	NA	0.0427805616039518	0.658918202803135	316	44	640	0.64	0.316	0.632
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75000000000003	2	29.249999999999993	0.0512472511431301	0.071696340510766	0.714781964854047	-0.0204490893676359	0.0321375355236862	0.0546374941000222	NA	NA	0.04443807309319	0.645393859001274	318	28	654	0.654	0.318	0.636
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000003	2	29.66666666666666	0.0510835693943593	0.0706404112947758	0.723149376653433	-0.0195568419004165	0.030512175485210902	0.0526822716358716	NA	NA	0.0464030304686612	0.673422035340949	300	38	662	0.662	0.3	0.6
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	29.999999999999993	0.0513020451633004	0.069817817299509	0.734798754066194	-0.0185157721362086	0.0319649700687093	0.0540473002788613	NA	NA	0.042947139492307	0.666374324240541	347	41	612	0.612	0.347	0.694
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666669	2	30.499999999999996	0.0516332867726302	0.0686192553184994	0.752460610844171	-0.0169859685458692	0.0313251897973091	0.0538163750150968	NA	NA	0.0428031212413858	0.691485832321621	323	37	640	0.64	0.323	0.646
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30.499999999999996	0.0511925740908369	0.0686192553184994	0.746038030480282	-0.0174266812276625	0.0315451331726101	0.0503475421755786	NA	NA	0.0427524153464495	0.683553680282248	330	37	633	0.633	0.33	0.66
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30.499999999999996	0.0511925740908369	0.0686192553184994	0.746038030480282	-0.0174266812276625	0.0319448276237261	0.0504598930675578	NA	NA	0.0429315862311336	0.684803235104592	347	44	609	0.609	0.347	0.694
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000001	2	30.16666666666666	0.0514119856124207	0.0694136680239339	0.740660839226849	-0.0180016824115131	0.0312328455462922	0.0540410267298079	NA	NA	0.0440562878285647	0.682828512442053	316	39	645	0.645	0.316	0.632
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	29.91666666666666	0.0508130785858607	0.070021663193269107	0.725676544494663	-0.0192085846074084	0.030159405655964	0.0527873596264989	NA	NA	0.043918328153433	0.661842617423477	327	54	619	0.619	0.327	0.654
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	28.916666666666664	0.0501754455827152	0.0725641058409196	0.691463706487522	-0.0223886602582045	0.0306314920653077	0.0571470595043483	NA	NA	0.0447557975144777	0.616905779895622	295	40	665	0.665	0.295	0.59
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	2	28.583333333333332	0.0495536228075988	0.0734531512400294	0.674628956975147	-0.0238995284324306	0.029863284531185	0.0539472880977622	NA	NA	0.0460934320789829	0.604108190438926	245	53	702	0.702	0.245	0.49
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	28.916666666666664	0.0501754455827152	0.0725641058409196	0.691463706487522	-0.0223886602582045	0.0311164546586375	0.053182407875296	NA	NA	0.0439304545627563	0.610304597976893	284	56	660	0.66	0.284	0.568
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	28.249999999999996	0.0500707265730996	0.0743642698449398	0.673316993194504	-0.0242935432718402	0.031054350228809	0.0552330669974096	NA	NA	0.0452409117411531	0.591280230803483	263	58	679	0.679	0.263	0.526
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	27.583333333333332	0.0496561870198999	0.0762561014897823	0.651176575379393	-0.0265999144698824	0.0319173043326469	0.0552940680054715	NA	NA	0.047824480379205	0.578075018476821	252	50	698	0.698	0.252	0.504
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	27.749999999999996	0.0499664439235005	0.0757741689236761	0.659412628778937	-0.0258077250001756	0.0315877500625595	0.0592659390958846	NA	NA	0.0472268777642202	0.584747951806382	274	48	678	0.678	0.274	0.548
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666664	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0306074915529266	0.0574594959753199	NA	NA	0.045502282974848	0.579288548046889	275	56	669	0.669	0.275	0.55
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.9166666666667	2	28.249999999999996	0.0498625949111442	0.0743642698449398	0.670518180506779	-0.0245016749337956	0.0290589948482821	0.0573001822511126	NA	NA	0.0439062767122647	0.576813706708104	259	54	687	0.687	0.259	0.518
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	27.75	0.0494514815652544	0.0757741689236761	0.652616614179757	-0.0263226873584217	0.0302749934061317	0.0609468865943188	NA	NA	0.0490390274898546	0.591426375828614	259	46	695	0.695	0.259	0.518
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	2	27.75	0.0490470943757949	0.0757741689236761	0.647279872184383	-0.0267270745478812	0.031344782033783	0.0550895073574836	NA	NA	0.045283216157986	0.55504294755901	246	57	697	0.697	0.246	0.492
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	2	27.75	0.0492484575638286	0.0757741689236761	0.649937284214022	-0.0265257113598475	0.0303481382790006	0.0573711194513044	NA	NA	0.0452426357581635	0.557674613950061	243	39	718	0.718	0.243	0.486
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.91666666666669	2	28.75	0.0498625949111442	0.073005919868405	0.682993858594246	-0.0231433249572607	0.0316097218886407	0.0526813404970677	NA	NA	0.0444794284847686	0.602843868493174	277	52	671	0.671	0.277	0.554
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	2	29.166666666666668	0.049707628561966	0.0719113287774619	0.691235016888537	-0.0222037002154959	0.0294049415522338	0.0543874450753029	NA	NA	0.0432134543297493	0.607381676539485	279	39	682	0.682	0.279	0.558
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	2	29.083333333333336	0.0492484575638286	0.0721276112438599	0.682796181857762	-0.0228791536800314	0.0310769533446007	0.0527505450808896	NA	NA	0.0459975272045803	0.618907256217277	281	59	660	0.66	0.281	0.562
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	3	29.416666666666668	0.0494514815652544	0.109617210244414	0.451128809563684	-0.0601657286791594	0.0310977963013514	0.0695142852936155	NA	NA	0.0602547922468834	0.318026358087369	137	21	842	0.842	0.137	0.274
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	3	29.416666666666668	0.0490470943757949	0.109617210244414	0.447439724715074	-0.0605701158686189	0.030588070237134	0.0698977782333417	NA	NA	0.0590168270309165	0.30474104491748	128	16	856	0.856	0.128	0.256
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.91666666666669	3	28.416666666666668	0.0480644914227491	0.113782401199837	0.422424653689045	-0.065717909777088	0.030375301441141	0.0708124757316267	NA	NA	0.062749055912169	0.29495518507138	110	17	873	0.873	0.11	0.22
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.91666666666669	4	28.416666666666668	0.0480644914227491	0.155898728322134	0.308305859451486	-0.107834236899385	0.0311723518479073	0.0855899130844999	NA	NA	0.0789001284762158	0.17171366949444	60	7	933	0.933	0.06	0.12
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000003	4	28.75	0.0484527683011411	0.153892310773211	0.314848533092374	-0.105439542472069	0.0300941411274938	0.0837943109880999	NA	NA	0.0825870003138313	0.201705105958218	47	3	950	0.95	0.047	0.094
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.9166666666667	4	28.416666666666668	0.0598522824019851	0.155898728322134	0.383917707643595	-0.0960464459201485	0.0309696094401658	0.0873904974522749	NA	NA	0.0826014327882226	0.244922940509045	85	2	913	0.913	0.085	0.17
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.58333333333337	4	29.083333333333336	0.0593781769392197	0.151937056450332	0.390807735298137	-0.0925588795111128	0.0315579167045195	0.0880495481766277	NA	NA	0.077652006961482	0.233272923956846	96	2	902	0.902	0.096	0.192
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.58333333333337	4	29.083333333333336	0.0593781769392197	0.151937056450332	0.390807735298137	-0.0925588795111128	0.0317122747937942	0.0868577150796095	NA	NA	0.087191402527797	0.288435614989694	105	2	893	0.893	0.105	0.21
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.25000000000004	3	29.75	0.0473063180425278	0.10829587866142	0.436824730795415	-0.0609895606188924	0.0290866664449721	0.0669231114907823	NA	NA	0.0723979484536998	0.399552276858939	168	2	830	0.83	0.168	0.336
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATC:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333339	3	30.083333333333336	0.0473997786251612	0.107006075844546	0.442963432226239	-0.0596062972193845	0.030390078644047	0.0696069568560583	NA	NA	0.0676788673967818	0.378468068116377	156	8	836	0.836	0.156	0.312
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.16666666666671	3	29.666666666666668	0.0467988043212529	0.108623210908842	0.430836134650145	-0.0618244065875891	0.0290770136635677	0.0709760010518448	NA	NA	0.0674838062723858	0.359595084313467	157	4	839	0.839	0.157	0.314
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0464364923107347	0.108623210908842	0.427500641181606	-0.0621867185981073	0.0283172998773962	0.0694557079537311	NA	NA	0.0686642973657242	0.365114213121645	145	4	851	0.851	0.145	0.29
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0307034563629367	0.0701432380110568	NA	NA	0.0717756319028076	0.369136041173894	143	4	853	0.853	0.143	0.286
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0279806084478861	0.0726575326884681	NA	NA	0.0714598125877516	0.367023921450557	156	3	841	0.841	0.156	0.312
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.038960561072972	0.0687823974298163	NA	NA	0.0729153873670263	0.591100489856826	275	5	720	0.72	0.275	0.55
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0394117684271282	0.0666658745384228	NA	NA	0.0707165183778954	0.632084171248854	305	4	691	0.691	0.305	0.61
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0403546308940825	0.068175972134824	NA	NA	0.0706411394378288	0.646685301201525	322	2	676	0.676	0.322	0.644
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0391605519095627	0.0683759225858601	NA	NA	0.0700771389939805	0.643634029569526	322	3	675	0.675	0.322	0.644
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.0390208525293874	0.0695691677579912	NA	NA	0.0728494404500941	0.672056276083834	371	1	628	0.628	0.371	0.742
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.0301407626975922	0.0680294503036502	NA	NA	0.0667097252759178	0.404367827403808	197	2	801	0.801	0.197	0.394
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0303895520989428	0.0678744769392116	NA	NA	0.0680438421524176	0.419703648030356	190	4	806	0.806	0.19	0.38
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.0302548754167425	0.065087728423442	NA	NA	0.0674504341295059	0.431422268983065	203	3	794	0.794	0.203	0.406
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0310785910354647	0.0643664671300342	NA	NA	0.0633515418710774	0.437501886275512	226	2	772	0.772	0.226	0.452
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.0305491614967695	0.0495774324718237	NA	NA	0.0590569632781683	0.641099477179836	306	17	677	0.677	0.306	0.612
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.0291944808568715	0.0664460616870808	NaN	NaN	0.0715664517489612	0.377715420746042	153	5	842	0.842	0.153	0.306
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.0276255915421543	0.0669564663513259	NA	NA	0.0748545624018333	0.368750864487814	156	3	841	0.841	0.156	0.312
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0271088490421741	0.0671612813680832	NA	NA	0.0726266330773535	0.350987724980197	141	4	855	0.855	0.141	0.282
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.0269934296237319	0.0677343242402187	NA	NA	0.0731344035159171	0.366635418759026	135	8	857	0.857	0.135	0.27
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0281380268092473	0.0654328858054045	NA	NA	0.0698946024678679	0.372246385319367	150	5	845	0.845	0.15	0.3
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.16666666666673	3	32.41666666666667	0.0490972805875701	0.0987726497511971	0.497073640438355	-0.049675369163627	0.0298236752057996	0.0637648727416312	NA	NA	0.069734152364483007	0.476245887735944	241	3	756	0.756	0.241	0.482
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.50000000000007	3	32.083333333333336	0.0488971496674064	0.0998703029515669	0.489606501855907	-0.0509731532841605	0.0287602927327002	0.0659385045091538	NA	NA	0.071416704597475	0.475386282426735	215	2	783	0.783	0.215	0.43
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.16666666666674	4	31.083333333333332	0.0485017445945919	0.141177857059553	0.343550650256241	-0.0926761124649607	0.0305376434447197	0.0849831190279602	NaN	NaN	0.0931269926444518	0.319659212708583	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC:GACGCATAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000009	4	30.75	0.0483064312987563	0.142863650574837	0.338129615926703	-0.0945572192760804	0.0294443884130373	0.0837159607433824	NaN	NaN	0.0913181364002747	0.300449323639247	98	0	902	0.902	0.098	0.196
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA:GCATATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.00000000000009	4	29.916666666666668	0.0597926053740288	0.147260274111344	0.406033505878302	-0.0874676687373155	0.0329069768978984	0.0897326199402715	NaN	NaN	0.096054455461465807	0.362503527832568	155	0	845	0.845	0.155	0.31
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA:TATAAAACA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.83333333333341	4	30.083333333333332	0.0599120787357042	0.146359364647636	0.409349131023793	-0.0864472859119317	0.0313785825476794	0.085012438732981	NaN	NaN	0.0907360410624497	0.340725003998053	146	0	854	0.854	0.146	0.292
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0613211655108464	0.145028544735405	0.42282135301518	-0.0837073792245584	0.0330225240536441	0.091013769963618	NaN	NaN	0.0947638049126874	0.377059894998715	173	1	826	0.826	0.173	0.346
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0619547111548277	0.142438427764417	0.434957841975737	-0.0804837166095893	0.0331181685882963	0.0834547506385654	NaN	NaN	0.0894212519338046	0.368092935748851	158	0	842	0.842	0.158	0.316
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.75000000000007	4	30.5	0.0638004014677688	0.144154737019872	0.442582760627378	-0.0803543355521036	0.0350134456960376	0.0920675547636277	NaN	NaN	0.0947390092667015	0.396345946613887	159	0	841	0.841	0.159	0.318
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.75000000000007	4	29.5	0.0646255322826462	0.149561992614941	0.432098631161124	-0.0849364603322949	0.0349690926006949	0.0896510711501797	NaN	NaN	0.0947626934864333	0.370088850713447	135	0	865	0.865	0.135	0.27
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0787608262631877	0.186134722106651	0.423138817797034	-0.107373895843463	0.0378406473621275	0.0978781497975273	NaN	NaN	0.109853271099956	0.328356258041554	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.0798094452064725	0.179422266799376	0.44481349294128	-0.0996128215929031	0.0387050265945842	0.0932517902948741	NaN	NaN	0.105513095752412	0.345128680822962	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.0803443058867965	0.176245193423779	0.455866649898416	-0.0959008875369827	0.0395151272155664	0.0990240552986592	NaN	NaN	0.0930103360732316	0.302504363423926	141	0	859	0.859	0.141	0.282
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.25000000000007	5	32.333333333333336	0.0808863909048055	0.173179167487274	0.467067673776347	-0.0922927765824687	0.0398096349162672	0.0933804857380974	NA	NA	0.0955797107609137	0.334239096801847	138	0	862	0.862	0.138	0.276
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666673	5	32.00000000000001	0.0812518671161105	0.175211138386129	0.463736882623571	-0.0939592712700183	0.0400113534396109	0.0917313720178482	NaN	NaN	0.097262109073863	0.334023222245364	150	0	850	0.85	0.15	0.3
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666673	5	32.5	0.0818063224852468	0.172180831233375	0.475118640671248	-0.0903745087481283	0.0388568297038401	0.0910961092759496	NaN	NaN	0.0970633140141543	0.351807929107255	158	0	842	0.842	0.158	0.316
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75000000000007	5	32.5	0.0825574874404693	0.172180831233375	0.47948129213391	-0.0896233437929057	0.038884728758676	0.0917115295877461	NaN	NaN	0.0991737633943804	0.366154425249687	162	0	838	0.838	0.162	0.324
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	CTTCAACAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC:CAACATTCC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG:CATTCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCTACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG:TCTACTCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GQ153547.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	ACT	TGA	CTG	2	ATGACTGAT:ATGTCTGAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.08333333333334	9	33.25	0.105569191646694	0.335773403798578	0.314406056145002	-0.230204212151884	0.0404627596667305	0.151876802385846	NA	NA	0.148094778770286	0.120079877641598	18	0	982	0.982	0.018	0.036
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	ACTGATAAT:TCTGATAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.25	9	33.083333333333336	0.105304068164251	0.337910093969753	0.311633390193064	-0.232606025805502	0.0409690595142204	0.155672123563529	0.185958618624715	0.0937732257827754	0.150690944241443	0.122686094649669	17	2	981	0.981	0.017	0.034
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.58333333333333	9	33.083333333333336	0.104777802638579	0.337910093969753	0.310075977333656	-0.233132291331174	0.0396877312235808	0.152649229990322	0.25310030786534	0.220533392162225	0.141896072568416	0.100387243374876	18	0	982	0.982	0.018	0.036
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACAA:AATGGACCC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.58333333333333	9	33.416666666666664	0.106372646579413	0.333664006808512	0.318801681958042	-0.227291360229099	0.0418954537613642	0.162297221573796	0.242797852006502	0.189171703742056	0.14078647128351	0.106431945098424	16	0	984	0.984	0.016	0.032
N	all	ss13	6	CAA	GAC	AA-	1	GGACAA---:GGACCCCAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.5	1	0.166666666666667	0	0	2	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.58333333333333	9	34.416666666666664	0.108016877019068	0.321552160019395	0.335923344481818	-0.213535283000327	0.0419954435671237	0.154427322693966	0.250682019844397	0.180233105215142	0.134636436688988	0.112736117759007	13	1	986	0.986	0.013	0.026
N	all	ss13	7	---	CCC	AA-	0	CAA---TCA:CCCCAA---	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.58333333333333	7	34.083333333333336	0.108016877019068	0.239987262930077	0.45009420791861	-0.131970385911008	0.0411039070972975	0.101989492352942	NaN	NaN	0.101917855489056	0.195365037197327	56	0	944	0.944	0.056	0.112
N	all	ss13	8	---	--T	CAA	0	---TCAAAC:CAA---AAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.58333333333333	7	35.083333333333336	0.106372646579413	0.231968667588477	0.458564717749396	-0.125596021009064	0.0402535348513758	0.102581892364746	0.291680421583501	0.115916290325893	0.0880163014196403	0.153590509135059	68	0	932	0.932	0.068	0.136
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACT	1	---AATCAG:TCAAACTCG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.58333333333333	7	36.083333333333336	0.104777802638579	0.224472453654355	0.466773543625608	-0.119694651015777	0.0411789563413878	0.0958371308132605	NaN	NaN	0.087205597200383	0.16989011402323	56	0	944	0.944	0.056	0.112
N	all	ss13	10	CAG	ACT	AGC	2	AACTCGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	71.25	7	36.416666666666664	0.105304068164251	0.22208100957439	0.474169621103859	-0.116776941410139	0.0419174757111155	0.0988467233677627	NaN	NaN	0.0899306151277183	0.194107795487289	53	0	947	0.947	0.053	0.106
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:TCGCGTAAT	1:1	FALSE	1.25	1.25	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72	6	36	0.104127333640662	0.18848582121068	0.552441202058768	-0.0843584875700177	0.040313576183806	0.0822797076280374	NaN	NaN	0.0795129652417491	0.288717156736656	114	0	886	0.886	0.114	0.228
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAATGCG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.75	6	35.5	0.102976648483437	0.191510018856633	0.537708936055856	-0.088533370373196	0.0386691931795737	0.0845404043199046	0.326661852456905	0.0997489317743294	0.0803755036366195	0.270680440604206	104	1	895	0.895	0.104	0.208
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AATGCGCCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.25	6	36	0.103740920648638	0.18848582121068	0.550391111555716	-0.0847449005620416	0.0387621001807809	0.0867279739907568	NaN	NaN	0.0759282800961891	0.264371738507247	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCGCCTCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.41666666666667	6	36.5	0.103484903870957	0.185556129985381	0.557701348261093	-0.0820712261144233	0.040273749420306	0.0827285309820624	NaN	NaN	0.0732806852321379	0.262732029924691	108	0	892	0.892	0.108	0.216
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT:CCTCGCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.08333333333334	6	36.16666666666667	0.118326006641223	0.187498978963039	0.631075471960557	-0.0691729723218168	0.042938279826822	0.0876605724592503	0.419485476295601	0.132477470988777	0.0791541471279663	0.382171592153702	171	0	829	0.829	0.171	0.342
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.91666666666667	6	36.333333333333336	0.118619025918598	0.18652246930412	0.635950330065555	-0.0679034433855226	0.0412784414686824	0.0859952644810648	0.461310580502294	0.168026433170026	0.0802444278845732	0.397436952320144	171	0	829	0.829	0.171	0.342
N	all	ss13	17	ACG	TTA	CGT	2	ATTACGTTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.83333333333334	7	35.75000000000001	0.133025780578275	0.226916358788052	0.586232659860923	-0.0938905782097768	0.0427724803436588	0.100855448523415	0.372050470180707	0.115099460448931	0.0888616492020072	0.290697470635957	108	1	891	0.891	0.108	0.216
N	all	ss13	18	TTT	CGT	TTG	2	ACGTTTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.16666666666667	7	36.08333333333334	0.132371896891818	0.224472453654355	0.589702187225368	-0.092100556762537	0.0451787473858617	0.0961545693058676	0.375002558098558	0.115828049108391	0.0853502982483359	0.280548113046743	105	0	895	0.895	0.105	0.21
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GT-	1	TTTGGT---:TTTGGTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.33333333333333	7	35.41666666666668	0.132047365954149	0.229414483788198	0.575584260303544	-0.0973671178340485	0.0438157973177659	0.0958950576072715	NaN	NaN	0.08886098368773	0.273199550138296	116	0	884	0.884	0.116	0.232
N	all	ss13	20	---	GTG	GAC	1	GGT---GTC:GGTGGACCC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	74.16666666666666	7	35.08333333333335	0.132371896891819	0.231968667588477	0.570645588768274	-0.0995967706966583	0.044568665181456	0.0998223626756231	0.346034930085803	0.099127513364496	0.0892598012378002	0.264504470667711	86	1	913	0.913	0.086	0.172
N	all	ss13	21	CCC	--G	CCT	1	---GTCTCA:GGACCCTCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666666	7	35.58333333333335	0.12950744207608	0.228158530802243	0.567620424363314	-0.0986510887261638	0.0406739523799621	0.0970173936848606	NaN	NaN	0.087716623060033	0.260734532520319	76	0	924	0.924	0.076	0.152
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT:GTCTCAGAT	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.83333333333333	6	35.08333333333335	0.112096321732094	0.194105738514483	0.577501327832869	-0.0820094167823893	0.038834745562442	0.0841380085253226	NaN	NaN	0.0820099289345208	0.31731353008744	150	0	850	0.85	0.15	0.3
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATA	2	TCAGATACC:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	78.41666666666666	6	34.500000000000014	0.109659022528177	0.197860943283853	0.554222681385173	-0.0882019207556763	0.0395701686765282	0.0888983314131422	NaN	NaN	0.0837211571905713	0.292102693311178	122	0	878	0.878	0.122	0.244
N	all	ss13	24	ACC	ATA	CAA	2	GATACCTCA:GATTCAACT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.41666666666666	6	34.83333333333335	0.111185843809109	0.195697415235261	0.568151825998548	-0.0845115714261515	0.0391465037535135	0.0882298388407711	NaN	NaN	0.0825394141552292	0.305885570516992	119	0	881	0.881	0.119	0.238
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CAG	2	ACCTCAGAC:TCAACTGGC	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666666	5	34.58333333333335	0.110800159129969	0.160610991304224	0.68986660396171	-0.0498108321742552	0.0384766592767821	0.0756294538627104	NaN	NaN	0.0711879791195743	0.484109383851229	230	1	769	0.769	0.23	0.46
N	all	ss13	26	GAC	CAG	ACA	2	ACTGGCAGT:TCAGACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	77.66666666666666	5	34.58333333333335	0.110800159129969	0.160610991304224	0.68986660396171	-0.0498108321742552	0.0385162271805609	0.0812461851620986	NaN	NaN	0.0697287802286098	0.475010089864101	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAT:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.33333333333331	5	34.250000000000014	0.0951500406590925	0.162356129339379	0.586057582465501	-0.0672060886802862	0.035611616768678	0.0749108195395815	NaN	NaN	0.067430867142779	0.318926398710437	138	0	862	0.862	0.138	0.276
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAATCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333331	5	34.08333333333335	0.0813437533100697	0.163243053958072	0.498298404359442	-0.0818993006480026	0.0326746618583199	0.0789332356509573	NaN	NaN	0.0663046249685108	0.216757045120798	81	0	919	0.919	0.081	0.162
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AATCAGAAT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.66666666666666	5	34.250000000000014	0.0815281512006671	0.162356129339379	0.50215628773858	-0.0808279781387115	0.0340556130207296	0.0756569524124093	NaN	NaN	0.0665495762405256	0.22453667746345	83	0	917	0.917	0.083	0.166
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGCA:CAGAATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.24999999999999	5	33.66666666666668	0.0808863909048056	0.165503521626615	0.488729122557824	-0.0846171307218099	0.0314541602711808	0.0783967334372743	NaN	NaN	0.0693120878471142	0.222156651219985	90	0	910	0.91	0.09	0.18
N	all	ss13	31	GCA	ATG	CAG	2	AATGCAGAA:AATGGAGAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.24999999999999	5	34.33333333333335	0.0965740892437444	0.161916285324778	0.596444570415089	-0.0653421960810339	0.0370561055048718	0.0748689827044722	NaN	NaN	0.0672715247821687	0.331388814500998	147	0	853	0.853	0.147	0.294
N	all	ss13	32	GAA	CAG	AAC	2	GCAGAACGT:GGAGAACGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.58333333333331	5	35.16666666666668	0.0974718405643037	0.157645932730055	0.618295942536048	-0.0601740921657512	0.0349063079092363	0.0726884509467084	NaN	NaN	0.0684455622069611	0.379318555276045	162	0	838	0.838	0.162	0.324
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GAACGTGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666664	5	35.33333333333335	0.0976988961284261	0.15681884839392	0.623004805410969	-0.0591199522654934	0.0376166740755624	0.0731960555589015	NaN	NaN	0.0666092288193047	0.374775336148116	181	0	819	0.819	0.181	0.362
N	all	ss13	34	AGT	GCA	CTG	2	CGCAGTGGG:CGTGCTGGA	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.91666666666664	5	35.500000000000014	0.0970208852905795	0.156000428408735	0.621927043920523	-0.0589795431181551	0.0378032111060877	0.0752951343683804	NA	NA	0.0675442091645022	0.382554561565167	194	0	806	0.806	0.194	0.388
N	all	ss13	35	GGA	CTG	GAG	2	AGTGGGGCG:GCTGGAGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666664	4	35.33333333333334	0.0818063224852469	0.122722067836352	0.666598305647316	-0.0409157453511046	0.0343437841561257	0.0656929007985804	NaN	NaN	0.064800536090328	0.527772087166866	252	0	748	0.748	0.252	0.504
N	all	ss13	36	GCG	GAG	CGC	2	GGAGCGCGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.24999999999997	4	35.000000000000014	0.0808863909048056	0.123992985319038	0.652346507317995	-0.043106594414232	0.0343898643187068	0.0647621360210314	NaN	NaN	0.0628907463842573	0.493078736163909	253	0	747	0.747	0.253	0.506
N	all	ss13	37	CGA	CGC	GAT	2	GCGCGATCA:GCGCGGCCA	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333331	4	34.66666666666668	0.0805241909860523	0.125290563497375	0.642699567615399	-0.0447663725113222	0.0336471004961176	0.0667892758845009	NaN	NaN	0.0649038739687825	0.490361830150387	238	1	761	0.761	0.238	0.476
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.58333333333331	4	35.08333333333334	0.0805241909860523	0.123672788927057	0.651106776879967	-0.0431485979410044	0.0333461604628975	0.0632538728946089	NaN	NaN	0.0628287475025529	0.492230696779775	239	1	760	0.76	0.239	0.478
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAGCAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.24999999999999	3	35.41666666666668	0.0808863909048056	0.0898829861073045	0.899907695637097	-0.00899659520249893	0.0336447970991999	0.0529946849888848	NaN	NaN	0.0490028750197691	0.854332588959276	456	0	544	0.544	0.456	0.912
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAA	2	AAACAACGT:AAGCAAAGA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.24999999999999	3	35.500000000000014	0.0819928280328052	0.089658862987337	0.91449774512962	-0.0076660349545318	0.0338730150425187	0.0544121201245754	NA	NA	0.0510787781348611	0.880699461158425	444	1	555	0.555	0.444	0.888
N	all	ss13	41	AGA	AAA	GAA	2	CAAAGAAGA:CAACGTCGG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.24999999999999	3	36.000000000000014	0.0831299860668389	0.0883372767422875	0.941052171093748	-0.0052072906754486	0.0329885902405981	0.0505927584030023	NaN	NaN	0.0512274796171961	0.919034221512149	464	1	535	0.535	0.464	0.928
N	all	ss13	42	AGA	GAA	GAC	2	AGAAGACCG:CGTCGGCCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.583333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.91666666666664	3	36.250000000000014	0.0689348268033826	0.0876910035441767	0.786110593074178	-0.0187561767407941	0.031505509235961	0.0522448228763718	NA	NA	0.0465966863798566	0.687300132195258	348	3	649	0.649	0.348	0.696
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	AGACCGCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333331	3	36.66666666666668	0.069253316318584	0.0866346653413832	0.799371891675138	-0.0173813490227992	0.0318237179083814	0.052628421685048	NA	NA	0.0462693947413909	0.707173082318978	370	2	628	0.628	0.37	0.74
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT:CCGCAAGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333331	3	36.500000000000014	0.069253316318584	0.0870541284395655	0.795520184509812	-0.0178008121209815	0.0322718832247846	0.0528715325068135	NA	NA	0.0448286039792473	0.691304025667886	351	2	647	0.647	0.351	0.702
N	all	ss13	45	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCCT:CAAGGTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666664	3	35.500000000000014	0.0694136680239339	0.089658862987337	0.774197504977701	-0.0202451949634032	0.0320893752673216	0.0536174083881164	NA	NA	0.0488160894819372	0.67834409496405	318	3	679	0.679	0.318	0.636
N	all	ss13	46	CCT	GCC	CTC	2	GGCCCTCCT:GGTTTACCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.5833333333333	4	35.500000000000014	0.069253316318584	0.122096350832699	0.567202179641529	-0.0528430345141155	0.0322771093408462	0.0667025496812749	NaN	NaN	0.0620491449268831	0.394418398775205	180	1	819	0.819	0.18	0.36
N	all	ss13	47	CCC	CTC	CCA	2	CCTCCTAAC:TTACCCAAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.91666666666664	3	35.000000000000014	0.054631651955928	0.0910206427532005	0.600211669610595	-0.0363889907972725	0.0282031473379409	0.0558034525943721	NaN	NaN	0.0567092308892016	0.521083136094617	259	3	738	0.738	0.259	0.518
N	all	ss13	48	AAC	CCA	ACA	2	CCCAATAAT:CCTAACAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333331	3	34.83333333333334	0.0545075207127159	0.0914838201648646	0.595815966304063	-0.0369762994521487	0.026915845015793	0.0567058943749223	NA	NA	0.0568532659725269	0.515445971366054	249	6	745	0.745	0.249	0.498
N	all	ss13	49	AAC	ACA	ACA	2	AACAACACA:AATAATACT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666664	3	34.83333333333334	0.0550074627952336	0.0914838201648646	0.60128078053697	-0.036476357369631	0.0272593513849764	0.0577805429120908	NA	NA	0.0586907419343581	0.534270007974872	262	1	737	0.737	0.262	0.524
N	all	ss13	50	ACA	ACA	CAG	2	AACACAGCA:AATACTGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.24999999999999	3	35.00000000000001	0.0551338852123344	0.0910206427532006	0.60572946470866	-0.0358867575408662	0.0285318120853328	0.0580844484438161	NA	NA	0.0556805601355015	0.519243846956863	270	3	727	0.727	0.27	0.54
N	all	ss13	51	GCA	CAG	CAT	2	ACAGCATCC:ACTGCGTCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	3	34.50000000000001	0.0547563501152288	0.0924244803179611	0.592444230433913	-0.0376681302027323	0.0273870753345904	0.0552910215594699	NA	NA	0.0568828933261933	0.507839919777874	218	2	780	0.78	0.218	0.436
N	all	ss13	52	TCC	CAT	CCT	2	GCATCCTGG:GCGTCTTGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333333	3	35.08333333333334	0.054693929928504303	0.0907908105289243	0.602417024474958	-0.03609688060042	0.0279870687043212	0.0536951056766479	NA	NA	0.0594755566791225	0.543904275310653	253	1	746	0.746	0.253	0.506
N	all	ss13	53	TGG	CCT	GGT	2	TCCTGGTTC:TCTTGGTTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.16666666666666	3	34.75000000000001	0.0551973146854054	0.0917171833187057	0.601820865928707	-0.0365198686333002	0.0288153143560104	0.0564322040489425	NA	NA	0.0563413817233807	0.516862661063134	264	1	735	0.735	0.264	0.528
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333333	3	33.75000000000001	0.0554524994575896	0.094613463995175	0.586095224886994	-0.0391609645375854	0.0272453542344829	0.0560982323214142	NA	NA	0.057554801306945	0.496243767099013	231	0	769	0.769	0.231	0.462
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.08333333333333	3	33.16666666666667	0.0687766788210944	0.0963891381007337	0.713531422484738	-0.0276124592796394	0.0304694133082642	0.0587697731592175	NA	NA	0.0591649572879601	0.640712428828396	336	1	663	0.663	0.336	0.672
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.58333333333333	3	32.66666666666667	0.0683065619163606	0.0979651368127982	0.697253779647017	-0.0296585748964375	0.0306538464896716	0.0617688307538629	NA	NA	0.0603809108290498	0.623291189025084	295	2	703	0.703	0.295	0.59
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666667	3	33.00000000000001	0.0679967073757475	0.0969087986100047	0.701656695274805	-0.0289120912342571	0.0295419485358443	0.0600215348431747	NaN	NaN	0.063494499784	0.648858924503019	342	1	657	0.657	0.342	0.684
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.91666666666667	3	33.00000000000001	0.0679967073757475	0.0969087986100047	0.701656695274805	-0.0289120912342571	0.0308526955101402	0.0607230173746076	NaN	NaN	0.0621827489190598	0.641964705007621	309	3	688	0.688	0.309	0.618
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.25	3	32.75000000000001	0.0819928280328052	0.0976988961284261	0.839240065978073	-0.0157060680956209	0.0349399566888551	0.0582028576793037	NaN	NaN	0.0651770540756451	0.809574165858844	406	0	594	0.594	0.406	0.812
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666666	3	32.41666666666667	0.0812518671161106	0.0987726497511971	0.822615038887583	-0.0175207826350865	0.0326451773792596	0.0635832972678216	NaN	NaN	0.0637137992612988	0.783322414096028	400	3	597	0.597	0.4	0.8
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG:CATGGTAAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.58333333333333	3	33.08333333333334	0.082747441258963	0.0966482688635724	0.856170961279899	-0.0139008276046095	0.0333983446495748	0.0607576260648904	NaN	NaN	0.0677662484687116	0.837471283843415	450	1	549	0.549	0.45	0.9
N	all	ss13	62	AAA	GCA	AAG	2	GGCAAGGAA:GGTAAAGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666666	3	33.91666666666667	0.0829382721030275	0.0941180977157371	0.881214921635201	-0.0111798256127096	0.0355386089263372	0.0631221005306582	NaN	NaN	0.0626803058430268	0.858438177910673	446	0	554	0.554	0.446	0.892
N	all	ss13	63	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGT:AAGGAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.91666666666666	3	33.75000000000001	0.0835160880143217	0.094613463995175	0.882708279432415	-0.0110973759808533	0.0333788333082899	0.0585805257421173	NaN	NaN	0.0630004220789376	0.86017795080417	429	0	571	0.571	0.429	0.858
N	all	ss13	64	GAC	AAG	ACC	2	GAAGACCTT:GAAGGTCTC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.74999999999999	3	34.25000000000001	0.0848961862428277	0.0931427851735378	0.911462826505074	-0.00824659893071013	0.0351661982131932	0.0580258056760352	NaN	NaN	0.0624005192898524	0.894860954626176	418	0	582	0.582	0.418	0.836
N	all	ss13	65	CTC	ACC	TCT	2	GACCTTAAA:GGTCTCTCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.91666666666666	3	34.41666666666667	0.0719113287774619	0.0926626795339059	0.776054924584272	-0.020751350756444	0.0306259815273746	0.0572406376912274	NaN	NaN	0.0571110675862319	0.716342867209405	397	1	602	0.602	0.397	0.794
N	all	ss13	66	AAA	TCT	AAT	2	CTCTCCTTT:CTTAAATTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.08333333333333	3	33.25	0.071739235186476	0.0961313950679982	0.746262291686618	-0.0243921598815223	0.0327267021621736	0.0593329228171351	NaN	NaN	0.0619566886925633	0.693804787346185	351	0	649	0.649	0.351	0.702
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:TCCTTTCCG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333333	2	33.166666666666664	0.0570345959917882	0.0628640039123036	0.907269541268044	-0.00582940792051536	0.0286737235829977	0.0470858301914205	NA	NA	0.0594697531106135	0.921913972389684	452	1	547	0.547	0.452	0.904
N	all	ss13	68	CCG	TCC	CGC	2	TTCCCTCGA:TTTCCGCGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333333	2	33.5	0.0578600049104132	0.0622118122355632	0.930048536302528	-0.00435180732514993	0.0294401197337659	0.0491712647676055	NA	NA	0.0597803609945152	0.94196797262046	489	2	509	0.509	0.489	0.978
N	all	ss13	69	CGA	CGC	GAG	2	CCGCGAGGA:CCTCGAGGA	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333333	2	33.5	0.0578600049104132	0.0622118122355632	0.930048536302528	-0.00435180732514993	0.02934299444256	0.0491313415883302	NA	NA	0.0563073856896934	0.938395537528961	467	1	532	0.532	0.467	0.934
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGACAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333333	2	33.666666666666664	0.0570345959917882	0.0618907677660026	0.921536410849278	-0.00485617177421436	0.0278041090643705	0.0474329648622444	NA	NA	0.0567354441018865	0.931789754352631	469	3	528	0.528	0.469	0.938
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGACAGGGA	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333333	2	33.666666666666664	0.0570345959917882	0.0618907677660026	0.921536410849278	-0.00485617177421436	0.029013908873058	0.0493547900246565	NA	NA	0.055545653844776	0.930332367715064	480	0	520	0.52	0.48	0.96
N	all	ss13	72	GGA	AAG	GAG	2	CAAGGCGTT:CAGGGAGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.33333333333333	2	34.5	0.0735883919688925	0.0603340239140544	1.2196831438546	0.0132543680548381	0.0343383267796027	0.0454823099281679	NaN	NaN	0.0582015214146676	0.819854337399236	610	1	389	0.389	0.61	0.778
N	all	ss13	73	GTG	GAG	TGC	2	GGAGTGCCC:GGCGTTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.75	2	34.25	0.0886640029508962	0.0607927570603562	1.45846326500489	0.02787124589054	0.03689006194298	0.0442791979594622	NaN	NaN	0.0599663973586652	0.642088250531016	690	1	309	0.309	0.69	0.618
N	all	ss13	74	CCA	TGC	CAA	2	GTGCCCGTT:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.75	2	34.25	0.0886640029508962	0.0607927570603562	1.45846326500489	0.02787124589054	0.0368629000280694	0.0446507859700705	NA	NA	0.0627493531258675	0.656921227311691	681	0	319	0.319	0.681	0.638
N	all	ss13	75	ATT	CAA	TTA	2	CCAATTAAC:CCCGTTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.16666666666666	2	34.833333333333336	0.0894358561096487	0.0597330472949441	1.49725922516628	0.0297028088147046	0.0374320985624149	0.0456644864032475	NaN	NaN	0.058878320705055	0.613925621473243	710	2	288	0.288	0.71	0.576
N	all	ss13	76	AAC	TTA	ACA	2	ATTAACACC:GTTAATACC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.16666666666666	1	33.833333333333336	0.0881207952860292	0.0301548153585304	2.92227938517624	0.0579659799274989	0.0357802024221934	0.0323291734614945	NaN	NaN	0.0514326220821846	0.259730850515082	869	0	131	0.131	0.869	0.262
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT:AATACCAAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.5	1	34.83333333333333	0.0903346148069003	0.0292720079293014	3.08604093798687	0.0610626068775989	0.0370682574934798	0.0319315868556957	NaN	NaN	0.0497381016731245	0.219566103782728	886	0	114	0.114	0.886	0.228
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71	1	35	0.089658862987337	0.0291298749871979	3.07790071281599	0.0605289880001391	0.0360262528155111	0.0298175770593083	NaN	NaN	0.0503864800083881	0.229637085588584	889	0	111	0.111	0.889	0.222
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71	1	35	0.089658862987337	0.0291298749871979	3.07790071281599	0.0605289880001391	0.0378948737319203	0.0305627573307267	NaN	NaN	0.0497707363406145	0.223925437271107	894	1	105	0.105	0.894	0.21
N	all	ss13	80	ACC	GCA	CCA	2	AGCAGTCCA:AGTACCAGG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333333	1	34.666666666666664	0.089213957146024	0.029415534864961	3.03288577126277	0.0597984222810631	0.0366591016670998	0.0311626205366811	NA	NA	0.0505421658599278	0.236753948295257	877	1	122	0.122	0.877	0.244
N	all	ss13	81	AGG	CCA	CAG	2	ACCAGGGAC:AGTCCAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	1	1	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.5	1	34.166666666666664	0.073408181482178	0.0298546878003148	2.45884940995444	0.043553493681863203	0.0324304434753967	0.0338301947832139	NA	NA	0.0478331860291636	0.362543698135074	813	1	186	0.186	0.813	0.372
N	all	ss13	82	GAC	CAG	ACG	2	AGGGACGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.16666666666667	1	34.33333333333333	0.058423686245627	0.0297068535712844	1.96667365345286	0.0287168326743426	0.0303507635568988	0.0301623127700843	NA	NA	0.0437895585908276	0.511958104564722	739	5	256	0.256	0.739	0.512
N	all	ss13	83	GAC	ACG	ACC	2	GACGACCAA:GATGACCAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.33333333333334	1	34.666666666666664	0.0591439311842398	0.029415534864961	2.01063592607628	0.0297283963192788	0.0294348510475665	0.0308862272137185	NA	NA	0.0442880458401869	0.502060626061221	784	5	211	0.211	0.784	0.422
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.5	1	34.83333333333333	0.0589984642956841	0.0292720079293014	2.01552501755872	0.0297264563663827	0.029495190065978	0.0308087820223331	NA	NA	0.0456911316375624	0.515307470182006	769	6	225	0.225	0.769	0.45
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.66666666666666	1	35	0.0597330472949441	0.0291298749871979	2.05057685009619	0.0306031723077461	0.0315811998802809	0.0283758471310027	NA	NA	0.0445008233229582	0.491642341244243	761	6	233	0.233	0.761	0.466
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69	1	35.166666666666664	0.0603340239140544	0.0289891158257093	2.08126471592992	0.0313449080883451	0.0305591467993932	0.0310563980012568	NA	NA	0.0434766621684266	0.470934497207798	768	5	227	0.227	0.768	0.454
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC:GGCTACTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.5	1	35.666666666666664	0.0607927570603562	0.0285748846742028	2.12748914837229	0.0322178723861534	0.0301980069546815	0.030154576787135	NA	NA	0.043836300735931	0.462364622244677	778	3	219	0.219	0.778	0.438
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA:TACTATCGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.25	1	35.583333333333336	0.060107245116144	0.0286430990492925	2.09848958776089	0.0314641460668516	0.0291189647368348	0.0318579394718456	NA	NA	0.0428807383094571	0.463095371138573	782	5	213	0.213	0.782	0.426
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA:TATCGCAGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75	1	35.083333333333336	0.05965876642654	0.0290593249318817	2.0529990482018	0.0305994414946583	0.0311490226437917	0.0309102406087336	NA	NA	0.0441513586567178	0.488273307728084	759	3	238	0.238	0.759	0.476
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT:CGCAGAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25	1	34.833333333333336	0.0592169340983304	0.0292720079293014	2.02298845509173	0.029944926169029	0.028960107148053	0.0327995279518797	NA	NA	0.0448732602218537	0.50456630008671	797	3	200	0.2	0.797	0.4
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.58333333333333	1	35	0.0607158174610799	0.0291298749871979	2.08431438472577	0.031585942473882	0.0322716315523438	0.0306919719005335	NA	NA	0.0445962435910634	0.47878093044159	777	5	218	0.218	0.777	0.436
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.91666666666667	1	34.333333333333336	0.0604099978044257	0.0297068535712844	2.03353740104001	0.0307031442331413	0.0294170913316385	0.0312207041240992	NA	NA	0.041756996070792	0.462168108738437	769	2	229	0.229	0.769	0.458
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.08333333333334	1	34.166666666666664	0.0602582409815693	0.0298546878003148	2.01838456273972	0.0304035531812545	0.0312304944101145	0.0303376188475787	NA	NA	0.0468450528631015	0.516323007185028	755	6	239	0.239	0.755	0.478
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.91666666666669	1	34.5	0.0604099978044257	0.0295604764056575	2.04360704392653	0.0308495213987682	0.0308152798144568	0.0302155235182968	NA	NA	0.0452194503849791	0.49510113690296	763	2	235	0.235	0.763	0.47
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333336	1	35.25	0.0600320307551523	0.0289192452027623	2.07585053946768	0.03111278555239	0.0293874937502315	0.0313686706619729	NA	NA	0.0443650101282534	0.483121383713602	787	6	207	0.207	0.787	0.414
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333336	0	35.25	0.059584670169267	0	-Inf	0.059584670169267	0.0296262148586761	0	NA	NA	0.0296934697716793	0.0447859779476612	979	21	0	0	0.979	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.16666666666669	0	35.583333333333336	0.0592901175479514	0	-Inf	0.0592901175479514	0.0295335561810796	0	NA	NA	0.0281182989957089	0.0349795152776879	990	10	0	0	0.99	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC:GGTGGTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.33333333333336	0	35.916666666666664	0.0591439311842398	0	-Inf	0.0591439311842398	0.0297266007264135	0	NA	NA	0.0283225456326488	0.0367772779050161	988	12	0	0	0.988	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT:GGTGATGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.00000000000003	0	35.25	0.0585663277285774	0	-Inf	0.0585663277285774	0.0301080188741791	0	NA	NA	0.0291036132896669	0.0441842441240227	982	18	0	0	0.982	0.001
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA:GATGGTAAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.33333333333336	0	35.25	0.0591439311842398	0	-Inf	0.0591439311842398	0.0292971340653914	0	NA	NA	0.0308806406726129	0.0554615197961865	982	18	0	0	0.982	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG:GGTAAGATG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333336	0	35.75	0.059584670169267	0	-Inf	0.059584670169267	0.0283793893860046	0	NA	NA	0.0303879806404717	0.0499026740093536	980	20	0	0	0.98	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA:AAGATGAAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333336	0	35.5	0.0593634822039754	0	-Inf	0.0593634822039754	0.0290900066068925	0	NA	NA	0.0296628777157562	0.0453631014851487	985	15	0	0	0.985	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAA:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.58333333333336	0	36	0.0589259989959384	0	-Inf	0.0589259989959384	0.0297010395664312	0	NA	NA	0.0294061396103613	0.0450842866566645	988	12	0	0	0.988	0.001
N	all	ss13	104	GAA	AAG	AAC	2	AAAGAACTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	1	37.166666666666664	0.0749687265834466	0.027400307499342	2.73605420615251	0.0475684190841046	0.0336581803155457	0.0280089348377194	NA	NA	0.0327396085654929	0.146242684871824	947	10	43	0.043	0.947	0.086
N	all	ss13	105	CTC	AAC	TCA	2	GAACTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.50000000000003	1	37.75	0.0598821656332629	0.0269691977905829	2.22039105865331	0.032912967842679997	0.0307045706932283	0.028382030688292	NA	NA	0.0299273804467298	0.27143623986667	881	18	101	0.101	0.881	0.202
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCG:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	1	38.25	0.0597330472949441	0.0266103300115572	2.24473154857536	0.0331227172833869	0.030507184419154	0.0263458640698047	NA	NA	0.02815584979893	0.239432580997605	909	9	82	0.082	0.909	0.164
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCGCGC:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	1	37.583333333333336	0.0597330472949441	0.0270909813104957	2.20490526387104	0.0326420659844483	0.0309847208112431	0.0274177469487935	NA	NA	0.0292937038072027	0.265149162577237	897	13	90	0.09	0.897	0.18
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCGCGCTGG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	1	37.583333333333336	0.0597330472949441	0.0270909813104957	2.20490526387104	0.0326420659844483	0.0322099823719907	0.0265717492761549	NA	NA	0.0298132315318962	0.273566933500595	885	7	108	0.108	0.885	0.216
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT:CGCTGGTAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	37.666666666666664	0.0441303750172001	0.0270299523623977	1.63264716213823	0.0171004226548024	0.025087533894523	0.0275011393116057	NA	NA	0.0249517553039711	0.493129733099519	754	50	196	0.196	0.754	0.392
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000004	1	37.666666666666664	0.0447894260262166	0.0270299523623977	1.65702941040047	0.0177594736638189	0.026504036447768	0.0265897817665617	NA	NA	0.0240555057023039	0.460350002253989	748	44	208	0.208	0.748	0.416
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAC:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666671	2	37.166666666666664	0.0445124432883257	0.0558397336460622	0.797146411379143	-0.0113272903577366	0.0257735354636143	0.0389816375491181	NA	NA	0.0395304684358962	0.774460107300674	408	10	582	0.582	0.408	0.816
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTACTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000004	2	36.333333333333336	0.0446228241484838	0.0571705240409132	0.780521516936772	-0.0125476998924294	0.0269858224804945	0.04228415929622	NA	NA	0.0410647394822921	0.759940457044685	386	15	599	0.599	0.386	0.772
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TACTATCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000004	3	35.5	0.0439686325106426	0.089658862987337	0.490399175783129	-0.0456902304766944	0.0258848711259958	0.0568446870720656	NA	NA	0.0561100254189657	0.415474775792164	175	4	821	0.821	0.175	0.35
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA:TATCTAGGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	0	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	3	35.166666666666664	0.0437548116643347	0.09056213746611	0.483146852410684	-0.0468073258017752	0.0264591445063783	0.0585078098108259	NA	NA	0.0508108674635275	0.356942374408496	175	6	819	0.819	0.175	0.35
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.58333333333339	3	35.166666666666664	0.0425143321315747	0.09056213746611	0.469449301011522	-0.0480478053345353	0.0257703866470753	0.0550179398699857	NA	NA	0.0574742932833134	0.403161792523062	178	6	816	0.816	0.178	0.356
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGA:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666671	3	35.583333333333336	0.0421656696333547	0.0894358561096487	0.47146269368361	-0.0472701864762939	0.0254411357719284	0.0559242125035015	NA	NA	0.0568635596078824	0.405809047600242	194	8	798	0.798	0.194	0.388
N	all	ss13	117	GGA	CTG	GAC	2	ACTGGACCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000006	3	35.75	0.0422647024133488	0.088993157850987	0.474920807778483	-0.0467284554376382	0.0264449278006195	0.0544612109634492	NA	NA	0.0556085521064646	0.400734263173244	180	3	817	0.817	0.18	0.36
N	all	ss13	118	CCA	GAC	CAG	2	GGACCAGAG:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333339	3	35.416666666666664	0.0420670999882826	0.0898829861073045	0.468020721274901	-0.0478158861190219	0.0240931040489703	0.0583218758149343	NA	NA	0.0558364687023304	0.391800982476584	164	6	830	0.83	0.164	0.328
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT:CCAGAGGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000006	3	35.083333333333336	0.0416773883661081	0.0907908105289243	0.459048532811924	-0.0491134221628163	0.0247138889526964	0.0578115345142855	NA	NA	0.0565586856111219	0.385196105456909	157	2	841	0.841	0.157	0.314
N	all	ss13	120	GCC	AAG	CCG	2	GAAGCTGGA:GAGGCCGCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000006	3	34.916666666666664	0.0419689902360334	0.091251642986027	0.459925858457803	-0.0492826527499936	0.0238636503664481	0.0573553565730969	NA	NA	0.0595062149159529	0.407560997191687	185	11	804	0.804	0.185	0.37
N	all	ss13	121	GCA	CCG	CAT	2	GCCGCATTA:GCTGGACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	3	34.916666666666664	0.041581086362894	0.091251642986027	0.455674933647619	-0.0496705566231329	0.0237580780598755	0.0589164098271997	NA	NA	0.0584977521281722	0.395824553836343	179	3	818	0.818	0.179	0.358
N	all	ss13	122	CTT	CAT	TAC	2	GCATTACCT:GGACTTCCC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333339	3	34.25	0.0272138698048233	0.0931427851735378	0.292173674580592	-0.0659289153687146	0.0193761413398509	0.060117607389263	NA	NA	0.0572298908620254	0.249320491041163	72	17	911	0.911	0.072	0.144
N	all	ss13	123	CCC	TAC	CCT	2	CTTCCCTAT:TTACCTTAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000006	3	35.08333333333333	0.0135443861537981	0.0907908105289244	0.149182346482996	-0.0772464243751264	0.0134605681267168	0.0581204364671763	NA	NA	0.0521767020634786	0.138745907249762	0	45	955	0.955	0	0.001
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT:CCTTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666673	3	35.416666666666664	0.0136058153029875	0.0898829861073045	0.151372533248334	-0.076277170804317	0.0133035298554347	0.0592237540380061	NA	NA	0.0503509319865719	0.129794994218358	0	52	948	0.948	0	0.001
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.00000000000007	3	35.583333333333336	0.0136367393123929	0.0894358561096487	0.152475079968756	-0.0757991167972558	0.0141249887565229	0.0583957034159309	NA	NA	0.0501663992327418	0.130800195518861	0	45	955	0.955	0	0.001
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666673	3	36.333333333333336	0.0136522540928075	0.0874776777943207	0.156065575093419	-0.0738254237015132	0.0136142795184105	0.0541494909318757	NA	NA	0.0484704246135625	0.127733069707551	0	41	959	0.959	0	0.001
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.8333333333334	3	35.41666666666667	0.0134835092215562	0.0898829861073045	0.150011807634643	-0.0763994768857483	0.0131570702439363	0.0564843685314585	NA	NA	0.0507769472991187	0.132424504452294	0	43	957	0.957	0	0.001
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC:AACAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	3	35.083333333333336	0.013423177093157	0.0907908105289243	0.147847309820861	-0.0773676334357673	0.0140321788676995	0.0555811812864813	NA	NA	0.0506369758230711	0.126540320059109	0	39	961	0.961	0	0.001
N	all	ss13	129	GAC	AAG	ACG	2	AAAGACGGC:AAAGATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.83333333333339	3	34.833333333333336	0.0272138698048233	0.0914838201648646	0.297471943735851	-0.0642699503600413	0.0200773828261674	0.0551450321491508	NA	NA	0.055311031739912	0.245246249770513	67	19	914	0.914	0.067	0.134
N	all	ss13	130	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATC:GATGGCATA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.83333333333339	3	35.16666666666667	0.0275893176123833	0.0905621374661099	0.30464516832664	-0.0629728198537265	0.0193582332148478	0.0570554802471987	NA	NA	0.0526697258878357	0.231846052866319	67	16	917	0.917	0.067	0.134
N	all	ss13	131	ATA	GCA	TAG	2	GGCATAGTT:GGCATCATA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333339	3	35.66666666666667	0.0277809537602618	0.089213957146024	0.311396945601128	-0.0614330033857622	0.0200880132761002	0.0586752583858504	NA	NA	0.0532514248932281	0.248647564256886	76	16	908	0.908	0.076	0.152
N	all	ss13	132	ATA	TAG	TAT	2	ATAGTTTGG:ATCATATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000006	3	35.66666666666667	0.0275260251378209	0.089213957146024	0.308539448516635	-0.0616879320082031	0.0199912322433163	0.0549300393724006	NA	NA	0.0519250138709347	0.234825704539723	73	12	915	0.915	0.073	0.146
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTTTGGGTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000006	3	35.66666666666667	0.0273378783823658	0.089213957146024	0.30643050994386	-0.0618760787636582	0.0188128757010486	0.0551666272616134	NA	NA	0.0516512893459454	0.230933341944986	79	20	901	0.901	0.079	0.158
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCT:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.8333333333334	3	35.333333333333336	0.0275893176123832	0.0901082338815474	0.306179762092008	-0.0625189162691642	0.0198536954755729	0.0545275365271173	NA	NA	0.0533616708181248	0.24135480706881	81	18	901	0.901	0.081	0.162
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCTACA:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000007	3	35.16666666666667	0.0275260251378209	0.0905621374661099	0.303946283822218	-0.0630361123282889	0.0204795465142006	0.0596041826592091	NA	NA	0.0507594422155798	0.21428828300158	67	13	920	0.92	0.067	0.134
N	all	ss13	136	ACA	CAA	CAG	2	GCAACTGAG:GCTACAGAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.8333333333334	3	35.333333333333336	0.0275893176123832	0.0901082338815474	0.306179762092008	-0.0625189162691642	0.0196897989728594	0.057300938641159	NA	NA	0.0534735611289317	0.242340924876315	73	19	908	0.908	0.073	0.146
N	all	ss13	137	GAA	CAG	AAG	2	ACAGAAGGA:ACTGAGGGA	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666673	3	35.5	0.0276529018562458	0.089658862987337	0.308423517038704	-0.0620059611310913	0.0199296586120684	0.0557925548119	NA	NA	0.0527771731019011	0.240049430304742	82	19	899	0.899	0.082	0.164
N	all	ss13	138	GGA	AAG	GAG	2	GAAGGAGCC:GAGGGAGCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.75000000000006	3	35.75000000000001	0.0280079218999906	0.088993157850987	0.314719946750153	-0.0609852359509964	0.0209922362207709	0.0545298981249255	NA	NA	0.0522151477745343	0.242822653151326	89	12	899	0.899	0.089	0.178
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCC	2	GGAGCCCTA:GGAGCCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.58333333333339	4	36.25000000000001	0.0280734527889724	0.119357976360937	0.235203826714343	-0.0912845235719643	0.019171274341815	0.0643836470855272	NA	NA	0.0649446376435256	0.159850526317502	42	9	949	0.949	0.042	0.084
N	all	ss13	140	CTA	CCC	TAA	2	GCCCTAAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25000000000004	4	36.58333333333334	0.0282054389472648	0.11818004032857	0.238664996803576	-0.0899746013813056	0.0210073241171809	0.064316473700371	NA	NA	0.0597034251155934	0.131804046836335	38	0	962	0.962	0.038	0.076
N	all	ss13	141	AAC	TAA	ACA	2	CTAAACACG:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666671	4	36.25000000000001	0.0275576350296145	0.119357976360937	0.230882223960304	-0.0918003413313223	0.0200610829522974	0.0637921800979381	NA	NA	0.063959701414722	0.151206161873473	34	2	964	0.964	0.034	0.068
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACGCCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666671	4	37.25000000000001	0.0275576350296145	0.115892704074692	0.237785762698692	-0.0883350690450776	0.0202373412041974	0.0624448546651849	NA	NA	0.0582085943911109	0.129125207368905	30	7	963	0.963	0.03	0.06
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACGCCTAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.75000000000004	4	37.41666666666667	0.0276210731371878	0.115334665090852	0.239486308088118	-0.0877135919536647	0.0198335237714094	0.0631811607449231	NA	NA	0.0596792898021774	0.14162967626867	32	5	963	0.963	0.032	0.064
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666671	5	37.58333333333334	0.0417257068817799	0.146448957671432	0.284916380049589	-0.104723250789652	0.0242252355409073	0.0699319724870748	NA	NA	0.065612804003717	0.110471047063291	22	0	978	0.978	0.022	0.044
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	5	37.83333333333334	0.0563645417845084	0.145381050470112	0.387702122128331	-0.0890165086856035	0.0280973204578638	0.0685972501794803	NA	NA	0.0651229910013631	0.171657170522825	62	1	937	0.937	0.062	0.124
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000004	5	38.33333333333334	0.0573071018565008	0.143291427572032	0.399933916686627	-0.085984325715531	0.0285049070746878	0.070450055504094	NaN	NaN	0.0657489324004773	0.190952135488023	53	1	946	0.946	0.053	0.106
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666671	5	38.16666666666667	0.0575822255219405	0.143981241370948	0.39992866413471	-0.0863990158490075	0.0287916863038057	0.0749543644284437	NaN	NaN	0.0710104969722412	0.223715462291402	67	0	933	0.933	0.067	0.134
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC:ATTGGCACG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333337	5	37.16666666666668	0.0566306643811088	0.148264213964023	0.381957741973059	-0.0916335495829144	0.029569643729567	0.0737090134138094	NaN	NaN	0.0691559639649274	0.185162051842772	54	0	946	0.946	0.054	0.108
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC:GGCACGCGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.00000000000004	5	37.50000000000001	0.0577207808520962	0.146808432844571	0.393170744579817	-0.0890876519924752	0.0302716048902397	0.074142174375824	NA	NA	0.0697271129277561	0.201368783966239	75	0	925	0.925	0.075	0.15
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT:ACGCGCAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.66666666666671	5	36.83333333333334	0.0571705240409132	0.149749252688945	0.38177502067183	-0.092578728648032	0.0296445692559188	0.0751873709832637	NaN	NaN	0.0680725083419582	0.173829378586927	56	1	943	0.943	0.056	0.112
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCC:CGCAATCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333339	5	36.66666666666668	0.0570345959917882	0.150503021596613	0.378959806831358	-0.0934684256048251	0.0276868310103781	0.0740461131578047	NaN	NaN	0.070971806410364	0.18784544195926	58	0	942	0.942	0.058	0.116
N	all	ss13	152	CCC	ATC	CCA	2	AATCCCAAC:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333339	6	36.33333333333334	0.0570345959917882	0.18652246930412	0.305778688243692	-0.129487873312332	0.0296954870597731	0.0830786868781707	0.264344057801946	0.247376525961114	0.0837796394391501	0.1222067896632	27	0	973	0.973	0.027	0.054
N	all	ss13	153	AAC	CCA	ACA	2	CCCAACAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333339	6	36.50000000000001	0.0566306643811088	0.185556129985381	0.30519425246458	-0.128925465604272	0.0291867609907964	0.0817868770125104	NaN	NaN	0.084320841413214	0.126267680661763	28	1	971	0.971	0.028	0.056
N	all	ss13	154	AAC	ACA	ACA	2	AACAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	5	36.33333333333334	0.0417741375922484	0.152033634372753	0.274769052023235	-0.110259496780504	0.0243415195842443	0.0756723789575872	NaN	NaN	0.0786751654177073	0.161078842092717	41	2	957	0.957	0.041	0.082
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	5	35.91666666666667	0.0417741375922484	0.153991399978411	0.271275782921026	-0.112217262386163	0.0237611646166255	0.0751995717270562	NaN	NaN	0.0769141024281782	0.144566585804871	29	0	971	0.971	0.029	0.058
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000004	5	35.58333333333334	0.0419689902360334	0.155594424961324	0.269733251988081	-0.113625434725291	0.0241597247828647	0.0788750308911386	NaN	NaN	0.07955533284138	0.153217994735833	40	0	960	0.96	0.04	0.08
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.1666666666667	5	35.91666666666667	0.0567646707244322	0.153991399978411	0.368622343406127	-0.0972267292539793	0.0291631493231073	0.076765989252013	NA	NA	0.080498456904056	0.227120889293909	87	0	913	0.913	0.087	0.174
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATTGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000003	5	35.58333333333334	0.0564972895530331	0.155594424961324	0.363106130358312	-0.0990971354082909	0.0300224462572794	0.0777664409094501	NaN	NaN	0.0766520601134945	0.196074138123585	66	0	934	0.934	0.066	0.132
N	all	ss13	159	GTC	TCG	TCA	2	ATCGTGCTA:ATTGTCATA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333336	5	35.75000000000001	0.0570345959917882	0.154788747544192	0.368467326576855	-0.097754151552404	0.0285681998910311	0.0771274272581136	NaN	NaN	0.0787099200080527	0.214253292887934	80	0	920	0.92	0.08	0.16
N	all	ss13	160	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACAG:GTGCTACAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.833333333333333	0.5	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333336	5	36.250000000000014	0.0574443341110379	0.152421181209951	0.376878945924922	-0.0949768470989133	0.0293928183502328	0.0771295475618043	NaN	NaN	0.0833532107402667	0.254515355887144	93	0	907	0.907	0.093	0.186
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	ATACAGTTA:CTACAACTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.58333333333336	4	36.16666666666668	0.0722580068136367	0.119656146346601	0.603880444255084	-0.0473981395329643	0.0325588308449543	0.0622940726702531	NaN	NaN	0.0673862061631471	0.481818691112445	219	1	780	0.78	0.219	0.438
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TAC	2	CAACTTCCT:CAGTTACCA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.25000000000003	4	36.83333333333334	0.0715679639391767	0.117311764843583	0.610066381957527	-0.045743800904406	0.0316494115019713	0.0637327354548969	NaN	NaN	0.0659772717082621	0.488104580924874	245	0	755	0.755	0.245	0.49
N	all	ss13	163	CCA	TAC	CAC	2	CTTCCTCAA:TTACCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.91666666666669	3	37.000000000000014	0.0719113287774619	0.0858077633833082	0.838051546178053	-0.0138964346058463	0.0334802926062881	0.0515596162714642	NaN	NaN	0.0568702613704587	0.806957226312769	408	1	591	0.591	0.408	0.816
N	all	ss13	164	CAA	CAC	AAG	2	CCACAAGGT:CCTCAAGGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.08333333333336	4	37.83333333333334	0.0727843418621031	0.113962844188242	0.638667298807313	-0.0411785023261388	0.0325776622720999	0.0584187153097028	NaN	NaN	0.062451307726685903	0.509658370872508	243	1	756	0.756	0.243	0.486
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA:CAAGGTACT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.91666666666669	4	37.33333333333334	0.0751566968036821	0.115613009870444	0.65007127561079	-0.0404563130667615	0.0354236763624209	0.0583963222738399	NaN	NaN	0.0623784932907214	0.51662159969182	262	1	737	0.737	0.262	0.524
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA:GGTACTACC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.83333333333336	4	37.41666666666668	0.0752510361297835	0.115334665090852	0.652458097229537	-0.040083628961069	0.0328384026144851	0.0615065875475822	NA	NA	0.0630181243754235	0.524733998084204	267	3	730	0.73	0.267	0.534
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG:ACTACCTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.91666666666669	4	37.33333333333334	0.0751566968036821	0.115613009870444	0.65007127561079	-0.0404563130667615	0.0338824112004363	0.059279291389398	NaN	NaN	0.062918611564322	0.520227752407421	281	0	719	0.719	0.281	0.562
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA:ACCTTGCCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.58333333333336	4	37.33333333333334	0.0744104199635986	0.115613009870444	0.643616320057606	-0.041202589906845	0.0338505265749699	0.0583134204637385	NaN	NaN	0.0619595696051621	0.506055901082232	245	0	755	0.755	0.245	0.49
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.91666666666669	4	37.66666666666668	0.0911359963120852	0.114507630156718	0.79589452848997	-0.0233716338446331	0.0365924983079015	0.0599727571136384	NaN	NaN	0.0675736292859695	0.729441052805577	375	0	625	0.625	0.375	0.75
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.41666666666669	4	38.16666666666668	0.0918343124831295	0.112888706112188	0.813494242655816	-0.0210543936290587	0.0393536169951437	0.0560195791813472	NaN	NaN	0.0643513382604305	0.743532654453753	347	0	653	0.653	0.347	0.694
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	68.25000000000003	4	38.66666666666668	0.0935061462707285	0.111315003838705	0.840013861978737	-0.0178088575679764	0.0383728882385855	0.0562245400304148	NaN	NaN	0.0620751333888629	0.77419503594318	408	0	592	0.592	0.408	0.816
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	68.25000000000003	4	38.66666666666668	0.0935061462707285	0.111315003838705	0.840013861978737	-0.0178088575679764	0.0390786529008466	0.0558687254517763	NaN	NaN	0.0660153416159932	0.787338382650335	401	0	599	0.599	0.401	0.802
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA:TTCTACGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	68.58333333333336	4	38.000000000000014	0.0930222923576628	0.113423227292943	0.820134416713523	-0.0204009349352798	0.0390487704087336	0.0582999454015739	NaN	NaN	0.0620785908213444	0.742434789641062	393	0	607	0.607	0.393	0.786
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.16666666666669	4	37.000000000000014	0.092187504132096	0.116739982283845	0.789682354995983	-0.0245524781517489	0.0377543832917262	0.0621333171235969	NaN	NaN	0.0649385218298775	0.705365196020433	377	0	623	0.623	0.377	0.754
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCTGAAGGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.83333333333334	4	35.83333333333334	0.0912516429860269	0.120863906464681	0.754994982829653	-0.0296122634786545	0.0383805019189879	0.0638936817346552	NaN	NaN	0.0692284855029138	0.668835469507701	342	0	658	0.658	0.342	0.684
N	all	ss13	176	GGA	AAG	GAA	2	GAAGGAAGT:GAAGGGAGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.08333333333334	5	35.66666666666667	0.0923058399364826	0.155190536855492	0.59479038997355	-0.0628846969190093	0.0384121657988439	0.0743240897276747	NaN	NaN	0.0816955775260128	0.441451645848316	208	1	791	0.791	0.208	0.416
N	all	ss13	177	AGC	GAA	GCA	2	GGAAGTCGT:GGGAGCAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.83333333333334	5	35.58333333333334	0.0912516429860269	0.155594424961324	0.586471160574739	-0.0643427819752971	0.0378909011255697	0.0742817432995308	NaN	NaN	0.0789364169320176	0.415002683329249	179	0	821	0.821	0.179	0.358
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGTCGTGGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.75	0.25	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	69.50000000000001	5	35.50000000000001	0.0917171833187057	0.156000428408735	0.587929047722861	-0.0642832450900289	0.0381143408976338	0.072725407988418	NaN	NaN	0.0765093531012578	0.400795623782646	219	0	781	0.781	0.219	0.438
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:CGTGGTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000003	5	35.083333333333336	0.0767933639165996	0.158062767299148	0.485840942992356	-0.0812694033825488	0.0336034614694652	0.0754181825435499	NaN	NaN	0.0790089602353587	0.303662996018603	145	0	855	0.855	0.145	0.29
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT:GGTGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333336	5	34.41666666666667	0.0764018799879129	0.161478827235442	0.473138685089138	-0.0850769472475288	0.0348918412299463	0.0761476424268558	NaN	NaN	0.079136794460219	0.282347046193641	135	2	863	0.863	0.135	0.27
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.50000000000003	5	34.41666666666667	0.075630775763093	0.161478827235442	0.46836341988551	-0.0858480514723487	0.0345964794099984	0.0750126460863135	NaN	NaN	0.0831380908130553	0.301793049010575	132	0	868	0.868	0.132	0.264
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666669	5	34.083333333333336	0.0760143706952156	0.163243053958072	0.465651486247857	-0.0872286832628568	0.0340829861927436	0.0775586804845236	NaN	NaN	0.0830850581897135	0.293776927510882	122	2	876	0.876	0.122	0.244
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCC:CAAGCCTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666669	5	34.083333333333336	0.0760143706952156	0.163243053958072	0.465651486247857	-0.0872286832628568	0.0348238862569269	0.078144094118976	NaN	NaN	0.0824102440943295	0.289841706368869	132	0	868	0.868	0.132	0.264
N	all	ss13	184	TCC	CCT	CCT	2	GCCTCCTCG:GCCTCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.83333333333336	5	34.083333333333336	0.0752510361297835	0.163243053958072	0.460975424713085	-0.0879920178282889	0.032392096354617	0.0776193381104243	NaN	NaN	0.0838007383440764	0.293711295586551	121	1	878	0.878	0.121	0.242
N	all	ss13	185	TCG	CCT	CGC	2	TCCTCGCGT:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000003	5	34.083333333333336	0.0745028923992239	0.163243053958072	0.456392419725003	-0.0887401615588485	0.0334298489637588	0.0753866924311235	NaN	NaN	0.0843320016644359	0.2926750053236	129	0	871	0.871	0.129	0.258
N	all	ss13	186	CGT	CGC	GTT	2	TCGCGTTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.66666666666669	6	33.41666666666667	0.0887734500607747	0.205237238024368	0.432540658387902	-0.116463787963593	0.0357234064441735	0.0939004860125523	0.406272983948657	0.287031975396068	0.0955342235824404	0.222814121324971	89	0	911	0.911	0.089	0.178
N	all	ss13	187	TCC	GTT	CCT	2	CGTTCCTCA:CGTTCTAAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.91666666666669	6	33.16666666666667	0.0884459172871288	0.207018740932176	0.427236282516594	-0.118572823645047	0.0359844404096651	0.0917251070285324	0.337719394249715	0.205848774233994	0.0917385487272406	0.196181218762845	75	1	924	0.924	0.075	0.15
N	all	ss13	188	AAC	CCT	ACT	2	TCCTCATCA:TCTAACTCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.41666666666669	6	32.66666666666667	0.0877980575084776	0.210676789099802	0.416742906912664	-0.122878731591324	0.0354581016875229	0.094652874429199	0.376472433639814	0.268307798294605	0.0940928651697078	0.191576232654015	69	0	931	0.931	0.069	0.138
N	all	ss13	189	TCA	ACT	CAC	2	AACTCACGT:TCATCACGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.50000000000003	5	32.91666666666667	0.0876910035441767	0.169734844556617	0.516635248191049	-0.0820438410124399	0.0357097547195418	0.0799581322434055	NaN	NaN	0.0831694373772566	0.323904380774323	126	1	873	0.873	0.126	0.252
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGC:TCACGTAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.83333333333337	6	32.583333333333336	0.102850364976667	0.211299152734159	0.48675237759266	-0.108448787757493	0.0401615627197323	0.102948443318328	0.437872779707731	0.266297406257446	0.0933179429047734	0.245177411070348	78	0	922	0.922	0.078	0.156
N	all	ss13	191	AGC	GTA	GCC	2	CGTAGCCGT:CGTAGTCGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.83333333333337	6	32.91666666666667	0.118766081588831	0.208831643632827	0.568716883719254	-0.0900655620439956	0.0432397199445134	0.0981632661547987	0.476763373246914	0.232920159649181	0.0873299300307698	0.302388320668141	124	0	876	0.876	0.124	0.248
N	all	ss13	192	CGC	GCC	GCA	2	AGCCGTGGT:AGTCGCAAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.00000000000003	6	32.75	0.118472334721436	0.210058104799921	0.563997922547572	-0.0915857700784855	0.0413310914808649	0.100665973987975	NaN	NaN	0.092407304821083	0.321632049147325	124	0	876	0.876	0.124	0.248
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGTGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.00000000000003	6	31.75	0.120256987556385	0.217732646143538	0.552314913203721	-0.0974756585871533	0.0413689883960147	0.10583930162605901	NaN	NaN	0.0997976128030618	0.328701170524901	120	0	880	0.88	0.12	0.24
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.83333333333337	5	31.25	0.102850364976667	0.179963002222943	0.57150838620292	-0.0771126372462764	0.0387425526343191	0.0852665050726181	NaN	NaN	0.0958413875254191	0.421058631967027	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCCAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.83333333333337	5	30.583333333333336	0.118766081588831	0.184409724221212	0.644033724850448	-0.065643642632381	0.0478022278392183	0.09739186915523	NaN	NaN	0.0924773942513847	0.477806787436706	233	0	767	0.767	0.233	0.466
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT:TCCAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.6666666666667	5	30.416666666666668	0.117311764843583	0.185556129985381	0.632217134798108	-0.068244365141798	0.0479035490010112	0.0928378116469468	NaN	NaN	0.098442202802751	0.488157085447504	206	0	794	0.794	0.206	0.412
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.33333333333336	7	30.583333333333336	0.117889187641809	0.273073727172108	0.431711936782216	-0.155184539530299	0.0477727530471801	0.152840847716552	0.449616805157594	0.336965892331507	0.153239961357998	0.311208371023477	92	0	908	0.908	0.092	0.184
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACA:AATTCAACT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.33333333333336	7	30.916666666666668	0.119656146346601	0.269530500680923	0.443942878614146	-0.149874354334322	0.0488641107900727	0.142769670508117	NA	NA	0.14367552419929	0.296881304165623	83	0	917	0.917	0.083	0.166
N	all	ss13	199	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACCT:TCAACTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.83333333333336	7	31.41666666666667	0.118766081588831	0.264386521096341	0.449213829420423	-0.14562043950751	0.0486725447623217	0.144690595936605	NaN	NaN	0.150373734377693	0.332849569130482	105	0	895	0.895	0.105	0.21
N	all	ss13	200	CCA	CAC	CAG	2	ACACCTAGC:ACTCCAGGC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.58333333333336	7	32.33333333333334	0.119209449101058	0.255453355429592	0.466658380355133	-0.136243906328535	0.0496165721946426	0.134250541195121	NaN	NaN	0.134123101833396	0.30971874293087	129	0	871	0.871	0.129	0.258
N	all	ss13	201	AGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTAGCAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.58333333333336	7	32.00000000000001	0.117455588516201	0.258630364718797	0.454144619267379	-0.141174776202596	0.0472414756296792	0.14505461832487	NaN	NaN	0.147579914159425	0.338769769390141	106	0	894	0.894	0.106	0.212
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	AGCAGCAGC:GGCAGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	73.41666666666669	6	31.83333333333334	0.133852300310132	0.217071598340042	0.616627423088547	-0.0832192980299097	0.0493546614422136	0.128025634047838	NaN	NaN	0.125009484075836	0.50560039585609	222	0	778	0.778	0.222	0.444
N	all	ss13	203	AGC	GCA	GCA	2	AGCAGCAGA:AGCAGTAGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	72.75000000000001	6	31.83333333333334	0.135196367873208	0.217071598340042	0.622819239859391	-0.0818752304668338	0.0504021405615176	0.123764999622273	NaN	NaN	0.130871904452469	0.53156848044377	231	0	769	0.769	0.231	0.462
N	all	ss13	204	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGT:AGTAGGGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.75000000000001	6	32.16666666666667	0.137263997871083	0.214467334863233	0.640022863894945	-0.0772033369921505	0.0504841257131092	0.117258796185003	NaN	NaN	0.127210739079985	0.543921767800715	275	0	725	0.725	0.275	0.55
N	all	ss13	205	GGA	GAG	GAA	2	AGAGGTTCA:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.41666666666667	6	32.916666666666664	0.137967373637613	0.208831643632827	0.660663160225808	-0.0708642699952137	0.0514829898139801	0.117119748321857	NaN	NaN	0.122926233561788	0.564292131951547	274	0	726	0.726	0.274	0.548
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CAT	2	GGAACTTCT:GGTTCATCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	71.75000000000001	6	32.583333333333336	0.137263997871083	0.211299152734159	0.649619253531877	-0.0740351548630767	0.0526910821733054	0.118390531171677	NaN	NaN	0.126682679596743	0.558941685934736	269	0	731	0.731	0.269	0.538
N	all	ss13	207	TCA	CAT	CAC	2	ACTTCTCCT:TCATCACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.08333333333336	6	33.24999999999999	0.121940919477753	0.206421458535371	0.590737611985521	-0.0844805390576175	0.0483767060297551	0.123964944641215	NaN	NaN	0.125338993736513	0.500300878501424	217	0	783	0.783	0.217	0.434
N	all	ss13	208	CCT	CAC	CTG	2	TCACCTGCA:TCTCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.1666666666667	6	33.83333333333333	0.12178588422283	0.202335646591906	0.601900289317099	-0.0805497623690753	0.0482773842246001	0.113543144823767	NaN	NaN	0.113703988031609	0.478686751920183	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	209	GCA	CTG	CAC	2	CCTGCACGC:CCTGCTAGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.33333333333336	6	33.33333333333333	0.119656146346601	0.20582763427632	0.581341503376386	-0.0861714879297193	0.0487441413569606	0.117443912561073	NaN	NaN	0.120238660507962	0.473577499230624	235	0	765	0.765	0.235	0.47
N	all	ss13	210	AGA	CAC	GAA	2	GCACGCATG:GCTAGAATG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0.25	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	73.1666666666667	6	32.49999999999999	0.11818004032857	0.211925228838758	0.557649700208591	-0.0937451885101876	0.0481000497131617	0.126662978708836	NaN	NaN	0.126576814611307	0.458924510066756	211	0	789	0.789	0.211	0.422
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGCATGGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.83333333333336	6	32.66666666666666	0.102850364976667	0.210676789099802	0.488190300488891	-0.107826424123135	0.044031729472419	0.122833458173607	NaN	NaN	0.119343305027918	0.366261708282493	136	0	864	0.864	0.136	0.272
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTG	2	ATGGCTGCC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.4166666666667	6	32.74999999999999	0.103484903870957	0.210058104799921	0.492648945726355	-0.106573200928964	0.045284202986476	0.119447413491206	NaN	NaN	0.120885226233251	0.377989640084793	173	0	827	0.827	0.173	0.346
N	all	ss13	213	GCC	CTG	CC-	1	GCTGCC---:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	0.5	0.5	1.5	0.5	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	72.9166666666667	6	32.91666666666666	0.102724391304868	0.208831643632827	0.491900506637207	-0.106107252327959	0.0444552418139429	0.125474190832099	NaN	NaN	0.126141829330561	0.40025035204212	160	0	840	0.84	0.16	0.32
N	all	ss13	214	---	GCA	ATG	1	GCC---GGA:GGCAATGGC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.08333333333337	5	31.833333333333325	0.116597908239164	0.176245193423779	0.661566457354703	-0.0596472851846152	0.0464116151022992	0.126173164062908	NaN	NaN	0.112986540677996	0.597558360426281	299	0	701	0.701	0.299	0.598
N	all	ss13	215	GGA	--G	GAG	1	---GGAGGA:AATGGCGGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25000000000004	5	32.66666666666666	0.114644643047729	0.171193988985735	0.669676801895665	-0.0565493459380064	0.0480317390789441	0.113402509802641	NaN	NaN	0.123880459074914	0.64804256310021	311	0	689	0.689	0.311	0.622
N	all	ss13	216	GGA	GAG	GAG	2	GGAGGAGAT:GGCGGTGAT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.91666666666671	5	32.99999999999999	0.115195995681218	0.169253998250676	0.680610188662162	-0.0540580025694583	0.0478887939009791	0.106098278824354	NaN	NaN	0.100522483028932	0.590735661205887	302	0	698	0.698	0.302	0.604
N	all	ss13	217	GAT	GAG	ATA	2	GGAGATACG:GGTGATGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.50000000000004	5	33.41666666666666	0.115892704074692	0.166890228132415	0.694424744765402	-0.0509975240577229	0.0472581316122136	0.104751635420379	NaN	NaN	0.10834077466923	0.637844954772622	282	0	718	0.718	0.282	0.564
N	all	ss13	218	ACG	ATA	CGG	2	GATACGGCA:GATGCTGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.16666666666671	5	33.74999999999999	0.116456180279654	0.165046413582601	0.705596551611049	-0.0485902333029468	0.0494824783169849	0.101599024818944	NaN	NaN	0.105794855873472	0.646027869292322	325	0	675	0.675	0.325	0.65
N	all	ss13	219	GCA	CGG	CAC	2	ACGGCACTT:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.50000000000006	5	33.41666666666666	0.100388275971152	0.166890228132415	0.601522791924651	-0.0665019521612628	0.0424921665578755	0.105835801674682	NA	NA	0.111761070173115	0.55181885698869	255	0	745	0.745	0.255	0.51
N	all	ss13	220	CTT	CAC	TTG	2	GCACTTGCA:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.83333333333339	5	33.08333333333333	0.0999099569047447	0.168775880107432	0.591968217503284	-0.0688659232026876	0.042875638317553	0.109294372186947	NaN	NaN	0.116912824984127	0.555836777581749	247	0	753	0.753	0.247	0.494
N	all	ss13	221	GCA	TTG	CAT	2	CTTGCATTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.66666666666671	5	32.91666666666666	0.0987338945676827	0.169734844556617	0.581694906697541	-0.0710009499889339	0.0440643291508433	0.106963514496908	NaN	NaN	0.105108074115023	0.499355456860535	225	0	775	0.775	0.225	0.45
N	all	ss13	222	TTA	CAT	TAT	2	GCATTATTG:GCTTTGCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.66666666666671	5	32.91666666666666	0.0987338945676827	0.169734844556617	0.581694906697541	-0.0710009499889339	0.0426722527607752	0.107021462389658	NA	NA	0.108280561434851	0.512008932324949	240	0	760	0.76	0.24	0.48
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	TTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.33333333333339	5	32.91666666666666	0.099200976433313	0.169734844556617	0.584446739221089	-0.0705338681233036	0.0445677993438666	0.108681203347049	NaN	NaN	0.109191578424791	0.518302436606496	229	0	771	0.771	0.229	0.458
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.75000000000006	5	33.58333333333333	0.0986178115404478	0.16596317904302	0.594215006660512	-0.0673453675025721	0.0443665545559926	0.104752618527432	NaN	NaN	0.109528618800863	0.538643557214983	256	0	744	0.744	0.256	0.512
N	all	ss13	225	CTT	TGC	TAG	2	CTGCTTGAC:CTGTTAGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.91666666666673	5	33.91666666666666	0.0983864636202627	0.164139760909006	0.599406646356729	-0.0657532972887435	0.0428004887856151	0.106385524566446	NaN	NaN	0.107936025595954	0.542400043823696	259	2	739	0.739	0.259	0.518
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTTGACAGA:TTAGACAGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333339	4	34.5	0.0981562001449569	0.125949614506391	0.779329103385036	-0.0277934143614345	0.0425165434714332	0.0863564516804571	NaN	NaN	0.0885642296149776	0.753656142575955	421	1	578	0.578	0.421	0.842
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GACAGGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.08333333333339	4	34.83333333333333	0.0995542025718477	0.124638389543236	0.798744294889279	-0.0250841869713888	0.041469436315507	0.0866766619186246	NaN	NaN	0.0944007386133647	0.790454673920459	397	1	602	0.602	0.397	0.794
N	all	ss13	228	CTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:AGGCTGAAC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.08333333333339	4	34.83333333333333	0.0995542025718477	0.124638389543236	0.798744294889279	-0.0250841869713888	0.0434292760966125	0.091672023024036	NaN	NaN	0.091710942863576	0.784458466052913	401	0	599	0.599	0.401	0.802
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	CTGAACCAG:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333339	4	34.916666666666664	0.0981562001449569	0.124314847835042	0.789577446735923	-0.0261586476900847	0.0433966270797973	0.0915282987868685	NaN	NaN	0.0885067582636551	0.7675696611365	388	0	612	0.612	0.388	0.776
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.75000000000004	4	35.58333333333333	0.0986178115404478	0.12178588422283	0.809763891519709	-0.0231680726823825	0.0442318574705734	0.0858072817174178	NaN	NaN	0.0893534104742733	0.795414716135212	415	0	585	0.585	0.415	0.83
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.08333333333337	4	35.58333333333333	0.0995542025718477	0.12178588422283	0.817452722104431	-0.0222316816509826	0.0439105828848051	0.0883549868354597	NA	NA	0.0896136730971876	0.804069732822493	402	0	598	0.598	0.402	0.804
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.66666666666671	4	35.666666666666664	0.0987338945676827	0.121476995958792	0.812778532992169	-0.0227431013911094	0.0415401274866301	0.090240451881496	NA	NA	0.084342114039132	0.787427246492994	418	1	581	0.581	0.418	0.836
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.00000000000004	4	35	0.128887692694994	0.123992985319038	1.0394756797198	0.00489470737595671	0.0528944723220915	0.0889520160167465	NaN	NaN	0.0951152347667672	0.958958326596359	566	0	434	0.434	0.566	0.868
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.00000000000004	4	35.33333333333333	0.130765040358583	0.122722067836352	1.06553811114849	0.00804297252223171	0.0547671731659071	0.0913725384055976	NaN	NaN	0.0948343993853376	0.932411880733374	558	0	442	0.442	0.558	0.884
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.33333333333337	4	35	0.13013319533385	0.123992985319038	1.04952062408219	0.00614021001481208	0.0537848371429586	0.0898183621161945	NaN	NaN	0.0950425820192546	0.948488637616313	532	0	468	0.468	0.532	0.936
N	all	ss13	236	TCA	TGT	CAG	2	ATGTCTGGT:GTTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.6666666666667	3	35.166666666666664	0.115613009870444	0.09056213746611	1.27661529536787	0.0250508724043337	0.0512447875591446	0.0823769618582249	NA	NA	0.0843754048004065	0.766544532708614	639	0	361	0.361	0.639	0.722
N	all	ss13	237	GGT	CAG	GTA	2	TCAGGTAAG:TCTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75000000000003	3	34.75	0.113827458253345	0.0917171833187057	1.24107014775856	0.022110274934639	0.0523604105355503	0.0743971793653394	NA	NA	0.0908827287052217	0.80778572926805	593	0	407	0.407	0.593	0.814
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC:GGTAAGACA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333337	3	34.916666666666664	0.11328912210942	0.091251642986027	1.24150227220311	0.0220374791233929	0.0515215251142757	0.073201103366591	NaN	NaN	0.0853226092697302	0.796187604161537	642	0	358	0.358	0.642	0.716
N	all	ss13	239	ACA	AAG	CAC	2	AAAGGCCAA:AAGACACCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.00000000000003	3	34.33333333333333	0.113423227292943	0.0929021112845893	1.22088966251252	0.0205211160083533	0.0488516767681648	0.0738883243214205	NA	NA	0.0918614875731019	0.823230476045046	622	0	378	0.378	0.622	0.756
N	all	ss13	240	CAA	CAC	AAC	2	ACACCACAA:GGCCAACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.00000000000003	2	35	0.098271196804803	0.0594370287406054	1.65336657782268	0.0388341680641976	0.047949271473872	0.0626801364280802	NA	NA	0.0806126464216896	0.629992139605114	715	2	283	0.283	0.715	0.566
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AA-	1	CAACAACAA:CCACAA---	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0838080288297114	0.0582817382454872	1.4379809414178	0.0255262905842243	0.0437416170757108	0.0590813874205381	NA	NA	0.0787494207601358	0.745827686560655	652	2	346	0.346	0.652	0.692
N	all	ss13	242	---	AAC	AAC	1	CAA---CAA:CAACAACAA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.00000000000003	2	35.33333333333333	0.0834192263326683	0.0588537115811214	1.41739958435224	0.0245655147515469	0.0465379118652747	0.0630785438794557	NA	NA	0.0764148292218747	0.747849884324256	636	0	364	0.364	0.636	0.728
N	all	ss13	243	CAA	--C	AAG	1	---CAATCA:CAACAAGGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.6666666666667	2	35.33333333333333	0.0826523551002107	0.0588537115811214	1.40436945911706	0.0237986435190893	0.0450214225664182	0.0599637801738025	NA	NA	0.0805361800496022	0.767610033606536	661	6	333	0.333	0.661	0.666
N	all	ss13	244	GGC	AAG	CAC	2	CAAGGCCAA:CAATCACAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.50000000000003	2	34.83333333333333	0.0840037937823711	0.0597330472949441	1.40632024627147	0.0242707464874271	0.0446418276207959	0.063063398836169	NA	NA	0.0786370019143304	0.757593239934644	646	9	345	0.345	0.646	0.69
N	all	ss13	245	CAA	CAC	AAA	2	GGCCAAACT:TCACAGGTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	2	34.99999999999999	0.0549444688504894	0.0594370287406054	0.924414796881547	-0.00449255989011599	0.0334690674684972	0.0628770117117727	NA	NA	0.0739105201925949	0.951531417913006	490	15	495	0.495	0.49	0.98
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC:CAGGTTGTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	2	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000003	2	34.33333333333333	0.0545695157118212	0.0606390724718212	0.89990683378575	-0.0060695567599999304	0.0331969304136366	0.0671543824592106	NA	NA	0.0738814839228211	0.934525357471438	517	24	459	0.459	0.517	0.918
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT:GTTGTCACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	0	34.166666666666664	0.0544456664773409	0	-Inf	0.0544456664773409	0.0335214559167688	0	NA	NA	0.0344485499938801	0.113994179080331	949	51	0	0	0.949	0.001
N	all	ss13	248	ACA	TCA	CAA	2	GTCACAAAG:GTCACTAAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	0	34.49999999999999	0.054693929928504303	0	-Inf	0.054693929928504303	0.033070301066408	0	NA	NA	0.0337254438651382	0.104858848637719	958	42	0	0	0.958	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CAA	AGA	2	ACAAAGAAA:ACTAAGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.6666666666667	0	34.33333333333332	0.0540774704260079	0	-Inf	0.0540774704260079	0.0334034873955023	0	NA	NA	0.0338011135808878	0.109626882003571	954	46	0	0	0.954	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAACA:AAGAAATCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333337	0	33.74999999999999	0.0541384900641951	0	-Inf	0.0541384900641951	0.0346766751237656	0	NA	NA	0.0348019616868957	0.119799420578217	954	46	0	0	0.954	0.001
N	all	ss13	251	ACA	AAA	CAG	2	AAAACAGCT:AAATCTGCT	1:1	TRUE	1.5	1	0.5	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333337	0	34.24999999999999	0.0545075207127158	0	-Inf	0.0545075207127158	0.0347552764681832	0	NA	NA	0.0343094722360793	0.112127729648974	956	44	0	0	0.956	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CAG	CTG	2	ACAGCTGCT:TCTGCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.9166666666667	0	34.08333333333332	0.0538952343889476	0	-Inf	0.0538952343889476	0.0336760451701048	0	NA	NA	0.0344545650350334	0.117761042470588	968	32	0	0	0.968	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000003	0	33.74999999999999	0.0529436946379863	0	-Inf	0.0529436946379863	0.0328375166135734	0	NA	NA	0.0319500462046766	0.0975038583905164	959	41	0	0	0.959	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCT	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	0	33.416666666666664	0.0527110387112104	0	-Inf	0.0527110387112104	0.0323794077509831	0	NA	NA	0.0327450465247953	0.107454445115149	950	50	0	0	0.95	0.001
N	all	ss13	255	GCT	AGG	CTT	2	GAGGCTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.1666666666667	0	32.83333333333333	0.0523087754921291	0	-Inf	0.0523087754921291	0.0334769516289963	0	NA	NA	0.0341829199004688	0.125952236798206	958	42	0	0	0.958	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CTT	CTA	2	GCTTCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.33333333333336	0	33.166666666666664	0.0521949688493964	0	-Inf	0.0521949688493964	0.0320100337535408	0	NA	NA	0.0318815602446036	0.101598656399089	952	48	0	0	0.952	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	0	32.16666666666667	0.0515223984646761	0	-Inf	0.0515223984646761	0.0317259882155899	0	NA	NA	0.0316590725473925	0.103649330349528	941	59	0	0	0.941	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCC:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	0	30.916666666666668	0.0507056829412418	0	-Inf	0.0507056829412418	0.0310802446562404	0	NA	NA	0.0305538287594146	0.0970045105190587	957	43	0	0	0.957	0.001
N	all	ss13	259	CCC	AGC	CCA	2	AAGCCCAGA:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	0	31.083333333333336	0.0509209303034166	0	-Inf	0.0509209303034166	0.0299454845217377	0	NA	NA	0.0326896380967221	0.119302341581714	963	37	0	0	0.963	0.001
N	all	ss13	260	AGA	CCA	GAC	2	CCCAGACAG:CCTCGGCAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	0	31.083333333333336	0.0509209303034166	0	-Inf	0.0509209303034166	0.0309755506671881	0	NA	NA	0.0295962772676738	0.0853383090766404	964	36	0	0	0.964	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GAC	AAA	2	AGACAGAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	0	31.16666666666667	0.0509209303034166	0	-Inf	0.0509209303034166	0.0322948000020687	0	NA	NA	0.0316040047597522	0.107132291989506	941	59	0	0	0.941	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAA	2	CAAAAACGT:CAGAAAAGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	0	31.41666666666667	0.0510835693943593	0	-Inf	0.0510835693943593	0.0308436513819779	0	NA	NA	0.031467032603434	0.104504001673657	960	40	0	0	0.96	0.001
N	all	ss13	263	AGA	AAA	GAA	2	AAAAGAACA:AAACGTACT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.83333333333336	0	31.91666666666667	0.0518565020980098	0	-Inf	0.0518565020980098	0.0322343343000024	0	NA	NA	0.031667779726287	0.101522658280491	943	57	0	0	0.943	0.001
N	all	ss13	264	ACA	GAA	CAG	2	AGAACAGCT:CGTACTGCC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333334	0	32.833333333333336	0.039054375562259	0	-Inf	0.039054375562259	0.0290601798535203	0	NA	NA	0.0283646323713146	0.168552834270275	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CAG	CCA	2	ACAGCTACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79	0	32.666666666666664	0.0389698041980333	0	-Inf	0.0389698041980333	0.0277194686415154	0	NA	NA	0.0299523274161186	0.193237585612567	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CCA	CCA	2	GCCACTAAA:GCTACCAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333334	0	32.5	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0294626431543877	0	NA	NA	0.0291147565066754	0.185452331511974	893	107	0	0	0.893	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAG	2	ACCAAAGCC:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333333	0	32.5	0.0383061974523115	0	-Inf	0.0383061974523115	0.0275570992008313	0	NA	NA	0.0286887974884442	0.18180046073069	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	268	GCA	AAG	CAT	2	AAAGCATAC:AAAGCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80	0	32.166666666666664	0.0384699707906629	0	-Inf	0.0384699707906629	0.0278058871093382	0	NA	NA	0.0278681550103072	0.167455022090165	883	117	0	0	0.883	0.001
N	all	ss13	269	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAT:GCCTATAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666666	0	32.5	0.0381438129251183	0	-Inf	0.0381438129251183	0.0290936172617991	0	NA	NA	0.0293765189952224	0.19413424549655	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA:TATAATGTT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333333	0	32.333333333333336	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.029380927594134	0	NA	NA	0.0281246787567339	0.175937008453078	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA:AATGTTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80	0	32.5	0.0384699707906629	0	-Inf	0.0384699707906629	0.0291808581963374	0	NA	NA	0.0301318155468265	0.201700189089277	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTTACTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5	0	33.5	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0303162284021761	0	NA	NA	0.029051410347202	0.182613780835282	884	116	0	0	0.884	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAGGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5	0	33.5	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0309475759227341	0	NA	NA	0.0307767610380711	0.20837872879736	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAGGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333333	0	33.5	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.028057797376924	0	NA	NA	0.0315682381001588	0.221995298283972	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333333	0	33.166666666666664	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.0281425433612817	0	NA	NA	0.0283802518616557	0.179860762816427	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGTAGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666666	0	32.33333333333333	0.0379028017472668	0	-Inf	0.0379028017472668	0.029529839835471	0	NA	NA	0.0292819830116183	0.195524898028111	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGTAGGCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333333	0	32.666666666666664	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.0284779191913256	0	NA	NA	0.0275691437533571	0.16738885986039	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	278	CGA	GAC	GAG	2	AGACGTGGT:AGGCGAGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666666	0	32.58333333333333	0.0381438129251183	0	-Inf	0.0381438129251183	0.0284207872567729	0	NA	NA	0.0290356645232496	0.188951118036387	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GAG	GTC	2	CGAGGTCCC:CGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333333	1	33.166666666666664	0.0383061974523115	0.0307735475083969	1.2447767824577	0.0075326499439147	0.0289272546562933	0.0327490975346779	NA	NA	0.0434090313129972	0.862237008291493	563	48	389	0.389	0.563	0.778
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA:GGTCCCGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333333	1	33.166666666666664	0.0383061974523115	0.0307735475083969	1.2447767824577	0.0075326499439147	0.0280695246993522	0.0312459545832294	NA	NA	0.0404838410452887	0.852393322492494	558	51	391	0.391	0.558	0.782
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCCGAACCT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666666	1	32.83333333333333	0.0381438129251183	0.0310925352587596	1.22678361888718	0.00705127766635871	0.0285772791915742	0.0318929152530166	NA	NA	0.0440856888972176	0.872924540093252	529	30	441	0.441	0.529	0.882
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC:GAACCTACA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75	1	33.08333333333333	0.0381034317265946	0.0308526791703671	1.23501208812982	0.00725075255622744	0.0277234279025499	0.0314141293928409	NA	NA	0.0439780177211466	0.869044573696355	558	35	407	0.407	0.558	0.814
N	all	ss13	283	ACA	AAA	CAC	2	CAAACCCAA:CCTACACAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75	1	33.416666666666664	0.0128071415099282	0.0305385697640887	0.419375943564603	-0.0177314282541605	0.0126264235604434	0.0319255895000154	NA	NA	0.034018225267136	0.602204332188686	277	121	602	0.602	0.277	0.554
N	all	ss13	284	CAA	CAC	AAG	2	ACACAGGGA:ACCCAAGGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666666	1	32.74999999999999	0.0128620515547158	0.0311733183159379	0.412598088671873	-0.018311266761222	0.0127829435872286	0.0321774138745912	NA	NA	0.0339070830208342	0.589167705361196	266	125	609	0.609	0.266	0.532
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT:CAGGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666666	1	33.08333333333333	0.0130296436641525	0.0308526791703671	0.422318061656928	-0.0178230355062146	0.0127803800252404	0.0325911026672362	NA	NA	0.0350781033615656	0.611386190227789	247	135	618	0.618	0.247	0.494
N	all	ss13	286	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666666	1	33.416666666666664	0.0262896575662818	0.0305385697640887	0.860867348057559	-0.00424891219780691	0.0184160408240362	0.0312596569267666	NA	NA	0.0356720398995832	0.905187863487513	435	47	518	0.518	0.435	0.87
N	all	ss13	287	TTC	ATT	TCG	2	AATTTCGGT:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666666	1	33.24999999999999	0.0264636052740321	0.0306948207819131	0.862152135112833	-0.00423121550788096	0.017875341368576	0.0305935506919184	NA	NA	0.0364941596802551	0.907698299460425	468	38	494	0.494	0.468	0.936
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGTGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25	1	33.416666666666664	0.026699148503671	0.0305385697640887	0.874276323676015	-0.00383942126041773	0.0184335858030172	0.0311924458035892	NA	NA	0.0362612075634886	0.915675711350866	455	59	486	0.486	0.455	0.91
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAG:GGTGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666666	1	33.74999999999999	0.026818499681086	0.0302307926160697	0.887125257404936	-0.00341229293498363	0.018783953592713	0.0309889307004252	NA	NA	0.0388805541264162	0.930064660361181	462	44	494	0.494	0.462	0.924
N	all	ss13	290	CAG	ACC	AGG	2	GACCAGGAA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666666	1	33.74999999999999	0.026818499681086	0.0302307926160697	0.887125257404936	-0.00341229293498363	0.0190719476458819	0.030777560799108	NA	NA	0.0369776387411749	0.9264756549101	446	39	515	0.515	0.446	0.892
N	all	ss13	291	GAA	AGG	AAC	2	CAGGAACTA:CAGGAATTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25	1	32.416666666666664	0.0263473854682498	0.031500692980973	0.836406535061439	-0.0051533075127232	0.0184896811990253	0.0319304610293954	NA	NA	0.0401382359834269	0.897841145048072	437	47	516	0.516	0.437	0.874
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAATTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75	1	31.916666666666664	0.0261749574292545	0.0320048558445568	0.817843315913768	-0.00582989841530232	0.0188846526311539	0.0318024915865756	NA	NA	0.038524117170047	0.87971450912193	467	45	488	0.488	0.467	0.934
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:TTAATCAGA	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.75	1	31.916666666666664	0.0255072404553968	0.0320048558445568	0.79698032633804	-0.00649761538915998	0.0177766728454903	0.0335405489826911	NA	NA	0.037514344719733	0.862491481346526	456	48	496	0.496	0.456	0.912
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA:ATCAGATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.66666666666667	1	32.666666666666664	0.0252124580992387	0.0312545223004261	0.806681921319752	-0.00604206420118732	0.0174483871006113	0.0330186490008793	NA	NA	0.0359344782591933	0.866472243664756	446	44	510	0.51	0.446	0.892
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA:AGATTAGGT	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.33333333333334	1	32.5	0.0250023152006939	0.0314182062818701	0.795790662789093	-0.00641589108117623	0.0179045644880588	0.031391324118047	NA	NA	0.0353793985953249	0.856096475100416	442	51	507	0.507	0.442	0.884
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT:TTAGGTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80	1	33.33333333333333	0.025426163756761	0.0306164958901914	0.830472691844098	-0.00519033213343037	0.0181311837918591	0.0305357335016187	NA	NA	0.0369191349904055	0.888196610278102	432	47	521	0.521	0.432	0.864
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT:GGTACTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.83333333333334	1	33.166666666666664	0.0251595918684029	0.0307735475083969	0.817572035253259	-0.00561395563999399	0.0178655014370976	0.0328496173809896	NA	NA	0.0378727234996257	0.882159551520573	463	47	490	0.49	0.463	0.926
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.16666666666667	1	32.83333333333333	0.0250545217996291	0.0310925352587596	0.805805045845225	-0.00603801345913054	0.017997949493734	0.0325275092028715	NA	NA	0.0359298396253981	0.866543858436827	450	35	515	0.515	0.45	0.9
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.16666666666667	1	32.83333333333333	0.0250545217996291	0.0310925352587596	0.805805045845225	-0.00603801345913054	0.0182533113884459	0.0325459576958274	NA	NA	0.0368240471907928	0.86975530706104	476	46	478	0.478	0.476	0.952
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAAAT:TACAAACAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.16666666666667	1	32.5	0.0247445123657617	0.0314182062818701	0.787585139131272	-0.00667369391610844	0.0177443399957546	0.0302127518030328	NA	NA	0.0362191854454848	0.853810644079986	424	45	531	0.531	0.424	0.848
N	all	ss13	301	AAT	AAA	ATT	2	AAAAATTGG:AAACATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.41666666666667	1	32.25	0.0246682051273184	0.03166697281676	0.778988420208658	-0.00699876768944161	0.0170018281217249	0.0332276992343473	NA	NA	0.037906972592179	0.853519184752103	439	42	519	0.519	0.439	0.878
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	AATTGGCCA:CATTGGCCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333334	1	32.416666666666664	0.0123586730492886	0.031500692980973	0.392330195934212	-0.0191420199316844	0.0122798142979794	0.0318295197653068	NA	NA	0.0371387327162675	0.606260042787034	258	115	627	0.627	0.258	0.516
N	all	ss13	303	CCA	GGC	CAC	2	TGGCCACAG:TGGCCGCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666667	1	32.416666666666664	0.012461345857946	0.031500692980973	0.395589578472856	-0.0190393471230271	0.0133077167869584	0.0320451501534848	NA	NA	0.0348979510393229	0.585360132785228	250	114	636	0.636	0.25	0.5
N	all	ss13	304	CAA	CAC	AAA	2	CCACAGATT:CCGCAAATT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666667	1	31.416666666666664	0.0123079685204042	0.0325254218363474	0.37841072691792	-0.0202174533159432	0.0127766928160055	0.0346656811812424	NA	NA	0.0355849023760703	0.569935198280273	248	133	619	0.619	0.248	0.496
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA:CAGATTGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666667	1	31.249999999999996	0.0124226442537559	0.0327027281115989	0.379865686170381	-0.020280083857843	0.0123605091314969	0.0323123908680905	NA	NA	0.03743650410005	0.588011762098545	252	136	612	0.612	0.252	0.504
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA:ATTGCACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.66666666666667	1	30.916666666666664	0.012345957790554	0.0330632048490145	0.373404751503452	-0.0207172470584605	0.0123565741136454	0.0328241410883287	NA	NA	0.0355589131588675	0.560150784673389	269	130	601	0.601	0.269	0.538
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCACAGTTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666667	1	31.083333333333332	0.0122702123289052	0.0328819783981324	0.373159187088393	-0.0206117660692272	0.0124723821618656	0.0342768119206068	NA	NA	0.0367798218390512	0.575200069751471	282	130	588	0.588	0.282	0.564
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAGTTTGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333334	1	31.416666666666664	0.0123206056064609	0.0325254218363474	0.378799256423251	-0.0202048162298864	0.0125062664603136	0.033757562227208	NA	NA	0.0359923698679848	0.574549505312629	280	123	597	0.597	0.28	0.56
N	all	ss13	309	GCA	TTG	CAC	2	TTTGCACCC:TTTGCCCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333334	1	31.916666666666668	0.0123969764634079	0.0320048558445568	0.387346736495811	-0.0196078793811488	0.0127208206707011	0.0316892664300169	NA	NA	0.0349724023427065	0.575024421834367	245	154	601	0.601	0.245	0.49
N	all	ss13	310	CCC	CAC	CCA	2	GCACCCAGT:GCCCCCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82	1	31.916666666666668	0.0122953573317573	0.0320048558445568	0.384171620440166	-0.0197094985127995	0.0124967185443772	0.0323509567375676	NA	NA	0.0342879151507864	0.56541068914767	264	126	610	0.61	0.264	0.528
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCCAGTGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.16666666666667	1	31.75	0.0122702123289052	0.0321765161581571	0.381340610916156	-0.0199063038292519	0.0122761042605009	0.0322493262585112	NA	NA	0.0357221475630733	0.577354010385627	287	128	585	0.585	0.287	0.574
N	all	ss13	312	GCT	GCG	CTT	2	AGCGCTTCA:AGTGCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333333	1	31.416666666666668	0.0123206056064609	0.0325254218363474	0.378799256423251	-0.0202048162298864	0.0123527564108711	0.0336146441580669	NA	NA	0.035530866557645	0.569590075980328	262	126	612	0.612	0.262	0.524
N	all	ss13	313	TCA	CTT	CAG	2	GCTTCAGCG:GCTTCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.5	1	31.416666666666668	0.0122202296145754	0.0325254218363474	0.375713178327458	-0.020305192221772	0.0123218042523025	0.0327040621583412	NA	NA	0.0351187134950394	0.563137708902271	281	113	606	0.606	0.281	0.562
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.5	1	30.416666666666668	0.012072695281631	0.0336190735350483	0.359102557333862	-0.0215463782534173	0.0122156411471696	0.0333907555817601	NA	NA	0.0377988981250437	0.568659641179199	256	125	619	0.619	0.256	0.512
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.5	1	30.083333333333336	0.0119286808797483	0.0340001559761409	0.350841945787517	-0.0220714750963925	0.0120237781577068	0.034966022361846	NA	NA	0.03655591126611	0.545994520183014	259	126	615	0.615	0.259	0.518
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.83333333333333	1	30.083333333333336	0.0120243056482867	0.0340001559761409	0.353654426077473	-0.0219758503278542	0.0124845762353788	0.0374070057108359	NA	NA	0.0376397340838855	0.559323173301785	250	132	618	0.618	0.25	0.5
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84	1	29.416666666666664	0.0120002560098308	0.0347888449357013	0.344945514345485	-0.0227885889258705	0.011816417091395	0.0360632385914101	NA	NA	0.0377335116145011	0.545886847653372	251	114	635	0.635	0.251	0.502
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG:GGCATGTCC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84	1	29.416666666666664	0.0120002560098308	0.0347888449357013	0.344945514345485	-0.0227885889258705	0.0123600777808069	0.0358538161698486	NA	NA	0.0373380144860821	0.541641834670982	250	136	614	0.614	0.25	0.5
N	all	ss13	319	TCC	TGT	CCC	2	ATGTCCCGT:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.83333333333334	1	29.25	0.0120243056482867	0.0349917687305995	0.343632405119655	-0.0229674630823129	0.0125905772697532	0.0355743873212011	NA	NA	0.0384922067086069	0.550722207172274	252	119	629	0.629	0.252	0.504
N	all	ss13	320	CGC	CCC	GCA	2	TCCCGTATA:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.66666666666667	1	29.416666666666664	0.012048451877855	0.0347888449357013	0.346330897163261	-0.0227403930578463	0.0124412669855849	0.03579578953077	NA	NA	0.0368979929716855	0.537693677654744	244	147	609	0.609	0.244	0.488
N	all	ss13	321	ATA	GCA	TAG	2	CGCATTGGC:CGTATAGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.33333333333334	1	29.416666666666664	0.0119524441971095	0.0347888449357013	0.343571171138354	-0.0228364007385918	0.0120105703009961	0.0360423383855838	NA	NA	0.0377538865964475	0.545261728324032	244	135	621	0.621	0.244	0.488
N	all	ss13	322	GGA	TAG	GAA	2	ATAGGAATG:ATTGGCATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85	1	28.916666666666668	0.0118579545199817	0.0354048034273472	0.334925020677346	-0.0235468489073656	0.0124500636953294	0.0356917362536872	NA	NA	0.0377225153071705	0.532488329116822	278	144	578	0.578	0.278	0.556
N	all	ss13	323	ATG	GAA	TGG	2	GGAATGGAA:GGCATGGAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.66666666666666	1	28.916666666666668	0.0117649471257747	0.0354048034273472	0.33229804961118	-0.0236398563015725	0.0118942490197771	0.036822220559346	NA	NA	0.0379837192030816	0.53369983138989	244	105	651	0.651	0.244	0.488
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.75	1	29.5	0.0118932125500045	0.0346882632380668	0.342859844794793	-0.0227950506880623	0.0123219157327505	0.0349801301414141	NA	NA	0.036863141635496	0.536331651059347	263	118	619	0.619	0.263	0.526
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.75	1	30.5	0.012036366652848	0.0335251341884302	0.359025159607023	-0.0214887675355822	0.0122330877685378	0.0344951714464811	NA	NA	0.0358130588760613	0.5484888880368	255	137	608	0.608	0.255	0.51
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84	1	30.916666666666668	0.0120002560098308	0.0330632048490145	0.362948965916367	-0.0210629488391837	0.0123691311711689	0.0325125027171108	NA	NA	0.0356181450854755	0.554282948924153	244	129	627	0.627	0.244	0.488
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTA	2	ACACCTACA:ACACCTTCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.83333333333333	1	30.75	0.0118814365992435	0.0332464403304228	0.357374698799592	-0.0213650037311793	0.0119119121520795	0.0344117950754357	NA	NA	0.0365545998477664	0.558905306950312	283	146	571	0.571	0.283	0.566
N	all	ss13	328	ACA	CTA	CAG	2	CCTACAGGG:CCTTCGGGA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.66666666666666	1	30.916666666666668	0.0119050118672176	0.0330632048490145	0.360068297117073	-0.0211581929817969	0.0125500017374437	0.0337848323362279	NA	NA	0.0364622499108586	0.56172805719641	272	122	606	0.606	0.272	0.544
N	all	ss13	329	GGA	CAG	GAA	2	ACAGGGACT:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.33333333333333	0	30.916666666666668	0.0118112677261044	0	-Inf	0.0118112677261044	0.0115668264546584	0	NA	NA	0.0125701003731974	0.347406389987757	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	330	ACG	GAA	CGT	2	GGAACGTGG:GGGACTTGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.66666666666667	0	30.25	0.0116281399019739	0	-Inf	0.0116281399019739	0.0112134895474693	0	NA	NA	0.0119455792309765	0.330341518288324	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	331	TGG	CGT	GGT	2	ACGTGGTTG:ACTTGGTTA	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	87.00000000000001	1	29.916666666666668	0.0233481889463799	0.0341939559917542	0.682816254194463	-0.0108457670453743	0.017365340956674	0.0369466359421755	NA	NA	0.0279616352568677	0.698104628646897	293	154	553	0.553	0.293	0.586
N	all	ss13	332	TTA	GGT	TAA	2	TGGTTAACC:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	86.66666666666669	1	29.916666666666668	0.0234394076280783	0.0341939559917542	0.685483938557173	-0.0107545483636759	0.0169803026201139	0.0375282765081085	NA	NA	0.0277775534606686	0.698632676884039	307	121	572	0.572	0.307	0.614
N	all	ss13	333	ACC	TAA	CCT	2	TTAACCTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	88.33333333333336	1	29.583333333333332	0.0347552529440265	0.0345882615712242	1.00482797819886	1.6699137280228e-4	0.0212299810210818	0.0363658400743408	NA	NA	0.0311408527775946	0.995721401705711	505	42	453	0.453	0.505	0.906
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACCTATAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.00000000000001	1	29.916666666666668	0.0344888349313675	0.0341939559917542	1.00862371524618	2.94878939613323e-4	0.0205817822960376	0.0362244414796577	NA	NA	0.0302223440651174	0.992215176303998	512	49	439	0.439	0.512	0.878
N	all	ss13	335	AAT	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATAATGGT	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.25000000000001	1	29.666666666666668	0.0343899783720917	0.0344888349313675	0.997133664866541	-9.88565592758561e-5	0.0205957423538803	0.0365455240065542	NA	NA	0.0306551741394325	0.997426992738239	523	48	429	0.429	0.523	0.858
N	all	ss13	336	GGT	ATG	GTG	2	AATGGTGCC:ACAGGTGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	89.16666666666669	1	30.083333333333332	0.0227721477975885	0.0340001559761409	0.669765980296339	-0.0112280081785524	0.0158852170364738	0.0388188222986488	NA	NA	0.0283154971050766	0.691712410993471	274	118	608	0.608	0.274	0.548
N	all	ss13	337	GCC	GTG	CCA	2	GGTGCCATA:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.00000000000003	1	30.333333333333332	0.0344888349313675	0.0337135408966997	1.02299651754301	7.75294034667827e-4	0.019886216289399	0.0365196627529014	NA	NA	0.0304545031571837	0.979690086325346	524	40	436	0.436	0.524	0.872
N	all	ss13	338	ATA	CCA	TAA	2	GCCATAAAA:GCCATCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.6666666666667	1	30.333333333333332	0.0342264710299645	0.0337135408966997	1.01521436549298	5.12930133264797e-4	0.019292786731691	0.0359076745435216	NA	NA	0.0304994138612258	0.986582045653717	510	51	439	0.439	0.51	0.878
N	all	ss13	339	AAA	TAA	AAT	2	ATAAAATTG:ATCAAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	90.33333333333337	1	30.333333333333332	0.0339680693851223	0.0337135408966997	1.00754974059837	2.54528488422619e-4	0.0197830054914409	0.0369815103699447	NA	NA	0.0294310256399593	0.993099736918598	503	49	448	0.448	0.503	0.896
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	90.83333333333337	1	29.833333333333332	0.0337768146824079	0.0342916870035713	0.984985506221673	-5.14872321163463e-4	0.0200887591437085	0.0370440598895554	NA	NA	0.0300158472849169	0.986314278355985	471	53	476	0.476	0.471	0.942
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	90.6666666666667	1	30	0.0338403264603522	0.034096780557568	0.992478641882836	-2.56454097215808e-4	0.0197490617569484	0.0366519764540448	NA	NA	0.0298823219417314	0.99315253167653	501	43	456	0.456	0.501	0.912
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA:GATGATAAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	90.1666666666667	1	30.166666666666668	0.0576098833212125	0.0339040775760351	1.69920220339319	0.0237058057451774	0.0298954423479204	0.0370876867898847	NA	NA	0.0375673271317381	0.528026212094224	716	16	268	0.268	0.716	0.536
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT:GATAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.83333333333336	1	30.833333333333336	0.0585091875923658	0.0331545693783718	1.76473978366717	0.0253546182139941	0.0314170463253505	0.0329945399835483	NA	NA	0.0365784051626889	0.4882103329942	734	13	253	0.253	0.734	0.506
N	all	ss13	344	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCCA:AAAGATCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.91666666666669	1	31.083333333333336	0.0598522824019851	0.0328819783981324	1.8202153677403	0.0269703040038528	0.0316653847330965	0.0347873214822111	NA	NA	0.0373025913088937	0.469671147152107	765	12	223	0.223	0.765	0.446
N	all	ss13	345	CCA	ACC	CAA	2	GACCCAAAT:GATCCAAAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.58333333333336	1	30.75	0.0608235875568599	0.0332464403304228	1.8294766884021	0.0275771472264371	0.0325141871702779	0.0350697022399888	NA	NA	0.038186659533629	0.470191779434766	773	18	209	0.209	0.773	0.418
N	all	ss13	346	AAT	CAA	ATT	2	CCAAATTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.41666666666669	1	30.75	0.0609472230590743	0.0332464403304228	1.83319544749286	0.0277007827286515	0.032313260680629	0.0344690815485902	NA	NA	0.0385949455663813	0.472923263382363	793	10	197	0.197	0.793	0.394
N	all	ss13	347	TTC	ATT	TCA	2	AATTTCAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.00000000000003	1	30.583333333333336	0.0741343759774745	0.0334317184415283	2.2174862505837	0.0407026575359461	0.0346133279815706	0.0350365902911949	NA	NA	0.0390882005471107	0.297734979940108	839	3	158	0.158	0.839	0.316
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.6666666666667	1	30.916666666666668	0.0744412185715059	0.0330632048490145	2.25148224170788	0.0413780137224914	0.0355580751575058	0.0345410167149997	NA	NA	0.0390663833426597	0.289521520266624	867	5	128	0.128	0.867	0.256
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAA:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333336	1	31.08333333333334	0.0752195633615916	0.0328819783981324	2.28756197242268	0.0423375849634592	0.0357131436065366	0.0351538225217819	NA	NA	0.0416863185473679	0.309808935841611	841	6	153	0.153	0.841	0.306
N	all	ss13	350	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGTT:GATCAAGTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.83333333333336	1	31.41666666666667	0.0761753537657808	0.0325254218363474	2.34202508268945	0.0436499319294334	0.0360918686554765	0.0329030808240206	NA	NA	0.0402577738742181	0.278249116564048	861	6	133	0.133	0.861	0.266
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	CAAGTCATT:CAAGTTATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.25000000000003	1	31.000000000000007	0.075774168923676	0.032972342565837	2.29811299492522	0.042801826357839	0.0357007407869915	0.0363299782103374	NA	NA	0.0409733337577504	0.296195670693993	849	3	148	0.148	0.849	0.296
N	all	ss13	352	ATT	TCA	TTC	2	GTCATTTTG:GTTATTCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.08333333333336	1	30.83333333333334	0.0749843548189804	0.0331545693783718	2.26165974177593	0.0418297854406086	0.0355465932362158	0.0353805375910158	NA	NA	0.0419557399619925	0.318765519950575	845	2	153	0.153	0.845	0.306
N	all	ss13	353	CTG	TTC	TGC	2	ATTCTGCTT:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.08333333333336	1	30.16666666666667	0.0740580604891802	0.0339040775760351	2.18434081632493	0.0401539829131451	0.0357945961362815	0.0384528074127813	NA	NA	0.0410480959487076	0.327966556808821	826	7	167	0.167	0.826	0.334
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTTAAT:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.75000000000003	1	30.16666666666667	0.0734531512400293	0.0339040775760351	2.16649903172559	0.0395490736639942	0.0346536618512072	0.0358256757348532	NA	NA	0.04101972398067	0.334971867049079	830	4	166	0.166	0.83	0.332
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG:CTTAATAAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333336	1	30.250000000000007	0.0727107813493274	0.0338085407384937	2.15066310941189	0.0389022406108337	0.0340420932520041	0.0371677887660787	NA	NA	0.0412981901940617	0.346200754522844	823	4	173	0.173	0.823	0.346
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.58333333333336	1	30.58333333333334	0.0736034494886183	0.0334317184415283	2.20160532930277	0.04017173104709	0.0353148756626952	0.0350001051602767	NA	NA	0.0414212642640661	0.332129475371531	841	9	150	0.15	0.841	0.3
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.08333333333336	1	31.08333333333334	0.0740580604891802	0.0328819783981324	2.25223858468889	0.0411760820910478	0.0355290883773633	0.0340485003754853	NA	NA	0.0407366998420011	0.312118909792378	842	9	149	0.149	0.842	0.298
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAT:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.4166666666667	1	30.750000000000007	0.0737543645690025	0.0332464403304228	2.21841387637257	0.0405079242385797	0.0343316691811003	0.0354485623533	NA	NA	0.0424152613262803	0.339561605486348	837	3	160	0.16	0.837	0.32
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA:ATTGATGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.08333333333336	2	29.750000000000004	0.0731543901609123	0.0704329495874262	1.0386387420863	0.00272144057348606	0.0354281020015634	0.0574157449151497	NaN	NaN	0.060914894208612	0.964365475363819	513	1	486	0.486	0.513	0.972
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC:GATGCTTAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.1666666666667	2	29.66666666666667	0.0730800795466123	0.0706404112947758	1.03453643894648	0.0024396682518365	0.0344232130797355	0.0558124645314599	NA	NA	0.058394519072673	0.966674826280321	518	2	480	0.48	0.518	0.96
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA:GCTTATAAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	87.1666666666667	2	29.33333333333334	0.0978984405032832	0.0714826348532436	1.36954157753519	0.0264158056500397	0.0417173552822968	0.0570717922596753	NA	NA	0.0658229202063978	0.688187321787279	652	0	348	0.348	0.652	0.696
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA:TATAAGACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	87.33333333333337	2	29.16666666666667	0.0976988961284261	0.0719113287774619	1.35860229242554	0.0257875673509642	0.0434217096198455	0.0587691224887298	NaN	NaN	0.0634995611438634	0.684664548753217	689	1	310	0.31	0.689	0.62
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC:AAGACATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	85.6666666666667	2	29.16666666666667	0.0997317620180998	0.0719113287774619	1.38687135550967	0.0278204332406379	0.044917603330226	0.0576924529803762	NA	NA	0.0687637532595012	0.685786326894376	662	0	338	0.338	0.662	0.676
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA:ACATTTCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	84.00000000000003	3	30.500000000000007	0.101851155869296	0.105436462965892	0.965995567418119	-0.00358530709659567	0.0455551365167632	0.0663768668107308	NaN	NaN	0.0757854790132636	0.962267250980629	497	0	503	0.503	0.497	0.994
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA:TTTCCACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	81.6666666666667	3	30.166666666666675	0.104974533626476	0.106688419438138	0.983935596565327	-0.00171388581166183	0.0454026265443294	0.0681532021684036	NA	NA	0.0752819755260308	0.981836755746076	501	1	498	0.498	0.501	0.996
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA:CCACCTACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	80.33333333333337	3	29.500000000000007	0.106847011144383	0.109283858386045	0.977701672711316	-0.00243684724166227	0.0475283978262163	0.0677444003862929	NaN	NaN	0.0767061488235102	0.974656584627588	467	0	533	0.533	0.467	0.934
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG:CCTACAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.1666666666667	4	30.000000000000007	0.136429382099394	0.146808432844571	0.929302080649781	-0.0103790507451775	0.0570448578229045	0.0791434475940983	NaN	NaN	0.0795784234840677	0.896229841799535	465	1	534	0.534	0.465	0.93
N	all	ss13	368	GAA	CAG	AAC	2	ACAGAACCT:ACAGAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.83333333333337	5	30.33333333333334	0.137054385390789	0.186134722106651	0.736318209948275	-0.0490803367158621	0.0572277116985131	0.0875508104176883	NaN	NaN	0.100345976796096	0.62476300370894	289	0	711	0.711	0.289	0.578
N	all	ss13	369	CCT	AAC	CTA	2	GAACCTAAA:GAGCCTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	79.33333333333337	5	30.83333333333334	0.138002732232704	0.182716561993313	0.75528310475629	-0.0447138297606084	0.0592724612608033	0.092429327597947	NaN	NaN	0.0903175851198291	0.620548342241072	311	0	689	0.689	0.311	0.622
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.83333333333337	5	31.333333333333343	0.138964332467004	0.179422266799375	0.774509958802323	-0.0404579343323718	0.0575315789623631	0.0909507469572844	NaN	NaN	0.0909982757714718	0.65660804584144306	336	1	663	0.663	0.336	0.672
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.50000000000004	5	31.00000000000001	0.139612900523289	0.181605039003649	0.768772173334266	-0.0419921384803596	0.0560410728339459	0.0892565215668902	NaN	NaN	0.0916835787081207	0.646944139496147	331	0	669	0.669	0.331	0.662
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA:AAGGACAAG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.00000000000004	5	31.500000000000007	0.14059721722078	0.178350531835637	0.788319584885511	-0.0377533146148576	0.0591576543639401	0.0891580267007678	NaN	NaN	0.085669646790573	0.659441172957217	320	0	680	0.68	0.32	0.64
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG:GACAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	77.33333333333337	5	31.500000000000007	0.141931499728896	0.178350531835637	0.795800821383006	-0.0364190321067412	0.0576024299413439	0.083833323625083	NaN	NaN	0.0899220973559923	0.685472747910228	357	0	643	0.643	0.357	0.714
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAG:AAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGCT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	GCT	AGG	CTG	2	AAGGCTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	GCTGATGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGTA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGTACAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GTACAGTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	GCC	AAG	CAC	2	CAAGCCTTA:CAGTCACTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	CTG	CAC	TAC	2	GCCTTACCG:TCACTGCCG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	CTGCCGCAG:TTACCGCAG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA:CCGCAGCGT	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG:CAGCGTCAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.916666666666667	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG:CGTCAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAACAGGCA	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGGCAACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:GCAACTGTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTG:GTGACTCTT	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTG	CTC	TGT	2	ACTCTGTTA:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TGT	TAC	2	CTGTTACCT:CTTCTTCCT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0.25	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TAC	CTG	2	CTTCCTGCT:TTACCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCA	CTG	CAG	2	CCTGCAGCA:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CAG	CAG	2	GCAGCAGAT:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	ATT	TGG	2	GATTTGGAT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC:GATGATTTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC:GATTTTTCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACTT:AAACAATTG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAG:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	CTTCAGAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAC	AAT	2	CAACAATCC:CAGAATTCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAAT:TCCATGAGC	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AAT	TGA	AT-	0	ATGAAT---:ATGAGC---	1:1	TRUE	0	0	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	1	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	NA	NA	0	AAT---GCT:AGC------	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	--G	CTT	0	------AGT:---GCTTCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CAC	1	---AGTGCT:GCTTCACCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	CCT	CAC	CTG	2	AGTGCTGAC:TCACCTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	CCTGATTCT:GCTGACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCTACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG:TCTACTCAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCC	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_GU190215.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0299575406550905	0.0476033728746708	NaN	NaN	0.0557636468119519	0.882523860449303	589	2	409	0.409	0.589	0.818
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0312949248724588	0.0455872008908458	NaN	NaN	0.0584817763965674	0.881532636078762	567	0	433	0.433	0.567	0.866
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0312102247299237	0.0463050670682275	NaN	NaN	0.0554323079657948	0.879671644630439	588	2	410	0.41	0.588	0.82
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0315416767350493	0.0437386655127992	NA	NA	0.0563841966257423	0.859394462129794	567	1	432	0.432	0.567	0.864
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0332281110183876	0.0430930583017366	NA	NA	0.0556383429711376	0.81842490584341	586	1	413	0.413	0.586	0.826
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0315105241232332	0.0429096041829294	NaN	NaN	0.0530215658742845	0.796332147965773	607	0	393	0.393	0.607	0.786
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0303023696233619	0.0425953624948911	NA	NA	0.0539759410015025	0.823071352520179	635	1	364	0.364	0.635	0.728
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0312313449528434	0.0431819214965411	NA	NA	0.0548190287671121	0.815654139610189	588	1	411	0.411	0.588	0.822
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0309995457583733	0.0429441670157844	NA	NA	0.0545973842909995	0.802325912143806	620	2	378	0.378	0.62	0.756
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0315485362252675	0.0438398107610325	NA	NA	0.0526667233936856	0.811546856437952	606	1	393	0.393	0.606	0.786
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0317248521139108	0.0433761783385044	NA	NA	0.0575278637152085	0.836627087489578	599	2	399	0.399	0.599	0.798
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0278896760212006	0.0428164153072688	NA	NA	0.0509453654165011	0.983249389274873	514	4	482	0.482	0.514	0.964
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0278847430708754	0.0409658179516096	NA	NA	0.0542148004487501	0.982498986771723	503	1	496	0.496	0.503	0.992
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0291898136062103	0.0414197463632828	NA	NA	0.0548204774096484	0.825216847368313	602	1	397	0.397	0.602	0.794
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0321450454972998	0.0456925338262549	NA	NA	0.0537460010500364	0.821780749973163	611	0	389	0.389	0.611	0.778
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0332799251271962	0.0431848147036435	NA	NA	0.0556113904737889	0.666806024479822	648	1	351	0.351	0.648	0.702
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0327357353308326	0.0419347845732142	NaN	NaN	0.0549001761595485	0.672733519588014	693	0	307	0.307	0.693	0.614
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0322662136988586	0.0439070243684363	NaN	NaN	0.0559869045457582	0.671374050439506	700	0	300	0.3	0.7	0.6
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0343416016708015	0.0433986093837702	NaN	NaN	0.0567588593856974	0.662125807607294	670	0	330	0.33	0.67	0.66
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0311965382147017	0.0443780934176128	NaN	NaN	0.058034234106043	0.690340185897488	658	0	342	0.342	0.658	0.684
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0345504468932212	0.0431523517571075	NA	NA	0.0555540769124317	0.674567472305988	689	1	310	0.31	0.689	0.62
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0313823373555192	0.0307880347175566	NaN	NaN	0.0468228865967149	0.266567559685261	871	1	128	0.128	0.871	0.256
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0324783811320681	0.0301208559496428	NaN	NaN	0.0466610538439183	0.246382812477762	870	2	128	0.128	0.87	0.256
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0315484411336105	0.0301965720251386	NaN	NaN	0.0447825855085336	0.242807549359146	880	0	120	0.12	0.88	0.24
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0314136225713522	0.0316296078006188	NA	NA	0.0462216410144488	0.260767730210578	881	2	117	0.117	0.881	0.234
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0278425315406606	0.0321514805367966	NA	NA	0.0439274643273075	0.400536456748343	811	1	188	0.188	0.811	0.376
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0271415233729319	0.0310967573468913	NA	NA	0.0417186840704816	0.571309658460711	729	2	269	0.269	0.729	0.538
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0251385033548391	0.0303645330102839	NA	NA	0.0402308205332765	0.552779568740982	737	4	259	0.259	0.737	0.518
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0261806037459547	0.0299600575141378	NA	NA	0.0414746405649748	0.586540714710443	710	7	283	0.283	0.71	0.566
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0258136720635316	0.0448904815425581	NaN	NaN	0.050925070869537	0.891930119347264	477	2	521	0.521	0.477	0.954
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0264599457437552	0.0427216579338537	NA	NA	0.0524969383738827	0.932782386462657	492	1	507	0.507	0.492	0.984
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0226824785897262	0.0430235190567083	NA	NA	0.0517959904805183	0.715354744558058	332	9	659	0.659	0.332	0.664
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0231032079480613	0.0470973336090276	NA	NA	0.048139484021098	0.6778437542117	352	9	639	0.639	0.352	0.704
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0180639633058457	0.0430191469205454	NA	NA	0.046018598804986	0.468288196691632	207	22	771	0.771	0.207	0.414
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0171025049314321	0.043152795445358	NA	NA	0.0488598402180238	0.496884168761146	240	12	748	0.748	0.24	0.48
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0178818570809213	0.0413095995285634	NA	NA	0.0489684043500039	0.479726809698923	205	18	777	0.777	0.205	0.41
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0181678040904439	0.0421854884740105	NA	NA	0.046050415831674	0.468305141271307	213	20	767	0.767	0.213	0.426
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0184359693673454	0.0288354808950995	NA	NA	0.0339086230811122	0.934758559987727	467	45	488	0.488	0.467	0.934
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0192084359294608	0.0288765372994677	NA	NA	0.0338541634689983	0.944067861124107	455	61	484	0.484	0.455	0.91
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0187718223023775	0.0298678879486337	NA	NA	0.03472587668085	0.962940810752162	488	43	469	0.469	0.488	0.938
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0192975929809176	0.0270019387900359	NA	NA	0.034211685462013	0.971372408903807	461	36	503	0.503	0.461	0.922
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0182746662238915	0.0282106583257953	NA	NA	0.0350338700109286	0.979450931443366	507	48	445	0.445	0.507	0.89
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.018019055035225	0.0284087128245742	NA	NA	0.0346813911521072	0.976269895871266	477	38	485	0.485	0.477	0.954
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.019604955679786	0.0285738683774487	NA	NA	0.0351572584411144	0.959785701197784	464	57	479	0.479	0.464	0.928
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0185963733883717	0.0447526913436018	NA	NA	0.0478250220901495	0.507601615684583	236	12	752	0.752	0.236	0.472
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0192426545202415	0.0458836726266407	NA	NA	0.048311401635534	0.504221612961367	223	10	767	0.767	0.223	0.446
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.018733503343922	0.0439446068705579	NA	NA	0.0479248089211273	0.500788558752355	229	26	745	0.745	0.229	0.458
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0198526487690009	0.0443145505730527	NA	NA	0.0497898951719452	0.520127283592713	237	16	747	0.747	0.237	0.474
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0192061916647058	0.0428332737673195	NA	NA	0.0506831260984188	0.536583279384546	250	22	728	0.728	0.25	0.5
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0187280545934457	0.0433657015803981	NA	NA	0.0504192775672632	0.534453606229929	251	20	729	0.729	0.251	0.502
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0189218722295576	0.0433291510462041	NA	NA	0.0513083359498995	0.538398214227274	257	18	725	0.725	0.257	0.514
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.017509778360023	0.0431685083701604	NA	NA	0.0482779757680197	0.499362421565902	217	28	755	0.755	0.217	0.434
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0190198436353502	0.0477388416386655	NA	NA	0.0512656771072711	0.50310338726225	257	14	729	0.729	0.257	0.514
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0234923729735669	0.0469707918114767	NA	NA	0.0515176173829981	0.66724244672729	361	5	634	0.634	0.361	0.722
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0227746669218272	0.0474798291432454	NA	NA	0.0525509965989582	0.65583284357119	344	6	650	0.65	0.344	0.688
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0221446080316887	0.0490888238607919	NA	NA	0.053996864313684	0.671081157963643	340	7	653	0.653	0.34	0.68
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.023064458473198	0.0467517647992539	NA	NA	0.0541357530082592	0.671875685445856	346	3	651	0.651	0.346	0.692
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0227409131768145	0.0460254073854743	NA	NA	0.0545286645572875	0.655932477193877	349	2	649	0.649	0.349	0.698
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0214496473493134	0.0503889724153185	NA	NA	0.0566152932482784	0.643376154738164	328	7	665	0.665	0.328	0.656
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0233737641515284	0.0488777749130246	NA	NA	0.0546740725875486	0.659121875466501	361	6	633	0.633	0.361	0.722
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0219438353238425	0.0459436611137764	NA	NA	0.0523789114406211	0.669402873804043	338	7	655	0.655	0.338	0.676
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0236823583159946	0.0460250832616142	NA	NA	0.052349083573558	0.662603761207022	367	10	623	0.623	0.367	0.734
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0229427017796838	0.0474523218171905	NA	NA	0.0542739855334613	0.684438807853321	298	8	694	0.694	0.298	0.596
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.0201008510279152	0.046887006767243	NA	NA	0.0527210812843941	0.51253248123724	212	18	770	0.77	0.212	0.424
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.0192046126026806	0.0494411276175333	NA	NA	0.0536859102981664	0.496279317742686	214	12	774	0.774	0.214	0.428
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.0135312635992117	0.0472948818106109	NA	NA	0.049691230241692697	0.313895984881429	115	43	842	0.842	0.115	0.23
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0133929833746992	0.0479072772585231	NA	NA	0.0479205440535626	0.311980318695076	99	49	852	0.852	0.099	0.198
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0139365535804677	0.0475218908169714	NA	NA	0.0488941703860598	0.321713915031475	115	41	844	0.844	0.115	0.23
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0144015247251301	0.0453327486058157	NA	NA	0.0508841446812293	0.33873717000933	116	43	841	0.841	0.116	0.232
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0137240340155999	0.0474377348833761	NA	NA	0.0512937115792604	0.344382230275573	100	41	859	0.859	0.1	0.2
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0191990382129548	0.0471010741171708	NA	NA	0.0517924830285873	0.519934021991795	238	15	747	0.747	0.238	0.476
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0214324663676163	0.0463741661245676	NA	NA	0.0507995007698896	0.511808277815559	229	17	754	0.754	0.229	0.458
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.0196297532812198	0.0475802409817164	NA	NA	0.0525302868315465	0.506570990641688	269	11	720	0.72	0.269	0.538
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0197281233610362	0.0462088347817546	NA	NA	0.0546080381593857	0.541682042408567	222	20	758	0.758	0.222	0.444
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0211492699989337	0.0466072073344521	NA	NA	0.051103676964525	0.514323841105147	241	13	746	0.746	0.241	0.482
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0205866895973642	0.0437149170351821	NA	NA	0.0495927879462309	0.524894557414868	278	12	710	0.71	0.278	0.556
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0203123270153727	0.0450078014438245	NA	NA	0.050911401896992003	0.532110183353498	226	13	761	0.761	0.226	0.452
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0208463113384692	0.0461354593746512	NA	NA	0.0513346019313118	0.5354965947335	260	21	719	0.719	0.26	0.52
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.0242513967433875	0.0455082046572929	NA	NA	0.0524453032100077	0.736233077210744	396	11	593	0.593	0.396	0.792
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0262820621882164	0.0325750957126678	NA	NA	0.0404499036595747	0.745551491910439	629	16	355	0.355	0.629	0.71
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	33.83333333333333	0.0431256509016318	0.0301548153585304	1.43014143475537	0.0129708355431015	0.024740537014343	0.0316530130650124	NA	NA	0.0429088880377042	0.762432639090469	638	20	342	0.342	0.638	0.684
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	34.49999999999999	0.0438614614252191	0.0603340239140544	0.72697722743803	-0.0164725624888354	0.0250452313740851	0.0431468353839502	NA	NA	0.0523133886511547	0.752850986960288	413	8	579	0.579	0.413	0.826
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.49999999999999	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0244823113245518	0.0437503025918076	NA	NA	0.051244834486707	0.780608658269182	407	8	585	0.585	0.407	0.814
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.666666666666664	0.0448452368647073	0.0582817382454872	0.769456063163656	-0.0134365013807799	0.0254395488723372	0.0437021792691349	NA	NA	0.0472652541469593	0.776196866748388	436	5	559	0.559	0.436	0.872
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	35.666666666666664	0.0451830456487547	0.0582817382454872	0.775252197496928	-0.0130986925967325	0.0260438716990412	0.0430799502710291	NA	NA	0.0530602496814442	0.805013082441091	412	7	581	0.581	0.412	0.824
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	36	0.0454110940157692	0.0577207808520962	0.786737347371142	-0.012309686836327	0.0258387974830576	0.0444147197748356	NA	NA	0.0536306050101598	0.81845912095525	439	5	556	0.556	0.439	0.878
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	36.33333333333333	0.0451830456487547	0.0571705240409132	0.790320648738853	-0.0119874783921585	0.0269459997930481	0.0415745951684036	NA	NA	0.0496304026421858	0.809140507440517	378	5	617	0.617	0.378	0.756
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0250429156004296	0.0456668322904513	NA	NA	0.050043798585982	0.792656134419267	401	5	594	0.594	0.401	0.802
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	2	35.666666666666664	0.0444026073250892	0.0582817382454872	0.76186141082584	-0.013879130920398	0.024981523660408	0.0463154515758842	NA	NA	0.0498753806762342	0.780800352010312	408	4	588	0.588	0.408	0.816
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0455259839052049	0.0579999025523778	0.784932075775332	-0.0124739186471729	0.0269699503888865	0.0447523768354449	NA	NA	0.0521319163875973	0.810891541137449	421	3	576	0.576	0.421	0.842
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.166666666666664	0.045296782717305	0.0591439311842398	0.765873722127137	-0.0138471484669348	0.0255349610888908	0.04491878994084	NA	NA	0.0508282732118095	0.785291377862652	393	5	602	0.602	0.393	0.786
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	34.99999999999999	0.0451830456487547	0.0594370287406054	0.760183451395967	-0.0142539830918507	0.025434663323681	0.0428769752713013	NA	NA	0.0513167042958345	0.781192779335939	390	7	603	0.603	0.39	0.78
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000004	2	34.83333333333333	0.0449572769752751	0.0597330472949441	0.752636589144522	-0.014775770319669	0.0254416341973112	0.0457840144276775	NA	NA	0.0518914653918618	0.775840471722348	413	5	582	0.582	0.413	0.826
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.16666666666671	2	35.58333333333333	0.0446782201839994	0.058423686245627	0.764727853633911	-0.0137454660616276	0.0258264272158102	0.044602434441135	NA	NA	0.0521509913794143	0.792110845382789	420	2	578	0.578	0.42	0.84
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666671	1	35.58333333333333	0.0443478924201168	0.0286430990492925	1.54829239475092	0.0157047933708244	0.0259362640257666	0.0291408090324355	NA	NA	0.0387577429475135	0.685327547985536	690	17	293	0.293	0.69	0.586
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	36.08333333333333	0.0442388662657619	0.0282386296527663	1.56660811129084	0.0160002366129955	0.0248595087316068	0.0278723107611172	NA	NA	0.0383166593651852	0.676254871015438	692	18	290	0.29	0.692	0.58
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	36.41666666666666	0.0441303750172001	0.0279752710599065	1.57747801344619	0.0161551039572936	0.025546164054701	0.0292764396129099	NA	NA	0.0385850884346394	0.675444347688361	681	14	305	0.305	0.681	0.61
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.66666666666671	1	35.74999999999999	0.0437016810929818	0.0285069944752381	1.53301608596242	0.0151946866177437	0.0244634451752239	0.0295670673489044	NA	NA	0.0395341591343806	0.70072406722303	671	13	316	0.316	0.671	0.632
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	35.74999999999999	0.0441303750172001	0.0285069944752381	1.5480542873621	0.015623380541962	0.025891504565761	0.0289338493665578	NA	NA	0.0390174767741994	0.68884714881953	669	17	314	0.314	0.669	0.628
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	35.74999999999999	0.0441303750172001	0.0285069944752381	1.5480542873621	0.015623380541962	0.0256512373837347	0.0295351043944049	NA	NA	0.0398784916086742	0.695224755895502	675	11	314	0.314	0.675	0.628
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	35.74999999999999	0.0441303750172001	0.0285069944752381	1.5480542873621	0.015623380541962	0.0254573348371672	0.0297963046065807	NA	NA	0.0384240796705278	0.684298934402488	667	18	315	0.315	0.667	0.63
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	36.41666666666666	0.0439149815636805	0.0279752710599065	1.56977859015702	0.015939710503774	0.0243420325175823	0.0281340491289745	NA	NA	0.037534465841963	0.671078248933046	709	9	282	0.282	0.709	0.564
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	37.58333333333333	0.0595846701692669	0.0551973146854054	1.07948494431055	0.00438735548386144	0.0297133721081478	0.0392290754614754	NA	NA	0.0415504867209017	0.915906903207742	576	8	416	0.416	0.576	0.832
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	37.99999999999999	0.0445124432883257	0.0545695157118212	0.81570163685149	-0.0100570724234956	0.0260120804817623	0.0402133244500154	NA	NA	0.0382941867987135	0.7928383887706	422	21	557	0.557	0.422	0.844
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333337	2	38.49999999999999	0.0444026073250892	0.053834761795598	0.824794349303128	-0.00943215447050888	0.0266278136028389	0.0391405137786713	NA	NA	0.0391896613361491	0.809803402529496	428	16	556	0.556	0.428	0.856
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333337	2	37.83333333333333	0.0444026073250892	0.0548189130040021	0.809987007984771	-0.010416305678913	0.0257247007925885	0.0385573448227688	NA	NA	0.0376534627622053	0.782059571020877	417	12	571	0.571	0.417	0.834
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333337	2	37.83333333333333	0.0444026073250892	0.0548189130040021	0.809987007984771	-0.010416305678913	0.0262307277517928	0.0382143465731815	NA	NA	0.0368062904808328	0.777174223780339	455	17	528	0.528	0.455	0.91
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.50000000000003	2	37.99999999999999	0.0598821656332629	0.0545695157118212	1.09735563624016	0.00531264992144165	0.0298333180072145	0.0386815674755405	NA	NA	0.0399108688437803	0.894104124360613	566	12	422	0.422	0.566	0.844
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	67.83333333333336	2	38.666666666666664	0.0614153696041381	0.0535942229866087	1.1459326431411	0.00782114661752938	0.0308478483036575	0.0373208658025642	NA	NA	0.0407590801333514	0.847830547595439	609	4	387	0.387	0.609	0.774
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.33333333333336	2	37.666666666666664	0.0609472230590743	0.0550706014161129	1.10671068577148	0.0058766216429614	0.0317662439898151	0.0409277351749938	NA	NA	0.0392739028941861	0.881055180938574	576	6	418	0.418	0.576	0.836
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.1666666666667	2	36.83333333333333	0.0611024764460932	0.0563645417845084	1.08405878077921	0.00473793466158472	0.0301683384488157	0.0410445839200859	NA	NA	0.0414580512179243	0.909013760446903	562	7	431	0.431	0.562	0.862
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.83333333333337	2	36.166666666666664	0.0604861633757488	0.0574443341110379	1.0529526420975	0.00304182926471092	0.0309476392462103	0.0421303917188263	NA	NA	0.041348645507355	0.941356210651852	538	6	456	0.456	0.538	0.912
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333337	2	35.666666666666664	0.0600320307551523	0.0582817382454872	1.03003157699746	0.00175029250966509	0.0306661263645776	0.0403768633569792	NA	NA	0.042531720273928	0.96717421065353	537	5	458	0.458	0.537	0.916
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.00000000000004	2	35.99999999999999	0.0585663277285774	0.0577207808520962	1.01464891610957	8.45546876481196e-4	0.0302113836106713	0.041995932365377	NA	NA	0.0411075299275271	0.983589351402441	528	5	467	0.467	0.528	0.934
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.50000000000004	2	36.49999999999999	0.0581404786806199	0.0568993130810351	1.02181336702285	0.00124116559958474	0.0297185937944746	0.0398580347189104	NA	NA	0.0431083853749365	0.977030685418549	518	7	475	0.475	0.518	0.95
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	2	36.16666666666666	0.0578600049104132	0.0574443341110379	1.00723606263016	4.15670799375385e-4	0.0297431263707948	0.0418185434062692	NA	NA	0.0428574789884095	0.992261511378412	510	5	485	0.485	0.51	0.97
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	2	35.49999999999999	0.0573071018565008	0.0585663277285774	0.978499149239604	-0.0012592258720766	0.0279275463294616	0.0438455596607372	NA	NA	0.0428382129041409	0.976549623734632	526	7	467	0.467	0.526	0.934
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333339	2	34.49999999999999	0.0562324166616757	0.0603340239140544	0.932018337477019	-0.00410160725237869	0.0290534889371432	0.0441190457414169	NA	NA	0.0429129481403109	0.923854378377027	467	5	528	0.528	0.467	0.934
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666671	2	34.49999999999999	0.0567646707244322	0.0603340239140544	0.940840127044953	-0.0035693531896222	0.0292980547777071	0.0429812591618539	NA	NA	0.0433181885427628	0.934329839267354	492	3	505	0.505	0.492	0.984
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333339	2	34.49999999999999	0.0562324166616757	0.0603340239140544	0.932018337477019	-0.00410160725237869	0.0275210390519355	0.0426183749607331	NA	NA	0.0436930956841544	0.925209945967178	498	2	500	0.5	0.498	0.996
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	33.83333333333333	0.0413898116754681	0.0615730216404005	0.672206927202523	-0.0201832099649325	0.0230349896893485	0.0461982543345451	NA	NA	0.0392032615546734	0.606668346734528	327	16	657	0.657	0.327	0.654
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	34.49999999999999	0.0413898116754681	0.0603340239140544	0.686011125901825	-0.0189442122385863	0.0240156084787645	0.0431067053818495	NA	NA	0.0410660919771605	0.644575978285239	322	20	658	0.658	0.322	0.644
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	2	35.16666666666666	0.0417741375922484	0.0591439311842398	0.706313171204623	-0.0173697935919914	0.0249882159375718	0.0409129656332682	NA	NA	0.0394251180733329	0.659519378931367	365	17	618	0.618	0.365	0.73
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	2	35.16666666666666	0.0417741375922484	0.0591439311842398	0.706313171204623	-0.0173697935919914	0.0234034951951054	0.0424475626761742	NA	NA	0.0397575309390494	0.662188827833966	340	11	649	0.649	0.34	0.68
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333339	2	35.33333333333333	0.0414852284880391	0.0588537115811214	0.704887208869702	-0.0173684830930823	0.0237563781568008	0.0410702435095407	NA	NA	0.0383077876254735	0.650265769737777	325	15	660	0.66	0.325	0.65
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.33333333333339	2	34.33333333333333	0.0409192381878258	0.0606390724718212	0.674799869454482	-0.0197198342839954	0.0247244752931675	0.0415759681180714	NA	NA	0.0398815258466313	0.620981083183658	305	20	675	0.675	0.305	0.61
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.33333333333339	2	34.33333333333333	0.0409192381878258	0.0606390724718212	0.674799869454482	-0.0197198342839954	0.0235343662284569	0.0438549638025736	NA	NA	0.040316562505828	0.624753279569963	312	18	670	0.67	0.312	0.624
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.33333333333339	2	33.83333333333333	0.0409192381878258	0.0615730216404005	0.664564400084225	-0.0206537834525748	0.0233844806127325	0.0447051926123642	NA	NA	0.0400414716086525	0.605987257418911	317	12	671	0.671	0.317	0.634
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	33.75	0.0272447663451876	0.0617314855970427	0.44134311821086	-0.0344867192518551	0.0196332382640361	0.0431095547611579	NA	NA	0.0377135987166226	0.360487139526648	138	48	814	0.814	0.138	0.276
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	34.08333333333333	0.0273690573365762	0.0611024764460933	0.447920590595409	-0.0337334191095171	0.0194697137306826	0.0464829379855867	NA	NA	0.0386603599976072	0.382903862299436	146	54	800	0.8	0.146	0.292
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.8333333333334	2	34.08333333333333	0.0272138698048233	0.0611024764460933	0.44538079939906	-0.03388860664127	0.01923183958581	0.0428306323247728	NA	NA	0.038894699750828	0.383595215966313	153	44	803	0.803	0.153	0.306
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	1	34.08333333333333	0.0270299523623976	0.0299291581301553	0.903131061851131	-0.00289920576775774	0.0183092584971432	0.0299588986378625	NA	NA	0.0227416888722355	0.898557186236447	394	136	470	0.47	0.394	0.788
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	1	33.416666666666664	0.0271522864979704	0.0305385697640887	0.889114542944304	-0.00338628326611825	0.0196963888347706	0.0308849707605535	NA	NA	0.0222653798313154	0.879118018324762	386	141	473	0.473	0.386	0.772
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	1	33.24999999999999	0.0270909813104956	0.0306948207819131	0.88259128479613	-0.00360383947141746	0.019823322326021	0.030093408018839	NA	NA	0.0234583987352349	0.877903979547947	391	117	492	0.492	0.391	0.782
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.8333333333334	1	33.58333333333333	0.0272138698048233	0.0303839016876759	0.895667386123144	-0.00317003188285264	0.0191041393699796	0.0310637441405975	NA	NA	0.0217493857640218	0.88411661027224	370	132	498	0.498	0.37	0.74
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000007	1	33.91666666666666	0.0273378783823658	0.0300792190929219	0.90886263695585	-0.00274134071055614	0.0200662265727416	0.0324590572479371	NA	NA	0.0206771028880778	0.89452668229389	389	133	478	0.478	0.389	0.778
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666674	1	33.58333333333333	0.0274630224286674	0.0303839016876759	0.903867538506641	-0.00292087925900852	0.0193988250182993	0.030338956019692	NA	NA	0.0226398845261519	0.897345969980299	355	145	500	0.5	0.355	0.71
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666674	1	34.08333333333333	0.0276529018562458	0.0299291581301553	0.923945195384025	-0.00227625627390959	0.0201800061116126	0.0306350671213747	NA	NA	0.0222922516951986	0.918669561148015	391	125	484	0.484	0.391	0.782
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666674	1	34.08333333333333	0.0276529018562458	0.0299291581301553	0.923945195384025	-0.00227625627390959	0.019420668347113	0.0316330742929531	NA	NA	0.0212523065263755	0.914704635977072	395	127	478	0.478	0.395	0.79
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	TTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333341	1	33.74999999999999	0.0270299523623976	0.0302307926160697	0.894119869951058	-0.00320084025367205	0.0189624247218401	0.0302502871098505	NA	NA	0.0212742641248326	0.880404878352619	412	109	479	0.479	0.412	0.824
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCC:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333341	1	34.74999999999999	0.0270299523623976	0.0293435958691742	0.921153374757076	-0.00231364350677658	0.0202651503017885	0.0317718261369794	NA	NA	0.0210635858629271	0.912535543282346	376	137	487	0.487	0.376	0.752
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	1	34.916666666666664	0.0270909813104956	0.0292007684815911	0.927748916182617	-0.00210978717109544	0.0187913134164205	0.0286024195289307	NA	NA	0.021577410443053	0.922108903442189	395	117	488	0.488	0.395	0.79
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCCAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.8333333333334	2	35.58333333333333	0.0412002891133781	0.058423686245627	0.70519838375419	-0.0172233971322489	0.0237186784291506	0.0415666581547517	NA	NA	0.0279855680834059	0.538265146724699	260	49	691	0.691	0.26	0.52
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.5833333333334	2	35.83333333333333	0.0556454425645553	0.0579999025523778	0.959405794075322	-0.0023544599878224802	0.0272918003762813	0.0438899166707988	NA	NA	0.0299992112340774	0.937443006909893	448	14	538	0.538	0.448	0.896
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666674	2	36.33333333333333	0.0573756358851215	0.0571705240409132	1.00358772020458	2.05111844208274e-4	0.0305217937900646	0.0409856888107427	NA	NA	0.0298472129491867	0.994516932421536	483	12	505	0.505	0.483	0.966
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000009	2	35.99999999999999	0.0575131971253351	0.0577207808520962	0.996403656989793	-2.07583726761149e-4	0.0285773820991285	0.0415233871703813	NA	NA	0.0306308189057548	0.994592812442503	500	18	482	0.482	0.5	0.964
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666674	2	35	0.0565638983071324	0.0594370287406054	0.95166093436447	-0.002873130433473	0.0282039953459472	0.0437329579469857	NA	NA	0.0324379519390336	0.929421175550888	469	17	514	0.514	0.469	0.938
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.0833333333334	2	35.333333333333336	0.05765141989764	0.0588537115811214	0.979571523168523	-0.00120229168348136	0.0296152309687343	0.0441647997131744	NA	NA	0.0308673198985266	0.968930005279316	482	11	507	0.507	0.482	0.964
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	2	34.666666666666664	0.0571024790858329	0.0600320307551523	0.951200190423876	-0.00292955166931942	0.0299476726301789	0.0423073581293921	NA	NA	0.0312131845592528	0.925223367757415	440	12	548	0.548	0.44	0.88
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	2	34.833333333333336	0.0572387314369154	0.0597330472949441	0.958242280094762	-0.00249431585802863	0.0295351342087186	0.0432025665637241	NA	NA	0.0318909668508432	0.937657931083224	464	18	518	0.518	0.464	0.928
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	2	34.5	0.0575131971253351	0.0603340239140544	0.953246499972593	-0.00282082678871932	0.0300043755318351	0.0426915715416583	NA	NA	0.0314491061923376	0.928529609342478	448	11	541	0.541	0.448	0.896
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	2	34.5	0.0569668741816511	0.0603340239140544	0.944191527201968	-0.00336714973240334	0.0286605872194204	0.0455733651910819	NA	NA	0.031280345493035	0.914277884281442	421	12	567	0.567	0.421	0.842
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666673	1	34.333333333333336	0.0420179878270026	0.0297068535712844	1.41442067320178	0.0123111342557182	0.0243628803336351	0.0310263923560388	NA	NA	0.0250959860065204	0.623736348323724	662	46	292	0.292	0.662	0.584
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000007	1	34.166666666666664	0.0421163271222965	0.0298546878003148	1.41071068650909	0.0122616393219818	0.02521617718445	0.0307359529334892	NA	NA	0.0257173311038442	0.633515183461387	679	40	281	0.281	0.679	0.562
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.5833333333334	1	34.166666666666664	0.0425143321315747	0.0298546878003148	1.42404209402339	0.012659644331259901	0.0253709305499257	0.0301704383734921	NA	NA	0.0267133850671806	0.635566650284755	647	56	297	0.297	0.647	0.594
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	1	34.166666666666664	0.0569668741816511	0.0298546878003148	1.90813833199925	0.0271121863813363	0.0287321767710363	0.0328752463707115	NA	NA	0.031553814625792	0.390210099715123	804	16	180	0.18	0.804	0.36
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	1	34	0.0568319121182793	0.0300040009602743	1.89414445738505	0.0268279111580049	0.0292933844244545	0.0306758044045428	NA	NA	0.0303905382116624	0.377359561306461	809	20	171	0.171	0.809	0.342
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	1	34.666666666666664	0.042766928969766	0.029415534864961	1.45388921758852	0.013351394104805	0.0245185688285901	0.0311081409196345	NA	NA	0.026703735890366	0.617087571846632	649	47	304	0.304	0.649	0.608
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0243430470813774	0.0295619625185742	NA	NA	0.0261633770535844	0.603280802766362	705	42	253	0.253	0.705	0.506
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.028849710620847	1.48948386556132	0.0141214678750176	0.024315608632244	0.0298930321444023	NA	NA	0.026321588961192	0.591614731723233	712	40	248	0.248	0.712	0.496
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0249852778589616	0.0290702916922747	NA	NA	0.0249015469210053	0.579747606146868	694	44	262	0.262	0.694	0.524
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0239117286377745	0.0303470554998244	NA	NA	0.0263338980767729	0.60053332574346	677	45	278	0.278	0.677	0.556
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0571705240409132	0.744520242876842	-0.0146059115965762	0.0250384092429001	0.0410901204203921	NA	NA	0.0374688992783493	0.696673891407162	360	13	627	0.627	0.36	0.72
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0295112793057211	0.0515446766188633	NA	NA	0.0436113164839316	0.493029981966927	212	2	786	0.786	0.212	0.424
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	3	36	0.0573071018565008	0.0883372767422876	0.648730682786235	-0.0310301748857868	0.0289111621415501	0.0540240998215283	NA	NA	0.0427026202638279	0.467435857801756	206	6	788	0.788	0.206	0.412
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.0281250252711522	0.053203728843027	NA	NA	0.0434359425737007	0.507675194639592	255	2	743	0.743	0.255	0.51
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	3	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.0849965139802523	0.859451690051178	-0.0119461163914659	0.0347914976478146	0.0484555813497034	NA	NA	0.0455945638780632	0.793315682009582	387	1	612	0.612	0.387	0.774
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	4	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.113962844188242	0.648908713450963	-0.0400113615848373	0.0340293682066342	0.0608036294645806	NA	NA	0.0569946658547518	0.482667060036906	236	0	764	0.764	0.236	0.472
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	4	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.112359208671495	0.663077759981812	-0.0378563162722712	0.0321132178856498	0.0582217781150912	NaN	NaN	0.0577103113606176	0.511842497912458	221	2	777	0.777	0.221	0.442
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0332289788214569	0.056071830992774	NaN	NaN	0.0560644358192534	0.540959633095135	275	0	725	0.725	0.275	0.55
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0339931289259359	0.0583937130794995	NaN	NaN	0.054407867113793	0.545603836924447	272	1	727	0.727	0.272	0.544
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0352603729276393	0.0592952056510193	NA	NA	0.0546391145487303	0.539840975695627	272	1	727	0.727	0.272	0.544
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0344667379461024	0.0583457344830801	NA	NA	0.0549790956345913	0.497350601226967	238	0	762	0.762	0.238	0.476
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0326406634189887	0.061053303259029	NaN	NaN	0.0581244993092795	0.478386075757048	254	3	743	0.743	0.254	0.508
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0332841792534909	0.0615287911600614	NaN	NaN	0.0591158662131076	0.493008490838377	246	0	754	0.754	0.246	0.492
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0339511655286477	0.0632040398499901	NaN	NaN	0.0561249561513327	0.461829428363177	214	0	786	0.786	0.214	0.428
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0343146337627771	0.0598419670623143	NaN	NaN	0.0594975893604514	0.469442278228199	253	1	746	0.746	0.253	0.506
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.034221347472496	0.0656859627694802	NaN	NaN	0.0581570839256669	0.452737014966614	232	0	768	0.768	0.232	0.464
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0331805806728806	0.0606774303014021	NA	NA	0.0629850905216029	0.475986735095673	247	0	753	0.753	0.247	0.494
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0356031788687647	0.0640430842968027	NaN	NaN	0.0618786651633821	0.460430482528326	240	1	759	0.759	0.24	0.48
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.033736805966839	0.0650613638886987	NA	NA	0.0622102125374367	0.454414317356114	218	1	781	0.781	0.218	0.436
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.034797681370963	0.0663342192935217	NA	NA	0.0634093164815305	0.462991716168214	222	0	778	0.778	0.222	0.444
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0356764032817685	0.0655962595557809	NA	NA	0.0618503480649576	0.444314717185386	222	0	778	0.778	0.222	0.444
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0329411755124228	0.0629662730352441	NaN	NaN	0.0581921814454904	0.40878581957044	206	1	793	0.793	0.206	0.412
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0366796997784043	0.077763837721455	NaN	NaN	0.0700278798634973	0.308692608324036	148	0	852	0.852	0.148	0.296
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0356203121753725	0.0812742988274922	NaN	NaN	0.0706037874546595	0.301674063534005	126	2	872	0.872	0.126	0.252
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0365090129078211	0.0759885488981571	NA	NA	0.0680453675881595	0.283862017738973	112	1	887	0.887	0.112	0.224
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0345166191113063	0.0825742604096062	NaN	NaN	0.0700339325231835	0.292015480312295	115	0	885	0.885	0.115	0.23
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0348196667308169	0.0792326316636344	NA	NA	0.0722328737298566	0.306954616055695	125	1	874	0.874	0.125	0.25
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0339194761138688	0.0818376593228958	NA	NA	0.067751360647120007	0.299028840056369	115	0	885	0.885	0.115	0.23
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.034752907524485	0.0795607675747728	NA	NA	0.0740214604033059	0.299194531704647	107	0	893	0.893	0.107	0.214
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0332818352947711	0.0818966966918036	NaN	NaN	0.0738157052538635	0.252552089092305	98	0	902	0.902	0.098	0.196
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0286228464247034	0.0742687799832292	NaN	NaN	0.0720279419602133	0.344822734613326	162	1	837	0.837	0.162	0.324
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0281595858786643	0.0763817173117524	NA	NA	0.068398508267865	0.211322701005994	67	3	930	0.93	0.067	0.134
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0273960959964681	0.078682829007815	NA	NA	0.0687414840319447	0.212133839272111	54	3	943	0.943	0.054	0.108
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0264842718836263	0.0780268632625394	NA	NA	0.0683432628012767	0.21507331086222	65	3	932	0.932	0.065	0.13
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0286181650390792	0.0741934372597632	NA	NA	0.0707383737958202	0.25437403007091	78	2	920	0.92	0.078	0.156
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0270805561646565	0.0742910870214826	NaN	NaN	0.0662838558867399	0.239973454202492	71	2	927	0.927	0.071	0.142
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.0267954916853182	0.0718048708120538	NA	NA	0.0637543394106104	0.254842751308889	100	3	897	0.897	0.1	0.2
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.026729978957589	0.0710020860588227	NaN	NaN	0.0653221265831659	0.242534070047323	74	0	926	0.926	0.074	0.148
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0278904650623587	0.0737033998812495	NA	NA	0.0636507070969625	0.230386102312786	98	2	900	0.9	0.098	0.196
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0264318197353512	0.0710166553104726	NA	NA	0.0614606890144575	0.22725612494143	67	4	929	0.929	0.067	0.134
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0268356348477372	0.0719238949766632	NA	NA	0.0619881689324074	0.244834520508442	83	2	915	0.915	0.083	0.166
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0275661839576901	0.070430464273625	NA	NA	0.0633295946289755	0.274625127943058	92	1	907	0.907	0.092	0.184
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0274196260887309	0.0697153697100976	NA	NA	0.0657296959953737	0.271056104808749	90	4	906	0.906	0.09	0.18
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0234755788914603	0.068667486674076	NA	NA	0.0598563859716484	0.164284480476188	34	5	961	0.961	0.034	0.068
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.0236323475184998	0.0684095765118353	NA	NA	0.0601908511872913	0.174196769087724	45	5	950	0.95	0.045	0.09
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0237299325230818	0.0702185881423124	NA	NA	0.0638577077383533	0.178729839336826	44	6	950	0.95	0.044	0.088
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0238224954835237	0.0696958345130507	NA	NA	0.0649063414553627	0.166798069193383	34	4	962	0.962	0.034	0.068
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0238201790898584	0.0722468839199378	NA	NA	0.0614764485011499	0.15151904437845	29	5	966	0.966	0.029	0.058
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0233875437744294	0.0672034320101256	NA	NA	0.0602269182039299	0.158484163809842	36	6	958	0.958	0.036	0.072
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0235110892954914	0.0712069508857454	NA	NA	0.0611343680388426	0.166659969354075	39	5	956	0.956	0.039	0.078
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.0235273040548411	0.0602240714172891	NA	NA	0.0493337677664218	0.279111571948734	67	16	917	0.917	0.067	0.134
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0188220331877166	0.0458834662331153	NA	NA	0.0423079913301782	0.426162524255186	156	57	787	0.787	0.156	0.312
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0195254275422295	0.0448486078597532	NA	NA	0.0387588528550897	0.415986192043092	188	45	767	0.767	0.188	0.376
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	35.58333333333332	0.0272447663451876	0.0584236862456271	0.466330834220972	-0.0311789199004395	0.0187132775397831	0.0443682849335396	NA	NA	0.0387471035389955	0.421005844112092	174	41	785	0.785	0.174	0.348
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	2	35.33333333333332	0.0134532755150005	0.0588537115811214	0.228588395762552	-0.0454004360661209	0.0132172010016516	0.0459176386899086	NA	NA	0.0386159583964096	0.239718362663884	0	113	887	0.887	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666673	1	34.99999999999999	0.0407339920153049	0.0291298749871979	1.39835794122724	0.011604117028107	0.0312368116112797	0.0297356120598155	NA	NA	0.0328604585178415	0.723988626227961	538	134	328	0.328	0.538	0.656
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.3333333333334	1	34.33333333333332	0.040368487510335	0.0297068535712844	1.35889475516035	0.0106616339390506	0.0311904118063981	0.0319250249997156	NA	NA	0.0327455827803888	0.744734587408883	544	131	325	0.325	0.544	0.65
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666673	1	34.16666666666666	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0296539648781865	0.0322351987111095	NA	NA	0.0333638178346585	0.762876675334574	521	132	347	0.347	0.521	0.694
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0299323270974553	0.0314817186948661	NA	NA	0.0320974867694187	0.759449583527059	513	141	346	0.346	0.513	0.692
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000007	1	34.33333333333332	0.0400094855289695	0.0297068535712844	1.34680993505297	0.0103026319576851	0.0301175244731351	0.032023243551488	NA	NA	0.0331226188683545	0.755766252111294	543	125	332	0.332	0.543	0.664
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	34.83333333333332	0.0397005575048303	0.0292720079293014	1.35626355392893	0.0104285495755289	0.030364455058696	0.0317039979156928	NA	NA	0.0328427550860973	0.750841720941033	544	145	311	0.311	0.544	0.622
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	35.16666666666665	0.0396131668795607	0.0289891158257094	1.3664841355537	0.0106240510538513	0.0295187347586002	0.0313155190802426	NA	NA	0.0320202519243642	0.740046617292909	528	138	334	0.334	0.528	0.668
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	35.74999999999999	0.0395261602343306	0.0285069944752381	1.38654252971719	0.0110191657590925	0.0292658107007491	0.0311434252521926	NA	NA	0.0306576450101992	0.719276157828849	564	131	305	0.305	0.564	0.61
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	1	36.08333333333332	0.0400540111089282	0.0282386296527663	1.41841199808378	0.0118153814561619	0.0291888442454806	0.0311456470486726	NA	NA	0.0330036290399969	0.720341448304669	540	118	342	0.342	0.54	0.684
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	1	36.08333333333332	0.0400540111089282	0.0282386296527663	1.41841199808378	0.0118153814561619	0.029926272743296	0.0300250964933731	NA	NA	0.0320074858324561	0.712020158726006	534	133	333	0.333	0.534	0.666
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	36.41666666666666	0.0395261602343306	0.0279752710599065	1.4128964166134	0.011550889174424	0.0290492796300044	0.0292434897770776	NA	NA	0.0318774891454298	0.717088600321443	519	140	341	0.341	0.519	0.682
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000007	1	37.41666666666666	0.0398765009105086	0.0272138698048234	1.46530064252166	0.0126626311056852	0.0298132437622983	0.0281347979069532	NA	NA	0.0323852822881398	0.695797561535437	566	125	309	0.309	0.566	0.618
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5833333333334	1	37.41666666666666	0.0402331091273881	0.0272138698048234	1.47840455679174	0.0130192393225648	0.0297400740434376	0.0273520675300365	NA	NA	0.0323234602690438	0.687110166617483	584	138	278	0.278	0.584	0.556
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	37.24999999999999	0.0397883346582442	0.0273378783823658	1.45542876816328	0.0124504562758784	0.0307829253424844	0.028912881710401	NA	NA	0.0299491095100089	0.677614599807032	546	127	327	0.327	0.546	0.654
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	1	36.24999999999999	0.0392674190316604	0.0281063333749098	1.39710215871537	0.0111610856567506	0.0276386839006454	0.0298724027932232	NA	NA	0.0305612844988924	0.714959564632415	514	139	347	0.347	0.514	0.694
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.24999999999999	0.0396131668795607	0.0281063333749098	1.4094035800103	0.0115068335046509	0.0297840680209612	0.029778208178577	NA	NA	0.0320862100377906	0.719877590641052	545	129	326	0.326	0.545	0.652
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.24999999999999	0.0396131668795607	0.0281063333749098	1.4094035800103	0.0115068335046509	0.0298278503180818	0.0292332597104215	NA	NA	0.0325697216516877	0.723864676855834	557	125	318	0.318	0.557	0.636
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333341	0	36.41666666666666	0.0264053674769446	0	-Inf	0.0264053674769446	0.0269136948845337	0	NA	NA	0.0278064868874132	0.342309551186763	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	0	35.99999999999999	0.026032982222434	0	-Inf	0.026032982222434	0.0273775617845918	0	NA	NA	0.0275737436338708	0.345107229741449	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.99999999999999	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0259124763746043	0	NA	NA	0.0264581076843047	0.328287420143605	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	35.66666666666666	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0256335616482759	0	NA	NA	0.0263580188279268	0.324363724646986	607	393	0	0	0.607	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	36.33333333333332	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0273016481838493	0	NA	NA	0.0276322631354243	0.347174957069326	676	324	0	0	0.676	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	0	36.49999999999999	0.026032982222434	0	-Inf	0.026032982222434	0.0276608621138921	0	NA	NA	0.0259476905601178	0.315722376849212	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000007	0	36.916666666666664	0.0396131668795607	0	-Inf	0.0396131668795607	0.0291837860942613	0	NA	NA	0.0309111353414015	0.200011889080744	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	37.24999999999999	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.030394070514983	0	NA	NA	0.0307430017442183	0.183683623381477	891	109	0	0	0.891	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75000000000006	0	37.24999999999999	0.0418226808888406	0	-Inf	0.0418226808888406	0.0317007076553958	0	NA	NA	0.0311734416642385	0.17972165146401	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75000000000006	0	37.416666666666664	0.0418226808888406	0	-Inf	0.0418226808888406	0.0300926790952425	0	NA	NA	0.031109271440775	0.178825552905002	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000006	0	36.416666666666664	0.0412475068105866	0	-Inf	0.0412475068105866	0.0314175660730025	0	NA	NA	0.0311099781022907	0.184885741763597	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666673	0	36.24999999999999	0.0411531794236845	0	-Inf	0.0411531794236845	0.0296239613951257	0	NA	NA	0.0307111187102086	0.180242377120578	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000006	0	35.916666666666664	0.0409658133601688	0	-Inf	0.0409658133601688	0.0309445589887507	0	NA	NA	0.0308921245618375	0.184809074351708	860	140	0	0	0.86	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000006	0	35.58333333333333	0.0404138163712346	0	-Inf	0.0404138163712346	0.0315011355822523	0	NA	NA	0.0293645725665923	0.168735569062896	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	0	34.75	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.029596197294273	0	NA	NA	0.0302519361419281	0.182559691017288	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	0	35.25	0.0405961546323978	0	-Inf	0.0405961546323978	0.030767592912481	0	NA	NA	0.0297681311689603	0.172647681517435	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666671	0	34.916666666666664	0.0400540111089283	0	-Inf	0.0400540111089283	0.0298470363399984	0	NA	NA	0.0306759539173107	0.191649961467656	855	145	0	0	0.855	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333339	0	34.25	0.0391819232689515	0	-Inf	0.0391819232689515	0.0291661206542201	0	NA	NA	0.0290366537589865	0.177210038952609	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666671	0	33.91666666666667	0.0390120440358434	0	-Inf	0.0390120440358434	0.028857832061361	0	NA	NA	0.030067671510021	0.194467893689001	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000006	0	33.58333333333334	0.0388436318463036	0	-Inf	0.0388436318463036	0.0290769623220959	0	NA	NA	0.0306373642144669	0.204850944022916	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666671	0	33.91666666666668	0.038759969965707	0	-Inf	0.038759969965707	0.0298925276495762	0	NA	NA	0.0302590358704703	0.20021519947174	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333339	0	33.25000000000001	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0282535371636599	0	NA	NA	0.0286338732849854	0.179570650936285	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333339	0	32.00000000000001	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0282593286680939	0	NA	NA	0.0274625967705401	0.168431830198329	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.16666666666668	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0280001690235761	0	NA	NA	0.0275031227529491	0.167267925710948	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.16666666666668	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0286931494968335	0	NA	NA	0.0297763156819379	0.202095394201369	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.33333333333334	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0286923494403147	0	NA	NA	0.0282139708771943	0.178224860789574	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333337	0	32.00000000000001	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0280470270266875	0	NA	NA	0.0285125591524887	0.184659850084907	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.1666666666667	0	32.50000000000001	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0300419357949522	0	NA	NA	0.030784728105247	0.212405198425843	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.1666666666667	0	33.50000000000001	0.0388855983989721	0	-Inf	0.0388855983989721	0.0286990239946212	0	NA	NA	0.0285855088982588	0.173726923384869	892	108	0	0	0.892	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333337	0	32.83333333333334	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0281682728003952	0	NA	NA	0.0292994423589602	0.18823914439304	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000003	0	32.33333333333334	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0275757876298281	0	NA	NA	0.0280406727448849	0.175557490008465	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.6666666666667	0	32.16666666666667	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0280374033797495	0	NA	NA	0.0280934427216129	0.180018578934323	883	117	0	0	0.883	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000003	0	32.41666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.0278851676635283	0	NA	NA	0.0284435922245548	0.180370899939142	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.583333333333336	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.012575484878012	0	NA	NA	0.0128092336078566	0.332636744242574	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.75	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0120201357951345	0	NA	NA	0.0122382511130174	0.30957277803798	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000001	0	32.41666666666667	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.012039730119473799	0	NA	NA	0.0122583958856705	0.308358844457072	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666669	0	33.25	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0112963847233893	0	NA	NA	0.0120951013192211	0.299856979139348	661	339	0	0	0.661	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.583333333333336	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.012180573502991	0	NA	NA	0.0120497932490145	0.302067008432465	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	33.083333333333336	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.011936444690944	0	NA	NA	0.0126915936946705	0.326169690950152	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666669	0	32.75	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0122871638955913	0	NA	NA	0.0121139862574964	0.30962315665532403	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.25000000000003	0	31.916666666666664	0.0122576783566175	0	-Inf	0.0122576783566175	0.0122541985569059	0	NA	NA	0.0120787299940432	0.31019394405101	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.9166666666667	0	32.24999999999999	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0122044517725348	0	NA	NA	0.0121105274412209	0.30948499661298	606	394	0	0	0.606	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.9166666666667	0	32.08333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0118025933462241	0	NA	NA	0.0121558984052365	0.311294274628637	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.74999999999999	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.0131181050454446	0	NA	NA	0.0123925243429553	0.316636458688078	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.74999999999999	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.012846498705674	0	NA	NA	0.0120810895589481	0.304322327604688	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.9166666666667	0	32.08333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0118868161595133	0	NA	NA	0.0124810153496988	0.324066774325939	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC:GAACAAACT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333336	0	32.24999999999999	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0119096596512102	0	NA	NA	0.0117358813319844	0.295284158578056	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA:CAAACTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.41666666666669	0	32.916666666666664	0.012698716061835	0	-Inf	0.012698716061835	0.0127086667032881	0	NA	NA	0.0129273961768811	0.325946939083321	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA:ACTCAAGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000001	0	32.58333333333333	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.0133017277203594	0	NA	NA	0.0130692902486895	0.327114935015265	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	0	32.58333333333333	0.0129174344873365	0	-Inf	0.0129174344873365	0.0131534083355406	0	NA	NA	0.0127706226067752	0.311779064550348	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	1	32.916666666666664	0.026061253903872	0.0310121698640216	0.840355706103191	-0.00495091596014964	0.0181048448571956	0.0313730293787845	NA	NA	0.0224223083929223	0.825245723386166	353	127	520	0.52	0.353	0.706
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333336	1	32.75	0.0262321821040851	0.0311733183159379	0.84149469871077	-0.00494113621185282	0.018038835448094	0.0335689277888918	NA	NA	0.0231285822642794	0.83082962829984	358	127	515	0.515	0.358	0.716
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	32.416666666666664	0.0262896575662818	0.031500692980973	0.834573943568835	-0.00521103541469126	0.0191200356939778	0.0321732353891485	NA	NA	0.0245726832035756	0.8320553927804	366	126	508	0.508	0.366	0.732
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666669	1	32.916666666666664	0.0264636052740321	0.0310121698640216	0.853329689282192	-0.0045485645899895	0.0184249326356384	0.0318067116293808	NA	NA	0.0225814220108087	0.840362748681717	361	132	507	0.507	0.361	0.722
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	1	32.666666666666664	0.0263763446044989	0.0312545223004261	0.843920900500833	-0.00487817769592713	0.0191101358622017	0.031323641640594	NA	NA	0.0227731034563892	0.830384969036454	326	138	536	0.536	0.326	0.652
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	31.499999999999996	0.0259766224970672	0.0324374878453625	0.800821032162051	-0.00646086534829531	0.0181893055564361	0.0359996658064507	NA	NA	0.0250291069617458	0.79630343521481	370	129	501	0.501	0.37	0.74
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	1	31.08333333333333	0.0128071415099282	0.0328819783981324	0.389488167495894	-0.0200748368882042	0.013037402134916	0.0351818239286701	NA	NA	0.0213151252101973	0.346288992004329	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	1	30.749999999999996	0.0124355180497881	0.0332464403304228	0.374040586787535	-0.0208109222806347	0.0121804692586241	0.0339802967342274	NA	NA	0.021515722967684	0.333422806626852	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000003	1	31.749999999999996	0.0123332686697829	0.0321765161581571	0.383300311604936	-0.0198432474883742	0.0119543202655245	0.0326074751165822	NA	NA	0.0212848452813712	0.35119640609204	0	380	620	0.62	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.41666666666669	1	31.58333333333333	0.0122326870775303	0.0323500281131817	0.378135284295033	-0.0201173410356514	0.0128814996469601	0.03200023329411	NA	NA	0.0206378920309276	0.329670923065563	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	1	32.25	0.0124355180497881	0.03166697281676	0.392696773441082	-0.0192314547669719	0.0131399421924859	0.0339280242996416	NA	NA	0.020508602341254	0.348385110135829	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333336	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0283596798673032	0.0330288476114959	NA	NA	0.0333912293288422	0.870019915429273	511	121	368	0.368	0.511	0.736
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000001	1	31.749999999999996	0.037390920168914	0.0321765161581571	1.16205620226648	0.00521440401075692	0.028512867680822	0.0330895442129305	NA	NA	0.031664624352215	0.869199000052781	487	118	395	0.395	0.487	0.79
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000001	1	31.749999999999996	0.037390920168914	0.0321765161581571	1.16205620226648	0.00521440401075692	0.0267479464043373	0.0362817663450869	NA	NA	0.0331853249949545	0.875142539668002	510	141	349	0.349	0.51	0.698
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.25000000000001	1	31.416666666666664	0.0369305370773724	0.0325254218363474	1.13543606792218	0.00440511524102505	0.0281248886140714	0.0317384728384408	NA	NA	0.0324747271021157	0.89209996028665	517	122	361	0.361	0.517	0.722
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000001	2	31.166666666666664	0.0495024994789391	0.0670837952639451	0.737920376808865	-0.017581295785006	0.0300433464501705	0.0511792602023435	NA	NA	0.0431519923696827	0.683694246830578	317	47	636	0.636	0.317	0.634
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000001	2	31.499999999999996	0.0501230313618422	0.0663415654213976	0.7555298257354	-0.0162185340595554	0.0305824944120699	0.047542030257299	NA	NA	0.0394854142640293	0.681257714123415	318	46	636	0.636	0.318	0.636
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	31.83333333333333	0.0507593239355005	0.0656155905923368	0.773586330280301	-0.0148562666568364	0.0303712005866037	0.0482004251009121	NA	NA	0.0408475492979478	0.716081806091078	351	57	592	0.592	0.351	0.702
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000001	2	30.83333333333333	0.0501230313618422	0.0678428326164385	0.73881100521291	-0.0177198012545964	0.0304735950462426	0.0504254375029947	NA	NA	0.0430955080933725	0.680944121201049	319	47	634	0.634	0.319	0.638
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333336	2	29.83333333333333	0.0508669472540708	0.0702267037754945	0.72432485820046	-0.0193597565214237	0.0316229417538847	0.0538710058627163	NA	NA	0.0452872189053631	0.669023700353229	318	39	643	0.643	0.318	0.636
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	29.166666666666664	0.0509750280987295	0.0719113287774619	0.708859493564328	-0.0209363006787324	0.031253614778503	0.0533424893796309	NA	NA	0.0440391295020373	0.634500300354867	286	45	669	0.669	0.286	0.572
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	29.583333333333332	0.0508130785858607	0.0708490996895694	0.717201471980617	-0.0200360211037088	0.0309903152782731	0.0545153831066696	NA	NA	0.0449132006263003	0.65552111596988	312	46	642	0.642	0.312	0.624
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333336	2	29.916666666666664	0.0510292410063947	0.070021663193269107	0.728763623702385	-0.0189924221868744	0.030606120703542	0.0515818830123245	NA	NA	0.0431613758445096	0.659913332614144	280	50	670	0.67	0.28	0.56
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.416666666666668	0.0513569565272317	0.0688161477015357	0.746292232892391	-0.0174591911743041	0.0308868385943304	0.0507079151412749	NA	NA	0.0421517327489319	0.678728623907642	347	43	610	0.61	0.347	0.694
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	30.416666666666668	0.0509209303034166	0.0688161477015357	0.739956129544872	-0.0178952173981191	0.0300968007290093	0.048279779345129	NA	NA	0.0428008900846514	0.675871182181486	314	53	633	0.633	0.314	0.628
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCG:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	30.416666666666668	0.0509209303034166	0.0688161477015357	0.739956129544872	-0.0178952173981191	0.030668470304764	0.0499236345086806	NA	NA	0.0423717804477886	0.672778249730671	312	47	641	0.641	0.312	0.624
N	all	ss13	312	GCG	GCG	CGT	2	AGCGCTTCA:AGTGCGTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	30.083333333333332	0.0511380136321413	0.0696151556756318	0.734581617118206	-0.0184771420434905	0.0330131641824877	0.0524702527092606	NA	NA	0.0436204236945583	0.671865405167953	306	48	646	0.646	0.306	0.612
N	all	ss13	313	TCA	CGT	CAG	2	GCGTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	30.083333333333332	0.0507056829412418	0.0696151556756318	0.728371321576903	-0.01890947273439	0.0311561804797167	0.0562611158843469	NA	NA	0.04295193017838	0.659757980815277	298	54	648	0.648	0.298	0.596
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	29.083333333333336	0.0500707265730996	0.0721276112438599	0.69419637930075	-0.0220568846707603	0.0312069567885358	0.0547415257063635	NA	NA	0.044221808618412	0.61793547854152	317	46	637	0.637	0.317	0.634
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	28.75	0.0494514815652544	0.073005919868405	0.677362625584227	-0.0235544383031505	0.028910305310096	0.0558582902831346	NA	NA	0.0458219906561832	0.60722246520535	273	34	693	0.693	0.273	0.546
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	29.083333333333336	0.0500707265730996	0.0721276112438599	0.69419637930075	-0.0220568846707603	0.0313114924662884	0.0563217242730315	NA	NA	0.0454528711211895	0.627485302762806	300	40	660	0.66	0.3	0.6
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.031456104671896	0.0553530438245176	NA	NA	0.046377825480097	0.605726432644051	260	52	688	0.688	0.26	0.52
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.75	0.0495536228075988	0.0757741689236761	0.653964583333298	-0.0262205461160774	0.0315343405811382	0.0573576775982679	NA	NA	0.046912752066929	0.576215290251315	265	51	684	0.684	0.265	0.53
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.9166666666667	2	27.916666666666668	0.0498625949111442	0.075298294736773	0.662200851765015	-0.0254356998256288	0.0296320433376392	0.0583268119960421	NA	NA	0.0457943275009275	0.578598240466172	260	45	695	0.695	0.26	0.52
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.083333333333336	0.0499664439235005	0.0748283653087125	0.667747367156272	-0.024861921385212	0.0311013674084094	0.0553068389223167	NA	NA	0.0470007453515111	0.596827189263924	280	48	672	0.672	0.28	0.56
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	28.416666666666668	0.0497591768358708	0.0739059002893285	0.673277460136098	-0.0241467234534577	0.0304830427195531	0.05436136427352	NA	NA	0.0464286144132518	0.603005870940602	256	49	695	0.695	0.256	0.512
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.0297315279221063	0.0545964593199307	NA	NA	0.047502318002075	0.584888416737684	239	46	715	0.715	0.239	0.478
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.41666666666669	2	27.91666666666667	0.0489470292290666	0.075298294736773	0.65004166960454	-0.0263512655077063	0.030368846755482	0.055700877319119	NA	NA	0.0467127409753043	0.572677215906158	241	47	712	0.712	0.241	0.482
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.0306587259855427	0.0564176135116021	NA	NA	0.0479186651636492	0.585250514646187	242	45	713	0.713	0.242	0.484
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	28.91666666666667	0.0497591768358708	0.0725641058409195	0.68572714097734	-0.0228049290050487	0.0310808204382913	0.0539797548227261	NA	NA	0.0443948851478826	0.607473147697235	299	50	651	0.651	0.299	0.598
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	29.33333333333334	0.0496048518784087	0.0714826348532436	0.693942689441278	-0.0218777829748349	0.0302110581169793	0.0533996148698076	NA	NA	0.0462922860454959	0.63649783348932	301	41	658	0.658	0.301	0.602
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	29.250000000000004	0.0491475696448996	0.071696340510766	0.685496209357012	-0.0225487708658663	0.0292071196888209	0.0551002419828615	NA	NA	0.0440003987384176	0.608323915638042	265	43	692	0.692	0.265	0.53
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000001	3	29.58333333333334	0.0493497606808473	0.108952531416164	0.452947352754449	-0.0596027707353166	0.0306127305019794	0.0662502099618482	NA	NA	0.0623073562449762	0.33877280519391	135	16	849	0.849	0.135	0.27
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0489470292290666	0.108952531416164	0.449250959044766	-0.0600055021870973	0.0293240112498376	0.0686130194073083	NA	NA	0.0596656468256619	0.314561829239241	125	21	854	0.854	0.125	0.25
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.08333333333336	3	28.58333333333334	0.0479683929216543	0.11306631811959	0.424250065973831	-0.0650979251979358	0.028998357153904	0.0690182250859636	NA	NA	0.0633776489586627	0.304353009287379	121	25	854	0.854	0.121	0.242
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.08333333333336	4	28.58333333333334	0.0479683929216543	0.154888999008431	0.309695286487346	-0.106920606086776	0.0282465086411017	0.086193340590561	NA	NA	0.0869191406039767	0.218653753230902	58	8	934	0.934	0.058	0.116
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.4166666666667	4	28.91666666666667	0.048355111951662	0.152908411727716	0.316235787196377	-0.104553299776054	0.0303001869365017	0.0898022107596221	NA	NA	0.0785583446842966	0.183221922133407	48	6	946	0.946	0.048	0.096
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.08333333333336	4	28.58333333333334	0.0597330472949441	0.154888999008431	0.385650676790111	-0.0951559517134866	0.0317954340109409	0.0860688124825441	NaN	NaN	0.0824506294327596	0.248460762968686	86	3	911	0.911	0.086	0.172
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.75000000000003	4	29.250000000000004	0.0592608224609778	0.150978005779684	0.39251295018067	-0.0917171833187057	0.0302267831399605	0.0849126250309771	NA	NA	0.0802159626776312	0.252881598082346	82	0	918	0.918	0.082	0.164
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.75000000000003	4	29.250000000000004	0.0592608224609778	0.150978005779684	0.39251295018067	-0.0917171833187057	0.0322380520734726	0.0814667036649482	NaN	NaN	0.0820237968922321	0.263491092076926	101	2	897	0.897	0.101	0.202
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.4166666666667	3	29.91666666666667	0.0472132254181562	0.107647107231784	0.438592607198424	-0.0604338818136273	0.0301932188802123	0.0696042389113139	NA	NA	0.0698169141826725	0.386706719899782	169	4	827	0.827	0.169	0.338
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.25000000000004	3	30.250000000000004	0.0473063180425278	0.106372646579413	0.444722582014643	-0.0590663285368855	0.0295484447675239	0.0687676271988737	NA	NA	0.066810697627157	0.376650387011056	164	4	832	0.832	0.164	0.328
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.33333333333339	3	29.83333333333334	0.0467076971411359	0.107970516691131	0.43259677338353	-0.0612628195499953	0.0288919033176744	0.067888949521572	NA	NA	0.0696901382053824	0.379360912851634	154	9	837	0.837	0.154	0.308
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.16666666666671	3	29.666666666666668	0.0462574325972005	0.108623210908842	0.425852193193039	-0.0623657783116415	0.0276885402021543	0.0714403249245122	NA	NA	0.0710484810336051	0.380056682729537	161	8	831	0.831	0.161	0.322
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.41666666666671	3	29.416666666666668	0.0461240417078171	0.109617210244414	0.420773723441549	-0.0634931685365967	0.0285759005441336	0.0712425718865793	NA	NA	0.0730710699305988	0.384888984628327	143	4	853	0.853	0.143	0.286
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.41666666666671	3	29.416666666666668	0.0461240417078171	0.109617210244414	0.420773723441549	-0.0634931685365967	0.0270581166906455	0.0734988175351796	NA	NA	0.0751618281045585	0.398248844629734	152	5	843	0.843	0.152	0.304
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.91666666666671	3	29.583333333333336	0.0584521589012038	0.108952531416164	0.536491976289519	-0.0505003725149602	0.0313820792016305	0.0685035319664221	NA	NA	0.0708540944495639	0.476008186177481	215	3	782	0.782	0.215	0.43
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.25000000000006	3	30.583333333333336	0.0596142865629318	0.105128058952294	0.567063514318133	-0.0455137723893624	0.0313741497271234	0.0652802566794742	NA	NA	0.0709587281667923	0.521255105895724	239	2	759	0.759	0.239	0.478
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.58333333333339	3	30.583333333333336	0.0608235875568599	0.105128058952294	0.578566637328108	-0.0443044713954343	0.031751575606734	0.067031985872342	NA	NA	0.0697610421249804	0.525370362290792	270	3	727	0.727	0.27	0.54
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.25000000000006	3	30.25	0.0618269563075532	0.106372646579413	0.581229839584708	-0.04454569027186	0.0338808218884062	0.0696571708131186	NA	NA	0.0697024669290564	0.52276867155976	240	4	756	0.756	0.24	0.48
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.91666666666671	3	30.583333333333336	0.0620829953645303	0.105128058952294	0.590546386790065	-0.0430450635877639	0.0316842559354657	0.0686049429136514	NA	NA	0.0706191161035123	0.542167622854104	245	3	752	0.752	0.245	0.49
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.08333333333339	3	30.75	0.0370064785139329	0.104516640682884	0.354072598125452	-0.0675101621689507	0.0208710756865362	0.0665371043762902	NA	NA	0.0623202519081558	0.278685016497427	104	3	893	0.893	0.104	0.208
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.58333333333339	3	31.25	0.0372361887723979	0.102724391304868	0.362486341358669	-0.0654882025324702	0.0215493934184503	0.0632225959182572	NA	NA	0.0637789333903555	0.30451469571170797	108	5	887	0.887	0.108	0.216
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333339	3	31.583333333333332	0.0377042739400825	0.101563372279023	0.371238893451652	-0.0638590983389401	0.0215509131918553	0.0635753862034619	NA	NA	0.0606176188642026	0.292123706731574	104	3	893	0.893	0.104	0.208
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333339	3	32.416666666666664	0.038428896281493	0.0987726497511971	0.389064142536353	-0.0603437534697041	0.022487706175006	0.0613040010864787	NA	NA	0.0605155674257719	0.318686450182109	111	6	883	0.883	0.111	0.222
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666671	2	32.333333333333336	0.0253723983888037	0.0645559565784322	0.393029547288599	-0.0391835581896285	0.0175958832778301	0.0495587906900743	NA	NA	0.0543410182786554	0.470867804708041	216	24	760	0.76	0.216	0.432
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAT	2	GTCATATTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.00000000000006	3	32.333333333333336	0.0251069468972921	0.0990447915097998	0.253490834950245	-0.0739378446125077	0.0181936220299339	0.05990637221013	NA	NA	0.0638788985784207	0.24708079914428	100	5	895	0.895	0.1	0.2
N	all	ss13	353	TTG	TAT	TGC	2	ATATTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.3333333333334	3	31.333333333333336	0.0246935885223499	0.102431651254313	0.241073810877476	-0.0777380627319632	0.0171021522934441	0.0671936427012376	NA	NA	0.0708533683207662	0.272567870590683	93	6	901	0.901	0.093	0.186
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	TTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	83.00000000000007	3	31.333333333333336	0.0244919722305394	0.102431651254313	0.239105510168256	-0.0779396790237736	0.0171299047566299	0.0679090971722743	NA	NA	0.063841741480993	0.222151781960465	91	6	903	0.903	0.091	0.182
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	84.50000000000007	3	32	0.0240501568474969	0.100148544468392	0.240144846589232	-0.0760983876208951	0.016440624799541	0.0630223297516585	NA	NA	0.0659839797156121	0.248793091700447	101	4	895	0.895	0.101	0.202
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	83.8333333333334	3	33	0.024244535262862	0.0969087986100047	0.250178885824709	-0.0726642633471426	0.0169299003576317	0.0648382201738786	NA	NA	0.0646888513952913	0.261314851816866	110	4	886	0.886	0.11	0.22
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	33	0.036779585610904	0.0969087986100047	0.379527825527154	-0.0601292129991007	0.0217851185060555	0.0633260379569528	NA	NA	0.0674276618980822	0.372522212213691	155	1	844	0.844	0.155	0.31
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.91666666666674	3	32.66666666666667	0.0366298633763431	0.0979651368127982	0.373907132354025	-0.0613352734364551	0.0207069529847752	0.0635315361614335	NA	NA	0.0690963505965985	0.374714270309762	176	3	821	0.821	0.176	0.352
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.58333333333341	4	31.666666666666664	0.036334047016945	0.138321779350139	0.262677701137513	-0.101987732333194	0.021222341662874	0.0783168304537334	NA	NA	0.0852245362791795	0.231425658416744	84	0	916	0.916	0.084	0.168
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.91666666666676	4	31.333333333333332	0.0361879236985499	0.139939466685309	0.25859698165013	-0.103751542986759	0.0210232740649582	0.0839592741482575	NA	NA	0.0845922679270646	0.220014459345786	66	1	933	0.933	0.066	0.132
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.41666666666676	4	30.5	0.0602128625824297	0.144154737019872	0.41769603848765	-0.0839418744374427	0.0310376933203728	0.0857311459887053	NaN	NaN	0.0900143917424732	0.351058365102239	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.25000000000009	4	30.666666666666668	0.0603340239140543	0.143291427572032	0.421058153557195	-0.0829574036579776	0.0316233170935841	0.082884708134462	NA	NA	0.0944048819536813	0.37954193373017	149	0	851	0.851	0.149	0.298
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.58333333333341	4	30.666666666666668	0.0615730216404005	0.143291427572032	0.429704851739634	-0.0817184059316315	0.0327541798430408	0.083243548377336593	NA	NA	0.0898908419479954	0.363305319212162	174	1	825	0.825	0.174	0.348
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.75000000000007	4	31.166666666666668	0.0622118122355632	0.140762624951505	0.441962575342682	-0.0785508127159418	0.0328364433568402	0.0852168853298512	NaN	NaN	0.0914022470748652	0.390121549715338	172	0	828	0.828	0.172	0.344
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.41666666666674	4	30.833333333333332	0.0640730924879899	0.142438427764417	0.449830101985977	-0.0783653352764272	0.0334406953685161	0.0824532657314484	NaN	NaN	0.0931164863781934	0.400020907196582	169	0	831	0.831	0.169	0.338
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.41666666666674	4	29.833333333333332	0.0649053422482923	0.147714914296514	0.439395998416282	-0.0828095720482218	0.0342491351856494	0.0886317026074471	NA	NA	0.097215949628011	0.394319246889047	160	1	839	0.839	0.16	0.32
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.91666666666674	5	30.66666666666667	0.0791072878500076	0.183841843524739	0.430300775565072	-0.104734555674731	0.0372959632674413	0.0977947601601892	NA	NA	0.103248935844392	0.310397305519226	110	0	890	0.89	0.11	0.22
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.91666666666674	5	31.666666666666668	0.080165223459528	0.177291583548173	0.452165984730719	-0.0971263600886448	0.0390220349295863	0.0923051172508376	NaN	NaN	0.0976054780782009	0.319691871458089	122	0	878	0.878	0.122	0.244
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.41666666666674	5	32.166666666666664	0.0807048841711543	0.174189200634338	0.463317380625519	-0.0934843164631834	0.0371138621127432	0.0910614986035713	NaN	NaN	0.0993598457608091	0.346773451591335	153	0	847	0.847	0.153	0.306
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.25000000000009	5	32.333333333333336	0.0819928280328051	0.173179167487274	0.473456647369726	-0.091186339454469	0.0390095120208531	0.0902793430309316	NaN	NaN	0.103134321505043	0.376614569574203	171	0	829	0.829	0.171	0.342
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.25000000000009	5	31.666666666666668	0.0819928280328051	0.177291583548173	0.462474452491573	-0.0952987555153677	0.0401182622562134	0.093408305157666	NaN	NaN	0.100313610939451	0.342108073141779	128	0	872	0.872	0.128	0.256
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75000000000009	5	32.166666666666664	0.0825574874404692	0.174189200634338	0.473952961146977	-0.0916317131938684	0.0401252000102922	0.0930086079631086	NaN	NaN	0.0979054713620856	0.349314250397943	146	0	854	0.854	0.146	0.292
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.08333333333341	5	32.166666666666664	0.0833225893012241	0.174189200634338	0.478345322200181	-0.0908666113331135	0.0404287499870684	0.0894767224338803	NaN	NaN	0.0958130903552469	0.342939262941569	158	0	842	0.842	0.158	0.316
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAA	AAC	AAC	2	AAACAGCAA:AAGCAACCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AAC	AAA	2	CAACCCACT:CAGCAAACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTC:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTC	TTC	TCC	2	CTTCTCCCT:CTTCTTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TCC	CTG	2	CTCCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KC881006.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.9166666666667	2	36.083333333333336	0.0577903089878649	0.0575822255219405	1.00361367529716	2.08083465924422e-4	0.0288393979991937	0.0450404155020427	NA	NA	0.0569544155419807	0.997084928115179	519	1	480	0.48	0.519	0.96
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000003	2	36.25	0.0579298692281368	0.0573071018565008	1.01086719361931	6.22767371635947e-4	0.029793666568258	0.0454996696532648	NA	NA	0.0550775054093074	0.990978424327404	516	1	483	0.483	0.516	0.966
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333336	2	36.25	0.05765141989764	0.0573071018565008	1.00600829617944	3.44318041139213e-4	0.0277509339080101	0.0442866422048415	NA	NA	0.0558020132839504	0.995076802975588	518	3	479	0.479	0.518	0.958
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.08333333333336	2	36.583333333333336	0.0584949199843536	0.0567646707244322	1.03048109392409	0.00173024925992138	0.0293003641440669	0.043280370801491	NA	NA	0.0526695634737212	0.973793386363702	529	5	466	0.466	0.529	0.932
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333336	2	37.583333333333336	0.0593634822039754	0.0551973146854054	1.07547772101442	0.00416616751856998	0.0310056827923203	0.0416572939456822	NA	NA	0.0552066328693805	0.939844758912674	572	3	425	0.425	0.572	0.85
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75000000000001	2	37.91666666666667	0.05965876642654	0.054693929928504303	1.09077490874263	0.00496483649803569	0.0314874681670892	0.0422733496579228	NA	NA	0.0541718118927051	0.92697627191008	546	3	451	0.451	0.546	0.902
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAC:CAA---AAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.75000000000001	2	36.25	0.0587816013967042	0.0573071018565008	1.02572978727655	0.00147449954020332	0.0293530738982457	0.0434828754797901	NaN	NaN	0.0544254048447495	0.978386260647599	532	3	465	0.465	0.532	0.93
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	0	---AACCAG:---AATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000001	2	37.25	0.0579298692281368	0.0557100557871529	1.03984583051694	0.0022198134409839	0.0288587332644602	0.0410982723019745	NA	NA	0.0531854650107558	0.966708182725661	533	6	461	0.461	0.533	0.922
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000001	2	37.25	0.0579298692281368	0.0557100557871529	1.03984583051694	0.0022198134409839	0.0288239706837755	0.0431729695058211	NA	NA	0.0543995911038023	0.967450794524367	544	1	455	0.455	0.544	0.91
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666669	2	36.833333333333336	0.0575822255219405	0.0563645417845084	1.02160371926889	0.00121768373743202	0.030845044631106	0.0429426850660821	NA	NA	0.0543627667804265	0.982129500132632	517	2	481	0.481	0.517	0.962
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.58333333333336	2	36.666666666666664	0.0572387314369155	0.0566306643811089	1.01073741695338	6.08067055806641e-4	0.0287707286679328	0.0424556709946251	NA	NA	0.0526848800441429	0.990791351442914	519	1	480	0.48	0.519	0.96
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.91666666666669	2	37.33333333333333	0.0429199333819239	0.0555809791152914	0.772205421082907	-0.0126610457333675	0.024084441374875	0.0424369378021502	NA	NA	0.0508858841045094	0.803505795763322	433	4	563	0.563	0.433	0.866
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.41666666666669	2	37.49999999999999	0.0426150118597228	0.0553246126797069	0.770272213317348	-0.012709600819984	0.0237882848966108	0.041089735277283	NA	NA	0.0508731071391168	0.802719237195987	439	5	556	0.556	0.439	0.878
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333336	2	37.24999999999999	0.0566306643811089	0.0557100557871529	1.01652499860121	9.20608593955999e-4	0.0283980946346626	0.0434805619750149	NA	NA	0.0523113645866137	0.985959045892051	525	2	473	0.473	0.525	0.946
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333336	2	37.24999999999999	0.0566306643811089	0.0557100557871529	1.01652499860121	9.20608593955999e-4	0.026420829556461	0.0407515528680669	NA	NA	0.0530044725679017	0.986142632518821	532	3	465	0.465	0.532	0.93
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333336	2	36.416666666666664	0.0702267037754945	0.0570345959917882	1.23130010047946	0.0131921077837063	0.0300106287017089	0.045121950984788	NaN	NaN	0.0539601429403624	0.806860065121927	629	1	370	0.37	0.629	0.74
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.25000000000001	2	36.416666666666664	0.0695747645549367	0.0570345959917882	1.21986950806058	0.0125401685631484	0.0298615418283231	0.0440055871888724	NaN	NaN	0.0528479592632792	0.812433635045176	620	1	379	0.379	0.62	0.758
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.75000000000001	2	36.416666666666664	0.0700625753990949	0.0570345959917882	1.22842240189064	0.0130279794073067	0.0293320265348898	0.0441666485656769	NaN	NaN	0.0576975701986638	0.821358755763071	604	1	395	0.395	0.604	0.79
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.08333333333334	2	36.583333333333336	0.0707237388415596	0.0567646707244322	1.24591119685856	0.0139590681171274	0.0321514482407216	0.041753603436652	NA	NA	0.0535956383819376	0.794515468619463	637	0	363	0.363	0.637	0.726
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666667	2	36	0.0701445435081176	0.0577207808520962	1.21523899144497	0.0124237626560214	0.030629856928406	0.0427825625536274	NA	NA	0.0570275434015296	0.827541718297576	611	0	389	0.389	0.611	0.778
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75	2	36.333333333333336	0.069817817299509	0.0571705240409132	1.22122052352616	0.0126472932585958	0.0305689835262668	0.0445552250026162	NaN	NaN	0.0571552755607442	0.824874777480575	590	1	409	0.409	0.59	0.818
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.66666666666667	2	35.666666666666664	0.068228833654295	0.0582817382454872	1.17067259330718	0.00994709540880778	0.0302230187627042	0.0446383518604824	NA	NA	0.0532571046114245	0.851837053565455	597	1	402	0.402	0.597	0.804
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333334	2	36.333333333333336	0.0694941228620286	0.0571705240409132	1.21555861220191	0.0123235988211154	0.0308774822857147	0.0449093259055682	NA	NA	0.05781678793618	0.831210634386558	607	0	393	0.393	0.607	0.786
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.66666666666669	2	36	0.068228833654295	0.0577207808520962	1.18204973403122	0.0105080528021987	0.0312378214445139	0.0440806781059026	NaN	NaN	0.0560925684875261	0.851398660785204	584	2	414	0.414	0.584	0.828
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.83333333333336	2	35.833333333333336	0.0680739069857003	0.0579999025523778	1.17369002343107	0.0100740044333225	0.0309490428272069	0.0438900895354183	NaN	NaN	0.0556125973397453	0.856252910209538	607	2	391	0.391	0.607	0.782
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000001	2	35.5	0.0534747581886499	0.0585663277285774	0.91306319283797	-0.00509156953992757	0.0262840491972175	0.0459235370094825	NA	NA	0.0518751437863798	0.921812814818284	469	4	527	0.527	0.469	0.938
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333336	2	35.5	0.0400986359257937	0.0585663277285774	0.684670483552064	-0.0184676918027837	0.0226135971104318	0.0442195105960093	NA	NA	0.0523925429039365	0.724473044245665	339	5	656	0.656	0.339	0.678
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AACCAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0401881846005798	0.0582817382454872	0.689550205783226	-0.0180935536449074	0.0232938733730582	0.0461370032116347	NA	NA	0.0497115935919944	0.715880037261022	378	4	618	0.618	0.378	0.756
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA:CAGGATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666669	2	34.916666666666664	0.0397883346582442	0.059584670169267	0.66776126384881	-0.0197963355110228	0.0230879019373321	0.0448675869431775	NA	NA	0.0545787610779496	0.716820528468411	346	6	648	0.648	0.346	0.692
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:GATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666669	2	35.58333333333333	0.0403232602433046	0.058423686245627	0.690186854587985	-0.0181004260023224	0.0227009541110059	0.041943172375296	NA	NA	0.0485830000166968	0.709470684820589	387	2	611	0.611	0.387	0.774
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000001	3	36.58333333333333	0.0547563501152288	0.0868438898173542	0.630514711286996	-0.0320875397021254	0.0275477714264106	0.0523101199983039	NA	NA	0.0535172689019271	0.548790469149925	272	3	725	0.725	0.272	0.544
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000001	3	36.416666666666664	0.0404138163712346	0.0872653886078579	0.463113921979321	-0.0468515722366233	0.0227305466618736	0.0534131401097679	NA	NA	0.0488142883473481	0.337159818732712	164	6	830	0.83	0.164	0.328
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	3	36.08333333333333	0.0398765009105086	0.0881207952860292	0.452520892271505	-0.0482442943755206	0.023386337022672	0.0522317998604864	NA	NA	0.051789688306355	0.351573024298796	169	8	823	0.823	0.169	0.338
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000001	3	36.08333333333333	0.0398765009105086	0.0881207952860292	0.452520892271505	-0.0482442943755206	0.0221512209881668	0.0538652453459453	NA	NA	0.0510604698968424	0.344737367171959	163	3	834	0.834	0.163	0.326
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	3	35.75	0.0394395350433882	0.088993157850987	0.443174913620067	-0.0495536228075988	0.022693614582973	0.0562502056809417	NA	NA	0.0517823314838409	0.338587416927867	136	5	859	0.859	0.136	0.272
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAT	2	GCACGGCCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000001	3	35.08333333333333	0.03909679907621	0.0907908105289244	0.430625069304282	-0.0516940114527144	0.0235629679558055	0.0549631364028736	NA	NA	0.0517999240989219	0.318301009685033	138	5	857	0.857	0.138	0.276
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333336	3	35.666666666666664	0.0391819232689515	0.089213957146024	0.439190509225134	-0.0500320338770725	0.0220742187466751	0.0562030480128455	NA	NA	0.0517376487659224	0.333527342079276	166	5	829	0.829	0.166	0.332
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000001	2	36	0.0393532888030902	0.0577207808520962	0.681787186904645	-0.018367492049006	0.0224387064810875	0.0426351907178127	NA	NA	0.0398915647544649	0.645203667631581	322	15	663	0.663	0.322	0.644
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	36	0.0399650588551816	0.0577207808520962	0.692385970272788	-0.0177557219969146	0.0235352614811042	0.0426787398534484	NA	NA	0.0390972594866399	0.649726360692958	336	15	649	0.649	0.336	0.672
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGT:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333336	2	36.5	0.0405047802473168	0.0568993130810351	0.711867649256689	-0.0163945328337183	0.0232610731400838	0.0429585482943824	NA	NA	0.0381832892978353	0.667658290813012	330	16	654	0.654	0.33	0.66
N	all	ss13	42	CGG	GCC	GGC	2	CGCCGTCCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000001	2	36.83333333333333	0.040687942312311	0.0563645417845084	0.721871251395392	-0.0156765994721974	0.024440971958718	0.0424140377241093	NA	NA	0.0380041966633613	0.679975519246779	342	11	647	0.647	0.342	0.684
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	CGGCCCCAA:CGTCCCCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000001	2	37	0.040687942312311	0.0561009098120238	0.725263501940401	-0.0154129674997128	0.0228336644847244	0.0401410903084623	NA	NA	0.0401982179914615	0.701405301135146	391	13	596	0.596	0.391	0.782
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333334	2	36.5	0.0405047802473168	0.0568993130810351	0.711867649256689	-0.0163945328337183	0.0235024870313535	0.0405972519229667	NA	NA	0.039488858001142	0.678018503106106	327	11	662	0.662	0.327	0.654
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666667	2	35.5	0.0405961546323978	0.0585663277285774	0.69316544517762	-0.0179701730961797	0.0225070905181211	0.0439877701889017	NA	NA	0.0396824475833969	0.650657179561879	301	17	682	0.682	0.301	0.602
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333333	3	35.5	0.0405047802473168	0.089658862987337	0.451765490858807	-0.0491540827400202	0.0234753106628877	0.0542975109652449	NA	NA	0.0524800095878487	0.348951548798302	151	8	841	0.841	0.151	0.302
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333333	3	35.166666666666664	0.0405047802473168	0.09056213746611	0.447259543343646	-0.0500573572187931	0.0232691324606013	0.0581624833673732	NA	NA	0.0550096224084049	0.362835923779344	158	1	841	0.841	0.158	0.316
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333333	3	35.166666666666664	0.0405047802473168	0.09056213746611	0.447259543343646	-0.0500573572187931	0.0222133993019654	0.0543089294339019	NA	NA	0.053404360693319	0.348590301290523	158	5	837	0.837	0.158	0.316
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666666	3	35.166666666666664	0.0408727688266098	0.09056213746611	0.451322925564838	-0.0496893686395002	0.0232829578309027	0.0570368235433199	NA	NA	0.0498084988673646	0.318469366319394	155	6	839	0.839	0.155	0.31
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333333	3	35.5	0.0410592825874941	0.089658862987337	0.457950070070519	-0.048599580399843	0.0235025721538518	0.0548206542248786	NA	NA	0.0548285325073752	0.375406251862101	143	5	852	0.852	0.143	0.286
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333333	3	35.5	0.0410592825874941	0.089658862987337	0.457950070070519	-0.048599580399843	0.023937600086015	0.0543677945057077	NA	NA	0.0529275654820951	0.358499435444607	132	5	863	0.863	0.132	0.264
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75	3	35.5	0.040687942312311	0.089658862987337	0.453808368259784	-0.048970920675026	0.0222551076945582	0.0538880148606842	NA	NA	0.0564378280947999	0.385560359111059	155	3	842	0.842	0.155	0.31
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666667	3	34.83333333333333	0.0408727688266098	0.0914838201648647	0.446775929918014	-0.0506110513382549	0.0242285694252228	0.0551304817695961	NA	NA	0.0535526570712555	0.344622742335269	158	6	836	0.836	0.158	0.316
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333334	3	33.83333333333333	0.0410592825874941	0.0943651299007743	0.435110751510311	-0.0533058473132803	0.0235203567266221	0.058918909168337	NA	NA	0.056205384611582	0.342919878789707	147	5	848	0.848	0.147	0.294
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333334	3	33.25	0.0543223783836108	0.0961313950679982	0.565084677541464	-0.0418090166843874	0.0272382251787486	0.0579229205484342	NA	NA	0.0576899210156454	0.468624066201134	247	0	753	0.753	0.247	0.494
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333334	3	32.75	0.0539558430514737	0.0976988961284261	0.55226666000963	-0.0437430530769525	0.0272446517835265	0.0612240792340746	NaN	NaN	0.059496273733003	0.462203445926641	213	3	784	0.784	0.213	0.426
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666667	3	33.08333333333333	0.0537142229868647	0.0966482688635724	0.555770151068997	-0.0429340458767078	0.0275625097215116	0.0600695829074927	NaN	NaN	0.057054292246706	0.45174314967514	196	3	801	0.801	0.196	0.392
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666667	3	33.08333333333333	0.0537142229868647	0.0966482688635724	0.555770151068997	-0.0429340458767078	0.0261025019972016	0.0616609789682498	NaN	NaN	0.0594918147393955	0.470491313347282	218	2	780	0.78	0.218	0.436
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.83333333333334	3	32.58333333333333	0.0532374199351599	0.0982328346145694	0.541951376482665	-0.0449954146794095	0.0255801693258092	0.0606169604010939	NA	NA	0.0617367247638451	0.466107267672479	237	4	759	0.759	0.237	0.474
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.83333333333334	3	31.916666666666664	0.0525378847838152	0.100428343016685	0.523138022650507	-0.0478904582328694	0.0254445150408178	0.0596476108379799	NA	NA	0.0597191041990191	0.422594255261787	219	1	780	0.78	0.219	0.438
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000001	3	32.58333333333333	0.0534747581886499	0.0982328346145694	0.544367455122981	-0.0447580764259195	0.0263002065685321	0.061517073376426	NA	NA	0.0629270998658353	0.47691774454985	227	0	773	0.773	0.227	0.454
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000001	3	33.25	0.0534747581886499	0.0961313950679982	0.556267368749041	-0.0426566368793484	0.0260348913289521	0.058871005139075	NaN	NaN	0.0571588996534719	0.455497305168158	209	0	791	0.791	0.209	0.418
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666669	3	32.916666666666664	0.0537142229868647	0.097170738715697	0.55278187339938	-0.0434565157288323	0.0267489525452251	0.060951357856494	NaN	NaN	0.0585740015637865	0.458143126279978	227	2	771	0.771	0.227	0.454
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333336	3	33.083333333333336	0.0543223783836108	0.0966482688635724	0.562062611388225	-0.0423258904799616	0.0258125548219757	0.058814119660245	NA	NA	0.0576040087003088	0.462477539687684	229	3	768	0.768	0.229	0.458
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	33.333333333333336	0.0416291816557173	0.0958750286324137	0.434202547311086	-0.0542458469766963	0.0233169358790263	0.0618363983246188	NA	NA	0.055491188685277	0.328293053902136	154	2	844	0.844	0.154	0.308
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333336	3	32.333333333333336	0.0416291816557173	0.0990447915097998	0.420306621086667	-0.0574156098540824	0.0223561711828844	0.0625955107032697	NA	NA	0.0587754729988297	0.328636771127752	131	3	866	0.866	0.131	0.262
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	3	32.5	0.0277167798918218	0.0985020015458152	0.28138291056888	-0.0707852216539934	0.0200408456652185	0.0623384744067056	NA	NA	0.0565781929304824	0.210896419249981	68	12	920	0.92	0.068	0.136
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.0203679018524403	0.0583164667237564	NA	NA	0.0544764612789004	0.21093142761519	61	16	923	0.923	0.061	0.122
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.166666666666664	0.0282386296527663	0.0963891381007337	0.292964852774748	-0.0681505084479674	0.0201158885364488	0.0575259694086189	NA	NA	0.055818492229397	0.22211227543086	70	15	915	0.915	0.07	0.14
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.33333333333336	3	33.166666666666664	0.0277809537602618	0.0963891381007337	0.288216642535269	-0.0686081843404719	0.0197041365928899	0.0614270173531944	NA	NA	0.0542372422244261	0.205884064836728	58	10	932	0.932	0.058	0.116
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.25000000000003	3	33.25	0.0278131522748419	0.0961313950679982	0.289324338372166	-0.0683182427931563	0.0194856281677035	0.0615131449518091	NA	NA	0.058357592173533	0.241726209140836	62	32	906	0.906	0.062	0.124
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0247679389371539	0.0598495769617511	NA	NA	0.0571203256823014	0.358972297482562	148	6	846	0.846	0.148	0.296
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0257630847517483	0.0593718674415049	NA	NA	0.05575278077345	0.347306850217782	154	5	841	0.841	0.154	0.308
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.9166666666667	3	32.916666666666664	0.0423143935004423	0.097170738715697	0.435464359535705	-0.0548563452152547	0.0239080862112339	0.0593177863722751	NA	NA	0.0568435877115036	0.334524695063897	147	8	845	0.845	0.147	0.294
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0262615103676462	0.0601926271612369	NA	NA	0.0580487003474809	0.366709391819174	154	7	839	0.839	0.154	0.308
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	3	33.583333333333336	0.0427161696956043	0.0951140793534504	0.449104590886782	-0.0523979096578461	0.0241287598104954	0.0585761001057932	NA	NA	0.0574116003679868	0.361415536872797	157	5	838	0.838	0.157	0.314
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.9166666666667	3	34.24999999999999	0.0435430609699594	0.0931427851735379	0.467487212120967	-0.0495997242035786	0.0258703804192549	0.0544599912370075	NA	NA	0.0551366752755907	0.368345022498804	169	4	827	0.827	0.169	0.338
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	3	34.24999999999999	0.0431256509016318	0.0931427851735379	0.463005812219194	-0.0500171342719061	0.0260249194887138	0.056347356720456	NA	NA	0.05693238642105	0.379653069803694	191	5	804	0.804	0.191	0.382
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	3	34.24999999999999	0.0431256509016318	0.0931427851735379	0.463005812219194	-0.0500171342719061	0.0250641591051213	0.0566725748881474	NA	NA	0.0561144083630579	0.37274567251833	162	7	831	0.831	0.162	0.324
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTCCA:AGTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333337	3	33.99999999999999	0.0578600049104132	0.0938723572155045	0.616368935719628	-0.0360123523050913	0.0290241777318323	0.0579161939100601	NA	NA	0.0591048904325624	0.54232849358719	271	2	727	0.727	0.271	0.542
N	all	ss13	81	AAA	GTA	AAG	2	AGTCCAGAT:GGTAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333337	2	33.666666666666664	0.0578600049104132	0.0618907677660026	0.934872954382648	-0.00403076285558936	0.029292693684186102	0.047425195593465	NA	NA	0.0469076251438012	0.931522221999666	489	6	505	0.505	0.489	0.978
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.75000000000003	1	33.666666666666664	0.0430225461599401	0.0303071537534075	1.41955085950963	0.0127153924065326	0.0245196367956313	0.0323624465888189	NA	NA	0.0406573380955568	0.754474157438117	640	7	353	0.353	0.64	0.706
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	2	34.33333333333333	0.0437548116643347	0.0606390724718212	0.721561361029516	-0.0168842608074864	0.0250344417968406	0.0462990299929071	NA	NA	0.0545823051787614	0.75706610422847	374	2	624	0.624	0.374	0.748
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	35	0.0439686325106426	0.0594370287406054	0.739751522616149	-0.0154683962299628	0.0246437457513812	0.0435439694558358	NA	NA	0.0530618789960482	0.770656571686037	419	10	571	0.571	0.419	0.838
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	35.166666666666664	0.0445124432883257	0.0591439311842398	0.752612185173565	-0.0146314878959141	0.0256879252607287	0.0458147764367422	NA	NA	0.0495743786937907	0.767885304604893	398	1	601	0.601	0.398	0.796
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.166666666666664	0.0448452368647073	0.0591439311842398	0.758239027517625	-0.0142986943195325	0.026009424373759	0.0450884381051341	NA	NA	0.0535782241694681	0.789565323302911	411	4	585	0.585	0.411	0.822
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	2	35.5	0.0450698784927921	0.0585663277285774	0.769552748836603	-0.0134964492357853	0.0248591510171599	0.0439471788715723	NA	NA	0.0504998462664715	0.789271111714765	395	7	598	0.598	0.395	0.79
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0262238408572413	0.0445593099999017	NA	NA	0.049701246613296	0.791260020249547	384	7	609	0.609	0.384	0.768
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666669	2	35.33333333333333	0.0445124432883257	0.0588537115811214	0.756323468690189	-0.0143412682927957	0.0259386200774031	0.0449578825121823	NA	NA	0.0506290610367757	0.776976319258585	436	0	564	0.564	0.436	0.872
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	2	35.166666666666664	0.044076328753575	0.0591439311842398	0.745238401828118	-0.0150676024306648	0.0255591644362924	0.043605325002523	NA	NA	0.0537086022413666	0.779060511209196	413	4	583	0.583	0.413	0.826
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	35.33333333333333	0.0451830456487547	0.0588537115811214	0.767717862389636	-0.0136706659323667	0.0253635902704884	0.0463849659974309	NA	NA	0.0523500697675696	0.793985006879421	417	7	576	0.576	0.417	0.834
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000003	2	34.666666666666664	0.0449572769752751	0.0600320307551523	0.748888158700455	-0.0150747537798772	0.0256364699994512	0.0462477772190836	NA	NA	0.0533985670759901	0.777708628222902	400	6	594	0.594	0.4	0.8
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	34.5	0.0448452368647073	0.0603340239140544	0.743282711071769	-0.0154887870493471	0.0259638139685595	0.0439826808189119	NA	NA	0.0542588623117658	0.775291008236035	410	6	584	0.584	0.41	0.82
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000004	2	34.33333333333333	0.0446228241484838	0.0606390724718212	0.735875770019732	-0.0160162483233374	0.0247564400746803	0.0420056843871532	NA	NA	0.0534169915629453	0.764303521410989	394	3	603	0.603	0.394	0.788
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.91666666666671	2	34.83333333333333	0.0441845540246642	0.0597330472949441	0.739700317087357	-0.0155484932702799	0.02556315784023	0.0433330607131661	NA	NA	0.0525521640534881	0.767331041033121	393	6	601	0.601	0.393	0.786
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.41666666666671	1	34.83333333333333	0.0438614614252191	0.0292720079293014	1.49840972751697	0.0145894534959176	0.0239715832192852	0.0291269037454171	NA	NA	0.0403819002332922	0.717884949611238	644	12	344	0.344	0.644	0.688
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.75000000000004	1	35.166666666666664	0.043648679432241	0.0289891158257093	1.50569198780222	0.0146595636065317	0.0247422432052345	0.0299377029878207	NA	NA	0.0396684258543264	0.711715992679979	647	13	340	0.34	0.647	0.68
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.91666666666671	1	35.49999999999999	0.0435430609699594	0.0287116399282627	1.51656474791247	0.0148314210416967	0.0249240961311916	0.0302769389770767	NA	NA	0.0387195615838326	0.701684740892658	669	17	314	0.314	0.669	0.628
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	34.83333333333333	0.0431256509016318	0.0292720079293014	1.47327272545806	0.0138536429723304	0.0244408406193256	0.0293091689302836	NA	NA	0.0407342177204986	0.733782413707129	660	21	319	0.319	0.66	0.638
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.91666666666671	1	34.83333333333333	0.0435430609699594	0.0292720079293014	1.48753242603397	0.0142710530406579	0.0235895237419463	0.0298640426869987	NA	NA	0.0413158201976195	0.729783329710331	628	15	357	0.357	0.628	0.714
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.91666666666671	1	34.83333333333333	0.0435430609699594	0.0292720079293014	1.48753242603397	0.0142710530406579	0.0250051663174648	0.0290440254804059	NA	NA	0.0384598254106781	0.710589933773179	656	16	328	0.328	0.656	0.656
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.91666666666671	1	34.83333333333333	0.0435430609699594	0.0292720079293014	1.48753242603397	0.0142710530406579	0.0250750233569924	0.0297827741252492	NA	NA	0.0390991154395788	0.715113775422919	655	15	330	0.33	0.655	0.66
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000004	1	35.49999999999999	0.0433333505001085	0.0287116399282627	1.50926072521036	0.0146217105718458	0.0249130773017948	0.0286594883904941	NA	NA	0.0393033717449493	0.709876628411708	645	19	336	0.336	0.645	0.672
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.75000000000004	2	36.666666666666664	0.0587816013967042	0.0566306643811089	1.03798184321342	0.00215093701559527	0.0286422951629266	0.040634837339913	NA	NA	0.0412765407892079	0.958440726911217	540	5	455	0.455	0.54	0.91
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	2	37.08333333333333	0.0439149815636805	0.0559700169039056	0.784616192613944	-0.0120550353402251	0.0259707101403129	0.0399473829029485	NA	NA	0.0405111550147014	0.766028907084274	408	15	577	0.577	0.408	0.816
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	2	37.58333333333333	0.0438080716173109	0.0551973146854054	0.793663095152236	-0.0113892430680946	0.0261926770491526	0.0380415920448944	NA	NA	0.0392489229684801	0.771678719142772	423	14	563	0.563	0.423	0.846
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	2	36.916666666666664	0.0438080716173109	0.0562324166616758	0.779053688566927	-0.0124243450443649	0.0254313359086496	0.0403001752695287	NA	NA	0.0381977113956313	0.744981182569441	390	19	591	0.591	0.39	0.78
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	2	36.916666666666664	0.0438080716173109	0.0562324166616758	0.779053688566927	-0.0124243450443649	0.0261302463786812	0.0426242644196956	NA	NA	0.0374059586177675	0.739776887030798	388	17	595	0.595	0.388	0.776
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.6666666666667	2	37.08333333333333	0.0437016810929818	0.0559700169039056	0.780805215192499	-0.0122683358109238	0.0250558531318348	0.0389891019495834	NA	NA	0.037405236560259	0.742923422604203	415	13	572	0.572	0.415	0.83
N	all	ss13	110	TAT	GGT	ATT	2	TGGTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	2	37.75	0.0447894260262167	0.0549444688504895	0.815176249097869	-0.0101550428242727	0.0249487969138383	0.0391733661306168	NA	NA	0.0398044298638293	0.798627765397743	420	17	563	0.563	0.42	0.84
N	all	ss13	111	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTAC:TATTTCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	36.75	0.0444574574471551	0.0564972895530331	0.786895403281667	-0.012039832105878	0.026627362437631	0.0405454095384299	NA	NA	0.0394023685246307	0.759938822312377	382	15	603	0.603	0.382	0.764
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.1666666666667	2	36.08333333333333	0.0446782201839994	0.0575822255219405	0.775902976639478	-0.0129040053379411	0.027078305976285	0.0401398097841115	NA	NA	0.0397560674022319	0.74549932816351006	399	15	586	0.586	0.399	0.798
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	2	35.416666666666664	0.0442388662657619	0.0587096677913667	0.7535192742526	-0.0144708015256048	0.0261168814213786	0.0425263214679546	NA	NA	0.0412141179070128	0.725503776707318	359	17	624	0.624	0.359	0.718
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	2	34.916666666666664	0.0439149815636805	0.059584670169267	0.737018119575516	-0.0156696886055865	0.0259943853749408	0.0432557880664818	NA	NA	0.0415327908054034	0.705962003815746	332	16	652	0.652	0.332	0.664
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000004	2	35.24999999999999	0.0428688103799615	0.0589984642956841	0.726608919261267	-0.0161296539157227	0.0246871094524364	0.0413412230953788	NA	NA	0.039942688539602	0.686345135550211	358	13	629	0.629	0.358	0.716
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000004	2	35.74999999999999	0.0425646124443371	0.0581404786806199	0.732099449647724	-0.0155758662362828	0.0246324641550209	0.0414672186866435	NA	NA	0.0402232706145084	0.69858209324213	358	17	625	0.625	0.358	0.716
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333339	2	35.416666666666664	0.042364201600918	0.0587096677913667	0.721588167581961	-0.0163454661904487	0.0245616823437103	0.0423941428437299	NA	NA	0.0413922323690853	0.692922509303453	343	17	640	0.64	0.343	0.686
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000006	2	34.74999999999999	0.0419689902360334	0.0598821656332629	0.70085959303918	-0.0179131753972295	0.0241093871359183	0.0409254135353365	NA	NA	0.0398710700498798	0.653231473611702	343	17	640	0.64	0.343	0.686
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	33.74999999999999	0.0412002891133781	0.0617314855970427	0.66741126857559	-0.0205311964836647	0.0242757299358246	0.0453833191739951	NA	NA	0.0433851982573027	0.636048782471459	300	10	690	0.69	0.3	0.6
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	33.74999999999999	0.041581086362894	0.0617314855970427	0.673579875176145	-0.0201503992341487	0.0250236372214904	0.0458134091958724	NA	NA	0.0427143497417708	0.637106835577342	343	16	641	0.641	0.343	0.686
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.66666666666671	2	33.916666666666664	0.0412948328872705	0.0614153696041381	0.67238597037586	-0.0201205367168676	0.0253972461845834	0.0452132569044474	NA	NA	0.0419428425747144	0.631431315291645	308	18	674	0.674	0.308	0.616
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333339	2	33.24999999999999	0.0270299523623976	0.0626996766264699	0.431101942094967	-0.0356697242640723	0.0185500003488621	0.048031738348376	NA	NA	0.0396974359169415	0.368897861650868	111	44	845	0.845	0.111	0.222
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333339	2	33.916666666666664	0.0270299523623976	0.0614153696041381	0.440117067382696	-0.0343854172417405	0.0191075884567247	0.0449099407303919	NA	NA	0.0404263115982625	0.395008131235046	153	53	794	0.794	0.153	0.306
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666671	2	34.58333333333333	0.0272757331281561	0.0601826482875393	0.453215900334574	-0.0329069151593831	0.0192459545720668	0.0443313538207378	NA	NA	0.0375861361692739	0.38129825014059	171	40	789	0.789	0.171	0.342
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666671	2	34.58333333333333	0.0272757331281561	0.0601826482875393	0.453215900334574	-0.0329069151593831	0.0194431211344961	0.0432044913585942	NA	NA	0.0384060412223455	0.391546516328325	156	65	779	0.779	0.156	0.312
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666671	2	34.74999999999999	0.0270909813104956	0.0598821656332629	0.452404835797177	-0.0327911843227673	0.0194679355264042	0.0425952224125913	NA	NA	0.0373833545577773	0.380399723870585	145	54	801	0.801	0.145	0.29
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666671	2	33.75	0.0267288865855191	0.0617314855970427	0.432986284503082	-0.0350025990115237	0.0190338285966449	0.0430657640009978	NA	NA	0.0396627995215209	0.377504048021994	152	41	807	0.807	0.152	0.304
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666671	2	33.75	0.0267288865855191	0.0617314855970427	0.432986284503082	-0.0350025990115237	0.0196213387262683	0.0425732470000305	NA	NA	0.0392050857760479	0.371960209239423	160	53	787	0.787	0.16	0.32
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666671	2	33.25	0.0267288865855191	0.0626996766264699	0.426300230298715	-0.0359707900409508	0.0182560584451335	0.0444113422708221	NA	NA	0.0406561412697386	0.376287911965803	134	47	819	0.819	0.134	0.268
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333339	2	33.166666666666664	0.0133485169832455	0.0628640039123036	0.212339592652528	-0.0495154869290581	0.0137334100371804	0.0443806666545103	NA	NA	0.0359069851838297	0.16789686313458	0	119	881	0.881	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTT	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000006	2	33.5	0.0134081783305544	0.0622118122355632	0.215524638307991	-0.0488036339050088	0.0136689352390255	0.0440237372905154	NA	NA	0.0364495548824023	0.18059139539555	0	127	873	0.873	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTTTGG	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666673	2	33.5	0.013333684515963	0.0622118122355632	0.214327215954992	-0.0488781277196002	0.0135666453690604	0.0449997569617418	NA	NA	0.0380028552343109	0.19838378072818	0	133	867	0.867	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTTTGGGTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666673	1	33.5	0.0132453773639628	0.0304610393656427	0.434830118728725	-0.0172156620016799	0.0135506417634086	0.029940837734776	NA	NA	0.0181269578189761	0.342250966293703	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000007	1	33.166666666666664	0.0133633824875953	0.0307735475083969	0.434249008306534	-0.0174101650208015	0.0144612439455266	0.0307760344565216	NA	NA	0.018265995568708	0.340515979797318	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666673	1	32.99999999999999	0.013333684515963	0.0309322189005369	0.431061365459674	-0.0175985343845739	0.0136213423494707	0.0319032479356008	NA	NA	0.0184698948428429	0.340679929724767	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.3333333333334	1	33.33333333333333	0.0133932130500048	0.0306164958901914	0.437450879357348	-0.0172232828401865	0.0139322633097305	0.0308072272578601	NA	NA	0.0185017439833478	0.351905032644238	0	366	634	0.634	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000007	1	33.66666666666666	0.0134532755150005	0.0303071537534075	0.443897689121926	-0.016853878238407	0.0140094546710868	0.0309262677044475	NA	NA	0.0179203661691758	0.346967619662309	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666674	1	33.33333333333333	0.0135138791270087	0.0306164958901914	0.44139209057357	-0.0171026167631827	0.0140906659255608	0.0307028345625742	NA	NA	0.0170696019389375	0.316375407506	0	397	603	0.603	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTA:GGAGCCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666674	1	33.83333333333333	0.0136058153029875	0.0301548153585304	0.451198760172101	-0.0165490000555428	0.0145650403865712	0.030074551621557	NA	NA	0.0170814734740502	0.332631297979303	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	140	TTA	CCT	TAA	2	GCCTTAAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666674	1	33.83333333333333	0.0136058153029875	0.0301548153585304	0.451198760172101	-0.0165490000555428	0.0140687066936133	0.0308323827343221	NA	NA	0.017043260062047	0.331548438246138	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	141	AAC	TAA	ACA	2	TTAAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333341	1	33.49999999999999	0.0133041182530361	0.0304610393656427	0.436758512844509	-0.0171569211126065	0.0132018044550722	0.0314245987957241	NA	NA	0.0174832102627137	0.326426582365159	0	363	637	0.637	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCA:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333341	1	34.49999999999999	0.0133041182530361	0.0295604764056575	0.45006440594746	-0.0162563581526213	0.0132378018364506	0.0292584800329724	NA	NA	0.0161006180868051	0.312652018436596	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.66666666666674	1	34.666666666666664	0.013333684515963	0.029415534864961	0.453287168741769	-0.016081850348998	0.0137653632396929	0.0283167398693836	NA	NA	0.0167895823682718	0.338139937855292	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	2	35.33333333333333	0.0270299523623976	0.0588537115811214	0.4592735383416	-0.0318237592187238	0.0195022576933604	0.0417894951426658	NA	NA	0.0227089132667205	0.161101228544303	0	144	856	0.856	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.8333333333334	2	35.83333333333333	0.0412002891133781	0.0579999025523778	0.710351005782664	-0.0167996134389998	0.0240268820539596	0.0420874577725746	NA	NA	0.026580749089119	0.527372618685236	212	39	749	0.749	0.212	0.424
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666674	2	36.33333333333333	0.0424641704996309	0.0571705240409132	0.742763359475978	-0.0147063535412823	0.024033154199092	0.0428492030516128	NA	NA	0.025553774823704	0.564949059685676	262	40	698	0.698	0.262	0.524
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.33333333333341	2	36.166666666666664	0.0426655308015385	0.0574443341110379	0.742728268362682	-0.0147788033094993	0.0248158128385364	0.0421805906572918	NA	NA	0.027126346393603	0.585881701848042	231	48	721	0.721	0.231	0.462
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000007	2	35.166666666666664	0.0419689902360334	0.0591439311842398	0.709607721294268	-0.0171749409482064	0.0237282034156563	0.0436799575562419	NA	NA	0.0263268074428631	0.514159534264257	217	43	740	0.74	0.217	0.434
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666673	2	35.5	0.0427669289697661	0.0585663277285774	0.730230673979887	-0.0157993987588114	0.0254418042632238	0.042931655301609	NA	NA	0.0268801749550781	0.556685725944518	258	41	701	0.701	0.258	0.516
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	2	34.833333333333336	0.042364201600918	0.0597330472949441	0.709225521204973	-0.0173688456940261	0.024811352241283	0.0416544798367156	NA	NA	0.0273145705750672	0.524853289635905	239	46	715	0.715	0.239	0.478
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	2	35	0.042464170499631	0.0594370287406054	0.714439658229767	-0.0169728582409744	0.0245999193932853	0.0423623272347383	NA	NA	0.0269814699135587	0.529312329310203	239	41	720	0.72	0.239	0.478
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.3333333333334	2	34.66666666666667	0.0426655308015385	0.0600320307551523	0.710712768914231	-0.0173664999536138	0.0250177666782247	0.0448958363144022	NA	NA	0.0277127323892269	0.530881204717782	231	44	725	0.725	0.231	0.462
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000007	2	34.66666666666667	0.0422647024133488	0.0600320307551523	0.704035860218196	-0.0177673283418035	0.0249480224957691	0.0422488585921838	NA	NA	0.0280051179984006	0.525799273457295	204	55	741	0.741	0.204	0.408
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.5	0.0277167798918218	0.0295604764056575	0.937629675228009	-0.00184369651383563	0.0198567167040033	0.0301421345945552	NA	NA	0.0220150232576936	0.933257430270942	386	130	484	0.484	0.386	0.772
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.3333333333334	1	34.333333333333336	0.0277809537602618	0.0297068535712844	0.935169848721906	-0.00192589981102255	0.019914924297631	0.0301707437570893	NA	NA	0.0216820768072856	0.929221379877936	378	129	493	0.493	0.378	0.756
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.66666666666673	1	34.333333333333336	0.0280406490537152	0.0297068535712844	0.943911780708418	-0.00166620451756912	0.0208361606202447	0.0303093268221926	NA	NA	0.0219620531108902	0.939524569590946	373	119	508	0.508	0.373	0.746
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000007	1	34.333333333333336	0.0422647024133488	0.0297068535712844	1.42272564517581	0.0125578488420644	0.0243377930354705	0.0300832884676072	NA	NA	0.0265556217856843	0.636292711403755	631	46	323	0.323	0.631	0.646
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATCGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666673	1	34.166666666666664	0.0421656696333547	0.0298546878003148	1.41236344239748	0.01231098183304	0.0231324916997419	0.0307357161001258	NA	NA	0.0258377096083463	0.633737140038782	633	47	320	0.32	0.633	0.64
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.83333333333333	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0262933710692169	0.0318706321176078	NA	NA	0.0259981286081423	0.600980110214696	684	46	270	0.27	0.684	0.54
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35	0.0429711784958646	0.0291298749871979	1.47515835597474	0.0138413035086667	0.0252615085421188	0.0315669225959106	NA	NA	0.0258278692820994	0.592023694324111	649	50	301	0.301	0.649	0.602
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.66666666666673	1	35.5	0.0430740368144066	0.0287116399282627	1.50022906814201	0.0143623968861439	0.0256444756837873	0.0288188688096787	NA	NA	0.0253215210735817	0.570577499629766	689	44	267	0.267	0.689	0.534
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	1	35.833333333333336	0.042464170499631	0.0284394261467203	1.49314442142947	0.0140247443529107	0.02460771800788	0.0295407179828806	NA	NA	0.0255369356546788	0.582871985332463	666	55	279	0.279	0.666	0.558
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666673	1	35.833333333333336	0.042464170499631	0.0284394261467203	1.49314442142947	0.0140247443529107	0.0243755422368971	0.0290024634390263	NA	NA	0.024591805120269	0.568473195988822	676	49	275	0.275	0.676	0.55
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.3333333333334	2	36.5	0.0426655308015385	0.0568993130810351	0.749842634141733	-0.0142337822794966	0.025206296316806	0.0430573125277859	NA	NA	0.0395076575152026	0.718638446328207	365	11	624	0.624	0.365	0.73
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.00000000000006	3	36.5	0.0577207808520961	0.0870541284395655	0.663044727306264	-0.0293333475874694	0.0295583119280431	0.0513283392031135	NA	NA	0.044841145123886	0.513007808268584	234	5	761	0.761	0.234	0.468
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	3	36.166666666666664	0.0574443341110378	0.0879053734766805	0.65347921110052	-0.0304610393656427	0.0285931720516653	0.0528258093978141	NA	NA	0.0441709869870777	0.490435417983284	249	12	739	0.739	0.249	0.498
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666671	3	36.833333333333336	0.0579999025523778	0.0862192295848232	0.672702630627394	-0.0282193270324454	0.0300528864598426	0.0498336646361324	NA	NA	0.0438307215974415	0.519688732476978	243	15	742	0.742	0.243	0.486
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.66666666666671	3	37.5	0.073228852172937	0.0845966206090083	0.865623846978341	-0.0113677684360713	0.0317170472732819	0.0507546100438929	NA	NA	0.0442043914416149	0.797052342574296	388	4	608	0.608	0.388	0.776
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA:TTGCCAAAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.83333333333339	4	38	0.0741343759774744	0.113423227292943	0.653608416431359	-0.0392888513154683	0.0336511206404335	0.0573384747139228	NaN	NaN	0.0558637224172661	0.481869978009179	258	1	741	0.741	0.258	0.516
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC:CCAAAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.33333333333339	4	38.5	0.0746885290720774	0.111834664347976	0.667847751030776	-0.0371461352758985	0.0324063934611226	0.0597490139812623	NA	NA	0.0543973307980688	0.494690967231422	245	0	755	0.755	0.245	0.49
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC:AAGGGCTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0332416242671118	0.0571417498264354	NaN	NaN	0.0535795577047378	0.522357343332705	250	0	750	0.75	0.25	0.5
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0350996830261748	0.0578166139905382	NaN	NaN	0.0552221952425005	0.551543652811751	280	0	720	0.72	0.28	0.56
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0356161935833477	0.0598969588572492	NaN	NaN	0.0539017208164834	0.534309987662685	272	0	728	0.728	0.272	0.544
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0338026385296034	0.0586813278527033	NA	NA	0.0580244969202351	0.520195057982012	230	2	768	0.768	0.23	0.46
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0340873605890248	0.0609628646007868	NaN	NaN	0.0570786894222103	0.470362481799196	227	0	773	0.773	0.227	0.454
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.033480050874347	0.0646581748654997	NaN	NaN	0.0588145574581192	0.490795794757744	223	1	776	0.776	0.223	0.446
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0326477100280357	0.0627901631207462	NA	NA	0.0572936412276407	0.471015323006292	228	3	769	0.769	0.228	0.456
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0322041947592505	0.0632661612370243	NaN	NaN	0.0594272757408666	0.468916746263775	217	1	782	0.782	0.217	0.434
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.0341098665594174	0.0634291432380584	NaN	NaN	0.0606926674368128	0.471838542651654	227	0	773	0.773	0.227	0.454
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0339020410753826	0.0645346122526257	NaN	NaN	0.0614576989172708	0.465092844787951	232	0	768	0.768	0.232	0.464
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0339621998990174	0.0623945440833346	NaN	NaN	0.0633081001675797	0.470619318631876	208	0	792	0.792	0.208	0.416
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0331938495372912	0.0673574440674262	NA	NA	0.0606172714152463	0.442644970579089	212	0	788	0.788	0.212	0.424
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0344094160345233	0.0644007217344156	NaN	NaN	0.0632653261109308	0.461974229318775	218	2	780	0.78	0.218	0.436
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCC:GCCTCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0331898104075441	0.0675229614411913	NA	NA	0.0609661689871985	0.437736540920883	204	2	794	0.794	0.204	0.408
N	all	ss13	185	TCC	CTT	CCC	2	TCTTCCCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0332625755390087	0.0653774034825482	NaN	NaN	0.0610388918469797	0.43098454049542	186	0	814	0.814	0.186	0.372
N	all	ss13	186	CGC	CCC	GCT	2	TCCCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0369420549856539	0.0767225249379695	NaN	NaN	0.0668349525867288	0.28615207994599	138	1	861	0.861	0.138	0.276
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0373773457896462	0.084286334049563	NaN	NaN	0.0699165804378637	0.296947404600897	122	0	878	0.878	0.122	0.244
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0364922401168398	0.080516760130683	NaN	NaN	0.0721254716503123	0.311988057901033	141	0	859	0.859	0.141	0.282
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.035048691554862	0.0806835117865559	NaN	NaN	0.0699084423752807	0.291150096926626	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0372439205814545	0.0796469095549411	NaN	NaN	0.0743452884973597	0.32090258586656	124	0	876	0.876	0.124	0.248
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.035765102210388	0.0791839412139567	NaN	NaN	0.0692691563127316	0.309742404120209	136	2	862	0.862	0.136	0.272
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0344091506989564	0.0784886737207488	NaN	NaN	0.070395671713497407	0.274994155381297	107	0	893	0.893	0.107	0.214
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0327104756033214	0.0835628660160723	NA	NA	0.0751107108759739	0.260824067037296	86	1	913	0.913	0.086	0.172
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0299634241585645	0.0779515011021146	NaN	NaN	0.0763732336414196	0.372966122575256	149	0	851	0.851	0.149	0.298
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0273692734202835	0.0781246754363531	NA	NA	0.0745635224088786	0.25155105007231	89	2	909	0.909	0.089	0.178
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0263478723236278	0.075437657693089	NaN	NaN	0.0723143009217343	0.23559324043144	69	3	928	0.928	0.069	0.138
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0273290910841648	0.0760356975539936	NA	NA	0.0675629312958999	0.209822420926986	61	4	935	0.935	0.061	0.122
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0271942352989487	0.0762609479200806	NA	NA	0.0659718047460341	0.221654283627942	74	0	926	0.926	0.074	0.148
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0250963571126725	0.0740779527124476	NA	NA	0.0640507280573775	0.223976785710872	86	2	912	0.912	0.086	0.172
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.0271977986698001	0.069035702088804	NA	NA	0.0632529692657861	0.251096180500652	105	2	893	0.893	0.105	0.21
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0259432734088514	0.071215402721135	NA	NA	0.0643932625539469	0.235806258812207	70	1	929	0.929	0.07	0.14
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0286459921898992	0.0721917528343238	NA	NA	0.0666821556513691	0.25227530064175	90	0	910	0.91	0.09	0.18
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0261713494643355	0.0675453115352885	NA	NA	0.0640253186697478	0.246419222710582	91	2	907	0.907	0.091	0.182
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0276814399915581	0.0706334506006873	NA	NA	0.0621914935642898	0.246380605257336	76	2	922	0.922	0.076	0.152
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0274603345614624	0.0693294738139033	NA	NA	0.0604083797818824	0.252083721978837	86	5	909	0.909	0.086	0.172
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0278463231996263	0.0690865191994922	NaN	NaN	0.0654373941640126	0.268921285188023	82	1	917	0.917	0.082	0.164
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.6666666666667	4	34.66666666666666	0.0412948328872706	0.125290563497375	0.329592522649448	-0.0839957306101041	0.0230791154076418	0.0670948186827836	NA	NA	0.0603379553948969	0.163895817038449	25	8	967	0.967	0.025	0.05
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.9166666666667	4	35.08333333333332	0.0411531794236846	0.123672788927057	0.332758562176172	-0.0825196095033722	0.0221082355573497	0.0705370986382526	NA	NA	0.0618888275744621	0.182416223844492	40	7	953	0.953	0.04	0.08
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	4	34.24999999999999	0.0403232602433046	0.126951325912032	0.317627720337839	-0.086628065668727	0.0229088840503185	0.0714074476845119	NA	NA	0.0623649249540978	0.164817221375215	36	11	953	0.953	0.036	0.072
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000004	4	33.41666666666666	0.0398765009105086	0.130408872715656	0.305780581337096	-0.0905323718051471	0.022608022944066698	0.0736880567630592	NA	NA	0.0632383160677629	0.15225652508525	40	6	954	0.954	0.04	0.08
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666671	4	33.749999999999986	0.0400540111089283	0.129003442367267	0.310487924771003	-0.0889494312583385	0.0236750067952212	0.0743345140062978	NA	NA	0.0614225231346178	0.147573263753087	29	0	971	0.971	0.029	0.058
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	4	34.41666666666666	0.0405961546323978	0.126281753068954	0.321472846597488	-0.0856855984365564	0.0236104577737832	0.0724902837020698	NA	NA	0.0621152947253025	0.167752802403458	46	9	945	0.945	0.046	0.092
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	4	34.58333333333332	0.0403232602433046	0.125619222573624	0.320995938497163	-0.0852959623303199	0.0239492989017865	0.0702846402732853	NA	NA	0.0622986127771026	0.170953311446326	30	5	965	0.965	0.03	0.06
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000006	3	33.91666666666666	0.0401433603117784	0.0941180977157372	0.426521161031352	-0.0539747374039588	0.0230995410066642	0.0613141676530508	NA	NA	0.049538450378088	0.275910361519105	88	16	896	0.896	0.088	0.176
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333339	2	34.249999999999986	0.0267586909940917	0.0607927570603562	0.440162484611862	-0.0340340660662645	0.0194767315004704	0.048938430440087	NA	NA	0.042374210271799	0.42187141468003603	166	32	802	0.802	0.166	0.332
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	2	35.083333333333314	0.0270604324233619	0.0592901175479514	0.456407130606152	-0.0322296851245894	0.0194095827075729	0.0451010700407231	NA	NA	0.0428175093285598	0.451616932572495	183	40	777	0.777	0.183	0.366
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	2	35.083333333333314	0.0270604324233619	0.0592901175479514	0.456407130606152	-0.0322296851245894	0.0187287037638683	0.0426336679625511	NA	NA	0.0432009869853149	0.455642961460785	177	41	782	0.782	0.177	0.354
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000006	2	35.083333333333314	0.0134081783305544	0.0592901175479514	0.226145247894144	-0.0458819392173969	0.0132265003777112	0.0485527097690629	NA	NA	0.0360152341158305	0.202677872369171	0	113	887	0.887	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666673	1	34.91666666666665	0.0269995408952429	0.0292007684815911	0.92461747752509	-0.00220122758634817	0.0182780306105982	0.0304900088654307	NA	NA	0.0231929420298545	0.924386811543067	385	121	494	0.494	0.385	0.77
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000006	1	34.583333333333314	0.0268785763539719	0.0294878275056261	0.911514296834637	-0.00260925115165425	0.0196152846876801	0.0304706849067203	NA	NA	0.0250459898378616	0.917027774866289	383	132	485	0.485	0.383	0.766
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.5833333333334	1	34.41666666666665	0.0265808550345806	0.0296334842053817	0.896987166623941	-0.00305262917080108	0.0182688568073684	0.0315608194281264	NA	NA	0.0224595293037487	0.891886990239997	376	137	487	0.487	0.376	0.752
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000007	1	34.24999999999998	0.0265221005560517	0.0297805871963346	0.890583532863182	-0.00325848664028289	0.0181805709312965	0.0328506346435045	NA	NA	0.0247335403024446	0.895187066257509	376	112	512	0.512	0.376	0.752
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.41666666666674	1	34.583333333333314	0.0266398704364015	0.0294878275056261	0.90341923057298	-0.00284795706922461	0.0188839544109183	0.0319824529275559	NA	NA	0.0233135029197069	0.902772999103386	364	121	515	0.515	0.364	0.728
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000007	1	35.083333333333314	0.026434454296256	0.0290593249318817	0.90967200229948	-0.00262487063562568	0.0194042285162228	0.0306733617868112	NA	NA	0.0229652455760608	0.909001947677034	361	126	513	0.513	0.361	0.722
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	1	35.41666666666664	0.0263763446044989	0.0287805096612114	0.916465514856652	-0.00240416505671245	0.0188195476991565	0.031699331976218	NA	NA	0.0211773613040935	0.909614152601391	370	142	488	0.488	0.37	0.74
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.3333333333334	1	35.999999999999986	0.0263184898584525	0.0283052459871353	0.929809614458544	-0.00198675612868277	0.0189602815078916	0.0314409443597634	NA	NA	0.0219751542879587	0.927962045743969	383	137	480	0.48	0.383	0.766
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAC	2	GACAGACTG:GACAGATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	1	36.333333333333314	0.0266694765273651	0.0280406490537152	0.95110054251157	-0.00137117252635015	0.0188626432687096	0.0300609816656689	NA	NA	0.0218968897640484	0.950069492488384	389	135	476	0.476	0.389	0.778
N	all	ss13	228	CTG	GAC	TGA	2	AGACTGAAC:AGATTGAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	1	36.333333333333314	0.0266694765273651	0.0280406490537152	0.95110054251157	-0.00137117252635015	0.0185516219452678	0.0300169524748208	NA	NA	0.021750168160047	0.949733117307511	400	130	470	0.47	0.4	0.8
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	CTGAACCAG:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.33333333333341	1	36.66666666666665	0.0263184898584525	0.0277809537602618	0.947357318455308	-0.00146246390180928	0.018659826983462	0.0284325214287223	NA	NA	0.0219224400866274	0.946811922304726	441	117	442	0.442	0.441	0.882
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.66666666666674	1	37.66666666666665	0.026551445288187	0.0270299523623977	0.982297154364341	-4.78507074210734e-4	0.0190776216224825	0.0287425906978361	NA	NA	0.0205892115352611	0.981458297260238	429	128	443	0.443	0.429	0.858
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000007	1	37.66666666666665	0.0267885619515594	0.0270299523623977	0.991069521410845	-2.41390410838274e-4	0.0190004219477717	0.027839000680373	NA	NA	0.0203672218629771	0.990543768105821	412	120	468	0.468	0.412	0.824
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333341	1	37.499999999999986	0.0264928206228062	0.0271522864979704	0.975712326281857	-6.59465875164258e-4	0.0188690009215037	0.0283555869741179	NA	NA	0.0206431245138388	0.974515090717652	430	116	454	0.454	0.43	0.86
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333341	1	36.499999999999986	0.0261464386246642	0.0279101972553257	0.936805941766498	-0.00176375863066158	0.0181551333688144	0.0294538935024886	NA	NA	0.0215360271934779	0.934727785151913	399	139	462	0.462	0.399	0.798
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	1	36.499999999999986	0.0263763446044989	0.0279101972553257	0.945043288773814	-0.00153385265082682	0.0182888348542933	0.0302269173363547	NA	NA	0.0222872579645265	0.945131342452975	406	122	472	0.472	0.406	0.812
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	1	36.499999999999986	0.0263763446044989	0.0279101972553257	0.945043288773814	-0.00153385265082682	0.0185668488421971	0.0302341261780304	NA	NA	0.0223821757476526	0.94536366330603006	394	133	473	0.473	0.394	0.788
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000009	0	36.66666666666665	0.0131871529184001	0	-Inf	0.0131871529184001	0.0129805876162158	0	NA	NA	0.01361100467967	0.332615231426344	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.58333333333341	0	36.249999999999986	0.0130014090011593	0	-Inf	0.0130014090011593	0.012799035804032	0	NA	NA	0.0129075962544959	0.31380599057148	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666674	0	36.41666666666665	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0131314228009761	0	NA	NA	0.0128404118319364	0.313373335684296	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666674	0	35.749999999999986	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0131456328937196	0	NA	NA	0.0128768705201846	0.314745414594588	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.91666666666674	0	36.41666666666665	0.0129453051997499	0	-Inf	0.0129453051997499	0.0127403590263972	0	NA	NA	0.0132560472308221	0.32878778791077	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.75000000000007	0	36.58333333333332	0.0129732964431592	0	-Inf	0.0129732964431592	0.0126539826243341	0	NA	NA	0.0130347434980233	0.319597232381182	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000007	0	37.08333333333332	0.0130580012294226	0	-Inf	0.0130580012294226	0.0127993185170068	0	NA	NA	0.0136225047972428	0.337779969453786	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000007	0	37.08333333333332	0.0134081783305544	0	-Inf	0.0134081783305544	0.0136963803251521	0	NA	NA	0.0131573647183544	0.308173247134218	611	389	0	0	0.611	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.5833333333334	0	37.08333333333332	0.0137146678675636	0	-Inf	0.0137146678675636	0.013792127030503	0	NA	NA	0.0142350728682812	0.335325729669712	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.5833333333334	0	37.24999999999999	0.0137146678675636	0	-Inf	0.0137146678675636	0.0139160951755145	0	NA	NA	0.0142176862891491	0.33473506122217	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.5833333333334	0	36.24999999999999	0.0135291154422588	0	-Inf	0.0135291154422588	0.0137072289695995	0	NA	NA	0.0128489798569011	0.29237168128009	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000007	0	36.08333333333332	0.0134986770919624	0	-Inf	0.0134986770919624	0.014164602867917	0	NA	NA	0.0135617069257742	0.319564916677962	658	342	0	0	0.658	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.0833333333334	0	35.74999999999999	0.0134382094503063	0	-Inf	0.0134382094503063	0.0139929120132422	0	NA	NA	0.0130843574495766	0.304399794928382	677	323	0	0	0.677	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.0833333333334	0	35.41666666666666	0.0132600139021293	0	-Inf	0.0132600139021293	0.0133592331975109	0	NA	NA	0.0127970332386262	0.300118758635511	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000006	0	34.58333333333333	0.0132307731029257	0	-Inf	0.0132307731029257	0.0137063755257356	0	NA	NA	0.0133392497884017	0.321261990652735	665	335	0	0	0.665	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000006	0	35.08333333333333	0.0133188849757348	0	-Inf	0.0133188849757348	0.013235880391285	0	NA	NA	0.0129961242174057	0.305440975631923	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.75000000000006	0	34.74999999999999	0.0131438194165355	0	-Inf	0.0131438194165355	0.013865015447527	0	NA	NA	0.0132038346148909	0.319515158932503	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666673	0	34.08333333333333	0.0128620515547158	0	-Inf	0.0128620515547158	0.0135520737609847	0	NA	NA	0.0132315285272423	0.331012732199376	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000006	0	33.75	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.013351309138221	0	NA	NA	0.0124567004005774	0.303887391932336	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.0833333333334	0	33.41666666666667	0.012752698321938	0	-Inf	0.012752698321938	0.0129848022306307	0	NA	NA	0.0131208402025239	0.331079303063073	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	256	TCC	CAT	CCA	2	GCATCCAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.25000000000006	0	33.75000000000001	0.0127256499425275	0	-Inf	0.0127256499425275	0.0127013561876543	0	NA	NA	0.013028654446487	0.328696290664896	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.75000000000006	0	33.25000000000001	0.0126451889006809	0	-Inf	0.0126451889006809	0.012941976717351601	0	NA	NA	0.0127015279825319	0.319461846257503	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000006	0	32.00000000000001	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0123063431531764	0	NA	NA	0.0128258182411775	0.331759959582691	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666671	0	32.16666666666667	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0125818917667402	0	NA	NA	0.0129005802843846	0.332559612767674	611	389	0	0	0.611	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666671	0	32.16666666666667	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0126306521235823	0	NA	NA	0.0129904395368919	0.335914802080502	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666671	0	32.333333333333336	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0127341221164573	0	NA	NA	0.012958934538751	0.334741290033195	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000004	0	32.00000000000001	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.013459321025955	0	NA	NA	0.011961196342	0.297999218968736	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACG:AAACGTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	0	32.50000000000001	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0128012207567631	0	NA	NA	0.0126879787638001	0.319455035973257	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	264	ACG	GTA	CGG	2	CGTACGGCA:CGTACTGCC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333337	0	33.5	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0131154316376259	0	NA	NA	0.0130310587236074	0.326213751091368	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	265	GCA	CGG	CAA	2	ACGGCAACT:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.50000000000003	0	32.83333333333334	0.0126852918315464	0	-Inf	0.0126852918315464	0.0130872386051094	0	NA	NA	0.0125567954441361	0.312383569386341	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	266	ACT	CAA	CTA	2	GCAACTAAG:GCCACTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	0	32.50000000000001	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0124323921873449	0	NA	NA	0.0122176947437848	0.305237686394873	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CTA	AAG	2	ACTAAAGCA:ACTAAGTCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.83333333333337	0	32.66666666666668	0.0124743000368564	0	-Inf	0.0124743000368564	0.0123909800020058	0	NA	NA	0.0125328639279187	0.319577165480707	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	268	GCA	AAG	CAT	2	AAAGCATAC:AAGTCGTAC	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.4166666666667	0	32.41666666666668	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.012078207514663	0	NA	NA	0.0127928567718649	0.326990535568677	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	269	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAT:TCGTACAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.4166666666667	0	32.41666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.58333333333337	0	32.25000000000001	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.25000000000003	0	31.916666666666675	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.9166666666667	0	32.75000000000001	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.58333333333337	0	32.08333333333334	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.4166666666667	0	32.58333333333334	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.4166666666667	0	32.25000000000001	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000003	0	31.416666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.4166666666667	0	31.750000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.4166666666667	0	31.583333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75000000000003	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75000000000003	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.4166666666667	0	31.583333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.58333333333337	0	31.750000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.9166666666667	0	32.41666666666667	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.25000000000003	0	32.083333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.58333333333336	0	32.083333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333336	1	32.41666666666667	0.0128345378007017	0.031500692980973	0.407436681105841	-0.0186661551802713	0.0129330262113117	0.0317231647779723	NA	NA	0.0193777609153103	0.335408434552879	0	353	647	0.647	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	1	32.25	0.0129174344873365	0.03166697281676	0.407915040129755	-0.0187495383294235	0.0131886149981618	0.033614558142209	NA	NA	0.0196468206027923	0.339916935472595	0	388	612	0.612	0	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	1	31.75	0.0129174344873365	0.0321765161581571	0.401455347864372	-0.0192590816708206	0.0136541490700904	0.031575828542589	NA	NA	0.0209664737304726	0.358322828208512	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666669	1	32.416666666666664	0.0130296436641525	0.031500692980973	0.413630381783114	-0.0184710493168205	0.0134192270790949	0.0328535080720695	NA	NA	0.0190236270358041	0.33157164254231	0	352	648	0.648	0	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAA:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666669	1	32.416666666666664	0.0130296436641525	0.031500692980973	0.413630381783114	-0.0184710493168205	0.013247505996161	0.0331408094108339	NA	NA	0.0194935394091622	0.343360000153233	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAACTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.58333333333336	1	31.249999999999996	0.0128345378007017	0.0327027281115989	0.392460768315827	-0.0198681903108972	0.0128592581941062	0.0363590963838258	NA	NA	0.0216096842346852	0.357880422083835	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	1	30.749999999999996	0.012752698321938	0.0332464403304228	0.383580864453282	-0.0204937420084848	0.0125084563899668	0.0337041604218329	NA	NA	0.0219095892344547	0.349593665762777	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	1	30.749999999999996	0.0124355180497881	0.0332464403304228	0.374040586787535	-0.0208109222806347	0.0124678871502583	0.0351736658802034	NA	NA	0.0221121023083854	0.346625279921684	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000003	1	31.749999999999996	0.0123332686697829	0.0321765161581571	0.383300311604936	-0.0198432474883742	0.0132124120563512	0.0328587670524183	NA	NA	0.0218946928272129	0.364774973746673	0	333	667	0.667	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.41666666666669	1	31.58333333333333	0.0122326870775303	0.0323500281131817	0.378135284295033	-0.0201173410356514	0.0126818077863126	0.0349652405645069	NA	NA	0.0223461602594144	0.367982216822897	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333334	1	32.25	0.0124355180497881	0.03166697281676	0.392696773441082	-0.0192314547669719	0.0125904392456458	0.0340889973029146	NA	NA	0.0206347239080135	0.351339228183582	0	379	621	0.621	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333334	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0273243078003691	0.0335968559488495	NA	NA	0.032610328814646	0.86693603623403	527	120	353	0.353	0.527	0.706
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000001	1	31.749999999999996	0.037390920168914	0.0321765161581571	1.16205620226648	0.00521440401075692	0.0274322297388585	0.0338201018649366	NA	NA	0.0339900101887492	0.878075039465674	504	116	380	0.38	0.504	0.76
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000001	1	31.749999999999996	0.037390920168914	0.0321765161581571	1.16205620226648	0.00521440401075692	0.0282255311489915	0.0322051830138294	NA	NA	0.0320772223517585	0.870866583374801	495	136	369	0.369	0.495	0.738
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.25000000000001	1	31.416666666666664	0.0369305370773724	0.0325254218363474	1.13543606792218	0.00440511524102505	0.0285703726696556	0.0346559667224374	NA	NA	0.0324096700709135	0.891884698039765	524	127	349	0.349	0.524	0.698
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000001	2	31.166666666666664	0.0495024994789391	0.0670837952639451	0.737920376808865	-0.017581295785006	0.0309235988259938	0.0489472943518553	NA	NA	0.041712144916755	0.673396544818999	316	50	634	0.634	0.316	0.632
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000001	2	31.499999999999996	0.0501230313618422	0.0663415654213976	0.7555298257354	-0.0162185340595554	0.0311684434887071	0.048064309438765	NA	NA	0.0421158547604456	0.700168281802743	310	47	643	0.643	0.31	0.62
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	31.83333333333333	0.0507593239355005	0.0656155905923368	0.773586330280301	-0.0148562666568364	0.0321225557218735	0.0511234597735549	NA	NA	0.0400689635472445	0.710810761750807	341	28	631	0.631	0.341	0.682
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000001	2	30.83333333333333	0.0501230313618422	0.0678428326164385	0.73881100521291	-0.0177198012545964	0.0298694629040854	0.0495702375387649	NA	NA	0.043850946995163	0.686145329506457	280	55	665	0.665	0.28	0.56
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333334	2	29.83333333333333	0.0508669472540708	0.0702267037754945	0.72432485820046	-0.0193597565214237	0.0315013249085027	0.0515919980880691	NA	NA	0.0438267969799741	0.658682195500882	311	54	635	0.635	0.311	0.622
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	29.166666666666664	0.0509750280987295	0.0719113287774619	0.708859493564328	-0.0209363006787324	0.0294260031370303	0.0537438276900131	NA	NA	0.0425379403728915	0.622592480849464	269	47	684	0.684	0.269	0.538
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.66666666666669	2	29.333333333333332	0.0506521552428655	0.0714826348532437	0.708593847258934	-0.0208304796103782	0.0318900325293402	0.0527367563006846	NA	NA	0.0441171924147859	0.63681087292758	321	45	634	0.634	0.321	0.642
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333334	2	29.666666666666664	0.0508669472540708	0.0706404112947758	0.720082829668245	-0.019773464040705	0.0324139679611897	0.052492274007708	NA	NA	0.0454304783451299	0.663383396184825	332	44	624	0.624	0.332	0.664
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333334	2	30.166666666666668	0.0511925740908369	0.0694136680239339	0.737499912455075	-0.018221093933097	0.0327788660969449	0.0536411872764983	NA	NA	0.0431633233286098	0.672920658054134	315	49	636	0.636	0.315	0.63
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.5	2	30.166666666666668	0.0507593239355005	0.0694136680239339	0.731258344077115	-0.0186543440884334	0.0326494088259039	0.0521536382225056	NA	NA	0.0448733868210321	0.677621758838705	311	49	640	0.64	0.311	0.622
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.5	2	30.166666666666668	0.0507593239355005	0.0694136680239339	0.731258344077115	-0.0186543440884334	0.0297635304448976	0.0520181716433972	NA	NA	0.0423808469092649	0.659821390358032	311	45	644	0.644	0.311	0.622
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666667	2	29.833333333333332	0.0509750280987295	0.0702267037754945	0.725863885932763	-0.019251675676765	0.0312734067279878	0.0526561197262748	NA	NA	0.0446395279450974	0.66627228162427	310	35	655	0.655	0.31	0.62
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333334	2	29.833333333333332	0.0505454383004815	0.0702267037754945	0.719746700088169	-0.019681265475013	0.0304181322041849	0.0543413388061416	NA	NA	0.0428492916622273	0.646008931497588	296	44	660	0.66	0.296	0.592
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	28.833333333333336	0.0499144653819543	0.0727843418621031	0.68578576249988	-0.0228698764801488	0.0302869379036439	0.0561074841230855	NA	NA	0.0428529261079874	0.593560899946272	280	47	673	0.673	0.28	0.56
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	2	28.5	0.049299057062491	0.0736788296875599	0.669107493584616	-0.0243797726250689	0.0303420198409104	0.0530262920459832	NA	NA	0.0460861993998001	0.596802843694191	257	43	700	0.7	0.257	0.514
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	28.833333333333336	0.0499144653819543	0.0727843418621031	0.68578576249988	-0.0228698764801488	0.0323920785140397	0.0524645142022816	NA	NA	0.0447869525970825	0.609605241080364	288	52	660	0.66	0.288	0.576
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGAATG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	2	27.999999999999996	0.049707628561966	0.0750625939177369	0.662215705154579	-0.0253549653557709	0.0312190042564625	0.0537919434128469	NA	NA	0.0448443682451431	0.571802337959267	259	49	692	0.692	0.259	0.518
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	27.583333333333332	0.0494514815652544	0.0762561014897823	0.648492128487325	-0.0268046199245279	0.0304382275022733	0.0573372499954789	NA	NA	0.0492203902715953	0.58603990035838	260	35	705	0.705	0.26	0.52
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.749999999999996	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0314578213147191	0.0567037547539053	NA	NA	0.0468896518374618	0.579022520521991	236	54	710	0.71	0.236	0.472
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.91666666666669	2	27.916666666666664	0.0498625949111442	0.075298294736773	0.662200851765015	-0.0254356998256288	0.0317932894165304	0.0577388108683784	NA	NA	0.0453293171180485	0.574708014249749	261	44	695	0.695	0.261	0.522
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	28.249999999999996	0.0496561870198999	0.0743642698449398	0.667742547912326	-0.0247080828250399	0.0301130846783237	0.0551956473668977	NA	NA	0.0458952418547996	0.590329732775394	297	39	664	0.664	0.297	0.594
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	2	27.75	0.0492484575638286	0.0757741689236761	0.649937284214022	-0.0265257113598475	0.0305484811330591	0.0593308870798077	NA	NA	0.0455998402160804	0.56076457118949	250	38	712	0.712	0.25	0.5
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.58333333333336	2	27.75	0.048847371697873	0.0757741689236761	0.644644110146226	-0.0269267972258031	0.0309256799623364	0.0586847456996163	NA	NA	0.0462164615287578	0.560146772494219	255	48	697	0.697	0.255	0.51
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	2	27.75	0.0490470943757949	0.0757741689236761	0.647279872184383	-0.0267270745478812	0.029494481916047	0.0563018167440341	NA	NA	0.0463651925206886	0.56431310699479	236	54	710	0.71	0.236	0.472
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000001	2	28.75	0.0496561870198999	0.073005919868405	0.680166582510109	-0.0233497328485051	0.0308324798054016	0.0534689368473382	NA	NA	0.0442599275567506	0.597805303605458	276	57	667	0.667	0.276	0.552
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000001	2	29.166666666666668	0.0495024994789391	0.0719113287774619	0.688382488830521	-0.0224088292985228	0.0304223465221788	0.0550169577128407	NA	NA	0.0462017117558518	0.62766100609574	278	51	671	0.671	0.278	0.556
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	2	29.083333333333336	0.0490470943757949	0.0721276112438599	0.680004418973049	-0.023080516868065	0.0301416188875569	0.0525645180202632	NA	NA	0.0442186351435625	0.601695692271273	259	48	693	0.693	0.259	0.518
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666669	3	29.416666666666668	0.0492484575638286	0.109617210244414	0.449276691625513	-0.0603687526805853	0.029869009157223	0.0670349543594952	NA	NA	0.0593553257983182	0.309118275496495	142	18	840	0.84	0.142	0.284
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.58333333333336	3	29.416666666666668	0.048847371697873	0.109617210244414	0.445617723612541	-0.0607698385465408	0.029535904916726	0.0686733373305631	NA	NA	0.0587239738021048	0.300744263448797	114	21	865	0.865	0.114	0.228
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.25000000000001	3	28.416666666666668	0.0478726780561084	0.113782401199837	0.420738862524347	-0.0659097231437287	0.0298710003057737	0.0725881184929548	NA	NA	0.0665536450173856	0.322015403605406	120	13	867	0.867	0.12	0.24
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.25000000000001	4	28.416666666666668	0.0478726780561084	0.155898728322134	0.307075487858945	-0.108026050266025	0.0291037567775881	0.0861214976035588	NA	NA	0.0826185344735355	0.19103343899805	54	6	940	0.94	0.054	0.108
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.58333333333336	4	28.75	0.0482578485978245	0.153892310773211	0.313581935025601	-0.105634462175386	0.0311538253875863	0.0891575407290287	NA	NA	0.082476321495141	0.200269080178787	41	3	956	0.956	0.041	0.082
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.25000000000003	4	28.416666666666668	0.0596142865629318	0.155898728322134	0.382391102252937	-0.0962844417592018	0.0308389430107871	0.0860825672552689	NA	NA	0.0825961164783917	0.243725238284498	69	3	928	0.928	0.069	0.138
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.9166666666667	4	29.083333333333336	0.0591439311842398	0.151937056450332	0.389266006371353	-0.0927931252660927	0.0311092210565627	0.0834891789527732	NA	NA	0.0832825591781743	0.265194951628761	93	3	904	0.904	0.093	0.186
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.9166666666667	4	29.083333333333336	0.0591439311842398	0.151937056450332	0.389266006371353	-0.0927931252660927	0.0315462616164304	0.0852477954010731	NA	NA	0.0822046853461505	0.258979767150601	85	2	913	0.913	0.085	0.17
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.58333333333337	3	29.75	0.0471204985826022	0.10829587866142	0.435108881012187	-0.061175380078818	0.0299384828889266	0.0689722648314162	NA	NA	0.0693411759433698	0.377648430752562	169	6	825	0.825	0.169	0.338
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATA:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.58333333333337	3	30.916666666666664	0.0476823900760352	0.103912304538584	0.458871452113066	-0.0562299144625488	0.0289067598530506	0.0688924146838035	NA	NA	0.06538937235639	0.389830736958671	177	5	818	0.818	0.177	0.354
N	all	ss13	338	ATA	CCA	TAA	2	GCCATAAAA:GCCATCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000004	3	30.249999999999996	0.0484527683011411	0.106372646579413	0.455500261197021	-0.0579198782782721	0.02897233018888	0.0690486307596923	NA	NA	0.0698148379576635	0.40675291671813	170	1	829	0.829	0.17	0.34
N	all	ss13	339	AAA	TAA	AAT	2	ATAAAATTG:ATCAAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.66666666666671	3	30.499999999999996	0.0482093635534236	0.105436462965892	0.457236160976103	-0.0572270994124685	0.0297314532720189	0.0662738369758932	NA	NA	0.0665010522598264	0.389489091722881	179	8	813	0.813	0.179	0.358
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.16666666666671	3	29.999999999999996	0.0479204876782094	0.107325632730505	0.446496204672167	-0.0594051450522956	0.0310125057046306	0.0644676138656824	NA	NA	0.0700126460553833	0.396164224879889	188	7	805	0.805	0.188	0.376
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.16666666666671	3	29.999999999999996	0.0479204876782094	0.107325632730505	0.446496204672167	-0.0594051450522956	0.0298989880496658	0.0654319197934822	NA	NA	0.0698722713208652	0.395215970396246	161	4	835	0.835	0.161	0.322
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.66666666666671	3	30.166666666666664	0.0735282234971393	0.106688419438138	0.68918654793432	-0.0331601959409989	0.041093445160389	0.0688161001437604	NA	NA	0.0754578938048244	0.660333348449612	326	3	671	0.671	0.326	0.652
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.00000000000004	3	31.166666666666664	0.0750625939177369	0.103018812035868	0.728629969947646	-0.0279562181181314	0.0413676974466756	0.0647427693023008	NA	NA	0.0727701555451443	0.700851357519593	345	1	654	0.654	0.345	0.69
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.33333333333337	3	31.166666666666664	0.0766624238758938	0.103018812035868	0.744159463314351	-0.0263563881599745	0.0411835121624816	0.0645091822122822	NA	NA	0.0692697565658325	0.70358237731745	357	1	642	0.642	0.357	0.714
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.00000000000004	3	30.833333333333332	0.0779922851430357	0.104213595070396	0.748388778741889	-0.0262213099273606	0.0419202925424474	0.0658523436016215	NA	NA	0.0747409786572311	0.725716567942049	359	1	640	0.64	0.359	0.718
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.66666666666671	3	31.166666666666664	0.0783319975256979	0.103018812035868	0.76036595625297	-0.0246868145101703	0.0415459562826261	0.0682518717669852	NA	NA	0.0742729610520105	0.739602666794153	363	0	637	0.637	0.363	0.726
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.83333333333339	3	31.166666666666664	0.0518565020980097	0.103018812035868	0.503369249491586	-0.0511623099378585	0.0307965475712518	0.0672824691534305	NA	NA	0.0685647592505761	0.455552892659334	200	8	792	0.792	0.2	0.4
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.58333333333339	3	31.416666666666664	0.0520251847574407	0.102140577511979	0.509348840830072	-0.0501153927545385	0.0316237953088124	0.0649349077279375	NA	NA	0.0665033694643065	0.451103411947385	211	5	784	0.784	0.211	0.422
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333339	3	31.749999999999993	0.0527110387112104	0.100992663859693	0.521929382756363	-0.0482816251484825	0.0336690736545255	0.0598683928279668	NA	NA	0.0647250912710481	0.455698148642279	227	7	766	0.766	0.227	0.454
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333339	3	32.58333333333333	0.0537744248135208	0.0982328346145694	0.547418030076323	-0.0444584098010486	0.0341957385652715	0.0616154821573314	NA	NA	0.0657212977360635	0.498743025546379	218	6	776	0.776	0.218	0.436
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666671	2	32.5	0.039920730758297	0.0642103145422439	0.621718349191908	-0.0242895837839469	0.0291773224858266	0.0481560652803527	NA	NA	0.059035577960713	0.680750107466455	363	13	624	0.624	0.363	0.726
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAT	2	GTCATATTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666671	3	32.33333333333333	0.0393963647100293	0.0990447915097998	0.397763114137419	-0.0596484267997704	0.0292472552940913	0.0651328495324222	NA	NA	0.0698014020409558	0.392803184664202	170	7	823	0.823	0.17	0.34
N	all	ss13	353	TTG	TAT	TGC	2	ATATTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000006	3	31.333333333333332	0.0387182740539804	0.102431651254313	0.377991310106407	-0.0637133772003327	0.0301106200530496	0.0661851238366883	NA	NA	0.0734705182267244	0.38583434663265	159	7	834	0.834	0.159	0.318
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	TTGCTGAAT	2	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666673	3	31.333333333333332	0.0383879094086674	0.102431651254313	0.374766089764183	-0.0640437418456457	0.0278662544335417	0.0682360170119341	NA	NA	0.0745178785067608	0.39009709625043	170	3	827	0.827	0.17	0.34
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	3	32	0.0376648177342698	0.100148544468392	0.376089517168741	-0.0624837267341222	0.028821702908155	0.065053385127051	NA	NA	0.0694351491482465	0.368180859096622	163	6	831	0.831	0.163	0.326
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	33	0.0379827996140662	0.0969087986100047	0.391943767324187	-0.0589259989959385	0.028613912979681	0.0623666021261501	NA	NA	0.0672560173461883	0.380951408447325	171	6	823	0.823	0.171	0.342
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000006	3	33.25	0.0514119856124207	0.0961313950679982	0.534809523736285	-0.0447194094555775	0.03098849288252	0.0615654870380772	NA	NA	0.0733005970663541	0.541807177081771	238	3	759	0.759	0.238	0.476
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.8333333333334	3	32.916666666666664	0.0511925740908369	0.097170738715697	0.526831171270773	-0.0459781646248601	0.0309839125292747	0.0628470678318208	NA	NA	0.0728805014827161	0.528125146177609	242	4	754	0.754	0.242	0.484
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000007	4	31.916666666666664	0.0507593239355005	0.137132914796851	0.370146904634058	-0.0863735908613505	0.0318218838994429	0.0815125432223357	NA	NA	0.0866574169219651	0.318898140369269	123	1	876	0.876	0.123	0.246
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.8333333333334	4	31.58333333333333	0.0505454383004815	0.138722674692595	0.364363204591381	-0.0881772363921134	0.0317168145179162	0.0807371897752679	NA	NA	0.0935148596849416	0.345720703324047	143	0	857	0.857	0.143	0.286
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.3333333333334	4	30.749999999999996	0.0756944389424703	0.142863650574837	0.529836936392851	-0.0671692116323664	0.0398661854264711	0.0810346814847878	NaN	NaN	0.0996862383036508	0.500434493003752	206	1	793	0.793	0.206	0.412
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.16666666666673	4	30.916666666666664	0.0758540671866301	0.142015736265178	0.53412438073054	-0.0661616690785484	0.0412062667052761	0.0874737067359808	NA	NA	0.0953152485528649	0.487597425849546	212	0	788	0.788	0.212	0.424
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000007	4	30.916666666666664	0.0774882105210194	0.142015736265178	0.545631157214365	-0.0645275257441591	0.0398572263308193	0.0835649814625373	NaN	NaN	0.0933531515908036	0.489427564324132	217	0	783	0.783	0.217	0.434
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.66666666666673	4	31.416666666666664	0.0783319975256979	0.139531497680893	0.561392938710099	-0.0611995001551952	0.0423011477065144	0.0862134063685593	NaN	NaN	0.0918698022870704	0.505312227333747	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.3333333333334	4	31.083333333333332	0.0807955355010693	0.141177857059553	0.572296089371774	-0.0603823215584833	0.0424040764599606	0.0827373995457322	NaN	NaN	0.0923842578800309	0.513369749259064	216	0	784	0.784	0.216	0.432
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.3333333333334	4	30.083333333333332	0.0818994689737439	0.146359364647636	0.559577920899828	-0.0644598956738921	0.0431401745729558	0.086372143452699	NaN	NaN	0.0943083381546662	0.494289968639387	233	1	766	0.766	0.233	0.466
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.8333333333334	5	30.916666666666668	0.0971332319175819	0.182159096576957	0.533232947148187	-0.085025864659375	0.0464305983421299	0.0931913098846649	NaN	NaN	0.104848549950064	0.417400228906708	198	0	802	0.802	0.198	0.396
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.8333333333334	5	31.916666666666664	0.0985020015458151	0.175726637753458	0.560541092717043	-0.0772246362076424	0.0496983045488763	0.0952203042139221	NaN	NaN	0.114508839356541	0.500057736871887	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.3333333333334	5	32.416666666666664	0.0992009764333129	0.172678550040526	0.574483492072591	-0.0734775736072128	0.0471000318890717	0.0908700671009701	NaN	NaN	0.104171908840433	0.480592943187726	234	0	766	0.766	0.234	0.468
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.16666666666673	5	32.58333333333333	0.100871203910845	0.171685985854599	0.58753312571635	-0.0708147819437533	0.0498884575689865	0.0897605277139943	NaN	NaN	0.0998517014371936	0.478200651360443	221	0	779	0.779	0.221	0.442
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.16666666666673	5	31.916666666666664	0.100871203910845	0.175726637753458	0.574023410453949	-0.0748554338426122	0.0469090523572012	0.0930286852827428	NaN	NaN	0.105770719549195	0.479122794536884	218	0	782	0.782	0.218	0.436
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.66666666666673	5	32.41666666666666	0.10160438445965	0.172678550040526	0.588401885676044	-0.0710741655808753	0.0480036577303547	0.0906675204260013	NaN	NaN	0.0994909483023936	0.474993342108545	205	0	795	0.795	0.205	0.41
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.00000000000007	5	32.41666666666666	0.102598726327403	0.172678550040526	0.594160226057749	-0.0700798237131225	0.0499811534251076	0.0882783671725275	NaN	NaN	0.106151003805326	0.509131954011741	231	0	769	0.769	0.231	0.462
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GA-	1	CAGAGA---:CAGAGACAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.666666666666667	1.33333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	---	GAC	AGA	1	AGA---AAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	--A	AGA	1	---AAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTG:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTG	TTC	TGC	2	CTTCTGCCT:CTTCTTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TGC	CTG	2	CTGCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAT:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATA	2	GCAGATTTG:GCTGATATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ATA	TGG	2	GATATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KJ473814.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.25000000000003	3	35.50000000000001	0.0726080462723539	0.089658862987337	0.809825641917952	-0.0170508167149831	0.0330804246725828	0.0576071746244136	NaN	NaN	0.0703341070020575	0.80845008463194	396	1	603	0.603	0.396	0.792
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.08333333333336	3	35.66666666666667	0.0727843418621031	0.089213957146024	0.815840303361624	-0.0164296152839209	0.0320240368564689	0.0552194726653833	NaN	NaN	0.0668582544516253	0.805885036256776	421	0	579	0.579	0.421	0.842
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.41666666666669	3	35.66666666666667	0.0724326033146383	0.089213957146024	0.811897663008959	-0.0167813538313857	0.0326999240329021	0.0546811393388628	NaN	NaN	0.0690650307982692	0.808021646385479	411	0	589	0.589	0.411	0.822
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAA	2	AATGGAACC:AATGGACCC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.41666666666669	3	36.00000000000001	0.0734981761725992	0.0883372767422875	0.832017681358013	-0.0148391005696883	0.0329401323793687	0.0579943628394185	NA	NA	0.067480335451236	0.825947018811632	417	2	581	0.581	0.417	0.834
N	all	ss13	6	ACC	GAA	CCC	2	GGAACCCAA:GGACCCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.41666666666669	3	37.00000000000001	0.0745955951479784	0.0858077633833082	0.869333871514116	-0.0112121682353297	0.0333176360248383	0.0560338133800559	NaN	NaN	0.0666083279168117	0.866323811029185	425	1	574	0.574	0.425	0.85
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	ACCCAA---:CCCCAA---	1:1	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333336	3	37.33333333333334	0.0593634822039754	0.0849965139802523	0.698422551985692	-0.0256330317762769	0.0294483351323713	0.0512375698048292	NaN	NaN	0.0667310027657648	0.70088596575655	342	0	658	0.658	0.342	0.684
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAC:CAA---AAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.08333333333336	3	35.66666666666667	0.0584949199843536	0.089213957146024	0.655670052709466	-0.0307190371616704	0.0291980183099428	0.0559834275825145	NA	NA	0.065963015086387	0.641429589951795	326	3	671	0.671	0.326	0.652
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	0	---AACCAA:---AATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333336	3	36.66666666666667	0.05765141989764	0.0866346653413833	0.665454407545352	-0.0289832454437432	0.0293506256671638	0.053129169300768	NA	NA	0.0636424305563601	0.64881604124638	337	1	662	0.662	0.337	0.674
N	all	ss13	10	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333336	3	36.66666666666667	0.05765141989764	0.0866346653413833	0.665454407545352	-0.0289832454437432	0.0284607132756524	0.0537650153166503	NaN	NaN	0.0661708641924372	0.661381825519195	333	2	665	0.665	0.333	0.666
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000001	3	36.25	0.0573071018565008	0.0876910035441767	0.653511757652891	-0.0303839016876759	0.0277162318350543	0.0540277240042954	NaN	NaN	0.0644077091562064	0.637110066113763	312	0	688	0.688	0.312	0.624
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666669	3	36.083333333333336	0.0569668741816512	0.0881207952860292	0.646463459581177	-0.0311539211043781	0.0289214572940485	0.0543180788058073	NA	NA	0.0641798787501576	0.627381494051301	329	2	669	0.669	0.329	0.658
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCTCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000001	3	36.75	0.0427161696956043	0.0864264476831886	0.494248818974811	-0.0437102779875843	0.0242411243652225	0.0563661961864908	NA	NA	0.0590200543332579	0.45893574342331	277	3	720	0.72	0.277	0.554
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCTCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.91666666666669	3	36.75	0.0423143935004423	0.0864264476831886	0.489600054552204	-0.0441120541827463	0.0235540057923832	0.0541382787232027	NaN	NaN	0.0608430412863929	0.468443467453003	211	0	789	0.789	0.211	0.422
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT:TCCCGCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.50000000000001	2	36.5	0.0713125861052076	0.0568993130810351	1.25331189857504	0.0144132730241725	0.0386547454688047	0.0430244372064989	NA	NA	0.0618525286634563	0.815740893977926	602	2	396	0.396	0.602	0.792
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666669	2	36.33333333333333	0.0711433450940078	0.0571705240409132	1.24440603418459	0.0139728210530946	0.0376728353077808	0.0454118899747992	NaN	NaN	0.0601049537110724	0.81617011109325	621	3	376	0.376	0.621	0.752
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.9166666666667	2	35.75	0.069899212963913	0.0581404786806199	1.20224694653594	0.0117587342832931	0.0383968094770987	0.0457749203121717	NaN	NaN	0.0609769558611032	0.847085070773594	598	2	400	0.4	0.598	0.8
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333336	2	35.75	0.0692533163185839	0.0581404786806199	1.19113770457601	0.011112837637964	0.037179762701921	0.0438509062924123	NA	NA	0.0635785133254825	0.861245272915002	589	2	409	0.409	0.589	0.818
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.08333333333336	2	35.75	0.0697366111169322	0.0581404786806199	1.19945024016766	0.0115961324363123	0.0366625956828582	0.0428591998965769	NA	NA	0.0591225535239586	0.844502775923287	581	3	416	0.416	0.581	0.832
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC:GGTGGACCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.75000000000001	2	36.16666666666667	0.0848961862428276	0.0574443341110379	1.47788615808003	0.0274518521317898	0.0382288595121695	0.0427020967543601	NaN	NaN	0.0608100946865306	0.651675505180527	688	0	312	0.312	0.688	0.624
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA:GGACCTTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.33333333333334	2	35.583333333333336	0.0842004764033108	0.058423686245627	1.44120444658887	0.0257767901576838	0.0411574486858402	0.0440200688311144	NaN	NaN	0.0646206595908249	0.68997134720435	677	0	323	0.323	0.677	0.646
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT:CCTTCAGAT	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.66666666666667	2	35.91666666666667	0.0838080288297114	0.0578600049104132	1.44846217969519	0.0259480239192982	0.0394580663380415	0.0456841459538983	NA	NA	0.0632214199566599	0.681489887362728	653	1	346	0.346	0.653	0.692
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.25	2	35.333333333333336	0.0819928280328052	0.0588537115811214	1.39316324884268	0.0231391164516838	0.0396900390414185	0.0429548991463678	NaN	NaN	0.0613205937803837	0.705916059153036	680	2	318	0.318	0.68	0.636
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.25	2	35.66666666666667	0.0831299860668389	0.0582817382454872	1.42634706117874	0.0248482478213518	0.0395556816955652	0.0425823898385657	NaN	NaN	0.0645472139703328	0.700265302812636	683	0	317	0.317	0.683	0.634
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666667	2	35.50000000000001	0.0818063224852469	0.0585663277285774	1.39681495593123	0.0232399947566694	0.0393731122084105	0.045181049461463	NA	NA	0.0620633840802492	0.708065227585561	637	1	362	0.362	0.637	0.724
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.25000000000001	2	35.66666666666667	0.0819928280328052	0.0582817382454872	1.40683566587265	0.023711089787318	0.0390618817154393	0.0429467700540253	NaN	NaN	0.0644226961576161	0.712832289393473	644	1	355	0.355	0.644	0.71
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.91666666666669	2	35.333333333333336	0.0670837952639451	0.0588537115811214	1.13983967130908	0.00823008368282369	0.0365311325771199	0.043237780484849	NA	NA	0.0586031180527821	0.888314218933361	553	1	446	0.446	0.553	0.892
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000001	2	35.333333333333336	0.0536541558618204	0.0588537115811214	0.911652883401684	-0.005199555719301	0.032723326906583	0.046042260197932	NA	NA	0.0589965951475829	0.92977084967214	463	8	529	0.529	0.463	0.926
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT:AACCAGGAT	1:1	FALSE	1.25	0.333333333333333	1.41666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333336	2	35.50000000000001	0.0537744248135208	0.0585663277285774	0.918179897888348	-0.00479190291505667	0.0339889635868376	0.0436039169060085	NA	NA	0.0564945330111849	0.93240397773108	468	7	525	0.525	0.468	0.936
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA:CAGGATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.83333333333336	2	34.75	0.0532374199351599	0.0598821656332629	0.889036316107913	-0.006644745698103	0.0332033948156448	0.0480054450278785	NA	NA	0.0572795024405861	0.907648066941827	454	6	540	0.54	0.454	0.908
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:GATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.83333333333336	2	35.416666666666664	0.0539558430514737	0.0587096677913667	0.919028246646081	-0.00475382473989306	0.0347485482253531	0.0416555091393446	NA	NA	0.0558522056977907	0.932170474144137	454	6	540	0.54	0.454	0.908
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333336	3	36.416666666666664	0.054693929928504303	0.0872653886078579	0.626753983463948	-0.0325714586793536	0.0341567687873633	0.0536190991506862	NA	NA	0.0650523096106345	0.616584790623579	305	5	690	0.69	0.305	0.61
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.33333333333336	3	36.25	0.0403684875103351	0.0876910035441767	0.46034924768535	-0.0473225160338416	0.0298046883578733	0.0517842371067451	NA	NA	0.0658181183113859	0.472147575920318	233	5	762	0.762	0.233	0.466
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGG:CGCAGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333336	3	35.916666666666664	0.0398323689854613	0.0885548256923263	0.449804611708619	-0.048722456706865	0.0306488447870149	0.0553116080725102	NA	NA	0.0583080642901218	0.403377669918516	189	8	803	0.803	0.189	0.378
N	all	ss13	35	GGG	GTG	GGG	2	AGTGGGGCG:AGTGGTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333336	3	35.916666666666664	0.0398323689854613	0.0885548256923263	0.449804611708619	-0.048722456706865	0.029602466181665	0.0540297988897046	NA	NA	0.0621525764644701	0.433088857165405	213	5	782	0.782	0.213	0.426
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666669	3	35.583333333333336	0.0393963647100293	0.0894358561096487	0.440498547492286	-0.0500394913996193	0.0309522240251773	0.0558613993293369	NA	NA	0.0620160848557544	0.419736060578245	195	8	797	0.797	0.195	0.39
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAT	2	GCACGGCCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1.16666666666667	0.416666666666667	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.83333333333336	3	34.916666666666664	0.039054375562259	0.091251642986027	0.42798545082897	-0.052197267423768	0.0290665863357699	0.057755071980559	NA	NA	0.0623108457780046	0.402203974472276	173	3	824	0.824	0.173	0.346
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	CGATCAAAA:CGGCCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666669	3	35.5	0.0391393148779276	0.089658862987337	0.436535927111361	-0.0505195481094094	0.0301203609997814	0.0534811342111531	NA	NA	0.0605022828976034	0.403716387941581	196	2	802	0.802	0.196	0.392
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333336	2	35.833333333333336	0.0393103070130301	0.0579999025523778	0.677765052752119	-0.018689595539347698	0.0312697805467926	0.0409968817538334	NA	NA	0.0530115042397507	0.724420315407821	335	12	653	0.653	0.335	0.67
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000001	2	35.583333333333336	0.0396131668795608	0.058423686245627	0.678032651226724	-0.0188105193660662	0.0290341255931354	0.0406868664694974	NA	NA	0.052498250196812	0.720113169202669	348	11	641	0.641	0.348	0.696
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000001	2	36.083333333333336	0.0401433603117785	0.0575822255219405	0.697148468089041	-0.017438865210162	0.0313031703848352	0.0422093133604824	NA	NA	0.0513533200963895	0.734168371737846	371	9	620	0.62	0.371	0.742
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666667	2	36.416666666666664	0.0403232602433046	0.0570345959917882	0.706996508734984	-0.0167113357484836	0.0323848925164091	0.0429821760850228	NA	NA	0.0535420105049473	0.754952117491475	363	18	619	0.619	0.363	0.726
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAG:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666667	2	36.833333333333336	0.0403232602433046	0.0563645417845084	0.715401189589503	-0.0160412815412038	0.0301707405490952	0.0406827116524007	NA	NA	0.0529999600802757	0.762144474136716	368	18	614	0.614	0.368	0.736
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT:CCCCAGGGT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666667	2	36.666666666666664	0.0403232602433046	0.0566306643811089	0.712039328586013	-0.0163074041378043	0.030488580733065	0.0407805443845286	NA	NA	0.0522118445441126	0.754788597025145	355	9	636	0.636	0.355	0.71
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA:CAGGGTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666667	2	35.5	0.0403232602433046	0.0585663277285774	0.6885058668896	-0.0182430674852728	0.0296181059798935	0.0424429718318064	NA	NA	0.0511939295587274	0.721576850026996	335	15	650	0.65	0.335	0.67
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333333	3	35.5	0.0402331091273882	0.089658862987337	0.448735437712059	-0.0494257538599488	0.028644816245929	0.0568977272466785	NA	NA	0.0617768010548722	0.423670348020749	190	7	803	0.803	0.19	0.38
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333333	3	35.166666666666664	0.0402331091273882	0.09056213746611	0.444259712205271	-0.0503290283387218	0.0300694867544595	0.0541672525173098	NA	NA	0.0646514535075856	0.43629370559781	180	7	813	0.813	0.18	0.36
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333333	3	35.166666666666664	0.0402331091273882	0.09056213746611	0.444259712205271	-0.0503290283387218	0.0294643794254838	0.0549493689332528	NA	NA	0.0638784717487331	0.430762706373244	178	3	819	0.819	0.178	0.356
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACC:AATAATACT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666666	3	35.166666666666664	0.0405961546323978	0.09056213746611	0.448268512297312	-0.0499659828337122	0.0309451089235043	0.056021851347443	NA	NA	0.0655259556505989	0.445739412442895	206	7	787	0.787	0.206	0.412
N	all	ss13	50	ACC	ATA	CCG	2	AATACCGCG:AATACTGCG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333333	3	35.5	0.0407801460981609	0.089658862987337	0.454836752769445	-0.0488787168891761	0.0311519450360132	0.0540092313743107	NA	NA	0.0632192921744698	0.439426862986538	211	1	788	0.788	0.211	0.422
N	all	ss13	51	GCG	CCG	CGT	2	ACCGCGTCT:ACTGCGTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666666	3	35.666666666666664	0.0408727688266098	0.089213957146024	0.4581432113779	-0.0483411883194142	0.0321521933539938	0.0580734712936042	NA	NA	0.0643134457610318	0.452261689647451	205	8	787	0.787	0.205	0.41
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333333	3	35.666666666666664	0.0405047802473168	0.089213957146024	0.454018424281071	-0.0487091768987072	0.0324379216258785	0.0565187812637612	NA	NA	0.0636047041340093	0.44378881653743	191	5	804	0.804	0.191	0.382
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75	3	35	0.040687942312311	0.0910206427532006	0.447018841897601	-0.0503327004408896	0.0312120496651379	0.0568978633695537	NA	NA	0.0653859641554797	0.441431376736647	226	8	766	0.766	0.226	0.452
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666667	3	34	0.0408727688266098	0.0938723572155045	0.435407930928776	-0.0529995883888947	0.032721138923037	0.0566588899011709	NA	NA	0.0671568023941631	0.429999995473329	213	9	778	0.778	0.213	0.426
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666667	3	33.416666666666664	0.054077470426008	0.0956200277799543	0.56554543730581	-0.0415425573539464	0.0331055745579639	0.0588184144186559	NaN	NaN	0.0703634558323605	0.554922767501997	277	2	721	0.721	0.277	0.554
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77	3	33.08333333333333	0.053834761795598	0.0966482688635724	0.557017341630718	-0.0428135070679744	0.0329652048359276	0.059293844934047	NA	NA	0.0708602720765339	0.545713207536233	283	4	713	0.713	0.283	0.566
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666667	3	33.08333333333333	0.0533558250189308	0.0966482688635724	0.552061880117556	-0.0432924438446416	0.0338517532116031	0.0583960054272488	NA	NA	0.0680165668103461	0.524451547854081	248	2	750	0.75	0.248	0.496
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.66666666666667	3	33.08333333333333	0.0533558250189308	0.0966482688635724	0.552061880117556	-0.0432924438446416	0.0335407809025214	0.0594198185169409	NA	NA	0.069209421753818	0.531624457155391	253	0	747	0.747	0.253	0.506
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.33333333333334	3	32.58333333333333	0.0528853382457436	0.0982328346145694	0.538367221644848	-0.0453474963688258	0.0314492264643984	0.0577515935496018	NA	NA	0.0718178073416827	0.527763244005285	267	3	730	0.73	0.267	0.534
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.33333333333334	3	31.916666666666664	0.0521949688493964	0.100428343016685	0.519723489221813	-0.0482333741672882	0.0318393805202043	0.0616862896718631	NA	NA	0.0717378744699144	0.501357230311413	267	2	731	0.731	0.267	0.534
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG:CATGGTAAG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78	3	32.58333333333333	0.0531195394264593	0.0982328346145694	0.54075136521186	-0.0451132951881101	0.0317388946541398	0.0590603011798173	NaN	NaN	0.0695127967869895	0.516343117762562	252	2	746	0.746	0.252	0.504
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGTAAGGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.83333333333334	3	33.416666666666664	0.0532374199351599	0.0956200277799543	0.556760138761647	-0.0423826078447944	0.034555440279834	0.0571766722389129	NA	NA	0.0677190409505538	0.531407074457893	291	1	708	0.708	0.291	0.582
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAAGGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.5	3	33.083333333333336	0.0534747581886499	0.0966482688635724	0.553292457458645	-0.0431735106749226	0.0317995873170697	0.0586961362712914	NA	NA	0.0671199641430898	0.520075487045751	228	2	770	0.77	0.228	0.456
N	all	ss13	64	GAC	AAG	ACC	2	GAAGACCTT:GAAGGACTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5	3	33.416666666666664	0.0541996476239405	0.0956200277799543	0.566823173788105	-0.0414203801560138	0.033619251944164	0.0611638699973872	NA	NA	0.0683134377744126	0.544296676860268	267	2	731	0.731	0.267	0.534
N	all	ss13	65	CTC	ACC	TCA	2	GACCTTAAA:GGACTCAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333334	3	33.666666666666664	0.0273067703935705	0.0948631103318397	0.287854470489624	-0.0675563399382691	0.0193527047654985	0.0562885437489313	NA	NA	0.0595142810741101	0.256321599167607	105	5	890	0.89	0.105	0.21
N	all	ss13	66	AAA	TCA	AAT	2	CTCAAATTC:CTTAAATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666667	3	32.833333333333336	0.0273690573365762	0.0974341006801572	0.280898136745978	-0.070065043343581	0.0181980977840681	0.0603502725763475	NA	NA	0.0638025574380501	0.272137182584739	128	3	869	0.869	0.128	0.256
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.83333333333333	3	32.75	0.0275893176123833	0.0976988961284261	0.2823912931024	-0.0701095785160428	0.0188631740977987	0.0594490105890417	NA	NA	0.0682402995027141	0.304235636058074	102	5	893	0.893	0.102	0.204
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCAA:TTCCCTCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.5	3	33.416666666666664	0.0281063333749098	0.0956200277799543	0.293937724423062	-0.0675136944050445	0.0188459574652104	0.0590210794703698	NA	NA	0.0646653951077658	0.296463769276599	93	4	903	0.903	0.093	0.186
N	all	ss13	69	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGC:CCTCGAGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.5	3	33.416666666666664	0.0281063333749098	0.0956200277799543	0.293937724423062	-0.0675136944050445	0.0194638646803326	0.0561877958817075	NA	NA	0.0631023413058002	0.284660760135374	108	3	889	0.889	0.108	0.216
N	all	ss13	70	GGA	AAG	GAC	2	CAAGGCCAG:CGAGGACAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.33333333333334	3	33.166666666666664	0.0137618540011474	0.0963891381007337	0.142773908682172	-0.0826272840995863	0.0137868728254809	0.0580667494576359	NA	NA	0.0610364440852643	0.175820344295735	41	15	944	0.944	0.041	0.082
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25	3	33.25	0.0137776549513118	0.0961313950679982	0.1433210757169	-0.0823537401166865	0.0133601794959213	0.0582464664462304	NA	NA	0.0611429351407963	0.17801075165677	60	13	927	0.927	0.06	0.12
N	all	ss13	72	GGA	AAG	GAG	2	CAAGGCGTT:CAGGGAGTT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25	3	33.583333333333336	0.0282054389472648	0.0951140793534504	0.296543257727927	-0.0669086404061856	0.0202966786244219	0.058641832856589	NA	NA	0.0624341602028378	0.283869547112901	101	3	896	0.896	0.101	0.202
N	all	ss13	73	GTT	GAG	TTC	2	GGAGTTCCT:GGCGTTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.33333333333334	3	33.5	0.0281723261817364	0.095366381613935	0.295411503560913	-0.0671940554321986	0.0202797539276401	0.0578059139753017	NA	NA	0.0652898556807233	0.303401994209665	115	6	879	0.879	0.115	0.23
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATT:GTTCCTATC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.66666666666669	3	33.166666666666664	0.0280406490537152	0.0963891381007337	0.290910880688763	-0.0683484890470185	0.0198536810269353	0.0595787506828962	NA	NA	0.0638677225377829	0.284548654994414	114	4	882	0.882	0.114	0.228
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATTAAC:CCTATCAAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.16666666666669	3	33.666666666666664	0.0282386296527663	0.0948631103318397	0.297677670002439	-0.0666244806790734	0.0201898010284436	0.0576956602305023	NA	NA	0.0621527018430836	0.283743271546555	117	4	879	0.879	0.117	0.234
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.00000000000001	3	32.833333333333336	0.0279101972553257	0.0974341006801572	0.286452043591446	-0.0695239034248314	0.0205594558895189	0.0579744072103906	NA	NA	0.062672754136079	0.267293785391611	87	5	908	0.908	0.087	0.174
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.83333333333336	3	33.333333333333336	0.0283721774047871	0.0958750286324137	0.295928750264748	-0.0675028512276265	0.0197471994581054	0.056738043472332	NA	NA	0.0640292924598853	0.291768690743107	124	5	871	0.871	0.124	0.248
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.50000000000001	3	33.333333333333336	0.0281063333749098	0.0958750286324137	0.293155932006757	-0.0677686952575039	0.0204339088709527	0.0603694591767793	NA	NA	0.0629242210834233	0.281485170621778	111	4	885	0.885	0.111	0.222
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.75000000000001	3	33.083333333333336	0.0280079218999906	0.0966482688635724	0.289792276978352	-0.0686403469635818	0.0204838161190842	0.0618965660482244	NA	NA	0.065198824644775	0.292439524631771	122	4	874	0.874	0.122	0.244
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GCA	2	AGCAGTCCA:AGTGGCACA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333336	3	33	0.042364201600918	0.0969087986100047	0.437155368847431	-0.0545445970090867	0.0242355166034554	0.0611400181901747	NA	NA	0.0624890889260942	0.382736155931113	165	1	834	0.834	0.165	0.33
N	all	ss13	81	ACA	GCA	CAG	2	AGTCCAGAT:GGCACAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333336	2	32.66666666666667	0.042364201600918	0.0638683562552301	0.663305024347622	-0.0215041546543121	0.0238285483132641	0.0471544325865331	NA	NA	0.0550839206059082	0.696248947823585	336	8	656	0.656	0.336	0.672
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	ACAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.08333333333336	1	32.66666666666667	0.042215127927666	0.0312545223004261	1.35068863065268	0.01096060562724	0.0247251595666868	0.0324103753318757	NA	NA	0.0413465001316514	0.790938977282884	639	13	348	0.348	0.639	0.696
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.91666666666669	2	33.333333333333336	0.0429199333819239	0.0625362067042883	0.686321343168081	-0.0196162733223644	0.025702586004241	0.0466802136480135	NA	NA	0.052820913624472	0.710359561302769	361	7	632	0.632	0.361	0.722
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000001	2	34.333333333333336	0.0433333505001085	0.0606390724718212	0.714611037631643	-0.0173057219717127	0.0251050548235604	0.0455526788884135	NA	NA	0.0538981753777932	0.748148419000626	389	1	610	0.61	0.389	0.778
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000001	2	34.666666666666664	0.0439686325106427	0.0600320307551523	0.73241954266005	-0.0160633982445096	0.0245504095565189	0.0466489594127565	NA	NA	0.0546662915394317	0.768876601482229	398	5	597	0.597	0.398	0.796
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	2	34.33333333333333	0.044076328753575	0.0606390724718212	0.726863504946537	-0.0165627437182462	0.0253420980388784	0.0461975134419993	NA	NA	0.052235971902555	0.751186360965151	368	6	626	0.626	0.368	0.736
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC:GGCTACTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000001	2	34.666666666666664	0.0442933122327008	0.0600320307551523	0.737827984086634	-0.0157387185224515	0.0261438678749743	0.0441927804671234	NA	NA	0.053161081773602	0.767186434822646	399	2	599	0.599	0.399	0.798
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA:TACTATAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333334	2	34.99999999999999	0.044076328753575	0.0594370287406054	0.741563461153696	-0.0153606999870304	0.0249942836428125	0.0451916327375627	NA	NA	0.0516875127265928	0.766326063032316	413	4	583	0.583	0.413	0.826
N	all	ss13	89	AGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA:TATAGAAGA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.25	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.66666666666667	2	34.416666666666664	0.0437016810929818	0.0604861633757489	0.722507076891298	-0.016784482282767	0.0246380908843475	0.0465800111229826	NA	NA	0.0521284347566411	0.747465392025655	398	1	601	0.601	0.398	0.796
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	AGAAGAGCT:CGAAGAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.41666666666667	2	34.83333333333333	0.0438614614252191	0.0597330472949441	0.734291374900803	-0.0158715858697249	0.0246855527007923	0.0468902135299421	NA	NA	0.0515169160216077	0.758017702051288	405	10	585	0.585	0.405	0.81
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75	2	35	0.0449572769752752	0.0594370287406054	0.756384999853835	-0.0144797517653302	0.0255685827214183	0.0442449842681755	NA	NA	0.0501235827711603	0.772672427905336	428	6	566	0.566	0.428	0.856
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333334	2	34.33333333333333	0.0447337539717068	0.0606390724718212	0.737705115666049	-0.0159053185001144	0.024563845769668	0.0451177576140342	NA	NA	0.0518756566005245	0.759144299674864	369	5	626	0.626	0.369	0.738
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000001	2	34.166666666666664	0.0446228241484838	0.0609472230590743	0.732155164891306	-0.0163243989105905	0.0253775587855098	0.0444027462873294	NA	NA	0.0562122558535957	0.771505347376948	409	5	586	0.586	0.409	0.818
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	2	33.99999999999999	0.0444026073250892	0.0612585232607004	0.72483966249273	-0.0168559159356113	0.0256612956851024	0.0475239215860085	NA	NA	0.0531013050664415	0.750917794287404	362	4	634	0.634	0.362	0.724
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	34.49999999999999	0.0439686325106426	0.0603340239140544	0.728753523439374	-0.0163653914034118	0.0252969692194391	0.0450443139642169	NA	NA	0.0513952300778917	0.750164565421962	419	3	578	0.578	0.419	0.838
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.75000000000003	1	34.49999999999999	0.043648679432241	0.0295604764056575	1.47658917377554	0.0140882030265836	0.0242424429223463	0.0305770931664265	NA	NA	0.0394132337822219	0.720756041023844	643	18	339	0.339	0.643	0.678
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.08333333333336	1	34.83333333333333	0.0434379525548368	0.0292720079293014	1.48394167765154	0.0141659446255353	0.0258289152424767	0.0309830209743094	NA	NA	0.0412482597277669	0.731273994561438	645	11	344	0.344	0.645	0.688
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.41666666666669	1	35	0.0432292511544661	0.0291298749871979	1.48401773689261	0.0140993761672681	0.0243199127788749	0.0300209359521699	NA	NA	0.0406946985137559	0.728991668574473	630	16	354	0.354	0.63	0.708
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333336	1	34.333333333333336	0.0428178090539073	0.0297068535712844	1.44134446790745	0.0131109554826229	0.025203904378652	0.031132216528944	NA	NA	0.0388677193066629	0.735873814892978	677	15	308	0.308	0.677	0.616
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.41666666666669	1	34.333333333333336	0.0432292511544661	0.0297068535712844	1.45519454124394	0.0135223975831817	0.0253858042282852	0.0306924488930961	NA	NA	0.0381869346089325	0.723256013067777	651	16	333	0.333	0.651	0.666
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.41666666666669	1	34.333333333333336	0.0432292511544661	0.0297068535712844	1.45519454124394	0.0135223975831817	0.0252810763195053	0.0309585685562809	NA	NA	0.0399516386261691	0.735009663528482	636	18	346	0.346	0.636	0.692
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.41666666666669	1	34.333333333333336	0.0432292511544661	0.0297068535712844	1.45519454124394	0.0135223975831817	0.025743746438729	0.0308868958578753	NA	NA	0.038461879103471	0.725153848997345	652	16	332	0.332	0.652	0.664
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.75000000000001	1	35	0.0430225461599401	0.0291298749871979	1.47692175743452	0.0138926711727422	0.0250332850805456	0.0302178729435528	NA	NA	0.0399830235504849	0.728242573975396	631	20	349	0.349	0.631	0.698
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTT:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.25000000000001	2	36.16666666666667	0.0583526258768297	0.0574443341110379	1.01581168586681	9.08291765791873e-4	0.0287610004833328	0.0426688702293255	NA	NA	0.0406798770903927	0.982186480937856	514	4	482	0.482	0.514	0.964
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTTAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333336	2	36.583333333333336	0.0435958062133857	0.0567646707244322	0.768009497051861	-0.013168864511046499	0.0263620422398643	0.0400558071954282	NA	NA	0.0407033602654024	0.746291912717194	384	16	600	0.6	0.384	0.768
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGTCCA:CTTAGCCCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.16666666666669	2	36.91666666666667	0.0433855884614561	0.0562324166616758	0.77154052834839	-0.0128468282002197	0.0263691653188258	0.0397008927436632	NA	NA	0.038819224305928	0.74068992174396	384	19	597	0.597	0.384	0.768
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333336	2	36.583333333333336	0.0435958062133857	0.0567646707244322	0.768009497051861	-0.013168864511046499	0.0255938824653228	0.0406624293647683	NA	NA	0.0396070335133559	0.739520777466781	400	16	584	0.584	0.4	0.8
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333336	2	36.583333333333336	0.0435958062133857	0.0567646707244322	0.768009497051861	-0.013168864511046499	0.0245490091334642	0.0405283872456137	NA	NA	0.0371511767083634	0.72298896395523	376	20	604	0.604	0.376	0.752
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333336	2	36.91666666666667	0.0435958062133857	0.0562324166616758	0.775278901415198	-0.0126366104482901	0.0269203638866546	0.0415157665892264	NA	NA	0.0405507663317938	0.755325946864395	375	19	606	0.606	0.375	0.75
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000001	2	37.25	0.0444574574471551	0.0557100557871529	0.798014951142938	-0.0112525983399977	0.0264028003887382	0.0408786598483835	NA	NA	0.0387975392599453	0.771790367956665	415	22	563	0.563	0.415	0.83
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	2	36.25	0.044076328753575	0.0573071018565008	0.769125070465853	-0.0132307731029258	0.0256531202582342	0.0399028564436274	NA	NA	0.0400913801638913	0.741388321334259	393	15	592	0.592	0.393	0.786
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.91666666666669	2	35.41666666666667	0.0441845540246642	0.0587096677913667	0.752594175488786	-0.0145251137667025	0.0264660730599808	0.0416805630353293	NA	NA	0.0396225314822686	0.713926940599486	355	16	629	0.629	0.355	0.71
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333336	2	34.75	0.0437548116643347	0.0598821656332629	0.730681851626791	-0.0161273539689281	0.0261554984219763	0.043889632230906	NA	NA	0.0435269630094781	0.710999465068739	335	16	649	0.649	0.335	0.67
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.08333333333336	2	34.25	0.0434379525548368	0.0607927570603562	0.714525128572648	-0.0173548045055194	0.0255642747586782	0.0440897868160045	NA	NA	0.0412471437759385	0.673936428572068	337	17	646	0.646	0.337	0.674
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000003	2	34.583333333333336	0.0424141271286909	0.0601826482875392	0.704756741944053	-0.0177685211588482	0.0243395475565806	0.0433059815548488	NA	NA	0.0402156853401047	0.658611779690597	322	17	661	0.661	0.322	0.644
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000003	2	35.083333333333336	0.0421163271222965	0.0592901175479514	0.71034312064290706	-0.0171737904256548	0.0248556917894241	0.0438838417967457	NA	NA	0.0412884206650418	0.67744886221573	349	13	638	0.638	0.349	0.698
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.58333333333337	2	34.75	0.0419201068148284	0.0598821656332629	0.700043266163088	-0.0179620588184345	0.0251986534764417	0.0429206113605171	NA	NA	0.0429602326322423	0.675867443525029	304	15	681	0.681	0.304	0.608
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25000000000004	2	34.083333333333336	0.0415331021017154	0.0611024764460933	0.679728621774558	-0.0195693743443779	0.0243921690405317	0.0446180122888744	NA	NA	0.0414803446718759	0.637087659827188	322	18	660	0.66	0.322	0.644
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333337	2	33.083333333333336	0.0407801460981609	0.0630291953285242	0.64700407304273	-0.0222490492303632	0.0241785584826698	0.0444079666071605	NA	NA	0.0429801779563688	0.60469664273832	295	9	696	0.696	0.295	0.59
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.9166666666667	2	33.083333333333336	0.0411531794236846	0.0630291953285242	0.652922494237532	-0.0218760159048395	0.0226507286212429	0.0465112688269971	NA	NA	0.0419705156014802	0.60221113735012	310	16	674	0.674	0.31	0.62
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333337	2	33.083333333333336	0.0407801460981609	0.0630291953285242	0.64700407304273	-0.0222490492303632	0.0234824600004634	0.0439061347551993	NA	NA	0.0435053124419642	0.60906403603977	297	17	686	0.686	0.297	0.594
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25000000000004	2	32.416666666666664	0.026699148503671	0.0643826713791054	0.41469463648779	-0.0376835228754345	0.0189735241568475	0.0468317447781089	NA	NA	0.0411018342299183	0.359230094860167	136	55	809	0.809	0.136	0.272
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25000000000004	2	33.083333333333336	0.026699148503671	0.0630291953285242	0.423599704303826	-0.0363300468248532	0.0189222079328841	0.0424358693095047	NA	NA	0.0413273829936823	0.379358281665752	151	34	815	0.815	0.151	0.302
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333337	2	33.75	0.0269389228181416	0.0617314855970427	0.43638870112389	-0.0347925627789011	0.0186849718630389	0.0452903972469202	NA	NA	0.0383356949709653	0.364102195298666	136	46	818	0.818	0.136	0.272
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCC:TATGGTGCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.4166666666667	2	33.91666666666667	0.0269995408952429	0.0614153696041381	0.43962189056701	-0.0344158287088952	0.0184097837802557	0.044179493556728	NA	NA	0.0392155029962853	0.380156630919422	157	56	787	0.787	0.157	0.314
N	all	ss13	126	GCC	GTG	CCA	2	GGTGCCAAT:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333337	2	34.66666666666667	0.0270299523623976	0.0600320307551523	0.450258837197137	-0.0330020783927547	0.0190161286650496	0.0442384829401827	NA	NA	0.0375328479170175	0.379246648278872	162	49	789	0.789	0.162	0.324
N	all	ss13	127	AAC	CCA	ACA	2	GCCAATAAA:GCTAACAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666671	2	33.833333333333336	0.0267288865855191	0.0615730216404005	0.43410061538999	-0.0348441350548815	0.0190951990420731	0.0446254189386347	NA	NA	0.0377405079866753	0.355874024140516	136	40	824	0.824	0.136	0.272
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC:AATAAAGAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666671	2	33.833333333333336	0.0267288865855191	0.0615730216404005	0.43410061538999	-0.0348441350548815	0.0186505309760956	0.0453005145079315	NA	NA	0.0407089643865596	0.392034989243503	150	34	816	0.816	0.15	0.3
N	all	ss13	129	GAC	AAG	ACG	2	AAAGACGGC:AAAGAGGGC	1:1	FALSE	2.08333333333333	0.333333333333333	0.583333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	33.666666666666664	0.0268184996810859	0.0618907677660026	0.433319873853911	-0.0350722680849167	0.0186873872974227	0.0422832911130285	NA	NA	0.0368802017702036	0.341615439821	126	49	825	0.825	0.126	0.252
N	all	ss13	130	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATC:GAGGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000006	3	33.75	0.0133633824875953	0.094613463995175	0.141241869003727	-0.0812500815075797	0.014235874652492	0.0585365718047533	NA	NA	0.0524341027841865	0.121245816916403	0	54	946	0.946	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666671	3	34.083333333333336	0.013423177093157	0.0936278982824406	0.143367279832174	-0.0802047211892836	0.0133379285950541	0.0548077625172297	NA	NA	0.0508640062999504	0.114830890457496	0	47	953	0.953	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.58333333333339	3	34.083333333333336	0.0133485169832455	0.0936278982824406	0.142569866761059	-0.0802793812991951	0.0137355181877142	0.0600093068792623	NA	NA	0.048664376043237	0.0990137290566425	0	51	949	0.949	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333339	2	34.083333333333336	0.0132600139021293	0.0611024764460933	0.217012708377339	-0.047842462543964	0.0133176939506513	0.0424738788894979	NA	NA	0.0373804444827418	0.200587537702016	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.75000000000006	2	33.416666666666664	0.0133188849757348	0.062373587449531503	0.213534053761322	-0.0490547024737967	0.0133604051552931	0.0462914323294647	NA	NA	0.0362206252864758	0.175630916390535	0	138	862	0.862	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.0833333333334	2	33.083333333333336	0.0132600139021293	0.0630291953285242	0.210378917785872	-0.0497691814263949	0.0135092450870523	0.0471754351662509	NA	NA	0.0376444196349534	0.186139327192474	0	157	843	0.843	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.41666666666673	2	33.75000000000001	0.0133782811395161	0.0617314855970427	0.216717304145958	-0.0483532044575266	0.013147665122886	0.0457037360891171	NA	NA	0.036957731039175	0.190758686671829	0	136	864	0.864	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA:ACTGAGGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.0833333333334	2	34.083333333333336	0.0134382094503063	0.0611024764460933	0.219929047592072	-0.047664266995787	0.0133706920434068	0.0462145396885863	NA	NA	0.0372835404700094	0.201099077217484	0	138	862	0.862	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC:GAGGGTGCC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000007	2	33.75000000000001	0.0134986770919624	0.0617314855970427	0.218667620929717	-0.0482328085050803	0.0141566117659806	0.0460543904558498	NA	NA	0.0379920794568586	0.20424530684805	0	119	881	0.881	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG:GGTGCCTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666673	2	34.33333333333334	0.0136058153029875	0.0606390724718212	0.224373737070436	-0.0470332571688337	0.014691998842103	0.0436265794861719	NA	NA	0.036260817103936	0.194602936222292	0	115	885	0.885	0	0.001
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.50000000000007	2	34.00000000000001	0.0135443861537981	0.0612585232607003	0.221102067644639	-0.0477141371069023	0.0142550387783426	0.0434106180534454	NA	NA	0.0366999699847553	0.19356197164481	0	135	865	0.865	0	0.001
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	TTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666674	2	33.66666666666667	0.0132453773639628	0.0618907677660026	0.214012167598907	-0.0486453904020398	0.0135341056573734	0.0458412728797149	NA	NA	0.0366026742018012	0.183844036531875	0	142	858	0.858	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCA:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666674	2	34.66666666666667	0.0132453773639628	0.0600320307551523	0.220638502435235	-0.0467866533911895	0.0135484393391492	0.0445590155532091	NA	NA	0.0391045328530022	0.231520649699321	0	126	874	0.874	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.00000000000007	2	34.833333333333336	0.0132746828245506	0.0597330472949441	0.22223347754224199	-0.0464583644703934	0.0140900687212607	0.0450691438474213	NA	NA	0.0357431942179896	0.193675658066635	0	145	855	0.855	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666673	3	35.50000000000001	0.0407339920153049	0.089658862987337	0.454321978420114	-0.0489248709720321	0.0322185019142627	0.0522070796047572	NA	NA	0.039576372671108	0.216378981078859	16	51	933	0.933	0.016	0.032
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC:AAAGATCAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000007	3	35.66666666666667	0.0549444688504894	0.089213957146024	0.615873015929079	-0.0342694882955346	0.0341188062881515	0.0546080184204754	NA	NA	0.0415020861432379	0.408957670848471	171	11	818	0.818	0.171	0.342
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT:GATCATATT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.3333333333334	3	36.16666666666667	0.0566306643811088	0.0879053734766805	0.644223010964532	-0.0312747090955717	0.0370610330018757	0.0514195829509848	NA	NA	0.0404238707920398	0.439126360542769	196	18	786	0.786	0.196	0.392
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC:CATATTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000007	3	36.00000000000001	0.056899313081035	0.0883372767422875	0.644114412164089	-0.031437963661252503	0.0352980245670827	0.052446621165141	NA	NA	0.0398379073450561	0.430026115230234	192	17	791	0.791	0.192	0.384
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666674	3	35.16666666666667	0.0711433450940077	0.0905621374661099	0.785574933239964	-0.0194187923721021	0.0376697880072351	0.0532209523098293	NA	NA	0.0425266963248307	0.647939936328848	328	3	669	0.669	0.328	0.656
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666674	3	35.66666666666667	0.0726960870999214	0.089213957146024	0.814851054986089	-0.0165178700461026	0.0387612316278071	0.0523730706026454	NA	NA	0.0401442657831046	0.680733248951296	369	6	625	0.625	0.369	0.738
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.83333333333341	3	35	0.0719976858062998	0.0910206427532006	0.791003926455662	-0.0190229569469009	0.0385631916105884	0.0541439902021101	NA	NA	0.0429389321977856	0.657748721513603	350	4	646	0.646	0.35	0.7
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.66666666666674	3	35.16666666666667	0.0721710240709152	0.0905621374661099	0.79692271064078	-0.0183911133951946	0.0402357984641973	0.0544140264796231	NA	NA	0.0405238229166731	0.649947870489739	347	7	646	0.646	0.347	0.694
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.3333333333334	3	34.833333333333336	0.0725202186018532	0.0914838201648646	0.792710869213411	-0.0189636015630114	0.0433597023905325	0.0538329572868857	NA	NA	0.0417367346761667	0.649568034002705	339	3	658	0.658	0.339	0.678
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000007	3	34.833333333333336	0.0718251788190062	0.0914838201648646	0.785113462572604	-0.0196586413458584	0.0390982226212515	0.0548911551997521	NA	NA	0.0435380063956644	0.651608844186649	355	5	640	0.64	0.355	0.71
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000007	2	34.66666666666667	0.0564972895530331	0.0600320307551523	0.941119079970225	-0.00353474120211914	0.0349170681593812	0.0423081809987842	NA	NA	0.0398931773614776	0.929395710336486	507	19	474	0.474	0.507	0.948
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.33333333333341	2	34.5	0.0566306643811088	0.0603340239140544	0.938619052854472	-0.00370335953294561	0.0358929333518318	0.0446347781236981	NA	NA	0.0382896346515379	0.922949045523307	488	16	496	0.496	0.488	0.976
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.66666666666674	2	34.5	0.0571705240409131	0.0603340239140544	0.94756690059911	-0.00316349987314131	0.0363734706937321	0.044775254918548	NA	NA	0.0403168500226762	0.937457415930954	502	11	487	0.487	0.502	0.974
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000007	2	34.5	0.0718251788190062	0.0603340239140544	1.19045895101114	0.0114911549049518	0.0379694827270713	0.0449155297979307	NA	NA	0.0420399771348131	0.784592828927866	615	6	379	0.379	0.615	0.758
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666674	2	34.333333333333336	0.0716534971389809	0.0606390724718212	1.18163906897286	0.0110144246671597	0.0398200333690854	0.0444094597446168	NA	NA	0.043587454939409	0.800502267626847	615	6	379	0.379	0.615	0.758
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA:ATTGTTCTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666674	2	34.833333333333336	0.0726960870999214	0.0597330472949441	1.2170162145080199	0.0129630398049773	0.0401768302526272	0.0424008775351083	NA	NA	0.0433783703703254	0.765064809840609	638	3	359	0.359	0.638	0.718
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA:GTTCTACAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0	0.416666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.66666666666674	2	35.333333333333336	0.073228852172937	0.0588537115811214	1.24425206508856	0.0143751405918155	0.0405028005276963	0.0428876986740854	NA	NA	0.040289702042219	0.721245719108156	667	8	325	0.325	0.667	0.65
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.41666666666674	2	35.833333333333336	0.0734981761725992	0.0579999025523778	1.26721206309313	0.0154982736202214	0.0400929910802771	0.0433132431495451	NA	NA	0.0406405589165541	0.70294362128839	669	6	325	0.325	0.669	0.65
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.91666666666674	3	36.16666666666667	0.0729614963194685	0.0879053734766805	0.830000413328814	-0.0149438771572119	0.0396843531506326	0.0533937340814993	NA	NA	0.0538547409609192	0.781407802432897	413	5	582	0.582	0.413	0.826
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.91666666666674	3	36.16666666666667	0.0729614963194685	0.0879053734766805	0.830000413328814	-0.0149438771572119	0.0382644460008177	0.0562968361594124	NaN	NaN	0.0545759312224657	0.78422442219841	431	0	569	0.569	0.431	0.862
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.5833333333334	4	36.833333333333336	0.0733184070851302	0.117311764843583	0.624987674364025	-0.0439933577584525	0.0386104204527779	0.0657418773772358	NA	NA	0.0623491100262897	0.480438663016153	235	1	764	0.764	0.235	0.47
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000006	5	36.833333333333336	0.0893247686558476	0.149749252688945	0.59649558880531	-0.0604244840330977	0.043558870756449	0.0747306867230171	NA	NA	0.0692559253330653	0.382945989242243	175	0	825	0.825	0.175	0.35
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.58333333333339	5	36.5	0.0888831680248487	0.151264442981809	0.587601198753216	-0.0623812749569606	0.0423180600273236	0.0695510018950981	NaN	NaN	0.0691333786857293	0.366880415631254	163	1	836	0.836	0.163	0.326
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.91666666666673	5	37.16666666666667	0.089770784493262007	0.148264213964023	0.605478436725433	-0.0584934294707613	0.0435140060750336	0.0738777820994382	NaN	NaN	0.067557328270955	0.386581219635236	188	0	812	0.812	0.188	0.376
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.91666666666673	5	37.833333333333336	0.105835655718879	0.145381050470112	0.727987969385578	-0.0395453947512329	0.0468440678513138	0.0714177502377485	NA	NA	0.0687237279960721	0.565003471748154	296	0	704	0.704	0.296	0.592
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	70.08333333333339	6	38.333333333333336	0.107188445973217	0.1755544663848	0.610570885381348	-0.0683660204115826	0.0478117176072404	0.0804942725406203	NaN	NaN	0.0806283328935402	0.39648498188464	185	0	815	0.815	0.185	0.37
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.58333333333339	6	38.833333333333336	0.108016877019068	0.173011971365532	0.624331808755909	-0.0649950943464638	0.0473848595409138	0.0806674776187479	NaN	NaN	0.0768564564608536	0.397737627101453	200	0	800	0.8	0.2	0.4
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.25000000000006	6	39.50000000000001	0.110290063467372	0.169734844556617	0.64977856347336	-0.0594447810892442	0.0488683654793717	0.0813610688241527	0.457401132743382	0.155436567112899	0.0822896510307102	0.470058019181354	192	0	808	0.808	0.192	0.384
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	67.91666666666671	6	39.83333333333334	0.110873416072648	0.168142592913661	0.659401131809479	-0.0572691768410123	0.047399377551023	0.0770252761147531	NaN	NaN	0.077881062127919	0.462131541437096	259	0	741	0.741	0.259	0.518
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA:TTCTACGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	67.58333333333337	6	39.50000000000001	0.111462983911202	0.169734844556617	0.65668887376877	-0.0582718606454147	0.048728215732861097	0.0777899434252043	NaN	NaN	0.0801164753924728	0.467018132564524	213	0	787	0.787	0.213	0.426
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCTGAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.1666666666667	6	38.50000000000001	0.110435324332129	0.174698668260279	0.632147488197184	-0.0642633439281507	0.0480032984292367	0.0800093766904376	0.512074865471704	0.217023143374306	0.0811639533969119	0.428493644272477	182	0	818	0.818	0.182	0.364
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCTGAAGGG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.83333333333337	6	37.333333333333336	0.109283858386045	0.180871542612666	0.604207034492292	-0.0715876842266208	0.0465903128260953	0.081208369063771	NaN	NaN	0.082364346118635	0.384760358577207	164	2	834	0.834	0.164	0.328
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.08333333333337	7	37.16666666666667	0.110580969035801	0.216883469282523	0.509863519804511	-0.106302500246722	0.0460188206283975	0.100492159878794	0.326718402405044	0.118627711396164	0.0930734793473565	0.253397811259339	106	0	894	0.894	0.106	0.212
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA:GGGAGCAGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.75000000000003	7	37.16666666666667	0.109426474440289	0.216883469282523	0.504540409660013	-0.107456994842234	0.047105233696347	0.0947826085321773	0.447131416976274	0.259153559156486	0.0934654174384527	0.250268316537914	85	0	915	0.915	0.085	0.17
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGCAGGAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.75000000000003	7	36.66666666666667	0.109426474440289	0.220320838896122	0.496668744493487	-0.110894364455834	0.0476444260270125	0.0949478920781592	0.351817059917279	0.158031112031698	0.0977673292025703	0.256682098505837	100	0	900	0.9	0.1	0.2
N	all	ss13	179	AGT	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:AGGAGTGGT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	67.75000000000003	7	36.083333333333336	0.111167416884915	0.224472453654355	0.495238569700369	-0.11330503676944	0.047614614399184	0.0993915132854686	0.417727284504326	0.235798177872775	0.10071055725889	0.260565220428612	102	0	898	0.898	0.102	0.204
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	AGTGGTAGT:GGCGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	67.75000000000003	6	35.41666666666667	0.111167416884915	0.192023563619284	0.578925912995354	-0.0808561467343684	0.048844327733158	0.0870602940824713	NaN	NaN	0.0916080860118569	0.377435613671753	150	0	850	0.85	0.15	0.3
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA:GGTAGTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.4166666666667	6	35.41666666666667	0.110000687190225	0.192023563619284	0.572849941522379	-0.0820228764290582	0.047600402839957	0.0906333928163134	NaN	NaN	0.0855540939818979	0.33769713769562	135	1	864	0.864	0.135	0.27
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.25000000000003	6	34.75000000000001	0.110290063467372	0.196233824001589	0.562033910456127	-0.0859437605342166	0.0496027676875434	0.090023475191307	0.408812850743943	0.169194972795621	0.0903392619448013	0.341429521044939	165	0	835	0.835	0.165	0.33
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	68.50000000000003	6	34.50000000000001	0.109856568765614	0.197860943283853	0.555221090844659	-0.088004374518239	0.0490628806922783	0.0887607432425961	NaN	NaN	0.0893994628452833	0.324921388904477	152	0	848	0.848	0.152	0.304
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.16666666666669	6	34.50000000000001	0.108717098806815	0.197860943283853	0.549462147518664	-0.0891438444770385	0.0458482535341506	0.0865064046016686	NaN	NaN	0.0884945569702037	0.313772839025925	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	69.83333333333336	6	34.50000000000001	0.107601064242965	0.197860943283853	0.543821647957069	-0.0902598790408879	0.0456901910926356	0.0915727844263993	NaN	NaN	0.0868074621949766	0.29844631999013	141	0	859	0.859	0.141	0.282
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.00000000000003	7	33.833333333333336	0.122096350832699	0.242080044197288	0.504363551475538	-0.119983693364589	0.0492829345046273	0.112674390011146	0.330372138081884	0.126847368749383	0.0996105968944938	0.228385797966557	77	0	923	0.923	0.077	0.154
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.25000000000003	7	33.583333333333336	0.121631243552431	0.244209971081393	0.498060103827178	-0.122578727528962	0.0479347423555479	0.115390110618551	NaN	NaN	0.10156187835853	0.227456639355562	74	0	926	0.926	0.074	0.148
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.25000000000003	7	33.583333333333336	0.121631243552431	0.244209971081393	0.498060103827178	-0.122578727528962	0.0477699245565818	0.112522934899692	NaN	NaN	0.105863694269733	0.246908101671093	68	0	932	0.932	0.068	0.136
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.9166666666667	7	33.583333333333336	0.120408143902943	0.244209971081393	0.493051710254749	-0.123801827178449	0.0478287949225722	0.113440406130157	0.317358903480993	0.120277664897676	0.104573233783127	0.236461828302375	89	0	911	0.911	0.089	0.178
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.9166666666667	7	33.583333333333336	0.120408143902943	0.244209971081393	0.493051710254749	-0.123801827178449	0.0494213842231994	0.11655610665394	0.305714362718921	0.106791103954977	0.101657043090349	0.223285476639369	68	0	932	0.932	0.068	0.136
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC:CGTAGTCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	71.9166666666667	7	34.25000000000001	0.120408143902943	0.238612230829161	0.504618491200277	-0.118204086926218	0.0470822086968376	0.102542539562107	0.349454842075791	0.148734387804177	0.100124652843981	0.23777388285603	73	0	927	0.927	0.073	0.146
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGTGGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	72.9166666666667	7	33.25000000000001	0.118619025918598	0.247109400847682	0.48002635881795	-0.128490374929084	0.0481741281806264	0.107290218000654	0.350266891708339	0.170543714804315	0.11189273629401	0.250830186534382	66	1	933	0.933	0.066	0.132
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGTGGAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.58333333333337	7	32.25000000000001	0.115752687680699	0.256240196522408	0.451735087826382	-0.140487508841709	0.0468105912920474	0.115268100579354	0.293918054687977	0.124307442362809	0.109937634824433	0.201290444904512	44	0	956	0.956	0.044	0.088
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGAAATTCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.91666666666671	6	31.250000000000004	0.0835160880143217	0.221785683111784	0.376562124491274	-0.138269595097462	0.0335644791195262	0.111106701737719	0.312135523254708	0.22766103750981	0.107274655430702	0.197422185220929	53	0	947	0.947	0.053	0.106
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333337	6	30.91666666666667	0.0692533163185839	0.224573223705648	0.30837744222505997	-0.155319907387064	0.0305157322178583	0.110692161961498	NA	NA	0.110401532543663	0.159467812478531	32	0	968	0.968	0.032	0.064
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT:TCAAGAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.08333333333339	6	31.083333333333336	0.0678428326164385	0.223170685092358	0.303995269756699	-0.155327852475919	0.0289439033260078	0.10522787804478	NaN	NaN	0.103355468646977	0.132877513337219	25	0	975	0.975	0.025	0.05
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA:AGAACTTCA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.75000000000004	6	31.250000000000004	0.068151282211769	0.221785683111784	0.307284407431383	-0.153634400900015	0.0300685986913709	0.11259780860669	NaN	NaN	0.105426118169787	0.145041650786095	31	0	969	0.969	0.031	0.062
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT:ACTTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000004	6	31.91666666666667	0.0547563501152287	0.216414580065769	0.253015994109954	-0.16165822995054	0.028213984643563	0.107962940967522	NaN	NaN	0.0946757648798879	0.0877304104069838	24	0	976	0.976	0.024	0.048
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25000000000004	6	32.416666666666664	0.0543839525266103	0.212555050951034	0.255858199009059	-0.158171098424424	0.0266291618778061	0.104824056722475	NaN	NaN	0.0988977590960859	0.109745174147835	15	0	985	0.985	0.015	0.03
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.75000000000004	6	33.583333333333336	0.0547563501152287	0.204066610769614	0.268325866288077	-0.149310260654386	0.0282127111386886	0.104389566811429	NaN	NaN	0.0988505656081665	0.130924965687309	18	0	982	0.982	0.018	0.036
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333337	6	32.916666666666664	0.0537744248135208	0.208831643632827	0.257501324406891	-0.155057218819306	0.0267428639045185	0.109026244583272	NA	NA	0.0981026266953605	0.113978371895169	15	1	984	0.984	0.015	0.03
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333337	6	32.916666666666664	0.0537744248135208	0.208831643632827	0.257501324406891	-0.155057218819306	0.0268558407137674	0.10651857696905	0.202682093906555	0.20391760577553	0.098590482023563	0.115778977065719	17	0	983	0.983	0.017	0.034
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25000000000004	6	33.083333333333336	0.0543839525266103	0.207619511953736	0.261940469924275	-0.153235559427126	0.0272955341504868	0.104247959803804	NaN	NaN	0.094676011948294	0.105549350761038	10	0	990	0.99	0.01	0.02
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.25000000000004	7	33.416666666666664	0.0551338852123344	0.245651054395603	0.224439847604095	-0.190517169183268	0.0282761361183826	0.11061463603964	NaN	NaN	0.105905699310931	0.0720294114739665	9	0	991	0.991	0.009	0.018
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	7	33.83333333333333	0.0551973146854054	0.242080044197288	0.228012659483907	-0.186882729511883	0.0275168453231896	0.115035483896798	NaN	NaN	0.105082112125367	0.0753308402671679	6	0	994	0.994	0.006	0.012
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	7	33.16666666666666	0.054693929928504303	0.247845145848439	0.220677833900166	-0.193151215919935	0.0275347519570774	0.113131310711993	0.206198345775644	0.284519769592081	0.110780148416359	0.0812368194568097	9	0	991	0.991	0.009	0.018
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333337	7	33.83333333333333	0.0412002891133781	0.242080044197288	0.170192835390434	-0.20087975508391	0.023336175252129	0.110244217963282	0.146316388027858	0.244754984532506	0.111605480927982	0.0718749439298265	1	0	999	0.999	0.001	0.002
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333337	7	34.24999999999999	0.0410592825874941	0.238612230829161	0.172075347708774	-0.197552948241667	0.0238399685027225	0.115326940875463	0.119612304146872	0.150261310195345	0.105560140861799	0.0612795557538738	2	0	998	0.998	0.002	0.004
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333337	7	33.416666666666664	0.0402331091273882	0.245651054395603	0.163781544623846	-0.205417945268215	0.0230191097003963	0.109764479023716	NaN	NaN	0.105024059142071	0.0504753782115276	3	0	997	0.997	0.003	0.006
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAGTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666671	7	32.58333333333333	0.0397883346582442	0.253121833623	0.157190448918385	-0.213333498964756	0.0227153856079278	0.11657963829837	0.114414838710741	0.169483850845741	0.108817857910273	0.0499415753440254	2	0	998	0.998	0.002	0.004
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAGTGGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	7	32.74999999999999	0.0399650588551816	0.251591206901637	0.158849187725414	-0.211626148046455	0.0236004833036246	0.118720057945794	0.129476755534614	0.21987714442093	0.111110115313422	0.0568252700213587	2	0	998	0.998	0.002	0.004
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTGGC:GTGGCTAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333337	6	33.416666666666664	0.0402331091273882	0.205237238024368	0.196032208943541	-0.16500412889698	0.0225448202218435	0.0979660599179525	NA	NA	0.0945471169904318	0.0809491404362176	4	0	996	0.996	0.004	0.008
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	6	33.58333333333333	0.0399650588551816	0.204066610769614	0.195843203865923	-0.164101551914433	0.0223479221367395	0.0936392957307572	NA	NA	0.0892889176415172	0.0660813510055557	0	0	1000	1	0	0.001
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666671	5	32.916666666666664	0.0397883346582442	0.169734844556617	0.234414652820284	-0.129946509898372	0.0242297655460673	0.0874425892491437	NA	NA	0.0783566275298634	0.0972370685943353	9	2	989	0.989	0.009	0.018
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666671	4	33.08333333333333	0.0264636052740321	0.13184534303006	0.200717026979092	-0.105381737756028	0.018190924691478	0.0727825833084974	NA	NA	0.0678664622727442	0.12047551758318	23	3	974	0.974	0.023	0.046
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333339	4	33.916666666666664	0.0267586909940917	0.128312053707491	0.208543860229161	-0.1015533627134	0.0188873840014074	0.0733673563320989	NA	NA	0.0671484710337077	0.130439650375989	19	5	976	0.976	0.019	0.038
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25000000000006	4	33.75	0.026699148503671	0.129003442367267	0.206964620584773	-0.102304293863596	0.0184324572701586	0.0709825507001254	NA	NA	0.0675612341667679	0.129963589112269	24	7	969	0.969	0.024	0.048
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000006	4	33.75	0.0132307731029257	0.129003442367267	0.102561395728172	-0.115772669264341	0.0133223891974026	0.0742521705187623	NA	NA	0.0658552459379056	0.0787497134861404	0	23	977	0.977	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666673	3	33.416666666666664	0.0400540111089283	0.0956200277799543	0.418887256559919	-0.055566016671026	0.0283719890166767	0.0605523220493973	NA	NA	0.0603142383092512	0.356906724810719	136	16	848	0.848	0.136	0.272
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.5833333333334	3	32.75	0.0397005575048303	0.0976988961284261	0.406356254554233	-0.0579983386235958	0.0293502553410432	0.0614485994783316	NA	NA	0.0579800934161118	0.317158244864114	142	15	843	0.843	0.142	0.284
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	3	32.58333333333333	0.0392674190316604	0.0982328346145694	0.39973822587663	-0.058965415582909	0.0282582505356375	0.0585913996406241	NA	NA	0.0637044182494019	0.354648947543081	148	23	829	0.829	0.148	0.296
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333341	3	31.91666666666666	0.0389276557511924	0.100428343016685	0.387616230457224	-0.0615006872654922	0.0293157338805235	0.0642880648229776	NA	NA	0.0588303832870473	0.295842812497877	113	12	875	0.875	0.113	0.226
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000009	3	32.24999999999999	0.0390967990762099	0.0993184392369987	0.393650961257206	-0.0602216401607887	0.0306001288106049	0.0636109374912924	NA	NA	0.0634836858673045	0.342815950305388	122	18	860	0.86	0.122	0.244
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGTTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.33333333333341	3	32.74999999999999	0.0388017557993916	0.0976988961284261	0.397156542571231	-0.0588971403290346	0.028289842683289	0.0614538517118364	NA	NA	0.0602483441589436	0.328285673333177	121	9	870	0.87	0.121	0.242
N	all	ss13	225	CTT	TGC	TAG	2	CTGCTTGAC:CTGTTAGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000009	3	33.08333333333333	0.0387182740539804	0.0966482688635724	0.400610114482595	-0.0579299948095921	0.0305177365795737	0.058137987791464	NA	NA	0.0567973228795229	0.307755804215019	123	14	863	0.863	0.123	0.246
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTTGACAGA:TTAGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.66666666666674	2	33.666666666666664	0.0386351508375809	0.0618907677660026	0.624247399606565	-0.0232556169284217	0.0296018190997587	0.0474367847234784	NA	NA	0.0445921066693176	0.602005491131938	272	40	688	0.688	0.272	0.544
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666674	2	34	0.0391393148779276	0.0612585232607003	0.638920313363757	-0.0221192083827727	0.0288768012820996	0.0467313682238	NA	NA	0.0446381653028538	0.620231452464145	266	47	687	0.687	0.266	0.532
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.33333333333341	2	34	0.0393103070130301	0.0612585232607003	0.641711633265067	-0.0219482162476702	0.0288276032836	0.0444805413288263	NA	NA	0.0472749598778789	0.642456275246675	300	39	661	0.661	0.3	0.6
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.33333333333341	2	34.33333333333333	0.0388017557993916	0.0606390724718212	0.639880430516523	-0.0218373166724296	0.0289328704695822	0.0449973819650763	NA	NA	0.0435085635784525	0.615731905457348	268	47	685	0.685	0.268	0.536
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTG:AACCAGCTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.66666666666674	2	35.33333333333333	0.0391393148779276	0.0588537115811214	0.66502712958009	-0.0197143967031938	0.0286757945694056	0.0411295703020776	NA	NA	0.0443642046411682	0.656770617180703	297	55	648	0.648	0.297	0.594
N	all	ss13	231	CTG	AGC	TGG	2	CAGCTGGAG:CAGCTTGAG	1:1	FALSE	1.5	1	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.00000000000007	2	35.33333333333333	0.0394828001140664	0.0588537115811214	0.670863384030505	-0.019370911467055	0.0302443641836919	0.0419764654289576	NA	NA	0.04404875573279	0.660110437292639	279	38	683	0.683	0.279	0.558
N	all	ss13	232	GAG	TGG	AGA	2	CTGGAGAGC:CTTGAGAGC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.75000000000007	2	35.416666666666664	0.0525954761681724	0.0587096677913667	0.895857158570169	-0.00611419162319435	0.0328541550058113	0.0445598170740739	NA	NA	0.0473008217204765	0.897150459070466	433	17	550	0.55	0.433	0.866
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25000000000007	2	34.916666666666664	0.052251810176858	0.059584670169267	0.876933782270207	-0.00733285999240892	0.0315559774974541	0.0438253422652901	NA	NA	0.0473540873011248	0.876938247489697	419	20	561	0.561	0.419	0.838
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333341	2	34.916666666666664	0.0527110387112103	0.059584670169267	0.884640941394318	-0.00687363145805669	0.0313324969689434	0.0432742365916534	NA	NA	0.0468165319462287	0.883273621948746	429	22	549	0.549	0.429	0.858
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333341	2	34.916666666666664	0.0527110387112103	0.059584670169267	0.884640941394318	-0.00687363145805669	0.0317556014560958	0.0439761265434008	NA	NA	0.0469880405909852	0.88369664294266	444	11	545	0.545	0.444	0.888
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	35.08333333333333	0.0395261602343306	0.0290593249318817	1.36018852216919	0.0104668353024489	0.0301913968437112	0.0279918680558463	NA	NA	0.0411249000303228	0.799099006296193	583	46	371	0.371	0.583	0.742
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.00000000000007	1	34.666666666666664	0.0389698041980332	0.029415534864961	1.32480352225222	0.00955426933307229	0.0286730762868724	0.0295851577682696	NA	NA	0.0432324038386824	0.825094088415729	592	49	359	0.359	0.592	0.718
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.3333333333334	1	34.833333333333336	0.0388017557993916	0.0292720079293014	1.3255583932987	0.00952974787009014	0.0279336488496619	0.0285908565129948	NA	NA	0.0420573611674042	0.820743116167333	567	46	387	0.387	0.567	0.774
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000006	1	34.25	0.0388436318463036	0.0297805871963345	1.30432726494676	0.00906304464996907	0.0294638595401913	0.030046618067982	NA	NA	0.040057982485635	0.821008418798134	564	44	392	0.392	0.564	0.784
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	1	34.583333333333336	0.0386766677741952	0.0294878275056261	1.31161469141177	0.00918884026856913	0.0290749861893375	0.0301909397847201	NA	NA	0.0412738425468351	0.823822642730421	551	37	412	0.412	0.551	0.824
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000006	1	34.916666666666664	0.0388436318463036	0.0292007684815911	1.33022635588483	0.00964286336471251	0.0267824346666834	0.0284834211799537	NA	NA	0.0412841403901209	0.815316437419456	544	47	409	0.409	0.544	0.818
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000006	1	35.416666666666664	0.0390967990762099	0.0287805096612113	1.35844707187039	0.0103162894149986	0.0303077710977051	0.0293929100260553	NA	NA	0.0409508553350962	0.801103845195696	574	52	374	0.374	0.574	0.748
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	1	35.416666666666664	0.0401433603117785	0.0287805096612113	1.39481061260987	0.0113628506505672	0.0303658138182924	0.0280704802383727	NA	NA	0.0412264479146306	0.782839628515043	590	52	358	0.358	0.59	0.716
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333337	1	35.416666666666664	0.0410592825874941	0.0287805096612113	1.42663500649648	0.0122787729262828	0.0317253969981103	0.0290312413140142	NA	NA	0.042678399754235	0.773572850678943	583	42	375	0.375	0.583	0.75
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333337	1	35.583333333333336	0.0410592825874941	0.0286430990492925	1.43347905604887	0.0124161835382016	0.0305083391129647	0.0293931230202209	NA	NA	0.0426195395452983	0.770801940387887	603	42	355	0.355	0.603	0.71
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333337	1	34.583333333333336	0.0405047802473168	0.0294878275056261	1.37361018676567	0.0110169527416907	0.0297507330193263	0.0284952921402588	NA	NA	0.0429092983398393	0.797371943409713	576	49	375	0.375	0.576	0.75
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	1	34.416666666666664	0.0404138163712346	0.0296334842053817	1.36378888459883	0.0107803321658529	0.0295410765974451	0.028613726404517	NA	NA	0.0438467995537118	0.805787818864129	581	34	385	0.385	0.581	0.77
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333337	1	34.083333333333336	0.0402331091273882	0.0299291581301553	1.34427800983988	0.0103039509972329	0.0292355501762266	0.0296597420724613	NA	NA	0.0406614656165594	0.799952750191532	581	43	376	0.376	0.581	0.752
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333339	1	33.75	0.0397005575048303	0.0302307926160697	1.31324897792216	0.00946976488876063	0.0286310115550216	0.0293251537639202	NA	NA	0.0437132141327072	0.828493649864511	571	45	384	0.384	0.571	0.768
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000004	1	32.91666666666667	0.0396131668795607	0.0310121698640216	1.27734263849488	0.00860099701553904	0.0297864232845584	0.0304900051163723	NA	NA	0.0447569932813968	0.84760824611489	541	37	422	0.422	0.541	0.844
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000004	1	33.16666666666667	0.0397443976053828	0.0307735475083969	1.29151173079861	0.0089708500969859	0.0288550599179071	0.0293448639999852	NA	NA	0.0445900675197811	0.840553966207859	531	44	425	0.425	0.531	0.85
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT:TCTGCTTCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000004	1	32.833333333333336	0.0392246245521367	0.0310925352587596	1.2615447478213	0.00813208929337708	0.0299829343174461	0.0311877149842004	NA	NA	0.0406011854746454	0.841252283341924	569	49	382	0.382	0.569	0.764
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CAG	2	GCTGCTGAG:GCTTCAGAG	1:1	TRUE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333337	1	32.5	0.0385523838449736	0.0314182062818701	1.22707144701702	0.00713417756310345	0.028423026124937	0.031084705173091	NA	NA	0.041254560969694	0.8627059485354	538	48	414	0.414	0.538	0.828
N	all	ss13	254	GAG	CAG	AGG	2	GCTGAGGCT:TCAGAGGCA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.333333333333333	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	0	32.16666666666667	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0280742284626102	0	NA	NA	0.02910035635264	0.18711696787715	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000006	0	32.083333333333336	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0299989993026469	0	NA	NA	0.0295870266308847	0.19494959638524	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	0	32.41666666666667	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0302993037070251	0	NA	NA	0.0296231993441605	0.196447196695007	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.08333333333339	0	31.750000000000007	0.0379427585051849	0	-Inf	0.0379427585051849	0.0296928787571019	0	NA	NA	0.0290774975667679	0.19193238335418	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333339	0	30.500000000000007	0.0373521168628637	0	-Inf	0.0373521168628637	0.0276304700603795	0	NA	NA	0.0285759894687891	0.191173510434816	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	0	30.66666666666667	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0283865246746908	0	NA	NA	0.0279385966578464	0.179431037735838	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	260	CGG	CTC	GGC	2	CCTCGGCAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	0	30.66666666666667	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0276106367123555	0	NA	NA	0.026886413744869	0.163001615417919	857	143	0	0	0.857	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GGC	AAA	2	CGGCAAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	0	31.000000000000007	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0284501008914073	0	NA	NA	0.0273807504435744	0.170730372927373	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333337	0	30.66666666666667	0.0373521168628637	0	-Inf	0.0373521168628637	0.0274091153256668	0	NA	NA	0.0290564354126471	0.198616785764287	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACC:AAACGTACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.1666666666667	0	31.16666666666667	0.0379028017472667	0	-Inf	0.0379028017472667	0.0293037759978981	0	NA	NA	0.0288572025365348	0.189027751747497	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	264	ACC	GTA	CCG	2	CGTACCGCA:CGTACTGCC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.1666666666667	0	32.16666666666667	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0285574834408998	0	NA	NA	0.0293662428142121	0.191140670195743	842	158	0	0	0.842	0.001
N	all	ss13	265	GCA	CCG	CAA	2	ACCGCAACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.6666666666667	0	31.666666666666668	0.0381438129251182	0	-Inf	0.0381438129251182	0.029031527290308	0	NA	NA	0.0276809151676631	0.16820873321711	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CAA	CCA	2	GCAACCAAA:GCCACTAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.6666666666667	0	31.333333333333332	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.027600256141131	0	NA	NA	0.0271934923169508	0.166031881158419	887	113	0	0	0.887	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAC	2	ACCAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000003	0	31.5	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0267832485158787	0	NA	NA	0.028633775256359	0.190224548232511	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333336	0	31.5	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0281509448559233	0	NA	NA	0.0288468003882494	0.189799387505145	840	160	0	0	0.84	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAT:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	0	31.666666666666668	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.012198280004281	0	NA	NA	0.0129579086073266	0.341697053255173	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA:TACAATGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.66666666666669	0	31.833333333333332	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0123962278173457	0	NA	NA	0.0119199066054364	0.300322135654514	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA:AATGTCACC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333334	0	31.5	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0128402104697247	0	NA	NA	0.0122755648361186	0.312547748650986	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACCCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000001	0	32.83333333333333	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0119636020878948	0	NA	NA	0.0122457777889727	0.3063481360205	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACCCAAGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	0	32.166666666666664	0.0124226442537559	0	-Inf	0.0124226442537559	0.012698399704046	0	NA	NA	0.012084660229948	0.303964870970216	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000001	0	32.666666666666664	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0131154017920515	0	NA	NA	0.0123015770433834	0.311568270599954	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.00000000000001	0	32.33333333333333	0.0122953573317573	0	-Inf	0.0122953573317573	0.0126511174182346	0	NA	NA	0.0127888589629488	0.336345255042434	608	392	0	0	0.608	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGCGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	0	31.499999999999993	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0119536458856089	0	NA	NA	0.0126809330253165	0.334226176147672	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGCGACGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.00000000000003	0	31.833333333333325	0.0122953573317573	0	-Inf	0.0122953573317573	0.0118468072163493	0	NA	NA	0.0120675113198361	0.308259491258879	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT:CGACGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333337	0	31.66666666666666	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0122692782916492	0	NA	NA	0.0120903685680273	0.311153935210282	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32.33333333333333	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0127902309824276	0	NA	NA	0.0124028723739914	0.319536324645246	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32.33333333333333	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0120618423903348	0	NA	NA	0.012240117464538	0.313143957038817	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCAGATCAA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333337	0	31.66666666666666	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0121715571160386	0	NA	NA	0.0123346274957365	0.320833045929638	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC:GATCAAACT	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.4166666666667	0	31.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA:CAAACTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.00000000000003	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA:ACTCAAGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.33333333333336	0	31.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.66666666666669	0	31.999999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666669	1	32.33333333333333	0.0128208250194751	0.0315836140125951	0.405932804724699	-0.0187627889931201	0.0128125713640343	0.0330688785273876	NA	NA	0.0214496950783091	0.38171836608925	0	358	642	0.642	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGA:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666669	1	32.16666666666666	0.0129035440872231	0.0317507728699206	0.406400944634876	-0.0188472287826975	0.01333428544316	0.0337453854551714	NA	NA	0.020623973649665	0.360795402850983	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	288	GGA	TTG	GAG	2	TTTGGAGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666669	1	31.666666666666657	0.0129035440872231	0.0322630388127681	0.399948193414333	-0.019359494725545	0.012990444732216	0.0343549597554972	NA	NA	0.0184661591155809	0.294464990163204	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GAG	ACC	2	GGAGACCAG:GGGGACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.41666666666669	1	32.41666666666666	0.0130296436641525	0.031500692980973	0.413630381783114	-0.0184710493168205	0.0134472835812538	0.0333090434273062	NA	NA	0.018933949380347	0.329286596096808	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	290	CAG	ACC	AGG	2	GACCAGGAA:GACCAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.33333333333336	1	32.49999999999999	0.0130438070339019	0.0314182062818701	0.415167145981496	-0.0183743992479682	0.0131161307251393	0.0326544403129565	NA	NA	0.019742910155488	0.352017345939311	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AGG	AAC	2	CAGGAACTA:CAGGAGCTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.6666666666667	1	31.166666666666664	0.0128208250194751	0.0327921082603737	0.390972880355115	-0.0199712832408986	0.0128016986880293	0.0351689707946403	NA	NA	0.0202473069872702	0.323952863876592	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAGCTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.1666666666667	1	30.666666666666664	0.0127391597743079	0.0333388219281254	0.38211187551174	-0.0205996621538174	0.0131396927544069	0.0341682570263222	NA	NA	0.0213452486374588	0.33450968030331	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.1666666666667	1	30.666666666666664	0.0124226442537559	0.0333388219281254	0.372617973140674	-0.0209161776743694	0.0122839102651799	0.0368341694350555	NA	NA	0.0224610368715958	0.351739522913772	0	394	606	0.606	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333337	1	31.416666666666664	0.012282771960992	0.0325254218363474	0.377636054123852	-0.0202426498753554	0.0124170463849491	0.0341049497105888	NA	NA	0.0224587111295735	0.36741431298258	0	382	618	0.618	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.75000000000003	1	31.249999999999996	0.0121830090017924	0.0327027281115989	0.372538002340892	-0.0205197191098065	0.0120524389435939	0.0333000683949488	NA	NA	0.0213469574892846	0.336427512429972	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666669	1	31.916666666666664	0.0123841823043677	0.0320048558445568	0.386946979686958	-0.0196206735401891	0.0122048313029314	0.033442579944417	NA	NA	0.0209131691486935	0.348143155635661	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666669	1	32.08333333333333	0.0375469431438597	0.0318350176854428	1.17942271981299	0.00571192545841687	0.027649101274624	0.0340119780116404	NA	NA	0.0330758281205219	0.862893661946759	516	115	369	0.369	0.516	0.738
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC:ACTGATTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333336	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0286272095178702	0.0341355351267195	NA	NA	0.0345025598255224	0.874171122117245	511	132	357	0.357	0.511	0.714
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA:GATTATAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333336	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0282341211758489	0.0317533004651673	NA	NA	0.0331261124415181	0.868989013326824	517	121	362	0.362	0.517	0.724
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT:TATAAACAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.08333333333336	1	31.58333333333333	0.0370064785139329	0.0323500281131817	1.14393960909276	0.00465645040075115	0.02929818061227	0.0334538510936516	NA	NA	0.0335771764720345	0.889703786360351	513	146	341	0.341	0.513	0.682
N	all	ss13	301	CAC	AAC	ACT	2	AAACACTGG:AAACATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	31.58333333333333	0.0497591768358708	0.0661585688516753	0.75211990977962	-0.0163993920158045	0.0303473749954494	0.0505922808877224	NA	NA	0.042790675692607603	0.701536737640969	345	56	599	0.599	0.345	0.69
N	all	ss13	302	TGG	ACT	GGC	2	CACTGGCCG:CATTGGCCG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333336	2	31.916666666666664	0.0503862036875865	0.0654365742860851	0.770000634007838	-0.0150503705984986	0.0322921979684616	0.0499484720153571	NA	NA	0.0415707296647711	0.717320276546347	339	55	606	0.606	0.339	0.678
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	32.08333333333333	0.0509209303034166	0.0650814580158656	0.782418400813993	-0.014160527712449	0.0313406977187548	0.0481165552720177	NA	NA	0.04199818414714	0.735988751720598	358	43	599	0.599	0.358	0.716
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATA:CCGCAAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666669	2	31.08333333333333	0.0504922483436096	0.0672719567702241	0.750569044930153	-0.0167797084266145	0.0317034628018919	0.0496115188255431	NA	NA	0.0439000408927489	0.702294221354301	329	45	626	0.626	0.329	0.658
N	all	ss13	305	ATA	AAA	TAG	2	CAAATAGCA:CAAATTGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75000000000001	2	30.08333333333333	0.0512472511431301	0.0696151556756318	0.736150779895028	-0.0183679045325017	0.0318987571045751	0.0533031444385841	NA	NA	0.0420597937068559	0.66232215854484	309	47	644	0.644	0.309	0.618
N	all	ss13	306	GCA	TAG	CAC	2	ATAGCACAG:ATTGCACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	29.416666666666664	0.0513569565272317	0.0712702003524607	0.720595091261849	-0.019913243825229	0.0315382120173143	0.0519946099806061	NA	NA	0.0447953810945544	0.656653747008081	307	32	661	0.661	0.307	0.614
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCACAGTTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333336	2	29.583333333333332	0.0510292410063947	0.0708490996895694	0.720252497632053	-0.0198198586831748	0.0326831402753334	0.0520897882979423	NA	NA	0.044372871169937	0.655116139621287	331	46	623	0.623	0.331	0.662
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAGTTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75000000000001	2	29.916666666666664	0.0512472511431301	0.070021663193269107	0.731877090689504	-0.018774412050139	0.0307906350377736	0.0516753928938797	NA	NA	0.0450383853731514	0.676785510994725	316	46	638	0.638	0.316	0.632
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.25000000000001	2	30.416666666666668	0.0515777829948789	0.0688161477015357	0.749501166769437	-0.0172383647066568	0.0322664606039956	0.052866419834547	NA	NA	0.0421102498612831	0.68227352373565	325	41	634	0.634	0.325	0.65
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	30.416666666666668	0.0511380136321413	0.0688161477015357	0.743110670099309	-0.0176781340693945	0.0324185289297608	0.0528720308974882	NA	NA	0.0468796160859482	0.706101972628672	305	46	649	0.649	0.305	0.61
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	30.416666666666668	0.0511380136321413	0.0688161477015357	0.743110670099309	-0.0176781340693945	0.0310885852788573	0.0502628881964988	NA	NA	0.0451473747144206	0.695379615366625	320	48	632	0.632	0.32	0.64
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.083333333333332	0.0513569565272317	0.0696151556756318	0.737726663523195	-0.0182581991484001	0.031021341050344	0.0535499677026917	NA	NA	0.042450231453314	0.667116823875594	337	40	623	0.623	0.337	0.674
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	30.333333333333332	0.0510835693943593	0.0690141740401891	0.740189535045536	-0.0179306046458298	0.0332106663050267	0.0534544843807625	NA	NA	0.0429356043182693	0.676227738049281	337	43	620	0.62	0.337	0.674
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000003	2	29.333333333333336	0.0504391702568755	0.0714826348532437	0.705614312628918	-0.0210434645963682	0.0315204923123848	0.0526980592075662	NA	NA	0.0431502660781216	0.625777458761071	306	51	643	0.643	0.306	0.612
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29	0.0498108321742552	0.0723451996406717	0.688516064944994	-0.0225343674664164	0.0299154224430559	0.0535713120100216	NA	NA	0.0466684673146984	0.62919466815724	285	54	661	0.661	0.285	0.57
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000003	2	29.333333333333336	0.0504391702568755	0.0714826348532437	0.705614312628918	-0.0210434645963682	0.0306819374541841	0.05361667441597	NA	NA	0.0439775046394758	0.6322906750089	288	55	657	0.657	0.288	0.576
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.1666666666667	2	28.666666666666668	0.0503333482845312	0.073228852172937	0.687343127619482	-0.0228955038884058	0.0305303371426627	0.0570316493012531	NA	NA	0.0469307909512589	0.625651299878132	291	48	661	0.661	0.291	0.582
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	28	0.0499144653819543	0.0750625939177369	0.664971229700067	-0.0251481285357826	0.0306031433379896	0.0563771029718854	NA	NA	0.0477556904659475	0.598471654712637	279	54	667	0.667	0.279	0.558
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	28.166666666666668	0.0502279695796377	0.0745955951479785	0.67333693738884	-0.0243676255683408	0.0319998171405323	0.0576460731438596	NA	NA	0.0463344619882381	0.598952710094221	278	47	675	0.675	0.278	0.556
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.1666666666667	2	28.333333333333336	0.0503333482845312	0.0741343759774745	0.678947487193051	-0.0238010276929433	0.032898544794551	0.0584295213554403	NA	NA	0.0475839008563054	0.61694076152946	291	45	664	0.664	0.291	0.582
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	28.666666666666668	0.0501230313618422	0.073228852172937	0.684471077649446	-0.0231058208110948	0.0318267501634514	0.0554235504639296	NA	NA	0.0468234221836563	0.621682543820436	288	42	670	0.67	0.288	0.576
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.1666666666667	2	28.16666666666667	0.049707628561966	0.0745955951479785	0.666361444846157	-0.0248879665860126	0.0307729778176908	0.0580432784934281	NA	NA	0.0441264402521304	0.572744041196892	274	45	681	0.681	0.274	0.548
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	2	28.16666666666667	0.049299057062491	0.0745955951479785	0.660884291688998	-0.0252965380854875	0.0292193356714238	0.0533597210441802	NA	NA	0.046646463617643	0.587609480293621	283	43	674	0.674	0.283	0.566
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	28.16666666666667	0.049502499478939	0.0745955951479785	0.663611562864251	-0.0250930956690395	0.0313351116371997	0.0568026602490462	NA	NA	0.0441756076537521	0.570014209320676	252	38	710	0.71	0.252	0.504
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	29.16666666666667	0.0501230313618422	0.0719113287774619	0.69701161435848	-0.0217882974156197	0.0312793994416025	0.0547929629926941	NA	NA	0.0452275562979434	0.629984774928318	298	50	652	0.652	0.298	0.596
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	29.58333333333334	0.0499664439235005	0.0708490996895694	0.705251642468743	-0.0208826557660689	0.0316723174821846	0.0549173962381596	NA	NA	0.0473663095481875	0.659302972976109	302	42	656	0.656	0.302	0.604
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	29.500000000000004	0.049502499478939	0.0710590256920246	0.696639153110356	-0.0215565262130856	0.0297092600991321	0.0538997692319239	NA	NA	0.045510527464801	0.635742228617359	324	44	632	0.632	0.324	0.648
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	3	29.83333333333334	0.049707628561966	0.107970516691131	0.460381501221889	-0.0582628881291653	0.0315468985283446	0.0687337298066762	NA	NA	0.0634720515562764	0.358655614686656	140	13	847	0.847	0.14	0.28
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	3	29.83333333333334	0.049299057062491	0.107970516691131	0.456597398746546	-0.0586714596286402	0.0312249146779382	0.0683075318513938	NA	NA	0.0612114950580307	0.337808702036129	128	12	860	0.86	0.128	0.256
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000003	3	28.83333333333334	0.0483064312987563	0.11200896641424	0.431272895779663	-0.0637025351154835	0.0297659483882666	0.0735082720567207	NA	NA	0.0667399364393687	0.339836175314468	124	17	859	0.859	0.124	0.248
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000003	4	28.83333333333334	0.0483064312987563	0.153398778089708	0.314907536424485	-0.105092346790952	0.0295593185250625	0.0902720491952025	NA	NA	0.0814267288376179	0.196829589223406	61	6	933	0.933	0.061	0.122
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.83333333333336	4	29.16666666666667	0.0486986442466362	0.151456007747705	0.321536563460449	-0.102757363501069	0.0314372411600081	0.0894792671820066	NA	NA	0.0808190181750339	0.203568503981683	60	1	939	0.939	0.06	0.12
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.50000000000003	4	28.83333333333334	0.06015246431623	0.153398778089708	0.392131313334535	-0.0932463137734779	0.0333426714588883	0.0857497513990451	NaN	NaN	0.0823763223588281	0.257653232292791	95	0	905	0.905	0.095	0.19
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.1666666666667	4	29.500000000000004	0.0596736078092626	0.149561992614941	0.398989119935685	-0.0898883848056783	0.0318176178473718	0.0818550472880191	NA	NA	0.0774469492224479	0.245786452605839	88	0	912	0.912	0.088	0.176
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0315338440946517	0.0850401785416667	NA	NA	0.0816350641387971	0.262449007364052	89	3	908	0.908	0.089	0.178
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333337	3	29.91666666666667	0.0473997786251612	0.107647107231784	0.440325614353027	-0.0602473286066223	0.0296355624787198	0.0697708864200061	NA	NA	0.0702526382953177	0.391123863921501	181	8	811	0.811	0.181	0.362
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.08333333333337	3	31.083333333333336	0.0479683929216542	0.103314927985559	0.464292952208797	-0.0553465350639043	0.0291889342370493	0.0658876226490703	NA	NA	0.0707903008067073	0.434309886405183	193	7	800	0.8	0.193	0.386
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.75000000000004	3	30.416666666666668	0.0487481192957683	0.105746684778908	0.460989575206914	-0.0569985654831398	0.0302567599182627	0.0682068435272462	NA	NA	0.0714613543385056	0.425094615101247	195	7	798	0.798	0.195	0.39
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.33333333333339	3	30.499999999999996	0.0484038908531784	0.105436462965892	0.459081132765585	-0.0570325721127137	0.0300317588816308	0.0657664069103604	NA	NA	0.0711087633723211	0.42252575689292	177	2	821	0.821	0.177	0.354
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.58333333333339	3	30.249999999999996	0.0482578485978244	0.106372646579413	0.453667838016958	-0.0581147979815888	0.0312325925182946	0.0667734129866431	NA	NA	0.0694579438245336	0.402766590945979	153	3	844	0.844	0.153	0.306
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.58333333333339	3	30.249999999999996	0.0482578485978244	0.106372646579413	0.453667838016958	-0.0581147979815888	0.0314669315076987	0.0688911813685425	NA	NA	0.0724944651160311	0.422758558786861	183	6	811	0.811	0.183	0.366
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA:GATGATAAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.08333333333339	3	30.416666666666664	0.0740580604891802	0.105746684778908	0.700334583954272	-0.031688624289728	0.0404025428520343	0.0674542300977507	NA	NA	0.0760266356160898	0.67681775015725	351	3	646	0.646	0.351	0.702
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT:GATAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.41666666666671	3	31.416666666666664	0.0756148767114708	0.102140577511979	0.740302028374596	-0.0265257008005083	0.0394283642133629	0.067393292447871	NA	NA	0.0751079161649162	0.723962613528088	353	1	646	0.646	0.353	0.706
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA:AAAGATCCC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.50000000000004	3	31.666666666666664	0.0774882105210195	0.101277212852957	0.76511002167411	-0.0237890023319376	0.0413674710175529	0.0644642681985246	NA	NA	0.0689281517072275	0.729998502117372	364	1	635	0.635	0.364	0.728
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.16666666666671	3	31.333333333333332	0.0788471565774535	0.102431651254313	0.769753836943379	-0.0235844946768596	0.0415268875020085	0.0651325464922791	NaN	NaN	0.0735167159001326	0.74835853465882	366	2	632	0.632	0.366	0.732
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCCCAATTC	1:1	TRUE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	79.83333333333339	3	31.666666666666664	0.0791943804803756	0.101277212852957	0.7819565551765	-0.0220828323725816	0.042842369763197	0.064534517113819	NA	NA	0.0738846847392691	0.765029771515141	385	1	614	0.614	0.385	0.77
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.50000000000006	3	31.166666666666664	0.0520816565415757	0.103018812035868	0.505554815788813	-0.0509371554942925	0.0312641333715012	0.065650534056166	NA	NA	0.0658739689175697	0.439373461061306	220	5	775	0.775	0.22	0.44
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25000000000006	3	31.416666666666664	0.052251810176858	0.102140577511979	0.511567600748389	-0.0498887673351211	0.0323129222727275	0.0649215588754181	NA	NA	0.069486150869925	0.472777598509013	218	4	778	0.778	0.218	0.436
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000006	3	31.749999999999993	0.0529436946379863	0.100992663859693	0.52423307411259	-0.0480489692217065	0.0333948994372115	0.0638878009784554	NA	NA	0.066308186739878	0.468678421273373	213	10	777	0.777	0.213	0.426
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.75000000000006	3	32.58333333333333	0.0540165882431452	0.0982328346145694	0.549883228505897	-0.0442162463714242	0.0337219056311856	0.0624593262580584	NA	NA	0.0667693233021548	0.507827694289713	239	4	757	0.757	0.239	0.478
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333339	2	32.5	0.0400986359257937	0.0642103145422439	0.624489012577768	-0.0241116786164501	0.0305426224292272	0.0519077545688118	NA	NA	0.0552579797845896	0.662584659271694	324	17	659	0.659	0.324	0.648
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333339	3	32.33333333333333	0.0395696157178212	0.0990447915097998	0.399512332901484	-0.0594751757919786	0.0294695784641479	0.0627558117182257	NA	NA	0.0727124860042477	0.413385754990284	170	2	828	0.828	0.17	0.34
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.16666666666673	3	31.333333333333332	0.0388855983989721	0.102431651254313	0.379624832000692	-0.0635460528553409	0.0282600063732923	0.0672549731147831	NA	NA	0.0758468462796399	0.402131448124036	177	6	817	0.817	0.177	0.354
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAT:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666673	3	31.333333333333332	0.0383879094086674	0.102431651254313	0.374766089764183	-0.0640437418456457	0.0291524414687864	0.0676777491663163	NA	NA	0.075971842992052993	0.399232285061069	143	3	854	0.854	0.143	0.286
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	3	32	0.0376648177342698	0.100148544468392	0.376089517168741	-0.0624837267341222	0.0290311087099219	0.066962942557655	NA	NA	0.0708363707835453	0.377730640040045	154	10	836	0.836	0.154	0.308
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	33	0.0379827996140662	0.0969087986100047	0.391943767324187	-0.0589259989959385	0.0284959791715212	0.0644872197359457	NA	NA	0.068526243749932	0.389841899914632	148	7	845	0.845	0.148	0.296
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000006	3	33.25	0.0514119856124207	0.0961313950679982	0.534809523736285	-0.0447194094555775	0.0315718553101334	0.062410115300064	NA	NA	0.0704725682648668	0.525712307722007	250	3	747	0.747	0.25	0.5
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.8333333333334	3	32.916666666666664	0.0511925740908369	0.097170738715697	0.526831171270773	-0.0459781646248601	0.0318721305253195	0.0643423246388029	NA	NA	0.0752289317845173	0.541082656496455	237	3	760	0.76	0.237	0.474
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000007	4	31.916666666666664	0.0507593239355005	0.137132914796851	0.370146904634058	-0.0863735908613505	0.0319212139833844	0.0778426908650715	NaN	NaN	0.087372271883047	0.32287365955377	123	0	877	0.877	0.123	0.246
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.8333333333334	4	31.58333333333333	0.0505454383004815	0.138722674692595	0.364363204591381	-0.0881772363921134	0.0299227811219042	0.0833244667006663	NaN	NaN	0.0878591207369143	0.315561450455711	125	0	875	0.875	0.125	0.25
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA:GCATACAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.3333333333334	4	30.749999999999996	0.0756944389424703	0.142863650574837	0.529836936392851	-0.0671692116323664	0.0400474936582596	0.0848980514610496	NaN	NaN	0.0990550128762186	0.497708243368744	229	1	770	0.77	0.229	0.458
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA:TACAAGACA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.16666666666673	4	30.916666666666664	0.0758540671866301	0.142015736265178	0.53412438073054	-0.0661616690785484	0.0414999161948964	0.0840849149540638	NaN	NaN	0.099744636311686	0.507131684306202	242	0	758	0.758	0.242	0.484
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC:AAGACATTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.666666666666664	0.0772386109180751	0.143291427572032	0.539031624060327	-0.0660528166539568	0.0432801606138544	0.0852154136638542	NaN	NaN	0.0964554535606758	0.493469336749065	228	2	770	0.77	0.228	0.456
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.91666666666673	4	31.166666666666664	0.0780769364502828	0.140762624951505	0.554670932551745	-0.0626856885012223	0.0422900518444617	0.0806788621411951	NaN	NaN	0.0982726563377921	0.523554934643699	253	0	747	0.747	0.253	0.506
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.5833333333334	4	30.833333333333332	0.0805241909860522	0.142438427764417	0.56532631151499	-0.0619142367783648	0.0432287447187055	0.0840564709956127	NaN	NaN	0.0966241906517654	0.521669745300507	234	0	766	0.766	0.234	0.468
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.5833333333334	4	29.833333333333332	0.0816206643196587	0.147714914296514	0.552555337478098	-0.0660942499768554	0.0416758667858711	0.0925973204102272	NaN	NaN	0.0987971835004758	0.503502359413779	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.0833333333334	5	30.666666666666668	0.0967969709734608	0.183841843524739	0.526523065247849	-0.0870448725512779	0.045838482218827	0.0953380968666256	NaN	NaN	0.111315949689463	0.434236748331922	186	0	814	0.814	0.186	0.372
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.0833333333334	5	31.666666666666664	0.0981562001449569	0.177291583548173	0.553642751565171	-0.0791353834032159	0.0475712413140748	0.0925239786104783	NaN	NaN	0.109569692054668	0.470148230513992	215	0	785	0.785	0.215	0.43
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.5833333333334	5	32.166666666666664	0.0988502515956035	0.174189200634338	0.567487830678507	-0.0753389490387342	0.046852501631826	0.0949748989672531	NaN	NaN	0.107570941180173	0.483699232537817	215	0	785	0.785	0.215	0.43
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.41666666666673	5	32.33333333333333	0.10050857327761	0.173179167487274	0.580373348226168	-0.0726705942096646	0.0492739937687259	0.0929070916817733	NaN	NaN	0.101486705512324	0.473954156140605	205	0	795	0.795	0.205	0.41
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.41666666666673	5	31.666666666666664	0.10050857327761	0.177291583548173	0.566911137382334	-0.0767830102705631	0.0498248347186014	0.0933409424201631	NaN	NaN	0.106776664664655	0.47207982253241	205	0	795	0.795	0.205	0.41
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.91666666666673	5	32.16666666666666	0.101236464717174	0.174189200634338	0.581186803478663	-0.0729527359171634	0.047944580980142	0.0943926955412732	NaN	NaN	0.102235581195241	0.475490135596002	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	73.25000000000007	5	32.16666666666666	0.10222357223844	0.174189200634338	0.586853673282713	-0.0719656283958972	0.0477148552902195	0.0915088102882326	NaN	NaN	0.103527793302227	0.486971696301715	207	0	793	0.793	0.207	0.414
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTGCCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG:TTGCCGCAG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GA-	1	CAGAGA---:CAGAGACAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.666666666666667	1.33333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	---	GAC	AGA	1	AGA---AAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	--A	AGA	1	---AAGAAA:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAACAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTG:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTG	TTC	TGC	2	CTTCTGCCT:CTTCTTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TGC	CTG	2	CTGCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAT:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATA	2	GCAGATTTG:GCTGATATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ATA	TGG	2	GATATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.5	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KU182964.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	ACT	TGA	CTG	2	ATGACTGAT:ATGTCTGAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.33333333333336	7	36.25000000000001	0.246767559456167	0.223270280899521	1.1052414072396	0.023497278556646	0.0791041586955813	0.115414839345939	0.839901461739643	0.18820158432615	0.107832446695268	0.827502775385127	624	0	376	0.376	0.624	0.752
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	ACTGATAAT:TCTGATAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.50000000000001	7	36.08333333333334	0.246086731522703	0.224472453654355	1.09628922175738	0.0216142778683481	0.0806171892292254	0.105951938272748	NaN	NaN	0.111115744912247	0.845768432905718	574	0	426	0.426	0.574	0.852
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	71.83333333333334	7	36.08333333333334	0.244736383443385	0.224472453654355	1.09027357013806	0.0202639297890297	0.0775673467295687	0.115282595314335	NaN	NaN	0.108264779265004	0.851527265629802	587	0	413	0.413	0.587	0.826
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACAA:AATGGACCC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	70.83333333333334	7	36.41666666666667	0.248833044237754	0.222081009574389	1.12046070357224	0.0267520346633643	0.0802078986092213	0.115928180430208	NaN	NaN	0.108506863187008	0.805258875719031	608	0	392	0.392	0.608	0.784
N	all	ss13	6	CAA	GAC	AAC	2	GGACAACAA:GGACCCCAA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	69.83333333333334	7	37.41666666666667	0.253070509898588	0.215204968042419	1.17595105819632	0.037865541856169	0.0824039787246619	0.104819562648358	0.953345003371404	0.217389278071236	0.102082269866371	0.710688462305529	658	0	342	0.342	0.658	0.684
N	all	ss13	7	CAA	AAC	AA-	0	CAACAA---:CCCCAA---	1:1	FALSE	0.5	0	2.16666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	68.66666666666667	7	38.25000000000001	0.218192674781964	0.209794072585264	1.04003260003109	0.0083986021966995	0.072866288585964	0.105807170338033	0.739022908197841	0.159336178753846	0.100135437194802	0.9331578619622	579	0	421	0.421	0.579	0.842
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAT:CAA---GGA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	69.16666666666667	7	37.083333333333336	0.216364206038598	0.217448844139347	0.995011984979538	-0.0010846381007491	0.0713006208495761	0.107761212383512	0.749109512956209	0.184092324622323	0.101773040342319	0.991496769580617	509	0	491	0.491	0.509	0.982
N	all	ss13	9	AAT	--A	ATC	0	---AATCAG:---GGACCG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	70.16666666666667	7	38.083333333333336	0.212798294853826	0.210854230397134	1.00921994523435	0.00194406445669185	0.0687608106717146	0.100989896292562	NaN	NaN	0.0938141757144332	0.983467018763657	547	0	453	0.453	0.547	0.906
N	all	ss13	10	CAG	ATC	AGC	2	AATCAGCGA:GGACCGCGC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	70.50000000000001	6	38.083333333333336	0.174931235415909	0.176854074420993	0.989127539122978	-0.00192283900508416	0.0574300198717754	0.0915716767250747	NaN	NaN	0.0959217248520211	0.984006742860367	526	0	474	0.474	0.526	0.948
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CCGCGCAAT	1:1	FALSE	1.25	1.25	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	70.91666666666667	6	38	0.156204228604278	0.177291583548173	0.881058341733606	-0.0210873549438946	0.054068995696398	0.0928469199500585	NaN	NaN	0.0871290071834838	0.808761174379112	433	0	567	0.567	0.433	0.866
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGCAATGCG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	71.66666666666667	6	37.5	0.154389040653112	0.179963002222943	0.857893226641385	-0.0255739615698317	0.0547231270535124	0.0991247920626195	NaN	NaN	0.0912885781456869	0.779366909724699	410	0	590	0.59	0.41	0.82
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AATGCGCCT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	71.16666666666667	6	38.00000000000001	0.155594424961324	0.177291583548173	0.877618789608513	-0.0216971585868488	0.0564199365955507	0.0952765998102825	NaN	NaN	0.0906403485242808	0.810813743057687	410	0	590	0.59	0.41	0.82
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCGCCTCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	71.33333333333334	6	38.50000000000001	0.155190536855492	0.174698668260279	0.888332683934815	-0.0195081314047875	0.0526463370944365	0.0919057192560263	NaN	NaN	0.0907751742892235	0.829840591412082	442	0	558	0.558	0.442	0.884
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT:CCTCGCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	72.00000000000001	7	38.16666666666667	0.170837948153034	0.210322806792345	0.812265444525493	-0.0394848586393115	0.0550245444244748	0.110724919597537	NaN	NaN	0.0914745695708858	0.665996919629998	329	1	670	0.67	0.329	0.658
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	71.83333333333334	7	38.33333333333334	0.171283232203356	0.2092680072815	0.818487423990003	-0.0379847750781438	0.0542072356415303	0.107876735760678	0.602137382495712	0.174050449906744	0.101936068879235	0.709421375410954	336	0	664	0.664	0.336	0.672
N	all	ss13	17	ACG	TTA	CGT	2	ATTACGTTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	72.75000000000001	7	37.750000000000014	0.186279937267567	0.213007236149638	0.874523986296435	-0.0267272988820706	0.0560015651322061	0.110248563199482	0.712262743659908	0.219517949237638	0.100013561524919	0.789286884280959	396	0	604	0.604	0.396	0.792
N	all	ss13	18	TTT	CGT	TTG	2	ACGTTTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	73.08333333333334	7	38.08333333333334	0.185316115582468	0.210854230397134	0.878882606402701	-0.0255381148146653	0.0592900011560422	0.106932371004919	NaN	NaN	0.0958160699720628	0.789828987129984	400	0	600	0.6	0.4	0.8
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GT-	1	TTTGGT---:TTTGGTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	72.66666666666667	7	38.000000000000014	0.18652246930412	0.211388364105741	0.88236866817711	-0.0248658948016202	0.0577668460198337	0.107683846788856	NaN	NaN	0.0968444661060604	0.797363176056958	415	1	584	0.584	0.415	0.83
N	all	ss13	20	---	GTG	GAC	1	GGT---GTC:GGTGGACCC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	72.83333333333333	7	37.666666666666686	0.186038038359055	0.213552421666518	0.871158645297738	-0.0275143833074629	0.0596800543906894	0.117208795295107	NaN	NaN	0.109115450588484	0.800918589671096	413	0	587	0.587	0.413	0.826
N	all	ss13	21	CCC	--G	CCT	1	---GTCTCA:GGACCCTCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	74.33333333333333	7	38.166666666666686	0.181789348152453	0.210322806792345	0.864334928412859	-0.0285334586398919	0.0553721641828187	0.105516355469045	NaN	NaN	0.0986488094783843	0.772395575248451	409	0	591	0.591	0.409	0.818
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT:GTCTCAGAT	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	75.66666666666667	6	37.500000000000014	0.161597898479986	0.179963002222943	0.897950670326083	-0.0183651037429569	0.0535907200169561	0.0966694126232911	NaN	NaN	0.0955610321729186	0.847599698636195	406	1	593	0.593	0.406	0.812
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATA	2	TCAGATAAC:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	77.33333333333334	6	36.83333333333335	0.15772155662727	0.18365333026498	0.858800417066793	-0.0259317736377098	0.0513302305911141	0.0972195198728937	NaN	NaN	0.0963874511919616	0.787901346369087	393	0	607	0.607	0.393	0.786
N	all	ss13	24	AAC	ATA	ACT	2	GATAACTTT:GATTCAACT	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	76.00000000000001	6	37.500000000000014	0.160807403509091	0.179963002222943	0.89355812874181	-0.0191555987138519	0.0521784140173751	0.0987330750780497	NaN	NaN	0.0940169122838031	0.838551753039819	451	0	549	0.549	0.451	0.902
N	all	ss13	25	ACT	ACT	CTG	2	AACTTTGAC:TCAACTGGC	1:1	TRUE	1.25	0.75	1	0	0	0	2	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.66666666666667	5	37.500000000000014	0.12950744207608	0.146808432844571	0.882152609129691	-0.0173009907684918	0.0410938263815234	0.0859063353148568	NaN	NaN	0.0885090033081171	0.845023819351585	433	0	567	0.567	0.433	0.866
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGGCAGT:TTTGACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	75.41666666666667	3	37.500000000000014	0.12997618937868	0.0845966206090083	1.53642294979381	0.0453795687696719	0.0424772220441858	0.0540439388070571	NaN	NaN	0.0551423048083893	0.410534271748438	784	1	215	0.215	0.784	0.43
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.08333333333333	3	37.166666666666686	0.11328912210942	0.0854002100517197	1.32656725364973	0.0278889120577003	0.0387831003093544	0.0540190457496785	NaN	NaN	0.0548351786841415	0.611035950860229	711	0	289	0.289	0.711	0.578
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.58333333333333	3	37.000000000000014	0.0988502515956035	0.0858077633833082	1.15199659911929	0.0130424882122954	0.0357845524518388	0.0536155799275626	NaN	NaN	0.0516535624283723	0.800655157246868	601	1	398	0.398	0.601	0.796
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.41666666666667	3	37.166666666666686	0.0990837915488086	0.0854002100517197	1.16022889743247	0.0136835814970888	0.0353848891932957	0.0537649990641944	NA	NA	0.0492809306915604	0.781269656942274	603	1	396	0.396	0.603	0.792
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333333	3	36.500000000000014	0.0981562001449569	0.0870541284395655	1.12753067435623	0.0111020717053914	0.0360965027971989	0.0540752233381917	NA	NA	0.052150426302822	0.831416240668141	603	1	396	0.396	0.603	0.792
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGAC	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.08333333333333	4	37.166666666666686	0.0995542025718477	0.116173757560117	0.856942261855749	-0.0166195549882689	0.036232544906469	0.0627445101875357	NaN	NaN	0.0615000848942133	0.78697847287481	389	0	611	0.611	0.389	0.778
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGACCGT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.41666666666666	5	38.166666666666686	0.116033060287472	0.143981241370948	0.805890122787101	-0.0279481810834755	0.0387841455658206	0.0670728191281125	NaN	NaN	0.0630427586529731	0.657533542258773	308	0	692	0.692	0.308	0.616
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GACCGTACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	74.49999999999999	5	38.08333333333335	0.100388275971152	0.144328652584645	0.69555333728538	-0.0439403766134931	0.0384348318011774	0.0699085606465423	NaN	NaN	0.0645009587743862	0.495722157894939	238	2	760	0.76	0.238	0.476
N	all	ss13	34	ACT	GCA	CTG	2	CGCAGTGGG:CGTACTGGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.83333333333333	5	37.41666666666668	0.0985020015458152	0.147169682776295	0.66930905664547	-0.04866768123048	0.0374837067902993	0.0694687758988173	NaN	NaN	0.0642594901091657	0.448833152789546	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	35	GGA	CTG	GAG	2	ACTGGAGCT:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.33333333333333	5	37.250000000000014	0.0830340183118736	0.147897559919249	0.561429264669476	-0.0648635416073752	0.0321213583972636	0.0699341309791147	NaN	NaN	0.0613856817040894	0.290668666975439	110	0	890	0.89	0.11	0.22
N	all	ss13	36	GCG	GAG	CGC	2	GGAGCTAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.16666666666666	5	36.91666666666668	0.0820864003916519	0.149375201835214	0.549531645033071	-0.0672888014435618	0.0328016688325633	0.0756575552541926	NaN	NaN	0.0633769058265508	0.288360861040616	110	0	890	0.89	0.11	0.22
N	all	ss13	37	AGG	CGC	GAT	2	GCGCGATCA:GCTAGGCCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.66666666666666	5	36.41666666666668	0.0815281512006671	0.151648059986963	0.537614204940544	-0.070119908786296	0.0335277543082336	0.07282894993923	NaN	NaN	0.0635877067403788	0.270145548676743	105	0	895	0.895	0.105	0.21
N	all	ss13	38	CCT	GAT	CAA	2	AGGCCTAAG:CGATCAAAA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333333	5	36.83333333333334	0.081899468973744	0.149749252688945	0.546910702411739	-0.0678497837152013	0.0337957486818844	0.0704468342703496	NA	NA	0.0601126049883959	0.259019590354867	97	0	903	0.903	0.097	0.194
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCTAAGCAT:TCAAAACAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333333	4	36.83333333333334	0.081899468973744	0.117311764843583	0.698135170696173	-0.0354122958698388	0.0320325380342189	0.0653659876100166	NA	NA	0.0491836413322939	0.471524067809979	224	1	775	0.775	0.224	0.448
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAGCATAGA	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.99999999999999	4	36.33333333333334	0.0822741879423184	0.119061291806916	0.691023813816367	-0.0367871038645975	0.0336251330774459	0.0629956964662141	NaN	NaN	0.0526500243862567	0.484733219987912	225	1	774	0.774	0.225	0.45
N	all	ss13	41	AGA	AAC	GAA	2	CAACGTCGG:CATAGAAGA	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0.25	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.16666666666666	4	36.66666666666668	0.0686978768215524	0.117889187641809	0.582732633889054	-0.0491913108202568	0.0302500890044522	0.062554811731736	NA	NA	0.0487090513282547	0.312542810344519	142	0	858	0.858	0.142	0.284
N	all	ss13	42	AGA	GAA	GAC	2	AGAAGACCG:CGTCGGCCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.916666666666667	0.583333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.74999999999999	4	37.000000000000014	0.0547563501152288	0.116739982283845	0.46904538654197	-0.0619836321686162	0.0271918327971106	0.0619590819730772	NA	NA	0.0479923110781413	0.196519073812016	58	14	928	0.928	0.058	0.116
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	AGACCGCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666666	5	37.41666666666668	0.0550074627952336	0.147169682776295	0.37376898392074	-0.0921622199810617	0.0282062083945437	0.0694087957572803	NA	NA	0.0583540463634113	0.114252825874006	23	1	976	0.976	0.023	0.046
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT:CCGCAAGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666666	5	37.250000000000014	0.0550074627952336	0.147897559919249	0.371929481630848	-0.0928900971240153	0.0261115465060214	0.0720658016486426	NA	NA	0.0582671481975725	0.110888904518339	21	3	976	0.976	0.021	0.042
N	all	ss13	45	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCCT:CAAGGTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.24999999999999	5	36.250000000000014	0.0551338852123344	0.152421181209951	0.361720626849039	-0.0972872959976167	0.0276439669790902	0.0745802377733372	NA	NA	0.0601811920736627	0.105970463216524	20	2	978	0.978	0.02	0.04
N	all	ss13	46	CCT	GCC	CTC	2	GGCCCTCCT:GGTTTACCC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666664	6	36.250000000000014	0.0550074627952336	0.187009442781175	0.294142701978954	-0.132001979985942	0.0281440971586163	0.0831126204642011	0.179080964069772	0.100483860945169	0.0747325583986288	0.0773413536749821	5	1	994	0.994	0.005	0.01
N	all	ss13	47	CCC	CTC	CCA	2	CCTCCTAAC:TTACCCAAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.74999999999999	5	35.750000000000014	0.040687942312311	0.154788747544192	0.262861112050116	-0.114100805231881	0.0231076556175702	0.0770539157894861	NA	NA	0.0668295351999152	0.087758690309716	23	1	976	0.976	0.023	0.046
N	all	ss13	48	AAC	CCA	ACA	2	CCCAATAAT:CCTAACAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666666	5	35.58333333333334	0.0405961546323978	0.155594424961324	0.260910084937097	-0.114998270328926	0.0238163043929153	0.0766558397828199	NA	NA	0.0715682783407574	0.108091010323911	16	2	982	0.982	0.016	0.032
N	all	ss13	49	AAC	ACA	ACA	2	AACAACACG:AATAATACT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.24999999999999	5	35.58333333333334	0.0409658133601689	0.155594424961324	0.26328586882436	-0.114628611601155	0.0238386452534853	0.0774899296751207	NA	NA	0.0671858127635618	0.0879814375929992	12	1	987	0.987	0.012	0.024
N	all	ss13	50	ACG	ACA	CGG	2	AACACGGCA:AATACTGCG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333333	5	35.75000000000001	0.0410592825874941	0.154788747544192	0.265260125422047	-0.113729464956698	0.0241094893115141	0.0797212491780351	NA	NA	0.0674408562932367	0.091726759084082	18	3	979	0.979	0.018	0.036
N	all	ss13	51	GCA	CGG	CAT	2	ACGGCATCC:ACTGCGTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25	5	35.583333333333336	0.0409658133601689	0.155594424961324	0.26328586882436	-0.114628611601155	0.0236272954762138	0.075734914473014	NA	NA	0.071357531331557	0.108186440858133	17	2	981	0.981	0.017	0.034
N	all	ss13	52	TCC	CAT	CCT	2	GCATCCTGG:GCGTCTTGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666666	5	35.333333333333336	0.0404592471687861	0.15681884839392	0.257999899777066	-0.116359601225133	0.0244419623307689	0.0766822288072637	NaN	NaN	0.0690650761837881	0.0920306276801066	15	1	984	0.984	0.015	0.03
N	all	ss13	53	TGG	CCT	GGT	2	TCCTGGTTC:TCTTGGTTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5	5	35.00000000000001	0.0408264049162628	0.158481820250405	0.257609389214208	-0.117655415334142	0.0242242860946633	0.0788269360383792	NA	NA	0.0744573724248524	0.114067604449346	17	1	982	0.982	0.017	0.034
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666667	5	34.00000000000001	0.0410124947055404	0.163690174515013	0.250549520318208	-0.122677679809473	0.0235069815430896	0.0779537835120857	NA	NA	0.0754862610181967	0.104127263626554	15	1	984	0.984	0.015	0.03
N	all	ss13	55	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666667	5	33.41666666666667	0.0542609435735893	0.166890228132415	0.325129542818632	-0.112629284558826	0.0283569579749981	0.0841837461128409	NaN	NaN	0.078213196048981	0.149859143684712	31	0	969	0.969	0.031	0.062
N	all	ss13	56	GCT	CCG	CTC	2	ACCGCTCTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666667	5	32.75000000000001	0.0538952343889476	0.170704815996831	0.315721815311573	-0.116809581607883	0.0258294935484334	0.088458964516671	NaN	NaN	0.0804621848901383	0.146575954690154	38	0	962	0.962	0.038	0.076
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333334	5	32.75000000000001	0.0534152253723939	0.170704815996831	0.312909891033101	-0.117289590624437	0.0265168017330833	0.0850601268126126	NA	NA	0.0799560283054752	0.142396139688254	34	0	966	0.966	0.034	0.068
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333334	5	32.75000000000001	0.0534152253723939	0.170704815996831	0.312909891033101	-0.117289590624437	0.0265978285075222	0.087609016022862	NaN	NaN	0.0837566372640706	0.161405019893361	35	0	965	0.965	0.035	0.07
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000001	5	32.25000000000001	0.0529436946379863	0.173682709081938	0.304829967921614	-0.120739014443952	0.0267726266600674	0.0901084710518454	NA	NA	0.0835397378517934	0.148376893484977	23	0	977	0.977	0.023	0.046
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAACATGGT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.25000000000001	5	31.583333333333336	0.0522518101768581	0.177819473768805	0.293847513263897	-0.125567663591947	0.0260862292046417	0.0855782871956345	NA	NA	0.0824454330029828	0.12774878539609	26	1	973	0.973	0.026	0.052
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG:CATGGTAAA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	5	32.25000000000001	0.0531784143271381	0.173682709081938	0.306181395996363	-0.1205042947548	0.0262802818362395	0.0920017816251964	NaN	NaN	0.0826547352528519	0.144861584192236	30	0	970	0.97	0.03	0.06
N	all	ss13	62	AAA	GCA	AAG	2	GGCAAGGAA:GGTAAAGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	5	33.083333333333336	0.0532965566864638	0.168775880107432	0.315783017410654	-0.115479323420969	0.0259759540644168	0.0846468900677136	NA	NA	0.078642894095833693	0.141995264236483	31	1	968	0.968	0.031	0.062
N	all	ss13	63	GAA	AAG	AAA	2	AAAGAAACT:AAGGAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000001	5	32.916666666666664	0.0536541558618204	0.169734844556617	0.316105723618367	-0.116080688694796	0.0258316151032636	0.0842727579949693	NaN	NaN	0.0835315212169151	0.164631146811459	40	0	960	0.96	0.04	0.08
N	all	ss13	64	ACT	AAA	ACC	2	GAAACTCTC:GAAGACCTT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333334	5	33.416666666666664	0.0545075207127158	0.166890228132415	0.3266070238065	-0.112382707419699	0.0270649876663983	0.0839254225657244	NaN	NaN	0.0771700432445097	0.145309800637279	36	1	963	0.963	0.036	0.072
N	all	ss13	65	CTC	ACC	TCA	2	ACTCTCACC:GACCTTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.08333333333334	4	33.75	0.0416291816557173	0.129003442367267	0.322698223332685	-0.0873742607115494	0.0233680552506366	0.0667791582712795	NA	NA	0.0699072328734028	0.211350658889153	73	1	926	0.926	0.073	0.146
N	all	ss13	66	AAA	TCA	AAT	2	CTCACCTTC:CTTAAATTC	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.75	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25	4	32.58333333333333	0.0415331021017154	0.134060541816084	0.309808550219751	-0.092527439714369	0.0238763853466101	0.0723967602561982	NA	NA	0.0729965912927455	0.204955709229545	57	2	941	0.941	0.057	0.114
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:ACCTTCCCG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666667	4	32.33333333333333	0.0274630224286674	0.135196367873208	0.203134321289039	-0.107733345444541	0.0207612969377456	0.0704231782729491	NA	NA	0.0713339310316005	0.130975081823478	26	3	971	0.971	0.026	0.052
N	all	ss13	68	CCG	TCC	CGA	2	TTCCCGAGA:TTCCCTCGA	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.41666666666667	4	32.416666666666664	0.0277488297186241	0.134815620966532	0.205828000640318	-0.107066791247908	0.0190063793324462	0.0706440526004206	NA	NA	0.0714507159035816	0.134011046952729	27	5	968	0.968	0.027	0.054
N	all	ss13	69	AGA	CGA	GAG	2	CCGAGAGGA:CCTCGAGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74	4	31.833333333333332	0.0275260251378209	0.137526919369799	0.200150088898637	-0.110000894231978	0.0187737131169177	0.0762767181467426	NA	NA	0.0702475298068	0.117371072231954	17	6	977	0.977	0.017	0.034
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	AGAGGACAA:CGAGGACAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666667	4	31.999999999999996	0.0272757331281561	0.136741167595466	0.199469798362761	-0.10946543446731	0.02001349701642	0.0731980809573871	NA	NA	0.0680588601948889	0.107749004696914	19	9	972	0.972	0.019	0.038
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGACAAGGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.5	4	32.166666666666664	0.0273378783823658	0.135964367940317	0.201066491143959	-0.108626489557951	0.0193824571988694	0.0728023461852423	NA	NA	0.0691564544830599	0.116244128348077	26	5	969	0.969	0.026	0.052
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAAGGTGTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333334	4	33.166666666666664	0.0423642016009181	0.131483259230803	0.322202247257598	-0.0891190576298849	0.0249582225932887	0.069177927599079	NA	NA	0.0669159104624299	0.182923717034746	71	1	928	0.928	0.071	0.142
N	all	ss13	73	GTG	GCG	TGC	2	GGCGTTCCA:GGTGTGCCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666667	4	33	0.0567646707244322	0.132209431753494	0.429354169150886	-0.0754447610290617	0.0270069620807522	0.0749194895593363	NaN	NaN	0.0680274916316654	0.267415769284562	94	2	904	0.904	0.094	0.188
N	all	ss13	74	CCA	TGC	CAA	2	GTGCCGATT:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.5	4	32.666666666666664	0.0564972895530331	0.133686173554739	0.422611314624094	-0.077188884001706	0.0286089612297056	0.0718793625823556	NaN	NaN	0.071777792545092	0.282201630479048	111	2	887	0.887	0.111	0.222
N	all	ss13	75	ATT	CAA	TTA	2	CCAATTAAC:CCGATTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666667	4	33	0.0567646707244322	0.132209431753494	0.429354169150886	-0.0754447610290617	0.0303448839852154	0.0698393691051436	NaN	NaN	0.0721705882081761	0.29585332011001	126	1	873	0.873	0.126	0.252
N	all	ss13	76	AAC	TTA	ACA	2	ATTAACACC:ATTAATACC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666667	4	32	0.0559700169039056	0.136741167595466	0.409313580453597	-0.0807711506915604	0.0278747173497051	0.0743394011375177	NA	NA	0.0686646654500959	0.239469752503796	114	0	886	0.886	0.114	0.228
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT:AATACCAAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5	4	32.99999999999999	0.0573071018565008	0.132209431753494	0.433456986361991	-0.0749023298969932	0.0278338677718613	0.0712829035312439	NaN	NaN	0.0696380418714958	0.282108422939591	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	78	AAC	CCA	ACA	2	ACCAACAGT:ACCAATAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73	4	33.166666666666664	0.0568993130810351	0.131483259230803	0.432749487759162	-0.0745839461497679	0.0277886591714848	0.0736946090629163	NaN	NaN	0.0684354928146751	0.275782287128981	122	2	876	0.876	0.122	0.244
N	all	ss13	79	AGC	ACA	GCA	2	AACAGTGGC:AATAGCAGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.25	4	32.916666666666664	0.0566975883332357	0.132575542143044	0.427662504084359	-0.0758779538098085	0.0272086903238111	0.0739281044311968	NaN	NaN	0.0718880530093211	0.291195985510286	132	0	868	0.868	0.132	0.264
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GCA	2	AGCAGTCCA:AGTGGCAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.66666666666667	4	32.5	0.0711433450940078	0.134437018317738	0.529194607142078	-0.0632936732237305	0.0311511003474377	0.0713217350930883	NaN	NaN	0.072661825262081	0.383714903209126	189	2	809	0.809	0.189	0.378
N	all	ss13	81	AAA	GCA	AAG	2	AGTCCAGAT:GGCAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.58333333333334	3	32.25	0.0712278649928987	0.0993184392369987	0.717166575915789	-0.0280905742440999	0.031596472677926	0.0613209320514045	NA	NA	0.0636439212958137	0.658944512179316	342	0	658	0.658	0.342	0.684
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.58333333333334	2	31.916666666666664	0.0564308375631679	0.0654365742860851	0.862374569250147	-0.0090057367229172	0.0272554793670397	0.0471951963843401	NA	NA	0.0583190516398072	0.877277114605941	465	0	535	0.535	0.465	0.93
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666669	2	32.58333333333333	0.0573756358851215	0.0640388786228151	0.895950040335032	-0.00666324273769368	0.0279810884365968	0.0478260480339836	NA	NA	0.0578145653138963	0.908245404365612	481	1	518	0.518	0.481	0.962
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333334	2	33.25	0.05765141989764	0.0626996766264699	0.919485123361886	-0.00504825672882984	0.0285499077070655	0.0487062376885602	NA	NA	0.0564780325916278	0.928776397306225	490	2	508	0.508	0.49	0.98
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.08333333333334	2	33.58333333333333	0.0584949199843537	0.0620508745044359	0.942692918536902	-0.00355595452008219	0.0292427740106158	0.0486953119193545	NaN	NaN	0.0569208185791475	0.95018699912347	500	3	497	0.497	0.5	0.994
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.91666666666669	2	33.24999999999999	0.0586379101169781	0.0626996766264699	0.935218700828562	-0.00406176650949174	0.0284804536772217	0.046084835587369	NA	NA	0.0561551451824857	0.942338371528625	474	5	521	0.521	0.474	0.948
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC:GGCTACTAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000001	2	33.91666666666666	0.0592169340983304	0.0614153696041381	0.964203821942649	-0.00219843550580773	0.0289543195837431	0.0464170006472983	NA	NA	0.0537029659877466	0.967346162180523	510	0	490	0.49	0.51	0.98
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA:TACTATAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.75000000000001	2	34.08333333333333	0.0587816013967042	0.0611024764460933	0.962016677811141	-0.00232087504938911	0.0288580884608229	0.044501818666276	NaN	NaN	0.0547759593030709	0.966203486477242	519	2	479	0.479	0.519	0.958
N	all	ss13	89	AGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA:TATAGAAGA	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.25	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.33333333333334	2	33.5	0.0582817382454872	0.0622118122355632	0.936827527621364	-0.00393007399007599	0.0283332142585553	0.0442698622713477	NA	NA	0.0558322943556345	0.943882697379288	462	2	536	0.536	0.462	0.924
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	AGAAGAGCT:CGAAGAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.08333333333334	2	33.916666666666664	0.0584949199843537	0.0614153696041381	0.952447577233376	-0.00292044961978444	0.0292531545702135	0.0472324251151994	NA	NA	0.0571247899294741	0.959226685824239	509	2	489	0.489	0.509	0.978
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC:AGAGCTTCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75	2	33.75	0.05965876642654	0.0617314855970427	0.966423630494938	-0.00207271917050272	0.0291636512294695	0.0476247537008115	NA	NA	0.058505290685913	0.971738543377588	501	0	499	0.499	0.501	0.998
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTTCCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.91666666666667	2	33.25	0.0595107578353943	0.0626996766264699	0.949139788868875	-0.00318891879107554	0.0287588451365752	0.0457700529143548	NA	NA	0.0585513013387342	0.956565752246435	507	2	491	0.491	0.507	0.982
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:TCCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.08333333333334	1	33.08333333333333	0.0593634822039754	0.0308526791703671	1.92409488576901	0.0285108030336083	0.0296896904665179	0.0338867885855245	NA	NA	0.047062224031739	0.544640405087088	738	6	256	0.256	0.738	0.512
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.25000000000001	1	33.08333333333333	0.0592169340983304	0.0308526791703671	1.91934495449608	0.0283642549279633	0.0292187375179383	0.035161272829673	NA	NA	0.0456816218769498	0.534657702005674	734	3	263	0.263	0.734	0.526
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.66666666666669	1	33.83333333333333	0.0588537115811214	0.0301548153585304	1.95171851929355	0.028698896222591	0.0281086733132272	0.0337928143085559	NA	NA	0.0468832338522776	0.540448049254292	739	2	259	0.259	0.739	0.518
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.08333333333336	0	33.916666666666664	0.0738603741781929	0	-Inf	0.0738603741781929	0.0323804471390542	0	NA	NA	0.0328332427851426	0.0244768425439426	997	3	0	0	0.997	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.58333333333336	0	34.08333333333333	0.0733184070851303	0	-Inf	0.0733184070851303	0.0337724845621327	0	NA	NA	0.0315186350291248	0.0200082926161186	998	2	0	0	0.998	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.75000000000003	0	34.416666666666664	0.0731395159410335	0	-Inf	0.0731395159410335	0.0319717769554962	0	NA	NA	0.0337410083568478	0.0301834778405783	991	9	0	0	0.991	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGA:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.4166666666667	0	33.74999999999999	0.0724326033146383	0	-Inf	0.0724326033146383	0.0322769093787761	0	NA	NA	0.031796549534012	0.0227264586576679	994	6	0	0	0.994	0.001
N	all	ss13	100	GGA	ACG	GAA	2	GACGGAAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.75000000000003	0	33.74999999999999	0.0731395159410335	0	-Inf	0.0731395159410335	0.0307897043578913	0	NA	NA	0.030263709295956	0.0156601998445029	998	2	0	0	0.998	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GAA	AAA	2	GGAAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.75000000000003	0	33.74999999999999	0.0731395159410335	0	-Inf	0.0731395159410335	0.0333764987236773	0	NA	NA	0.0313817625305976	0.0197724766939512	995	5	0	0	0.995	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.50000000000003	0	33.99999999999999	0.073408181482178	0	-Inf	0.073408181482178	0.0311661369735882	0	NA	NA	0.0320803254253794	0.022122282800414	990	10	0	0	0.99	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.00000000000003	0	34.49999999999999	0.0728728113402358	0	-Inf	0.0728728113402358	0.0311578052234863	0	NA	NA	0.0311076228022582	0.0191497460528741	999	1	0	0	0.999	0.001
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGT	2	AAAGAGTTG:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	1	35.666666666666664	0.088993157850987	0.0285748846742028	3.11438379771763	0.0604182731767842	0.0359938667158933	0.0295031271856871	NaN	NaN	0.0350746252748301	0.0849674702064703	968	2	30	0.03	0.968	0.06
N	all	ss13	105	CTC	AGT	TCA	2	GAGTTGAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.9166666666667	1	36.25	0.0740428162575335	0.0281063333749098	2.6343819120722	0.0459364828826237	0.0317865021101189	0.0285890297594151	NA	NA	0.0321585632112636	0.153166103964397	951	2	47	0.047	0.951	0.094
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGTCCA:TTGAGCCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.08333333333337	1	36.916666666666664	0.0738603741781928	0.0275893176123833	2.6771366807942	0.0462710565658094	0.032173063369609	0.0285131266604542	NA	NA	0.0314668590582573	0.141434639783259	943	3	54	0.054	0.943	0.108
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCAAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.75000000000003	1	36.58333333333333	0.0742261626042775	0.02784542552167	2.66565014589247	0.0463807370826075	0.0337746070904452	0.0271397170064069	NA	NA	0.0328549011516711	0.158043037246151	923	11	66	0.066	0.923	0.132
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.08333333333336	1	36.25	0.0738603741781929	0.0281063333749098	2.62789077440202	0.0457540408032831	0.0311974946786231	0.0289070307932521	NA	NA	0.0316690753231626	0.148526840302444	951	5	44	0.044	0.951	0.088
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.08333333333336	1	36.58333333333333	0.0738603741781929	0.02784542552167	2.65251375385565	0.0460149486565229	0.0318178820058914	0.0272133539553703	NA	NA	0.0318868969947787	0.149001422774632	937	6	57	0.057	0.937	0.114
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.75000000000001	1	36.916666666666664	0.0753456127890199	0.0275893176123833	2.73097050994844	0.0477562951766366	0.0348251095491127	0.0273234888574999	NA	NA	0.0312057285312982	0.125925294020724	950	5	45	0.045	0.95	0.09
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAC:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.33333333333334	1	36.25	0.0746885290720775	0.0281063333749098	2.65735583776826	0.0465821956971677	0.0321607902183421	0.0269784452701551	NA	NA	0.0328102975305794	0.155682466291394	928	3	69	0.069	0.928	0.138
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.16666666666669	1	35.416666666666664	0.073769490149132	0.0287805096612113	2.56317525358331	0.0449889804879208	0.032588467283052	0.0303501284176992	NA	NA	0.0322324208253255	0.162784379522608	919	6	75	0.075	0.919	0.15
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.16666666666669	2	34.583333333333336	0.0726960870999215	0.0601826482875392	1.20792436305887	0.0125134388123823	0.0335259463710268	0.0461926326659502	NA	NA	0.0484823765167381	0.796327543903643	630	1	369	0.369	0.63	0.738
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.75000000000001	2	34	0.0720842506535657	0.0612585232607003	1.1767219778837	0.0108257273928653	0.0319838382190265	0.0450333084331927	NA	NA	0.0485594017798283	0.823583897402525	613	2	385	0.385	0.613	0.77
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACA:CTAGGAACT	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.41666666666669	2	34.333333333333336	0.0703916034965163	0.0606390724718212	1.16082915894248	0.00975253102469515	0.0310362138856301	0.0468772521099576	NA	NA	0.047188630639419	0.836266649136711	628	1	371	0.371	0.628	0.742
N	all	ss13	116	ACA	GAA	CAG	2	GGAACAGGA:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000001	2	34.75	0.069817817299509	0.0598821656332629	1.16592004582959	0.00993565166624609	0.0314941759978483	0.0446177867929561	NA	NA	0.0463496869742059	0.830264098422733	622	4	374	0.374	0.622	0.748
N	all	ss13	117	GGA	CAG	GAC	2	ACAGGACCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.83333333333334	2	34.916666666666664	0.0699807987745894	0.059584670169267	1.17447656546204	0.0103961286053224	0.0316922782859898	0.0449496867382224	NA	NA	0.0463569945839951	0.822553169414423	611	0	389	0.389	0.611	0.778
N	all	ss13	118	CCA	GAC	CAG	2	GGACCAGAG:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.91666666666667	2	34.833333333333336	0.084696240393644	0.0597330472949441	1.41791259996228	0.0249631930986999	0.0346414294495164	0.0436846921565861	NA	NA	0.0497389341734425	0.615748868111975	721	1	278	0.278	0.721	0.556
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT:CCAGAGGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.58333333333334	2	34.5	0.0839057969997928	0.0603340239140544	1.39068789973823	0.0235717730857383	0.033965867313137	0.0465589607809721	NaN	NaN	0.0511014461202197	0.644601971218179	670	2	328	0.328	0.67	0.656
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAGGCTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.08333333333334	2	34.333333333333336	0.0844972351423309	0.0606390724718212	1.39344537602544	0.0238581626705097	0.0342258764529148	0.0474419383517594	NaN	NaN	0.0494391121763789	0.629396339730469	695	0	305	0.305	0.695	0.61
N	all	ss13	121	GCA	CTG	CAT	2	GCTGCATTA:GCTGGACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.91666666666669	2	34.166666666666664	0.0835160880143217	0.0609472230590743	1.37030177623305	0.0225688649552474	0.0346326624746236	0.0458745570020183	NaN	NaN	0.0510794140582074	0.658605888580514	677	0	323	0.323	0.677	0.646
N	all	ss13	122	CTT	CAT	TAC	2	GCATTACCT:GGACTTCCC	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.50000000000001	2	33.583333333333336	0.0683844676038055	0.0620508745044359	1.10207097240695	0.00633359309936966	0.0302172301980945	0.0475355227502103	NA	NA	0.0494544593223855	0.898094209214221	538	1	461	0.461	0.538	0.922
N	all	ss13	123	CCC	TAC	CCT	2	CTTCCCTAT:TTACCTTAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.50000000000001	2	34.083333333333336	0.0541996476239404	0.0611024764460933	0.887028657042358	-0.00690282882215286	0.0273652499561847	0.0465944043176082	NA	NA	0.0468421200348038	0.882844944112541	424	10	566	0.566	0.424	0.848
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT:CCTTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666669	2	34.416666666666664	0.0544456664773409	0.0604861633757489	0.900134236306516	-0.00604049689840801	0.0275530833488658	0.0458419243844109	NA	NA	0.0459109724092327	0.895324583568866	473	6	521	0.521	0.473	0.946
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666669	2	34.416666666666664	0.0544456664773409	0.0604861633757489	0.900134236306516	-0.00604049689840801	0.0251889730036976	0.0449644991962047	NA	NA	0.0468814898615543	0.897479430922278	468	3	529	0.529	0.468	0.936
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC:GGTGCTAAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333336	2	34.916666666666664	0.0543223783836108	0.059584670169267	0.911683797683077	-0.00526229178565612	0.0267601362117081	0.0444098974681126	NA	NA	0.0463031144140815	0.909516228580398	469	6	525	0.525	0.469	0.938
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA:GCTAATAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000001	2	34	0.0536541558618204	0.0612585232607003	0.875864337007967	-0.00760436739887994	0.0267259936269513	0.0475204993338003	NA	NA	0.0465833134696156	0.870327659471818	448	4	548	0.548	0.448	0.896
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC:AATAAAGAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	33.66666666666667	0.0534152253723939	0.0618907677660026	0.863056434755292	-0.00847554239360868	0.0257332422095086	0.0462657297430223	NA	NA	0.0438676647320385	0.84679681229962	407	5	588	0.588	0.407	0.814
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGA:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.00000000000001	2	33.66666666666667	0.0679196827842952	0.0618907677660026	1.09741218659763	0.00602891501829264	0.0304481611745525	0.0450210433019313	NaN	NaN	0.0475213703266992	0.899045310487957	572	1	427	0.427	0.572	0.854
N	all	ss13	130	GGA	AAG	GAA	2	GAAGGAATA:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333334	2	33.91666666666667	0.0545075207127158	0.0614153696041381	0.887522473023482	-0.0069078488914223	0.0264881754203192	0.0439569758123606	NA	NA	0.0458425127934944	0.880223004354585	457	5	538	0.538	0.457	0.914
N	all	ss13	131	ATA	GAA	TAG	2	GGAATAGTT:GGCATCATA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333334	2	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.0609472230590743	0.89739822724148	-0.00625329313056999	0.0287800566475184	0.0466250807925184	NA	NA	0.0465981701590645	0.893247502503946	467	4	529	0.529	0.467	0.934
N	all	ss13	132	ATA	TAG	TAT	2	ATAGTTTGG:ATCATATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.16666666666669	2	34.5	0.0544456664773409	0.0603340239140544	0.902404032505747	-0.00588835743671356	0.0276039516853796	0.0427294112017896	NA	NA	0.0458724326800747	0.897861117850684	466	5	529	0.529	0.466	0.932
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTTTGGGTA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.66666666666669	2	34.5	0.054077470426008	0.0603340239140544	0.896301405373544	-0.00625655348804646	0.0274592110207983	0.044074159378084	NA	NA	0.0463995441543573	0.892737715401323	458	9	533	0.533	0.458	0.916
N	all	ss13	134	GTA	GGG	TAG	2	TGGGTAGCC:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	3	34.16666666666667	0.0545695157118212	0.0933847109044368	0.584351712216187	-0.0388151951926156	0.0275558371167376	0.0573531760841547	NaN	NaN	0.0609143313436085	0.523988341564515	253	4	743	0.743	0.253	0.506
N	all	ss13	135	GCA	TAG	CAA	2	GTAGCCACG:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333336	4	33.833333333333336	0.0543223783836108	0.128656816904346	0.422226973204216	-0.0743344385207348	0.0268249513112137	0.0703006151045317	NA	NA	0.0687742998710318	0.279765547500029	117	0	883	0.883	0.117	0.234
N	all	ss13	136	ACG	CAA	CGG	2	GCAACTGAG:GCCACGGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.66666666666669	4	34.50000000000001	0.0548189130040021	0.125949614506391	0.435244785931602	-0.0711307015023892	0.0276551747601011	0.0716063503577593	NaN	NaN	0.0744009021695197	0.339048882205399	134	0	866	0.866	0.134	0.268
N	all	ss13	137	GAA	CGG	AAG	2	ACGGAAGGG:ACTGAGGGA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000001	4	34.16666666666667	0.0545695157118212	0.127288788480472	0.428706379903939	-0.0727192727686506	0.027591179638333	0.0729499692453843	NA	NA	0.0702489654849698	0.300591845033848	128	0	872	0.872	0.128	0.256
N	all	ss13	138	GGA	AAG	GAG	2	GAAGGGGCA:GAGGGAGCC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000001	4	34	0.0549444688504895	0.127969137773073	0.429357185698339	-0.073024668922583	0.0279656960924105	0.0706441822163968	NaN	NaN	0.0720671703476491	0.310923478901856	129	0	871	0.871	0.129	0.258
N	all	ss13	139	GCA	GAG	CAC	2	GGAGCCTTG:GGGGCACTA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.25000000000001	5	34.583333333333336	0.0842991638602775	0.160610991304224	0.524865472628837	-0.0763118274439464	0.0405533080545939	0.0782029713255931	NaN	NaN	0.0735949169706446	0.299774496603228	124	2	874	0.874	0.124	0.248
N	all	ss13	140	CTA	CAC	TAA	2	GCACTAAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.25000000000001	5	34.583333333333336	0.0842991638602775	0.160610991304224	0.524865472628837	-0.0763118274439464	0.0406539136269544	0.0803685401580802	NaN	NaN	0.0701058751185705	0.27636447776836	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	141	AAC	TAA	ACA	2	CTAAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.58333333333336	5	34.583333333333336	0.082747441258963	0.160610991304224	0.515204100211458	-0.0778635500452609	0.0397043598037225	0.0828714889487261	NaN	NaN	0.0752849984777962	0.30101905429160303	121	0	879	0.879	0.121	0.242
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.58333333333336	5	35.583333333333336	0.082747441258963	0.155594424961324	0.531814949536472	-0.0728469837023611	0.0420677789156182	0.0801794124187135	NaN	NaN	0.070623139341549	0.302311614902156	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666669	5	35.75	0.0829382721030275	0.154788747544192	0.535815900179362	-0.0718504754411649	0.0409557280406853	0.072259046813216	NaN	NaN	0.0711066043746965	0.312274307803322	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	76.25000000000001	6	36.25	0.113021862643589	0.187009442781175	0.604364469316335	-0.0739875801375868	0.0525162224727268	0.0852523423113502	NaN	NaN	0.0741046071043668	0.318075357995875	144	0	856	0.856	0.144	0.288
N	all	ss13	145	GAA	AAG	AAC	2	AAAGAACAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	76.33333333333334	6	36.16666666666667	0.128273860987015	0.187498978963039	0.684130984053525	-0.059225117976024	0.0543864956883059	0.0814220482100828	NaN	NaN	0.0769555839126228	0.441536429367363	192	0	808	0.808	0.192	0.384
N	all	ss13	146	CAC	AAC	ACA	2	GAACACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25000000000001	6	36.583333333333336	0.114644643047729	0.185076724431924	0.619443873342908	-0.0704320813841948	0.0516336421368346	0.0838179199868692	NaN	NaN	0.0718035986142384	0.326642527961154	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.75000000000001	6	36.583333333333336	0.115473669414864	0.185076724431924	0.623923239236593	-0.0696030550170595	0.0528363538239719	0.0849087964670398	NaN	NaN	0.0754557698094171	0.356301637549164	139	0	861	0.861	0.139	0.278
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC:ATTGGCACG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.91666666666667	6	35.583333333333336	0.113557650951866	0.190999228388671	0.594545077013525	-0.0774415774368049	0.0535583465553519	0.0854451757224362	NaN	NaN	0.074010826622283	0.295397292149771	119	0	881	0.881	0.119	0.238
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC:GGCACGCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	74.58333333333333	6	35.91666666666667	0.115752687680699	0.188983168709011	0.61250262905122	-0.0732304810283115	0.0551627332249296	0.0833035998949308	NaN	NaN	0.0782608320044825	0.349415690352119	134	0	866	0.866	0.134	0.268
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT:ACGCGTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25	6	35.25000000000001	0.114644643047729	0.193059006111768	0.593832141564829	-0.0784143630640395	0.0534409355410354	0.0893442450397622	NaN	NaN	0.0772542011128626	0.31009750422599	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT:CGTAATCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333334	6	35.41666666666668	0.114919656765687	0.192023563619284	0.59846643088831	-0.0771039068535967	0.0536644075900294	0.0845434028799642	NaN	NaN	0.0789049133267417	0.328482533958873	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	152	CCC	ATC	CCA	2	AATCCCAAC:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333334	7	35.08333333333334	0.114919656765687	0.231968667588477	0.495410255015818	-0.11704901082279	0.0502321562045519	0.100766332703242	0.280336792402897	0.0771952918222952	0.0893865568392976	0.190375207651453	54	0	946	0.946	0.054	0.108
N	all	ss13	153	AAC	CCA	ACA	2	CCCAACAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.58333333333334	7	35.25000000000001	0.114098553183291	0.230684450150283	0.494608774492429	-0.116585896966992	0.0509797946749138	0.100912782289002	NaN	NaN	0.0919432665406131	0.204790823435093	67	0	933	0.933	0.067	0.134
N	all	ss13	154	AAC	ACA	ACA	2	AACAACAAC:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333334	6	35.08333333333334	0.0981562001449569	0.194105738514483	0.505684174492519	-0.0959495383695259	0.0494180686223699	0.0923696411273864	NA	NA	0.0835321621879013	0.250698749253214	95	0	905	0.905	0.095	0.19
N	all	ss13	155	AAC	ACA	ACG	2	AACAACGCA:AACAATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.08333333333334	6	34.66666666666667	0.0981562001449569	0.196773198350618	0.498829113759987	-0.0986169982056613	0.047563462775181	0.0899189674695378	NaN	NaN	0.08479606555806	0.244833454818041	74	1	925	0.925	0.074	0.148
N	all	ss13	156	GCA	ACG	CAG	2	AACGCAGCC:AATGCTGCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	75.75	6	34.33333333333334	0.0986178115404479	0.198960851821961	0.495664401500933	-0.100343040281513	0.0500790078371033	0.0895487635402437	NaN	NaN	0.0853188820126032	0.239557244760667	83	0	917	0.917	0.083	0.166
N	all	ss13	157	GCA	CAG	CAA	2	GCAGCCATT:GCTGCAATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75	6	34.33333333333334	0.113827458253345	0.198960851821961	0.572109825681701	-0.085133393568616	0.0537290713837573	0.0913061182489351	NaN	NaN	0.0898744079475272	0.343512192457927	146	0	854	0.854	0.146	0.292
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATTGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.75	6	34.33333333333334	0.113827458253345	0.198960851821961	0.572109825681701	-0.085133393568616	0.0512851218859804	0.091829416239931	NaN	NaN	0.0889908322318666	0.33874216183203	153	0	847	0.847	0.153	0.306
N	all	ss13	159	GTC	TCG	TCT	2	ATCGTGCTA:ATTGTCTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.25	6	34.33333333333334	0.114644643047729	0.198960851821961	0.576217089934447	-0.0843162087742318	0.0501019501793894	0.0916951213188372	0.435580592956688	0.185878162212035	0.0881742784557288	0.338948493487818	152	0	848	0.848	0.152	0.304
N	all	ss13	160	CTA	TCT	TAC	2	GTCTTGCAA:GTGCTACAA	1:1	TRUE	1.58333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333334	6	34.50000000000001	0.114919656765687	0.197860943283853	0.580810213771306	-0.0829412865181661	0.0535367392920724	0.0911660099282145	NaN	NaN	0.0924529354722026	0.36965541253464	162	0	838	0.838	0.162	0.324
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT:TTGCAATTG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	75.08333333333334	6	34.41666666666667	0.114919656765687	0.198409364312814	0.579204802977462	-0.0834897075471271	0.0519076611220743	0.0925757716597821	0.421113686488808	0.169003761649725	0.0885169031400385	0.345575352029214	146	0	854	0.854	0.146	0.292
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCCT:CAATTGCCT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	74.91666666666667	6	34.75000000000001	0.146988835142564	0.196233824001589	0.749049435745459	-0.0492449888590251	0.0609375538529769	0.0939091577961333	NaN	NaN	0.0968819570314658	0.611243765462853	310	0	690	0.69	0.31	0.62
N	all	ss13	163	CCT	TGC	CTC	2	CTTCCTCAA:TTGCCTCAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	74.25	6	35.083333333333336	0.165046413582601	0.194105738514483	0.850291263131752	-0.0290593249318817	0.0632332750803968	0.0872580011730321	NaN	NaN	0.0864050043885227	0.736633113848457	353	0	647	0.647	0.353	0.706
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA:CCTCAAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	74.5	6	35.16666666666667	0.216321047091377	0.193580949501978	1.1174707410409	0.0227400975893988	0.0881495815350231	0.0886811140086315	0.890577558228796	0.209561965039813	0.103710121276553	0.826442889558061	607	0	393	0.393	0.607	0.786
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA:CAAGGTACG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.33333333333333	7	35.00000000000001	0.235066177990017	0.23261619622788	1.01053229225594	0.0024499817621377	0.0873554199414742	0.0985879074161475	NaN	NaN	0.109071647156832	0.982079318467344	514	1	485	0.485	0.514	0.97
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA:GGTACGTCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.25	7	35.083333333333336	0.23537608894668	0.231968667588477	1.01468914484713	0.0034074213582031	0.0891337805415323	0.103265779818417	0.739665834938572	0.170119159976053	0.108538989615749	0.974955705833412	524	0	476	0.476	0.524	0.952
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG:ACGTCCTTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	15	74.25	7	35.083333333333336	0.23537608894668	0.231968667588477	1.01468914484713	0.0034074213582031	0.0882199878924013	0.0995793820952736	0.670892317242744	0.130420158571752	0.110021342580081	0.975293027062841	516	0	484	0.484	0.516	0.968
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA:TCCTTGCCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	74.58333333333334	7	35.41666666666667	0.21604093597738	0.229414483788198	0.941705738931617	-0.0133735478108175	0.0875151839507464	0.0995453231874857	NaN	NaN	0.104747798623439	0.898407137649026	448	2	550	0.55	0.448	0.896
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	73.91666666666667	8	35.75000000000001	0.218302494092788	0.265759990634356	0.821427234294036	-0.0474574965415681	0.0840934002659389	0.105958122347353	0.471488358976077	0.0814733741280594	0.112068888379834	0.671954436509222	336	0	664	0.664	0.336	0.672
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGA:CCAAAAGGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	73.75	8	35.91666666666667	0.218875353867182	0.264281463445784	0.828190335460601	-0.0454061095786016	0.0832142063262262	0.107761218136802	0.560418201569027	0.13945925586544	0.117251122145413	0.698567270389499	345	0	655	0.655	0.345	0.69
N	all	ss13	171	GGA	AAG	GAT	2	AAAGGATTC:AAAGGCTTC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	72.58333333333333	8	36.41666666666667	0.222971761763702	0.259943938648383	0.857768651668033	-0.0369721768846818	0.085655954052205	0.106675099651754	NaN	NaN	0.119836050881563	0.757684408387655	365	0	635	0.635	0.365	0.73
N	all	ss13	172	TTC	GAT	TCT	2	GGATTCTAC:GGCTTCTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	72.66666666666667	8	36.333333333333336	0.222674045667529	0.260656845281595	0.854280444570591	-0.0379827996140663	0.0862761355592512	0.10533951876663	0.514508811671157	0.0968379122716915	0.119460241403601	0.750520223799489	363	0	637	0.637	0.363	0.726
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	72	9	36.50000000000001	0.225078444337754	0.298979357278323	0.752822691127219	-0.0739009129405697	0.0889301539601694	0.117970447863231	NaN	NaN	0.12554827835496	0.556112551735901	246	0	754	0.754	0.246	0.492
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	72.91666666666667	9	35.50000000000001	0.221785683111784	0.309399206498442	0.716826929266544	-0.0876135233866586	0.0870892321647148	0.121698342176503	0.395891851230698	0.0701929544713406	0.129657510476023	0.49921182148818	234	0	766	0.766	0.234	0.468
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGA:GCAGAAGGG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	73.41666666666667	9	34.50000000000001	0.220030205588677	0.320583011120205	0.686343935755769	-0.100552805531528	0.0866722238276177	0.130819104389605	0.372563191941868	0.0654427515025621	0.131274833062821	0.443693148155704	193	2	805	0.805	0.193	0.386
N	all	ss13	176	GGA	AAG	GAA	2	GAAGGAAGT:GAAGGGAGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	72.41666666666667	9	34.583333333333336	0.223569606352215	0.319619774513248	0.69948615254701	-0.0960501681610333	0.0938979679635749	0.130827443738252	0.3968967659128	0.078003741298065	0.12994650911516	0.459814956020496	203	0	797	0.797	0.203	0.406
N	all	ss13	177	AGC	GAA	GCA	2	GGAAGTCGT:GGGAGCAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	73.16666666666667	9	34.5	0.220904431633438	0.320583011120205	0.689070923819506	-0.0996785794867663	0.0877577614184046	0.125517832698237	0.383737504960325	0.0725449430506759	0.137227616365474	0.467609494986305	182	0	818	0.818	0.182	0.364
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGTCGTGGT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.75	0.25	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	73	9	34.25	0.221491146757304	0.323508417071989	0.684653428068354	-0.102017270314685	0.0912371165385141	0.124432270895903	0.442902241674172	0.122144617495591	0.138156803061129	0.46026135865113	193	0	807	0.807	0.193	0.386
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:CGTGGTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	72	9	33.833333333333336	0.206558984894975	0.328506491880477	0.628782048453791	-0.121947506985502	0.0836716905309126	0.128920192540885	0.423228601499844	0.137363920911925	0.139243333004419	0.381145814753575	159	0	841	0.841	0.159	0.318
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT:GGTGGCAGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	72.33333333333334	9	33.16666666666667	0.205463909729909	0.336838303699426	0.609977866155189	-0.131374393969517	0.0886720168171864	0.135967125091252	0.364430480796019	0.0941730804714979	0.1409735530305	0.351384028473411	157	0	843	0.843	0.157	0.314
N	all	ss13	181	AGC	GCA	GCC	2	GGCAGCCAA:GGCAGTCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	73.00000000000001	9	33.16666666666667	0.203308438049809	0.336838303699426	0.603578737385014	-0.133529865649616	0.0853322430184116	0.131510237138312	0.381087246479228	0.113231619647165	0.134868072543556	0.32213616185497	140	0	860	0.86	0.14	0.28
N	all	ss13	182	CAA	GCC	AAA	2	AGCCAAACC:AGTCAAGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	73.33333333333334	10	32.5	0.202247675211827	0.396050572650373	0.510661236665773	-0.193802897438546	0.0840493498122649	0.164959393389407	0.314337561646699	0.104255662587209	0.166644756376205	0.244841564585337	74	0	926	0.926	0.074	0.148
N	all	ss13	183	ACC	AAA	CCG	2	CAAACCGCC:CAAGCCTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	73.58333333333334	10	32.25	0.201459382298573	0.400106006661284	0.503515015882081	-0.198646624362712	0.0848474483776232	0.156284466610668	0.323550848577383	0.119656731693783	0.177439386048138	0.262919125421914	71	0	929	0.929	0.071	0.142
N	all	ss13	184	GCC	CCG	CCT	2	ACCGCCTCA:GCCTCTTCT	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.25	9	32.25	0.199387175925014	0.349022437266925	0.571273232421237	-0.149635261341911	0.0804157188577388	0.137462003236437	0.379045677722053	0.1317759050082	0.137686790034632	0.277134011174301	110	0	890	0.89	0.11	0.22
N	all	ss13	185	TCA	CCT	CAC	2	GCCTCACGT:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	74.91666666666667	8	32.25	0.197357408027963	0.301197473497683	0.655242574700684	-0.10384006546972	0.0811063348597615	0.137048211175931	NaN	NaN	0.129907472721322	0.424094066400093	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	186	CGT	CAC	GTT	2	TCACGTTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.08333333333334	9	31.583333333333336	0.211120957185982	0.3584630182037	0.5889616123971	-0.147342061017718	0.0873476974630644	0.147896516135176	0.318070822307841	0.0640734896931056	0.148595551441046	0.321410055365191	118	0	882	0.882	0.118	0.236
N	all	ss13	187	TCC	GTT	CCA	2	CGTTCCAGC:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.00000000000001	9	31.666666666666668	0.211388364105741	0.357254585771116	0.591702311250868	-0.145866221665375	0.0845068279501323	0.151711618992139	0.336620273269041	0.0787859977057798	0.152143488428303	0.337689167329893	132	0	868	0.868	0.132	0.264
N	all	ss13	188	AGC	CCA	CAT	2	TCCAGCTCA:TCCTCATCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	14	76.33333333333334	9	31.333333333333336	0.210322806792345	0.362138828792688	0.580779496894954	-0.151816022000343	0.0820361035414093	0.152432550759398	0.30857286550244	0.0598160577413572	0.154593538421713	0.326083381667164	98	0	902	0.902	0.098	0.196
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	AGCTCACGT:TCATCACGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	76.41666666666669	8	31.583333333333336	0.176201863051343	0.309062449462982	0.5701173447551	-0.132860586411639	0.0748497190809962	0.134902968399468	0.423135133902382	0.177862802190077	0.129770852316313	0.305925426238612	124	0	876	0.876	0.124	0.248
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	76.75000000000001	9	31.25	0.191983961880758	0.363381236586463	0.528326568768989	-0.171397274705705	0.0741421058956551	0.162875255895763	0.332443202939792	0.112009930363609	0.160266743147613	0.284866929934763	77	0	923	0.923	0.077	0.154
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC:CGTAGTCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	77.25000000000001	9	31.416666666666668	0.190569155883606	0.360905050411733	0.528031280432897	-0.170335894528126	0.0756475182239422	0.159978945013012	0.301093859810501	0.0794802296494699	0.169553244178572	0.315081810992782	76	0	924	0.924	0.076	0.152
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGTGGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	78.25000000000001	9	30.416666666666668	0.187801514593863	0.376300989048554	0.499072604270066	-0.188499474454691	0.074402503012331	0.16973192204284	NaN	NaN	0.161721030477069	0.24378260770123	57	0	943	0.943	0.057	0.114
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGTGGAAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	79.91666666666669	9	29.416666666666668	0.183364067339478	0.393100353726364	0.466456123993001	-0.209736286386887	0.075807528962187	0.18950308430095	0.271536079305829	0.0858254098628203	0.171484835547845	0.221306939514702	54	0	946	0.946	0.054	0.108
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGAAATTCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	11	81.25000000000003	8	28.416666666666668	0.149307393923679	0.352942733680569	0.423035749643199	-0.203635339756889	0.0623380034720766	0.164658033289785	NaN	NaN	0.171222628824576	0.234321021257763	47	0	953	0.953	0.047	0.094
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCCAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.9166666666667	8	28.083333333333332	0.165236566815432	0.358311508790663	0.461153389610963	-0.193074941975231	0.066598980918089	0.173943323108841	0.403139029338635	0.252662380581908	0.18060403137074801	0.285046635381784	84	0	916	0.916	0.084	0.168
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT:TCCAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.9166666666667	8	27.75	0.162983364284634	0.363849383131527	0.447941845831626	-0.200866018846892	0.0679946158507197	0.171930288672176	0.312096912593031	0.151211532940531	0.173873786173616	0.247992003008036	84	0	916	0.916	0.084	0.168
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.58333333333336	10	27.916666666666668	0.16372754558483	0.487008418426164	0.336190380679535	-0.323280872841334	0.0695164957972829	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACG:AATTCAACT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.58333333333336	10	28.25	0.16600159957496	0.478960726154771	0.34658708013007	-0.312959126579811	0.0703277671892838	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	199	ACG	CAA	CGC	2	TCAACGCCT:TCAACTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.08333333333336	10	28.750000000000004	0.164856699259739	0.467391443964776	0.352716553519459	-0.302534744705037	0.0697306212803382	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	200	CCA	CGC	CAG	2	ACGCCTAGC:ACTCCAGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.83333333333336	10	29.41666666666667	0.181012136858087	0.452833401021308	0.399732299891829	-0.271821264163222	0.0735300590272886	NaN	0.337422911824557	0.236150880176713	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	201	AGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTAGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	82.1666666666667	10	28.75	0.177697372818183	0.467391443964776	0.380189614321597	-0.289694071146593	0.0690351862656448	0.270962592455264	0.278712407066524	0.17253833054924	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	AGCAGTAGC:GGCAGCAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.83333333333336	9	28.75	0.178514576073554	0.405179631729213	0.440581317752067	-0.226665055655659	0.0657845145247198	0.249514249397687	0.347665569318967	0.205063727750783	0.249156648514647	0.36296538924788	66	0	934	0.934	0.066	0.132
N	all	ss13	203	AGC	GCA	GCA	2	AGCAGTAGG:AGTAGCAGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	81.33333333333336	9	28.583333333333336	0.179754639949065	0.408319216831086	0.440230663998914	-0.22856457688202	0.0715533618218981	0.231358205598433	0.330490842150185	0.182843423125584	0.247471256905226	0.35569435285931	82	0	918	0.918	0.082	0.164
N	all	ss13	204	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGT:AGTAGGGGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.33333333333336	10	28.916666666666664	0.182287438823259	0.463662122319204	0.393147143250501	-0.281374683495945	0.0745488918739917	0.269184505812561	0.301466437492832	0.192194103742101	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	205	GGA	GAG	GAA	2	AGAGGTTCA:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.16666666666669	10	29.5	0.182716561993313	0.451079065552835	0.405065488395872	-0.268362503559522	0.0745102726042654	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CAT	2	GGAACTTCT:GGTTCATCA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	13	80.50000000000003	10	29.166666666666668	0.18186033642761	0.45818181174223	0.396917406511813	-0.27632147531462	0.0708605479775585	NA	NA	NA	0.2603017742156	0.288443291046599	52	0	948	0.948	0.052	0.104
N	all	ss13	207	TCA	CAT	CAC	2	ACTTCTCCT:TCATCACCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.83333333333336	10	29.833333333333332	0.167749206172702	0.444199466779624	0.377643871094347	-0.276450260606922	0.0712484575080276	NA	0.285370658475696	0.185720630046948	0.263850579106289	0.294752378580596	48	0	952	0.952	0.048	0.096
N	all	ss13	208	CCA	CAC	CAG	2	TCACCAGCA:TCTCCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	79.6666666666667	10	30.666666666666664	0.16814259291366	0.42790864385071	0.392940398213416	-0.259766050937049	0.0668592065529385	0.245399139325591	0.282905206774495	0.164848802610009	0.222084949842201	0.242133890306066	47	0	953	0.953	0.047	0.094
N	all	ss13	209	GCA	CAG	CAC	2	CCAGCACGA:CCTGCTAGA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.6666666666667	10	30.333333333333332	0.165809675320019	0.434275405344393	0.381807657720166	-0.268465730024375	0.0692316422471625	NA	0.286318518725351	0.182365584373932	0.230706379689153	0.244558409114983	40	0	960	0.96	0.04	0.08
N	all	ss13	210	AGA	CAC	GAA	2	GCACGAAAC:GCTAGAATG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.916666666666667	0.25	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	81.1666666666667	10	29.833333333333332	0.164667422322918	0.444199466779624	0.370706033297903	-0.279532044456706	0.0676930550746608	0.242994381174301	0.273011418097973	0.174514216040436	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	211	AAC	GAA	ACC	2	AGAATGGCT:CGAAACCTG	1:1	TRUE	2.5	0.166666666666667	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	12	80.9166666666667	10	30.166666666666664	0.165236566815432	0.437532385818425	0.377655625437531	-0.272295819002992	0.0687179716067797	0.250072879944833	NA	NA	0.239894088527455	0.256347324498208	56	0	944	0.944	0.056	0.112
N	all	ss13	212	CTG	ACC	CTG	2	AACCTGCAA:ATGGCTGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.58333333333337	10	30.333333333333332	0.135656120387509	0.434275405344393	0.312373481707834	-0.298619284956884	0.0614581777919857	NA	NA	NA	0.230410038927801	0.19496371077194	25	0	975	0.975	0.025	0.05
N	all	ss13	213	CAA	CTG	AAG	2	CTGCAAGCT:GCTGGCAAT	1:1	TRUE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	3	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	9	81.41666666666671	9	30.333333333333332	0.119589757406955	0.377644740963284	0.316672640804978	-0.258054983556329	0.0574223124349398	NA	0.293335113578047	0.280338487457606	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1
N	all	ss13	214	AAT	AAG	ATG	2	CAAGCTGGA:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.16666666666671	9	29.999999999999996	0.0778235325055638	0.383119217824493	0.203131372389716	-0.305295685318929	0.0393060728078845	NA	0.168748659981311	0.2286858241909	0.216145785922514	0.157816727084689	3	0	997	0.997	0.003	0.006
N	all	ss13	215	GGA	ATG	GAG	2	AATGGCGGT:GCTGGAGGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.66666666666671	8	30.166666666666664	0.0646952582133052	0.327242322351052	0.197698322602364	-0.262547064137747	0.0353489869648977	0.181787919757631	0.197256551006178	0.316227896492303	0.193890836498853	0.175705327724418	7	1	992	0.992	0.007	0.014
N	all	ss13	216	GGT	GAG	GTG	2	GGAGGTGAC:GGCGGTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.00000000000004	8	30.833333333333336	0.0652585327422223	0.318423959611188	0.204942281422247	-0.253165426868965	0.035420960547600903	0.189252980956019	NA	NA	0.161181256764639	0.116255194072995	7	0	993	0.993	0.007	0.014
N	all	ss13	217	GAC	GTG	ACA	2	GGTGACACA:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.50000000000004	8	31.33333333333334	0.0656874718445632	0.312120297918684	0.210455623304821	-0.246432826074121	0.0356603543292926	NA	NaN	NaN	0.175330390050879	0.159862543585613	9	0	991	0.991	0.009	0.018
N	all	ss13	218	ACA	ACA	CAG	2	GACACAGCA:GATGCTGCT	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.50000000000004	8	31.33333333333334	0.0656874718445632	0.312120297918684	0.210455623304821	-0.246432826074121	0.0357852198976287	0.169739760139008	0.258444960742727	0.415464485310733	0.15791250330558	0.118626272232258	11	0	989	0.989	0.011	0.022
N	all	ss13	219	GCA	CAG	CAC	2	ACAGCACTT:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.33333333333339	7	30.83333333333334	0.0926285758359223	0.270407565537489	0.342551716893736	-0.177778989701567	0.044569644852906	0.154655852051946	NaN	NaN	0.15846155713552	0.261902361049017	52	0	948	0.948	0.052	0.104
N	all	ss13	220	CTT	CAC	TTG	2	GCACTTGCC:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.66666666666673	7	30.500000000000004	0.0922212833511261	0.273974299787122	0.336605599221467	-0.181753016435996	0.0451504030191729	0.15015760909459	NaN	NaN	0.151580196063592	0.230506497504101	58	0	942	0.942	0.058	0.116
N	all	ss13	221	GCC	TTG	CCC	2	CTTGCCCTT:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.3333333333334	7	30.500000000000004	0.0914173632067776	0.273974299787122	0.333671308870244	-0.182556936580345	0.0443540457085912	0.156960479711229	NaN	NaN	0.155077638276458	0.239116870268344	55	0	945	0.945	0.055	0.11
N	all	ss13	222	CTT	CCC	TGC	2	GCCCTTTTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.66666666666673	7	30.16666666666667	0.0910206427532005	0.277637470472643	0.327839907913904	-0.186616827719443	0.0436004415907779	0.165859144224642	0.350677615332161	0.34985246906131	0.180504359502533	0.301200087249655	61	0	939	0.939	0.061	0.122
N	all	ss13	223	CTG	TGC	TGC	2	CTTTTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.666666666666667	0	0.416666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.3333333333334	6	30.33333333333334	0.0914173632067776	0.229625165344413	0.398115611891499	-0.138207802137635	0.0456698875262292	0.136291353310633	NaN	NaN	0.137223323971444	0.313851031940749	114	0	886	0.886	0.114	0.228
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.5833333333334	6	30.83333333333334	0.0911194993124763	0.22528117443765	0.404470100708282	-0.134161675125174	0.04338682642149	0.13852265626791	NaN	NaN	0.135013260452134	0.320372556182908	107	0	893	0.893	0.107	0.214
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAT:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.75000000000007	6	31.16666666666667	0.0909220007249782	0.222476012792921	0.408682264589162	-0.131554012067943	0.0459341891793209	0.131014631191307	NaN	NaN	0.131391055488425	0.31671067601483	123	1	876	0.876	0.123	0.246
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGATAGG:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666673	6	31.750000000000007	0.0907253574709977	0.217732646143538	0.416682381250206	-0.12700728867254	0.0443048267258803	0.131726126537552	NaN	NaN	0.131432420052599	0.333878324606602	103	0	897	0.897	0.103	0.206
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GATAGGTTA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.416666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.91666666666673	6	32.08333333333334	0.0919181597303021	0.215112484631514	0.427302766214417	-0.123194324901212	0.0444987442550816	0.131845836494296	NaN	NaN	0.128823324818553	0.338918418374871	97	0	903	0.903	0.097	0.194
N	all	ss13	228	TTA	GAT	TAA	2	AGATTGAAC:AGGTTAAAC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.75000000000007	6	32.16666666666667	0.0921200199697398	0.214467334863233	0.429529373452069	-0.122347314893494	0.0454217209550409	0.130104399076364	NaN	NaN	0.131281643651116	0.351364778792658	121	0	879	0.879	0.121	0.242
N	all	ss13	229	AAC	TAA	ACC	2	TTAAACCAG:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	82.00000000000007	6	32.00000000000001	0.0906273548574553	0.215761554338836	0.420034770027345	-0.12513419948138	0.0443999650984297	0.125758723062231	NaN	NaN	0.129533986301387	0.334027304991452	108	0	892	0.892	0.108	0.216
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT:AACCAGTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.5833333333334	6	32.75000000000001	0.0911194993124763	0.210058104799921	0.433782354645478	-0.118938605487445	0.043010889744322	0.119751212942491	NaN	NaN	0.120187527360434	0.322365486013417	117	1	882	0.882	0.117	0.234
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TGG	2	CAGCTTGAG:CAGTTGGAG	1:1	TRUE	2	0.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.25000000000006	6	32.41666666666668	0.0915170849358143	0.212555050951034	0.430557093451037	-0.12103796601522	0.0433153879361549	0.122847549602124	NaN	NaN	0.12410309632425	0.329410606715443	104	0	896	0.896	0.104	0.208
N	all	ss13	232	GAG	TGG	AGA	2	CTTGAGAGC:TTGGAGAGC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.16666666666673	5	32.83333333333334	0.0916170247341314	0.17021844254226	0.538232070308043	-0.0786014178081288	0.0460548143090579	0.113702721195548	NA	NA	0.109587710873864	0.473221923322444	214	1	785	0.785	0.214	0.428
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.91666666666673	5	32.08333333333334	0.0907253574709977	0.174698668260279	0.519324837301154	-0.0839733107892816	0.045246458608965	0.106918421200474	NaN	NaN	0.110662882235502	0.447959685855168	185	1	814	0.814	0.185	0.37
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.25000000000007	5	32.08333333333334	0.0915170849358143	0.174698668260279	0.523856797806067	-0.083181583324465	0.0438200220750005	0.114348574978204	NA	NA	0.10686032634764	0.436324936982533	184	1	815	0.815	0.184	0.368
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCA	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	81.75000000000007	5	31.583333333333343	0.0909220007249782	0.177819473768805	0.511316329971779	-0.0868974730438266	0.0453815131997812	0.112457658655713	NaN	NaN	0.111963220763385	0.437675087213544	186	0	814	0.814	0.186	0.372
N	all	ss13	236	TCA	TGT	CAG	2	ATGTCTGGT:GTTTCAGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.16666666666673	4	31.66666666666668	0.0778235325055638	0.138321779350139	0.562626745196546	-0.0604982468445756	0.0428864224380844	0.100364437218722	NA	NA	0.100096418563774	0.545577925258568	276	0	724	0.724	0.276	0.552
N	all	ss13	237	GGT	CAG	GTA	2	TCAGGTAAG:TCTGGTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.91666666666673	4	31.583333333333343	0.0770731033781903	0.138722674692595	0.555591243817796	-0.0616495713144046	0.0402307646540218	0.100054493688354	NA	NA	0.108675895908808	0.570524531227277	256	0	744	0.744	0.256	0.512
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC:GGTAAGACA	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.91666666666673	4	32.08333333333335	0.0770731033781903	0.136351658368326	0.565252409105235	-0.0592785549901358	0.0425169085784355	0.0970635207050767	NaN	NaN	0.0963602012367133	0.538438003391106	281	0	719	0.719	0.281	0.562
N	all	ss13	239	ACA	AAG	CAC	2	AAAGGCCAA:AAGACACAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.16666666666673	4	31.16666666666668	0.0768261689073373	0.140762624951505	0.545785281666957	-0.0639364560441676	0.0407907405066675	0.0994963541125931	NA	NA	0.105759137900024	0.545479487697245	261	6	733	0.733	0.261	0.522
N	all	ss13	240	CAA	CAC	AAC	2	ACACAACAA:GGCCAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.16666666666673	3	31.833333333333346	0.063462786419742	0.100709711722406	0.630155576203707	-0.037246925302664	0.0398807767308274	0.0812494610325519	NA	NA	0.0938641654207322	0.691502187549723	343	6	651	0.651	0.343	0.686
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.33333333333339	3	32.66666666666668	0.0641416300786215	0.0979651368127981	0.654739350807931	-0.0338235067341766	0.0399837536052176	0.0836475153853277	NA	NA	0.0963584587306021	0.725575208365855	374	4	622	0.622	0.374	0.748
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.83333333333339	3	33.16666666666668	0.0645559565784322	0.0963891381007337	0.669743062864267	-0.0318331815223016	0.0391266401871076	0.0810219380640447	NA	NA	0.0968668642695324	0.742436743821613	381	4	615	0.615	0.381	0.762
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACCA:CAACAAGGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.83333333333339	3	33.16666666666668	0.0662682453670823	0.0963891381007337	0.6875073962984	-0.0301208927336514	0.0400375133068715	0.0794518205461591	NA	NA	0.089802295788339	0.737313266341441	407	6	587	0.587	0.407	0.814
N	all	ss13	244	CCA	AAC	CAC	2	CAACCACAA:CAAGGCCAA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.16666666666671	3	33.16666666666668	0.067766156279967	0.0963891381007337	0.703047642247267	-0.0286229818207667	0.0407612392690937	0.0861338068359973	NA	NA	0.0918726325333328	0.755382015767816	398	1	601	0.601	0.398	0.796
N	all	ss13	245	CAA	CAC	AAA	2	CCACAAGTT:GGCCAAACT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666671	3	33.33333333333334	0.039920730758297	0.0958750286324137	0.416382986557988	-0.0559542978741166	0.0292554135147768	0.0778032476855723	NA	NA	0.0852368980652891	0.511530582580103	248	14	738	0.738	0.248	0.496
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC:CAAGTTGTC	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	2	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000004	3	32.83333333333334	0.0397443976053828	0.0974341006801571	0.407910550084	-0.0576897030747743	0.0314379992067414	0.0819322239963307	NA	NA	0.0868515835517442	0.506541083673019	256	19	725	0.725	0.256	0.512
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT:GTTGTCACA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.66666666666671	1	32.66666666666668	0.0396568140359608	0.031254522300426	1.26883443153506	0.00840229173553479	0.0277630749780051	0.0322364842429513	NA	NA	0.0430959353311458	0.845418663729839	549	48	403	0.403	0.549	0.806
N	all	ss13	248	ACA	TCA	CAA	2	GTCACAAGA:GTCACTAAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.33333333333339	1	33.00000000000001	0.0398323689854613	0.0309322189005369	1.28773073517755	0.00890015008492445	0.0295797699188559	0.0317352959105535	NA	NA	0.043280895894633	0.83707453656853	560	41	399	0.399	0.56	0.798
N	all	ss13	249	AAG	CAA	AGA	2	ACAAGAAAA:ACTAAGAAA	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.583333333333333	1	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.16666666666671	1	32.83333333333334	0.0393963647100293	0.0310925352587596	1.26706826516922	0.00830382945126973	0.0292499499976044	0.029138476390645	NA	NA	0.0438988655269236	0.849968844412983	589	39	372	0.372	0.589	0.744
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT:AGAAAATCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333337	1	32.50000000000001	0.026061253903872	0.0314182062818701	0.829495282768917	-0.00535695237799811	0.0273867863162994	0.0314650055578396	NA	NA	0.0419532009592881	0.898395282298672	348	134	518	0.518	0.348	0.696
N	all	ss13	251	TCA	AAT	CAG	2	AAATCAGCT:AAATCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333337	1	33.00000000000001	0.0262321821040851	0.0309322189005369	0.848053681128895	-0.00470003679645179	0.0264329181674847	0.0314761912451918	NA	NA	0.0421872101234712	0.911291987740335	371	122	507	0.507	0.371	0.742
N	all	ss13	252	GCT	CAG	CTG	2	TCAGCTTCT:TCTGCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333337	1	32.66666666666667	0.0391819232689515	0.0312545223004261	1.25364012581365	0.0079274009685255	0.0296699620826077	0.0299418070516649	NA	NA	0.0445045310891525	0.858624255299759	575	44	381	0.381	0.575	0.762
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG:GCTTCTGAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000004	1	32.50000000000001	0.0385937229566065	0.0314182062818701	1.22838721632804	0.00717551667473641	0.0302569117351334	0.0316154226835889	NA	NA	0.0411211017403846	0.861474739493644	560	34	406	0.406	0.56	0.812
N	all	ss13	254	GAA	CTG	AAG	2	GCTGAGGCT:TCTGAAGCT	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333337	0	32.16666666666668	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0297477556058667	0	NA	NA	0.0291448851123123	0.187320654584604	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	255	GCT	AAG	CTT	2	GAAGCTTCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000004	0	31.750000000000007	0.0382248326940206	0	-Inf	0.0382248326940206	0.0301953943691707	0	NA	NA	0.0275753397237639	0.165686984313205	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CTT	CTA	2	GCTTCTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.6666666666667	0	32.08333333333334	0.0381438129251182	0	-Inf	0.0381438129251182	0.0282583440229439	0	NA	NA	0.0296873478318415	0.198844422804866	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CTA	AGA	2	TCTAAGAAG	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.6666666666667	0	31.083333333333343	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.027524253107047002	0	NA	NA	0.028532425291605	0.186811424640572	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AGA	AGC	2	AAGAAGCCC:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.6666666666667	0	30.083333333333343	0.037197705854529	0	-Inf	0.037197705854529	0.0267438372974069	0	NA	NA	0.0271007886509318	0.169886334709765	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	259	CCC	AGC	CCA	2	AAGCCCAGA:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	0	30.25000000000001	0.0373521168628637	0	-Inf	0.0373521168628637	0.0297662239635357	0	NA	NA	0.0283563928502534	0.187758875962513	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	260	AGA	CCA	GAC	2	CCCAGACAA:CCTCGGCAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	0	30.25000000000001	0.0373521168628637	0	-Inf	0.0373521168628637	0.0272881788260614	0	NA	NA	0.027258432760619	0.170594572885187	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.1666666666667	0	30.50000000000001	0.0374298041973081	0	-Inf	0.0374298041973081	0.0282355871442199	0	NA	NA	0.0286347994224142	0.191163834630824	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGA:CAAAAACGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.6666666666667	0	31.00000000000001	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0287084172947163	0	NA	NA	0.0285532204836128	0.187132585610298	886	114	0	0	0.886	0.001
N	all	ss13	263	CGA	AAC	GAA	2	AAACGAACG:AAACGTACT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000003	0	31.50000000000001	0.0382248326940206	0	-Inf	0.0382248326940206	0.0292129300912497	0	NA	NA	0.0288833657742509	0.18569564353238	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	264	ACG	GAA	CGG	2	CGAACGGCT:CGTACTGCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.9166666666667	0	32.33333333333334	0.0390120440358434	0	-Inf	0.0390120440358434	0.029806081714307	0	NA	NA	0.0289468747913456	0.177751103024812	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CGG	CCA	2	ACGGCTACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333337	0	31.66666666666668	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.027568523294168	0	NA	NA	0.0291334933126208	0.184321153115435	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CCA	CCA	2	GCCACTAAA:GCTACCAAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	0	31.500000000000007	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0262356826320827	0	NA	NA	0.0294814182327212	0.194303759098743	860	140	0	0	0.86	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAG	2	ACCAAGCAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.91666666666671	0	31.500000000000007	0.0380229253413545	0	-Inf	0.0380229253413545	0.028398426199683	0	NA	NA	0.0285565986160202	0.183026683478592	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAG	AGT	2	AAAGCATAC:AAGCAGTAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.58333333333337	0	31.166666666666675	0.0381842798232054	0	-Inf	0.0381842798232054	0.029106172364917	0	NA	NA	0.0288612197246685	0.185825167645456	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAT:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000003	0	31.666666666666675	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.0121498324761644	0	NA	NA	0.0121290825740455	0.303229652382156	661	339	0	0	0.661	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA:TACAATGTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333336	0	31.83333333333334	0.012513324680928	0	-Inf	0.012513324680928	0.0119421513499024	0	NA	NA	0.0130396847128693	0.337239455539666	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA:AATGTCACG	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.91666666666669	0	31.83333333333334	0.0126185941874855	0	-Inf	0.0126185941874855	0.0119644009217108	0	NA	NA	0.0118306293445268	0.286150784890083	662	338	0	0	0.662	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACGCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	0	33.16666666666667	0.012752698321938	0	-Inf	0.012752698321938	0.0125724168001587	0	NA	NA	0.0129827281641577	0.325961010475119	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACGCAAGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.75000000000003	0	32.50000000000001	0.0126451889006809	0	-Inf	0.0126451889006809	0.012585841738108	0	NA	NA	0.0129800307017573	0.329955600482134	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.58333333333336	0	33.00000000000001	0.0126718959543505	0	-Inf	0.0126718959543505	0.0124915189960609	0	NA	NA	0.0127551042610472	0.320477811817666	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333336	0	32.66666666666667	0.012513324680928	0	-Inf	0.012513324680928	0.0123597242952478	0	NA	NA	0.0129028545785858	0.332140925993872	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGTAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.9166666666667	0	31.833333333333332	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.01227067444348	0	NA	NA	0.0118510378194823	0.29302979993543	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGTAGACGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333337	0	32.166666666666664	0.012513324680928	0	-Inf	0.012513324680928	0.012491450094907	0	NA	NA	0.0125500866989004	0.318730157070098	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	278	CGA	GAC	GAG	2	AGACGAGGA:AGACGTGGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.4166666666667	0	32.166666666666664	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0126608636934855	0	NA	NA	0.0125809861908167	0.318909836696037	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	279	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACCC:CGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	1	33	0.0126318775458731	0.0309322189005369	0.408372822735128	-0.0183003413546638	0.012487908218147	0.0322170322303893	NA	NA	0.0329777567356704	0.578942648728342	264	145	591	0.591	0.264	0.528
N	all	ss13	280	CCA	GAC	CAG	2	GGACCCGAA:GGTCCAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	1	32.916666666666664	0.0126185941874855	0.0310121698640216	0.406891689385618	-0.0183935756765361	0.0122472283859096	0.0312904209693705	NA	NA	0.0337319635012236	0.585556663612135	256	144	600	0.6	0.256	0.512
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA:CCCGAACAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	1	32.916666666666664	0.0126185941874855	0.0310121698640216	0.406891689385618	-0.0183935756765361	0.0130980093174744	0.030761896974167	NA	NA	0.0340094231960463	0.588619506610992	260	138	602	0.602	0.26	0.52
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACA:GAACAAACC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333336	1	32.833333333333336	0.0125525942666428	0.0310925352587596	0.403717296199139	-0.0185399409921168	0.01271749439039	0.03376783570629	NA	NA	0.0329691878407207	0.573883400439591	260	137	603	0.603	0.26	0.52
N	all	ss13	283	ACA	AAA	CAC	2	CAAACACAA:CAAACCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666669	2	33.666666666666664	0.0128208250194751	0.0618907677660026	0.207152463642852	-0.0490699427465276	0.0128639277567257	0.0431585196041119	NA	NA	0.0468900941389558	0.295335566776502	112	34	854	0.854	0.112	0.224
N	all	ss13	284	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGGC:ACCCAAGGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.00000000000001	2	34.333333333333336	0.0129313548258795	0.0606390724718212	0.213251197598523	-0.0477077176459417	0.0137841676853797	0.0457255539149196	NA	NA	0.0469999985669747	0.310078250683722	121	42	837	0.837	0.121	0.242
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT:CAAGGCAAC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.83333333333334	2	34.833333333333336	0.0131294381352109	0.0597330472949441	0.219801914179627	-0.0466036091597332	0.0131059607059596	0.0428256118254829	NA	NA	0.0448391951058223	0.298642074623675	110	45	845	0.845	0.11	0.22
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAATTTT:GGCAACTTT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000001	3	35.25	0.0265221005560517	0.0903346148069003	0.293598424178212	-0.0638125142508486	0.0182626816111485	0.0546370903898216	NA	NA	0.0533455280290809	0.231614179424761	68	17	915	0.915	0.068	0.136
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.58333333333334	3	34.75	0.0265808550345806	0.0917171833187057	0.289813250612107	-0.065136328284125	0.0190174199880638	0.0543574660601539	NA	NA	0.0525856949416909	0.215467694076775	61	14	925	0.925	0.061	0.122
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.58333333333334	3	34.25	0.0265808550345806	0.0931427851735378	0.285377498483182	-0.0665619301389572	0.018418340656369	0.0552201675078102	NA	NA	0.0510682379570839	0.19244098415328	60	11	929	0.929	0.06	0.12
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666667	3	34.916666666666664	0.026818499681086	0.091251642986027	0.293896074673336	-0.064433143304941	0.0189819058031495	0.0580809816501678	NA	NA	0.0515955715283484	0.211734025124464	74	12	914	0.914	0.074	0.148
N	all	ss13	290	CAG	ACC	AGG	2	GACCAGGAA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666667	3	34.916666666666664	0.026818499681086	0.091251642986027	0.293896074673336	-0.064433143304941	0.0189595793377884	0.0523207098844591	NA	NA	0.0507846095401413	0.20452904930238	47	17	936	0.936	0.047	0.094
N	all	ss13	291	GAA	AGG	AAC	2	CAGGAACTA:CAGGAATTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	3	33.583333333333336	0.0263473854682498	0.0951140793534504	0.277008258370889	-0.0687666938852006	0.0185890391891786	0.0567511985884747	NA	NA	0.0559183909886231	0.218783686103234	62	12	926	0.926	0.062	0.124
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAATTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000001	3	33.083333333333336	0.0261749574292545	0.0966482688635724	0.27082696603912	-0.070473311434318	0.0186029884846101	0.0582108466748631	NA	NA	0.0542462822606476	0.193897176406725	48	12	940	0.94	0.048	0.096
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:TTAATCAGA	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.75000000000001	3	33.083333333333336	0.0255072404553968	0.0966482688635724	0.263918234183817	-0.0711410284081757	0.0181663709234652	0.0592260213006052	NA	NA	0.0546281269484445	0.192821241214648	57	11	932	0.932	0.057	0.114
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA:ATCAGATTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.41666666666669	3	34.083333333333336	0.0252921753687316	0.0936278982824406	0.270135032748834	-0.068335722913709	0.0175406199387907	0.0585152027017693	NA	NA	0.0505489850735031	0.176416485399511	55	20	925	0.925	0.055	0.11
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA:AGATTAGGT	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.08333333333336	3	33.916666666666664	0.025080706950469	0.0941180977157371	0.266481235375366	-0.069037390765268	0.0182537356706843	0.0573765778967944	NA	NA	0.0539565571217351	0.200721196619441	62	13	925	0.925	0.062	0.124
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT:TTAGGTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.91666666666669	3	34.583333333333336	0.0254531319881873	0.092187504132096	0.276101758343683	-0.0667343721439088	0.0185709869592925	0.0589893081234082	NA	NA	0.0505811917618241	0.187051621927386	54	12	934	0.934	0.054	0.108
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT:GGTACTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000001	3	34.416666666666664	0.025185997239258	0.0926626795339059	0.271803031878031	-0.0674766822946479	0.0175488268684853	0.055255089049893	NA	NA	0.0518960362152243	0.19352281740413	59	15	926	0.926	0.059	0.118
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666669	3	34.25	0.0251332418122965	0.0931427851735378	0.269835626725889	-0.0680095433612414	0.0175299635340567	0.0584170150806434	NA	NA	0.0495652584051205	0.170025701284112	47	18	935	0.935	0.047	0.094
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666669	3	34.25	0.0251332418122965	0.0931427851735378	0.269835626725889	-0.0680095433612414	0.0182788819785095	0.0581682009601156	NA	NA	0.0523733472661168	0.19409753283181	56	23	921	0.921	0.056	0.112
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAAAT:TACAAACAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666669	3	33.916666666666664	0.0248212932013322	0.0941180977157371	0.26372497748838297	-0.0692968045144049	0.0171500614098092	0.0572592346518802	NA	NA	0.051656670217555	0.179762055085243	51	16	933	0.933	0.051	0.102
N	all	ss13	301	AAT	AAA	ATT	2	AAAAATTGG:AAACATTGG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.00000000000001	3	33.833333333333336	0.0247956466956661	0.0943651299007742	0.262762809967399	-0.0695694832051082	0.0180053166765449	0.0589139647758968	NA	NA	0.0524990164227906	0.185118805421881	67	11	922	0.922	0.067	0.134
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	AATTGGCCA:CATTGGCCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	3	34	0.0124226442537559	0.0938723572155045	0.132335488553217	-0.0814497129617486	0.0124468952048155	0.055295618361692	NA	NA	0.0530948913388948	0.125019692770528	0	47	953	0.953	0	0.001
N	all	ss13	303	CCA	GGC	CAC	2	TGGCCACAG:TGGCCGCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000001	3	34	0.0125263872134486	0.0938723572155045	0.133440637744843	-0.0813459700020559	0.0125001373946683	0.0576793597345383	NA	NA	0.0492446262972623	0.0985600232677714	0	36	964	0.964	0	0.001
N	all	ss13	304	CAA	CAC	AAA	2	CCACAGATA:CCGCAAATT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	3	33	0.0123206056064609	0.0969087986100047	0.127136088602681	-0.0845881930035437	0.0122317342813166	0.0598418453369127	NA	NA	0.0538710078400365	0.116368863742826	0	57	943	0.943	0	0.001
N	all	ss13	305	ATA	AAA	TAG	2	CAAATTGCA:CAGATAGCG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666669	3	32.25	0.0125394770467935	0.0993184392369987	0.126255276896481	-0.0867789621902051	0.0123563957368602	0.0602780270862721	NA	NA	0.0542603399740151	0.109752320416795	0	54	946	0.946	0	0.001
N	all	ss13	306	GCA	TAG	CAC	2	ATAGCGCAG:ATTGCACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000001	3	31.583333333333332	0.0125657389590355	0.101563372279023	0.123723136373553	-0.0889976333199871	0.0129472302170755	0.0629754130142824	NA	NA	0.0563066723548668	0.113972341764624	0	46	954	0.954	0	0.001
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT:GCGCAGTTT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000001	3	31.75	0.0124872811774231	0.100992663859693	0.1236454282934	-0.0885053826822697	0.0128394772654236	0.0616846921788493	NA	NA	0.0555861144449704	0.111335040308031	0	61	939	0.939	0	0.001
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAGTTTGCA	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	3	31.583333333333332	0.012461345857946	0.101563372279023	0.122695274667635	-0.0891020264210766	0.0136698294172297	0.0623431559955565	NA	NA	0.056289655537706	0.113439679843561	0	57	943	0.943	0	0.001
N	all	ss13	309	GCA	TTG	CAC	2	TTTGCACCT:TTTGCCCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666669	3	32.083333333333336	0.0125394770467935	0.0998703029515669	0.125557614988659	-0.0873308259047734	0.0126100555040126	0.0588609659378506	NA	NA	0.0548648799653237	0.111442309574244	0	45	955	0.955	0	0.001
N	all	ss13	310	CCC	CAC	CCA	2	GCACCTAGT:GCCCCCAGC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333334	3	32.083333333333336	0.0124355180497881	0.0998703029515669	0.124516674950098	-0.0874347849017788	0.0121342845363869	0.0589533459726815	NA	NA	0.0528799592256061	0.0982377129808894	0	59	941	0.941	0	0.001
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCTAGTGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.41666666666667	3	31.750000000000004	0.0123841823043677	0.100992663859693	0.122624573222198	-0.0886084815553251	0.0124456571525275	0.0607499804960625	NA	NA	0.0574267075980439	0.122834697943826	0	49	951	0.951	0	0.001
N	all	ss13	312	GCT	GCG	CTT	2	AGCGCTTCA:AGTGCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333333	3	31.41666666666667	0.0124355180497881	0.102140577511979	0.121749047760472	-0.089705059462191	0.0123328927930656	0.0616578462895947	NA	NA	0.0555493500666258	0.106338536201359	0	54	946	0.946	0	0.001
N	all	ss13	313	TCA	CTT	CAG	2	GCTTCAGCG:GCTTCAGCT	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82	3	31.16666666666667	0.0122953573317573	0.103018812035868	0.119350602950812	-0.0907234547041109	0.0123627675878459	0.0628087356125332	NA	NA	0.0563551410082554	0.107430099274728	0	52	948	0.948	0	0.001
N	all	ss13	314	GCG	CAG	CGT	2	TCAGCGTTC:TCAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.66666666666667	3	30.500000000000004	0.012048451877855	0.105436462965892	0.114272155371454	-0.093388011088037	0.0121869286613203	0.0624004440965237	NA	NA	0.0579236095742724	0.106905027024894	0	52	948	0.948	0	0.001
N	all	ss13	315	TTC	CGT	TCT	2	GCGTTCTTC:GCTTTCTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.33333333333333	3	30.500000000000004	0.0119524441971095	0.105436462965892	0.113361581571415	-0.0934840187687825	0.0120160560809362	0.0662250645830502	NA	NA	0.0590364253781723	0.113308167052629	0	43	957	0.957	0	0.001
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.99999999999999	3	30.166666666666668	0.0120002560098309	0.106688419438138	0.112479461904383	-0.0946881634283074	0.0120441582110488	0.0648353317551818	NA	NA	0.0605061708119936	0.117598387377799	0	45	955	0.955	0	0.001
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGCATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.16666666666666	3	29.5	0.0119763023840483	0.109283858386045	0.109588941687454	-0.0973075560019969	0.0119547488595659	0.0651517603335944	NA	NA	0.0598468159043108	0.103961622973964	0	56	944	0.944	0	0.001
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG:GGCATGTCC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84	3	29.666666666666664	0.0120002560098308	0.108623210908842	0.110475983074203	-0.0966229548990112	0.0123619784147531	0.0662131319937465	NA	NA	0.062822395097808	0.124040397996105	0	42	958	0.958	0	0.001
N	all	ss13	319	TCC	TGT	CCC	2	ATGTCCCGT:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.58333333333334	3	29.75	0.0120605613963404	0.10829587866142	0.111366762478995	-0.0962353172650798	0.0123206293587291	0.0699039630947631	NA	NA	0.0604637006095087	0.1114698081732	0	55	945	0.945	0	0.001
N	all	ss13	320	CGC	CCC	GCA	2	TCCCGTATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	83.41666666666667	3	29.916666666666664	0.0120848536073488	0.107647107231784	0.112263616906378	-0.0955622536244348	0.0115752347323068	0.0680388754531613	NA	NA	0.0620021144497075	0.123250087778732	0	39	961	0.961	0	0.001
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC:CGTATTGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.08333333333334	3	29.916666666666664	0.0119882672313273	0.107647107231784	0.111366366822235	-0.0956588400004563	0.0124381401217456	0.0654347601763873	NA	NA	0.0595283048368789	0.108065961336801	0	40	960	0.96	0	0.001
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG:ATTGGTATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.75	3	29.416666666666668	0.0118932125500045	0.109617210244414	0.108497675898576	-0.0977239976944093	0.0118451124254674	0.0645592207309837	NA	NA	0.0584210320319041	0.094375792275681	0	39	961	0.961	0	0.001
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA:GGTATGGAA	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.41666666666666	3	29.416666666666668	0.0117996534141747	0.109617210244414	0.107644168172726	-0.0978175568302391	0.011807152017625	0.0643909523180682	NA	NA	0.0618119582803841	0.113534982052185	0	56	944	0.944	0	0.001
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.08333333333333	3	29.416666666666668	0.011846248253617	0.109617210244414	0.108069236821512	-0.0977709619907968	0.0118891962240255	0.0643834533356553	NA	NA	0.0625816299003693	0.118218530042103	0	38	962	0.962	0	0.001
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.08333333333333	3	30.416666666666668	0.0119882672313273	0.105746684778908	0.113367783173458	-0.0937584175475809	0.0124758539806585	0.0633747501539752	NA	NA	0.0579238365743342	0.10552259251098	0	45	955	0.955	0	0.001
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.08333333333333	3	31.083333333333336	0.0119882672313273	0.103314927985559	0.116036157262801	-0.0913266607542312	0.0118663467846714	0.0633768010400063	NA	NA	0.0572148956130989	0.110443194321365	0	54	946	0.946	0	0.001
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTA	2	ACACCTACA:ACACCTTCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.91666666666666	3	30.916666666666668	0.011869683945592	0.103912304538584	0.114227896285224	-0.092042620592992	0.0121308265706379	0.0620578182639862	NA	NA	0.0567332312234822	0.104722910556464	0	38	962	0.962	0	0.001
N	all	ss13	328	ACA	CTA	CAG	2	CCTACAGGG:CCTTCGGGA	1:1	TRUE	1	1	1	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	84.74999999999999	3	31.083333333333336	0.0118932125500045	0.103314927985559	0.115116109374503	-0.091421715435554	0.011461037758901	0.0600997183093946	NA	NA	0.0558799719670115	0.101831792486266	0	44	956	0.956	0	0.001
N	all	ss13	329	GGA	CAG	GAA	2	ACAGGGACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	85.41666666666666	2	31.083333333333336	0.0117996534141747	0.0672719567702241	0.175402262408955	-0.0554723033560494	0.0119207402758558	0.0516867068200469	NA	NA	0.0440745839385448	0.208174584574799	0	120	880	0.88	0	0.001
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACGTGG:GGGACATGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	86.75	2	30.416666666666668	0.0116168827818452	0.0688161477015357	0.168810419790266	-0.0571992649196905	0.0115400685958185	0.0500540253544605	NA	NA	0.042663709280778	0.180017647036708	0	134	866	0.866	0	0.001
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTC:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	87.08333333333334	3	30.083333333333336	0.023325495112671	0.107006075844546	0.217982903574161	-0.0836805807318747	0.0168088616510508	0.069594617578225	NA	NA	0.0550808125636575	0.128703891305843	0	46	954	0.954	0	0.001
N	all	ss13	332	CTC	GGC	TCA	2	TGGCTCACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	86.41666666666669	3	30.416666666666668	0.0235082908022634	0.105746684778908	0.222307591499571	-0.0822383939766448	0.0171801273361965	0.0634326030513663	NA	NA	0.056031169421081	0.142178714755987	0	44	956	0.956	0	0.001
N	all	ss13	333	ACC	TCA	CCT	2	CTCACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.08333333333336	2	29.916666666666668	0.0352660458278048	0.070021663193269107	0.503644789619832	-0.0347556173654643	0.0212547270612289	0.0524717221794064	NA	NA	0.0384301498571184	0.365791754175496	144	47	809	0.809	0.144	0.288
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.41666666666669	2	29.583333333333336	0.0351283718108075	0.0708490996895694	0.495819593540709	-0.035720727878762	0.021356044099526	0.0539125812039581	NA	NA	0.0391576758006121	0.361648712568459	135	43	822	0.822	0.135	0.27
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.66666666666669	2	29.333333333333336	0.0350258197844855	0.0714826348532437	0.489990608997481	-0.0364568150687582	0.0195962863092664	0.0535609433996955	NA	NA	0.0398300435526521	0.360029201974399	136	52	812	0.812	0.136	0.272
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	87.33333333333336	1	30	0.0232576775569202	0.034096780557568	0.682107729134503	-0.0108391030006478	0.0170278167887363	0.0350772781642444	NA	NA	0.0263890278766742	0.681261145242969	297	126	577	0.577	0.297	0.594
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATA:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	87.16666666666669	1	30.333333333333336	0.0233028453553048	0.0337135408966997	0.691201361100161	-0.0104106955413949	0.017263759179707	0.0359537471869857	NA	NA	0.0281233567845338	0.71124860723949	292	138	570	0.57	0.292	0.584
N	all	ss13	338	ATA	CCA	TAA	2	GCCATAAAA:GCCATCAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	88.00000000000003	1	30.166666666666668	0.0230787440000652	0.0339040775760351	0.680707031427344	-0.0108253335759699	0.0157979704445294	0.0359301104979159	NA	NA	0.0280544910776644	0.699594346190758	320	113	567	0.567	0.32	0.64
N	all	ss13	339	AAA	TAA	AAT	2	ATAAAATTG:ATCAAATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	88.6666666666667	1	30.166666666666668	0.0229025428950612	0.0339040775760351	0.67550998382713	-0.0110015346809739	0.0162767125000042	0.0358239783899122	NA	NA	0.0276817616115846	0.69105113791574	307	127	566	0.566	0.307	0.614
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	89.1666666666667	1	29.666666666666668	0.0227721477975885	0.0344888349313675	0.660275936920015	-0.0117166871337791	0.0159928605460774	0.0366442214150616	NA	NA	0.0282936504323168	0.67879345760416	303	125	572	0.572	0.303	0.606
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	89.1666666666667	1	29.666666666666668	0.0227721477975885	0.0344888349313675	0.660275936920015	-0.0117166871337791	0.0160925775144597	0.0386675302169076	NA	NA	0.0277038212887922	0.672348704362756	290	129	581	0.581	0.29	0.58
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	88.6666666666667	1	29.833333333333336	0.0346215313223719	0.0342916870035713	1.00961878366515	3.29844318800537e-4	0.0206297350513615	0.0369025393242715	NA	NA	0.0296643813602642	0.991128341317033	523	50	427	0.427	0.523	0.854
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.33333333333336	1	30.5	0.0351626894241378	0.0335251341884302	1.04884559824589	0.00163755523570758	0.0201490637986512	0.0340853144274459	NA	NA	0.0308263913926949	0.957634814594558	509	43	448	0.448	0.509	0.896
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	86.33333333333336	1	30.833333333333332	0.0355797938036704	0.0331545693783718	1.07314902502944	0.00242522442529867	0.0200706428615644	0.0359715067869594	NA	NA	0.0288328759141802	0.932966458241299	527	35	438	0.438	0.527	0.876
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAC:GATCCAAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.6666666666667	1	30.833333333333332	0.0358634057628696	0.0331545693783718	1.08170325946881	0.00270883638449781	0.0199328412519409	0.0371760495910932	NA	NA	0.0295512308400207	0.926963592953856	523	46	431	0.431	0.523	0.862
N	all	ss13	346	AAC	CAA	ACT	2	CCAAACTTC:CCAAATTTC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.6666666666667	1	30.666666666666664	0.0358634057628696	0.0333388219281254	1.07572504631948	0.00252458383474421	0.0197852509440907	0.0380034200479617	NA	NA	0.0289404645864655	0.930485751921786	565	38	397	0.397	0.565	0.794
N	all	ss13	347	TTC	ACT	TCA	2	AACTTCAAA:AATTTCAAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000004	1	30.5	0.0484527683011411	0.0335251341884302	1.44526694595193	0.0149276341127109	0.0241321240062252	0.0365643261809521	NA	NA	0.0325607597048376	0.646625783274318	693	17	290	0.29	0.693	0.58
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333337	1	30.666666666666664	0.0485508200337835	0.0333388219281254	1.45628481229641	0.0152119981056581	0.0247591131203028	0.0353124096467292	NA	NA	0.0333576050126565	0.648369925401268	669	20	311	0.311	0.669	0.622
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAG:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000003	1	30.833333333333336	0.0490470943757948	0.0331545693783718	1.47934644591676	0.0158925249974231	0.0246407481708803	0.0348376514062111	NA	NA	0.0306698039305928	0.604331641306733	716	16	268	0.268	0.716	0.536
N	all	ss13	350	CAA	ACC	AAG	2	GACCAGGTT:GATCAAGTC	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333337	1	31.333333333333336	0.0497591768358708	0.0326138339548041	1.52570767683513	0.0171453428810667	0.0244859038447891	0.0344094642821148	NA	NA	0.0311011955924932	0.581444484170907	729	10	261	0.261	0.729	0.522
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	CAAGTCATT:CAGGTTATT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.33333333333337	1	31.083333333333336	0.0625362067042883	0.0328819783981324	1.90183832454072	0.0296542283061559	0.0278648932947295	0.037309702855635	NA	NA	0.0346526947709166	0.392133127411427	807	10	183	0.183	0.807	0.366
N	all	ss13	352	ATT	TCA	TTT	2	GTCATTTTG:GTTATTTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.33333333333337	1	30.750000000000004	0.0617632763713647	0.0332464403304228	1.85774103204808	0.0285168360409419	0.0264861165022298	0.036592918183637	NA	NA	0.0341077623239924	0.403109600143544	821	14	165	0.165	0.821	0.33
N	all	ss13	353	TTG	TTT	TGC	2	ATTTTGCTG:ATTTTGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.33333333333337	1	30.083333333333336	0.0610092295904643	0.0340001559761409	1.79438087381942	0.0270090736143234	0.0270864266305554	0.0383379629284372	NA	NA	0.0357426154081475	0.449856279444131	760	5	235	0.235	0.76	0.47
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	TTGCTGAAT:TTGTTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.66666666666671	1	30.083333333333336	0.0607619578200664	0.0340001559761409	1.78710820805367	0.0267618018439255	0.026932532094614	0.035470696461641	NA	NA	0.033303411169647	0.421642236881908	786	3	211	0.211	0.786	0.422
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG:TTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.16666666666671	1	30.750000000000004	0.0596736078092626	0.0332464403304228	1.79488712825166	0.0264271674788398	0.026173265148373	0.0351757267480032	NA	NA	0.0343139825804254	0.441206532543425	785	5	210	0.21	0.785	0.42
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.83333333333337	1	31.41666666666667	0.0599120787357042	0.0325254218363474	1.84200773896657	0.0273866568993568	0.0254596303604171	0.0358262949578568	NA	NA	0.031852709124656	0.389904533582041	786	6	208	0.208	0.786	0.416
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.33333333333337	1	31.91666666666667	0.0602733823260203	0.0320048558445568	1.88325742252238	0.0282685264814635	0.0269217399356056	0.0357491648516807	NA	NA	0.0329954860812005	0.391589031722031	814	6	180	0.18	0.814	0.36
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAT:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.66666666666671	1	31.583333333333336	0.0600320307551523	0.0323500281131817	1.85570258378511	0.0276820026419706	0.0265352411922623	0.0348151086711906	NA	NA	0.0346630207082685	0.424520474952129	807	5	188	0.188	0.807	0.376
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA:ATTGATGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.33333333333339	2	30.583333333333332	0.0595550832033078	0.0684234871721278	0.870389476839868	-0.00886840396882008	0.0266275432384664	0.0525279422363952	NA	NA	0.0548004743919581	0.871439107069645	450	5	545	0.545	0.45	0.9
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC:GATGCTTAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.50000000000006	2	30.416666666666668	0.0594370287406054	0.0688161477015357	0.863707585004485	-0.00937911896093037	0.0257648728493666	0.0537074238392909	NaN	NaN	0.0515852396228319	0.855725651375787	427	2	571	0.571	0.427	0.854
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA:GCTTATAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	88.50000000000006	2	30.083333333333336	0.0835854129054732	0.0696151556756318	1.20067838812191	0.0139702572298414	0.0370436861900631	0.0583538126760792	NaN	NaN	0.0597224006280474	0.815047173577499	582	0	418	0.418	0.582	0.836
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA:TATAAAACA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	88.66666666666671	2	29.916666666666668	0.0834192263326682	0.070021663193269107	1.19133454603071	0.0133975631393991	0.0359528690773881	0.0534544387482031	NaN	NaN	0.0601526146843446	0.823748610787375	599	1	400	0.4	0.599	0.8
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC:AAAACATTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	86.75000000000006	2	30.166666666666668	0.0853712473508477	0.0694136680239339	1.22989102551693	0.0159575793269139	0.0359759213817133	0.0572238561065565	NaN	NaN	0.060026993474893	0.790362392334053	627	0	373	0.373	0.627	0.746
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA:ACATTTCCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	85.91666666666671	2	30.666666666666668	0.0994214479499808	0.068228833654295	1.45717642564043	0.0311926142956858	0.0388985923087448	0.0519486604659197	NA	NA	0.0592849163682113	0.598785683683344	719	0	281	0.281	0.719	0.562
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA:TTTCCACCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	83.58333333333339	2	30.333333333333336	0.102395176203241	0.0690141740401891	1.48368328140264	0.0333810021630517	0.0417920363562264	0.0568223623868132	NA	NA	0.0619610893496066	0.590065323800911	692	0	308	0.308	0.692	0.616
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA:CCACCTACT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	8	82.25000000000006	2	29.666666666666668	0.10417583808692	0.0706404112947758	1.47473430827297	0.0335354267921437	0.0424495383640057	0.0547011930960166	NA	NA	0.0624943571909996	0.591533389332607	732	1	267	0.267	0.732	0.534
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG:CCTACTGAA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	81.58333333333339	3	30.666666666666668	0.133835669008081	0.104821456781369	1.2767964987095	0.0290142122267117	0.05151477752308	0.0692440651420776	NaN	NaN	0.0683581318691076	0.671241895664075	682	0	318	0.318	0.682	0.636
N	all	ss13	368	GAA	CAG	AAC	2	ACAGAGCCT:ACTGAACCT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.41666666666671	3	29.833333333333336	0.135964367940317	0.107970516691131	1.25927310628018	0.0279938512491856	0.0527513882208661	0.0716287110362388	NaN	NaN	0.0703844903750753	0.690831023730549	686	0	314	0.314	0.686	0.628
N	all	ss13	369	CCT	AAC	CTA	2	GAACCTAAA:GAGCCTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	80.16666666666671	3	30.083333333333336	0.136429382099394	0.107006075844546	1.27496855690319	0.0294233062548482	0.0541212358504482	0.071577116729963	NaN	NaN	0.0696705015012009	0.672790832713422	692	1	307	0.307	0.692	0.614
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.83333333333339	3	30.416666666666668	0.138964332467004	0.105746684778908	1.31412471944199	0.0332176476880955	0.0545996741838552	0.0655846678960348	NaN	NaN	0.0685675246529412	0.628065398843595	698	0	302	0.302	0.698	0.604
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.83333333333339	3	29.75	0.138964332467004	0.10829587866142	1.28319132902062	0.0306684538055835	0.056507343195068	0.0691489639892094	NaN	NaN	0.0700270968587636	0.661421631227976	697	0	303	0.303	0.697	0.606
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.83333333333339	3	29.75	0.138964332467004	0.10829587866142	1.28319132902062	0.0306684538055835	0.0521302937230061	0.068723566486117	NaN	NaN	0.0690741832115521	0.657047645072823	665	0	335	0.335	0.665	0.67
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	1000	10	78.16666666666673	3	29.75	0.140267568620875	0.10829587866142	1.29522536180173	0.0319716899594545	0.0551905875097018	0.0703188460320841	NaN	NaN	0.0698996923002888	0.647387977976119	704	0	296	0.296	0.704	0.592
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAG	AGA	AGA	2	AAGAAGAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AGA	AGG	2	AAGAAGGCT	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	GCT	AGG	CTG	2	AAGGCTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	GCTGATGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGTA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGTACAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GTACAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTCTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	CTG	CCT	TAC	2	CCTCTGCCG:GCCTTACCG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	CTGCCGCAG:TTACCGCAG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAACAGCCA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCAACT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCAACTGTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT:ACTGTTACA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACA	TGA	CAC	2	GTGACTCTT:GTTACACTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTG	CAC	TGT	2	ACACTGTTA:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.5	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TGT	TAC	2	CTGTTACCT:CTTCTTCCT	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0.25	1	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TAC	CTG	2	CTTCCTGCT:TTACCTGCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCA	CTG	CAG	2	CCTGCAGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CAG	CAG	2	GCAGCTGAA:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAA	CAG	AAT	2	GCAGATTTG:GCTGAATTG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	AAT	TGG	2	GAATTGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.5	0	0.166666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC:GATGATTTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC:GATTTTTCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTTTCCAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACTT:AAACAATTG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAG:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	CTTCAGGAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC:CAGGATTCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG:GATTCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAAT:TCCATGAGC	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AAT	TGA	ATG	1	ATGAATGGA:ATGAGC---	1:1	TRUE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	ATG	GAG	1	AATGGAGCC:AGC------	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CCT	1	------AGT:GGAGCCTCA	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CA-	0	---AGTGCT:GCCTCA---	1:1	TRUE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.5	0.5	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	---	GTG	CTG	1	AGTGCTGAC:TCA---GAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	--G	ACT	1	---GACTCA:GCTGACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACA:GACTCAACT	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACA	CAA	CAC	2	TCAACACAG:TCAACTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CAC	AGG	2	ACACAGGCC:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY352407.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.16666666666669	3	33.91666666666666	0.0686978768215524	0.0941180977157372	0.729911446245324	-0.0254202208941847	0.0301305168343892	0.0603690435229427	NaN	NaN	0.0699863049753632	0.716442734334401	374	1	625	0.625	0.374	0.748
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.00000000000001	3	34.08333333333333	0.068855661939842	0.0936278982824406	0.735418216183066	-0.0247722363425986	0.0315067490977606	0.0601709759493528	NaN	NaN	0.0690813461517699	0.719897968436611	372	0	628	0.628	0.372	0.744
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.33333333333336	3	34.08333333333333	0.0685408136920715	0.0936278982824406	0.732055455151938	-0.0250870845903692	0.0294064017543213	0.0585673409605766	NaN	NaN	0.0693600740852708	0.717581121184564	360	0	640	0.64	0.36	0.72
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	3	34.41666666666666	0.0694941228620285	0.0926626795339059	0.749968846266745	-0.0231685566718774	0.030467575317323	0.0572053618805873	NaN	NaN	0.0675472137411565	0.731599993128256	390	0	610	0.61	0.39	0.78
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	3	35.41666666666666	0.0704743443137485	0.0898829861073046	0.784067679166938	-0.0194086417935561	0.0310996767964594	0.0537957009651209	NaN	NaN	0.0667485068249288	0.771225186002523	386	0	614	0.614	0.386	0.772
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAACCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.00000000000001	3	35.74999999999999	0.070807263353306	0.088993157850987	0.795648396608961	-0.018185894497681	0.0318621963279798	0.0542774148725698	NaN	NaN	0.0654997743596079	0.781282427446918	419	0	581	0.581	0.419	0.838
N	all	ss13	8	---	AAC	CAA	1	CAA---AAT:CAACCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666667	3	34.916666666666664	0.0706404112947758	0.091251642986027	0.774127555222131	-0.0206112316912512	0.0312701767976564	0.0535866636956779	NaN	NaN	0.0672549884376176	0.759251398117772	377	1	622	0.622	0.377	0.754
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:CCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.16666666666667	3	35.916666666666664	0.0696555937548328	0.0885548256923263	0.78658156921728	-0.0188992319374936	0.0297525675974265	0.0517853058067156	NaN	NaN	0.0627879339451182	0.763413719442459	372	0	628	0.628	0.372	0.744
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.83333333333334	3	36.25	0.0699807987745894	0.0876910035441767	0.798038521013557	-0.0177102047695873	0.0314378239738334	0.0529047303783555	NaN	NaN	0.0645711340918103	0.783873807336275	402	0	598	0.598	0.402	0.804
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.25	3	35.83333333333333	0.0695747645549368	0.0887734500607747	0.783733926160418	-0.0191986855058379	0.0324847750189033	0.0526646221409043	NaN	NaN	0.0646936776187641	0.76664750656982406	411	0	589	0.589	0.411	0.822
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.66666666666667	3	35.666666666666664	0.0691734181620252	0.089213957146024	0.77536542907522	-0.0200405389839988	0.030498911333403	0.0537933723868183	NaN	NaN	0.0642242763758623	0.755010174221249	396	0	604	0.604	0.396	0.792
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75	3	36.33333333333333	0.0553246126797069	0.0874776777943207	0.632442630790763	-0.0321530651146138	0.0280251881755868	0.0532486850857563	NaN	NaN	0.061829395518783	0.603043516073125	299	0	701	0.701	0.299	0.598
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.5	3	36.49999999999999	0.0549444688504895	0.0870541284395655	0.631152937090547	-0.032109659589076	0.027834444109044	0.055026642765162	NaN	NaN	0.063047529039912	0.610546926230713	301	2	697	0.697	0.301	0.602
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.41666666666667	3	36.24999999999999	0.0684625513252421	0.0876910035441767	0.780724915421367	-0.0192284522189346	0.0306839795088535	0.0524697824960227	NaN	NaN	0.063282138944027	0.761240073470104	402	0	598	0.598	0.402	0.804
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.41666666666667	3	36.24999999999999	0.0684625513252421	0.0876910035441767	0.780724915421367	-0.0192284522189346	0.0306896873602427	0.0533752849023068	NaN	NaN	0.0658632037812329	0.770328453643526	373	2	625	0.625	0.373	0.746
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.66666666666669	3	35.416666666666664	0.0815281512006671	0.0898829861073045	0.907047648632154	-0.00835483490663738	0.0318254576649544	0.0550374098674675	NaN	NaN	0.0699399933833059	0.904913156484966	476	1	523	0.523	0.476	0.952
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.33333333333334	3	35.416666666666664	0.0807955355010693	0.0898829861073045	0.898896876930786	-0.00908745060623524	0.032987137934693	0.055549383357727	NaN	NaN	0.0682673126420634	0.894101884672218	487	1	512	0.512	0.487	0.974
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.83333333333334	3	35.416666666666664	0.0813437533100697	0.0898829861073045	0.904996115871801	-0.00853923279723484	0.0324867249902089	0.0547509506238653	NaN	NaN	0.06272342501998	0.891709778226536	495	0	505	0.505	0.495	0.99
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.16666666666667	3	35.58333333333333	0.0820864003916518	0.0894358561096487	0.917824281695404	-0.00734945571799688	0.0328703075526204	0.0532599347989907	NaN	NaN	0.0661410852049586	0.911522887749751	469	0	531	0.531	0.469	0.938
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	3	35	0.0814358477684013	0.0910206427532006	0.894696469999799	-0.00958479498479926	0.0344536156253848	0.0539374544789534	NaN	NaN	0.0666298481747104	0.885617836791973	450	1	549	0.549	0.45	0.9
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.08333333333333	3	35.33333333333333	0.0810687166991056	0.0901082338815474	0.899681563015376	-0.00903951718244178	0.0312770997450558	0.0556764202366704	NaN	NaN	0.065443186406784	0.890139489780813	426	1	573	0.573	0.426	0.852
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATC	2	ACAGATCCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	78.75	2	34.666666666666664	0.0803443058867966	0.0600320307551523	1.3383572882032	0.0203122751316443	0.0328795565362636	0.0471258498570603	NaN	NaN	0.0558313389505915	0.715996206902853	679	0	321	0.321	0.679	0.642
N	all	ss13	24	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.41666666666667	2	35.33333333333333	0.0818063224852469	0.0588537115811214	1.38999428052194	0.0229526109041255	0.0330014138643916	0.0441412625670017	NaN	NaN	0.0570593393454354	0.687493707397497	675	0	325	0.325	0.675	0.65
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	CCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0321145980014578	0.0312948945220804	NA	NA	0.045447754192693	0.249771997371644	881	0	119	0.119	0.881	0.238
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0328872657331913	0.0294145831224221	NaN	NaN	0.0468463993738957	0.267179764843403	873	0	127	0.127	0.873	0.254
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0287236468812939	0.0307278908883462	NA	NA	0.0429986962236568	0.390438843877296	814	5	181	0.181	0.814	0.362
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0258168533259832	0.0310116638694633	NA	NA	0.0403536130292241	0.558363204254409	736	4	260	0.26	0.736	0.52
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0266390610431797	0.031392653935336	NA	NA	0.0403825689379756	0.554272834849639	734	8	258	0.258	0.734	0.516
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0265553855075903	0.0318943824843252	NA	NA	0.0402492733076892	0.575197641920653	720	4	276	0.276	0.72	0.552
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0258747702157065	0.0436362326277908	NA	NA	0.0508266759318247	0.891722195568332	466	1	533	0.533	0.466	0.932
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0267616176697523	0.0436334941841858	NaN	NaN	0.0512028764348728	0.931087758691682	500	1	499	0.499	0.5	0.998
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0231238920835496	0.0450402411061764	NA	NA	0.0501145103753381	0.706240599086147	353	6	641	0.641	0.353	0.706
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0223634616836944	0.0450249392415983	NA	NA	0.0500313153428691	0.689377831422962	356	6	638	0.638	0.356	0.712
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0186178042115381	0.043781059602591	NA	NA	0.0486387898552017	0.492589107693056	236	19	745	0.745	0.236	0.472
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0190312373321265	0.0445529514551112	NA	NA	0.0469508396458243	0.479551210241589	244	11	745	0.745	0.244	0.488
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0187221751936563	0.045672003030142	NA	NA	0.0482049964699064	0.472797685688653	225	18	757	0.757	0.225	0.45
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0179747283316769	0.0438208582778594	NA	NA	0.0468394389445065	0.475831772683095	222	21	757	0.757	0.222	0.444
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.01831504417019	0.0315668808507188	NA	NA	0.0357269466238174	0.938072169456418	465	37	498	0.498	0.465	0.93
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0182690847546636	0.0279697864611789	NA	NA	0.0357747613178736	0.947066090151962	457	39	504	0.504	0.457	0.914
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0189271586046927	0.0293561314818226	NA	NA	0.0348711130308706	0.963095049975902	486	43	471	0.471	0.486	0.942
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0189345010137569	0.0280021348589254	NA	NA	0.0346646557626798	0.971746334187775	470	51	479	0.479	0.47	0.94
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0184564331134692	0.0286301462870719	NA	NA	0.0343269690712064	0.979027857567018	510	37	453	0.453	0.51	0.906
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0188385364845861	0.0297103547124044	NA	NA	0.0349398919993561	0.976445410525244	487	36	477	0.477	0.487	0.954
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.0184510256409037	0.0290908529976445	NA	NA	0.0338858157924398	0.958278156246132	467	61	472	0.472	0.467	0.934
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0181147737854852	0.0444395918697992	NA	NA	0.0486190039639078	0.514558274152126	206	22	772	0.772	0.206	0.412
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0191393935103684	0.0429736866253538	NA	NA	0.0463600082245328	0.486445187252159	243	8	749	0.749	0.243	0.486
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0190095083073637	0.0438876558380921	NA	NA	0.051687949138857	0.53247418033237	238	18	744	0.744	0.238	0.476
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0188587780967766	0.0434362877988291	NA	NA	0.0506316726129576	0.527088605481659	251	13	736	0.736	0.251	0.502
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0192395493773458	0.0445039169764751	NA	NA	0.0483932460692526	0.517483088186465	258	13	729	0.729	0.258	0.516
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0198382965002776	0.0435418065328386	NA	NA	0.0474468195490415	0.509163749194357	239	21	740	0.74	0.239	0.478
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0188206213724323	0.0440114403597551	NA	NA	0.0493769757889452	0.522626652857573	260	22	718	0.718	0.26	0.52
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0189035324458188	0.0441852464323114	NA	NA	0.0505459940191853	0.518808191566648	203	17	780	0.78	0.203	0.406
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0191863934637189	0.0479302480932761	NA	NA	0.0507635517789383	0.498889392585546	225	18	757	0.757	0.225	0.45
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0224968270084584	0.0467828050698425	NA	NA	0.0534335748980208	0.678493662763898	329	4	667	0.667	0.329	0.658
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0223157666362398	0.0492379783374142	NA	NA	0.0598242699547945	0.695435048278427	361	7	632	0.632	0.361	0.722
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0232112567983267	0.0486920837365694	NA	NA	0.0536932992924194	0.669331570484837	340	5	655	0.655	0.34	0.68
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.022220165383061	0.046067240213541	NA	NA	0.0541413245773027	0.671907480788534	351	8	641	0.641	0.351	0.702
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0224816724237769	0.0476888592038257	NA	NA	0.0537236558285159	0.651116275304326	341	4	655	0.655	0.341	0.682
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0217987710844475	0.0460705313815873	NA	NA	0.0544441591394611	0.630199196462795	322	4	674	0.674	0.322	0.644
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0230609932948293	0.0471864451880064	NA	NA	0.0552847118764221	0.662652830987802	314	7	679	0.679	0.314	0.628
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0225554176569156	0.0456118614709585	NA	NA	0.0537865452750856	0.677561033886805	363	5	632	0.632	0.363	0.726
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	32.75	0.0400094855289696	0.0636987401522852	0.628104817039058	-0.0236892546233156	0.0226404570057795	0.0470421840767096	NA	NA	0.0514014510251363	0.64489372049541	330	7	663	0.663	0.33	0.66
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666669	2	32.916666666666664	0.0404592471687861	0.0633621979772033	0.638539199403132	-0.0229029508084172	0.0230555831948615	0.0463419006425436	NA	NA	0.053864852389037	0.670696086430276	340	3	657	0.657	0.34	0.68
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666669	2	33.166666666666664	0.0275576350296145	0.0628640039123036	0.438369071560536	-0.0353063688826892	0.0189323947178658	0.0484249586308954	NA	NA	0.0503068023783252	0.482790818969879	220	18	762	0.762	0.22	0.44
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.91666666666669	2	32.166666666666664	0.0275576350296145	0.0649053422482923	0.424581923074899	-0.0373477072186778	0.0192978486290203	0.0492548166411259	NA	NA	0.0530787041776166	0.481663944195508	237	20	743	0.743	0.237	0.474
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.50000000000001	2	32.166666666666664	0.0137303605832671	0.0649053422482923	0.211544383060831	-0.0511749816650252	0.0139512898349525	0.0491200462471009	NA	NA	0.0490110864345636	0.296415469494622	99	48	853	0.853	0.099	0.198
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.16666666666669	2	32.833333333333336	0.0139864193085547	0.0635300231041221	0.220154481694927	-0.0495436037955674	0.0141933031678275	0.0472739654804098	NA	NA	0.048192954003811	0.303937655543152	122	31	847	0.847	0.122	0.244
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.16666666666669	2	32.833333333333336	0.0139864193085547	0.0635300231041221	0.220154481694927	-0.0495436037955674	0.0137509781759533	0.0452419084887769	NA	NA	0.0491301584129744	0.313255127370919	102	47	851	0.851	0.102	0.204
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.33333333333336	2	32.833333333333336	0.0137618540011474	0.0635300231041221	0.216619691426721	-0.0497681691029747	0.0134503584511448	0.0470201420602541	NA	NA	0.0504962642159792	0.324338663130272	127	48	825	0.825	0.127	0.254
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25000000000003	2	32.916666666666664	0.0137776549513118	0.0633621979772033	0.217442819080688	-0.0495845430258915	0.0136270587713672	0.0503045719585935	NA	NA	0.0514760502900564	0.335419762972165	123	46	831	0.831	0.123	0.246
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25000000000003	2	33.25	0.0282054389472648	0.0626996766264699	0.449849831208815	-0.0344942376792051	0.0197990730071863	0.0460031499557735	NA	NA	0.0514520201733513	0.502592884057651	224	21	755	0.755	0.224	0.448
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25000000000003	2	33.25	0.0282054389472648	0.0626996766264699	0.449849831208815	-0.0344942376792051	0.020405876944524	0.0484012044115028	NA	NA	0.0529149532708306	0.514478125347759	245	23	732	0.732	0.245	0.49
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.9166666666667	2	32.58333333333333	0.0279426962668192	0.0640388786228151	0.436339562274348	-0.0360961823559959	0.0209829734843793	0.0487791763175986	NA	NA	0.0530936328369992	0.496593765508885	217	18	765	0.765	0.217	0.434
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25000000000003	2	33.25	0.0282054389472648	0.0626996766264699	0.449849831208815	-0.0344942376792051	0.0198519670536908	0.0468100174623353	NA	NA	0.0507929944968149	0.497065582421688	267	14	719	0.719	0.267	0.534
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.25000000000003	2	33.25	0.0282054389472648	0.0626996766264699	0.449849831208815	-0.0344942376792051	0.0193557388500165	0.0467409641258761	NA	NA	0.0539684274406995	0.522721531349663	239	17	744	0.744	0.239	0.478
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.9166666666667	2	33.916666666666664	0.0287460335402285	0.0614153696041381	0.468059277759221	-0.0326693360639096	0.0206289461140357	0.0484408056343111	NA	NA	0.0527056444904092	0.53535976572777	263	21	716	0.716	0.263	0.526
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.58333333333337	2	33.916666666666664	0.0284731702204231	0.0614153696041381	0.463616361896885	-0.0329421993837151	0.0196081526347379	0.0454742744594939	NA	NA	0.0525736901202689	0.530927390313255	262	13	725	0.725	0.262	0.524
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.58333333333337	2	33.916666666666664	0.0284731702204231	0.0614153696041381	0.463616361896885	-0.0329421993837151	0.0208063126820033	0.0454289016216927	NA	NA	0.0519285495952806	0.525835797598181	241	12	747	0.747	0.241	0.482
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.83333333333337	2	33.666666666666664	0.0429711784958646	0.0618907677660026	0.69430676087798	-0.018919589270138	0.0247973511520896	0.0452431894894732	NA	NA	0.0571615201893558	0.740656033757234	385	3	612	0.612	0.385	0.77
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.83333333333337	1	33.33333333333333	0.0429711784958646	0.0306164958901914	1.40353026192104	0.0123546826056732	0.0249882291615399	0.033651124781616	NA	NA	0.0406982166739718	0.761456914820831	633	19	348	0.348	0.633	0.696
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.08333333333337	1	33.33333333333333	0.0428178090539073	0.0306164958901914	1.39852088911406	0.0122013131637159	0.0244979878006995	0.0314957559924859	NA	NA	0.0436288000153877	0.779736910739754	633	10	357	0.357	0.633	0.714
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.9166666666667	2	33.99999999999999	0.0435430609699594	0.0612585232607004	0.710808205164388	-0.0177154622907411	0.0247377971407368	0.045518833089519	NA	NA	0.0539981356326356	0.742854620668382	369	6	625	0.625	0.369	0.738
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	2	34.99999999999999	0.0439686325106426	0.0594370287406054	0.739751522616149	-0.0154683962299628	0.0256205444948549	0.045623450702583	NA	NA	0.0501868660517923	0.757917961454458	389	3	608	0.608	0.389	0.778
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	35.166666666666664	0.0445124432883257	0.0591439311842398	0.752612185173565	-0.0146314878959141	0.0247211321497742	0.0446072676305576	NA	NA	0.0503332282770516	0.771286569930328	402	4	594	0.594	0.402	0.804
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.166666666666664	0.0448452368647073	0.0591439311842398	0.758239027517625	-0.0142986943195325	0.0256913920307425	0.0459829322173019	NA	NA	0.0509263199647871	0.778885136091577	416	8	576	0.576	0.416	0.832
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	2	35.5	0.0450698784927921	0.0585663277285774	0.769552748836603	-0.0134964492357853	0.0248248418678357	0.0425093775868799	NA	NA	0.0528738202385239	0.798524075896586	429	5	566	0.566	0.429	0.858
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0256929968832073	0.0428054067601401	NA	NA	0.0529640795699858	0.803848475392007	419	5	576	0.576	0.419	0.838
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666669	2	35.33333333333333	0.0445124432883257	0.0588537115811214	0.756323468690189	-0.0143412682927957	0.0263208114054941	0.0453309044426031	NA	NA	0.0524451409469805	0.784505204582825	377	5	618	0.618	0.377	0.754
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	2	35.166666666666664	0.044076328753575	0.0591439311842398	0.745238401828118	-0.0150676024306648	0.0245083373579412	0.0446843152521047	NA	NA	0.0544140453659631	0.781851907372352	399	8	593	0.593	0.399	0.798
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	35.33333333333333	0.0451830456487547	0.0588537115811214	0.767717862389636	-0.0136706659323667	0.0253004089736234	0.0417668172037621	NA	NA	0.0528927374796281	0.796051784400007	422	8	570	0.57	0.422	0.844
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000003	2	34.666666666666664	0.0449572769752751	0.0600320307551523	0.748888158700455	-0.0150747537798772	0.025906269372584	0.0436864468423515	NA	NA	0.0519818280232614	0.77181588949341	390	6	604	0.604	0.39	0.78
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	34.49999999999999	0.0448452368647073	0.0603340239140544	0.743282711071769	-0.0154887870493471	0.025951779209264	0.0436393892973723	NA	NA	0.0537937080306754	0.773400824585603	389	3	608	0.608	0.389	0.778
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333337	2	34.49999999999999	0.0447337539717067	0.0603340239140544	0.741434949464497	-0.0156002699423477	0.0253378653183824	0.0454237397453559	NA	NA	0.0510453200489252	0.759896985898144	411	12	577	0.577	0.411	0.822
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000004	2	35.24999999999999	0.0444574574471551	0.0589984642956841	0.753535841616937	-0.014541006848529	0.0258874587038232	0.0439783949884112	NA	NA	0.0528869657944114	0.783358493352723	425	6	569	0.569	0.425	0.85
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	35.24999999999999	0.0441303750172001	0.0289192452027623	1.52598640482446	0.0152111298144378	0.0248685141400756	0.0281221028733938	NA	NA	0.0395454309459138	0.700497122785792	648	21	331	0.331	0.648	0.662
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	35.58333333333333	0.0439149815636805	0.0286430990492925	1.53317842765918	0.015271882514388	0.0265336463787249	0.0297437744889238	NA	NA	0.0379531390866843	0.687398601158973	657	13	330	0.33	0.657	0.66
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.91666666666666	0.0438080716173109	0.0283721774047871	1.54405039106795	0.0154358942125237	0.025476501811464	0.0293282760162997	NA	NA	0.0401875369905361	0.700906890256046	667	18	315	0.315	0.667	0.63
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.16666666666671	1	35.24999999999999	0.0433855884614561	0.0289192452027623	1.50023239393925	0.0144663432586939	0.0236573580046473	0.0284440186066261	NA	NA	0.0383043882279729	0.705677212137194	689	17	294	0.294	0.689	0.588
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.24999999999999	0.0438080716173109	0.0289192452027623	1.51484145973237	0.0148888264145486	0.0252633780572837	0.0308248544576764	NA	NA	0.0389242064262033	0.702084480590278	652	13	335	0.335	0.652	0.67
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.24999999999999	0.0438080716173109	0.0289192452027623	1.51484145973237	0.0148888264145486	0.0246841323453465	0.0307248630266944	NA	NA	0.0388923964928404	0.70185248407054	648	11	341	0.341	0.648	0.682
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.24999999999999	0.0438080716173109	0.0289192452027623	1.51484145973237	0.0148888264145486	0.0250450812010334	0.0291280069912654	NA	NA	0.0390695876802874	0.703140318067105	662	15	323	0.323	0.662	0.646
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0435958062133857	0.0283721774047871	1.53656892777041	0.0152236288085986	0.0249883718436298	0.0277828368625012	NA	NA	0.0390634091782645	0.69674669191015	642	10	348	0.348	0.642	0.696
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.33333333333337	2	37.08333333333333	0.0591439311842397	0.0559700169039056	1.05670740256847	0.00317391428033409	0.0289059581356947	0.0408676855917983	NA	NA	0.0420688928295229	0.93986015216844	542	6	452	0.452	0.542	0.904
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	2	37.49999999999999	0.0441845540246642	0.0553246126797069	0.798641904290658	-0.0111400586550427	0.0255534304805023	0.0395229668419267	NA	NA	0.0366634583327108	0.761244939110853	392	22	586	0.586	0.392	0.784
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333337	2	37.99999999999999	0.044076328753575	0.0545695157118212	0.807709729115791	-0.0104931869582462	0.0250079484657202	0.0401668924347891	NA	NA	0.0361526440579041	0.771627483647324	443	11	546	0.546	0.443	0.886
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333337	2	37.33333333333333	0.044076328753575	0.0555809791152914	0.793011016631205	-0.0115046503617164	0.0264815049959858	0.0384609577567362	NA	NA	0.0374025932267423	0.758394600768094	399	14	587	0.587	0.399	0.798
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333337	2	37.33333333333333	0.044076328753575	0.0555809791152914	0.793011016631205	-0.0115046503617164	0.0265269354789521	0.0381631750516652	NA	NA	0.0385261608357559	0.765230633191984	414	18	568	0.568	0.414	0.828
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.00000000000003	2	37.49999999999999	0.0594370287406054	0.0553246126797069	1.07433248714648	0.00411241606089852	0.0312919957949296	0.0405894263352323	NA	NA	0.0427915614550473	0.92343842290382006	547	4	449	0.449	0.547	0.898
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTT:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.33333333333336	2	38.166666666666664	0.0609472230590743	0.0543223783836108	1.12195424560907	0.00662484467546346	0.0313827847906982	0.0394632338747937	NA	NA	0.0410812704729674	0.871887111745355	577	1	422	0.422	0.577	0.844
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTTTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.83333333333336	2	37.166666666666664	0.0604861633757488	0.0558397336460622	1.08321009837077	0.00464642972968653	0.0310335055083131	0.0425034915928268	NA	NA	0.0437668104452941	0.915452775970852	532	3	465	0.465	0.532	0.93
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTTTATTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	36.33333333333333	0.0606390724718212	0.0571705240409132	1.06067022279568	0.00346854843090798	0.0297224672552583	0.0418505695990047	NA	NA	0.0423791299426239	0.934769435710861	560	3	437	0.437	0.56	0.874
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.00000000000004	2	35.99999999999999	0.0603340239140543	0.0577207808520962	1.04527386884551	0.00261324306195808	0.0297350210042593	0.0421774924249655	NA	NA	0.0438250045305005	0.95245108687073	547	5	448	0.448	0.547	0.896
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.50000000000004	2	35.49999999999999	0.0598821656332629	0.0585663277285774	1.02246748184014	0.00131583790468545	0.0302541481856863	0.0423478710957829	NA	NA	0.0422633349028236	0.975162462709148	546	5	449	0.449	0.546	0.898
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACC:CTAGGAACT	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.16666666666671	2	35.83333333333333	0.058423686245627	0.0579999025523778	1.00730662767694	4.23783693249191e-4	0.0295386901751903	0.0431191391685754	NA	NA	0.0442431275221508	0.992357563434074	538	1	461	0.461	0.538	0.922
N	all	ss13	116	ACC	GAA	CCG	2	GGAACCGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666671	2	36.33333333333333	0.0579999025523778	0.0571705240409132	1.01450710003762	8.29378511464612e-4	0.028957503425728	0.0403363085943569	NA	NA	0.0438062591733531	0.98489465228023	544	4	452	0.452	0.544	0.904
N	all	ss13	117	GGC	CCG	GCC	2	ACCGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	2	36.166666666666664	0.0578600049104132	0.0574443341110379	1.00723606263016	4.15670799375385e-4	0.0296230410265395	0.0409437800981613	NA	NA	0.0431838111807297	0.992319987913942	522	5	473	0.473	0.522	0.946
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	2	35.49999999999999	0.0573071018565008	0.0585663277285774	0.978499149239604	-0.0012592258720766	0.0286954836920424	0.0439534219484612	NA	NA	0.0438242635595798	0.977077112865797	531	8	461	0.461	0.531	0.922
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333339	2	34.49999999999999	0.0562324166616757	0.0603340239140544	0.932018337477019	-0.00410160725237869	0.0285602572936837	0.0440518985858539	NA	NA	0.042676020817345	0.923432932089163	467	1	532	0.532	0.467	0.934
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666671	2	34.49999999999999	0.0567646707244322	0.0603340239140544	0.940840127044953	-0.0035693531896222	0.0288760034876576	0.0416219942234231	NA	NA	0.0431857639095707	0.934128925997658	486	3	511	0.511	0.486	0.972
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.83333333333339	2	34.49999999999999	0.0562324166616757	0.0603340239140544	0.932018337477019	-0.00410160725237869	0.0292012113118064	0.0433003908447749	NA	NA	0.0450816872423618	0.927507154794138	502	5	493	0.493	0.502	0.986
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	33.83333333333333	0.0413898116754681	0.0615730216404005	0.672206927202523	-0.0201832099649325	0.023221795129223	0.0441694056435848	NA	NA	0.0399742925951695	0.613625742025346	276	18	706	0.706	0.276	0.552
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	34.49999999999999	0.0413898116754681	0.0603340239140544	0.686011125901825	-0.0189442122385863	0.0232326427052892	0.0443695539179615	NA	NA	0.0398143043375079	0.634206736891735	306	11	683	0.683	0.306	0.612
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	2	35.166666666666664	0.0417741375922484	0.0591439311842398	0.706313171204623	-0.0173697935919914	0.0249524767669397	0.0412156180463772	NA	NA	0.0376082255124925	0.644180603727058	316	10	674	0.674	0.316	0.632
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.83333333333339	2	35.166666666666664	0.0417741375922484	0.0591439311842398	0.706313171204623	-0.0173697935919914	0.0232873964724776	0.0434728254061323	NA	NA	0.0403666686737715	0.666977137707309	329	16	655	0.655	0.329	0.658
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	35.166666666666664	0.0413898116754681	0.0591439311842398	0.699815024918352	-0.0177541195087717	0.0240146043058821	0.0431440520539633	NA	NA	0.0374766692106547	0.63568680529148	292	14	694	0.694	0.292	0.584
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000006	2	34.166666666666664	0.0408264049162627	0.0609472230590743	0.669864890754595	-0.0201208181428116	0.0243232308737797	0.0439532036844093	NA	NA	0.0402769745884671	0.617384007192795	311	20	669	0.669	0.311	0.622
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000006	2	34.166666666666664	0.0408264049162627	0.0609472230590743	0.669864890754595	-0.0201208181428116	0.0241564539118062	0.0445342089537338	NA	NA	0.0415391430751787	0.628114706114098	313	18	669	0.669	0.313	0.626
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000006	2	33.666666666666664	0.0408264049162627	0.0618907677660026	0.659652584544107	-0.0210643628497399	0.0248449436207756	0.0455872623711638	NA	NA	0.0405688456569813	0.60360377917072106	304	13	683	0.683	0.304	0.608
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	33.58333333333333	0.0271830432683088	0.0620508745044359	0.438076715040746	-0.034867831236127	0.018841001823785	0.0456624553616227	NA	NA	0.0385203485458186	0.365370281149165	154	52	794	0.794	0.154	0.308
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.5833333333334	2	33.916666666666664	0.0273067703935705	0.0614153696041381	0.444624376106183	-0.0341085992105676	0.019432911784188302	0.0440712315327788	NA	NA	0.038014149334453	0.369579864510444	128	44	828	0.828	0.128	0.256
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	2	33.916666666666664	0.0271522864979704	0.0614153696041381	0.442108981399681	-0.0342630831061677	0.0203769164755605	0.0468410990133906	NA	NA	0.0377919780740123	0.364606102776114	137	41	822	0.822	0.137	0.274
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	1	33.916666666666664	0.0269691977905829	0.0300792190929219	0.896605650142331	-0.00311002130233904	0.0185253157526268	0.0311025298812026	NA	NA	0.0224457615197326	0.889800086352322	389	118	493	0.493	0.389	0.778
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	1	33.25	0.0270909813104956	0.0306948207819131	0.88259128479613	-0.00360383947141746	0.0200313223916146	0.0310460927074381	NA	NA	0.022786903483145	0.874335466131585	325	139	536	0.536	0.325	0.65
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	1	33.08333333333333	0.0270299523623976	0.0308526791703671	0.876097411610169	-0.00382272680796951	0.0191324108615852	0.0314258766302973	NA	NA	0.0228616719412555	0.867203899396771	369	133	498	0.498	0.369	0.738
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	1	33.41666666666666	0.0271522864979704	0.0305385697640887	0.889114542944304	-0.00338628326611825	0.0194005201009814	0.0301780172267314	NA	NA	0.0228701475574296	0.882290957836668	368	139	493	0.493	0.368	0.736
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666674	1	33.74999999999999	0.0272757331281561	0.0302307926160697	0.902250016218803	-0.00295505948791353	0.0200756513023958	0.0308443743028012	NA	NA	0.0222010601254286	0.894110790460727	401	120	479	0.479	0.401	0.802
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333341	1	33.416666666666664	0.027400307499342	0.0305385697640887	0.897236108665537	-0.00313826226474672	0.0199533159528917	0.0311527052058275	NA	NA	0.0223553906497102	0.888359316400827	347	141	512	0.512	0.347	0.694
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.83333333333341	1	33.916666666666664	0.0275893176123832	0.0300792190929219	0.917221870925347	-0.00248990148053867	0.0195312505688976	0.0307366004649459	NA	NA	0.0215969919297807	0.908215841235314	401	161	438	0.438	0.401	0.802
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.83333333333341	1	33.916666666666664	0.0275893176123832	0.0300792190929219	0.917221870925347	-0.00248990148053867	0.0201557688137583	0.0304341520629441	NA	NA	0.0223431753614982	0.911268222289943	407	124	469	0.469	0.407	0.814
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	TTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000009	1	33.58333333333333	0.0269691977905829	0.0303839016876759	0.887614700304336	-0.00341470389709304	0.0207833058926681	0.0323084903272142	NA	NA	0.0229884133241418	0.881916449620372	369	133	498	0.498	0.369	0.738
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000009	1	34.58333333333333	0.0269691977905829	0.0294878275056261	0.914587478017406	-0.00251862971504324	0.0198374109591873	0.0290031298321076	NA	NA	0.0216583505220128	0.907423437651579	373	139	488	0.488	0.373	0.746
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333341	1	34.74999999999999	0.0270299523623976	0.0293435958691742	0.921153374757076	-0.00231364350677658	0.019199360484103	0.0296164673373246	NA	NA	0.0223097200494903	0.91740296100631	369	133	498	0.498	0.369	0.738
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666674	2	35.24999999999999	0.0410124947055403	0.0589984642956841	0.695145122761109	-0.0179859695901439	0.0251656719442903	0.0423143647013732	NA	NA	0.0285371388747925	0.528520994562944	225	61	714	0.714	0.225	0.45
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.91666666666674	3	35.49999999999999	0.0553884822155735	0.0896588629873371	0.61776917942174	-0.0342703807717636	0.0271116044384087	0.0508268151355551	NA	NA	0.0338655713096324	0.31156032453731	124	23	853	0.853	0.124	0.248
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000009	3	35.99999999999999	0.0571024790858329	0.0883372767422876	0.646414301998711	-0.0312347976564548	0.0292794523064517	0.0519533746700566	NA	NA	0.0320993456742615	0.330520256864093	121	22	857	0.857	0.121	0.242
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666674	3	35.83333333333333	0.0573756358851215	0.0887734500607747	0.646315264821203	-0.0313978141756532	0.0285622417798604	0.0531222503134823	NA	NA	0.0322498226835569	0.330264630819467	142	20	838	0.838	0.142	0.284
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.58333333333341	3	34.83333333333333	0.0564308375631679	0.0914838201648647	0.616839540166478	-0.0350529826016968	0.0288078458119331	0.052577886007321	NA	NA	0.0337425749393036	0.298881277046294	125	9	866	0.866	0.125	0.25
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	3	35.166666666666664	0.0575131971253351	0.09056213746611	0.635068901138267	-0.0330489403407749	0.028540921522705	0.0539621331817199	NA	NA	0.0337287544073583	0.327162796732242	127	14	859	0.859	0.127	0.254
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666674	3	34.5	0.0569668741816511	0.0924244803179611	0.616361314509664	-0.03545760613631	0.0287488207971044	0.0526494414321268	NA	NA	0.0346563481004463	0.306251067191654	111	13	876	0.876	0.111	0.222
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	3	34.66666666666667	0.0571024790858329	0.0919517415692493	0.621004867458967	-0.0348492624834164	0.0288908613388658	0.057376339389288	NA	NA	0.0333703433256597	0.296338117431469	107	17	876	0.876	0.107	0.214
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666673	3	34.333333333333336	0.0573756358851215	0.0929021112845893	0.617592378599032	-0.0355264753994678	0.029615705490007	0.0562814255684233	NA	NA	0.0342649259008786	0.299820910167275	123	15	862	0.862	0.123	0.246
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	3	34.333333333333336	0.0568319121182793	0.0929021112845893	0.611739726174626	-0.03607019916631	0.0290719580189855	0.0524899470773946	NA	NA	0.0322540276091846	0.263432002500781	95	15	890	0.89	0.095	0.19
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.5833333333334	2	34.166666666666664	0.0419201068148284	0.0609472230590743	0.687809956069639	-0.0190271162442459	0.0246286291738098	0.0443452813606927	NA	NA	0.0290299106037329	0.512190011681563	196	37	767	0.767	0.196	0.392
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666674	2	34	0.0420179878270026	0.0612585232607003	0.685912516176483	-0.0192405354336977	0.0243465073564533	0.0445040499018962	NA	NA	0.028893562879381898	0.505468119997505	209	52	739	0.739	0.209	0.418
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000007	2	34	0.0424141271286908	0.0612585232607003	0.692379196739486	-0.0188443961320095	0.0246772860266444	0.0458494018526089	NA	NA	0.030655519965471	0.538743206750942	236	48	716	0.716	0.236	0.472
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	2	34	0.0568319121182793	0.0612585232607003	0.927738853194639	-0.00442661114242109	0.0282940804043526	0.0436587409804176	NA	NA	0.0319906053523268	0.889946249523562	450	14	536	0.536	0.45	0.9
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	2	34	0.0568319121182793	0.0612585232607003	0.927738853194639	-0.00442661114242109	0.0294434518872142	0.0434359668407045	NA	NA	0.0329001383001698	0.892970138796399	473	18	509	0.509	0.473	0.946
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	2	34.666666666666664	0.042766928969766	0.0600320307551523	0.712401836682753	-0.0172651017853863	0.0239453746077027	0.0436228897602271	NA	NA	0.0273160862053206	0.527354935298758	227	46	727	0.727	0.227	0.454
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	2	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0597330472949441	0.71767325327114	-0.0168642369149827	0.0247408181083145	0.0428377212750648	NA	NA	0.0281649411159944	0.549328280247009	211	50	739	0.739	0.211	0.422
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	2	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.0588537115811214	0.730135404232492	-0.0158825330852568	0.0239352367876881	0.0436881036464979	NA	NA	0.0267962201505509	0.553371614908081	255	46	699	0.699	0.255	0.51
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	2	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0582817382454872	0.726886377727389	-0.0159175366445692	0.0237584936628297	0.0420639565928911	NA	NA	0.0273603126920289	0.560718473854149	257	42	701	0.701	0.257	0.514
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	2	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0582817382454872	0.726886377727389	-0.0159175366445692	0.0244016224347432	0.042176733836946	NA	NA	0.0260633241505672	0.541381322171243	262	45	693	0.693	0.262	0.524
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	3	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0874776777943207	0.48657684471707	-0.0449130653499836	0.024533049233873	0.0531164317631536	NA	NA	0.041089876412271	0.274374241346134	102	13	885	0.885	0.102	0.204
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	4	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.119061291806916	0.483635148317748	-0.0614790662849754	0.0279794481922902	0.0610161607857161	NA	NA	0.046213444209468	0.183410029807969	51	7	942	0.942	0.051	0.102
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	4	36	0.0573071018565008	0.120256987556385	0.476538644622471	-0.0629498856998837	0.0296277681405726	0.0638459455240669	NA	NA	0.0464798303485457	0.175625238979552	57	10	933	0.933	0.057	0.114
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	4	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.117889187641809	0.490799928880783	-0.060029182731396	0.0290002036681221	0.0612743957268055	NA	NA	0.0448301230147875	0.18055870570351	59	8	933	0.933	0.059	0.118
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	4	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.115613009870444	0.631852744519384	-0.0425626122816573	0.033189787276802	0.0598684866109245	NaN	NaN	0.0461585899395853	0.356478942409809	163	3	834	0.834	0.163	0.326
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	5	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.145381050470112	0.508673464418307	-0.0714295678667075	0.0323789037195762	0.073143731028836	NA	NA	0.0577622684707449	0.216230818530077	93	0	907	0.907	0.093	0.186
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	5	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.143291427572032	0.519939633944757	-0.068788535172808	0.0332468367203108	0.068841361177260793	NaN	NaN	0.0596693436180537	0.248980678925749	93	1	906	0.906	0.093	0.186
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	5	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.14059721722078	0.540653451027058	-0.0645828465255643	0.0333817226849264	0.0652909185650346	NA	NA	0.0586353804065632	0.270708964957832	92	1	907	0.907	0.092	0.184
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	5	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.13928785934632	0.548517870448065	-0.0628859793584068	0.0342369099689578	0.0651280104902152	NA	NA	0.0550800799923515	0.253570798962547	111	2	887	0.887	0.111	0.222
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	5	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.14059721722078	0.546194053016077	-0.0638038533041804	0.0352277800473881	0.0643702176513917	NaN	NaN	0.0583920874142068	0.274534420055245	108	0	892	0.892	0.108	0.216
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	5	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.144677749593369	0.526071762433919	-0.068566870879812	0.0343959228582714	0.0709920665167801	NaN	NaN	0.0583265363904017	0.239767130010722	93	0	907	0.907	0.093	0.186
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	5	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.149003021096613	0.506939263012635	-0.07346753939524	0.0336863360793526	0.0730995271529133	NaN	NaN	0.0648938245363773	0.257584358333309	85	0	915	0.915	0.085	0.17
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.58333333333337	5	37.083333333333336	0.0766951169694829	0.148632696437812	0.51600434364435	-0.0719375794683286	0.0346417862613887	0.0708993497187528	NaN	NaN	0.0612758884662203	0.240397075496954	90	1	909	0.909	0.09	0.18
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.25000000000003	5	37.083333333333336	0.0759181073184851	0.148632696437812	0.510776626798596	-0.0727145891193265	0.0329106436213618	0.0734477957772022	NaN	NaN	0.0600472922941085	0.22591252225271	78	0	922	0.922	0.078	0.156
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.25000000000003	5	36.583333333333336	0.0759181073184851	0.150882768440169	0.503159559592714	-0.0749646611216843	0.0331135187491439	0.0716613245114762	NaN	NaN	0.0627430179824343	0.232169520201282	91	1	908	0.908	0.091	0.182
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.25000000000003	5	36.083333333333336	0.0770896221786507	0.153202253301895	0.503188566206926	-0.076112631123244	0.0342151578922241	0.0749553907487573	NA	NA	0.0639402461326254	0.233900505293174	82	2	916	0.916	0.082	0.164
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.25000000000003	5	35.75000000000001	0.0770896221786507	0.154788747544192	0.498031177341503	-0.0776991253655415	0.0336684192219962	0.0733329020692496	NA	NA	0.0640460280187006	0.225062410937504	75	3	922	0.922	0.075	0.15
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.9166666666667	5	35.75000000000001	0.0763046324181554	0.154788747544192	0.492959815417916	-0.0784841151260368	0.0351394419279362	0.0762912826795666	NaN	NaN	0.0613071656833516	0.20048236714061	69	0	931	0.931	0.069	0.138
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.58333333333336	5	35.41666666666667	0.0766951169694829	0.156408563919793	0.490351135816403	-0.0797134469503099	0.034160253428605	0.0722849275776801	NaN	NaN	0.0616315095934365	0.195876943118191	97	0	903	0.903	0.097	0.194
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.58333333333336	5	35.41666666666667	0.0766951169694829	0.156408563919793	0.490351135816403	-0.0797134469503099	0.0343049181382693	0.0720049908005221	NaN	NaN	0.0629796306710062	0.205619778091492	71	2	927	0.927	0.071	0.142
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.25000000000001	5	35.41666666666667	0.0759181073184851	0.156408563919793	0.485383315439277	-0.0804904566013077	0.0336336392333369	0.0741825998334852	NA	NA	0.0643277337573496	0.210841128249683	64	1	935	0.935	0.064	0.128
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.91666666666669	5	35.41666666666667	0.0751566968036821	0.156408563919793	0.480515228323578	-0.0812518671161107	0.0338598877734149	0.0774672028817893	NA	NA	0.0618515666854735	0.188960984894513	57	0	943	0.943	0.057	0.114
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.08333333333336	6	34.75000000000001	0.0895472205406727	0.196233824001589	0.456329182781189	-0.106686603460916	0.0351220186959433	0.0898649717899418	0.230164984039548	0.0474101431677285	0.0750262203772535	0.155028889523355	47	0	953	0.953	0.047	0.094
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333336	6	34.50000000000001	0.089213957146024	0.197860943283853	0.450892205734797	-0.108646986137829	0.0358957984155202	0.0925817023612087	NaN	NaN	0.0769547354902995	0.158000091979262	32	1	967	0.967	0.032	0.064
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.33333333333336	6	34.50000000000001	0.089213957146024	0.197860943283853	0.450892205734797	-0.108646986137829	0.0364558005948647	0.0880486455010516	NA	NA	0.0747614778837122	0.146154842790358	42	0	958	0.958	0.042	0.084
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.00000000000003	6	34.50000000000001	0.0883372767422875	0.197860943283853	0.44646141515437	-0.109523666541566	0.037416522708437	0.0915052007322409	NaN	NaN	0.0732748181850929	0.134993481923505	36	1	963	0.963	0.036	0.072
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.00000000000003	6	34.50000000000001	0.0883372767422875	0.197860943283853	0.44646141515437	-0.109523666541566	0.0353706088094935	0.0929859410869663	0.247722860270065	0.0715042464905098	0.0743802594444727	0.140890498099677	35	0	965	0.965	0.035	0.07
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.00000000000003	6	35.16666666666667	0.0883372767422875	0.193580949501978	0.456332490203975	-0.10524367275969	0.0357572197914222	0.0821921675258505	NaN	NaN	0.072705406801188	0.147746942032063	55	1	944	0.944	0.055	0.11
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.00000000000003	6	34.16666666666667	0.0870541284395655	0.200073130342575	0.435111542916868	-0.11301900190301	0.0356785559089657	0.0919725892170889	0.277344715532494	0.116683494747639	0.0768694480751265	0.141488084581025	26	0	974	0.974	0.026	0.052
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGCGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.6666666666667	6	33.16666666666667	0.0849965139802523	0.207018740932176	0.410574006959588	-0.122022226951924	0.0333831980909003	0.0928624111018211	NaN	NaN	0.0775099564313433	0.115423170437036	24	0	976	0.976	0.024	0.048
N	all	ss13	194	AGT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGCGATTCA	1:1	TRUE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.00000000000003	5	32.16666666666667	0.068855661939842	0.174189200634338	0.39529236995803	-0.105333538694495	0.0316340112070152	0.0851732637950211	NA	NA	0.0767300508061705	0.169820508773435	42	1	957	0.957	0.042	0.084
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AGTTCAAGA:GATTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000003	4	31.500000000000004	0.0545695157118212	0.139125907283501	0.392231157929655	-0.0845563915716795	0.0270861891727794	0.0797263037523005	NA	NA	0.0699401256831585	0.226669549054433	84	2	914	0.914	0.084	0.168
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000004	4	31.66666666666667	0.0534747581886498	0.138321779350139	0.386596806662579	-0.0848470211614897	0.0259541748974495	0.0753853662910739	NA	NA	0.0713401053821553	0.234309318261268	61	3	936	0.936	0.061	0.122
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.1666666666667	4	31.83333333333334	0.0537142229868647	0.137526919369799	0.390572429259696	-0.083812696382934	0.0260514203751475	0.0751108974727477	NA	NA	0.0749877423850677	0.26370142867249	81	0	919	0.919	0.081	0.162
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	32.50000000000001	0.054693929928504303	0.134437018317738	0.40683682673798	-0.079743088389234	0.0267201214530873	0.0767358488855034	NA	NA	0.0690115024316846	0.247883969319065	78	1	921	0.921	0.078	0.156
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.16666666666667	0.0544456664773409	0.131483259230803	0.414088202527502	-0.0770375927534622	0.0277887890852473	0.0705005910186526	NaN	NaN	0.0651391345214246	0.236943046983549	80	0	920	0.92	0.08	0.16
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.6666666666667	4	34.333333333333336	0.0548189130040021	0.126615652181289	0.432955263110062	-0.0717967391772869	0.0274211259244812	0.0685519619307708	NA	NA	0.0629214938059988	0.253848001095437	102	3	895	0.895	0.102	0.204
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000004	4	33.666666666666664	0.053834761795598	0.129351945263207	0.416188265944159	-0.0755171834676092	0.0263207268982705	0.0715072909687737	NA	NA	0.0609860175540969	0.215615796442078	70	0	930	0.93	0.07	0.14
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.00000000000004	4	33.666666666666664	0.053834761795598	0.129351945263207	0.416188265944159	-0.0755171834676092	0.0260436597691794	0.0713231957817915	NaN	NaN	0.0615348825217912	0.219737808005617	72	1	927	0.927	0.072	0.144
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000003	4	33.99999999999999	0.0545695157118212	0.127969137773073	0.426427157840114	-0.0733996220612513	0.0279224805092252	0.0731754215022429	NA	NA	0.0670246740661823	0.273466936851533	88	0	912	0.912	0.088	0.176
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.00000000000003	4	34.33333333333333	0.0553246126797069	0.126615652181289	0.436949237527859	-0.0712910395015822	0.0281679204701978	0.0710635423051507	NA	NA	0.065750235601589	0.278244890047258	83	3	914	0.914	0.083	0.166
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAC:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.66666666666669	4	34.999999999999986	0.0555809791152914	0.123992985319038	0.448259060561207	-0.0684120062037464	0.0282269728859684	0.068826969835456	NA	NA	0.0667332871067273	0.305289751611194	118	2	880	0.88	0.118	0.236
N	all	ss13	206	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTCT:GGAACTTCT	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.33333333333336	4	34.33333333333332	0.0550706014161129	0.126615652181289	0.434943077474043	-0.0715450507651762	0.0268062327962748	0.0689078499388006	NA	NA	0.0692981043695753	0.301873367052061	104	2	894	0.894	0.104	0.208
N	all	ss13	207	TCT	ACT	CTC	2	AACTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0245340260125132	0.0727581276275311	NA	NA	0.059661130919394	0.1629082052194	35	4	961	0.961	0.035	0.07
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.9166666666667	4	35.08333333333332	0.0411531794236846	0.123672788927057	0.332758562176172	-0.0825196095033722	0.023558380208815	0.0694533190464464	NA	NA	0.0596807930736562	0.166762130456142	48	10	942	0.942	0.048	0.096
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	4	34.24999999999999	0.0403232602433046	0.126951325912032	0.317627720337839	-0.086628065668727	0.0235444351069908	0.0686487919269375	NA	NA	0.0591037885956194	0.142731681725884	33	5	962	0.962	0.033	0.066
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000004	4	33.41666666666666	0.0398765009105086	0.130408872715656	0.305780581337096	-0.0905323718051471	0.0226836698585126	0.0710787036844478	NA	NA	0.0636026954318536	0.15461888812589	29	9	962	0.962	0.029	0.058
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666671	4	33.749999999999986	0.0400540111089283	0.129003442367267	0.310487924771003	-0.0889494312583385	0.0226677812605172	0.0711631094213766	NA	NA	0.064853167226876507	0.170203233133765	39	8	953	0.953	0.039	0.078
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	4	34.41666666666666	0.0405961546323978	0.126281753068954	0.321472846597488	-0.0856855984365564	0.0235223027013766	0.0681312936116122	NA	NA	0.0636872958123703	0.178492493781706	37	9	954	0.954	0.037	0.074
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	4	34.58333333333332	0.0403232602433046	0.125619222573624	0.320995938497163	-0.0852959623303199	0.0235794350963943	0.0737236524058541	NA	NA	0.0602264550332712	0.156701128851552	37	3	960	0.96	0.037	0.074
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000006	3	33.91666666666666	0.0401433603117784	0.0941180977157372	0.426521161031352	-0.0539747374039588	0.0229727925289243	0.0603110592175406	NA	NA	0.049776106999117	0.278209503419141	88	9	903	0.903	0.088	0.176
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333339	2	34.249999999999986	0.0267586909940917	0.0607927570603562	0.440162484611862	-0.0340340660662645	0.0185394425576436	0.0481567124096326	NA	NA	0.0408084616979203	0.404283621166841	151	49	800	0.8	0.151	0.302
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.0184848635733585	0.0465938155618262	NA	NA	0.0422948577132101	0.451040305167475	171	40	789	0.789	0.171	0.342
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0195345446208429	0.0454220670785604	NA	NA	0.0392204980524203	0.42149499093512	198	47	755	0.755	0.198	0.396
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	2	35.16666666666666	0.013423177093157	0.0591439311842398	0.226957809945747	-0.0457207540910828	0.0129964840505711	0.0454880699307255	NA	NA	0.0380135013826187	0.229072922953743	0	124	876	0.876	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.8333333333334	1	34.83333333333332	0.0406419966354019	0.0292720079293014	1.38842530835471	0.0113699887061005	0.0305879139111377	0.0305688318964912	NA	NA	0.0323708840254647	0.725407390668662	553	139	308	0.308	0.553	0.616
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000007	1	34.16666666666666	0.0402781342288957	0.0298546878003148	1.34913935453953	0.010423446428581	0.0305210948704165	0.0311061273292275	NA	NA	0.0330960084993709	0.752802862496494	537	133	330	0.33	0.537	0.66
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0299056676121187	0.032206106266749	NA	NA	0.0347103173938153	0.777058726433726	525	134	341	0.341	0.525	0.682
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	1	33.83333333333332	0.0397443976053827	0.0301548153585304	1.31801163869967	0.00958958224685231	0.0294280957585713	0.0321756442926151	NA	NA	0.0339516108949279	0.777599615254795	505	120	375	0.375	0.505	0.75
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666674	1	34.16666666666665	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0301282869285341	0.0321989014611228	NA	NA	0.0343339942555474	0.769384514299978	533	130	337	0.337	0.533	0.674
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	34.66666666666665	0.0396131668795607	0.029415534864961	1.34667504981345	0.0101976320145997	0.0298883157526812	0.0313077891736474	NA	NA	0.0326497449996286	0.754786550615222	526	129	345	0.345	0.526	0.69
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	34.999999999999986	0.0395261602343306	0.0291298749871979	1.35689426239219	0.0103962852471327	0.0300789688298051	0.0320592955485633	NA	NA	0.0323308211088161	0.747786369365982	541	134	325	0.325	0.541	0.65
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.249999999999986	0.0392674190316604	0.0289192452027623	1.35783001099592	0.0103481738288981	0.028645128743346	0.0309938117753073	NA	NA	0.0321846242712567	0.747812275412855	548	120	332	0.332	0.548	0.664
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.58333333333332	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0297797070693893	0.0317558882276403	NA	NA	0.032929807779064	0.735020847374737	547	125	328	0.328	0.547	0.656
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.66666666666665	0.0397883346582442	0.0285748846742028	1.39242328050985	0.0112134499840414	0.0315324244345891	0.0289891140638096	NA	NA	0.0307049372679458	0.714961950711182	543	136	321	0.321	0.543	0.642
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333341	1	36.33333333333332	0.0394395350433882	0.0280406490537152	1.40651291515532	0.0113988859896729	0.0300898076646352	0.0300071184645288	NA	NA	0.0321823639693665	0.723191502748698	548	121	331	0.331	0.548	0.662
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	37.33333333333332	0.0397883346582442	0.0272757331281561	1.45874482901329	0.0125126015300881	0.0289020047700524	0.0283658712164472	NA	NA	0.0334354863026575	0.708232327469765	526	129	345	0.345	0.526	0.69
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000007	1	37.33333333333332	0.0401433603117784	0.0272757331281561	1.47176100173598	0.0128676271836223	0.030591568605162	0.0277185383617364	NA	NA	0.0306978357375126	0.6750915292891	553	122	325	0.325	0.553	0.65
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	37.16666666666665	0.0397005575048303	0.027400307499342	1.44890919584693	0.0123002500054883	0.0307252388433415	0.0283585332263848	NA	NA	0.0305377443836592	0.687103876032039	560	127	313	0.313	0.56	0.626
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333341	1	36.16666666666665	0.0391819232689515	0.0281723261817365	1.39079474716406	0.0110095970872151	0.0285517413821899	0.0287412873418615	NA	NA	0.0318066309071195	0.729236325481558	555	114	331	0.331	0.555	0.662
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0293866895449147	0.0308475860162037	NA	NA	0.031344885822089	0.717185501257982	550	118	332	0.332	0.55	0.664
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0297131663127964	0.0298366688899165	NA	NA	0.0331969290209064	0.732339912779567	545	124	331	0.331	0.545	0.662
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000009	0	36.33333333333332	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0263693313264756	0	NA	NA	0.0261148067611824	0.31301971304466	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333341	0	35.91666666666665	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0268671515675534	0	NA	NA	0.0275128728354016	0.345086620555371	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.91666666666665	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0251660748738303	0	NA	NA	0.0244869020680396	0.291886592648618	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	35.58333333333332	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0260039896466587	0	NA	NA	0.0264037239652804	0.326248216331215	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	36.249999999999986	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0255519943269993	0	NA	NA	0.0261504575970417	0.321584705938521	609	391	0	0	0.609	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	36.41666666666666	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0258756015246584	0	NA	NA	0.0265605136094669	0.328066127376735	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	0	36.83333333333332	0.0395261602343306	0	-Inf	0.0395261602343306	0.0304740804475004	0	NA	NA	0.0297148491898789	0.183458283268629	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	37.16666666666666	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.031079711863519	0	NA	NA	0.0312191475575036	0.191466088703335	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.16666666666666	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0308401714111126	0	NA	NA	0.0308443007825829	0.176124331871767	884	116	0	0	0.884	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.33333333333332	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0317026355819768	0	NA	NA	0.0311375489332696	0.18023081855122	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666673	0	36.33333333333332	0.0411531794236845	0	-Inf	0.0411531794236845	0.030225995254645	0	NA	NA	0.031427657892483	0.19037945640306	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.0833333333334	0	36.16666666666666	0.0410592825874941	0	-Inf	0.0410592825874941	0.0319476796022615	0	NA	NA	0.0305638172986967	0.179144070669295	886	114	0	0	0.886	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.83333333333332	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0305425314582909	0	NA	NA	0.0307694038607052	0.184060027854868	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	0	35.49999999999999	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.0294393709874121	0	NA	NA	0.0311592983011372	0.195630745101539	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	0	34.666666666666664	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0293776254072333	0	NA	NA	0.0318055542854633	0.20588166382425	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333339	0	35.166666666666664	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0305466826556595	0	NA	NA	0.0315367492945661	0.199013350212805	859	141	0	0	0.859	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333339	0	34.83333333333333	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.0302829885410156	0	NA	NA	0.0310792232187908	0.198474754905732	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000006	0	34.166666666666664	0.0390967990762099	0	-Inf	0.0390967990762099	0.0300792166893193	0	NA	NA	0.0281491749625005	0.164858731228899	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	0	33.833333333333336	0.0389276557511924	0	-Inf	0.0389276557511924	0.0290485684971099	0	NA	NA	0.029784926533454	0.191226887840424	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666673	0	33.50000000000001	0.038759969965707	0	-Inf	0.038759969965707	0.0291589070449082	0	NA	NA	0.0292018419173951	0.184405328724155	890	110	0	0	0.89	0.001
N	all	ss13	256	TCC	CAT	CCA	2	GCATCCAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	0	33.833333333333336	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0290822192384984	0	NA	NA	0.0292497633608007	0.186071622126215	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333339	0	33.333333333333336	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0300738367505907	0	NA	NA	0.0278678241602827	0.167903972767518	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333339	0	32.083333333333336	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0283257684095732	0	NA	NA	0.0284859801479871	0.184250500124218	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0291458303917823	0	NA	NA	0.0289696878726927	0.18981649654798	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0294009884682916	0	NA	NA	0.0281897318823831	0.177851955873364	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000004	0	32.66666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.027931083636277	0	NA	NA	0.028348968936719902	0.178920812943329	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000004	0	32.66666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.0279850277961878	0	NA	NA	0.0301895042056911	0.206897807672488	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333337	0	33.16666666666667	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0290226550974238	0	NA	NA	0.0281802828121027	0.169916343573998	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333337	0	34.16666666666667	0.0391819232689515	0	-Inf	0.0391819232689515	0.0289574944889802	0	NA	NA	0.0305730596705455	0.199988855049079	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000004	0	33.50000000000001	0.0388436318463037	0	-Inf	0.0388436318463037	0.0297029672924321	0	NA	NA	0.0291408285612506	0.182544108583433	850	150	0	0	0.85	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.4166666666667	0	33.00000000000001	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0299527112254982	0	NA	NA	0.0292036470342928	0.1900951421049	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.08333333333337	0	32.833333333333336	0.0379427585051849	0	-Inf	0.0379427585051849	0.0270532446319904	0	NA	NA	0.0295633399666904	0.199338139855245	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.1666666666667	0	33.083333333333336	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0293019894338335	0	NA	NA	0.0293572348227968	0.191004518485045	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.25	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0121827978510562	0	NA	NA	0.0128095007235584	0.329133460160053	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	0	33.416666666666664	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0122275127786064	0	NA	NA	0.0123356527895163	0.309885630005404	600	400	0	0	0.6	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	0	33.083333333333336	0.0125789112103712	0	-Inf	0.0125789112103712	0.0125990074575531	0	NA	NA	0.0120845512745557	0.297918052120665	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333336	0	33.916666666666664	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0121045134743251	0	NA	NA	0.0119463600346907	0.290336844712849	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	0	33.25	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0122388142054203	0	NA	NA	0.0124881130695092	0.315829574722769	599	401	0	0	0.599	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333336	0	33.75	0.0125525942666428	0	-Inf	0.0125525942666428	0.0126139520500088	0	NA	NA	0.0122713335242563	0.306345603870717	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	33.416666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.012416540928234	0	NA	NA	0.0121107637107898	0.306008688384088	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	32.916666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0123489805626063	0	NA	NA	0.0122696326764339	0.312313851645933	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGGCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	33.25	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0119647444658848	0	NA	NA	0.0125211116086804	0.320128252821208	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT:AGGCGTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	32.99999999999999	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0126828571749452	0	NA	NA	0.0121419483387138	0.305249669564465	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.33333333333333	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0125309438893637	0	NA	NA	0.0131088710034858	0.340298904388989	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.33333333333333	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0118695454204862	0	NA	NA	0.0126623858957433	0.323545298257803	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333337	0	32.666666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0120455159004002	0	NA	NA	0.0117282797090631	0.29050439588721	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.83333333333333	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0119820378987725	0	NA	NA	0.0118500621691418	0.296487356533256	668	332	0	0	0.668	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	0	33.49999999999999	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0129258868188162	0	NA	NA	0.013247891372879	0.334194376948955	611	389	0	0	0.611	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666669	0	33.166666666666664	0.0129035440872231	0	-Inf	0.0129035440872231	0.0121188910561775	0	NA	NA	0.0131170266606048	0.325250855406202	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000001	0	33.166666666666664	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0125644987391382	0	NA	NA	0.0128160338541307	0.309836742514671	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	33.49999999999999	0.0262608883838265	0.0304610393656427	0.862113996459571	-0.00420015098181616	0.0191415207579175	0.0321587926567553	NA	NA	0.0223049497227363	0.850636953694921	341	135	524	0.524	0.341	0.682
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000001	1	33.33333333333333	0.026434454296256	0.0306164958901914	0.863405609546743	-0.00418204159393534	0.0188953776568788	0.0325116330844926	NA	NA	0.0230493931570858	0.856023596695095	344	131	525	0.525	0.344	0.688
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333336	1	33	0.0264928206228062	0.0309322189005369	0.856479798878779	-0.00443939827773067	0.0174583528644807	0.0316973528800301	NA	NA	0.0225791446150718	0.844128839780057	354	126	520	0.52	0.354	0.708
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333336	1	33.5	0.0266694765273651	0.0304610393656427	0.875527463368367	-0.00379156283827758	0.0193191276645609	0.0325235214999582	NA	NA	0.0224970676067866	0.866161727875026	346	137	517	0.517	0.346	0.692
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.58333333333336	1	33.25	0.0265808550345806	0.0306948207819131	0.865971989979606	-0.00411396574733245	0.0188485976059592	0.0315551052215065	NA	NA	0.0231895417097116	0.859189430034538	367	119	514	0.514	0.367	0.734
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000003	1	32.08333333333333	0.0261749574292545	0.0318350176854428	0.822206467352569	-0.00566006025618833	0.0191159850799644	0.0334358603826924	NA	NA	0.024092700609257	0.814264285388415	346	128	526	0.526	0.346	0.692
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.1666666666667	1	31.666666666666664	0.0129035440872231	0.0322630388127681	0.399948193414333	-0.019359494725545	0.0132548788764847	0.0345934801988173	NA	NA	0.02105374667189	0.357819835654684	0	334	666	0.666	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	1	31.333333333333332	0.0125263872134486	0.0326138339548042	0.384082019636437	-0.0200874467413556	0.012666127108811	0.0366684388153213	NA	NA	0.0208711709889765	0.335823891155844	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.1666666666667	1	32.33333333333333	0.0124226442537559	0.0315836140125951	0.393325610197805	-0.0191609697588392	0.0130288477144221	0.0348702940899887	NA	NA	0.0209600548332199	0.360629619845732	0	344	656	0.656	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	1	32.166666666666664	0.0123206056064609	0.0317507728699206	0.388041124445604	-0.0194301672634596	0.0123549022947672	0.0322395060690212	NA	NA	0.020226834331591	0.336746609319361	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000001	1	32.83333333333333	0.0125263872134486	0.0310925352587596	0.402874423368856	-0.018566148045311	0.0123652478455149	0.0319846691460375	NA	NA	0.0203329245295232	0.361185950323265	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000001	1	32.5	0.0377438129156367	0.0314182062818701	1.2013357025228	0.0063256066337666304	0.028570537182448	0.0321895033374383	NA	NA	0.0342584964741139	0.853508711632013	524	132	344	0.344	0.524	0.688
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	1	32.33333333333333	0.0376648177342698	0.0315836140125951	1.19254299774717	0.00608120372167471	0.0271610472613154	0.0323755822693139	NA	NA	0.0316109950302783	0.847447518500906	469	145	386	0.386	0.469	0.772
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	1	32.33333333333333	0.0376648177342698	0.0315836140125951	1.19254299774717	0.00608120372167471	0.0275191551145899	0.0327445205205219	NA	NA	0.0320563118130573	0.849541253751415	520	128	352	0.352	0.52	0.704
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.66666666666669	1	31.999999999999996	0.037197705854529	0.0319197108140969	1.165352219861	0.00527799504043212	0.0274761126466973	0.0325391523615106	NA	NA	0.0308237230879078	0.864041670948227	497	126	377	0.377	0.497	0.754
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.91666666666669	2	31.749999999999996	0.0498625949111442	0.0657955896932053	0.757840991222144	-0.0159329947820611	0.0305113489154584	0.0507069478182311	NA	NA	0.0415064791296207	0.701076541226879	341	47	612	0.612	0.341	0.682
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666669	2	32.08333333333333	0.0504922483436096	0.0650814580158656	0.775831548385111	-0.014589209672256	0.0316007070664025	0.0460213519553425	NA	NA	0.0385974699570171	0.705442795818792	329	33	638	0.638	0.329	0.658
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	32.416666666666664	0.0511380136321413	0.0643826713791054	0.7942822585137	-0.0132446577469642	0.0338017331681099	0.0479730315768479	NA	NA	0.0388277017310637	0.733018051066217	352	53	595	0.595	0.352	0.704
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	31.416666666666664	0.0507056829412418	0.0665255778124882	0.762198309410599	-0.0158198948712465	0.0318825306186837	0.0482370269125521	NA	NA	0.0430103939533564	0.713010718546125	346	44	610	0.61	0.346	0.692
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.41666666666669	2	30.416666666666664	0.051467132797986	0.0688161477015357	0.747893256408443	-0.0173490149035498	0.0325332017538906	0.0534809249464592	NA	NA	0.04281717281466	0.685339148468645	344	50	606	0.606	0.344	0.688
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.25000000000003	2	29.749999999999996	0.0515777829948789	0.0704329495874262	0.732296223528975	-0.0188551665925473	0.0304615873691676	0.0504728753228639	NA	NA	0.0456396069513049	0.679510154391996	320	42	638	0.638	0.32	0.64
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000003	2	30.166666666666664	0.0514119856124207	0.0694136680239339	0.740660839226849	-0.0180016824115131	0.0327385233353891	0.0505579020238386	NA	NA	0.0431001857929598	0.676187937482573	320	41	639	0.639	0.32	0.64
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666669	2	30.499999999999996	0.0516332867726302	0.0686192553184994	0.752460610844171	-0.0169859685458692	0.0305655137799987	0.0511807367920438	NA	NA	0.0415352239815836	0.682573904072221	307	45	648	0.648	0.307	0.614
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.66666666666669	2	31	0.0519688353535439	0.0674611774972046	0.770351738311969	-0.0154923421436608	0.0321035307117636	0.0493070087305385	NA	NA	0.0411750301263372	0.706726767234266	336	32	632	0.632	0.336	0.672
N	all	ss13	310	CCC	CCC	CCA	2	GCCCCCAGC:GCTCCGAGT	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	31	0.0515223984646761	0.0674611774972046	0.763734052326778	-0.0159387790325285	0.0314382691633813	0.0501509962689721	NA	NA	0.0426849774420193	0.708847125356155	332	39	629	0.629	0.332	0.664
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCGAGTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.75	0.0513569565272317	0.0680352852661241	0.754857664318535	-0.0166783287388925	0.0314217751326624	0.0508757152124399	NA	NA	0.0400863837890437	0.677366319773419	330	41	629	0.629	0.33	0.66
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.083333333333332	0.0513569565272317	0.0696151556756318	0.737726663523195	-0.0182581991484001	0.0316509998170297	0.0504457345875723	NA	NA	0.0429592906794695	0.670828179828823	308	49	643	0.643	0.308	0.616
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	30.083333333333332	0.0509209303034166	0.0696151556756318	0.731463282804107	-0.0186942253722152	0.0313256393448483	0.0519874761139962	NA	NA	0.043568371414413803	0.667866533724065	310	45	645	0.645	0.31	0.62
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.050280603697972	0.0721276112438599	0.697106182096836	-0.0218470075458879	0.0297737782837017	0.0544999857374592	NA	NA	0.0441640854091334	0.620827335808771	292	38	670	0.67	0.292	0.584
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	28.75	0.0496561870198999	0.073005919868405	0.680166582510109	-0.0233497328485051	0.0307587280921032	0.0542295133488178	NA	NA	0.0450411971306774	0.604173387543169	283	38	679	0.679	0.283	0.566
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.050280603697972	0.0721276112438599	0.697106182096836	-0.0218470075458879	0.0305040560095298	0.0526096436256664	NA	NA	0.0446225841220763	0.624420301594191	275	46	679	0.679	0.275	0.55
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.416666666666668	0.0501754455827152	0.0739059002893285	0.678909875751289	-0.0237304547066133	0.031071697927839	0.054016099598498	NA	NA	0.0459048922035083	0.605192268986958	268	55	677	0.677	0.268	0.536
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.75	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0299062222405197	0.056060078628279	NA	NA	0.0478324823994533	0.5865260444363	243	47	710	0.71	0.243	0.486
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0319027556630327	0.0557644026815394	NA	NA	0.0473731032822246	0.594359415711094	268	42	690	0.69	0.268	0.536
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0501754455827152	0.0748283653087125	0.670540447806269	-0.0246529197259974	0.0305865792733841	0.0541800384734015	NA	NA	0.0457505354838294	0.58998668448843	288	42	670	0.67	0.288	0.576
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.031365895106042	0.0523241451049843	NA	NA	0.0435570783644271	0.582586102671762	248	40	712	0.712	0.248	0.496
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0495536228075988	0.075298294736773	0.658097543653914	-0.0257446719291742	0.0316739358283433	0.0553541537125843	NA	NA	0.0470986489808828	0.584645538853392	263	38	699	0.699	0.263	0.526
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.0315924923117668	0.0563763754371189	NA	NA	0.047310781516748	0.58043908907525	252	42	706	0.706	0.252	0.504
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.0302315080442052	0.0573923057823091	NA	NA	0.0487375807119906	0.594439805792501	268	33	699	0.699	0.268	0.536
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0499664439235005	0.0725641058409195	0.688583471737951	-0.022597661917419	0.0310506880901759	0.0533512345475463	NA	NA	0.0453867829311003	0.618561008169226	275	43	682	0.682	0.275	0.55
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.0498108321742552	0.0714826348532436	0.696824232577865	-0.0216718026789884	0.0309841014444859	0.054838384098005	NA	NA	0.043004029686479	0.614297789278132	286	35	679	0.679	0.286	0.572
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0493497606808473	0.071696340510766	0.688316311952309	-0.0223465798299186	0.0286017370386228	0.0515581389919117	NA	NA	0.0430635149251792	0.603815547769502	290	48	662	0.662	0.29	0.58
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0495536228075988	0.108952531416164	0.454818462347788	-0.0593989086085652	0.0306438485792214	0.0705726433086462	NA	NA	0.0606591895018744	0.327469520887759	147	15	838	0.838	0.147	0.294
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0491475696448996	0.108952531416164	0.451091580948878	-0.0598049617712643	0.0304267758233367	0.0693204261174481	NA	NA	0.0572062330539127	0.295825492337657	130	18	852	0.852	0.13	0.26
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.11306631811959	0.425953340236639	-0.0649053422482923	0.0288639312420891	0.0720233211097683	NA	NA	0.0638394552592583	0.309297894445699	118	16	866	0.866	0.118	0.236
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.154888999008431	0.310938647545113	-0.106728023137133	0.0284502159205463	0.0855927447414036	NA	NA	0.0819379323143776	0.192729398694725	48	3	949	0.949	0.048	0.096
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0485508200337835	0.152908411727716	0.317515691159214	-0.104357591693933	0.0297945080041798	0.0841429457128295	NA	NA	0.0847816103470387	0.218360675649776	56	2	942	0.942	0.056	0.112
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0599719947335073	0.154888999008431	0.387193377950896	-0.0949170042749234	0.0324888877879966	0.087839795087559	NA	NA	0.0829575187312659	0.252555640750592	79	1	920	0.92	0.079	0.158
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0304809903385123	0.0853863793081298	NA	NA	0.0832112287954088	0.27159581326384	80	1	919	0.919	0.08	0.16
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0312647542506583	0.0853316750140098	NA	NA	0.0778290391557704	0.239825702412593	77	3	920	0.92	0.077	0.154
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333337	3	29.91666666666667	0.0473997786251612	0.107647107231784	0.440325614353027	-0.0602473286066223	0.0290777311944792	0.0722390185339725	NA	NA	0.0678183700075278	0.374345537406136	158	7	835	0.835	0.158	0.316
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.91666666666671	3	30.250000000000004	0.0474936093526965	0.106372646579413	0.44648329133411	-0.0588790372267168	0.0292933191755107	0.0717957398645946	NA	NA	0.0697328792031095	0.39847320738383	168	6	826	0.826	0.168	0.336
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.00000000000006	3	29.83333333333334	0.0468902677360004	0.107970516691131	0.43428770346759	-0.0610802489551308	0.0285881937874224	0.0699932190975856	NA	NA	0.0666437801555603	0.359395075430365	150	13	837	0.837	0.15	0.3
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0464364923107347	0.108623210908842	0.427500641181606	-0.0621867185981073	0.0277451698498806	0.0682949435982276	NA	NA	0.0683369270439032	0.362821622386995	142	8	850	0.85	0.142	0.284
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0288117375605913	0.0704259343169143	NA	NA	0.0718941478761148	0.378495531549933	158	8	834	0.834	0.158	0.316
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0290252554650859	0.0671760210344763	NA	NA	0.0755172254884694	0.401794933947343	162	5	833	0.833	0.162	0.324
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.58333333333339	3	29.583333333333336	0.0709889121664901	0.108952531416164	0.651558171653076	-0.0379636192496739	0.0375736841277996	0.0687406225370247	NaN	NaN	0.0725407073178648	0.600736082622505	290	3	707	0.707	0.29	0.58
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.91666666666671	3	30.583333333333336	0.0724180213610206	0.105128058952294	0.68885530735313	-0.0327100375912736	0.038143554596812	0.065853580126638	NA	NA	0.0715268766881065	0.647447423025706	328	0	672	0.672	0.328	0.656
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.25000000000006	3	30.583333333333336	0.0739059002893284	0.105128058952294	0.703008321716146	-0.0312221586629658	0.0399287163764627	0.0618214291684593	NA	NA	0.0706423233214857	0.658507114337383	320	4	676	0.676	0.32	0.64
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.91666666666671	3	30.25	0.075140996593953	0.106372646579413	0.70639397448719	-0.0312316499854603	0.0412137946569243	0.0688815674489484	NaN	NaN	0.0722178951240801	0.665404109060174	326	3	671	0.671	0.326	0.652
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.58333333333339	3	30.583333333333336	0.0754562533850991	0.105128058952294	0.717755603376452	-0.0296718055671951	0.0400543501937625	0.0675661051359277	NaN	NaN	0.0699763794968079	0.671546838484361	355	1	644	0.644	0.355	0.71
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000006	3	30.75	0.0499664439235005	0.104516640682884	0.478071660139795	-0.054550196759383	0.0298530385908262	0.0686169911327107	NA	NA	0.0689504994863727	0.428856387840005	166	4	830	0.83	0.166	0.332
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333339	3	30.916666666666668	0.0500707265730995	0.103912304538584	0.481855606950837	-0.0538415779654844	0.0305997694913898	0.0684181507214071	NA	NA	0.0653663169597848	0.410115754635705	214	3	783	0.783	0.214	0.428
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333339	3	31.249999999999996	0.0507056829412418	0.102724391304868	0.493608989035099	-0.0520187083636263	0.0319671382302788	0.0660704804711402	NA	NA	0.0640155931397616	0.416450680371055	185	4	811	0.811	0.185	0.37
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333339	3	32.083333333333336	0.0516889101836222	0.0998703029515669	0.51756036235005	-0.0481813927679447	0.0330789731952058	0.0667594843484689	NA	NA	0.0666757509846169	0.469911887992593	204	5	791	0.791	0.204	0.408
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	2	32	0.0383879094086674	0.0652585327422224	0.58824352610414	-0.026870623333555	0.0299460173315665	0.0517654694784387	NA	NA	0.0526613961095031	0.609874385369343	312	13	675	0.675	0.312	0.624
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	32	0.0379827996140662	0.100148544468392	0.379264619527785	-0.0621657448543258	0.0285761922775292	0.0630883255575965	NA	NA	0.0716947915690534	0.385893402094508	157	13	830	0.83	0.157	0.314
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.3333333333334	3	31	0.0373521168628637	0.103612753860613	0.360497288906271	-0.0662606369977492	0.0280186292022519	0.0653462732730214	NA	NA	0.0700285288711542	0.344049186015247	137	3	860	0.86	0.137	0.274
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.3333333333334	3	31	0.0368926831430787	0.103612753860613	0.356063146364292	-0.0667200707175341	0.0278115252830618	0.0675487373225843	NA	NA	0.0748695180753774	0.37284798988939	151	3	846	0.846	0.151	0.302
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.8333333333334	3	31.666666666666668	0.0362243442097796	0.101277212852957	0.357675168869163	-0.0650528686431775	0.0274117434080866	0.0651342802551564	NA	NA	0.0677167830028658	0.336722675138186	149	3	848	0.848	0.149	0.298
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666673	3	32.66666666666667	0.0365183693771989	0.0979651368127982	0.372769033610212	-0.0614467674355992	0.0278054619653818	0.0681960830837185	NaN	NaN	0.0681909065020684	0.367535608347472	165	6	829	0.829	0.165	0.33
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0311643447946168	0.0630071291414971	NA	NA	0.0699808360212561	0.4863391893511	236	3	761	0.761	0.236	0.472
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0307123738459342	0.0616836494587811	NaN	NaN	0.0717101722742665	0.485665728065131	228	3	769	0.769	0.228	0.456
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0310467123831653	0.082026872012662	NA	NA	0.0872495378468702	0.295417225402834	114	1	885	0.885	0.114	0.228
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0307772587098362	0.0805675755080163	NaN	NaN	0.091785861776785	0.310209003756308	138	1	861	0.861	0.138	0.276
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0385577990412789	0.0855536101203867	NA	NA	0.0956029769232884	0.442948098456539	205	1	794	0.794	0.205	0.41
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0384738320506199	0.0876357017938549	NaN	NaN	0.0972730411510941	0.4572085298548	219	0	781	0.781	0.219	0.438
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.039445718615719	0.0874505464692151	NaN	NaN	0.101610358170104	0.485831889068854	192	0	808	0.808	0.192	0.384
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0400630258093265	0.0844575461571334	NaN	NaN	0.094037318090722	0.47318176041686	224	0	776	0.776	0.224	0.448
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0417782946721826	0.087523366975823	NaN	NaN	0.102690077322114	0.514638689493272	236	0	764	0.764	0.236	0.472
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0438686408054644	0.0872872359390452	NaN	NaN	0.10238988999191	0.486111830737706	210	0	790	0.79	0.21	0.42
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0447974592873148	0.100560202873371	NaN	NaN	0.105382930240224	0.375441224736004	157	0	843	0.843	0.157	0.314
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0448631033412278	0.0951716523897579	NaN	NaN	0.103911773044639	0.410916587530239	190	1	809	0.809	0.19	0.38
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.04664143433089	0.0910251798895708	NaN	NaN	0.102945797194625	0.427802089715311	181	0	819	0.819	0.181	0.362
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0487547789351555	0.0933111621668559	NaN	NaN	0.101581160036713	0.436281208832569	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0464413064038296	0.0948956230197037	NaN	NaN	0.0983144034354949	0.39688983706473	180	0	820	0.82	0.18	0.36
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0458995495808463	0.0937656971917098	NaN	NaN	0.102239018679179	0.437109692840142	167	0	833	0.833	0.167	0.334
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0461771315856368	0.0879443849146185	NaN	NaN	0.0998516930698756	0.431498726952986	175	0	825	0.825	0.175	0.35
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417143.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.4166666666667	2	33.66666666666666	0.0694136680239339	0.0618907677660027	1.12155125117164	0.00752290025793116	0.0312001842113461	0.0469164752278144	NaN	NaN	0.0602143615058485	0.900574759599296	579	1	420	0.42	0.579	0.84
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.25000000000003	2	33.83333333333333	0.0695747645549367	0.0615730216404005	1.12995533922743	0.00800174291453612	0.0316858986485321	0.0455416678963522	NaN	NaN	0.0572921353667711	0.888924173338381	580	1	419	0.419	0.58	0.838
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.58333333333336	2	33.83333333333333	0.0692533163185839	0.0615730216404005	1.1247347372854	0.00768029467818337	0.0302520543780382	0.0441919516426516	NaN	NaN	0.0549978884045327	0.88893883834604	563	0	437	0.437	0.563	0.874
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.58333333333336	2	34.16666666666666	0.0702267037754945	0.0609472230590744	1.15225436452496	0.0092794807164201	0.0314577333226977	0.0439565221972336	NA	NA	0.0565572895958796	0.86967428153433	589	1	410	0.41	0.589	0.82
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.58333333333336	2	35.16666666666666	0.0712278649928987	0.0591439311842398	1.20431401103549	0.0120839338086589	0.0310257842559579	0.0437848818238113	NaN	NaN	0.0541041709269609	0.823266463692065	602	1	397	0.397	0.602	0.794
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAACCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.25000000000001	2	35.49999999999999	0.0715679639391767	0.0585663277285774	1.22199848812196	0.0130016362105993	0.0332667583609333	0.0442086310547265	NaN	NaN	0.0553937916177554	0.814431592337406	626	1	373	0.373	0.626	0.746
N	all	ss13	8	---	AAC	CAA	1	CAA---AAT:CAACCAAAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.41666666666669	2	34.666666666666664	0.0713975091508652	0.0600320307551523	1.18932357031313	0.0113654783957129	0.0298503127701236	0.0438907529431053	NA	NA	0.0567140617054205	0.841168029336897	604	1	395	0.395	0.604	0.79
N	all	ss13	9	AAT	--A	ATC	1	---AATCAG:CCAAATCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.41666666666669	2	35.666666666666664	0.0703916034965163	0.0582817382454872	1.20778147007252	0.0121098652510291	0.0324655294267754	0.0425657508607627	NaN	NaN	0.0544277072712663	0.823928958125828	623	0	377	0.377	0.623	0.754
N	all	ss13	10	CAG	ATC	AGC	2	AATCAGCGA:AATCAGCGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.08333333333336	2	36	0.0707237388415596	0.0577207808520962	1.22527342488284	0.0130029579894634	0.03314110034888	0.0421732170044019	NaN	NaN	0.0559018280991303	0.816069349295338	612	1	387	0.387	0.612	0.774
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0301681672812112	0.041215687819457	NA	NA	0.0541465737168359	0.81660439499357	613	1	386	0.386	0.613	0.772
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0308943138988612	0.0425285279760914	NaN	NaN	0.057631842238452	0.836917699376615	586	1	413	0.413	0.586	0.826
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.028080375344456	0.0427508485422125	NA	NA	0.049677542320313	0.982821961317053	539	1	460	0.46	0.539	0.92
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0280805990280742	0.0432744174168218	NA	NA	0.0522825497895276	0.981852296499975	506	3	491	0.491	0.506	0.982
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0306183632359543	0.0420827737457289	NA	NA	0.0550582367048799	0.825959505163134	595	1	404	0.404	0.595	0.808
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0302227551876104	0.0417922736774869	NaN	NaN	0.055019213208551	0.825838042162423	587	0	413	0.413	0.587	0.826
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0318044584790011	0.0430972820330639	NaN	NaN	0.0576742014908457	0.678041712281516	671	0	329	0.329	0.671	0.658
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0324469985778316	0.0423006118247879	NaN	NaN	0.0564252116320158	0.681085020603816	665	0	335	0.335	0.665	0.67
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0329652006292647	0.0453492373297387	NaN	NaN	0.05475740869721	0.664441561799712	680	1	319	0.319	0.68	0.638
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0346667129998935	0.0451306417903436	NaN	NaN	0.0571462197134313	0.664275345808979	705	0	295	0.295	0.705	0.59
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.032312455628058	0.0422423173180722	NaN	NaN	0.0575402643811713	0.687821239014207	661	0	339	0.339	0.661	0.678
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0328320467427129	0.0431759013518823	NA	NA	0.0539643049778028	0.66555427727795	694	0	306	0.306	0.694	0.612
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0327507277001932	0.031225928898308	NaN	NaN	0.0458235616086119	0.256278678922285	879	0	121	0.121	0.879	0.242
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0336955484686777	0.0297182825308711	NA	NA	0.0453842981423962	0.23334352177248	876	3	121	0.121	0.876	0.242
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0328136491407386	0.0308033220993961	NaN	NaN	0.0464557845932402	0.260195047489366	875	1	124	0.124	0.875	0.248
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.033560734443679	0.0316431310113647	NaN	NaN	0.0451620704134015	0.24974757480043	873	2	125	0.125	0.873	0.25
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0287663422388655	0.0301247559355764	NA	NA	0.0448491987057358	0.410288332602529	796	2	202	0.202	0.796	0.404
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0265651808561083	0.0294332484029042	NA	NA	0.0417821142632275	0.571894001420056	715	9	276	0.276	0.715	0.552
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0258734937343329	0.0302467294278642	NA	NA	0.0407607279202826	0.557954071807589	732	3	265	0.265	0.732	0.53
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0259206955274292	0.0324891561822749	NA	NA	0.0411349052367638	0.583453302653794	713	5	282	0.282	0.713	0.564
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0264238550408623	0.0460383165742273	NA	NA	0.053201347617235	0.896527414286292	453	4	543	0.543	0.453	0.906
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0256173272052274	0.0434146091812614	NaN	NaN	0.0511846212030542	0.93106324205955	471	1	528	0.528	0.471	0.942
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0226993969621871	0.0438126210176433	NA	NA	0.0485933770918511	0.697491885070328	344	11	645	0.645	0.344	0.688
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0212422109387054	0.0424989138311157	NA	NA	0.049039906584587	0.683435189311534	359	9	632	0.632	0.359	0.718
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0181866367827356	0.0427890790287259	NA	NA	0.0465083591697569	0.472985706230507	229	13	758	0.758	0.229	0.458
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0171371616332336	0.0426817895301468	NA	NA	0.0475587992691052	0.485185672493337	213	22	765	0.765	0.213	0.426
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0184722397814454	0.0440484327542227	NA	NA	0.0511638309837885	0.49877662049935	210	13	777	0.777	0.21	0.42
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0181666799849797	0.0428792009001414	NA	NA	0.0477862413664462	0.484617477748056	247	15	738	0.738	0.247	0.494
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0185703282891417	0.0298495653162211	NA	NA	0.0351915982972619	0.937132036504456	462	46	492	0.492	0.462	0.924
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0187908745471688	0.0302997092461168	NA	NA	0.0339979662775549	0.944304054492519	491	42	467	0.467	0.491	0.934
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000001	1	35.666666666666664	0.0267885619515594	0.0285748846742028	0.937486266593543	-0.00178632272264338	0.0183369999380818	0.0292641890345883	NA	NA	0.0358735479304238	0.960285764415947	494	49	457	0.457	0.494	0.914
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666667	1	36	0.0269087157486764	0.0283052459871352	0.950661787603135	-0.0013965302384588	0.0188618965472215	0.0298971126057426	NA	NA	0.0345134041130206	0.967723672706903	504	44	452	0.452	0.504	0.904
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666667	1	36.416666666666664	0.0269087157486764	0.0279752710599065	0.96187506784309	-0.00106655531123012	0.0198735716035	0.0295461782768032	NA	NA	0.0333281882637523	0.974470775853528	487	46	467	0.467	0.487	0.934
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666667	1	36.25	0.0269087157486764	0.0281063333749098	0.957389759444665	-0.00119761762623334	0.018493150761922	0.0287168536942964	NA	NA	0.0347398780923453	0.972499288203014	481	39	480	0.48	0.481	0.96
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.5	1	35.25	0.0269691977905829	0.0289192452027623	0.932569214773519	-0.00195004741217941	0.0189139287347342	0.0294650459697095	NA	NA	0.0341554479478694	0.954470869443451	456	52	492	0.492	0.456	0.912
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666666	2	35.25	0.0269087157486764	0.0589984642956841	0.456091799505447	-0.0320897485470077	0.0185904757837685	0.0431309614824563	NA	NA	0.0468928490088113	0.493772661173109	247	18	735	0.735	0.247	0.494
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666666	2	34.916666666666664	0.0269087157486764	0.059584670169267	0.451604677381526	-0.0326759544205905	0.0189294833810112	0.0436831385237531	NA	NA	0.0490824269517991	0.505579652522951	214	27	759	0.759	0.214	0.428
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666666	2	34.916666666666664	0.0269087157486764	0.059584670169267	0.451604677381526	-0.0326759544205905	0.0185597582721492	0.0446578511379534	NA	NA	0.0478400224919909	0.494590740802529	224	11	765	0.765	0.224	0.448
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.99999999999999	2	34.916666666666664	0.0271522864979704	0.059584670169267	0.455692486353231	-0.0324323836712965	0.0184352191860793	0.0474528768874333	NA	NA	0.0504141464061643	0.52001706038892	260	15	725	0.725	0.26	0.52
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666666	2	35.25	0.0272757331281561	0.0589984642956841	0.462312594976331	-0.031722731167528	0.0186916951741458	0.0448652654336626	NA	NA	0.0481119212459465	0.509669228383308	224	15	761	0.761	0.224	0.448
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666666	2	35.25	0.0272757331281561	0.0589984642956841	0.462312594976331	-0.031722731167528	0.0199589331796288	0.0443683120680352	NA	NA	0.0517960927431384	0.540237334484442	252	19	729	0.729	0.252	0.504
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333333	2	35.25	0.0270299523623977	0.0589984642956841	0.458146710852184	-0.0319685119332864	0.0187708834675495	0.0452133889586751	NA	NA	0.048538398882165	0.510137809632775	240	8	752	0.752	0.24	0.48
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75	2	34.58333333333333	0.0271522864979704	0.0601826482875393	0.45116470063336	-0.0330303617895688	0.0184448470532241	0.0438295957996023	NA	NA	0.0477427273142266	0.489037375335031	242	23	735	0.735	0.242	0.484
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666667	2	33.58333333333333	0.0272757331281561	0.0620508745044359	0.439570487055847	-0.0347751413762797	0.0191325335890693	0.0480641788313366	NA	NA	0.0481707041479621	0.470346898090017	257	9	734	0.734	0.257	0.514
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666667	2	33	0.0405961546323978	0.0631952577133049	0.642392421541638	-0.0225991030809071	0.0220389678362205	0.0493455120309828	NA	NA	0.0518274522449074	0.66280405726708	322	5	673	0.673	0.322	0.644
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666667	2	32.5	0.0403232602433046	0.0642103145422439	0.627987271683212	-0.0238870542989393	0.0222230290433871	0.0485352346474046	NA	NA	0.0533312360226147	0.654225453864794	340	3	657	0.657	0.34	0.68
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75	2	32.83333333333333	0.0401433603117785	0.0635300231041221	0.631880146588107	-0.0233866627923436	0.0232681221832285	0.0496022757582931	NA	NA	0.0524195887592661	0.655493537374486	323	7	670	0.67	0.323	0.646
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75	2	32.83333333333333	0.0401433603117785	0.0635300231041221	0.631880146588107	-0.0233866627923436	0.0224579753940137	0.0508882533364926	NA	NA	0.0547596821584558	0.66932241983041	325	8	667	0.667	0.325	0.65
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666667	2	32.33333333333333	0.0397883346582442	0.0645559565784323	0.616338704700369	-0.0247676219201881	0.0220170485916588	0.0486368469661518	NA	NA	0.0530751070722149	0.640748646883033	314	5	681	0.681	0.314	0.628
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666667	2	31.666666666666664	0.0392674190316604	0.0659765797094679	0.595172092954455	-0.0267091606778075	0.0215439326937005	0.0493662998163108	NA	NA	0.0541280558175631	0.621698947474457	305	5	690	0.69	0.305	0.61
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333334	2	32.33333333333333	0.0399650588551816	0.0645559565784323	0.619076239798663	-0.0245908977232506	0.0221790651294913	0.0505661229156961	NA	NA	0.053948300042016	0.648516973498426	334	7	659	0.659	0.334	0.668
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666667	2	33.166666666666664	0.0400540111089283	0.0628640039123036	0.637153356709578	-0.0228099928033753	0.0222294914348061	0.0474673835547535	NA	NA	0.0524250041918356	0.663491595110291	326	10	664	0.664	0.326	0.652
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333334	2	32.833333333333336	0.0402331091273882	0.0635300231041221	0.633292845832095	-0.0232969139767339	0.0229473213611931	0.0502178637780174	NA	NA	0.054262042926502	0.667675161321837	337	7	656	0.656	0.337	0.674
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000001	2	33	0.040687942312311	0.0631952577133049	0.643844867235104	-0.0225073154009939	0.022853447456433	0.0479277495029455	NA	NA	0.0554523778373246	0.684826741882594	327	3	670	0.67	0.327	0.654
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	2	33.25	0.0277167798918218	0.0626996766264699	0.442056185663335	-0.034982896734648	0.0191983604530903	0.0483416809002736	NA	NA	0.0528346356305117	0.507893982093124	241	12	747	0.747	0.241	0.482
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000001	2	32.25	0.0277167798918218	0.0647301776657745	0.428189461103192	-0.0370133977739526	0.0190836945399754	0.048032543640452	NA	NA	0.0511827319236861	0.469580470017047	233	14	753	0.753	0.233	0.466
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666667	2	32.416666666666664	0.0138412232800193	0.0643826713791054	0.214983674699016	-0.0505414480990862	0.0140604695128133	0.0516259568847459	NA	NA	0.05091949061	0.320916780691692	109	50	841	0.841	0.109	0.218
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.58333333333334	2	33.083333333333336	0.0141014729867999	0.0630291953285242	0.223729224422102	-0.0489277223417243	0.0140491405342241	0.0476243118635196	NA	NA	0.0495805222428005	0.323724248764421	116	53	831	0.831	0.116	0.232
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.58333333333334	2	33.083333333333336	0.0141014729867999	0.0630291953285242	0.223729224422102	-0.0489277223417243	0.0141426556219763	0.0472515290051478	NA	NA	0.0485805065518379	0.313864030091181	124	46	830	0.83	0.124	0.248
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000001	2	33.083333333333336	0.0138732279313668	0.0630291953285242	0.220107965190672	-0.0491559673971573	0.013797059759728	0.0482873072145276	NA	NA	0.0466563422756574	0.292077426295857	115	41	844	0.844	0.115	0.23
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666669	2	33.166666666666664	0.0138892858254281	0.0628640039123036	0.2209417943662	-0.0489747180868755	0.0137005534401634	0.0478732223277462	NA	NA	0.0498756802951743	0.326131457125283	111	41	848	0.848	0.111	0.222
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	2	33.5	0.0284394261467203	0.0622118122355632	0.457138686766353	-0.0337723860888429	0.0197595073423375	0.0458099091390916	NA	NA	0.0520460842918407	0.516406964369977	252	14	734	0.734	0.252	0.504
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	2	33.5	0.0284394261467203	0.0622118122355632	0.457138686766353	-0.0337723860888429	0.0198375438519998	0.0505750900589662	NA	NA	0.0526465929896469	0.521202856588078	243	18	739	0.739	0.243	0.486
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.33333333333336	2	32.83333333333333	0.0281723261817364	0.0635300231041221	0.443449015209132	-0.0353576969223857	0.0195614356065541	0.0479059768864558	NA	NA	0.056058253182279603	0.528216206253876	234	15	751	0.751	0.234	0.468
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	2	33.5	0.0284394261467203	0.0622118122355632	0.457138686766353	-0.0337723860888429	0.0203532003839	0.0455557039677898	NA	NA	0.0509933206783187	0.507785136385928	242	13	745	0.745	0.242	0.484
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.66666666666669	2	33.5	0.0284394261467203	0.0622118122355632	0.457138686766353	-0.0337723860888429	0.0202062122334707	0.0485081142291437	NA	NA	0.0543101496785975	0.534045112364198	258	17	725	0.725	0.258	0.516
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.33333333333336	2	34.166666666666664	0.0289891158257093	0.0609472230590743	0.475642931222823	-0.031958107233365	0.0207928777787245	0.0461642480470907	NA	NA	0.0519485495037034	0.53843078827642	258	15	727	0.727	0.258	0.516
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	2	34.166666666666664	0.0287116399282627	0.0609472230590743	0.471090207021136	-0.0322355831308116	0.0197643177808697	0.0458978463008674	NA	NA	0.0516754282432641	0.532753207382825	270	16	714	0.714	0.27	0.54
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	2	34.166666666666664	0.0287116399282627	0.0609472230590743	0.471090207021136	-0.0322355831308116	0.0201960256208864	0.0458862626579027	NA	NA	0.0507755319852303	0.525516786714684	267	14	719	0.719	0.267	0.534
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000003	2	33.916666666666664	0.0433333505001085	0.0614153696041381	0.705578274288994	-0.0180820191040296	0.0248184240119821	0.0470608408404901	NA	NA	0.0539532083658017	0.737517510993171	380	4	616	0.616	0.38	0.76
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000003	1	33.58333333333333	0.0433333505001085	0.0303839016876759	1.42619440207329	0.0129494488124326	0.0256254794396633	0.0324687495690926	NA	NA	0.0419136423202807	0.757355405033493	627	13	360	0.36	0.627	0.72
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.25000000000003	1	33.58333333333333	0.0433333505001085	0.0303839016876759	1.42619440207329	0.0129494488124326	0.0251148147083829	0.031248201506202	NA	NA	0.0423006475994506	0.75950653883523	610	17	373	0.373	0.61	0.746
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	1	34.24999999999999	0.0439686325106426	0.0297805871963345	1.47641925999546	0.0141880453143081	0.0244640735874887	0.0321957071119301	NA	NA	0.0416738279862229	0.73351422710217	636	12	352	0.352	0.636	0.704
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	1	35.24999999999999	0.0444026073250892	0.0289192452027623	1.53539993916743	0.0154833621223269	0.0248156570268378	0.0295975291340375	NA	NA	0.04053196143178	0.702458567354792	643	17	340	0.34	0.643	0.68
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000001	1	35.416666666666664	0.0449572769752751	0.0287805096612113	1.56207369169233	0.0161767673140638	0.0255880149295272	0.0303031291072386	NA	NA	0.0412103694320431	0.69465838577252	683	14	303	0.303	0.683	0.606
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000001	1	35.416666666666664	0.045296782717305	0.0287805096612113	1.57387006868587	0.0165162730560937	0.0251956929677279	0.0299333799342305	NA	NA	0.0406927295612721	0.684832435532032	664	17	319	0.319	0.664	0.638
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.91666666666667	1	35.75	0.0455259839052049	0.0285069944752381	1.59701100530783	0.0170189894299668	0.0264920523681119	0.03104717141523	NA	NA	0.0402271925354798	0.672242900447473	688	15	297	0.297	0.688	0.594
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25	1	36.08333333333333	0.045296782717305	0.0282386296527663	1.60407155992669	0.0170581530645386	0.0263977691051453	0.0307894337693734	NA	NA	0.0378721778597369	0.65241206730559	685	8	307	0.307	0.685	0.614
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA:TACCGACGA	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75	1	35.58333333333333	0.0449572769752752	0.0286430990492925	1.56956748632218	0.0163141779259827	0.0262899429765473	0.0324143790415816	NA	NA	0.0397642662174195	0.681606191563846	695	14	291	0.291	0.695	0.582
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT:CGACGAGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.16666666666667	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666667	1	35.416666666666664	0.0445124432883257	0.0287805096612113	1.54661761769692	0.0157319336271144	0.0256683668657733	0.0294856145365176	NA	NA	0.0399632972054501	0.69383240863378	688	10	302	0.302	0.688	0.604
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC:CGAGCTACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.83333333333334	1	35.83333333333333	0.0455836471964618	0.0284394261467203	1.60283287578637	0.0171442210497415	0.025046063883544	0.0315214161040974	NA	NA	0.0431390783129642	0.691059674344792	656	18	326	0.326	0.656	0.652
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.16666666666669	1	35.166666666666664	0.0453538663162631	0.0289891158257093	1.56451361224479	0.0163647504905538	0.0259364359255241	0.0317234778957622	NA	NA	0.0403962095883295	0.685399530644051	668	19	313	0.313	0.668	0.626
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.50000000000001	1	34.83333333333333	0.0451263910998395	0.0292720079293014	1.54162267271962	0.0158543831705381	0.0245585976384284	0.0306815151015298	NA	NA	0.0410462469004444	0.699306650083734	657	19	324	0.324	0.657	0.648
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	1	34.916666666666664	0.0450698784927921	0.0292007684815911	1.54344836921691	0.0158691100112011	0.0252539936622422	0.0335040649813688	NA	NA	0.0411887843753716	0.700031863163746	672	20	308	0.308	0.672	0.616
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	1	35.666666666666664	0.0447894260262167	0.0285748846742028	1.56744030769973	0.0162145413520139	0.0245858852958759	0.0313076780919383	NA	NA	0.0388932238171749	0.676752374623363	689	12	299	0.299	0.689	0.598
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	0	35.666666666666664	0.0444574574471551	0	-Inf	0.0444574574471551	0.0243883146972598	0	NA	NA	0.0251585802907715	0.0772132780957567	968	32	0	0	0.968	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333336	0	36	0.0442388662657619	0	-Inf	0.0442388662657619	0.0248624366947972	0	NA	NA	0.0252724191622823	0.0800355088386882	963	37	0	0	0.963	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.16666666666669	0	36.166666666666664	0.0440224147463932	0	-Inf	0.0440224147463932	0.0256016471263731	0	NA	NA	0.0246462035735146	0.0740710452966108	959	41	0	0	0.959	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000001	0	35.833333333333336	0.0438080716173109	0	-Inf	0.0438080716173109	0.024842085946933	0	NA	NA	0.0244269405184898	0.0729037776574494	959	41	0	0	0.959	0.001
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333334	0	35.833333333333336	0.0442388662657619	0	-Inf	0.0442388662657619	0.0250763429239126	0	NA	NA	0.0248618251637297	0.075175955583984	959	41	0	0	0.959	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333334	0	35.833333333333336	0.0442388662657619	0	-Inf	0.0442388662657619	0.0248974053774679	0	NA	NA	0.0249261007232956	0.0759307659169545	960	40	0	0	0.96	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333334	0	35.833333333333336	0.0442388662657619	0	-Inf	0.0442388662657619	0.0264052915626709	0	NA	NA	0.0260489367609779	0.0894514663904064	962	38	0	0	0.962	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.16666666666669	0	36.5	0.0440224147463932	0	-Inf	0.0440224147463932	0.0255773373771551	0	NA	NA	0.025209051126005	0.080759877798762	958	42	0	0	0.958	0.001
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.66666666666669	1	37.66666666666667	0.0597330472949441	0.0270299523623976	2.20988355784307	0.0327030949325464	0.0305206448883771	0.0282197313143105	NA	NA	0.0288485831225356	0.256957411054294	884	21	95	0.095	0.884	0.19
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000001	1	38.083333333333336	0.0446228241484838	0.0267288865855191	1.66946064160634	0.0178939375629647	0.0270652599104617	0.0271175354971553	NA	NA	0.0256326629882083	0.485120134289046	718	59	223	0.223	0.718	0.446
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666669	1	38.583333333333336	0.0445124432883257	0.0263763446044989	1.68758954115019	0.0181360986838268	0.0253163122124983	0.0278088302346816	NA	NA	0.023842485237953098	0.446858321405385	760	46	194	0.194	0.76	0.388
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666669	1	37.91666666666667	0.0445124432883257	0.0268485044068343	1.65791146552636	0.0176639388814914	0.0263942369127571	0.027021649323658	NA	NA	0.0242966574540843	0.467219175679026	780	50	170	0.17	0.78	0.34
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.41666666666669	1	37.91666666666667	0.0445124432883257	0.0268485044068343	1.65791146552636	0.0176639388814914	0.0257545892264167	0.0272217368353469	NA	NA	0.0250921880947838	0.481456638081727	754	46	200	0.2	0.754	0.4
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333334	1	38.083333333333336	0.0600320307551523	0.0267288865855191	2.24596077218106	0.0333031441696332	0.0300260889713818	0.027053242800995	NA	NA	0.029676083490558	0.261768198290122	880	15	105	0.105	0.88	0.21
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	67.66666666666667	1	38.75000000000001	0.0615730216404005	0.0262608883838265	2.34466636240387	0.035312133256574	0.031485037205088	0.0263822009188687	NA	NA	0.0280131281148256	0.207468647007561	914	17	69	0.069	0.914	0.138
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.16666666666667	1	37.75000000000001	0.0611024764460933	0.0269691977905829	2.26563937572622	0.0341332786555104	0.0320932318884428	0.0272615365991561	NA	NA	0.0300598530206932	0.256161486097483	892	12	96	0.096	0.892	0.192
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.00000000000001	1	36.91666666666667	0.0612585232607003	0.0275893176123833	2.22037109149828	0.033669205648317	0.0307013145895636	0.0279671784670446	NA	NA	0.0294713250200075	0.253271382764979	888	12	100	0.1	0.888	0.2
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.66666666666669	1	36.25000000000001	0.0606390724718212	0.0281063333749098	2.15748783958967	0.0325327390969114	0.0297614537534106	0.0283690354710611	NA	NA	0.0296597053287864	0.272699726578774	879	21	100	0.1	0.879	0.2
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.16666666666669	1	35.75000000000001	0.0601826482875392	0.0285069944752381	2.11115374999688	0.0316756538123011	0.0284835454139958	0.0291304247469351	NA	NA	0.0300497028193921	0.291833143747213	862	19	119	0.119	0.862	0.238
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.83333333333336	1	36.083333333333336	0.0587096677913666	0.0282386296527663	2.07905512814483	0.0304710381386003	0.0288947727166489	0.0291098356996456	NA	NA	0.0296834257410241	0.304640066776362	852	19	129	0.129	0.852	0.258
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.33333333333336	1	36.583333333333336	0.0582817382454872	0.02784542552167	2.09304534420316	0.0304363127238172	0.0296186752002299	0.0292692754114614	NA	NA	0.0290001504486159	0.293937668359781	850	16	134	0.134	0.85	0.268
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666669	1	36.25	0.0579999025523778	0.0281063333749098	2.0635883656085	0.029893569177468	0.0293429822201347	0.0276726858103615	NA	NA	0.0300012416841501	0.319050458959315	838	21	141	0.141	0.838	0.282
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333336	1	35.583333333333336	0.0574443341110379	0.0286430990492925	2.00552091141328	0.0288012350617454	0.0290569614110559	0.0297054958412384	NA	NA	0.0283380317091893	0.309464820534784	858	13	129	0.129	0.858	0.258
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	1	34.583333333333336	0.0563645417845084	0.0294878275056261	1.91145114958891	0.0268767142788823	0.0280278805863292	0.0298032863875819	NA	NA	0.0308485479535939	0.383619135604954	810	20	170	0.17	0.81	0.34
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000001	1	34.583333333333336	0.0568993130810351	0.0294878275056261	1.92958647327203	0.027411485575409	0.0278242082400806	0.0296288959544536	NA	NA	0.0297112435257623	0.356217585452256	823	18	159	0.159	0.823	0.318
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666669	1	34.583333333333336	0.0563645417845084	0.0294878275056261	1.91145114958891	0.0268767142788823	0.0286783363903266	0.0298328518022292	NA	NA	0.0300728954819749	0.371472324541595	797	28	175	0.175	0.797	0.35
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333336	1	33.91666666666667	0.0414852284880391	0.0300792190929219	1.37919898651229	0.0114060093951172	0.0235509140386228	0.030661623711857	NA	NA	0.0243873166865381	0.639997340949392	646	41	313	0.313	0.646	0.626
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333336	1	34.583333333333336	0.0414852284880391	0.0294878275056261	1.40685943988664	0.011997400982413	0.0232529231690457	0.0305797741116256	NA	NA	0.0252425084594211	0.634583415725983	671	43	286	0.286	0.671	0.572
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666669	1	35.25	0.0418713371647064	0.0289192452027623	1.44787102398879	0.0129520919619441	0.0246112313814674	0.0297294674817852	NA	NA	0.025318446555737	0.608953803679918	672	42	286	0.286	0.672	0.572
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666669	1	35.25	0.0418713371647064	0.0289192452027623	1.44787102398879	0.0129520919619441	0.0238771972730801	0.0280663711870989	NA	NA	0.0248339782602219	0.601985630177425	653	52	295	0.295	0.653	0.59
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666669	1	35.41666666666667	0.0415810863628941	0.0287805096612113	1.44476546289014	0.0128005767016829	0.0244396191078876	0.0295015146529361	NA	NA	0.024952611199171	0.607954484096551	665	46	289	0.289	0.665	0.578
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.1666666666667	1	34.41666666666667	0.0410124947055404	0.0296334842053817	1.38399165016485	0.0113790105001586	0.0250532333004816	0.0311030904156445	NA	NA	0.0255744649165115	0.656365712339509	632	60	308	0.308	0.632	0.616
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.1666666666667	1	34.41666666666667	0.0410124947055404	0.0296334842053817	1.38399165016485	0.0113790105001586	0.0239418353668381	0.0295399524004035	NA	NA	0.0253562877361071	0.65360130227642	647	50	303	0.303	0.647	0.606
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.1666666666667	1	33.91666666666667	0.0410124947055404	0.0300792190929219	1.36348269477485	0.0109332756126184	0.023404238853692	0.0292112979716614	NA	NA	0.0258147344465968	0.671909713531723	656	47	297	0.297	0.656	0.594
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333336	1	33.833333333333336	0.0273067703935705	0.0301548153585304	0.90555256495198	-0.00284804496495982	0.0206145133477628	0.0319019236237171	NA	NA	0.0223243975328612	0.898484963825407	360	119	521	0.521	0.36	0.72
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.25000000000003	1	34.16666666666667	0.0274316291149154	0.0298546878003148	0.918838250742859	-0.00242305868539937	0.0200220709073684	0.0291030324911219	NA	NA	0.020935201559248	0.907857905111528	393	133	474	0.474	0.393	0.786
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.9166666666667	1	34.16666666666667	0.0271830432683088	0.0298546878003148	0.910511724326999	-0.00267164453200596	0.0200428634918948	0.0290774288106104	NA	NA	0.021056056100889	0.899033416689665	377	134	489	0.489	0.377	0.754
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTC:ATATGGGTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000004	1	34.16666666666667	0.0270604324233619	0.0298546878003148	0.906404803304512	-0.00279425537695286	0.0189159801872957	0.0291076114429717	NA	NA	0.0208711679237194	0.893496578424653	359	133	508	0.508	0.359	0.718
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	33.50000000000001	0.0271830432683088	0.0304610393656427	0.89238725382985	-0.00327799609733386	0.0199308033858746	0.0309975434520033	NA	NA	0.0221995220871152	0.882610579481233	357	121	522	0.522	0.357	0.714
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	1	33.333333333333336	0.0271215992572094	0.0306164958901914	0.88584922828802	-0.00349489663298199	0.0196636402933955	0.0291007667769979	NA	NA	0.0231934553475909	0.880224518827589	355	124	521	0.521	0.355	0.71
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	1	33.666666666666664	0.0272447663451876	0.0303071537534075	0.898954965116921	-0.0030623874082199	0.0201841409622918	0.03097620532583	NA	NA	0.0214695047358747	0.88657534185661	378	131	491	0.491	0.378	0.756
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666671	1	34	0.0273690573365762	0.0300040009602743	0.912180257986698	-0.00263494362369817	0.0196037517210496	0.0296545675721975	NA	NA	0.0211766075275857	0.900977126304951	354	126	520	0.52	0.354	0.708
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.66666666666667	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.0194749835523759	0.0305727266591531	NA	NA	0.0223823985399497	0.899997746384752	366	130	504	0.504	0.366	0.732
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333339	1	34.16666666666667	0.0276848040229394	0.0298546878003148	0.927318490419702	-0.00216988377737538	0.0201723596620385	0.0310214610425397	NA	NA	0.0223398369957172	0.922622609147647	378	132	490	0.49	0.378	0.756
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.25000000000006	1	34.50000000000001	0.0278131522748419	0.0295604764056575	0.940889852151329	-0.00174732413081556	0.0201049468996963	0.0310303809834049	NA	NA	0.0208786858523579	0.933303406515294	416	123	461	0.461	0.416	0.832
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	34.16666666666667	0.0271830432683088	0.0298546878003148	0.910511724326999	-0.00267164453200596	0.019693492867244	0.0291045171234687	NA	NA	0.0218433264390598	0.902653973948061	383	131	486	0.486	0.383	0.766
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	35.16666666666667	0.0271830432683088	0.0289891158257093	0.937698253087154	-0.00180607255740051	0.0185778387121372	0.0296598410914713	NA	NA	0.0217185977978416	0.933726003289624	383	128	489	0.489	0.383	0.766
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	1	35.50000000000001	0.0273067703935705	0.0287116399282627	0.951069686782006	-0.00140486953469215	0.0200896112688111	0.0306211568852916	NA	NA	0.0208835620934296	0.946365527546346	440	127	433	0.433	0.44	0.866
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000006	2	35.91666666666667	0.0413898116754681	0.0578600049104132	0.715344074711944	-0.0164701932349452	0.0244603381640722	0.0431259210956139	NA	NA	0.0263956570304183	0.532644920612766	228	46	726	0.726	0.228	0.456
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000006	2	36.16666666666667	0.0559047993353384	0.0574443341110379	0.973199536568331	-0.00153953477569944	0.0271886453687289	0.0405652734292585	NA	NA	0.0296157555721118	0.958541729183919	485	19	496	0.496	0.485	0.97
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATC:GATCACATT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333339	2	36.66666666666667	0.05765141989764	0.0566306643811089	1.01802478441118	0.00102075551653117	0.0286753599497123	0.0398584006088675	NA	NA	0.0281507551848682	0.971074785622356	515	16	469	0.469	0.515	0.938
N	all	ss13	147	ATC	ACA	TCG	2	CACATCGGC:CACATTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000006	2	36.50000000000001	0.0579298692281368	0.0568993130810351	1.01811192598466	0.00103055614710167	0.0281704729285459	0.0395237046702366	NA	NA	0.0308352166896736	0.973338543529962	480	22	498	0.498	0.48	0.96
N	all	ss13	148	GGC	TCG	GCA	2	ATCGGCACC:ATTGGCACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000006	2	35.666666666666664	0.0571024790858329	0.0582817382454872	0.979766232182589	-0.00117925915965433	0.0289245758488623	0.0419054526191954	NA	NA	0.0311787824929036	0.96982921352447	461	23	516	0.516	0.461	0.922
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000006	2	35.666666666666664	0.0579298692281368	0.0582817382454872	0.993962619716861	-3.51869017350404e-4	0.0299512606636788	0.041294618247406	NA	NA	0.0312895523241936	0.991027518190696	492	24	484	0.484	0.492	0.968
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666673	2	35	0.0573756358851215	0.0594370287406054	0.96531803659836	-0.00206139285548391	0.0293861875662471	0.0431217176750138	NA	NA	0.0304614663842882	0.946046621302574	464	17	519	0.519	0.464	0.928
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	2	35.16666666666667	0.0575131971253351	0.0591439311842398	0.972427702618807	-0.00163073405890469	0.0301429966978005	0.0440901025762936	NA	NA	0.0315979602858527	0.958840375876578	464	17	519	0.519	0.464	0.928
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.91666666666673	2	34.833333333333336	0.0577903089878649	0.0597330472949441	0.967476323491643	-0.00194273830707917	0.0297431933533376	0.0429500105840897	NA	NA	0.0312452647905582	0.950421840710129	462	16	522	0.522	0.462	0.924
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	2	34.833333333333336	0.0572387314369154	0.0597330472949441	0.958242280094762	-0.00249431585802863	0.0293946576101186	0.0417741376850642	NA	NA	0.0319411027540517	0.937755586528818	461	23	516	0.516	0.461	0.922
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.0833333333334	1	34.666666666666664	0.042215127927666	0.029415534864961	1.43513038676552	0.0127995930627051	0.0232853331108574	0.0280487536937678	NA	NA	0.0261041505438358	0.623901894229884	664	39	297	0.297	0.664	0.594
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.91666666666673	1	34.5	0.0423143935004423	0.0295604764056575	1.43145167620992	0.0127539170947848	0.0242361062673838	0.0297173278515177	NA	NA	0.0268418166447516	0.634679321141985	657	35	308	0.308	0.657	0.616
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000007	1	34.5	0.0427161696956043	0.0295604764056575	1.44504334468131	0.0131556932899468	0.0256563526340805	0.0299970193545854	NA	NA	0.0254275007345905	0.604890562552171	685	51	264	0.264	0.685	0.528
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	1	34.5	0.0572387314369154	0.0295604764056575	1.93632641948763	0.0276782550312579	0.0289696824766254	0.0296798631622257	NA	NA	0.0296310611575573	0.350254386798543	790	19	191	0.191	0.79	0.382
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	1	34.333333333333336	0.0571024790858329	0.0297068535712844	1.9221988269074	0.0273956255145485	0.0295953656848086	0.0313760164770746	NA	NA	0.0304065349674474	0.367599904182275	776	26	198	0.198	0.776	0.396
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35	0.0429711784958646	0.0291298749871979	1.47515835597474	0.0138413035086667	0.0243384116652026	0.0300666579064036	NA	NA	0.0240899828502075	0.565584334791455	710	41	249	0.249	0.71	0.498
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.66666666666673	1	35.166666666666664	0.0430740368144066	0.0289891158257093	1.48586928533384	0.0140849209886972	0.0247818688649245	0.0296148177180973	NA	NA	0.0250636538297468	0.574139192577507	689	45	266	0.266	0.689	0.532
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.50000000000007	1	35.666666666666664	0.0431773888661084	0.0285748846742028	1.51102583119394	0.0146025041919056	0.0247614256522113	0.0288142321888331	NA	NA	0.0252652069001504	0.563285106919636	700	47	253	0.253	0.7	0.506
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	1	36	0.042564612444337	0.0283052459871352	1.50377115477755	0.0142593664572018	0.0232638044804887	0.0288829724996491	NA	NA	0.0239125781350496	0.550966560002331	672	51	277	0.277	0.672	0.554
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	1	36	0.042564612444337	0.0283052459871352	1.50377115477755	0.0142593664572018	0.0246703727375803	0.0289905187579959	NA	NA	0.0250650128930878	0.569427237711878	683	44	273	0.273	0.683	0.546
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666673	2	36.666666666666664	0.0427669289697661	0.0566306643811089	0.755190309651964	-0.0138637354113428	0.0238960811329533	0.0391926919735913	NA	NA	0.037574018432885103	0.712149097544024	361	9	630	0.63	0.361	0.722
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.0280550353274493	0.0502568931312673	NA	NA	0.0424752715884778	0.498123654050267	259	4	737	0.737	0.259	0.518
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666671	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0291721722309484	0.0511325139730937	NA	NA	0.0425847333757412	0.482664966540732	213	5	782	0.782	0.213	0.426
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.50000000000004	3	37	0.0581404786806199	0.0858077633833082	0.677566648846248	-0.0276672847026883	0.029843386729038	0.0508792253786623	NA	NA	0.0427735260378176	0.517740689888944	252	10	738	0.738	0.252	0.504
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.50000000000004	3	37.666666666666664	0.073408181482178	0.0842004764033108	0.871826201202961	-0.0107922949211328	0.0323680045767643	0.051851781332869	NA	NA	0.045984399345371	0.814445699753685	413	2	585	0.585	0.413	0.826
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.66666666666671	4	38.166666666666664	0.0743181769831732	0.112888706112188	0.658331373816226	-0.0385705291290152	0.0349086599736487	0.0602129448869163	NaN	NaN	0.0583741073181508	0.508774435919941	225	2	773	0.773	0.225	0.45
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.16666666666671	4	38.666666666666664	0.0748750939167602	0.111315003838705	0.672641524814157	-0.0364399099219448	0.0335354625567521	0.0598242913350839	NaN	NaN	0.0529433269655155	0.491275560048278	250	0	750	0.75	0.25	0.5
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0350901831526496	0.0568230413219197	NaN	NaN	0.0544956859924213	0.546251391493715	296	1	703	0.703	0.296	0.592
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.66666666666667	0.0767933639165995	0.10829587866142	0.709106984178861	-0.0315025147448207	0.033752870594391	0.0569266528507876	NaN	NaN	0.0556282396057378	0.571186895613069	283	1	716	0.716	0.283	0.566
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.1666666666667	4	39.333333333333336	0.0771888840017059	0.109283858386045	0.706315508453556	-0.0320949743843393	0.0351145544178152	0.0551379633111019	NaN	NaN	0.0547917507208544	0.558034863397039	286	0	714	0.714	0.286	0.572
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	38.333333333333336	0.0764993759663411	0.112359208671495	0.680846517796352	-0.035859832705154	0.0350058839738256	0.061399257750658	NA	NA	0.0541529160041373	0.507845755385475	237	0	763	0.763	0.237	0.474
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.25000000000003	4	37.333333333333336	0.0759181073184851	0.115613009870444	0.656657130573446	-0.0396949025519586	0.0345192183648446	0.0608594440792025	NaN	NaN	0.0595539246582642	0.505067833440463	251	2	747	0.747	0.251	0.502
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	37.25000000000001	0.076891863117256	0.115892704074692	0.663474579622369	-0.0390008409574361	0.033398515508796	0.0615780904016907	NaN	NaN	0.0589425436589667	0.508179166992986	243	1	756	0.756	0.243	0.486
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	37.25000000000001	0.0761108787135566	0.115892704074692	0.656735722246188	-0.0397818253611355	0.0362479587766775	0.0608863115967841	NaN	NaN	0.0565812897212619	0.481998712459324	236	1	763	0.763	0.236	0.472
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	36.75000000000001	0.0761108787135566	0.117599765999126	0.647202637411047	-0.0414888872855698	0.0341627694706402	0.0620060549575143	NA	NA	0.057409410817129	0.469873783968972	236	0	764	0.764	0.236	0.472
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.08333333333336	4	36.25000000000001	0.0772884020029997	0.119357976360937	0.647534453577536	-0.042069574357937	0.0357184970329966	0.0618404299295742	NA	NA	0.0611885432777401	0.491742469119645	223	1	776	0.776	0.223	0.446
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.08333333333336	4	35.91666666666667	0.0772884020029997	0.120559681536883	0.64108001130838	-0.0432712795338834	0.0357352740324149	0.0668113646430941	NaN	NaN	0.0607061153412143	0.475969928131076	241	2	757	0.757	0.241	0.482
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.91666666666667	0.0764993759663411	0.120559681536883	0.634535318865598	-0.0440603055705421	0.0334347774132952	0.0619960503039392	NA	NA	0.0575440217921508	0.443866740896011	213	5	782	0.782	0.213	0.426
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.41666666666669	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0333125732787584	0.0630219595800779	NA	NA	0.0597733680769734	0.452610151293249	237	1	762	0.762	0.237	0.474
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.41666666666669	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0343827423868334	0.0654796537714254	NA	NA	0.0601746631696605	0.455630047775357	200	0	800	0.8	0.2	0.4
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333334	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0327227650757062	0.0655606627746204	NA	NA	0.0583697954461967	0.433914338356277	224	2	774	0.774	0.224	0.448
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.75000000000001	4	35.583333333333336	0.0753456127890199	0.12178588422283	0.618672790117128	-0.0464402714338104	0.034100754343746	0.0645846721513068	NaN	NaN	0.0614475818956121	0.449786789655731	217	1	782	0.782	0.217	0.434
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	70.91666666666669	5	34.91666666666667	0.089770784493262007	0.158903109406266	0.564940389327097	-0.0691323249130035	0.0371771727247618	0.0776921801808863	NaN	NaN	0.0680340940488961	0.309561599576223	119	0	881	0.881	0.119	0.238
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCG:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.16666666666669	5	34.66666666666667	0.0894358561096487	0.160180575223544	0.558343956405663	-0.0707447191138956	0.0353338813032808	0.0749703628422273	NaN	NaN	0.0697816144792409	0.310677385838532	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCGTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.16666666666669	5	34.66666666666667	0.0894358561096487	0.160180575223544	0.558343956405663	-0.0707447191138956	0.0357736593823704	0.0788042861942062	NaN	NaN	0.0740515770704387	0.339403836633862	128	1	871	0.871	0.128	0.256
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT:TCGTCACGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.83333333333336	5	34.66666666666667	0.0885548256923263	0.160180575223544	0.552843723833188	-0.0716257495312179	0.0350169111943985	0.0812614799761992	NaN	NaN	0.0701516709741303	0.307248404586883	131	2	867	0.867	0.131	0.262
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.036411972133328	0.0786553057330625	NaN	NaN	0.0720017455522926	0.305404469435322	117	1	882	0.882	0.117	0.234
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0364841828675764	0.0778421669685567	NaN	NaN	0.0703989744271513	0.317571452971619	129	0	871	0.871	0.129	0.258
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0345462857269159	0.0781379866914249	NaN	NaN	0.0729626602856144	0.292236709917527	101	0	899	0.899	0.101	0.202
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0348428264782427	0.0842944771755963	NaN	NaN	0.0761927717525324	0.267656048862185	89	0	911	0.911	0.089	0.178
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0307911241086332	0.0741880704004681	NaN	NaN	0.0706460799777214	0.335468567757217	147	1	852	0.852	0.147	0.294
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0272154283788391	0.0803527595140429	NA	NA	0.0660378631488759	0.195452071737394	61	0	939	0.939	0.061	0.122
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0268606851604201	0.078407806712352	NA	NA	0.0726693359057288	0.237889315970249	62	4	934	0.934	0.062	0.124
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0260711561592478	0.0768695814926943	NaN	NaN	0.072252976348713	0.240935614339998	63	1	936	0.936	0.063	0.126
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0263356345989214	0.0743158305385933	NA	NA	0.0681092989949615	0.236497683523364	79	5	916	0.916	0.079	0.158
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0252475395763591	0.0732270512834174	NA	NA	0.067695673255309	0.249918650328038	85	4	911	0.911	0.085	0.17
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.0274650258748709	0.0716889939310004	NaN	NaN	0.0637887357110415	0.255099029433942	94	1	905	0.905	0.094	0.188
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0279746838452118	0.0725256592403871	NA	NA	0.0642251237754587	0.23458215273271	74	2	924	0.924	0.074	0.148
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0273594104701807	0.0738164196306071	NA	NA	0.0663592458918879	0.249974535882291	95	1	904	0.904	0.095	0.19
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0273544260004613	0.0738927845791113	NA	NA	0.0637772263299979	0.244586342963859	74	1	925	0.925	0.074	0.148
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0268867555278891	0.0682459910628878	NA	NA	0.0633395089895417	0.255047230064027	99	3	898	0.898	0.099	0.198
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0274113732436865	0.0703061622605962	NA	NA	0.0642300701118494	0.281409989609038	97	0	903	0.903	0.097	0.194
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0280758635444133	0.0762689638681623	NA	NA	0.0669537445186104	0.279914277719499	91	1	908	0.908	0.091	0.182
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.02469741807908	0.0691440426441566	NA	NA	0.061459049885282	0.175565009358666	46	2	952	0.952	0.046	0.092
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.0240637544135369	0.0689867902085088	NA	NA	0.0617384970106232	0.185244613583782	44	6	950	0.95	0.044	0.088
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0237991835251056	0.0717947726202236	NA	NA	0.0615028438111057	0.162665700889435	36	3	961	0.961	0.036	0.072
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0233228900285797	0.0715165391300337	NA	NA	0.0614684914398951	0.144320101840585	32	5	963	0.963	0.032	0.064
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0244517185441997	0.0696925965624006	NA	NA	0.0630950394288616	0.162294818203493	27	3	970	0.97	0.027	0.054
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0232618528307701	0.0701098595598531	NA	NA	0.0587339220275637	0.148167512621726	25	6	969	0.969	0.025	0.05
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0230539473773137	0.0686103346131735	NA	NA	0.0594902600134758	0.155247634138029	36	7	957	0.957	0.036	0.072
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.0238567306461877	0.0574099396601787	NA	NA	0.0471095285448961	0.257038744988927	77	12	911	0.911	0.077	0.154
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0184886024435377	0.0485253333060194	NA	NA	0.0432497786378644	0.436305495633148	151	39	810	0.81	0.151	0.302
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0194019227461583	0.0466695866022013	NA	NA	0.0415679459665723	0.448190044080743	190	36	774	0.774	0.19	0.38
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	35.58333333333332	0.0272447663451876	0.0584236862456271	0.466330834220972	-0.0311789199004395	0.019114089923244	0.0451806699557918	NA	NA	0.0394692678126916	0.42955442726613	188	45	767	0.767	0.188	0.376
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	2	35.33333333333332	0.0134532755150005	0.0588537115811214	0.228588395762552	-0.0454004360661209	0.0135031098687843	0.0440442825562708	NA	NA	0.0374941526908515	0.22594634220068	0	114	886	0.886	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666673	1	34.99999999999999	0.0407339920153049	0.0291298749871979	1.39835794122724	0.011604117028107	0.0299457731913532	0.030119503679867	NA	NA	0.0341820505084647	0.734248281897802	533	131	336	0.336	0.533	0.672
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.3333333333334	1	34.33333333333332	0.040368487510335	0.0297068535712844	1.35889475516035	0.0106616339390506	0.0309893600486254	0.0300593466182733	NA	NA	0.0331351893921555	0.747633252705631	528	127	345	0.345	0.528	0.69
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666673	1	34.16666666666666	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0305493227602875	0.0333486670289831	NA	NA	0.0329281946152158	0.759835527687275	541	135	324	0.324	0.541	0.648
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0296662220598354	0.0322925210358848	NA	NA	0.0330798296715077	0.766382072336241	533	121	346	0.346	0.533	0.692
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000007	1	34.33333333333332	0.0400094855289695	0.0297068535712844	1.34680993505297	0.0103026319576851	0.0310771550520671	0.0311939441141179	NA	NA	0.0323380261092112	0.750036025166249	503	139	358	0.358	0.503	0.716
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	34.83333333333332	0.0397005575048303	0.0292720079293014	1.35626355392893	0.0104285495755289	0.0299308819030228	0.0320404355587941	NA	NA	0.0329216846910876	0.751419339083554	550	130	320	0.32	0.55	0.64
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	35.16666666666665	0.0396131668795607	0.0289891158257094	1.3664841355537	0.0106240510538513	0.0275146798458102	0.0280747798003008	NA	NA	0.032482163408006	0.743612383360414	550	132	318	0.318	0.55	0.636
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000009	1	35.41666666666665	0.0393532888030902	0.0287805096612114	1.36735899629075	0.0105727791418788	0.0285202445679951	0.0300802057084565	NA	NA	0.0328777730034756	0.747772167133298	529	146	325	0.325	0.529	0.65
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000009	1	35.749999999999986	0.0398765009105086	0.0285069944752382	1.39883216889617	0.0113695064352704	0.0292953092108988	0.0288783953254867	NA	NA	0.0338451975212986	0.736926121659563	530	145	325	0.325	0.53	0.65
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000009	1	35.749999999999986	0.0398765009105086	0.0285069944752382	1.39883216889617	0.0113695064352704	0.0290747495842519	0.0310612746880075	NA	NA	0.0328242118465403	0.729060451589366	541	146	313	0.313	0.541	0.626
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000009	1	36.08333333333332	0.0393532888030902	0.0282386296527663	1.39359768115501	0.0111146591503239	0.0284318038600308	0.0290540259677225	NA	NA	0.0324848119174331	0.732238456888141	555	127	318	0.318	0.555	0.636
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	37.08333333333332	0.0397005575048303	0.0274630224286674	1.44560044721766	0.0122375350761629	0.0285696191965621	0.0286100847432675	NA	NA	0.0320432673151539	0.702530649166083	549	141	310	0.31	0.549	0.62
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	1	37.08333333333332	0.0400540111089282	0.0274630224286674	1.45847061127247	0.0125909886802608	0.0295517279642511	0.0299746182099213	NA	NA	0.031157868542862	0.686136966521852	543	149	308	0.308	0.543	0.616
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.91666666666665	0.0396131668795607	0.0275893176123833	1.43581539188851	0.0120238492671774	0.0295054772191985	0.0298859663316947	NA	NA	0.0307632657398506	0.695907468864875	538	130	332	0.332	0.538	0.664
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000009	1	35.91666666666665	0.0390967990762099	0.0283721774047871	1.37799783634559	0.0107246216714228	0.0290451688293867	0.030219830372654	NA	NA	0.0312735088221965	0.731651187178548	532	132	336	0.336	0.532	0.672
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333343	1	35.91666666666665	0.0394395350433882	0.0283721774047871	1.39007783860585	0.0110673576386011	0.0293678615384343	0.0308626795416233	NA	NA	0.0315500733107767	0.725748101464294	554	132	314	0.314	0.554	0.628
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333343	1	35.91666666666665	0.0394395350433882	0.0283721774047871	1.39007783860585	0.0110673576386011	0.0302028273131077	0.0294612763678197	NA	NA	0.0313714653407284	0.724250221720616	531	127	342	0.342	0.531	0.684
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666676	0	36.08333333333332	0.0262896575662818	0	-Inf	0.0262896575662818	0.0264153942972196	0	NA	NA	0.0259982058667739	0.311915713213103	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000009	0	35.66666666666665	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0254872448713376	0	NA	NA	0.0267842377347534	0.333168117019001	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000009	0	35.66666666666665	0.0257536031856686	0	-Inf	0.0257536031856686	0.0269849409167381	0	NA	NA	0.0255287525518561	0.313066847998452	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.33333333333332	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.025302999819944	0	NA	NA	0.0258170274695794	0.316418980311126	606	394	0	0	0.606	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.999999999999986	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.025540112779535	0	NA	NA	0.0265418652422123	0.329816110549471	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	36.16666666666666	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0266258157133361	0	NA	NA	0.0270856304505132	0.338575492479263	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.0833333333334	0	36.58333333333332	0.0394395350433882	0	-Inf	0.0394395350433882	0.0293233677675428	0	NA	NA	0.0286590127058334	0.168770503241915	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000007	0	36.91666666666666	0.040687942312311	0	-Inf	0.040687942312311	0.030752316957407	0	NA	NA	0.0317737070681216	0.200350425413357	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.0833333333334	0	36.91666666666666	0.0416291816557173	0	-Inf	0.0416291816557173	0.0314497154622334	0	NA	NA	0.0319624661305156	0.192766152293249	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.0833333333334	0	37.08333333333332	0.0416291816557173	0	-Inf	0.0416291816557173	0.0320203602558681	0	NA	NA	0.0307489436173616	0.175787098794809	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.0833333333334	0	36.08333333333332	0.0410592825874941	0	-Inf	0.0410592825874941	0.0312240417953945	0	NA	NA	0.0325392906649789	0.207007426799104	845	155	0	0	0.845	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000007	0	35.91666666666666	0.0409658133601688	0	-Inf	0.0409658133601688	0.0317992891718116	0	NA	NA	0.0303425366262957	0.176980159605171	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	35.58333333333332	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0307153402511347	0	NA	NA	0.0312742647835229	0.192249883558557	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5833333333334	0	35.24999999999999	0.0402331091273881	0	-Inf	0.0402331091273881	0.0302725284200747	0	NA	NA	0.0305865239506216	0.18837994757817	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000006	0	34.416666666666664	0.0401433603117784	0	-Inf	0.0401433603117784	0.029822612257465	0	NA	NA	0.0287974977466951	0.1633212910598	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000006	0	34.666666666666664	0.0402781342288957	0	-Inf	0.0402781342288957	0.0312825588492133	0	NA	NA	0.0309121408755545	0.19257901730431	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000006	0	34.33333333333333	0.0397443976053827	0	-Inf	0.0397443976053827	0.0295808886427185	0	NA	NA	0.0306069112406519	0.19410072882021	857	143	0	0	0.857	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.16666666666673	0	33.666666666666664	0.0388855983989721	0	-Inf	0.0388855983989721	0.0294363833821602	0	NA	NA	0.0304492242106778	0.201579765308741	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.50000000000006	0	33.333333333333336	0.0387182740539804	0	-Inf	0.0387182740539804	0.0295356024068676	0	NA	NA	0.0302344828221939	0.200334254041499	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.8333333333334	0	33.00000000000001	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0293239829261909	0	NA	NA	0.0301820144610008	0.201485868069305	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.00000000000006	0	33.333333333333336	0.0384699707906628	0	-Inf	0.0384699707906628	0.0287138867136587	0	NA	NA	0.0282886093055787	0.173858315367113	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666673	0	32.66666666666667	0.0381438129251182	0	-Inf	0.0381438129251182	0.0289239198959204	0	NA	NA	0.0293514408612919	0.193753517356405	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666673	0	31.41666666666667	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0275460995040888	0	NA	NA	0.0283913244377133	0.1860085477463	844	156	0	0	0.844	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333339	0	31.58333333333334	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.0278735701053558	0	NA	NA	0.0293407962608344	0.198776197228569	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333339	0	31.58333333333334	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.027764035261965	0	NA	NA	0.0279153678876723	0.176803186992315	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333339	0	31.750000000000007	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.0282499742967961	0	NA	NA	0.0281280077887593	0.180098097237041	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.91666666666671	0	31.41666666666667	0.0375469431438597	0	-Inf	0.0375469431438597	0.0290109594440945	0	NA	NA	0.0289909712634295	0.195276975327441	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000004	0	31.91666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.0283649018796217	0	NA	NA	0.0286425400407036	0.183416449412846	884	116	0	0	0.884	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.75000000000004	0	32.91666666666667	0.0385937229566065	0	-Inf	0.0385937229566065	0.028080532402323	0	NA	NA	0.0279501197355716	0.167338288896715	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.4166666666667	0	32.25000000000001	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0303453902020824	0	NA	NA	0.0282031264345008	0.174850741815261	886	114	0	0	0.886	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333337	0	31.750000000000004	0.0377042739400825	0	-Inf	0.0377042739400825	0.0287069483373375	0	NA	NA	0.0281662499954191	0.180690152049476	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.25000000000004	0	31.583333333333332	0.037390920168914	0	-Inf	0.037390920168914	0.0286825563198864	0	NA	NA	0.0282546313871364	0.185717202755497	868	132	0	0	0.868	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333337	0	31.833333333333332	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0276170955651464	0	NA	NA	0.0292324124235925	0.195707979568532	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333337	0	32	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.0124331769574489	0	NA	NA	0.0126913573101687	0.331654321534083	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32.166666666666664	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0121721657514437	0	NA	NA	0.0122128683123586	0.312065500674965	661	339	0	0	0.661	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	31.833333333333332	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0126207858913028	0	NA	NA	0.0118592989699604	0.295866757491456	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	32.666666666666664	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0123038133724344	0	NA	NA	0.0123099367052426	0.311896982218418	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	31.999999999999996	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0120847795772387	0	NA	NA	0.0132214407786053	0.350415795308599	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.49999999999999	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0125467382706065	0	NA	NA	0.0130665934540076	0.343742112034086	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	32.166666666666664	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0117331657436138	0	NA	NA	0.0112901196270825	0.27908253387821	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	31.666666666666664	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0124510393050499	0	NA	NA	0.0122640406125907	0.31904238632565	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.999999999999996	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.012498222155211	0	NA	NA	0.0116368800615388	0.291688575284499	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.83333333333333	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0123379889671643	0	NA	NA	0.0119054294506936	0.302709650496847	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.49999999999999	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0127208374788966	0	NA	NA	0.0123341000518611	0.315848649640676	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.49999999999999	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0129807488967322	0	NA	NA	0.0123162563303781	0.315148035426599	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.83333333333333	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0118263549953453	0	NA	NA	0.0128595390149899	0.33999657483721	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	0	31.999999999999996	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0126859329222355	0	NA	NA	0.0124484319923265	0.325276970424173	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666669	0	32.666666666666664	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0129284066715101	0	NA	NA	0.0121878946500293	0.298983897862073	613	387	0	0	0.613	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000001	0	32.33333333333333	0.012766265677073	0	-Inf	0.012766265677073	0.0130601107449061	0	NA	NA	0.0131742577226873	0.332529663917997	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333336	0	32.33333333333333	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0130982204595288	0	NA	NA	0.0124417487635578	0.300719859599595	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	32.666666666666664	0.0259766224970672	0.0312545223004261	0.831131643842563	-0.00527789980335889	0.0179170165979697	0.0323572907131714	NA	NA	0.0228848170015806	0.817603126343584	344	131	525	0.525	0.344	0.688
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333336	1	32.5	0.0261464386246643	0.0314182062818701	0.832206599895936	-0.00527176765720586	0.0174319169459782	0.0321832700056336	NA	NA	0.0243713282215763	0.828745934025891	329	131	540	0.54	0.329	0.658
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666669	1	32.166666666666664	0.0262035385209603	0.0317507728699206	0.82528821041029	-0.00554723434896023	0.0191531815574996	0.0333104067907365	NA	NA	0.0238269543247533	0.815906303827946	328	129	543	0.543	0.328	0.656
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	1	32.666666666666664	0.0263763446044989	0.0312545223004261	0.843920900500833	-0.00487817769592713	0.0183947529989307	0.0321796377206699	NA	NA	0.023553020325069	0.835920250324102	346	147	507	0.507	0.346	0.692
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	32.416666666666664	0.0262896575662818	0.031500692980973	0.834573943568835	-0.00521103541469126	0.0185006104606134	0.0322033116061487	NA	NA	0.0236913337458756	0.825905934920331	356	117	527	0.527	0.356	0.712
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	1	31.249999999999996	0.0258925390301244	0.0327027281115989	0.79175471054786	-0.00681018908147454	0.0189423507313698	0.0357723273264689	NA	NA	0.0249188525442842	0.784626727630456	337	133	530	0.53	0.337	0.674
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000003	1	30.83333333333333	0.012766265677073	0.0331545693783718	0.385052978109286	-0.0203883037012988	0.0129796723248452	0.035620415236967	NA	NA	0.0213098913304764	0.33869191061466	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	1	30.499999999999996	0.0123969764634079	0.0335251341884302	0.369781561312475	-0.0211281577250223	0.0121591768808969	0.0350255153797636	NA	NA	0.0244688168169399	0.387877569085939	0	341	659	0.659	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.00000000000003	1	31.499999999999996	0.0122953573317573	0.0324374878453625	0.379047766903908	-0.0201421305136052	0.0122363162117497	0.0362209340437816	NA	NA	0.0211656563017513	0.341278501077122	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.66666666666669	1	31.33333333333333	0.0121953906538352	0.0326138339548042	0.373933057693721	-0.0204184433009689	0.012666771127066	0.0335269772209696	NA	NA	0.021745779188058	0.347750656618182	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	1	31.999999999999996	0.0123969764634079	0.0319197108140969	0.388379974229998	-0.019522734350689	0.0127810980270227	0.0335030263300464	NA	NA	0.0210459425042524	0.353602323805223	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666664	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.0294778090563489	0.0334850771813609	NA	NA	0.0330767889411325	0.877722905701821	489	132	379	0.379	0.489	0.758
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC:ACTGATTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.50000000000001	1	31.499999999999996	0.0372747514142044	0.0324374878453625	1.14912571503386	0.00483726356884192	0.0282805007387726	0.0332832820233378	NA	NA	0.0324248339298378	0.881408514361719	487	148	365	0.365	0.487	0.73
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA:GATTATAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.50000000000001	1	31.499999999999996	0.0372747514142044	0.0324374878453625	1.14912571503386	0.00483726356884192	0.0285991343940795	0.0334013996381481	NA	NA	0.0336710023908165	0.885766909847075	497	133	370	0.37	0.497	0.74
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT:TATAAACAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.50000000000001	1	31.166666666666664	0.0368172076473926	0.0327921082603737	1.12274597763154	0.00402509938701895	0.0284093273665747	0.0346131682974908	NA	NA	0.0332184722451443	0.903555977688016	513	119	368	0.368	0.513	0.736
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000001	2	31.166666666666664	0.0495024994789391	0.0670837952639451	0.737920376808865	-0.017581295785006	0.0304776482302713	0.0490812744279248	NA	NA	0.0419875037590543	0.675415760111417	307	37	656	0.656	0.307	0.614
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000001	2	31.499999999999996	0.0501230313618422	0.0663415654213976	0.7555298257354	-0.0162185340595554	0.0303644627789535	0.0478759980548386	NA	NA	0.0396030827147967	0.682152912082021	340	46	614	0.614	0.34	0.68
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	31.83333333333333	0.0507593239355005	0.0656155905923368	0.773586330280301	-0.0148562666568364	0.030658596775968	0.0472809091116806	NA	NA	0.0424759237886865	0.726520807511251	363	45	592	0.592	0.363	0.726
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.16666666666669	2	30.83333333333333	0.0503333482845312	0.0678428326164385	0.741911066259567	-0.0175094843319073	0.0320469088672892	0.0521146869262345	NA	NA	0.0405967335913135	0.666248224317282	323	48	629	0.629	0.323	0.646
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	29.83333333333333	0.0510835693943593	0.0702267037754945	0.727409470301592	-0.0191431343811352	0.0313039565128994	0.053864535727995	NA	NA	0.0436077487371625	0.660672624490131	299	41	660	0.66	0.299	0.598
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.166666666666664	0.0511925740908369	0.0719113287774619	0.711884691343395	-0.020718754686625	0.0316102814564819	0.0545952557653861	NA	NA	0.0432625710313365	0.632004682660088	308	50	642	0.642	0.308	0.616
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333336	2	29.333333333333332	0.0508669472540708	0.0714826348532437	0.711598661108427	-0.0206156875991729	0.0332116001468878	0.0520563548730322	NA	NA	0.0457758036786176	0.652449359953293	303	49	648	0.648	0.303	0.606
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	29.666666666666664	0.0510835693943593	0.0706404112947758	0.723149376653433	-0.0195568419004165	0.0302730318309323	0.0515245777532603	NA	NA	0.0448360276834943	0.662701876397704	319	38	643	0.643	0.319	0.638
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000001	2	30.166666666666668	0.0514119856124207	0.0694136680239339	0.740660839226849	-0.0180016824115131	0.0302766579719662	0.0519975159840696	NA	NA	0.0443732671226196	0.684972184785706	291	56	653	0.653	0.291	0.582
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	30.166666666666668	0.0509750280987295	0.0694136680239339	0.734365861218475	-0.0184386399252044	0.0299097408818884	0.0500600692166722	NA	NA	0.0430866869583628	0.668692723788174	330	37	633	0.633	0.33	0.66
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	30.166666666666668	0.0509750280987295	0.0694136680239339	0.734365861218475	-0.0184386399252044	0.0323293166430609	0.0506960973531333	NA	NA	0.0425202024870825	0.664546820207498	311	61	628	0.628	0.311	0.622
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.833333333333332	0.0511925740908369	0.0702267037754945	0.728961653312005	-0.0190341296846576	0.0326017380219875	0.0509102053079073	NA	NA	0.0442671955088093	0.667208202092191	306	53	641	0.641	0.306	0.612
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	29.833333333333332	0.0507593239355005	0.0702267037754945	0.722792345455531	-0.019467379839994	0.0321937407912334	0.0532054716169725	NA	NA	0.0431074973867741	0.651556601375164	284	49	667	0.667	0.284	0.568
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	28.833333333333336	0.0501230313618422	0.0727843418621031	0.688651296137362	-0.022661310500261	0.0303133063929132	0.055499302396416	NA	NA	0.0453172581785485	0.617033414831231	322	48	630	0.63	0.322	0.644
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	28.5	0.049502499478939	0.0736788296875599	0.671868699446744	-0.0241763302086209	0.0312160730136824	0.0568826771555578	NA	NA	0.0463771192544978	0.602158733029928	263	41	696	0.696	0.263	0.526
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	28.833333333333336	0.0501230313618422	0.0727843418621031	0.688651296137362	-0.022661310500261	0.0300484944585449	0.0530171011195174	NA	NA	0.0448863870843556	0.613657653658936	273	50	677	0.677	0.273	0.546
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.6666666666667	2	28.166666666666668	0.0500185308740041	0.0745955951479785	0.67052928225561	-0.0245770642739744	0.0305654774075298	0.0526269999951324	NA	NA	0.0448746755272709	0.583910086572314	243	40	717	0.717	0.243	0.486
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	27.5	0.0496048518784087	0.0764993759663411	0.648434725797428	-0.0268945240879324	0.030031238636239	0.0596070461262347	NA	NA	0.0474661143521175	0.570982772379742	235	52	713	0.713	0.235	0.47
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	27.666666666666668	0.0499144653819543	0.0760143706952156	0.65664511756717	-0.0260999053132613	0.0317459133631704	0.058081902036815	NA	NA	0.0486684499066202	0.59176520711745	239	51	710	0.71	0.239	0.478
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.6666666666667	2	27.833333333333336	0.0500185308740041	0.0755354817013731	0.662185899227474	-0.0255169508273689	0.0290057658214666	0.055754788200385	NA	NA	0.0482562493314853	0.596957910803158	270	50	680	0.68	0.27	0.54
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	28.166666666666668	0.0498108321742552	0.0745955951479785	0.667744952975351	-0.0247847629737233	0.0315070080213664	0.0558115595388452	NA	NA	0.0473823033595216	0.600918175492358	279	45	676	0.676	0.279	0.558
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.6666666666667	2	27.66666666666667	0.0494005687407186	0.0760143706952156	0.649884597989942	-0.0266138019544969	0.0300721770487284	0.0586472204602009	NA	NA	0.0466581597940547	0.568406609671416	237	48	715	0.715	0.237	0.474
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.33333333333336	2	27.66666666666667	0.0489970106942918	0.0760143706952156	0.644575627557957	-0.0270173600009238	0.0303075731023297	0.0606240310617343	NA	NA	0.0472639030710979	0.567574170851046	254	55	691	0.691	0.254	0.508
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.00000000000003	2	27.66666666666667	0.0491979618643599	0.0760143706952156	0.647219222028717	-0.0268164088308557	0.0308443808900356	0.0582372436166745	NA	NA	0.0479081289606995	0.575652341338001	241	38	721	0.721	0.241	0.482
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	28.66666666666667	0.0498108321742552	0.073228852172937	0.680207741842275	-0.0234180199986817	0.0304112709153217	0.0570397106333546	NA	NA	0.0470865511985841	0.618949389344092	280	47	673	0.673	0.28	0.56
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	29.08333333333334	0.0496561870198999	0.0721276112438599	0.688449071909712	-0.02247142422396	0.0301882264584678	0.053107368252148	NA	NA	0.0435085077687718	0.60551679459794	273	46	681	0.681	0.273	0.546
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.00000000000003	2	29.000000000000004	0.0491979618643599	0.0723451996406717	0.68004459326561	-0.0231472377763117	0.0296028859756622	0.0533983208819869	NA	NA	0.0460435186112976	0.615157479429265	276	40	684	0.684	0.276	0.552
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.66666666666669	3	29.33333333333334	0.0494005687407186	0.109952605643907	0.449289659407506	-0.0605520369031879	0.0316166442437335	0.0649366041800642	NA	NA	0.0648436710131271	0.350398978496721	147	21	832	0.832	0.147	0.294
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.33333333333336	3	29.33333333333334	0.0489970106942918	0.109952605643907	0.445619368521142	-0.0609555949496148	0.0296982731053059	0.0706906634938257	NA	NA	0.0611199102975576	0.318613289507949	143	10	847	0.847	0.143	0.286
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.00000000000003	3	28.33333333333334	0.0480163940736983	0.114143861506444	0.42066558323846	-0.0661274674327457	0.0304555207271359	0.0737032313337889	NA	NA	0.0632688526776611	0.295938850398958	121	16	863	0.863	0.121	0.242
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.00000000000003	4	28.33333333333334	0.0480163940736983	0.156408563919793	0.306993382397663	-0.108392169846095	0.0303756414563378	0.0889892584887436	NA	NA	0.0843225162997774	0.198635942937079	57	3	940	0.94	0.057	0.114
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.33333333333336	4	28.66666666666667	0.0484038908531784	0.154389040653111	0.313518956063303	-0.105985149799933	0.0305282194209183	0.0916767636489643	NA	NA	0.0817367345180857	0.194746531956519	57	1	942	0.942	0.057	0.114
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.00000000000003	4	28.33333333333334	0.0597926053740288	0.156408563919793	0.38228472837773	-0.096615958545764	0.032546429293672	0.0907033048446448	NaN	NaN	0.0894789872598658	0.280248434203587	84	0	916	0.916	0.084	0.168
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.6666666666667	4	29.000000000000004	0.0593194416279121	0.152421181209951	0.389181091217257	-0.0931017395820392	0.0316698592903305	0.085404885783826	NaN	NaN	0.0842559919751944	0.269165408475577	117	2	881	0.881	0.117	0.234
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.6666666666667	4	29.000000000000004	0.0593194416279121	0.152421181209951	0.389181091217257	-0.0931017395820392	0.0317616657836035	0.0894865827604783	NaN	NaN	0.0763499946215191	0.222689646629688	84	0	916	0.916	0.084	0.168
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.33333333333337	3	29.66666666666667	0.0472597258715505	0.108623210908842	0.435079440905236	-0.0613634850372915	0.0298094080020836	0.0687473523814175	NA	NA	0.0683428982708148	0.369251373087347	157	4	839	0.839	0.157	0.314
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.16666666666671	3	30.000000000000004	0.0473530022028017	0.107325632730505	0.441208693562565	-0.0599726305277032	0.0290417075748977	0.0707181134164541	NA	NA	0.0687361384621261	0.382932893763576	166	12	822	0.822	0.166	0.332
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.25000000000006	3	29.58333333333334	0.0467532063321102	0.108952531416164	0.429115374598575	-0.0621993250840537	0.0278556018131291	0.0702413044163916	NA	NA	0.0691966916385192	0.36871809936347	152	4	844	0.844	0.152	0.304
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0272939543430542	0.0699164299353431	NA	NA	0.0710725032737167	0.373008116110575	154	7	839	0.839	0.154	0.308
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0278044769176242	0.0756164637142245	NA	NA	0.0712074777585997	0.365328392705848	140	7	853	0.853	0.14	0.28
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0276372734847234	0.0737290754808526	NA	NA	0.0700264331239789	0.357297723532392	145	5	850	0.85	0.145	0.29
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.0368495957828204	0.0725685195228705	NA	NA	0.0711786108969241	0.582078784756497	296	1	703	0.703	0.296	0.592
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0406995532792123	0.070132506624096	NA	NA	0.068781039644555	0.622529480576262	348	3	649	0.649	0.348	0.696
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0375724864566572	0.0650864734816549	NaN	NaN	0.0726489184655327	0.65581110172074	315	5	680	0.68	0.315	0.63
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0398882665985395	0.0675281877794663	NA	NA	0.0762807522547908	0.670836347557646	327	0	673	0.673	0.327	0.654
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.0402539297696295	0.0679738815860522	NA	NA	0.0741270656095839	0.677387122312988	307	2	691	0.691	0.307	0.614
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.03012377265457	0.0667366372165054	NA	NA	0.0693100705721464	0.42222792329888	194	11	795	0.795	0.194	0.388
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0297745931470788	0.0668723049769724	NA	NA	0.0725058826835615	0.448884306713076	199	6	795	0.795	0.199	0.398
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.0314656396587226	0.0650279726490208	NA	NA	0.0657115263989131	0.419332394538642	208	4	788	0.788	0.208	0.416
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0326912852874503	0.064188092974375	NA	NA	0.0675515356624653	0.466524826784219	217	6	777	0.777	0.217	0.434
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.0293992756978584	0.0482080601067779	NA	NA	0.0616452783548944	0.655171667512226	303	20	677	0.677	0.303	0.606
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.0278020770363783	0.062499214457687	NA	NA	0.0699106560176414	0.366522764158416	148	6	846	0.846	0.148	0.296
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.0280005640844548	0.067127850471857	NA	NA	0.0739554030008544	0.36295776372324	160	5	835	0.835	0.16	0.32
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAT:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0284822571295508	0.0710194930265512	NA	NA	0.0751347057297463	0.367300480632278	140	4	856	0.856	0.14	0.28
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.028229079783563	0.0674144130631211	NA	NA	0.0684349519343314	0.334650604086556	176	5	819	0.819	0.176	0.352
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0271838116101125	0.0619980054305518	NA	NA	0.0703319727465035	0.375227135753885	176	5	819	0.819	0.176	0.352
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0314102249829748	0.0660620512411587	NA	NA	0.0690382265106312	0.480407131119971	249	2	749	0.749	0.249	0.498
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0290417267266158	0.0675920690629329	NA	NA	0.0720402907508471	0.487667102455215	230	1	769	0.769	0.23	0.46
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0295173925693109	0.0760001729846745	NA	NA	0.085430687116772	0.285255410656653	120	0	880	0.88	0.12	0.24
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0298715462710511	0.0785636935987449	NaN	NaN	0.0957977947520606	0.330908647491491	108	0	892	0.892	0.108	0.216
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0394760897437442	0.0840089783590038	NaN	NaN	0.100176519435027	0.464048389088101	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0393384630078776	0.0869158596629282	NaN	NaN	0.0976337046621853	0.458872388075156	211	0	789	0.789	0.211	0.422
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0405389226451434	0.0884870972479242	NA	NA	0.0982717825382581	0.471136558166868	219	0	781	0.781	0.219	0.438
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0397757858101825	0.0846689925411942	NaN	NaN	0.0971570849958435	0.487507586257597	248	0	752	0.752	0.248	0.496
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.042135797321177	0.0820674122380292	NaN	NaN	0.0983257131458269	0.496152655972407	243	0	757	0.757	0.243	0.486
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0432246802629185	0.0944900164066744	NA	NA	0.100932087751611	0.479836106734074	209	0	791	0.791	0.209	0.418
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0487747625133339	0.0937945767140417	NaN	NaN	0.108818173617238	0.390700849399775	147	0	853	0.853	0.147	0.294
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0465938111860382	0.096754097349401	NaN	NaN	0.100665879315292	0.395995070417175	163	0	837	0.837	0.163	0.326
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0456768857307285	0.0919970743612688	NaN	NaN	0.102237502050263	0.424608285997096	177	1	822	0.822	0.177	0.354
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0462054804029289	0.088569650024722	NA	NA	0.101610691549907	0.436414553575071	190	0	810	0.81	0.19	0.38
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0466380317020065	0.0942880468942342	NaN	NaN	0.108270678369552	0.441724891355319	172	0	828	0.828	0.172	0.344
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0468574806607237	0.0903776792622421	NaN	NaN	0.105138805714694	0.449858590799766	195	0	805	0.805	0.195	0.39
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0463913581493364	0.0959524874076842	NaN	NaN	0.0995243934696552	0.429985457432404	207	1	792	0.792	0.207	0.414
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417146.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0305628613000342	0.0483554473974411	NaN	NaN	0.0586047485453527	0.888180603045671	551	2	447	0.447	0.551	0.894
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0299113988677814	0.0454511002673956	NaN	NaN	0.0566660415025278	0.877765991272694	593	0	407	0.407	0.593	0.814
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0317028140493389	0.0439554634903411	NaN	NaN	0.0576713936973746	0.884309837370344	584	0	416	0.416	0.584	0.832
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0310331888852357	0.0458886027134432	NA	NA	0.0557096921064095	0.857710136028844	584	0	416	0.416	0.584	0.832
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0315713775385768	0.0445767404975033	NaN	NaN	0.0551258435567682	0.816766675866009	589	0	411	0.411	0.589	0.822
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0318577131126022	0.0428186988343071	NA	NA	0.0558099277617542	0.806300107905627	658	0	342	0.342	0.658	0.684
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0331921139450392	0.0447694710657598	NA	NA	0.0552591737771576	0.827114315660455	636	0	364	0.364	0.636	0.728
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0319455187677037	0.0438385570427804	NA	NA	0.0553749561950877	0.817472054323867	584	4	412	0.412	0.584	0.824
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0316348779201233	0.0420344053359299	NaN	NaN	0.055408720538019	0.805161738305732	623	1	376	0.376	0.623	0.752
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0308621305474273	0.0439426744231954	NaN	NaN	0.0570872986815078	0.825896096443543	586	0	414	0.414	0.586	0.828
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0312318641470877	0.0430032949618146	NA	NA	0.0530667375557633	0.823111343394282	601	1	398	0.398	0.601	0.796
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0275709294431494	0.0406242992545569	NaN	NaN	0.0512398278593936	0.983345636813044	503	4	493	0.493	0.503	0.986
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0294706696224285	0.0415389673711583	NA	NA	0.0509281441268974	0.9813697550038	517	6	477	0.477	0.517	0.954
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0318585089995413	0.0429475037753335	NaN	NaN	0.0554563734497714	0.827189195175999	583	3	414	0.414	0.583	0.828
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0304725035905856	0.0426406492333239	NA	NA	0.0538471190044986	0.822109816218576	623	1	376	0.376	0.623	0.752
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0332215682335497	0.0435683115964407	NaN	NaN	0.0543553351800062	0.659586173824751	686	0	314	0.314	0.686	0.628
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0323172328843908	0.0423753358274265	NaN	NaN	0.0562637501614385	0.680220408966297	658	0	342	0.342	0.658	0.684
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0337637764603027	0.0431680716496083	NaN	NaN	0.0552724527617853	0.667379703729372	681	0	319	0.319	0.681	0.638
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.032364342518655	0.0434771141716237	NaN	NaN	0.0576291761994275	0.666918673014377	664	0	336	0.336	0.664	0.672
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0326473750518849	0.0440639106090808	NA	NA	0.0558531931178163	0.678910339362707	693	1	306	0.306	0.693	0.612
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0332606582153958	0.0420027500755727	NaN	NaN	0.0560077103160742	0.677053783227633	693	0	307	0.307	0.693	0.614
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.032337776679376	0.0310376491733746	NaN	NaN	0.0460869624779625	0.259006478275507	867	1	132	0.132	0.867	0.264
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0328712393278873	0.0294154541081124	NaN	NaN	0.0451455274308071	0.230880631866754	896	0	104	0.104	0.896	0.208
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0329490956267589	0.029333622856786	NaN	NaN	0.0477118322317601	0.27295217557586	864	2	134	0.134	0.864	0.268
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0333431805710243	0.0302786516995718	NA	NA	0.046235445032298	0.260910101108605	867	0	133	0.133	0.867	0.266
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.028948176034833	0.0306480351270094	NA	NA	0.0446064677894574	0.407745894280127	788	2	210	0.21	0.788	0.42
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0266450270991347	0.0313102764040576	NA	NA	0.0403128443221556	0.55796534917276	712	9	279	0.279	0.712	0.558
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0254758006321027	0.0293653666507753	NA	NA	0.0418856308132512	0.568577108051924	717	8	275	0.275	0.717	0.55
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0257283485300264	0.0314542605248618	NA	NA	0.041353808532925	0.585447576872282	724	5	271	0.271	0.724	0.542
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0257131370525476	0.0447762678668795	NaN	NaN	0.0537501795676344	0.897578098917774	487	2	511	0.511	0.487	0.974
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0272543597066186	0.0454514855446876	NA	NA	0.049512812780369	0.92874167804895	462	1	537	0.537	0.462	0.924
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0238464752456538	0.0422442095155236	NA	NA	0.0503946490215747	0.707798318259933	344	7	649	0.649	0.344	0.688
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.022573217287092998	0.0426601795604857	NA	NA	0.0491132072452926	0.683882100498338	340	3	657	0.657	0.34	0.68
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0184712661016379	0.0435937962205336	NA	NA	0.0467993447338818	0.475742072943073	228	17	755	0.755	0.228	0.456
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0183083119873879	0.0423386724126628	NA	NA	0.0462994873678271	0.473391892516111	225	21	754	0.754	0.225	0.45
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0183056160373733	0.0431796544124722	NA	NA	0.048358466455355	0.474203754240629	212	10	778	0.778	0.212	0.424
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0183482790300772	0.0441935841195508	NA	NA	0.0471810814254129	0.479032488559596	228	17	755	0.755	0.228	0.456
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0178896150055405	0.0302397473908938	NA	NA	0.0356047856605225	0.937860122800153	480	47	473	0.473	0.48	0.946
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0186912500987665	0.0288744842582426	NA	NA	0.0346783402223802	0.945395060029202	467	62	471	0.471	0.467	0.934
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0190253900862552	0.0281351875402985	NA	NA	0.0350043181366444	0.963235388106415	453	53	494	0.494	0.453	0.906
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0186492828388536	0.0277667259044604	NA	NA	0.0354349657092499	0.972360283567117	504	55	441	0.441	0.504	0.882
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0188284424459481	0.028422531711706	NA	NA	0.0344860070108228	0.979124551956783	502	40	458	0.458	0.502	0.916
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0190796896802457	0.0299793065903442	NA	NA	0.0340945685211626	0.975861585998412	504	37	459	0.459	0.504	0.918
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.0186245637893429	0.0293420821229452	NA	NA	0.0352427448814996	0.959883164531133	459	36	505	0.505	0.459	0.918
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.018835774657347	0.0444799665823352	NA	NA	0.0476066939427944	0.50565692362577	242	7	751	0.751	0.242	0.484
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.019032261220257	0.0436726774038853	NA	NA	0.0464132276475688	0.486945106957959	234	10	756	0.756	0.234	0.468
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0189813850076499	0.0417937437689696	NA	NA	0.0476584206264513	0.498397912475523	207	21	772	0.772	0.207	0.414
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0192722625289276	0.0441943693467392	NA	NA	0.0497194924207862	0.519536584197915	240	11	749	0.749	0.24	0.48
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0193758632648077	0.0428855789653738	NA	NA	0.0490656823818651	0.52323946397012	256	12	732	0.732	0.256	0.512
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0189602226580278	0.0446633036348525	NA	NA	0.0474197041508629	0.508921562764329	239	13	748	0.748	0.239	0.478
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0190368337810063	0.0440684258250964	NA	NA	0.0492592781685545	0.52163361947459	228	15	757	0.757	0.228	0.456
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0189028815137929	0.0426346980563665	NA	NA	0.0482238801425158	0.498881285916932	231	15	754	0.754	0.231	0.462
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0186574674655157	0.0445196970519938	NA	NA	0.0505708394988243	0.497254951964004	219	22	759	0.759	0.219	0.438
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0230116706706061	0.0462043006358988	NA	NA	0.0523868745820798	0.672439932713508	341	4	655	0.655	0.341	0.682
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0231753531488629	0.0488313694296557	NA	NA	0.0548271069627191	0.669254040751009	328	5	667	0.667	0.328	0.656
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0227526494872261	0.048417757776012	NA	NA	0.056686363769317	0.685833077556247	360	7	633	0.633	0.36	0.72
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0220567680772269	0.0466704931273916	NA	NA	0.0515595348196848	0.656508053039283	314	5	681	0.681	0.314	0.628
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0216931788398378	0.0486117365361034	NA	NA	0.0558348188126227	0.663480076266719	337	10	653	0.653	0.337	0.674
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0222485042769206	0.0476229442811867	NA	NA	0.0524390068492163	0.617176509133952	312	8	680	0.68	0.312	0.624
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0221967718702418	0.0478158605953391	NA	NA	0.0524370239265739	0.645555686685971	337	5	658	0.658	0.337	0.674
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0223391713813408	0.0487989279773596	NA	NA	0.0518202310244748	0.666053337672134	344	7	649	0.649	0.344	0.688
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0223112631789369	0.0481838684738932	NA	NA	0.0526925543585357	0.664668267008765	336	2	662	0.662	0.336	0.672
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0230491917482591	0.0468417974484636	NA	NA	0.0546362091381557	0.686419308653861	331	11	658	0.658	0.331	0.662
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.0189929217452621	0.0474289543578604	NA	NA	0.0503642170835999	0.492999185108322	225	17	758	0.758	0.225	0.45
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.0197590305171693	0.0488895685707948	NA	NA	0.0546745294422068	0.504099445312857	241	13	746	0.746	0.241	0.482
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.0138816942288938	0.0464357066499462	NA	NA	0.0507359871789163	0.323964881876534	101	41	858	0.858	0.101	0.202
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0134487747860377	0.0472272663829147	NA	NA	0.0494232698138532	0.326921537230303	111	39	850	0.85	0.111	0.222
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0139623031276742	0.0469354396860241	NA	NA	0.0466791803733364	0.299287045590075	103	49	848	0.848	0.103	0.206
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0134049129606511	0.0467350431817089	NA	NA	0.0485269352297978	0.315796401527953	100	45	855	0.855	0.1	0.2
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0145346011342321	0.0487384345960407	NA	NA	0.0515286653621	0.34658666977976	129	51	820	0.82	0.129	0.258
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0200398534344467	0.0484160533982554	NA	NA	0.0507015110599915	0.510992849545633	243	11	746	0.746	0.243	0.486
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0203321174672007	0.0458393698165833	NA	NA	0.0508566278799184	0.512282526951728	244	19	737	0.737	0.244	0.488
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.0204009484748633	0.0480803994552987	NA	NA	0.0558024692279626	0.531813924414412	250	18	732	0.732	0.25	0.5
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0199739778100713	0.0479695028942759	NA	NA	0.0520089144039128	0.521672482392923	266	16	718	0.718	0.266	0.532
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0198466699448543	0.0489646503166864	NA	NA	0.0511662155791008	0.514838122933725	238	13	749	0.749	0.238	0.476
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0204722592236721	0.0442663405908557	NA	NA	0.0515972042831014	0.541120890279705	256	21	723	0.723	0.256	0.512
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0198621906555805	0.0463529379236135	NA	NA	0.0506454993762116	0.529959170517434	276	13	711	0.711	0.276	0.552
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.020367904793035	0.0457159807840581	NA	NA	0.0496515369029123	0.521755633173546	263	15	722	0.722	0.263	0.526
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.024772783206302	0.0456924409276394	NA	NA	0.0536530522939318	0.741956627863702	389	5	606	0.606	0.389	0.778
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0248229285788452	0.0322412264208745	NA	NA	0.0438923148387272	0.76489448854808	605	18	377	0.377	0.605	0.754
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	33.83333333333333	0.0431256509016318	0.0301548153585304	1.43014143475537	0.0129708355431015	0.0257174089154308	0.0319246647284395	NA	NA	0.041238229525685	0.753115308627335	665	11	324	0.324	0.665	0.648
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	34.49999999999999	0.0438614614252191	0.0603340239140544	0.72697722743803	-0.0164725624888354	0.0262791560473889	0.0440031974433914	NA	NA	0.051697188818655	0.750002888131573	392	3	605	0.605	0.392	0.784
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.49999999999999	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.02449311372269	0.0405754913620873	NA	NA	0.0528899199731157	0.787265900087096	398	7	595	0.595	0.398	0.796
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.666666666666664	0.0448452368647073	0.0582817382454872	0.769456063163656	-0.0134365013807799	0.0254155317221529	0.0435096298336541	NA	NA	0.0535518528003712	0.80188649377482	425	7	568	0.568	0.425	0.85
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	35.666666666666664	0.0451830456487547	0.0582817382454872	0.775252197496928	-0.0130986925967325	0.0242858875249236	0.041434471396853	NA	NA	0.051422771526212	0.798935098455289	398	5	597	0.597	0.398	0.796
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	36	0.0454110940157692	0.0577207808520962	0.786737347371142	-0.012309686836327	0.0272119341078487	0.0422883859946354	NA	NA	0.0524194338237283	0.814340220239117	454	4	542	0.542	0.454	0.908
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	36.33333333333333	0.0451830456487547	0.0571705240409132	0.790320648738853	-0.0119874783921585	0.0253124010969858	0.0453507479115313	NA	NA	0.0499155636331688	0.810210001279547	403	5	592	0.592	0.403	0.806
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0249585031507116	0.0426784247267948	NA	NA	0.0499953816058152	0.792459925536226	407	9	584	0.584	0.407	0.814
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	2	35.666666666666664	0.0444026073250892	0.0582817382454872	0.76186141082584	-0.013879130920398	0.0252503549326414	0.042700830946988	NA	NA	0.0530409673218639	0.793577310462518	446	6	548	0.548	0.446	0.892
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0455259839052049	0.0579999025523778	0.784932075775332	-0.0124739186471729	0.0253981268848032	0.0428461583836525	NA	NA	0.0506766071440294	0.805568077330483	441	4	555	0.555	0.441	0.882
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.166666666666664	0.045296782717305	0.0591439311842398	0.765873722127137	-0.0138471484669348	0.0254889547798616	0.0428631899507965	NA	NA	0.0539848661656835	0.797564347169243	408	5	587	0.587	0.408	0.816
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	34.99999999999999	0.0451830456487547	0.0594370287406054	0.760183451395967	-0.0142539830918507	0.0261742289286964	0.0431566716442418	NA	NA	0.0542921602573819	0.792903456604253	442	5	553	0.553	0.442	0.884
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333337	2	34.99999999999999	0.0450698784927921	0.0594370287406054	0.758279467324749	-0.0143671502478133	0.0261082283316574	0.0441118403320674	NA	NA	0.0526513788035113	0.784950687861546	399	4	597	0.597	0.399	0.798
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000004	2	35.74999999999999	0.0447894260262166	0.0581404786806199	0.770365622069541	-0.0133510526544033	0.0250917691997968	0.0432850218134314	NA	NA	0.0529476928244878	0.800920862558822	419	5	576	0.576	0.419	0.838
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000004	1	35.74999999999999	0.0444574574471551	0.0285069944752381	1.55952804795932	0.015950462971917	0.0245733802375328	0.0296836704535683	NA	NA	0.0385895973526479	0.679360587468093	659	15	326	0.326	0.659	0.652
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.6666666666667	1	36.24999999999999	0.0443478924201168	0.0281063333749098	1.57786118269364	0.0162415590452071	0.0241235562526913	0.0293320535886637	NA	NA	0.0385203574543963	0.673290922188044	698	18	284	0.284	0.698	0.568
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	36.58333333333333	0.0442388662657619	0.02784542552167	1.58873012126656	0.0163934407440919	0.0262730275528182	0.0277040851905091	NA	NA	0.0391939426461499	0.675753631549694	693	17	290	0.29	0.693	0.58
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.91666666666666	0.0438080716173109	0.0283721774047871	1.54405039106795	0.0154358942125237	0.0249713120126497	0.0288888732971259	NA	NA	0.0396826140982123	0.697288126787261	663	20	317	0.317	0.663	0.634
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0257747242533309	0.0296360084955108	NA	NA	0.0394347940499669	0.68742460578155	699	17	284	0.284	0.699	0.568
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0249017842315246	0.0283982593538058	NA	NA	0.0391179209491772	0.685027884859206	665	11	324	0.324	0.665	0.648
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0252853379342329	0.029008047954129	NA	NA	0.0386393591870772	0.681339899387146	665	18	317	0.317	0.665	0.634
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.1666666666667	1	36.58333333333333	0.0440224147463932	0.02784542552167	1.58095679709164	0.0161769892247232	0.0252363702903517	0.0294314176478908	NA	NA	0.0384464298547265	0.673925225846156	656	14	330	0.33	0.656	0.66
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	2	37.74999999999999	0.0597330472949441	0.0549444688504895	1.08715305734386	0.00478857844445458	0.0301908195992251	0.0398836009565978	NA	NA	0.0396301801809452	0.903824413001683	537	5	458	0.458	0.537	0.916
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000003	2	38.166666666666664	0.0446228241484838	0.0543223783836108	0.821444595694406	-0.00969955423512708	0.0245186257852715	0.0366274020695131	NA	NA	0.0371478549424481	0.79401021630967	412	10	578	0.578	0.412	0.824
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	38.666666666666664	0.0445124432883257	0.0535942229866087	0.830545547781292	-0.00908177969828305	0.0252222180413651	0.0372793592448337	NA	NA	0.0374856549077946	0.808568269196514	454	8	538	0.538	0.454	0.908
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	37.99999999999999	0.0445124432883257	0.0545695157118212	0.81570163685149	-0.0100570724234956	0.0269990233288187	0.0403536012792582	NA	NA	0.0393858660257347	0.798454911962898	409	16	575	0.575	0.409	0.818
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	37.99999999999999	0.0445124432883257	0.0545695157118212	0.81570163685149	-0.0100570724234956	0.0265893128472813	0.0371028934843841	NA	NA	0.0389121802392086	0.796055280734388	395	13	592	0.592	0.395	0.79
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333336	2	38.166666666666664	0.0600320307551523	0.0543223783836108	1.10510681861573	0.00570965237154143	0.0298057121450625	0.0382514167693775	NA	NA	0.0391673231489076	0.884098289785772	579	6	415	0.415	0.579	0.83
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	67.66666666666669	2	38.83333333333333	0.0615730216404005	0.0533558250189308	1.15400748875225	0.00821719662146974	0.0310586102388198	0.0377984005162881	NA	NA	0.0403198021210626	0.838509386800128	622	5	373	0.373	0.622	0.746
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.16666666666669	2	37.83333333333333	0.0611024764460932	0.0548189130040021	1.11462400652914	0.00628356344209104	0.0306409619761754	0.0402787047372315	NA	NA	0.0423140684947375	0.881949598268718	569	5	426	0.426	0.569	0.852
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.00000000000003	2	36.99999999999999	0.0612585232607003	0.0561009098120238	1.09193457763801	0.00515761344867654	0.0314226323633319	0.0404544440357958	NA	NA	0.0411512116833282	0.900259761821287	586	8	406	0.406	0.586	0.812
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	36.33333333333333	0.0606390724718212	0.0571705240409132	1.06067022279568	0.00346854843090798	0.0304503222617122	0.0407619888664552	NA	NA	0.0424808682738663	0.934925310502786	572	6	422	0.422	0.572	0.844
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.1666666666667	2	35.83333333333333	0.0601826482875392	0.0579999025523778	1.03763361038737	0.00218274573516138	0.0293163160715233	0.0401204168146746	NA	NA	0.043162749792812	0.959668067621766	567	7	426	0.426	0.567	0.852
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.83333333333337	2	36.166666666666664	0.0587096677913666	0.0574443341110379	1.02202712765167	0.00126533368032876	0.0312119206245023	0.0415347642000355	NA	NA	0.041257498756071	0.975533369915816	539	4	457	0.457	0.539	0.914
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.33333333333337	2	36.666666666666664	0.0582817382454872	0.0566306643811089	1.02915512085938	0.00165107386437831	0.0295052770144215	0.0407266159054701	NA	NA	0.0406779991036622	0.967623660299747	533	6	461	0.461	0.533	0.922
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666671	2	36.33333333333333	0.0579999025523778	0.0571705240409132	1.01450710003762	8.29378511464612e-4	0.0294112217929037	0.0411706225950534	NA	NA	0.0400279491991188	0.983469026627773	537	10	453	0.453	0.537	0.906
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	2	35.66666666666666	0.0574443341110378	0.0582817382454872	0.985631792055992	-8.37404134449417e-4	0.0286824337603287	0.042211954106878	NA	NA	0.0423312599612798	0.984217142254817	492	13	495	0.495	0.492	0.984
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	2	34.66666666666666	0.0563645417845084	0.0600320307551524	0.938907797645524	-0.00366748897064392	0.0279134048765056	0.0420577353049896	NA	NA	0.0434207255986855	0.932687509649998	513	3	484	0.484	0.513	0.968
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000004	2	34.66666666666666	0.0568993130810351	0.0600320307551524	0.947815897035128	-0.00313271767411726	0.0284497849191136	0.0439449354247879	NA	NA	0.041996278046625	0.940536851797771	484	6	510	0.51	0.484	0.968
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	2	34.66666666666666	0.0563645417845084	0.0600320307551524	0.938907797645524	-0.00366748897064392	0.0284910274345988	0.0451154441858478	NA	NA	0.0428896771599972	0.931856081480629	472	10	518	0.518	0.472	0.944
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333339	2	33.99999999999999	0.0414852284880391	0.0612585232607004	0.677215614739662	-0.0197732947726613	0.0246590725645582	0.0436053066397943	NA	NA	0.0415116678330814	0.633838574547495	313	13	674	0.674	0.313	0.626
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333339	2	34.66666666666666	0.0414852284880391	0.0600320307551524	0.691051559745521	-0.0185468022671132	0.0242859047007986	0.0439505621937125	NA	NA	0.0419312998870929	0.658261979248905	295	18	687	0.687	0.295	0.59
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666671	2	35.33333333333333	0.0418713371647063	0.0588537115811214	0.711447690210543	-0.0169823744164151	0.0237785288237932	0.0426307871798268	NA	NA	0.041034973001856	0.678983056159271	346	14	640	0.64	0.346	0.692
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666671	2	35.33333333333333	0.0418713371647063	0.0588537115811214	0.711447690210543	-0.0169823744164151	0.0243258417824418	0.0422229147834488	NA	NA	0.0388146673284709	0.661730890657566	303	20	677	0.677	0.303	0.606
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	35.49999999999999	0.041581086362894	0.0585663277285774	0.709982817355382	-0.0169852413656834	0.025009054505692	0.0406693664978478	NA	NA	0.039794346898231	0.66950644358678	355	12	633	0.633	0.355	0.71
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34.5	0.0410124947055404	0.0603340239140544	0.67975732505364606	-0.0193215292085141	0.0221270510940055	0.044372912208729	NA	NA	0.040652586536817	0.634584469379934	324	15	661	0.661	0.324	0.648
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34.5	0.0410124947055404	0.0603340239140544	0.67975732505364606	-0.0193215292085141	0.0237253526402345	0.0439464579804201	NA	NA	0.0395436602175151	0.625116016370807	307	18	675	0.675	0.307	0.614
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34	0.0410124947055404	0.0612585232607003	0.66949858603352	-0.02024602855516	0.0224087967553166	0.043529500391954	NA	NA	0.0414506680444344	0.625240534130377	285	13	702	0.702	0.285	0.57
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	2	33.916666666666664	0.0273067703935705	0.0614153696041381	0.444624376106183	-0.0341085992105676	0.0194762752255215	0.0449838089993279	NA	NA	0.0385472944180917	0.376237177895817	145	35	820	0.82	0.145	0.29
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.25000000000006	2	34.25	0.0274316291149154	0.0607927570603562	0.45123186447492	-0.0333611279454408	0.0196127841401506	0.0432248318178309	NA	NA	0.0392300907755631	0.395104737266199	158	45	797	0.797	0.158	0.316
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	2	34.25	0.0272757331281561	0.0607927570603562	0.448667480257167	-0.0335170239322001	0.0198240626872014	0.0445670192471224	NA	NA	0.0393872488949304	0.394790859211888	148	38	814	0.814	0.148	0.296
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	1	34.25	0.0270909813104956	0.0297805871963345	0.909685935065447	-0.00268960588583888	0.0186804006864059	0.0305975879671506	NA	NA	0.0206530426810815	0.896385987115737	393	132	475	0.475	0.393	0.786
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.8333333333334	1	33.58333333333333	0.0272138698048233	0.0303839016876759	0.895667386123144	-0.00317003188285264	0.019064991670389	0.03018428728428	NA	NA	0.0222056530944337	0.886481405902914	366	123	511	0.511	0.366	0.732
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000006	1	33.41666666666666	0.0271522864979704	0.0305385697640887	0.889114542944304	-0.00338628326611825	0.0195271399892778	0.031440207660108	NA	NA	0.0222730188528661	0.879159158948428	346	128	526	0.526	0.346	0.692
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	1	33.74999999999999	0.0272757331281561	0.0302307926160697	0.902250016218803	-0.00295505948791353	0.0193623199679171	0.0303065103822531	NA	NA	0.0222189419435616	0.894195508680136	382	123	495	0.495	0.382	0.764
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.3333333333334	1	34.08333333333333	0.027400307499342	0.0299291581301553	0.91550545391835	-0.00252885063081339	0.0198770962569159	0.0310236782820238	NA	NA	0.0217399741433074	0.907396863517316	342	123	535	0.535	0.342	0.684
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000007	1	33.74999999999999	0.0275260251378209	0.0302307926160697	0.910529389268777	-0.00270476747824871	0.0190402293255664	0.0294555515990177	NA	NA	0.0214926480560077	0.899853692523331	385	143	472	0.472	0.385	0.77
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.24999999999999	0.0277167798918218	0.0297805871963345	0.930699576509133	-0.00206380730451267	0.0191544590392366	0.0301944764063033	NA	NA	0.0206850015800669	0.920524442547475	389	142	469	0.469	0.389	0.778
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.24999999999999	0.0277167798918218	0.0297805871963345	0.930699576509133	-0.00206380730451267	0.0207123241896931	0.0293479762590992	NA	NA	0.0209905939844086	0.921677739548365	377	149	474	0.474	0.377	0.754
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	TTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	1	33.916666666666664	0.0270909813104956	0.0300792190929219	0.900654409504619	-0.00298823778242627	0.0190981790166409	0.0302669691521491	NA	NA	0.0223803378509239	0.893781615584339	354	150	496	0.496	0.354	0.708
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	1	34.916666666666664	0.0270909813104956	0.0292007684815911	0.927748916182617	-0.00210978717109544	0.0193046362548018	0.0286088073501243	NA	NA	0.0222615054136484	0.924495221738788	381	144	475	0.475	0.381	0.762
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	1	35.08333333333333	0.0271522864979704	0.0290593249318817	0.934374303657033	-0.00190703843391128	0.0198348602755006	0.0298893219714606	NA	NA	0.0214858306843562	0.929274271292291	387	107	506	0.506	0.387	0.774
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.8333333333334	2	35.58333333333333	0.0412002891133781	0.058423686245627	0.70519838375419	-0.0172233971322489	0.0251586750603047	0.0429253198020025	NA	NA	0.0271851475013985	0.526368610718065	213	40	747	0.747	0.213	0.426
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.5833333333334	2	35.83333333333333	0.0556454425645553	0.0579999025523778	0.959405794075322	-0.0023544599878224802	0.0288018880470237	0.0424386382794427	NA	NA	0.029993473971525	0.937431065333371	445	18	537	0.537	0.445	0.89
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666674	2	36.33333333333333	0.0573756358851215	0.0571705240409132	1.00358772020458	2.05111844208274e-4	0.0284539772942223	0.0404261400360933	NA	NA	0.029946468047496	0.994535105312117	516	22	462	0.462	0.516	0.924
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000009	2	35.99999999999999	0.0575131971253351	0.0577207808520962	0.996403656989793	-2.07583726761149e-4	0.0289260808267288	0.0426138805471977	NA	NA	0.0303492102443817	0.994542640223818	499	9	492	0.492	0.499	0.984
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666674	2	35	0.0565638983071324	0.0594370287406054	0.95166093436447	-0.002873130433473	0.0297480072469863	0.0434491979118936	NA	NA	0.0317023095064441	0.927787843631038	445	16	539	0.539	0.445	0.89
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.0833333333334	2	35.333333333333336	0.05765141989764	0.0588537115811214	0.979571523168523	-0.00120229168348136	0.0292577797129448	0.0420667249087643	NA	NA	0.0321014017435105	0.970123866954265	481	18	501	0.501	0.481	0.962
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	2	34.666666666666664	0.0571024790858329	0.0600320307551523	0.951200190423876	-0.00292955166931942	0.0296107941076269	0.0439013528543741	NA	NA	0.0331465441239578	0.929573215728148	459	15	526	0.526	0.459	0.918
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	2	34.833333333333336	0.0572387314369154	0.0597330472949441	0.958242280094762	-0.00249431585802863	0.0292740720047121	0.0430716439453672	NA	NA	0.0312591112549877	0.936400426366372	475	19	506	0.506	0.475	0.95
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	2	34.5	0.0575131971253351	0.0603340239140544	0.953246499972593	-0.00282082678871932	0.0292310135535371	0.0442744023480855	NA	NA	0.0318966094239984	0.929529695081529	452	13	535	0.535	0.452	0.904
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	2	34.5	0.0569668741816511	0.0603340239140544	0.944191527201968	-0.00336714973240334	0.0296994608972231	0.0433033619181774	NA	NA	0.0327319583909355	0.918065828477223	448	22	530	0.53	0.448	0.896
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666673	1	34.333333333333336	0.0420179878270026	0.0297068535712844	1.41442067320178	0.0123111342557182	0.0246995936466867	0.0305302293797865	NA	NA	0.0252176674913668	0.62541186412963	671	46	283	0.283	0.671	0.566
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000007	1	34.166666666666664	0.0421163271222965	0.0298546878003148	1.41071068650909	0.0122616393219818	0.0242838563785591	0.0294864732374165	NA	NA	0.0258563164185267	0.635341462252333	644	52	304	0.304	0.644	0.608
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.5833333333334	1	34.166666666666664	0.0425143321315747	0.0298546878003148	1.42404209402339	0.012659644331259901	0.0239138321566119	0.0315409123729147	NA	NA	0.0255500069678089	0.620257831763331	648	52	300	0.3	0.648	0.6
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	1	34.166666666666664	0.0569668741816511	0.0298546878003148	1.90813833199925	0.0271121863813363	0.0281998625735155	0.0303877878266791	NA	NA	0.0290961106414954	0.351432247097606	847	17	136	0.136	0.847	0.272
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	1	34	0.0568319121182793	0.0300040009602743	1.89414445738505	0.0268279111580049	0.0283543118349358	0.0297109818622271	NA	NA	0.0291503202747675	0.357400392012886	803	15	182	0.182	0.803	0.364
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	1	34.666666666666664	0.042766928969766	0.029415534864961	1.45388921758852	0.013351394104805	0.0247596561937713	0.0310238376598672	NA	NA	0.0257790708780979	0.604516855634528	692	41	267	0.267	0.692	0.534
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0245343927753771	0.0278965200540548	NA	NA	0.0256634319195231	0.596242061208185	688	38	274	0.274	0.688	0.548
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.028849710620847	1.48948386556132	0.0141214678750176	0.0252960486041911	0.0292643459473958	NA	NA	0.0255268072220939	0.580125444527865	689	51	260	0.26	0.689	0.52
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0242075491702086	0.0292308756052047	NA	NA	0.0246779222166687	0.576317749617751	675	50	275	0.275	0.675	0.55
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0246494150921054	0.0297876726940659	NA	NA	0.0242251924759056	0.569210970846027	682	50	268	0.268	0.682	0.536
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0571705240409132	0.744520242876842	-0.0146059115965762	0.0258209395399508	0.0435278114458155	NA	NA	0.0387402179368715	0.706157310335291	346	21	633	0.633	0.346	0.692
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0278655410035789	0.0522821930925586	NA	NA	0.0440654889658076	0.497497617313602	243	9	748	0.748	0.243	0.486
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	3	36	0.0573071018565008	0.0883372767422876	0.648730682786235	-0.0310301748857868	0.0287904957617534	0.0529393483834344	NA	NA	0.0452117972827704	0.492505564270645	224	5	771	0.771	0.224	0.448
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.0294922982179998	0.0494112711094685	NA	NA	0.0433370003507804	0.50670667200429	249	6	745	0.745	0.249	0.498
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	3	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.0849965139802523	0.859451690051178	-0.0119461163914659	0.0330604329461889	0.0528939140283651	NA	NA	0.0457757945708057	0.794115519637664	412	1	587	0.587	0.412	0.824
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	4	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.113962844188242	0.648908713450963	-0.0400113615848373	0.0325168917266496	0.0605311256339168	NaN	NaN	0.0540188435084281	0.458879802997122	237	0	763	0.763	0.237	0.474
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	4	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.112359208671495	0.663077759981812	-0.0378563162722712	0.0337259105786967	0.0598729961717727	NA	NA	0.0556890808393216	0.496643852952604	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0326702782977666	0.0617484117804824	NaN	NaN	0.0539178772100651	0.524970788737167	273	1	726	0.726	0.273	0.546
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0334696971627863	0.0562812126234878	NaN	NaN	0.055827563328538	0.555866757734415	260	1	739	0.739	0.26	0.52
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0331275136335617	0.0610069731446071	NA	NA	0.0579371957947558	0.563159242635843	312	0	688	0.688	0.312	0.624
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0352308964805192	0.05968785094007	NaN	NaN	0.0572747246433527	0.514747827089855	244	1	755	0.755	0.244	0.488
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0340457577578849	0.0618695145029421	NaN	NaN	0.0568767293316223	0.468787851031452	252	0	748	0.748	0.252	0.504
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0346086171588392	0.0608178112342239	NA	NA	0.0609045692275898	0.505795762227766	236	1	763	0.763	0.236	0.472
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0346588960979604	0.0618407485350696	NaN	NaN	0.0597725494805647	0.489607268096626	228	0	772	0.772	0.228	0.456
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0331105401767777	0.0603709307085631	NaN	NaN	0.0581158870997668	0.458944932822685	225	1	774	0.774	0.225	0.45
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.0346534778697655	0.0655418528155505	NA	NA	0.0596705761299947	0.464281535843587	239	0	761	0.761	0.239	0.478
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0350896487411306	0.0639692235151362	NA	NA	0.0613926775640389	0.46462024134586	229	1	770	0.77	0.229	0.458
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0337911037545084	0.0662784578987449	NaN	NaN	0.0608753402463948	0.453071691230181	210	2	788	0.788	0.21	0.42
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0343343615192294	0.0642562787513501	NA	NA	0.0621214685757525	0.453770014920014	219	1	780	0.78	0.219	0.438
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0335999633858284	0.0639314517124916	NA	NA	0.0590101465825311	0.430320414662848	203	0	797	0.797	0.203	0.406
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0332382054763307	0.0634245730780468	NaN	NaN	0.0616030209534003	0.442488033078578	212	1	787	0.787	0.212	0.424
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0336552330874214	0.0649696062131373	NA	NA	0.062308213820572	0.440431263713789	230	1	769	0.769	0.23	0.46
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0359197163980558	0.07872360407331	NaN	NaN	0.0693179256352786	0.303763961088316	138	0	862	0.862	0.138	0.276
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0357270781078574	0.0807123218088435	NA	NA	0.0727721783448281	0.316307723850503	133	0	867	0.867	0.133	0.266
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0355806307547075	0.0792606399691654	NA	NA	0.0687146366899102	0.288578158036673	107	1	892	0.892	0.107	0.214
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0351870352318672	0.0771704100163935	NaN	NaN	0.0741434453268239	0.319586974937396	132	0	868	0.868	0.132	0.264
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0354574487386744	0.0782647053219331	NaN	NaN	0.0753684641354381	0.327515974750495	128	0	872	0.872	0.128	0.256
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0362008165123578	0.0797447024292739	NaN	NaN	0.0680390732367732	0.301076917198655	123	2	875	0.875	0.123	0.246
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0357665973295471	0.0812672645725044	NaN	NaN	0.0736817527819	0.296972075219789	123	0	877	0.877	0.123	0.246
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0344502945363025	0.0845316727393512	NaN	NaN	0.0764278847920749	0.269130731056111	102	0	898	0.898	0.102	0.204
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0304902806012627	0.0776355932491971	NaN	NaN	0.0710769100827344	0.338406166721286	144	0	856	0.856	0.144	0.288
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0270941532794622	0.0767005671197295	NaN	NaN	0.0715876182532967	0.23237862143038	68	4	928	0.928	0.068	0.136
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0251644199154429	0.0803934564732458	NaN	NaN	0.0686475275336178	0.211508896186508	57	3	940	0.94	0.057	0.114
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0257150405684837	0.0760082042944279	NA	NA	0.0697326362460869	0.224352946729083	73	4	923	0.923	0.073	0.146
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0263023335605099	0.0740116012064098	NA	NA	0.0681331564673687	0.236661850785859	77	0	923	0.923	0.077	0.154
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0272957327929182	0.0743585349777642	NaN	NaN	0.0654723553466284	0.234196802381792	82	2	916	0.916	0.082	0.164
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.026614649405563	0.0679514548734319	NA	NA	0.0647580009245975	0.262280372331309	91	1	908	0.908	0.091	0.182
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0272893590538726	0.0725835166861866	NA	NA	0.0625331277131706	0.222161877655038	67	1	932	0.932	0.067	0.134
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0274046024800732	0.0721677471207633	NA	NA	0.0685692551735772	0.265565392868543	83	1	916	0.916	0.083	0.166
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0262551778194649	0.0720723796671955	NA	NA	0.0629025166503881	0.238087603767039	90	1	909	0.909	0.09	0.18
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0284670080847695	0.0709140950318012	NA	NA	0.0633576490684313	0.255183301816455	88	2	910	0.91	0.088	0.176
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0272160454800731	0.0663264893892417	NA	NA	0.0619025985598286	0.263713393677268	83	2	915	0.915	0.083	0.166
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0278030840088852	0.0689014491836825	NA	NA	0.0635081017970445	0.254646732513263	90	6	904	0.904	0.09	0.18
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0236337805137168	0.0697283910206974	NA	NA	0.0607237119166568	0.170393597811845	31	5	964	0.964	0.031	0.062
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.0251485162888502	0.0685892885884622	NA	NA	0.0589434196125992	0.165259155145034	47	7	946	0.946	0.047	0.094
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0233828210293811	0.0714791266899738	NA	NA	0.0612388895386495	0.160861548410103	36	2	962	0.962	0.036	0.072
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0235533688233556	0.0705378122016394	NA	NA	0.0628872862701835	0.153593074530097	36	6	958	0.958	0.036	0.072
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0226711652145736	0.0696188610985017	NA	NA	0.0633544820839203	0.164021579453068	39	8	953	0.953	0.039	0.078
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0235606915987576	0.0716199334330715	NA	NA	0.0617513717112752	0.169015278730799	42	3	955	0.955	0.042	0.084
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0234701872761484	0.0661312311445575	NA	NA	0.0619030957602641	0.171988767677613	43	4	953	0.953	0.043	0.086
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.0238154777415974	0.0583328288209582	NA	NA	0.049901394141506	0.284616625903788	110	16	874	0.874	0.11	0.22
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0185162195949378	0.0453160699475186	NA	NA	0.0431455378493607	0.43519793893845	155	37	808	0.808	0.155	0.31
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.0201309178283859	0.0462892872577846	NA	NA	0.0403468899195553	0.429486921932786	172	47	781	0.781	0.172	0.344
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0188910602477452	0.0438600551261194	NA	NA	0.0428815326551063	0.462215970647367	171	51	778	0.778	0.171	0.342
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000006	2	35.58333333333332	0.0134986770919624	0.0584236862456271	0.231048021092178	-0.0449250091536647	0.0128938049555919	0.0466500294835192	NA	NA	0.0392452268130791	0.252322913649642	0	134	866	0.866	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666673	1	35.41666666666666	0.0134683754007452	0.0287805096612113	0.467968620406229	-0.0153121342604661	0.0137378176182362	0.0318770490357512	NA	NA	0.0189135110407098	0.418177533590831	0	386	614	0.614	0	0.001
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000006	1	35.08333333333332	0.0134081783305544	0.0290593249318817	0.461407082304378	-0.0156511466013273	0.013698113444684	0.0291011356429429	NA	NA	0.017625728119637	0.374556009792837	0	349	651	0.651	0	0.001
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.08333333333339	1	34.91666666666666	0.0132600139021293	0.0292007684815911	0.454098114249586	-0.0159407545794618	0.0133031316086826	0.0325920125892992	NA	NA	0.018603638484432	0.391521045999534	0	409	591	0.591	0	0.001
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.25000000000006	1	34.749999999999986	0.0132307731029257	0.0293435958691742	0.450891334583326	-0.0161128227662485	0.0129518872238031	0.0303988662942849	NA	NA	0.0180770884777173	0.372747070977614	0	393	607	0.607	0	0.001
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.91666666666673	1	35.08333333333332	0.0132893842388272	0.0290593249318817	0.45731909705332	-0.0157699406930545	0.013105694171512	0.0295388254583872	NA	NA	0.018787899485467	0.401263459865924	0	353	647	0.647	0	0.001
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.50000000000007	1	35.58333333333332	0.0131871529184001	0.0286430990492925	0.460395465438501	-0.0154559461308924	0.0126862742402302	0.0294490343782504	NA	NA	0.0175910935749218	0.379605513618197	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666674	1	35.91666666666665	0.0131582322381821	0.0283721774047871	0.463772379907719	-0.015213945166605	0.0133670846537928	0.0306838216956121	NA	NA	0.0176997200923579	0.390032449846203	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666674	1	36.16666666666665	0.0130722263514627	0.0281723261817365	0.464009477497005	-0.0151000998302737	0.0126400295709901	0.0290519062553597	NA	NA	0.017750446320966302	0.394942435763038	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666674	1	36.499999999999986	0.0132453773639628	0.0279101972553257	0.474571255903085	-0.014664819891363	0.013163980168878	0.029670536253162	NA	NA	0.0165970901267016	0.376924183326662	0	383	617	0.617	0	0.001
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666674	1	36.58333333333332	0.0132453773639628	0.02784542552167	0.475675164441459	-0.0146000481577072	0.0128498701242188	0.0301657490511115	NA	NA	0.0164219187839434	0.373971585948169	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.8333333333334	1	37.249999999999986	0.0131294381352109	0.0273378783823658	0.480265437996827	-0.0142084402471549	0.0124921412229498	0.0273513686142447	NA	NA	0.0169972063321757	0.403195424148011	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.16666666666673	1	38.249999999999986	0.0132453773639628	0.0266103300115572	0.497753216822571	-0.0133649526475944	0.01377474699771	0.0274929976775839	NA	NA	0.0157350600587656	0.395673154214065	0	398	602	0.602	0	0.001
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000006	1	38.249999999999986	0.0133633824875953	0.0266103300115572	0.502187777520665	-0.0132469475239618	0.013203488766368	0.0291723527865715	NA	NA	0.0151415098261947	0.381641236210279	0	366	634	0.634	0	0.001
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.3333333333334	1	38.08333333333332	0.0132162010123647	0.0267288865855191	0.494453855011111	-0.0135126855731544	0.0128137725368013	0.0274579814265968	NA	NA	0.0159991555626991	0.398341233378451	0	347	653	0.653	0	0.001
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.3333333333334	1	37.08333333333332	0.0130438070339019	0.0274630224286674	0.474958904023837	-0.0144192153947655	0.0123924658867354	0.0305486445729314	NA	NA	0.0154498330146253	0.350668895768027	0	390	610	0.61	0	0.001
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666674	1	37.08333333333332	0.0131582322381821	0.0274630224286674	0.479125423006859	-0.0143047901904853	0.0125983813961835	0.0300574215183808	NA	NA	0.0166251406960647	0.389551379109348	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666674	1	37.08333333333332	0.0131582322381821	0.0274630224286674	0.479125423006859	-0.0143047901904853	0.0123850832214541	0.029743460026114	NA	NA	0.0171294739617897	0.403662508227227	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000007	0	37.249999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.0833333333334	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.5833333333334	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000006	0	36.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000006	0	37.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.08333333333339	0	37.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	76.66666666666673	0	37.74999999999999	0.0131582322381821	0	-Inf	0.0131582322381821	0.012977703991299201	0	NA	NA	0.0136335125457079	0.334475284325003	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.33333333333339	0	38.08333333333332	0.0135750312327134	0	-Inf	0.0135750312327134	0.0133722161181053	0	NA	NA	0.0131080571151373	0.300377138983182	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666671	0	38.08333333333332	0.0138892858254281	0	-Inf	0.0138892858254281	0.0132915182169073	0	NA	NA	0.0132917142256704	0.29604228715879	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.66666666666671	0	38.24999999999999	0.0138892858254281	0	-Inf	0.0138892858254281	0.0136450312585786	0	NA	NA	0.0141460593598068	0.326174537059406	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.66666666666671	0	37.24999999999999	0.0136990109829699	0	-Inf	0.0136990109829699	0.0132863819167348	0	NA	NA	0.0138131206088386	0.321324841160109	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.83333333333339	0	37.08333333333332	0.0136678042173386	0	-Inf	0.0136678042173386	0.0138457869473296	0	NA	NA	0.0132925740633695	0.303842329425716	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.16666666666671	0	36.74999999999999	0.0136058153029875	0	-Inf	0.0136058153029875	0.0134319520716651	0	NA	NA	0.0135042550934844	0.313684659533133	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666671	0	36.416666666666664	0.013423177093157	0	-Inf	0.013423177093157	0.0136788650856915	0	NA	NA	0.013214379495388	0.30972426111686	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333337	0	35.58333333333333	0.0133932130500048	0	-Inf	0.0133932130500048	0.0130309268791176	0	NA	NA	0.0135290774176073	0.322194842332844	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.83333333333337	0	36.08333333333333	0.0134835092215562	0	-Inf	0.0134835092215562	0.0129889315469231	0	NA	NA	0.013878750083811	0.33128846835631	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.83333333333337	0	35.74999999999999	0.0133041182530361	0	-Inf	0.0133041182530361	0.0131145776146287	0	NA	NA	0.0128573032480767	0.300784817202533	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000004	0	35.08333333333333	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0125742937644443	0	NA	NA	0.0133727107023906	0.330409732788057	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333337	0	34.75	0.0129592857062641	0	-Inf	0.0129592857062641	0.0130840720107417	0	NA	NA	0.0126953035144148	0.307352195111565	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666671	0	34.41666666666667	0.0129035440872231	0	-Inf	0.0129035440872231	0.0129101418582502	0	NA	NA	0.0131971993543597	0.328198644865171	620	380	0	0	0.62	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333337	0	34.75000000000001	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0136439110665084	0	NA	NA	0.0128538470661001	0.316482714397357	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000004	0	34.083333333333336	0.012766265677073	0	-Inf	0.012766265677073	0.0122516177859804	0	NA	NA	0.0127631537597525	0.31719252744752	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000004	0	32.833333333333336	0.0125657389590355	0	-Inf	0.0125657389590355	0.0127265162786917	0	NA	NA	0.0128857269802159	0.329477303865437	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGG:AAGCCTCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	0	33.00000000000001	0.0126185941874855	0	-Inf	0.0126185941874855	0.0126541014584711	0	NA	NA	0.0124205227820915	0.309654574837793	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	260	CGG	CTC	GGC	2	CCTCGGCAA:CCTCGTCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	0	33.00000000000001	0.0126185941874855	0	-Inf	0.0126185941874855	0.012449679423294	0	NA	NA	0.0123441436172405	0.306670511837266	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GGC	AAA	2	CGGCAAAAA:CGTCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.9166666666667	0	33.16666666666667	0.0126185941874855	0	-Inf	0.0126185941874855	0.0124232773461707	0	NA	NA	0.0127165831400065	0.321053936167041	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.25000000000003	0	32.83333333333334	0.0125657389590355	0	-Inf	0.0125657389590355	0.0120960813217429	0	NA	NA	0.0122798817924138	0.306176188597392	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.08333333333336	0	33.33333333333334	0.012752698321938	0	-Inf	0.012752698321938	0.0125116226050164	0	NA	NA	0.0125723746734019	0.310419185472821	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	0	34.333333333333336	0.0129174344873365	0	-Inf	0.0129174344873365	0.0134220567316662	0	NA	NA	0.0130525391048367	0.322345627890132	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	0	33.66666666666667	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.0125790559318615	0	NA	NA	0.0127409370052676	0.314802382799325	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CCA	CCA	2	GCCACCAAG:GCCACTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.75000000000003	0	33.33333333333334	0.0126451889006809	0	-Inf	0.0126451889006809	0.0127856665886369	0	NA	NA	0.0118721501755873	0.286824514636333	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAG	2	ACCAAGGCG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666669	0	33.16666666666667	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0123413050869935	0	NA	NA	0.0118989902861726	0.291962136871122	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	268	GCA	AAG	CAT	2	AAAGCATAC:AAGGCGTAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.91666666666669	0	33	0.0126185941874855	0	-Inf	0.0126185941874855	0.0126260389173137	0	NA	NA	0.0121547529995514	0.299194966003265	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	269	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAT:GCGTACAAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	33	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0123863503506236	0	NA	NA	0.0119985334922509	0.299003642321387	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.833333333333336	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0124623255133362	0	NA	NA	0.0119750082781292	0.299057854327426	614	386	0	0	0.614	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.75000000000001	0	32.5	0.0124872811774231	0	-Inf	0.0124872811774231	0.0126533799109414	0	NA	NA	0.0122839500110622	0.309366318430338	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.41666666666669	0	33.33333333333333	0.0125394770467935	0	-Inf	0.0125394770467935	0.0120027313507364	0	NA	NA	0.0124208105023685	0.31270909026375	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.666666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0123666616362239	0	NA	NA	0.0129012243048504	0.335094977889868	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	33.166666666666664	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0120625000064526	0	NA	NA	0.0125503227093318	0.320753624336963	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666669	0	32.83333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0121182280881946	0	NA	NA	0.0119430605324401	0.302750028062481	612	388	0	0	0.612	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666669	0	32.33333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0115742157742363	0	NA	NA	0.0119978949929052	0.304965125167149	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGGCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333336	0	32.666666666666664	0.0123586730492886	0	-Inf	0.0123586730492886	0.0123548122476077	0	NA	NA	0.0124809341056779	0.322074332701649	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT:AGGCGTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.58333333333336	0	32.416666666666664	0.0123586730492886	0	-Inf	0.0123586730492886	0.0125976300381113	0	NA	NA	0.0117703179959529	0.293724395673676	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.74999999999999	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.012292352763336	0	NA	NA	0.0121733409389221	0.30800167129697	660	340	0	0	0.66	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.74999999999999	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.0120144984140115	0	NA	NA	0.0127838011540404	0.331675821241441	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.9166666666667	0	32.08333333333333	0.0123079685204042	0	-Inf	0.0123079685204042	0.0122614714602614	0	NA	NA	0.0120640421653275	0.307624471518276	651	349	0	0	0.651	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333336	0	32.24999999999999	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0123225504398499	0	NA	NA	0.0127416921550896	0.335054553961074	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.41666666666669	0	32.916666666666664	0.012698716061835	0	-Inf	0.012698716061835	0.0127747663898979	0	NA	NA	0.0132914771763189	0.339373979581703	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000001	0	32.58333333333333	0.0128071415099282	0	-Inf	0.0128071415099282	0.0127351278976598	0	NA	NA	0.0122928510310461	0.297487465274822	641	359	0	0	0.641	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	0	32.58333333333333	0.0129174344873365	0	-Inf	0.0129174344873365	0.0132107124450307	0	NA	NA	0.0125935955199883	0.30502614179809	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	1	32.916666666666664	0.026061253903872	0.0310121698640216	0.840355706103191	-0.00495091596014964	0.0193351350843656	0.0329178191129289	NA	NA	0.0234867889649003	0.833046632940876	355	138	507	0.507	0.355	0.71
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333336	1	32.75	0.0262321821040851	0.0311733183159379	0.84149469871077	-0.00494113621185282	0.0179666021140112	0.0326581179034383	NA	NA	0.023308216122857	0.832113916219263	345	122	533	0.533	0.345	0.69
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.41666666666669	1	32.416666666666664	0.0262896575662818	0.031500692980973	0.834573943568835	-0.00521103541469126	0.0185076357024224	0.0329563571038914	NA	NA	0.0238321409339207	0.826918196217131	334	124	542	0.542	0.334	0.668
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666669	1	32.916666666666664	0.0264636052740321	0.0310121698640216	0.853329689282192	-0.0045485645899895	0.0190267205789623	0.0328063078796369	NA	NA	0.024205671580046	0.850944714877171	360	128	512	0.512	0.36	0.72
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	1	32.666666666666664	0.0263763446044989	0.0312545223004261	0.843920900500833	-0.00487817769592713	0.0185759996692348	0.0322008735202933	NA	NA	0.0233858680410624	0.834764328946427	313	154	533	0.533	0.313	0.626
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	31.499999999999996	0.0259766224970672	0.0324374878453625	0.800821032162051	-0.00646086534829531	0.0184483738287962	0.0334785022049834	NA	NA	0.0236630976517432	0.784825938282095	357	135	508	0.508	0.357	0.714
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	1	31.08333333333333	0.0128071415099282	0.0328819783981324	0.389488167495894	-0.0200748368882042	0.0122316358848806	0.0340160644928372	NA	NA	0.0218487705880682	0.358195727593918	0	333	667	0.667	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	1	30.749999999999996	0.0124355180497881	0.0332464403304228	0.374040586787535	-0.0208109222806347	0.0126352098505196	0.0321867539531958	NA	NA	0.0217529881445015	0.338722446004068	0	345	655	0.655	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.75000000000003	1	31.749999999999996	0.0123332686697829	0.0321765161581571	0.383300311604936	-0.0198432474883742	0.0124354307063986	0.0341785368070327	NA	NA	0.021428815471356	0.354441994197839	0	393	607	0.607	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.41666666666669	1	31.58333333333333	0.0122326870775303	0.0323500281131817	0.378135284295033	-0.0201173410356514	0.0122883224262085	0.0344191608943465	NA	NA	0.0214817976342201	0.349024495664083	0	363	637	0.637	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	1	32.25	0.0124355180497881	0.03166697281676	0.392696773441082	-0.0192314547669719	0.0129561955423206	0.0319998041824226	NA	NA	0.0196266774454492	0.327153755906724	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333336	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.028488569311983	0.034105186094527	NA	NA	0.0333755052648525	0.869959223439608	517	115	368	0.368	0.517	0.736
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.08333333333336	1	31.916666666666664	0.03746876920025	0.0320048558445568	1.17072138622435	0.00546391335569325	0.0278698663446516	0.0313287336557511	NA	NA	0.0319005510633409	0.864003926928499	505	142	353	0.353	0.505	0.706
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666664	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.029427665870492	0.0336418639612441	NA	NA	0.0337598278111864	0.880177976723617	503	123	374	0.374	0.503	0.748
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.33333333333336	1	31.33333333333333	0.0368926831430788	0.0326138339548042	1.13119736839907	0.00427884918827467	0.0283868422560305	0.0332739655052912	NA	NA	0.032195110240191	0.894269542765659	474	155	371	0.371	0.474	0.742
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	31.08333333333333	0.0494514815652544	0.0672719567702241	0.735098010217872	-0.0178204752049697	0.0308949651951824	0.0510686140483652	NA	NA	0.041781770836826	0.669733959082289	315	52	633	0.633	0.315	0.63
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	30.916666666666664	0.0497591768358708	0.0676514664202386	0.735522516641042	-0.0178922895843678	0.0309581558531406	0.050615904648389	NA	NA	0.0418016917822463	0.668630821204998	305	50	645	0.645	0.305	0.61
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333336	2	31.249999999999996	0.0503862036875865	0.0668966841033532	0.753194337850012	-0.0165104804157667	0.0306186271211765	0.0484443719206825	NA	NA	0.0415074069990753	0.690798327548088	324	50	626	0.626	0.324	0.648
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000001	2	30.249999999999996	0.0499664439235005	0.0692133441658409	0.721919227075299	-0.0192469002423404	0.0314432419084088	0.0502271842833687	NA	NA	0.0445205319471741	0.665512380944567	303	50	647	0.647	0.303	0.606
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	29.249999999999996	0.0507056829412418	0.071696340510766	0.7072283268576	-0.0209906575695242	0.0308262685845222	0.0550357342838865	NA	NA	0.0441837502455082	0.634732509939219	312	52	636	0.636	0.312	0.624
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666669	2	28.583333333333332	0.0508130785858607	0.0734531512400294	0.691775338811732	-0.0226400726541687	0.0307362647428813	0.0555615554245044	NA	NA	0.0465917762408316	0.627020893593566	288	54	658	0.658	0.288	0.576
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.66666666666669	2	28.999999999999996	0.0506521552428655	0.0723451996406717	0.700145351653566	-0.0216930443978062	0.0311355895564163	0.0543809472291982	NA	NA	0.0446558779574272	0.627121377415841	307	45	648	0.648	0.307	0.614
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333336	2	29.333333333333332	0.0508669472540708	0.0714826348532437	0.711598661108427	-0.0206156875991729	0.0316426335880535	0.0548005691489259	NA	NA	0.0417691502067533	0.621615166344485	302	43	655	0.655	0.302	0.604
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.833333333333332	0.0511925740908369	0.0702267037754945	0.728961653312005	-0.0190341296846576	0.0329621352936721	0.0555408880375993	NA	NA	0.0451828967462159	0.673559052836295	303	41	656	0.656	0.303	0.606
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	29.833333333333332	0.0507593239355005	0.0702267037754945	0.722792345455531	-0.019467379839994	0.0316031680065869	0.0533539977817305	NA	NA	0.0427113304574857	0.648541289908458	288	48	664	0.664	0.288	0.576
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.50000000000001	2	29.833333333333332	0.0507593239355005	0.0702267037754945	0.722792345455531	-0.019467379839994	0.0315082535246994	0.0506904366678272	NA	NA	0.0428109584457099	0.649304290207981	303	51	646	0.646	0.303	0.606
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	29.5	0.0509750280987295	0.0710590256920247	0.717361765128321	-0.0200839975932952	0.0321433890536941	0.0548661714289071	NA	NA	0.0431900675033837	0.641921239515388	299	37	664	0.664	0.299	0.598
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333336	2	29.5	0.0505454383004815	0.0710590256920247	0.711316230531353	-0.0205135873915431	0.0314479284683409	0.0526052818303094	NA	NA	0.0446337795993194	0.645804930797427	291	57	652	0.652	0.291	0.582
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	28.500000000000004	0.0499144653819543	0.0736788296875599	0.677460073587216	-0.0237643643056056	0.0305639771228656	0.0523140966878959	NA	NA	0.04547858250823	0.601294620958339	271	37	692	0.692	0.271	0.542
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	2	28.166666666666668	0.049299057062491	0.0745955951479785	0.660884291688998	-0.0252965380854875	0.0317882264142762	0.0551876302832989	NA	NA	0.0479166294218117	0.597549197655577	251	48	701	0.701	0.251	0.502
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	28.5	0.0499144653819543	0.0736788296875599	0.677460073587216	-0.0237643643056056	0.0313326110926731	0.0556632828393594	NA	NA	0.0467741114267615	0.6114066294311	259	53	688	0.688	0.259	0.518
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	27.833333333333336	0.0498108321742552	0.0755354817013731	0.659436215303169	-0.0257246495271178	0.0309708264483029	0.0538180492411703	NA	NA	0.0461462863516308	0.577214058393837	263	46	691	0.691	0.263	0.526
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.6666666666667	2	27.166666666666668	0.0494005687407186	0.0774882105210195	0.637523675002383	-0.0280876417803009	0.0297310075608752	0.0602389626897839	NA	NA	0.0477974620305932	0.556774782384663	242	41	717	0.717	0.242	0.484
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.1666666666667	2	27.333333333333336	0.049707628561966	0.0769906155450625	0.645632304795279	-0.0272829869830965	0.0312389928102644	0.0605494909581172	NA	NA	0.0474601696670844	0.565385501814968	254	56	690	0.69	0.254	0.508
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	27.5	0.0498108321742552	0.0764993759663411	0.651127300648458	-0.0266885437920859	0.0307076862814193	0.0553892731186247	NA	NA	0.0479385336763954	0.577715851728894	251	55	694	0.694	0.251	0.502
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	27.833333333333336	0.0496048518784087	0.0755354817013731	0.656709281004122	-0.0259306298229643	0.0307020993301302	0.0556117017333783	NA	NA	0.0455471896406094	0.569143408733626	240	39	721	0.721	0.24	0.48
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.00000000000003	2	27.33333333333334	0.0491979618643599	0.0769906155450625	0.639012449972743	-0.0277926536807026	0.0297662242770876	0.0588161709417992	NA	NA	0.0480769087633299	0.563205134530084	241	44	715	0.715	0.241	0.482
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.66666666666669	2	27.33333333333334	0.0487976950102964	0.0769906155450625	0.633813545518871	-0.0281929205347661	0.0290845487544304	0.0548377398823153	NA	NA	0.0469652699589927	0.548311015180253	227	59	714	0.714	0.227	0.454
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.33333333333336	2	27.33333333333334	0.0489970106942918	0.0769906155450625	0.636402376411887	-0.0279936048507708	0.0297092131666607	0.0589149238803555	NA	NA	0.0474814955757086	0.555479823823413	231	52	717	0.717	0.231	0.462
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	28.33333333333334	0.0496048518784087	0.0741343759774745	0.669120785389507	-0.0245295240990657	0.0309543691871215	0.0561688748759811	NA	NA	0.0468653153396871	0.600692687079428	253	41	706	0.706	0.253	0.506
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	28.750000000000004	0.0494514815652544	0.0730059198684049	0.677362625584228	-0.0235544383031504	0.0299811447750085	0.0552694832404278	NA	NA	0.0450136195944522	0.600783877159062	265	42	693	0.693	0.265	0.53
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.33333333333336	2	28.66666666666667	0.0489970106942918	0.073228852172937	0.669094342467374	-0.0242318414786452	0.0308273692734195	0.0529468741792799	NA	NA	0.0455834667457063	0.595008071448655	265	39	696	0.696	0.265	0.53
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.00000000000001	3	29.000000000000007	0.0491979618643599	0.111315003838705	0.441970625412255	-0.062117041974345	0.0314133435285673	0.0693275079566504	NA	NA	0.0605036896291621	0.304578068326947	126	15	859	0.859	0.126	0.252
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.66666666666669	3	29.000000000000007	0.0487976950102964	0.111315003838705	0.4383748221489	-0.0625173088284085	0.0302039931560121	0.070699757250478	NA	NA	0.0599489674765925	0.297021416245908	113	11	876	0.876	0.113	0.226
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.33333333333336	3	28.000000000000007	0.047824963769242	0.115613009870444	0.413664204598036	-0.0677880461012017	0.0285510113382311	0.0724001885912837	NA	NA	0.0686079031233139	0.323128108413375	137	15	848	0.848	0.137	0.274
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.33333333333336	4	28.000000000000007	0.047824963769242	0.158481820250405	0.301769399756245	-0.110656856481163	0.0288426753823762	0.086410330847562	NA	NA	0.0835439639264954	0.185325616863882	46	5	949	0.949	0.046	0.092
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.6666666666667	4	28.33333333333334	0.0482093635534236	0.156408563919793	0.308227135044508	-0.108199200366369	0.0295732160060081	0.089731957939941	NA	NA	0.0841106866718463	0.198306762102258	44	9	947	0.947	0.044	0.088
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.33333333333336	4	28.000000000000004	0.0595550832033079	0.158481820250405	0.375784951921989	-0.0989267370470973	0.030816480973021	0.0912539689563909	NA	NA	0.084275375722352	0.24045469787337	68	3	929	0.929	0.068	0.136
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.00000000000003	4	28.66666666666667	0.0590856583898357	0.154389040653111	0.382706299228791	-0.0953033822632758	0.0311606484101452	0.0898933617914305	NA	NA	0.0782502613969467	0.223250373624031	84	2	914	0.914	0.084	0.168
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.00000000000003	4	28.66666666666667	0.0590856583898357	0.154389040653111	0.382706299228791	-0.0953033822632758	0.0315003631252967	0.0910636747980366	NA	NA	0.0812223268161628	0.24064972921817	98	4	898	0.898	0.098	0.196
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.6666666666667	3	29.33333333333334	0.0470742716623405	0.109952605643907	0.428132388374639	-0.0628783339815661	0.0276562781126606	0.0706007234131249	NA	NA	0.0679843024498496	0.355020584592385	140	4	856	0.856	0.14	0.28
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.50000000000004	3	29.66666666666667	0.0471668164117002	0.108623210908842	0.434224103826973	-0.0614563944971418	0.028614704289573	0.0686615097245766	NA	NA	0.0722004569891925	0.394663143669823	183	7	810	0.81	0.183	0.366
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.58333333333339	3	29.250000000000004	0.0465716997700458	0.110290063467372	0.422265599509998	-0.0637183636973267	0.0271841980407549	0.0718354811850875	NA	NA	0.0713157793734675	0.371606624408934	152	2	846	0.846	0.152	0.304
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.41666666666671	3	29.083333333333336	0.0461240417078171	0.110971243090164	0.415639587549196	-0.0648472013823464	0.0285839759070888	0.0748350501154874	NA	NA	0.0694991063342426	0.35078627709991	134	7	859	0.859	0.134	0.268
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.66666666666671	3	28.833333333333336	0.0459914181557391	0.11200896641424	0.410604790206262	-0.0660175482585007	0.0276343425943059	0.0695307566552291	NA	NA	0.0713998637745297	0.355165018217398	147	6	847	0.847	0.147	0.294
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.66666666666671	3	28.833333333333336	0.0459914181557391	0.11200896641424	0.410604790206262	-0.0660175482585007	0.0286305228164157	0.0683985135433248	NA	NA	0.0705508526716276	0.349404928838669	159	1	840	0.84	0.159	0.318
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	89.16666666666671	3	29	0.0705019678600625	0.111315003838705	0.633355481550534	-0.0408130359786425	0.0365169553486405	0.0723295262809834	NA	NA	0.0752104024748646	0.587369789099241	278	2	720	0.72	0.278	0.556
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.50000000000006	3	30	0.0719113287774619	0.107325632730505	0.670029395102953	-0.0354143039530431	0.0379321635605665	0.0698382689123959	NA	NA	0.0724446187761452	0.624950319582056	323	4	673	0.673	0.323	0.646
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.83333333333339	3	30	0.0733782322461291	0.107325632730505	0.683697178197702	-0.0339474004843758	0.0379556416665145	0.0705187219507377	NA	NA	0.0744559594843087	0.648433604462728	308	2	690	0.69	0.308	0.616
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.50000000000006	3	29.666666666666668	0.0745955951479784	0.108623210908842	0.686737157959545	-0.0340276157608635	0.0393002738350242	0.070900696109789	NA	NA	0.0755874847719066	0.652584072209156	331	0	669	0.669	0.331	0.662
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTT	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0408208978880193	0.0712227512999824	NA	NA	0.0741180241045614	0.661820010372772	336	3	661	0.661	0.336	0.672
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTTAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333339	3	30.166666666666668	0.0496048518784087	0.106688419438138	0.464950667932346	-0.0570835675597295	0.0308533051493653	0.0693370650746135	NA	NA	0.0698702615197067	0.413931994966698	183	7	810	0.81	0.183	0.366
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAT:TTTAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333339	3	30.166666666666668	0.0496048518784087	0.106688419438138	0.464950667932346	-0.0570835675597295	0.0321231858677969	0.0662040657708259	NA	NA	0.0672368031709199	0.395885250902103	177	6	817	0.817	0.177	0.354
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAT:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.08333333333339	3	30.749999999999996	0.0503862036875865	0.104516640682884	0.482087860443817	-0.054130436995297	0.0316305771288187	0.0678202340017103	NA	NA	0.0669571770093164	0.418840970127126	195	3	802	0.802	0.195	0.39
N	all	ss13	350	AAT	ACA	AAG	2	GACAATGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333339	3	31.583333333333336	0.0513569565272317	0.101563372279023	0.505664152093532	-0.0502064157517909	0.030454432275573	0.0683618560083749	NA	NA	0.0670962331867541	0.454294463727564	188	6	806	0.806	0.188	0.376
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AATGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.66666666666671	2	31.5	0.0381438129251182	0.0663415654213976	0.574961001942463	-0.0281977524962794	0.0276620968425928	0.0500540680118851	NA	NA	0.0594906798966051	0.635509853603757	317	10	673	0.673	0.317	0.634
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	32	0.0379827996140662	0.100148544468392	0.379264619527785	-0.0621657448543258	0.0295066005218012	0.0636491273542249	NA	NA	0.0681817010418654	0.361892004564049	156	8	836	0.836	0.156	0.312
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.3333333333334	3	31	0.0373521168628637	0.103612753860613	0.360497288906271	-0.0662606369977492	0.0275673609065385	0.0657025118366175	NA	NA	0.0798073481967867	0.406393299368331	155	5	840	0.84	0.155	0.31
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.3333333333334	3	31	0.0368926831430787	0.103612753860613	0.356063146364292	-0.0667200707175341	0.0281053439530469	0.0663922091428029	NA	NA	0.0720075758951714	0.354149756854803	144	5	851	0.851	0.144	0.288
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.8333333333334	3	31.666666666666668	0.0362243442097796	0.101277212852957	0.357675168869163	-0.0650528686431775	0.0270899461034573	0.0665054846777363	NA	NA	0.0695971516417792	0.349939882662268	146	2	852	0.852	0.146	0.292
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666673	3	32.66666666666667	0.0365183693771989	0.0979651368127982	0.372769033610212	-0.0614467674355992	0.0269675008314121	0.0611505572733074	NA	NA	0.0705917382415098	0.384053070686967	173	1	826	0.826	0.173	0.346
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0295712052467381	0.0623701893114122	NA	NA	0.0727460830671946	0.503061082120369	211	2	787	0.787	0.211	0.422
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0311928681627186	0.0571515436808734	NA	NA	0.0736515506503689	0.497238570731091	258	2	740	0.74	0.258	0.516
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0306925509096955	0.0816251904540618	NaN	NaN	0.0905103466899583	0.313158760466963	126	0	874	0.874	0.126	0.252
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0293589594260709	0.0792050723455613	NaN	NaN	0.0898953024567348	0.300143753018973	113	0	887	0.887	0.113	0.226
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0366666267117751	0.0912496876318502	NaN	NaN	0.0997868126485194	0.462305128539424	228	2	770	0.77	0.228	0.456
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0374772319095692	0.0859655529978376	NaN	NaN	0.0945992445630443	0.444590489346459	207	0	793	0.793	0.207	0.414
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0399935383345869	0.0890852474036695	NaN	NaN	0.0981455193541868	0.470566200061249	210	0	790	0.79	0.21	0.42
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0393004714037537	0.0848983003342263	NaN	NaN	0.0926711794175818	0.466683249424613	211	0	789	0.789	0.211	0.422
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0397066057530884	0.0841587143638864	NaN	NaN	0.0993589505056834	0.500642863778348	224	0	776	0.776	0.224	0.448
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0414400123055964	0.0878027708961546	NaN	NaN	0.105884545824986	0.500617482657352	234	0	766	0.766	0.234	0.468
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0438388593450676	0.101262483311053	NaN	NaN	0.0995352778442142	0.348039634525694	131	0	869	0.869	0.131	0.262
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0472075174262556	0.0945267225296468	NaN	NaN	0.107728997115554	0.427693161771002	186	0	814	0.814	0.186	0.372
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0452619785857044	0.0919736968771751	NaN	NaN	0.0988266050392259	0.40879861778608	190	0	810	0.81	0.19	0.38
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0481090190176206	0.0990873766179851	NaN	NaN	0.104686183654206	0.45001015813662	200	0	800	0.8	0.2	0.4
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0488544770121026	0.0932226330241561	NaN	NaN	0.106906213711684	0.435919484344195	197	0	803	0.803	0.197	0.394
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0465607736897838	0.10246341165714801	NaN	NaN	0.0986292046017154	0.420517181011959	214	0	786	0.786	0.214	0.428
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0464337094563369	0.0946148960749079	NaN	NaN	0.109035668612692	0.47129567651998	215	0	785	0.785	0.215	0.43
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417147.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0309656293723412	0.0454763111687711	NA	NA	0.0592159482826258	0.889327282026842	561	1	438	0.438	0.561	0.876
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0319013697335989	0.0454023086231044	NaN	NaN	0.058314233412802	0.881194789846411	579	1	420	0.42	0.579	0.84
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0322516485819315	0.0451664249802175	NaN	NaN	0.0572478238061672	0.883459950292297	568	0	432	0.432	0.568	0.864
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0327054281826938	0.0442381044551091	NaN	NaN	0.0577944580937595	0.862790975138249	601	1	398	0.398	0.601	0.796
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0322490465095814	0.043741790486157	NA	NA	0.0571322516267559	0.82309314111725	592	1	407	0.407	0.592	0.814
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAACCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0310300796483417	0.0433839909129433	NA	NA	0.0535553044237264	0.798317911451322	627	1	372	0.372	0.627	0.744
N	all	ss13	8	---	AAC	CAA	1	CAA---AAT:CAACCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0329663708623385	0.0432204226451553	NA	NA	0.056788002769643	0.831698071091356	595	1	404	0.404	0.595	0.808
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:CCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0308206166300446	0.0426000945095884	NaN	NaN	0.0560158929280767	0.819524351193384	634	1	365	0.365	0.634	0.73
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0310192132317792	0.0407801573865764	NaN	NaN	0.0521810471543969	0.793375077203528	632	1	367	0.367	0.632	0.734
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0307941675515337	0.0417557278226866	NaN	NaN	0.0562771214844667	0.823430688366492	593	2	405	0.405	0.593	0.81
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0316134767761454	0.0424325949428119	NaN	NaN	0.0546327657251697	0.828101431423944	613	1	386	0.386	0.613	0.772
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0282682644997385	0.0416689511234067	NA	NA	0.0526647610996683	0.983796185662561	514	1	485	0.485	0.514	0.97
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0279832554219708	0.0432988442116878	NA	NA	0.0513395169372566	0.981519008452975	517	5	478	0.478	0.517	0.956
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0318548540194543	0.0420665764768701	NA	NA	0.0537199891697051	0.821695904759075	633	0	367	0.367	0.633	0.734
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0309774408593134	0.041718295415215	NaN	NaN	0.0514184435359816	0.813858068948486	622	0	378	0.378	0.622	0.756
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.033213130520807	0.0439353769240295	NA	NA	0.0550375202111859	0.663544411981612	710	0	290	0.29	0.71	0.58
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.032489938386588	0.0437954865349582	NaN	NaN	0.0573301991635134	0.68584846831636	667	2	331	0.331	0.667	0.662
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0341550810545391	0.0445300365698344	NaN	NaN	0.054222527890217	0.661336784847007	677	1	322	0.322	0.677	0.644
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0331875458426202	0.0451206836246708	NaN	NaN	0.0543035696615618	0.647859558239165	726	1	273	0.273	0.726	0.546
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0343437609033171	0.0447828935133527	NaN	NaN	0.0561021983286391	0.680256425029504	676	2	322	0.322	0.676	0.644
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.032794724723438	0.042850711956603	NaN	NaN	0.0549622297379671	0.671267422354166	682	0	318	0.318	0.682	0.636
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0319524115180019	0.0311162899286403	NaN	NaN	0.0467352741744052	0.265672106748455	865	1	134	0.134	0.865	0.268
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.033529529268448	0.0301704346423545	NA	NA	0.0472482438275771	0.252302784750586	888	0	112	0.112	0.888	0.224
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0322556380892956	0.0313364579268836	NaN	NaN	0.0452312773900314	0.247512848761119	880	1	119	0.119	0.88	0.238
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0335481809538953	0.0310745655790125	NaN	NaN	0.0458974693841692	0.257415357582659	879	2	119	0.119	0.879	0.238
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0296958742910676	0.030426981132697	NaN	NaN	0.044797674980515	0.409750176982809	803	1	196	0.196	0.803	0.392
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0252342984341803	0.0315343094838327	NA	NA	0.0405162052784685	0.559943308975413	727	4	269	0.269	0.727	0.538
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0260464880176269	0.0308016345888264	NA	NA	0.0412849088722937	0.562964166204422	719	1	280	0.28	0.719	0.56
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0277965725639505	0.0314064502910375	NA	NA	0.0416217363662265	0.587864150939535	712	4	284	0.284	0.712	0.568
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0267109189568693	0.0452786627166857	NA	NA	0.0508173078991964	0.89170235787027	474	0	526	0.526	0.474	0.948
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0269454708534514	0.04661370572937	NA	NA	0.0506067066066953	0.930277998833318	483	3	514	0.514	0.483	0.966
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.023371524619118	0.0438226889443579	NA	NA	0.0506865955470148	0.709404652957404	341	7	652	0.652	0.341	0.682
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0230008655185382	0.0448210257073151	NA	NA	0.0499966784645696	0.689173866315617	362	10	628	0.628	0.362	0.724
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0187901065515869	0.0437022501555803	NA	NA	0.0464258393652413	0.472199365429311	225	18	757	0.757	0.225	0.45
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0198590933315284	0.0434257739115071	NA	NA	0.049295550237488	0.500695769706091	255	9	736	0.736	0.255	0.51
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0173992569677028	0.0432754658862959	NA	NA	0.0481704935841723	0.472480659727192	218	10	772	0.772	0.218	0.436
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0177453659746121	0.042683335656062	NA	NA	0.0480649217084275	0.487153643435401	217	21	762	0.762	0.217	0.434
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0182065633838403	0.0293114940234081	NA	NA	0.0330723663356647	0.933112708968664	451	39	510	0.51	0.451	0.902
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0192041227583681	0.029622873243982	NA	NA	0.0348669613568612	0.945690000584274	480	39	481	0.481	0.48	0.96
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0184589857407503	0.0295149464669805	NA	NA	0.0351385248082434	0.963375706540691	464	47	489	0.489	0.464	0.928
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.019133796759898	0.0279537263353918	NA	NA	0.0339093495346171	0.971117276185574	483	51	466	0.466	0.483	0.932
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0191442935411026	0.0286773883683074	NA	NA	0.0341591710710688	0.978924861301932	497	51	452	0.452	0.497	0.904
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0181569851098512	0.0284197563797644	NA	NA	0.0352218189394163	0.976633895026257	490	45	465	0.465	0.49	0.93
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.019185153001803	0.0288894331655304	NA	NA	0.0346337702966989	0.95917839025485	477	56	467	0.467	0.477	0.934
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0187730909798269	0.0435832356970117	NA	NA	0.0484523969182694	0.513113350837077	226	13	761	0.761	0.226	0.452
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0180053544741781	0.0461808419848405	NA	NA	0.0489959354783548	0.51019682085717	245	15	740	0.74	0.245	0.49
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0185961919301662	0.0458632696369346	NA	NA	0.0475220923619392	0.497166473639704	235	14	751	0.751	0.235	0.47
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0182800111870851	0.042557359748802	NA	NA	0.0491364448620896	0.514593267502581	248	16	736	0.736	0.248	0.496
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0191250871996281	0.0445540537382694	NA	NA	0.0491493966827756	0.523947327458371	243	11	746	0.746	0.243	0.486
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0188322618860945	0.0433401717776178	NA	NA	0.0490169471974001	0.522826487074517	274	12	714	0.714	0.274	0.548
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0194277334818763	0.0435667841009225	NA	NA	0.0482315028358286	0.512799498802434	229	16	755	0.755	0.229	0.458
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0186268561856001	0.0465464510365083	NA	NA	0.0507473041206595	0.520467946667763	231	20	749	0.749	0.231	0.462
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0196707656524501	0.0450400212564698	NA	NA	0.0517745680076141	0.507309318524234	254	16	730	0.73	0.254	0.508
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0221034220215086	0.0458979275045082	NaN	NaN	0.0522741011147129	0.671774512721955	329	7	664	0.664	0.329	0.658
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0223763498165413	0.0460892954382074	NA	NA	0.0555162532128976	0.673120379386796	329	4	667	0.667	0.329	0.658
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0230214759274912	0.0481175448670233	NA	NA	0.0551811363118605	0.677738813771023	341	5	654	0.654	0.341	0.682
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0229215109251381	0.0466544371929588	NA	NA	0.0528793817271188	0.664550648015421	340	10	650	0.65	0.34	0.68
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0224853765094321	0.0494426274986907	NA	NA	0.0549783902033982	0.658567752035733	321	6	673	0.673	0.321	0.642
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0218042361151743	0.0492614427101334	NA	NA	0.055291059627587	0.635448480670248	322	4	674	0.674	0.322	0.644
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0224747621132799	0.0468529015934974	NA	NA	0.0529378928072141	0.648682481199433	307	11	682	0.682	0.307	0.614
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	33.25	0.039920730758297	0.0626996766264699	0.636697554217428	-0.0227789458681729	0.0223637645612898	0.049240652304556	NA	NA	0.0547733983938373	0.677500688338517	347	4	649	0.649	0.347	0.694
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333336	2	32.916666666666664	0.0400986359257937	0.0633621979772033	0.632847931509898	-0.0232635620514096	0.0230266908884716	0.0458656913396097	NA	NA	0.0528596631705933	0.659864349136994	325	4	671	0.671	0.325	0.65
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.00000000000003	2	33.083333333333336	0.0405504159527068	0.0630291953285242	0.643359251872846	-0.0224787793758174	0.0224212017532243	0.0463871117138915	NA	NA	0.0510795258994895	0.659883397452043	343	8	649	0.649	0.343	0.686
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.75000000000003	2	33.333333333333336	0.0276210731371878	0.0625362067042883	0.441681301006922	-0.0349151335671005	0.0193814789475309	0.0475298728977077	NA	NA	0.0512729884318548	0.495893353280648	230	20	750	0.75	0.23	0.46
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.75000000000003	2	32.333333333333336	0.0276210731371878	0.0645559565784322	0.427862502565966	-0.0369348834412444	0.0192496514149369	0.0512433442558134	NA	NA	0.052017478834660603	0.477674649497398	214	15	771	0.771	0.214	0.428
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.16666666666669	2	32.5	0.0137934922285677	0.0642103145422439	0.214817390740127	-0.0504168223136762	0.0128669205273119	0.0499600855101544	NA	NA	0.0493069535204042	0.306539876955903	100	50	850	0.85	0.1	0.2
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.83333333333336	2	33.166666666666664	0.0140519332931024	0.0628640039123036	0.223529085304605	-0.0488120706192012	0.013701228633531	0.0500601738902989	NA	NA	0.0515531352568646	0.343725258267796	120	37	843	0.843	0.12	0.24
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.83333333333336	2	33.166666666666664	0.0140519332931024	0.0628640039123036	0.223529085304605	-0.0488120706192012	0.0142743761368466	0.0471522049612868	NA	NA	0.048251365676543	0.311719540801684	119	45	836	0.836	0.119	0.238
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000003	2	33.166666666666664	0.0138252762666285	0.0628640039123036	0.219923571618426	-0.0490387276456751	0.0135184265261771	0.0475755370992629	NA	NA	0.0505669475168159	0.332157018978219	117	43	840	0.84	0.117	0.234
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.9166666666667	2	33.25	0.0138412232800193	0.0626996766264699	0.220754300895005	-0.0488584533464506	0.0133810304273553	0.0477967307439248	NA	NA	0.0472438950947481	0.301054377666622	113	44	843	0.843	0.113	0.226
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.9166666666667	2	33.583333333333336	0.0283386721709848	0.0620508745044359	0.456700608932738	-0.0337122023334511	0.0195516042884925	0.0460972522573663	NA	NA	0.054528521054121	0.53641123002620394	240	22	738	0.738	0.24	0.48
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.9166666666667	2	33.583333333333336	0.0283386721709848	0.0620508745044359	0.456700608932738	-0.0337122023334511	0.0201701140391616	0.0459941920222064	NA	NA	0.0513014187798705	0.511091051514955	266	20	714	0.714	0.266	0.532
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.58333333333337	2	32.916666666666664	0.0280734527889724	0.0633621979772033	0.443063114683503	-0.0352887451882309	0.0198172134308286	0.0494231710475504	NA	NA	0.0533915499503368	0.508649181009535	233	17	750	0.75	0.233	0.466
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.9166666666667	2	33.583333333333336	0.0283386721709848	0.0620508745044359	0.456700608932738	-0.0337122023334511	0.0199878969048262	0.0481151982055611	NA	NA	0.0529174933850596	0.524078573850696	231	12	757	0.757	0.231	0.462
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.9166666666667	2	33.583333333333336	0.0283386721709848	0.0620508745044359	0.456700608932738	-0.0337122023334511	0.0205124847314668	0.0479742415416715	NA	NA	0.0541908895026563	0.533875508638829	240	13	747	0.747	0.24	0.48
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.58333333333337	2	34.24999999999999	0.0288844360583938	0.0607927570603562	0.475129562387124	-0.0319083210019624	0.0212689989681824	0.0444608494293837	NA	NA	0.0542817043127328	0.556647558474187	251	16	733	0.733	0.251	0.502
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.25000000000003	2	34.24999999999999	0.0286089511947678	0.0607927570603562	0.47059802151043	-0.0321838058655884	0.0201559034625119	0.0461451432563265	NA	NA	0.051524042144417	0.532209549733096	235	14	751	0.751	0.235	0.47
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.25000000000003	2	34.24999999999999	0.0286089511947678	0.0607927570603562	0.47059802151043	-0.0321838058655884	0.0199078889071131	0.0447945319392077	NA	NA	0.0509152800771078	0.527318232895061	259	18	723	0.723	0.259	0.518
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.50000000000003	2	33.99999999999999	0.0431773888661084	0.0612585232607004	0.70483887903005	-0.0180811343945921	0.0248493577646182	0.046606095692568	NA	NA	0.0550452420794972	0.742550504225017	363	9	628	0.628	0.363	0.726
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.50000000000003	1	33.666666666666664	0.0431773888661084	0.0303071537534075	1.42465997359629	0.0128702351127009	0.0242861032942234	0.0321346303484949	NA	NA	0.0426976602244972	0.763088774477242	611	11	378	0.378	0.611	0.756
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.75000000000003	1	33.666666666666664	0.0430225461599401	0.0303071537534075	1.41955085950963	0.0127153924065326	0.0239115188747633	0.0339024990228241	NA	NA	0.0405866039215284	0.754060061155854	654	17	329	0.329	0.654	0.658
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	2	34.33333333333333	0.0437548116643347	0.0606390724718212	0.721561361029516	-0.0168842608074864	0.0248578318970212	0.0468414133866788	NA	NA	0.052634185845857	0.748373277014756	409	6	585	0.585	0.409	0.818
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	2	35.33333333333333	0.0441845540246642	0.0588537115811214	0.750752209803491	-0.0146691575564572	0.0255666673349658	0.048017251922918	NA	NA	0.0526407908524478	0.780501756094733	391	4	605	0.605	0.391	0.782
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333337	2	35.5	0.0447337539717067	0.0585663277285774	0.763813537687098	-0.0138325737568707	0.0253375103074405	0.0436759030222525	NA	NA	0.0506100685314511	0.784609827146419	442	9	549	0.549	0.442	0.884
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333337	2	35.5	0.0450698784927921	0.0585663277285774	0.769552748836602	-0.0134964492357854	0.0261984185651838	0.0427934624248404	NA	NA	0.0504456279745985	0.789049972836886	431	5	564	0.564	0.431	0.862
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.833333333333336	0.045296782717305	0.0579999025523778	0.780980324516906	-0.0127031198350728	0.0268827790359049	0.0454952329181955	NA	NA	0.0517868141160889	0.806226927567937	416	4	580	0.58	0.416	0.832
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	2	36.166666666666664	0.0450698784927921	0.0574443341110379	0.78458353100018	-0.0123744556182457	0.0252596367813478	0.0418055965729154	NA	NA	0.0512101385978161	0.809058553948512	438	6	556	0.556	0.438	0.876
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333336	2	35.666666666666664	0.0447337539717067	0.0582817382454872	0.76754323598388	-0.0135479842737805	0.0265947621334376	0.0431058033567289	NA	NA	0.0514076078291523	0.792134047908263	424	3	573	0.573	0.424	0.848
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.5	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0251821398125159	0.0445352667270656	NA	NA	0.0525288444540626	0.785839109606779	406	1	593	0.593	0.406	0.812
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	35.666666666666664	0.0454110940157692	0.0582817382454872	0.779165058950269	-0.012870644229718	0.0256394371708231	0.0438782110496505	NA	NA	0.0514821210710674	0.802585636760596	442	5	553	0.553	0.442	0.884
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	35	0.0451830456487547	0.0594370287406054	0.760183451395967	-0.0142539830918507	0.0265190200452761	0.044756574704128	NA	NA	0.0542617370171662	0.7927899882003	414	6	580	0.58	0.414	0.828
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000003	2	34.666666666666664	0.0449572769752751	0.0600320307551523	0.748888158700455	-0.0150747537798772	0.0254869788116587	0.0444263023597804	NA	NA	0.0524272092833369	0.773701302550713	417	6	577	0.577	0.417	0.834
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.83333333333337	2	34.75	0.0449011870069398	0.0598821656332629	0.749825704065693	-0.0149809786263231	0.0258628036933244	0.0455949731652005	NA	NA	0.0528501390941704	0.776823106005905	386	8	606	0.606	0.386	0.772
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000004	2	35.5	0.0446228241484838	0.0585663277285774	0.761919448924404	-0.0139435035800937	0.0250857943457292	0.0447154034463414	NA	NA	0.0527581623759771	0.791555751903773	404	8	588	0.588	0.404	0.808
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000004	1	35.5	0.0442933122327008	0.0287116399282627	1.54269530905826	0.0155816723044381	0.0244200797308829	0.0290278298329134	NA	NA	0.0388886371207887	0.688660032226876	671	18	311	0.311	0.671	0.622
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333337	1	35.83333333333333	0.044076328753575	0.0284394261467203	1.54983186109956	0.0156369026068547	0.0238350972284891	0.0303350644538563	NA	NA	0.0380183467472547	0.680853406742638	642	20	338	0.338	0.642	0.676
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	1	36	0.0438614614252191	0.0283052459871352	1.54958771406382	0.0155562154380838	0.0248321058855589	0.0309103225315402	NA	NA	0.038261054916388	0.684315802955636	657	17	326	0.326	0.657	0.652
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.75000000000003	1	35.666666666666664	0.043648679432241	0.0285748846742028	1.52751900593484	0.0150737947580382	0.0245301588804238	0.0301902498434494	NA	NA	0.04113240429087	0.714014348070637	676	13	311	0.311	0.676	0.622
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	1	35.666666666666664	0.044076328753575	0.0285748846742028	1.54248492185051	0.0155014440793722	0.0244935175926016	0.0297633529566948	NA	NA	0.0393384955435755	0.693542062023488	659	17	324	0.324	0.659	0.648
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	1	35.666666666666664	0.044076328753575	0.0285748846742028	1.54248492185051	0.0155014440793722	0.0252286041382859	0.0291770895641402	NA	NA	0.0377011457223884	0.680950529542069	653	23	324	0.324	0.653	0.648
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.08333333333336	1	35.666666666666664	0.044076328753575	0.0285748846742028	1.54248492185051	0.0155014440793722	0.0246844375948136	0.0290682546287002	NA	NA	0.0385271144281274	0.687425323845669	642	25	333	0.333	0.642	0.666
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.41666666666669	1	36.333333333333336	0.0438614614252191	0.0280406490537152	1.56420992043362	0.0158208123715038	0.0251098790579116	0.0278179735937541	NA	NA	0.0393401888823252	0.687570729957085	687	14	299	0.299	0.687	0.598
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.91666666666669	2	37.50000000000001	0.0595107578353943	0.0553246126797069	1.07566515069744	0.00418614515568749	0.0290593890655759	0.0390525804651318	NA	NA	0.0420894028329578	0.920774306769388	568	0	432	0.432	0.568	0.864
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000001	2	37.91666666666667	0.0444574574471551	0.054693929928504303	0.812840794312454	-0.0102364724813492	0.0257417267811118	0.0409062386635766	NA	NA	0.038804776507843	0.791938553574044	428	13	559	0.559	0.428	0.856
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666669	2	38.41666666666667	0.0443478924201168	0.0539558430514737	0.821929376171718	-0.00960795063135681	0.0258825588723747	0.0397379776152159	NA	NA	0.0376072416345312	0.798351310006395	446	14	540	0.54	0.446	0.892
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666669	2	37.75000000000001	0.0443478924201168	0.0549444688504895	0.807140251747502	-0.0105965764303726	0.0258892841004099	0.0412064421812391	NA	NA	0.0374525960023269	0.777228175120318	399	22	579	0.579	0.399	0.798
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666669	2	37.75000000000001	0.0443478924201168	0.0549444688504895	0.807140251747502	-0.0105965764303726	0.0265053594574878	0.037729545083074	NA	NA	0.0379797911851087	0.780240486705625	404	21	575	0.575	0.404	0.808
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.58333333333336	2	37.91666666666667	0.0598075134656445	0.054693929928504303	1.09349453483823	0.0051135835371402	0.0297106551834226	0.0387830282065362	NA	NA	0.0419171919608113	0.902904948651746	557	5	438	0.438	0.557	0.876
N	all	ss13	110	TAT	GGT	ATT	2	TGGTATTTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	67.91666666666669	2	38.583333333333336	0.061336846107546	0.0537142229868647	1.14191070254419	0.00762262312068127	0.0307921203460176	0.0369888623318573	NA	NA	0.0422089962088201	0.856687536713435	599	2	399	0.399	0.599	0.798
N	all	ss13	111	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTAC:TATTTCTAT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.41666666666669	2	37.583333333333336	0.0608698920112345	0.0551973146854054	1.10276908139752	0.0056725773258291	0.0305658800081588	0.0380959912793146	NA	NA	0.0414724708418203	0.891205211845282	590	6	404	0.404	0.59	0.808
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.08333333333336	2	36.91666666666667	0.061180400295082	0.0562324166616758	1.08799165903141	0.00494798363340618	0.0308777648262415	0.0403508983443776	NA	NA	0.0422365987722531	0.906741824471704	560	8	432	0.432	0.56	0.864
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.75000000000001	2	36.25000000000001	0.0605625213547463	0.0573071018565008	1.0568065631097	0.00325541949824548	0.03042185482831	0.041973731978317	NA	NA	0.0435679328790591	0.940437064309496	530	8	462	0.462	0.53	0.924
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.25000000000001	2	35.75000000000001	0.060107245116144	0.0581404786806199	1.03382783355342	0.0019667664355241	0.0297548850712161	0.0427440013976628	NA	NA	0.0423535860761235	0.962962079075258	538	10	452	0.452	0.538	0.904
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.91666666666669	2	36.083333333333336	0.0586379101169781	0.0575822255219405	1.0183335149947501	0.00105568459503768	0.0291433484272599	0.0409081663246362	NA	NA	0.0411794908244871	0.979547532805832	554	5	441	0.441	0.554	0.882
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.41666666666669	2	36.583333333333336	0.0582110227221988	0.0567646707244322	1.02547979190768	0.00144635199776662	0.0294292862722114	0.0402024735973496	NA	NA	0.0432353571953445	0.973313352897745	539	7	454	0.454	0.539	0.908
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.75000000000003	2	36.25	0.0579298692281368	0.0573071018565008	1.01086719361931	6.22767371635947e-4	0.0293145661901098	0.0412043035111167	NA	NA	0.0429210540854227	0.988423419536363	515	9	476	0.476	0.515	0.952
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.4166666666667	2	35.583333333333336	0.0573756358851215	0.058423686245627	0.982061207913187	-0.00104805036050553	0.0285217350287908	0.0399842157284097	NA	NA	0.0422322690633125	0.980201457401708	510	6	484	0.484	0.51	0.968
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000003	2	34.583333333333336	0.0562984016666259	0.0601826482875392	0.935459027951791	-0.00388424662091327	0.0274466349466259	0.0426162744733677	NA	NA	0.0419338193798252	0.926199083443701	464	4	532	0.532	0.464	0.928
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.08333333333336	2	34.583333333333336	0.0568319121182793	0.0601826482875392	0.944323882969543	-0.00335073616925985	0.0290547860036126	0.0424107231158866	NA	NA	0.0447414307076715	0.940301336360784	490	7	503	0.503	0.49	0.98
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.75000000000003	2	34.583333333333336	0.0562984016666259	0.0601826482875392	0.935459027951791	-0.00388424662091327	0.0285670868991637	0.0433650980639059	NA	NA	0.0428371351783781	0.927751032727275	487	5	508	0.508	0.487	0.974
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.4166666666667	2	33.91666666666667	0.0414374651394939	0.0614153696041381	0.674708389880013	-0.0199779044646442	0.0241026772574003	0.0453287526304234	NA	NA	0.0420690762425242	0.634870109306263	306	25	669	0.669	0.306	0.612
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.4166666666667	2	34.583333333333336	0.0414374651394939	0.0601826482875392	0.688528443306698	-0.0187451831480453	0.0241815893591328	0.0429242028036059	NA	NA	0.0424567090865064	0.658841752002135	308	18	674	0.674	0.308	0.616
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75000000000003	2	35.25	0.0418226808888407	0.0589984642956841	0.708877449406765	-0.0171757834068435	0.0244522583524135	0.0432860184016216	NA	NA	0.0407287030474384	0.673235233918876	314	17	669	0.669	0.314	0.628
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75000000000003	2	35.25	0.0418226808888407	0.0589984642956841	0.708877449406765	-0.0171757834068435	0.0244100551937011	0.0427531797366696	NA	NA	0.0393544819073909	0.662519120358444	329	15	656	0.656	0.329	0.658
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25000000000003	2	35.41666666666667	0.0415331021017154	0.0587096677913667	0.707432074889424	-0.0171765656896513	0.0256067533750839	0.0444588301277747	NA	NA	0.0408761326360554	0.674331943015202	342	18	640	0.64	0.342	0.684
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000003	2	34.41666666666667	0.0409658133601689	0.0604861633757488	0.677275778026842	-0.0195203500155799	0.0236222941715182	0.0425777384401321	NA	NA	0.0413924589196752	0.637218080652909	307	15	678	0.678	0.307	0.614
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000003	2	34.41666666666667	0.0409658133601689	0.0604861633757488	0.677275778026842	-0.0195203500155799	0.0237929673911845	0.0459672850064753	NA	NA	0.0405447090485129	0.630194957954978	304	18	678	0.678	0.304	0.608
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000003	2	33.91666666666667	0.0409658133601689	0.0614153696041381	0.667028687187265	-0.0204495562439692	0.0235389941006701	0.0444223538428266	NA	NA	0.0404205407245155	0.612912876105137	304	17	679	0.679	0.304	0.608
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.6666666666667	2	33.833333333333336	0.0272757331281561	0.0615730216404005	0.442981883972695	-0.0342972885122444	0.0187150009543864	0.0428121474097787	NA	NA	0.0392082837304837	0.381712136770508	162	42	796	0.796	0.162	0.324
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.33333333333337	2	34.16666666666667	0.027400307499342	0.0609472230590743	0.449574338650075	-0.0335469155597323	0.0200940216275548	0.0436493365914469	NA	NA	0.0393811830308687	0.394296578663983	138	55	807	0.807	0.138	0.276
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000004	2	34.16666666666667	0.0272447663451876	0.0609472230590743	0.447022275629852	-0.0337024567138867	0.0192531939357251	0.0424898148719815	NA	NA	0.0385538534350499	0.382028016169932	151	44	805	0.805	0.151	0.302
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000004	1	34.16666666666667	0.0270604324233619	0.0298546878003148	0.906404803304512	-0.00279425537695286	0.0193514065173625	0.0296492829274747	NA	NA	0.0215137481041288	0.896659537488539	364	134	502	0.502	0.364	0.728
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	33.50000000000001	0.0271830432683088	0.0304610393656427	0.89238725382985	-0.00327799609733386	0.0188341372192656	0.030391237471473	NA	NA	0.0232481129034591	0.88786952852494	375	126	499	0.499	0.375	0.75
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	1	33.333333333333336	0.0271215992572094	0.0306164958901914	0.88584922828802	-0.00349489663298199	0.0196211141845651	0.0315130433904429	NA	NA	0.0210624211358004	0.868211698375809	345	141	514	0.514	0.345	0.69
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	1	33.666666666666664	0.0272447663451876	0.0303071537534075	0.898954965116921	-0.0030623874082199	0.0196357337401935	0.0317550697007275	NA	NA	0.0219568212628007	0.889076257967692	390	125	485	0.485	0.39	0.78
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666671	1	34	0.0273690573365762	0.0300040009602743	0.912180257986698	-0.00263494362369817	0.0204316631735227	0.0307113944100526	NA	NA	0.0220448236828908	0.904858138546311	389	134	477	0.477	0.389	0.778
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.66666666666667	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.0201088332968539	0.0318997302252079	NA	NA	0.0226894274234173	0.901343992373164	360	133	507	0.507	0.36	0.72
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333339	1	34.16666666666667	0.0276848040229394	0.0298546878003148	0.927318490419702	-0.00216988377737538	0.019806217563912	0.0321799579175784	NA	NA	0.0212863166882642	0.918805916246196	393	139	468	0.468	0.393	0.786
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333339	1	34.16666666666667	0.0276848040229394	0.0298546878003148	0.927318490419702	-0.00216988377737538	0.018753380264962	0.0301445425051204	NA	NA	0.0221760615002032	0.922052973414484	404	107	489	0.489	0.404	0.808
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	1	33.833333333333336	0.0270604324233619	0.0301548153585304	0.897383456062414	-0.00309438293516844	0.0190750591623551	0.0300521740667263	NA	NA	0.0226458181565303	0.891313321100379	369	136	495	0.495	0.369	0.738
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	1	34.833333333333336	0.0270604324233619	0.0292720079293014	0.924447427341474	-0.0022115755059395	0.0198773544715028	0.0278352006414176	NA	NA	0.0209693289901627	0.91600512978855	374	138	488	0.488	0.374	0.748
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	1	35.16666666666667	0.0271830432683088	0.0289891158257093	0.937698253087154	-0.00180607255740051	0.0190576378327443	0.0281389871883355	NA	NA	0.0208461560325531	0.930959134324336	402	124	474	0.474	0.402	0.804
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAAGAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	35.583333333333336	0.0412002891133781	0.058423686245627	0.70519838375419	-0.0172233971322489	0.0237928977796376	0.0431010498858989	NA	NA	0.0283992682606274	0.544200525923396	233	46	721	0.721	0.233	0.466
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333339	2	35.833333333333336	0.0556454425645553	0.0579999025523778	0.959405794075322	-0.0023544599878224802	0.0282276865709927	0.0398816084462022	NA	NA	0.0304966793828228	0.938461406916261	469	12	519	0.519	0.469	0.938
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATC:GATCACATT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666673	2	36.333333333333336	0.0573756358851215	0.0571705240409132	1.00358772020458	2.05111844208274e-4	0.0292636524978145	0.0405238788982903	NA	NA	0.0299475016645943	0.99453529392619	501	16	483	0.483	0.501	0.966
N	all	ss13	147	ATC	ACA	TCG	2	CACATCGGC:CACATTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.0833333333334	2	36.16666666666667	0.05765141989764	0.0574443341110379	1.00360498193263	2.07085786602189e-4	0.0280256475197669	0.0399206579013061	NA	NA	0.0304253492746493	0.9945693548281	488	18	494	0.494	0.488	0.976
N	all	ss13	148	GGC	TCG	GCA	2	ATCGGCACC:ATTGGCACC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	2	35.333333333333336	0.0568319121182793	0.0588537115811214	0.965647035530539	-0.00202179946284215	0.0284159203121093	0.0432147672820961	NA	NA	0.0328160376877523	0.950873331177945	469	13	518	0.518	0.469	0.938
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.0833333333334	2	35.333333333333336	0.05765141989764	0.0588537115811214	0.979571523168523	-0.00120229168348136	0.0282633193527231	0.0433409999845778	NA	NA	0.0308015459974482	0.968863691783446	465	12	523	0.523	0.465	0.93
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	2	34.666666666666664	0.0571024790858329	0.0600320307551523	0.951200190423876	-0.00292955166931942	0.0306594944673324	0.0424437231517113	NA	NA	0.031163289718985	0.925103996554471	446	8	546	0.546	0.446	0.892
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	2	34.833333333333336	0.0572387314369154	0.0597330472949441	0.958242280094762	-0.00249431585802863	0.0290856712735249	0.0434526942829412	NA	NA	0.0318652423816567	0.937607705664305	455	15	530	0.53	0.455	0.91
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	2	34.5	0.0575131971253351	0.0603340239140544	0.953246499972593	-0.00282082678871932	0.0285163014446532	0.0433076236296183	NA	NA	0.0317410883877118	0.92918531927117	445	15	540	0.54	0.445	0.89
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	2	34.5	0.0569668741816511	0.0603340239140544	0.944191527201968	-0.00336714973240334	0.0293043312921541	0.0421281205894055	NA	NA	0.0320472109014355	0.916321519801062	435	19	546	0.546	0.435	0.87
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666673	1	34.333333333333336	0.0420179878270026	0.0297068535712844	1.41442067320178	0.0123111342557182	0.0252769775356903	0.0297229338052199	NA	NA	0.0264048269449451	0.641039716168524	647	47	306	0.306	0.647	0.612
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000007	1	34.166666666666664	0.0421163271222965	0.0298546878003148	1.41071068650909	0.0122616393219818	0.0254593998147346	0.0305401502343887	NA	NA	0.0274354245410415	0.654927575435582	653	44	303	0.303	0.653	0.606
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.5833333333334	1	34.166666666666664	0.0425143321315747	0.0298546878003148	1.42404209402339	0.012659644331259901	0.0243944970396288	0.0301415805519848	NA	NA	0.0249373092371278	0.611692650846059	644	44	312	0.312	0.644	0.624
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	1	34.166666666666664	0.0569668741816511	0.0298546878003148	1.90813833199925	0.0271121863813363	0.0275126125316263	0.0309248257954682	NA	NA	0.02988150812598	0.364235894852596	795	20	185	0.185	0.795	0.37
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	1	34	0.0568319121182793	0.0300040009602743	1.89414445738505	0.0268279111580049	0.0273389731037342	0.030818489309592	NA	NA	0.0302652566364839	0.375387999982343	785	22	193	0.193	0.785	0.386
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	1	34.666666666666664	0.042766928969766	0.029415534864961	1.45388921758852	0.013351394104805	0.024776487908549	0.0301684508978835	NA	NA	0.0251786783588249	0.595927597890442	650	46	304	0.304	0.65	0.608
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0249469744865958	0.0284325672638705	NA	NA	0.0247257642140286	0.582385059460773	684	44	272	0.272	0.684	0.544
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.028849710620847	1.48948386556132	0.0141214678750176	0.0248860869260808	0.0308952815333627	NA	NA	0.0258858937933769	0.58539074700841	683	45	272	0.272	0.683	0.544
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0244913832328355	0.0282869209946651	NA	NA	0.0249167103766314	0.579978290337792	686	48	266	0.266	0.686	0.532
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0235900019330351	0.0286937960904473	NA	NA	0.025880985137114	0.594173958592831	672	42	286	0.286	0.672	0.572
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0571705240409132	0.744520242876842	-0.0146059115965762	0.0254472708863809	0.0416518084532104	NA	NA	0.0419534107728132	0.727730549443187	369	18	613	0.613	0.369	0.738
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0287882143256839	0.0513749760962707	NA	NA	0.0433612589340875	0.490539659167214	238	5	757	0.757	0.238	0.476
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	3	36	0.0573071018565008	0.0883372767422876	0.648730682786235	-0.0310301748857868	0.028009611631537	0.0514394630914065	NA	NA	0.0454033673424495	0.494333060180785	247	3	750	0.75	0.247	0.494
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.028823011066088	0.049596246861955	NA	NA	0.0438933128430469	0.512107852022617	249	8	743	0.743	0.249	0.498
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	3	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.0849965139802523	0.859451690051178	-0.0119461163914659	0.0338754523088912	0.0511174101280649	NA	NA	0.0471773319275839	0.800100302204128	410	1	589	0.589	0.41	0.82
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	4	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.113962844188242	0.648908713450963	-0.0400113615848373	0.0337269950204008	0.0602196222694112	NaN	NaN	0.0574693752099825	0.48629070296155	245	0	755	0.755	0.245	0.49
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	4	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.112359208671495	0.663077759981812	-0.0378563162722712	0.0339738328266505	0.0590661894997053	NaN	NaN	0.0573879712447417	0.509474645463372	240	0	760	0.76	0.24	0.48
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0337600556314207	0.059802323127614	NA	NA	0.0546117849948862	0.530249972859147	280	1	719	0.719	0.28	0.56
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0329740147342838	0.0543860000983585	NaN	NaN	0.0543965442103028	0.54552022025905	282	0	718	0.718	0.282	0.564
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0342772927275643	0.0558452406879304	NaN	NaN	0.0517754565652937	0.517657204749555	258	0	742	0.742	0.258	0.516
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.033845952852367	0.0588333271120633	NA	NA	0.0567665779220118	0.510991695417213	257	1	742	0.742	0.257	0.514
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0342303150122001	0.0623635064192805	NaN	NaN	0.0573308365704618	0.472316879122871	236	2	762	0.762	0.236	0.472
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0345562786157293	0.0603029681625469	NA	NA	0.0603335072229734	0.501777013147803	275	0	725	0.725	0.275	0.55
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0326726196218025	0.0598133469953645	NA	NA	0.0589608388662931	0.483649037597352	242	0	758	0.758	0.242	0.484
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0325771130136567	0.0652014874315662	NA	NA	0.0591204481633249	0.466612710835454	217	1	782	0.782	0.217	0.434
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.0336969172153504	0.0684810687953955	NaN	NaN	0.0607737513109298	0.472430000392996	228	1	771	0.771	0.228	0.456
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0357228144453973	0.0648761084722294	NaN	NaN	0.0615998185285746	0.466123282971528	224	1	775	0.775	0.224	0.448
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0327132472338234	0.0639507629021385	NaN	NaN	0.061038066983426	0.454277051117188	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0354617155763107	0.065328874346962107	NaN	NaN	0.0647222106538055	0.472115240350199	232	0	768	0.768	0.232	0.464
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0349766697499881	0.0675786187877201	NaN	NaN	0.0611012040848455	0.446266629794857	215	1	784	0.784	0.215	0.43
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0332114567904336	0.0645129443795918	NA	NA	0.0585017549327559	0.41868120855223	216	1	783	0.783	0.216	0.432
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0326142000507497	0.0664403283867889	NaN	NaN	0.0612355554461952	0.43246596495885	211	1	788	0.788	0.211	0.422
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.035883414329109	0.0783873973539708	NA	NA	0.0732160896467956	0.330234577851118	130	1	869	0.869	0.13	0.26
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.035326387239553	0.0772234497944253	NaN	NaN	0.0678430041013364	0.282428198412187	116	0	884	0.884	0.116	0.232
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0353987965830456	0.0810663944148981	NaN	NaN	0.0704250008276622	0.300448463131999	117	0	883	0.883	0.117	0.234
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0345959031553303	0.0797228483721482	NaN	NaN	0.0712068399253799	0.300037044146626	122	1	877	0.877	0.122	0.244
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0362006146373314	0.0785587964316052	NA	NA	0.0730527570174103	0.312415249736044	122	0	878	0.878	0.122	0.244
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0345542298174077	0.0816205038478859	NA	NA	0.0683428024266804	0.303230280468743	122	1	877	0.877	0.122	0.244
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0357425893503127	0.0794138287880283	NA	NA	0.0698372581521831	0.271174305819154	108	1	891	0.891	0.108	0.216
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0347782188082985	0.0853579286625382	NaN	NaN	0.0781796305970291	0.280006058827743	100	0	900	0.9	0.1	0.2
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0301251694606057	0.0806788449020824	NaN	NaN	0.0703897591682153	0.333711712283157	123	0	877	0.877	0.123	0.246
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0269121730392967	0.0779026730145873	NaN	NaN	0.0723455696630467	0.237308076650868	74	2	924	0.924	0.074	0.148
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0264941164854496	0.0790825699961846	NaN	NaN	0.0746282364590367	0.250433126054725	67	0	933	0.933	0.067	0.134
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0259156699875593	0.0746483882793539	NA	NA	0.0705617009302448	0.229844926159278	87	1	912	0.912	0.087	0.174
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0270722818028429	0.0749181722158013	NA	NA	0.0673394000784615	0.231181610872138	83	2	915	0.915	0.083	0.166
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0278292199918073	0.0761667310755398	NA	NA	0.0664999800810801	0.24150463738943	79	0	921	0.921	0.079	0.158
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.027356253827215	0.0702411906113319	NaN	NaN	0.0611784262878369	0.235381966086481	104	1	895	0.895	0.104	0.208
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0261525501449636	0.0732393407815541	NA	NA	0.0646794175070691	0.23788518801555	87	0	913	0.913	0.087	0.174
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.027349671179221	0.0731946442087605	NA	NA	0.0630309878648772	0.225835241062416	91	1	908	0.908	0.091	0.182
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0272517366274354	0.072448168410906	NA	NA	0.0672678615033936	0.269932281765452	89	1	910	0.91	0.089	0.178
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0264900759091081	0.0745278861511424	NA	NA	0.0656558134436597	0.272195240563994	92	4	904	0.904	0.092	0.184
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0270868050123444	0.0699182744606834	NA	NA	0.0580889465308746	0.233640374549442	93	3	904	0.904	0.093	0.186
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0275307222026592	0.0704975944231612	NA	NA	0.0657247846494026	0.271020296518646	108	1	891	0.891	0.108	0.216
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.6666666666667	4	34.66666666666666	0.0412948328872706	0.125290563497375	0.329592522649448	-0.0839957306101041	0.0232201124301242	0.0705043300160251	NA	NA	0.0627575396406056	0.180760682092024	35	5	960	0.96	0.035	0.07
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.9166666666667	4	35.08333333333332	0.0411531794236846	0.123672788927057	0.332758562176172	-0.0825196095033722	0.0239051865628691	0.0683950506132275	NA	NA	0.0611491729246988	0.177182716072749	37	7	956	0.956	0.037	0.074
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	4	34.24999999999999	0.0403232602433046	0.126951325912032	0.317627720337839	-0.086628065668727	0.0234092871534264	0.0742040934744038	NA	NA	0.06185847602716	0.161386526416218	32	1	967	0.967	0.032	0.064
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000004	4	33.41666666666666	0.0398765009105086	0.130408872715656	0.305780581337096	-0.0905323718051471	0.0234097558673366	0.0753504555270187	NA	NA	0.0649831454753334	0.163569305752807	33	8	959	0.959	0.033	0.066
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666671	4	33.749999999999986	0.0400540111089283	0.129003442367267	0.310487924771003	-0.0889494312583385	0.0234371829901505	0.0690370114555191	NA	NA	0.0609410247972955	0.144400438781206	36	6	958	0.958	0.036	0.072
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	4	34.41666666666666	0.0405961546323978	0.126281753068954	0.321472846597488	-0.0856855984365564	0.0231878923616968	0.0730633331362017	NA	NA	0.0641392896433259	0.181572168359057	38	4	958	0.958	0.038	0.076
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	4	34.58333333333332	0.0403232602433046	0.125619222573624	0.320995938497163	-0.0852959623303199	0.0235366967418462	0.0699103401300952	NA	NA	0.0635910135683502	0.179816252342501	39	5	956	0.956	0.039	0.078
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000006	3	33.91666666666666	0.0401433603117784	0.0941180977157372	0.426521161031352	-0.0539747374039588	0.0228702147327928	0.0558733441844093	NA	NA	0.0495892853078988	0.276402906570131	76	17	907	0.907	0.076	0.152
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333339	2	34.249999999999986	0.0267586909940917	0.0607927570603562	0.440162484611862	-0.0340340660662645	0.0190358320545781	0.0491761490491525	NA	NA	0.0429152013011589	0.427746443109981	154	50	796	0.796	0.154	0.308
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.018971030848074	0.044461475279191	NA	NA	0.0413803892013278	0.441099724806447	163	63	774	0.774	0.163	0.326
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0190004857099456	0.0442019136946176	NA	NA	0.0417974098557041	0.450685788285872	191	43	766	0.766	0.191	0.382
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	2	35.16666666666666	0.013423177093157	0.0591439311842398	0.226957809945747	-0.0457207540910828	0.0136664754241704	0.0464916238874199	NA	NA	0.0366612571712622	0.212355830129784	0	126	874	0.874	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.8333333333334	1	34.83333333333332	0.0406419966354019	0.0292720079293014	1.38842530835471	0.0113699887061005	0.0317360500937097	0.0302914450404679	NA	NA	0.0329545791448601	0.730079339412601	546	133	321	0.321	0.546	0.642
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000007	1	34.16666666666666	0.0402781342288957	0.0298546878003148	1.34913935453953	0.010423446428581	0.0298520938416731	0.0323308872233502	NA	NA	0.0320996207738074	0.745391638918291	512	150	338	0.338	0.512	0.676
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0309106808483198	0.0318670235264584	NA	NA	0.033170603650903	0.767002869904458	529	134	337	0.337	0.529	0.674
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	1	33.83333333333332	0.0397443976053827	0.0301548153585304	1.31801163869967	0.00958958224685231	0.0294735962249223	0.0327591737162428	NA	NA	0.0342275197924784	0.779345781245311	536	120	344	0.344	0.536	0.688
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666674	1	34.16666666666665	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0299990904394646	0.0332498767455829	NA	NA	0.033000967100142	0.760348889609507	536	135	329	0.329	0.536	0.658
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	34.66666666666665	0.0396131668795607	0.029415534864961	1.34667504981345	0.0101976320145997	0.0306053203593256	0.0313150163823991	NA	NA	0.0326672506349694	0.754913740612219	528	126	346	0.346	0.528	0.692
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	34.999999999999986	0.0395261602343306	0.0291298749871979	1.35689426239219	0.0103962852471327	0.0304671267884596	0.0310703384880746	NA	NA	0.0324371117561029	0.748584869030831	526	135	339	0.339	0.526	0.678
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.249999999999986	0.0392674190316604	0.0289192452027623	1.35783001099592	0.0103481738288981	0.0297088687199076	0.0312907209444844	NA	NA	0.032442560697318	0.749749957521685	558	124	318	0.318	0.558	0.636
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.58333333333332	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0300426990003569	0.0294114388351617	NA	NA	0.0315738710195394	0.724096533950121	562	126	312	0.312	0.562	0.624
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.66666666666665	0.0397883346582442	0.0285748846742028	1.39242328050985	0.0112134499840414	0.0295008929133741	0.0310214956136463	NA	NA	0.0333925924784252	0.737016779708189	542	134	324	0.324	0.542	0.648
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333341	1	36.33333333333332	0.0394395350433882	0.0280406490537152	1.40651291515532	0.0113988859896729	0.0302301694311288	0.0317764704402532	NA	NA	0.0315635457378257	0.717994151104653	539	144	317	0.317	0.539	0.634
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	37.33333333333332	0.0397883346582442	0.0272757331281561	1.45874482901329	0.0125126015300881	0.0286520974882749	0.029778799322126	NA	NA	0.0301912736720719	0.678548745270485	573	116	311	0.311	0.573	0.622
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000007	1	37.33333333333332	0.0401433603117784	0.0272757331281561	1.47176100173598	0.0128676271836223	0.0299246395923013	0.0289765079624838	NA	NA	0.0317445010249311	0.685220404381582	547	120	333	0.333	0.547	0.666
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	37.16666666666665	0.0397005575048303	0.027400307499342	1.44890919584693	0.0123002500054883	0.0292470800133572	0.0295238352475824	NA	NA	0.0315441050936636	0.696582282281695	557	133	310	0.31	0.557	0.62
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333341	1	36.16666666666665	0.0391819232689515	0.0281723261817365	1.39079474716406	0.0110095970872151	0.0304133672097418	0.029375033134304	NA	NA	0.031952518216604	0.730424301239565	518	129	353	0.353	0.518	0.706
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0294060608896022	0.0285119194909606	NA	NA	0.0327275043744208	0.728651231822433	555	110	335	0.335	0.555	0.67
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.16666666666665	0.0395261602343306	0.0281723261817365	1.40301372273457	0.0113538340525941	0.0299238762820874	0.031315091075918	NA	NA	0.0319109416520963	0.721992202905616	547	122	331	0.331	0.547	0.662
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000009	0	36.33333333333332	0.0263473854682498	0	-Inf	0.0263473854682498	0.0271844440498842	0	NA	NA	0.0279661385219285	0.346132541468369	606	394	0	0	0.606	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333341	0	35.91666666666665	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0259215280360339	0	NA	NA	0.0264793149613705	0.326585021833482	662	338	0	0	0.662	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.91666666666665	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0260189570613618	0	NA	NA	0.0272483935479472	0.343549592833134	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	35.58333333333332	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0262640847560781	0	NA	NA	0.0253944652698765	0.307389584966838	636	364	0	0	0.636	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000007	0	36.249999999999986	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.026450614598012	0	NA	NA	0.0253233065446703	0.306032274149021	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	36.41666666666666	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0269025261370695	0	NA	NA	0.0265293896910457	0.327498968629015	620	380	0	0	0.62	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	0	36.83333333333332	0.0395261602343306	0	-Inf	0.0395261602343306	0.0304875355875661	0	NA	NA	0.0288249387557827	0.170297436802929	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	37.16666666666666	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0306744483827994	0	NA	NA	0.0304554102935402	0.180566913360004	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.16666666666666	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0303438894075469	0	NA	NA	0.0313272729930014	0.182883483842622	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.33333333333332	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0304143174316681	0	NA	NA	0.0317810553841041	0.18921283721362	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666673	0	36.33333333333332	0.0411531794236845	0	-Inf	0.0411531794236845	0.0315072569504825	0	NA	NA	0.0309635186312249	0.183819595372831	857	143	0	0	0.857	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.0833333333334	0	36.16666666666666	0.0410592825874941	0	-Inf	0.0410592825874941	0.0291713326877096	0	NA	NA	0.0310116621417685	0.18550473773338	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.83333333333332	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0306635221322566	0	NA	NA	0.0300525145235028	0.173815718724281	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	0	35.49999999999999	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.0294965864628785	0	NA	NA	0.030900737980702	0.191917123028393	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	0	34.666666666666664	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0307914620774597	0	NA	NA	0.0297135549882043	0.17572611680442	889	111	0	0	0.889	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333339	0	35.166666666666664	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0331705977879262	0	NA	NA	0.0307314237713116	0.187495328916154	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333339	0	34.83333333333333	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.0318382579918299	0	NA	NA	0.0304479844748022	0.189328461291939	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000006	0	34.166666666666664	0.0390967990762099	0	-Inf	0.0390967990762099	0.0283809003477461	0	NA	NA	0.0286685574348911	0.172645670001765	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	0	33.833333333333336	0.0389276557511924	0	-Inf	0.0389276557511924	0.0299795545960578	0	NA	NA	0.0294593738862076	0.186367583763317	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666673	0	33.50000000000001	0.038759969965707	0	-Inf	0.038759969965707	0.0295134008226032	0	NA	NA	0.0293057076332216	0.185965697453739	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	256	TCC	CAT	CCA	2	GCATCCAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	0	33.833333333333336	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.02915215400152	0	NA	NA	0.0283620882874595	0.17266990866043	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.08333333333339	0	33.333333333333336	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0292018463009982	0	NA	NA	0.0295211435015295	0.193004783350436	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333339	0	32.083333333333336	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0283488405186165	0	NA	NA	0.0278826893698807	0.174937032639517	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0283097400642536	0	NA	NA	0.0275346853975476	0.16775518111536	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000004	0	32.25000000000001	0.0379827996140662	0	-Inf	0.0379827996140662	0.0297837716833752	0	NA	NA	0.0271640723896368	0.162030985198628	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000004	0	32.66666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.028649832603745	0	NA	NA	0.0273998213139795	0.164333023516075	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000004	0	32.66666666666667	0.0381034317265946	0	-Inf	0.0381034317265946	0.0275404218533937	0	NA	NA	0.0272895205805897	0.162634386450074	851	149	0	0	0.851	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333337	0	33.16666666666667	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0299452553280742	0	NA	NA	0.0270727218757265	0.153113101778619	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333337	0	34.16666666666667	0.0391819232689515	0	-Inf	0.0391819232689515	0.0292201480922012	0	NA	NA	0.028259118341935	0.165587200303966	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000004	0	33.50000000000001	0.0388436318463037	0	-Inf	0.0388436318463037	0.0279197031940034	0	NA	NA	0.0304561071704667	0.20216871203098	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.4166666666667	0	33.00000000000001	0.0382654718118908	0	-Inf	0.0382654718118908	0.0286792833839587	0	NA	NA	0.0265583877920757	0.149639632716504	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.08333333333337	0	32.833333333333336	0.0379427585051849	0	-Inf	0.0379427585051849	0.0285602141451856	0	NA	NA	0.0272755063949583	0.164197310796775	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.1666666666667	0	33.083333333333336	0.0383879094086674	0	-Inf	0.0383879094086674	0.0282128928565227	0	NA	NA	0.0285280732069564	0.178425510648405	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.25	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0124872377313744	0	NA	NA	0.0125870199327998	0.320656583549782	658	342	0	0	0.658	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	0	33.416666666666664	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0126355189897034	0	NA	NA	0.0125584146848518	0.318546267727359	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	0	33.083333333333336	0.0125789112103712	0	-Inf	0.0125789112103712	0.0129864476576275	0	NA	NA	0.0124322915691016	0.311636821171589	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333336	0	33.916666666666664	0.0126318775458731	0	-Inf	0.0126318775458731	0.0121124082398165	0	NA	NA	0.0125340888756239	0.31354961334918	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	0	33.25	0.0125263872134486	0	-Inf	0.0125263872134486	0.0124361821212087	0	NA	NA	0.0121748710572747	0.303539700864359	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333336	0	33.75	0.0125525942666428	0	-Inf	0.0125525942666428	0.0123182477856954	0	NA	NA	0.0128866014532925	0.330016298084253	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	33.416666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0121169815854741	0	NA	NA	0.0131851958258237	0.34710504997985703	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	32.916666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0126950952446961	0	NA	NA	0.0125226819066936	0.322192800859089	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGGCGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	33.25	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0123515367276772	0	NA	NA	0.0124268096201183	0.316469715397056	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT:AGGCGTGGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	32.99999999999999	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0120377626377661	0	NA	NA	0.0125357589890573	0.320694020579102	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.33333333333333	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0120041017567028	0	NA	NA	0.0125195052585162	0.318053868273457	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.6666666666667	0	33.33333333333333	0.0125002893639087	0	-Inf	0.0125002893639087	0.0121605018308879	0	NA	NA	0.0126669285670691	0.323718853295359	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333337	0	32.666666666666664	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0123205515978489	0	NA	NA	0.0124943663074319	0.321097387898139	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.83333333333333	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0118790063720625	0	NA	NA	0.0117608211814201	0.292837366609819	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	0	33.49999999999999	0.0127934871784325	0	-Inf	0.0127934871784325	0.0128102673871628	0	NA	NA	0.0128963868728477	0.32118725964816	634	366	0	0	0.634	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.16666666666669	0	33.166666666666664	0.0129035440872231	0	-Inf	0.0129035440872231	0.0131279698016318	0	NA	NA	0.0133562544193521	0.333991646166482	664	336	0	0	0.664	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000001	0	33.166666666666664	0.0130155110198637	0	-Inf	0.0130155110198637	0.0127808394221246	0	NA	NA	0.0130728948061206	0.319439442753976	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	33.49999999999999	0.0262608883838265	0.0304610393656427	0.862113996459571	-0.00420015098181616	0.0189636682307715	0.0316838114592189	NA	NA	0.0231795133183118	0.85620981008047	355	112	533	0.533	0.355	0.71
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000001	1	33.33333333333333	0.026434454296256	0.0306164958901914	0.863405609546743	-0.00418204159393534	0.0180922541931197	0.0322381913806202	NA	NA	0.0219461281354831	0.848870780472986	363	130	507	0.507	0.363	0.726
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333336	1	33	0.0264928206228062	0.0309322189005369	0.856479798878779	-0.00443939827773067	0.0196124192103286	0.0327266398881569	NA	NA	0.0225448200504699	0.843894574567146	347	139	514	0.514	0.347	0.694
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333336	1	33.5	0.0266694765273651	0.0304610393656427	0.875527463368367	-0.00379156283827758	0.0188591351059073	0.0308438356211085	NA	NA	0.0219372244227478	0.862779596579983	344	161	495	0.495	0.344	0.688
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.58333333333336	1	33.25	0.0265808550345806	0.0306948207819131	0.865971989979606	-0.00411396574733245	0.0185867076299749	0.0330244370462827	NA	NA	0.0228882891852543	0.857355843843129	349	131	520	0.52	0.349	0.698
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000003	1	32.08333333333333	0.0261749574292545	0.0318350176854428	0.822206467352569	-0.00566006025618833	0.0193060631023703	0.032300379963903	NA	NA	0.0231394022982313	0.806760727472291	367	130	503	0.503	0.367	0.734
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.1666666666667	1	31.666666666666664	0.0129035440872231	0.0322630388127681	0.399948193414333	-0.019359494725545	0.0127954502351229	0.0331182387694884	NA	NA	0.0200621152251171	0.334555958426778	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000003	1	31.333333333333332	0.0125263872134486	0.0326138339548042	0.384082019636437	-0.0200874467413556	0.0121631120129534	0.035314820864079	NA	NA	0.0215310844657519	0.350845269433639	0	355	645	0.645	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.1666666666667	1	32.33333333333333	0.0124226442537559	0.0315836140125951	0.393325610197805	-0.0191609697588392	0.0123980304305584	0.0322637117691942	NA	NA	0.0198081397524573	0.333380051541935	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	1	32.166666666666664	0.0123206056064609	0.0317507728699206	0.388041124445604	-0.0194301672634596	0.0126298915142036	0.0340919028085152	NA	NA	0.0212064351956216	0.359541448330592	0	349	651	0.651	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000001	1	32.83333333333333	0.0125263872134486	0.0310925352587596	0.402874423368856	-0.018566148045311	0.0129965503284061	0.0324937006825255	NA	NA	0.020334670438803	0.361227180217753	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000001	1	32.5	0.0377438129156367	0.0314182062818701	1.2013357025228	0.0063256066337666304	0.0277018535795466	0.0341019088442151	NA	NA	0.0323543189404465	0.844993377500625	513	121	366	0.366	0.513	0.732
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	1	32.33333333333333	0.0376648177342698	0.0315836140125951	1.19254299774717	0.00608120372167471	0.0286411932967299	0.0325419776715823	NA	NA	0.0319361754735459	0.848982058436338	521	130	349	0.349	0.521	0.698
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666669	1	32.33333333333333	0.0376648177342698	0.0315836140125951	1.19254299774717	0.00608120372167471	0.0298136200347942	0.0326806323032784	NA	NA	0.0340000797779241	0.858048798996385	510	135	355	0.355	0.51	0.71
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.66666666666669	1	31.999999999999996	0.037197705854529	0.0319197108140969	1.165352219861	0.00527799504043212	0.0278541463249556	0.0346131243314175	NA	NA	0.0337542077070062	0.875744895199426	528	131	341	0.341	0.528	0.682
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.91666666666669	2	31.749999999999996	0.0628640039123036	0.0657955896932053	0.955444038201173	-0.00293158578090173	0.0369650304414332	0.049880943255602	NA	NA	0.0339293950980388	0.931146431047221	430	49	521	0.521	0.43	0.86
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.91666666666669	2	32.08333333333333	0.0636649250476358	0.0650814580158656	0.978234461682089	-0.00141653296822981	0.038890397727321	0.0497679630905721	NA	NA	0.0343858461046198	0.967140253359604	436	59	505	0.505	0.436	0.872
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.91666666666669	2	32.416666666666664	0.0644865306153867	0.0643826713791054	1.00161315512476	1.03859236281256e-4	0.0402568766315244	0.0469319783209225	NA	NA	0.0341397782495926	0.997572697962513	456	48	496	0.496	0.456	0.912
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.58333333333336	2	31.416666666666664	0.0639364560441675	0.0665255778124882	0.961080807511082	-0.0025891217683207	0.0377808930070622	0.0494357045980437	NA	NA	0.0357039906813391	0.94219102364464	421	44	535	0.535	0.421	0.842
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.41666666666669	2	30.416666666666664	0.0649053422482923	0.0688161477015357	0.943170235709719	-0.00391080545324346	0.0384164591800542	0.053256785986321	NA	NA	0.0379492930048242	0.91792055218838	414	51	535	0.535	0.414	0.828
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.25000000000003	2	29.749999999999996	0.0650461583956241	0.0704329495874262	0.923518875421856	-0.0053867911918021	0.0420189736454279	0.0531795001798084	NA	NA	0.0384454288709763	0.888568925239876	386	40	574	0.574	0.386	0.772
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.50000000000003	2	30.166666666666664	0.0648351627055778	0.0694136680239339	0.934040291361963	-0.00457850531835609	0.0398182226374477	0.0512061060123973	NA	NA	0.0370613527648894	0.901680659487543	380	43	577	0.577	0.38	0.76
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.16666666666669	2	30.499999999999996	0.0651167959941864	0.0686192553184994	0.948958068576289	-0.00350245932431296	0.0411869880527103	0.0533015840539048	NA	NA	0.0364275330540498	0.923402487017072	400	47	553	0.553	0.4	0.8
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	79.66666666666669	2	31	0.0655438665862574	0.0674611774972046	0.97157904765260406	-0.00191731091094727	0.0399882310568773	0.0515331694517157	NA	NA	0.0357491879777158	0.957228127729603	430	44	526	0.526	0.43	0.86
N	all	ss13	310	CCC	CCC	CCA	2	GCCCCCAGC:GCTCCGAGT	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.33333333333336	2	31	0.0649756739796766	0.0674611774972046	0.963156535214182	-0.00248550351752808	0.0382798400053772	0.0492341152847901	NA	NA	0.0369944773414219	0.946433790361942	420	51	529	0.529	0.42	0.84
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCGAGTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333336	2	30.75	0.0647651348577861	0.0680352852661241	0.951934494056333	-0.003270150408338	0.0383547273275767	0.0534212641646682	NA	NA	0.0365166761643711	0.928643033129733	432	34	534	0.534	0.432	0.864
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.58333333333336	2	30.083333333333332	0.0647651348577861	0.0696151556756318	0.930330963555636	-0.00485002081784568	0.0380098506001782	0.0519180617609731	NA	NA	0.0394391405041973	0.902127045090815	427	41	532	0.532	0.427	0.854
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.25000000000001	2	30.083333333333332	0.0642103145422438	0.0696151556756318	0.922361142757885	-0.005404841133388	0.03786844094132	0.0517981081856375	NA	NA	0.0380269663097778	0.886975901147704	419	51	530	0.53	0.419	0.838
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.0633956919887587	0.0721276112438599	0.878937911508271	-0.00873191925510122	0.0394937387736416	0.0538960780217535	NA	NA	0.0391718293900107	0.823603034611055	392	39	569	0.569	0.392	0.784
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.25000000000003	2	28.75	0.062601492219649807	0.073005919868405	0.857485150964341	-0.0104044276487551	0.0382894443720631	0.0557391267804354	NA	NA	0.0387431146624564	0.788276704361684	334	37	629	0.629	0.334	0.668
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.0633956919887587	0.0721276112438599	0.878937911508271	-0.00873191925510122	0.0382015353701791	0.0543523575684529	NA	NA	0.0391333940237788	0.823432638879589	364	54	582	0.582	0.364	0.728
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.4166666666667	2	28.416666666666668	0.0632619280839249	0.0739059002893285	0.855979398617237	-0.0106439722054036	0.0379368845133829	0.0561090983831454	NA	NA	0.0385001030738527	0.782190116376724	325	50	625	0.625	0.325	0.65
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.08333333333336	2	27.75	0.0627324732790301	0.0757741689236761	0.827887315296294	-0.013041695644646	0.038903865250295	0.05677707460132	NA	NA	0.0421034570979463	0.756748370919066	341	47	612	0.612	0.341	0.682
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0631287278025222	0.075298294736773	0.838381905237124	-0.0121695669342508	0.0383053085618066	0.0574618056649318	NA	NA	0.0420503708435831	0.772271844755244	346	33	621	0.621	0.346	0.692
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0632619280839249	0.0748283653087125	0.845427102716075	-0.0115664372247876	0.03875175867171	0.0562580709050444	NA	NA	0.0413992852942156	0.779947566575588	364	44	592	0.592	0.364	0.728
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0629960875876531	0.0739059002893285	0.852382385452779	-0.0109098127016754	0.0389528292986441	0.056023488824123203	NA	NA	0.0407074781794476	0.788695375263699	380	49	571	0.571	0.38	0.76
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0624710572949353	0.075298294736773	0.829647703355315	-0.0128272374418377	0.0396932513815556	0.0551248971042202	NA	NA	0.0403258869769221	0.7504171192824	335	47	618	0.618	0.335	0.67
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0619547111548278	0.075298294736773	0.822790361606574	-0.0133435835819451	0.0378330729032719	0.0586545805511263	NA	NA	0.0405531276802738	0.742125781319348	341	42	617	0.617	0.341	0.682
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0622118122355632	0.075298294736773	0.826204795912612	-0.0130864825012098	0.0383670636972338	0.0560487804069009	NA	NA	0.0401124590079509	0.74423912329626	322	41	637	0.637	0.322	0.644
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0629960875876531	0.0725641058409195	0.868143924018823	-0.00956801825326647	0.0378256588494257	0.0531102794110715	NA	NA	0.0383786416839394	0.803124239441633	331	54	615	0.615	0.331	0.662
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.062798169682851	0.0714826348532436	0.878509442353068	-0.00868446517039261	0.0392593125024988	0.0554773255346065	NA	NA	0.0374400315409757	0.81657166562085	395	47	558	0.558	0.395	0.79
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0622118122355632	0.071696340510766	0.867712519109973	-0.00948452827520279	0.0369503313057534	0.0546266112946403	NA	NA	0.0374043521338752	0.799829702938555	326	53	621	0.621	0.326	0.652
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0624710572949353	0.108952531416164	0.573378667598972	-0.0464814741212287	0.0373484086005129	0.0710438777810769	NA	NA	0.0543069689963665	0.392051675459377	174	21	805	0.805	0.174	0.348
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0619547111548278	0.108952531416164	0.568639483172544	-0.0469978202613361	0.0371200578452277	0.0673371910035898	NA	NA	0.0582861419462748	0.420053037785526	180	12	808	0.808	0.18	0.36
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0607004529180913	0.11306631811959	0.536857075808275	-0.0523658652014988	0.0378774950744872	0.0703655682406592	NA	NA	0.0591894103411932	0.376309397036112	160	13	827	0.827	0.16	0.32
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0607004529180913	0.154888999008431	0.391896476229324	-0.0941885460903394	0.0374826860857611	0.0896917455692592	NA	NA	0.0812928114882627	0.246605751233131	65	8	927	0.927	0.065	0.13
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0611960089344644	0.152908411727716	0.400213488865715	-0.0917124027932517	0.0349879233201946	0.0863314797556553	NA	NA	0.0720838999239245	0.203266268148359	68	5	927	0.927	0.068	0.136
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0725641058409195	0.154888999008431	0.468491024575411	-0.0823248931675111	0.0390180875334629	0.0861006041240846	NA	NA	0.0763678632805277	0.281031789443129	104	1	895	0.895	0.104	0.208
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0719832785565712	0.150978005779684	0.476779900389026	-0.0789947272231123	0.0377201981718001	0.0908841299101349	NA	NA	0.0749905342091974	0.292159546160936	135	1	864	0.864	0.135	0.27
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0719832785565712	0.150978005779684	0.476779900389026	-0.0789947272231123	0.0387165093714237	0.0857013782319336	NaN	NaN	0.0783291682374633	0.313215951446089	127	1	872	0.872	0.127	0.254
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.08333333333337	3	29.91666666666667	0.0597330472949441	0.107647107231784	0.554896911129512	-0.0479140599368395	0.037136184524057	0.0663149832495751	NA	NA	0.0651328217759368	0.461952140745543	209	2	789	0.789	0.209	0.418
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.91666666666671	3	30.250000000000004	0.0598522824019851	0.106372646579413	0.562666101922189	-0.0465203641774282	0.0367677581822279	0.064035228982977	NA	NA	0.0635893871003073	0.464428412183177	203	2	795	0.795	0.203	0.406
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.00000000000006	3	29.83333333333334	0.0590856583898357	0.107970516691131	0.547238822232005	-0.0488848583012956	0.0352856770862942	0.0710426063600018	NA	NA	0.0657361601410171	0.457086747006138	229	8	763	0.763	0.229	0.458
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0585091875923657	0.108623210908842	0.538643510008808	-0.0501140233164763	0.0362805128595021	0.0684495881054497	NA	NA	0.0661344823836948	0.448595053241574	225	6	769	0.769	0.225	0.45
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0583384345517498	0.109617210244414	0.532201416380442	-0.051278775692664	0.035461085430094	0.0745474806207748	NA	NA	0.0648305600602418	0.428963769995624	192	4	804	0.804	0.192	0.384
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0583384345517498	0.109617210244414	0.532201416380442	-0.051278775692664	0.0357495991222762	0.0694472160987639	NA	NA	0.0674178412502442	0.446889234543009	216	4	780	0.78	0.216	0.432
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	88.58333333333339	3	29.583333333333336	0.0835022368474181	0.108952531416164	0.766409332229888	-0.0254502945687459	0.0434012934156234	0.0693898952186653	NA	NA	0.0736348275324452	0.729621928895389	359	3	638	0.638	0.359	0.718
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	86.91666666666671	3	30.583333333333336	0.085197883292779	0.105128058952294	0.810420016709723	-0.0199301756595152	0.0446384358300839	0.0682380916839326	NA	NA	0.0689615343624426	0.772578134760992	370	4	626	0.626	0.37	0.74
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	85.25000000000006	3	30.583333333333336	0.086963901518751	0.105128058952294	0.827218750021953	-0.0181641574335432	0.0439051374767669	0.0662480261883122	NA	NA	0.0674948031409497	0.787837841739233	404	2	594	0.594	0.404	0.808
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	83.91666666666671	3	30.25	0.0884303808327802	0.106372646579413	0.831326320030609	-0.0179422657466331	0.0458810177974746	0.069527387598321	NA	NA	0.0701793854434262	0.798211138770943	419	3	578	0.578	0.419	0.838
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	83.58333333333339	3	30.583333333333336	0.0888047703683446	0.105128058952294	0.844729478061068	-0.0163232885839496	0.0456201670900191	0.0633463836830787	NA	NA	0.0677081802250049	0.809490818378103	423	1	576	0.576	0.423	0.846
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.75000000000006	3	30.75	0.0629960875876531	0.104516640682884	0.602737393548564	-0.0415205530952305	0.0395788645159373	0.0684104962616454	NA	NA	0.0668396506584576	0.534470380946941	243	3	754	0.754	0.243	0.486
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	82.58333333333339	3	30.916666666666668	0.0631287278025222	0.103912304538584	0.607519273899673	-0.0407835767360618	0.0398931101211846	0.0720775489530617	NA	NA	0.0647285551654203	0.528648220782441	245	5	750	0.75	0.245	0.49
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAGC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	81.58333333333339	3	31.249999999999996	0.0639364560441675	0.102724391304868	0.622407738142885	-0.0387879352607005	0.0407877421253501	0.0709537628428915	NA	NA	0.0643714426751184	0.546798555381952	244	6	750	0.75	0.244	0.488
N	all	ss13	350	AGC	ACA	AAG	2	GACAGCGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	2	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	80.08333333333339	3	32.083333333333336	0.0651875872755847	0.0998703029515669	0.652722434487839	-0.0346827156759822	0.0393105116273121	0.0635712362247507	NA	NA	0.0617658430803777	0.57444354723229	272	7	721	0.721	0.272	0.544
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AGCGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	2	32	0.0383879094086674	0.0652585327422224	0.58824352610414	-0.026870623333555	0.0294340522706712	0.0476746599821761	NA	NA	0.0619993040467553	0.664722736555484	311	19	670	0.67	0.311	0.622
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	32	0.0379827996140662	0.100148544468392	0.379264619527785	-0.0621657448543258	0.0279784673600385	0.0672875428347504	NA	NA	0.0697583559128613	0.372844198201323	180	1	819	0.819	0.18	0.36
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.3333333333334	3	31	0.0373521168628637	0.103612753860613	0.360497288906271	-0.0662606369977492	0.0264750497684666	0.0693807306563755	NA	NA	0.0707204461190951	0.348790715347455	151	1	848	0.848	0.151	0.302
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.3333333333334	3	31	0.0368926831430787	0.103612753860613	0.356063146364292	-0.0667200707175341	0.0280256217805944	0.0702523153807046	NA	NA	0.0750704675980143	0.374128912897999	140	9	851	0.851	0.14	0.28
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.8333333333334	3	31.666666666666668	0.0362243442097796	0.101277212852957	0.357675168869163	-0.0650528686431775	0.0276229194485008	0.0645937832138179	NA	NA	0.0715497904198911	0.363246045390921	136	2	862	0.862	0.136	0.272
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666673	3	32.66666666666667	0.0365183693771989	0.0979651368127982	0.372769033610212	-0.0614467674355992	0.0272938954760882	0.0627126114714548	NA	NA	0.0657615760966515	0.350104256975685	161	4	835	0.835	0.161	0.322
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0293773040433262	0.0615256955150078	NA	NA	0.0724303119049396	0.501201349586561	235	1	764	0.764	0.235	0.47
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0298286624476498	0.0623040636778099	NaN	NaN	0.071331603955269	0.483353385937002	235	3	762	0.762	0.235	0.47
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0303760720433831	0.0813333331311225	NaN	NaN	0.0900030649843392	0.310439155978071	127	0	873	0.873	0.127	0.254
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0316065997068126	0.0802860130924381	NaN	NaN	0.0888793844952781	0.294653172350519	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0380418362129064	0.0849730412980391	NaN	NaN	0.0946421416784394	0.438331678198171	203	0	797	0.797	0.203	0.406
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0391172663034001	0.0858153806391361	NaN	NaN	0.097020599413054	0.456038611187875	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0405742964647573	0.083566644025304	NaN	NaN	0.0952835927073985	0.457341991751568	227	0	773	0.773	0.227	0.454
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0395908919985274	0.0855597099958561	NaN	NaN	0.0909189069010315	0.458139022738342	211	0	789	0.789	0.211	0.422
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0420711353348864	0.08191815787059	NaN	NaN	0.0936067113691142	0.474692701037972	222	0	778	0.778	0.222	0.444
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0427120367634293	0.0916501248295342	NaN	NaN	0.0965572338945407	0.460162331849867	223	0	777	0.777	0.223	0.446
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0449613678033134	0.0990066845579868	NA	NA	0.108236433143244	0.388159219376708	161	0	839	0.839	0.161	0.322
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0449014525793681	0.0981140864680147	NaN	NaN	0.106630150795424	0.422947081321066	191	0	809	0.809	0.191	0.382
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0456820442876375	0.0918428048328377	NaN	NaN	0.0962837915441245	0.396535878471241	192	0	808	0.808	0.192	0.384
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.046549711396282	0.0896946833510858	NaN	NaN	0.103733357032705	0.445859085484189	183	0	817	0.817	0.183	0.366
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0459140326824076	0.0970675460817032	NaN	NaN	0.101779494602754	0.413159481597375	180	0	820	0.82	0.18	0.36
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0456915873868355	0.092782984047259	NaN	NaN	0.0997374536975827	0.42569871542974	198	1	801	0.801	0.198	0.396
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0479307409693068	0.0934685884873745	NaN	NaN	0.100107650095064	0.432677379335825	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_KY417151.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.41666666666671	2	34.916666666666664	0.0865304311153282	0.059584670169267	1.45222640101077	0.0269457609460612	0.0343874852435501	0.045381727869503	NaN	NaN	0.062267123689739	0.665200331510982	660	0	340	0.34	0.66	0.68
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.58333333333337	2	34.75	0.0863227141399175	0.0598821656332629	1.44154295735703	0.0264405485066547	0.0340160266520597	0.0455521495704452	NA	NA	0.0560516792745958	0.637128565442056	703	0	297	0.297	0.703	0.594
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.9166666666667	2	34.75	0.0859102609064442	0.0598821656332629	1.43465520990983	0.0260280952731813	0.0335481208159751	0.0444923278182494	NaN	NaN	0.0599151633272697	0.663986506113433	685	0	315	0.315	0.685	0.63
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.9166666666667	2	35.08333333333333	0.0871596303651496	0.0592901175479514	1.47005325625571	0.0278695128171982	0.035567235847216	0.0425102173222767	NA	NA	0.0615107068550936	0.650488306315918	692	1	307	0.307	0.692	0.614
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.9166666666667	2	36.08333333333333	0.0884459172871288	0.0575822255219405	1.53599338138517	0.0308636917651883	0.0368903471165234	0.042546905253	NaN	NaN	0.0588881361020048	0.600204032507314	710	1	289	0.289	0.71	0.578
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	2	36.75	0.0893247686558476	0.0564972895530331	1.58104520345175	0.0328274791028145	0.0357473017358964	0.041226560770707	NaN	NaN	0.0586650232891263	0.575769376276554	725	0	275	0.275	0.725	0.55
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAC:CAA---AAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.25000000000003	2	35.08333333333333	0.0880129524129092	0.0592901175479514	1.48444557124934	0.0287228348649578	0.0344043864933014	0.0443590145801584	NaN	NaN	0.0573738977946159	0.616634729865409	712	2	286	0.286	0.712	0.572
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	0	---AACCAA:---AATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.25000000000003	2	36.08333333333333	0.0867391512707804	0.0575822255219405	1.50635288032989	0.0291569257488398	0.0354626710394652	0.042230679065562	NaN	NaN	0.0559635083486633	0.602367544387722	696	0	304	0.304	0.696	0.608
N	all	ss13	10	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.25000000000003	2	36.08333333333333	0.0867391512707804	0.0575822255219405	1.50635288032989	0.0291569257488398	0.0349956353530698	0.0447512662275658	NaN	NaN	0.0549826067051002	0.595908366930567	718	0	282	0.282	0.718	0.564
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0862192295848232	0.0582817382454872	1.4793524040354	0.027937491339336	0.0353293297277455	0.0402228422871043	NaN	NaN	0.0569249390716425	0.623583675657359	695	0	305	0.305	0.695	0.61
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.08333333333336	2	35.49999999999999	0.0857055104092924	0.0585663277285774	1.46339225512807	0.027139182680715	0.0336157565597279	0.0422129515461317	NaN	NaN	0.0555591959861614	0.625214647673549	701	0	299	0.299	0.701	0.598
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCACCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.41666666666669	2	36.16666666666666	0.0713975091508652	0.0574443341110379	1.24289906490789	0.0139531750398273	0.0323366524762731	0.0433091297566403	NaN	NaN	0.0573836856295922	0.807884718649154	605	1	394	0.394	0.605	0.788
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.08333333333336	2	36.16666666666666	0.0707237388415596	0.0574443341110379	1.23116996542867	0.0132794047305218	0.0312966125405178	0.0413826687040252	NaN	NaN	0.0566537846604844	0.814677779900657	630	1	369	0.369	0.63	0.738
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.75000000000001	3	36.16666666666666	0.0700625753990949	0.0879053734766805	0.797022669128197	-0.0178427980775856	0.0320262685671338	0.0543183177972646	NA	NA	0.0670230341110158	0.790070631876587	385	1	614	0.614	0.385	0.77
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.41666666666669	3	36.499999999999986	0.0703916034965163	0.0870541284395655	0.808595809966479	-0.0166625249430492	0.0310125177059189	0.0539741299428348	NaN	NaN	0.0639991912065698	0.794589764048324	424	1	575	0.575	0.424	0.848
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.66666666666669	3	35.58333333333332	0.0838080288297114	0.0894358561096487	0.937074149846148	-0.00562782727993721	0.0333127798435916	0.0538618089061929	NaN	NaN	0.0680537257328078	0.934092606794132	506	0	494	0.494	0.506	0.988
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.00000000000001	3	35.91666666666666	0.0834192263326683	0.0885548256923263	0.942006555605438	-0.00513559935965806	0.0342554974773173	0.053493539988286	NaN	NaN	0.0680061857554153	0.939803650202096	515	0	485	0.485	0.515	0.97
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.50000000000001	3	35.91666666666666	0.0840037937823711	0.0885548256923263	0.948607748088543	-0.00455103190995519	0.0343860014567473	0.0546317904495315	NaN	NaN	0.0674898057147736	0.946237095004034	498	0	502	0.502	0.498	0.996
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	3	36.08333333333333	0.0847960953267638	0.0881207952860292	0.962271108102533	-0.0033246999592654	0.0330966900939626	0.0527567240593085	NaN	NaN	0.0686489004649514	0.961373159468431	477	0	523	0.523	0.477	0.954
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.41666666666669	3	35.49999999999999	0.0841020199810758	0.0896588629873371	0.938022379259414	-0.0055568430062613	0.0333427766243161	0.0522733415102587	NaN	NaN	0.0659066181331601	0.932806873268262	480	0	520	0.52	0.48	0.96
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	75.91666666666669	3	35.66666666666666	0.0835160880143217	0.089213957146024	0.936132536724314	-0.00569786913170231	0.0342628097256019	0.0556735419479616	NaN	NaN	0.0651015854992344	0.930256010996376	481	0	519	0.519	0.481	0.962
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333336	3	34.99999999999999	0.0816206643196587	0.0910206427532006	0.896726960509061	-0.00939997843354196	0.0331411061241269	0.0565024093083271	NaN	NaN	0.0673024784180333	0.888922594032835	454	0	546	0.546	0.454	0.908
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT:GATTCAAGT	1:1	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.25000000000001	3	35.66666666666666	0.0831299860668389	0.089213957146024	0.931804716730288	-0.00608397107918508	0.0328837645443876	0.0546338299809816	NaN	NaN	0.0679927617628856	0.928700695796986	501	0	499	0.499	0.501	0.998
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGGC:TCAAGTGAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.58333333333336	3	35.33333333333333	0.0816206643196587	0.0901082338815474	0.905806947974963	-0.00848756956188876	0.0326534489074771	0.0567222598972343	NaN	NaN	0.0678036316154502	0.900382090027905	447	0	553	0.553	0.447	0.894
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGGCAGT:AGTGACAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	77.25000000000003	3	35.33333333333333	0.0676896531853505	0.0901082338815474	0.751203860840648	-0.0224185806961969	0.0293204774545875	0.0547641398142289	NaN	NaN	0.0682735939744134	0.742636566713917	372	0	628	0.628	0.372	0.744
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAGC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.9166666666667	3	34.99999999999999	0.0531784143271381	0.0910206427532006	0.58424564712567	-0.0378422284260625	0.0266189166490895	0.0540272389297348	NA	NA	0.0649992673138652	0.560435548178862	274	0	726	0.726	0.274	0.548
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAGCAAA:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000003	3	34.99999999999999	0.0398765009105086	0.0910206427532006	0.438103925706527	-0.051144141842692	0.0229884498629032	0.0571220529744303	NA	NA	0.0629106335433116	0.416238137719081	199	2	799	0.799	0.199	0.398
N	all	ss13	29	AAA	ACC	AAA	2	AACCAGAAT:AGCAAAAAC	1:1	TRUE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333337	3	35.16666666666666	0.0264053674769446	0.09056213746611	0.291571822571281	-0.0641567699891654	0.0190524065596878	0.0539980830587649	NA	NA	0.0606726301891928	0.290317561507485	130	3	867	0.867	0.13	0.26
N	all	ss13	30	AAC	AAA	ACG	2	AAAAACGGA:CAGAATGGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.6666666666667	2	34.58333333333333	0.0262035385209603	0.0601826482875393	0.43540022359544	-0.0339791097665789	0.0188283004447848	0.0482678414490504	NA	NA	0.0509838447786316	0.505111901744216	232	16	752	0.752	0.232	0.464
N	all	ss13	31	GGA	ACG	GAG	2	AACGGAGAG:AATGGAGAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000004	3	35.416666666666664	0.0402781342288957	0.0898829861073045	0.448117446618993	-0.0496048518784088	0.0237072301360236	0.052541883210639	NA	NA	0.0546448897672953	0.364001102592405	136	9	855	0.855	0.136	0.272
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGAGCGC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	35.916666666666664	0.0543223783836108	0.120559681536883	0.450584952540637	-0.0662373031532723	0.028402562601708	0.0630973914148321	NA	NA	0.0590974154816162	0.262366377109469	92	1	907	0.907	0.092	0.184
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GAGCGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.50000000000003	4	35.75	0.0541996476239404	0.121169674009144	0.447303733934699	-0.0669700263852038	0.0266502211967741	0.0683056667728684	NA	NA	0.0605267164058993	0.268530071497287	96	2	902	0.902	0.096	0.192
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGT:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.50000000000003	4	35.416666666666664	0.0534747581886499	0.122408407943652	0.436855270703838	-0.0689336497550021	0.0282555017085139	0.0659355594358163	NaN	NaN	0.0571392389429651	0.227657415354826	82	4	914	0.914	0.082	0.164
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGTGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000003	4	35.416666666666664	0.0397443976053828	0.122408407943652	0.324686827261721	-0.0826640103382692	0.0232682471727779	0.0671337639558973	NA	NA	0.0563606794770672	0.142458640190094	41	11	948	0.948	0.041	0.082
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAC	2	GGGGCGCGA:GGTGCACGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.83333333333336	4	35.58333333333333	0.0395696157178212	0.12178588422283	0.324911347241369	-0.0822162685050091	0.0231812511519577	0.0636166432318307	NA	NA	0.0592828256073133	0.165488115008465	34	6	960	0.96	0.034	0.068
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAC	2	GCACGACCT:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.25	1.25	0.25	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000003	4	34.916666666666664	0.0392246245521367	0.124314847835042	0.315526465544851	-0.0850902232829048	0.0234737907151226	0.0650376771860784	NA	NA	0.0590973845364002	0.149915328450408	30	6	964	0.964	0.03	0.06
N	all	ss13	38	CCT	GAC	CAA	2	CGACCTAAA:CGATCAAAA	1:1	TRUE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000003	4	35.666666666666664	0.0393532888030902	0.121476995958792	0.323956717010353	-0.0821237071557019	0.0232415393200417	0.0675588215947948	NA	NA	0.0541965419223157	0.129697909381879	26	7	967	0.967	0.026	0.052
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCTAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.9166666666667	3	36	0.0395261602343306	0.0883372767422876	0.44744598986952	-0.0488111165079571	0.0229941067656608	0.0522223528610725	NA	NA	0.0426772140920803	0.252736537342052	94	23	883	0.883	0.094	0.188
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000003	3	36	0.0400094855289696	0.0883372767422876	0.45291735272406	-0.0483277912133181	0.0242997807097147	0.0532260908001489	NA	NA	0.0427578756728794	0.258363978213636	90	16	894	0.894	0.09	0.18
N	all	ss13	41	CGT	AAC	GTC	2	CAACGTCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.00000000000003	3	36.5	0.0405504159527068	0.0870541284395655	0.465806925869778	-0.0465037124868587	0.0235848034260104	0.0524071283329386	NA	NA	0.0408181926705139	0.254582690247659	97	15	888	0.888	0.097	0.194
N	all	ss13	42	CGA	GTC	GAC	2	CGTCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666669	3	36.83333333333333	0.0407339920153049	0.0862192295848233	0.472446717645863	-0.0454852375695184	0.0234563090535518	0.0506890459139815	NA	NA	0.0433438778267295	0.293992230714663	114	14	872	0.872	0.114	0.228
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666669	3	37.25	0.0407339920153049	0.085197883292779	0.478110375997537	-0.0444638912774741	0.0230319073048708	0.0513121785523832	NA	NA	0.0399630104842049	0.265869016288642	117	15	868	0.868	0.117	0.234
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGC:CCCCAAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.00000000000003	3	37.08333333333333	0.0405504159527068	0.0856035011092873	0.473700437800287	-0.0450530851565805	0.024248562729757	0.0503294206865868	NA	NA	0.0419441622413312	0.282768670866817	84	10	906	0.906	0.084	0.168
N	all	ss13	45	GGC	AAG	GCT	2	CAAGGCTTA:CAAGGTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	3	36.08333333333333	0.040641996635402	0.0881207952860292	0.461207783060549	-0.0474787986506272	0.0236999057727443	0.0533868111585821	NA	NA	0.0409238837083371	0.245978241028969	101	16	883	0.883	0.101	0.202
N	all	ss13	46	TTA	GCT	TAC	2	GGCTTACCC:GGTTTACCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666669	3	36.08333333333333	0.0404592471687861	0.0881207952860292	0.45913393129806	-0.0476615481172431	0.0245258971353374	0.051752890481476	NA	NA	0.0440517071074876	0.279276726867028	90	18	892	0.892	0.09	0.18
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666669	3	35.75	0.0404592471687861	0.088993157850987	0.454633234124947	-0.0485339106822009	0.0233255020138929	0.0524736182533842	NA	NA	0.0417849983675841	0.2454324459524	90	21	889	0.889	0.09	0.18
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.16666666666669	3	35.75	0.0404592471687861	0.088993157850987	0.454633234124947	-0.0485339106822009	0.0246965688486486	0.0524333705653287	NA	NA	0.0438983614376002	0.26890085107161	96	17	887	0.887	0.096	0.192
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.50000000000001	3	35.75	0.0408264049162628	0.088993157850987	0.458758919248869	-0.0481667529347242	0.0226462593450279	0.0541029259579658	NA	NA	0.0432715273037197	0.265653417155859	94	13	893	0.893	0.094	0.188
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCA:AATACTGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666669	3	36.08333333333333	0.0410124947055404	0.0881207952860292	0.465412217086998	-0.0471083005804889	0.0223831502235555	0.0534196813031231	NA	NA	0.0430025413498892	0.273307659549702	98	23	879	0.879	0.098	0.196
N	all	ss13	51	GCA	CTG	CAT	2	ACTGCATCT:ACTGCGTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666669	3	36.08333333333333	0.0410124947055404	0.0881207952860292	0.465412217086998	-0.0471083005804889	0.0239239197324086	0.0539911264821647	NA	NA	0.045048814520816	0.295691820205991	110	19	871	0.871	0.11	0.22
N	all	ss13	52	TCT	CAT	CTT	2	GCATCTTGG:GCGTCTTGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	3	36.08333333333333	0.040641996635402	0.0881207952860292	0.461207783060549	-0.0474787986506272	0.0235971396982498	0.0520184082691513	NA	NA	0.0423852326730579	0.262639992905948	92	14	894	0.894	0.092	0.184
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.1666666666667	3	35.74999999999999	0.0410124947055404	0.088993157850987	0.460849976514071	-0.0479806631454466	0.0242200698237908	0.0561192572607454	NA	NA	0.0454085079766585	0.290673733126064	83	13	904	0.904	0.083	0.166
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333337	3	34.74999999999999	0.0412002891133781	0.0917171833187058	0.449210143863797	-0.0505168942053277	0.0241258056428474	0.0554577910097743	NA	NA	0.0442517132942695	0.253628421879475	83	16	901	0.901	0.083	0.166
N	all	ss13	55	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.08333333333337	3	34.166666666666664	0.0545075207127158	0.0933847109044368	0.583687845524252	-0.038877190191721	0.026547948256923	0.0573499403447885	NA	NA	0.0484390933676983	0.422206280426825	201	4	795	0.795	0.201	0.402
N	all	ss13	56	GCT	CCG	CTC	2	ACCGCTCTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333337	3	33.666666666666664	0.0541384900641951	0.0948631103318397	0.57070119116708	-0.0407246202676446	0.0263911742577072	0.0587131229219626	NA	NA	0.0505850578648679	0.42077805759959	193	5	802	0.802	0.193	0.386
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	3	33.666666666666664	0.0536541558618204	0.0948631103318397	0.565595579505388	-0.0412089544700193	0.0261874022698718	0.0590395315518691	NA	NA	0.0507083033747872	0.416409122915744	199	6	795	0.795	0.199	0.398
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000003	3	33.666666666666664	0.0536541558618204	0.0948631103318397	0.565595579505388	-0.0412089544700193	0.0269151626219033	0.0573416062704848	NA	NA	0.0514487866381218	0.423148790430471	169	3	828	0.828	0.169	0.338
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.9166666666667	3	33.166666666666664	0.0531784143271381	0.0963891381007337	0.55170546572958	-0.0432107237735956	0.0267012598796155	0.0560499889576053	NA	NA	0.0504262150748098	0.391494671646169	187	3	810	0.81	0.187	0.374
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.9166666666667	3	32.49999999999999	0.0524804194365887	0.0985020015458152	0.532785310074933	-0.0460215821092265	0.025039480342637	0.0603425206604258	NA	NA	0.053455614062795	0.389276182409464	161	5	834	0.834	0.161	0.322
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333337	3	33.166666666666664	0.0534152253723938	0.0963891381007337	0.554162288665461	-0.0429739127283399	0.0268496378913282	0.0617734503296	NA	NA	0.0519197733504635	0.407841332061717	170	4	826	0.826	0.17	0.34
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333337	3	33.83333333333333	0.0534152253723938	0.0943651299007743	0.566048342523985	-0.0409499045283805	0.0263008203208142	0.057350274797964	NA	NA	0.0508170077212826	0.42034047812313	176	4	820	0.82	0.176	0.352
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAA	2	AAGGAAAAC:AAGGAAGAC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333337	3	33.166666666666664	0.0534152253723938	0.0963891381007337	0.554162288665461	-0.0429739127283399	0.0264370647268885	0.0568508308616573	NA	NA	0.0488235151692463	0.378757023176473	179	6	815	0.815	0.179	0.358
N	all	ss13	64	AAC	AAA	ACC	2	GAAAACCTT:GAAGACCTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.4166666666667	3	33.666666666666664	0.0542609435735893	0.0948631103318397	0.571992035510744	-0.0406021667582504	0.0268249281650975	0.055341512021296	NA	NA	0.0508326956885482	0.424440509982306	155	4	841	0.841	0.155	0.31
N	all	ss13	65	CTT	ACC	TTA	2	AACCTTACG:GACCTTAAA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.25000000000004	2	33.833333333333336	0.0559047993353384	0.0615730216404005	0.907943086857654	-0.00566822230506213	0.0292928445662748	0.0436658963491186	NA	NA	0.0301166640887857	0.850712945810715	388	11	601	0.601	0.388	0.776
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTACGTTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.666666666666667	0.416666666666667	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.58333333333337	2	32.50000000000001	0.0556454425645553	0.0642103145422438	0.866612209599851	-0.00856487197768847	0.0271540879182944	0.0468012095633568	NA	NA	0.0326870545494075	0.793301071174097	405	13	582	0.582	0.405	0.81
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:ACGTTCCCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000003	2	32.75000000000001	0.0416773883661081	0.0636987401522852	0.654289052914854	-0.0220213517861771	0.0246304940394192	0.0471735260936908	NA	NA	0.0292850037846291	0.4520709998628	197	51	752	0.752	0.197	0.394
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000003	2	33.083333333333336	0.0422647024133488	0.0630291953285242	0.670557543897783	-0.0207644929151754	0.0240773753287396	0.0478894929612344	NA	NA	0.0293638492764228	0.479476506522519	212	50	738	0.738	0.212	0.424
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGG	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333337	2	32.75000000000001	0.0420670999882827	0.0636987401522852	0.660407095771635	-0.0216316401640025	0.0246443828650982	0.0444318955540311	NA	NA	0.02978736059954	0.467714960034771	196	44	760	0.76	0.196	0.392
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGGCAA	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	2	32.75000000000001	0.0413898116754681	0.0636987401522852	0.649774415891383	-0.0223089284768171	0.0249945159225289	0.0450468288439238	NA	NA	0.0302661795405672	0.461067013247804	191	45	764	0.764	0.191	0.382
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGGCAAGGT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25000000000003	2	33.00000000000001	0.0415331021017154	0.0631952577133049	0.657218652230785	-0.0216621556115895	0.0249990492576231	0.0455794433882486	NA	NA	0.0278965143261383	0.437442983317251	181	50	769	0.769	0.181	0.362
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAAGGTGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.08333333333337	2	33.50000000000001	0.042215127927666	0.0622118122355632	0.678570940319495	-0.0199966843078972	0.0245507338312383	0.0449033414006399	NA	NA	0.0289272310227994	0.489392463958167	197	45	758	0.758	0.197	0.394
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA:GGTGTTCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.08333333333337	2	33.50000000000001	0.042215127927666	0.0622118122355632	0.678570940319495	-0.0199966843078972	0.0251866394957664	0.0477535231549704	NA	NA	0.0285805235574902	0.484138893149557	171	47	782	0.782	0.171	0.342
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.75000000000003	2	32.833333333333336	0.0418226808888407	0.0635300231041221	0.658313642044419	-0.0217073422152814	0.0237982215768832	0.0449102664636089	NA	NA	0.0293957977956008	0.460240723455122	173	46	781	0.781	0.173	0.346
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.08333333333337	2	33.50000000000001	0.042215127927666	0.0622118122355632	0.678570940319495	-0.0199966843078972	0.0246379597415548	0.0452691045584202	NA	NA	0.0286018229720289	0.484464416225423	208	44	748	0.748	0.208	0.416
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.58333333333337	2	33.00000000000001	0.0419201068148284	0.0631952577133049	0.663342604044839	-0.0212751508984765	0.0238947132978699	0.0440921522372895	NA	NA	0.0288821680465995	0.461354137217053	203	47	750	0.75	0.203	0.406
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000003	2	33.666666666666664	0.0427161696956043	0.0618907677660026	0.690186456518137	-0.0191745980703983	0.0250883993305584	0.0433098668162489	NA	NA	0.027698286594488	0.488769934982992	200	46	754	0.754	0.2	0.4
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.9166666666667	2	33.666666666666664	0.0423143935004423	0.0618907677660026	0.683694758165307	-0.0195763742655603	0.0244298915421136	0.0449924578327799	NA	NA	0.0283264632102882	0.489503686562442	211	50	739	0.739	0.211	0.422
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGCTCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.9166666666667	2	33.666666666666664	0.0423143935004423	0.0618907677660026	0.683694758165307	-0.0195763742655603	0.024805014674794	0.0435055825681586	NA	NA	0.0284079626352036	0.490750434025782	212	44	744	0.744	0.212	0.424
N	all	ss13	80	AGT	GCA	CTA	2	AGCAGTCCA:AGCTCTAAA	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.1666666666667	2	33.416666666666664	0.0567646707244322	0.062373587449531503	0.910075450932854	-0.00560891672509931	0.0281858164864462	0.0453493620932206	NA	NA	0.0314498096395662	0.858452029750482	405	17	578	0.578	0.405	0.81
N	all	ss13	81	AAA	CTA	AAG	2	AGTCCAGAT:TCTAAAGAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333336	1	32.916666666666664	0.0420670999882827	0.0310121698640216	1.35647070723311	0.0110549301242611	0.0238829480183447	0.0301828894368544	NA	NA	0.0251972644417368	0.660853324376878	621	46	333	0.333	0.621	0.666
N	all	ss13	82	GAT	AAG	ATG	2	AAAGATGAC:CCAGATGAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.00000000000003	0	32.916666666666664	0.0279101972553257	0	-Inf	0.0279101972553257	0.0189884833962684	0	NA	NA	0.0193033852975424	0.148213499840801	859	141	0	0	0.859	0.001
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.00000000000003	0	33.58333333333333	0.0283052459871352	0	-Inf	0.0283052459871352	0.018754169066028	0	NA	NA	0.0196746120245387	0.150244447792112	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.33333333333336	0	34.58333333333333	0.0285748846742028	0	-Inf	0.0285748846742028	0.0197534682701109	0	NA	NA	0.0184290658260257	0.121013509741712	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.33333333333336	0	34.91666666666666	0.0289891158257093	0	-Inf	0.0289891158257093	0.0197357497917774	0	NA	NA	0.0211829387714928	0.171151721909496	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.1666666666667	0	34.58333333333333	0.0290593249318817	0	-Inf	0.0290593249318817	0.0198499099145301	0	NA	NA	0.0197561104066097	0.141317312000392	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.83333333333336	0	34.91666666666666	0.0292007684815911	0	-Inf	0.0292007684815911	0.0200330941853157	0	NA	NA	0.0203932427168573	0.152176874223625	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA:TACTACCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.16666666666669	0	35.24999999999999	0.0290593249318817	0	-Inf	0.0290593249318817	0.0200335507239529	0	NA	NA	0.0202833089079071	0.151951648600981	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA:TACCGTAGA	1:1	FALSE	1	1	0.75	0.25	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.66666666666669	0	34.74999999999999	0.028849710620847	0	-Inf	0.028849710620847	0.0196189759645573	0	NA	NA	0.0202951758176222	0.155169761702444	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT:CGTAGAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.33333333333336	0	34.33333333333332	0.0285748846742028	0	-Inf	0.0285748846742028	0.0199999222127091	0	NA	NA	0.0194586637721575	0.141970731030197	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.66666666666669	0	34.49999999999999	0.0292720079293014	0	-Inf	0.0292720079293014	0.0191720624915099	0	NA	NA	0.0206016651740501	0.155358508740492	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.00000000000003	0	33.83333333333332	0.0291298749871979	0	-Inf	0.0291298749871979	0.0195744714282648	0	NA	NA	0.0199581985256843	0.144415355782802	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.1666666666667	0	33.66666666666666	0.0290593249318817	0	-Inf	0.0290593249318817	0.0202494931843829	0	NA	NA	0.0201327953178393	0.148912744154987	888	112	0	0	0.888	0.001
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT	2	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	69.9166666666667	0	33.74999999999999	0.029165278647943	0	-Inf	0.029165278647943	0.0212190939143156	0	NA	NA	0.0202756542153781	0.150309717205938	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.33333333333337	0	34.49999999999999	0.0289891158257093	0	-Inf	0.0289891158257093	0.0206826410078508	0	NA	NA	0.0200996773562794	0.149226862951097	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.6666666666667	0	34.49999999999999	0.028849710620847	0	-Inf	0.028849710620847	0.0201027173243019	0	NA	NA	0.0191378302904782	0.131690153068762	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.83333333333336	0	34.99999999999999	0.0287805096612113	0	-Inf	0.0287805096612113	0.0202996943185032	0	NA	NA	0.0205923153666227	0.162223155137446	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	35.33333333333332	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0189459758208099	0	NA	NA	0.0196237996407112	0.143439199861926	882	118	0	0	0.882	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.6666666666667	0	34.66666666666665	0.0284394261467203	0	-Inf	0.0284394261467203	0.0201803326849634	0	NA	NA	0.0193752778362222	0.142153041508865	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	34.66666666666665	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0192823023036784	0	NA	NA	0.0197690974781388	0.146404435025924	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	34.66666666666665	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0197558655504449	0	NA	NA	0.0200778368350241	0.152712255320898	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.00000000000003	0	34.66666666666665	0.0287116399282627	0	-Inf	0.0287116399282627	0.0206213582478778	0	NA	NA	0.0200121585132186	0.151369810564997	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.33333333333336	0	35.33333333333332	0.0285748846742028	0	-Inf	0.0285748846742028	0.019366739552766	0	NA	NA	0.0198482147259768	0.149960708111722	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.33333333333336	0	36.66666666666665	0.0289891158257093	0	-Inf	0.0289891158257093	0.0197124115053425	0	NA	NA	0.0204701018453707	0.156726141878351	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.75000000000003	0	37.249999999999986	0.0144757207777853	0	-Inf	0.0144757207777853	0.0144790816865964	0	NA	NA	0.014875173390279	0.33048056772347	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.9166666666667	0	37.749999999999986	0.0144408793426023	0	-Inf	0.0144408793426023	0.0142648011681063	0	NA	NA	0.0140613491761011	0.304424692264166	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.9166666666667	0	37.083333333333314	0.0144408793426023	0	-Inf	0.0144408793426023	0.014067995962439	0	NA	NA	0.0138677770782721	0.297724189837551	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.9166666666667	0	37.083333333333314	0.0144408793426023	0	-Inf	0.0144408793426023	0.0140303754513524	0	NA	NA	0.0146403129836563	0.323947767194915	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.4166666666667	0	36.91666666666665	0.0143373541664091	0	-Inf	0.0143373541664091	0.0138563935624909	0	NA	NA	0.0137001009588958	0.295323558557828	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	110	TAT	GGT	ATT	2	TGGTATTTC:TGGTATTTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	68.75000000000003	0	37.583333333333314	0.014688351957142	0	-Inf	0.014688351957142	0.0145257798956487	0	NA	NA	0.014120324293018	0.298234141757904	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	111	TTC	ATT	TCT	2	TATTTCTAC:TATTTTTAC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.25000000000003	0	36.583333333333314	0.0145812612109391	0	-Inf	0.0145812612109391	0.0142351398662003	0	NA	NA	0.0143377366270401	0.309160627330949	660	340	0	0	0.66	0.001
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTTTACTAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	68.9166666666667	0	35.91666666666665	0.0146524806812088	0	-Inf	0.0146524806812088	0.0140779121551114	0	NA	NA	0.0142688676982192	0.304474800622238	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TACTATCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.25000000000004	0	35.583333333333314	0.0145812612109391	0	-Inf	0.0145812612109391	0.0145071882428824	0	NA	NA	0.0143539454649805	0.309707268528483	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA:TATCTAGGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	0	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	69.91666666666671	0	34.91666666666665	0.0144408793426023	0	-Inf	0.0144408793426023	0.0142424667912121	0	NA	NA	0.0138284042990368	0.296350735793475	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.41666666666671	0	35.41666666666665	0.0141346939686238	0	-Inf	0.0141346939686238	0.0140746976060677	0	NA	NA	0.0137824987255227	0.305101952908899	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGA:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.91666666666671	0	35.91666666666665	0.0140354973235301	0	-Inf	0.0140354973235301	0.0135329829325163	0	NA	NA	0.0137056672707856	0.305804465306548	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	117	GGA	CTG	GAC	2	ACTGGACCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.25000000000006	0	35.583333333333314	0.0139701361553758	0	-Inf	0.0139701361553758	0.0142004755632685	0	NA	NA	0.0137870544864823	0.310926798451719	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	118	CCA	GAC	CAG	2	GGACCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.91666666666673	0	34.91666666666664	0.0138412232800193	0	-Inf	0.0138412232800193	0.013301366400148701	0	NA	NA	0.0137707929285427	0.314841731690907	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.91666666666673	0	34.24999999999998	0.0136522540928075	0	-Inf	0.0136522540928075	0.0132695377689875	0	NA	NA	0.0136627897579207	0.317683829195376	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.25000000000006	0	34.24999999999998	0.0137776549513118	0	-Inf	0.0137776549513118	0.0137764877351086	0	NA	NA	0.0141840433677803	0.331374564652225	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	121	GGA	CTG	GAC	2	GCTGGACTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333339	0	34.083333333333314	0.0136212597557268	0	-Inf	0.0136212597557268	0.0138187799804292	0	NA	NA	0.0131380450140359	0.299838489085153	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	122	CTT	GAC	TTC	2	GGACTTCCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000006	0	33.41666666666664	0.0134986770919624	0	-Inf	0.0134986770919624	0.0139654616762919	0	NA	NA	0.0134812569217276	0.316685573872778	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.75000000000006	0	34.083333333333314	0.0134986770919624	0	-Inf	0.0134986770919624	0.0137031120996828	0	NA	NA	0.0131568638439899	0.304901085728262	616	384	0	0	0.616	0.001
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333339	0	34.74999999999998	0.0136212597557268	0	-Inf	0.0136212597557268	0.0130882475253422	0	NA	NA	0.0137045431967667	0.32026038906774	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.08333333333339	0	34.74999999999998	0.0136212597557268	0	-Inf	0.0136212597557268	0.0131361350617393	0	NA	NA	0.0136508135723554	0.318359368351104	609	391	0	0	0.609	0.001
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.25000000000006	0	35.24999999999998	0.0135904058348962	0	-Inf	0.0135904058348962	0.0133474719818386	0	NA	NA	0.0134416174010684	0.311983293384746	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000007	0	34.249999999999986	0.0134081783305544	0	-Inf	0.0134081783305544	0.0134132145493939	0	NA	NA	0.0134646164336027	0.319343241523509	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000007	0	34.249999999999986	0.0134081783305544	0	-Inf	0.0134081783305544	0.0137810953219279	0	NA	NA	0.0130739430184111	0.3050966736832	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.25000000000007	0	33.749999999999986	0.0134081783305544	0	-Inf	0.0134081783305544	0.0134823026918433	0	NA	NA	0.0129422582366776	0.300202185868012	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666674	0	33.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.3333333333334	0	33.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000007	0	33.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333341	0	33.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.00000000000009	0	33.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333341	0	32.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666674	0	33.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666674	0	33.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333341	0	33.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTA:GGAGCCTTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333341	0	33.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	140	TTA	CCT	TAA	2	GCCTTAAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333341	0	33.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	141	AAC	TAA	ACA	2	TTAAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000009	0	33.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCG:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000009	0	34.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAA	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333341	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.58333333333341	0	35.08333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333341	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000009	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	35.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.00000000000009	0	34.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000009	0	35.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTG	2	AATCCTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666676	0	33.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	153	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	0	33.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	154	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333343	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333343	0	33.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666676	0	33.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666676	0	33.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.16666666666676	0	33.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666676	0	34.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333343	0	34.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.5000000000001	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.5000000000001	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.5000000000001	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333343	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666676	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666676	0	36.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.5000000000001	1	37.66666666666666	0	0.0270299523623977	0	-0.0270299523623977	0	0.0271697743085969	NA	NA	0.0282529800761027	0.338712866739332	0	385	615	0.615	0	0.001
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.0000000000001	1	38.16666666666666	0	0.0266694765273651	0	-0.0266694765273651	0	0.0270243599627427	NA	NA	0.0277240629432936	0.33606902791421	0	346	654	0.654	0	0.001
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.50000000000009	1	38.999999999999986	0	0.0260895870640617	0	-0.0260895870640617	0	0.0274807016873227	NA	NA	0.0273317288525394	0.339803733927162	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.50000000000009	1	38.999999999999986	0	0.0260895870640617	0	-0.0260895870640617	0	0.026168966633818	NA	NA	0.0272972797452325	0.339194631156305	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.50000000000009	1	38.66666666666665	0	0.0263184898584526	0	-0.0263184898584526	0	0.0271170772522227	NA	NA	0.0263430002136926	0.317760991669851	0	374	626	0.626	0	0.001
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000009	1	37.66666666666665	0	0.0270299523623977	0	-0.0270299523623977	0	0.0282825248099067	NA	NA	0.0276730095605992	0.328686846060904	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.50000000000009	1	36.66666666666665	0	0.0277809537602618	0	-0.0277809537602618	0	0.0287122214055505	NA	NA	0.0279551611736876	0.320335669125344	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.50000000000009	1	36.749999999999986	0	0.0277167798918218	0	-0.0277167798918218	0	0.0301545449837416	NA	NA	0.0287152327880756	0.334430046841075	0	348	652	0.652	0	0.001
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.16666666666676	1	36.749999999999986	0	0.0277167798918218	0	-0.0277167798918218	0	0.0298070215290218	NA	NA	0.027867882337762	0.319941600516426	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333341	1	36.16666666666665	0	0.0281723261817365	0	-0.0281723261817365	0	0.0313316309996442	NA	NA	0.0299576592429714	0.347009967306035	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.00000000000007	1	35.999999999999986	0	0.0283052459871353	0	-0.0283052459871353	0	0.0269733861794258	NA	NA	0.0283197586097457	0.317558569976259	0	396	604	0.604	0	0.001
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.00000000000007	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0299449491578667	NA	NA	0.0301828015282115	0.343777713702687	0	345	655	0.655	0	0.001
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666674	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0285192714221719	NA	NA	0.0299697614058818	0.340358473792764	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.3333333333334	1	35.33333333333332	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0297732924514501	NA	NA	0.029661780686795602	0.330741034016634	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAAGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.3333333333334	1	35.33333333333332	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0304103373890954	NA	NA	0.0300682725887765	0.337320265380525	0	384	616	0.616	0	0.001
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT:GCTTCTTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.00000000000006	1	35.33333333333332	0.0144235214459156	0.028849710620847	0.499953765064565	-0.0144261891749314	0.014097418718882	0.0308713034117301	NA	NA	0.0335457048197171	0.667162331659571	288	112	600	0.6	0.288	0.576
N	all	ss13	185	TCA	CTT	CAC	2	TCTTCACGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	70.66666666666673	1	35.33333333333332	0.0142861462280209	0.028849710620847	0.495192011309034	-0.0145635643928262	0.0136703536304009	0.0308229550829734	NA	NA	0.0337454401447217	0.666053001525721	273	145	582	0.582	0.273	0.546
N	all	ss13	186	CGC	CAC	GCT	2	TCACGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.8333333333334	2	34.66666666666665	0.0283721774047871	0.0600320307551524	0.472617318586245	-0.0316598533503653	0.0200875782023756	0.0480693557418652	NA	NA	0.0405753722695162	0.435230406183062	174	50	776	0.776	0.174	0.348
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.41666666666674	2	35.083333333333314	0.0285408991973241	0.0592901175479514	0.48137700476376	-0.0307492183506273	0.0197764676855007	0.0449713403401407	NA	NA	0.0382797933175085	0.421815542143556	183	53	764	0.764	0.183	0.366
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.41666666666674	2	35.083333333333314	0.0285408991973241	0.0592901175479514	0.48137700476376	-0.0307492183506273	0.0198285042800396	0.043705429553589	NA	NA	0.0371242135725107	0.40751233203343	184	42	774	0.774	0.184	0.368
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.08333333333341	2	35.083333333333314	0.0282718985737775	0.0592901175479514	0.476839981821799	-0.0310182189741739	0.0192095322731257	0.0442929307423829	NA	NA	0.0394253555179469	0.431423468189477	181	44	775	0.775	0.181	0.362
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.08333333333341	2	35.083333333333314	0.0282718985737775	0.0592901175479514	0.476839981821799	-0.0310182189741739	0.0187945735571486	0.0459634309168993	NA	NA	0.0399795721377549	0.437836554353389	173	43	784	0.784	0.173	0.346
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.08333333333341	2	35.749999999999986	0.0282718985737775	0.0581404786806199	0.486268761719043	-0.0298685801068425	0.0186927292232721	0.0460274340036049	NA	NA	0.0399088567555462	0.454206960383284	183	41	776	0.776	0.183	0.366
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.08333333333341	2	34.749999999999986	0.0278777737612569	0.0598821656332629	0.46554384709446	-0.032004391872006	0.0196983433853954	0.046538975317263	NA	NA	0.0397676977793307	0.420944554185555	169	51	780	0.78	0.169	0.338
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000009	2	33.749999999999986	0.0272447663451875	0.0617314855970427	0.441343118210858	-0.0344867192518552	0.0191480553406024	0.0474988588169069	NA	NA	0.0397337938392563	0.385424834417063	145	47	808	0.808	0.145	0.29
N	all	ss13	194	AGT	ACA	GTT	2	AACAGTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333341	2	32.91666666666665	0.0269389228181416	0.0633621979772033	0.425157644118245	-0.0364232751590617	0.0195164339918626	0.0471097898380997	NA	NA	0.0436031615764634	0.403528752393935	151	42	807	0.807	0.151	0.302
N	all	ss13	195	TCA	GTT	CAA	2	AGTTCAAGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333341	2	32.249999999999986	0.0269389228181416	0.0647301776657746	0.416172545628363	-0.037791254847633	0.0186630014821573	0.0514920724218409	NA	NA	0.0414052006652966	0.361391091745894	137	40	823	0.823	0.137	0.274
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAC:TCAAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000009	2	32.249999999999986	0.0263473854682498	0.0647301776657746	0.407034036030165	-0.0383827921975247	0.0194630110569342	0.0493080809493456	NA	NA	0.0437188097626148	0.379972551961193	142	42	816	0.816	0.142	0.284
N	all	ss13	197	AAC	GAA	ACT	2	AGAAACTCA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666674	2	32.41666666666665	0.0264636052740321	0.0643826713791054	0.411036148503471	-0.0379190661050733	0.018304673311942	0.0539263207616559	NA	NA	0.0442833065449544	0.39184096837025	151	48	801	0.801	0.151	0.302
N	all	ss13	198	TCA	ACT	CAA	2	AACTCAACT:AATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333341	2	33.083333333333314	0.0269389228181416	0.0630291953285242	0.427403882878864	-0.0360902725103826	0.0180421384598779	0.0484917493576961	NA	NA	0.0435108386890214	0.406847122858065	152	46	802	0.802	0.152	0.304
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333341	2	33.583333333333314	0.0267586909940917	0.062050874504436	0.431237935126583	-0.0352921835103443	0.0183244515475642	0.0473380850742939	NA	NA	0.0410402715172867	0.389821950693773	162	43	795	0.795	0.162	0.324
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333341	2	34.74999999999998	0.0269389228181416	0.059882165633263	0.449865540654023	-0.0329432428151214	0.0186989645218037	0.0454183881186484	NA	NA	0.0388281840190716	0.396195004729673	161	48	791	0.791	0.161	0.322
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.75000000000009	2	34.24999999999998	0.0265221005560517	0.0607927570603562	0.43627073089842	-0.0342706565043045	0.0181829053009286	0.0466460499298882	NA	NA	0.0403250695895041	0.395403025056051	158	50	792	0.792	0.158	0.316
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.41666666666674	2	34.583333333333314	0.0266398704364015	0.0601826482875393	0.44265035179446	-0.0335427778511378	0.0187313704605776	0.046464639112582	NA	NA	0.0397375009956327	0.39860856048628	174	37	789	0.789	0.174	0.348
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666674	2	34.91666666666664	0.0269995408952429	0.059584670169267	0.453128981305815	-0.0325851292740241	0.0186439051493401	0.0453743181009365	NA	NA	0.0393114014590954	0.407162311066511	158	46	796	0.796	0.158	0.316
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	35.24999999999997	0.0273690573365762	0.0589984642956842	0.463894402393424	-0.0316294069591081	0.0194083491621852	0.0446636164738966	NA	NA	0.0399936434911115	0.429025195326772	177	39	784	0.784	0.177	0.354
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.0833333333334	2	35.916666666666636	0.0274944876870935	0.0578600049104132	0.475189860935274	-0.0303655172233197	0.0184621978270039	0.0433240466884291	NA	NA	0.0394245475498016	0.441170271427283	181	43	776	0.776	0.181	0.362
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	35.24999999999997	0.0272447663451876	0.0589984642956842	0.461787720586154	-0.0317536979504966	0.0186551375975478	0.0442827771004632	NA	NA	0.0386174651895928	0.410927448437988	161	30	809	0.809	0.161	0.322
N	all	ss13	207	TCT	CTT	CTC	2	ACTTCTCCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.0833333333334	2	35.916666666666636	0.0274944876870935	0.0578600049104132	0.475189860935274	-0.0303655172233197	0.0186165425522065	0.0453313671994754	NA	NA	0.0401107756960274	0.449025068269651	186	40	774	0.774	0.186	0.372
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000006	2	36.166666666666636	0.0273378783823658	0.0574443341110379	0.475902085130322	-0.0301064557286721	0.0193678582509942	0.0446943853442434	NA	NA	0.0392759383077608	0.443356908583523	179	48	773	0.773	0.179	0.358
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000007	2	35.33333333333331	0.0267885619515594	0.0588537115811215	0.455172005840875	-0.0320651496295621	0.0181243291615124	0.0437850598716696	NA	NA	0.0389760935016209	0.410685656803646	163	44	793	0.793	0.163	0.326
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000007	2	34.33333333333331	0.026434454296256	0.0606390724718213	0.435931046084849	-0.0342046181755652	0.0179190518488732	0.0483867670606515	NA	NA	0.0431057297430992	0.427483574989421	146	55	799	0.799	0.146	0.292
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	2	34.66666666666664	0.0266694765273651	0.0600320307551524	0.44425411221119	-0.0333625542277873	0.0197051510545909	0.0471730381876672	NA	NA	0.038705086606148	0.388705011616646	142	54	804	0.804	0.142	0.284
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTG	2	ATGGCTGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.3333333333334	2	35.33333333333331	0.0270299523623976	0.0588537115811215	0.459273538341599	-0.0318237592187239	0.0189652115295461	0.0442605479181949	NA	NA	0.0410468086850928	0.438159985035379	151	44	805	0.805	0.151	0.302
N	all	ss13	213	GGC	CTG	GCA	2	GCTGGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	2	35.49999999999998	0.0268485044068343	0.0585663277285775	0.458429023094332	-0.0317178233217432	0.0190705629836381	0.0454373633821126	NA	NA	0.038459327815703	0.409535794097345	148	44	808	0.808	0.148	0.296
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	GGCAATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000007	2	34.83333333333331	0.0266103300115572	0.0597330472949441	0.445487568718254	-0.033122717283387	0.018386575348747	0.0448025639964328	NA	NA	0.0381351559557159	0.38508717777406	147	37	816	0.816	0.147	0.294
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000007	2	35.16666666666664	0.0269691977905829	0.0591439311842398	0.455992647945076	-0.0321747333936569	0.0182172627791562	0.0443775044076189	NA	NA	0.040041328344201	0.421663777321197	174	52	774	0.774	0.174	0.348
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAC:GGCGGTGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.3333333333334	2	36.33333333333331	0.027400307499342	0.0571705240409132	0.479273331126602	-0.0297702165415712	0.0186827651497513	0.0431334460462905	NA	NA	0.0394393519430332	0.450347787907476	190	47	763	0.763	0.19	0.38
N	all	ss13	217	GAC	GTG	ACA	2	GGTGACACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666673	2	36.49999999999998	0.0274630224286674	0.0568993130810351	0.482659999595338	-0.0294362906523677	0.0194193718608349	0.0429797310410349	NA	NA	0.0375195506763295	0.432712341015913	167	42	791	0.791	0.167	0.334
N	all	ss13	218	ACT	ACA	CTG	2	GACACTGCT:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.41666666666673	2	36.24999999999998	0.0273690573365762	0.0573071018565008	0.477585786925839	-0.0299380445199247	0.0187898067167651	0.0433010718936227	NA	NA	0.0403340702597273	0.457934665084164	191	44	765	0.765	0.191	0.382
N	all	ss13	219	GCT	CTG	CTC	2	ACTGCTCTT:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.41666666666673	1	35.583333333333314	0.0550074627952335	0.0286430990492925	1.92044382839196	0.026364363745941	0.0341093564721064	0.0315673239989535	NA	NA	0.0351256350685519	0.452909496220462	756	39	205	0.205	0.756	0.41
N	all	ss13	220	CTT	CTC	TTG	2	GCTCTTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.0833333333334	1	34.91666666666665	0.0545075207127158	0.0292007684815911	1.86664678866513	0.0253067522311247	0.0354876113629786	0.0310020283718412	NA	NA	0.0364472312825336	0.487469327018491	740	48	212	0.212	0.74	0.424
N	all	ss13	221	GCT	TTG	CTT	2	CTTGCTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.0833333333334	1	34.583333333333314	0.0537744248135208	0.0294878275056261	1.82361433046436	0.0242865973078947	0.0326102001271614	0.0321363970468535	NA	NA	0.0374758120616216	0.516945754961105	700	40	260	0.26	0.7	0.52
N	all	ss13	222	TTG	CTT	TGC	2	GCTTTGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666673	1	34.749999999999986	0.0538952343889475	0.0293435958691742	1.83669495140386	0.0245516385197733	0.0319656534181893	0.0298304547809033	NA	NA	0.0348482055133211	0.481102197322185	740	46	214	0.214	0.74	0.428
N	all	ss13	223	CTG	TGC	TGC	2	TTGCTGCTG	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.25000000000007	1	35.083333333333314	0.0543839525266103	0.0290593249318817	1.87148024443418	0.0253246275947286	0.0318135726951016	0.0322712991685695	NA	NA	0.0350868917740617	0.470436567683264	733	44	223	0.223	0.733	0.446
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTA:CTGCTGCTT	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.91666666666673	1	35.583333333333314	0.0538952343889475	0.0286430990492925	1.88161323941233	0.025252135339655	0.0327086683719702	0.0310128599264812	NA	NA	0.0340085325770811	0.457770206549212	758	48	194	0.194	0.758	0.388
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAT:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.0833333333334	1	35.91666666666665	0.0537744248135208	0.0283721774047871	1.89532245080519	0.0254022474087337	0.0347721539522994	0.0326404450203346	NA	NA	0.0352178798034397	0.470732105855003	715	52	233	0.233	0.715	0.466
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGATAGG:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.5833333333334	1	36.16666666666665	0.0534152253723938	0.0281723261817365	1.89601756801403	0.0252428991906574	0.0319807814558292	0.0290378666378152	NA	NA	0.0337815077697897	0.454918607782611	743	39	218	0.218	0.743	0.436
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG:GATAGGTTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.416666666666667	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.5833333333334	1	36.499999999999986	0.0541384900641951	0.0279101972553257	1.93973871158738	0.0262282928088693	0.0318159327988564	0.0282003650098452	NA	NA	0.0362964694687103	0.469917812619931	718	48	234	0.234	0.718	0.468
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC:AGGTTGAAC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666674	1	36.583333333333314	0.0542609435735893	0.02784542552167	1.94864838863253	0.0264155180519193	0.0338290315013293	0.0298238320446443	NA	NA	0.0340352805323131	0.437677162235737	765	38	197	0.197	0.765	0.394
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000009	1	36.583333333333314	0.0532965566864638	0.02784542552167	1.91401480451384	0.0254511311647938	0.034769896221105	0.0299450841866319	NA	NA	0.034590341646097	0.461860202675551	736	42	222	0.222	0.736	0.444
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.08333333333341	1	37.583333333333314	0.0537744248135208	0.0270909813104957	1.98495669821629	0.026683443503025	0.0319225949176787	0.0290158133247282	NA	NA	0.0342548486364811	0.435998349021733	752	42	206	0.206	0.752	0.412
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.41666666666674	1	37.583333333333314	0.0542609435735893	0.0270909813104957	2.00291539651859	0.0271699622630936	0.03380638261786	0.0279908081082804	NA	NA	0.0348932691657843	0.436180543262029	752	49	199	0.199	0.752	0.398
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAAC:CTTGAGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.25000000000009	1	37.41666666666665	0.0536541558618203	0.0272138698048234	1.97157391604448	0.026440286056997	0.0318561165137085	0.0299174605154318	NA	NA	0.033576489420807	0.431010130808287	755	47	198	0.198	0.755	0.396
N	all	ss13	233	AAC	AGA	ACA	2	GAGAACAAA:GAGAGCAAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.25000000000009	1	36.41666666666665	0.0529436946379863	0.0279752710599065	1.89251766406882	0.0249684235780797	0.0339559659605023	0.0308176484155108	NA	NA	0.0335492979925417	0.456736809071089	748	41	211	0.211	0.748	0.422
N	all	ss13	234	AAA	ACA	AAA	2	AACAAAGTA:AGCAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333343	1	36.41666666666665	0.0397005575048303	0.0279752710599065	1.41913039626372	0.0117252864449237	0.029433726172397	0.0292071622952243	NA	NA	0.0332738652589738	0.724547849740024	559	123	318	0.318	0.559	0.636
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TAT	2	AAAATGTCT:AAAGTATCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333343	1	36.41666666666665	0.0397005575048303	0.0279752710599065	1.41913039626372	0.0117252864449237	0.0294067179677491	0.0283127623851276	NA	NA	0.0311949271907002	0.707012372738188	549	144	307	0.307	0.549	0.614
N	all	ss13	236	TCT	TAT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTATCTGGC	1:1	FALSE	0.916666666666667	1	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.91666666666676	0	36.583333333333314	0.0264636052740321	0	-Inf	0.0264636052740321	0.0277817526605984	0	NA	NA	0.025563635171463	0.300573141741139	609	391	0	0	0.609	0.001
N	all	ss13	237	GGC	CTG	GCA	2	TCTGGCAAA:TCTGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333341	0	35.83333333333332	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0261782993850901	0	NA	NA	0.0258093662118208	0.314184511697424	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GCA	AAG	2	GGCAAAGGC:GGTAAAGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.83333333333332	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0254096210479363	0	NA	NA	0.0262007252127059	0.32460000221394	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.16666666666665	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0263113710377621	0	NA	NA	0.025174886167999	0.305274358147917	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.83333333333332	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0270300305395093	0	NA	NA	0.0264229009615921	0.328684882378101	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.99999999999999	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0254022442486373	0	NA	NA	0.0266892143103739	0.332493158070015	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA:CAACAACAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	0	36.49999999999999	0.026032982222434	0	-Inf	0.026032982222434	0.0253455752502866	0	NA	NA	0.0264529715420165	0.325054955638057	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC:CAACAGGGC	1:1	FALSE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	0	36.49999999999999	0.026728886585519	0	-Inf	0.026728886585519	0.026859445239489	0	NA	NA	0.026642839515724	0.315750069847754	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA:CAGGGCCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666674	0	36.33333333333332	0.0272757331281561	0	-Inf	0.0272757331281561	0.025614046763895	0	NA	NA	0.0266874446730354	0.306760245641768	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666674	0	36.49999999999999	0.0272757331281561	0	-Inf	0.0272757331281561	0.0273872782156684	0	NA	NA	0.0280897555110872	0.331537987170537	654	346	0	0	0.654	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.66666666666674	0	35.49999999999999	0.0269087157486763	0	-Inf	0.0269087157486763	0.0277766041577887	0	NA	NA	0.0260932366846763	0.302422423528447	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.83333333333341	0	35.33333333333332	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0277567214998055	0	NA	NA	0.027582724692584	0.33036390163552	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	0	34.99999999999999	0.026728886585519	0	-Inf	0.026728886585519	0.027654496250365	0	NA	NA	0.0285899624299749	0.349837480757666	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	0	34.66666666666666	0.0263763446044989	0	-Inf	0.0263763446044989	0.0262847794931367	0	NA	NA	0.0262861565122013	0.315652947859254	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.3333333333334	0	33.83333333333333	0.0263184898584525	0	-Inf	0.0263184898584525	0.0272852389746712	0	NA	NA	0.0265805856520518	0.322105900740401	599	401	0	0	0.599	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.8333333333334	0	34.33333333333333	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0270081032897285	0	NA	NA	0.026998940344375	0.326467456726001	670	330	0	0	0.67	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.8333333333334	0	33.99999999999999	0.0261464386246642	0	-Inf	0.0261464386246642	0.0262984800840426	0	NA	NA	0.0270409212627198	0.333583453833071	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.50000000000007	0	33.33333333333333	0.0255888359187695	0	-Inf	0.0255888359187695	0.0253874963257398	0	NA	NA	0.0276415114578155	0.35458143280816	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.8333333333334	0	33	0.0254801574935108	0	-Inf	0.0254801574935108	0.0261669068492258	0	NA	NA	0.0254152729513817	0.316076594800662	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.16666666666674	0	32.66666666666667	0.0253723983888037	0	-Inf	0.0253723983888037	0.0254243691750086	0	NA	NA	0.0251209581704508	0.312490891404069	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.3333333333334	0	33.00000000000001	0.0253188599437158	0	-Inf	0.0253188599437158	0.0258737108971346	0	NA	NA	0.0253604222713514	0.318104272836256	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.00000000000007	0	32.333333333333336	0.0251069468972921	0	-Inf	0.0251069468972921	0.0254831978999097	0	NA	NA	0.0250795573151521	0.316782280191888	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.25000000000007	0	31.08333333333334	0.0247190242145635	0	-Inf	0.0247190242145635	0.0239949609183364	0	NA	NA	0.0255016209164465	0.332389601685751	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666673	0	31.250000000000004	0.0248212932013322	0	-Inf	0.0248212932013322	0.0238900631191584	0	NA	NA	0.0251933824126339	0.324510775463806	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666673	0	31.250000000000004	0.0248212932013322	0	-Inf	0.0248212932013322	0.0249791546508793	0	NA	NA	0.0243739707697701	0.308510483949055	609	391	0	0	0.609	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666673	0	31.41666666666667	0.0248212932013322	0	-Inf	0.0248212932013322	0.0247088759541737	0	NA	NA	0.024124595348554	0.303536466269042	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.25000000000006	0	31.08333333333334	0.0247190242145635	0	-Inf	0.0247190242145635	0.024909690180079	0	NA	NA	0.0247929807148528	0.318756239510058	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.08333333333339	0	31.58333333333334	0.025080706950469	0	-Inf	0.025080706950469	0.0251115246807481	0	NA	NA	0.0257844108692127	0.330698366661787	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333339	0	32.583333333333336	0.0253992526173405	0	-Inf	0.0253992526173405	0.0252387967354491	0	NA	NA	0.0261606332467209	0.331600099944555	623	377	0	0	0.623	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000006	0	31.91666666666667	0.025185997239258	0	-Inf	0.025185997239258	0.0261822679851939	0	NA	NA	0.0249677212867413	0.313098227241649	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666671	0	31.416666666666668	0.0248212932013322	0	-Inf	0.0248212932013322	0.0265447639343672	0	NA	NA	0.0253693917054316	0.327878859793363	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.41666666666671	0	31.416666666666668	0.0246682051273183	0	-Inf	0.0246682051273183	0.0243389963234852	0	NA	NA	0.0257396678854775	0.337874658140567	617	383	0	0	0.617	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.75000000000004	0	31.416666666666668	0.0248727457165764	0	-Inf	0.0248727457165764	0.025259012453157	0	NA	NA	0.025888500102492	0.336670711212792	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.25000000000004	0	31.583333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.08333333333337	0	31.750000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75000000000003	0	31.416666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.4166666666667	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.08333333333337	0	31.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.9166666666667	0	32.083333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.9166666666667	0	31.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.9166666666667	0	31.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.58333333333337	0	31.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.58333333333337	0	31.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.9166666666667	0	32.083333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.9166666666667	0	32.083333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.58333333333337	0	31.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000003	0	31.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.08333333333337	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.4166666666667	0	31.916666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75000000000003	0	31.916666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.75000000000003	1	32.25	0.0128071415099282	0.03166697281676	0.404432137673414	-0.0188598313068319	0.0135823253421027	0.0323561109218037	NA	NA	0.0198021780379207	0.340888093466713	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ATT	TTG	2	AATTTTGGG	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25000000000003	1	32.083333333333336	0.0128896835290581	0.0318350176854428	0.404890101096195	-0.0189453341563847	0.013432863828133	0.0330642642752467	NA	NA	0.0199338253204311	0.341903270843024	0	344	656	0.656	0	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.08333333333336	1	31.75	0.0129174344873365	0.0321765161581571	0.401455347864372	-0.0192590816708206	0.0132266180430032	0.034532471169946	NA	NA	0.0197396205470802	0.329234902023397	0	382	618	0.618	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.25000000000001	1	32.583333333333336	0.0130580012294226	0.0313361505112163	0.416707253966906	-0.0182781492817937	0.012807811181089	0.0316052797629333	NA	NA	0.0187177286541967	0.328809146660539	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAA:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.50000000000001	1	32.333333333333336	0.0130155110198637	0.0315836140125951	0.412096950484302	-0.0185681029927314	0.0129509621542957	0.0324882971869569	NA	NA	0.0193499184446519	0.33725861804136	0	352	648	0.648	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAATTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.66666666666669	1	31.166666666666668	0.0128208250194751	0.0327921082603737	0.390972880355115	-0.0199712832408986	0.0128124931800618	0.0336496167871991	NA	NA	0.0213282380598533	0.349078834037467	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GAATTAATC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.16666666666669	1	30.666666666666668	0.0127391597743079	0.0333388219281254	0.38211187551174	-0.0205996621538174	0.0123281133915545	0.0361652691395927	NA	NA	0.0231518927167479	0.373593978179019	0	386	614	0.614	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:TTAATCAGA	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	30.666666666666668	0.0124226442537559	0.0333388219281254	0.372617973140674	-0.0209161776743694	0.0127644967770144	0.0356997189055016	NA	NA	0.0223297686531322	0.348915583542847	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	1	31.666666666666668	0.0123206056064609	0.0322630388127681	0.381879886701344	-0.0199424332063072	0.0125401281770064	0.0341580158177045	NA	NA	0.020822838877543	0.338204357492597	0	357	643	0.643	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000001	1	31.5	0.0122202296145754	0.0324374878453625	0.376731689976494	-0.0202172582307871	0.0122939939551969	0.0345395705788838	NA	NA	0.0222134542692738	0.362750937873175	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	32.166666666666664	0.0124226442537559	0.0317507728699206	0.391254861878485	-0.0193281286161646	0.0130741057693369	0.0336327219701797	NA	NA	0.0209047404045978	0.355183829584982	0	391	609	0.609	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.833333333333336	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0285865120844716	0.0346374756344107	NA	NA	0.031244324266948	0.864310128487287	523	127	350	0.35	0.523	0.7
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.0281930545948305	0.0349974897087237	NA	NA	0.0319805915933664	0.873566292410206	502	150	348	0.348	0.502	0.696
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.0276438614653349	0.0326095638800742	NA	NA	0.0347242093900143	0.883481648509139	514	125	361	0.361	0.514	0.722
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.33333333333336	1	31.333333333333332	0.0368926831430788	0.0326138339548042	1.13119736839907	0.00427884918827467	0.0288916507396837	0.0356361967924939	NA	NA	0.0340667731265316	0.90004711101389	496	130	374	0.374	0.496	0.748
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000001	2	30.916666666666668	0.0493497606808473	0.0676514664202386	0.729470672140284	-0.0183017057393913	0.0307181548662005	0.0504811403546798	NA	NA	0.0409940390868457	0.65527368473388	318	49	633	0.633	0.318	0.636
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000001	2	31.25	0.0499664439235005	0.0668966841033532	0.746919590906837	-0.0169302401798527	0.0313191031285721	0.0503392208008816	NA	NA	0.0415557353882705	0.683706565025508	320	42	638	0.638	0.32	0.64
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.75000000000001	2	31.583333333333332	0.0505987404816737	0.0661585688516753	0.764810082199841	-0.0155598283700017	0.0297482253124512	0.0471352243890315	NA	NA	0.0422399936185452	0.712599447816255	324	43	633	0.633	0.324	0.648
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.41666666666669	2	30.583333333333332	0.0501754455827152	0.0684234871721278	0.733307343083707	-0.0182480415894127	0.0311310389018378	0.0510551929656251	NA	NA	0.0423425595598456	0.666495873347273	314	53	633	0.633	0.314	0.628
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	29.583333333333332	0.0509209303034166	0.0708490996895694	0.718723745630226	-0.0199281693861528	0.0315434293736578	0.0542757448235668	NA	NA	0.0426025693381913	0.639949655139924	315	53	632	0.632	0.315	0.63
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333336	2	28.916666666666668	0.0510292410063947	0.0725641058409195	0.703229791300189	-0.0215348648345249	0.0309739898379896	0.0548013829531456	NA	NA	0.0452881348069934	0.63442502014762	282	45	673	0.673	0.282	0.564
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	29.083333333333332	0.0507056829412418	0.0721276112438599	0.702999615082334	-0.0214219283026181	0.0309265673528917	0.0548315035008311	NA	NA	0.0442333807280793	0.62817775621782	302	44	654	0.654	0.302	0.604
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	29.416666666666668	0.0509209303034166	0.0712702003524607	0.71447715948028	-0.0203492700490441	0.0300652011467729	0.0548016970512553	NA	NA	0.045266861356376	0.653042076934907	289	59	652	0.652	0.289	0.578
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.75000000000001	2	29.91666666666667	0.0512472511431301	0.070021663193269107	0.731877090689504	-0.018774412050139	0.029361626753167	0.0526309103720317	NA	NA	0.0458447286889817	0.682156832128834	311	42	647	0.647	0.311	0.622
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666667	2	29.91666666666667	0.0508130785858607	0.070021663193269107	0.725676544494663	-0.0192085846074084	0.0299287041830936	0.0532487926971459	NA	NA	0.0428003030020416	0.653579164648841	309	51	640	0.64	0.309	0.618
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.41666666666667	2	29.91666666666667	0.0508130785858607	0.070021663193269107	0.725676544494663	-0.0192085846074084	0.0313447299056458	0.0546415804373521	NA	NA	0.0416048813858188	0.644303179206716	309	33	658	0.658	0.309	0.618
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333334	2	29.583333333333336	0.0510292410063947	0.0708490996895694	0.720252497632053	-0.0198198586831748	0.0307132166325695	0.0539352087508422	NA	NA	0.0455551435063551	0.663508712145719	305	49	646	0.646	0.305	0.61
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.75000000000001	2	29.583333333333336	0.0505987404816737	0.0708490996895694	0.714176195652109	-0.0202503592078958	0.0304454000196288	0.0524600077669447	NA	NA	0.0439563207724234	0.645019042383388	293	43	664	0.664	0.293	0.586
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000001	2	28.58333333333334	0.0499664439235005	0.0734531512400294	0.680249153099242	-0.0234867073165289	0.0313740968328382	0.0559047907593976	NA	NA	0.046519165511479	0.613641445661154	266	52	682	0.682	0.266	0.532
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000001	2	28.250000000000004	0.0493497606808473	0.0743642698449398	0.663621935423405	-0.0250145091640925	0.0297386507881732	0.0573173675683718	NA	NA	0.0469100197794739	0.593864353863352	282	43	675	0.675	0.282	0.564
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000001	2	28.58333333333334	0.0499664439235005	0.0734531512400294	0.680249153099242	-0.0234867073165289	0.0298201220711757	0.0546190151612897	NA	NA	0.0431379327297134	0.5861277026243	270	49	681	0.681	0.27	0.54
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGAATG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.75	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0300340672549473	0.0603896724643451	NA	NA	0.0447186002968566	0.560735895305682	229	43	728	0.728	0.229	0.458
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	27.333333333333332	0.049502499478939	0.0769906155450625	0.642967966010939	-0.0274881160661235	0.0290596641473446	0.0614255783828903	NA	NA	0.0492682183999892	0.576893585191296	227	42	731	0.731	0.227	0.454
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	27.5	0.0498108321742552	0.0764993759663411	0.651127300648458	-0.0266885437920859	0.0298906423307655	0.0593003388933339	NA	NA	0.0482611202988031	0.580261363236761	263	50	687	0.687	0.263	0.526
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	27.666666666666668	0.0499144653819543	0.0760143706952156	0.65664511756717	-0.0260999053132613	0.0302088901871775	0.0583185862409669	NA	NA	0.0490156966213934	0.594393206287474	260	47	693	0.693	0.26	0.52
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.1666666666667	2	28	0.049707628561966	0.0750625939177369	0.662215705154579	-0.0253549653557709	0.0309863866783671	0.0597792802301384	NA	NA	0.0463409022614001	0.584282492720865	269	50	681	0.681	0.269	0.538
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	2	27.500000000000004	0.049299057062491	0.0764993759663411	0.644437375334697	-0.02720031890385	0.0324174416909795	0.0588596542159827	NA	NA	0.0468560281493092	0.561571809794854	216	49	735	0.735	0.216	0.432
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.50000000000001	2	27.500000000000004	0.0488971496674065	0.0764993759663411	0.639183641039382	-0.0276022262989346	0.0299080086366998	0.0570176469165749	NA	NA	0.0470823431196844	0.557704633955365	267	51	682	0.682	0.267	0.534
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.16666666666669	2	27.500000000000004	0.0490972805875701	0.0764993759663411	0.641799752839453	-0.027402095378771	0.0299482487259494	0.0594142523426481	NA	NA	0.0460862001441687	0.552121894727294	227	36	737	0.737	0.227	0.454
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	2	28.500000000000004	0.049707628561966	0.0736788296875599	0.674652797455586	-0.0239712011255939	0.0316940708015698	0.0547438586568919	NA	NA	0.0469535848109372	0.609680389474975	280	43	677	0.677	0.28	0.56
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	2	28.91666666666667	0.0495536228075988	0.0725641058409195	0.682894417747445	-0.0230104830333208	0.0304628269317512	0.0534839132272572	NA	NA	0.0464792360337606	0.62055059328142	284	46	670	0.67	0.284	0.568
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000001	2	28.750000000000004	0.0490470943757949	0.0730059198684049	0.671823524232057	-0.0239588254926099	0.0305306741069901	0.0543703190843911	NA	NA	0.0456915599941031	0.600028186025244	286	53	661	0.661	0.286	0.572
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666667	2	29.08333333333334	0.0492484575638286	0.0721276112438599	0.682796181857762	-0.0228791536800314	0.0298754260897091	0.0565991754626867	NA	NA	0.0440802802086201	0.603737197409771	281	46	673	0.673	0.281	0.562
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.58333333333334	2	29.08333333333334	0.048847371697873	0.0721276112438599	0.677235400639049	-0.0232802395459869	0.0299705657567443	0.0529904471999089	NA	NA	0.0431106727457941	0.589189413730759	287	35	678	0.678	0.287	0.574
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.25000000000001	2	28.08333333333334	0.0478726780561084	0.0748283653087125	0.63976645565628	-0.0269556872526042	0.0289675500770149	0.0555375849354986	NA	NA	0.0473412456009338	0.569090707399235	249	39	712	0.712	0.249	0.498
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.25000000000001	2	28.08333333333334	0.0730059198684049	0.0748283653087125	0.975644991938699	-0.00182244544030767	0.0387213257570899	0.0568827440322324	NA	NA	0.0535485588060282	0.972850428628153	486	20	494	0.494	0.486	0.972
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.91666666666669	2	28.08333333333334	0.0733034660462047	0.0748283653087125	0.979621374111051	-0.00152489926250787	0.0384172492877175	0.0597008990697235	NA	NA	0.0553332635185116	0.978014317034829	468	15	517	0.517	0.468	0.936
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.58333333333336	2	27.750000000000004	0.0718395227971656	0.075774168923676	0.948074044461331	-0.0039346461265104	0.0389186865876945	0.0575631595936981	NA	NA	0.0561608989169729	0.944145711799363	467	18	515	0.515	0.467	0.934
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.25000000000003	2	28.41666666666667	0.0712702003524606	0.0739059002893285	0.964337083689535	-0.00263569993686789	0.0401550076425429	0.0545519032192588	NA	NA	0.0522062260372544	0.959734855092572	470	11	519	0.519	0.47	0.94
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.25000000000003	2	28.41666666666667	0.0712702003524606	0.0739059002893285	0.964337083689535	-0.00263569993686789	0.0371030641451028	0.0555877307568896	NA	NA	0.0554300274673062	0.96207485049982	485	12	503	0.503	0.485	0.97
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.9166666666667	1	29.08333333333334	0.0591439311842398	0.0351970741664875	1.68036499012617	0.0239468570177523	0.0374452444228464	0.0376107397313394	NA	NA	0.0439626860274173	0.585953888700707	686	61	253	0.253	0.686	0.506
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.75000000000003	1	29.41666666666667	0.0592608224609778	0.0347888449357013	1.70344323217707	0.0244719775252765	0.0361853154583751	0.038885988928224	NA	NA	0.0404397117093638	0.545081207704335	718	52	230	0.23	0.718	0.46
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.58333333333337	1	29.250000000000004	0.058680943646086	0.0349917687305995	1.67699278358487	0.0236891749154865	0.0358549611313914	0.0372264343224131	NA	NA	0.0421679921531112	0.57426526928724	704	45	251	0.251	0.704	0.502
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.41666666666671	1	29.083333333333332	0.0581123089391443	0.0351970741664875	1.65105510373573	0.0229152347726568	0.0360920692316367	0.0372303440999735	NA	NA	0.0425972594795423	0.590610935374845	672	48	280	0.28	0.672	0.56
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.66666666666671	1	28.833333333333332	0.0579438623528486	0.0355095904478987	1.63178064353816	0.0224342719049499	0.0368695892035728	0.0399292866315226	NA	NA	0.041060796141749	0.584813557105947	674	38	288	0.288	0.674	0.576
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.66666666666671	1	28.833333333333332	0.0579438623528486	0.0355095904478987	1.63178064353816	0.0224342719049499	0.0356798260595996	0.0383455170247352	NA	NA	0.0414100543044972	0.587984501084091	688	51	261	0.261	0.688	0.522
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	89.66666666666671	1	28.833333333333332	0.0579438623528486	0.0355095904478987	1.63178064353816	0.0224342719049499	0.0349881056742845	0.0388995124564628	NA	NA	0.042296194431786	0.595828555933342	682	51	267	0.267	0.682	0.534
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	88.33333333333337	1	29.5	0.0588537115811214	0.0346882632380668	1.69664624536565	0.0241654483430546	0.0351208389450514	0.0377084784589071	NA	NA	0.0419849974473937	0.564903554956575	694	47	259	0.259	0.694	0.518
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.6666666666667	1	29.5	0.0600320307551523	0.0346882632380668	1.73061505971488	0.0253437675170855	0.0361610397097326	0.0351840320249782	NA	NA	0.0418369152408339	0.544664011215714	676	50	274	0.274	0.676	0.548
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.33333333333337	1	29.166666666666668	0.0610092295904643	0.0350941211300692	1.73844586004437	0.0259151084603951	0.0379343401031659	0.0353184954158798	NA	NA	0.043068158855424	0.547358433717666	701	60	239	0.239	0.701	0.478
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	85.00000000000004	1	29.5	0.0612585232607003	0.0346882632380668	1.76597262423549	0.0265702600226336	0.0390224943069982	0.0383295637516923	NA	NA	0.0437769626420073	0.543886633224131	712	44	244	0.244	0.712	0.488
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666671	1	29.666666666666668	0.0365183693771989	0.0344888349313675	1.05884612947553	0.0020295344458314	0.0283215578156805	0.0342359679892562	NA	NA	0.0330842324681885	0.951084881793624	452	138	410	0.41	0.452	0.82
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.00000000000004	1	29.833333333333332	0.036592623127074	0.0342916870035713	1.06709894801218	0.00230093612350263	0.0284452928769875	0.0358080098363228	NA	NA	0.0355442130520185	0.948385409886465	464	146	390	0.39	0.464	0.78
N	all	ss13	349	GAT	AAG	ATA	2	AAAGATAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.00000000000004	1	30.166666666666664	0.0370445664971823	0.0339040775760351	1.09262864958069	0.00314048892114717	0.0298415908823406	0.0360755085731743	NA	NA	0.0345576038431956	0.927590382077498	498	129	373	0.373	0.498	0.746
N	all	ss13	350	AAC	ATA	AAG	2	GATAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	2.08333333333333	0.333333333333333	0.583333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666671	1	30.833333333333332	0.0376648177342698	0.0331545693783718	1.13603700607375	0.00451024835589799	0.0292629570264075	0.0347288656552946	NA	NA	0.0343805759647228	0.895628213940826	495	124	381	0.381	0.495	0.762
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.91666666666671	0	30.583333333333332	0.0248212932013322	0	-Inf	0.0248212932013322	0.0253914700837637	0	NA	NA	0.024515028076413502	0.311302413802508	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	82.91666666666671	0	30.249999999999996	0.0245169940203504	0	-Inf	0.0245169940203504	0.0258458165317429	0	NA	NA	0.0242211335562413	0.311435279171218	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	84.25000000000004	0	29.249999999999996	0.0241226823674708	0	-Inf	0.0241226823674708	0.0254157553862775	0	NA	NA	0.0247979366403979	0.330667755429665	650	350	0	0	0.65	0.001
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAT:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.25000000000004	0	29.249999999999996	0.0360429712153345	0	-Inf	0.0360429712153345	0.0275974939383906	0	NA	NA	0.0281859600784503	0.20098292211237	883	117	0	0	0.883	0.001
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	86.91666666666671	0	29.749999999999996	0.0353352883816348	0	-Inf	0.0353352883816348	0.0272154040824638	0	NA	NA	0.026978800194296	0.190282870951806	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	86.25000000000004	0	30.749999999999996	0.0356149996994909	0	-Inf	0.0356149996994909	0.0275300995601968	0	NA	NA	0.0277161265294984	0.198795094268738	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.75000000000004	0	31.249999999999996	0.0358277072015149	0	-Inf	0.0358277072015149	0.026956648453209	0	NA	NA	0.0282870794361013	0.205307301782651	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	86.08333333333339	0	30.916666666666664	0.0356856209606622	0	-Inf	0.0356856209606622	0.0269176402728816	0	NA	NA	0.0273381111783731	0.19177596737195	851	149	0	0	0.851	0.001
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.08333333333339	0	29.749999999999993	0.0352660458278048	0	-Inf	0.0352660458278048	0.0270709148941898	0	NA	NA	0.0257342740022127	0.170564536382853	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.41666666666673	0	29.41666666666666	0.0351283718108074	0	-Inf	0.0351283718108074	0.0273105444654612	0	NA	NA	0.0252614322227742	0.164348868317002	860	140	0	0	0.86	0.001
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.0833333333334	0	28.41666666666666	0.0344558196452847	0	-Inf	0.0344558196452847	0.026321103116493	0	NA	NA	0.0263337041755637	0.190727359983185	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	89.0833333333334	0	28.41666666666666	0.0344558196452847	0	-Inf	0.0344558196452847	0.0257293202343524	0	NA	NA	0.0254567305381567	0.175894258738412	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	87.41666666666673	0	28.41666666666666	0.0351283718108074	0	-Inf	0.0351283718108074	0.0273381966344433	0	NA	NA	0.0276946026095339	0.204648209696675	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	86.58333333333339	0	28.91666666666666	0.0354745925769295	0	-Inf	0.0354745925769295	0.0256893226268625	0	NA	NA	0.0272337621975549	0.192712688067234	837	163	0	0	0.837	0.001
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.25000000000006	0	28.58333333333333	0.0364813554167594	0	-Inf	0.0364813554167594	0.0284502109317675	0	NA	NA	0.0283422209675365	0.198033825829781	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.25000000000006	0	27.58333333333333	0.0369305370773723	0	-Inf	0.0369305370773723	0.0280745409772963	0	NA	NA	0.0281982563187864	0.190305975623936	849	151	0	0	0.849	0.001
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.41666666666673	1	28.749999999999993	0.0373133940279994	0.0356149996994909	1.04768761316409	0.00169839432850845	0.0284506857321855	0.0362525946776282	NA	NA	0.0434980683253014	0.968854286592411	505	62	433	0.433	0.505	0.866
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000006	1	28.41666666666666	0.0381034317265945	0.0360429712153345	1.0571667773711	0.00206046051126001	0.0298699673500542	0.0366176489129459	NA	NA	0.0448278394297915	0.963339055424808	512	57	431	0.431	0.512	0.862
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000006	1	28.91666666666666	0.0383470098919532	0.0354048034273472	1.08310190086618	0.00294220646460594	0.0291654468131407	0.0339367530729157	NA	NA	0.0468040861567373	0.949876258456607	525	54	421	0.421	0.525	0.842
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	1	29.08333333333333	0.0389276557511924	0.0351970741664875	1.10599124140429	0.0037305815847049	0.0287594711162029	0.0338130050470943	NA	NA	0.0454212732499898	0.93454101898195	535	38	427	0.427	0.535	0.854
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	1	28.41666666666666	0.0389276557511924	0.0360429712153345	1.08003459311453	0.00288468453585796	0.0300272346540353	0.036593921868378	NA	NA	0.0471205946469907	0.95118464868865	529	45	426	0.426	0.529	0.852
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333339	1	28.916666666666657	0.0391819232689515	0.0354048034273472	1.10668382467806	0.00377711984160431	0.0287998519840476	0.0357052040244539	NA	NA	0.0455709503024239	0.93394347635336	521	48	431	0.431	0.521	0.862
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666673	1	28.916666666666657	0.0395261602343306	0.0354048034273472	1.11640671344047	0.00412135680698334	0.0295127385960215	0.0341512988389877	NA	NA	0.0482398633569656	0.931915831233674	554	46	400	0.4	0.554	0.8
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGCT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	GCT	AGG	CTG	2	AAGGCTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	GCTGATGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAACTTCAG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:CTTCAGGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGGCTTTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	GCCTTACCG:GCTTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAA:AAGAAACAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACAA:AAACAGCAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AAC	AAA	2	CAACAAACT:CAGCAAACT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACC:ACTGTGACT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACC	TGA	CCC	2	GTGACCCTT:GTGACTCTT	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CCC	TTC	2	ACCCTTCTT:ACTCTTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCT	CTG	CTG	2	CCTGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	ATT	TGG	2	GATTTGGAT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAA:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAA	ATG	AAT	2	GATGAATTC:GATGATTTC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	AAT	TCT	2	GAATTCTCC:GATTTCTCC	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAAACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATTG:AAACAGTTG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	TTG	AAT	TGC	2	CAATTGCAA:CAGTTGCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	TTGCAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGT	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GT-	0	AGC------:AGTGGT---	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	NA	NA	0	------AGT:GGT---ACT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	ACT	--A	CT-	0	---ACT---:---AGTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.5	0.5	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	---	GTG	CTG	1	ACT---GAT:AGTGCTGAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	--G	ACT	1	---GATTCA:GCTGACTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACC	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACC	CAA	CCC	2	TCAACCCAG:TCAACTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CCC	AGG	2	ACCCAGGCT:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA:CAGGCTTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MG772933.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0309492530357746	0.0459635335861303	NA	NA	0.0565890685864561	0.884225229260579	565	1	434	0.434	0.565	0.868
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0311401511236447	0.0449162025138091	NA	NA	0.0579475362975762	0.880448613861762	579	1	420	0.42	0.579	0.84
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0307264999154045	0.0450663347745766	NA	NA	0.0563451485810204	0.881606579754694	562	1	437	0.437	0.562	0.874
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0312449189109784	0.0458333122828631	NA	NA	0.0576622970853634	0.862479623520599	587	2	411	0.411	0.587	0.822
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0315240547284057	0.0429934637547973	NA	NA	0.0566324231813776	0.821557970564221	613	0	387	0.387	0.613	0.774
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0313951133456929	0.0426184764490207	NaN	NaN	0.0559304248280621	0.806709146790085	609	4	387	0.387	0.609	0.774
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0314025383042769	0.0454632223376821	NA	NA	0.0546040837472193	0.825073546653645	618	1	381	0.381	0.618	0.762
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.030664856807245	0.0400666654108234	NaN	NaN	0.0564214507800294	0.820799495607939	612	1	387	0.387	0.612	0.774
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0311701796537806	0.0401632545163936	NA	NA	0.0551962724576152	0.804426987604836	587	0	413	0.413	0.587	0.826
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0327484023475246	0.0410609851967019	NA	NA	0.0553649113161424	0.820570617646057	571	1	428	0.428	0.571	0.856
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0303122732055919	0.0431135603698075	NA	NA	0.0537910749810232	0.825454654145938	614	2	384	0.384	0.614	0.768
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0276662101756536	0.043339652171716	NA	NA	0.0514485667836187	0.983413197723277	533	6	461	0.461	0.533	0.922
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0280299781622539	0.0414869761790335	NA	NA	0.052417499438933	0.981899010012121	493	3	504	0.504	0.493	0.986
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0298717013396989	0.0414019287833549	NaN	NaN	0.0562214227397711	0.829504394968594	620	4	376	0.376	0.62	0.752
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0313413363187815	0.0425697123602163	NA	NA	0.0544412385940892	0.824019173118306	595	0	405	0.405	0.595	0.81
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.032439693026943	0.0427119539978915	NaN	NaN	0.0554223464801959	0.665738349388304	686	0	314	0.314	0.686	0.628
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0314402160499207	0.0423169024774194	NaN	NaN	0.0557241177128222	0.677297492306772	664	1	335	0.335	0.664	0.67
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0334750873163694	0.0422952670198767	NaN	NaN	0.0549888129676263	0.665767814373582	683	0	317	0.317	0.683	0.634
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0321304895206413	0.0421885673573004	NaN	NaN	0.0563811860663683	0.660004318386586	656	1	343	0.343	0.656	0.686
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.034807303257853	0.0442954067909215	NaN	NaN	0.0564064126874495	0.681886196495816	675	0	325	0.325	0.675	0.65
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0322760691354575	0.0416408145790995	NaN	NaN	0.0589929384947896	0.692539362165446	659	0	341	0.341	0.659	0.682
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0320120561176078	0.0310937044524907	NA	NA	0.0447320500382202	0.244857269906508	890	2	108	0.108	0.89	0.216
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0332774323890671	0.0300518186635954	NaN	NaN	0.0453700566823919	0.2331968318948	888	0	112	0.112	0.888	0.224
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0310453324812846	0.029780592572329002	NaN	NaN	0.0439743577312298	0.234256616411739	882	0	118	0.118	0.882	0.236
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0319486535444679	0.0307958803783787	NA	NA	0.0461072650873654	0.259586886525536	859	3	138	0.138	0.859	0.276
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0292650211819353	0.0313330062617538	NA	NA	0.0440703286552619	0.402065344390574	778	3	219	0.219	0.778	0.438
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0257966918501192	0.0315177574214531	NA	NA	0.0413514410249436	0.567896945438638	735	6	259	0.259	0.735	0.518
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0266746580181916	0.029716560565043	NA	NA	0.0423402511316133	0.572736126906823	707	9	284	0.284	0.707	0.568
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.026764731435075	0.0322790412229475	NA	NA	0.0405323208654843	0.577869317160206	731	6	263	0.263	0.731	0.526
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0265579626478336	0.0471857184422078	NA	NA	0.0528747364326432	0.895891884887181	462	2	536	0.536	0.462	0.924
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0265490152799339	0.0424477308348012	NA	NA	0.0508483067985416	0.930608436840963	498	7	495	0.495	0.498	0.99
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0225399431370018	0.0421044946735787	NA	NA	0.0503994132555295	0.707824670707011	369	7	624	0.624	0.369	0.738
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0228287807918192	0.04679451720861	NA	NA	0.0499482080926461	0.688888003459729	373	5	622	0.622	0.373	0.746
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0181841282811133	0.0441943038666133	NA	NA	0.0482220009521255	0.488857238796046	211	21	768	0.768	0.211	0.422
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0174515756824799	0.0455892667916489	NA	NA	0.0458427037323681	0.468995033100941	248	16	736	0.736	0.248	0.496
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0181884914646302	0.0435060035097237	NA	NA	0.0500446479508951	0.489224328195234	216	20	764	0.764	0.216	0.432
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0181151917515461	0.0439324500577843	NA	NA	0.0491202867040357	0.49655881459024	232	9	759	0.759	0.232	0.464
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0183011732500735	0.0284446859263804	NA	NA	0.0338443464898713	0.934634931886704	492	41	467	0.467	0.492	0.934
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGC:AAACAACGT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0179077760461539	0.0284361196601568	NA	NA	0.0327986380074048	0.942270948770176	452	50	498	0.498	0.452	0.904
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGCCGA:CAACGTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0188411079404607	0.0285732649438296	NA	NA	0.0344543472032261	0.962648965509225	469	48	483	0.483	0.469	0.938
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0189942209085233	0.0286571060497452	NA	NA	0.034403865043218	0.971532254223258	484	48	468	0.468	0.484	0.936
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0185086024831184	0.0275835553686959	NA	NA	0.033936241815911	0.978786449941726	492	48	460	0.46	0.492	0.92
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0180279671053413	0.0284673006559478	NA	NA	0.0345468885079401	0.976177534007841	481	38	481	0.481	0.481	0.962
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.0185852958357838	0.0285780854710681	NA	NA	0.0351245727166022	0.959748310896276	472	42	486	0.486	0.472	0.944
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0187164912054041	0.0434874831485826	NA	NA	0.0480339717190766	0.509449837848797	251	19	730	0.73	0.251	0.502
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0185193864048782	0.0441426030185325	NA	NA	0.0474803685965839	0.496788499651812	231	10	759	0.759	0.231	0.462
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0185494931473742	0.043866434581891	NA	NA	0.0477881797244432	0.499564979018895	210	10	780	0.78	0.21	0.42
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.018787665630028	0.0419215929225229	NA	NA	0.0484492606794119	0.508647118290245	238	14	748	0.748	0.238	0.476
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0196025916944461	0.0437498178030815	NA	NA	0.0484359172648885	0.517852135185812	230	11	759	0.759	0.23	0.46
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0202582102649348	0.0427557368040929	NA	NA	0.0504920617950489	0.535042885305323	224	13	763	0.763	0.224	0.448
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.017899781910495	0.0436441996883089	NA	NA	0.0491448177955988	0.520664275674779	273	14	713	0.713	0.273	0.546
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.018805134916722	0.0461647540052107	NA	NA	0.0485283583182711	0.501578563748099	214	22	764	0.764	0.214	0.428
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0192160784370352	0.0473860318732231	NA	NA	0.0518953088958156	0.508297786898462	219	19	762	0.762	0.219	0.438
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0232264275044991	0.0481435136986451	NA	NA	0.0540510002611826	0.681964057006338	337	6	657	0.657	0.337	0.674
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0249488842600704	0.0477193006949486	NA	NA	0.053529230958264	0.661727545739207	327	6	667	0.667	0.327	0.654
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0222172776189877	0.0467407247980153	NA	NA	0.0531379806078996	0.666084047753168	334	3	663	0.663	0.334	0.668
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0229262686019229	0.0477865822965897	NA	NA	0.0535760026179035	0.668650708878835	343	4	653	0.653	0.343	0.686
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0224186091884115	0.0500637837795324	NA	NA	0.0558823365624585	0.663748640213811	303	6	691	0.691	0.303	0.606
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.021988540774709	0.048988679051883303	NA	NA	0.0564161005822416	0.64220486308547	320	0	680	0.68	0.32	0.64
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0233348912911457	0.0476097780321783	NA	NA	0.0546389116797536	0.658916391325916	322	3	675	0.675	0.322	0.644
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0220048631585232	0.0451538584214895	NA	NA	0.0517969192300905	0.665912148518688	333	5	662	0.662	0.333	0.666
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0240310274549145	0.0494190071992471	NA	NA	0.0517828034722315	0.65914597017725	363	4	633	0.633	0.363	0.726
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0226831043215337	0.0472725115981921	NA	NA	0.0542797301899854	0.684470406736493	338	4	658	0.658	0.338	0.676
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.0195317776110938	0.0483051796714328	NA	NA	0.0513744990799643	0.50154224895685	217	16	767	0.767	0.217	0.434
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.0194712699766366	0.0474968686659039	NA	NA	0.0507651303539151	0.471832911572383	226	11	763	0.763	0.226	0.452
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.013880040211451901	0.0491657336029532	NA	NA	0.0512770929666739	0.32909696374478	122	39	839	0.839	0.122	0.244
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.01394962216474	0.0474397970448781	NA	NA	0.0488291132135268	0.321069613395521	118	36	846	0.846	0.118	0.236
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.01345270451414	0.0489717996687342	NA	NA	0.0504718599297366	0.33707216521977	110	34	856	0.856	0.11	0.22
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0145799365539882	0.0467418680590074	NA	NA	0.0490165839425749	0.320654960470868	103	50	847	0.847	0.103	0.206
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0137209369910761	0.0470203341372589	NA	NA	0.0469637897990676	0.301735803260113	108	52	840	0.84	0.108	0.216
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0202149243102132	0.0468615075524028	NA	NA	0.051508415559408	0.517634723347782	235	11	754	0.754	0.235	0.47
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0201528539046882	0.0467668999112712	NA	NA	0.0499591529248194	0.504734178720124	240	15	745	0.745	0.24	0.48
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.0212386209139043	0.0473281640364965	NA	NA	0.0540603055927768	0.518675397515385	228	26	746	0.746	0.228	0.456
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0198614230073458	0.0461129638257397	NA	NA	0.050645877913359	0.510528793633752	255	21	724	0.724	0.255	0.51
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0199562280424357	0.0463827731060558	NA	NA	0.0506920764787959	0.510914208557925	256	18	726	0.726	0.256	0.512
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0205767001755892	0.0450759282039103	NA	NA	0.0518927614397682	0.543427448268482	265	14	721	0.721	0.265	0.53
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0205635892921006	0.0439794835716963	NA	NA	0.051002344789245	0.532841721259139	259	18	723	0.723	0.259	0.518
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0199157658256269	0.0464139739445053	NA	NA	0.0503925054304546	0.527895680309032	257	19	724	0.724	0.257	0.514
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.0243817179415108	0.0464206267451894	NA	NA	0.0541206329130603	0.744107616211537	385	6	609	0.609	0.385	0.77
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0250155559699139	0.0321684754827629	NA	NA	0.0385910118802834	0.733749615538018	627	14	359	0.359	0.627	0.718
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	33.83333333333333	0.0431256509016318	0.0301548153585304	1.43014143475537	0.0129708355431015	0.0243823135297798	0.0337600808945469	NA	NA	0.0409813485381061	0.751618604279262	614	18	368	0.368	0.614	0.736
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	34.49999999999999	0.0438614614252191	0.0603340239140544	0.72697722743803	-0.0164725624888354	0.0248527210732432	0.0459043633716321	NA	NA	0.054238766248583	0.76135295763703	404	5	591	0.591	0.404	0.808
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.49999999999999	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0264829825414918	0.045608339042149	NA	NA	0.0515241272771907	0.781767703463823	424	4	572	0.572	0.424	0.848
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.666666666666664	0.0448452368647073	0.0582817382454872	0.769456063163656	-0.0134365013807799	0.0267344729603615	0.0457238173559629	NA	NA	0.0514999094593984	0.794167004263732	423	4	573	0.573	0.423	0.846
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	35.666666666666664	0.0451830456487547	0.0582817382454872	0.775252197496928	-0.0130986925967325	0.0264893282241847	0.0457567305363469	NA	NA	0.0508410910830743	0.796684848786136	412	9	579	0.579	0.412	0.824
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	36	0.0454110940157692	0.0577207808520962	0.786737347371142	-0.012309686836327	0.0269567658163966	0.0421584342989135	NA	NA	0.0500984208768008	0.805906671217595	435	7	558	0.558	0.435	0.87
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	36.33333333333333	0.0451830456487547	0.0571705240409132	0.790320648738853	-0.0119874783921585	0.0251343996148398	0.0421095555423041	NA	NA	0.0507105647623916	0.813129932962794	433	3	564	0.564	0.433	0.866
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0263228879628757	0.0442423409525578	NA	NA	0.0497386107693232	0.791413204384449	426	3	571	0.571	0.426	0.852
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	2	35.666666666666664	0.0444026073250892	0.0582817382454872	0.76186141082584	-0.013879130920398	0.0250226277046377	0.0446548504707887	NA	NA	0.0511197477866547	0.786004703581979	435	4	561	0.561	0.435	0.87
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0455259839052049	0.0579999025523778	0.784932075775332	-0.0124739186471729	0.0264949411803878	0.0439310809682153	NA	NA	0.050574857283428	0.805184766168642	453	3	544	0.544	0.453	0.906
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.166666666666664	0.045296782717305	0.0591439311842398	0.765873722127137	-0.0138471484669348	0.0260641980265325	0.04462619273347	NA	NA	0.0515080196125466	0.788056807568768	441	7	552	0.552	0.441	0.882
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	2	34.83333333333333	0.0450698784927921	0.0597330472949441	0.754521668219109	-0.0146631688021519	0.0250841304035756	0.0451901538864291	NA	NA	0.0505374607115121	0.771705654869234	396	11	593	0.593	0.396	0.792
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.6666666666667	2	34.916666666666664	0.0450135072946897	0.059584670169267	0.755454501414814	-0.0145711628745773	0.025977838063261	0.0442583695749118	NA	NA	0.0513659972624205	0.776660744255592	411	6	583	0.583	0.411	0.822
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0254665182419122	0.0434050956515694	NA	NA	0.0512875751973333	0.797573772746332	413	11	576	0.576	0.413	0.826
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	1	35.83333333333333	0.0445124432883257	0.0284394261467203	1.56516671815683	0.0160730171416054	0.0257801170466301	0.0295150752218968	NA	NA	0.0379376324581473	0.671806873768135	710	17	273	0.273	0.71	0.546
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	1	36.166666666666664	0.0442933122327008	0.0281723261817364	1.5722277225874	0.0161209860509644	0.0252792039362637	0.0295751642310099	NA	NA	0.0405727652920358	0.691120325424599	651	14	335	0.335	0.651	0.67
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	1	36.49999999999999	0.0441845540246642	0.0279101972553257	1.58309716052734	0.0162743567693384	0.0262183721057411	0.0285247613882849	NA	NA	0.038413067993184	0.6718085428278	646	10	344	0.344	0.646	0.688
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.58333333333337	1	35.83333333333333	0.0437548116643347	0.0284394261467203	1.53852653139348	0.0153153855176145	0.0249714574961388	0.028292077184326	NA	NA	0.0374281532804327	0.682397105790101	699	16	285	0.285	0.699	0.57
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	1	35.83333333333333	0.0441845540246642	0.0284394261467203	1.55363732716385	0.0157451278779439	0.0258355851078768	0.029340750556093	NA	NA	0.0383526878445464	0.681413397044742	668	13	319	0.319	0.668	0.638
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	1	35.83333333333333	0.0441845540246642	0.0284394261467203	1.55363732716385	0.0157451278779439	0.0257350624018166	0.0286260831620909	NA	NA	0.0397005464454026	0.691664474580103	685	12	303	0.303	0.685	0.606
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	1	35.83333333333333	0.0441845540246642	0.0284394261467203	1.55363732716385	0.0157451278779439	0.0255937809332333	0.0290068553325942	NA	NA	0.0394492680095608	0.689802245583029	666	13	321	0.321	0.666	0.642
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.25000000000003	1	36.49999999999999	0.0439686325106426	0.0279101972553257	1.57536086572275	0.0160584352553169	0.0254091409933576	0.0287349157271759	NA	NA	0.0399782849255754	0.687920322926096	686	17	297	0.297	0.686	0.594
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.75000000000003	2	37.666666666666664	0.05965876642654	0.0550706014161129	1.08331423468139	0.0045881650104271	0.0303034475935163	0.0384056865478287	NA	NA	0.0415775150373126	0.912130160429327	568	6	426	0.426	0.568	0.852
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.33333333333336	2	38.08333333333333	0.0445675653531006	0.0544456664773409	0.818569561852064	-0.00987810112424038	0.0259369590181023	0.040546529827555	NA	NA	0.0383410668198749	0.796686594604618	420	13	567	0.567	0.42	0.84
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	38.58333333333333	0.0444574574471551	0.0537142229868647	0.827666397743979	-0.00925676553970955	0.0251732129238566	0.0385762040780886	NA	NA	0.0368729718803605	0.801779521061767	426	26	548	0.548	0.426	0.852
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	37.916666666666664	0.0444574574471551	0.054693929928504303	0.812840794312454	-0.0102364724813492	0.0260684861982368	0.0409783759951028	NA	NA	0.0397646190093222	0.796849435670436	353	11	636	0.636	0.353	0.706
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	37.916666666666664	0.0444574574471551	0.054693929928504303	0.812840794312454	-0.0102364724813492	0.0261464771536304	0.0397379602523897	NA	NA	0.0367903170685442	0.780829494350131	433	20	547	0.547	0.433	0.866
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.66666666666669	2	38.08333333333333	0.0443478924201168	0.0544456664773409	0.814534843440174	-0.0100977740572241	0.0263791296153751	0.0400004839160736	NA	NA	0.0372221360487169	0.786172526628949	407	12	581	0.581	0.407	0.814
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.00000000000001	2	38.75	0.0454684663623261	0.0534747581886499	0.850279045712018	-0.00800629182632373	0.0267253647544348	0.0395552521594316	NA	NA	0.0373318625811878	0.830186255902592	424	19	557	0.557	0.424	0.848
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.50000000000001	2	37.75	0.0451263910998395	0.0549444688504895	0.821309078856216	-0.00981807775064993	0.0269498219961539	0.0395946104763375	NA	NA	0.0398249464348762	0.805271329189353	434	16	550	0.55	0.434	0.868
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.33333333333336	2	36.916666666666664	0.0452398426751419	0.0562324166616758	0.804515355392405	-0.0109925739865339	0.0268347332404245	0.0406966574279876	NA	NA	0.0400669095664758	0.783811495155514	423	10	567	0.567	0.423	0.846
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000003	2	36.25	0.0447894260262167	0.0573071018565008	0.781568506785968	-0.0125176758302841	0.0260241041247925	0.0424140984059134	NA	NA	0.0396478391147305	0.752213894793499	393	17	590	0.59	0.393	0.786
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000003	2	35.75	0.0444574574471551	0.0581404786806199	0.764655855198079	-0.0136830212334648	0.0256787574370591	0.0416647196354166	NA	NA	0.0411016550001662	0.739204621734892	398	15	587	0.587	0.398	0.796
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.1666666666667	2	36.08333333333333	0.0433855884614561	0.0575822255219405	0.753454526430642	-0.0141966370604844	0.024889376270054	0.040854598504846	NA	NA	0.0410215623968431	0.729284521708173	373	16	611	0.611	0.373	0.746
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.6666666666667	2	36.58333333333333	0.0430740368144066	0.0567646707244323	0.75881769883793	-0.0136906339100257	0.0259549095231889	0.0411088163029952	NA	NA	0.0379904951138482	0.718570474173322	353	23	624	0.624	0.353	0.706
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000004	2	36.24999999999999	0.0428688103799615	0.0573071018565008	0.748054062955524	-0.0144382914765394	0.0244483253797359	0.041392917850754	NA	NA	0.0393040346935622	0.713358829085866	376	11	613	0.613	0.376	0.752
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.66666666666671	2	35.58333333333333	0.042464170499631	0.058423686245627	0.726831414250404	-0.015959515745996	0.024445305657859	0.0427878705853261	NA	NA	0.0376417984110243	0.671577569429852	359	18	623	0.623	0.359	0.718
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000004	2	34.58333333333333	0.0416773883661081	0.0601826482875393	0.692515028035702	-0.0185052599214312	0.0230707814355098	0.040975470372825	NA	NA	0.0429391154703046	0.666493751550565	318	15	667	0.667	0.318	0.636
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.33333333333337	2	34.58333333333333	0.0420670999882827	0.0601826482875393	0.69899050947867	-0.0181155482992566	0.0248366490010874	0.0443888572485921	NA	NA	0.0414744384481602	0.662264905239267	332	16	652	0.652	0.332	0.664
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.00000000000004	2	34.58333333333333	0.0416773883661081	0.0601826482875393	0.692515028035702	-0.0185052599214312	0.0249467073355031	0.0411352045624723	NA	NA	0.0408081510471345	0.650210558527366	318	18	664	0.664	0.318	0.636
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666671	2	33.916666666666664	0.0272757331281561	0.0614153696041381	0.444119009687085	-0.034139636475982	0.0193547763018145	0.0456003132992585	NA	NA	0.0372944945632043	0.359978073991003	139	48	813	0.813	0.139	0.278
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666671	2	34.58333333333333	0.0272757331281561	0.0601826482875393	0.453215900334574	-0.0329069151593831	0.0197802409992188	0.0411920859891585	NA	NA	0.039404466827476	0.40365790750998	168	36	796	0.796	0.168	0.336
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000004	2	35.24999999999999	0.0275260251378209	0.0589984642956841	0.466554942851869	-0.0314724391578632	0.0188833254298799	0.0426245644105842	NA	NA	0.0367645095506958	0.391967404044117	162	43	795	0.795	0.162	0.324
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000004	2	35.24999999999999	0.0275260251378209	0.0589984642956841	0.466554942851869	-0.0314724391578632	0.0193009859818002	0.04552190378803	NA	NA	0.0379058790599909	0.406381300009552	165	51	784	0.784	0.165	0.33
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000004	2	35.416666666666664	0.0273378783823658	0.0587096677913667	0.465645257600756	-0.0313717894090009	0.019308384064315	0.0424577682845179	NA	NA	0.0362637072185845	0.386983052761299	154	38	808	0.808	0.154	0.308
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	2	34.416666666666664	0.0269691977905829	0.0604861633757489	0.445873837675011	-0.033516965585166	0.0196392902013062	0.0431418326008636	NA	NA	0.0384417996848274	0.383269172187449	152	47	801	0.801	0.152	0.304
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	2	34.416666666666664	0.0269691977905829	0.0604861633757489	0.445873837675011	-0.033516965585166	0.019379836391781	0.04270800480076	NA	NA	0.0371162933271933	0.366512272095892	152	52	796	0.796	0.152	0.304
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.50000000000004	2	33.916666666666664	0.0269691977905829	0.0614153696041381	0.439127826868369	-0.0344461718135552	0.0186656245540096	0.0435619057467987	NA	NA	0.0383431218099255	0.368990250260398	135	48	817	0.817	0.135	0.27
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.91666666666671	2	33.83333333333333	0.0134683754007452	0.0615730216404005	0.21873825649492	-0.0481046462396553	0.0139448088193446	0.043141109374024	NA	NA	0.0360378759962612	0.181930100848597	0	136	864	0.864	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.58333333333339	2	34.166666666666664	0.0135291154422588	0.0609472230590743	0.221980834617279	-0.0474181076168155	0.0138403884401462	0.0433346623439416	NA	NA	0.0353561259533584	0.179869559323903	0	132	868	0.868	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	2	34.166666666666664	0.0134532755150005	0.0609472230590743	0.220736480511354	-0.0474939475440738	0.0140751124195694	0.0440819188987877	NA	NA	0.0369811848899243	0.19904635330929	0	114	886	0.886	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000006	1	34.166666666666664	0.0133633824875953	0.0298546878003148	0.447614209767568	-0.0164913053127194	0.0137072272719507	0.0297271446654233	NA	NA	0.0169121943645149	0.329504072119204	0	385	615	0.615	0	0.001
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	1	33.5	0.013423177093157	0.0304610393656427	0.440667074160875	-0.0170378622724857	0.0136777256282306	0.031942474440676	NA	NA	0.0177052406733778	0.335895832521765	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.33333333333339	1	33.33333333333333	0.0133932130500048	0.0306164958901914	0.437450879357348	-0.0172232828401865	0.0143046586498084	0.0303948363364873	NA	NA	0.0170861676720675	0.313442497929683	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	1	33.66666666666666	0.0134532755150005	0.0303071537534075	0.443897689121926	-0.016853878238407	0.0139854274305039	0.0306122589898213	NA	NA	0.0163544896770811	0.302758810011522	0	382	618	0.618	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.66666666666673	1	33.99999999999999	0.0135138791270087	0.0300040009602743	0.450402569474025	-0.0164901218332657	0.0136458938804375	0.031622058854204	NA	NA	0.0164676173745553	0.316649610875597	0	386	614	0.614	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	74.3333333333334	1	33.666666666666664	0.0135750312327134	0.0303071537534075	0.447915081144403	-0.0167321225206941	0.0140604833062579	0.0296642437509077	NA	NA	0.0166805021053804	0.315815192896344	0	340	660	0.66	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.8333333333334	1	34.166666666666664	0.0136678042173386	0.0298546878003148	0.457810991317568	-0.0161868835829762	0.0139138280667184	0.0293966121611919	NA	NA	0.0168092526961179	0.335560264414487	0	380	620	0.62	0	0.001
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.8333333333334	1	34.166666666666664	0.0136678042173386	0.0298546878003148	0.457810991317568	-0.0161868835829762	0.0142405511706466	0.0289780529790338	NA	NA	0.0160382045462904	0.312845017677418	0	358	642	0.642	0	0.001
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000007	1	33.83333333333333	0.0133633824875953	0.0301548153585304	0.443159154805272	-0.016791432870935	0.0131921044875146	0.0300259495970341	NA	NA	0.0176323106018753	0.34093958184913	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.50000000000007	1	34.83333333333333	0.0133633824875953	0.0292720079293014	0.456524284902865	-0.0159086254417061	0.0135303197308302	0.0303388502778765	NA	NA	0.0166145613122671	0.338309390136027	0	345	655	0.655	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666674	1	35.166666666666664	0.013423177093157	0.0289891158257093	0.463041962847743	-0.0155659387325523	0.0138932390337653	0.0290522735232085	NA	NA	0.0159612214104655	0.329443798648421	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCGAAGGAT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.0833333333334	2	35.58333333333333	0.0271215992572094	0.058423686245627	0.464222663787146	-0.0313020869884176	0.0188743039028526	0.0421961855707922	NA	NA	0.0225939603316674	0.165924586647183	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC:AAGGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.00000000000007	2	35.666666666666664	0.0411061773712462	0.0582817382454872	0.705301156223306	-0.017175560874241	0.0241045693507709	0.0410660379429582	NA	NA	0.0274182862372711	0.531034759094075	217	36	747	0.747	0.217	0.434
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.83333333333341	2	36.166666666666664	0.042364201600918	0.0574443341110379	0.737482682261222	-0.0150801325101199	0.0252694392026281	0.0415390858847106	NA	NA	0.0257248984168078	0.557735974612439	256	40	704	0.704	0.256	0.512
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000009	2	35.99999999999999	0.042564612444337	0.0577207808520962	0.737422671973281	-0.0151561684077592	0.024888352813414	0.0436125017161029	NA	NA	0.0265239493128743	0.56771872351203	256	35	709	0.709	0.256	0.512
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666674	2	35	0.0418713371647063	0.0594370287406054	0.704465516731007	-0.0175656915758991	0.0244665752171838	0.0418513674103782	NA	NA	0.0280662342690933	0.531403075582054	211	43	746	0.746	0.211	0.422
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.3333333333334	2	35.333333333333336	0.0426655308015385	0.0588537115811214	0.724942058118632	-0.0161881807795829	0.0250425441437794	0.0442036141800299	NA	NA	0.0279375201156203	0.562290772319314	252	45	703	0.703	0.252	0.504
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.00000000000007	2	34.666666666666664	0.0422647024133488	0.0600320307551523	0.704035860218196	-0.0177673283418035	0.025855177192155	0.0417708731960146	NA	NA	0.0277122204157902	0.521433712446195	228	52	720	0.72	0.228	0.456
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	2	34.833333333333336	0.042364201600918	0.0597330472949441	0.709225521204973	-0.0173688456940261	0.0247121474770299	0.0414118715921923	NA	NA	0.0280080360739187	0.535166977907913	223	46	731	0.731	0.223	0.446
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	34.5	0.042564612444337	0.0603340239140544	0.705482738976107	-0.0177694114697174	0.0251547932217916	0.0417326967962363	NA	NA	0.0277436756782148	0.521857259386768	217	44	739	0.739	0.217	0.434
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666673	2	34.5	0.0421656696333547	0.0603340239140544	0.698870502876115	-0.0181683542806997	0.0247815020574809	0.0441730018067807	NA	NA	0.0291899455012533	0.533666894809694	232	45	723	0.723	0.232	0.464
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.66666666666673	1	34.333333333333336	0.0276529018562458	0.0297068535712844	0.930859331497024	-0.00205395171503861	0.0197475361371849	0.0303790769361785	NA	NA	0.0215146898378646	0.923943575079294	388	134	478	0.478	0.388	0.776
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.166666666666664	0.0277167798918218	0.0298546878003148	0.928389540604394	-0.00213790790849294	0.0196799356290314	0.0321806973242554	NA	NA	0.0218207738941259	0.921951504983226	396	146	458	0.458	0.396	0.792
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.8333333333334	1	34.166666666666664	0.0279752710599065	0.0298546878003148	0.937047851480517	-0.00187941674040823	0.0199212853630602	0.0315216915801033	NA	NA	0.0227256457921327	0.934089880765886	388	127	485	0.485	0.388	0.776
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCATC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.16666666666673	1	34.166666666666664	0.0421656696333547	0.0298546878003148	1.41236344239748	0.01231098183304	0.0239985160417541	0.0294626701152464	NA	NA	0.0257632634184331	0.632756793795607	654	46	300	0.3	0.654	0.6
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG:GCCATCGTG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.3333333333334	1	34	0.0420670999882826	0.0300040009602743	1.40204968144015	0.0120630990280082	0.0237151077016239	0.0314659827781262	NA	NA	0.0270516985391777	0.655649544107628	632	48	320	0.32	0.632	0.64
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	1	34.666666666666664	0.042766928969766	0.029415534864961	1.45388921758852	0.013351394104805	0.0251880646642983	0.0317137707729074	NA	NA	0.0254162078036809	0.599367543223847	683	44	273	0.273	0.683	0.546
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0262610133991661	0.029179787560217	NA	NA	0.0266167320398531	0.609465437669413	676	43	281	0.281	0.676	0.562
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.028849710620847	1.48948386556132	0.0141214678750176	0.0247726532245964	0.0291442726282765	NA	NA	0.0254070169509269	0.578340915898408	682	46	272	0.272	0.682	0.544
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0239934082992475	0.028615381948921	NA	NA	0.0258480829819839	0.593704521599966	655	60	285	0.285	0.655	0.57
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0243481024242645	0.0295017492719912	NA	NA	0.0249649200556378	0.580710134971971	669	46	285	0.285	0.669	0.57
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0571705240409132	0.744520242876842	-0.0146059115965762	0.0239992570034535	0.0416123651920529	NA	NA	0.0374654166953405	0.696647095467469	344	15	641	0.641	0.344	0.688
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0287363778860494	0.0526934515343372	NA	NA	0.0459504089191876	0.515303097118798	242	5	753	0.753	0.242	0.484
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	3	36	0.0573071018565008	0.0883372767422876	0.648730682786235	-0.0310301748857868	0.0298034688126237	0.0509864284043389	NA	NA	0.0439094434657564	0.479761830921004	226	5	769	0.769	0.226	0.452
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.0284172509176096	0.0503121204651911	NA	NA	0.0436426978980924	0.509687994604346	262	9	729	0.729	0.262	0.524
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	3	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.0849965139802523	0.859451690051178	-0.0119461163914659	0.0322523479068243	0.0487051594560434	NA	NA	0.046134282690065	0.795679774907367	382	2	616	0.616	0.382	0.764
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	4	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.113962844188242	0.648908713450963	-0.0400113615848373	0.0324274668432628	0.060844236160642703	NaN	NaN	0.0579752823989789	0.490102894868468	268	1	731	0.731	0.268	0.536
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	4	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.112359208671495	0.663077759981812	-0.0378563162722712	0.032205974469998	0.0566129850568002	NA	NA	0.0587777114713671	0.519537151481009	265	3	732	0.732	0.265	0.53
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0355323149232043	0.0568666014109771	NA	NA	0.0553714458955927	0.535907224548837	265	0	735	0.735	0.265	0.53
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0337999393152587	0.0577061521366714	NaN	NaN	0.0551253402443116	0.550844731588653	270	2	728	0.728	0.27	0.54
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.033507026220426	0.0609240042312982	NA	NA	0.0552567512166577	0.544381268327073	269	0	731	0.731	0.269	0.538
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0340734308484621	0.0630814527284713	NA	NA	0.054041252100647	0.489916290807969	256	0	744	0.744	0.256	0.512
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0335903906797037	0.0619293254955734	NA	NA	0.0591792218593958	0.486262044776306	214	0	786	0.786	0.214	0.428
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0329496813907374	0.0601820837182486	NaN	NaN	0.0599052828983012	0.498724582324051	261	0	739	0.739	0.261	0.522
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0335415618330476	0.06198895529576	NA	NA	0.0597893149819054	0.489729036511311	229	1	770	0.77	0.229	0.458
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0322720084922806	0.0624223340573335	NA	NA	0.0610207176289345	0.480604609086643	240	1	759	0.759	0.24	0.48
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.035300649663011	0.0647491955465995	NaN	NaN	0.0585777065420356	0.455988718328388	237	1	762	0.762	0.237	0.474
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0355618043742356	0.0666457078718385	NaN	NaN	0.06111311647269	0.46257989086292	220	0	780	0.78	0.22	0.44
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0358333413775594	0.0670410582369859	NA	NA	0.0590680306022723	0.439367920686409	226	1	773	0.773	0.226	0.452
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0341170530063061	0.0641174383410089	NA	NA	0.0616220256006764	0.450119124519952	212	1	787	0.787	0.212	0.424
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0344236480492682	0.0645017591855922	NaN	NaN	0.0610950145220397	0.446220565076038	197	1	802	0.802	0.197	0.394
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0350133387038838	0.0600733567748554	NaN	NaN	0.0636920548589273	0.457597320444329	209	2	789	0.789	0.209	0.418
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0331853144889482	0.0636517401693212	NA	NA	0.0644248962595513	0.455595746874036	228	1	771	0.771	0.228	0.456
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.035551654703181	0.0813871382073176	NA	NA	0.0736867757458655	0.333333016943494	137	0	863	0.863	0.137	0.274
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0359006786579735	0.0806516260631397	NaN	NaN	0.0704280967457951	0.30046971056183	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0376455938238716	0.0808912478219864	NA	NA	0.0690559834338064	0.290968155533076	117	0	883	0.883	0.117	0.234
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0349331008853098	0.0841375793767961	NaN	NaN	0.0727372345736108	0.310320851248477	115	1	884	0.884	0.115	0.23
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0346439764437363	0.079910779911226	NaN	NaN	0.0739103000404069	0.318062831587021	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0342961240832689	0.0794011035494152	NaN	NaN	0.0710594254654153	0.322090251678921	141	2	857	0.857	0.141	0.282
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0332160857781521	0.0847612868432364	NaN	NaN	0.0737707201055986	0.297555028989739	127	0	873	0.873	0.127	0.254
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0344361244179214	0.0875998008188354	NaN	NaN	0.0728802647185923	0.246513930680648	91	0	909	0.909	0.091	0.182
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0314513028719154	0.0771178192182983	NaN	NaN	0.0726483858140487	0.348958596095175	134	1	865	0.865	0.134	0.268
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0269631026447878	0.0749289109084035	NA	NA	0.0682887413393091	0.210589628721604	69	1	930	0.93	0.069	0.138
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0269100695916726	0.0783970711426239	NA	NA	0.0665679965243793	0.197586503767382	82	0	918	0.918	0.082	0.164
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0271308315481385	0.0743150560329339	NA	NA	0.0693293245477686	0.221668783246201	65	2	933	0.933	0.065	0.13
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0282986676384697	0.0718580560405586	NA	NA	0.0646915676881091	0.212644342794577	73	1	926	0.926	0.073	0.146
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0275891955899644	0.0735456412848363	NA	NA	0.0655642894347647	0.234853375119731	74	2	924	0.924	0.074	0.148
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.0277949149536644	0.0695431659146222	NA	NA	0.0607740794717424	0.232281021527075	92	0	908	0.908	0.092	0.184
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0281388941735443	0.0717739910008993	NaN	NaN	0.0699064336417381	0.274816776921347	90	4	906	0.906	0.09	0.18
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0265711748178959	0.0723385649085835	NaN	NaN	0.0638516167342363	0.231856183528829	92	1	907	0.907	0.092	0.184
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0270361458232548	0.0733701639672769	NA	NA	0.064681135016023	0.251241786356973	87	5	908	0.908	0.087	0.174
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0259976017485081	0.0686152871852836	NA	NA	0.0659099427789071	0.274048172610838	90	3	907	0.907	0.09	0.18
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0286521456600316	0.0698360504414881	NA	NA	0.0613549480740081	0.259474765480244	80	1	919	0.919	0.08	0.16
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0271577898126029	0.0702459424745904	NA	NA	0.062014408444058	0.243382949197674	95	1	904	0.904	0.095	0.19
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0245508407546808	0.0708008676893796	NaN	NaN	0.061434047969716	0.175389331313237	41	5	954	0.954	0.041	0.082
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.0253708200422784	0.071014766956816	NA	NA	0.0583356427441614	0.16089853409	37	4	959	0.959	0.037	0.074
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0238381068434856	0.0673843955422992	NA	NA	0.062084744379282	0.16664148089176	37	3	960	0.96	0.037	0.074
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0228058717163731	0.0754974314600197	NA	NA	0.0632159206619687	0.155742777198212	39	6	955	0.955	0.039	0.078
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0238264206180626	0.0712633236426918	NA	NA	0.0614348946952341	0.151242483307733	28	10	962	0.962	0.028	0.056
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0237314498953126	0.0685713385640158	NA	NA	0.0603574828259807	0.159386606597558	33	3	964	0.964	0.033	0.066
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0238480833824254	0.0724717737672841	NA	NA	0.0609717858613607	0.16553210074316	37	4	959	0.959	0.037	0.074
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.0228754822590292	0.0627272640540233	NA	NA	0.0525623921330315	0.309707317715547	87	18	895	0.895	0.087	0.174
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0184178103048412	0.0469834348402343	NA	NA	0.0425287645936413	0.428567976658816	177	44	779	0.779	0.177	0.354
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0193829810793559	0.0450725963717441	NA	NA	0.0401787937196466	0.432653930160757	175	51	774	0.774	0.175	0.35
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75000000000006	2	35.58333333333332	0.0272447663451876	0.0584236862456271	0.466330834220972	-0.0311789199004395	0.0190733596724712	0.043328567282619	NA	NA	0.0378735600324109	0.410373172449854	159	70	771	0.771	0.159	0.318
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.00000000000006	2	35.33333333333332	0.0134532755150005	0.0588537115811214	0.228588395762552	-0.0454004360661209	0.0140743216489556	0.0463222024117866	NA	NA	0.0391315540450375	0.245967313522522	0	115	885	0.885	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.66666666666673	1	34.99999999999999	0.0407339920153049	0.0291298749871979	1.39835794122724	0.011604117028107	0.0309544726716932	0.0305574903645593	NA	NA	0.0330708685142249	0.725673596827225	524	140	336	0.336	0.524	0.672
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.3333333333334	1	34.33333333333332	0.040368487510335	0.0297068535712844	1.35889475516035	0.0106616339390506	0.0323377306055927	0.0308229048195717	NA	NA	0.032924411787053	0.746073142736325	541	133	326	0.326	0.541	0.652
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666673	1	34.16666666666666	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0311453910490814	0.0323147360487963	NA	NA	0.0331941627826836	0.761701342384723	509	133	358	0.358	0.509	0.716
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0299168755918938	0.0322176152985942	NA	NA	0.0325642806120937	0.762793571347595	507	125	368	0.368	0.507	0.736
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000007	1	34.33333333333332	0.0400094855289695	0.0297068535712844	1.34680993505297	0.0103026319576851	0.0288785473787869	0.0306750527607684	NA	NA	0.0339562597182597	0.761578251631856	514	125	361	0.361	0.514	0.722
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.58333333333341	1	34.83333333333332	0.0397005575048303	0.0292720079293014	1.35626355392893	0.0104285495755289	0.0307309875570351	0.0308852246652747	NA	NA	0.0334559058808957	0.755260719513385	530	132	338	0.338	0.53	0.676
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	35.16666666666665	0.0396131668795607	0.0289891158257094	1.3664841355537	0.0106240510538513	0.0300623069858544	0.0300599662410167	NA	NA	0.0335276138837317	0.751338714785701	541	112	347	0.347	0.541	0.694
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	35.74999999999999	0.0395261602343306	0.0285069944752381	1.38654252971719	0.0110191657590925	0.0289493700848408	0.0314599194552253	NA	NA	0.0318549608478769	0.729405251137653	536	154	310	0.31	0.536	0.62
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAC	2	GACAGACTG:GACAGATTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	1	36.08333333333332	0.0400540111089282	0.0282386296527663	1.41841199808378	0.0118153814561619	0.0302425173027591	0.0303491204041354	NA	NA	0.0316773664497671	0.709154934045756	519	123	358	0.358	0.519	0.716
N	all	ss13	228	CTG	GAC	TGA	2	AGACTGAAC:AGATTGAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	1	36.08333333333332	0.0400540111089282	0.0282386296527663	1.41841199808378	0.0118153814561619	0.030636946826272	0.0300436493726248	NA	NA	0.0316528030810318	0.708939516548259	562	118	320	0.32	0.562	0.64
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	CTGAACCAG:TTGAACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	36.41666666666666	0.0395261602343306	0.0279752710599065	1.4128964166134	0.011550889174424	0.0297205537667559	0.0308966354922715	NA	NA	0.030721839776326	0.70692954189243	517	144	339	0.339	0.517	0.678
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000007	1	37.41666666666666	0.0398765009105086	0.0272138698048234	1.46530064252166	0.0126626311056852	0.028810634697733	0.0287330884330564	NA	NA	0.0306947791628406	0.67994827833848	561	130	309	0.309	0.561	0.618
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5833333333334	1	37.41666666666666	0.0402331091273881	0.0272138698048234	1.47840455679174	0.0130192393225648	0.0293350917375833	0.0297947963285035	NA	NA	0.0304538214676433	0.669009669983439	531	129	340	0.34	0.531	0.68
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	37.24999999999999	0.0397883346582442	0.0273378783823658	1.45542876816328	0.0124504562758784	0.0298765495229638	0.0290007805480034	NA	NA	0.0300513058922883	0.678649534472897	551	136	313	0.313	0.551	0.626
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	1	36.24999999999999	0.0392674190316604	0.0281063333749098	1.39710215871537	0.0111610856567506	0.0285724764917997	0.0314722607491612	NA	NA	0.030986706058256	0.718705438466235	538	144	318	0.318	0.538	0.636
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.24999999999999	0.0396131668795607	0.0281063333749098	1.4094035800103	0.0115068335046509	0.0286401202325963	0.0290198949945502	NA	NA	0.0321848272336686	0.720699903556633	554	123	323	0.323	0.554	0.646
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.24999999999999	0.0396131668795607	0.0281063333749098	1.4094035800103	0.0115068335046509	0.0302255110507952	0.0308224384486267	NA	NA	0.0322757394389746	0.721453801193181	546	129	325	0.325	0.546	0.65
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333341	0	36.41666666666666	0.0264053674769446	0	-Inf	0.0264053674769446	0.027013429085865	0	NA	NA	0.0267710639951254	0.323966366659311	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	0	35.99999999999999	0.026032982222434	0	-Inf	0.026032982222434	0.0271169485828601	0	NA	NA	0.0262574501112192	0.321465276534464	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.99999999999999	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0273120211326127	0	NA	NA	0.0276152765774078	0.348961295838858	665	335	0	0	0.665	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	35.66666666666666	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0275941609925267	0	NA	NA	0.0262390130629259	0.322174127129124	632	368	0	0	0.632	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	0	36.33333333333332	0.0259766224970672	0	-Inf	0.0259766224970672	0.0255026509619227	0	NA	NA	0.0253956341867345	0.306365774792617	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	0	36.49999999999999	0.026032982222434	0	-Inf	0.026032982222434	0.0243667240455811	0	NA	NA	0.0248570272281046	0.294957199778336	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000007	0	36.916666666666664	0.0396131668795607	0	-Inf	0.0396131668795607	0.0310059208358031	0	NA	NA	0.0294142135633499	0.178065420662611	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	37.08333333333333	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0304850393617552	0	NA	NA	0.0308617949775083	0.186374826805582	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.08333333333333	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.0311408199449613	0	NA	NA	0.0317396179839636	0.188635841050667	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.91666666666673	0	37.24999999999999	0.0417257068817799	0	-Inf	0.0417257068817799	0.030239713217277	0	NA	NA	0.0316977661425783	0.18805286616879	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.91666666666673	0	36.24999999999999	0.0411531794236845	0	-Inf	0.0411531794236845	0.0319705658256915	0	NA	NA	0.0312718347609351	0.188180000830122	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.0833333333334	0	36.08333333333333	0.0410592825874941	0	-Inf	0.0410592825874941	0.0298237492316803	0	NA	NA	0.030452119746425	0.177554632389668	873	127	0	0	0.873	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.74999999999999	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0307322989334026	0	NA	NA	0.031308012969744	0.191720930980683	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	0	35.416666666666664	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.031169321489337	0	NA	NA	0.0303148464510061	0.1834692103377	895	105	0	0	0.895	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	0	34.583333333333336	0.0402331091273882	0	-Inf	0.0402331091273882	0.0306246101570515	0	NA	NA	0.0297928373324822	0.176878439635153	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.08333333333339	0	35.083333333333336	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0285303205872847	0	NA	NA	0.0315625968366191	0.199381447907856	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333339	0	34.75	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.0306577720507627	0	NA	NA	0.0293661823927232	0.173538607386569	855	145	0	0	0.855	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000006	0	34.083333333333336	0.0390967990762099	0	-Inf	0.0390967990762099	0.0289710357795512	0	NA	NA	0.0285901089352564	0.171470553375706	860	140	0	0	0.86	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.08333333333339	0	33.75000000000001	0.0389276557511924	0	-Inf	0.0389276557511924	0.0285167509914151	0	NA	NA	0.029331776025192	0.18445919010717	864	136	0	0	0.864	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666673	0	33.41666666666668	0.038759969965707	0	-Inf	0.038759969965707	0.0286770514782204	0	NA	NA	0.0297225091600668	0.192212728077459	852	148	0	0	0.852	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	0	33.75000000000001	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.0303999575138734	0	NA	NA	0.0286742230255331	0.177391402312396	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.25000000000006	0	33.08333333333334	0.0383470098919532	0	-Inf	0.0383470098919532	0.0294839791301539	0	NA	NA	0.0295240036918382	0.193998228680279	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000006	0	31.833333333333343	0.0377438129156367	0	-Inf	0.0377438129156367	0.0288647565509345	0	NA	NA	0.0284940378472256	0.185296747332995	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666671	0	32.00000000000001	0.0379028017472667	0	-Inf	0.0379028017472667	0.0281141077765634	0	NA	NA	0.0293275255181246	0.19621974526563	858	142	0	0	0.858	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666671	0	32.00000000000001	0.0379028017472667	0	-Inf	0.0379028017472667	0.0284941015054489	0	NA	NA	0.0287978116245369	0.188117153320306	875	125	0	0	0.875	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666671	0	32.16666666666668	0.0379028017472667	0	-Inf	0.0379028017472667	0.0308666681815526	0	NA	NA	0.0282806810343322	0.180168459604412	870	130	0	0	0.87	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000004	0	31.833333333333343	0.0377438129156367	0	-Inf	0.0377438129156367	0.0278936451382302	0	NA	NA	0.0285244438717066	0.18576574323391	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.33333333333337	0	32.33333333333334	0.0383061974523115	0	-Inf	0.0383061974523115	0.029120254624628798	0	NA	NA	0.0288142539450282	0.183709992682231	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.33333333333337	0	33.33333333333334	0.0388017557993916	0	-Inf	0.0388017557993916	0.0281749303189598	0	NA	NA	0.0293969160891468	0.186859703913939	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.00000000000003	0	32.66666666666668	0.0384699707906628	0	-Inf	0.0384699707906628	0.029150877916582	0	NA	NA	0.0297418068593081	0.195850460874605	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.1666666666667	0	32.16666666666667	0.0379028017472667	0	-Inf	0.0379028017472667	0.0285107623597713	0	NA	NA	0.0282973426597162	0.180425070808405	854	146	0	0	0.854	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.83333333333337	0	32.00000000000001	0.0375861525942175	0	-Inf	0.0375861525942175	0.0289479420677019	0	NA	NA	0.0279098428480358	0.178077250583655	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.9166666666667	0	32.25000000000001	0.0380229253413545	0	-Inf	0.0380229253413545	0.0279885604746994	0	NA	NA	0.0285612059565617	0.183097321753366	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.4166666666667	0	32.41666666666667	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0127470102255618	0	NA	NA	0.0123411427683877	0.315625712853078	608	392	0	0	0.608	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.583333333333336	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.012116810657421	0	NA	NA	0.0124241744632801	0.317870853721717	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.91666666666669	0	32.25000000000001	0.012461345857946	0	-Inf	0.012461345857946	0.0124459232862888	0	NA	NA	0.0126197394581144	0.323422699258306	667	333	0	0	0.667	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333336	0	33.083333333333336	0.012513324680928	0	-Inf	0.012513324680928	0.0123368997938258	0	NA	NA	0.012356701107441	0.311215330617731	672	328	0	0	0.672	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	0	32.416666666666664	0.0124097970858067	0	-Inf	0.0124097970858067	0.012720982132878	0	NA	NA	0.0128029455589463	0.332399349054859	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.08333333333336	0	32.916666666666664	0.0124355180497881	0	-Inf	0.0124355180497881	0.0125659142302016	0	NA	NA	0.0125931466854966	0.323405921328817	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333336	0	32.583333333333336	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0123798693507991	0	NA	NA	0.0117292197256622	0.295009976781915	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.4166666666667	0	31.749999999999996	0.0122326870775303	0	-Inf	0.0122326870775303	0.0124559321975212	0	NA	NA	0.0129822948919314	0.346059940397945	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333337	0	32.08333333333333	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0121139119573878	0	NA	NA	0.0120861840649724	0.309502970033111	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333337	0	31.916666666666664	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0121064914124466	0	NA	NA	0.0122354987604749	0.315444358642754	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.4166666666667	0	32.58333333333333	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.0122804412706818	0	NA	NA	0.0125932138935466	0.325409994551297	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.4166666666667	0	32.58333333333333	0.0123841823043677	0	-Inf	0.0123841823043677	0.01211273737833	0	NA	NA	0.0127513879671726	0.331447354240814	629	371	0	0	0.629	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.08333333333337	0	31.916666666666664	0.012282771960992	0	-Inf	0.012282771960992	0.0130796740299413	0	NA	NA	0.0122286073661338	0.315171716422684	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.25000000000003	0	32.08333333333333	0.0122576783566175	0	-Inf	0.0122576783566175	0.0125373652658632	0	NA	NA	0.0125305491681757	0.327963768773811	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.58333333333336	0	32.75	0.0126718959543505	0	-Inf	0.0126718959543505	0.0127173965930347	0	NA	NA	0.0121377955857812	0.296483965460365	647	353	0	0	0.647	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.91666666666669	0	32.416666666666664	0.0127798619317583	0	-Inf	0.0127798619317583	0.0127018804258474	0	NA	NA	0.0129844670069536	0.324996382243078	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.25000000000001	0	32.416666666666664	0.0128896835290581	0	-Inf	0.0128896835290581	0.0125399944970025	0	NA	NA	0.0128721133730397	0.316650389095818	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	32.75	0.0260047718198447	0.0311733183159379	0.834199668969772	-0.00516854649609318	0.0186031601778148	0.0302214099037186	NA	NA	0.0236902287020411	0.827295037225624	335	125	540	0.54	0.335	0.67
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.75000000000001	1	32.58333333333333	0.0261749574292545	0.0313361505112163	0.835295880388549	-0.00516119308196179	0.0186243994255862	0.0327724637322277	NA	NA	0.0237995156986462	0.828316465237829	350	138	512	0.512	0.35	0.7
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333334	1	32.25	0.0262321821040851	0.03166697281676	0.828376689362661	-0.00543479071267497	0.0185972257491007	0.0323999322515168	NA	NA	0.0234151606749597	0.816455969097281	355	145	500	0.5	0.355	0.71
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	32.75	0.0264053674769446	0.0311733183159379	0.847050262963004	-0.00476795083899328	0.0185969542703477	0.0325327994876128	NA	NA	0.0244066873879253	0.845115606338828	360	126	514	0.514	0.36	0.72
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAT:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.33333333333336	1	32.5	0.0263184898584525	0.0314182062818701	0.837682763374039	-0.00509971642341756	0.0183140238949976	0.0330354208896675	NA	NA	0.0241051043522944	0.832449005882415	371	131	498	0.498	0.371	0.742
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGATCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000001	1	31.333333333333332	0.0260895870640617	0.0326138339548042	0.799954617424504	-0.00652424689074251	0.0177082376862115	0.0334927860254839	NA	NA	0.0235915592665755	0.782125623639119	330	153	517	0.517	0.33	0.66
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GATCTAATC	1:1	FALSE	0.5	0	0.166666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.41666666666669	1	30.916666666666664	0.0128620515547158	0.0330632048490145	0.389014059993619	-0.0202011532942986	0.0127459310919271	0.0359006219633682	NA	NA	0.021183598318337	0.340274826708799	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333336	1	30.749999999999996	0.012513324680928	0.0332464403304228	0.376380886391541	-0.0207331156494948	0.0125239184314786	0.0337766253221182	NA	NA	0.0208701824554597	0.320499273892074	0	388	612	0.612	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.25000000000003	1	31.749999999999996	0.0124097970858067	0.0321765161581571	0.385678705078228	-0.0197667190723504	0.0128203643374116	0.0342232959490647	NA	NA	0.0211395532290294	0.349758148724028	0	344	656	0.656	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.91666666666669	1	31.58333333333333	0.0123079685204042	0.0323500281131817	0.38046237478814	-0.0200420595927775	0.0121543759922248	0.0334275321777949	NA	NA	0.0210504475257719	0.341047991386267	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.58333333333336	1	32.25	0.012513324680928	0.03166697281676	0.395153801196471	-0.019153648135832	0.0120097899272074	0.0336780394975355	NA	NA	0.0207012737767506	0.35484104117613	0	361	639	0.639	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.58333333333336	1	31.916666666666664	0.0377042739400825	0.0320048558445568	1.17807979274167	0.00569941809552572	0.0286066299053316	0.0324601688057979	NA	NA	0.0326796314085669	0.861548941016877	507	116	377	0.377	0.507	0.754
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000001	1	31.749999999999996	0.0376254440385144	0.0321765161581571	1.16934486796439	0.00544892788035732	0.0275108793223605	0.0329629919601402	NA	NA	0.034652201508241	0.875050799010226	477	129	394	0.394	0.477	0.788
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.75000000000001	1	31.749999999999996	0.0376254440385144	0.0321765161581571	1.16934486796439	0.00544892788035732	0.0290374690464102	0.0343685174261982	NA	NA	0.0326526410250345	0.867467960789305	499	132	369	0.369	0.499	0.738
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.75000000000001	1	31.416666666666664	0.0371593024135724	0.0325254218363474	1.14246949972057	0.00463388057722503	0.029138787439063	0.0339543464535497	NA	NA	0.0326713296382301	0.88721172679593	510	121	369	0.369	0.51	0.738
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000001	2	31.166666666666664	0.0498108321742553	0.0670837952639451	0.742516608940679	-0.0172729630896898	0.0313538537584755	0.0484284493967479	NA	NA	0.0422452796261802	0.682632710121801	305	51	644	0.644	0.305	0.61
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000001	2	31.499999999999996	0.0504391702568756	0.0663415654213976	0.760295147340722	-0.015902395164522	0.029966782894139	0.0503684315689977	NA	NA	0.0409470315626737	0.697745918842232	322	40	638	0.638	0.322	0.644
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	31.83333333333333	0.0510835693943593	0.0656155905923368	0.778527921995497	-0.0145320211979776	0.0308356178244007	0.0491300480417548	NA	NA	0.0399610114225399	0.716115658238228	353	36	611	0.611	0.353	0.706
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.66666666666669	2	30.83333333333333	0.0506521552428655	0.0678428326164385	0.746610265070099	-0.017190677373573	0.0288820834781318	0.0526133092451035	NA	NA	0.0398761194343694	0.666394160288096	311	45	644	0.644	0.311	0.622
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000001	2	29.83333333333333	0.0514119856124207	0.0702267037754945	0.732085985080235	-0.0188147181630738	0.0325734453945091	0.0513053771604052	NA	NA	0.0419119571516173	0.653496212292492	274	39	687	0.687	0.274	0.548
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	29.166666666666664	0.0515223984646761	0.0719113287774619	0.716471233957007	-0.0203889303127858	0.0316464348734882	0.0521334231905647	NA	NA	0.04478081757774	0.648889826967304	288	52	660	0.66	0.288	0.576
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.333333333333332	0.0511925740908369	0.0714826348532437	0.716153988950421	-0.0202900607624068	0.0326369046382525	0.0534817303274756	NA	NA	0.043442378947203	0.64045920340387	291	56	653	0.653	0.291	0.582
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000001	2	29.666666666666664	0.0514119856124207	0.0706404112947758	0.727798503294146	-0.0192284256823551	0.0318781470037076	0.0512111013517727	NA	NA	0.0436329119918092	0.65944013035964	302	45	653	0.653	0.302	0.604
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.00000000000001	2	30.166666666666668	0.0517446536152136	0.0694136680239339	0.745453382428544	-0.0176690144087203	0.0316458173305393	0.0524586358302432	NA	NA	0.0432455881379284	0.682852458938299	302	42	656	0.656	0.302	0.604
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	30.166666666666668	0.0513020451633004	0.0694136680239339	0.739076994830635	-0.0181116228606335	0.0309609891839353	0.0542388461744897	NA	NA	0.0419502664280449	0.665930134874323	322	41	637	0.637	0.322	0.644
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	30.166666666666668	0.0513020451633004	0.0694136680239339	0.739076994830635	-0.0181116228606335	0.0317531078425077	0.0479876742672874	NA	NA	0.0429770390899492	0.673444356425407	313	49	638	0.638	0.313	0.626
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	29.833333333333332	0.0515223984646761	0.0702267037754945	0.73365821966223	-0.0187043053108184	0.0314596049486395	0.053701088071281	NA	NA	0.0424830543819243	0.659736606318106	310	35	655	0.655	0.31	0.62
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	29.833333333333332	0.0510835693943593	0.0702267037754945	0.727409470301592	-0.0191431343811352	0.0324042016947952	0.051739725418465	NA	NA	0.0436020600277316	0.660631124804204	308	50	642	0.642	0.308	0.616
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000003	2	28.833333333333336	0.0504391702568755	0.0727843418621031	0.692994797595853	-0.0223451716052276	0.0309176137414004	0.0537155906610318	NA	NA	0.0457354936100474	0.625143346442437	287	37	676	0.676	0.287	0.574
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	28.5	0.0498108321742552	0.0736788296875599	0.676053520196798	-0.0238679975133047	0.0303450019688253	0.0575961511794542	NA	NA	0.0450972994936896	0.596628163600702	276	40	684	0.684	0.276	0.552
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.00000000000003	2	28.833333333333336	0.0504391702568755	0.0727843418621031	0.692994797595853	-0.0223451716052276	0.0301708072238134	0.0533569839793668	NA	NA	0.0493115496178205	0.650445947812299	315	44	641	0.641	0.315	0.63
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.1666666666667	2	28.166666666666668	0.0503333482845312	0.0745955951479785	0.674749603977054	-0.0242622468634473	0.0293358303203734	0.0545250654916533	NA	NA	0.047059137271822	0.606155250768935	249	50	701	0.701	0.249	0.498
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333336	2	27.5	0.0499144653819543	0.0764993759663411	0.652481994152686	-0.0265849105843868	0.0293807253438665	0.0554216570761516	NA	NA	0.0469823909792369	0.571496843903881	250	40	710	0.71	0.25	0.5
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	27.666666666666668	0.0502279695796377	0.0760143706952156	0.660769392948472	-0.0257864011155779	0.0305722385641896	0.0591140647138583	NA	NA	0.0455821038829924	0.571588711797401	261	44	695	0.695	0.261	0.522
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.1666666666667	2	27.833333333333336	0.0503333482845312	0.0755354817013731	0.666353707566496	-0.0252021334168419	0.0318013063325052	0.05580061526008	NA	NA	0.0468175191535351	0.590366075859798	262	41	697	0.697	0.262	0.524
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	28.166666666666668	0.0501230313618422	0.0745955951479785	0.671930175802082	-0.0244725637861364	0.0303856278409369	0.0582540384949628	NA	NA	0.0483862359692798	0.613014388792708	271	34	695	0.695	0.271	0.542
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.1666666666667	2	27.66666666666667	0.049707628561966	0.0760143706952156	0.653924094975039	-0.0263067421332496	0.0302498603065971	0.0578413586559776	NA	NA	0.0464238672025379	0.570942369009167	246	39	715	0.715	0.246	0.492
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	2	27.66666666666667	0.049299057062491	0.0760143706952156	0.648549170526698	-0.0267153136327246	0.0310490243449416	0.0552091113256296	NA	NA	0.0462988794570986	0.563926904907332	236	43	721	0.721	0.236	0.472
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	27.66666666666667	0.049502499478939	0.0760143706952156	0.651225538358035	-0.0265118712162766	0.0300466397148989	0.0547040573649406	NA	NA	0.0464749403627248	0.568369002053194	250	40	710	0.71	0.25	0.5
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.50000000000003	2	28.66666666666667	0.0501230313618422	0.073228852172937	0.684471077649446	-0.0231058208110948	0.0303213588647873	0.0544304046146427	NA	NA	0.0461240482232253	0.616406634942919	268	40	692	0.692	0.268	0.536
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	29.08333333333334	0.0499664439235005	0.0721276112438599	0.692750571685598	-0.0221611673203594	0.030734870838256	0.0519519988790406	NA	NA	0.0433052847108758	0.608831032871822	306	30	664	0.664	0.306	0.612
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.50000000000003	2	29.000000000000004	0.049502499478939	0.0723451996406717	0.684254100131189	-0.0228427001617327	0.0314393309129397	0.0538173359181785	NA	NA	0.045906472659004	0.618771541917034	286	42	672	0.672	0.286	0.572
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.16666666666669	3	29.33333333333334	0.049707628561966	0.109952605643907	0.452082315565577	-0.0602449770819406	0.0299934998624612	0.0682534794479617	NA	NA	0.0592008859834997	0.308850777446698	123	15	862	0.862	0.123	0.246
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.83333333333336	3	29.33333333333334	0.049299057062491	0.109952605643907	0.448366428187717	-0.0606535485814155	0.031199669234591	0.0675371058661266	NA	NA	0.0594321746831426	0.307467348145476	112	21	867	0.867	0.112	0.224
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000003	3	28.33333333333334	0.0483064312987563	0.114143861506444	0.423206562851644	-0.0658374302076877	0.0309404391388468	0.0721421664642406	NA	NA	0.0650396349224593	0.311410746239136	102	17	881	0.881	0.102	0.204
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000003	4	28.33333333333334	0.0483064312987563	0.156408563919793	0.308847738820287	-0.108102132621037	0.0299076537104339	0.0906954969383139	NA	NA	0.0817663913248307	0.186139794556601	54	4	942	0.942	0.054	0.108
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.83333333333336	4	28.66666666666667	0.0486986442466362	0.154389040653111	0.315428116144944	-0.105690396406475	0.0295661849045122	0.0880660562189218	NA	NA	0.0796072927122778	0.184294695825126	56	2	942	0.942	0.056	0.112
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.50000000000003	4	28.33333333333334	0.06015246431623	0.156408563919793	0.384585490773232	-0.0962560996035628	0.0312952991736166	0.0887602371057466	NaN	NaN	0.0825884482789743	0.243820269666378	85	0	915	0.915	0.085	0.17
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.1666666666667	4	29.000000000000004	0.0596736078092626	0.152421181209951	0.39150469334748	-0.0927475734006886	0.0337838995380228	0.0913624968733009	NaN	NaN	0.0867647662576785	0.285090244632762	91	2	907	0.907	0.091	0.182
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.1666666666667	4	29.000000000000004	0.0596736078092626	0.152421181209951	0.39150469334748	-0.0927475734006886	0.0307823279801932	0.0854631991336303	NA	NA	0.0790733050931824	0.240823260883105	79	2	919	0.919	0.079	0.158
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.83333333333337	3	29.66666666666667	0.0475406642088711	0.108623210908842	0.437665797310741	-0.0610825466999709	0.0293354949291787	0.071388182952398	NA	NA	0.0694110799878457	0.378853094672998	179	5	816	0.816	0.179	0.358
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.66666666666671	3	30.000000000000004	0.0476350542917444	0.107325632730505	0.443836696601232	-0.0596905784387606	0.0282958701056595	0.0694085175479823	NA	NA	0.0708051829030783	0.399214153084482	182	3	815	0.815	0.182	0.364
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.75000000000006	3	29.58333333333334	0.0470281353834475	0.108952531416164	0.431638758385659	-0.0619243960327164	0.0292267697066515	0.0653173933199563	NA	NA	0.0723411930523247	0.391995219673028	161	6	833	0.833	0.161	0.322
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAC	2	ATCAAATTG:ATTAAACTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.58333333333339	3	29.416666666666668	0.0465716997700458	0.109617210244414	0.424857553537485	-0.063045510474368	0.028769546608954	0.0748586366943876	NA	NA	0.0672888545796436	0.348790254918614	150	3	847	0.847	0.15	0.3
N	all	ss13	340	CTG	AAC	TGG	2	AAACTGGAT:AAATTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.5	0	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.166666666666668	0.0464364923107347	0.110629602831442	0.419747437595762	-0.0641931105207075	0.0291182364098951	0.0703742444696911	NA	NA	0.072308548144935	0.374666338023087	151	9	840	0.84	0.151	0.302
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	CTGGATGAC:TTGGATGAC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0279725955898258	0.0700596979473996	NA	NA	0.0718981241441356	0.369952258790632	136	12	852	0.852	0.136	0.272
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.0372724639379983	0.0693479622528404	NaN	NaN	0.071953304404425	0.586148778646026	287	5	708	0.708	0.287	0.574
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0375337603390798	0.0740532016444109	NA	NA	0.0685788022066256	0.621503739870567	298	0	702	0.702	0.298	0.596
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0395494167990931	0.0660086641098855	NA	NA	0.0711206068016083	0.648906589166237	338	6	656	0.656	0.338	0.676
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0406780048500411	0.068411002792323	NA	NA	0.0766295698966767	0.672247219126486	335	4	661	0.661	0.335	0.67
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.0392515921511034	0.0687154359573959	NA	NA	0.0744387163766223	0.678662116545687	335	4	661	0.661	0.335	0.67
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.0295736397616535	0.0695831917031586	NA	NA	0.0647542268409512	0.390325606609409	190	11	799	0.799	0.19	0.38
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0309469728266482	0.0690345610781213	NA	NA	0.0680188489828033	0.419532833558775	186	6	808	0.808	0.186	0.372
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.0326792847952176	0.0678338358324213	NA	NA	0.0672006621873377	0.429712095733856	196	5	799	0.799	0.196	0.392
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0314123267230604	0.0648614584627394	NA	NA	0.0651946502133007	0.450567922728567	200	5	795	0.795	0.2	0.4
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.028942243340828	0.0500727881819329	NA	NA	0.0633080971838575	0.663664523443575	323	13	664	0.664	0.323	0.646
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.0292086255784609	0.0640250166125549	NA	NA	0.0703875933894758	0.369779086394763	174	7	819	0.819	0.174	0.348
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.0286203988877549	0.0657229548392788	NA	NA	0.0741390037604722	0.364147397405939	155	7	838	0.838	0.155	0.31
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAT:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0283030742591165	0.0703368631513505	NA	NA	0.069842129367997	0.332116512708786	130	9	861	0.861	0.13	0.26
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.0286247880257433	0.0683411747752167	NA	NA	0.0711322818034876	0.353301708694734	156	3	841	0.841	0.156	0.312
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0289875288373465	0.0616206341530641	NA	NA	0.0715668389692532	0.383522407908745	148	2	850	0.85	0.148	0.296
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0319397412332437	0.0605727749041878	NA	NA	0.070936864640859	0.492233286343894	223	1	776	0.776	0.223	0.446
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0296398748672523	0.0630821076413304	NA	NA	0.0718329277689193	0.486411573046199	232	1	767	0.767	0.232	0.464
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0297680177192372	0.0802023831757096	NaN	NaN	0.0850972450777185	0.283372080041938	117	1	882	0.882	0.117	0.234
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0296880397862997	0.0920964514571257	NaN	NaN	0.0871514503524606	0.285184028015966	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0384300072355884	0.0848649185212463	NaN	NaN	0.0915698030052551	0.423121998654067	180	0	820	0.82	0.18	0.36
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0388052849907793	0.0883887092614812	NaN	NaN	0.0942668634704329	0.442986414638653	183	0	817	0.817	0.183	0.366
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0390443105815452	0.0853393570823987	NaN	NaN	0.0974604540680122	0.467452607886417	173	0	827	0.827	0.173	0.346
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0402063165192594	0.0845412500195164	NaN	NaN	0.0937882636039708	0.472007493439638	225	0	775	0.775	0.225	0.45
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0419943394043658	0.0842532868313322	NaN	NaN	0.0986932413917589	0.49775814783389	233	0	767	0.767	0.233	0.466
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0422892480112363	0.0925473395980936	NA	NA	0.103900180214558	0.492472330563131	240	0	760	0.76	0.24	0.48
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.0430852132590264	0.0990894200909124	NaN	NaN	0.105814331637419	0.377390980739944	141	0	859	0.859	0.141	0.282
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0446757317638304	0.0982634684963726	NA	NA	0.100392520383241	0.394710067265769	182	0	818	0.818	0.182	0.364
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0458148669563104	0.0948678891697328	NaN	NaN	0.0952145178282639	0.391254021568223	164	0	836	0.836	0.164	0.328
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0470159149109361	0.0896412278546458	NaN	NaN	0.104538007323346	0.44936815827231	189	1	810	0.81	0.189	0.378
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0459835056851063	0.0952234758699941	NA	NA	0.10237654142316	0.415889152833705	190	0	810	0.81	0.19	0.38
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0472412278521437	0.0901169801614066	NaN	NaN	0.0954418964286307	0.40516908490899	180	0	820	0.82	0.18	0.36
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0458299936059287	0.0920754055394704	NaN	NaN	0.0994529774502119	0.429654353743246	218	0	782	0.782	0.218	0.436
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211376.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0310244320430301	0.044949489017949	NaN	NaN	0.0577106738168279	0.886459907457133	597	1	402	0.402	0.597	0.804
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.0309443086256323	0.0468734821985335	NaN	NaN	0.0557215727294487	0.875710850249	588	0	412	0.412	0.588	0.824
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0298732152671854	0.0437435413723291	NaN	NaN	0.0557442552023011	0.880339921783262	550	1	449	0.449	0.55	0.898
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0313489367328474	0.0449366723451803	NaN	NaN	0.0547898400762229	0.855347397623634	597	1	402	0.402	0.597	0.804
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.032041783942739	0.0438129479435137	NaN	NaN	0.0555673700580333	0.818197044043179	606	0	394	0.394	0.606	0.788
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0314660838298099	0.041918956706591	NaN	NaN	0.0558878682118983	0.806564879686756	615	1	384	0.384	0.615	0.768
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0328178655823757	0.044918645021269	NaN	NaN	0.0547920695380012	0.825664040878988	600	4	396	0.396	0.6	0.792
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0304793330136855	0.0439106512923011	NaN	NaN	0.0556299160562853	0.818293957720081	624	0	376	0.376	0.624	0.752
N	all	ss13	10	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0305092920910977	0.0429431790016072	NaN	NaN	0.0545623424766862	0.802201591464213	616	1	383	0.383	0.616	0.766
N	all	ss13	11	CGA	AGC	GAA	2	CAGCGAAAT:CAGCGTAGT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0308216621964054	0.0438877747375162	NA	NA	0.0550294153914816	0.819495495658664	614	1	385	0.385	0.614	0.77
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0312044209537254	0.0455754305587843	NaN	NaN	0.0551566025979445	0.82970885962758	621	0	379	0.379	0.621	0.758
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0279021696831297	0.0413045601141332	NA	NA	0.0533553770257308	0.984005894674468	520	1	479	0.479	0.52	0.958
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0285253731964417	0.0414977410651408	NA	NA	0.0531720658189838	0.982155838565141	493	3	504	0.504	0.493	0.986
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0307338151926634	0.0428039570340288	NaN	NaN	0.0524209752889816	0.817354506846807	591	4	405	0.405	0.591	0.81
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0298341244355474	0.0424771412477791	NaN	NaN	0.0544566161110751	0.824068053346316	609	1	390	0.39	0.609	0.78
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0327843242758228	0.0430050578134376	NaN	NaN	0.0564395612352148	0.67140671169472	690	0	310	0.31	0.69	0.62
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0322851127299752	0.0404954853038235	NaN	NaN	0.0587471717636968	0.69303550043385	668	0	332	0.332	0.668	0.664
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0330710377257955	0.0443455241460081	NaN	NaN	0.055770059636754	0.670171551127232	692	0	308	0.308	0.692	0.616
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0343114423187474	0.0414645890475469	NaN	NaN	0.0549074734741147	0.65147482890835	705	1	294	0.294	0.705	0.588
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0338443724706274	0.0434550357266133	NaN	NaN	0.055020592362566	0.674328656986289	682	1	317	0.317	0.682	0.634
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0329107320715929	0.0427234325094429	NaN	NaN	0.0588313501262197	0.691738152638308	653	1	346	0.346	0.653	0.692
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0327556489340635	0.0315271055604341	NA	NA	0.0475071297589378	0.273516582834791	885	0	115	0.115	0.885	0.23
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0353908806370949	0.0297476897515471	NaN	NaN	0.0470171863458192	0.249979244996393	881	0	119	0.119	0.881	0.238
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.033360264405633	0.031039329038937	NA	NA	0.0456568862572357	0.251947606224445	880	2	118	0.118	0.88	0.236
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0320548052286724	0.0303458341067973	NA	NA	0.0451303726836792	0.249415144777876	880	2	118	0.118	0.88	0.236
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0291810843952277	0.0309487339833875	NA	NA	0.0422186020909511	0.381742239220212	799	1	200	0.2	0.799	0.4
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.0259239844350874	0.0310422793977734	NA	NA	0.039907357603892	0.553971707230075	722	7	271	0.271	0.722	0.542
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0259866661700621	0.0320193962597651	NA	NA	0.0401404080353731	0.551885452365277	744	3	253	0.253	0.744	0.506
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0253941711585815	0.0316107229272898	NA	NA	0.0413194568306593	0.585135811864423	695	6	299	0.299	0.695	0.598
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0266300512339096	0.0449126660832384	NaN	NaN	0.0509000444888504	0.89187731024432	487	4	509	0.509	0.487	0.974
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0257508146808465	0.0425636580483691	NaN	NaN	0.0522209144292064	0.932427942902083	498	2	500	0.5	0.498	0.996
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.0229258407355452	0.0427957728472428	NA	NA	0.0500141891864399	0.705678818262404	360	3	637	0.637	0.36	0.72
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0226470288780854	0.0461347477434125	NA	NA	0.0503600875386945	0.691300998161751	307	4	689	0.689	0.307	0.614
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0184064500917838	0.0445924847821562	NA	NA	0.0466933689417876	0.474741175774464	214	15	771	0.771	0.214	0.428
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0186893898903425	0.0434941085683168	NA	NA	0.0458497591848927	0.469063438984077	239	22	739	0.739	0.239	0.478
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.0179751277742275	0.0460941622465088	NA	NA	0.0482055147980676	0.47280244572175	222	18	760	0.76	0.222	0.444
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0189983424377225	0.0446450417696982	NA	NA	0.0476279298092151	0.483166757697649	250	19	731	0.731	0.25	0.5
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0183136465540672	0.0288375297388719	NA	NA	0.0355929415639674	0.937839486682661	461	38	501	0.501	0.461	0.922
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0183408634512414	0.0283144306308138	NA	NA	0.0354384342377058	0.946564471151259	475	39	486	0.486	0.475	0.95
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0190464407507572	0.028857951742933	NA	NA	0.0347125601174093	0.962926604199606	468	56	476	0.476	0.468	0.936
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0196440237269886	0.028889720168666	NA	NA	0.0356187086846424	0.972502809437926	490	42	468	0.468	0.49	0.936
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0184632751695134	0.0289990178707286	NA	NA	0.0360210127882628	0.980013951752817	462	45	493	0.493	0.462	0.924
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0185127314607515	0.0286027351866551	NA	NA	0.0333746990002779	0.97534110089834	473	37	490	0.49	0.473	0.946
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.018986366371301	0.0285105346263572	NA	NA	0.0354782007185777	0.96014918305455	479	45	476	0.476	0.479	0.952
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0188647912074107	0.0425456633439803	NA	NA	0.0491647201314612	0.519236895715843	243	18	739	0.739	0.243	0.486
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0181710817181529	0.0455830516369086	NA	NA	0.0485083523729769	0.505954237342529	228	18	754	0.754	0.228	0.456
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0192241349819765	0.0451467564223748	NA	NA	0.0487932575606064	0.508441313646734	224	15	761	0.761	0.224	0.448
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0192056477094678	0.0443380241602535	NA	NA	0.0468097652844014	0.493915104170888	234	13	753	0.753	0.234	0.468
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0192492532837987	0.045274321841422	NA	NA	0.0463013558455992	0.498741146517107	244	10	746	0.746	0.244	0.488
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0194608236441244	0.047064416356232	NA	NA	0.0486275832356286	0.519503456250254	223	15	762	0.762	0.223	0.446
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0193571585017137	0.0431050219292384	NA	NA	0.0482936366377873	0.51334197686964	228	12	760	0.76	0.228	0.456
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0185929765024208	0.0490258803431861	NA	NA	0.0491698088828214	0.507176023603455	228	18	754	0.754	0.228	0.456
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0191012278767198	0.0476654736818569	NA	NA	0.0503361322926821	0.495251348769146	226	10	764	0.764	0.226	0.452
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0222136630379548	0.0474431877370018	NA	NA	0.0526326008039765	0.6738808429129	334	2	664	0.664	0.334	0.668
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0224797359086642	0.0468097219849422	NA	NA	0.0542684520143168	0.666054367052795	317	5	678	0.678	0.317	0.634
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0212424551318273	0.0452834176351734	NA	NA	0.0532338013851237	0.66664880020068	319	13	668	0.668	0.319	0.638
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0224689515809191	0.0464727160323762	NA	NA	0.0528092679558173	0.664132553639498	329	9	662	0.662	0.329	0.658
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.0223113327580828	0.0485971384633136	NA	NA	0.0560186711496663	0.664516894415351	358	8	634	0.634	0.358	0.716
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0216185210778591	0.0494077375088921	NA	NA	0.0553369220437362	0.635728678148488	342	2	656	0.656	0.342	0.684
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0233234276315467	0.0488356699555345	NA	NA	0.0519871176185032	0.642701145495914	338	4	658	0.658	0.338	0.676
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0227322776692187	0.0429098171170941	NA	NA	0.0518061511718668	0.665968076057624	350	4	646	0.646	0.35	0.7
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0227169033523346	0.049194285894614	NA	NA	0.0545816337110819	0.675600376071099	322	8	670	0.67	0.322	0.644
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0229174274570375	0.0474446940993544	NA	NA	0.0524231843830764	0.673928937061678	342	10	648	0.648	0.342	0.684
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.0199668774924905	0.0459449030771839	NA	NA	0.050623494991506	0.495216659832664	233	7	760	0.76	0.233	0.466
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.019853143549104	0.0476621336428663	NA	NA	0.0520267018645145	0.482646010889831	224	19	757	0.757	0.224	0.448
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.0141398003614792	0.049558628919996	NA	NA	0.0494073238425377	0.311123382263172	113	43	844	0.844	0.113	0.226
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0143787907671425	0.0465077561377292	NA	NA	0.0485112117421756	0.317908691239635	115	41	844	0.844	0.115	0.23
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0139695456936813	0.0481130701517441	NA	NA	0.0494030223804473	0.326723313953489	118	54	828	0.828	0.118	0.236
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0144811067586417	0.0480927510715151	NA	NA	0.04944287606428	0.324845001438627	113	39	848	0.848	0.113	0.226
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0133637001852712	0.0460272206561139	NA	NA	0.0456029678053116	0.287539330573853	102	48	850	0.85	0.102	0.204
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0214759237524945	0.0463870062892743	NA	NA	0.0509423846170214	0.512992880407335	233	19	748	0.748	0.233	0.466
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0198366485345982	0.045956737604017	NA	NA	0.0515648016348706	0.51809271837065	248	16	736	0.736	0.248	0.496
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.0195105694973739	0.0464549496397033	NA	NA	0.0539613147476697	0.517908636061122	253	29	718	0.718	0.253	0.506
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0204098258219913	0.0450227011772187	NA	NA	0.0513175943065756	0.516078883269438	238	16	746	0.746	0.238	0.476
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0206358381071608	0.0459479003954189	NA	NA	0.0508080956622644	0.511879683082529	267	21	712	0.712	0.267	0.534
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0206514675719162	0.044815959439029	NA	NA	0.0505469748412296	0.532748257066704	275	26	699	0.699	0.275	0.55
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0202390382035077	0.0464817761172737	NA	NA	0.0502730185357713	0.526915330394721	261	13	726	0.726	0.261	0.522
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0201352378085513	0.0437761854554909	NA	NA	0.0507642883417206	0.530922349560782	257	10	733	0.733	0.257	0.514
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.0241591036569344	0.0471609146143676	NA	NA	0.0530375433389126	0.739070481565766	370	7	623	0.623	0.37	0.74
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0248430426764462	0.0329913530168736	NA	NA	0.0416236679081679	0.752488644874126	610	18	372	0.372	0.61	0.744
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	33.83333333333333	0.0431256509016318	0.0301548153585304	1.43014143475537	0.0129708355431015	0.024422456111738	0.0322907991470366	NA	NA	0.0400586781938344	0.746092564521159	631	14	355	0.355	0.631	0.71
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	34.49999999999999	0.0438614614252191	0.0603340239140544	0.72697722743803	-0.0164725624888354	0.0248193519653806	0.043846819179586403	NA	NA	0.0545701230470293	0.762758438237913	404	7	589	0.589	0.404	0.808
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.49999999999999	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0249960144513132	0.0454287708349185	NA	NA	0.0530976281485606	0.788078186528691	378	3	619	0.619	0.378	0.756
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.9166666666667	2	35.666666666666664	0.0448452368647073	0.0582817382454872	0.769456063163656	-0.0134365013807799	0.0249691000796283	0.0444165097473625	NA	NA	0.0515179340470325	0.794237400676263	421	6	573	0.573	0.421	0.842
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	35.666666666666664	0.0451830456487547	0.0582817382454872	0.775252197496928	-0.0130986925967325	0.0260955707061645	0.0428492673548267	NA	NA	0.0537410193686012	0.807434259577848	417	6	577	0.577	0.417	0.834
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	36	0.0454110940157692	0.0577207808520962	0.786737347371142	-0.012309686836327	0.0251288546169759	0.0426372817827083	NA	NA	0.0527565752054565	0.815505236260647	417	7	576	0.576	0.417	0.834
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.41666666666669	2	36.33333333333333	0.0451830456487547	0.0571705240409132	0.790320648738853	-0.0119874783921585	0.025214451776356	0.0434293628062901	NA	NA	0.050058443942792	0.810741422404592	401	5	594	0.594	0.401	0.802
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0448452368647073	0.0579999025523778	0.773195038115952	-0.0131546656876705	0.0266241482553597	0.0432352302814877	NA	NA	0.0497938240245746	0.791639159419518	421	2	577	0.577	0.421	0.842
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.58333333333336	2	35.666666666666664	0.0444026073250892	0.0582817382454872	0.76186141082584	-0.013879130920398	0.0258433739515313	0.0424603811459227	NA	NA	0.0529243002069346	0.793132593888518	426	9	565	0.565	0.426	0.852
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	67.91666666666669	2	35.83333333333333	0.0455259839052049	0.0579999025523778	0.784932075775332	-0.0124739186471729	0.0254808472025771	0.0419837164952239	NA	NA	0.051305532778836	0.807904624330889	433	3	564	0.564	0.433	0.866
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.166666666666664	0.045296782717305	0.0591439311842398	0.765873722127137	-0.0138471484669348	0.0237732283312506	0.0444994876303078	NA	NA	0.053580524812693	0.796070263805873	408	4	588	0.588	0.408	0.816
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	34.99999999999999	0.0451830456487547	0.0594370287406054	0.760183451395967	-0.0142539830918507	0.0254908846683064	0.0448307733957262	NA	NA	0.0537739633939741	0.790953838243478	436	3	561	0.561	0.436	0.872
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333337	2	34.99999999999999	0.0450698784927921	0.0594370287406054	0.758279467324749	-0.0143671502478133	0.0254661639821024	0.0438822123688914	NA	NA	0.053959596841418	0.790040860796245	399	3	598	0.598	0.399	0.798
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.00000000000004	2	35.74999999999999	0.0447894260262166	0.0581404786806199	0.770365622069541	-0.0133510526544033	0.0248890692656212	0.0435831858878362	NA	NA	0.0493448320443218	0.786724555273883	419	4	577	0.577	0.419	0.838
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000004	1	35.74999999999999	0.0444574574471551	0.0285069944752381	1.55952804795932	0.015950462971917	0.0259613557437172	0.0278258625239158	NA	NA	0.0398970935579469	0.689311124020968	669	18	313	0.313	0.669	0.626
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.6666666666667	1	36.24999999999999	0.0443478924201168	0.0281063333749098	1.57786118269364	0.0162415590452071	0.0256621891281977	0.0277985366615435	NA	NA	0.0394989100492921	0.680933179066212	662	21	317	0.317	0.662	0.634
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	36.58333333333333	0.0442388662657619	0.02784542552167	1.58873012126656	0.0163934407440919	0.025144021254934	0.0295647329918436	NA	NA	0.0390291625308899	0.674463133666182	674	13	313	0.313	0.674	0.626
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.50000000000004	1	35.91666666666666	0.0438080716173109	0.0283721774047871	1.54405039106795	0.0154358942125237	0.0248443917486745	0.028260706305905	NA	NA	0.0389007627404584	0.691513594151484	682	12	306	0.306	0.682	0.612
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0245028899009297	0.0295484986362952	NA	NA	0.0391852048194399	0.68553977350333	655	14	331	0.331	0.655	0.662
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0256303813341392	0.029517679914073	NA	NA	0.0402239485820988	0.693242369159546	660	13	327	0.327	0.66	0.654
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.83333333333337	1	35.91666666666666	0.0442388662657619	0.0283721774047871	1.55923409171612	0.0158666888609748	0.0248834501919404	0.0271337566241346	NA	NA	0.0370192687069993	0.66820981757233	692	24	284	0.284	0.692	0.568
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.1666666666667	1	36.58333333333333	0.0440224147463932	0.02784542552167	1.58095679709164	0.0161769892247232	0.0260372950539417	0.0298627753448645	NA	NA	0.040003903430085	0.685929431480169	678	16	306	0.306	0.678	0.612
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	2	37.74999999999999	0.0597330472949441	0.0549444688504895	1.08715305734386	0.00478857844445458	0.0297638278512957	0.0388986882224189	NA	NA	0.0421363290791867	0.909519301498609	570	8	422	0.422	0.57	0.844
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.25000000000003	2	38.166666666666664	0.0446228241484838	0.0543223783836108	0.821444595694406	-0.00969955423512708	0.0260632917471736	0.0377826335522522	NA	NA	0.0380081946172324	0.798571415524285	433	24	543	0.543	0.433	0.866
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	38.666666666666664	0.0445124432883257	0.0535942229866087	0.830545547781292	-0.00908177969828305	0.0263428690051395	0.0378381505202073	NA	NA	0.0384363372509304	0.813214558806393	454	16	530	0.53	0.454	0.908
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	37.99999999999999	0.0445124432883257	0.0545695157118212	0.81570163685149	-0.0100570724234956	0.0256915809055034	0.0386110971733255	NA	NA	0.0384861710189553	0.793848425036148	426	22	552	0.552	0.426	0.852
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.4166666666667	2	37.99999999999999	0.0445124432883257	0.0545695157118212	0.81570163685149	-0.0100570724234956	0.0260215791782971	0.0412190947449916	NA	NA	0.0375909694820076	0.789053739126852	424	16	560	0.56	0.424	0.848
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.33333333333336	2	38.166666666666664	0.0600320307551523	0.0543223783836108	1.10510681861573	0.00570965237154143	0.0308324235366481	0.0391775354753559	NA	NA	0.0421098539836573	0.892145838027508	556	5	439	0.439	0.556	0.878
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	67.66666666666669	2	38.83333333333333	0.0615730216404005	0.0533558250189308	1.15400748875225	0.00821719662146974	0.0315084087422164	0.0381143872884764	NA	NA	0.0401426384969676	0.837806549192073	596	4	400	0.4	0.596	0.8
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.16666666666669	2	37.83333333333333	0.0611024764460932	0.0548189130040021	1.11462400652914	0.00628356344209104	0.0315316998671634	0.0399763199481186	NA	NA	0.0428275551767264	0.883354791003759	576	4	420	0.42	0.576	0.84
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.00000000000003	2	36.99999999999999	0.0612585232607003	0.0561009098120238	1.09193457763801	0.00515761344867654	0.0313860705481338	0.041227998128191	NA	NA	0.0423308346455931	0.903025275088542	570	6	424	0.424	0.57	0.848
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	36.33333333333333	0.0606390724718212	0.0571705240409132	1.06067022279568	0.00346854843090798	0.0298634387230311	0.040346408819597	NA	NA	0.0432168679108967	0.936031158961447	526	5	469	0.469	0.526	0.938
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.1666666666667	2	35.83333333333333	0.0601826482875392	0.0579999025523778	1.03763361038737	0.00218274573516138	0.0311844694433678	0.0427835786114679	NA	NA	0.042743463506879	0.959272779040858	559	8	433	0.433	0.559	0.866
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.83333333333337	2	36.166666666666664	0.0587096677913666	0.0574443341110379	1.02202712765167	0.00126533368032876	0.0289671719635144	0.0430522089868122	NA	NA	0.0436836324319893	0.976891824431094	524	9	467	0.467	0.524	0.934
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.33333333333337	2	36.666666666666664	0.0582817382454872	0.0566306643811089	1.02915512085938	0.00165107386437831	0.0291840607354977	0.0398136767797417	NA	NA	0.04200630059111	0.96864691243038	550	7	443	0.443	0.55	0.886
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.66666666666671	2	36.33333333333333	0.0579999025523778	0.0571705240409132	1.01450710003762	8.29378511464612e-4	0.0290392902809937	0.0420794859302264	NA	NA	0.0418326533886951	0.98418209447415	511	8	481	0.481	0.511	0.962
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	2	35.66666666666666	0.0574443341110378	0.0582817382454872	0.985631792055992	-8.37404134449417e-4	0.0281836661696742	0.042133834046219	NA	NA	0.0424283700739159	0.984253261385896	497	1	502	0.502	0.497	0.994
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	2	34.66666666666666	0.0563645417845084	0.0600320307551524	0.938907797645524	-0.00366748897064392	0.0282525791242526	0.0453288670310014	NA	NA	0.0435298832759139	0.932855906242965	474	2	524	0.524	0.474	0.948
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000004	2	34.66666666666666	0.0568993130810351	0.0600320307551524	0.947815897035128	-0.00313271767411726	0.0293471756612491	0.0421480967867561	NA	NA	0.0438195375602875	0.94300671268411	441	4	555	0.555	0.441	0.882
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666671	2	34.66666666666666	0.0563645417845084	0.0600320307551524	0.938907797645524	-0.00366748897064392	0.0298373824914616	0.0432658614096626	NA	NA	0.0444046219570366	0.934175560884902	463	8	529	0.529	0.463	0.926
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333339	2	33.99999999999999	0.0414852284880391	0.0612585232607004	0.677215614739662	-0.0197732947726613	0.0230946129855257	0.0436518130847413	NA	NA	0.0399888916950798	0.620974509056133	334	14	652	0.652	0.334	0.668
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.33333333333339	2	34.66666666666666	0.0414852284880391	0.0600320307551524	0.691051559745521	-0.0185468022671132	0.0249019515786735	0.0427357290309834	NA	NA	0.0392598497819482	0.636633138538855	315	10	675	0.675	0.315	0.63
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666671	2	35.33333333333333	0.0418713371647063	0.0588537115811214	0.711447690210543	-0.0169823744164151	0.0245766566577033	0.0412334020248237	NA	NA	0.0386796497598901	0.66062391755596	341	14	645	0.645	0.341	0.682
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666671	2	35.33333333333333	0.0418713371647063	0.0588537115811214	0.711447690210543	-0.0169823744164151	0.0233302390238412	0.0430432112457041	NA	NA	0.041082915116499	0.6793368027096	339	21	640	0.64	0.339	0.678
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	35.49999999999999	0.041581086362894	0.0585663277285774	0.709982817355382	-0.0169852413656834	0.0238844394056767	0.0420212935556819	NA	NA	0.0402484610725789	0.673017930386153	357	19	624	0.624	0.357	0.714
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34.5	0.0410124947055404	0.0603340239140544	0.67975732505364606	-0.0193215292085141	0.023728737374655	0.0431683767968719	NA	NA	0.0394374779855706	0.624184768076385	299	21	680	0.68	0.299	0.598
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34.5	0.0410124947055404	0.0603340239140544	0.67975732505364606	-0.0193215292085141	0.0243501854417005	0.0429628983085865	NA	NA	0.0398539841977976	0.627812568069168	302	17	681	0.681	0.302	0.604
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.16666666666671	2	34	0.0410124947055404	0.0612585232607003	0.66949858603352	-0.02024602855516	0.0231974430320458	0.0437713014186104	NA	NA	0.0411212150970358	0.622471968464046	304	20	676	0.676	0.304	0.608
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	2	33.916666666666664	0.0273067703935705	0.0614153696041381	0.444624376106183	-0.0341085992105676	0.0202449491793265	0.0448538179571029	NA	NA	0.0388971816169091	0.380545695293944	145	45	810	0.81	0.145	0.29
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.25000000000006	2	34.25	0.0274316291149154	0.0607927570603562	0.45123186447492	-0.0333611279454408	0.0201290133689093	0.0440953149367556	NA	NA	0.0383941540280181	0.384895453800869	175	51	774	0.774	0.175	0.35
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	2	34.25	0.0272757331281561	0.0607927570603562	0.448667480257167	-0.0335170239322001	0.019182345288211	0.0445466382072676	NA	NA	0.0379569891149637	0.377222001010248	147	39	814	0.814	0.147	0.294
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTC	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	1	34.25	0.0270909813104956	0.0297805871963345	0.909685935065447	-0.00268960588583888	0.0193246972041939	0.0285854512111118	NA	NA	0.0225146823433984	0.904910860407923	376	128	496	0.496	0.376	0.752
N	all	ss13	134	GTC	GGG	TCG	2	TGGGTCGCA:TGGGTTGCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.8333333333334	1	33.58333333333333	0.0272138698048233	0.0303839016876759	0.895667386123144	-0.00317003188285264	0.0199599518510126	0.0308974459839291	NA	NA	0.023085200892157	0.890778817844854	381	132	487	0.487	0.381	0.762
N	all	ss13	135	GCA	TCG	CAA	2	GTCGCAACT:GTTGCAACT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000006	1	33.41666666666666	0.0271522864979704	0.0305385697640887	0.889114542944304	-0.00338628326611825	0.0188542716484321	0.0315602632895522	NA	NA	0.0213749489849126	0.874123501459245	357	152	491	0.491	0.357	0.714
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	1	33.74999999999999	0.0272757331281561	0.0302307926160697	0.902250016218803	-0.00295505948791353	0.0196692434641035	0.03097038723394	NA	NA	0.0213988643144988	0.890165953358095	377	99	524	0.524	0.377	0.754
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.3333333333334	1	34.08333333333333	0.027400307499342	0.0299291581301553	0.91550545391835	-0.00252885063081339	0.0198993069593735	0.0305925439636153	NA	NA	0.0212663635463038	0.905344150360877	382	139	479	0.479	0.382	0.764
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.00000000000007	1	33.74999999999999	0.0275260251378209	0.0302307926160697	0.910529389268777	-0.00270476747824871	0.0191256747368023	0.0303062047431026	NA	NA	0.0212869013984618	0.898890910335092	363	122	515	0.515	0.363	0.726
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.24999999999999	0.0277167798918218	0.0297805871963345	0.930699576509133	-0.00206380730451267	0.0204228846241535	0.0309563206847581	NA	NA	0.0222676091113352	0.926156170367697	403	122	475	0.475	0.403	0.806
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAC:GCCTTGAAT	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.50000000000007	1	34.24999999999999	0.0277167798918218	0.0297805871963345	0.930699576509133	-0.00206380730451267	0.0196698294295125	0.0286498336584053	NA	NA	0.0216927105361545	0.924204987951796	395	108	497	0.497	0.395	0.79
N	all	ss13	141	AAC	TGA	ACA	2	TTGAACACA:TTGAATACA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	1	33.916666666666664	0.0270909813104956	0.0300792190929219	0.900654409504619	-0.00298823778242627	0.0204972206130381	0.0302497562015524	NA	NA	0.0215883916465378	0.889909494077278	371	128	501	0.501	0.371	0.742
N	all	ss13	142	ACA	ACA	CAC	2	AACACACCT:AATACACCA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666674	1	34.916666666666664	0.0270909813104956	0.0292007684815911	0.927748916182617	-0.00210978717109544	0.0196234941324158	0.0281262184075283	NA	NA	0.0219221634229141	0.923330029374388	397	130	473	0.473	0.397	0.794
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCTAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000007	1	35.08333333333333	0.0271522864979704	0.0290593249318817	0.934374303657033	-0.00190703843391128	0.0193883790671486	0.0287694432850069	NA	NA	0.0219753571664139	0.930845772616179	388	118	494	0.494	0.388	0.776
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCTAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.8333333333334	2	35.58333333333333	0.0412002891133781	0.058423686245627	0.70519838375419	-0.0172233971322489	0.0233649973060998	0.0442851389182408	NA	NA	0.0256043080696176	0.501153598524504	229	43	728	0.728	0.229	0.458
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.5833333333334	2	35.83333333333333	0.0556454425645553	0.0579999025523778	0.959405794075322	-0.0023544599878224802	0.0271874119009772	0.0417569067593461	NA	NA	0.0315156521485772	0.940447329005817	431	19	550	0.55	0.431	0.862
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666674	2	36.33333333333333	0.0573756358851215	0.0571705240409132	1.00358772020458	2.05111844208274e-4	0.02840274186772	0.0422423748912544	NA	NA	0.0298137322554238	0.994510775057197	474	18	508	0.508	0.474	0.948
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000009	2	35.99999999999999	0.0575131971253351	0.0577207808520962	0.996403656989793	-2.07583726761149e-4	0.0300191399616168	0.0422849368683369	NA	NA	0.0314539536962074	0.994734313849723	481	12	507	0.507	0.481	0.962
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.41666666666674	2	35	0.0565638983071324	0.0594370287406054	0.95166093436447	-0.002873130433473	0.0282465125678197	0.0424417733368324	NA	NA	0.0311794911660714	0.92658038383769	441	13	546	0.546	0.441	0.882
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.0833333333334	2	35.333333333333336	0.05765141989764	0.0588537115811214	0.979571523168523	-0.00120229168348136	0.0295481007736574	0.0408195680953135	NA	NA	0.0305029196771818	0.96855902159372	456	16	528	0.528	0.456	0.912
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000007	2	34.666666666666664	0.0571024790858329	0.0600320307551523	0.951200190423876	-0.00292955166931942	0.0286396979049971	0.042133167995339	NA	NA	0.0320780699359163	0.927233810602616	457	17	526	0.526	0.457	0.914
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.5833333333334	2	34.833333333333336	0.0572387314369154	0.0597330472949441	0.958242280094762	-0.00249431585802863	0.0298286142874445	0.0431393973817246	NA	NA	0.0315096524532883	0.93690506298462	480	23	497	0.497	0.48	0.96
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.25000000000007	2	34.5	0.0575131971253351	0.0603340239140544	0.953246499972593	-0.00282082678871932	0.0284954450611239	0.0428418328198295	NA	NA	0.0318582890948392	0.929445151939502	424	16	560	0.56	0.424	0.848
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	2	34.5	0.0569668741816511	0.0603340239140544	0.944191527201968	-0.00336714973240334	0.0298775100106528	0.0452212484445196	NA	NA	0.0316137043643853	0.915178372158914	478	12	510	0.51	0.478	0.956
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.41666666666673	1	34.333333333333336	0.0420179878270026	0.0297068535712844	1.41442067320178	0.0123111342557182	0.0252992902006774	0.0297237010358413	NA	NA	0.0258576846598676	0.633995131153813	650	42	308	0.308	0.65	0.616
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.25000000000007	1	34.166666666666664	0.0421163271222965	0.0298546878003148	1.41071068650909	0.0122616393219818	0.0240655696768989	0.0307896443350074	NA	NA	0.0267077488538604	0.646159350148979	640	37	323	0.323	0.64	0.646
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.5833333333334	1	34.166666666666664	0.0425143321315747	0.0298546878003148	1.42404209402339	0.012659644331259901	0.0254778655301873	0.0301417841189991	NA	NA	0.0263230701590892	0.630563814730301	624	47	329	0.329	0.624	0.658
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.91666666666673	1	34.166666666666664	0.0569668741816511	0.0298546878003148	1.90813833199925	0.0271121863813363	0.0281120373499393	0.0295165069673714	NA	NA	0.0302256618267455	0.369723017685237	813	14	173	0.173	0.813	0.346
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.0833333333334	1	34	0.0568319121182793	0.0300040009602743	1.89414445738505	0.0268279111580049	0.0284690064337879	0.0316828381297353	NA	NA	0.0305334740455391	0.379596864122871	801	9	190	0.19	0.801	0.38
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.16666666666674	1	34.666666666666664	0.042766928969766	0.029415534864961	1.45388921758852	0.013351394104805	0.026418807104576	0.028925709443859	NA	NA	0.0257526237216067	0.604145790496191	668	48	284	0.284	0.668	0.568
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.00000000000007	1	34.833333333333336	0.0428688103799614	0.0292720079293014	1.46449845475238	0.01359680245066	0.0240548843167525	0.0302316983530295	NA	NA	0.0270320042895466	0.614971963186329	665	41	294	0.294	0.665	0.588
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.8333333333334	1	35.333333333333336	0.0429711784958646	0.028849710620847	1.48948386556132	0.0141214678750176	0.0234770569272209	0.0284801374798176	NA	NA	0.0253288904840321	0.577169370733604	679	44	277	0.277	0.679	0.554
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0238269846245095	0.0299973853662363	NA	NA	0.0256343170736883	0.590629449875147	692	45	263	0.263	0.692	0.526
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	35.666666666666664	0.042364201600918	0.0285748846742028	1.48256771930786	0.0137893169267152	0.0255727846748341	0.0293840370954723	NA	NA	0.0255432963806768	0.589306736102268	689	45	266	0.266	0.689	0.532
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.50000000000007	2	36.333333333333336	0.042564612444337	0.0571705240409132	0.744520242876842	-0.0146059115965762	0.023645300765312	0.0436932701770419	NA	NA	0.0378696076258224	0.699726609458695	367	19	614	0.614	0.367	0.734
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666673	3	36.333333333333336	0.0575822255219405	0.0874776777943207	0.658250504286693	-0.0298954522723802	0.0286825017752814	0.0549405950930828	NA	NA	0.0428675508815124	0.48555801420439	241	9	750	0.75	0.241	0.482
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	3	36	0.0573071018565008	0.0883372767422876	0.648730682786235	-0.0310301748857868	0.0276350160268444	0.0514471775181283	NA	NA	0.046309149739704	0.502815880847276	219	7	774	0.774	0.219	0.438
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333339	3	36.666666666666664	0.0578600049104132	0.0866346653413833	0.667862046704011	-0.02877466043097	0.0289834515317161	0.0503683144341697	NA	NA	0.042941300893949	0.50279857683125	255	4	741	0.741	0.255	0.51
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.83333333333339	3	37.333333333333336	0.0730503975887864	0.0849965139802523	0.859451690051178	-0.0119461163914659	0.032925881984077	0.0499578528214726	NA	NA	0.0467438072619633	0.79828616400101	422	2	576	0.576	0.422	0.844
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.00000000000006	4	37.833333333333336	0.0739514826034046	0.113962844188242	0.648908713450963	-0.0400113615848373	0.0328675597816165	0.0597596018014786	NaN	NaN	0.056558940735946	0.47930072559417	233	0	767	0.767	0.233	0.466
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.50000000000006	4	38.333333333333336	0.0745028923992239	0.112359208671495	0.663077759981812	-0.0378563162722712	0.0321240415590141	0.0594253675449514	NA	NA	0.0552632253742586	0.493332423758385	249	1	750	0.75	0.249	0.498
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.16666666666671	4	39.00000000000001	0.0760143706952156	0.110290063467372	0.689222295331285	-0.0342756927721569	0.0342488150122642	0.0598411632664358	NaN	NaN	0.0547361186294305	0.53118454260921	272	0	728	0.728	0.272	0.544
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.83333333333337	4	39.333333333333336	0.0764018799879128	0.109283858386045	0.699114042240558	-0.0328819783981324	0.0330849032570902	0.0600515884269424	NaN	NaN	0.0536855120934742	0.540211898497454	261	1	738	0.738	0.261	0.522
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.50000000000004	4	39.00000000000001	0.0767933639165995	0.110290063467372	0.696285426831018	-0.033496699550773	0.0369354735400348	0.0559618749153281	NaN	NaN	0.0534656164094687	0.530981016842039	260	0	740	0.74	0.26	0.52
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	38.00000000000001	0.0761108787135566	0.113423227292943	0.67103432453903	-0.037312348579386	0.0347233171088883	0.0595173803571724	NA	NA	0.0582482289996031	0.521798966093326	263	0	737	0.737	0.263	0.526
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.58333333333337	4	37.00000000000001	0.0755354817013731	0.116739982283845	0.647040373174924	-0.0412045005824719	0.0338360707623944	0.064043740105701	NaN	NaN	0.056285019276878	0.464126640322057	252	2	746	0.746	0.252	0.504
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC:GAGGGGAGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000004	4	36.91666666666667	0.0764993759663411	0.117025173722032	0.653700170085189	-0.0405257977556908	0.0318986259366923	0.0599520367830913	NaN	NaN	0.0579266940867546	0.48417409529817	225	0	775	0.775	0.225	0.45
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.91666666666667	0.0757263107752118	0.117025173722032	0.647094196630576	-0.0412988629468201	0.0339549787154095	0.0659539397584268	NA	NA	0.0584930388926694	0.480158608578085	235	0	765	0.765	0.235	0.47
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0340058420211237	0.0620174484248908	NaN	NaN	0.0598534013247517	0.472087645924281	206	2	792	0.792	0.206	0.412
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.0339391115286172	0.0624435297645372	NaN	NaN	0.0583257718349576	0.454045144130754	213	0	787	0.787	0.213	0.426
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.0346511994687397	0.0615729767133586	NA	NA	0.0601992733229937	0.455814303682486	211	3	786	0.786	0.211	0.422
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0341468296688101	0.0630595683335664	NaN	NaN	0.0604180561588467	0.44965956532567	230	2	768	0.768	0.23	0.46
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0342791726466764	0.0652796098767744	NA	NA	0.0603968346415845	0.440981698741634	232	1	767	0.767	0.232	0.464
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0340679831685209	0.0655754620904938	NA	NA	0.0630101991024425	0.460163093343797	210	1	789	0.789	0.21	0.42
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0340805986162653	0.0669527030395662	NaN	NaN	0.0598998672999925	0.429623936403866	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0331951136887555	0.0658168537362724	NA	NA	0.0614197134425497	0.433847230950087	216	0	784	0.784	0.216	0.432
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0369115067951902	0.0779568670303104	NaN	NaN	0.07359629124717	0.332739005133598	121	0	879	0.879	0.121	0.242
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0356185490750917	0.0833096445968936	NaN	NaN	0.0709943683352879	0.304341468549735	115	1	884	0.884	0.115	0.23
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0353024406265409	0.0772332603537385	NaN	NaN	0.074241771375301	0.325982355837963	122	0	878	0.878	0.122	0.244
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0363973893051485	0.0823879294024591	NA	NA	0.0718952099501935	0.304688355440921	134	0	866	0.866	0.134	0.268
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0361420625265767	0.0800258385393458	NaN	NaN	0.0723434591315955	0.30769462312459	126	0	874	0.874	0.126	0.252
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0362148037924644	0.0769054021486369	NaN	NaN	0.0706455685508241	0.319263634633461	117	0	883	0.883	0.117	0.234
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0348918713157556	0.0813392420244471	NaN	NaN	0.069486645139705	0.268763551287763	124	2	874	0.874	0.124	0.248
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0339428319712422	0.0801096377445907	NaN	NaN	0.0775056665521657	0.275845440742118	94	0	906	0.906	0.094	0.188
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0302343980246478	0.0753934291220901	NaN	NaN	0.0734374684384917	0.354161608943055	134	0	866	0.866	0.134	0.268
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0278171494046007	0.076842858102501	NA	NA	0.0717890908765361	0.233691904513784	80	2	918	0.918	0.08	0.16
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.0267646062275876	0.0778293694374344	NA	NA	0.0728443024165203	0.239018361582934	70	3	927	0.927	0.07	0.14
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0267351401676893	0.0754965722566607	NA	NA	0.0699063496578469	0.225506573190586	81	0	919	0.919	0.081	0.162
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0264222914414319	0.0759209733719299	NA	NA	0.0728030025136335	0.268092491456194	78	1	921	0.921	0.078	0.156
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.0265252853562137	0.0744738164514488	NA	NA	0.0686984502404115	0.256898297317578	71	3	926	0.926	0.071	0.142
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.0270838089917336	0.0726272581393412	NA	NA	0.0638839899259077	0.255808235885977	84	2	914	0.914	0.084	0.168
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0261045655214609	0.0736884806326098	NA	NA	0.0637357466446306	0.231008667432341	80	0	920	0.92	0.08	0.16
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0261489956711835	0.0699914300938618	NA	NA	0.0646031523522943	0.237331659897814	91	3	906	0.906	0.091	0.182
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.0256488197509936	0.0711169755570229	NA	NA	0.0670050980797484	0.268058438175734	86	2	912	0.912	0.086	0.172
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0283833414123379	0.072092442670235	NA	NA	0.0662211542027765	0.27630949597849	109	2	889	0.889	0.109	0.218
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0268897978117294	0.0676507135864538	NA	NA	0.060549923065713	0.253194086269803	90	0	910	0.91	0.09	0.18
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0272562449088203	0.0711554159734204	NA	NA	0.0642636006807138	0.260274178740955	85	2	913	0.913	0.085	0.17
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.6666666666667	4	34.66666666666666	0.0412948328872706	0.125290563497375	0.329592522649448	-0.0839957306101041	0.0245996209471471	0.0688249818644294	NA	NA	0.0632453835321099	0.184147492953053	47	2	951	0.951	0.047	0.094
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.9166666666667	4	35.08333333333332	0.0411531794236846	0.123672788927057	0.332758562176172	-0.0825196095033722	0.0242526179104101	0.0703848207894285	NA	NA	0.0605727704518285	0.173096330761452	31	3	966	0.966	0.031	0.062
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.4166666666667	4	34.24999999999999	0.0403232602433046	0.126951325912032	0.317627720337839	-0.086628065668727	0.0223291480106207	0.0688470018813138	NA	NA	0.0629535678009047	0.168802177114496	36	8	956	0.956	0.036	0.072
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.25000000000004	4	33.41666666666666	0.0398765009105086	0.130408872715656	0.305780581337096	-0.0905323718051471	0.0227867315566674	0.0711031425646631	NA	NA	0.0639881123786997	0.157118021508144	25	6	969	0.969	0.025	0.05
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666671	4	33.749999999999986	0.0400540111089283	0.129003442367267	0.310487924771003	-0.0889494312583385	0.02262630244011	0.0703543337060658	NA	NA	0.0615065781613643	0.148127414535238	34	9	957	0.957	0.034	0.068
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	4	34.41666666666666	0.0405961546323978	0.126281753068954	0.321472846597488	-0.0856855984365564	0.0227672224039265	0.0716601461002536	NA	NA	0.0602583782025275	0.155034996882619	37	8	955	0.955	0.037	0.074
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666671	4	34.58333333333332	0.0403232602433046	0.125619222573624	0.320995938497163	-0.0852959623303199	0.0230002316126978	0.0704482982903996	NA	NA	0.0575245147368329	0.138133969378587	29	6	965	0.965	0.029	0.058
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000006	3	33.91666666666666	0.0401433603117784	0.0941180977157372	0.426521161031352	-0.0539747374039588	0.0224081711782967	0.0583190603894133	NA	NA	0.0477682519690623	0.258506105757853	79	12	909	0.909	0.079	0.158
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333339	2	34.249999999999986	0.0267586909940917	0.0607927570603562	0.440162484611862	-0.0340340660662645	0.0187785819774261	0.0463985439264622	NA	NA	0.0452983405770212	0.452453230839373	177	44	779	0.779	0.177	0.354
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.0183554459545455	0.0482106114632961	NA	NA	0.041125565412115	0.438274260321599	157	50	793	0.793	0.157	0.314
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0192836394613329	0.0443535645900721	NA	NA	0.0410251404218577	0.44220750241656	183	54	763	0.763	0.183	0.366
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	2	35.16666666666666	0.013423177093157	0.0591439311842398	0.226957809945747	-0.0457207540910828	0.0133654935689074	0.0455511819380043	NA	NA	0.0366012537466552	0.211607238690816	0	124	876	0.876	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.8333333333334	1	34.83333333333332	0.0406419966354019	0.0292720079293014	1.38842530835471	0.0113699887061005	0.0310052729738669	0.0312462354140259	NA	NA	0.0346505012966865	0.742810759720546	551	122	327	0.327	0.551	0.654
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000007	1	34.16666666666666	0.0402781342288957	0.0298546878003148	1.34913935453953	0.010423446428581	0.0310468151664478	0.0315045391568176	NA	NA	0.0336558016851776	0.756783574475571	542	127	331	0.331	0.542	0.662
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0303579682902818	0.0302260511936202	NA	NA	0.0342603278099993	0.774209452964419	527	138	335	0.335	0.527	0.67
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	1	33.83333333333332	0.0397443976053827	0.0301548153585304	1.31801163869967	0.00958958224685231	0.0292017958698139	0.0315447180221902	NA	NA	0.031430042233761	0.760283294538135	525	148	327	0.327	0.525	0.654
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666674	1	34.16666666666665	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0301342801021065	0.0310263163573573	NA	NA	0.032368203127647	0.755811618392727	514	127	359	0.359	0.514	0.718
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	34.66666666666665	0.0396131668795607	0.029415534864961	1.34667504981345	0.0101976320145997	0.0298412387750111	0.0327547438625605	NA	NA	0.0334457959585981	0.760442114752256	540	142	318	0.318	0.54	0.636
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	34.999999999999986	0.0395261602343306	0.0291298749871979	1.35689426239219	0.0103962852471327	0.0295105974222758	0.0293799186131086	NA	NA	0.0318623630745585	0.744206976383069	547	132	321	0.321	0.547	0.642
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.249999999999986	0.0392674190316604	0.0289192452027623	1.35783001099592	0.0103481738288981	0.0288457645060248	0.0326152059684713	NA	NA	0.0320290799073892	0.746629485565314	540	108	352	0.352	0.54	0.704
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.58333333333332	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0298806541634237	0.0294438535142117	NA	NA	0.034238004629902	0.744785772664471	540	119	341	0.341	0.54	0.682
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666676	1	35.58333333333332	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0299000006831629	0.030531584663007	NA	NA	0.0331911146745112	0.73702943129008	540	134	326	0.326	0.54	0.652
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.91666666666665	0.0392674190316604	0.0283721774047871	1.38401147262793	0.0108952416268733	0.029524868270746	0.029733193985021	NA	NA	0.032187466147916	0.734991475452826	517	149	334	0.334	0.517	0.668
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.91666666666665	0.0396131668795607	0.0275893176123833	1.43581539188851	0.0120238492671774	0.0297989911878501	0.028814315010234	NA	NA	0.0311235092021536	0.699254570202068	562	133	305	0.305	0.562	0.61
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333341	1	36.91666666666665	0.0399650588551815	0.0275893176123833	1.44857003774691	0.0123757412427982	0.0305547868543193	0.0296719079212962	NA	NA	0.0312239961095033	0.691844238651631	532	139	329	0.329	0.532	0.658
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.749999999999986	0.0395261602343306	0.0277167798918218	1.42607331690768	0.0118093803425087	0.0292741025090312	0.0307216897715825	NA	NA	0.0317960833191151	0.710332247882592	526	150	324	0.324	0.526	0.648
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666676	1	35.749999999999986	0.0390120440358434	0.0285069944752382	1.36850779094689	0.0105050495606052	0.0297649470773686	0.0304704292097011	NA	NA	0.0299092908090478	0.725415570793326	546	150	304	0.304	0.546	0.608
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.0284706078644356	0.0336184432318618	NA	NA	0.0313499219306468	0.729361381001972	530	122	348	0.348	0.53	0.696
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.030178504586959	0.0290018351504079	NA	NA	0.0331662975057988	0.743647018046507	535	132	333	0.333	0.535	0.666
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333343	0	35.91666666666665	0.0262321821040851	0	-Inf	0.0262321821040851	0.026673360394995	0	NA	NA	0.0275945706297956	0.341793054278504	615	385	0	0	0.615	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666676	0	35.499999999999986	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0257698400497023	0	NA	NA	0.0271009766476533	0.339891289630115	658	342	0	0	0.658	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.16666666666676	0	35.499999999999986	0.025698445480572	0	-Inf	0.025698445480572	0.0274899103873891	0	NA	NA	0.0270386360108215	0.341891652675424	644	356	0	0	0.644	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.16666666666665	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0257054228312387	0	NA	NA	0.0271585001189541	0.341954685311594	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.83333333333332	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0266708258243126	0	NA	NA	0.0252113564371204	0.305974510151824	659	341	0	0	0.659	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	0	35.99999999999999	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.026402495730228102	0	NA	NA	0.0261861576046509	0.323289039744213	624	376	0	0	0.624	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.25000000000007	0	36.41666666666666	0.0393532888030902	0	-Inf	0.0393532888030902	0.030108296465654	0	NA	NA	0.0293201325411424	0.179533291273136	859	141	0	0	0.859	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666674	0	36.74999999999999	0.0405961546323977	0	-Inf	0.0405961546323977	0.0295182900397636	0	NA	NA	0.0301233341496657	0.177766244705542	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25000000000007	0	36.74999999999999	0.0415331021017154	0	-Inf	0.0415331021017154	0.0298670917446894	0	NA	NA	0.0314110157779808	0.186086119335046	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.25000000000007	0	36.91666666666666	0.0415331021017154	0	-Inf	0.0415331021017154	0.0325661742225454	0	NA	NA	0.0312756477615445	0.184188227546769	856	144	0	0	0.856	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.25000000000007	0	35.91666666666666	0.0409658133601688	0	-Inf	0.0409658133601688	0.031135062199486	0	NA	NA	0.0320234857040726	0.20081157005956	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666674	0	35.74999999999999	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0299304831928112	0	NA	NA	0.0297471102814425	0.169439185020091	848	152	0	0	0.848	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000007	0	35.41666666666666	0.040687942312311	0	-Inf	0.040687942312311	0.0308775915704048	0	NA	NA	0.030550034538583	0.18291078775903	852	148	0	0	0.852	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000007	0	35.08333333333333	0.0401433603117784	0	-Inf	0.0401433603117784	0.0293954001261857	0	NA	NA	0.03139769532255	0.201057396499543	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666673	0	34.24999999999999	0.0400540111089283	0	-Inf	0.0400540111089283	0.0309381163501978	0	NA	NA	0.0308498144749138	0.194165372228882	861	139	0	0	0.861	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.41666666666673	0	34.74999999999999	0.0403232602433046	0	-Inf	0.0403232602433046	0.0313421418010798	0	NA	NA	0.0308664022261717	0.191423256903358	869	131	0	0	0.869	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.0833333333334	1	34.41666666666666	0.0399650588551815	0.0296334842053817	1.34864528849171	0.0103315746497998	0.0287155870368762	0.0321976938947701	NA	NA	0.0406784012450728	0.799509598151377	564	49	387	0.387	0.564	0.774
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.75000000000007	1	33.75	0.0390967990762099	0.0302307926160697	1.29327734051629	0.00886600646014027	0.0275407274862004	0.0319572678690542	NA	NA	0.0434068766421542	0.838155405842536	541	37	422	0.422	0.541	0.844
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.0833333333334	1	33.416666666666664	0.0389276557511924	0.0305385697640887	1.27470461295043	0.00838908598710373	0.02921859774678	0.0358045095401905	NA	NA	0.0471239740582858	0.858706000227035	575	45	380	0.38	0.575	0.76
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCC:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.41666666666674	1	33.083333333333336	0.038759969965707	0.0308526791703671	1.25629186858218	0.00790729079533987	0.0289625604432779	0.0322284057089599	NA	NA	0.0442263631611387	0.858101544288868	551	41	408	0.408	0.551	0.816
N	all	ss13	256	TCC	CAT	CCA	2	GCATCCAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5833333333334	1	33.41666666666667	0.0386766677741952	0.0305385697640887	1.26648589220037	0.00813809801010655	0.0291045007899209	0.0315610147667321	NA	NA	0.0427059732957956	0.848869455343206	561	56	383	0.383	0.561	0.766
N	all	ss13	257	AAA	CCA	AAA	2	TCCAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.0833333333334	1	32.91666666666667	0.038428896281493	0.0310121698640216	1.2391553525597	0.00741672641747135	0.0281442478759746	0.0335165756405459	NA	NA	0.0441204995161966	0.866503353213464	556	38	406	0.406	0.556	0.812
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.3333333333334	1	31.66666666666667	0.0378231402201689	0.0322630388127681	1.17233656877976	0.00556010140740078	0.0270017762915638	0.0357723168244525	NA	NA	0.0449465744607784	0.901549109605091	546	40	414	0.414	0.546	0.828
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	1	31.83333333333334	0.0379827996140662	0.0320904564039067	1.18361668453684	0.00589234321015945	0.0275928364736893	0.0339508008750102	NA	NA	0.0449288901372602	0.895658069848394	540	55	405	0.405	0.54	0.81
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	1	31.83333333333334	0.0379827996140662	0.0320904564039067	1.18361668453684	0.00589234321015945	0.0271756399821617	0.0329923492263133	NA	NA	0.0477820616306128	0.9018560345152	516	51	433	0.433	0.516	0.866
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000006	1	32.25000000000001	0.0381034317265945	0.03166697281676	1.20325463210768	0.00643645890983444	0.0289186431558446	0.0334347316140035	NA	NA	0.0441638651899872	0.884126335637576	560	44	396	0.396	0.56	0.792
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000006	1	32.25000000000001	0.0381034317265945	0.03166697281676	1.20325463210768	0.00643645890983444	0.0280813087381139	0.0342407312701625	NA	NA	0.0437488837122491	0.883035082331895	555	49	396	0.396	0.555	0.792
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.58333333333339	1	32.75000000000001	0.0386766677741952	0.0311733183159379	1.24069781029443	0.00750334945825736	0.0283091732580405	0.0331789883935563	NA	NA	0.0457464983230372	0.869715247817225	542	38	420	0.42	0.542	0.84
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC:CGTACTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.58333333333339	1	33.75	0.0391819232689515	0.0302307926160697	1.29609315132954	0.0089511306528819	0.0292383921964985	0.031783208876033	NA	NA	0.0438677923412705	0.838316071948877	563	40	397	0.397	0.563	0.794
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACT:ACTGCTACA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000004	1	33.08333333333334	0.0388436318463037	0.030852679170367	1.25900352548999	0.00799095267593664	0.0299079065883395	0.0346177778035864	NA	NA	0.0467616160543645	0.864312612187353	542	50	408	0.408	0.542	0.816
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACTAAA:GCTACAAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	1	32.583333333333336	0.0382654718118908	0.0313361505112163	1.22112867048536	0.00692932130067454	0.0284141346252046	0.0331299736583522	NA	NA	0.0433878771503881	0.873112365732684	535	56	409	0.409	0.535	0.818
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.08333333333339	1	32.416666666666664	0.0379427585051849	0.031500692980973	1.20450551764379	0.00644206552421184	0.0299153642101961	0.0329181044501896	NA	NA	0.0455023693265767	0.88741454178800006	528	43	429	0.429	0.528	0.858
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	1	32.666666666666664	0.0383879094086674	0.0312545223004261	1.22823535870021	0.00713338710824131	0.0287181640002296	0.0346553263625384	NA	NA	0.0426321143466146	0.867114914232231	563	50	387	0.387	0.563	0.774
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.66666666666671	1	32.833333333333336	0.0125002893639087	0.0310925352587596	0.402035062753111	-0.0185922458948509	0.01277344959731	0.0326119376454588	NA	NA	0.0364625882072459	0.610122056742618	242	129	629	0.629	0.242	0.484
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000004	1	33	0.0125263872134486	0.0309322189005369	0.404962452054521	-0.0184058316870882	0.0127901390919539	0.0313048406567746	NA	NA	0.0353771548088956	0.602872263258948	272	127	601	0.601	0.272	0.544
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.1666666666667	1	32.666666666666664	0.0125789112103712	0.0312545223004261	0.402466916290053	-0.0186756110900549	0.0122080071322963	0.0331823077149097	NA	NA	0.0376829753916875	0.620177992024257	273	118	609	0.609	0.273	0.546
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.83333333333337	1	33.5	0.0126318775458731	0.0304610393656427	0.414689643194537	-0.0178291618197696	0.0123021511040917	0.0317508649667866	NA	NA	0.0351664273559339	0.612159145240776	268	122	610	0.61	0.268	0.536
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.50000000000004	1	32.83333333333333	0.0125263872134486	0.0310925352587596	0.402874423368856	-0.018566148045311	0.0120721605507751	0.0318660646531406	NA	NA	0.0343171902431294	0.588496573651747	250	136	614	0.614	0.25	0.5
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333337	1	33.33333333333333	0.0125525942666428	0.0306164958901914	0.409994478521113	-0.0180639016235486	0.0120532036838523	0.0329910520943458	NA	NA	0.0351755780553508	0.607576912850943	237	125	638	0.638	0.237	0.474
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333337	1	33	0.0123969764634079	0.0309322189005369	0.400778764151083	-0.0185352424371289	0.0121625821371117	0.0329728396980486	NA	NA	0.0361303603457059	0.607944204104472	283	102	615	0.615	0.283	0.566
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333337	1	32.49999999999999	0.0123969764634079	0.0314182062818701	0.394579383437355	-0.0190212298184622	0.0122157984352347	0.0331932981328735	NA	NA	0.0358517754612925	0.595729291841253	259	125	616	0.616	0.259	0.518
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000004	1	32.83333333333333	0.0124484185567784	0.0310925352587596	0.400366790716152	-0.0186441167019812	0.0129637646610168	0.0322647120212444	NA	NA	0.0352575222494826	0.596945399325881	277	135	588	0.588	0.277	0.554
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000004	1	32.666666666666664	0.0124484185567784	0.0312545223004261	0.398291755577678	-0.0188061037436477	0.0123579033444703	0.0332094567973493	NA	NA	0.0351541750258298	0.592677000471562	267	129	604	0.604	0.267	0.534
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333337	1	33.33333333333333	0.0125525942666428	0.0306164958901914	0.409994478521113	-0.0180639016235486	0.0123397606984591	0.0327201141586103	NA	NA	0.0356606564554743	0.612470675403373	265	115	620	0.62	0.265	0.53
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.33333333333337	1	33.33333333333333	0.0125525942666428	0.0306164958901914	0.409994478521113	-0.0180639016235486	0.0129828855657936	0.0321361081443713	NA	NA	0.0346708871802867	0.602359349193933	237	134	629	0.629	0.237	0.474
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000004	1	32.666666666666664	0.0124484185567784	0.0312545223004261	0.398291755577678	-0.0188061037436477	0.0122488322983067	0.0343192692320331	NA	NA	0.0358046895987461	0.599415418419287	272	124	604	0.604	0.272	0.544
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.1666666666667	1	32.83333333333333	0.0124226442537559	0.0310925352587596	0.399537836023074	-0.0186698910050037	0.0127174521536814	0.0344970421944577	NA	NA	0.0360315497486743	0.604350838522255	265	130	605	0.605	0.265	0.53
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.50000000000003	1	33.49999999999999	0.0128482799476378	0.0304610393656427	0.42179387884346	-0.0176127594180049	0.0128268844725907	0.0333697688245287	NA	NA	0.0350974264449559	0.615790758287024	274	124	602	0.602	0.274	0.548
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333336	1	33.166666666666664	0.0129592857062641	0.0307735475083969	0.421117705156614	-0.0178142618021327	0.0129550660820711	0.0345799501611152	NA	NA	0.036319882791138	0.623792609783667	289	112	599	0.599	0.289	0.578
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.16666666666669	1	33.166666666666664	0.0130722263514627	0.0307735475083969	0.424787761238637	-0.0177013211569341	0.0133418076463885	0.031671161232253	NA	NA	0.035876954622654	0.62173723356637	253	137	610	0.61	0.253	0.506
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666669	2	33.49999999999999	0.0263763446044989	0.0622118122355632	0.423976470973481	-0.0358354676310643	0.019214389802264	0.0490242153086512	NA	NA	0.0434696941150437	0.40972470497133	147	51	802	0.802	0.147	0.294
N	all	ss13	287	TTC	ACT	TCG	2	AACTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.66666666666669	2	33.33333333333333	0.026551445288187	0.0625362067042884	0.424577163973814	-0.0359847614161014	0.0196573856288496	0.0465198064620448	NA	NA	0.0417471259791791	0.388704142215938	152	44	804	0.804	0.152	0.304
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.50000000000001	2	33	0.0266103300115572	0.0631952577133049	0.421081121818967	-0.0365849277017477	0.0192997878729411	0.0501225794349547	NA	NA	0.0404922243972801	0.366257929268143	142	42	816	0.816	0.142	0.284
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.00000000000003	2	33.5	0.0267885619515594	0.0622118122355632	0.430602501179765	-0.0354232502840038	0.0190909281960051	0.0476183209346426	NA	NA	0.0400544999143246	0.37649311432338	142	51	807	0.807	0.142	0.284
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.25000000000003	2	33.25	0.026699148503671	0.0626996766264699	0.425825936276032	-0.0360005281227989	0.0189186082879109	0.0476465817457381	NA	NA	0.0408398665748413	0.378044793531201	139	42	819	0.819	0.139	0.278
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.4166666666667	2	32.08333333333333	0.0262896575662818	0.0650814580158656	0.40395003996181	-0.0387918004495839	0.018533703739124	0.0493500056486032	NA	NA	0.0435393286616676	0.372950627409065	148	50	802	0.802	0.148	0.296
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	77.83333333333336	2	31.666666666666664	0.0129592857062641	0.0659765797094679	0.196422514827704	-0.0530172940032037	0.0135341651208684	0.0488622373073891	NA	NA	0.0428147878812025	0.215607075893388	0	116	884	0.884	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.1666666666667	2	31.333333333333332	0.0125789112103712	0.0667106145123721	0.188559366486397	-0.054131703302001	0.0124847637159119	0.0478569158588642	NA	NA	0.0461136666669748	0.240444898968269	0	149	851	0.851	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.83333333333337	2	32.33333333333333	0.0124743000368564	0.0645559565784323	0.193232363022935	-0.0520816565415758	0.0128965110472608	0.0506417186736978	NA	NA	0.04506362911826	0.247789175628403	0	134	866	0.866	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	2	32.166666666666664	0.0123714145268331	0.0649053422482923	0.190607030150258	-0.0525339277214592	0.0124853894826995	0.0515830945027805	NA	NA	0.0422247161490803	0.213443951169154	0	150	850	0.85	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	1	80.16666666666669	2	32.83333333333333	0.0125789112103712	0.0635300231041221	0.197999474827123	-0.0509511118937509	0.0128622170808517	0.0473168557098132	NA	NA	0.0396653348089365	0.198958342227125	0	129	871	0.871	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.16666666666669	2	32.5	0.0379028017472667	0.0642103145422439	0.590291482256025	-0.0263075127949771	0.0288169127013563	0.0491987750244968	NA	NA	0.0497733352503258	0.597120212041416	261	42	697	0.697	0.261	0.522
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333336	2	32.33333333333333	0.0378231402201689	0.0645559565784323	0.585896983405639	-0.0267328163582634	0.0266772638401432	0.0486728539157273	NA	NA	0.0475685533002163	0.574126197059978	228	48	724	0.724	0.228	0.456
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333336	2	32.33333333333333	0.0378231402201689	0.0645559565784323	0.585896983405639	-0.0267328163582634	0.0295042138426964	0.0498285598956458	NA	NA	0.0483792802977142	0.580559624376505	277	55	668	0.668	0.277	0.554
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT:TACAAATAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	2	31.999999999999996	0.0373521168628637	0.0652585327422224	0.572371386442417	-0.0279064158793587	0.0274300261425284	0.0500795230574529	NA	NA	0.0500115745517263	0.576844967473164	254	43	703	0.703	0.254	0.508
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG:AAATATTGG	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	3	31.749999999999996	0.0500707265730996	0.100992663859693	0.495785779476635	-0.0509219372865932	0.0292322038311224	0.0639795531508246	NA	NA	0.0574467951761449	0.375391723039484	140	18	842	0.842	0.14	0.28
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG:TATTGGCCG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.91666666666669	2	32.08333333333333	0.0504922483436096	0.0650814580158656	0.775831548385111	-0.014589209672256	0.0305184500515686	0.0479755821998849	NA	NA	0.0406615343330308	0.71974745133678	343	47	610	0.61	0.343	0.686
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	32.416666666666664	0.0511380136321413	0.0643826713791054	0.7942822585137	-0.0132446577469642	0.0317912480001193	0.048495107501120203	NA	NA	0.0415522716674399	0.749918447729808	332	47	621	0.621	0.332	0.664
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	31.416666666666664	0.0507056829412418	0.0665255778124882	0.762198309410599	-0.0158198948712465	0.0308636753185955	0.0493125351018625	NA	NA	0.0420174246281656	0.706539298188127	308	37	655	0.655	0.308	0.616
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.41666666666669	2	30.416666666666664	0.051467132797986	0.0688161477015357	0.747893256408443	-0.0173490149035498	0.0311225420218972	0.0534674682398398	NA	NA	0.0421849910159787	0.680881627338759	331	49	620	0.62	0.331	0.662
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.25000000000003	2	29.749999999999996	0.0515777829948789	0.0704329495874262	0.732296223528975	-0.0188551665925473	0.0311725769225325	0.0505548633049955	NA	NA	0.0444480566697428	0.671415023278521	338	47	615	0.615	0.338	0.676
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.50000000000003	2	30.166666666666664	0.0514119856124207	0.0694136680239339	0.740660839226849	-0.0180016824115131	0.0317803251431515	0.049781328502541	NA	NA	0.0418830945117562	0.667335428908909	301	50	649	0.649	0.301	0.602
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.16666666666669	2	30.499999999999996	0.0516332867726302	0.0686192553184994	0.752460610844171	-0.0169859685458692	0.0313398334365466	0.0529674849802129	NA	NA	0.0426592066281179	0.690498792036024	330	47	623	0.623	0.33	0.66
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	79.66666666666669	2	31	0.0519688353535439	0.0674611774972046	0.770351738311969	-0.0154923421436608	0.0322495823587384	0.0512542591826403	NA	NA	0.0421184234946153	0.713001371456465	334	44	622	0.622	0.334	0.668
N	all	ss13	310	CCC	CCC	CCA	2	GCCCCCAGC:GCTCCGAGT	1:1	FALSE	0.75	1	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	31	0.0515223984646761	0.0674611774972046	0.763734052326778	-0.0159387790325285	0.0314485862296924	0.049556806491314	NA	NA	0.0421562152169329	0.705364871191502	310	40	650	0.65	0.31	0.62
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT:CCGAGTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.75	0.0513569565272317	0.0680352852661241	0.754857664318535	-0.0166783287388925	0.0303912892734193	0.049774856981785597	NA	NA	0.0398874769407682	0.675848809231843	338	52	610	0.61	0.338	0.676
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.58333333333336	2	30.083333333333332	0.0513569565272317	0.0696151556756318	0.737726663523195	-0.0182581991484001	0.0324392918293862	0.0515092862978676	NA	NA	0.0429823597026362	0.670994473808734	301	35	664	0.664	0.301	0.602
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.25000000000001	2	30.083333333333332	0.0509209303034166	0.0696151556756318	0.731463282804107	-0.0186942253722152	0.0306527414381674	0.0510299458571051	NA	NA	0.0425791472438017	0.660627846694972	309	48	643	0.643	0.309	0.618
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.050280603697972	0.0721276112438599	0.697106182096836	-0.0218470075458879	0.0311790606591268	0.0554445811859316	NA	NA	0.0425781360901122	0.607878645834158	259	53	688	0.688	0.259	0.518
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.25000000000003	2	28.75	0.0496561870198999	0.073005919868405	0.680166582510109	-0.0233497328485051	0.0306635684081043	0.053032556104638	NA	NA	0.0456665922987391	0.60913480810824	266	46	688	0.688	0.266	0.532
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000003	2	29.083333333333336	0.050280603697972	0.0721276112438599	0.697106182096836	-0.0218470075458879	0.0306988917899851	0.0540614845923894	NA	NA	0.0441046205896653	0.620356543036185	284	39	677	0.677	0.284	0.568
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.416666666666668	0.0501754455827152	0.0739059002893285	0.678909875751289	-0.0237304547066133	0.0303691422108884	0.0542626934357835	NA	NA	0.04606974143911	0.606484190917015	267	42	691	0.691	0.267	0.534
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.75	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0313793524166685	0.0557200353877792	NA	NA	0.0468261193042511	0.578507692358035	243	39	718	0.718	0.243	0.486
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.031024221292364	0.0567958068446726	NA	NA	0.0486381157346863	0.603984623654155	250	53	697	0.697	0.25	0.5
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0501754455827152	0.0748283653087125	0.670540447806269	-0.0246529197259974	0.0308147742444614	0.0559392282037395	NA	NA	0.0470418394586969	0.600234245841821	235	40	725	0.725	0.235	0.47
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.029368049715923	0.0567913450428689	NA	NA	0.0476205304711668	0.615166118155843	274	42	684	0.684	0.274	0.548
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0495536228075988	0.075298294736773	0.658097543653914	-0.0257446719291742	0.0296620752196786	0.0559377605213462	NA	NA	0.0462713327430233	0.57794774317457	275	41	684	0.684	0.275	0.55
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.0298600974923446	0.0546999699795916	NA	NA	0.0450176725369192	0.561308464490275	237	43	720	0.72	0.237	0.474
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.0306065802174623	0.0557560691729747	NA	NA	0.0441297579705117	0.556528697637629	255	49	696	0.696	0.255	0.51
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0499664439235005	0.0725641058409195	0.688583471737951	-0.022597661917419	0.0315944725372195	0.0557083693890731	NA	NA	0.0449358061842617	0.615043265406624	263	44	693	0.693	0.263	0.526
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.0498108321742552	0.0714826348532436	0.696824232577865	-0.0216718026789884	0.031786889202161	0.0527457874249768	NA	NA	0.0443342447149208	0.62496375244695	309	49	642	0.642	0.309	0.618
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0493497606808473	0.071696340510766	0.688316311952309	-0.0223465798299186	0.0290358009780859	0.0542515768719675	NA	NA	0.0422777336875897	0.597106432476824	296	47	657	0.657	0.296	0.592
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0495536228075988	0.108952531416164	0.454818462347788	-0.0593989086085652	0.0305191361075593	0.0712158015795935	NA	NA	0.0600327978153986	0.322447446618747	143	18	839	0.839	0.143	0.286
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0491475696448996	0.108952531416164	0.451091580948878	-0.0598049617712643	0.0307232843358519	0.0652664477774817	NA	NA	0.0622320458021261	0.33655244451666	129	13	858	0.858	0.129	0.258
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.11306631811959	0.425953340236639	-0.0649053422482923	0.03005076793831	0.0723961151092631	NA	NA	0.0635126097756449	0.306814770593103	119	16	865	0.865	0.119	0.238
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.154888999008431	0.310938647545113	-0.106728023137133	0.0296298141100486	0.0856129502799548	NA	NA	0.0823778858155218	0.19511653323568	50	2	948	0.948	0.05	0.1
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0485508200337835	0.152908411727716	0.317515691159214	-0.104357591693933	0.0292777471393456	0.0884992414107346	NA	NA	0.0808438936872348	0.196754616994555	42	8	950	0.95	0.042	0.084
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0599719947335073	0.154888999008431	0.387193377950896	-0.0949170042749234	0.0327336349056169	0.0911261706778575	NA	NA	0.0836166559542224	0.25631469304961	96	2	902	0.902	0.096	0.192
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0329465779591967	0.0835646139536446	NaN	NaN	0.0833136028669755	0.272185241686637	91	0	909	0.909	0.091	0.182
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.032633528489484	0.0848484856332015	NA	NA	0.0793025886572394	0.248671738862477	87	1	912	0.912	0.087	0.174
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.08333333333337	3	29.91666666666667	0.0473997786251612	0.107647107231784	0.440325614353027	-0.0602473286066223	0.0281399325780245	0.0668074002511249	NA	NA	0.0696243092590679	0.386863008473487	193	9	798	0.798	0.193	0.386
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	86.91666666666671	3	30.250000000000004	0.0474936093526965	0.106372646579413	0.44648329133411	-0.0588790372267168	0.0294899101930491	0.0667364809844761	NA	NA	0.0661608501082781	0.373499319390322	158	11	831	0.831	0.158	0.316
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.00000000000006	3	29.83333333333334	0.0468902677360004	0.107970516691131	0.43428770346759	-0.0610802489551308	0.0289409376674842	0.0712496740202348	NA	NA	0.0687308348515826	0.374170932272939	174	5	821	0.821	0.174	0.348
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.83333333333339	3	29.666666666666668	0.0464364923107347	0.108623210908842	0.427500641181606	-0.0621867185981073	0.0279355409246171	0.0677381099148609	NA	NA	0.0720217710344611	0.387893758707642	163	7	830	0.83	0.163	0.326
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0289530351526148	0.0660330631302703	NA	NA	0.0729412146406679	0.385378061267034	178	7	815	0.815	0.178	0.356
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0286561890113944	0.071925478148573	NA	NA	0.0717785909226137	0.3777284025924	145	6	849	0.849	0.145	0.29
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.58333333333339	3	29.583333333333336	0.0709889121664901	0.108952531416164	0.651558171653076	-0.0379636192496739	0.0392721784250661	0.0692142278244517	NA	NA	0.0757781813280214	0.616382728396551	286	3	711	0.711	0.286	0.572
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.91666666666671	3	30.583333333333336	0.0724180213610206	0.105128058952294	0.68885530735313	-0.0327100375912736	0.039151509560843	0.0659488433438555	NA	NA	0.0721690429953079	0.650374530067737	318	1	681	0.681	0.318	0.636
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.25000000000006	3	30.583333333333336	0.0739059002893284	0.105128058952294	0.703008321716146	-0.0312221586629658	0.0390202182847368	0.0625205569869822	NA	NA	0.0707243406274816	0.658878056138597	340	2	658	0.658	0.34	0.68
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.91666666666671	3	30.25	0.075140996593953	0.106372646579413	0.70639397448719	-0.0312316499854603	0.0405234575485421	0.0713561054993581	NaN	NaN	0.0711136356649816	0.660531487753132	316	1	683	0.683	0.316	0.632
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.58333333333339	3	30.583333333333336	0.0754562533850991	0.105128058952294	0.717755603376452	-0.0296718055671951	0.0416582970304885	0.0697929630756217	NA	NA	0.07379799624927	0.687634054059394	333	1	666	0.666	0.333	0.666
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000006	3	30.75	0.0499664439235005	0.104516640682884	0.478071660139795	-0.054550196759383	0.0309694321403234	0.0701405262624377	NA	NA	0.0681622932395639	0.423537738344352	194	2	804	0.804	0.194	0.388
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333339	3	30.916666666666668	0.0500707265730995	0.103912304538584	0.481855606950837	-0.0538415779654844	0.0309372657543256	0.0673021207998502	NA	NA	0.0689074020055222	0.434590019355643	178	8	814	0.814	0.178	0.356
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333339	3	31.249999999999996	0.0507056829412418	0.102724391304868	0.493608989035099	-0.0520187083636263	0.0315551913835484	0.0640977580019812	NA	NA	0.0692264415451885	0.452394927071298	206	2	792	0.792	0.206	0.412
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.08333333333339	3	32.083333333333336	0.0516889101836222	0.0998703029515669	0.51756036235005	-0.0481813927679447	0.031837243836012	0.0618661717079763	NA	NA	0.0675658544669158	0.475782213271967	202	10	788	0.788	0.202	0.404
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.16666666666671	2	32	0.0383879094086674	0.0652585327422224	0.58824352610414	-0.026870623333555	0.029051050513222	0.0479127429562838	NA	NA	0.055996000455051	0.631322087290501	331	11	658	0.658	0.331	0.662
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.00000000000006	3	32	0.0379827996140662	0.100148544468392	0.379264619527785	-0.0621657448543258	0.0285545692508482	0.0588882588746973	NA	NA	0.0720781422334575	0.388425046415578	143	6	851	0.851	0.143	0.286
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.3333333333334	3	31	0.0373521168628637	0.103612753860613	0.360497288906271	-0.0662606369977492	0.0289160668466435	0.0675546201791868	NA	NA	0.0749416084746352	0.376607943121362	181	4	815	0.815	0.181	0.362
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.3333333333334	3	31	0.0368926831430787	0.103612753860613	0.356063146364292	-0.0667200707175341	0.0284809385971006	0.0678582615099428	NA	NA	0.0734259994593393	0.363523856921822	174	1	825	0.825	0.174	0.348
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.8333333333334	3	31.666666666666668	0.0362243442097796	0.101277212852957	0.357675168869163	-0.0650528686431775	0.0277451278344731	0.0639690478552213	NA	NA	0.0716594988870384	0.363981128993384	155	6	839	0.839	0.155	0.31
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.16666666666673	3	32.66666666666667	0.0365183693771989	0.0979651368127982	0.372769033610212	-0.0614467674355992	0.0277750906748767	0.0661862546934383	NA	NA	0.0681358151694527	0.367148387508199	167	5	828	0.828	0.167	0.334
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.91666666666673	3	32.66666666666667	0.0492484575638286	0.0979651368127982	0.502714120207248	-0.0487166792489696	0.0299116362446506	0.0657461912231586	NA	NA	0.0706043302294605	0.490196936094988	244	0	756	0.756	0.244	0.488
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.25000000000007	3	32.333333333333336	0.0490470943757948	0.0990447915097998	0.495201147159182	-0.049997697134005	0.0306833119155615	0.0603759205673154	NA	NA	0.0701466435886367	0.475994498049272	217	6	777	0.777	0.217	0.434
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.91666666666674	4	31.333333333333332	0.0486492695564959	0.139939466685309	0.347645097618506	-0.0912901971288132	0.0300931676118529	0.0849742652128456	NaN	NaN	0.0850120027808804	0.282889610519592	109	0	891	0.891	0.109	0.218
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.25000000000009	4	31	0.0484527683011411	0.141595553474679	0.342191312595178	-0.0931427851735379	0.0307661334095661	0.0824802444489046	NA	NA	0.0903650363770189	0.302663137518413	112	0	888	0.888	0.112	0.224
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.75000000000009	4	30.166666666666668	0.0725641058409195	0.145913043990275	0.497310616354189	-0.0733489381493554	0.0378265552460534	0.0872433895811582	NaN	NaN	0.0901077390139738	0.415637076466215	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.58333333333341	4	30.333333333333332	0.0727107813493273	0.145028544735405	0.501354967616778	-0.0723177633860774	0.0373876680499291	0.0825886507907495	NaN	NaN	0.0981285129565134	0.461140635487145	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.91666666666674	4	30.333333333333332	0.0742108490399044	0.145028544735405	0.511698225858208	-0.0708176956955004	0.0412387549277723	0.0870789355189778	NaN	NaN	0.0995393021525867	0.476802566668843	208	0	792	0.792	0.208	0.416
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.0833333333334	4	30.833333333333332	0.0749843548189803	0.142438427764417	0.526433463187329	-0.0674540729454368	0.0389061723226461	0.0863247713576442	NaN	NaN	0.0955736174109743	0.480324146410546	228	0	772	0.772	0.228	0.456
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.75000000000007	4	30.5	0.0772386109180751	0.144154737019872	0.535803488077034	-0.0669161261017973	0.0406339909470975	0.0851211984717144	NaN	NaN	0.0941158681673106	0.477085922455216	208	0	792	0.792	0.208	0.416
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	6	80.75000000000007	4	29.5	0.078246792038373	0.149561992614941	0.523172971089155	-0.0713152005765681	0.0435859953226292	0.0896000599028739	NaN	NaN	0.106550254203914	0.503297450201719	197	0	803	0.803	0.197	0.394
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.25000000000007	5	30.33333333333334	0.0927309624185634	0.186134722106651	0.498192714228948	-0.0934037596880874	0.042252301739253	0.100487939555498	NaN	NaN	0.109119965195027	0.392012634482926	177	0	823	0.823	0.177	0.354
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.25000000000007	5	31.333333333333336	0.093977517058638	0.179422266799376	0.523778451443381	-0.0854447497407376	0.0476493352507246	0.0904148994600543	NaN	NaN	0.102444748413483	0.40424891834412	193	0	807	0.807	0.193	0.386
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	78.75000000000007	5	31.833333333333336	0.094613463995175	0.176245193423779	0.536828620158044	-0.0816317294286041	0.0465278406200398	0.0880602124317424	NaN	NaN	0.103209038661375	0.428981422919536	165	0	835	0.835	0.165	0.33
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	32	0.0961313950679981	0.175211138386129	0.548660296105974	-0.0790797433181307	0.0445714222860947	0.090822608573166	NaN	NaN	0.102463621156968	0.44024260134992	202	0	798	0.798	0.202	0.404
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.58333333333341	5	31.333333333333332	0.0961313950679981	0.179422266799376	0.535782970435265	-0.0832908717313774	0.0464657713055585	0.0879962744291294	NaN	NaN	0.106488396237401	0.434121058011461	179	0	821	0.821	0.179	0.358
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.08333333333341	5	31.833333333333332	0.0967969709734608	0.176245193423779	0.549217650099052	-0.0794482224503183	0.0464674509935453	0.0925885680177366	NaN	NaN	0.104245449487784	0.445984491526683	206	0	794	0.794	0.206	0.412
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.41666666666674	5	31.833333333333332	0.097698896128426	0.176245193423779	0.554335095502493	-0.0785462972953531	0.0474270716817278	0.0938809060531241	NaN	NaN	0.107938278299137	0.466799450279187	197	0	803	0.803	0.197	0.394
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTA	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTACCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MK211377.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666673	1	34.33333333333333	0	0.0297068535712844	0	-0.0297068535712844	0	0.0324676452261901	NA	NA	0.0327678508064181	0.364626110492155	0	348	652	0.652	0	0.001
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.00000000000006	1	34.49999999999999	0	0.0295604764056575	0	-0.0295604764056575	0	0.0308437976760919	NA	NA	0.0333807480327168	0.375857562079715	0	337	663	0.663	0	0.001
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.33333333333339	1	34.49999999999999	0	0.0295604764056575	0	-0.0295604764056575	0	0.032321558504068	NA	NA	0.0308373224912793	0.337763249530549	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333339	1	34.83333333333333	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0292151946918148	NA	NA	0.033443511457137	0.381428547927739	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.33333333333339	1	35.83333333333333	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.0312283658953509	NA	NA	0.0303590383914186	0.348877053755459	0	349	651	0.651	0	0.001
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	0	CCCCAA---	2	FALSE	0	0	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.66666666666671	1	36.49999999999999	0	0.0279101972553257	0	-0.0279101972553257	0	0.0283646669623299	NA	NA	0.0302731741583966	0.356557338983426	0	380	620	0.62	0	0.001
N	all	ss13	8	---	NA	NA	0	CAA---AAC:CAA---AAT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666671	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0313950623215431	NA	NA	0.0311721718976463	0.347708698583653	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	0	---AACCAA:---AATCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666671	1	35.83333333333332	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.0325988778112595	NA	NA	0.0310972207616025	0.360436988701294	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	10	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACGA:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666671	1	35.83333333333332	0	0.0284394261467203	0	-0.0284394261467203	0	0.0312469779856205	NA	NA	0.0312123851850683	0.362211932826625	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGAAAT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333339	1	35.41666666666666	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0298116289772185	NA	NA	0.0289573984180259	0.320275734832283	0	343	657	0.657	0	0.001
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.58333333333339	1	35.41666666666666	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0318630519713002	NA	NA	0.0319379124610982	0.367514233367265	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.58333333333339	1	36.41666666666666	0	0.0279752710599065	0	-0.0279752710599065	0	0.0306287227445943	NA	NA	0.0298312529205074	0.348355436056904	0	339	661	0.661	0	0.001
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.75000000000006	1	36.91666666666666	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0289352935322166	NA	NA	0.0298062830692573	0.354643044549169	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.41666666666671	1	36.91666666666666	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0284412000302278	NA	NA	0.0267063218887497	0.301574336404316	0	350	650	0.65	0	0.001
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.08333333333337	1	37.249999999999986	0	0.0273378783823658	0	-0.0273378783823658	0	0.0292251005337611	NA	NA	0.0286427766097985	0.339859789089149	0	381	619	0.619	0	0.001
N	all	ss13	17	ACG	TTA	CGT	2	ATTACGTTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333339	1	36.41666666666666	0	0.0279752710599065	0	-0.0279752710599065	0	0.0302953850050243	NA	NA	0.0307907797243957	0.363582424867857	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	18	TTT	CGT	TTG	2	ACGTTTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.25000000000004	1	36.41666666666666	0	0.0279752710599065	0	-0.0279752710599065	0	0.0302776192829509	NA	NA	0.0302714675167066	0.355410040660227	0	392	608	0.608	0	0.001
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.08333333333337	1	36.08333333333332	0	0.0282386296527663	0	-0.0282386296527663	0	0.0297499558412613	NA	NA	0.0304762989585671	0.35414633766492	0	404	596	0.596	0	0.001
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.4166666666667	1	36.24999999999999	0	0.0281063333749098	0	-0.0281063333749098	0	0.0308833076758794	NA	NA	0.0310182286454645	0.364870701938221	0	351	649	0.649	0	0.001
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCT	2	GGACCCTCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.9166666666667	1	35.74999999999999	0	0.0285069944752381	0	-0.0285069944752381	0	0.029365545846311	NA	NA	0.0298007260777146	0.338775628976338	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	22	TCA	CCT	CAG	2	CCCTCAGAT	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.9166666666667	1	35.41666666666666	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0320071156931435	NA	NA	0.0308504702806872	0.350869829260258	0	380	620	0.62	0	0.001
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	TCAGATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.58333333333337	1	34.74999999999999	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0328984248896065	NA	NA	0.0336686738892192	0.383459378015852	0	379	621	0.621	0	0.001
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000004	1	35.41666666666666	0	0.0287805096612113	0	-0.0287805096612113	0	0.0304667625922433	NA	NA	0.028744355579732	0.316702198687762	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGGC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.33333333333337	1	35.33333333333332	0	0.028849710620847	0	-0.028849710620847	0	0.0330679148950863	NA	NA	0.0316854041188195	0.362556383414607	0	340	660	0.66	0	0.001
N	all	ss13	26	GGC	CTG	GCA	2	ACTGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000004	1	35.66666666666666	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0302581942008295	NA	NA	0.0280547341571585	0.308421135057193	0	354	646	0.646	0	0.001
N	all	ss13	27	AGT	GCA	GTA	2	GGCAGTAAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.33333333333337	1	34.99999999999999	0	0.0291298749871979	0	-0.0291298749871979	0	0.0312937057860115	NA	NA	0.0302459183931037	0.335496827765368	0	377	623	0.623	0	0.001
N	all	ss13	28	AAC	GTA	ACC	2	AGTAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0319826729701035	NA	NA	0.0301621268001089	0.331802877091929	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.83333333333337	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0321606907732562	NA	NA	0.0300985541638019	0.330782635171813	0	398	602	0.602	0	0.001
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.66666666666671	1	33.99999999999999	0	0.0300040009602743	0	-0.0300040009602743	0	0.0322758595573058	NA	NA	0.0312518519403626	0.337019414763393	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.00000000000004	1	34.66666666666666	0	0.029415534864961	0	-0.029415534864961	0	0.0309055721310518	NA	NA	0.0329268749984609	0.371664711869605	0	370	630	0.63	0	0.001
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.00000000000004	1	35.66666666666666	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0316979499064665	NA	NA	0.029922941482748	0.339603460972184	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666671	1	35.49999999999999	0	0.0287116399282627	0	-0.0287116399282627	0	0.0311602418514277	NA	NA	0.0297045027570001	0.333756365908066	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	34	AGT	GCA	GTG	2	CGCAGTGGA:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666671	1	35.16666666666666	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0303227708562849	NA	NA	0.0290458798772835	0.318257193592554	0	358	642	0.642	0	0.001
N	all	ss13	35	GGA	GTG	GAG	2	AGTGGAGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.16666666666671	1	35.16666666666666	0	0.0289891158257094	0	-0.0289891158257094	0	0.0311940880774303	NA	NA	0.0321220985664679	0.366809143018559	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	36	GCA	GAG	CAC	2	GGAGCACGA:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.00000000000004	1	34.83333333333332	0	0.0292720079293014	0	-0.0292720079293014	0	0.0305780428221281	NA	NA	0.030613006014297	0.338973648959967	0	371	629	0.629	0	0.001
N	all	ss13	37	CGA	CAC	GAC	2	GCACGACCA:GCGCGATCA	1:1	FALSE	1.25	1.25	0.25	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.33333333333337	1	34.49999999999999	0	0.0295604764056575	0	-0.0295604764056575	0	0.0325361412404085	NA	NA	0.0307616999308019	0.336576967785666	0	342	658	0.658	0	0.001
N	all	ss13	38	CCA	GAC	CAA	2	CGACCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.08333333333337	1	35.24999999999999	0	0.0289192452027623	0	-0.0289192452027623	0	0.0304378960526007	NA	NA	0.0288995209086306	0.316980324325147	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAA:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.41666666666671	0	35.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000004	0	35.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	41	CGT	AAC	GTC	2	CAACGTCGG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000004	0	36.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	42	CGG	GTC	GGC	2	CGTCGGCCC:CGTCGGCCT	1:1	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.9166666666667	0	36.74999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	43	CCC	GGC	CCC	2	CGGCCCCAA:CGGCCTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.9166666666667	0	37.08333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT:CCTCAAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.58333333333337	0	36.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.4166666666667	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000003	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000003	0	35.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000003	0	35.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.08333333333336	0	35.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000003	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000003	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.4166666666667	0	35.58333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.08333333333337	0	34.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000003	0	33.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	55	ACC	TCA	CCG	2	TTCACCGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.08333333333337	0	33.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	56	GCT	CCG	CTC	2	ACCGCTCTC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.4166666666667	0	32.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333337	0	32.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333337	0	32.91666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75000000000003	0	32.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.75000000000003	0	31.74999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.4166666666667	0	32.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25000000000003	0	33.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25000000000003	0	32.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	64	GAC	AAG	ACC	2	GAAGACCTT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.08333333333337	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	65	CTT	ACC	TTA	2	GACCTTAAA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.75000000000003	0	33.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.08333333333337	0	32.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.25000000000003	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.9166666666667	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.9166666666667	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.08333333333337	0	32.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.9166666666667	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.25000000000003	0	34.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA:GGCGTTCCG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.25000000000003	0	34.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATT:GTTCCGATT	1:1	FALSE	1.41666666666667	1	0.583333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.9166666666667	0	33.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	75	ATT	CAA	TTA	2	CCAATTAAC:CCGATTAAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000003	0	33.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	76	AAC	TTA	ACA	2	ATTAACACC:ATTAATACC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000003	0	32.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT:AATACCAAT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.83333333333337	0	33.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333337	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333337	0	33.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.6666666666667	0	33.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000003	0	33.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.00000000000003	0	33.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000003	0	34.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	0	35.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.33333333333336	0	35.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.16666666666669	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	68.83333333333336	0	35.66666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.16666666666669	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666669	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	0	35.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	68.66666666666669	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.00000000000003	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.33333333333336	0	34.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT	2	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.33333333333336	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT	2	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000003	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.66666666666669	0	35.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.83333333333336	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.50000000000003	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	100	GGT	ACG	GTA	2	GACGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.83333333333336	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	101	AAA	GTA	AAA	2	GGTAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.83333333333336	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.83333333333336	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.16666666666669	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	104	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.16666666666669	0	36.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	105	CTC	ATC	TCA	2	GATCTCAGT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.50000000000003	0	37.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	106	AGT	TCA	GTC	2	CTCAGTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.83333333333336	0	37.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	107	CCA	GTC	CAA	2	AGTCCAAGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.83333333333336	0	37.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.83333333333336	0	37.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333336	0	36.99999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTT:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	68.66666666666669	0	37.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTTTAC:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.16666666666669	0	36.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTTTACTAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.00000000000003	0	35.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.33333333333337	0	35.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000004	0	34.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666671	0	35.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666671	0	35.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	117	GGG	CTG	GGC	2	ACTGGGCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.50000000000006	0	35.333333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	118	CCA	GGC	CAG	2	GGGCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.16666666666673	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000006	0	33.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333339	0	33.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	121	GGA	CTG	GAC	2	GCTGGACTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666673	0	33.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	122	CTT	GAC	TTC	2	GGACTTCCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333339	0	32.833333333333314	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.33333333333339	0	33.49999999999998	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	124	TAT	CCT	ATG	2	CCCTATGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666673	0	34.16666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	125	GGT	ATG	GTG	2	TATGGTGCT	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.66666666666673	0	34.16666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	126	GCT	GTG	CTA	2	GGTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333339	0	34.66666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.8333333333334	0	33.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.8333333333334	0	33.66666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	129	GAC	AAG	ACG	2	AAAGACGGC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.8333333333334	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	130	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666674	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666674	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.8333333333334	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666674	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333341	0	32.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666674	0	32.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.50000000000009	0	32.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666674	0	33.16666666666665	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333341	0	32.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333341	0	33.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.33333333333341	0	33.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000009	0	32.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000009	0	33.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666676	0	34.33333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.66666666666676	0	34.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	145	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.16666666666676	0	35.499999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	146	CAC	ATC	ACA	2	GATCACATT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	36.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.5000000000001	0	35.999999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.66666666666676	0	34.99999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666676	0	35.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTG	2	AATCCTGCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	34.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	153	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAAC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.5000000000001	0	34.16666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	154	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.5000000000001	0	33.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.5000000000001	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	158	ATC	CAA	TCG	2	GCAATCGTG	2	FALSE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.83333333333343	0	33.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	159	GTG	TCG	TGC	2	ATCGTGCTA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333343	0	34.49999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.0000000000001	0	34.83333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666676	0	35.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	36.08333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.83333333333343	0	36.08333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666676	0	36.749999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.16666666666676	0	36.749999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666676	0	36.249999999999986	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333341	1	36.91666666666666	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0287316393016378	NA	NA	0.0287270478435663	0.336856374811693	0	362	638	0.638	0	0.001
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.33333333333341	1	37.58333333333332	0	0.0270909813104957	0	-0.0270909813104957	0	0.0277899163293206	NA	NA	0.0286521775201287	0.344397482563043	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.66666666666676	1	37.91666666666666	0	0.0268485044068343	0	-0.0268485044068343	0	0.0275094827853135	NA	NA	0.0285836019586758	0.347578047927206	0	347	653	0.653	0	0.001
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.16666666666676	1	38.41666666666666	0	0.0264928206228063	0	-0.0264928206228063	0	0.0268902764280448	NA	NA	0.0276843982973314	0.338588195579463	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666676	1	39.249999999999986	0	0.0259205062991005	0	-0.0259205062991005	0	0.0267672517901422	NA	NA	0.026417472627524	0.326500056230979	0	383	617	0.617	0	0.001
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666676	1	39.249999999999986	0	0.0259205062991005	0	-0.0259205062991005	0	0.0263412983643948	NA	NA	0.0268199459250606	0.333812162935095	0	363	637	0.637	0	0.001
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666676	1	38.91666666666665	0	0.0261464386246643	0	-0.0261464386246643	0	0.0261474049524367	NA	NA	0.0268676552542004	0.330475429239583	0	366	634	0.634	0	0.001
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.16666666666676	1	37.91666666666665	0	0.0268485044068343	0	-0.0268485044068343	0	0.0273939194103899	NA	NA	0.0284445023120217	0.345225447282975	0	387	613	0.613	0	0.001
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.66666666666676	1	36.91666666666665	0	0.0275893176123833	0	-0.0275893176123833	0	0.0295889047799537	NA	NA	0.0279525519921629	0.323640029016057	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	176	GGG	AAG	GGA	2	GAAGGGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666676	1	37.249999999999986	0	0.0273378783823658	0	-0.0273378783823658	0	0.0287467271042133	NA	NA	0.0280051849451901	0.328979218824408	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	177	AGC	GGA	GCA	2	GGGAGCAGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333341	1	37.249999999999986	0	0.0273378783823658	0	-0.0273378783823658	0	0.0300435820007063	NA	NA	0.0275544305597405	0.321128782374641	0	378	622	0.622	0	0.001
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC:AGCAGAGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.33333333333341	1	36.749999999999986	0	0.0277167798918218	0	-0.0277167798918218	0	0.0285892351559351	NA	NA	0.0288037063556394	0.335916829866604	0	356	644	0.644	0	0.001
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC:AGAGGTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.3333333333334	1	36.249999999999986	0	0.0281063333749098	0	-0.0281063333749098	0	0.0292480807375117	NA	NA	0.0277653592521073	0.311403927716801	0	342	658	0.658	0	0.001
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT:GGTGGCAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.3333333333334	1	35.91666666666665	0	0.0283721774047871	0	-0.0283721774047871	0	0.0288062905812883	NA	NA	0.0298803624465867	0.342353216545168	0	368	632	0.632	0	0.001
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.00000000000007	1	35.91666666666665	0	0.0283721774047871	0	-0.0283721774047871	0	0.0299803344207617	NA	NA	0.028128468901582	0.313135743610127	0	379	621	0.621	0	0.001
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC:AGTCAAGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666674	1	35.58333333333332	0	0.0286430990492925	0	-0.0286430990492925	0	0.0302938471839313	NA	NA	0.0298258651957716	0.336881971129877	0	380	620	0.62	0	0.001
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT:CAAGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	69.66666666666674	1	35.58333333333332	0	0.0286430990492925	0	-0.0286430990492925	0	0.0286646766424651	NA	NA	0.0293906814494519	0.329776595594065	0	340	660	0.66	0	0.001
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT:GCTTCTTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	70.3333333333334	1	35.58333333333332	0	0.0286430990492925	0	-0.0286430990492925	0	0.0292580415554865	NA	NA	0.0290020337046151	0.323336920502904	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	71.00000000000007	1	35.58333333333332	0	0.0286430990492925	0	-0.0286430990492925	0	0.0290525238383177	NA	NA	0.0306573135376626	0.350149651959477	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCT:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.66666666666674	1	34.91666666666665	0	0.0292007684815911	0	-0.0292007684815911	0	0.0299990005305247	NA	NA	0.0303586878457921	0.336120579344242	0	359	641	0.641	0	0.001
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCTTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.8333333333334	1	34.749999999999986	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0302394729012495	NA	NA	0.0306909243809034	0.33902166429543	0	376	624	0.624	0	0.001
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA:TCTTCATCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	72.8333333333334	1	34.749999999999986	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0311380398327995	NA	NA	0.0293823922243996	0.317949923453447	0	364	636	0.636	0	0.001
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000007	1	34.749999999999986	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0301466941210584	NA	NA	0.0299196867149597	0.326718297027003	0	360	640	0.64	0	0.001
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000007	1	34.749999999999986	0	0.0293435958691742	0	-0.0293435958691742	0	0.0297232192922864	NA	NA	0.0299974494555248	0.327973919496799	0	372	628	0.628	0	0.001
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	73.50000000000007	1	35.41666666666665	0	0.0287805096612114	0	-0.0287805096612114	0	0.0284227437567712	NA	NA	0.029096049990774	0.32258720500023	0	367	633	0.633	0	0.001
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.50000000000007	1	34.41666666666665	0	0.0296334842053817	0	-0.0296334842053817	0	0.0306366506380887	NA	NA	0.0297607827510696	0.319384942438284	0	390	610	0.61	0	0.001
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666674	1	33.41666666666665	0	0.0305385697640887	0	-0.0305385697640887	0	0.0299947413597074	NA	NA	0.0326409387895368	0.34948379121074	0	381	619	0.619	0	0.001
N	all	ss13	194	AGT	ACA	GTT	2	AACAGTTCA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.91666666666674	1	32.66666666666665	0	0.0312545223004261	0	-0.0312545223004261	0	0.0299707226953042	NA	NA	0.0316134104775128	0.322835590041236	0	375	625	0.625	0	0.001
N	all	ss13	195	TCA	GTT	CAA	2	AGTTCAAGA	2	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000007	2	31.999999999999986	0	0.0652585327422224	0	-0.0652585327422224	0	0.0495747906714881	NA	NA	0.0495229697675915	0.187589789498853	0	133	867	0.867	0	0.001
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAC:TCAAGAAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.91666666666674	2	31.999999999999986	0	0.0652585327422224	0	-0.0652585327422224	0	0.0498970948729667	NA	NA	0.0473223695464358	0.167888335477843	0	140	860	0.86	0	0.001
N	all	ss13	197	AAC	GAA	ACT	2	AGAAACTCA:AGAAATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.5833333333334	2	32.16666666666665	0	0.0649053422482924	0	-0.0649053422482924	0	0.0493500582909076	NA	NA	0.0497756415405614	0.192247928597561	0	115	885	0.885	0	0.001
N	all	ss13	198	TCA	ACT	CAA	2	AACTCAACT:AATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000007	2	32.83333333333332	0	0.0635300231041221	0	-0.0635300231041221	0	0.0470115144503105	NA	NA	0.0491870489687235	0.196495488104831	0	132	868	0.868	0	0.001
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.75000000000007	2	33.333333333333314	0	0.0625362067042884	0	-0.0625362067042884	0	0.0477274542601311	NA	NA	0.048640575347422	0.198554822909581	0	130	870	0.87	0	0.001
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.25000000000007	2	34.499999999999986	0	0.0603340239140544	0	-0.0603340239140544	0	0.045762429597157	NA	NA	0.0440526346407423	0.170815092844682	0	152	848	0.848	0	0.001
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.41666666666674	2	33.999999999999986	0	0.0612585232607004	0	-0.0612585232607004	0	0.0458898737926745	NA	NA	0.0453210843594969	0.176485332767137	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.0833333333334	2	34.333333333333314	0	0.0606390724718213	0	-0.0606390724718213	0	0.0458912981746205	NA	NA	0.0455680404321819	0.18327559970065	0	132	868	0.868	0	0.001
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.0833333333334	2	34.66666666666665	0	0.0600320307551524	0	-0.0600320307551524	0	0.0470779671205121	NA	NA	0.0462471628431978	0.194263459741184	0	150	850	0.85	0	0.001
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000007	2	34.833333333333314	0	0.0597330472949441	0	-0.0597330472949441	0	0.0456492146569976	NA	NA	0.0451221501747148	0.185566936966446	0	131	869	0.869	0	0.001
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.16666666666673	2	35.24999999999998	0	0.0589984642956841	0	-0.0589984642956841	0	0.0447333134578074	NA	NA	0.0435298977282988	0.175304481284959	0	139	861	0.861	0	0.001
N	all	ss13	206	ACT	GAA	CTT	2	GGAACTTCC:GGAACTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.8333333333334	2	34.583333333333314	0	0.0601826482875393	0	-0.0601826482875393	0	0.0466157478346336	NA	NA	0.0471795139227784	0.202093503322538	0	149	851	0.851	0	0.001
N	all	ss13	207	TCC	CTT	CCC	2	ACTTCCCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.8333333333334	2	35.58333333333331	0	0.0584236862456271	0	-0.0584236862456271	0	0.044124417481699	NA	NA	0.0436896307007789	0.181143080496995	0	120	880	0.88	0	0.001
N	all	ss13	208	CCT	CCC	CTG	2	TCCCCTGCT:TCTCCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.00000000000006	2	36.08333333333331	0	0.0575822255219405	0	-0.0575822255219405	0	0.0434705911746122	NA	NA	0.0454312584599512	0.204991465783254	0	131	869	0.869	0	0.001
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTAGG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.50000000000007	2	35.24999999999998	0	0.0589984642956841	0	-0.0589984642956841	0	0.0446980475123038	NA	NA	0.0442318879480711	0.182254795223952	0	104	896	0.896	0	0.001
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTAGGATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.50000000000007	2	34.249999999999986	0	0.0607927570603562	0	-0.0607927570603562	0	0.0460809095445538	NA	NA	0.0455568117400765	0.182060236019248	0	142	858	0.858	0	0.001
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:AGGATGGCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.8333333333334	2	34.333333333333314	0	0.0606390724718213	0	-0.0606390724718213	0	0.0454514072480507	NA	NA	0.0460521873692689	0.187923495242148	0	128	872	0.872	0	0.001
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTG	2	ATGGCTGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.16666666666674	2	34.66666666666665	0	0.0600320307551524	0	-0.0600320307551524	0	0.0433050579973344	NA	NA	0.0459767469733044	0.191653175589512	0	129	871	0.871	0	0.001
N	all	ss13	213	GGC	CTG	GCA	2	GCTGGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.66666666666674	2	34.833333333333314	0	0.0597330472949441	0	-0.0597330472949441	0	0.0451688203481352	NA	NA	0.0448747473818243	0.1831541217644	0	134	866	0.866	0	0.001
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	GGCAATGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.33333333333341	2	34.16666666666665	0	0.0609472230590744	0	-0.0609472230590744	0	0.0463345995619176	NA	NA	0.044493169699981	0.170745979134176	0	127	873	0.873	0	0.001
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCA	2	AATGGCAGT:AATGGCGGT	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.3333333333334	2	34.49999999999998	0	0.0603340239140544	0	-0.0603340239140544	0	0.0464762165706667	NA	NA	0.0452932825329717	0.182835728858557	0	133	867	0.867	0	0.001
N	all	ss13	216	AGT	GCA	GTG	2	GGCAGTGAT:GGCGGTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.3333333333334	2	35.49999999999998	0	0.0585663277285775	0	-0.0585663277285775	0	0.046252176887816	NA	NA	0.0441869596359439	0.185031529396502	0	151	849	0.849	0	0.001
N	all	ss13	217	GAT	GTG	ATG	2	AGTGATGCT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333341	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0293460182653746	NA	NA	0.0293059796281286	0.329533948316133	0	383	617	0.617	0	0.001
N	all	ss13	218	GCT	ATG	CTG	2	GATGCTGCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.83333333333341	1	35.66666666666665	0	0.0285748846742028	0	-0.0285748846742028	0	0.0299429065700795	NA	NA	0.0305239387227337	0.349197658525779	0	373	627	0.627	0	0.001
N	all	ss13	219	GCT	CTG	CTC	2	GCTGCTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.33333333333341	1	35.499999999999986	0.0266694765273651	0.0287116399282627	0.92887332782105	-0.00204216340089759	0.0266571885382484	0.0298787551769711	NA	NA	0.0398986137466567	0.959179045979249	396	155	449	0.449	0.396	0.792
N	all	ss13	220	CTT	CTC	TTG	2	GCTCTTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000009	1	34.833333333333314	0.026434454296256	0.0292720079293014	0.903062555875951	-0.00283755363304539	0.0280611975054705	0.032168970344682	NA	NA	0.0400539404020475	0.943522463660524	374	135	491	0.491	0.374	0.748
N	all	ss13	221	GCT	TTG	CTT	2	CTTGCTTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000009	1	34.499999999999986	0.0260895870640617	0.0295604764056576	0.882583443718397	-0.0034708893415959	0.0254675760706434	0.0302198976585831	NA	NA	0.0413109269816836	0.933041583887314	357	147	496	0.496	0.357	0.714
N	all	ss13	222	TTG	CTT	TGC	2	GCTTTGCTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.33333333333341	1	34.16666666666666	0.0263184898584525	0.0298546878003148	0.881553008843558	-0.00353619794186223	0.025479887060825	0.0321070733589491	NA	NA	0.0407937236024993	0.930922016489635	378	124	498	0.498	0.378	0.756
N	all	ss13	223	CTG	TGC	TGC	2	TTGCTGCTG	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.66666666666674	1	33.499999999999986	0.026551445288187	0.0304610393656427	0.871652636979111	-0.00390959407745572	0.0271630510652046	0.0340844765183766	NA	NA	0.0433763638139252	0.928182399992461	350	137	513	0.513	0.35	0.7
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333341	1	33.499999999999986	0.0261464386246642	0.0304610393656427	0.858356745835633	-0.00431460074097852	0.0260306305004053	0.0333387563280403	NA	NA	0.042469703003453	0.919080180654309	368	119	513	0.513	0.368	0.736
N	all	ss13	225	CTT	TGC	TTG	2	CTGCTTGAC	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000009	1	33.83333333333332	0.0260895870640617	0.0301548153585304	0.865188088663965	-0.0040652282944687	0.026828759322006	0.0319154077968277	NA	NA	0.043332658444274	0.925256575319245	368	118	514	0.514	0.368	0.736
N	all	ss13	226	GAC	TTG	ACA	2	CTTGACAGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	1	34.16666666666666	0.026032982222434	0.0298546878003148	0.871989765780083	-0.00382170557788079	0.0257370513531295	0.0325651852703575	NA	NA	0.042105970151393	0.92768012893071	381	134	485	0.485	0.381	0.762
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	1	34.49999999999999	0.0263763446044989	0.0295604764056575	0.89228415139652	-0.00318413180115855	0.0276703940952133	0.0318082183826642	NA	NA	0.0421663832966356	0.939806145133788	388	105	507	0.507	0.388	0.776
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.16666666666674	1	34.49999999999999	0.0263763446044989	0.0295604764056575	0.89228415139652	-0.00318413180115855	0.0247598459948308	0.0332683614769744	NA	NA	0.0419122560341279	0.939441870269105	361	145	494	0.494	0.361	0.722
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.16666666666674	1	34.83333333333332	0.026032982222434	0.0292720079293014	0.889347334330791	-0.00323902570686744	0.0263130942341964	0.0324184064856244	NA	NA	0.0413339371790023	0.937539797602678	365	125	510	0.51	0.365	0.73
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000007	1	35.83333333333332	0.0262608883838265	0.0284394261467203	0.923397267172179	-0.00217853776289377	0.0274808019268228	0.0308822370934674	NA	NA	0.0443609701426807	0.960832163785612	394	118	488	0.488	0.394	0.788
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.8333333333334	1	35.83333333333332	0.0264928206228062	0.0284394261467203	0.931552573744931	-0.00194660552391411	0.0266197174415043	0.0300231637626302	NA	NA	0.0422594685078172	0.963259892578951	384	132	484	0.484	0.384	0.768
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.66666666666674	1	35.66666666666666	0.0262035385209603	0.0285748846742028	0.917012923051851	-0.00237134615324254	0.0273061623692725	0.0302208632929505	NA	NA	0.0395850168890701	0.952231182608485	389	141	470	0.47	0.389	0.778
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666674	1	34.66666666666666	0.0258646320533769	0.029415534864961	0.879284778336164	-0.00355090281158405	0.0260365368827353	0.0301470533554261	NA	NA	0.0404212404133691	0.929997925531482	401	132	467	0.467	0.401	0.802
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000009	1	34.66666666666666	0.0260895870640617	0.029415534864961	0.886932268402806	-0.00332594780089929	0.0260815840675908	0.0319977545474409	NA	NA	0.0425132486617951	0.937642547251184	341	139	520	0.52	0.341	0.682
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000009	1	34.66666666666666	0.0260895870640617	0.029415534864961	0.886932268402806	-0.00332594780089929	0.0264783429415323	0.03073368456504	NA	NA	0.0419963651344483	0.936876656674449	379	130	491	0.491	0.379	0.758
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.83333333333341	1	34.83333333333332	0.0264928206228062	0.0292720079293014	0.905056485595125	-0.00277918730649524	0.0279357598162367	0.0313839044475957	NA	NA	0.0407516757759274	0.945627930705488	380	120	500	0.5	0.38	0.76
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.00000000000007	1	34.33333333333332	0.0260895870640617	0.0297068535712844	0.878234613485984	-0.00361726650722272	0.0257615325220494	0.0325809766608943	NA	NA	0.0410115948073577	0.929716867617071	369	110	521	0.521	0.369	0.738
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	1	34.49999999999999	0.0259766224970672	0.0295604764056575	0.87876197056471	-0.00358385390859031	0.0253350318650954	0.0315235640814016	NA	NA	0.0402761919295973	0.92909625873062	357	123	520	0.52	0.357	0.714
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	1	33.83333333333333	0.0259766224970672	0.0301548153585304	0.861441935167371	-0.0041781928614632	0.0262553720832768	0.0314638033974598	NA	NA	0.0414725341550756	0.919752076484138	351	137	512	0.512	0.351	0.702
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.3333333333334	1	34.49999999999999	0.0259766224970672	0.0295604764056575	0.87876197056471	-0.00358385390859031	0.0257679066109036	0.0317847956126218	NA	NA	0.040172442819348	0.928913627801904	386	128	486	0.486	0.386	0.772
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666674	1	34.416666666666664	0.0259485340559255	0.0296334842053817	0.875649109503399	-0.00368495014945618	0.0259728119655836	0.0317182375612999	NA	NA	0.0407396719471669	0.927928711974586	371	123	506	0.506	0.371	0.742
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA:CAACAACAG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.91666666666674	1	34.916666666666664	0.0261179819037762	0.0292007684815911	0.894427895630268	-0.00308278657781492	0.0265827757641146	0.0321716126762123	NA	NA	0.0421812276980187	0.941739014686813	379	128	493	0.493	0.379	0.758
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC:CAACAGAGC	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666673	1	34.916666666666664	0.0268184996810859	0.0292007684815911	0.918417599111921	-0.00238226880050514	0.0277262264832009	0.0322739267088613	NA	NA	0.0394788198754861	0.951882488102106	388	122	490	0.49	0.388	0.776
N	all	ss13	244	AGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA:CAGAGCCAA	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.50000000000006	1	34.666666666666664	0.0273378783823658	0.029415534864961	0.929368733489527	-0.00207765648259518	0.0274250590281146	0.032508439378092	NA	NA	0.0429148629721602	0.961386741999329	393	130	477	0.477	0.393	0.786
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	AGCCAAACT:GGCCAAACT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.16666666666673	0	34.916666666666664	0.0274630224286674	0	-Inf	0.0274630224286674	0.0284422598057152	0	NA	NA	0.0282640025459324	0.331219340171237	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.66666666666673	0	34.416666666666664	0.0272757331281561	0	-Inf	0.0272757331281561	0.0283393256314519	0	NA	NA	0.0272713114503317	0.317232049600839	639	361	0	0	0.639	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.8333333333334	0	34.24999999999999	0.0272138698048233	0	-Inf	0.0272138698048233	0.026921683204301	0	NA	NA	0.0272242320338101	0.317494743233367	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.16666666666673	0	33.916666666666664	0.0270909813104956	0	-Inf	0.0270909813104956	0.0274679269807835	0	NA	NA	0.0271032881356748	0.317530301673739	649	351	0	0	0.649	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.16666666666674	0	33.58333333333333	0.026728886585519	0	-Inf	0.026728886585519	0.0275234810943653	0	NA	NA	0.0272586744285764	0.326807581773274	637	363	0	0	0.637	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.3333333333334	0	32.75	0.0266694765273651	0	-Inf	0.0266694765273651	0.0263491676392577	0	NA	NA	0.0282523062967627	0.345182320827144	655	345	0	0	0.655	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.8333333333334	0	33.25	0.0268485044068343	0	-Inf	0.0268485044068343	0.0266538207360927	0	NA	NA	0.027585121089279	0.330405914665072	664	336	0	0	0.664	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCA:TCTGCTGCT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.8333333333334	0	32.916666666666664	0.0264928206228062	0	-Inf	0.0264928206228062	0.0265436951608449	0	NA	NA	0.0258819500368154	0.306023212530964	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	253	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAG:GCTGCTGAG	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.50000000000006	0	32.25	0.0259205062991005	0	-Inf	0.0259205062991005	0.0271724731534202	0	NA	NA	0.0248312750159486	0.296547715367915	652	348	0	0	0.652	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CAG	AGG	2	GCAGAGGCT:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.333333333333333	1.08333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666673	0	32.08333333333333	0.025864632053377	0	-Inf	0.025864632053377	0.0259929545037816	0	NA	NA	0.0252141238951226	0.304986169721393	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	255	GCT	AGG	CTT	2	GAGGCTTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.75000000000007	0	32	0.0258367851740807	0	-Inf	0.0258367851740807	0.0254505580095117	0	NA	NA	0.0263508921764923	0.326844323950691	653	347	0	0	0.653	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CTT	CTA	2	GCTTCTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.91666666666673	0	32.333333333333336	0.0257812709329177	0	-Inf	0.0257812709329177	0.0264569441965846	0	NA	NA	0.0264471152579783	0.329647790485894	596	404	0	0	0.596	0.001
N	all	ss13	257	AAG	CTA	AGA	2	TCTAAGAAA:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.91666666666673	0	31.33333333333334	0.0254531319881873	0	-Inf	0.0254531319881873	0.0262423128652491	0	NA	NA	0.0251934744058943	0.31234844820887	681	319	0	0	0.681	0.001
N	all	ss13	258	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.41666666666673	0	29.83333333333334	0.02497629341178	0	-Inf	0.02497629341178	0.025960369366515	0	NA	NA	0.0257833711295231	0.332696019165998	628	372	0	0	0.628	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AAC	CTC	2	AAACCTCGG:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	81.25000000000006	0	29.83333333333334	0.0250283912732922	0	-Inf	0.0250283912732922	0.0255827773761699	0	NA	NA	0.025586620309382	0.327983933815313	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	260	CGG	CTC	GGC	2	CCTCGGCAA	2	FALSE	1	1	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666671	0	30.16666666666667	0.0251332418122965	0	-Inf	0.0251332418122965	0.0252454035313918	0	NA	NA	0.0259805547227824	0.333350781002699	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GGC	AAA	2	CGGCAAAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666671	0	30.500000000000007	0.0251332418122965	0	-Inf	0.0251332418122965	0.0264534581028571	0	NA	NA	0.024497735898596	0.304919200007003	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.91666666666671	0	30.500000000000007	0.0251332418122965	0	-Inf	0.0251332418122965	0.0249623376518529	0	NA	NA	0.026304465303884	0.339337872085472	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.75000000000004	0	31.000000000000007	0.0255072404553968	0	-Inf	0.0255072404553968	0.0248986774822694	0	NA	NA	0.0252777564032561	0.312936989295022	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333337	0	31.66666666666667	0.026061253903872	0	-Inf	0.026061253903872	0.0266992858280047	0	NA	NA	0.0256610145856512	0.309821250998137	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACC:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333339	0	30.666666666666675	0.0257259947650973	0	-Inf	0.0257259947650973	0.0264023637648563	0	NA	NA	0.0263302377297985	0.328543722780088	672	328	0	0	0.672	0.001
N	all	ss13	266	ACC	CCA	CCA	2	GCCACCAAA:GCCACTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333339	0	30.333333333333343	0.0253992526173405	0	-Inf	0.0253992526173405	0.0251637124423818	0	NA	NA	0.025015288921313	0.309939417950919	626	374	0	0	0.626	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CCA	AAC	2	ACCAAACAA:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.75000000000004	0	30.16666666666667	0.025185997239258	0	-Inf	0.025185997239258	0.0257236578276304	0	NA	NA	0.0257574777982445	0.328166808663771	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	268	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	2	80.08333333333337	0	30.16666666666667	0.0253992526173405	0	-Inf	0.0253992526173405	0.0252592337315904	0	NA	NA	0.0250512685030938	0.310634824565177	643	357	0	0	0.643	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AAT	ACA	2	CAATACAAT:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.58333333333337	0	30.33333333333334	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	270	AAT	ACA	ATG	2	TACAATGTA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.41666666666671	0	30.500000000000007	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ATG	TAA	2	AATGTAACA	2	FALSE	1	0	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.75000000000004	0	30.500000000000007	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.91666666666671	0	31.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.58333333333337	0	32.16666666666667	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	274	GCT	AAG	CTT	2	CAAGCTTTC:CAAGCTTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.91666666666671	0	33.16666666666667	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CTT	TCG	2	GCTTTCGGC:GCTTTTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.91666666666671	0	32.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGCAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.25000000000004	0	32	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.91666666666671	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.91666666666671	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.25000000000004	0	32.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.25000000000004	0	32.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.91666666666671	0	32.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.75000000000004	0	32.666666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.08333333333337	0	33.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.41666666666671	0	33	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAC:CAAGGAAAT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.75000000000004	0	33	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	286	AAC	GAA	ACT	2	GGAAACTTT:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.41666666666671	0	33.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	287	TTT	ACT	TTG	2	AACTTTGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000004	0	33.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	288	GGG	TTG	GGG	2	TTTGGGGAC:TTTGGGGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.41666666666671	0	33.166666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAG:GGGGATCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.58333333333339	0	34	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAGGAA:GATCAAGAA	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	74.83333333333339	0	33.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGAACTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	75.75000000000006	0	32.83333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	76.25000000000006	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA:CTAATCAGG	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.25000000000006	0	32.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA:ATCAGGCAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.91666666666673	0	33.33333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA:AGGCAAGGA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333339	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.75000000000004	0	33.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333337	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333337	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333337	0	33.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.58333333333337	0	32.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.08333333333337	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.41666666666671	0	32.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.41666666666671	0	32.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.75000000000004	0	31.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333337	0	30.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.41666666666671	0	29.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTC:GCACAATTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.91666666666671	0	30.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	308	TTC	AAT	TCG	2	CAATTCGCT:CAATTTGCC	1:1	FALSE	2	0.5	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.58333333333337	0	30.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	309	GCC	TCG	CCC	2	TTCGCTCCC:TTTGCCCCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.9166666666667	0	31.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	310	CCC	CCC	CCA	2	GCCCCCAGC:GCTCCCAGC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.9166666666667	0	30.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	311	AGC	CCA	GCG	2	CCCAGCGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.9166666666667	0	30.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	312	GCT	GCG	CTT	2	AGCGCTTCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.9166666666667	0	30.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	313	TCA	CTT	CAG	2	GCTTCAGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.58333333333337	0	30.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCATTC:TCAGCGTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.25000000000004	0	29.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTC:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.9166666666667	0	29.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA	2	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.9166666666667	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.08333333333337	0	29.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCG	2	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000004	0	28.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	319	TCG	TGT	CGC	2	ATGTCGCGC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.25000000000004	0	28.583333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	320	CGC	CGC	GCA	2	TCGCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.08333333333337	0	28.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000004	0	28.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.4166666666667	0	28.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.08333333333336	0	28.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.75000000000003	0	28.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000003	0	29.25	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.00000000000003	0	29.666666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.83333333333336	0	29.500000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.50000000000003	0	29.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.1666666666667	0	29.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	330	ACG	GAA	CGT	2	GGAACGTGG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.83333333333336	0	28.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	331	TGG	CGT	GGT	2	ACGTGGTTG	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.83333333333336	0	28.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	332	TTG	GGT	TGA	2	TGGTTGACC	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.50000000000003	0	28.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	TTGACCTAC:TTGACCTAT	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.1666666666667	0	28.500000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACCTATACA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.83333333333337	0	29.166666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	335	ACA	ACA	CAG	2	TACACAGGT:TATACAGGT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.83333333333337	0	29.166666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	336	GGT	CAG	GTG	2	ACAGGTGCC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.83333333333337	0	29.833333333333336	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	337	GCC	GTG	CCA	2	GGTGCCATC:GGTGCCATT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.83333333333337	0	30.000000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	89.00000000000004	0	29.500000000000004	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	89.83333333333339	0	29.333333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	90.08333333333339	0	29.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	90.08333333333339	0	29.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	90.08333333333339	0	29.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	88.75000000000004	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	87.08333333333337	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.75000000000004	0	29.416666666666668	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	346	AAT	CAA	ATT	2	CCAAATTTC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.41666666666671	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	347	TTC	ATT	TCA	2	AATTTCAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.75000000000006	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.75000000000006	0	29.75	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	349	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.75000000000004	0	30.08333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	350	CAA	ATC	AAG	2	GATCAAGTC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.41666666666671	0	30.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	CAAGTCATT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.58333333333337	0	30.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	352	ATT	TCA	TTT	2	GTCATTTTG	2	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	83.25000000000004	0	30.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	353	TTG	TTT	TGC	2	ATTTTGCTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.58333333333337	0	29.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	TTGCTGAAT	2	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	84.91666666666671	0	29.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	355	AAT	TGA	ATA	2	CTGAATAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.25000000000004	0	30.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	356	AAG	ATA	AGC	2	AATAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.58333333333337	0	31.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.08333333333337	0	31.916666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.41666666666671	0	31.58333333333333	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.41666666666671	0	30.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.75000000000006	0	30.083333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	88.41666666666673	0	29.083333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	88.41666666666673	0	29.083333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	86.75000000000006	0	29.083333333333325	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	85.08333333333339	0	30.416666666666664	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	82.75000000000006	0	30.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75000000000006	0	29.083333333333332	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	81.75000000000006	0	29.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.75000000000006	0	30.749999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	80.25000000000006	0	31.249999999999996	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.08333333333339	0	31.41666666666666	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	79.08333333333339	0	30.749999999999993	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	78.58333333333339	0	31.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	1000	0	77.91666666666673	0	31.24999999999999	0	0	NaN	0	0	0	NA	NaN	0	NaN	0	1000	0	0	0	0.001
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGCT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	GCT	AGG	CTG	2	AAGGCTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	GCTGATGAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	GCCTTACCG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAG	GAC	AGA	2	AGACAGAAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AGA	AGA	2	CAGAAGAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCT	CTG	CTG	2	CCTGCTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CTG	CAG	2	GCTGCAGAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAT	CAG	ATT	2	GCAGATTTG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	TTG	ATT	TGG	2	GATTTGGAT	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAC	ATG	ACT	2	GATGACTTC:GATGATTTC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ACT	TCT	2	GACTTCTCC:GATTTCTCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAT	2	AAACAATTG	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	TTG	AAT	TGC	2	CAATTGCAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAC	2	TTGCAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	CAA	AAC	AAT	2	CAACAATCC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	CAATCCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	0	ATGAGC---	2	FALSE	0	0	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	NA	NA	0	AGC------	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	NA	NA	0	------AGT	2	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	GTG	0	---AGTGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	GTG	CTG	2	AGTGCTGAC:AGTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCC	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCC	AGG	CCT	2	CAGGCCTAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_MN996532.1	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	2	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGAT	2	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.1666666666667	2	33.91666666666666	0.0696555937548328	0.0614153696041381	1.13417201921617	0.00824022415069464	0.0314457694617801	0.0474859873028	NA	NA	0.0554454100224931	0.88185452507032	569	3	428	0.428	0.569	0.856
N	all	ss13	3	GAT	CTG	ATA	2	TCTGATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.00000000000003	2	34.08333333333333	0.0698178172995089	0.0611024764460933	1.14263482202893	0.00871534085341563	0.031104726612905	0.0455908545728212	NA	NA	0.0582215905458776	0.881007152316773	587	1	412	0.412	0.587	0.824
N	all	ss13	4	AAT	ATA	ATG	2	GATAATGGA	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.33333333333336	2	34.08333333333333	0.0694941228620285	0.0611024764460933	1.13733725544395	0.00839164641593526	0.0302729519996362	0.0443497842797916	NaN	NaN	0.059369275141762	0.887596121276818	593	3	404	0.404	0.593	0.808
N	all	ss13	5	GGA	ATG	GAC	2	AATGGACCC	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.33333333333336	2	34.41666666666666	0.0704743443137485	0.0604861633757489	1.16513166616225	0.00998818093799964	0.0298390896484028	0.0447853813346647	NA	NA	0.0581850581922903	0.863703025701625	607	2	391	0.391	0.607	0.782
N	all	ss13	6	CCC	GAC	CCC	2	GGACCCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.33333333333336	2	35.41666666666666	0.0714826348532436	0.0587096677913667	1.21756156255674	0.0127729670618769	0.0312634458279596	0.0445434371903824	NaN	NaN	0.0568865241550574	0.822341701234134	600	0	400	0.4	0.6	0.8
N	all	ss13	7	CAA	CCC	AA-	1	CCCCAA---:CCCCAATCA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	1.83333333333333	0.166666666666667	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.00000000000001	2	35.74999999999999	0.0718251788190063	0.0581404786806199	1.23537302149781	0.0136847001383864	0.0318873577119949	0.0413597578727281	NA	NA	0.0562182046022417	0.807679159438571	606	0	394	0.394	0.606	0.788
N	all	ss13	8	---	AAT	CAA	1	CAA---AAT:CAATCAAAC	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.16666666666669	2	34.916666666666664	0.0716534971389809	0.059584670169267	1.20254919487561	0.012068826969714	0.0311898480773631	0.0435796641034011	NaN	NaN	0.0569355219712607	0.832127638547968	587	0	413	0.413	0.587	0.826
N	all	ss13	9	AAC	--A	ACC	1	---AATCAG:TCAAACCAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.16666666666669	2	35.916666666666664	0.0706404112947758	0.0578600049104132	1.22088498616879	0.0127804063843626	0.0311142767811647	0.0402355470252828	NaN	NaN	0.0557806883044205	0.818776553699287	588	1	411	0.411	0.588	0.822
N	all	ss13	10	CAA	ACC	AAC	2	AACCAACGT:AATCAGCGA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	73.83333333333336	2	36.25	0.0709749060738395	0.0573071018565008	1.23850105439921	0.0136678042173386	0.0312827165449792	0.0420543609296445	NA	NA	0.0544700555959113	0.801873436533153	633	1	366	0.366	0.633	0.732
N	all	ss13	11	CGA	AAC	GAA	2	CAACGTAGT:CAGCGAAAT	1:1	FALSE	1.58333333333333	1.25	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.25000000000001	2	35.83333333333333	0.0705572800165473	0.0579999025523778	1.21650687176292	0.0125573774641695	0.0313604740918486	0.0442811657969593	NaN	NaN	0.0539210859559613	0.815851205344203	621	0	379	0.379	0.621	0.758
N	all	ss13	12	AAT	GAA	ATG	2	CGAAATGCA:CGTAGTGCC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	74.66666666666669	2	35.666666666666664	0.0701445435081176	0.0582817382454872	1.20354240658821	0.0118628052626304	0.0315337188516771	0.0419034614572656	NaN	NaN	0.0550735934640287	0.829456132045548	613	3	384	0.384	0.613	0.768
N	all	ss13	13	GCA	ATG	CAC	2	AATGCACCC:AGTGCCCCC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.00000000000001	2	36.33333333333333	0.0561009098120237	0.0571705240409132	0.98129080943662494	-0.00106961422888947	0.0279861644643385	0.0409361143512242	NA	NA	0.0502749631063839	0.983026058130282	498	3	499	0.499	0.498	0.996
N	all	ss13	14	CCC	CAC	CCC	2	GCACCCCGC:GCCCCCCGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.50000000000001	2	36.49999999999999	0.0557100557871529	0.0568993130810351	0.979098916498543	-0.00118925729388224	0.0272666366262365	0.0413129424193084	NaN	NaN	0.0519187078720889	0.981725141091438	512	4	484	0.484	0.512	0.968
N	all	ss13	15	CGC	CCC	GCA	2	CCCCGCATT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0306344843965962	0.0398446998570702	NaN	NaN	0.0570429006137463	0.83192279785149	619	1	380	0.38	0.619	0.76
N	all	ss13	16	ATT	GCA	TTA	2	CGCATTACA:CGCATTACG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	75.41666666666669	2	36.24999999999999	0.0694136680239339	0.0573071018565008	1.21125769364063	0.012106566167433	0.0306837248770326	0.0424298851336681	NaN	NaN	0.0519121782656656	0.815596440325317	578	1	421	0.421	0.578	0.842
N	all	ss13	17	ACA	TTA	CAT	2	ATTACATTT:ATTACGTTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.66666666666669	2	35.416666666666664	0.0826523551002107	0.0587096677913667	1.40781507049108	0.023942687308844	0.0329581112069309	0.0451425238257353	NaN	NaN	0.0583345028128078	0.681484793306206	693	0	307	0.307	0.693	0.614
N	all	ss13	18	TTT	CAT	TTG	2	ACATTTGGT:ACGTTTGGT	1:1	FALSE	1.5	0.5	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.33333333333334	2	35.416666666666664	0.081899468973744	0.0587096677913667	1.39499118381636	0.0231898011823773	0.0334136872878735	0.0442914898675102	NaN	NaN	0.0570297301108396	0.684282309902989	682	0	318	0.318	0.682	0.636
N	all	ss13	19	GGT	TTG	GTG	2	TTTGGTGGA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.83333333333334	2	35.416666666666664	0.0824628375267118	0.0587096677913667	1.40458702338012	0.0237531697353451	0.0349916903888929	0.0447105032598162	NaN	NaN	0.0551894277731801	0.666909439243006	658	2	340	0.34	0.658	0.68
N	all	ss13	20	GGA	GTG	GAC	2	GGTGGACCC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.16666666666667	2	35.58333333333333	0.0832261761385522	0.058423686245627	1.42452798662258	0.0248024898929252	0.0320620316316561	0.0422760611468632	NaN	NaN	0.0553366358564417	0.654000911713028	696	1	303	0.303	0.696	0.606
N	all	ss13	21	CCC	GAC	CCA	2	GGACCCACA:GGACCCTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.75	2	35	0.0825574874404694	0.0594370287406054	1.38899082255215	0.0231204586998641	0.0332544628793097	0.0408900438497221	NaN	NaN	0.0581974491547212	0.691163830842891	680	0	320	0.32	0.68	0.64
N	all	ss13	22	ACA	CCA	CAG	2	CCCACAGAT:CCCTCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.08333333333333	2	35.33333333333333	0.0821801867828477	0.0588537115811214	1.39634671416728	0.0233264752017263	0.0333201390180522	0.0429737817607695	NaN	NaN	0.055702181403385	0.675383277898139	686	0	314	0.314	0.686	0.628
N	all	ss13	23	GAT	CAG	ATT	2	ACAGATTCA:TCAGATTCA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75	1	34.666666666666664	0.0814358477684013	0.029415534864961	2.76846394744315	0.0520203129034404	0.0317665798231758	0.0314117332674625	NaN	NaN	0.0469315873486817	0.267676765979438	857	0	143	0.143	0.857	0.286
N	all	ss13	24	TCA	ATT	CAA	2	GATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	76.41666666666667	1	35.33333333333333	0.0829382721030275	0.028849710620847	2.87483896088357	0.0540885614821804	0.0334059631811348	0.0316542155526619	NA	NA	0.0447020651169997	0.226286938807321	882	1	117	0.117	0.882	0.234
N	all	ss13	25	ACT	CAA	CTG	2	TCAACTGAC:TCAACTGGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.75000000000001	1	35	0.0814358477684013	0.0291298749871979	2.79561267613373	0.0523059727812034	0.0333650030473933	0.0291087678542588	NA	NA	0.0448003810334732	0.242994743583944	898	0	102	0.102	0.898	0.204
N	all	ss13	26	GAC	CTG	ACA	2	ACTGACAAT:ACTGGCAGT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	77.91666666666669	1	34.83333333333333	0.0812518671161106	0.0292720079293014	2.77575311240528	0.0519798591868092	0.0309203646610367	0.0321906968721131	NA	NA	0.0443670333252793	0.241362731394258	891	1	108	0.108	0.891	0.216
N	all	ss13	27	AAT	ACA	ATA	2	GACAATAAC:GGCAGTAAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	78.58333333333336	1	34.5	0.0664886936625221	0.0295604764056575	2.24924296720052	0.0369282172568646	0.0289750543358428	0.030301166230874	NA	NA	0.044122697780474	0.402624172674659	814	2	184	0.184	0.814	0.368
N	all	ss13	28	AAC	ATA	ACC	2	AATAACCAG:AGTAACCAG	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.91666666666669	1	34.5	0.0531784143271381	0.0295604764056575	1.79897013828101	0.0236179379214806	0.02650333851972	0.0295636055935371	NA	NA	0.0414830615084366	0.569125889535503	729	5	266	0.266	0.729	0.532
N	all	ss13	29	CAG	ACC	AGA	2	AACCAGAAT	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.75000000000001	1	34.666666666666664	0.0532965566864638	0.029415534864961	1.8118506745206	0.0238810218215028	0.0272332313159461	0.0320412835544116	NA	NA	0.0411362759674163	0.561554319751033	726	8	266	0.266	0.726	0.532
N	all	ss13	30	AAT	AGA	ATG	2	CAGAATGGA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	78.58333333333336	1	33.83333333333333	0.0527110387112104	0.0301548153585304	1.74801397668977	0.02255622335268	0.0271274247689317	0.0322438308183909	NA	NA	0.0430140100111967	0.600005586352963	695	7	298	0.298	0.695	0.596
N	all	ss13	31	GGA	ATG	GAG	2	AATGGAGAA:AATGGAGGA	1:1	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.58333333333336	2	34.5	0.0534152253723939	0.0603340239140544	0.885325093656669	-0.00691879854166048	0.0253043679866025	0.0440904394963877	NA	NA	0.0528734095113789	0.895889287048431	470	2	528	0.528	0.47	0.94
N	all	ss13	32	GAA	GAG	AAC	2	GGAGAACGC:GGAGGACGC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.666666666666667	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.58333333333336	2	35.5	0.0541384900641951	0.0585663277285774	0.924396187432087	-0.00442783766438236	0.0259434287992703	0.0426010870478935	NA	NA	0.0512215259771188	0.931112786901437	466	4	530	0.53	0.466	0.932
N	all	ss13	33	CGC	AAC	GCA	2	GAACGCAGT:GGACGCAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333336	2	35.33333333333333	0.0399650588551816	0.0588537115811214	0.679057578214002	-0.0188886527259398	0.023058076670306	0.0424291211789849	NA	NA	0.0484557736575089	0.696675406564066	382	10	608	0.608	0.382	0.764
N	all	ss13	34	AAT	GCA	ATG	2	CGCAATGGG:CGCAGTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.08333333333336	2	35	0.0394395350433882	0.0594370287406054	0.663551591979974	-0.0199974936972172	0.0239280884649474	0.044707757778002	NA	NA	0.049801791008208	0.688021374575501	331	6	663	0.663	0.331	0.662
N	all	ss13	35	GGG	ATG	GGG	2	AATGGGGCA:AGTGGGGCG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.08333333333336	2	35	0.026061253903872	0.0594370287406054	0.438468316066207	-0.0333757748367334	0.0187344120200188	0.0452124216818648	NA	NA	0.0470553058026688	0.478145627322941	235	7	758	0.758	0.235	0.47
N	all	ss13	36	GCA	GGG	CAA	2	GGGGCAAGG:GGGGCGCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	2	35.166666666666664	0.0259485340559256	0.0591439311842398	0.438735361961198	-0.0331953971283142	0.0186367618651458	0.0438694821131387	NA	NA	0.0470940880351529	0.480888666021143	221	19	760	0.76	0.221	0.442
N	all	ss13	37	AGG	CAA	GAT	2	GCAAGGCCA:GCGCGATCA	1:1	TRUE	1.5	0.833333333333333	0.416666666666667	0.25	0	2	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.08333333333336	2	34.5	0.0257259947650973	0.0603340239140544	0.426392822758579	-0.0346080291489571	0.018142844013983202	0.044972694762429	NA	NA	0.0472744293511623	0.464127939493069	218	9	773	0.773	0.218	0.436
N	all	ss13	38	CCA	GAT	CAA	2	AGGCCAAAA:CGATCAAAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.58333333333336	2	35.08333333333333	0.0258925390301244	0.0592901175479514	0.436709186976794	-0.033397578517827	0.0179829612444088	0.0424142865622622	NA	NA	0.0462589359645715	0.470312729203359	224	22	754	0.754	0.224	0.448
N	all	ss13	39	AAA	CAA	AAC	2	CCAAAACAG:TCAAAACAA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.25000000000001	1	35.416666666666664	0.0260047718198447	0.0287805096612113	0.903554944855353	-0.00277573784136658	0.0175866161777137	0.0282958605701823	NA	NA	0.0345656782953303	0.935996038100979	440	45	515	0.515	0.44	0.88
N	all	ss13	40	CAA	AAC	AAC	2	AAACAACGT:AAACAGCGC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.08333333333336	1	35.416666666666664	0.0264053674769446	0.0287805096612113	0.917473935930059	-0.00237514218426668	0.0180438234125037	0.0309939521792759	NA	NA	0.0362182626101067	0.94771334413034	457	47	496	0.496	0.457	0.914
N	all	ss13	41	CGC	AAC	GCC	2	CAACGTCGG:CAGCGCCGA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	76.08333333333336	1	35.916666666666664	0.0267586909940917	0.0283721774047871	0.943131385805336	-0.00161348641069542	0.0180542043413412	0.0297268261684884	NA	NA	0.0360278292777972	0.964279122152975	483	46	471	0.471	0.483	0.942
N	all	ss13	42	CGA	GCC	GAC	2	CGCCGACCC:CGTCGGCCC	1:1	FALSE	1	1	0.583333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.25	0.0268785763539719	0.0281063333749098	0.956317424810953	-0.00122775702093791	0.0187297885039732	0.0286754325363053	NA	NA	0.0352838350694675	0.972241942520509	489	52	459	0.459	0.489	0.918
N	all	ss13	43	CCC	GAC	CCC	2	CGACCCCAA:CGGCCCCAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.666666666666664	0.0268785763539719	0.0277809537602618	0.967518127200487	-9.02377406289963e-4	0.0192198462640273	0.0280112214758753	NA	NA	0.0345714816161356	0.979176152724593	478	44	478	0.478	0.478	0.956
N	all	ss13	44	CAA	CCC	AAG	2	CCCCAAGGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000001	1	36.5	0.0268785763539719	0.0279101972553257	0.963037849861236	-0.00103162090135388	0.0191249386000293	0.0296733659647624	NA	NA	0.0344541982260254	0.97611346482903	470	52	478	0.478	0.47	0.94
N	all	ss13	45	GGT	AAG	GTT	2	CAAGGTTTA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333334	1	35.5	0.0269389228181416	0.0287116399282627	0.938257894200738	-0.0017727171101211	0.018720905217091	0.029921059385073	NA	NA	0.0349858455757575	0.959588839717925	445	43	512	0.512	0.445	0.89
N	all	ss13	46	TTA	GTT	TAC	2	GGTTTACCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.5	0.0268785763539719	0.0585663277285774	0.458942491298741	-0.0316877513746056	0.0187910467310777	0.0458276198857273	NA	NA	0.046637326006328	0.496852503599115	227	16	757	0.757	0.227	0.454
N	all	ss13	47	CCC	TAC	CCA	2	TTACCCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0192407053603345	0.0446315213925144	NA	NA	0.0502428980498779	0.520751529055419	243	14	743	0.743	0.243	0.486
N	all	ss13	48	AAT	CCA	ATA	2	CCCAATAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75	2	35.166666666666664	0.0268785763539719	0.0591439311842398	0.454460429257605	-0.0322653548302679	0.0188126264783782	0.0434556658191021	NA	NA	0.0485959132774768	0.506721019636418	221	15	764	0.764	0.221	0.442
N	all	ss13	49	AAT	ATA	ATA	2	AATAATACT	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333333	2	35.166666666666664	0.0271215992572094	0.0591439311842398	0.458569437542504	-0.0320223319270304	0.0186629615351207	0.0471027868402774	NA	NA	0.048362451126245	0.507886557197719	236	22	742	0.742	0.236	0.472
N	all	ss13	50	ACT	ATA	CTG	2	AATACTGCG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0182941751139234	0.0443971984037188	NA	NA	0.0484871215513491	0.518294303367507	254	17	729	0.729	0.254	0.508
N	all	ss13	51	GCG	CTG	CGT	2	ACTGCGTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	35.5	0.0272447663451876	0.0585663277285774	0.465195060059972	-0.0313215613833898	0.0189061138126602	0.0447402696878595	NA	NA	0.0465782164333948	0.501296717899187	258	11	731	0.731	0.258	0.516
N	all	ss13	52	TCT	CGT	CTT	2	GCGTCTTGG	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666667	2	35.5	0.0269995408952429	0.0585663277285774	0.461007919437443	-0.0315667868333345	0.0187282478403504	0.043759815929789	NA	NA	0.0487897293002144	0.517634172338968	260	17	723	0.723	0.26	0.52
N	all	ss13	53	TGG	CTT	GGT	2	TCTTGGTTC	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333334	2	34.83333333333333	0.0271215992572094	0.0597330472949441	0.454046804665615	-0.0326114480377347	0.0186270172604213	0.0458933262504897	NA	NA	0.0489493220406358	0.505264867790171	245	7	748	0.748	0.245	0.49
N	all	ss13	54	TTC	GGT	TCA	2	TGGTTCACA:TGGTTCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.75	2	33.83333333333333	0.0272447663451876	0.0615730216404005	0.442478956194529	-0.0343282552952129	0.0189537722508272	0.0448999648376308	NA	NA	0.0516309033218821	0.506128484039371	249	16	735	0.735	0.249	0.498
N	all	ss13	55	ACA	TCA	CAG	2	TTCACAGCT:TTCACCGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76	2	33.25	0.0405504159527068	0.0626996766264699	0.646740432080437	-0.0221492606737631	0.0228896043257905	0.0477790367843827	NA	NA	0.0521180859924198	0.670849625118464	349	3	648	0.648	0.349	0.698
N	all	ss13	56	GCT	CAG	CTC	2	ACAGCTCTC:ACCGCTCTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5	2	32.75	0.0402781342288958	0.0636987401522852	0.632322305474214	-0.0234206059233894	0.0228698741248874	0.0489275549752899	NA	NA	0.0543666610840855	0.666621178429305	350	6	644	0.644	0.35	0.7
N	all	ss13	57	CTC	CTC	TCA	2	GCTCTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0223688854807953	0.0470000479300086	NA	NA	0.0516199879173262	0.656884536947911	334	3	663	0.663	0.334	0.668
N	all	ss13	58	ACT	TCA	CTC	2	CTCACTCAA:CTCACTCAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.83333333333334	2	33.08333333333333	0.0400986359257937	0.0630291953285242	0.63619146201676	-0.0229305594027304	0.0223297483894252	0.0463392073670482	NA	NA	0.0549117695926822	0.676247528126334	317	7	676	0.676	0.317	0.634
N	all	ss13	59	CAA	CTC	AAC	2	ACTCAACAT:ACTCAGCAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000001	2	32.58333333333333	0.0397443976053828	0.0640388786228151	0.620629193703948	-0.0242944810174324	0.022420518465964	0.0479194632757997	NA	NA	0.0548486179437843	0.657811320673275	344	10	646	0.646	0.344	0.688
N	all	ss13	60	CAT	AAC	ATG	2	CAACATGGC:CAGCATGGC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.50000000000001	2	31.916666666666664	0.0392246245521367	0.0654365742860851	0.599429676447437	-0.0262119497339484	0.0220507476707893	0.0456214846004172	NA	NA	0.0551450056957353	0.634553405400985	296	5	699	0.699	0.296	0.592
N	all	ss13	61	GGC	ATG	GCA	2	CATGGCAAG	2	FALSE	2	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666669	2	32.58333333333333	0.039920730758297	0.0640388786228151	0.623382726506308	-0.0241181478645181	0.0223578921702038	0.0489710948977077	NA	NA	0.0529701424795883	0.648881992155286	329	9	662	0.662	0.329	0.658
N	all	ss13	62	AAG	GCA	AGG	2	GGCAAGGAA:GGCAAGGAG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.00000000000001	2	33.416666666666664	0.0400094855289696	0.062373587449531503	0.64144916406071	-0.022364101920562	0.0220637160053831	0.0458753759458873	NaN	NaN	0.0517085923804446	0.665376145041736	342	7	651	0.651	0.342	0.684
N	all	ss13	63	GAA	AGG	AAG	2	AAGGAAGAC:AAGGAGGAA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.66666666666669	2	33.083333333333336	0.0401881846005798	0.0630291953285242	0.637612211152447	-0.0228410107279444	0.0223059596725403	0.0466633754146272	NA	NA	0.0539487945227399	0.672015734421772	342	3	655	0.655	0.342	0.684
N	all	ss13	64	GAA	AAG	AAC	2	GAAGACCTT:GAGGAACTT	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333336	2	33.25	0.040641996635402	0.0626996766264699	0.648201056562454	-0.0220576799910679	0.0227856537778337	0.0481991773546715	NA	NA	0.0528158229960029	0.676214781608224	333	4	663	0.663	0.333	0.666
N	all	ss13	65	CTT	AAC	TTA	2	GAACTTAGA:GACCTTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	33.5	0.0276848040229394	0.0622118122355632	0.445008801835119	-0.0345270082126238	0.019261552955222	0.0486361181692284	NA	NA	0.0492446385766444	0.483220435437642	226	15	759	0.759	0.226	0.452
N	all	ss13	66	AAA	TTA	AAT	2	CTTAAATTC:CTTAGATTC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.583333333333333	0.5	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	73.58333333333336	2	32.5	0.0276848040229394	0.0642103145422439	0.43115820597212	-0.0365255105193045	0.0188970465773039	0.0519782818029521	NA	NA	0.0512180595847824	0.475760778590044	199	17	784	0.784	0.199	0.398
N	all	ss13	67	TTC	AAT	TCC	2	AAATTCCCT:AGATTCCCT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	73.00000000000001	2	32.666666666666664	0.0138252762666285	0.0638683562552301	0.216465196182286	-0.0500430799886016	0.0136576096634509	0.0475116071813847	NA	NA	0.0502300738166614	0.319115452591468	116	41	843	0.843	0.116	0.232
N	all	ss13	68	CCT	TCC	CTC	2	TTCCCTCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0134353221221084	0.0471953555851144	NA	NA	0.0513955873274908	0.345827747979288	129	38	833	0.833	0.129	0.258
N	all	ss13	69	CGA	CTC	GAG	2	CCTCGAGGA:CCTCGAGGC	1:1	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	71.66666666666669	2	33.333333333333336	0.0140849209886972	0.0625362067042883	0.225228259451358	-0.0484512857155911	0.0134324809240764	0.0475743206529412	NA	NA	0.0502391489779194	0.334838933777859	122	44	834	0.834	0.122	0.244
N	all	ss13	70	GGA	GAG	GAC	2	CGAGGACAA:CGAGGCCAG	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.83333333333336	2	33.333333333333336	0.0138572071256798	0.0625362067042883	0.221586947081803	-0.0486789995786084	0.0135631637828471	0.0460313135482086	NA	NA	0.0478705427639037	0.309206522838194	110	45	845	0.845	0.11	0.22
N	all	ss13	71	CAA	GAC	AAG	2	GGACAAGGC:GGCCAGGGC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	72.75000000000003	2	33.416666666666664	0.0138732279313668	0.062373587449531503	0.222421516841436	-0.0485003595181648	0.0129240911322542	0.045513761930489303	NA	NA	0.0490514833585939	0.32277843575212	123	31	846	0.846	0.123	0.246
N	all	ss13	72	GGC	AAG	GCG	2	CAAGGCGTT:CAGGGCGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0191719698577902	0.0470226553282743	NA	NA	0.0488533717680165	0.495138981118111	229	19	752	0.752	0.229	0.458
N	all	ss13	73	GTT	GCG	TTC	2	GGCGTTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0206650038045345	0.0476214861750206	NA	NA	0.0521157001136862	0.522525998044469	243	11	746	0.746	0.243	0.486
N	all	ss13	74	CCA	TTC	CAA	2	GTTCCAATC:GTTCCAATT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	72.4166666666667	2	33.08333333333333	0.0281392910819376	0.0630291953285242	0.446448521756758	-0.0348899042465866	0.020372306404377	0.0469860740089742	NA	NA	0.0529997797761115	0.510343569197025	234	15	751	0.751	0.234	0.468
N	all	ss13	75	ATC	CAA	TCA	2	CCAATCAAC:CCAATTAAC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0210955382248317	0.0462238448287541	NA	NA	0.0514166865088381	0.516887959238284	215	15	770	0.77	0.215	0.43
N	all	ss13	76	AAC	TCA	ACA	2	ATCAACACC:ATTAACACC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.75000000000003	2	33.75	0.0284057619693269	0.0617314855970427	0.46015030570862703	-0.0333257236277158	0.0199312571419368	0.0463751344365438	NA	NA	0.0488293779739087	0.494927073800413	273	15	712	0.712	0.273	0.546
N	all	ss13	77	ACC	ACA	CCA	2	AACACCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	70.4166666666667	2	34.416666666666664	0.0289541383570224	0.0604861633757489	0.478690277926128	-0.0315320250187264	0.0206423264053936	0.0456826142626571	NA	NA	0.0493773555001762	0.523087849099582	255	19	726	0.726	0.255	0.51
N	all	ss13	78	AAT	CCA	ATA	2	ACCAATAGC:ACCAATAGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0204480624466099	0.0446729797424764	NA	NA	0.0516982046103084	0.538370289295358	237	19	744	0.744	0.237	0.474
N	all	ss13	79	AGC	ATA	GCA	2	AATAGCAGT:AATAGTGGT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	71.08333333333337	2	34.416666666666664	0.0286773285294381	0.0604861633757489	0.474113862228133	-0.0318088348463107	0.0204974553407397	0.0457521473339424	NA	NA	0.0527950928402489	0.546843992332184	289	16	695	0.695	0.289	0.578
N	all	ss13	80	AGT	GCA	GTC	2	AGCAGTCCA:AGTGGTCCA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	2	34.166666666666664	0.043281238215485	0.0609472230590743	0.710142907963729	-0.0176659848435893	0.0245268330223867	0.0447596932661999	NaN	NaN	0.0539104769791401	0.743145214535007	391	7	602	0.602	0.391	0.782
N	all	ss13	81	CCA	GTC	CAG	2	AGTCCAGAT:GGTCCAGAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.33333333333337	1	33.83333333333333	0.043281238215485	0.0301548153585304	1.43530105228256	0.0131264228569547	0.0242725909932799	0.0323339939167209	NA	NA	0.0417583315306348	0.75326084020701	630	19	351	0.351	0.63	0.702
N	all	ss13	82	GAT	CAG	ATG	2	CCAGATGAC	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.58333333333337	1	33.83333333333333	0.0431256509016318	0.0301548153585304	1.43014143475537	0.0129708355431015	0.0240061699425181	0.0307983801249494	NA	NA	0.0397992202259569	0.744494889012308	648	14	338	0.338	0.648	0.676
N	all	ss13	83	GAC	ATG	ACC	2	GATGACCAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.4166666666667	2	34.49999999999999	0.0438614614252191	0.0603340239140544	0.72697722743803	-0.0164725624888354	0.0258907230905785	0.0457696980303161	NA	NA	0.0527832459854402	0.754980199654175	378	7	615	0.615	0.378	0.756
N	all	ss13	84	CAA	ACC	AAA	2	GACCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.49999999999999	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0247969272751846	0.0421840677137024	NA	NA	0.0517002012007843	0.782492208179222	380	4	616	0.616	0.38	0.76
N	all	ss13	85	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGGC	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000003	2	35.83333333333333	0.0449572769752751	0.0579999025523778	0.775126767405784	-0.0130426255771027	0.0259762494018488	0.0438328755105498	NA	NA	0.0525039760661578	0.803815533827564	388	1	611	0.611	0.388	0.776
N	all	ss13	86	GGC	TTG	GCT	2	ATTGGCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333337	2	35.49999999999999	0.0450698784927921	0.0585663277285774	0.769552748836602	-0.0134964492357854	0.0265533904108043	0.0427925780590731	NA	NA	0.0527275951398359	0.797977418748152	392	10	598	0.598	0.392	0.784
N	all	ss13	87	TAC	GCT	ACT	2	GGCTACTAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.25000000000003	2	35.83333333333333	0.045296782717305	0.0579999025523778	0.780980324516906	-0.0127031198350728	0.0259335948779465	0.0454396093396486	NA	NA	0.0526199938276662	0.809235490782802	437	6	557	0.557	0.437	0.874
N	all	ss13	88	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.58333333333336	2	36.16666666666666	0.0450698784927921	0.0574443341110379	0.78458353100018	-0.0123744556182457	0.0269340301326101	0.044555018447267	NA	NA	0.0507324655024008	0.807295944911289	443	7	550	0.55	0.443	0.886
N	all	ss13	89	CGA	ACC	GAA	2	TACCGAAGA	2	FALSE	1	1	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333336	2	35.66666666666666	0.0447337539717067	0.0582817382454872	0.76754323598388	-0.0135479842737805	0.0251601119249201	0.045367905969325197	NA	NA	0.0528600189774448	0.797719760923338	412	3	585	0.585	0.412	0.824
N	all	ss13	90	AGA	GAA	GAG	2	CGAAGAGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	35.499999999999986	0.0442933122327008	0.0585663277285774	0.756293145747089	-0.0142730154958766	0.0251834705730201	0.0434976395755096	NA	NA	0.0533717079060981	0.789140705082177	407	9	584	0.584	0.407	0.814
N	all	ss13	91	GCT	GAG	CTA	2	AGAGCTACC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.08333333333336	2	35.66666666666666	0.0454110940157692	0.0582817382454872	0.779165058950269	-0.012870644229718	0.0253709813163264	0.043989766794382	NA	NA	0.051686200837034	0.80334910474171894	428	5	567	0.567	0.428	0.856
N	all	ss13	92	ACC	CTA	CCA	2	GCTACCAGA:GCTACCCGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.4166666666667	2	34.999999999999986	0.0451830456487547	0.0594370287406055	0.760183451395966	-0.0142539830918508	0.0257732156993181	0.04607241360926	NA	NA	0.0512914835440125	0.781087929337461	425	9	566	0.566	0.425	0.85
N	all	ss13	93	AGA	CCA	GAC	2	ACCAGACGA:ACCCGACGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	68.75000000000003	2	34.66666666666666	0.0449572769752751	0.0600320307551524	0.748888158700454	-0.0150747537798773	0.0254439172072283	0.0456649527806486	NA	NA	0.0549976295725515	0.784009122009143	367	9	624	0.624	0.367	0.734
N	all	ss13	94	CGA	GAC	GAA	2	AGACGAATT:CGACGAGTT	1:1	FALSE	1.5	1.5	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.08333333333337	2	34.499999999999986	0.0447337539717067	0.0603340239140544	0.741434949464497	-0.0156002699423477	0.0262554660469263	0.043122658214663503	NA	NA	0.053207669874303	0.769372428032166	426	6	568	0.568	0.426	0.852
N	all	ss13	95	ATT	GAA	TTC	2	CGAATTCGT:CGAGTTCGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.833333333333333	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.50000000000004	2	35.249999999999986	0.0444574574471551	0.0589984642956841	0.753535841616937	-0.014541006848529	0.0250589921300491	0.0421787531437466	NA	NA	0.0522821598787753	0.780915948231282	402	7	591	0.591	0.402	0.804
N	all	ss13	96	CGT	TTC	GTG	2	ATTCGTGGT:GTTCGTGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.00000000000004	1	35.249999999999986	0.0441303750172001	0.0289192452027623	1.52598640482446	0.0152111298144378	0.0245761273523906	0.0290913561183569	NA	NA	0.0404082574482057	0.706592657674366	647	16	337	0.337	0.647	0.674
N	all	ss13	97	GGT	GTG	GTG	2	CGTGGTGGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.1666666666667	1	35.749999999999986	0.0440224147463932	0.0285069944752382	1.54426713712777	0.015515420271155	0.0252877643229708	0.0283442486608342	NA	NA	0.0380716675855711	0.683617345711244	678	23	299	0.299	0.678	0.598
N	all	ss13	98	GGT	GTG	GTG	2	GGTGGTGAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	36.08333333333332	0.0439149815636805	0.0282386296527663	1.55513854969866	0.0156763519109142	0.0249067988080628	0.0279300340606253	NA	NA	0.0373113300108142	0.674375944777298	680	17	303	0.303	0.68	0.606
N	all	ss13	99	GAC	GTG	ACG	2	GGTGACGGC:GGTGACGGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	71.00000000000004	1	35.41666666666665	0.043490443237762	0.0287805096612114	1.51110747341545	0.0147099335765506	0.0236784762976684	0.0299083895211796	NA	NA	0.0386805824100306	0.703728336925571	658	21	321	0.321	0.658	0.642
N	all	ss13	100	GGC	ACG	GCA	2	GACGGCAAA:GACGGTAAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	35.41666666666665	0.0439149815636805	0.0287805096612114	1.52585837014785	0.0151344719024691	0.0249700918022669	0.0302582246057212	NA	NA	0.0385143519329519	0.694351476601703	677	16	307	0.307	0.677	0.614
N	all	ss13	101	AAA	GCA	AAA	2	GGCAAAATG:GGTAAAATG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	35.41666666666665	0.0439149815636805	0.0287805096612114	1.52585837014785	0.0151344719024691	0.0247152488398589	0.0279312543180153	NA	NA	0.0384711758567268	0.69402577190323	682	14	304	0.304	0.682	0.608
N	all	ss13	102	ATG	AAA	TGA	2	AAAATGAAA	2	FALSE	0.666666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.33333333333337	1	35.41666666666665	0.0439149815636805	0.0287805096612114	1.52585837014785	0.0151344719024691	0.025973718730378	0.0317273860681122	NA	NA	0.0386782736958147	0.695581930663606	680	21	299	0.299	0.68	0.598
N	all	ss13	103	AAA	TGA	AAG	2	ATGAAAGAG:ATGAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	70.6666666666667	1	36.08333333333332	0.0437016810929818	0.0282386296527663	1.54758505034966	0.0154630514402155	0.0245063417832256	0.0286860891007016	NA	NA	0.038399490231166	0.687177044000821	684	20	296	0.296	0.684	0.592
N	all	ss13	104	GAG	AAG	AGC	2	AAAGAGCTC:AAAGATCTC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	70.1666666666667	2	37.249999999999986	0.0592901175479513	0.0557100557871529	1.06426239769848	0.00358006176079841	0.0289763859772631	0.0406209298713838	NA	NA	0.0420924254726947	0.932219733312299	540	5	455	0.455	0.54	0.91
N	all	ss13	105	CTC	AGC	TCA	2	GAGCTCAGC:GATCTCAGT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.75000000000003	2	37.66666666666666	0.0442933122327008	0.0550706014161129	0.804300499608148	-0.0107772891834121	0.0260703851190048	0.0393171612209854	NA	NA	0.0387444042647099	0.780886652475158	414	12	574	0.574	0.414	0.828
N	all	ss13	106	AGC	TCA	GCC	2	CTCAGCCCC:CTCAGTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	2	38.16666666666666	0.0441845540246642	0.0543223783836109	0.813376647698376	-0.0101378243589468	0.0257137979892943	0.0402451269970266	NA	NA	0.0384869442781591	0.792235017002736	411	15	574	0.574	0.411	0.822
N	all	ss13	107	CCA	GCC	CAA	2	AGCCCCAGA:AGTCCAAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	2	37.499999999999986	0.0441845540246642	0.0553246126797069	0.798641904290658	-0.0111400586550427	0.0256294713225449	0.040884817080182	NA	NA	0.0382518600178902	0.770876030335202	417	17	566	0.566	0.417	0.834
N	all	ss13	108	AGA	CAA	GAT	2	CCAAGATGG:CCCAGATGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.583333333333333	0.5	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	69.9166666666667	2	37.499999999999986	0.0441845540246642	0.0553246126797069	0.798641904290658	-0.0111400586550427	0.0268492924698439	0.0390377814416831	NA	NA	0.0399410434451756	0.780311929814019	385	15	600	0.6	0.385	0.77
N	all	ss13	109	TGG	GAT	GGT	2	AGATGGTAC:AGATGGTAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.83333333333337	2	37.66666666666666	0.0595846701692669	0.0550706014161129	1.08196875714223	0.00451406875315397	0.0302092530431133	0.040445264450594	NA	NA	0.0399320700118382	0.909995913412622	545	4	451	0.451	0.545	0.902
N	all	ss13	110	TAC	GGT	ACT	2	TGGTACTTC:TGGTATTTC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.1666666666667	2	38.33333333333332	0.0611024764460932	0.054077470426008	1.12990633557273	0.00702500602008521	0.0300648086897278	0.0387687069286791	NA	NA	0.0414430528161285	0.865395618582687	585	6	409	0.409	0.585	0.818
N	all	ss13	111	TTC	ACT	TCT	2	TACTTCTAT:TATTTCTAC	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.6666666666667	2	37.33333333333332	0.0606390724718212	0.0555809791152914	1.09100403478028	0.00505809335652978	0.0303630134525476	0.04057295751434	NA	NA	0.0412113627772112	0.902316625609801	581	5	414	0.414	0.581	0.828
N	all	ss13	112	TAC	TCT	ACT	2	TTCTACTAC:TTCTATTAC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	68.50000000000003	2	36.499999999999986	0.0607927570603561	0.0568993130810351	1.06842690655643	0.003893443979321	0.031284251313578	0.0394287210607064	NA	NA	0.0449510541395064	0.930977393450485	551	2	447	0.447	0.551	0.894
N	all	ss13	113	TAC	ACT	ACC	2	TACTACCTA:TATTACCTA	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.1666666666667	2	35.83333333333332	0.0601826482875392	0.0579999025523778	1.03763361038737	0.00218274573516138	0.0294898715585539	0.0409907038452183	NA	NA	0.0441752150385867	0.960591686643925	532	2	466	0.466	0.532	0.932
N	all	ss13	114	CTA	ACC	TAG	2	TACCTAGGA	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	69.6666666666667	2	35.33333333333332	0.0597330472949441	0.0588537115811214	1.01494104093351	8.79335713822649e-4	0.0290167144458469	0.0411909805631663	NA	NA	0.0427449579816769	0.983587329594019	518	10	472	0.472	0.518	0.944
N	all	ss13	115	GGA	TAG	GAA	2	CTAGGAACT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.33333333333337	2	35.66666666666666	0.0582817382454872	0.0582817382454872	1	0	0.0281127740141292	0.0421764447461613	NA	NA	0.042352129154973	1	521	2	477	0.477	0.521	0.954
N	all	ss13	116	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGGC:GGAACTGGG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	71.83333333333337	2	36.16666666666666	0.0578600049104132	0.0574443341110379	1.00723606263016	4.15670799375385e-4	0.0289403742213215	0.0423443127448788	NA	NA	0.0413459912172129	0.991978624369045	502	2	496	0.496	0.502	0.992
N	all	ss13	117	GGC	CTG	GCC	2	ACTGGCCCA:ACTGGGCCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.16666666666671	2	35.83333333333332	0.0575822255219405	0.0579999025523778	0.992798659789814	-4.17677030437338e-4	0.0289428805954248	0.0441175331347736	NA	NA	0.0430283616525574	0.9922550427751	498	7	495	0.495	0.498	0.99
N	all	ss13	118	CCA	GCC	CAG	2	GGCCCAGAA:GGGCCAGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.83333333333339	2	35.16666666666665	0.0570345959917882	0.0591439311842398	0.964335559875438	-0.00210933519245153	0.028124205342525	0.0438558056064395	NA	NA	0.0447855411924877	0.962434662678448	518	8	474	0.474	0.518	0.948
N	all	ss13	119	GAA	CAG	AAG	2	CCAGAAGCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666671	2	34.16666666666665	0.0559700169039055	0.0609472230590744	0.918335800954465	-0.00497720615516889	0.0281206888386316	0.0432352640718288	NA	NA	0.0462564780972562	0.914312840726785	445	9	546	0.546	0.445	0.89
N	all	ss13	120	GCT	AAG	CTG	2	GAAGCTGGA:GAAGCTTCA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.50000000000004	2	34.16666666666665	0.0564972895530331	0.0609472230590744	0.92698709994173	-0.00444993350604127	0.0284275447281092	0.0437665460066196	NA	NA	0.0459172387719145	0.922796243379032	459	3	538	0.538	0.459	0.918
N	all	ss13	121	GGA	CTG	CAC	2	GCTGGACTT:GCTTCACTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.16666666666671	2	34.16666666666665	0.0559700169039055	0.0609472230590744	0.918335800954465	-0.00497720615516889	0.0277958375708037	0.045920850374991	NA	NA	0.0440265680127066	0.90999086742834	430	9	561	0.561	0.43	0.86
N	all	ss13	122	CTT	CAC	TTC	2	GGACTTCCC:TCACTTCCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	33.499999999999986	0.0412002891133781	0.0622118122355633	0.66225830164494	-0.0210115231221852	0.0238452463975869	0.0454486638871383	NA	NA	0.0412254374727467	0.610280049486408	311	11	678	0.678	0.311	0.622
N	all	ss13	123	CCC	TTC	CCT	2	CTTCCCTAC:CTTCCCTAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.83333333333339	2	34.16666666666665	0.0412002891133781	0.0609472230590744	0.675999447480056	-0.0197469339456964	0.0230046680885576	0.0458596658926631	NA	NA	0.0406519206901586	0.627139832830709	311	14	675	0.675	0.311	0.622
N	all	ss13	124	TAC	CCT	ACG	2	CCCTACGGC:CCCTATGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	34.83333333333332	0.041581086362894	0.0597330472949441	0.696115270288805	-0.0181519609320501	0.0240319701048364	0.0426148079210541	NA	NA	0.0411701629958706	0.659284759422847	349	15	636	0.636	0.349	0.698
N	all	ss13	125	GGC	ACG	GCG	2	TACGGCGCT:TATGGTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.16666666666671	2	34.83333333333332	0.041581086362894	0.0597330472949441	0.696115270288805	-0.0181519609320501	0.0239416047349038	0.0413757430289834	NA	NA	0.0391868058335465	0.64320944849904	320	22	658	0.658	0.32	0.64
N	all	ss13	126	GCT	GCG	CTA	2	GGCGCTAAC:GGTGCTAAC	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.66666666666671	2	34.999999999999986	0.0412948328872705	0.0594370287406055	0.694766103929741	-0.018142195853335	0.02286270563942	0.0451533187516223	NA	NA	0.0404164149974413	0.653516876894105	327	18	655	0.655	0.327	0.654
N	all	ss13	127	AAC	CTA	ACA	2	GCTAACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.58333333333337	2	34.08333333333332	0.0407801460981609	0.0611024764460933	0.667405782384918	-0.0203223303479323	0.0242427955946352	0.0455822198307562	NA	NA	0.0403658555193783	0.614645480905754	297	13	690	0.69	0.297	0.594
N	all	ss13	128	AAA	ACA	AAG	2	AACAAAGAA:AACAAAGAC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	2	33.74999999999999	0.0405961546323978	0.0617314855970427	0.657624779960626	-0.0211353309646449	0.0236771615452161	0.0444127285277065	NA	NA	0.0432385756440004	0.624978136730453	297	13	690	0.69	0.297	0.594
N	all	ss13	129	GAA	AAG	AAG	2	AAAGAAGGC:AAAGACGGC	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666671	2	33.24999999999999	0.0405961546323978	0.0626996766264699	0.64746992036733	-0.0221035219940721	0.0230421182666508	0.0435553021717465	NA	NA	0.0443723353025658	0.618387165534779	275	14	711	0.711	0.275	0.55
N	all	ss13	130	GGC	AAG	GCA	2	GAAGGCATC:GACGGCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.33333333333337	2	33.16666666666666	0.0270299523623976	0.0628640039123036	0.429975036272027	-0.035834051549906	0.0197060722666197	0.0448212403199293	NA	NA	0.0396896241512447	0.366601840720449	149	50	801	0.801	0.149	0.298
N	all	ss13	131	ATC	GCA	TCA	2	GGCATCATA:GGCATCGTA	1:1	FALSE	1.25	0.75	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.00000000000004	2	33.49999999999999	0.0271522864979704	0.0622118122355632	0.43644905239473	-0.0350595257375927	0.0201220664017608	0.0436604976071844	NA	NA	0.0428413435580395	0.413153202924867	144	38	818	0.818	0.144	0.288
N	all	ss13	132	ATA	TCA	TAT	2	ATCATATGG:ATCGTATGG	1:1	FALSE	1.16666666666667	0.833333333333333	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666671	2	33.49999999999999	0.0269995408952429	0.0622118122355632	0.433993801579191	-0.0352122713403203	0.0189365959759871	0.0442312118411821	NA	NA	0.0384581747998971	0.35987718847745	164	37	799	0.799	0.164	0.328
N	all	ss13	133	TGG	TAT	GGG	2	ATATGGGTT:GTATGGGTT	1:1	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	1	33.49999999999999	0.0268184996810859	0.0304610393656427	0.880419717763629	-0.00364253968455675	0.0198246251595344	0.0313762249409527	NA	NA	0.0214499515072668	0.865155037122979	368	139	493	0.493	0.368	0.736
N	all	ss13	134	GTT	GGG	TTG	2	TGGGTTGCA	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.58333333333339	1	32.83333333333332	0.0269389228181416	0.0310925352587596	0.866411265403396	-0.004153612440618	0.0197086610745993	0.0310811511958619	NA	NA	0.0224555902909387	0.853252499523851	364	126	510	0.51	0.364	0.728
N	all	ss13	135	GCA	TTG	CAA	2	GTTGCAACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	1	32.49999999999999	0.0268184996810859	0.0314182062818701	0.853597415475675	-0.00459970660078417	0.0180400093340606	0.0321334766941635	NA	NA	0.022976335452422	0.841329468729056	367	119	514	0.514	0.367	0.734
N	all	ss13	136	ACT	CAA	CTG	2	GCAACTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.25000000000006	1	33.16666666666666	0.0270604324233619	0.0307735475083969	0.879340687516713	-0.00371311508503493	0.0200587331121443	0.0305195632440519	NA	NA	0.0234185322223393	0.874019831238596	370	133	497	0.497	0.37	0.74
N	all	ss13	137	GAG	CTG	AGG	2	ACTGAGGGA	2	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666671	1	33.49999999999999	0.0271830432683088	0.0304610393656427	0.89238725382985	-0.00327799609733386	0.0193192202980203	0.0323054716853923	NA	NA	0.0218663528130999	0.880835219814172	358	126	516	0.516	0.358	0.716
N	all	ss13	138	GGA	AGG	GAG	2	GAGGGAGCC	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.58333333333339	1	33.166666666666664	0.0273067703935705	0.0307735475083969	0.887345548514341	-0.00346677711482632	0.019309519493713	0.0313784151456003	NA	NA	0.0225077986343363	0.877589553169432	376	122	502	0.502	0.376	0.752
N	all	ss13	139	GCC	GAG	CCT	2	GGAGCCTTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.666666666666664	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.0194841145595024	0.0313230729557863	NA	NA	0.0226122040083255	0.90100880126022	379	127	494	0.494	0.379	0.758
N	all	ss13	140	TTG	CCT	TGA	2	GCCTTGAAT	2	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.08333333333339	1	33.666666666666664	0.0274944876870936	0.0303071537534075	0.907194648194318	-0.00281266606631388	0.0204150563636568	0.0311883752284043	NA	NA	0.0220434558644334	0.898468363913026	357	131	512	0.512	0.357	0.714
N	all	ss13	141	AAT	TGA	ATA	2	TTGAATACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000006	1	33.33333333333333	0.0268785763539719	0.0306164958901914	0.877911582382717	-0.00373791953621951	0.0181785435319889	0.0313413729288835	NA	NA	0.0211413576693781	0.859660751758774	357	130	513	0.513	0.357	0.714
N	all	ss13	142	ACA	ATA	CAC	2	AATACACCA:AATACACCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.75000000000006	1	34.33333333333333	0.0268785763539719	0.0297068535712844	0.904793780649782	-0.00282827721731251	0.0188397298473881	0.0303593769554832	NA	NA	0.0217220767622038	0.896405906478815	407	121	472	0.472	0.407	0.814
N	all	ss13	143	CCA	CAC	CAA	2	ACACCAAAA:ACACCCAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.41666666666673	1	34.666666666666664	0.0269995408952429	0.029415534864961	0.917866733315942	-0.00241599396971805	0.0194972928644052	0.0290669330826395	NA	NA	0.0211538563508777	0.909070873907935	412	132	456	0.456	0.412	0.824
N	all	ss13	144	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGAT:CCCAAAGAC	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.08333333333339	2	35.33333333333333	0.0410592825874941	0.0588537115811214	0.697649842030774	-0.0177944289936273	0.0240045843527642	0.0418203610696026	NA	NA	0.0257529314933085	0.489586201884378	226	37	737	0.737	0.226	0.452
N	all	ss13	145	GAC	AAG	ACC	2	AAAGACCAC:AAAGATCAC	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333339	2	35.58333333333333	0.0554524994575896	0.058423686245627	0.949144140348388	-0.00297118678803739	0.0292365374546336	0.0411606292011305	NA	NA	0.031114365288135	0.923923691568824	451	16	533	0.533	0.451	0.902
N	all	ss13	146	CAC	ACC	ACA	2	GACCACATT:GATCACATT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.66666666666673	2	36.08333333333333	0.0571705240409131	0.0575822255219405	0.992850198524012	-4.11701481027447e-4	0.0290556985203386	0.0406314517978476	NA	NA	0.0310063173947961	0.98940601042571	474	16	510	0.51	0.474	0.948
N	all	ss13	147	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000007	2	35.75	0.0573071018565007	0.0581404786806199	0.985666151310911	-8.33376824119193e-4	0.0294894673582862	0.0415939956218679	NA	NA	0.0315294547260143	0.978913016721144	479	16	505	0.505	0.479	0.958
N	all	ss13	148	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCACC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.66666666666673	2	34.75	0.0563645417845084	0.0598821656332629	0.941257571239199	-0.00351762384875444	0.0277763466130642	0.0447357258746054	NA	NA	0.0313470145232646	0.910652465194486	428	12	560	0.56	0.428	0.856
N	all	ss13	149	ACC	GCA	CCC	2	GGCACCCGC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.33333333333339	2	35.083333333333336	0.0574443341110378	0.0592901175479514	0.968868615660598	-0.0018457834369136	0.0289593607301233	0.0428448720992701	NA	NA	0.0310407186682723	0.952583099408682	474	17	509	0.509	0.474	0.948
N	all	ss13	150	CGC	CCC	GCA	2	ACCCGCAAT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.00000000000006	2	34.416666666666664	0.0568993130810351	0.0604861633757489	0.940699656011711	-0.00358685029471375	0.0289777958692353	0.0439657739155123	NA	NA	0.0315299825453602	0.909428061122267	447	22	531	0.531	0.447	0.894
N	all	ss13	151	AAT	GCA	ATC	2	CGCAATCCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.8333333333334	2	34.583333333333336	0.0570345959917882	0.0601826482875392	0.947691695441679	-0.00314805229575094	0.0293483600718937	0.0443425561541531	NA	NA	0.0336753053672386	0.9255202385344	438	13	549	0.549	0.438	0.876
N	all	ss13	152	CCT	ATC	CTA	2	AATCCTAAT:AATCCTGCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.50000000000006	2	34.25000000000001	0.0573071018565008	0.0607927570603562	0.942663314309059	-0.00348565520385537	0.0293853427802389	0.0454516489429658	NA	NA	0.0312532383741625	0.911196546094883	464	12	524	0.524	0.464	0.928
N	all	ss13	153	AAT	CTA	ATA	2	CCTAATAAC:CCTGCTAAC	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666673	2	34.25000000000001	0.0567646707244322	0.0607927570603562	0.933740686708372	-0.004028086335924	0.0301563641968451	0.0452153410171611	NA	NA	0.0331278372477373	0.90322199775492	441	22	537	0.537	0.441	0.882
N	all	ss13	154	AAC	ATA	ACA	2	AATAACAAT:GCTAACAAT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.66666666666673	1	34.083333333333336	0.0418713371647063	0.0299291581301553	1.39901486645956	0.0119421790345509	0.0237462400938144	0.0314147895724441	NA	NA	0.0259132253399248	0.644904312048469	656	35	309	0.309	0.656	0.618
N	all	ss13	155	AAT	ACA	ATG	2	AACAATGCT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.50000000000007	1	33.916666666666664	0.0419689902360334	0.0300792190929219	1.39528190896117	0.0118897711431115	0.024139267107655	0.0306923104882919	NA	NA	0.026690080920621	0.655976323763765	668	60	272	0.272	0.668	0.544
N	all	ss13	156	GCT	ATG	CTG	2	AATGCTGCA:AATGCTGCC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.8333333333334	1	33.916666666666664	0.042364201600918	0.0300792190929219	1.40842092575757	0.0122849825079961	0.0241067566072494	0.0307342662986113	NA	NA	0.027761635656194	0.658115475786166	635	46	319	0.319	0.635	0.638
N	all	ss13	157	GCA	CTG	CAA	2	GCTGCAATC:GCTGCCACC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.16666666666673	1	33.916666666666664	0.0567646707244322	0.0300792190929219	1.8871723547434	0.0266854516315103	0.0295147536375039	0.0306350423181999	NA	NA	0.0287820626316989	0.353845732227153	821	15	164	0.164	0.821	0.328
N	all	ss13	158	ACC	CAA	CCG	2	GCAATCGTG:GCCACCGTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.75	0.666666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	73.3333333333334	1	33.75	0.0566306643811088	0.0302307926160697	1.87327752534698	0.0263998717650391	0.0275440982061927	0.0290802440750168	NA	NA	0.0283301404527236	0.351406198435936	792	16	192	0.192	0.792	0.384
N	all	ss13	159	GTG	CCG	TGC	2	ACCGTGCTA:ATCGTGCTA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.41666666666673	1	34.416666666666664	0.0426150118597228	0.0296334842053817	1.43806956901759	0.0129815276543411	0.0244223683713201	0.0302401301353437	NA	NA	0.0265869048291355	0.625360216095589	641	52	307	0.307	0.641	0.614
N	all	ss13	160	CTA	TGC	TAC	2	GTGCTACAA	2	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.25000000000007	1	34.583333333333336	0.0427161696956043	0.0294878275056261	1.44860348519925	0.0132283421899782	0.0249099036168672	0.0302393086028618	NA	NA	0.0266894964983159	0.6201494798399	654	45	301	0.301	0.654	0.602
N	all	ss13	161	CAA	TAC	AAC	2	CTACAACTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.0833333333334	1	35.083333333333336	0.0428178090539073	0.0290593249318817	1.47346193190231	0.0137584841220256	0.0246096097730009	0.0292762738259504	NA	NA	0.0254963221591027	0.589454825949596	692	37	271	0.271	0.692	0.542
N	all	ss13	162	CTT	AAC	TTC	2	CAACTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.0833333333334	1	35.416666666666664	0.042215127927666	0.0287805096612113	1.46679570391907	0.0134346182664547	0.0255647434520869	0.029444633677416	NA	NA	0.0256762815872491	0.600813733995974	656	49	295	0.295	0.656	0.59
N	all	ss13	163	CCT	TTC	CTC	2	CTTCCTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	73.0833333333334	1	35.416666666666664	0.042215127927666	0.0287805096612113	1.46679570391907	0.0134346182664547	0.0238784886248632	0.0288046584045276	NA	NA	0.026951271161949	0.618147105880297	693	30	277	0.277	0.693	0.554
N	all	ss13	164	CAA	CTC	AAG	2	CCTCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	72.75000000000006	2	36.083333333333336	0.0424141271286908	0.0575822255219405	0.73658367220506	-0.0151680983932496	0.0238719772767908	0.0416785006055702	NA	NA	0.0406469272903543	0.709024036702672	354	21	625	0.625	0.354	0.708
N	all	ss13	165	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.41666666666671	3	36.083333333333336	0.0573756358851215	0.0881207952860292	0.651102111583165	-0.0307451594009078	0.0294453954856137	0.0527359490213961	NA	NA	0.043730590529278	0.482019350045114	231	7	762	0.762	0.231	0.462
N	all	ss13	166	ACA	GAA	CAA	2	GGAACAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.75000000000004	3	35.75	0.0571024790858329	0.088993157850987	0.641650217440841	-0.0318906787651541	0.0281638172149093	0.0532685886645207	NA	NA	0.0436790958572586	0.4653210729559	217	10	773	0.773	0.217	0.434
N	all	ss13	167	ACA	CAA	CAT	2	ACAACATTG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	72.08333333333337	3	36.416666666666664	0.05765141989764	0.0872653886078579	0.66064473919559	-0.0296139687102178	0.0298946800949926	0.0545183159082193	NA	NA	0.0426299138441127	0.487258508894286	247	6	747	0.747	0.247	0.494
N	all	ss13	168	TTG	CAT	TGC	2	ACATTGCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	72.08333333333337	3	37.083333333333336	0.0727843418621031	0.0856035011092873	0.850249591651416	-0.0128191592471842	0.0332249404910674	0.0484895374281181	NA	NA	0.0453040930761083	0.777208970678614	407	3	590	0.59	0.407	0.814
N	all	ss13	169	CCA	TGC	CAA	2	TTGCCAAAA	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	71.25000000000004	4	37.583333333333336	0.0736788296875599	0.114781984854672	0.64190238373074	-0.0411031551671125	0.0334267202076461	0.0617536229348138	NA	NA	0.0576919249462725	0.476180333945016	233	2	765	0.765	0.233	0.466
N	all	ss13	170	AAA	CAA	AAG	2	CCAAAAGGC	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.75000000000004	4	38.083333333333336	0.0742261626042775	0.113155334268708	0.655966977464926	-0.0389291716644301	0.0324782442066505	0.0593994573411763	NaN	NaN	0.0552829685225186	0.481320561842225	259	0	741	0.741	0.259	0.518
N	all	ss13	171	GGC	AAG	GCT	2	AAAGGCTTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	38.75000000000001	0.0757263107752118	0.11105698371059	0.681868967129085	-0.0353306729353785	0.0330056431464981	0.058175003442632	NA	NA	0.0572155251092659	0.536903988076601	268	1	731	0.731	0.268	0.536
N	all	ss13	172	TTC	GCT	TCT	2	GGCTTCTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333337	4	39.083333333333336	0.0761108787135566	0.110036776004805	0.691685829746892	-0.0339258972912486	0.034890133061463	0.0575076659215693	NaN	NaN	0.0569079328483362	0.551072288005325	264	1	735	0.735	0.264	0.528
N	all	ss13	173	TAC	TCT	ACG	2	TTCTACGCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	38.75000000000001	0.0764993759663411	0.11105698371059	0.688829944865918	-0.0345576077442492	0.0330831361845885	0.058877204901582	NaN	NaN	0.0560037529052658	0.537195952139749	247	0	753	0.753	0.247	0.494
N	all	ss13	174	GCA	ACG	CAG	2	TACGCAGAA:TACGCAGAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.33333333333336	4	37.75000000000001	0.0758220876535266	0.114234586398441	0.663740203768633	-0.0384124987449142	0.0324265478074022	0.0616413639975926	NaN	NaN	0.0588719911615567	0.514094835739265	238	0	762	0.762	0.238	0.476
N	all	ss13	175	GAA	CAG	AAG	2	GCAGAAGGG:GCAGAGGGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.83333333333336	4	36.75000000000001	0.0752510361297835	0.117599765999126	0.639891036265689	-0.0423487298693429	0.0335176062188796	0.0627137222383967	NA	NA	0.0570638758894102	0.458009470440415	227	1	772	0.772	0.227	0.454
N	all	ss13	176	GGA	AAG	GAA	2	GAAGGGAGC:GAGGGAAGC	1:1	FALSE	1.58333333333333	1	0.416666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.00000000000003	4	36.66666666666667	0.0762076323080868	0.117889187641809	0.646434451135873	-0.0416815553337224	0.0331952969254729	0.0618586186511562	NaN	NaN	0.0604173503907196	0.49026097625845	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	177	AGC	GAA	GCA	2	GGAAGCAGA:GGGAGCAGA	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.75000000000003	4	36.583333333333336	0.0753456127890199	0.11818004032857	0.637549391416182	-0.0428344275395505	0.0339086122306663	0.0624317862996124	NaN	NaN	0.0581834542695065	0.461611413227965	246	2	752	0.752	0.246	0.492
N	all	ss13	178	AGA	GCA	GAG	2	AGCAGAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.4166666666667	4	36.41666666666667	0.0757263107752118	0.118766081588831	0.637608901145505	-0.0430397708136191	0.0345613273453099	0.0639403759986541	NaN	NaN	0.0556916712845792	0.439627497401364	230	0	770	0.77	0.23	0.46
N	all	ss13	179	GGC	GAG	GCG	2	AGAGGCGGC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.91666666666667	0.076891863117256	0.120559681536883	0.637790861231931	-0.0436678184196271	0.0349555234738279	0.0628235966836314	NaN	NaN	0.0567829047567212	0.441874861809575	248	2	750	0.75	0.248	0.496
N	all	ss13	180	GGC	GCG	GCA	2	GGCGGCAGT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.4166666666667	4	35.583333333333336	0.076891863117256	0.12178588422283	0.631369256034368	-0.0448940211055743	0.035456276933629	0.0656374185438688	NA	NA	0.063295323492932	0.478151579514657	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	181	AGT	GCA	GTC	2	GGCAGTCAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.08333333333336	4	35.583333333333336	0.0761108787135566	0.12178588422283	0.62495648982026	-0.0456750055092737	0.0350787025567578	0.0647524402673465	NaN	NaN	0.0600618769021286	0.446976182330569	214	1	785	0.785	0.214	0.428
N	all	ss13	182	CAA	GTC	AAG	2	AGTCAAGCC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0345220155708571	0.0675468390468937	NA	NA	0.0638549212445525	0.466119217778537	210	1	789	0.789	0.21	0.42
N	all	ss13	183	GCC	AAG	CCT	2	CAAGCCTCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	68.75000000000003	4	35.25000000000001	0.0764993759663411	0.12303734291849899	0.621757379928261	-0.0465379669521583	0.0351530102002431	0.0650561134317764	NaN	NaN	0.0662735279507013	0.482547900740396	225	0	775	0.775	0.225	0.45
N	all	ss13	184	TCT	CCT	CTT	2	GCCTCTTCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	69.41666666666669	4	35.25000000000001	0.0757263107752118	0.12303734291849899	0.615474204651619	-0.0473110321432875	0.0344731418318415	0.063711104774855	NaN	NaN	0.0628758900206424	0.451779830837217	192	0	808	0.808	0.192	0.384
N	all	ss13	185	TCT	CTT	CTC	2	TCTTCTCGC:TCTTCTCGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	70.08333333333336	4	35.25000000000001	0.0749687265834466	0.12303734291849899	0.609316852958263	-0.0480686163350527	0.0342510147912603	0.0669662553203474	NA	NA	0.0588398579698337	0.413962884741389	205	0	795	0.795	0.205	0.41
N	all	ss13	186	CGC	CTC	GCT	2	TCTCGCTCC:TCTCGTTCC	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.25000000000003	5	34.583333333333336	0.0893247686558476	0.160610991304224	0.55615601354861	-0.0712862226483762	0.0351639587834655	0.0783575144641792	NaN	NaN	0.0709737311545867	0.315184444266821	139	0	861	0.861	0.139	0.278
N	all	ss13	187	TCC	GCT	CCT	2	CGCTCCTCA:CGTTCCTCA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0340051046851987	0.0796017026590062	NaN	NaN	0.0739874902385272	0.324322424226621	120	0	880	0.88	0.12	0.24
N	all	ss13	188	TCA	CCT	CAT	2	TCCTCATCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	71.50000000000003	5	34.333333333333336	0.088993157850987	0.161916285324778	0.549624503010805	-0.0729231274737913	0.0369750514941069	0.0788954580102539	NaN	NaN	0.0705468021902495	0.301283737740811	107	0	893	0.893	0.107	0.214
N	all	ss13	189	TCA	CAT	CAC	2	TCATCACGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.0355697473158658	0.0788057428707761	NaN	NaN	0.0744364666691583	0.321495697068815	131	2	867	0.867	0.131	0.262
N	all	ss13	190	CGT	CAC	GTA	2	TCACGTAGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	34.333333333333336	0.0881207952860292	0.161916285324778	0.544236764753298	-0.0737954900387491	0.036267701608902	0.0788388960167482	NaN	NaN	0.0713835875978781	0.301235323489423	134	2	864	0.864	0.134	0.268
N	all	ss13	191	AGT	GTA	GTC	2	CGTAGTCGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	72.1666666666667	5	35.00000000000001	0.0881207952860292	0.158481820250405	0.556030938733516	-0.070361024964376	0.0358762666992406	0.0762846810662451	NaN	NaN	0.0719894894840851	0.328381488694478	139	1	860	0.86	0.139	0.278
N	all	ss13	192	CGC	GTC	GCA	2	AGTCGCAAC:AGTCGCGGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	73.1666666666667	5	34.00000000000001	0.0868438898173541	0.163690174515013	0.530538195555463	-0.0768462846976593	0.0350124980012627	0.0806176723863349	NaN	NaN	0.0736745234487292	0.296924677159924	111	0	889	0.889	0.111	0.222
N	all	ss13	193	AAC	GCA	ACA	2	CGCAACAGT:CGCGGTAAT	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	74.83333333333336	5	33.00000000000001	0.0847960953267638	0.169253998250676	0.500999067692187	-0.0844579029239125	0.0347255468838671	0.0841011132008347	NaN	NaN	0.0790313574480711	0.285221461758599	83	0	917	0.917	0.083	0.166
N	all	ss13	194	AAT	ACA	ATT	2	AACAGTTCA:GGTAATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	76.1666666666667	4	32.00000000000001	0.0686978768215524	0.136741167595466	0.502393522225784	-0.0680432907739135	0.0304629764514163	0.0744309850741593	NA	NA	0.072527973485287	0.348159023197276	129	0	871	0.871	0.129	0.258
N	all	ss13	195	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAAGA:AGTTCAAGA	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	31.33333333333334	0.0544456664773409	0.139939466685309	0.389065842302918	-0.0854938002079682	0.0266986577869174	0.0799399875359562	NA	NA	0.0717161098110807	0.233216429735269	74	1	925	0.925	0.074	0.148
N	all	ss13	196	AGA	CAA	GAA	2	TCAAGAAAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.6666666666667	4	31.500000000000004	0.0533558250189307	0.139125907283501	0.383507472193558	-0.08577008226457	0.026801042913067	0.0773072530414873	NA	NA	0.0677592742581668	0.205582618585269	63	1	936	0.936	0.063	0.126
N	all	ss13	197	AAT	GAA	ATT	2	AGAAATTCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.33333333333337	4	31.66666666666667	0.0535942229866087	0.138321779350139	0.387460479748048	-0.0847275563635308	0.0268673194357005	0.0754739224966938	NA	NA	0.068634619381229	0.217026854317799	75	3	922	0.922	0.075	0.15
N	all	ss13	198	TCA	ATT	CAA	2	AATTCAACT	2	FALSE	0.333333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.00000000000004	4	32.333333333333336	0.0545695157118212	0.135196367873208	0.403631521839392	-0.0806268521613868	0.0270074196158028	0.0733087660925748	NA	NA	0.0670328601703403	0.229055295721683	85	2	913	0.913	0.085	0.17
N	all	ss13	199	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCCA:TCAACTCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.33333333333337	4	33	0.0543223783836108	0.132209431753494	0.410881263637042	-0.0778870533698831	0.026565461847399	0.0770090236494102	NA	NA	0.0675924326977047	0.24919603527219	73	3	924	0.924	0.073	0.146
N	all	ss13	200	CCA	CTC	CAG	2	ACTCCAGGC:ACTCCTGGC	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.83333333333337	4	34.16666666666667	0.054693929928504303	0.127288788480472	0.429683796832549	-0.0725948585519675	0.027968619066357	0.0699105907233468	NA	NA	0.0667023347823183	0.276444776789762	93	1	906	0.906	0.093	0.186
N	all	ss13	201	GGC	CAG	GCA	2	CCAGGCAGC:CCTGGCAGC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0277112904837888	0.0712710733996202	NA	NA	0.066069336992148	0.247902439875919	90	1	909	0.909	0.09	0.18
N	all	ss13	202	AGC	GCA	GCA	2	GGCAGCAGT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	77.16666666666671	4	33.5	0.0537142229868647	0.130054644852002	0.413012722828853	-0.0763404218651369	0.0253039973382632	0.0671628227485661	NA	NA	0.067584263920178	0.258662043691778	93	1	906	0.906	0.093	0.186
N	all	ss13	203	AGT	GCA	GTA	2	AGCAGTAGG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	76.1666666666667	4	33.83333333333333	0.0544456664773409	0.128656816904346	0.423185244181973	-0.0742111504270048	0.027311953213032	0.0700636404680545	NA	NA	0.0673429288167856	0.270466559442942	93	3	904	0.904	0.093	0.186
N	all	ss13	204	AGG	GTA	GGG	2	AGTAGGGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.1666666666667	4	34.16666666666666	0.0551973146854054	0.127288788480472	0.433638463719635	-0.0720914737950665	0.0271665138414318	0.0664544474529116	NaN	NaN	0.0616720896259548	0.242424530627935	94	4	902	0.902	0.094	0.188
N	all	ss13	205	GGA	GGG	GAA	2	AGGGGAAAT:AGGGGAACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	74.83333333333336	4	34.83333333333332	0.0554524994575896	0.124638389543236	0.444907060022253	-0.0691858900856468	0.0284050394042405	0.0659983060228653	NA	NA	0.0646150376346365	0.284286458449615	96	6	898	0.898	0.096	0.192
N	all	ss13	206	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTCT:GGAACTTCT	1:1	FALSE	2	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	75.50000000000003	4	34.16666666666666	0.0549444688504894	0.127288788480472	0.431652068547409	-0.0723443196299826	0.0270337528974496	0.068419257793448	NaN	NaN	0.0645285204279505	0.262236095249172	99	1	900	0.9	0.099	0.198
N	all	ss13	207	TCT	ATT	CTC	2	AATTCTCCT:ACTTCTCCT	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.50000000000003	4	34.83333333333332	0.0413898116754681	0.124638389543236	0.332079159776933	-0.0832485778677683	0.0240754020008526	0.0716786219512362	NA	NA	0.0602779917195373	0.167255134098731	50	5	945	0.945	0.05	0.1
N	all	ss13	208	CCT	CTC	CTG	2	TCTCCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.75000000000003	4	35.249999999999986	0.0412475068105866	0.12303734291849899	0.335243803484192	-0.0817898361079128	0.023272470646287	0.0672861674489983	NA	NA	0.059860814286743	0.171834309745727	46	6	948	0.948	0.046	0.092
N	all	ss13	209	GCT	CTG	CTA	2	CCTGCTAGA:CCTGCTCGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000003	4	34.41666666666666	0.0404138163712346	0.126281753068954	0.320028946297311	-0.0858679366977196	0.0229343866902141	0.0674833109017218	NA	NA	0.0624352050016032	0.169034489443891	35	4	961	0.961	0.035	0.07
N	all	ss13	210	AGA	CTA	GAA	2	GCTAGAATG:GCTCGAATG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.5	0.5	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333337	4	33.58333333333332	0.0399650588551816	0.129702340924675	0.308129048174941	-0.0897372820694929	0.0232913646614216	0.0728406648844333	NA	NA	0.0636075975378918	0.158305062269525	38	3	959	0.959	0.038	0.076
N	all	ss13	211	ATG	GAA	TGG	2	AGAATGGCT:CGAATGGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.75000000000004	4	33.91666666666666	0.0401433603117785	0.128312053707491	0.312857281540298	-0.0881686933957128	0.0231014481645	0.0682919797110936	NA	NA	0.0609522858020585	0.148031439006477	43	4	953	0.953	0.043	0.086
N	all	ss13	212	GCT	TGG	CTA	2	ATGGCTAGC:ATGGCTGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.75000000000004	4	34.58333333333332	0.040687942312311	0.125619222573624	0.323899013850879	-0.0849312802613135	0.0239197386965722	0.0714891960512345	NA	NA	0.0603828607131863	0.159562010686264	30	5	965	0.965	0.03	0.06
N	all	ss13	213	AGC	CTA	GCA	2	GCTAGCGGA:GCTGGCAAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.25000000000004	4	34.749999999999986	0.0404138163712346	0.124963623649129	0.32340464521666	-0.084549807277893907	0.0233403197037997	0.0702048996473041	NA	NA	0.0630631719097301	0.180012658749311	45	3	952	0.952	0.045	0.09
N	all	ss13	214	AAT	GCA	ATG	2	AGCGGAGGT:GGCAATGGC	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.58333333333339	3	34.08333333333332	0.0402331091273882	0.0936278982824407	0.429712829887731	-0.0533947891550525	0.0227264642220446	0.0609399779706358	NA	NA	0.0481511107201662	0.267473122443384	88	21	891	0.891	0.088	0.176
N	all	ss13	215	GGC	ATG	GCG	2	AATGGCGGT:GGAGGTGGT	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.91666666666671	2	34.41666666666665	0.0268184996810859	0.0604861633757489	0.443382390026716	-0.0336676636946629	0.0195097591697127	0.0484764884143706	NA	NA	0.0434172778044626	0.43807739663712	169	37	794	0.794	0.169	0.338
N	all	ss13	216	GGT	GCG	GTG	2	GGCGGTGAT:GGTGGTGAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	75.08333333333339	2	35.249999999999986	0.0271215992572094	0.0589984642956841	0.459700088485072	-0.0318768650384748	0.0182357045455182	0.046812877655379	NA	NA	0.0415218384774347	0.442657570068226	171	42	787	0.787	0.171	0.342
N	all	ss13	217	GAA	GTG	AAA	2	GGTGAAACT:GGTGATGCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	74.91666666666673	2	35.41666666666666	0.0271830432683088	0.0587096677913667	0.463007955774979	-0.0315266245230579	0.0197344872334519	0.0461018266910572	NA	NA	0.0409572363423459	0.441451219609375	172	58	770	0.77	0.172	0.344
N	all	ss13	218	ACT	AAA	CTG	2	GAAACTGCC:GATGCTGCT	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	75.16666666666673	2	35.16666666666666	0.013423177093157	0.0591439311842398	0.226957809945747	-0.0457207540910828	0.0142242146844286	0.0474434579034609	NA	NA	0.0374196676246231	0.221769074766674	0	126	874	0.874	0	0.001
N	all	ss13	219	GCC	CTG	CCC	2	ACTGCCCTC:GCTGCTCTT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.83333333333339	1	34.83333333333332	0.0406419966354019	0.0292720079293014	1.38842530835471	0.0113699887061005	0.0298353981323578	0.0305924833182673	NA	NA	0.0332662659614147	0.732510934253237	521	133	346	0.346	0.521	0.692
N	all	ss13	220	CTC	CCC	TCG	2	GCCCTCGCG:GCTCTTGCT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.50000000000006	1	34.16666666666666	0.0402781342288957	0.0298546878003148	1.34913935453953	0.010423446428581	0.0299102115998684	0.0321364746427754	NA	NA	0.0331156264913813	0.752944530281967	530	126	344	0.344	0.53	0.688
N	all	ss13	221	GCG	TCG	CGC	2	CTCGCGCTA:CTTGCTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.3333333333334	1	33.999999999999986	0.0398323689854613	0.0300040009602743	1.32756858121021	0.00982836802518695	0.0311436258264996	0.0316562210884268	NA	NA	0.0315060997257627	0.755077552537024	520	139	341	0.341	0.52	0.682
N	all	ss13	222	CTA	CGC	TAT	2	GCGCTATTG:GCTTTGCTG	1:1	TRUE	1.33333333333333	0.666666666666667	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.50000000000007	1	33.833333333333314	0.0397443976053827	0.0301548153585304	1.31801163869967	0.00958958224685223	0.0294122971198034	0.0334406705043066	NA	NA	0.0340521209530569	0.778238867722781	518	127	355	0.355	0.518	0.71
N	all	ss13	223	CTG	TAT	TGC	2	CTATTGCTG:TTGCTGCTG	1:1	FALSE	1.58333333333333	0.666666666666667	0	0.75	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.16666666666674	1	34.16666666666665	0.039920730758297	0.0298546878003148	1.33716791899851	0.0100660429579822	0.0292996221495209	0.0335046646925418	NA	NA	0.0332308870485714	0.76195673111716	512	144	344	0.344	0.512	0.688
N	all	ss13	224	CTG	TGC	TGC	2	CTGCTGCTT:TTGCTGCTA	1:1	FALSE	1.5	1	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	34.66666666666665	0.0396131668795607	0.029415534864961	1.34667504981345	0.0101976320145997	0.0303025384627846	0.0316659917130591	NA	NA	0.0337973590698968	0.762858914999784	515	133	352	0.352	0.515	0.704
N	all	ss13	225	CTA	TGC	TAG	2	CTGCTAGAC:CTGCTTGAC	1:1	FALSE	1.16666666666667	1	0.583333333333333	0.25	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666674	1	34.999999999999986	0.0395261602343306	0.0291298749871979	1.35689426239219	0.0103962852471327	0.029685402394175	0.0329499298669788	NA	NA	0.0331693601628289	0.753953704257864	535	116	349	0.349	0.535	0.698
N	all	ss13	226	GAC	TAG	ACA	2	CTAGACAGA:CTTGACAGA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	1	35.249999999999986	0.0392674190316604	0.0289192452027623	1.35783001099592	0.0103481738288981	0.0294625473436138	0.0317133307332678	NA	NA	0.0309530474659867	0.73813929446328	513	155	332	0.332	0.513	0.664
N	all	ss13	227	AGA	ACA	GAT	2	GACAGATTG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	35.583333333333314	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0288781121223107	0.031220800690284	NA	NA	0.0306988954708231	0.716567495001588	509	149	342	0.342	0.509	0.684
N	all	ss13	228	TTG	GAT	TGA	2	AGATTGAAC	2	FALSE	0.666666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.41666666666674	1	35.583333333333314	0.0397883346582442	0.0286430990492925	1.38910718388997	0.0111452356089517	0.0297476374196285	0.0294536317014627	NA	NA	0.0330261379954176	0.735764795827993	562	128	310	0.31	0.562	0.62
N	all	ss13	229	AAC	TGA	ACC	2	TTGAACCAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666676	1	35.91666666666665	0.0392674190316604	0.0283721774047871	1.38401147262793	0.0108952416268733	0.029931404787273	0.0296064193114885	NA	NA	0.0318778042479717	0.732515383145185	549	141	310	0.31	0.549	0.62
N	all	ss13	230	CAG	ACC	AGC	2	AACCAGCTT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.75000000000009	1	36.91666666666665	0.0396131668795607	0.0275893176123833	1.43581539188851	0.0120238492671774	0.0293459216966521	0.0304708796947613	NA	NA	0.0319126487606564	0.706341728571914	534	135	331	0.331	0.534	0.662
N	all	ss13	231	CTT	AGC	TTG	2	CAGCTTGAG	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.08333333333341	1	36.91666666666665	0.0399650588551815	0.0275893176123833	1.44857003774691	0.0123757412427982	0.0295024648493435	0.0288280222097036	NA	NA	0.0323188024451847	0.701773910155767	554	120	326	0.326	0.554	0.652
N	all	ss13	232	GAG	TTG	AGA	2	CTTGAGAGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.91666666666676	1	36.749999999999986	0.0395261602343306	0.0277167798918218	1.42607331690768	0.0118093803425087	0.0294625831723481	0.0304352139606953	NA	NA	0.0302380119645333	0.696131729435218	561	125	314	0.314	0.561	0.628
N	all	ss13	233	AGC	AGA	GCA	2	GAGAGCAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.91666666666676	1	35.749999999999986	0.0390120440358434	0.0285069944752382	1.36850779094689	0.0105050495606052	0.0291043302684139	0.0302905421694937	NA	NA	0.0326702690162144	0.747795377373651	548	121	331	0.331	0.548	0.662
N	all	ss13	234	AAA	GCA	AAA	2	AGCAAAATG:AGCAAAGTT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.0295108659088753	0.0297823453252609	NA	NA	0.0327457291147899	0.740472457211229	534	137	329	0.329	0.534	0.658
N	all	ss13	235	ATG	AAA	TGT	2	AAAATGTCT:AAAGTTTCT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.5	0.333333333333333	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.2500000000001	1	35.749999999999986	0.0393532888030901	0.0285069944752382	1.38047835373432	0.0108462943278519	0.0292518460538731	0.0301216552998735	NA	NA	0.0326545433902579	0.739773967821381	546	120	334	0.334	0.546	0.668
N	all	ss13	236	TCT	TGT	CTG	2	ATGTCTGGT:GTTTCTGGT	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.58333333333343	0	35.91666666666665	0.0262321821040851	0	-Inf	0.0262321821040851	0.028296659918059	0	NA	NA	0.0256736570462165	0.306896971230136	657	343	0	0	0.657	0.001
N	all	ss13	237	GGT	CTG	GTA	2	TCTGGTAAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.66666666666676	0	35.499999999999986	0.0258646320533769	0	-Inf	0.0258646320533769	0.0264011883959662	0	NA	NA	0.0277842066889926	0.35189944717361	627	373	0	0	0.627	0.001
N	all	ss13	238	AAA	GTA	AAG	2	GGTAAAGGC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.33333333333343	0	35.333333333333314	0.0256435235612095	0	-Inf	0.0256435235612095	0.0264731575208114	0	NA	NA	0.02568865407932	0.318161456038968	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	239	GGC	AAG	GCC	2	AAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000009	0	34.999999999999986	0.0257536031856686	0	-Inf	0.0257536031856686	0.0254686042128716	0	NA	NA	0.0264867626925048	0.330891488152891	642	358	0	0	0.642	0.001
N	all	ss13	240	CAA	GCC	AAC	2	GGCCAACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	79.00000000000009	0	35.66666666666665	0.0257536031856686	0	-Inf	0.0257536031856686	0.0262117757948608	0	NA	NA	0.0265331826629736	0.331738191826357	648	352	0	0	0.648	0.001
N	all	ss13	241	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.83333333333341	0	35.83333333333332	0.0258089981982962	0	-Inf	0.0258089981982962	0.0275064153569548	0	NA	NA	0.0257838713192835	0.316839127400195	646	354	0	0	0.646	0.001
N	all	ss13	242	CAA	AAC	AAC	2	CAACAACAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	78.41666666666674	0	36.249999999999986	0.0392674190316604	0	-Inf	0.0392674190316604	0.0299031561348032	0	NA	NA	0.0296484152827769	0.185358391628703	886	114	0	0	0.886	0.001
N	all	ss13	243	CAA	AAC	AAG	2	CAACAAGGC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.0833333333334	0	36.58333333333332	0.0405047802473168	0	-Inf	0.0405047802473168	0.0303173545820968	0	NA	NA	0.0302620970345665	0.180744659697966	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	244	GGC	AAG	GCC	2	CAAGGCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	0	36.58333333333332	0.0414374651394939	0	-Inf	0.0414374651394939	0.0294642993331976	0	NA	NA	0.0299055543683715	0.165865717061254	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	245	CAA	GCC	AAA	2	GGCCAAACT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	74.41666666666673	0	36.749999999999986	0.0414374651394939	0	-Inf	0.0414374651394939	0.0301087290865477	0	NA	NA	0.0300770404921856	0.16829257889563	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	246	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTC	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.41666666666673	0	35.749999999999986	0.0408727688266097	0	-Inf	0.0408727688266097	0.0298607694132509	0	NA	NA	0.0298183091485083	0.170459997556679	885	115	0	0	0.885	0.001
N	all	ss13	247	GTC	CTG	TCA	2	ACTGTCACT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.5833333333334	0	35.58333333333332	0.0407801460981609	0	-Inf	0.0407801460981609	0.0302201523114828	0	NA	NA	0.0310490008614617	0.18904398494231	880	120	0	0	0.88	0.001
N	all	ss13	248	ACT	TCA	CTA	2	GTCACTAAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	75.91666666666673	0	35.249999999999986	0.0405961546323978	0	-Inf	0.0405961546323978	0.0307926926516544	0	NA	NA	0.0296334603037105	0.170704662517852	871	129	0	0	0.871	0.001
N	all	ss13	249	AAG	CTA	AGA	2	ACTAAGAAA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.91666666666674	0	34.91666666666666	0.0400540111089282	0	-Inf	0.0400540111089282	0.0299992212931437	0	NA	NA	0.0298436037275107	0.179553682693832	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	250	AAA	AGA	AAT	2	AAGAAATCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.0833333333334	0	34.08333333333332	0.0399650588551815	0	-Inf	0.0399650588551815	0.0291801206249462	0	NA	NA	0.0283776866272432	0.159034299887595	893	107	0	0	0.893	0.001
N	all	ss13	251	TCT	AAT	CTG	2	AAATCTGCT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	76.5833333333334	0	34.58333333333332	0.0402331091273881	0	-Inf	0.0402331091273881	0.0287964467233276	0	NA	NA	0.0309611808042246	0.193782865157065	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	252	GCT	CTG	CTG	2	TCTGCTGCT	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	77.5833333333334	0	34.24999999999999	0.0397005575048303	0	-Inf	0.0397005575048303	0.0304185812756526	0	NA	NA	0.0301627490191351	0.188103060754155	867	133	0	0	0.867	0.001
N	all	ss13	253	GCT	CTG	CTG	2	GCTGCTGAG	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.25000000000006	0	33.58333333333333	0.0388436318463036	0	-Inf	0.0388436318463036	0.0289104525422982	0	NA	NA	0.028853169270476	0.178221315898305	853	147	0	0	0.853	0.001
N	all	ss13	254	GAG	CTG	AGG	2	GCTGAGGCA:GCTGAGGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.5833333333334	0	33.25	0.0386766677741952	0	-Inf	0.0386766677741952	0.028852562179364	0	NA	NA	0.0290323809089031	0.182797532592019	865	135	0	0	0.865	0.001
N	all	ss13	255	GCA	AGG	CAT	2	GAGGCATCT:GAGGCTTCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.91666666666673	0	32.916666666666664	0.0385111332176099	0	-Inf	0.0385111332176099	0.0288134861908812	0	NA	NA	0.0281935401532883	0.171952797740793	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	256	TCT	CAT	CTA	2	GCATCTAAA:GCTTCTAAG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.0833333333334	0	33.25	0.038428896281493	0	-Inf	0.038428896281493	0.0282329779199893	0	NA	NA	0.028557031287296	0.17840268390105	881	119	0	0	0.881	0.001
N	all	ss13	257	AAA	CTA	AAA	2	TCTAAAAAG:TCTAAGAAG	1:1	FALSE	1.41666666666667	0.333333333333333	1.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.75000000000007	0	32.583333333333336	0.0381034317265945	0	-Inf	0.0381034317265945	0.0287699440780541	0	NA	NA	0.0276464277166155	0.168128986891046	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	258	AAG	AAA	AGC	2	AAAAAGCCT:AAGAAGCCT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000007	0	31.333333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0284775118432566	0	NA	NA	0.0278748999238989	0.178439074985355	886	114	0	0	0.886	0.001
N	all	ss13	259	CCT	AGC	CTC	2	AAGCCTCGC:AAGCCTCGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.5	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0279895454466148	0	NA	NA	0.0285626315186278	0.187277909695443	866	134	0	0	0.866	0.001
N	all	ss13	260	CGC	CTC	GCC	2	CCTCGCCAA:CCTCGGCAA	1:1	FALSE	1	1	0.833333333333333	0.166666666666667	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.5	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0283001897201979	0	NA	NA	0.0292737283421945	0.198218986095724	874	126	0	0	0.874	0.001
N	all	ss13	261	CAA	GCC	AAA	2	CGCCAAAAA:CGGCAAAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.66666666666673	0	31.666666666666668	0.0376648177342698	0	-Inf	0.0376648177342698	0.0286959882670701	0	NA	NA	0.0283356979461009	0.183770261876777	876	124	0	0	0.876	0.001
N	all	ss13	262	AAA	AAA	AAC	2	CAAAAACGT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000006	0	31.333333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0298480500144559	0	NA	NA	0.027835834771421	0.177830491499882	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	263	CGT	AAC	GTA	2	AAACGTACT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.83333333333339	0	31.833333333333336	0.038063135955626	0	-Inf	0.038063135955626	0.0295746282351836	0	NA	NA	0.0297121246618071	0.200171155577259	863	137	0	0	0.863	0.001
N	all	ss13	264	ACT	GTA	CTG	2	CGTACTGCC	2	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	79.83333333333339	0	32.833333333333336	0.0385523838449736	0	-Inf	0.0385523838449736	0.0283536466275339	0	NA	NA	0.0296321780744246	0.193247825731531	862	138	0	0	0.862	0.001
N	all	ss13	265	GCC	CTG	CCA	2	ACTGCCACA:ACTGCCACT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.50000000000004	0	32.16666666666667	0.0382248326940206	0	-Inf	0.0382248326940206	0.029364525379052	0	NA	NA	0.028555261293828	0.180692258069042	877	123	0	0	0.877	0.001
N	all	ss13	266	ACA	CCA	CAA	2	GCCACAAAA:GCCACTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.50000000000004	0	31.833333333333336	0.0377438129156367	0	-Inf	0.0377438129156367	0.027630996282185	0	NA	NA	0.0275943977697037	0.171372467826143	872	128	0	0	0.872	0.001
N	all	ss13	267	AAA	CAA	AAC	2	ACAAAACAG:ACTAAAGCA	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.00000000000004	0	31.833333333333336	0.037507815430996	0	-Inf	0.037507815430996	0.0288598290353257	0	NA	NA	0.0274441532798762	0.171720601651767	878	122	0	0	0.878	0.001
N	all	ss13	268	CAG	AAC	AGT	2	AAACAGTAC:AAAGCATAC	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.33333333333337	0	31.833333333333336	0.0378231402201689	0	-Inf	0.0378231402201689	0.0279541350662989	0	NA	NA	0.0267168146459138	0.1568617607355	879	121	0	0	0.879	0.001
N	all	ss13	269	TAC	AGT	ACA	2	CAGTACAAC:GCATACAAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333337	0	32	0.0123206056064609	0	-Inf	0.0123206056064609	0.012088474816205	0	NA	NA	0.0125550189290022	0.326430469863236	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	270	AAC	ACA	ACG	2	TACAACGTC:TACAATGTA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32.16666666666667	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0122768369931609	0	NA	NA	0.0127171110781392	0.331640583987739	625	375	0	0	0.625	0.001
N	all	ss13	271	GTA	ACG	TAA	2	AACGTCACT:AATGTAACA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.33333333333336	0	31.833333333333336	0.0123969764634079	0	-Inf	0.0123969764634079	0.0122324790626972	0	NA	NA	0.0124044702186174	0.317602953579518	621	379	0	0	0.621	0.001
N	all	ss13	272	ACA	TAA	CAC	2	GTAACACAA:GTCACTCAA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.00000000000003	0	32.666666666666664	0.0124484185567784	0	-Inf	0.0124484185567784	0.0118333689246625	0	NA	NA	0.0122355606799397	0.308964770742654	612	388	0	0	0.612	0.001
N	all	ss13	273	CAA	CAC	AAG	2	ACACAAGCT:ACTCAAGCA	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.6666666666667	0	32	0.012345957790554	0	-Inf	0.012345957790554	0.0129614992277401	0	NA	NA	0.0126761755873807	0.330081499957541	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	274	GCA	AAG	CAT	2	CAAGCATTT:CAAGCTTTC	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0126353085922389	0	NA	NA	0.012962959980236	0.339898165876485	635	365	0	0	0.635	0.001
N	all	ss13	275	TTC	CAT	TCG	2	GCATTTGGG:GCTTTCGGC	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	32.166666666666664	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0120029862510399	0	NA	NA	0.0118887958260184	0.30400730100614	633	367	0	0	0.633	0.001
N	all	ss13	276	GGC	TCG	GCA	2	TTCGGCAGA:TTTGGGAGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000003	0	31.666666666666668	0.0122202296145754	0	-Inf	0.0122202296145754	0.0123910208732848	0	NA	NA	0.0123161053145452	0.321092451707087	610	390	0	0	0.61	0.001
N	all	ss13	277	AGA	GCA	GAC	2	GGCAGACGT:GGGAGACGT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	32	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0116170339075587	0	NA	NA	0.0121517281847307	0.312614891639186	622	378	0	0	0.622	0.001
N	all	ss13	278	CGT	GAC	GTG	2	AGACGTGGT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.833333333333332	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.0122505154636386	0	NA	NA	0.012885983726096	0.340988532277912	631	369	0	0	0.631	0.001
N	all	ss13	279	GGT	GTG	GTC	2	CGTGGTCCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0125462444644129	0	NA	NA	0.011956136495664	0.300793403648113	656	344	0	0	0.656	0.001
N	all	ss13	280	CCA	GTC	CAG	2	GGTCCAGAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.50000000000003	0	32.5	0.0123714145268331	0	-Inf	0.0123714145268331	0.0128499585507232	0	NA	NA	0.0120950400745175	0.306378664219335	638	362	0	0	0.638	0.001
N	all	ss13	281	GAA	CAG	AAC	2	CCAGAACAA	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.1666666666667	0	31.833333333333332	0.0122702123289052	0	-Inf	0.0122702123289052	0.012121275417714	0	NA	NA	0.011470816136495	0.284759064659166	619	381	0	0	0.619	0.001
N	all	ss13	282	CAA	AAC	AAA	2	GAACAAACC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.33333333333336	0	32	0.0122451699655716	0	-Inf	0.0122451699655716	0.0123751887266656	0	NA	NA	0.0123382797009066	0.320976308856739	640	360	0	0	0.64	0.001
N	all	ss13	283	ACC	AAA	CCC	2	CAAACCCAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.66666666666669	0	32.666666666666664	0.0126585283405138	0	-Inf	0.0126585283405138	0.0122345762435832	0	NA	NA	0.0125290397151899	0.312334779738098	645	355	0	0	0.645	0.001
N	all	ss13	284	CAA	CCC	AAG	2	ACCCAAGGA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	79.00000000000001	0	32.333333333333336	0.012766265677073	0	-Inf	0.012766265677073	0.0128963791495391	0	NA	NA	0.0123548003356435	0.301461615391722	618	382	0	0	0.618	0.001
N	all	ss13	285	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAAAT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.33333333333336	0	32.333333333333336	0.0128758527167741	0	-Inf	0.0128758527167741	0.0129588247275733	0	NA	NA	0.0130829095998729	0.32503022108897	630	370	0	0	0.63	0.001
N	all	ss13	286	AAT	GAA	ATT	2	GGAAATTTC:GGAAATTTT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.33333333333336	1	32.666666666666664	0.0259766224970672	0.0312545223004261	0.831131643842563	-0.00527789980335889	0.0188919066180999	0.0335409541599128	NA	NA	0.0233259395030847	0.820993447958408	330	138	532	0.532	0.33	0.66
N	all	ss13	287	TTC	ATT	TCG	2	AATTTCGGG:AATTTTGGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.5	0.833333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.83333333333336	1	32.5	0.0261464386246643	0.0314182062818701	0.832206599895936	-0.00527176765720586	0.0186123169644725	0.0332875862710522	NA	NA	0.0242158728493323	0.827663760203881	326	124	550	0.55	0.326	0.652
N	all	ss13	288	GGG	TCG	GGG	2	TTCGGGGAC:TTTGGGGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.50000000000001	1	32.333333333333336	0.0262608883838265	0.0315836140125951	0.831471926339843	-0.00532272562876861	0.0183764814987733	0.0325569071222125	NA	NA	0.0228165170080438	0.81554097477507	347	140	513	0.513	0.347	0.694
N	all	ss13	289	GAC	GGG	ACC	2	GGGGACCAA:GGGGACCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.00000000000001	1	32.833333333333336	0.026434454296256	0.0310925352587596	0.850186518283637	-0.00465808096250356	0.0190780184527018	0.0315913653378405	NA	NA	0.0235138860140537	0.842967485534343	347	132	521	0.521	0.347	0.694
N	all	ss13	290	CAA	ACC	AAG	2	GACCAAGAC:GACCAGGAA	1:1	FALSE	1.5	0.333333333333333	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	77.25000000000001	1	32.583333333333336	0.0263473854682498	0.0313361505112163	0.840798408177776	-0.00498876504296641	0.0184472118564214	0.0328367446497338	NA	NA	0.022852598939254	0.827193918905041	353	134	513	0.513	0.353	0.706
N	all	ss13	291	GAA	AAG	AAC	2	CAAGACCTA:CAGGAACTA	1:1	FALSE	2.25	0.333333333333333	0.416666666666667	0	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	2	78.41666666666669	1	31.416666666666668	0.0259485340559256	0.0325254218363474	0.797792391025286	-0.00657688778042175	0.0186216707268992	0.0354865238013144	NA	NA	0.024817337060409	0.791000352555231	349	124	527	0.527	0.349	0.698
N	all	ss13	292	CTA	AAC	TAA	2	GAACTAATC:GACCTAATC	1:1	FALSE	0.333333333333333	0	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	78.83333333333336	1	31	0.0127934871784325	0.032972342565837	0.388006619574792	-0.0201788553874046	0.0133164938352633	0.03436186909073	NA	NA	0.0211214933628717	0.339390277936076	0	369	631	0.631	0	0.001
N	all	ss13	293	ATC	TAA	TCA	2	CTAATCAGA	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	30.666666666666668	0.0124226442537559	0.0333388219281254	0.372617973140674	-0.0209161776743694	0.0123532994737032	0.035390969488463	NA	NA	0.0219405228019386	0.340431690012652	0	382	618	0.618	0	0.001
N	all	ss13	294	AGA	TCA	GAC	2	ATCAGACAA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.5	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.83333333333336	1	31.666666666666668	0.0123206056064609	0.0322630388127681	0.381879886701344	-0.0199424332063072	0.012986234065926	0.0340556334190298	NA	NA	0.0212100358234223	0.347096665599739	0	365	635	0.635	0	0.001
N	all	ss13	295	CAA	GAC	AAG	2	AGACAAGGA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	82.50000000000001	1	31.5	0.0122202296145754	0.0324374878453625	0.376731689976494	-0.0202172582307871	0.0121553884172801	0.0341893680160684	NA	NA	0.0201064459734392	0.314650720574864	0	358	642	0.642	0	0.001
N	all	ss13	296	GGA	AAG	GAA	2	CAAGGAACT	2	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	1	81.16666666666669	1	32.166666666666664	0.0124226442537559	0.0317507728699206	0.391254861878485	-0.0193281286161646	0.0127641357599911	0.0349048665324499	NA	NA	0.0200990634938763	0.336228841264212	0	353	647	0.647	0	0.001
N	all	ss13	297	ACT	GAA	CTG	2	GGAACTGAT	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.16666666666669	1	31.833333333333336	0.0374298041973081	0.0320904564039067	1.1663842896529	0.00533934779340132	0.0278268593183086	0.03242025519823	NA	NA	0.0343116868554962	0.876338002211547	506	128	366	0.366	0.506	0.732
N	all	ss13	298	GAT	CTG	ATT	2	ACTGATTAC	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.0286095759826525	0.0315805832864668	NA	NA	0.0322699835726835	0.874690718455237	513	125	362	0.362	0.513	0.724
N	all	ss13	299	TAC	ATT	ACA	2	GATTACAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.33333333333336	1	31.666666666666668	0.0373521168628637	0.0322630388127681	1.15773709598866	0.00508907805009558	0.027320012825913	0.0336026069499668	NA	NA	0.032990974587631	0.87740735658459	490	120	390	0.39	0.49	0.78
N	all	ss13	300	AAA	ACA	AAC	2	TACAAACAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.33333333333336	1	31.333333333333332	0.0368926831430788	0.0326138339548042	1.13119736839907	0.00427884918827467	0.0275225425262827	0.0325773563677401	NA	NA	0.0326775401238296	0.8958215107616	485	137	378	0.378	0.485	0.756
N	all	ss13	301	CAT	AAC	ATT	2	AAACATTGG	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.58333333333336	2	31.083333333333332	0.0494514815652544	0.0672719567702241	0.735098010217872	-0.0178204752049697	0.0317058048687337	0.0513643896601975	NA	NA	0.0398089402160106	0.654405755486706	305	48	647	0.647	0.305	0.61
N	all	ss13	302	TGG	ATT	GGC	2	CATTGGCCG	2	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	31.416666666666668	0.0500707265730996	0.0665255778124882	0.752653764454795	-0.0164548512393886	0.0298315470260169	0.0497342947511342	NA	NA	0.0420637691029017	0.695658110151467	320	41	639	0.639	0.32	0.64
N	all	ss13	303	CCG	GGC	CGC	2	TGGCCGCAA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.58333333333336	2	31.75	0.0507056829412418	0.0657955896932053	0.770654738070964	-0.0150899067519635	0.030210453988415	0.0478986925936651	NA	NA	0.041887724562315	0.718662793365598	329	46	625	0.625	0.329	0.658
N	all	ss13	304	CAA	CGC	AAA	2	CCGCAAATT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.25000000000001	2	30.75	0.050280603697972	0.0680352852661241	0.739037155518587	-0.0177546815681521	0.0312993725651438	0.0512251073504065	NA	NA	0.0406483936625625	0.662265976832067	314	50	636	0.636	0.314	0.628
N	all	ss13	305	ATT	AAA	TTG	2	CAAATTGCA	2	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.08333333333336	2	29.75	0.0510292410063947	0.0704329495874262	0.724508079035561	-0.0194037085810315	0.0320582649404783	0.0534177020217093	NA	NA	0.0432780601988838	0.653900782695231	302	46	652	0.652	0.302	0.604
N	all	ss13	306	GCA	TTG	CAC	2	ATTGCACAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.91666666666669	2	29.083333333333332	0.0511380136321413	0.0721276112438599	0.70899358442977	-0.0209895976117187	0.0306307785158381	0.0535810606892787	NA	NA	0.0446795476696889	0.638511569823778	296	53	651	0.651	0.296	0.592
N	all	ss13	307	CAA	CAC	AAT	2	GCACAATTT	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.16666666666669	2	29.5	0.0509750280987295	0.0710590256920247	0.717361765128321	-0.0200839975932952	0.0321227206779374	0.0513480719874258	NA	NA	0.0434941875717045	0.644251434432523	296	51	653	0.653	0.296	0.592
N	all	ss13	308	TTT	AAT	TTG	2	CAATTTGCC:CAATTTGCT	1:1	FALSE	1.83333333333333	0.5	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.83333333333336	2	29.833333333333332	0.0511925740908369	0.0702267037754945	0.728961653312005	-0.0190341296846576	0.0324363637009454	0.0546804813665347	NA	NA	0.043606713726106	0.662477340407719	307	47	646	0.646	0.307	0.614
N	all	ss13	309	GCC	TTG	CCC	2	TTTGCCCCC:TTTGCTCCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333336	2	30.333333333333336	0.0515223984646761	0.0690141740401891	0.746548070468438	-0.017491775575513	0.0334730709351742	0.0516971438277327	NA	NA	0.043253446690072	0.685917210854492	311	56	633	0.633	0.311	0.622
N	all	ss13	310	CCA	CCC	CAA	2	GCCCCCAGC:GCTCCAAGT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	30.333333333333336	0.0510835693943593	0.0690141740401891	0.740189535045536	-0.0179306046458298	0.0307078127038677	0.0511448707046186	NA	NA	0.0431500077021064	0.677745783776171	312	45	643	0.643	0.312	0.624
N	all	ss13	311	AGC	CAA	GCG	2	CCAAGTGCC:CCCAGCGCT	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.00000000000001	2	30.333333333333336	0.0510835693943593	0.0690141740401891	0.740189535045536	-0.0179306046458298	0.0309591846022313	0.0538795735224222	NA	NA	0.0442208700769204	0.685125942416691	303	51	646	0.646	0.303	0.606
N	all	ss13	312	GCC	GCG	CCT	2	AGCGCTTCA:AGTGCCTCT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.66666666666669	2	30.000000000000004	0.0513020451633004	0.069817817299509	0.734798754066194	-0.0185157721362086	0.031081524671315	0.051783378091008	NA	NA	0.0434013730325798	0.669658169527663	325	58	617	0.617	0.325	0.65
N	all	ss13	313	TCA	CCT	CAG	2	GCCTCTGCA:GCTTCAGCG	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.33333333333336	2	30.000000000000004	0.0508669472540708	0.069817817299509	0.728566850433872	-0.0189508700454382	0.0315472133828877	0.0527833562982357	NA	NA	0.043389888569613	0.66228704363493	301	36	663	0.663	0.301	0.602
N	all	ss13	314	GCA	CAG	CAT	2	TCAGCGTTC:TCTGCATTC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	29.000000000000007	0.0502279695796377	0.0723451996406717	0.694281995614262	-0.022117230061034	0.0315156136373004	0.0528390507262439	NA	NA	0.043018193392733	0.607156451523785	276	52	672	0.672	0.276	0.552
N	all	ss13	315	TTC	CAT	TCT	2	GCATTCTTT:GCGTTCTTC	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.33333333333336	2	28.66666666666667	0.0496048518784087	0.073228852172937	0.677394912066382	-0.0236240002945282	0.0315140647180542	0.0572879381781564	NA	NA	0.0442033119082055	0.593037428049151	252	64	684	0.684	0.252	0.504
N	all	ss13	316	TTC	TCT	TCG	2	TTCTTCGGA:TTCTTTGGA	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.33333333333336	2	29.000000000000004	0.0502279695796377	0.0723451996406717	0.694281995614262	-0.022117230061034	0.0313345908880554	0.0537771825254681	NA	NA	0.0447987553118613	0.621516731928011	278	47	675	0.675	0.278	0.556
N	all	ss13	317	GGA	TCG	GAA	2	TTCGGAATG:TTTGGAATG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.6666666666667	2	28.166666666666668	0.0500185308740041	0.0745955951479785	0.67052928225561	-0.0245770642739744	0.0316585830065819	0.0570749297260184	NA	NA	0.0468017362813029	0.599491804973839	247	46	707	0.707	0.247	0.494
N	all	ss13	318	ATG	GAA	TGT	2	GGAATGTCA:GGAATGTCG	1:1	FALSE	2.66666666666667	0	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.08333333333336	2	27.75	0.0497591768358708	0.0757741689236761	0.656677302340208	-0.0260149920878053	0.0295679416664825	0.0550539993772961	NA	NA	0.0452490277703007	0.565339109697124	261	48	691	0.691	0.261	0.522
N	all	ss13	319	TCA	TGT	CAC	2	ATGTCACGC:ATGTCGCGC	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.58333333333336	2	27.916666666666668	0.0500707265730996	0.075298294736773	0.664964947056721	-0.0252275681636733	0.0302147587498791	0.0552613080647598	NA	NA	0.0493901479598981	0.60950414550935	275	41	684	0.684	0.275	0.55
N	all	ss13	320	CGC	CAC	GCA	2	TCACGCATT:TCGCGCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.4166666666667	2	28.083333333333336	0.0501754455827152	0.0748283653087125	0.670540447806269	-0.0246529197259974	0.0304982516517152	0.0551599398599051	NA	NA	0.0452317684248433	0.585729098944781	262	59	679	0.679	0.262	0.524
N	all	ss13	321	ATT	GCA	TTG	2	CGCATTGGC	2	FALSE	1.16666666666667	0.5	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.416666666666668	0.0499664439235005	0.0739059002893285	0.676081932942982	-0.023939456365828	0.0300790441069781	0.0575671964455149	NA	NA	0.04381632232986	0.5848189628592	290	48	662	0.662	0.29	0.58
N	all	ss13	322	GGC	TTG	GCA	2	ATTGGCATG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.4166666666667	2	27.91666666666667	0.0495536228075988	0.075298294736773	0.658097543653914	-0.0257446719291742	0.029377381690188598	0.0547641892226979	NA	NA	0.0469791144209129	0.583690189466886	257	48	695	0.695	0.257	0.514
N	all	ss13	323	ATG	GCA	TGG	2	GGCATGGAA	2	FALSE	2	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	2	27.91666666666667	0.0491475696448996	0.075298294736773	0.65270494925163	-0.0261507250918733	0.0287378408844303	0.0592539849214151	NA	NA	0.0469098850692829	0.57720822224644	267	42	691	0.691	0.267	0.534
N	all	ss13	324	GAA	TGG	AAG	2	ATGGAAGTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	27.91666666666667	0.0493497606808473	0.075298294736773	0.655390149981002	-0.0259485340559256	0.0300850743133103	0.0582098065299139	NA	NA	0.0459449350754004	0.572227060021407	271	34	695	0.695	0.271	0.542
N	all	ss13	325	GTC	AAG	TCA	2	GAAGTCACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.75000000000003	2	28.91666666666667	0.0499664439235005	0.0725641058409195	0.688583471737951	-0.022597661917419	0.030477665915437	0.0553362085997356	NA	NA	0.0435592506477755	0.603914264598695	280	51	669	0.669	0.28	0.56
N	all	ss13	326	ACA	TCA	CAC	2	GTCACACCT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000003	2	29.33333333333334	0.0498108321742552	0.0714826348532436	0.696824232577865	-0.0216718026789884	0.0295544783493934	0.0537450701554833	NA	NA	0.0437818347682557	0.620603434246236	278	54	668	0.668	0.278	0.556
N	all	ss13	327	CCT	CAC	CTT	2	ACACCTTCG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.75000000000003	2	29.250000000000004	0.0493497606808473	0.071696340510766	0.688316311952309	-0.0223465798299186	0.0293092645819628	0.0529812743899967	NA	NA	0.0435807338826693	0.608117243240514	275	51	674	0.674	0.275	0.55
N	all	ss13	328	TCG	CTT	CGG	2	CCTTCGGGA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.41666666666669	3	29.58333333333334	0.0495536228075988	0.108952531416164	0.454818462347788	-0.0593989086085652	0.0310927174874414	0.0695083056975195	NA	NA	0.0636927980663205	0.351034601199846	154	23	823	0.823	0.154	0.308
N	all	ss13	329	GGA	CGG	GAA	2	TCGGGAACA:TCGGGAACG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.08333333333336	3	29.58333333333334	0.0491475696448996	0.108952531416164	0.451091580948878	-0.0598049617712643	0.0304717038633673	0.0660218965616444	NA	NA	0.0587451044833948	0.308658173837009	109	7	884	0.884	0.109	0.218
N	all	ss13	330	ACA	GAA	CAT	2	GGAACATGG:GGAACGTGG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	3	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.11306631811959	0.425953340236639	-0.0649053422482923	0.0287008980387951	0.0700823118393831	NA	NA	0.0624253529078691	0.298466623703753	126	13	861	0.861	0.126	0.252
N	all	ss13	331	TGG	CAT	GGC	2	ACATGGCTG:ACGTGGTTG	1:1	FALSE	2.33333333333333	0	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0481609758712978	0.154888999008431	0.310938647545113	-0.106728023137133	0.0312832639203582	0.0897471937444864	NA	NA	0.0799404142385738	0.181845354833763	59	8	933	0.933	0.059	0.118
N	all	ss13	332	CTG	GGC	TGA	2	TGGCTGACT:TGGTTGACC	1:1	FALSE	0	0	0.666666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.08333333333336	4	28.91666666666667	0.0485508200337835	0.152908411727716	0.317515691159214	-0.104357591693933	0.0307268231058783	0.0843105071859568	NA	NA	0.0806168945979643	0.19549695854867	68	10	922	0.922	0.068	0.136
N	all	ss13	333	ACC	TGA	CCT	2	CTGACTTAT:TTGACCTAC	1:1	FALSE	1	1	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	86.75000000000003	4	28.58333333333334	0.0599719947335073	0.154888999008431	0.387193377950896	-0.0949170042749234	0.0312965537873439	0.0866200404327066	NA	NA	0.0809364420650198	0.240902062057468	91	1	908	0.908	0.091	0.182
N	all	ss13	334	TAC	CCT	ACA	2	ACCTACACA:ACTTATCAT	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.4166666666667	4	29.250000000000004	0.0594959973791482	0.150978005779684	0.394070626856526	-0.0914820084005354	0.0330656805556609	0.090834079437316	NA	NA	0.081165055486752	0.259695649230576	92	2	906	0.906	0.092	0.184
N	all	ss13	335	ACA	ACA	ATG	2	TACACAGGT:TATCATGGA	1:1	TRUE	1.5	0.666666666666667	0.833333333333333	0	1	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	5	87.6666666666667	4	29.000000000000004	0.0593194416279121	0.152421181209951	0.389181091217257	-0.0931017395820392	0.0313476126807916	0.09123344179481	NA	NA	0.0782105735592148	0.233889851906557	102	0	898	0.898	0.102	0.204
N	all	ss13	336	GGA	ATG	GAG	2	ACAGGTGCC:CATGGAGCC	1:1	FALSE	1.83333333333333	1	0.166666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.33333333333337	3	29.66666666666667	0.0472597258715505	0.108623210908842	0.435079440905236	-0.0613634850372915	0.029000963974843	0.0703294220826551	NA	NA	0.0687856741106067	0.372341008831458	172	7	821	0.821	0.172	0.344
N	all	ss13	337	GCC	GAG	CCA	2	GGAGCCATT:GGTGCCATC	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	87.16666666666671	3	30.000000000000004	0.0473530022028017	0.107325632730505	0.441208693562565	-0.0599726305277032	0.029401398354006	0.068614614218098	NA	NA	0.0692619877720775	0.386555492450379	146	8	846	0.846	0.146	0.292
N	all	ss13	338	ATC	CCA	TCA	2	GCCATCAAA:GCCATTAAA	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	88.25000000000006	3	29.58333333333334	0.0467532063321102	0.108952531416164	0.429115374598575	-0.0621993250840537	0.0291043248779403	0.0680665166764491	NA	NA	0.0738960321772395	0.39994805795377403	173	8	819	0.819	0.173	0.346
N	all	ss13	339	AAA	TCA	AAT	2	ATCAAATTG:ATTAAATTG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.08333333333339	3	29.416666666666668	0.0463020678989018	0.109617210244414	0.422397794978197	-0.063315142345512	0.0268220373056724	0.0717671822274708	NA	NA	0.0704226334129685	0.368613369698544	161	7	832	0.832	0.161	0.322
N	all	ss13	340	TTG	AAT	TGG	2	AAATTGGAT	2	FALSE	2.66666666666667	0	0	0.333333333333333	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0292194806886116	0.069940858320524	NA	NA	0.071832863402296	0.369517605834658	145	4	851	0.851	0.145	0.29
N	all	ss13	341	GAT	TGG	ATG	2	TTGGATGAC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	89.33333333333339	3	29.166666666666668	0.046168419749575	0.110629602831442	0.417324283627034	-0.0644611830818673	0.0285689627881749	0.0704621319182796	NA	NA	0.0674510818124743	0.339237427315908	143	5	852	0.852	0.143	0.286
N	all	ss13	342	GAC	ATG	ACA	2	GATGACAAA	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	88.83333333333339	3	29.333333333333336	0.070779399921271	0.109952605643907	0.643726444741999	-0.0391732057226356	0.0364576865036361	0.0704822349841183	NaN	NaN	0.0751091538386527	0.601983437926601	283	1	716	0.716	0.283	0.566
N	all	ss13	343	AAA	ACA	AAG	2	GACAAAGAT	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.16666666666671	3	30.333333333333336	0.0721999950227112	0.106058740537371	0.680754784159166	-0.0338587455146602	0.0384621793463136	0.0704176182605913	NA	NA	0.0744820792372976	0.649404837868986	309	4	687	0.687	0.309	0.618
N	all	ss13	344	GAT	AAG	ATC	2	AAAGATCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.50000000000006	3	30.333333333333336	0.0736788296875599	0.106058740537371	0.694698327683781	-0.0323799108498115	0.0388597492807417	0.0641570079654315	NaN	NaN	0.0739573374980706	0.661517660271051	311	3	686	0.686	0.311	0.622
N	all	ss13	345	CCA	ATC	CAA	2	GATCCAAAT:GATCCACAA	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.16666666666671	3	30	0.0749062787858663	0.107325632730505	0.69793465810685	-0.0324193539446386	0.0403824427386573	0.0680311605364151	NA	NA	0.0716201946013022	0.65079603384636	316	0	684	0.684	0.316	0.632
N	all	ss13	346	AAT	CAA	AAT	2	CCAAATTTC:CCACAATTC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	83.83333333333339	3	30.333333333333336	0.0752195633615915	0.106058740537371	0.709225500703421	-0.0308391771757799	0.0398854525377061	0.0690247903724594	NA	NA	0.0728908682409876	0.672231802808164	338	3	659	0.659	0.338	0.676
N	all	ss13	347	TTC	AAT	TCA	2	AATTTCAAA:CAATTCAAA	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	83.00000000000006	3	30.5	0.0498108321742552	0.105436462965892	0.472425105822913	-0.0556256307916368	0.0304605315410563	0.0671310530405906	NA	NA	0.0702932664840045	0.428747626822706	191	12	797	0.797	0.191	0.382
N	all	ss13	348	AAA	TCA	AAG	2	TTCAAAGAC:TTCAAAGAT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	82.83333333333339	3	30.666666666666668	0.0499144653819543	0.104821456781369	0.476185572254193	-0.0549069913994147	0.0312173948563526	0.0631757631902145	NA	NA	0.064165470179131	0.39215857903928	172	5	823	0.823	0.172	0.344
N	all	ss13	349	GAC	AAG	ACA	2	AAAGACAAC:AAAGATCAA	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	81.83333333333339	3	30.999999999999996	0.0505454383004815	0.103612753860613	0.487830275879732	-0.0530673155601314	0.0295920799747394	0.0669497510327142	NA	NA	0.0674462543559769	0.431393722230982	202	7	791	0.791	0.202	0.404
N	all	ss13	350	AAC	ACA	AAG	2	GACAACGTC:GATCAAGTC	1:1	TRUE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	80.33333333333339	3	31.833333333333336	0.0515223984646761	0.100709711722406	0.511593148103644	-0.0491873132577299	0.0313138810727268	0.060756332918438	NA	NA	0.0714268198276758	0.491050300401194	202	10	788	0.788	0.202	0.404
N	all	ss13	351	GTC	AAG	TCA	2	AACGTCATA:CAAGTCATT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	80.41666666666671	2	31.75	0.0382654718118908	0.0657955896932053	0.581581105820569	-0.0275301178813146	0.029513627787564	0.0503703308991908	NA	NA	0.0575268233149679	0.632250674510447	311	10	679	0.679	0.311	0.622
N	all	ss13	352	ATA	TCA	TAC	2	GTCATACTG:GTCATTTTG	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.666666666666667	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	81.25000000000006	3	31.75	0.037862929073994	0.100992663859693	0.374907717322876	-0.0631297347856989	0.0276460592349885	0.0605875878243376	NA	NA	0.0725956130866652	0.384514597494432	153	8	839	0.839	0.153	0.306
N	all	ss13	353	CTG	TAC	TGC	2	ATACTGCTG:ATTTTGCTG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.666666666666667	0	0.666666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	82.5833333333334	3	30.75	0.0372361887723979	0.104516640682884	0.356270432431684	-0.0672804519104857	0.0272119712619033	0.0683797364565641	NA	NA	0.0727500136380181	0.355061087987925	136	5	859	0.859	0.136	0.272
N	all	ss13	354	CTG	TGC	TGA	2	CTGCTGAAC:TTGCTGAAT	1:1	FALSE	0.5	0	0	0.5	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	83.5833333333334	3	30.75	0.036779585610904	0.104516640682884	0.351901719865813	-0.0677370550719796	0.0282076746479414	0.0649065171065903	NA	NA	0.0748131155379552	0.365244594737944	150	6	844	0.844	0.15	0.3
N	all	ss13	355	AAC	TGA	ACA	2	CTGAACAAG:CTGAATAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	85.0833333333334	3	31.416666666666668	0.0361153019839953	0.102140577511979	0.35358427437675	-0.0660252755279838	0.0266844869876471	0.0608089945902945	NA	NA	0.0722564090794559	0.360841083802815	159	5	836	0.836	0.159	0.318
N	all	ss13	356	AAG	ACA	AGC	2	AACAAGCAC:AATAAGCAT	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	3	84.41666666666673	3	32.41666666666667	0.0364075521822731	0.0987726497511971	0.368599529059732	-0.062365097568924	0.0276000313390291	0.06404629035174	NA	NA	0.0698438633351423	0.371899133116636	157	3	840	0.84	0.157	0.314
N	all	ss13	357	CAC	AGC	ACA	2	AAGCACATT:AAGCATATT	1:1	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.16666666666673	3	32.41666666666667	0.0490972805875701	0.0987726497511971	0.497073640438355	-0.049675369163627	0.0299750636619449	0.064304640881168093	NA	NA	0.073519887174539	0.499248571960668	243	4	753	0.753	0.243	0.486
N	all	ss13	358	ATT	ACA	TTG	2	CACATTGAC:CATATTGAC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.5	1.16666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	84.50000000000007	3	32.083333333333336	0.0488971496674064	0.0998703029515669	0.489606501855907	-0.0509731532841605	0.030830875360635	0.0657777695314009	NA	NA	0.0709523913265473	0.472502387044117	218	0	782	0.782	0.218	0.436
N	all	ss13	359	GAC	TTG	ACG	2	ATTGACGCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.16666666666674	4	31.083333333333332	0.0485017445945919	0.141177857059553	0.343550650256241	-0.0926761124649607	0.0303056666590039	0.0788172715226728	NaN	NaN	0.0859870292046004	0.28112669283993	120	1	879	0.879	0.12	0.24
N	all	ss13	360	GCA	ACG	CAT	2	GACGCATAC	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	4	85.50000000000009	4	30.75	0.0483064312987563	0.142863650574837	0.338129615926703	-0.0945572192760804	0.0313128512801658	0.0818030884936356	NA	NA	0.0911290518812183	0.299447552546564	118	1	881	0.881	0.118	0.236
N	all	ss13	361	TAC	CAT	ACA	2	GCATACAAA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	87.00000000000009	4	29.916666666666668	0.0723451996406716	0.147260274111344	0.491274378492403	-0.0749150744706727	0.0383044056316602	0.0885834266172373	NaN	NaN	0.0990983670778438	0.449669107239562	227	0	773	0.773	0.227	0.454
N	all	ss13	362	AAA	ACA	AAA	2	TACAAAACA	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	86.83333333333341	4	30.083333333333332	0.0724909899460754	0.146359364647636	0.495294511018132	-0.0738683747015606	0.0390810978316718	0.084139446264464	NA	NA	0.100240391620449	0.461175700829687	212	0	788	0.788	0.212	0.424
N	all	ss13	363	ACA	AAA	CAT	2	AAAACATTC	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	85.16666666666674	4	30.083333333333332	0.0739819020881027	0.146359364647636	0.505481164571984	-0.0723774625595333	0.0400710439926072	0.0862055629520974	NaN	NaN	0.0963528577396877	0.45254981274492	218	0	782	0.782	0.218	0.436
N	all	ss13	364	TTC	CAT	TCC	2	ACATTCCCA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	84.3333333333334	4	30.583333333333332	0.0747506138799603	0.143721781908901	0.520106367226518	-0.0689711680289405	0.0419663254188783	0.0845021943877528	NaN	NaN	0.09949786058516	0.488188771241156	226	0	774	0.774	0.226	0.452
N	all	ss13	365	CCA	TCC	CAC	2	TTCCCACCA	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	82.00000000000007	4	30.25	0.0769906155450624	0.145469445655623	0.529256265451963	-0.0684788301105608	0.0411547031860125	0.0825793377918521	NaN	NaN	0.0962659344510205	0.476867003808653	204	0	796	0.796	0.204	0.408
N	all	ss13	366	CCA	CAC	CAA	2	CCACCAACA	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	6	81.00000000000007	4	29.25	0.0779922851430356	0.150978005779684	0.516580443225928	-0.0729857206366479	0.0428523642106827	0.0911210516615165	NaN	NaN	0.101894714612594	0.473814993267777	231	1	768	0.768	0.231	0.462
N	all	ss13	367	ACA	CAA	CAG	2	CCAACAGAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	80.50000000000007	5	30.08333333333334	0.092424480317961	0.187892466749351	0.491900936301269	-0.0954679864313903	0.045839944815386	0.101789965895546	NaN	NaN	0.106445383479492	0.369786708945256	157	0	843	0.843	0.157	0.314
N	all	ss13	368	GAG	CAG	AGC	2	ACAGAGCCT	2	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.50000000000007	5	31.083333333333336	0.0936627429044698	0.181054357970061	0.517318356512345	-0.0873916150655913	0.0454701828148606	0.0986547628893719	NaN	NaN	0.107838878738221	0.417715711101844	177	0	823	0.823	0.177	0.354
N	all	ss13	369	CCT	AGC	CTA	2	GAGCCTAAA	2	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	79.00000000000007	5	31.583333333333336	0.09429441687774	0.177819473768805	0.530281722688813	-0.0835250568910649	0.0450955937900895	0.090730551055683	NaN	NaN	0.109841312996698	0.447006152602299	176	0	824	0.824	0.176	0.352
N	all	ss13	370	AAA	CTA	AAA	2	CCTAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333341	5	31.75	0.0958020323794969	0.176766832783369	0.541968370824996	-0.080964800403872	0.0465687810684625	0.0902580862700706	NaN	NaN	0.103849816884079	0.435606607823521	190	0	810	0.81	0.19	0.38
N	all	ss13	371	AAG	AAA	AGG	2	AAAAAGGAC	2	FALSE	1.83333333333333	0.333333333333333	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.83333333333341	5	31.083333333333332	0.0958020323794969	0.181054357970061	0.529134086876487	-0.0852523255905641	0.0464062344025977	0.10130462591846	NaN	NaN	0.103010436705816	0.407892183703978	182	0	818	0.818	0.182	0.364
N	all	ss13	372	GAC	AGG	ACA	2	AAGGACAAA	2	FALSE	2.33333333333333	0.333333333333333	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	77.33333333333341	5	31.583333333333332	0.0964630333665701	0.177819473768805	0.54247733008134	-0.0813564404022348	0.044844662540701	0.100611695653377	NaN	NaN	0.101523125892961	0.422924016024639	189	0	811	0.811	0.189	0.378
N	all	ss13	373	AAA	ACA	AAA	2	GACAAAAAG	2	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	1000	7	76.66666666666674	5	31.583333333333332	0.0973587086414928	0.177819473768805	0.54751432212692	-0.0804607651273121	0.0473931278452909	0.0913754002331039	NaN	NaN	0.104548940505254	0.441537769661985	201	0	799	0.799	0.201	0.402
N	all	ss13	374	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGAAA:AAAAAGAAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	375	AAA	AGA	AAA	2	AAGAAAAAG:AAGAAGAAG	1:1	FALSE	1.91666666666667	0.333333333333333	0.75	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	376	AAG	AAA	AGA	2	AAAAAGACT:AAGAAGGCT	1:1	FALSE	1.75	0.333333333333333	0.916666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	377	ACT	AGA	CTG	2	AAGACTGAT:AAGGCTGAT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	378	GAT	CTG	ATG	2	ACTGATGAA:GCTGATGAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	379	GAA	ATG	AAA	2	GATGAAACT:GATGAAGCT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	380	ACT	AAA	CTC	2	GAAACTCAA:GAAGCTCAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	381	CAA	CTC	AAG	2	ACTCAAGCC:GCTCAGCCT	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	382	CCT	AAG	CCT	2	CAAGCCTTA:CAGCCTTTG	1:1	TRUE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	1	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	383	TTA	CCT	TAC	2	CCTTTGCCG:GCCTTACCG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.666666666666667	0.333333333333333	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	384	CCG	TAC	CGC	2	TTACCGCAG:TTGCCGCAG	1:1	FALSE	1.25	1	0.75	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	385	CAG	CGC	AGA	2	CCGCAGAGA	2	FALSE	1.16666666666667	0.333333333333333	1.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	386	AGA	AGA	GAC	2	CAGAGACAA:CAGAGACAG	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.833333333333333	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	387	CAA	GAC	AAA	2	AGACAAAAG:AGACAGAAG	1:1	FALSE	2.41666666666667	0.333333333333333	0.25	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	388	AAG	AAA	AGA	2	CAAAAGAAG:CAGAAGAAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	389	AAA	AGA	AAC	2	AAGAAACAG:AAGAAGCAG	1:1	FALSE	2.16666666666667	0.333333333333333	0.5	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	390	CAG	AAC	AGC	2	AAACAGCAA:AAGCAGCCC	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	391	CAA	AGC	AAA	2	CAGCAAACT:CAGCCCACT	1:1	TRUE	2.16666666666667	0.666666666666667	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	392	ACT	AAA	CTG	2	CAAACTGTG:CCCACTGTG	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	393	GTG	CTG	TGA	2	ACTGTGACT	2	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	394	ACT	TGA	CTC	2	GTGACTCTT	2	FALSE	1	1	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	395	CTT	CTC	TTC	2	ACTCTTCTT	2	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	396	CTT	TTC	TTC	2	CTTCTTCCT	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	397	CCT	TTC	CTG	2	CTTCCTGCG:CTTCCTGCT	1:1	FALSE	1.33333333333333	1	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	398	GCG	CTG	CGG	2	CCTGCGGCT:CCTGCTGCA	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	399	GCA	CGG	CAG	2	GCGGCTGAC:GCTGCAGAT	1:1	FALSE	0.833333333333333	1	1.16666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	400	GAC	CAG	ACA	2	GCAGATTTG:GCTGACATG	1:1	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	401	ATG	ACA	TGG	2	GACATGGAT:GATTTGGAT	1:1	FALSE	2.16666666666667	0	0.666666666666667	0.166666666666667	0	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	402	GAT	TGG	ATG	2	ATGGATGAT:TTGGATGAT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	403	GAT	ATG	ATT	2	GATGATTTC	2	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	404	TTC	ATT	TCT	2	GATTTCTCC	2	FALSE	2	0.333333333333333	0.666666666666667	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	405	TCC	TCT	CCA	2	TTCTCCAAA:TTCTCCAGA	1:1	FALSE	1	1	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	406	AAA	CCA	AAC	2	TCCAAACAA:TCCAGACAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	0.75	0.25	1	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	407	CAA	AAC	AAC	2	AAACAATTG:AGACAACTT	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	408	CTT	AAC	TGC	2	CAACTTCAA:CAATTGCAA	1:1	TRUE	2	0.666666666666667	0.166666666666667	0.166666666666667	0	1	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	409	CAA	TGC	AAA	2	CTTCAAAAT:TTGCAACAA	1:1	FALSE	2.66666666666667	0.333333333333333	0	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	410	AAT	AAA	AAT	2	CAAAATTCC:CAACAATCC	1:1	TRUE	2.5	0.333333333333333	0.166666666666667	0	2	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	411	TCC	AAT	CCA	2	AATTCCATG:CAATCCATG	1:1	FALSE	1.5	1	0.5	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	412	ATG	CCA	TGA	2	TCCATGAGC:TCCATGAGT	1:1	FALSE	0	0	1	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	413	AGC	TGA	GC-	1	ATGAGC---:ATGAGTGGA	1:1	FALSE	0.833333333333333	0.166666666666667	0.833333333333333	0.166666666666667	0	0	0	1	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	414	---	GTG	GAG	1	AGC------:AGTGGAGCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	415	---	GAG	CTT	1	------AGT:GGAGCTTCT	1:1	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	416	AGT	--A	CTG	1	---AGTGCT:GCTTCTGCT	1:1	TRUE	1.16666666666667	0.666666666666667	1.16666666666667	0	1	0	1	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	417	GCT	CTG	CTG	2	AGTGCTGAC:TCTGCTGAT	1:1	FALSE	0.666666666666667	1	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	418	GAC	CTG	ACT	2	GCTGACTCA:GCTGATTCA	1:1	FALSE	1.66666666666667	0.333333333333333	1	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	419	TCA	ACT	CAA	2	GACTCAACT:GATTCAACT	1:1	FALSE	0.166666666666667	1	0.833333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	420	ACT	CAA	CTC	2	TCAACTCAG	2	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	421	CAG	CTC	AGG	2	ACTCAGGCA:ACTCAGGCC	1:1	FALSE	1.33333333333333	0.333333333333333	1.33333333333333	0	0	0	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
N	all	ss13	422	GCA	AGG	CAT	2	CAGGCATAA:CAGGCCTAA	1:1	FALSE	1.66666666666667	1	0.333333333333333	0	0	1	0	0	SARSCOV2_vs_NC_004718.3	ORF2	dNNdNS	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA