Preview

EcoSimR-0.1.0.zip

EcoSimR-0.1.0
- .DS_Store 6.1 kB
- .gitignore 153 Bytes
- .travis.yml 339 Bytes
- DESCRIPTION 900 Bytes
- LICENSE 76 Bytes
- NAMESPACE 1.0 kB
- R
  - EcoSimR-package.r 2.2 kB
  - algorithms.R 28.3 kB
  - coccurrence_null.R 10.8 kB
  - metrics.R 24.0 kB
  - niche_overlap_null.R 8.6 kB
  - null_model_engine.R 8.1 kB
  - randomMatrixGenerator.R 7.8 kB
  - reproduce_model.R 984 Bytes
  - sim9fast.R 7.7 kB
  - sizeratio_null.R 8.9 kB
- README.md 3.4 kB
- appveyor.yml 451 Bytes
- data
  - datasets.rda 1.3 kB
- inst
  - burnin.png 40.4 kB
  - cooc.png 31.0 kB
  - cooc_hist.png 35.8 kB
  - niche.png 74.4 kB
  - niche_hist.png 35.5 kB
  - size.png 44.9 kB
  - size_hist.png 37.1 kB
- man
  - EcoSimR.Rd 920 Bytes
  - c_score.Rd 1.8 kB
  - c_score_skew.Rd 1.4 kB
  - c_score_var.Rd 1.3 kB
  - checker.Rd 1.2 kB
  - cooc_null_model.Rd 2.5 kB
  - czekanowski.Rd 1.6 kB
  - czekanowski_skew.Rd 1.4 kB
  - czekanowski_var.Rd 1.3 kB
  - dataMacWarb.Rd 1.4 kB
  - dataRodents.Rd 855 Bytes
  - dataWiFinches.Rd 1.0 kB
  - min_diff.Rd 930 Bytes
  - min_ratio.Rd 921 Bytes
  - niche_null_model.Rd 2.2 kB
  - null_model_engine.Rd 1.6 kB
  - pianka.Rd 1.6 kB
  - pianka_skew.Rd 1.3 kB
  - pianka_var.Rd 1.3 kB
  - plot.coocnullmod.Rd 2.1 kB
  - plot.nichenullmod.Rd 1.5 kB
  - plot.nullmod.Rd 793 Bytes
  - plot.sizenullmod.Rd 1.4 kB
  - ra1.Rd 1.7 kB
  - ra2.Rd 1.7 kB
  - ra3.Rd 1.4 kB
  - ra4.Rd 1.5 kB
  - ranMatGen.Rd 5.9 kB
  - reproduce_model.Rd 902 Bytes
  - sim1.Rd 1.3 kB
  - sim10.Rd 2.7 kB
  - sim2.Rd 1.8 kB
  - sim3.Rd 1.1 kB
  - sim4.Rd 1.4 kB
  - sim5.Rd 1.4 kB
  - sim6.Rd 1.2 kB
  - sim7.Rd 1.3 kB
  - sim8.Rd 1.8 kB
  - sim9.Rd 4.9 kB
  - sim9_single.Rd 405 Bytes
  - size_gamma.Rd 1.2 kB
  - size_null_model.Rd 2.2 kB
  - size_source_pool.Rd 1.5 kB
  - size_uniform.Rd 1.4 kB
  - size_uniform_user.Rd 1.4 kB
  - species_combo.Rd 1.5 kB
  - summary.coocnullmod.Rd 1.2 kB
  - summary.nichenullmod.Rd 1.2 kB
  - summary.nullmod.Rd 1.2 kB
  - summary.sizenullmod.Rd 1.2 kB
  - v_ratio.Rd 1.7 kB
  - var_diff.Rd 1.2 kB
  - var_ratio.Rd 1.2 kB
  - vector_sample.Rd 1.6 kB
- tests
  - testthat
    - test_cooccurrence.R 11.4 kB
    - test_nichebreadth.R 5.2 kB
    - test_sizeratio.R 5.5 kB
  - testthat.R 40 Bytes
- vignettes
  - CoOccurrenceVignette.Rmd 18.9 kB
  - SizeRatioVignette.Rmd 13.5 kB
  - nicheOverlapVignette.Rmd 14.0 kB
  - nullModelPlug-Ins.Rmd 7.8 kB
__MACOSX
- ._EcoSimR-0.1.0 212 Bytes
- EcoSimR-0.1.0
  - ._.DS_Store 120 Bytes
  - ._.gitignore 212 Bytes
  - ._.travis.yml 212 Bytes
  - ._DESCRIPTION 212 Bytes
  - ._LICENSE 212 Bytes
  - ._NAMESPACE 212 Bytes
  - ._R 212 Bytes
  - ._README.md 212 Bytes
  - ._appveyor.yml 212 Bytes
  - ._data 212 Bytes
  - ._inst 212 Bytes
  - ._man 212 Bytes
  - ._tests 212 Bytes
  - ._vignettes 212 Bytes
  - R
    - ._EcoSimR-package.r 212 Bytes
    - ._algorithms.R 212 Bytes
    - ._coccurrence_null.R 212 Bytes
    - ._metrics.R 212 Bytes
    - ._niche_overlap_null.R 212 Bytes
    - ._null_model_engine.R 212 Bytes
    - ._randomMatrixGenerator.R 212 Bytes
    - ._reproduce_model.R 212 Bytes
    - ._sim9fast.R 212 Bytes
    - ._sizeratio_null.R 212 Bytes
  - data
    - ._datasets.rda 212 Bytes
  - inst
    - ._burnin.png 212 Bytes
    - ._cooc.png 212 Bytes
    - ._cooc_hist.png 212 Bytes
    - ._niche.png 212 Bytes
    - ._niche_hist.png 212 Bytes
    - ._size.png 212 Bytes
    - ._size_hist.png 212 Bytes
  - man
    - ._EcoSimR.Rd 212 Bytes
    - ._c_score.Rd 212 Bytes
    - ._c_score_skew.Rd 212 Bytes
    - ._c_score_var.Rd 212 Bytes
    - ._checker.Rd 212 Bytes
    - ._cooc_null_model.Rd 212 Bytes
    - ._czekanowski.Rd 212 Bytes
    - ._czekanowski_skew.Rd 212 Bytes
    - ._czekanowski_var.Rd 212 Bytes
    - ._dataMacWarb.Rd 212 Bytes
    - ._dataRodents.Rd 212 Bytes
    - ._dataWiFinches.Rd 212 Bytes
    - ._min_diff.Rd 212 Bytes
    - ._min_ratio.Rd 212 Bytes
    - ._niche_null_model.Rd 212 Bytes
    - ._null_model_engine.Rd 212 Bytes
    - ._pianka.Rd 212 Bytes
    - ._pianka_skew.Rd 212 Bytes
    - ._pianka_var.Rd 212 Bytes
    - ._plot.coocnullmod.Rd 212 Bytes
    - ._plot.nichenullmod.Rd 212 Bytes
    - ._plot.nullmod.Rd 212 Bytes
    - ._plot.sizenullmod.Rd 212 Bytes
    - ._ra1.Rd 212 Bytes
    - ._ra2.Rd 212 Bytes
    - ._ra3.Rd 212 Bytes
    - ._ra4.Rd 212 Bytes
    - ._ranMatGen.Rd 212 Bytes
    - ._reproduce_model.Rd 212 Bytes
    - ._sim1.Rd 212 Bytes
    - ._sim10.Rd 212 Bytes
    - ._sim2.Rd 212 Bytes
    - ._sim3.Rd 212 Bytes
    - ._sim4.Rd 212 Bytes
    - ._sim5.Rd 212 Bytes
    - ._sim6.Rd 212 Bytes
    - ._sim7.Rd 212 Bytes
    - ._sim8.Rd 212 Bytes
    - ._sim9.Rd 212 Bytes
    - ._sim9_single.Rd 212 Bytes
    - ._size_gamma.Rd 212 Bytes
    - ._size_null_model.Rd 212 Bytes
    - ._size_source_pool.Rd 212 Bytes
    - ._size_uniform.Rd 212 Bytes
    - ._size_uniform_user.Rd 212 Bytes
    - ._species_combo.Rd 212 Bytes
    - ._summary.coocnullmod.Rd 212 Bytes
    - ._summary.nichenullmod.Rd 212 Bytes
    - ._summary.nullmod.Rd 212 Bytes
    - ._summary.sizenullmod.Rd 212 Bytes
    - ._v_ratio.Rd 212 Bytes
    - ._var_diff.Rd 212 Bytes
    - ._var_ratio.Rd 212 Bytes
    - ._vector_sample.Rd 212 Bytes
  - tests
    - ._testthat 212 Bytes
    - ._testthat.R 212 Bytes
    - testthat
      - ._test_cooccurrence.R 212 Bytes
      - ._test_nichebreadth.R 212 Bytes
      - ._test_sizeratio.R 212 Bytes
  - vignettes
    - ._CoOccurrenceVignette.Rmd 212 Bytes
    - ._SizeRatioVignette.Rmd 212 Bytes
    - ._nicheOverlapVignette.Rmd 212 Bytes
    - ._nullModelPlug-Ins.Rmd 212 Bytes