
Prediction by meta-PPISP : metamethod for Protein-Protein Interaction Site Prediction
Column 1: AA (Amino Acid code)
Column 2: Ch (Chain ID)
Column 3: AA# (Amino Acid number)
Column 4-7: Prediction scores of cons-PPISP, PINUP, Promate, and meta-PPISP
            Note: PINUP and Promate scores are scaled by 100
Column 8: Prediction of whether the residue is in an interface
	  (P = Positive; N = Negative; - = Burried and not predicted)
          (Note: P corresponds to a score > 0.34 in 7th column; user may set a
           different threshold for positive prediction.)
*************************************************************************
I  E   16    0.000   0.000   0.533   0.000       -
V  E   17    0.000   0.140   0.463   0.000       -
G  E   18    0.031   0.000   0.511   0.090       N
G  E   19    0.011   0.000   0.514   0.100       N
Y  E   20    0.058   0.000   0.511   0.068       N
T  E   21    0.020   0.000   0.469   0.094       N
C  E   22    0.018   0.000   0.454   0.103       N
G  E   23    0.006   0.000   0.425   0.040       N
A  E   24    0.028   0.000   0.400   0.043       N
N  E   25    0.025   0.000   0.405   0.046       N
T  E   26    0.016   0.000   0.425   0.066       N
V  E   27    0.000   0.000   0.441   0.000       -
P  E   28    0.007   0.000   0.413   0.066       N
Y  E   29    0.060   0.000   0.443   0.115       N
Q  E   30    0.000   0.000   0.510   0.000       -
V  E   31    0.000   0.000   0.433   0.000       -
S  E   32    0.000   0.420   0.633   0.000       -
L  E   33    0.000   0.000   0.000   0.000       -
N  E   34    0.199   0.990   0.605   0.569       P
S  E   37    0.217   0.570   0.628   0.431       P
G  E   38    0.022   0.420   0.645   0.459       P
Y  E   39    0.023   0.990   0.655   0.529       P
H  E   40    0.307   0.990   0.708   0.661       P
F  E   41    0.976   0.990   0.676   0.843       P
C  E   42    0.000   0.990   0.669   0.000       -
G  E   43    0.000   0.710   0.647   0.000       -
G  E   44    0.000   0.000   0.000   0.000       -
S  E   45    0.000   0.420   0.505   0.000       -
L  E   46    0.000   0.000   0.380   0.000       -
I  E   47    0.976   0.000   0.328   0.073       N
N  E   48    0.015   0.000   0.320   0.076       N
S  E   49    0.004   0.000   0.352   0.097       N
Q  E   50    0.006   0.000   0.326   0.089       N
W  E   51    0.000   0.000   0.273   0.000       -
V  E   52    0.000   0.000   0.000   0.000       -
V  E   53    0.000   0.280   0.395   0.000       -
S  E   54    0.000   0.000   0.000   0.000       -
A  E   55    0.000   0.000   0.000   0.000       -
A  E   56    0.000   0.000   0.616   0.000       -
H  E   57    0.852   0.710   0.633   0.612       P
C  E   58    0.000   0.000   0.626   0.000       -
Y  E   59    0.983   0.710   0.569   0.452       P
K  E   60    0.149   0.850   0.606   0.441       P
S  E   61    0.068   0.000   0.563   0.258       N
G  E   62    0.021   0.140   0.513   0.306       N
I  E   63    0.000   0.000   0.515   0.000       -
Q  E   64    0.007   0.570   0.523   0.277       N
V  E   65    0.000   0.000   0.000   0.000       -
R  E   66    0.100   0.420   0.551   0.338       N
L  E   67    0.000   0.000   0.467   0.000       -
G  E   69    0.000   0.420   0.437   0.000       -
E  E   70    0.000   0.140   0.500   0.000       -
D  E   71    0.000   0.420   0.416   0.000       -
N  E   72    0.006   0.000   0.441   0.124       N
I  E   73    0.110   0.710   0.605   0.421       P
N  E   74    0.021   0.420   0.514   0.201       N
V  E   75    0.004   0.420   0.442   0.224       N
V  E   76    0.004   0.280   0.464   0.183       N
E  E   77    0.028   0.140   0.418   0.130       N
G  E   78    0.005   0.280   0.433   0.203       N
N  E   79    0.006   0.000   0.411   0.051       N
E  E   80    0.072   0.280   0.454   0.173       N
Q  E   81    0.057   0.000   0.443   0.073       N
F  E   82    0.018   0.280   0.531   0.254       N
I  E   83    0.013   0.000   0.453   0.083       N
S  E   84    0.003   0.000   0.446   0.096       N
A  E   85    0.003   0.000   0.444   0.079       N
S  E   86    0.005   0.000   0.397   0.065       N
K  E   87    0.008   0.000   0.367   0.048       N
S  E   88    0.235   0.140   0.468   0.131       N
I  E   89    0.984   0.140   0.435   0.259       N
V  E   90    0.990   0.140   0.529   0.353       P
H  E   91    0.907   0.000   0.478   0.201       N
P  E   92    0.959   0.000   0.480   0.225       N
S  E   93    0.959   0.000   0.485   0.243       N
Y  E   94    0.945   0.140   0.538   0.207       N
N  E   95    0.055   0.140   0.486   0.203       N
S  E   96    0.014   0.140   0.509   0.177       N
N  E   97    0.005   0.140   0.486   0.187       N
T  E   98    0.128   0.140   0.494   0.151       N
L  E   99    0.065   0.280   0.580   0.326       N
N  E  100    0.013   0.000   0.491   0.142       N
N  E  101    0.045   0.000   0.504   0.017       N
D  E  102    0.000   0.000   0.563   0.000       -
I  E  103    0.000   0.000   0.000   0.000       -
M  E  104    0.000   0.000   0.000   0.000       -
L  E  105    0.000   0.000   0.000   0.000       -
I  E  106    0.000   0.000   0.000   0.000       -
K  E  107    0.009   0.000   0.321   0.042       N
L  E  108    0.000   0.000   0.362   0.000       -
K  E  109    0.003   0.000   0.391   0.040       N
S  E  110    0.002   0.000   0.412   0.041       N
A  E  111    0.002   0.000   0.392   0.053       N
A  E  112    0.000   0.000   0.407   0.000       -
S  E  113    0.005   0.000   0.398   0.046       N
L  E  114    0.023   0.000   0.389   0.030       N
N  E  115    0.004   0.000   0.367   0.038       N
S  E  116    0.004   0.000   0.364   0.034       N
R  E  117    0.008   0.000   0.372   0.044       N
V  E  118    0.000   0.000   0.403   0.000       -
A  E  119    0.107   0.000   0.382   0.090       N
S  E  120    0.295   0.000   0.388   0.093       N
I  E  121    0.956   0.000   0.378   0.149       N
S  E  122    0.054   0.000   0.378   0.108       N
L  E  123    0.973   0.000   0.358   0.229       N
P  E  124    0.000   0.000   0.401   0.000       -
T  E  125    0.165   0.000   0.410   0.098       N
S  E  127    0.021   0.000   0.422   0.125       N
C  E  128    0.016   0.000   0.458   0.060       N
A  E  129    0.009   0.000   0.460   0.074       N
S  E  130    0.015   0.000   0.432   0.068       N
A  E  132    0.088   0.000   0.427   0.044       N
G  E  133    0.024   0.000   0.406   0.044       N
T  E  134    0.010   0.000   0.398   0.049       N
Q  E  135    0.100   0.000   0.450   0.054       N
C  E  136    0.000   0.000   0.470   0.000       -
L  E  137    0.352   0.000   0.501   0.094       N
I  E  138    0.000   0.000   0.601   0.000       -
S  E  139    0.000   0.000   0.562   0.000       -
G  E  140    0.000   0.570   0.681   0.000       -
W  E  141    0.000   0.000   0.674   0.000       -
G  E  142    0.000   0.000   0.707   0.000       -
N  E  143    0.000   0.570   0.562   0.000       -
T  E  144    0.007   0.000   0.480   0.063       N
K  E  145    0.108   0.000   0.448   0.028       N
S  E  146    0.009   0.000   0.462   0.050       N
S  E  147    0.040   0.000   0.454   0.061       N
G  E  148    0.008   0.000   0.476   0.142       N
T  E  149    0.005   0.140   0.551   0.162       N
S  E  150    0.004   0.140   0.459   0.174       N
Y  E  151    0.014   0.710   0.654   0.361       P
P  E  152    0.008   0.420   0.579   0.243       N
D  E  153    0.004   0.420   0.521   0.275       N
V  E  154    0.005   0.280   0.430   0.157       N
L  E  155    0.000   0.570   0.504   0.000       -
K  E  156    0.105   0.280   0.485   0.202       N
C  E  157    0.000   0.000   0.496   0.000       -
L  E  158    0.000   0.000   0.529   0.000       -
K  E  159    0.357   0.000   0.499   0.082       N
A  E  160    0.000   0.000   0.508   0.000       -
P  E  161    0.040   0.000   0.464   0.059       N
I  E  162    0.000   0.000   0.463   0.000       -
L  E  163    0.282   0.000   0.511   0.100       N
S  E  164    0.050   0.000   0.506   0.058       N
D  E  165    0.007   0.000   0.515   0.054       N
S  E  166    0.009   0.000   0.486   0.071       N
S  E  167    0.013   0.000   0.478   0.084       N
C  E  168    0.000   0.000   0.540   0.000       -
K  E  169    0.050   0.000   0.494   0.053       N
S  E  170    0.068   0.000   0.457   0.067       N
A  E  171    0.000   0.000   0.467   0.000       -
Y  E  172    0.000   0.000   0.569   0.000       -
P  E  173    0.052   0.000   0.444   0.020       N
G  E  174    0.057   0.000   0.455   0.049       N
Q  E  175    0.179   0.000   0.481   0.120       N
I  E  176    0.006   0.000   0.502   0.080       N
T  E  177    0.008   0.000   0.507   0.048       N
S  E  178    0.006   0.000   0.519   0.061       N
N  E  179    0.086   0.000   0.505   0.064       N
M  E  180    0.000   0.000   0.539   0.000       -
F  E  181    0.000   0.000   0.575   0.000       -
C  E  182    0.000   0.000   0.585   0.000       -
A  E  183    0.000   0.000   0.624   0.000       -
G  E  184A   0.000   0.000   0.501   0.000       -
Y  E  184    0.093   0.000   0.501   0.094       N
L  E  185    0.231   0.000   0.475   0.091       N
E  E  186    0.007   0.000   0.424   0.050       N
G  E  187    0.008   0.000   0.461   0.059       N
G  E  188A   0.136   0.000   0.473   0.061       N
K  E  188    0.029   0.000   0.473   0.039       N
D  E  189    0.000   0.000   0.614   0.000       -
S  E  190    0.000   0.140   0.663   0.000       -
C  E  191    0.000   0.000   0.686   0.000       -
Q  E  192    0.964   0.710   0.694   0.522       P
G  E  193    0.942   0.990   0.690   0.691       P
D  E  194    0.000   0.000   0.677   0.000       -
S  E  195    0.988   0.710   0.672   0.565       P
G  E  196    0.000   0.000   0.556   0.000       -
G  E  197    0.000   0.000   0.552   0.000       -
P  E  198    0.000   0.000   0.511   0.000       -
V  E  199    0.000   0.000   0.000   0.000       -
V  E  200    0.000   0.000   0.479   0.000       -
C  E  201    0.000   0.000   0.436   0.000       -
S  E  202    0.101   0.000   0.424   0.123       N
G  E  203    0.038   0.000   0.409   0.052       N
K  E  204    0.036   0.000   0.422   0.014       N
L  E  209    0.000   0.000   0.483   0.000       -
Q  E  210    0.000   0.000   0.468   0.000       -
G  E  211    0.000   0.000   0.000   0.000       -
I  E  212    0.000   0.000   0.476   0.000       -
V  E  213    0.000   0.710   0.687   0.000       -
S  E  214    0.000   0.570   0.680   0.000       -
W  E  215    0.164   0.420   0.663   0.328       N
G  E  216    0.237   0.140   0.685   0.186       N
S  E  217    0.136   0.000   0.626   0.188       N
G  E  219    0.052   0.140   0.637   0.153       N
C  E  220    0.000   0.140   0.624   0.000       -
A  E  221A   0.000   0.000   0.505   0.000       -
Q  E  221    0.152   0.000   0.505   0.089       N
K  E  222    0.017   0.000   0.407   0.038       N
N  E  223    0.265   0.000   0.423   0.062       N
K  E  224    0.277   0.000   0.525   0.123       N
P  E  225    0.000   0.000   0.610   0.000       -
G  E  226    0.000   0.140   0.643   0.000       -
V  E  227    0.000   0.000   0.698   0.000       -
Y  E  228    0.000   0.000   0.645   0.000       -
T  E  229    0.000   0.000   0.555   0.000       -
K  E  230    0.076   0.000   0.507   0.068       N
V  E  231    0.000   0.000   0.000   0.000       -
C  E  232    0.233   0.000   0.444   0.053       N
N  E  233    0.150   0.000   0.469   0.043       N
Y  E  234    0.000   0.000   0.467   0.000       -
V  E  235    0.749   0.000   0.390   0.160       N
S  E  236    0.075   0.000   0.391   0.144       N
W  E  237    0.188   0.000   0.408   0.175       N
I  E  238    0.000   0.000   0.280   0.000       -
K  E  239    0.898   0.000   0.342   0.185       N
Q  E  240    0.047   0.000   0.358   0.100       N
T  E  241    0.000   0.000   0.364   0.000       -
I  E  242    0.853   0.000   0.303   0.238       N
A  E  243    0.928   0.000   0.300   0.108       N
S  E  244    0.033   0.000   0.334   0.054       N
N  E  245    0.827   0.000   0.298   0.092       N
*************************************************************************
A pdb file in which meta-PPSIP prediction scores are stored as B-factors
can be downloaded at
http://pipe.sc.fsu.edu/meta-ppisp/000029333.pdb 
*************************************************************************
If there is no prediction printed above this asterisks line, you should 
go back and check your submission input. The structure must be in 
PDB format and chain IDs of protein must be entered.

This is an automated email, please do not reply.
Please contact pi2pe.fsu@gmail.com if you have questions or suggestions.
http://pipe.sc.fsu.edu