Fils de Johann Joseph Abert, il étudia les lettres classiques après avoir reçu une formation de musicien, avant de se tourner vers la musicologie. Il enseigna cette discipline à partir de 1902 et jusqu'en 1923,
successivement dans les universités de Halle, de Leipzig et de Berlin.
Il se spécialisa plus spécifiquement dans les domaines de la musique antique et de l'histoire de l'opéra. Il est l'auteur de nombreuses études sur l'histoire de la musique[1].
Un de ses ouvrages de référence est sa biographie de Mozart[2].
Die Lehre vom Ethos in der griechischen Musik. Breitkopf & Härtel, Leipzig 1899 (Dissertation).
Die ästhetischen Grundsätze der mittelalterlichen Melodiebildung. Eine Studie zur Musikästhetik des Mittelalters. Kaemmerer, Halle 1902 (Habilitationsschrift).
Johann Joseph Abert (1832–1915). Sein Leben und seine Werke. Breitkopf & Härtel, Leipzig 1916; Nachdruck: Pfaehler, Bad Neustadt 1983, (ISBN3-922923-26-7).
Wolfgang Amadeus Mozart. Eine Biographie. 2 Bände. Breitkopf & Härtel, Leipzig 1919/1921.
En tant qu'éditeur : Illustriertes Musik-Lexikon. Mitarbeiter: Friedrich Blume, Rudolf Gerber, Hans Hoffmann, Theodor Schwartzkopff. J. Engelhorns Nachf., Stuttgart 1927
Gesammelte Schriften und Vorträge. éd. de Friedrich Blume. Niemeyer, Halle 1929; Nachdruck: Schneider, Tutzing 1968.