Elle a participé en tant que choriste à des albums d'autres membres de Broken Social Scene, comme Jason Collett. Elle joue du piano et synthétiseur et occasionnellement de la guitare en concert (par exemple au Jimmy Kimmel Live! sur la chanson Gold Guns Girls).
Emily est la fille du poète canadien Paul Haines et la sœur de la journaliste de télévision Avery Haines. Son frère Tim Haines, dirige Bluestreak Records à Peterborough (Ontario), Canada. Elle est née à New Delhi, Inde, et a grandi au Canada. Après être restée à Peterborough jusqu’à l’âge de 3 ans, elle vécut dans une maison remplie d’art expérimental et d'expression musicale. Paul, son père, lui a fait écouter des musiques éclectiques comme Carla Bley, Robert Wyatt, et plus tard PJ Harvey. Adolescente, elle suivit les traces de ses parents à l’école Etobicoke School of the Arts. Elle y rencontra Amy Millan et Kevin Drew, avec qui elle collabora pour Broken Social Scene et Stars.
Haines et Millan ont brièvement formé en groupe vers 1990.
Jason Collett – "Fire", "Hangover Days" (Emily is actually in the video edit of the song "fire". The album version credits the female backing vocals to Amy Millan)