Data for 'QUANTIFYING INBREEDING AVOIDANCE THROUGH EXTRA-PAIR REPRODUCTION'
Reid, Arcese, Keller, Germain, Duthie, Losdat, Wolak & Nietlisbach Evolution, 2015

This file contains the pedigree data required for the simulation that quantifies the consequences of observation failure due to offspring mortality
for estimates of inbreeding avoidance through extra-pair reproduction.

These data come from the long-term song sparrow field study on Mandarte Island, BC, Canada.
The data provided here are sufficient to replicate the analyses presented in the above paper, and are therefore a restricted subset of the full Mandarte dataset.
If you are interested in running further analyses that require further data then please get in touch with
Prof Peter Arcese (University of British Columbia), Prof Lukas Keller (University of Zurich) or Prof Jane Reid (University of Aberdeen).
We are always happy to develop collaborations with researchers who have good ideas for new analyses.
We'd also appreciate it if you could let us know if you are intending to make use of the dataset below in order to facilitate coordination of different ongoing research efforts
and allow us to keep track of all outputs from the long-term field study.


Key to variables:
"indID" is the identity of each pedigree individual
"damID" is the identity of each individual's mother
"sireID" is the identity of each individual's mother


"indID"	"damID"	"sireID"
20	NA	NA
12	NA	NA
13	NA	NA
45	NA	NA
15	NA	NA
16	NA	NA
27	NA	NA
28	NA	NA
39	NA	NA
48	NA	NA
36	NA	NA
53	NA	NA
35	NA	NA
50	NA	NA
29	NA	NA
44	NA	NA
37	NA	NA
46	NA	NA
41	NA	NA
17	NA	NA
49	NA	NA
19	NA	NA
24	NA	NA
40	NA	NA
18	NA	NA
23	NA	NA
10	NA	NA
11	NA	NA
1	NA	NA
38	NA	NA
14	NA	NA
2	NA	NA
3	NA	NA
4	NA	NA
5	NA	NA
6	NA	NA
7	NA	NA
8	NA	NA
9	NA	NA
52	NA	NA
47	NA	NA
21	NA	NA
42	NA	NA
43	NA	NA
31	NA	NA
32	NA	NA
26	NA	NA
22	NA	NA
30	NA	NA
51	NA	NA
34	NA	NA
33	NA	NA
25	NA	NA
54	2	3
56	10	4
60	5	6
59	15	8
57	16	11
58	1	12
61	7	13
55	7	13
62	7	13
68	24	18
65	24	18
67	21	23
66	29	25
69	29	25
70	27	28
64	27	28
63	27	28
73	58	54
76	62	56
72	14	57
75	14	57
71	14	57
74	55	9
77	58	59
78	69	60
80	68	66
82	68	66
79	67	70
81	67	70
84	17	71
90	20	72
89	26	73
83	61	74
88	77	75
87	77	75
85	65	76
91	65	76
93	32	79
86	81	80
92	81	80
98	88	83
96	30	84
99	88	82
101	31	86
102	31	86
100	31	86
97	87	19
94	89	22
95	89	91
107	94	85
106	95	78
104	26	96
103	26	96
105	97	98
110	101	92
109	101	92
108	101	99
112	90	103
111	63	104
119	106	92
114	106	92
120	106	99
117	106	99
122	106	99
116	106	99
121	106	99
118	106	99
123	106	99
113	107	93
115	34	108
124	111	64
133	37	114
132	37	114
130	37	114
131	37	114
134	123	102
126	37	118
128	39	120
125	39	120
127	33	121
129	122	121
135	105	124
136	132	99
139	37	125
137	122	130
138	100	133
146	135	99
144	135	99
140	135	99
142	135	99
145	135	99
143	135	99
141	135	99
148	112	140
147	112	140
153	112	140
149	110	142
150	110	142
155	145	143
154	145	143
156	38	144
157	38	144
151	38	144
152	38	144
158	146	119
168	157	113
160	157	113
169	157	113
163	157	113
176	147	141
173	39	148
174	39	148
167	153	125
171	150	128
172	150	128
175	147	109
166	147	109
161	147	109
165	156	151
162	152	131
170	152	131
159	152	131
164	145	158
184	167	102
188	136	159
187	175	161
181	160	149
197	160	149
190	167	162
191	167	162
200	176	126
193	127	163
198	127	163
192	101	165
196	167	137
195	134	168
183	53	170
189	164	138
182	117	173
199	169	173
179	117	173
186	169	173
180	116	174
194	116	174
185	116	174
178	176	154
177	176	154
217	186	179
210	183	179
216	187	149
204	101	180
212	167	182
205	169	184
203	183	166
213	193	166
214	193	166
218	188	129
209	35	191
202	101	195
208	192	196
207	189	197
215	187	130
201	178	155
206	194	198
211	139	200
232	201	161
231	201	161
225	204	171
226	208	207
228	206	209
222	202	172
223	214	211
224	214	211
233	206	36
221	214	36
219	177	215
230	123	215
227	204	216
220	217	216
229	218	199
239	220	185
238	115	219
249	233	205
251	233	205
254	228	205
248	230	221
245	230	221
258	43	221
242	230	221
257	43	221
241	204	223
240	190	223
243	225	224
244	225	224
256	228	226
246	228	226
253	228	226
247	228	226
255	228	226
252	228	226
250	227	210
237	231	195
235	160	229
234	181	229
236	232	212
260	35	235
262	222	236
264	40	237
268	40	237
269	40	237
259	213	238
261	208	239
266	248	241
263	227	242
270	246	244
267	247	245
265	42	250
271	259	203
272	259	203
276	261	234
283	268	205
279	264	221
281	253	260
280	253	260
278	267	243
277	269	243
275	262	36
274	262	36
284	228	265
286	258	265
285	258	265
282	264	266
273	263	256
291	271	205
290	271	205
288	271	240
300	282	260
289	276	272
292	276	245
294	254	274
295	254	274
293	247	275
298	280	251
287	280	251
301	268	277
296	279	252
297	279	252
299	255	278
302	228	278
304	289	221
305	288	260
307	292	243
303	296	243
314	287	265
306	288	249
313	301	278
308	270	291
312	42	293
309	42	293
318	297	295
316	297	295
315	297	295
310	292	298
311	294	257
317	302	300
326	310	260
323	306	303
330	306	303
328	311	303
324	281	303
340	306	303
335	306	303
329	311	303
334	306	303
325	306	303
322	311	278
320	228	304
319	228	304
343	312	295
332	308	298
331	312	298
339	297	305
327	308	305
338	308	299
336	309	299
333	308	299
321	41	307
337	313	300
341	318	44
342	310	284
370	340	295
366	340	295
367	340	295
361	322	295
353	322	305
346	322	305
354	322	305
349	320	299
355	320	299
345	320	299
351	283	319
344	290	319
356	283	326
348	46	326
359	270	326
347	283	326
358	270	326
350	270	326
352	324	327
357	287	327
360	324	327
371	285	330
363	312	337
362	312	337
368	312	337
369	312	337
364	314	339
365	314	339
388	357	295
401	370	305
399	370	305
400	370	305
386	351	344
396	351	344
384	351	344
372	228	344
376	310	344
380	287	344
375	287	344
385	351	344
379	345	300
377	345	300
378	345	300
374	313	346
398	367	347
391	351	350
397	351	350
381	358	354
373	353	356
394	355	284
393	355	284
387	355	284
389	314	359
383	321	360
395	363	286
382	351	361
402	351	361
392	351	361
390	351	361
403	379	265
424	389	344
425	389	344
438	390	372
435	390	372
439	390	372
420	378	45
427	388	347
414	357	373
432	46	373
413	357	373
408	46	373
410	46	373
409	46	373
418	357	373
421	46	373
441	312	373
436	46	373
426	283	373
423	321	374
422	318	374
429	383	350
419	377	330
415	380	316
416	380	316
405	378	333
404	378	333
434	378	333
412	377	286
417	380	361
430	389	361
431	389	361
437	396	381
411	312	381
406	312	381
407	312	381
428	312	381
440	312	381
433	367	394
468	413	265
449	413	265
450	413	265
469	413	265
456	405	265
448	413	265
467	413	265
457	405	265
458	403	305
459	418	344
455	430	284
442	429	284
443	429	284
473	392	404
462	46	404
472	46	404
463	392	404
460	420	386
475	433	416
476	433	416
461	366	416
471	388	423
452	390	423
470	388	423
446	388	423
451	390	423
445	388	423
447	388	423
474	433	371
454	351	427
464	285	428
453	433	398
465	430	431
466	430	431
444	429	434
477	285	458
479	421	458
481	459	458
480	459	458
478	285	458
482	392	460
