python quantify_if_signal.py \
  --pstat3-csv /path/to/pSTAT3_panel.figure_parameters.csv \
  --ecm-csv /path/to/fibrin_collagen_panel.figure_parameters.csv \
  --ome-search-root /path/to/raw_ome_tiffs \
  --out-dir /path/to/output_dir
