Patienten var en 8-årig pojke, som vid 6 års ålder hade en gradvis progressiv unilateral ptosis, som vid 8 års ålder och 4 månader utvecklade sig till en bilateral ptosis. Patienten var en 8-årig pojke med bilateral ptosis. I slutet av december 2017 utvecklade patienten feber av okänt ursprung, med en kroppstemperatur på 38,5 °C. Han återhämtade sig efter att ha fått orala antipyretika. En vecka efter febern hade patienten en stroke av dyskinesia och fortsatte att luta huvudet åt vänster (cervical dyskinesia), ett fenomen som åtföljdes av ögonrörelser. Patienten var det första barnet som föddes av icke-besläktade föräldrar, och det finns inga liknande familjemedlemmar. Även om han hade en "historia av medfödd hjärtsjukdom" visade efterföljande hjärtultraljudsundersökningar med färg-Doppler normala resultat. Patienten hade inga utvecklingsmässiga milstolpsförseningar. Vid den fysiska undersökningen visade det sig att han hade dubbelsidig övre ögonlockskrypning (50 % pupiller täckta). Dessutom hade han begränsad abduktion i höger öga, nackdystoni och något minskad (grad 5-) muskelstyrka i båda nedre extremiteterna, medan hans dubbla knäreflexer försvann. Han hade också en rätt kryptorkism och en liten penis. Han kunde varken hoppa eller hoppa på en fot. Blodtester visade inga anmärkningsvärda resultat. Framför allt hade han en blodacetylkolinreceptorantikropps nivå på 0,82 nmol/L, medan IgG-tester för anti-MuSK, anti-Titin antikroppar och humant lipoproteinreceptor-relaterat protein 4 var negativa. Magnetisk resonanstomografi av hjärnan visade diffusa signaler i occipital, parietal cortex och basala ganglier. Hans högra ptosis var bättre, även om den inte försvann efter behandling med prednison, neostigmin och omeprazol från januari 2018 till oktober 2019. Hans ögonlock som föll ned återkom i mars 2020 och blev bilateralt. I augusti 2019 blev han inlagd på sjukhus på grund av återkommande huvudvärk och svarade inte på mannitol och karbamazepin. Patienten gick för närvarande i första klass i grundskolan med medelbetyg. Hela exombibliotek förbereddes med hjälp av xGen Exome Research Panel v1.0 (IDT, Iowa, USA) och sekvenserades på Novaseq 6000-plattformen (Illumina, San Diego, CA, USA). Rådata rengjordes med hjälp av snabbprogramvarupaket. Därefter utfördes de parade ändläsningarna med hjälp av Burrows-Wheeler Aligner till referensgenomet Ensemble GRCh37/hg19. Synonym och kort indel-kallande utfördes med hjälp av GATK-programvarupaket följt av ANNOVAR-kommentar. Prediktion utfördes med hjälp av Provean, Sift, Polypen2_hdiv, Polypen2_hvar, Mutationtaster, M-Cap och Revel-programvarupaket. Alla varianternas patogenicitet tolkades enligt riktlinjerna från American College of Medical Genetics and Genomics. Vi utförde CNV-sekvensering[], en CNV-detektionsmetod baserad på hög genomströmningssekvensering, hos patienten. Kort sagt, genomiskt DNA klipptes först till 200-300 bp-fragment via ultraljud, och utsattes sedan för kvalitetskontroll via elektrofores. DNA-fragmentens ändar lappades ihop med hjälp av ett DNA-reparationsenzymsystem för att generera trubbiga ändar, och sedan tillsattes en enda adeninnukleotid till 3'-änden för att bilda en överhängande A-svans. Därefter amplifierades genomet med hjälp av ligeringsmedierad PCR i 4-6 cykler. Vi använde samma sekvenseringsplattform och datarensningsprotokoll för att detektera CNV med en längd på 100 kB och däröver med hjälp av Chigene-oberoende utvecklade mjukvarupaket. Därefter använde vi Decipher, ClinVar, OMIM, DGV och ClinGen för annotering. Minst 2 ml perifert blod samlades in från patienten och mitokondriellt DNA extraherades med hjälp av mitokondriellt DNA-extraktionssats. Fullständigt mitokondriellt DNA amplifierades och renades med hjälp av PCR, med användning av DNA-polymeras med hög fidelitet och visualiserades med hjälp av agarosgelelektrofores. Sekvensering av 150 bp med parvis ändade baser utfördes på Novaseq6000-sekvenseringssystemet. De sekvenserade uppgifterna anpassades till referenssekvensen NC_012920 (mänskligt komplett mitokondriellt genom 16569 bp cirkulär DNA) med hjälp av programvaran Burrows-Wheeler Aligner. Varianterna kartlades sedan i MITOMAP-databasen, medan patogenitet utfördes enligt MITOtip. Resultaten från hela exomesekvensen visade inga misstänkta sjukdomsskapande varianter. Därefter använde vi CNV-analysmetoden (utvecklad av Chigene) på hela exomesekvensen och fann att två raderingar av den angränsande regionen av Chr16:15,125,591-16326688 (ungefär 1,20 Mb) och 9857005-14989502 (ungefär 5,13 Mb) förekom. CNV-sekvenseringsdata visade de novo heterozygot radering av chr16:9699585-16928372 (ungefär 7,23 Mb). Därefter jämförde vi denna region och fenotyp för centrala nervsystemet med Decipher-patienter som tidigare dokumenterats. Gener relaterade till OMIM-sjukdomar finns listade i tabell. Mito-DNA-sekvenseringen visade negativa resultat.