76-летний датчанин был доставлен в отделение неотложной помощи в Университетской больнице Ольборга (Ольборг, Дания) в мае 2017 года с оталгией в правой части, которая появилась в течение предыдущей недели, а также с лихорадкой и спутанностью сознания, которые появились в течение предыдущих 24 часов. При поступлении пациент был в целом здоров и не принимал ежедневных лекарств. За 53 дня до поступления пациент вернулся из 16-дневного отпуска на восточном побережье полуострова Малайзия. Перед поездкой он был повторно вакцинирован против дифтерии, столбняка и гепатита А. Во время отпуска он не принимал противомалярийные препараты. При осмотре у пациента были изменены психические состояния с показателем комы Глазго в 6 баллов, ригидность шеи и лихорадка (40,0 °С). В соответствии с национальными рекомендациями по лечению подозреваемого бактериального менингита пациенту была проведена культура крови и начато лечение бензилпенициллином в высоких дозах внутривенно (1,8 г каждые 4 часа), цефотаксимом (3 г каждые 6 часов) и дексаметазоном (10 мг каждые 6 часов). У пациента была проведена люмбальная пункция после компьютерной томографии головного мозга, которая оказалась нормальной. Лабораторные тесты показали уровень С-реактивного белка 273 мг л−1, прокальцитонин 10,8 мкг л−1 и белые клетки крови 19,9×109 л−1. Анализ спинномозговой жидкости (СМЖ) выявил плеоцитоз с белыми клетками крови 741×106 л−1 (636 полинуклеарных и 105 мононуклеарных), слегка пониженное соотношение глюкозы (СМЖ: сыворотка) 0,38, повышенный уровень белка 1,34 г л−1 и лактат 7,3 ммоль л−1, и пациент был переведен в отделение интенсивной терапии (ОИТ). Полученная overnight culture CSF пациентки показала Gram-негативные, неподвижные, оксидазо- и каталазо-положительные палочки. Более того, аналогичные результаты были получены при одновременном положительном результате бактериологического исследования крови (BD BACTEC; Becton Dickinson) (MALDI Biotyper 3.1, Bruker Daltonics Microflex LT, MBT 6903 MSP Library). MALDI-TOF MS (матрично-ассоциированная лазерная десорбция-ионизация-время полета MS) (MALDI Biotyper 3.1, Bruker Daltonics Microflex LT, MBT 6903 MSP Library) не смог отличить колонии E. meningoseptica (результат 2.215) или E. miricola (результат 2.101), тогда как E. anophelis не была обнаружена в библиотеке MALDI. API 20 E v5.0 (bioMérieux) дал идентификацию E. meningoseptica с результатом 71,6 % идентичности (числовой профиль: 0042004). Изолят был мультирезистентным и положительным на металлобета-лактамазу с использованием MBL Confirm kit (Rosco Diagnostica). Тестирование антимикробной чувствительности (AST) было выполнено с использованием Etests (bioMérieux) в соответствии с рекомендациями Европейского комитета по тестированию антимикробной чувствительности (). Мы использовали фармакокинетические/фармакодинамические (не связанные с видом) предельные значения, за исключением триметоприма/сульфаметоксазола, в котором использовались предельные значения Stenotrophomonas maltophilia, а для гентамицина и колистина использовались предельные значения Pseudomonas species, как это было сделано Eriksen et al. (). Изолят был восприимчив к моксифлоксацину (MIC 0,125 мг л−1) и триметоприму/сульфаметоксазолу (MIC 0,25 мг л−1); промежуточно восприимчив к амоксициллину/клавулановой кислоте (MIC 6 мг л−1); и резистентен к ципрофлоксацину (MIC 0,75 мг л−1) и всем другим протестированным препаратам, включая: ампициллин, цефуроксим, цефтазидим, меропенем, гентамицин, колистин и тигециклин. Тест на чувствительность к ванкомицину показал MIC 12 мг л−1, но мы не сделали интерпретацию восприимчивого или резистентного. Тесты на чувствительность к пиперациллину/тазобактаму и рифампицину не были доступны, но зона дифузии диска (Neo-Sensitabs; Rosco Diagnostica) для пиперациллина/тазобактама была 19 мм, а для рифампицина — 24 мм, но как и для ванкомицина, мы не сделали интерпретацию восприимчивого или резистентного. Чтобы определить идентичность изолата на уровне видов, мы выполнили секвенирование с помощью прибора Illumina MiSeq, который производит 2×300-нм парные конечные отсчитывания с использованием набора для подготовки библиотеки Nextera XT (Illumina). Отсчитывания были собраны с помощью CLC Genomics Workbench (версия 11) (QIAGEN Bioinformatics) в 105 контигов, N50 (497, 160), общая длина последовательности 4 047 726 нм, с содержанием G+C 35,6%. Анализ гена 16S рРНК, а также измерения расстояния на основе k-мера, по сравнению с общедоступными штаммами E. meningoseptica и E. miricola, показал четкую идентификацию изолята как E. anophelis (данные не представлены). Breurec et al. [] и Perrin et al. [] сообщили о четком разделении E. anophelis на 15 подлиний, включая 1, связанную с крупной вспышкой инфекций E. anophelis, которая произошла в Висконсине (США) в 2015–2016 годах. Для определения подтипа нашего штамма и его подлинии мы использовали стратегию многолокусной последовательности генов (cgMLST), используя подмножество из 1546 семейств генов, которые хорошо сохраняются в E. anopheles []. Профиль cgMLST нашего изолята сравнили с общедоступными в базе данных Elizabethkingia cgMLST на сервере Института Пастера (). Анализ кластеров на основе cgMLST-профилей, см., показал, что изолят принадлежит к подлинии 11, которая была определена со штаммом CIP 60–59 (CDC 3375; ATCC 13255; NCTC 10586; CCUG 4321; LMG 12873) в качестве эталона. Штамм CIP 60–59 был выделен из спинномозговой жидкости недоношенного ребенка, который умер []; однако два штамма подлинии 11 имеют разные аллели в 299 локусах из 1513 локусов, называемых в обоих штаммах. Этот результат явно показывает, что AAUH 98722 (наш изолят) и CIP 60–59 генетически отличаются. Сборки были представлены в ResFinder 3.0 () для анализа на наличие генов антимикробной резистентности []. Изолят оказался положительным на два гена металлобета-лактамазы, а именно blaGOB-3 (расположенный на контиге 69; длина хита 756; 100 % ID; доступный номер AF189291), и blaB-3 (расположенный на контиге 21; длина хита 750; 100 % ID; доступный номер AF189299), а также ген, кодирующий бета-лактамазу широкого спектра действия, blaCME-1 (расположенный на контиге 41; длина хита 784; 100 % ID; доступный номер AJ006275). Это согласуется с известной консервативностью генов карбапенемазы и бета-лактамазы в E. anophelis []. После предварительной идентификации вида Elizabethkingia антимикробная терапия была заменена на внутривенный ввк ванкомицин в сочетании с внутривенным рифампицином в дозе 600 мг два раза в день. Однако, когда на следующий день стали доступны значения МИК, определенное лечение было заменено на внутривенный моксифлоксацин в дозе 400 мг один раз в день в сочетании с внутривенным рифампицином в дозе 600 мг два раза в день на общую продолжительность 14 дней. Пациент поправился и после 10 дней в реанимации был переведен в инфекционное отделение для дальнейшего лечения и реабилитации, и он был, наконец, выписан после 3 недель госпитализации. Единственной последовательностью была частичная потеря слуха. Из-за тяжести инфекции, пациент был обследован на иммунодефицит в амбулаторных условиях и было обнаружено, что у него был устойчивый и повышенный уровень IgM примерно 14 г л−1 (нормальный диапазон 0,39–2,1 г л−1) в течение следующих месяцев. Через семь месяцев после эпизода менингита его костный мозг был дополнительно обследован, и ему был наконец поставлен диагноз лимфоплазматической лимфомы (макроглобулинемия Вальденстрема).