79-летний мужчина был госпитализирован в кардиологическое отделение нашей больницы, жалуясь на 7-дневную историю лихорадки с температурой до 39,5 ℃. Он отрицал кашель, мокроту, заложенность носа, фарингоалгию, боль в грудной клетке, головокружение или головную боль. За пять дней до госпитализации ему был поставлен диагноз легочной инфекции на основе рентгенографии грудной клетки, и ему была назначена антибиотикотерапия в местной больнице, но его симптомы не уменьшились. Пациенту был поставлен диагноз сахарного диабета два месяца назад, и он выпивал 2000–3000 мл воды в день. Около 20 дней назад он начал жаловаться на стеснение в грудной клетке и одышку после физической активности. Кроме того, у пациента была история высокого артериального давления на протяжении более 20 лет. При поступлении (в день 0) физикальное обследование показало сознание, температуру 36,5 ℃, частоту сердечных сокращений 78/мин, частоту дыхания 20/мин, артериальное давление 120/62 мм рт.ст. и хрипы при аускультации легких. Пациент сообщил о потере веса на 10 кг за последние шесть месяцев. Лабораторные исследования показали лейкоцитоз 7,77 × 109/л (с 90,1% нейтрофилов, 2,5% моноцитов и 7,2% лимфоцитов), прокальцитонин 3,24 нг/мл, скорость оседания эритроцитов 52 мм/ч, гемоглобин A1c 9,5% и сахар крови натощак 8,26 ммоль/л. Компьютерная томография грудной клетки (КТ) показала множественные узелки и пятнистое инфильтрацию в обоих легких (фиг. А, В), что не исключало возможности туберкулеза. Предварительный диагноз был легочная инфекция, и был назначен эмпирический антибиотик с внутривенным пиперациллин/тазобактам (4,5 г, q12h) и моксифлоксацин (2 г, q12h). Внутривенно инсулин (4 U, qd) и пероральный миглитол (50 мг, q12h) использовались для контроля уровня глюкозы в крови. После госпитализации у пациента развилась постоянная лихорадка, а суточная температура превышала 38,5 ℃. В первый день у него развилась дыхательная недостаточность, и ему была назначена кислородная терапия. Анализ артериальной крови на газ показал pH 7,50, PaO2 57,7 мм рт.ст., PaCO2 31,9 мм рт.ст. и SaO2 90,2%. Серологические тесты на грипп А IgM, грипп В IgM, парагрипп IgM, аденовирус IgM, респираторный синцитиальный вирус IgM, Mycoplasma pneumoniae IgM и Chlamydia pneumoniae IgM оказались отрицательными. Тест на туберкулезный иммунный пятно был положительным. На второй день у пациента развилась полиурия и полидипсия, а его симптом тахипноэ не уменьшился во время кислородной терапии. Затем он был переведен в отделение интенсивной терапии (ОИТ) и ему была назначена механическая вентиляция. На третий день у пациента был балл PASS − 1, и ему была назначена анальгезия и седация с пропофолом и альфентанилом. Бронхоскопия выявила воспаление бронхиальной слизистой оболочки и производство гнойной мокроты, а для дальнейшего выявления был получен бронхоальвеолярный лаваж (БАЛФ). На 5-й день у пациента снизился показатель кислородозависимости (155) по сравнению с предыдущим. В крови не было обнаружено отклонений. В культуральной жидкости был обнаружен положительный результат на галактоманнан (1,74 нг/мл) и 1,3-бета-глюкан (424,50 нг/л). Положительный результат на кислотостойкие окрашивания и культуру BALF. Положительный результат на ДНК M. tuberculosis в BALF. Образец BALF был также отправлен на метагеномное секвенирование следующего поколения (Genskey, Пекин, Китай). Было получено в общей сложности 86 398 947 необработанных считываний, а после удаления низкокачественных считываний было получено 60 161 047 считываний высокого качества. Среди считываний высокого качества 47 232 566 были согласованы с человеческим эталонным геномом (HG38), а 12 928 481 были использованы для последующего анализа. В метагеномном анализе BALF был обнаружен комплекс M. tuberculosis (7 453 374 считывания), A. lentulus (37 868 считываний) и несколько оральных колонизирующих микроорганизмов. В настоящее время метагеномные данные доступны в NCBI в базе данных Sequence Read Archive (SRA) с номером доступа PRJNA917778. На основании этих результатов у пациента был диагностирован коинфекция M. tuberculosis и A. lentulus. Первоначальное антибактериальное лечение было заменено на пероральный изониазид (0,3 г, qd), рифапентин (0,45 г, qd) для лечения туберкулеза и внутривенный каспофунгин (50 мг, qd) для лечения грибковой инфекции. На 6-й день состояние пациента снова ухудшилось. У него развилась полиорганная дисфункция и он впал в состояние легкой комы. Его семья решила отказаться от лечения из-за финансовых проблем и плохого прогноза. Впоследствии искусственное дыхание было прекращено, и пациент умер через 1,5 часа.