Un bărbat de 79 de ani a fost internat în secția de cardiologie a spitalului nostru, plângându-se de o febră cu o durată de 7 zile, cu o temperatură de până la 39,5℃. A negat că ar fi avut tuse, flegm, obstrucție nazală, faringalgie, durere toracică, amețeli sau dureri de cap. Cu cinci zile înainte de internare, i s-a pus diagnosticul de infecție pulmonară pe baza unei radiografii toracice și i s-a administrat tratament cu antibiotice la un spital local, dar simptomele nu s-au ameliorat. Pacientul a fost diagnosticat cu diabet zaharat în urmă cu două luni și a băut 2000-3000 ml de apă pe zi. În urmă cu aproximativ 20 de zile, a început să prezinte senzație de constricție toracică și dificultăți de respirație după activitate fizică. În plus, pacientul a avut un istoric de tensiune arterială crescută de mai bine de 20 de ani. La internare (ziua 0), examenul fizic a arătat că pacientul era conștient, temperatura era de 36,5 ℃, ritmul cardiac de 78/min, ritmul respirator de 20/min, tensiunea arterială de 120/62 mmHg și se auzeau zgomote la auscultația pulmonară. Pacientul a raportat o pierdere în greutate de 10 kg în ultimele șase luni. Investigațiile de laborator au arătat un număr de leucocite de 7,77 × 109/L (cu 90,1% neutrofile, 2,5% monocite și 7,2% limfocite), procalcitonină de 3,24 ng/ml, viteza de sedimentare a eritrocitelor de 52 mm/h, hemoglobină A1c de 9,5% și glucoză în sânge în condiții de repaus alimentar de 8,26 mmol/L. O scanare computerizată a toracelui (CT) a arătat multiple noduli și infiltrări în ambele plămâni, care nu au exclus posibilitatea tuberculozei. Diagnosticul preliminar a fost infecție pulmonară, iar tratamentul antibiotic empiric cu piperacilină/tazobactam intravenos (4,5 g, q12h) și moxifloxacină (2 g, q12h) a fost administrat. Insulina intravenoasă (4 U, qd) și miglitol oral (50 mg, q12h) au fost folosite pentru a controla nivelul glucozei din sânge. După internare, pacientul a dezvoltat febră continuă, iar temperatura zilnică a depășit 38,5 ℃. În ziua 1, a dezvoltat insuficiență respiratorie și a primit tratament cu oxigen. Analiza gazelor sanguine arteriale a arătat pH 7,50, PaO2 de 57,7 mmHg, PaCO2 de 31,9 mmHg și SaO2 de 90,2%. Testele serologice pentru gripă A IgM, gripă B IgM, virus parainfluenza IgM, adenovirus IgM, virus sincitial respirator IgM, Mycoplasma pneumoniae IgM și Chlamydia pneumoniae IgM au fost negative. Testul imun pentru tuberculoză a fost pozitiv. În ziua 2, pacientul a prezentat poliurie și polidipsie, iar simptomul său de tahipnee nu a fost ameliorat în timpul tratamentului cu oxigen. Apoi a fost transferat la unitatea de terapie intensivă (UTI) și i s-a administrat ventilație mecanică. În ziua 3, pacientul a avut un scor PASS de - 1 și a primit analgezie și sedare cu propofol și alfentanil. Bronhoscopia a găsit inflamație a mucoasei bronșice și producția de spută purulentă, iar lichidul de lavaj bronhoalveolar (BALF) a fost obținut pentru detectare suplimentară. În ziua 5, pacientul a avut un indice de oxigenare scăzut (155) comparativ cu cel de dinainte. Nu s-au găsit anomalii în cultura de sânge. Galactomanan seric (1,74 ng/ml) și 1,3-β-d-glucan (424,50 ng/L) au fost pozitive. Colorarea acid-rezistentă și cultura de BALF au fost negative. Detectarea ADN-ului M. tuberculosis din BALF a fost pozitivă. Eșantionul de BALF a fost trimis și pentru secvențierea metagenomică de generație următoare (Genskey, Beijing, China). Au fost generate un total de 86.398.947 de citiri brute și au fost obținute 60.161.047 de citiri de înaltă calitate după eliminarea citirilor de calitate scăzută. Printre citiri de înaltă calitate, 47.232.566 au fost aliniate cu genomul de referință uman (HG38) și 12.928.481 au fost utilizate pentru analiza în aval. M. tuberculosis complex a fost raportat de către mNGS din BALF (7.453.374 de citiri), A. lentulus (37.868 de citiri) și mai multe microorganisme orale colonizatoare. Datele metagenomice sunt acum disponibile la NCBI în baza de date Sequence Read Archive (SRA) cu numărul de acces PRJNA917778. Pe baza acestor constatări, pacientul a fost diagnosticat cu coinfecție cu M. tuberculosis și A. lentulus. Tratamentul antibiotic inițial a fost schimbat cu izoniazidă orală (0,3 g, qd), rifapentină (0,45 g, qd) pentru anti-tuberculoză și caspofungină intravenoasă (50 mg, qd) pentru antifungic. În ziua 6, starea pacientului s-a agravat din nou. A dezvoltat disfuncții multiple ale organelor și a căzut într-o stare de comă ușoară. Familia sa a decis să abandoneze tratamentul din cauza problemelor financiare și a prognosticului grav. Respiratia artificiala a fost oprită ulterior și pacientul a murit 1,5 ore mai târziu.