Uma mulher japonesa de 50 anos foi submetida a ressecção cirúrgica para um tumor que surgiu no retroperitônio esquerdo. A tomografia computadorizada (TC) e a tomografia por emissão de pósitrons (PET)-TC pré-operativas, bem como os achados intraoperativos, não mostraram metástases à distância, nem disseminação peritoneal óbvia, nem invasão do útero ou dos ovários (Informação Suplementar). Histologicamente, o tumor foi identificado como um leiomiossarcoma de 12 cm × 11 cm. Ela foi tratada com quimioterapia pós-operativa com 6 ciclos de doxorubicina, seguida por quimioterapia com pazopanib durante 8 meses. Durante o período de acompanhamento observacional, os estudos de imagem indicaram recorrência peritoneal. Enquanto a quimioterapia com pazopanib foi reiniciada prontamente, a massa tumoral acabou por se transformar num tumor óbvio no peritoneu. Ela foi submetida a cirurgia de debulking duas vezes para tumores peritoneais, mas os tumores reapareceram. Ela recebeu quimioterapia com gemcitabina e docetaxel, que foi descontinuada devido ao aparecimento de pneumonia intersticial. A caracterização genómica do cancro foi realizada para procurar estratégias de tratamento correspondentes ao genoma na prática clínica diária de medicina de precisão contra o cancro. Ela foi encaminhada a nós para aconselhamento genético e interpretação da variante de splicing RAD51D, que foi originalmente detetada na análise do perfil do genoma do tumor. Não tinha histórico familiar de cancros relacionados com o RAD51 ou outros tipos de malignidades, incluindo sarcoma. Em estudos imunohistoquímicos realizados no Hospital Mita, em conjunto com a Universidade Internacional de Saúde e Bem-Estar, no Japão, as células tumorais mostraram-se fracamente positivas para a-actina do músculo liso e desmina. Estes achados são consistentes com um diagnóstico de leiomiossarcoma, equivalente ao grau histológico 1 de acordo com o sistema de classificação de sarcoma da Federação Francesa de Centros de Câncer (FNCLCC) []. Através da análise do perfil genómico dos 324 genes designados da amostra do tumor da paciente, utilizando o painel oncológico FoundationOne CDx® (Foundation Medicine Inc., MA, EUA), foram detetadas duas variantes patogénicas em RAD51D (variante de splicing) e TP53 (variante sem sentido) e ampliações intermédias de quatro genes (Tabela). Com base nas recomendações do painel de especialistas, que é um painel de tumores que fornece interpretações moleculares e clínicas e sugestões para os resultados dos testes do painel oncológico, a paciente recebeu aconselhamento genético e, subsequentemente, foi submetida a análise da linha germinal para RAD51D c.904-2A > T [NM_002878]. A mesma variante de splicing de RAD51D foi detetada na análise do ADN extraído de linfócitos por sequenciamento direto do ADN utilizando eletroforese em gel capilar e deteção por fluorescência (técnica e aplicação de sequenciamento de Sanger), que foi realizada num laboratório certificado pelo Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA). Após aconselhamento genético extensivo com base nos resultados obtidos dos testes da linha germinal, as suas duas filhas, mostradas como IV-1 e IV-2, foram também submetidas a testes genéticos preditivos, e ambas foram encontradas positivas para a variante, NetGene2, Splice Site Prediction by Neural Network (NNSplice) e Alternative Splice Site Predictor (ASSP) para analisar os potenciais efeitos da RAD51D c.904-2A > T [NM_002878]. Todas as quatro ferramentas previram que a variante RAD51D atenuou o normal splicing e produziu uma forma mais curta da proteína RAD51D (Tabela e). Além disso, a análise cBROCA, uma análise experimental para RNA, como mostrado por Casadei et al. [], também previu que esta alteração enfraqueceria o local de aceitação de splicing nativo e criaria ou fortaleceria novos locais de aceitação de splicing, resultando em formas mais curtas da proteína RAD51D. Tomados em conjunto, estas análises computacionais sugerem que uma alteração de um único nucleótido no intrão 9 da RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] atenua o normal splicing do mRNA RAD51D, resultando na produção de uma forma mais curta da proteína RAD51D (um produto truncado representativo é mostrado na Figura c e d). Embora não existam domínios de consenso específicos no exão 10, que é truncado por splicing atenuado, os fenótipos agressivamente malignos observados neste caso seriam evidência para a RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] como uma nova variante de perda de função envolvida na formação e/ou progressão de tumores malignos. De acordo com a base de dados ClinVar (Variation ID: 472631) (acedido em agosto de 2021), a significância clínica de RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] é provavelmente patogénica ou incerta, o que significa que a sua significância clínica ainda não foi determinada e é um assunto de debate na interpretação. As frequências alélicas de RAD51D c.904-2A > T (NM_002878) na população geral foram 6.60 × 10− 4 (ToMMo 8.3KJPN) e 4.13 × 10− 4 (HGVD ver2.3, dbSNP rsID: 1403784434) em pessoas japonesas e 3.98 × 10− 6 na população global, sugerindo que a variante de splicing RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] foi extremamente rara na população global e no Japão, o que pode ser potencialmente indicativo de que é uma variante patogénica (Tabela).