De patiënt was een 8-jarige jongen die op 6-jarige leeftijd een geleidelijk toenemende eenzijdige ptosis vertoonde, die op 8-jarige leeftijd en 4 maanden later een bilaterale ptosis werd. De patiënt was een 8-jarige jongen met bilaterale ptosis. Op het einde van december 2017 kreeg de patiënt koorts van onbekende oorsprong, met een lichaamstemperatuur van 38,5 °C. Hij herstelde nadat hij orale antipyretica kreeg. Een week na de koorts kreeg de patiënt een aanval van dyskinesie en bleef hij zijn hoofd naar links kantelen (cervicale dyskinesie), een fenomeen dat gepaard ging met oogbewegingsstoornissen. De patiënt was het eerste kind geboren uit niet-verwante ouders en er zijn geen familieleden met een vergelijkbare aandoening. Hoewel hij een 'geschiedenis van aangeboren hartaandoeningen' had, toonde een daaropvolgende cardiale kleur-Doppler-echografie normale resultaten. De patiënt had geen vertragingen in de ontwikkeling van mijlpalen. Bij lichamelijk onderzoek werd ontdekt dat hij bilaterale ooglidpaniek had (50% pupillen bedekt). Bovendien had hij beperkte abductie in het rechteroog, nekdystonie en iets verminderde (graad 5-) spierkracht in de bilaterale onderste ledematen, terwijl zijn bilaterale kniereflexen verdwenen waren. Hij vertoonde ook rechter cryptorchidisme en een kleine penis. Hij kon niet op één voet hurken of springen. Bloedtesten vertoonden opmerkelijke resultaten. Met name had hij een bloed acetylcholine receptor antilichaam niveau van 0.82 nmol/L, terwijl IgG tests voor anti-MuSK, anti-Titin antilichaam, en humaan low-density lipoprotein receptor-related protein 4 negatief waren. MRI van de hersenen toonde diffuse signalen in de occipitale, pariëtale cortex en basale ganglia. Zijn rechter ptosis was beter, hoewel het niet verdween na behandeling met prednison, neostigmine en omeprazol van januari 2018 tot oktober 2019. Zijn oogliddruppel verscheen opnieuw in maart 2020 en werd bilateraal. In augustus 2019 werd hij in het ziekenhuis opgenomen vanwege een terugkerende hoofdpijn en reageerde niet op mannitol en carbamazepine. De patiënt zat momenteel in de eerste klas van de basisschool met middelmatige cijfers. Whole exome libraries werden voorbereid met behulp van de xGen Exome Research Panel v1.0 (IDT, Iowa, Verenigde Staten) en gesequenced op het Novaseq 6000 platform (Illumina, San Diego, CA, Verenigde Staten). Ruwe data werd opgeschoond met behulp van het fastp softwarepakket. Vervolgens werden de paired-end reads uitgevoerd met behulp van Burrows-Wheeler Aligner op het Ensemble GRCh37/hg19 referentiegenome. Synoniem en korte indel calling werd uitgevoerd met behulp van het GATK softwarepakket gevolgd door de ANNOVAR annotatie. Voorspelling werd uitgevoerd met behulp van de Provean, Sift, Polypen2_hdiv, Polypen2_hvar, Mutationtaster, M-Cap, en Revel softwarepakketten. De pathogeniciteit van alle varianten werd geïnterpreteerd volgens de richtlijnen van het American College of Medical Genetics and Genomics. We hebben bij de patiënt CNV-sequencing[] uitgevoerd, een CNV-detectiemethode op basis van high-throughput sequencing. Kort gezegd werd het genoom eerst met ultrasone trillingen in 200-300 bp-fragmenten gesneden, waarna de kwaliteit werd gecontroleerd met behulp van elektroforese. De uiteinden van de DNA-fragmenten werden hersteld met behulp van een DNA-reparatie-enzymsysteem om stompe uiteinden te vormen, waarna een enkel adeninenuclotide werd toegevoegd aan het 3' uiteinde om een overhangende A-staart te vormen. Vervolgens werd het genoom versterkt door middel van ligatie-gemedieerde PCR voor 4-6 cycli. We hebben dezelfde sequencingplatform en gegevensreinigingsprotocollen gebruikt om CNV's te detecteren met een lengte van 100 kB en meer met behulp van Chigene onafhankelijk ontwikkelde softwarepakketten. Daarna hebben we Decipher, ClinVar, OMIM, DGV en ClinGen gebruikt voor annotatie. Minstens 2 ml perifeer bloed werd van de patiënt afgenomen en mitochondriaal DNA werd geëxtraheerd met behulp van de mitochondriaal DNA-extractieset. Volledig mitochondriaal DNA werd versterkt en gezuiverd via PCR, met behulp van de high-fidelity DNA-polymerase en gevisualiseerd via agarosegelelektroforese. Gelijke-eindige 150 bp sequencing werd uitgevoerd op het Novaseq6000 sequencing systeem. De gesekwentieerde gegevens werden uitgelijnd op de referentiesequentie van NC_012920 (menselijk compleet mitochondriaal genoom 16569 bp circulair DNA) met behulp van de Burrows-Wheeler Aligner software. De varianten werden vervolgens in kaart gebracht op de MITOMAP database, terwijl pathogeniciteit werd uitgevoerd volgens de MITOtip. De resultaten van de sequentiebepaling van het gehele exome onthulden geen vermoedelijke ziekteverwekkende varianten. Vervolgens gebruikten we de CNV-analysemethode (ontwikkeld door Chigene) op de sequentiebepalingsgegevens van het gehele exome en ontdekten dat er twee deleties waren in het aangrenzende gebied van Chr16:15,125,591-16326688 (ongeveer 1,20 Mb) en 9857005-14989502 (ongeveer 5,13 Mb). De CNV-sequentiebepalingsgegevens onthulden een de novo heterozygote deletie van chr16:9699585-16928372 (ongeveer 7,23 Mb). Vervolgens vergeleken we dit gebied en het fenotype van het centrale zenuwstelsel met eerder gedocumenteerde Decipher-patiënten. De genen die verband houden met OMIM-stoornissen staan vermeld in Tabel. De mitochondriale DNA-sequentiebepalingsresultaten waren negatief.