Een 79-jarige man werd opgenomen op de cardiologieafdeling van ons ziekenhuis, met een koorts van 7 dagen, met een temperatuur tot 39,5 ℃. Hij klaagde niet over hoest, slijm, neusverstopping, faryngalgie, pijn op de borst, duizeligheid of hoofdpijn. Vijf dagen voor opname werd hij gediagnosticeerd met een longinfectie op basis van een röntgenfoto van de borst en kreeg hij antibioticatherapie in een lokaal ziekenhuis, maar zijn symptomen verdwenen niet. De patiënt werd twee maanden geleden gediagnosticeerd met diabetes mellitus en dronk 2000-3000 ml water per dag. Ongeveer 20 dagen geleden begon hij kortademigheid te krijgen na lichamelijke activiteit. Bovendien had de patiënt al meer dan 20 jaar een hoge bloeddruk. Bij opname (dag 0) toonde het lichamelijk onderzoek een bewuste toestand, temperatuur van 36,5 ℃, hartslag van 78/min, ademhalingsfrequentie van 20/min, bloeddruk van 120/62 mmHg, en geruis bij pulmonaire auscultatie. De patiënt meldde een gewichtsverlies van 10 kg in de afgelopen zes maanden. Laboratoriumonderzoeken toonden een aantal witte bloedcellen van 7,77 × 109/L (met 90,1% neutrofielen, 2,5% monocytes, en 7,2% lymfocyten), procalcitonine van 3,24 ng/ml, erythrocyte sedimentation rate van 52 mm/h, hemoglobine A1c van 9,5%, en nuchtere bloedsuiker van 8,26 mmol/L. Een thoraxcomputertomografie (CT) scan toonde meerdere nodules en patchy infiltratie in beide longen, wat de mogelijkheid van tuberculose niet uitsloot. De voorlopige diagnose was pulmonaire infectie, en empirische antibioticabehandeling met intraveneuze piperacillin/tazobactam (4,5 g, q12h) en moxifloxacin (2 g, q12h) werd gegeven. Intraveneuze insuline (4 U, qd) en orale miglitol (50 mg, q12h) werden gebruikt om de bloedglucosewaarde te controleren. Na opname ontwikkelde de patiënt een aanhoudende koorts en de dagelijkse temperatuurpiek overschreed 38,5 ℃. Op dag 1 ontwikkelde hij ademhalingsfalen en kreeg hij zuurstofbehandeling. De arteriële bloedgasanalyse toonde PH 7.50, PaO2 van 57.7 mmHg, PaCO2 van 31.9 mmHg en SaO2 van 90.2%. Serologische tests voor influenza A IgM, influenza B IgM, parainfluenza virus IgM, adenovirus IgM, respiratory syncytial virus IgM, Mycoplasma pneumoniae IgM en Chlamydia pneumoniae IgM bleken negatief. De tuberculose immuunspot test was positief. Op dag 2, vertoonde de patiënt polyurie en polydipsie en zijn symptoom van tachypneu werd niet verlicht tijdens zuurstofbehandeling. Toen werd hij overgedragen aan de intensive care unit (ICU) en kreeg hij mechanische ventilatie. Op dag 3, had de patiënt een PASS score van -1 en kreeg hij analgesie en sedatie met propofol en alfentanil. Bronchoscopie vond bronchiale mucosale ontsteking en productie van purulent sputum, en bronchoalveolaire lavage vloeistof (BALF) werd verkregen voor verdere detectie. Op dag 5 had de patiënt een verminderde oxygenatie-index (155) in vergelijking met eerder. Er werden geen abnormaliteiten gevonden in zijn bloedcultuur. Serum galactomannan (1,74 ng/ml) en 1,3-β-d-glucan (424,50 ng/L) waren positief. Zuurvaste kleuring en cultuur van BALF waren negatief. M. tuberculosis DNA detectie van BALF was positief. Het BALF monster werd ook gestuurd voor metagenomische next-generation sequencing (Genskey, Beijing, China). Een totaal van 86.398.947 ruwe lezingen werden gegenereerd en 60.161.047 hoge kwaliteitslezingen werden verkregen na het verwijderen van lage kwaliteitslezingen. Onder de hoge kwaliteitslezingen waren 47.232.566 uitgelijnd met het menselijke referentiegenome (HG38) en 12.928.481 werden gebruikt voor downstream analyse. De mNGS van BALF rapporteerde M. tuberculosis complex (7.453.374 lezingen), A. lentulus (37.868 lezingen), en verschillende orale koloniserende microorganismen. Metagenome data is nu beschikbaar bij NCBI onder de Sequence Read Archive (SRA) database met toegangsnr. PRJNA917778. Op basis van deze bevindingen werd de patiënt gediagnosticeerd als co-infectie van M. tuberculosis en A. lentulus. De initiële antibioticabehandeling werd veranderd in orale isoniazide (0,3 g, qd), rifapentine (0,45 g, qd) voor anti-tuberculose, en intraveneuze caspofungine (50 mg, qd) voor anti-schimmel. Op dag 6 verslechterde de toestand van de patiënt opnieuw. Hij ontwikkelde een meervoudige orgaandysfunctie en raakte in een lichte coma. Zijn familie besloot de behandeling te staken wegens financiële problemen en een slechte prognose. De kunstmatige beademing werd vervolgens stopgezet en de patiënt overleed 1,5 uur later.