Ένας 79χρονος άνδρας εισήχθη στο καρδιολογικό τμήμα του νοσοκομείου μας, παραπονούμενος για πυρετό 7 ημερών, με θερμοκρασία έως 39,5 ℃. Αρνήθηκε βήχας, φλέγμα, ρινική απόφραξη, φαρυγγαλγία, θωρακικό άλγος, ζάλη ή πονοκέφαλο. Πέντε ημέρες πριν την εισαγωγή, διαγνώστηκε με πνευμονική λοίμωξη με ακτινογραφία θώρακα και του χορηγήθηκε αντιβιοτική θεραπεία σε τοπικό νοσοκομείο, αλλά τα συμπτώματά του δεν υποχώρησαν. Ο ασθενής διαγνώστηκε με σακχαρώδη διαβήτη πριν από δύο μήνες και έπινε 2000-3000 ml νερού την ημέρα. Περίπου 20 ημέρες πριν, άρχισε να παρουσιάζει σφίξιμο στο στήθος και δύσπνοια μετά από σωματική άσκηση. Επιπλέον, ο ασθενής είχε ιστορικό υψηλής αρτηριακής πίεσης για περισσότερα από 20 χρόνια. Κατά την εισαγωγή (ημέρα 0), η φυσική εξέταση έδειξε ότι ο ασθενής ήταν σε κατάσταση συνείδησης, με θερμοκρασία 36,5 ℃, καρδιακό ρυθμό 78/min, αναπνευστικό ρυθμό 20/min, αρτηριακή πίεση 120/62 mmHg, και αναπνευστικούς ήχους κατά την ακρόαση των πνευμόνων. Ο ασθενής ανέφερε απώλεια βάρους 10 kg τους τελευταίους έξι μήνες. Οι εργαστηριακές εξετάσεις έδειξαν λευκά αιμοσφαίρια 7,77 × 109/L (με 90,1% ουδετερόφιλα, 2,5% μονοκύτταρα, και 7,2% λεμφοκύτταρα), προκαλσιτονίνη 3,24 ng/ml, ταχύτητα καθίζησης ερυθρών αιμοσφαιρίων 52 mm/h, αιμοσφαιρίνη A1c 9,5%, και γλυκόζη αίματος νηστείας 8,26 mmol/L. Μια αξονική τομογραφία θώρακα (CT) έδειξε πολλαπλούς οζίδια και διάχυτη διήθηση και στους δύο πνεύμονες (Εικόνες Α, Β), η οποία δεν απέκλεισε την πιθανότητα φυματίωσης. Η προκαταρκτική διάγνωση ήταν πνευμονική λοίμωξη, και δόθηκε εμπειρική αντιβιοτική θεραπεία με ενδοφλέβια πιπεραζίνη/ταζοβακτάμη (4,5 g, q12h) και μοξιφλοξασίνη (2 g, q12h). Ενδοφλέβια ινσουλίνη (4 U, qd) και από του στόματος μιλιτόλ (50 mg, q12h) χρησιμοποιήθηκαν για τον έλεγχο του επιπέδου γλυκόζης στο αίμα. Μετά την εισαγωγή, ο ασθενής ανέπτυξε συνεχή πυρετό και η ημερήσια θερμοκρασία κορυφής υπερέβη τα 38,5 ℃. Την 1η ημέρα, ανέπτυξε αναπνευστική ανεπάρκεια και έλαβε θεραπεία με οξυγόνο. Η ανάλυση αερίων αίματος έδειξε pH 7,50, PaO2 57,7 mmHg, PaCO2 31,9 mmHg και SaO2 90,2%. Οι ορολογικές εξετάσεις για την γρίπη Α IgM, γρίπη Β IgM, παραγρίπη IgM, αδενοϊό IgM, αναπνευστικό συγκυτιακό ιό IgM, Mycoplasma pneumoniae IgM και Chlamydia pneumoniae IgM αποδείχθηκαν αρνητικές. Η ανοσολογική δοκιμή για τη φυματίωση ήταν θετική. Την 2η ημέρα, ο ασθενής παρουσίασε πολυουρία και πολυδιψία και το σύμπτωμα της ταχύπνοιας δεν ανακουφίστηκε κατά τη διάρκεια της θεραπείας με οξυγόνο. Τότε μεταφέρθηκε στη μονάδα εντατικής θεραπείας (ΜΕΘ) και έλαβε μηχανικό αερισμό. Την 3η ημέρα, ο ασθενής είχε βαθμολογία PASS -1 και έλαβε αναλγησία και καταστολή με προποφόλη και αλφεντανίλη. Η βρογχοσκόπηση βρήκε φλεγμονή του βρογχικού βλεννογόνου και παραγωγή πυώδους φλέγματος και το υγρό έκπλυσης του βρογχικού-αλveolar (BALF) ελήφθη για περαιτέρω ανίχνευση. Την 5η ημέρα, ο ασθενής παρουσίασε μειωμένο δείκτη οξυγόνωσης (155) σε σύγκριση με πριν. Δεν διαπιστώθηκαν ανωμαλίες στη βακτηριολογική καλλιέργεια του αίματος. Ο ορός γαλακτομαννάνης (1,74 ng/ml) και η 1,3 β-δ-γλυκάνη (424,50 ng/L) ήταν θετικά. Η χρώση με βακτήρια που δεν αντιδρούν στα αντιβιοτικά και η καλλιέργεια του BALF ήταν αρνητικά. Η ανίχνευση του DNA του M. tuberculosis από το BALF ήταν θετική. Το δείγμα του BALF εστάλη επίσης για μεταγονιδιωματική αλληλούχιση επόμενης γενιάς (Genskey, Πεκίνο, Κίνα). Συνολικά, δημιουργήθηκαν 86.398.947 ακατέργαστες αναγνώσεις και 60.161.047 αναγνώσεις υψηλής ποιότητας ελήφθησαν μετά την αφαίρεση των αναγνώσεων χαμηλής ποιότητας. Μεταξύ των αναγνώσεων υψηλής ποιότητας, 47.232.566 ευθυγραμμίστηκαν με το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς (HG38) και 12.928.481 χρησιμοποιήθηκαν για ανάλυση επόμενης γενιάς. Η μεταγονιδιωματική ανάλυση του BALF ανέφερε σύμπλοκο M. tuberculosis (7.453.374 αναγνώσεις), A. lentulus (37.868 αναγνώσεις) και πολλά στοματικά μικροοργανισμούς αποικισμού. Τα μεταγονιδιωματικά δεδομένα είναι τώρα διαθέσιμα στο NCBI στη βάση δεδομένων Sequence Read Archive (SRA) με αριθμό πρόσβασης PRJNA917778. Με βάση τα ευρήματα αυτά, ο ασθενής διαγνώστηκε με συνύπαρξη M. tuberculosis και A. lentulus. Η αρχική αντιβιοτική θεραπεία άλλαξε σε από του στόματος ιοζινιδίλη (0,3 g, qd), ριφαπεντίνη (0,45 g, qd) για αντιφυματική θεραπεία και ενδοφλέβια καψοφυκίνη (50 mg, qd) για αντιμυκητιακή θεραπεία. Την 6η ημέρα, η κατάσταση του ασθενούς επιδεινώθηκε ξανά. Παρουσίασε πολλαπλή ανεπάρκεια οργάνων και έπεσε σε ελαφρύ κώμα. Η οικογένειά του αποφάσισε να σταματήσει την θεραπεία λόγω οικονομικών προβλημάτων και σοβαρής πρόγνωσης. Στη συνέχεια διακόπηκε η τεχνητή αναπνοή και ο ασθενής απεβίωσε 1,5 ώρα αργότερα.