En japansk kvinde i 50'erne gennemgik kirurgisk resektion for en tumor, der opstod i venstre retroperitoneum. Præoperativ computertomografi (CT) og positronemissionstomografi (PET)-CT samt intraoperative fund viste ingen fjernmetastase, ingen åbenlys peritoneal spredning og ingen invasion af livmoderen eller æggestokkene (Supplerende oplysninger). Histologisk blev tumoren identificeret som et leiomyosarkom på 12 cm × 11 cm. Hun blev behandlet med postoperativ kemoterapi med 6 cyklusser af doxorubicin efterfulgt af kemoterapi med pazopanib i 8 måneder. Under den observationsmæssige opfølgningsperiode viste billeddannelsesundersøgelser åbenbar peritoneal spredning. Mens kemoterapi med pazopanib blev genoptaget straks, voksede tumormassen til en åbenbar tumor i peritoneummet. Hun gennemgik debulking-kirurgi to gange for peritoneale tumorer, men tumorene opstod igen. Hun modtog kemoterapi med gemcitabin og docetaxel, som blev afbrudt på grund af interstitiel lungebetændelse. Cancer genomprofilering blev udført for at søge efter genom-matchede behandlingsstrategier i daglig klinisk praksis inden for kræftpræcisionsmedicin. Hun blev henvist til os for genetisk rådgivning og fortolkning af RAD51D-splicing-varianten, som oprindeligt blev påvist i tumorgenomprofileringsanalysen. Hun havde ingen familiehistorie af RAD51-relaterede kræftformer eller andre typer af maligniteter, herunder sarkom. I immunohistokemiske studier udført på Mita Hospital i tilknytning til International University of Health and Welfare, Japan, viste tumorcellerne sig at være svagt positive for α-glat muskel actin og desmin. Disse fund er i overensstemmelse med en diagnose af leiomyosarkom, svarende til histologisk grad 1 i henhold til den franske Federation of Cancer Centers Sarcoma Group (FNCLCC) gradsystem for sarkom []. Gennem genomprofilering af de 324 gener i patientens tumorprøver ved hjælp af FoundationOne CDx® (Foundation Medicine Inc., MA, USA) onkologi panel, blev der fundet to patogene varianter i RAD51D (splicing variant) og TP53 (missense variant) og intermediære amplificeringer af fire gener (tabel). På baggrund af anbefalingerne fra ekspertpanelet, som er et tumorpanel, der giver molekylære og kliniske fortolkninger og forslag til resultaterne af onkologi panel test, modtog patienten genetisk rådgivning og blev efterfølgende underkastet germline analyse for RAD51D c.904-2A > T [NM_002878]. Den samme splicing variant af RAD51D blev fundet i analysen af DNA ekstraheret fra lymfocytter ved direkte DNA sekventering ved hjælp af kapillær gelelektroforese og fluorescensdetektion (Sanger sekventeringsteknik og anvendelse), som blev udført i et CLIA-certificeret laboratorium. Efter omfattende genetisk rådgivning baseret på resultaterne opnået fra germline testning, blev hendes to døtre, vist som IV-1 og IV-2, også underkastet prædiktiv genetisk testning, og begge blev fundet positive for varianten, NetGene2, Splice Site Prediction by Neural Network (NNSplice) og Alternative Splice Site Predictor (ASSP) til at analysere de potentielle effekter af RAD51D c.904-2A > T [NM_002878]. Alle fire værktøjer forudsagde, at RAD51D-varianten svækkede normal splejsning og gav en kortere form af RAD51D-proteinet (tabel og). Endvidere forudsagde cBROCA-analysen, en eksperimentel analyse for RNA som vist af Casadei et al. [], også, at denne ændring ville svække den naturlige splejsningsakse og skabe eller styrke alternative nye splejsningsakse, hvilket resulterede i kortere former af RAD51D-proteinprodukterne. Når alt dette lægges sammen, antyder disse beregningsmæssige analyser, at en enkelt nukleotidændring i intron 9 af RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] svækker normal splejsning af RAD51D mRNA, hvilket resulterer i produktion af en kortere form af RAD51D-proteinet (et repræsentativt afkortet produkt er vist i figur c og d). Selv om der ikke er nogen specifikke konsensusdomæner i exon 10, som er afkortet ved svækket splejsning, ville de aggressivt ondartede fænotyper, der blev observeret i dette tilfælde, være bevis for, at RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] er en ny funktionsfejl-variant, der er involveret i dannelsen og/eller udviklingen af ondartede tumorer. Ifølge ClinVar-databasen (Variation ID: 472631) (, adgang i august 2021), er den kliniske betydning af RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] sandsynligvis patogen eller usikker, hvilket betyder, at dens kliniske betydning endnu ikke er blevet bestemt og er et emne, der er under debat i fortolkningen. Allelfrekvenserne af RAD51D c.904-2A > T (NM_002878) i den generelle befolkning var 6,60 × 10− 4 (ToMMo 8.3KJPN) og 4,13 × 10− 4 (HGVD ver2.3, dbSNP rsID: 1403784434) i japanske personer og 3,98 × 10− 6 i den globale befolkning, hvilket antyder, at splejsningsvarianten RAD51D c.904-2A > T [NM_002878] var ekstremt sjælden i den globale befolkning såvel som i Japan, hvilket muligvis indikerer, at det er en patogen variant (Tabel).