Patienten var en 8-årig dreng, som viste sig med gradvis fremadskridende unilateral ptosis i en alder af 6 år, som udviklede sig til bilateral ptosis i en alder af 8 år og 4 måneder. Patienten var en 8-årig dreng med bilateral ptosis. I slutningen af december 2017 udviklede patienten feber af ukendt oprindelse med en kropstemperatur på 38,5 °C. Han kom sig efter at have fået oral antipyretika. En uge efter feberen havde patienten et anfald af dyskinesi og fortsatte med at vippe sit hoved mod venstre (cervical dyskinesi), et fænomen, der var ledsaget af øjenbevægelsesforstyrrelser. Patienten var det første barn født af forældre, der ikke var i familie med hinanden, og der er ingen andre familiemedlemmer, der er ramt på samme måde. Selvom han havde en "historie med medfødt hjertesygdom", afslørede efterfølgende ultralydsundersøgelser af hjertet med farvet Doppler normale resultater. Patienten havde ingen forsinkelser i udviklingsmæssige milepæle. Ved fysisk undersøgelse viste det sig, at han havde dobbeltsidig øvre øjenlågs-dråbe (50 % pupiller dækket). Endvidere havde han begrænset abduktion i højre øje, nakke-dystoni og lidt nedsat (grad 5-) muskelstyrke i bilaterale underben, mens hans bilaterale knæreflekser forsvandt. Han udviste også højre kryptorkisme og en lille penis. Han kunne hverken sidde på hug eller hoppe på ét ben. Blodprøver viste bemærkelsesværdige resultater. Han havde et niveau af acetylcholinreceptor-antistof i blodet på 0,82 nmol/L, mens IgG-prøver for anti-MuSK, anti-Titin antistof og humant lavdensitets lipoprotein receptor-relateret protein 4 var negative. Brain magnetisk resonansbilleddannelse afslørede diffuse signaler i occipital, parietal cortex og basale ganglier. Hans højre ptosis var bedre, selvom den ikke forsvandt efter behandling med prednison, neostigmin og omeprazol fra januar 2018 til oktober 2019. Hans øjenlåg faldt ned igen i marts 2020 og blev bilateralt. I august 2019 blev han indlagt på grund af tilbagevendende hovedpine og reagerede ikke på mannitol og carbamazepin. Patienten var i øjeblikket i første klasse i grundskolen med gennemsnitlige karakterer. Hele exom-biblioteker blev forberedt ved hjælp af xGen Exome Research Panel v1.0 (IDT, Iowa, USA) og sekventeret på Novaseq 6000-platformen (Illumina, San Diego, CA, USA). Rådata blev renset ved hjælp af fastp-softwarepakken. Derefter blev de parrede ende-læsninger udført ved hjælp af Burrows-Wheeler Aligner til reference-genom Ensemble GRCh37/hg19. Synonym og kort indel-kald blev udført ved hjælp af GATK-softwarepakken efterfulgt af ANNOVAR-annotation. Forudsigelse blev udført ved hjælp af Provean, Sift, Polypen2_hdiv, Polypen2_hvar, Mutationtaster, M-Cap og Revel-softwarepakkerne. Patogeniciteten af alle varianterne blev fortolket i henhold til retningslinjerne fra American College of Medical Genetics and Genomics. Vi udførte CNV-sekventering[], en CNV-detektionsmetode baseret på high-throughput-sekventering, i patienten. Kort fortalt blev genomisk DNA først skåret i 200-300 bp-fragmenter via sonikering og derefter underkastet kvalitetskontrol via elektroforese. Enderne af DNA-fragmenterne blev patchet ved hjælp af et DNA-reparationsenzymsystem for at generere stumpe ender, og derefter blev et enkelt adeninnukleotid tilføjet til 3'-enden for at danne en overhængende A-hale. Derefter blev genomet amplificeret ved hjælp af ligeringsmedieret PCR i 4-6 cyklusser. Vi brugte den samme sekventeringsplatform og dataoprydningsprotokoller til at detektere CNV'er med en længde på 100 kB og derover ved hjælp af Chigene uafhængigt udviklede softwarepakker. Derefter brugte vi Decipher, ClinVar, OMIM, DGV og ClinGen til annotation. Mindst 2 ml perifert blod blev indsamlet fra patienten, og mitokondrie-DNA blev ekstraheret ved hjælp af mitokondrie-DNA-ekstraktionssættet. Fuldlængde mitokondrie-DNA blev amplificeret og renset via PCR ved hjælp af den meget pålidelige DNA-polymerase og visualiseret via agarosegelelektroforese. Sekvensering af 150 bp blev udført på Novaseq6000-sekvenseringssystemet. De sekvenserede data blev justeret til referencesekvensen af NC_012920 (det komplette humane mitokondrie-genom 16569 bp cirkulær DNA) ved hjælp af Burrows-Wheeler Aligner-softwaren. Varianterne blev derefter kortlagt på MITOMAP-databasen, mens patogenicitet blev udført i henhold til MITOtip. Resultaterne fra sekventering af hele exomet afslørede ingen mistænkte sygdomsfremkaldende varianter. Derefter anvendte vi CNV-analysemetoden (udviklet af Chigene) på sekventeringsdata fra hele exomet og fandt, at der var to deletioner i det tilstødende område af Chr16:15,125,591-16326688 (ca. 1,20 Mb) og 9857005-14989502 (ca. 5,13 Mb). CNV-sekventeringsdata afslørede en de novo heterozygot deletion af chr16:9699585-16928372 (ca. 7,23 Mb). Derefter sammenlignede vi dette område og centralnervesystemets fænotyper med tidligere dokumenterede Decipher-patienter. Gener relateret til OMIM-lidelser er anført i tabel. Sekventeringen af mitokondrie-DNA afslørede negative resultater.