El pacient era un nen de 8 anys que va presentar una ptosi unilateral progressiva als 6 anys, que va esdevenir bilateral als 8 anys i 4 mesos. El pacient era un nen de 8 anys amb ptosis bilateral. A finals de desembre de 2017, el pacient va desenvolupar una febre d'origen desconegut, amb una temperatura corporal de 38.5 °C. Es va recuperar després de rebre antipirètics orals. Una setmana després de la febre, el pacient va tenir un atac de discinèsia i va mantenir la inclinació del cap cap a l'esquerra (discinèsia cervical), un fenomen que va anar acompanyat de trastorns del moviment ocular. El pacient va ser el primer infant nascut de pares no emparentats, i no hi ha cap altre membre de la família afectat. Tot i que tenia un "historial de cardiopatia congènita", un examen d'ultrasò Doppler cardíac posterior va revelar resultats normals. El pacient no va tenir retards en les fites del desenvolupament. L'examen físic va revelar que tenia ptosis bilateral de la parpella superior (50% de les pupil·les cobertes). A més, tenia una abducció limitada a l'ull dret, distonia cervical i una força muscular lleugerament reduïda (grau 5-) a les extremitats inferiors bilaterals, mentre que els reflexos del genoll bilateral havien desaparegut. També presentava criptorquídia dreta i un penis petit. No podia ni ajupir-se ni saltar amb un peu. Les anàlisis de sang van mostrar resultats poc destacables. En particular, tenia un nivell d'anticòs del receptor d'acetilcolina de 0,82 nmol/L, mentre que les proves d'IgG per a l'anticòs anti-MuSK, anti-Titin i la proteïna 4 relacionada amb el receptor de lipoproteïnes de baixa densitat humana van ser negatives. La ressonància magnètica del cervell va revelar senyals difosos a l'occipital, el còrtex parietal i els ganglis basals. La seva ptosi dreta va millorar, tot i que no va desaparèixer després del tractament amb prednisona, neostigmina i omeprazol de gener de 2018 a octubre de 2019. La seva caiguda de la parpella va reaparèixer el març de 2020 i va esdevenir bilateral. L'agost de 2019, va ser hospitalitzat a causa d'un mal de cap recurrent i no va respondre al manitol i la carbamazepina. El pacient estava actualment a primer curs de primària amb notes mitjanes. Es van preparar biblioteques exòmiques completes utilitzant el xGen Exome Research Panel v1.0 (IDT, Iowa, Estats Units) i es van seqüenciar a la plataforma Novaseq 6000 (Illumina, San Diego, CA, Estats Units). Les dades en brut es van netejar utilitzant el paquet de programari fastp. Posteriorment, es van realitzar les lectures de final aparellat utilitzant l'Alineador Burrows-Wheeler amb el genoma de referència Ensemble GRCh37/hg19. Es van fer trucades de sinònims i indels curts utilitzant el paquet de programari GATK seguit per l'anotació ANNOVAR. La predicció es va realitzar utilitzant els paquets de programari Provean, Sift, Polypen2_hdiv, Polypen2_hvar, Mutationtaster, M-Cap, i Revel. La patogenicitat de totes les variants es va interpretar segons les directrius de l'American College of Medical Genetics and Genomics. Hem fet una seqüenciació de CNV[] en aquest pacient, un mètode de detecció de CNV basat en la seqüenciació d'alt rendiment. Breument, primer es va tallar l'ADN genòmic en fragments de 200-300 pb mitjançant sonicació, després es va sotmetre a un control de qualitat mitjançant electroforesi. Es van reparar els extrems dels fragments d'ADN utilitzant un sistema d'enzims de reparació d'ADN per generar extrems roms, després es va afegir un nucleòtid d'adenina a l'extrem 3' per formar una cua d'adenina. Posteriorment, es va amplificar el genoma mitjançant PCR mediada per lligació durant 4-6 cicles. Hem fet servir la mateixa plataforma de seqüenciació i els mateixos protocols de neteja de dades per detectar CNV de 100 kB o més utilitzant els paquets de programari desenvolupats independentment per Chigene. Després d'això, hem emprat Decipher, ClinVar, OMIM, DGV i ClinGen per a l'anotació. Es van recollir almenys 2 ml de sang perifèrica del pacient i es va extreure l'ADN mitocondrial utilitzant el kit d'extracció d'ADN mitocondrial. Es va amplificar l'ADN mitocondrial complet i es va purificar mitjançant PCR, utilitzant la polimerasa d'ADN d'alta fidelitat i es va visualitzar mitjançant electroforesi en gel d'agarosa. Es va realitzar la seqüenciació de 150 pb amb el sistema de seqüenciació Novaseq6000. Les dades seqüenciades es van aliniar amb la seqüència de referència de NC_012920 (ADN circular de 16569 pb del genoma mitocondrial complet humà) utilitzant el programari Burrows-Wheeler Aligner. Les variants es van mapejar a la base de dades MITOMAP, mentre que la patogenicitat es va realitzar segons el MITOtip. Els resultats de la seqüenciació de l'exoma complet no van revelar variants sospitoses de causar malalties. Tot seguit, vam aplicar el mètode d'anàlisi CNV (desenvolupat per Chigene) a les dades de la seqüenciació de l'exoma complet i vam trobar dues delecions a la regió veïna de Chr16:15,125,591-16326688 (aproximadament 1,20 Mb) i 9857005-14989502 (aproximadament 5,13 Mb). Les dades de la seqüenciació CNV van revelar una deleció heterozigòtica de novo de chr16:9699585-16928372 (aproximadament 7,23 Mb). Tot seguit, vam comparar aquesta regió i el fenotip del sistema nerviós central amb els pacients de Decipher prèviament documentats. Els gens relacionats amb els trastorns OMIM es mostren a la Taula. La seqüenciació de l'ADN mitocondrial va revelar resultats negatius.