Zotero pour les revues de littérature

Frédérique Flamerie
Raphaël Grolimund

Introduction

Les processus d’une revue de littérature : vue d’ensemble

(Van Essen et al. 2025)

Les processus d’une revue de littérature : points de méthode

Typologie des revues de littérature

De la revue narrative à la revue systématique - Télécharger le tableau au format PDF.

7 points clés pour distinguer une revue systématique (Haddaway et al. 2015)

  1. Le protocole est revu par les pairs et publié.

  2. Les recherches sont menées dans plusieurs bases de données et sources de littérature grise, selon les équations définies dans le protocole.

  3. Tous les résultats sont analysés selon des critères d’inclusion prédéfinis, en suivant un degré de précision croissante (tri sur titre, résumé, texte intégral).

  4. L’analyse est effectuée par plusieurs relecteurs pour assurer une application cohérente des critères.

  5. La rigueur méthodologique de chaque article de recherche primaire fait l’objet d’une évaluation critique, de manière objective et transparente.

  6. Les données probantes sont synthétisées et décrites, en incluant généralement des implications pratiques, politiques, de recherche, etc.

  7. La documentation fournie (supplementary information) garantit que la démarche est reproductible et vérifiable.

Les processus d’une revue de littérature avec Zotero

Fonctionnalités et extensions de Zotero

Pour une vue d’ensemble des extensions de Zotero, voir (Flamerie, Grolimund, Marois 2024).

Import des données bibliographiques : fonctionnalités d’export

Partons de 4 exemples. Avez-vous déjà expérimenté d’exporter un lot d’au moins 100 références en vue de son import dans Zotero avec un ou plusieurs des outils de recherche suivant ?

  • Google Scholar
  • Business Source Premier ou une autre base disponible via EBSCOHost
  • CAIRN info
  • CORE

Import des données bibliographiques : fonctionnalités d’export

Partons de 4 exemples. Avez-vous déjà expérimenté d’exporter un lot d’au moins 100 références en vue de son import dans Zotero avec un ou plusieurs des outils de recherche suivant ?

  • Google Scholar → détour nécessaire par Publish or Perish
  • Business Source Premier ou une autre base disponible via EBSCOHost → cf. copies d’écran avec GreenFile infra : l’envoi du fichier d’export par courriel n’est pas toujours activé en fonction des établissements
  • CAIRN info → au moins 2 clics par référence, nécessaire d’ajouter chacune à l’unité dans une liste de lecture avant d’exporter cette dernière
  • CORE → fichier CSV très pauvre et mal construit : espérer qu’il y ait beaucoup de références avec DOI 😅

Export des références avec EBSCOHost - 1/2

L’option permettant d’exporter jusqu’à 25’000 références d’un coup est affichée sur la liste de résultats.

Export des références avec EBSCOHost - 2/2

Le fichier de références est envoyé par courriel, au format RIS, CSV, BIBTEX ou XML.

Import des données bibliographiques : qualité des données

  • Certains formats peuvent être plus riches que d’autres pour une même base de données → faire des tests et choisir le meilleur - voici par exemple les exports du Web of Science ci-dessous

Plain text Plain text

RIS RIS

BibTeX BibTeX

Import des données bibliographiques : qualité des données

Tous les auteurs sont concaténés dans le champ “Prénom” de l’éditeur : en plus d’être incorrect, cela empêche la synchronisation de Zotero.

Import des données bibliographiques : qualité des données

  • Données lacunaires ou absentes → l’anticiper - exemple du résumé de Google Scholar

Référence importée depuis Google Scholar dans une bibliothèque Zotero : le résumé n’est pas un résumé mais un bref extrait.

Nettoyage des références

Nettoyer les références est évidemment important pour que votre base bibliographique soit cohérente et que les entrées de votre bibliographie soient correctes et complètes.

Mais c’est aussi indispensable pour améliorer la détection des doublons.

Nettoyer les références avec l’extension Linter

Linter peut fonctionner automatiquement ou manuellement, sur tout ou partie des références.

Menu contextuel Linter, avec la commande “Lint and Fix” et les commandes individuelles.

Quelques fonctionnalités de Linter

  • Corriger la casse des auteurs, des titres et des titres de revue.
  • Compléter et/ou corriger les abréviations de titres de revues selon la norme ISO4.
  • Normaliser les DOI, les dates, les volumes, numéros et pages.
  • Disposer de raccourcis clavier pour la mise en forme enrichie : gras, italique, etc.

👉 Pour en savoir plus, référez-vous au matériel de l’atelier Zotero+.

Nettoyer les références avec l’extension Actions & Tags

Actions & Tags offre des possibilités de nettoyage étendues, principalement grâce au script “Bulk Edit Multiple Items”.

Première fenêtre de dialogue du script “Bulk Edit Multiple Items”.

Autres scripts intéressants

  • Collection Tags pour créer et associer automatiquement aux références les marqueurs correspondant à leurs collections
  • Batch Tag Operations pour effectuer sur tout ou partie des marqueurs des opérations telles que combiner, scinder, retirer, préfixer ou suffixer, etc.
  • Backup Attachment(s) pour créer une copie de sauvegarde des fichiers PDF joints aux références

👉 Pour en savoir plus, référez-vous au matériel de l’atelier Zotero+.

Dédoublonnage avec Zoplicate : vue d’ensemble

Zoplicate optimise la gestion des doublons grâce aux fonctionnalités suivantes, qui peuvent être utilisées de façon combinée ou dissociée.

  • Détection des doublons à l’import et choix de la décision à appliquer (rubrique Action Preferences des paramètres de Zoplicate): conserver les deux documents, les fusionner et choisir le document existant ou le nouveau document importé comme document maître, demander pour chaque cas.
  • Fusion des doublons par lot et paramétrage du document maître (rubrique Master Item Preferences): utiliser comme document maître le document le plus ancien, le document le plus récent, le document modifié le plus récemment, ou le document le plus détaillé.
  • Affichage du nombre de doublons dans le volet de gauche de Zotero (rubrique View Preferences).
  • Marquage des faux positifs comme “non doublons”, ce qui les fait disparaître de la vue “Doublons”.

Dédoublonnage avec Zoplicate : les paramètres

Avec le paramètre [Keep All] on désactive la fusion automatique des doublons à l’import.

Dédoublonnage : Zotero versus Rayyan

Dédoublonnage avec Rayyan (version gratuite) : repérage peu précis, pas de fusion par lot.

Dédoublonnage : Zotero versus Pico Portal

Dédoublonnage avec PICO Portal (version gratuite) : peu d’outils d’aide à la décision, repérage peu précis, pas de fusion par lot PICO Portal.

Recherche de texte intégral : option “Trouver le texte intégral”

L’option “Trouver le texte intégral” recherche dans les données de Unpaywall et dans les abonnements si l’accès est direct sur site ou via un VPN.

Recherche de texte intégral : option “Recherche dans la bibliothèque”

L’option “Recherche dans la bibliothèque” effectue une recherche via le résolveur de liens OpenURL de l’établissement, configuré dans les paramètres de Zotero.

Recherche de texte intégral : les moteurs de recherche intégrés à Zotero

Les moteurs de recherche que vous installez sont accessibles dans le menu “Localiser” de Zotero.

Recherche de texte intégral

👉 Vue d’ensemble dans la base de connaissance en français : Trouver des fichiers PDF de texte intégral avec Zotero

🎁 Pour les utilisateurs français : Click & Read et bibliographie html

Bonus 1 : suivre les citations avec l’extension scite

Dans le cadre d’une revue de la littérature, il est toujours bon de confronter les opinions opposées sur le sujet traité. Mais il est difficile de trouver une publication dont les conclusions s’opposent aux articles que vous avez déjà lus. Et si vous êtes d’accord avec les articles déjà lus, serez-vous vraiment motivé·e à chercher des avis opposés ?

Bonus 1 : suivre les citations avec l’extension scite

C’est là que scite entre en scène. Intégrée à Zotero, cette extension permet de rapidement identifier des articles dont les conclusions diffèrent de celles des articles que vous avez déjà enregistrés dans votre bibliothèque Zotero.

Bonus 1 : suivre les citations avec l’extension scite

Les informations de scite s’affichent dans le panneau de droite de la bibliothèque.

Bonus 2 : personnaliser un export CSV

Page de la base de connaissance en français Créer un format d’export CSV personnalisé.

Bonus 2 : personnaliser un export CSV

Exemple de fichier généré avec un export personnalisé : on choisit quelles données sont exportées et dans quel ordre.

Questions et conclusion

LibreABC 2025 | 9 septembre 2025 | Support mis à disposition selon les termes de la Licence Creative Commons Attribution 4.0 International deed

Références citées

FLAMERIE, Frédérique, GROLIMUND, Raphaël et MAROIS, Alain, 2024. Les extensions dans Zotero 7. Billet. Le blog Zotero francophone. DOI 10.58079/12m5t.
HADDAWAY, N. R. et al., 2015. Making literature reviews more reliable through application of lessons from systematic reviews. Conservation Biology. Vol. 29, no 6, pp. 1596‑1605. DOI 10.1111/cobi.12541.
VAN ESSEN, Koert et al., 2025. Therapeutic factors and mechanisms of change in music therapy for people with late-life depression: A scoping review. The Arts in Psychotherapy. Vol. 93, p. 102289. DOI 10.1016/j.aip.2025.102289.