query:N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O.N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)O
query_format:smiles
topology:free
template:None
pop_size:50
pop_selection:15
mutation_ratio:0.5
cut_off:3
selection_strategy:ranking
descriptor:MAP4_COMBO
n_iterations:10000
run_id:CathelicidinCirculin
seed:1
verbose:False
bb_list:['BB001', 'BB002', 'BB003', 'BB004', 'BB005', 'BB006', 'BB007', 'BB008', 'BB009', 'BB010', 'BB011', 'BB012', 'BB013', 'BB014', 'BB015', 'BB016', 'BB017', 'BB018', 'BB019', 'BB020', 'BB021', 'BB022', 'BB023', 'BB024', 'BB025', 'BB026', 'BB027', 'BB028', 'BB029', 'BB030', 'BB031', 'BB032', 'BB033', 'BB034', 'BB035', 'BB036', 'BB037', 'BB038', 'BB039', 'BB040', 'BB041', 'BB042', 'BB043', 'BB044', 'BB045', 'BB046', 'BB047', 'BB048', 'BB049', 'BB050', 'BB051', 'BB052', 'BB053', 'BB054', 'BB055', 'BB056', 'BB057', 'BB058', 'BB059', 'BB060', 'BB061', 'BB062', 'BB063', 'BB064', 'BB065', 'BB066', 'BB067', 'BB068', 'BB069', 'BB070', 'BB071', 'BB072', 'BB073', 'BB074', 'BB075', 'BB076', 'BB077', 'BB078', 'BB079', 'BB080', 'BB081', 'BB082', 'BB083', 'BB084', 'BB085', 'BB086', 'BB087', 'BB088', 'BB089', 'BB090', 'BB091', 'BB092', 'BB093', 'BB094', 'BB095', 'BB096', 'BB097', 'BB098', 'BB099', 'BB100']
ncap_list:['T000', 'T001', 'T002', 'T003', 'T004', 'T005', 'T006', 'T007', 'T008', 'T009', 'T010', 'T011']
branch_list:['b000', 'b001', 'b002']
translation_dict:{'BB001': 'N[C@@H](C)C(=O)', 'BB002': 'N[C@@H](C(C)C)C(=O)', 'BB003': 'N[C@@H](CC(C)C)C(=O)', 'BB004': 'N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)', 'BB005': 'N[C@@H]([C@H](C)CC)C(=O)', 'BB006': 'N[C@@H](CCSC)C(=O)', 'BB007': 'N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)', 'BB008': 'N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)', 'BB009': 'N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)', 'BB010': 'N[C@@H](CO)C(=O)', 'BB011': 'N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)', 'BB012': 'N[C@@H]([C@H](C)O)C(=O)', 'BB013': 'N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)', 'BB014': 'N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)', 'BB015': 'N[C@@H](CS)C(=O)', 'BB016': 'NCC(=O)', 'BB017': 'N1CCC[C@@H]1C(=O)', 'BB018': 'N1CCC[C@H]1C(=O)', 'BB019': 'N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)', 'BB020': 'N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)', 'BB021': 'N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)', 'BB022': 'N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)', 'BB023': 'N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)', 'BB024': 'N[C@H](C)C(=O)', 'BB025': 'N[C@H](C(C)C)C(=O)', 'BB026': 'N[C@H](CC(C)C)C(=O)', 'BB027': 'N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)', 'BB028': 'N[C@H]([C@H](C)CC)C(=O)', 'BB029': 'N[C@H](CCSC)C(=O)', 'BB030': 'N[C@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)', 'BB031': 'N[C@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)', 'BB032': 'N[C@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)', 'BB033': 'N[C@H](CO)C(=O)', 'BB034': 'N[C@H]([C@@H](C)O)C(=O)', 'BB035': 'N[C@H]([C@H](C)O)C(=O)', 'BB036': 'N[C@H](CC(N)=O)C(=O)', 'BB037': 'N[C@H](CCC(N)=O)C(=O)', 'BB038': 'N[C@H](CS)C(=O)', 'BB039': 'N[C@H](CC1CCCCC1)C(=O)', 'BB040': 'N[C@H](CCCNC(N)=N)C(=O)', 'BB041': 'N[C@H](CC1=CNC=N1)C(=O)', 'BB042': 'N[C@H](CCCC[NH3+])C(=O)', 'BB043': 'N[C@H](CC(O)=O)C(=O)', 'BB044': 'N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)', 'BB045': 'N[C@@H](CC[NH3+])C(=O)', 'BB046': 'N[C@H](CC[NH3+])C(=O)', 'BB047': 'N[C@@H](CCC[NH3+])C(=O)', 'BB048': 'N[C@H](CCC[NH3+])C(=O)', 'BB049': 'N(CC[NH3+])CC(=O)', 'BB050': 'N(CCC[NH3+])CC(=O)', 'BB051': 'N(CC1=CC=CC=C1)CC(=O)', 'BB052': 'N(CCC1=CC=CC=C1)CC(=O)', 'BB053': 'N(C1CC1)CC(=O)', 'BB054': 'N(CCC)CC(=O)', 'BB055': 'N(C(C)C)CC(=O)', 'BB056': 'N(CC1CC1)CC(=O)', 'BB057': 'N(C1CCCC1)CC(=O)', 'BB058': 'N(C1CCCCC1)CC(=O)', 'BB059': 'N(CC1CCCCC1)CC(=O)', 'BB060': 'N(CC1=CC=CC=N1)CC(=O)', 'BB061': 'N(CC1=CC=CN=C1)CC(=O)', 'BB062': 'N(CC1=CC=NC=C1)CC(=O)', 'BB063': 'N(CCC1=CC=CC=N1)CC(=O)', 'BB064': 'N(CCN(C(C)C)(C(C)C))CC(=O)', 'BB065': 'N(CCCC[NH3+])CC(=O)', 'BB066': 'N[C@@H](CC1CCCCC1)C(=O)', 'BB067': 'N(CCCCO)CC(=O)', 'BB068': 'N(CCN(C)(C))CC(=O)', 'BB069': 'N(CC(CC)(CC))CC(=O)', 'BB070': 'N(CC1=CC=CC=C1(Cl))CC(=O)', 'BB071': 'N(CC1=CC=CC(Cl)=C1)CC(=O)', 'BB072': 'N(CC1=CC=C(Cl)C=C1)CC(=O)', 'BB073': 'N(CCC1=CC=CC=C1(Cl))CC(=O)', 'BB074': 'N(CCC1=CC=CC(Cl)=C1)CC(=O)', 'BB075': 'N(CCC1=CC=C(Cl)C=C1)CC(=O)', 'BB076': 'N(CC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1)CC(=O)', 'BB077': 'N(CC1=CC(Cl)=CC(Cl)=C1)CC(=O)', 'BB078': 'N(CC1=CC=C(O)C=C1)CC(=O)', 'BB079': 'N(CCC(C)(C))CC(=O)', 'BB080': 'N(CC1=CC=C(C)C=C1)CC(=O)', 'BB081': 'N(C(C)C1=CC=C(C)C=C1)CC(=O)', 'BB082': 'N(CC1=CC=C(CN)C=C1)CC(=O)', 'BB083': 'N(CC1=CC=C(C2=CC=CC=C2)C=C1)CC(=O)', 'BB084': 'N(CC(C)(C)(C))CC(=O)', 'BB085': 'N(CCN1CCCC1)CC(=O)', 'BB086': 'N(CCN1CCCCC1)CC(=O)', 'BB087': 'N(CCN(CC)(CC))CC(=O)', 'BB088': 'N(CC1=CC=CC2=CC=CC=C12)CC(=O)', 'BB089': 'N(CCO)CC(=O)', 'BB090': 'N(CCCO)CC(=O)', 'BB091': 'NCCCC(=O)', 'BB092': 'NCCC(=O)', 'BB093': 'N[C@@H](CC1=CC=C(C)C=C1)C(=O)', 'BB094': 'N[C@H](CC1=CC=C(C=C1)C)C(=O)', 'BB095': 'N[C@@H](CC1=CC2=CC=CC=C2C=C1)C(=O)', 'BB096': 'N[C@H](CC1=CC2=CC=CC=C2C=C1)C(=O)', 'BB097': 'NC(C)(C)C(=O)', 'BB098': 'N(CC(C)C)CC(=O)', 'BB099': 'N(CC1=CNC=N1)CC(=O)', 'BB100': 'N(CC1=CC2=CC=CN=C2C=C1)CC(=O)', 'T000': 'CCCC(=O)', 'T001': 'CCCCC(=O)', 'T002': 'CCCCCC(=O)', 'T003': 'CCCCCCC(=O)', 'T004': 'CCCCCCCC(=O)', 'T005': 'CC(C)CC(=O)', 'T006': 'CC(C)CCC(=O)', 'T007': 'C1CCCC1CCC(=O)', 'T008': 'C(C1CCCCC1)(C2CCCCC2)C(=O)', 'T009': 'C1CCCCC1CC(=O)', 'T010': 'C1CCCCC1CCC(=O)', 'T011': 'CC(C)CCCCC(=O)', 'b000': 'N[C@@H](CCN8)C(=O)', 'b001': 'N[C@@H](CCCN8)C(=O)', 'b002': 'N[C@@H](CCCCN8)C(=O)', 'c': '9', 's0': 'NC(CS4)C(=O)', 's1': 'NC(CS5)C(=O)', 's2': 'NC(CS6)C(=O)', 's3': 'NC(CS7)C(=O)'}
query_smiles:['N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O', 'N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCC[NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)O']
self:<pdga.pdga.PDGA object at 0x7cf746b97350>
